View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16767_low_8 (Length: 407)

Name: NF16767_low_8
Description: NF16767
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16767_low_8
NF16767_low_8
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (1-397)||(48704086-48704482)
chr1 (1-380)||(33256170-33256549)
chr1 (1-380)||(33276342-33276721)
chr1 (1-367)||(1577749-1578115)
chr1 (1-383)||(19717406-19717788)
chr1 (1-383)||(20954287-20954671)
chr1 (1-353)||(28492248-28492602)
chr1 (1-334)||(22201601-22201934)
chr1 (11-382)||(22599997-22600370)
chr1 (1-353)||(10757303-10757656)
chr1 (1-397)||(12284305-12284704)
chr1 (1-383)||(22153739-22154123)
chr1 (1-382)||(38282449-38282831)
chr1 (1-353)||(1900227-1900581)
chr1 (1-353)||(30892975-30893327)
chr1 (1-339)||(32785798-32786135)
chr1 (1-382)||(35401690-35402072)
chr1 (1-383)||(2268413-2268793)
chr1 (1-321)||(36134072-36134391)
chr1 (1-342)||(26701986-26702327)
chr1 (1-353)||(22427203-22427555)
chr1 (1-339)||(22464670-22465007)
chr1 (1-353)||(29215679-29216031)
chr1 (1-353)||(2266971-2267321)
chr1 (1-382)||(23036344-23036727)
chr1 (1-324)||(39200869-39201188)
chr1 (1-353)||(21028676-21029029)
chr1 (1-353)||(16235142-16235494)
chr1 (1-324)||(25448443-25448764)
chr1 (1-383)||(21191693-21192063)
chr1 (1-339)||(2834571-2834908)
chr1 (1-367)||(7309702-7310068)
chr1 (1-397)||(2327240-2327638)
chr1 (1-304)||(35040048-35040351)
chr1 (1-339)||(30572079-30572414)
chr1 (1-339)||(21702696-21703031)
chr1 (9-353)||(17024811-17025153)
chr1 (1-339)||(46088871-46089198)
chr1 (1-263)||(14263387-14263650)
chr1 (11-206)||(21135153-21135348)
chr1 (1-339)||(48570094-48570429)
chr1 (1-339)||(10250868-10251194)
chr1 (1-206)||(42284510-42284715)
chr1 (74-324)||(44821422-44821670)
chr1 (106-302)||(12613713-12613907)
chr1 (15-206)||(19215507-19215699)
chr1 (1-206)||(21121057-21121262)
chr1 (7-206)||(21984483-21984683)
chr1 (9-183)||(23024678-23024852)
chr1 (1-162)||(17370924-17371085)
chr1 (16-163)||(34255552-34255700)
chr1 (1-92)||(12624663-12624754)
chr1 (35-339)||(7744952-7745254)
chr1 (32-109)||(17400889-17400966)
chr1 (6-162)||(44200899-44201054)
chr1 (11-157)||(41132659-41132804)
chr1 (1-162)||(19170371-19170532)
chr1 (77-185)||(21204937-21205044)
chr1 (6-162)||(22655364-22655520)
chr1 (6-157)||(5929591-5929741)
chr1 (6-153)||(20251662-20251808)
chr1 (11-157)||(675464-675609)
chr1 (6-154)||(28474115-28474262)
chr1 (6-154)||(52350731-52350878)
chr1 (6-157)||(19037894-19038045)
chr1 (11-157)||(14388170-14388315)
chr1 (1-259)||(18896537-18896794)
chr1 (6-162)||(22019223-22019379)
chr1 (6-126)||(28379883-28380002)
chr1 (106-206)||(37642235-37642335)
chr1 (34-157)||(18311016-18311138)
chr1 (9-67)||(37640899-37640957)
chr1 (1-162)||(22642777-22642938)
chr1 (1-65)||(18614783-18614847)
chr1 (34-157)||(11195111-11195233)
chr1 (1-116)||(21543911-21544026)
chr1 (6-65)||(26548391-26548450)
chr1 (333-383)||(12613609-12613659)
chr1 (1-71)||(17018461-17018531)
chr1 (1-55)||(44823906-44823960)
chr1 (11-116)||(45070738-45070842)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-397)||(14531-14927)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (1-383)||(22187941-22188325)
chr2 (1-397)||(24575912-24576309)
chr2 (1-353)||(25829011-25829363)
chr2 (1-383)||(23234884-23235268)
chr2 (1-383)||(9015210-9015591)
chr2 (1-383)||(25037098-25037482)
chr2 (1-383)||(30666866-30667250)
chr2 (1-383)||(10009590-10009973)
chr2 (6-376)||(20568596-20568968)
chr2 (1-342)||(13963860-13964201)
chr2 (9-367)||(19540301-19540659)
chr2 (1-383)||(40782354-40782730)
chr2 (1-383)||(21537087-21537473)
chr2 (1-353)||(24376978-24377332)
chr2 (1-353)||(30621093-30621447)
chr2 (1-353)||(30623714-30624068)
chr2 (82-383)||(25041205-25041508)
chr2 (1-379)||(24850508-24850889)
chr2 (1-334)||(28140509-28140842)
chr2 (1-383)||(38781275-38781658)
chr2 (1-339)||(22317470-22317809)
chr2 (1-367)||(23595427-23595790)
chr2 (6-353)||(39037511-39037860)
chr2 (1-353)||(6573993-6574348)
chr2 (1-353)||(20151905-20152249)
chr2 (1-379)||(22454833-22455213)
chr2 (106-353)||(18376775-18377024)
chr2 (150-383)||(22260432-22260665)
chr2 (1-353)||(25189275-25189629)
chr2 (1-258)||(31800853-31801110)
chr2 (7-367)||(41121577-41121936)
chr2 (1-304)||(28711618-28711921)
chr2 (1-367)||(23184170-23184527)
chr2 (69-306)||(24779288-24779525)
chr2 (6-382)||(28701069-28701447)
chr2 (1-259)||(26619066-26619323)
chr2 (1-339)||(6392511-6392848)
chr2 (1-154)||(22258078-22258231)
chr2 (1-383)||(22802338-22802718)
chr2 (1-339)||(33074103-33074439)
chr2 (1-322)||(34321840-34322159)
chr2 (1-383)||(22272010-22272391)
chr2 (1-397)||(30557145-30557543)
chr2 (1-339)||(31967940-31968266)
chr2 (7-339)||(31327852-31328182)
chr2 (7-339)||(31334573-31334903)
chr2 (1-209)||(44840311-44840519)
chr2 (202-378)||(7609039-7609216)
chr2 (1-258)||(28550893-28551141)
chr2 (1-209)||(22776303-22776511)
chr2 (1-209)||(22781681-22781889)
chr2 (7-209)||(40331970-40332172)
chr2 (1-258)||(35743966-35744223)
chr2 (142-397)||(45087008-45087266)
chr2 (1-321)||(19114961-19115279)
chr2 (1-339)||(1586929-1587255)
chr2 (1-209)||(14581389-14581600)
chr2 (1-209)||(22785670-22785877)
chr2 (1-185)||(23392707-23392891)
chr2 (1-367)||(44881045-44881409)
chr2 (1-223)||(1083891-1084105)
chr2 (1-162)||(24814645-24814806)
chr2 (11-157)||(20646626-20646771)
chr2 (11-157)||(22774423-22774568)
chr2 (11-157)||(24275090-24275235)
chr2 (1-342)||(18702616-18702955)
chr2 (1-321)||(18430844-18431162)
chr2 (6-116)||(22755349-22755459)
chr2 (32-157)||(22779822-22779946)
chr2 (138-210)||(3277044-3277116)
chr2 (11-157)||(19313036-19313181)
chr2 (283-353)||(22776171-22776239)
chr2 (283-353)||(22781549-22781617)
chr2 (34-157)||(27978402-27978524)
chr2 (34-157)||(28064931-28065053)
chr2 (11-157)||(967522-967667)
chr2 (290-339)||(22785552-22785599)
chr2 (1-38)||(17963452-17963489)
chr2 (343-383)||(28140475-28140515)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (1-383)||(16681197-16681579)
chr8 (1-383)||(39693410-39693794)
chr8 (1-382)||(16188859-16189240)
chr8 (1-342)||(12757698-12758039)
chr8 (1-383)||(29693190-29693574)
chr8 (7-383)||(24646219-24646597)
chr8 (1-382)||(17525623-17526005)
chr8 (10-377)||(17267358-17267724)
chr8 (1-383)||(20382288-20382670)
chr8 (1-367)||(18321067-18321435)
chr8 (1-381)||(16207181-16207563)
chr8 (1-367)||(17441716-17442083)
chr8 (1-383)||(33082741-33083114)
chr8 (1-381)||(19943110-19943494)
chr8 (40-383)||(17914373-17914718)
chr8 (7-353)||(18718882-18719228)
chr8 (69-353)||(19156139-19156425)
chr8 (1-366)||(18121018-18121382)
chr8 (7-353)||(18679696-18680042)
chr8 (1-353)||(21932758-21933112)
chr8 (1-376)||(17701615-17701997)
chr8 (1-353)||(23185150-23185503)
chr8 (74-342)||(602655-602923)
chr8 (1-383)||(23263505-23263888)
chr8 (1-382)||(19707381-19707761)
chr8 (1-383)||(17797297-17797680)
chr8 (1-353)||(30421352-30421705)
chr8 (1-300)||(43644771-43645069)
chr8 (6-339)||(15336028-15336359)
chr8 (6-339)||(15425093-15425424)
chr8 (6-339)||(15516397-15516728)
chr8 (1-339)||(45538379-45538715)
chr8 (1-338)||(40845329-40845663)
chr8 (1-397)||(1237512-1237909)
chr8 (1-383)||(22673653-22674036)
chr8 (1-190)||(25163945-25164134)
chr8 (8-339)||(24551156-24551485)
chr8 (1-383)||(9320444-9320828)
chr8 (1-397)||(36105072-36105467)
chr8 (1-261)||(18685412-18685672)
chr8 (1-321)||(18730947-18731266)
chr8 (182-383)||(20255460-20255660)
chr8 (1-244)||(19956374-19956613)
chr8 (1-397)||(22662991-22663388)
chr8 (1-210)||(14989518-14989727)
chr8 (233-379)||(22745594-22745742)
chr8 (1-339)||(24832996-24833332)
chr8 (1-339)||(6407601-6407927)
chr8 (1-206)||(13430699-13430904)
chr8 (125-321)||(18722602-18722798)
chr8 (1-223)||(45567955-45568177)
chr8 (1-185)||(43639657-43639842)
chr8 (16-210)||(18151713-18151908)
chr8 (1-299)||(22461617-22461913)
chr8 (1-128)||(45292710-45292837)
chr8 (1-185)||(21288277-21288462)
chr8 (1-223)||(21540827-21541041)
chr8 (6-162)||(28903340-28903495)
chr8 (9-206)||(33560295-33560484)
chr8 (1-113)||(20255675-20255787)
chr8 (6-157)||(23271239-23271390)
chr8 (6-157)||(7018416-7018566)
chr8 (6-162)||(17519173-17519329)
chr8 (1-181)||(1745032-1745215)
chr8 (11-157)||(3843623-3843768)
chr8 (84-185)||(21300980-21301081)
chr8 (6-154)||(8031914-8032062)
chr8 (11-157)||(20259652-20259797)
chr8 (11-157)||(21046282-21046427)
chr8 (1-71)||(26832912-26832982)
chr8 (1-58)||(21298887-21298944)
chr8 (32-157)||(29379484-29379609)
chr8 (6-65)||(2810689-2810748)
chr8 (283-339)||(3598286-3598340)
chr8 (32-153)||(19461070-19461190)
chr8 (32-153)||(19558748-19558868)
chr8 (11-116)||(22135934-22136038)
chr8 (1-162)||(40003104-40003265)
chr8 (9-58)||(43774002-43774051)
chr8 (11-67)||(22167147-22167203)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (1-383)||(17814847-17815229)
chr5 (1-353)||(21910435-21910787)
chr5 (1-397)||(7745555-7745951)
chr5 (1-353)||(89328-89680)
chr5 (1-353)||(6512337-6512686)
chr5 (1-353)||(23412880-23413234)
chr5 (9-367)||(21072131-21072490)
chr5 (6-383)||(19536176-19536553)
chr5 (6-353)||(41566338-41566687)
chr5 (1-353)||(26784233-26784587)
chr5 (1-334)||(20550773-20551107)
chr5 (1-353)||(33022547-33022895)
chr5 (1-382)||(23880946-23881328)
chr5 (1-383)||(21099579-21099962)
chr5 (9-324)||(13545455-13545762)
chr5 (1-354)||(6499118-6499471)
chr5 (1-383)||(642582-642960)
chr5 (6-348)||(31117761-31118102)
chr5 (1-354)||(21198910-21199261)
chr5 (1-339)||(4886901-4887237)
chr5 (1-339)||(29138330-29138664)
chr5 (6-353)||(9398649-9398987)
chr5 (1-333)||(30742860-30743189)
chr5 (1-339)||(11993767-11994103)
chr5 (1-339)||(15516849-15517184)
chr5 (1-209)||(12352845-12353053)
chr5 (1-339)||(42243560-42243896)
chr5 (1-306)||(25096777-25097083)
chr5 (1-306)||(25154747-25155053)
chr5 (1-397)||(26759029-26759425)
chr5 (1-339)||(3245364-3245699)
chr5 (1-397)||(33933147-33933547)
chr5 (7-233)||(30115863-30116089)
chr5 (1-258)||(26765378-26765634)
chr5 (1-209)||(28464389-28464597)
chr5 (1-324)||(14086474-14086796)
chr5 (1-253)||(28139486-28139738)
chr5 (7-209)||(10848658-10848860)
chr5 (1-235)||(32160645-32160879)
chr5 (1-206)||(35932059-35932264)
chr5 (15-210)||(25930205-25930400)
chr5 (1-210)||(9088848-9089057)
chr5 (9-185)||(21660098-21660275)
chr5 (1-206)||(35986284-35986490)
chr5 (6-183)||(23391679-23391858)
chr5 (1-109)||(21203796-21203904)
chr5 (1-234)||(11208011-11208243)
chr5 (1-162)||(25111975-25112136)
chr5 (1-162)||(25171066-25171227)
chr5 (6-162)||(1915302-1915457)
chr5 (1-81)||(13736310-13736390)
chr5 (1-64)||(25741002-25741065)
chr5 (6-157)||(40228544-40228694)
chr5 (1-162)||(23478248-23478409)
chr5 (6-162)||(20215213-20215369)
chr5 (6-156)||(40032869-40033018)
chr5 (1-95)||(41566693-41566787)
chr5 (6-154)||(13405001-13405148)
chr5 (6-157)||(20417022-20417172)
chr5 (11-157)||(21414193-21414338)
chr5 (224-339)||(5429985-5430099)
chr5 (1-78)||(16607392-16607469)
chr5 (1-65)||(23488394-23488458)
chr5 (11-157)||(106239-106384)
chr5 (138-214)||(16607528-16607603)
chr5 (319-383)||(12352692-12352758)
chr5 (34-157)||(32753963-32754085)
chr5 (6-65)||(34638340-34638399)
chr5 (11-157)||(13533806-13533951)
chr5 (242-339)||(25930087-25930182)
chr5 (283-339)||(30115798-30115852)
chr5 (11-116)||(36095812-36095916)
chr5 (11-116)||(36097269-36097373)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (1-383)||(377403-377787)
scaffold0004 (1-383)||(220121-220504)
scaffold0004 (1-257)||(244256-244510)
scaffold0004 (1-353)||(211283-211631)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-397)||(1573-1969)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (1-383)||(59899-60281)
scaffold0026 (1-353)||(7809-8161)
scaffold0026 (305-383)||(115708-115786)
scaffold0026 (329-383)||(151734-151788)
scaffold0026 (269-306)||(151794-151831)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (1-379)||(10883072-10883452)
chr7 (1-342)||(13137833-13138174)
chr7 (1-383)||(16316454-16316836)
chr7 (1-375)||(11319284-11319660)
chr7 (1-342)||(13302690-13303030)
chr7 (1-382)||(13879983-13880366)
chr7 (1-342)||(2913546-2913887)
chr7 (1-375)||(11792786-11793162)
chr7 (6-397)||(21283256-21283647)
chr7 (21-367)||(29935272-29935617)
chr7 (1-382)||(12366646-12367027)
chr7 (1-353)||(21695280-21695634)
chr7 (8-353)||(21692173-21692517)
chr7 (1-339)||(33691653-33691991)
chr7 (1-353)||(44466942-44467298)
chr7 (1-383)||(28408918-28409301)
chr7 (1-383)||(9069441-9069826)
chr7 (1-327)||(13730628-13730954)
chr7 (1-353)||(30025784-30026138)
chr7 (1-318)||(2499917-2500234)
chr7 (1-353)||(30945285-30945635)
chr7 (9-352)||(30944253-30944594)
chr7 (6-383)||(13260520-13260889)
chr7 (14-353)||(24788033-24788372)
chr7 (111-383)||(22577918-22578190)
chr7 (1-339)||(23279900-23280238)
chr7 (1-383)||(15467795-15468179)
chr7 (78-353)||(13648685-13648960)
chr7 (1-313)||(5000788-5001101)
chr7 (1-339)||(28622299-28622635)
chr7 (110-342)||(15088508-15088740)
chr7 (1-304)||(16111860-16112163)
chr7 (1-353)||(331524-331877)
chr7 (1-353)||(9709729-9710081)
chr7 (1-353)||(39284490-39284843)
chr7 (1-226)||(16309961-16310186)
chr7 (1-345)||(41842209-41842552)
chr7 (1-353)||(48236829-48237183)
chr7 (1-353)||(14426426-14426776)
chr7 (1-364)||(13018421-13018784)
chr7 (1-339)||(35952630-35952967)
chr7 (143-382)||(13692372-13692602)
chr7 (8-302)||(19237022-19237313)
chr7 (27-251)||(14193019-14193243)
chr7 (1-339)||(4821353-4821688)
chr7 (1-353)||(33605565-33605917)
chr7 (1-339)||(2265462-2265797)
chr7 (1-339)||(8182809-8183144)
chr7 (1-263)||(12174357-12174619)
chr7 (1-209)||(48062891-48063099)
chr7 (6-132)||(13683479-13683605)
chr7 (9-234)||(19711059-19711285)
chr7 (1-258)||(1292909-1293157)
chr7 (1-206)||(19339324-19339529)
chr7 (1-173)||(4494456-4494628)
chr7 (1-338)||(14425326-14425651)
chr7 (1-134)||(13033988-13034121)
chr7 (148-324)||(16542978-16543152)
chr7 (148-324)||(16622510-16622684)
chr7 (1-336)||(15704445-15704768)
chr7 (137-302)||(13880603-13880768)
chr7 (6-112)||(16314708-16314814)
chr7 (1-206)||(27871597-27871803)
chr7 (2-182)||(24794813-24794994)
chr7 (1-243)||(9098283-9098514)
chr7 (106-321)||(13893958-13894171)
chr7 (139-306)||(13032046-13032213)
chr7 (7-123)||(16545840-16545956)
chr7 (7-123)||(16619706-16619822)
chr7 (1-206)||(21381502-21381708)
chr7 (1-122)||(13472667-13472787)
chr7 (250-334)||(4494634-4494718)
chr7 (195-304)||(13472555-13472665)
chr7 (1-182)||(32264816-32264998)
chr7 (9-206)||(48805953-48806151)
chr7 (1-89)||(15088428-15088516)
chr7 (1-100)||(2266502-2266601)
chr7 (1-163)||(4412079-4412242)
chr7 (6-157)||(8999014-8999164)
chr7 (1-102)||(9099219-9099320)
chr7 (289-383)||(14193241-14193337)
chr7 (6-157)||(11087124-11087274)
chr7 (167-254)||(16556664-16556751)
chr7 (8-95)||(16556774-16556861)
chr7 (8-95)||(16608801-16608888)
chr7 (167-254)||(16608911-16608998)
chr7 (11-157)||(12734247-12734392)
chr7 (11-157)||(18441270-18441415)
chr7 (11-157)||(26209629-26209774)
chr7 (11-157)||(29590067-29590212)
chr7 (6-185)||(602648-602828)
chr7 (34-157)||(3476421-3476543)
chr7 (6-65)||(13174777-13174836)
chr7 (34-157)||(15216414-15216536)
chr7 (271-324)||(7339832-7339883)
chr7 (11-157)||(18419189-18419334)
chr7 (333-383)||(19236907-19236957)
chr7 (1-65)||(7488119-7488183)
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (1-322)||(37985525-37985846)
chr4 (1-381)||(16632317-16632697)
chr4 (1-397)||(37435373-37435769)
chr4 (1-367)||(29680410-29680778)
chr4 (1-383)||(12811028-12811409)
chr4 (1-383)||(45833271-45833655)
chr4 (1-353)||(55380167-55380519)
chr4 (1-319)||(19666249-19666567)
chr4 (1-342)||(3395467-3395808)
chr4 (1-383)||(14604758-14605138)
chr4 (1-334)||(19620962-19621295)
chr4 (1-342)||(14904249-14904590)
chr4 (1-339)||(19884580-19884916)
chr4 (1-324)||(22675433-22675755)
chr4 (41-309)||(9140829-9141097)
chr4 (1-353)||(19911760-19912115)
chr4 (1-353)||(56034451-56034803)
chr4 (1-383)||(6641561-6641942)
chr4 (1-324)||(10072812-10073134)
chr4 (122-368)||(12601099-12601345)
chr4 (1-339)||(10692728-10693064)
chr4 (1-339)||(10906494-10906830)
chr4 (1-353)||(13575996-13576348)
chr4 (1-353)||(54679805-54680157)
chr4 (1-357)||(23750399-23750755)
chr4 (28-383)||(40846003-40846360)
chr4 (1-353)||(3483607-3483952)
chr4 (1-353)||(412878-413231)
chr4 (1-383)||(17247120-17247503)
chr4 (1-304)||(29121246-29121550)
chr4 (1-339)||(6517362-6517698)
chr4 (1-397)||(8105515-8105913)
chr4 (1-323)||(17398598-17398908)
chr4 (1-353)||(3105304-3105653)
chr4 (177-352)||(14833449-14833626)
chr4 (1-125)||(12600635-12600759)
chr4 (1-259)||(11915578-11915835)
chr4 (1-223)||(16853380-16853602)
chr4 (1-263)||(56533033-56533295)
chr4 (4-255)||(25651084-25651335)
chr4 (1-206)||(22190723-22190928)
chr4 (1-259)||(17540273-17540530)
chr4 (1-258)||(16939893-16940150)
chr4 (1-206)||(40860544-40860749)
chr4 (9-182)||(39419787-39419961)
chr4 (221-363)||(23123528-23123672)
chr4 (180-376)||(15139283-15139482)
chr4 (9-183)||(20977341-20977516)
chr4 (1-132)||(23123396-23123527)
chr4 (1-259)||(41114746-41115003)
chr4 (9-185)||(38513762-38513939)
chr4 (9-183)||(27188690-27188866)
chr4 (9-183)||(3499704-3499879)
chr4 (9-185)||(15475193-15475370)
chr4 (6-123)||(44397733-44397850)
chr4 (9-206)||(9751569-9751767)
chr4 (9-185)||(1672273-1672450)
chr4 (9-185)||(1674748-1674925)
chr4 (1-151)||(16848424-16848574)
chr4 (9-134)||(17700866-17700992)
chr4 (1-169)||(8685509-8685676)
chr4 (1-214)||(17788067-17788278)
chr4 (6-162)||(36210131-36210287)
chr4 (15-213)||(14154015-14154214)
chr4 (6-154)||(14778473-14778620)
chr4 (1-209)||(33378288-33378488)
chr4 (1-116)||(55731722-55731837)
chr4 (11-157)||(18007087-18007232)
chr4 (188-324)||(55731844-55731977)
chr4 (6-154)||(17993824-17993971)
chr4 (1-259)||(11901066-11901322)
chr4 (34-157)||(55651455-55651577)
chr4 (1-50)||(15014572-15014621)
chr4 (6-154)||(14710809-14710956)
chr4 (11-157)||(11535953-11536098)
chr4 (269-376)||(22089733-22089841)
chr4 (6-103)||(19242129-19242226)
chr4 (11-157)||(10300642-10300787)
chr4 (11-157)||(11515143-11515288)
chr4 (11-157)||(49001985-49002130)
chr4 (283-339)||(14571183-14571237)
chr4 (34-157)||(24713562-24713683)
chr4 (11-117)||(16819420-16819525)
chr4 (329-367)||(17540632-17540670)
chr4 (11-157)||(31266804-31266949)
chr4 (329-367)||(41114604-41114642)
chr4 (11-116)||(18774724-18774828)
[»] chr3 (102 HSPs)
chr3 (1-380)||(49642658-49643039)
chr3 (1-382)||(31303268-31303651)
chr3 (1-353)||(37467215-37467567)
chr3 (6-383)||(13948223-13948602)
chr3 (1-383)||(20646036-20646421)
chr3 (1-383)||(14392899-14393281)
chr3 (1-379)||(29951335-29951715)
chr3 (1-379)||(30000489-30000869)
chr3 (1-339)||(2561070-2561408)
chr3 (1-353)||(12963010-12963362)
chr3 (1-383)||(15903080-15903465)
chr3 (1-353)||(16658541-16658895)
chr3 (1-353)||(38177566-38177920)
chr3 (1-383)||(28581988-28582373)
chr3 (4-353)||(17238847-17239196)
chr3 (1-367)||(49553400-49553766)
chr3 (1-383)||(6090614-6090998)
chr3 (1-383)||(52920290-52920671)
chr3 (1-353)||(19888869-19889220)
chr3 (1-353)||(47405346-47405698)
chr3 (1-287)||(13780575-13780861)
chr3 (1-353)||(20627356-20627708)
chr3 (15-299)||(41494895-41495179)
chr3 (1-342)||(18121558-18121891)
chr3 (1-353)||(40799756-40800108)
chr3 (1-353)||(12726155-12726507)
chr3 (1-353)||(16032407-16032757)
chr3 (1-353)||(18142677-18143021)
chr3 (1-353)||(47207588-47207941)
chr3 (1-253)||(22804048-22804300)
chr3 (14-313)||(13823973-13824263)
chr3 (1-397)||(14955310-14955706)
chr3 (1-324)||(11223446-11223766)
chr3 (1-397)||(2784947-2785344)
chr3 (1-324)||(24775490-24775810)
chr3 (1-383)||(20724970-20725350)
chr3 (1-397)||(33583112-33583510)
chr3 (138-342)||(14969346-14969550)
chr3 (1-383)||(46349738-46350120)
chr3 (1-383)||(53056621-53057004)
chr3 (6-353)||(22140651-22140996)
chr3 (1-306)||(12388845-12389149)
chr3 (1-383)||(25398168-25398532)
chr3 (1-306)||(19249385-19249688)
chr3 (1-367)||(5213460-5213822)
chr3 (1-324)||(29855291-29855613)
chr3 (1-339)||(21640749-21641084)
chr3 (1-339)||(49666356-49666682)
chr3 (1-185)||(11868151-11868335)
chr3 (1-206)||(21605726-21605931)
chr3 (1-206)||(21636742-21636947)
chr3 (1-263)||(50300115-50300367)
chr3 (1-130)||(17668288-17668417)
chr3 (1-185)||(30054310-30054494)
chr3 (1-324)||(46796333-46796644)
chr3 (9-164)||(1728129-1728285)
chr3 (9-183)||(9700131-9700306)
chr3 (1-206)||(40850859-40851055)
chr3 (1-223)||(11909079-11909303)
chr3 (9-259)||(23538185-23538434)
chr3 (1-223)||(12752683-12752897)
chr3 (1-223)||(51340893-51341107)
chr3 (1-320)||(12968189-12968506)
chr3 (188-353)||(11869137-11869302)
chr3 (9-128)||(3238584-3238703)
chr3 (1-90)||(16812095-16812184)
chr3 (1-157)||(45861693-45861849)
chr3 (6-259)||(26417698-26417948)
chr3 (6-162)||(10529234-10529389)
chr3 (1-209)||(15833288-15833486)
chr3 (9-164)||(37412494-37412650)
chr3 (1-84)||(14969249-14969332)
chr3 (1-209)||(15850891-15851092)
chr3 (11-157)||(2246456-2246601)
chr3 (11-157)||(16077018-16077163)
chr3 (11-157)||(31113987-31114132)
chr3 (32-154)||(41045657-41045778)
chr3 (11-157)||(29933559-29933705)
chr3 (11-157)||(29982713-29982859)
chr3 (152-223)||(45858804-45858875)
chr3 (1-116)||(49990143-49990258)
chr3 (6-157)||(51989144-51989295)
chr3 (1-65)||(13148148-13148212)
chr3 (6-126)||(22151133-22151253)
chr3 (34-157)||(27883495-27883617)
chr3 (327-383)||(41495182-41495240)
chr3 (11-157)||(1064227-1064372)
chr3 (11-157)||(29906181-29906326)
chr3 (11-157)||(29947346-29947491)
chr3 (11-157)||(29996500-29996645)
chr3 (11-157)||(13199243-13199390)
chr3 (1-65)||(6253301-6253365)
chr3 (283-397)||(33598015-33598130)
chr3 (11-65)||(15651162-15651216)
chr3 (11-65)||(15662797-15662851)
chr3 (359-397)||(21636574-21636612)
chr3 (28-65)||(12396978-12397015)
chr3 (283-339)||(21605604-21605658)
chr3 (335-383)||(12388751-12388799)
chr3 (339-383)||(13824254-13824298)
chr3 (335-383)||(16199704-16199752)
chr3 (1-65)||(22766736-22766800)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (1-383)||(25819-26203)
scaffold0083 (151-282)||(44651-44782)
[»] scaffold0084 (5 HSPs)
scaffold0084 (1-368)||(49215-49584)
scaffold0084 (6-353)||(32373-32722)
scaffold0084 (110-223)||(351-464)
scaffold0084 (1-134)||(466-599)
scaffold0084 (11-157)||(56822-56967)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (6-383)||(363-742)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-383)||(18465-18849)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (1-383)||(13602055-13602439)
chr6 (1-353)||(15302083-15302435)
chr6 (1-383)||(9717726-9718110)
chr6 (1-383)||(23284447-23284831)
chr6 (1-383)||(24116711-24117095)
chr6 (1-342)||(20112624-20112966)
chr6 (9-353)||(12715333-12715678)
chr6 (1-367)||(19623862-19624228)
chr6 (1-324)||(32544148-32544471)
chr6 (1-321)||(15987116-15987437)
chr6 (4-334)||(14100373-14100701)
chr6 (1-380)||(15531509-15531890)
chr6 (1-353)||(26972140-26972492)
chr6 (1-300)||(18378196-18378496)
chr6 (1-342)||(19086041-19086372)
chr6 (1-381)||(21624984-21625363)
chr6 (51-383)||(13435465-13435799)
chr6 (1-352)||(29917900-29918250)
chr6 (1-353)||(18435439-18435793)
chr6 (1-353)||(16265064-16265416)
chr6 (1-324)||(20730649-20730970)
chr6 (1-339)||(20487847-20488184)
chr6 (1-353)||(22802024-22802376)
chr6 (1-339)||(16336010-16336346)
chr6 (1-383)||(19470554-19470934)
chr6 (1-339)||(21618126-21618463)
chr6 (1-261)||(26943459-26943719)
chr6 (25-339)||(16877120-16877432)
chr6 (32-350)||(19688689-19688996)
chr6 (1-324)||(15954589-15954907)
chr6 (1-339)||(19832962-19833298)
chr6 (1-339)||(22076337-22076673)
chr6 (1-205)||(25593951-25594155)
chr6 (197-383)||(25597558-25597746)
chr6 (1-256)||(12423144-12423399)
chr6 (1-222)||(21235007-21235229)
chr6 (148-340)||(34451595-34451787)
chr6 (74-302)||(10640384-10640611)
chr6 (1-256)||(33351939-33352192)
chr6 (40-324)||(12348915-12349196)
chr6 (1-206)||(19066079-19066284)
chr6 (1-195)||(17381405-17381598)
chr6 (9-183)||(17316609-17316784)
chr6 (9-183)||(19482642-19482817)
chr6 (1-162)||(20635602-20635763)
chr6 (4-104)||(16915309-16915409)
chr6 (6-157)||(7586268-7586418)
chr6 (1-224)||(14051425-14051647)
chr6 (32-157)||(25686761-25686885)
chr6 (1-157)||(17608417-17608572)
chr6 (1-157)||(21128110-21128265)
chr6 (9-185)||(26589489-26589667)
chr6 (1-162)||(22386685-22386846)
chr6 (1-224)||(14070106-14070328)
chr6 (15-154)||(25675204-25675342)
chr6 (15-154)||(25735573-25735711)
chr6 (11-157)||(9933683-9933828)
chr6 (11-157)||(11205985-11206130)
chr6 (245-324)||(21235240-21235317)
chr6 (11-157)||(4292765-4292910)
chr6 (11-157)||(11235538-11235683)
chr6 (11-157)||(18826250-18826395)
chr6 (34-157)||(17741714-17741836)
chr6 (34-157)||(18834646-18834768)
chr6 (6-65)||(19452722-19452781)
chr6 (15-154)||(25679280-25679418)
chr6 (34-158)||(17745793-17745916)
chr6 (1-65)||(23006251-23006315)
chr6 (1-65)||(23782051-23782115)
chr6 (1-78)||(19625691-19625769)
chr6 (1-59)||(19875715-19875773)
chr6 (359-397)||(22076291-22076329)
chr6 (1-71)||(23296606-23296676)
chr6 (138-214)||(25930493-25930568)
chr6 (29-65)||(30451738-30451774)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-383)||(5536-5918)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-383)||(19318-19700)
scaffold0035 (1-397)||(99039-99433)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-383)||(12092-12476)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-383)||(20815-21199)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-383)||(212240-212620)
scaffold0005 (177-352)||(6073-6250)
scaffold0005 (6-154)||(61110-61257)
scaffold0005 (283-339)||(246139-246193)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (1-353)||(1543-1895)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (1-339)||(9997-10336)
scaffold0161 (1-185)||(14816-15000)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (4-353)||(15003-15352)
[»] scaffold0193 (3 HSPs)
scaffold0193 (7-334)||(15682-16011)
scaffold0193 (343-382)||(16005-16044)
scaffold0193 (8-71)||(16298-16361)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-353)||(7588-7940)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (7-286)||(13460-13739)
scaffold0426 (310-353)||(13818-13861)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-353)||(27305-27657)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-353)||(9852-10204)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (1-342)||(18914-19255)
scaffold0217 (1-397)||(21962-22359)
scaffold0217 (77-339)||(9519-9778)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (1-353)||(22559-22913)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-353)||(5890-6241)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-367)||(103454-103821)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (83-383)||(4791-5093)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-338)||(9839-10176)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (106-383)||(36619-36898)
scaffold0120 (106-383)||(42107-42386)
scaffold0120 (1-59)||(36904-36962)
scaffold0120 (1-59)||(42043-42101)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-353)||(89931-90283)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-367)||(9786-10151)
scaffold0047 (177-352)||(30283-30460)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (1-383)||(215342-215725)
scaffold0012 (15-157)||(127721-127862)
scaffold0012 (6-154)||(7693-7841)
scaffold0012 (40-157)||(140905-141021)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (1-324)||(1606-1927)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-339)||(78258-78594)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-339)||(60686-61022)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-353)||(142980-143325)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (1-353)||(533-883)
scaffold1359 (15-338)||(1658-1969)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (1-397)||(6571-6968)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (9-197)||(2027-2212)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (183-383)||(632-832)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (148-383)||(9825-10060)
scaffold0334 (1-152)||(7707-7858)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-323)||(5510-5830)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-397)||(3189-3584)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (15-339)||(9052-9373)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (1-383)||(36031-36410)
scaffold0056 (9-206)||(34827-35024)
scaffold0056 (6-383)||(25519-25888)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-321)||(43828-44146)
scaffold0064 (329-383)||(43749-43803)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (40-306)||(158977-159242)
scaffold0022 (181-353)||(39488-39662)
scaffold0022 (181-353)||(137548-137722)
scaffold0022 (1-179)||(37285-37463)
scaffold0022 (1-179)||(135345-135523)
scaffold0022 (335-383)||(159288-159336)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (1-321)||(40522-40839)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (1-258)||(2702-2958)
scaffold0280 (9-162)||(17873-18026)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-209)||(17785-17993)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-219)||(74464-74682)
scaffold0025 (269-397)||(74718-74846)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (1-211)||(1201-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (1-211)||(1-210)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-259)||(1491-1748)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-228)||(38086-38312)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (1-158)||(9789-9946)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (1-182)||(2738-2919)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-339)||(7048-7386)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-200)||(850-1048)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-259)||(5511-5767)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (15-235)||(25393-25614)
scaffold0247 (15-157)||(15811-15954)
scaffold0247 (242-339)||(23455-23549)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-152)||(84278-84429)
scaffold0009 (4-65)||(268667-268728)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (9-185)||(7271-7448)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (297-397)||(9238-9338)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (234-383)||(4837-4988)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-223)||(1803-2027)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-185)||(87644-87828)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (6-183)||(610-789)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (75-235)||(164940-165100)
scaffold0011 (172-339)||(65321-65485)
scaffold0011 (172-339)||(144366-144530)
scaffold0011 (1-134)||(65501-65633)
scaffold0011 (1-134)||(144546-144678)
scaffold0011 (7-65)||(59445-59503)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-157)||(5397-5553)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (234-353)||(5813-5935)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-155)||(5889-6043)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (47-223)||(15628-15804)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (7-152)||(2873-3016)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (1-162)||(1002-1163)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (1-162)||(1195-1356)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-162)||(16838-16999)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-162)||(6589-6750)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (149-339)||(7963-8150)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (6-154)||(40388-40536)
scaffold0017 (6-115)||(58973-59082)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (1-123)||(10602-10725)
scaffold0207 (1-123)||(20503-20626)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (1-185)||(7167-7352)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (6-162)||(61620-61776)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (4-162)||(1739-1897)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-185)||(3939-4124)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-78)||(1945-2022)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-162)||(20444-20604)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (6-157)||(40568-40718)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-58)||(3113-3164)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (6-116)||(1118-1227)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (1-162)||(5000-5161)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-65)||(144789-144853)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (6-162)||(475317-475473)
scaffold0002 (6-162)||(481837-481993)
scaffold0002 (1-65)||(156790-156854)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (299-369)||(13391-13462)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (7-78)||(462-533)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (299-367)||(60729-60799)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (11-157)||(12156-12301)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (11-157)||(35608-35753)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (11-157)||(5366-5511)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (11-116)||(1276-1380)
scaffold0752 (11-116)||(1891-1995)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-162)||(11644-11804)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (11-116)||(58372-58476)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (7-67)||(12087-12147)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (11-117)||(789-894)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-65)||(31948-32012)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 48704086 - 48704482
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48704086 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcacagtatgtaggaacattgttgcaggcagaattgtt 48704185  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48704186 atcattgtcttgtagcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatc 48704285  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48704286 cagtgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 48704385  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48704386 aagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatctagcttctgatgagatgcttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 48704482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33256549 - 33256170
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33256549 atcaccaatgatcttttgcctgatatgattattttcctatgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 33256450  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33256449 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatc 33256350  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33256349 caatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 33256250  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgat 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33256249 aagtcttgcatctcctgttgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33256170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33276721 - 33276342
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33276721 atcaccaatgatcttttgcctgatatgattattttcctatgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 33276622  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33276621 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatc 33276522  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33276521 caatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 33276422  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgat 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33276421 aagtcttgcatctcctggtgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 33276342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 1577749 - 1578115
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1577749 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaagaatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctggt 1577848  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1577849 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatc 1577948  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  1577949 caatgctttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctct 1578048  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1578049 aagtcttgcatctcctgataaactttagcttcttgtgatcttgcttctgacgagatgtttctgatga 1578115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 19717406 - 19717788
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || | ||    
T  19717406 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcagtcatagctttt 19717505  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||| |  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19717506 attcttgtcttttagcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 19717605  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19717606 cgatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 19717705  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  19717706 aagtcttgcatctccatatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttatgatgac 19717788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20954671 - 20954287
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20954671 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcggggttgtt 20954572  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20954571 atccttgtcttgtagcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctc 20954472  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20954471 caatgctttcaaatcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 20954372  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20954371 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgaatctgatgac 20954287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28492602 - 28492248
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  28492602 atcaccaatgatattttgcctgatatggttattatcctatgaatgatcaaattcaaattcattcccagtatgtaagaacattgttgcaggcagagctatt 28492503  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28492502 attcttgtctagtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatc 28492403  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28492402 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 28492303  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  28492302 aagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatga 28492248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22201934 - 22201601
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22201934 atcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaagcagagttgct 22201835  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22201834 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatc 22201735  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | || ||||||  |||||    
T  22201734 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgcttt 22201635  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22201634 aagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22600370 - 22599997
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||    
T  22600370 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagttgtttttcttgtct 22600271  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 210  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  22600270 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttc 22600171  T
Q  211 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgca 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22600170 aaatcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgca 22600071  T
Q  311 tctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  22600070 tctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 22599997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 10757303 - 10757656
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10757303 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacaatgctgcaggcagagctgtt 10757402  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10757403 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatc 10757502  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10757503 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctt 10757602  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  10757603 taagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttgatgatcttgcttctgatga 10757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 12284305 - 12284704
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  12284305 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcatatgaagaatcaatttcaaatcctttcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagatatatt 12284404  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12284405 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 12284504  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  12284505 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctct 12284604  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagat---gtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |   | ||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  12284605 aagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaacttgcttctgatga 12284704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 22153739 - 22154123
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||| | |||||||||    
T  22153739 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcctattgtgatggaacatttttgcatgtagagttgtt 22153838  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22153839 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatc 22153938  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22153939 caatgctttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 22154038  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||    
T  22154039 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatgagatgcttctaaggaacttgcttctaatgac 22154123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 38282449 - 38282831
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||| | ||    
T  38282449 atcaccaatgaccttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaagcagagctatt 38282548  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  38282549 tttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatt 38282647  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38282648 caatgcctttaaatcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 38282747  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  38282748 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 38282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 1900227 - 1900581
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1900227 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatccccattgtgaaggaatattgttgcaggcagagctgtt 1900326  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  1900327 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatt 1900426  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1900427 caatgcctttaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagcttt 1900526  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  1900527 aagtcttgcatctcctgatgaactagatcttctggcgatctttagcttctgatga 1900581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 30892975 - 30893327
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30892975 atcaccaatgatctttcgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaaaccattcc-agtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 30893073  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30893074 atccttgtcttgtagtagagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatc 30893173  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |||| ||||||||||  | |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||    
T  30893174 tagtgctttcaaatcctttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactt 30893273  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30893274 taagtcttgcatctcctgatgaactttagcttttggtgatcttgcttctgatga 30893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32786135 - 32785798
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  32786135 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaagcagagctgtt 32786036  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| |||| |||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32786035 tttcttgtcttttagcggagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatc 32785936  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32785935 caatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagcttt 32785837  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  32785836 aagtcttgcatctcatgatgaactacaacttctagtgat 32785798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 35401690 - 35402072
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  35401690 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatatattcccattgtgaaggaacatcgttgtaggcagagctgtt 35401789  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35401790 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcat 35401889  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35401890 ccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctt 35401989  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||   | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35401990 taagtcttgcatcttctgatgagac---agcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 35402072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 2268413 - 2268793
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||| |||||||| | || ||||    
T  2268413 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctccaaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggtaaagctgtt 2268512  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  2268513 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcatt 2268612  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2268613 caatgccttcaaatcatttcaaaata---gttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcctt 2268709  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtga-tcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2268710 aagtcttgcatctcctaatgaactttagcttctagtgattgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 2268793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 36134072 - 36134391
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36134072 atcaccaattatctttttcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaattttaaatccattccacttatgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 36134171  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36134172 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 36134271  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36134272 caatg-cttcaaatcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaacttt 36134370  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  36134371 aagtcttgtatcttctgatga 36134391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26702327 - 26701986
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  26702327 atcaccaatgatcttttgccggatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 26702228  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |||    
T  26702227 attcttgtcttgtagcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatc 26702128  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| | | ||  || || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26702127 caatgccttcaacttcatttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagcttt 26702028  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26702027 aagtctcccatcttctgatgaactttagcttctggtgatctt 26701986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22427555 - 22427203
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | || |||||||| |||||||||| || ||||    
T  22427555 atcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctgtt 22427456  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22427455 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatc 22427356  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  22427355 caatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttt 22427256  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22427255 a--tgttgcatctcctgatgaactggagcttctggtgattttcagcttctgatga 22427203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22465007 - 22464670
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  22465007 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtt 22464908  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22464907 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 22464808  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  22464807 caatgccttcaaatcatttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagctt 22464708  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||  | || |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  22464707 ta--tgttacatctcctgatgaactgtagcatctggtgat 22464670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 29215679 - 29216031
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29215679 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatatattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 29215778  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | || ||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  29215779 tttcttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatc 29215878  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29215879 caatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagcttt 29215978  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  29215979 aag--ttgcatctcctgatgaattgcaacttctggtgattttcagcttctgatga 29216031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 2266971 - 2267321
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| | || ||||||||  |||||| || || ||||    
T  2266971 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctttgcagacaaagctgtt 2267070  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| ||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  2267071 tttcttgtcttgtagtagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatc 2267170  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2267171 caatgccttcaaattctttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 2267270  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |  | ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  2267271 a--tgttgcatctcctgatgaactgtagcttctgatgaacttgcttctaatga 2267321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23036727 - 23036344
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23036727 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagctgtt 23036628  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa--ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  |  ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  23036627 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaacaaagtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagca 23036528  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  23036527 tccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagct 23036428  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||   | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  23036427 ttaagtcttgcatcttctgatgagac---agcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaaattgcttctgatga 23036344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39201188 - 39200869
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | || || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  39201188 atcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggataaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacatcgttgcaggcagagctgtt 39201089  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     |   ||| |||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39201088 ttt--tgtgttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 39200991  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  39200990 caatgtcttcaaatcctttcaaactagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttt 39200891  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |  | ||||||||||| |||||||    
T  39200890 a--tgttgcatctcctaatgaact 39200869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 21028676 - 21029029
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  21028676 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagttgt- 21028774  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  21028775 attcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatc 21028874  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  21028875 caatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagcttt 21028974  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||  ||| | || ||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21028975 aagtctctcatattctaatgatattcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21029029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16235494 - 16235142
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |  |  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16235494 atcaccaatgattttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatttcaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtt 16235395  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||     
T  16235394 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcatt 16235295  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16235294 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagtttt 16235195  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    || ||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16235194 aaatcttgcatcttatgatgagac---aacttctggtgatcttcagcttctgatga 16235142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25448764 - 25448443
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| || ||||    
T  25448764 atcatcaatgattctttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctgtt 25448665  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25448664 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatc 25448565  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  25448564 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 25448465  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||  |||||||| ||||||||||    
T  25448464 aag--ttgcatcttctgatgaact 25448443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21192063 - 21191693
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||   |||||| ||| || ||||    
T  21192063 atcaccaataatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatttccaatatgaaggaaccccgttgcaagcatagctgtt 21191964  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21191963 attcttgtcctgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatc 21191864  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||   || |||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  21191863 caatgccttcaaatccttttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagcttt 21191765  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||       || ||    ||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  21191764 aa-------atgtc----tgaacttcagcttcttgtgatattgtttctgatgagatgcttcagatgaacttgcttctgatgac 21191693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 2834571 - 2834908
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || || ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  2834571 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatcgttgcagacagagctgtt 2834670  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacaca-aactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  2834671 tttcttgtcttgtagcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcat 2834770  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  2834771 ccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctt 2834870  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  2834871 taag--ttgcatctcccgatgaactgcagcttctggtgat 2834908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 7309702 - 7310068
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |  | ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  7309702 atcaccaatgatctttcgcctgatatggttgttgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattccaattgggaaggaacattgttgcacgcagaactgtt 7309801  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||| |||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || || |||| ||||||    
T  7309802 tttcttgtcttgtagcagatacacaa-cagagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttttgaa-gaacgagcatc 7309899  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | || | | |||||||| |||| | |||||||||||    
T  7309900 caatgccttcaaatccctacaaaatgaccgttgcttcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagcttt 7309999  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7310000 aagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatggtgatcttcagcttctgatgagatgtttctgatga 7310068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2327638 - 2327240
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| | || |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  2327638 atcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctaagaaggattaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaagcagagctgtt 2327539  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| || | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||  | ||||||||||    
T  2327538 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcat 2327439  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||  ||| | ||| || |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  2327438 ccaatgcgttcgaatcctttcaaaatagtttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctt 2327339  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatg 396  Q
    ||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||  |  || |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  2327338 taag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttttgatgaacttgcttctgatg 2327241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 35040048 - 35040351
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||| | ||||||||||||| | ||    
T  35040048 atcaccaatggtcttttgtctgatatagttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacgtcgttgcaggcagagctttt 35040147  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  35040148 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatc 35040247  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||| | ||| ||  ||||||| |||||| |||||||| ||    
T  35040248 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagcctt 35040347  T
Q  301 aagt 304  Q
    ||||    
T  35040348 aagt 35040351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 30572079 - 30572414
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30572079 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgagttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 30572178  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  30572179 tttcttgtcttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatc 30572278  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| || | | ||| || ||||| |  |||| |  ||||||||||    
T  30572279 caatgcttttcaatcctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagcttt 30572377  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30572378 aag--ttgtatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 30572414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 21702696 - 21703031
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  21702696 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 21702795  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||     
T  21702796 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatt 21702895  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||| |  ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||| | ||| || ||||| |  |||||  |||||||||||    
T  21702896 caatgcccttcaatcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagcttt 21702994  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  21702995 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 21703031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17025153 - 17024811
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| | | |    
T  17025153 tgatctttttcctgatttggttattgtcatatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctgaaggaatatcgttgcaggaagagttgttattctttt 17025054  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcct 208  Q
    ||| ||||||||||| ||||  || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17025053 cttatagcagagaca-aaacaaagaagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgcct 17024955  T
Q  209 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttg 308  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||   ||||| ||||||| |||   | |||||||||| || ||||  | |||||||||||| |||      
T  17024954 tcaaatccttttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttttgcaatg-ttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctct 17024856  T
Q  309 catctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    || || ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  17024855 cagcttctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatga 17024811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 46088871 - 46089198
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  46088871 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 46088970  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  46088971 atccttgtctagtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 46089070  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||         |||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||   ||| || ||||| |  |||| | |||||||||||    
T  46089071 caatg---------cctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagcttt 46089161  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  ||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  46089162 aag--ttgcatctcatgatgaactgcagcttctggtgat 46089198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14263650 - 14263387
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||   || || |||||||||||||| |||| ||||    
T  14263650 atcaccaatgatcctttgcatgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgccttcccatagtgaagaaacattgttgcaggaagagctgtt 14263551  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  | ||||||| ||    
T  14263550 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtat 14263451  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctta 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  14263450 ccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatcctta 14263387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21135348 - 21135153
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21135348 atcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtct 21135249  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  21135248 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48570429 - 48570094
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||  ||| |||| | |||||||  ||||||| |  | || |||||| ||||||||| || ||||    
T  48570429 atcaccaacgatcctttgcctgatatggttattgtccttagaaagatcgatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattattgcaggcatagctgtt 48570330  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||| ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  48570329 tttcttgtcctgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 48570230  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||| ||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || |||| | |||||| ||||    
T  48570229 caatgccttttaatccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaacttt 48570131  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  ||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  48570130 aag--ttgcatctcctgatgaattacagcttctggtgat 48570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 10250868 - 10251194
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |  | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  10250868 atcaccaatgatcctttgcctggtatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaacattgttgcaggcagagatgtt 10250967  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||    
T  10250968 tttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatc 10251067  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||         |||| |||  |||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  10251068 caatgccttc---------caaattagccgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttt 10251157  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  10251158 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 10251194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 42284510 - 42284715
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  42284510 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 42284609  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  |  | || | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  42284610 atccttgtcttgtagcagagacaaactcataatagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatc 42284709  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  42284710 caatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44821670 - 44821422
Alignment:
Q  74 aggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 173  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| || | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |    
T  44821670 aggaacatcattgcatgcagagttatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactat 44821571  T
Q  174 gtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagatta 273  Q
    |||||| |||||  ||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||  |||| | ||| ||     
T  44821570 gtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttg 44821471  T
Q  274 aatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44821470 aatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 44821422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12613907 - 12613713
Alignment:
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12613907 tgtcctgtagcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatg 12613808  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 302  Q
    | ||||||| ||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  12613807 ctttcaaat-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Original strand, 19215507 - 19215699
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctgtcttgt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  19215507 tttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgt 19215606  T
Q  114 agcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    |||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |  | ||| |||||||||||||    
T  19215607 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctccttgaggaataagcatcaaatgc 19215699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21121262 - 21121057
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||   |||||| | || |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21121262 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatataggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaataaacattgttgcagacagagctgtt 21121163  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  21121162 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 21121063  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  21121062 caatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 21984483 - 21984683
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  21984483 aatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagaactgtcatcctt 21984582  T
Q  107 gtcttgtagcagagac-acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  21984583 gtcttgtagcagagacaaaaaaaagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg 21984682  T
Q  206 c 206  Q
    |    
T  21984683 c 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 23024678 - 23024852
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  |||||||||||| |||||| |||||| | |||    
T  23024678 tgatcctttgcctgatatggtcattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgcataaacattgttgcatgcagagctgttattcttgt 23024777  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  23024778 cttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 23024852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 17370924 - 17371085
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||| |||||||||  ||||||||||| | ||    
T  17370924 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcatgaaggaacatttctgcaggcagagctatt 17371023  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  17371024 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 17371085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34255700 - 34255552
Alignment:
Q  16 ttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34255700 ttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttatccttgtcttgta 34255601  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtaca 163  Q
    ||||||||| |  | ||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  34255600 gcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtaca 34255552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12624754 - 12624663
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggca 92  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  12624754 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggca 12624663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7745254 - 7744952
Alignment:
Q  35 tcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagta 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    | ||  ||||||||  |||||||| || |||| | | |||| ||||||  || ||  | | |||||    
T  7745254 tcctatgaaggatcaagttcaaatccattcttgttctgagggaacatttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcatgtagcgaaggcaatagcagagta 7745155  T
Q  135 atagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgc 234  Q
     | ||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||    
T  7745154 gtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaactgttgc 7745055  T
Q  235 ttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    | | ||  | ||||||| |||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||| |||||| || || |  |||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  7745054 tactcttcttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtagg--ttgcatcttctgatgaactgcagcttctg 7744957  T
Q  335 gtgat 339  Q
    |||||    
T  7744956 gtgat 7744952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 17400889 - 17400966
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtc 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  17400889 ttgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtc 17400966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 44200899 - 44201054
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||| |||||| | | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||| ||||||||| |     
T  44200899 caatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaaagatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagttgttat-ct 44200997  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  44200998 tgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 44201054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41132804 - 41132659
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||| |  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  41132804 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacagttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 41132706  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41132705 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacactt 41132659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19170532 - 19170371
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || | |||||||  ||||||||||| ||||    
T  19170532 atcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaacgaacatttctgcaggcagagctgtt 19170433  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||| ||||    
T  19170432 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtac 19170371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21205044 - 21204937
Alignment:
Q  77 aacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtc 176  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  21205044 aacattgttgcaagaagagctgttatccttgtcttgtagcacagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 21204946  T
Q  177 aacgctctt 185  Q
    |||||||||    
T  21204945 aacgctctt 21204937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 22655364 - 22655520
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||  |||| | |     
T  22655364 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagaactgtttttct 22655463  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22655464 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 22655520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 5929591 - 5929741
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| || | | |     
T  5929591 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctggtgt-ct 5929689  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  5929690 tgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 5929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 20251662 - 20251808
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  20251662 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 20251760  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtac 153  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||    
T  20251761 tgttttgtagcatagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtac 20251808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 675464 - 675609
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  675464 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 675562  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| || | ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  675563 tgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 675609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 28474115 - 28474262
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   |  |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  28474115 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 28474213  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  28474214 tgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 28474262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52350878 - 52350731
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||| |||||  ||||||||||| | |||| |     
T  52350878 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacatttctgcaggcagagctattat-ct 52350780  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  52350779 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtaca 52350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 19037894 - 19038045
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  19037894 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttct 19037993  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  19037994 tgtcttgtagcgcagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 19038045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14388315 - 14388170
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  14388315 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 14388217  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  14388216 tgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14388170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18896794 - 18896537
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | | |||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||  | ||||| || |  ||||    
T  18896794 atcaccaatgatctattgcctgatttggttattgccatgtgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatggagaaacaccggtgcagacacaactgtt 18896695  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||  | | ||||| | | ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||  |||||||    
T  18896694 gttcttgtactattgcagacata-aaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatc 18896596  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     ||||||||||||| ||||  || |||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  18896595 caatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcttgcttctagtcttctgcaatg 18896537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 22019223 - 22019379
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||| |||| ||||   |     
T  22019223 caatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgtttatct 22019322  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22019323 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 22019379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 28379883 - 28380002
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  28379883 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 28379981  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaa 126  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  28379982 tgtcttgtagcgtagacacaa 28380002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Original strand, 37642235 - 37642335
Alignment:
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| ||||    
T  37642235 tgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatg 37642334  T
Q  206 c 206  Q
    |    
T  37642335 c 37642335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18311138 - 18311016
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||| |||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  18311138 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggtagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtagacagaaacagagt 18311040  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  18311039 agtggaggtagtggttgtacactt 18311016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Original strand, 37640899 - 37640957
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattccca 67  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  37640899 tgatcctttgcctgatatggttattttcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttccca 37640957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 22642777 - 22642938
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || | | | |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||  ||||    
T  22642777 atcaccaatgatcttttgccttatttggatgttgtcctaagaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagaactgtt 22642876  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
       | ||||||||| |  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22642877 tatcttgtcttgtaccgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 22642938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 18614783 - 18614847
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18614783 atcaccaatgatcttttgtttgatttggttattatcctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 18614847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11195233 - 11195111
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  |||||||| || |||| | | |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  11195233 gtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 11195135  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| || |||||||||||||    
T  11195134 agtggaggtaatggttgtacactt 11195111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 21543911 - 21544026
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  | ||||||||| ||||    
T  21543911 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcatgttcaaatccattcctaacttgaaggaacatttctacaggcagagctgtt 21544010  T
Q  101 atccctgtcttgtagc 116  Q
     | | |||||||||||    
T  21544011 tttcttgtcttgtagc 21544026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 26548450 - 26548391
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26548450 caatgatcttttgcctgatttggatgctgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcc 26548391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12613659 - 12613609
Alignment:
Q  333 tggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  12613659 tggtgatgttgcttctgatgaggtggttctaatgaacttgcttctgatgac 12613609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 17018461 - 17018531
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtat 71  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  17018461 atcaccaatgatctgttgcttgattttgatattatcctatgaaggaacaatttcaaatccattccaagtat 17018531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 44823960 - 44823906
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattca 55  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  44823960 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttca 44823906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 45070842 - 45070738
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  45070842 atcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 45070744  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  45070743 tgtagc 45070738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 14531 - 14927
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14531 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatcctctgaagtatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 14630  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14631 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatc 14730  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14731 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 14830  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14831 aagtcttgcatttcctaatgatttttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatga 14927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22188325 - 22187941
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22188325 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 22188226  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22188225 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatc 22188126  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22188125 caatgccttcaaatctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 22188026  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22188025 aagtcttgcatgtcctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 22187941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 24575912 - 24576309
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24575912 atcaccaatgatctttttccggatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtgggaacattgttgcaggcagagctgtt 24576011  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |    
T  24576012 attcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaac 24576111  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgaga-ttaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24576112 caatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctt 24576211  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24576212 taagtattgcatctcctaatgaactttagcttctggtgatcttgcttatgatgatatgcttctgatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatga 24576309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 25829011 - 25829363
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25829011 atcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcctctgaaggatcaattttaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcatgcagagttgtt 25829110  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829111 atccttgtcttgcagcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 25829210  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  25829211 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctct 25829310  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25829311 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 25829363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 23234884 - 23235268
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  23234884 atcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattgccagtatgtaggaacattgttgcaggcggaactgtt 23234983  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23234984 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatc 23235083  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23235084 caatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 23235183  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23235184 aagtcttgcatctcatgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 23235268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9015591 - 9015210
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  9015591 atcaccaatgatcttttgcatgatagggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtatgaacattgttgcaggcggagctgtt 9015492  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9015491 ctccttgtcttatagcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatc 9015394  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9015393 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 9015294  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9015293 aagtcttgcatctcctgatgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctgatgac 9015210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25037482 - 25037098
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037482 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtactcttaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 25037383  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25037382 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatc 25037283  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25037282 caatgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagcttt 25037183  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25037182 aagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25037098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 30666866 - 30667250
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30666866 atcaccaatgatctttttcctgaaatggttattgacctctgaaggatcaatttcaaatccattctatgtatgtaggaacattgttgcaggcagcgctgtt 30666965  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30666966 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatc 30667065  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30667066 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 30667165  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  30667166 aattcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatattcttcagcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgac 30667250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10009973 - 10009590
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10009973 atcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 10009874  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10009873 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatc 10009774  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttc-cagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  10009773 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctt 10009674  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10009673 taagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctttcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 10009590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20568968 - 20568596
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |     
T  20568968 caatgatcttttgcctgatatggttattggcctatgaaggatgaatttcaaatttgttcccagtatgtaggaacattgttgtaagcagagttgttattct 20568869  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20568868 tgtcttatagcagatacacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg 20568769  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  20568768 ccttcaaatcctttcaaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtc 20568669  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttg--cttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 376  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  20568668 ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttc 20568596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13964201 - 13963860
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13964201 atcaccaacgatcttttgcctgatatggttcttgtcctctaaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgtt 13964102  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964101 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 13964002  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13964001 caatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 13963902  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    || |||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13963901 aaatcttgcatctactgatgaactagagcttctagtgatctt 13963860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 367
Target Start/End: Original strand, 19540301 - 19540659
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||     
T  19540301 tgatcttttgcttgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgc 19540400  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  19540401 cttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatacct 19540500  T
Q  209 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttg 308  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19540501 tcaaaacctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttg 19540600  T
Q  309 catctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19540601 catctcatgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 19540659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 40782354 - 40782730
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40782354 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggtagagctgtt 40782453  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40782454 atccttgtcttgtagcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatc 40782553  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| ||     |||  |||| |    
T  40782554 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctct 40782647  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  40782648 aagtcttgcatctcctgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctgatgac 40782730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21537473 - 21537087
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc--agagttg 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||   |||| ||    
T  21537473 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctgtgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaatgttgtaggggaagagctg 21537374  T
Q  99 ttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21537373 ttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagca 21537274  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21537273 tccaatgcctccaaaacctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagct 21537174  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||    
T  21537173 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatgaggtgcttctggtgagcttgcttctgatgac 21537087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 24376978 - 24377332
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24376978 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattattgcaggcagagctgtt 24377077  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24377078 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 24377177  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24377178 caatgctctcaaaacctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctt 24377276  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  24377277 taagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatga 24377332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 30621093 - 30621447
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  30621093 atcaccaatgatctttttcctcatatggttagtgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattctatgtatgtaggaacattgttgcaggcaacgctgtt 30621192  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30621193 atcattgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatc 30621292  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30621293 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaaccttt 30621392  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    || ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  30621393 aattcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30621447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 30623714 - 30624068
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  30623714 atcaccaatgatctttttcctcatatggttagtgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattctatgtatgtaggaacattgttgcaggcaacgctgtt 30623813  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30623814 atcattgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatc 30623913  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30623914 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaaccttt 30624013  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    || ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  30624014 aattcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgatattcagcttctgatga 30624068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 82 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25041508 - 25041205
Alignment:
Q  82 tgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25041508 tgttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgc 25041409  T
Q  182 tcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatt 281  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||    
T  25041408 ttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccatt 25041309  T
Q  282 taacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25041308 gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 25041209  T
Q  380 tgac 383  Q
    ||||    
T  25041208 tgac 25041205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24850889 - 24850508
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  24850889 atcaccaatgatattttgcttgatatggtgattgtcctttaaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacattgttgcaggcaaagctgtt 24850790  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24850789 attcttgtcttgtagcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 24850690  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24850689 caatgctttgaaatcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctt 24850590  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  24850589 taagtcttgcatctcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 24850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28140842 - 28140509
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28140842 atcaacaatgatcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctatt 28140743  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28140742 atccttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 28140643  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28140642 caatgttttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagtttt 28140543  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  28140542 aagtcttgcatctcccgatgaacttcagcttctg 28140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 38781275 - 38781658
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  38781275 atcaccaatgatcttttgtctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaagggacatcgttgcaggcagagctgtt 38781374  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaact-gagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  38781375 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcat 38781474  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38781475 tcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctt 38781574  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||   | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38781575 taagtcttgcatcctctgatgagac---atcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 38781658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 22317470 - 22317809
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22317470 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 22317569  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||| |||||||| | ||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22317570 tttcttgtcttgcagcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 22317669  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttc-aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  22317670 caatgcctttaaatcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctt 22317769  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||    
T  22317770 taagtcttgcatctcttgatgaaatagagcttctggtgat 22317809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23595790 - 23595427
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  23595790 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 23595691  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||    
T  23595690 aatcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaacaagaatc 23595593  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23595592 caatgccttcaaattcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttt 23595494  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    || |||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  23595493 aattctttcatcttctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23595427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39037860 - 39037511
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||     
T  39037860 caatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaacgatcaatttcaaattcattctaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctgttatcct 39037761  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  39037760 tgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatg 39037661  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||| | | ||  || |||  ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  39037660 ccttcaacttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtc 39037561  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  39037560 tctcatcttctgatcaactttaacttccggtgatcttcagcttctgatga 39037511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6574348 - 6573993
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6574348 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtt 6574249  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
     | | ||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  6574248 tttcttgttttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaaca 6574149  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagc 297  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6574148 tccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagc 6574049  T
Q  298 tttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||  | |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  6574048 ttta--tgttgcatcttctgatgaactgcaacttctagtgattttcagcttctgatga 6573993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20152249 - 20151905
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  20152249 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtt 20152150  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20152149 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagta---------gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 20152059  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20152058 caatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagcttt 20151959  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    || | |||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  20151958 aa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 20151905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22455213 - 22454833
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  22455213 atcaccaataatcttttgcctgacatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcataaatgtt 22455114  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22455113 attcttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatc 22455014  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||||||||| | | ||  || ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    | ||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22455013 caatgccttcaacttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctt 22454915  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  22454914 taagtctctcatcttctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgagcttgcttctga 22454833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 106 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18377024 - 18376775
Alignment:
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18377024 tgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg 18376925  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18376924 ccttcaaatcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtc 18376825  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatga 353  Q
    |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18376824 tctcatcttcaaatgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatga 18376775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 383
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260665
Alignment:
Q  150 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtc 249  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  250 ttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctg 349  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttccttctg 22260631  T
Q  350 atgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  22260632 atgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 22260665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 25189275 - 25189629
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  25189275 atcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaatgaacattgttgcaggcatagctgtt 25189374  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||  |||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  25189375 atccttgtccagtagtagagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatc 25189474  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| | | ||  || ||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25189475 caatgccttcaacttcatttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 25189573  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaac-tttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||  ||||| || || ||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  25189574 aagtctctcatcttctaataaacttttagcttcaggtgatcttcagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31801110 - 31800853
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31801110 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 31801011  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||    
T  31801010 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatc 31800911  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 258  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31800910 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaat 31800853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41121936 - 41121577
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||| || |||||| | |    
T  41121936 aatgatctttttcctgatatggttattgtcatatgaaggatcaatttcaaatccatttcaagtatgaaggaacatcgttacaggcatagctgttattctt 41121837  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||    
T  41121836 gtcctgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgc 41121737  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 306  Q
    |||||||||||||  || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||   | |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||    
T  41121736 cttcaaatccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattct 41121638  T
Q  307 tgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
      || || ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  41121637 cacagcttctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaggtgcatctgatga 41121577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28711921 - 28711618
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28711921 atcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagctgtt 28711822  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  28711821 tttcttgtcttttagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatc 28711722  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |  || || |||||||| |||| | |||||||| ||    
T  28711721 caatgccttcaaattcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagcctt 28711622  T
Q  301 aagt 304  Q
    ||||    
T  28711621 aagt 28711618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23184527 - 23184170
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  23184527 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 23184428  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  23184427 aatcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaac-agaatc 23184331  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||||||| ||    
T  23184330 caatgccttcaaattcatttgaattagtcg-tgcttcactcttctggtcttctgc-atgc-taggtgtgatt-aatcctttgaacaacctttgaagc-tt 23184236  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    || |||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  23184235 aattctt-catcttctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23184170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Original strand, 24779288 - 24779525
Alignment:
Q  69 tatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24779288 tatgtaggaacattgttgcaggcagagctattatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgt 24779387  T
Q  169 actttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatga 268  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||||||  | ||    
T  24779388 actatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacga 24779487  T
Q  269 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 306  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24779488 gattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28701447 - 28701069
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| |||||| | |||  | || | |     
T  28701447 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcccatgaaggatcaatttcaaatctattcccattgtgaaggaacatcgttgcaagtagaactatttttct 28701348  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  28701347 tgtcttgtagcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatg 28701248  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaa-atgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagt 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||| ||| |||| | |||||||| |||||     
T  28701247 ccttcaaatcctttcaaaatatctgttgctttacttttccagtcttctgcaat-cttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag- 28701150  T
Q  305 cttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt---gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
     ||||||| | |||||||||  | ||||||||||| ||   |||||||||  |  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  28701149 -ttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgattttttggcttctgataaacttgtttctgatgaactcacttctgatga 28701069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26619323 - 26619066
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || ||||    
T  26619323 atcaccaatgatctttttcctgatttgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacactgatgcaggcatagctgtt 26619224  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||| | | ||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||     
T  26619223 gttcttgtcctattgcagacaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcatt 26619125  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26619124 caatgccttcaaattcttttgaaatagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg 26619066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 6392511 - 6392848
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | ||    
T  6392511 atcaccaatgatcatttgcctaatatggttgttgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatt 6392610  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  6392611 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 6392709  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatc-catttaacaacctttgaagct 298  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||| |||| | ||||||||     
T  6392710 ccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagcc 6392809  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||   ||||||  ||||||||||  ||||| |||||||    
T  6392810 ttaag--atgcatcctctgatgaactgcaacttatggtgat 6392848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 22258078 - 22258231
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22258078 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 22258177  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22258178 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 22802338 - 22802718
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22802338 atcaccaatgatcctttgcgtgatatgattattgtcctaagaagaatcaagttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcagacagagctatt 22802437  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  22802438 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatc 22802536  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||  ||| |||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| || | | |||||| ||||    
T  22802537 atatgccttcaaatcctttcaaaatagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatcttt 22802636  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgt-ttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |  ||||| | | ||||||||||||||  | | ||||||||| || ||||||||||||    
T  22802637 aag--ttgcatctcctgatgaactgcaggttctgataaacttgcttctgatgaattttcttctgatgaccttgcttctgatgac 22802718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 33074103 - 33074439
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  33074103 atcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcctaagaagaatcaatttcaaatgtattcccactgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 33074202  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||  ||||| |||||||    
T  33074203 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatc 33074302  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||| |||    
T  33074303 taatgccttccaatctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagtttt 33074402  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  33074403 aag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgat 33074439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34322159 - 34321840
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34322159 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtatacccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 34322060  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||| ||| |||  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  34322059 tttcttgtcttgtagcagaaacaaaaatagagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatc 34321960  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||| |||||    
T  34321959 caatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggcttt 34321860  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaa 322  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  34321859 aag--ttgcatctcctgatgaa 34321840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 22272010 - 22272391
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||| || |||||||| || ||||    
T  22272010 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtctggaggaacactggtgcaggcatagctgtt 22272109  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa-gcat 199  Q
    || | |||| | | ||||| ||| || |  |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||| ||| ||| || ||||    
T  22272110 attcttgtcctattgcagacaca-aatcacagtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcat 22272208  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||||||||||||| ||  || ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | | | | |||||||||  || ||||||||||||| ||     
T  22272209 ccaatgccttcaaatccatttgaattagtcattgcttcattcttccagtcttctgcaatgat-agacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactc 22272307  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
     || |||  || || ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22272308 caattctctcagcttctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaggtgtttctgatgaacttgtttctaatgac 22272391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 30557543 - 30557145
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| | || ||||||||  ||||||||| || ||||    
T  30557543 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttgttgtcctaagaaggatcaatttcaaatgctttcccattgtgaaggaacatcattgcaggcatagctgtt 30557444  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  30557443 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 30557345  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||| | ||| || ||| ||||| |||||  ||||||||     
T  30557344 ccaatgtgttcaaattctttcaaaatagtcgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagcc 30557245  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgat 395  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||| |  || |||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  30557244 ttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatatttagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttttgatgaacttgcttctgat 30557147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31968266 - 31967940
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || | || || ||||||||||||||||||||||||    
T  31968266 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaaattcaaatgcgttctcaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagttgtt 31968167  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  31968166 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 31968067  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||         | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||   ||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||    
T  31968066 caatg---------catttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttatgcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaggcttt 31967977  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  31967976 aag--ttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 31967940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31328182 - 31327852
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| | | |    
T  31328182 aatgatcctttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaacgtgttcccaatgtgtaggaacattgttgcaggcatagctgtttttctt 31328083  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  31328082 gtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 31327984  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaac-ctttgaagctttaagtc 305  Q
     |||||| || | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  |||   ||| || ||||| || ||||||  |||||| |||||||      
T  31327983 tttcaaaaccctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag-- 31327886  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  31327885 ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 31327852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31334903 - 31334573
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| | | |    
T  31334903 aatgatcctttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaacgtgttcccaatgtgtaggaacattgttgcaggcatagctgtttttctt 31334804  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  31334803 gtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 31334705  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaac-ctttgaagctttaagtc 305  Q
     |||||| || | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  |||   ||| || ||||| || ||||||  |||||| |||||||      
T  31334704 tttcaaaaccctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag-- 31334607  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  31334606 ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 31334573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 44840311 - 44840519
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| || |    
T  44840311 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctggt 44840410  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  44840411 atccttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 44840510  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  44840511 caatgcctt 44840519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 378
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609216
Alignment:
Q  202 aatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag-tcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||| || |||||||  | |||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagcttt 7609138  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7609139 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctg 7609216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28551141 - 28550893
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  28551141 atcaccaatgatcctttgtctgatacggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 28551042  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  28551041 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 28550942  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 258  Q
     ||||         |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  28550941 caatg---------cctttcaaaatagttgtttctatacttttccagtcttctgcaat 28550893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22776511 - 22776303
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22776511 atcaccaatgatcctttgcccgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttccaaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 22776412  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22776411 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 22776312  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  22776311 caatgcctt 22776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22781889 - 22781681
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22781889 atcaccaatgatcctttgcccgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttccaaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 22781790  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22781789 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 22781690  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  22781689 caatgcctt 22781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 40331970 - 40332172
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| | | || |  ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40331970 aatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattttaaatgcgttccaaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccgt 40332069  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  40332070 gtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40332169  T
Q  207 ctt 209  Q
    |||    
T  40332170 ctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35744223 - 35743966
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||| | |  | |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35744223 atcaccaatgatcatttgcctgatatagttattgtcctaagagtgatcaatttcaaatgcattcctattgagaaggaacattgttgcagacagagctgtt 35744124  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||| || ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||     
T  35744123 tttcttgttttatagcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatt 35744024  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 258  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||||    
T  35744023 caatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatattctgcaat 35743966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 45087266 - 45087008
Alignment:
Q  142 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45087266 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 45087167  T
Q  242 ttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaac-ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  45087166 ttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaactgtagcttctagtgat 45087069  T
Q  340 ctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
     ||  |||||||||  |  || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45087068 atttagcttctgataaacttgcttcttatgaacttgcttctggtgaccttgtttctgatga 45087008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 19114961 - 19115279
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||| |||||||| || ||||    
T  19114961 atcaccaatgatcttttgcctaatttggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcatttcaagtatggaggaacattgatgcaggcatagctgtt 19115060  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||| | | ||||| ||| || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| | |||||    
T  19115061 gttcttgtcctattgcagacaca-aatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatc 19115159  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     | || ||||| |||| |   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||   |||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  19115160 cactggcttcacatccatctgaattagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaat-agtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttc 19115258  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    || |||| || || |||||||    
T  19115259 aattctttcagcttctgatga 19115279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1587255 - 1586929
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |  | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  1587255 atcaccaatgatcctttgcttgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattctcattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 1587156  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  ||||||    
T  1587155 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc 1587057  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||         |||||||||||||  ||||    ||| || ||||||||||||||  | | ||||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  1587056 caatg---------cctttcaaaatagccgttgtaatactttttcagtcttctgcaatcttcagatgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttt 1586966  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  || ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  1586965 aag--ttccatctcctgatgaactccagcttctggtgat 1586929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 14581389 - 14581600
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaa---attcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagtt 97  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||| || | || |  |||||| |||||||||||  |    
T  14581389 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttattcaaatgcgttcacaatgtgaataaacattattgcaggcagaact 14581488  T
Q  98 gttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 197  Q
    ||| | | |||||||||||||||||| || | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||    
T  14581489 gtttttcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagc 14581588  T
Q  198 atcaaatgcctt 209  Q
    ||| ||||||||    
T  14581589 atccaatgcctt 14581600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22785877 - 22785670
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22785877 atcaccaatgatccattgcctgatatggtttttgtcctatgaagcatcaatttcaaatgcgttcccaatgtg-ataaacattgttgcaggcagagctgtt 22785779  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||| | | || ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22785778 atccttgtcttgtagtagagataaagacagagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 22785679  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  22785678 caatgcctt 22785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23392891 - 23392707
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23392891 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatttctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 23392792  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||  |||||||||||||||||| |    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  23392791 atcattgtcttgtagcagagacaaacttagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctt 23392707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 44881045 - 44881409
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||| || ||||||| || |||| ||| || ||||    
T  44881045 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcttatgaatgatcaatttcaaatccattacaagtctggaggaacactggtgcatgcatagctgtt 44881144  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | || | | ||| | ||| |  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||  || || ||||    
T  44881145 gttcttttcctattgcatacaca-attcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatc 44881243  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||| || ||  || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  || | | |||||| ||  || |||| ||||||||||||     
T  44881244 caatgccttcaaacccatttgaattagctgctgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttc 44881342  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    || | |  || || ||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  44881343 aattatctcagcttctgatgatcttcagcttttggtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 44881409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1083891 - 1084105
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1083891 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 1083990  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  1083991 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacact--------ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatc 1084082  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  1084083 taatgccttcaattcctttcaaa 1084105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24814806 - 24814645
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24814806 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 24814707  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||| | || | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  24814706 tttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 24814645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20646771 - 20646626
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||    
T  20646771 atcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttgcaggcagagctgtt-ttcttgtct 20646673  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  |||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  20646672 tgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 20646626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 22774423 - 22774568
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  22774423 atcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 22774521  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  22774522 tgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22774568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 24275090 - 24275235
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||    
T  24275090 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgacggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtct 24275188  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  24275189 tgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24275235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 18702616 - 18702955
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |    || ||||| |  ||||    
T  18702616 atcatcaatgatttgttgtctgatttagttattgtcttatgaaggagcaatttcaaatccattccaagtatggaggaatacaagtgtaggcacaactgtt 18702715  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||  | | ||| | ||| |||  ||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||  |||||||    
T  18702716 gttcttgtactattgcatacaca-aaatagagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatc 18702814  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||  || |||  ||| |||||  |||| ||||||||| ||||  || | | ||||||| |  || |||||||||||||||||     
T  18702815 taatgccttcaaattcttttgaattagccgttacttcatgcttctagtcttctgtaatg-atagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttc 18702913  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    || |||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  18702914 aattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatgatctt 18702955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18431162 - 18430844
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | ||| |  | |  ||||| |  ||||    
T  18431162 atcaccaatgatttgttgcctgatttggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatggaagaataccggtataggcacaactgtt 18431063  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||  | ||||||| ||| || | ||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||| | | ||||||| ||||||     
T  18431062 gttcttgtactatagcagacaca-aatcagagtagtggaggtcgtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcatt 18430964  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||  || |||  |||||||||  |||| ||||||||||||||  ||   | ||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  18430963 caatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcatgcttctagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttt 18430865  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    || |||| || || |||||||    
T  18430864 aattctttcagcttctgatga 18430844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Original strand, 22755349 - 22755459
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||| ||||| |||||| |     
T  22755349 caatgatcttttgtctgatttggatattgtcatatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcagacagagctgttatact 22755448  T
Q  106 tgtcttgtagc 116  Q
    |||||||||||    
T  22755449 tgtcttgtagc 22755459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 22779822 - 22779946
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactga 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||  ||||| |||  ||    
T  22779822 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaataga 22779920  T
Q  132 gtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  22779921 gtagtggaggtagtggttgtacactt 22779946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Original strand, 3277044 - 3277116
Alignment:
Q  138 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  3277044 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 3277116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19313181 - 19313036
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  19313181 atcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatttctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 19313083  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  |||||||  | ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  19313082 tgtagcgtagacacactcagagttgtggagatagtggttgtacactt 19313036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22776239 - 22776171
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22776239 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22776171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22781617 - 22781549
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22781617 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22781549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27978524 - 27978402
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  27978524 gtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 27978426  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  27978425 agtggaggtagtggttgtacactt 27978402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28065053 - 28064931
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  28065053 gtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 28064955  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  28064954 agtggaggtagtggttgtacactt 28064931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 967667 - 967522
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||| || |||| ||  |||||    
T  967667 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcatagctgttgtct-tgtct 967569  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  967568 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 967522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22785599 - 22785552
Alignment:
Q  290 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22785599 tttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgtagcttctggtgat 22785552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17963489 - 17963452
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcct 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17963489 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 17963452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28140515 - 28140475
Alignment:
Q  343 gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  28140515 gcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgac 28140475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16681579 - 16681197
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  16681579 atcaccaatgatctattgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcagggagagctgtc 16681480  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16681479 attcatgtcttgtagcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 16681380  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  16681379 taatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctct 16681280  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16681279 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 16681197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 39693410 - 39693794
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  39693410 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatcctttccatgtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctgtt 39693509  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39693510 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 39693609  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39693610 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttt 39693709  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  39693710 aagtcttgcatctcctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatgaacttgtttctgatgac 39693794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 16188859 - 16189240
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16188859 atcaccaacgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattaagagggaacatagttgcaggcagagttgtt 16188958  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  16188959 atccttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatc 16189058  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16189059 caatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagcttt 16189158  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16189159 aagtcttgcatctcctaatgaacttcggcttctggtgatcttgcttctaatgagatacttctgatgaacttgcttctgatga 16189240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12758039 - 12757698
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12758039 atcaccaatgatcttttttctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattattgcaggcggagctgtt 12757940  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12757939 atccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 12757840  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  12757839 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagtttt 12757740  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    
T  12757739 aagtcttgcatctcctgatgaactagagctactggtgatctt 12757698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 29693190 - 29693574
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29693190 atcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgaaggaacattgttgcaggcatagttgtt 29693289  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29693290 atccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcata 29693389  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||    
T  29693390 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagcttt 29693489  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29693490 aagtcttgcatctcctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 29693574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 383
Target Start/End: Original strand, 24646219 - 24646597
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  24646219 aatgatcttttttctgatatggtgattgacctctgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgttatcctt 24646318  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  24646319 gtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgc 24646418  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 306  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24646419 ctgcaaatcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactct 24646518  T
Q  307 tgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24646519 tgcatctcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 24646597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17526005 - 17525623
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17526005 atcaccaataatctttttcctaatatggttgttgtcctctgaagaatcaatttcaaatctattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 17525906  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17525905 atccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 17525806  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  17525805 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatt 17525706  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  17525705 taagtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatga 17525623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 377
Target Start/End: Original strand, 17267358 - 17267724
Alignment:
Q  10 gatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtc 109  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17267358 gatcttttacctaataaggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttggaggcagagctgttatccttgtc 17267457  T
Q  110 ttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 209  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17267458 ttgtggcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgcttt 17267557  T
Q  210 caaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgc 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17267558 caaatcctttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgc 17267656  T
Q  310 atctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttct 377  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17267657 atctcttgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttct 17267724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20382670 - 20382288
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20382670 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttaaaatccattcccaatatgtaggaacattcttgcaggcagagctgtt 20382571  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | | |||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20382570 attcttctcttgttgcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatc 20382471  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     | | | |||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |  | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20382470 cactactttcaaatcctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagcttt 20382371  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  20382370 aagacttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgac 20382288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18321435 - 18321067
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18321435 atcaccaataatcttttgcctgatatggttcttgtcctatggaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaactttgttgcaggcagagctgtt 18321336  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18321335 attcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatc 18321236  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18321235 caatgccctcaaatcctttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 18321136  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  18321135 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatgagatgcttctgatga 18321067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 16207181 - 16207563
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16207181 atcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatccattcacattgtgaaggaacatcgttgcaggaagagctgtt 16207280  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16207281 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 16207380  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  16207381 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagcttt 16207480  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  16207481 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatgagatgcttctgataaacttgcttcagatg 16207563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17442083 - 17441716
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||    
T  17442083 atcaccaatgatcgtttgcctgatatggttattgtcatctgaaggatcaatttcaaatccattcccaatatgtaggaacatcgttgcagacggagctgtt 17441984  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17441983 atccttgtcttgtagtagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatc 17441884  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17441883 caatg-cttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagcttt 17441785  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  17441784 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgattagatgcttctgatga 17441716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 33082741 - 33083114
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||  ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  33082741 atcaccaatgatcctttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccaagtctgagggaacaccgttgcaggcagagatgtt 33082840  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082841 atccttgtcttgtagcagagacaagagcagagta---------gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 33082931  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33082932 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 33083031  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |||| |||||    
T  33083032 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagttgcttcagatgaacttgtttctaatgac 33083114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 19943110 - 19943494
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | || |||||||| ||||||||||||| || |    
T  19943110 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatctattccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctggt 19943209  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaa-gaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||| ||||||  |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19943210 tttcttgtcttgtaggagagaccaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcat 19943309  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagct 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  19943310 ccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagct 19943409  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  19943410 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctagtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttccgatg 19943494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 40 - 383
Target Start/End: Original strand, 17914373 - 17914718
Alignment:
Q  40 tgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaataga 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  17914373 tgaaggatcaatttcaaatccattccatgtaagtaagaacattattgcaggtagagttgttatcattggcttgtagcagagaaacaaattgagtagtgga 17914472  T
Q  140 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17914473 gatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 17914572  T
Q  240 tcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||    
T  17914573 tcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaactcctaatgagctacaacttctagtgat 17914672  T
Q  340 ctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17914673 cttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatgac 17914718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 353
Target Start/End: Original strand, 18718882 - 18719228
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  18718882 aatgatctttttcctgatatggttattgtcttatgaaagatcaatttcaaatccattctcagtatgtagaaacattgttgtaggcagagctgttattctt 18718981  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18718982 gtcttttagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgc 18719081  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 306  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| || |||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  18719082 tttcaaatcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtct 18719181  T
Q  307 tgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18719182 tgcatcttctgaagaacttaagcttctggtgatcttgcttctgatga 18719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 19156139 - 19156425
Alignment:
Q  69 tatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19156139 tatgtaggaaaattgttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgt 19156238  T
Q  169 actttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  19156239 actttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacga 19156338  T
Q  269 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19156339 gattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatctcttgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 19156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18121382 - 18121018
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18121382 atcatcaatgatcttttgactgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 18121283  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  18121282 tttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatc 18121186  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  18121185 caatgcctttaaatcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaacttt 18121086  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18121085 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatg 18121018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 353
Target Start/End: Original strand, 18679696 - 18680042
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |    
T  18679696 aatgatcttttgcctgatatggttattgtcttatgaaagatcaatttcaaatccattcccactatgtagaaacattgttgcaggcaaagctgttattctt 18679795  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18679796 gtctttaagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgc 18679895  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 306  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||    
T  18679896 tttcaaatcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtct 18679995  T
Q  307 tgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||| |||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  18679996 tgcatcttctgatgaaatgaagcttctagtgatcttgcttctgatga 18680042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 21932758 - 21933112
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21932758 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 21932857  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||     
T  21932858 tttcttgtcttgtagcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcata 21932957  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21932958 caatgcctttaaatcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 21933057  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21933058 aagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatga 21933112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 17701615 - 17701997
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacatt-----gttgcaggcagag 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||     ||||||| |  ||    
T  17701615 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattatattgttgcagacgtag 17701714  T
Q  96 ttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa 195  Q
     |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||  |    
T  17701715 ctgttattcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaatta 17701814  T
Q  196 gcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaa 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17701815 gcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaa 17701914  T
Q  296 gctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 376  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||    
T  17701915 gctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatgaacttgcttc 17701997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23185503 - 23185150
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  23185503 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggaagagctgtt 23185404  T
Q  101 atccct-gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     |  || ||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  23185403 ttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcat 23185304  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23185303 ccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 23185204  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  23185203 ta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 23185150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 74 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 602923 - 602655
Alignment:
Q  74 aggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 173  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  602923 aggaacattgttacagacagagctattattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 602824  T
Q  174 gtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagatta 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||     
T  602823 gtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattg 602724  T
Q  274 aatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  602723 aatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatttcctgatgaactttagcttcttgtgatctt 602655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23263888 - 23263505
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23263888 atcaccaatgatcttttgtatgatatcgttattgtcctatgatggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtt 23263789  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||| ||| ||| ||||   ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  23263788 tttcttttcttgtagtagaaacaaaaacatggtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatc 23263689  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct-t 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |    
T  23263688 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttct 23263589  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  23263588 taagttttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 23263505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 19707381 - 19707761
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  19707381 atcaccaatgatcttttgtcttatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttccaggcctagttgtt 19707480  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  19707481 attcttgtcctgtagtagagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccatt 19707580  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||     |||||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  19707581 caatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagcttt 19707679  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    || |||| ||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  19707680 aattctttcatcttctgatgatcttcagcttctggcgatcttgcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatga 19707761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 17797297 - 17797680
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| | || |||||||| |||| || || || ||||    
T  17797297 atcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcactcccattgtgaaggaacatcgttgtagtcatagctgtt 17797396  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17797397 tttcttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 17797496  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  17797497 caatgccttcaattcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggcttt 17797596  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||  |||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||  |||||||||| |  || |||||||||| | ||||||||||||    
T  17797597 aag--ttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaatttgcttctgatgac 17797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30421705 - 30421352
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | || ||||||||   |||||| |||| ||||    
T  30421705 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctatgcaggaagagctgtt 30421606  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttc--aaagaacaagca 198  Q
     | | |||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  30421605 tttcttgtcttgttgcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagca 30421507  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30421506 tccaatgccttcaaatccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagct 30421407  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||  | |||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  30421406 tta--tgttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgattttgagcttctgatga 30421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 43644771 - 43645069
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  43644771 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttacaggcatagttgtt 43644870  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43644871 atctctgtcctgtagcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatc 43644970  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||   | |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  43644971 caatgccttcaaattcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttt 43645069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15336359 - 15336028
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||| | |     
T  15336359 caatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttct 15336260  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||    
T  15336259 tgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatg 15336160  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| | ||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||      
T  15336159 ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag-- 15336062  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15336061 ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 15336028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15425424 - 15425093
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||| | |     
T  15425424 caatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttct 15425325  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||    
T  15425324 tgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatg 15425225  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| | ||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||      
T  15425224 ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag-- 15425127  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15425126 ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 15425093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15516728 - 15516397
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||| | |     
T  15516728 caatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttct 15516629  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||    
T  15516628 tgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatg 15516529  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| | ||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||      
T  15516528 ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag-- 15516431  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15516430 ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 15516397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 45538715 - 45538379
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45538715 atcaccaatgatattttgcctcatatggttactgtcctaagaaggatcaattttaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 45538616  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45538615 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 45538516  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  45538515 caatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagcctt 45538416  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  ||||||| | |||||||||  | |||||||||||    
T  45538415 aag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtgat 45538379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40845663 - 40845329
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40845663 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatatattctcattgagaaggaacattgttgcaggcagagttgtt 40845564  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  40845563 tttcttctcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 40845464  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  40845463 caatgccttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagcttt 40845365  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtga 338  Q
    |||   |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40845364 aag--ctgcatctcctgatgaactatagcttctggtga 40845329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 1237512 - 1237909
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1237512 atcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcttaagaaagatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 1237611  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | ||||||||||||||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  1237612 tttcttctcttgtagcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatc 1237711  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | |||||||| ||    
T  1237712 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagcctt 1237811  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  ||||||| | ||||||| |  | |||||||| || ||  |||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  1237812 aag--ttgcatcccatgatgaattgcagcttctggtaatttttggcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgaacttgtttcagatga 1237909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 22673653 - 22674036
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |  | ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22673653 atcatcaatgattctttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaggaacaatgttgcaggaagagctgtt 22673752  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22673753 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 22673852  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||    | | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  22673853 caatgtcttctaatccttccaaaatagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagcttt 22673952  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22673953 aag--ttgcatctccggatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 22674036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 25163945 - 25164134
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  25163945 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcataactgtt 25164044  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag 190  Q
    || | |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  25164045 attcttgtcttgtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactcttcaaag 25164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 339
Target Start/End: Original strand, 24551156 - 24551485
Alignment:
Q  8 atgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| |||| |||||||| |||| | | ||    
T  24551156 atgatcttttgtcggatatggttattttcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgtaggcagagctgtttttcttg 24551255  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcc 207  Q
    |||||||| ||||||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  24551256 tcttgtagtagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcc 24551355  T
Q  208 ttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtctt 307  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||    
T  24551356 ttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--tt 24551453  T
Q  308 gcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||| | |||||||||  | |||||||||||    
T  24551454 gcatcccatgatgaactgcagcttctggtgat 24551485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 9320444 - 9320828
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||||| || || ||||    
T  9320444 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttgttgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacattgttgcagtcacagctgtt 9320543  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  9320544 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcat 9320642  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatcc-atttaacaacctttgaagct 298  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| ||| |||| | ||||||||     
T  9320643 ccaatgcgttcaaatcctttcaaaataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagcc 9320742  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  9320743 ttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 9320828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 36105072 - 36105467
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| | |  | | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  36105072 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctatt--gaaagaacatctttgcaggcagagctgtt 36105169  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| || ||||    
T  36105170 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatc 36105269  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  36105270 caatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 36105369  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||  |  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36105370 aag--ttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 36105467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18685672 - 18685412
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||  || || ||||    
T  18685672 atcaccaatgatcttttgtatgatttgttaattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacatcgttgcaaacatagatgtt 18685573  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||| |  |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18685572 attcttgtcttattacagacaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatc 18685474  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgct 261  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  18685473 taatgccttcaaattctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttcttgcaatgct 18685412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18731266 - 18730947
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||  || || ||||    
T  18731266 atcaccaatgatcttttgtatgatttgttaattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacatcgttgcaaacatagatgtt 18731167  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||| |  |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18731166 attcttgtcttattacagacaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatc 18731068  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||   | |||||||||| || ||||  ||||||||| |    
T  18731067 taatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcat 18730969  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    ||| |||| ||||| |||||||    
T  18730968 taactctttcatcttctgatga 18730947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20255660 - 20255460
Alignment:
Q  182 tcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatt 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  20255660 tcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccatt 20255561  T
Q  282 taacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||   || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||    
T  20255560 gaacagcctttgacgctttaagtcttgcat---ctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatacttctgatgaacttccttatga 20255464  T
Q  380 tgac 383  Q
    ||||    
T  20255463 tgac 20255460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19956613 - 19956374
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||   |||||||||| |  ||||    
T  19956613 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaac---gttgcaggcataactgtt 19956517  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||    
T  19956516 attcttgtcttgttgcagagaca-aaacagggtattggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatc 19956418  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttc 244  Q
     ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  19956417 caatgccttcaaatcctttagaattagtcgttgcttcactcttc 19956374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 22662991 - 22663388
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||| |  | ||||||| || || |||||||| ||||    
T  22662991 atcaccaatgattctttgcctgatatggttattgttctacgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaggaacaatgctgtaggcagagctgtt 22663090  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||| |||||| ||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22663091 tttcttgttttgtagtagagacaaaaatagagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 22663190  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||| |||| || ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||  | | | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  22663191 caatgtcttctaatctttccaaaatagttgttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 22663290  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||||| ||  |  || |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  22663291 aag--ttgcatctcctaatgaactacaacttctagtgatcttcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcatctgattaccttgcttctgatga 22663388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14989727 - 14989518
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  14989727 atcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 14989628  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14989627 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 14989528  T
Q  201 aaatgccttc 210  Q
     |||||||||    
T  14989527 caatgccttc 14989518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 379
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745742
Alignment:
Q  233 gcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttc 332  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 22745693  T
Q  333 tggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22745694 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 22745742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24833332 - 24832996
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24833332 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttactgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtaaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 24833233  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | ||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  24833232 tttcttgtcttgtaacagagaca-aaatagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 24833134  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    | ||||| ||||||||| |||||| |||   |||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||| || ||| ||||| |||| | ||||||||     
T  24833133 ccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagccattgcttcact-tttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagcc 24833035  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||  | |||||||||||    
T  24833034 ttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggtgat 24832996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 6407601 - 6407927
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |  | || |||||||||||||||| |||||||    
T  6407601 atcaccaatgatccttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaacattgttgcaggcaaagttgtt 6407700  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||||  ||||||    
T  6407701 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc 6407800  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||         ||||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  6407801 caatgccttc---------caaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagcttt 6407890  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  6407891 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 6407927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13430904 - 13430699
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13430904 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 13430805  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  13430804 atccttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatc 13430705  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  13430704 caatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722602
Alignment:
Q  125 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 224  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  225 tagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||   | |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45568177 - 45567955
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  45568177 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtt 45568078  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| ||||  ||||| |||| ||||| |  || ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| | || ||||    
T  45568077 tttcttgtcttatagcgtagacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatc 45567978  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  45567977 caatgccttcaaatcctttcaaa 45567955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 43639657 - 43639842
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  43639657 atcaccaatcatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 43639756  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagac-acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||||||||    
T  43639757 atccttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaaacgtaacatgtcaacgctctt 43639842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18151908 - 18151713
Alignment:
Q  16 ttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct-gtcttgta 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||    
T  18151908 ttgccttatatggttattgtcctatgaaggataaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgttttttcttgtcttgta 18151809  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 210  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  18151808 gcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 18151713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22461913 - 22461617
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||  | |||| ||  | ||| |||| |||| ||    
T  22461913 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaaaatcaatttcaaatacattccaagtgaggaggagcaccgatgccggcatagttatt 22461814  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| | ||||| ||| ||||   ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  22461813 gttcttgtcttattgcagacaca-aaacaaggtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatc 22461715  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatg--agattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
     ||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||   | |||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22461714 caatgccttcaaatccatttgaattagtcgttgcttcattcttctagtcttctgcaatg---atatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagct 22461618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 45292710 - 45292837
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  45292710 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgagtaaacattgttgcaggcagagctgtt 45292809  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaac 128  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45292810 atccttgtcttgtagcagagacaaaaac 45292837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 21288277 - 21288462
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| | || |  ||||||| |||||||||||| |||    
T  21288277 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgtttccaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgt 21288376  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  |  |||| | ||  |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21288377 tatccttgtcttgtagcagagacaaactcaaagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctctt 21288462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21540827 - 21541041
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  21540827 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttatgcaggcagagctgtt 21540926  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||  ||||| | ||| ||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  21540927 tttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttc--------gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatc 21541018  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
     ||||||||| | ||||||||||    
T  21541019 caatgccttctattcctttcaaa 21541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 28903340 - 28903495
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  28903340 caatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttct 28903439  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  28903440 tgtcttgtagcgtagaca-aaacagagtagtggagctagtggttgtacactttgtac 28903495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33560484 - 33560295
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| || | || |  ||||||| |||||||||||| |||| | | ||    
T  33560484 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatccatttcaaatgcattctcaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttg 33560385  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    |||||||||||||||| |||| |||         |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  |||||  |||||| |||||    
T  33560384 tcttgtagcagagacaaaaacagag---------tagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 33560295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20255787 - 20255675
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20255787 atcaccaatgatattttttctcatatggttattgtcctacgaaggataaatttcaaatccattccatgtatgtatgaacattgttgcaggaagagctgtt 20255688  T
Q  101 atccctgtcttgt 113  Q
    |||| ||||||||    
T  20255687 atccttgtcttgt 20255675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23271390 - 23271239
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||   |     
T  23271390 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatct 23271291  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||  | ||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  23271290 tgtcttgtagcgtagacacaggcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 23271239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7018566 - 7018416
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||| |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||| || |||| | |     
T  7018566 caataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgttgt-ct 7018468  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  7018467 tgtcttgtagcgtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7018416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17519329 - 17519173
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||| |||| |||| | |     
T  17519329 caatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgtttttct 17519230  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17519229 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 17519173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 1745032 - 1745215
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagttg- 98  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| | ||||  |||||||| ||||||||||| ||     
T  1745032 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaattttaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtctgcaggcagagctgt 1745131  T
Q  99 ttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacac-ttcgtacaattgtactttgtcaacgc 181  Q
    || | | |||||||||| ||| ||| |||| ||||| | ||  |||| ||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||    
T  1745132 tttttcttgtcttgtagtagatacagaaacagagtagtggaagtagttgttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgc 1745215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 3843623 - 3843768
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  3843623 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 3843721  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  3843722 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 3843768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 21300980 - 21301081
Alignment:
Q  84 ttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  21300980 ttgcaggcagagcagttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctc 21301079  T
Q  184 tt 185  Q
    ||    
T  21301080 tt 21301081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 8031914 - 8032062
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||| |||||| ||||   |     
T  8031914 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaagcagagctgtttatct 8032013  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  8032014 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 8032062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20259797 - 20259652
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||    
T  20259797 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtct 20259699  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  20259698 tgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20259652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21046427 - 21046282
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||    
T  21046427 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtct 21046329  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21046328 tgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21046282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 26832912 - 26832982
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtat 71  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  26832912 atcaccaatgatttgttgcctgatatggttattgtcttatgaaggaacaatttcaaatccattccaagtat 26832982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 21298887 - 21298944
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaat 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21298887 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaat 21298944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 29379484 - 29379609
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactga 131  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||  |||||||| | ||    
T  29379484 ttgtcctatgaaggattatgttcaaatccattcctatcctgaaggaacatttctgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaatcaga 29379583  T
Q  132 gtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||    
T  29379584 gtcgtggaggtagtggttgtacactt 29379609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 2810689 - 2810748
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    ||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2810689 caatgatccattgcctgattaaggtattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc 2810748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3598340 - 3598286
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3598340 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 3598286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 19461070 - 19461190
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactga 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| ||||  |||||||| | ||    
T  19461070 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttatagcgtagacacaagcaga 19461168  T
Q  132 gtaatagagatagtggttgtac 153  Q
    ||  | ||| ||||||||||||    
T  19461169 gtcgtggaggtagtggttgtac 19461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 19558748 - 19558868
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactga 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| ||||  |||||||| | ||    
T  19558748 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttatagcgtagacacaagcaga 19558846  T
Q  132 gtaatagagatagtggttgtac 153  Q
    ||  | ||| ||||||||||||    
T  19558847 gtcgtggaggtagtggttgtac 19558868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22136038 - 22135934
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  22136038 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 22135940  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  22135939 tgtagc 22135934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 40003104 - 40003265
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | | | |||||||| |||| || |  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  40003104 atcaccaatgatcttttgtctgatttggatgttgtcctaagaagaattacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 40003203  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  |||||||  | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  40003204 tttcttgtcttgtagcgtagacacagtcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 40003265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 58
Target Start/End: Original strand, 43774002 - 43774051
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaat 58  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43774002 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaat 43774051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22167203 - 22167147
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattccca 67  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22167203 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattccca 22167147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 17814847 - 17815229
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17814847 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtagaaacattgttgcaggcagagctgtt 17814946  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17814947 atccttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 17815046  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17815047 taatgctttcaaatcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 17815146  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  17815147 aagtcttgcatctcttgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactgatgac 17815229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 21910435 - 21910787
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  21910435 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgtaggcagaactgtt 21910534  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21910535 atctttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 21910634  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  21910635 caatgccttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgcttt 21910734  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21910735 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 21910787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 7745951 - 7745555
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7745951 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagttgcaggcagagctgtt 7745852  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7745851 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 7745752  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7745751 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 7745652  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  7745651 aagtcttacatctcctgatgtacttcagcttcttgtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttcttatgaccttgcttctgatga 7745555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 89680 - 89328
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  89680 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgatgcaggcagagctgtt 89581  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  89580 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatg 89481  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  89480 caatgctttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagcttt 89381  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  89380 aagttttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttgcttctgatga 89328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6512686 - 6512337
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || | ||    
T  6512686 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcgtagctatt 6512587  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6512586 atccttgtcgtgtagcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaag---c 6512490  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6512489 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagcttt 6512390  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6512389 aagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 6512337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23413234 - 23412880
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctat--gaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttg 98  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  23413234 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattatcctatatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtataagggaacattgttgcaggcatagctg 23413135  T
Q  99 ttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23413134 ttatttttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagca 23413035  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23413034 tccaatgctttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagct 23412935  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23412934 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 23412880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21072490 - 21072131
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||   |||    
T  21072490 tgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcatttgaagtatgaaggaacaatgctacaggcagagctgttattattgt 21072391  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21072390 cttgtagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctt 21072291  T
Q  209 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   | | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21072290 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttg 21072192  T
Q  309 catctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21072191 catctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 21072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19536553 - 19536176
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |     
T  19536553 caatgatcttttgcctgatatggttattgtcatacgaagaatcaatatcaaatccattcc-agtatgtaagaacattgttgcaggcagagctgttattct 19536455  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19536454 tgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatg 19536355  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact-cttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagt 304  Q
    | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  19536354 ctttcaaatccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 19536255  T
Q  305 cttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  19536254 cttgcatctcctgatgaacttctgcttcttgcgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttacttctgatgac 19536176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41566687 - 41566338
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  41566687 caatgataatttgcctgatatgattattgtcctacgaatgatcaatttcaaattcattccatgcatgtaggaacattgtttcaggcagagctgttatcct 41566588  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  41566587 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatg 41566488  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  41566487 ccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtc 41566388  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  41566387 ttgcatctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 41566338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 26784233 - 26784587
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26784233 atcaccaatgatcttttgcctaatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagcatgtaggaacatttttgcaggcagagttgtt 26784332  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26784333 attcttgtcttgtagcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatc 26784432  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     | | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  26784433 cagttcttccaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagcttt 26784532  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    || |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  26784533 aaatcttgcatctcctgctgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatga 26784587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 20550773 - 20551107
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagta-tgtaggaacattgttgcaggcagagttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |  || |||||||| |||||||| | || |||    
T  20550773 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattttcctatgaaggatcaatttcaaatcgattccaatttgtgaaggaacatcgttgcaggaaaagctgt 20550872  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20550873 ttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcat 20550971  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagct 298  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  20550972 ccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagct 20551071  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20551072 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 20551107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 33022547 - 33022895
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | || ||||||||  |||||||||||| | |     
T  33022547 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggcagagcttt- 33022645  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
       | |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  33022646 ---cttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatc 33022742  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33022743 caatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 33022842  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  | |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||  |||||||||||    
T  33022843 a--tgttgcatctcctgatgaactgcaaattctggtgattttcagcttctgatga 33022895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 23880946 - 23881328
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  23880946 atcaccaatgatcttttgccttatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtatgagggaacaatgttgcaggcagagttgtt 23881045  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23881046 attcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatc 23881145  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||   | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23881146 caatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagctt 23881244  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  23881245 t-agtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaccttgcttctgatga 23881328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21099962 - 21099579
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21099962 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattctaagtatgaaggaacattgttgcaagcatagttgtt 21099863  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||    
T  21099862 atccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatc 21099763  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||  | | ||  || ||||||||||||||||||    ||||| || ||||| ||     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21099762 caatgccttcagcttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgc-taggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagcttt 21099664  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||    
T  21099663 aagtctctgatcttctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctgatgac 21099579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13545762 - 13545455
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||| ||||  |||||||||||||||||   | |||    
T  13545762 tgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccatagtgaagggacatcattgcaggcagagttgtttatcttgt 13545663  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcct 208  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  13545662 cttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcct 13545563  T
Q  209 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttg 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13545562 tcaaatcctttcaaagtagttgttgcttcact--------cttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttg 13545471  T
Q  309 catctcctgatgaact 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  13545470 catctcctgatgaact 13545455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 6499118 - 6499471
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  || | ||    
T  6499118 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggatcattgttgcaggcgtagctatt 6499217  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6499218 attcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatc 6499317  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
      |||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | |   || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6499318 cgatgccttcaacttcatttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatac-tgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctt 6499416  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgag 354  Q
    |||||||  ||||| |  |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6499417 taagtct--catcttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgag 6499471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 642960 - 642582
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||    
T  642960 atcaccaatgatcttttgcctaatatggtt--tgtcctataaatgatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaagcatagctgtt 642863  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  642862 atccttgtcctgtagcagagacacaa---gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatc 642766  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| |   ||  || |||  |||| |||||||| |   ||||||| ||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  642765 caatgccttcaactttatttgaattagccgttgtttcactctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 642667  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||  || |||||||||||||  || ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  642666 aagtctctcatcttctgatgaactgcaatttctggtgatcttcagcatctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 642582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 31117761 - 31118102
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||| | || ||||||||  |||||||||| | |||| | |     
T  31117761 caatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgttcaatttcaaatgcgttcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagcgctgtttttct 31117860  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  31117861 tgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatg 31117960  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagt 304  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||  |    
T  31117961 ccttcaaattctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--t 31118058  T
Q  305 cttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttct 348  Q
     |||||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||    
T  31118059 gttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatgaacttgcttct 31118102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21199261 - 21198910
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| || ||||    
T  21199261 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctgtt 21199162  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  21199161 atccttgtccagtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatc 21199062  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||  ||||| ||| | |||  |||||||||| | | ||   | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21199061 caatgccttcaaattcatttgaattagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttt 21198964  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgag 354  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  21198963 aagtctctcatcttctgatgaacttcagctcctggtgatattgcttctgatgag 21198910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 4886901 - 4887237
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4886901 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 4887000  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4887001 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 4887100  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaa-atgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4887101 caatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaat-cttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctt 4887199  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||  |||||| || |||||||||  | |||||||||||    
T  4887200 taag--ttgcatatcttgatgaactgcagcttctggtgat 4887237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29138664 - 29138330
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  29138664 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagttgtt 29138565  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||    
T  29138564 tttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatc 29138465  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||  || ||||  || |||| | |||||| ||||    
T  29138464 caatgccttctaatccttccaaaatagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaacttt 29138367  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29138366 aag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 29138330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9398987 - 9398649
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||| |||||| |     
T  9398987 caatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctgagggaacaatgttgcaggcagagctgttattct 9398888  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||    
T  9398887 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatg 9398788  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||| | | ||  || |||| |||||| ||||| ||| |         || |||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  9398787 ccttcaacttcatttgaattagtcgttgctccactc-tcctg---------at-cttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtc 9398699  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9398698 tctcatcttctgatgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatga 9398649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 30742860 - 30743189
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  30742860 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaagtatcaatttcaaatgcattcccattgtaaaggaacatcgttgcaggtagagctgtt 30742959  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  30742960 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatc 30743058  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |  |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| |||||||||||    
T  30743059 caatgccttcaaatcctttcaaaataatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagcttt 30743158  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttct 333  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  30743159 aag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttct 30743189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 11993767 - 11994103
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || | | ||||||||||||||| || ||||    
T  11993767 atcaccaatgatcttttacctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgcaaggacattgttgcaggcatagctgtt 11993866  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11993867 tttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 11993966  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || |||| | |||||| ||||    
T  11993967 caatgctttcaaatcccttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaacttt 11994066  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  11994067 aag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 11994103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 15516849 - 15517184
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15516849 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctaagaaagatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 15516948  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||  ||||| |||||||    
T  15516949 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatc 15517047  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  15517048 caatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagcttt 15517147  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  15517148 aag--ttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgat 15517184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12353053 - 12352845
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  12353053 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttactgtcctatgagggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgtaggcatagttgtt 12352954  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  12352953 attcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatc 12352854  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  12352853 caatgcctt 12352845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 42243560 - 42243896
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||| |||||| ||||||| ||||||||   || |||||||| |||| ||||| || |||     
T  42243560 atcatcaatgatcctttgcctgatatggttattgtctaaagaatgatcaatttcaaatgcattcccatagtgaaggaacatcgttgtaggcaaagctgtc 42243659  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  42243660 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacat 42243758  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | ||||||||||    
T  42243759 caaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctt 42243858  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  42243859 taag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 42243896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25097083 - 25096777
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  25097083 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcatatgaagaatcaattttaaatccattccaagtctgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 25096984  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtac---tttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 197  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25096983 attcttgtcttgttgcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagc 25096885  T
Q  198 atcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagc 297  Q
    ||| |||| |||||||||||||  || || | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||   |  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  25096884 atccaatgtcttcaaatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagc 25096786  T
Q  298 tttaagtct 306  Q
    |||||||||    
T  25096785 tttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25155053 - 25154747
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  25155053 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcatatgaagaatcaattttaaatccattccaagtctgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 25154954  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtac---tttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 197  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25154953 attcttgtcttgttgcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagc 25154855  T
Q  198 atcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagc 297  Q
    ||| |||| |||||||||||||  || || | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||   |  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  25154854 atccaatgtcttcaaatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagc 25154756  T
Q  298 tttaagtct 306  Q
    |||||||||    
T  25154755 tttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 26759029 - 26759425
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26759029 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctattatgaaggaatattgttgcaggcagagctgtt 26759128  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||   |||| | ||| |||||||  ||||| |||||||    
T  26759129 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatc 26759227  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||   ||  || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  26759228 caatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagcttt 26759327  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  |||||||||  |  || |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  26759328 aag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgataaatttgcttctgatgaatttgcttctgatgaccttgcctctgatga 26759425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3245699 - 3245364
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  3245699 atcaccaatgatcctttgcctaatatgtttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatacgttcccaatgtgaagaaacattgttgcagacagagctgtt 3245600  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  3245599 tttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 3245500  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| |  ||||   || ||||||||    
T  3245499 aaatgcctttcaattctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagcttt 3245401  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3245400 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 3245364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 33933147 - 33933547
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |   || | |||||| |||||||||| || ||||    
T  33933147 atcatcaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgctttcc-atcgtgaatgaacatcgttgcaggcaaagctgtt 33933245  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||  | ||||||||||    
T  33933246 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcat 33933345  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaac--ctttgaag 296  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||| || ||| ||||| ||||||   |||||||    
T  33933346 ccaatgcgtttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaag 33933445  T
Q  297 ctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctg 393  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||  ||||| |||||||  |  |||||||||  |  || ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  33933446 ctttaag--ttgcatcctctgatgaactgcaacttatggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactgtcttctgatgaacttgcttctg 33933543  T
Q  394 atga 397  Q
    ||||    
T  33933544 atga 33933547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30116089 - 30115863
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| | | |    
T  30116089 aatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttctt 30115990  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  30115989 gtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgc 30115890  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttg 233  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||    
T  30115889 ccttcaatcctttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 26765378 - 26765634
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26765378 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 26765477  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||  ||||| |||||||    
T  26765478 tttcttgtcttgtagctgagaca-aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatc 26765576  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 258  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26765577 caatgccttcaaatccttccaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28464597 - 28464389
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28464597 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 28464498  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  28464497 tttcttgtcttatagtagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 28464398  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  28464397 caatgcctt 28464389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14086796 - 14086474
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| | | | || |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  14086796 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgaatttc-attgtgaaggaacatcgttgcaggaagagatgtt 14086698  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  14086697 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 14086598  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    | ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||| ||||| |||| | ||||||||     
T  14086597 ccaatgcattcaaatcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagcc 14086498  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||    
T  14086497 ttaag--ttgcatcctctgatgaact 14086474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 28139486 - 28139738
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |  | || |||| |||||||||||||| ||||    
T  28139486 atcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtt 28139585  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||   ||||| |||||||    
T  28139586 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatc 28139685  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 253  Q
     |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  28139686 caatgtctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttct 28139738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 10848658 - 10848860
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| |||| | | |    
T  10848658 aatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtttttctt 10848757  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  10848758 gtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgc 10848857  T
Q  207 ctt 209  Q
    |||    
T  10848858 ctt 10848860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 32160645 - 32160879
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |   ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  32160645 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctaagggaacatttctgcaggcagagctgtt 32160744  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  32160745 tttcttatcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatc 32160844  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 235  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32160845 caatgccttcaaatcctttcaaattagctgttgct 32160879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35932264 - 35932059
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| | || |  || |||||||||| |||||| |||    
T  35932264 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaaaattgttgcagacagagtagtt 35932165  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  35932164 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatc 35932065  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  35932064 caatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25930400 - 25930205
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| || |  | || |||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||    
T  25930400 tttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgtattcacattgagaagaaacattgttgtaggcagagctgtttttcttgtcttgta 25930301  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 210  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  || || ||||||| |||||||||    
T  25930300 gcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc 25930205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 9088848 - 9089057
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||  |  | || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  9088848 atcaccaatgatcatttgcctaatatggttgttgtcctatgaaggatcgatttcaaatgtattccctttgagaagaaacattgttgcagacagagctgtt 9088947  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  ||||||    
T  9088948 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatc 9089047  T
Q  201 aaatgccttc 210  Q
     |||||||||    
T  9089048 caatgccttc 9089057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 21660098 - 21660275
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21660098 tgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagttgttatccttg 21660197  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||    
T  21660198 tcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgatctt 21660275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35986490 - 35986284
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||   |||||||||||||||||| ||||    
T  35986490 atcatcactgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccaatgtatatagacattgttgcaggcagagctgtt 35986391  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacac-ttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  | ||||| | ||  |||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||    
T  35986390 atccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacacttttgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcat 35986291  T
Q  200 caaatgc 206  Q
    | |||||    
T  35986290 ccaatgc 35986284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23391858 - 23391679
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatcc 104  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  23391858 caatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagcatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattc 23391759  T
Q  105 ctgtcttgtagcagagac-acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
     ||||||||||||||||| | |||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  23391758 ttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctc 23391679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21203904 - 21203796
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || ||||    
T  21203904 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctgtt 21203805  T
Q  101 atccctgtc 109  Q
    |||| ||||    
T  21203804 atccttgtc 21203796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11208243 - 11208011
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||| || || |||||||||||||  | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  11208243 atcaccaatgattttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaagttcaaatccattcttattttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 11208144  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||    ||||||    
T  11208143 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatc 11208045  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgc 234  Q
     ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  11208044 caatgcattcaaatctcttcaaaatagtcgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25112136 - 25111975
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25112136 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 25112037  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||  ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25112036 tttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 25111975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25171227 - 25171066
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25171227 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 25171128  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||  ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25171127 tttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 25171066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 1915302 - 1915457
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||||| |     
T  1915302 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttat-ct 1915400  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  1915401 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 1915457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13736390 - 13736310
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  13736390 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacat 13736310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 25741002 - 25741065
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattc 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25741002 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattc 25741065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 40228544 - 40228694
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  40228544 caatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 40228642  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  40228643 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacactt 40228694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 23478248 - 23478409
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   || |||||||||  | |||||| || ||||    
T  23478248 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctacaggcatagctgtt 23478347  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||| ||||    
T  23478348 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtac 23478409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20215369 - 20215213
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||   |     
T  20215369 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatct 20215270  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  20215269 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 20215213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40033018 - 40032869
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||| |||||| |||||| |     
T  40033018 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaagcagagctgttat-ct 40032920  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacact 156  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||    
T  40032919 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacact 40032869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41566787 - 41566693
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagag 95  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41566787 atcaccaatgataatttccctgatatcgttattgtcctacgaatgatcaatttcaaattcattccatgtatgtaggaacattgtttcaggcagag 41566693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 13405001 - 13405148
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  13405001 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtccaatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 13405099  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  13405100 tgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 13405148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20417172 - 20417022
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||     || |||||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  20417172 caataatcttttgcctgatttagatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctctcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-ct 20417074  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  20417073 tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20417022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 21414193 - 21414338
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  21414193 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 21414291  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21414292 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21414338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 339
Target Start/End: Original strand, 5429985 - 5430099
Alignment:
Q  224 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 322  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||  |||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  5429985 atagctgttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatctcctgatgaa 5430082  T
Q  323 ctttaacttctggtgat 339  Q
    ||  | |||||||||||    
T  5430083 ctgcagcttctggtgat 5430099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 16607392 - 16607469
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaa 78  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  16607392 atcaccaatgatctgttgcctgatttggttattgtcctatgaacgaacaatttcaaatccattccatgtatggaggaa 16607469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 23488394 - 23488458
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23488394 atcaccaatgatcttctgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcc 23488458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 106384 - 106239
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  | ||||||||| |||| | | |||||    
T  106384 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctacaggcagagctgttgt-cttgtct 106286  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||| | |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  106285 tgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 106239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Original strand, 16607528 - 16607603
Alignment:
Q  138 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  16607528 gagatagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcttccaatgccttcaaat 16607603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12352758 - 12352692
Alignment:
Q  319 tgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  12352758 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttttgatgac 12352692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Original strand, 32753963 - 32754085
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| |   |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  32753963 gtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgttt-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 32754061  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  32754062 agtggaggtagtggttgtacactt 32754085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 34638340 - 34638399
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    ||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34638340 caatgatttgttgcttgatttggttattgtcctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 34638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 13533806 - 13533951
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  13533806 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 13533904  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||   ||||||  | | ||  | ||||||||||||||||||||    
T  13533905 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacactt 13533951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25930182 - 25930087
Alignment:
Q  242 ttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||| ||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  25930182 ttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaattgcagcttctggtgat 25930087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30115852 - 30115798
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  30115852 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 30115798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 36095916 - 36095812
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||| |||||| |   || ||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||    
T  36095916 atcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattttgcaggcagagctgttat-cttgtct 36095818  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  36095817 tgtagc 36095812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 36097373 - 36097269
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||| |||||| |   || ||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||    
T  36097373 atcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattttgcaggcagagctgttat-cttgtct 36097275  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  36097274 tgtagc 36097269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 377787 - 377403
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  377787 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccatatatgtaggagcattcttgcaggcagagttgtt 377688  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  377687 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatc 377588  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  377587 caatgccttcaaatcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagtttt 377488  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  377487 aagtcttgcatctcctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 377403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 220121 - 220504
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  220121 atcatcaatgatcttttgcctgttatggttattgtcctatgatggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 220220  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  220221 atccttgtcttttagcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatc 220320  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||||||| | ||  || |||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||    
T  220321 caatg-cttcaaattcatttgaattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagcttt 220419  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  220420 aagtctctcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 220504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 244510 - 244256
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||| || |||||||| |||||||||| || ||||    
T  244510 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccgtttaaagtctggaggaacatcgttgcaggcatagctgtt 244411  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||  ||||| |||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  244410 attcttgtcctgatgcagaaaca--aacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatc 244313  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaa 257  Q
     |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  244312 caatgtcttcaaatccttttgaattagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 211283 - 211631
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||| |  | ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  211283 atcaccaatgatcattttcctgatatggttattgtcctaataaggataaatttcaaatgcattcccatt--gaaggaacatcattgcaggcagagctgtt 211380  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  211381 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 211480  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  211481 aaatgcattaaaatccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagcttt 211580  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||   ||||||||||||||| ||  | |||||| | | ||||||||||||||    
T  211581 aag--ctgcatctcctgatgagctacagcttctgataaacttgcttctgatga 211631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 1573 - 1969
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  1573 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatcctctgaagtatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaatactgttgcaggcagagctgtt 1672  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1673 attcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatc 1772  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1773 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 1872  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1873 aagtcttgcatttcctaatgatttttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatgaccttgcttctgatga 1969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 59899 - 60281
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  59899 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcttatgaaggatcgatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 59998  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  59999 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 60098  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  60099 caatggcttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagcttt 60198  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  60199 aagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctgatgac 60281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 7809 - 8161
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7809 atcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgtagcaggcagagctgtt 7908  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7909 atctttgtcttgtagcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 8008  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8009 caatgaattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 8108  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8109 aagttttgcatctcctgatgaactttagcttctggttatcttgcttctgatga 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 383
Target Start/End: Original strand, 115708 - 115786
Alignment:
Q  305 cttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  115708 cttgcatctcctgatgaacatcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttttgatgac 115786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 151788 - 151734
Alignment:
Q  329 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  151788 cttctggtgatcttgcttctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 151734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 151831 - 151794
Alignment:
Q  269 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 306  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  151831 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10883452 - 10883072
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10883452 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagatctgtt 10883353  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10883352 attcttgtcttgtagcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatc 10883253  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10883252 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaacttt 10883153  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10883152 aagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctga 10883072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13138174 - 13137833
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13138174 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgtaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 13138075  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13138074 atccttgtcttgtagcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 13137975  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13137974 caatgccttcaaatcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagcttt 13137875  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  13137874 aagtcttgcatctccttatgaactagagcttctggtgatctt 13137833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16316836 - 16316454
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||| || |    
T  16316836 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaatgattaatttcaaatccattccaagtataagggaacattgttgcaggaagagctgct 16316737  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16316736 gttcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatc 16316637  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16316636 caatggcttcaaatcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 16316537  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16316536 aagtcttgcatcccctgatgaacttcaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 16316454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 11319284 - 11319660
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  11319284 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcatatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcaggactgtt 11319383  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11319384 atccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatc 11319483  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  11319484 caatgcattcaaatcctttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttg 11319583  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 375  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11319584 aagtcttgcatctcttgatgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctt 11319660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 13302690 - 13303030
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13302690 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcc-agtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctgtt 13302788  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13302789 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 13302888  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13302889 taatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 13302988  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  13302989 aagtcttgcatctcctaatgaactacagcttctggtgatctt 13303030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 13879983 - 13880366
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13879983 atcaccaataatctttttcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgtt 13880082  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13880083 atccttgtcttgtagcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatc 13880182  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  13880183 taatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagcttt 13880282  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    | ||||||||  ||||||||||||  | |||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13880283 atgtcttgcaattcctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13880366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2913887 - 2913546
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2913887 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggatcattgttgcaggcagagttgtt 2913788  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2913787 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 2913688  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  2913687 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagattt 2913588  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  2913587 aagtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatctt 2913546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 11792786 - 11793162
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  11792786 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcatatccattcaaagtatgaaggaacattgttgcaggcaaagctgtt 11792885  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11792886 attcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 11792985  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  11792986 aaatgctttcaaatgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagcttt 11793085  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagctt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11793086 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgtttatgatgaacttgctt 11793162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21283647 - 21283256
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  |  || |||| ||||||||||||| |||| | |     
T  21283647 caatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattccaattgagaggggacatagttgcaggcagagctgtttttct 21283548  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  21283547 tgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatg 21283448  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21283447 ccttcaaatcctttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc 21283348  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21283347 ttgcatatcctgatgaacttcaacttctggtgatcttgcttctgatgagattcttctgatgaacttgattctgatgaccttgcttctgatga 21283256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29935617 - 29935272
Alignment:
Q  21 tgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  29935617 tgatatagttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagag 29935518  T
Q  121 acacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttc 220  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29935517 acacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttc 29935418  T
Q  221 aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29935417 aaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatctcctgatg 29935319  T
Q  321 aactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29935318 aactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatga 29935272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12367027 - 12366646
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12367027 atcaccaaagatcttttgccagatatggttattgtcctatgaacgatcaatttcaaatccattccaagtatgtaggaacattgttgcaggcatagctgtt 12366928  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12366927 tttcttgtcttgtagcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatc 12366828  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  12366827 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagcttt 12366728  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||    
T  12366727 aagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 12366646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 21695280 - 21695634
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21695280 atcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcagagctgtt 21695379  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21695380 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 21695479  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21695480 caatgccttcaaatcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagcttt 21695579  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21695580 aagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 21695634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 353
Target Start/End: Original strand, 21692173 - 21692517
Alignment:
Q  8 atgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  21692173 atgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcagagatgttatacttg 21692272  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21692273 tcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcc 21692372  T
Q  208 ttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtctt 307  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  21692373 ttcaaatcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtctt 21692472  T
Q  308 gcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||    
T  21692473 gcatctcctaatgaacttcagcttctgatgat-atgcttctgatga 21692517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33691991 - 33691653
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33691991 atcatcaatggtcttttgcctgatatggttattgtcccatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 33691892  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33691891 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 33691792  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33691791 taacgcctttaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagcttt 33691692  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  33691691 atgtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 33691653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 44466942 - 44467298
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagta-tgtaggaacattgttgcaggcagagttgt 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  || |||||||| |||||||||| || |||    
T  44466942 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaatttgtgaaggaacatcgttgcaggcatagctgt 44467041  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44467042 ttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcat 44467141  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagct 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44467142 ccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagct 44467241  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44467242 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatga 44467298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 28408918 - 28409301
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||| |||||| ||||||||| |    
T  28408918 atcaccaataatcttttgtctgatatggttattgtcctctaaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcatgcagagttgct 28409017  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  28409018 tttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatc 28409117  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28409118 caatgccttcaaatcctttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcctt 28409217  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtga-tcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28409218 atgtcttgcatctcttgatgaactttagcttctggtgactgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 28409301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 9069441 - 9069826
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  9069441 atcaccaacgatcttttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaaattcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagatgtt 9069540  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||     
T  9069541 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcata 9069640  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9069641 caatgcctttaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagcttt 9069740  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9069741 aagttttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctgatgac 9069826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13730954 - 13730628
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||    
T  13730954 atcaccaatggtcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttaaaatccattcccagtatgtaggaacatcgttgcaagcagagctatt 13730855  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13730854 atccttgtcttgtaacagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 13730755  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13730754 caatgcattcaaatcttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 13730655  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaacttta 327  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  13730654 aagccttgcatctcctggtgagcttta 13730628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 30025784 - 30026138
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30025784 atcaccaacgatcttttgcctgatatggttatagtcatctgaaggatcaatttcaaatccattctaattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 30025883  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30025884 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatc 30025983  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| | || | |||||||||||    
T  30025984 gaatgccttcaattcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagcttt 30026083  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  30026084 aagtcttgcatctcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 30026138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 2499917 - 2500234
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| | | |  |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  2499917 atcaccaatgatcattttcctgatatggttattgtcctctaaatgatcaatttcaaatccattccaattgtaaaggaacatcgttgtaggcagagctgtt 2500016  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  2500017 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatc 2500116  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2500117 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 2500216  T
Q  301 aagtcttgcatctcctga 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2500217 aagtcttgcatctcctga 2500234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30945635 - 30945285
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||| || ||||    
T  30945635 atcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattctgagggaacattgttgcaggcatagctgtt 30945536  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||| |||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  30945535 tttcttgtcttgtagctgagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatc 30945436  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30945435 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagcttt 30945336  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  30945335 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatgaacttgcttctgatga 30945285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30944594 - 30944253
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||| | | |||    
T  30944594 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgagggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgt 30944495  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcct 208  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  30944494 cttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcct 30944395  T
Q  209 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||    
T  30944394 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttg 30944297  T
Q  309 catctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatg 352  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| ||| | |||||||||||    
T  30944296 catctcctgatgaactgcagcttctgatgaacgtgcttctgatg 30944253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13260889 - 13260520
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||| |     
T  13260889 caatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagaggcattattct 13260790  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13260789 tgtcttgtagcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatg 13260690  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    | ||||       | | |||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  13260689 ctttca-------taagaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatcca-ttaacagtctttggagctttaagtc 13260598  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  13260597 ttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctaatgagatgcttatgatgaacttgcttctgatgac 13260520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Original strand, 24788033 - 24788372
Alignment:
Q  14 ttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||| |||||||| | || | | ||||||||    
T  24788033 ttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccaatttagagggaacatcgttgtaggcagagctatttttcttgtcttgt 24788132  T
Q  114 agcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 213  Q
    || ||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24788133 agtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaa 24788232  T
Q  214 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 313  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788233 tcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 24788332  T
Q  314 cctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24788333 cctaatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 24788372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 111 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22578190 - 22577918
Alignment:
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttc 210  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||    
T  22578190 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttc 22578091  T
Q  211 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22578090 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgca 22577991  T
Q  311 tctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  22577990 tctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttctaatgac 22577918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23280238 - 23279900
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||||| || ||||    
T  23280238 atcagcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcatagctgtt 23280139  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23280138 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcat 23280039  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  23280038 ccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctt 23279940  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23279939 taagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 23279900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 15467795 - 15468179
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| | || ||||    
T  15467795 atcaccaatgatctttttcctgatatggtcattatcctatgaaggctcaatttcaaatccattcccattttgaaggaacatcgttgcaggtaaagctgtt 15467894  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |  | ||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15467895 tttcttgtcttgtagcagagacaaattcagagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 15467994  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  15467995 caatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagcttt 15468094  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||  || ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  15468095 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtaatcttcagcatctgatgagatgcatatgatgaacttgcttctgatgac 15468179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 353
Target Start/End: Original strand, 13648685 - 13648960
Alignment:
Q  78 acattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtca 177  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13648685 acattgttccaggcagagttattatccttgtcttgtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtca 13648784  T
Q  178 acgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatc 277  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  13648785 acgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaatcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatc 13648884  T
Q  278 catttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13648885 cattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatctcctgatgagctttagcttctgttgatcttgcttctgatga 13648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5001101 - 5000788
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5001101 atcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcatatgaaagatcaatttcaaattcattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcaaagttgtt 5001002  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  5001001 attcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatt 5000902  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||| ||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  5000901 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctc 5000802  T
Q  300 taagtcttgcatct 313  Q
    ||||||||||||||    
T  5000801 taagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28622635 - 28622299
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28622635 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 28622536  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||    
T  28622535 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatc 28622436  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  28622435 caatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagcttt 28622336  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  28622335 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 28622299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 110 - 342
Target Start/End: Original strand, 15088508 - 15088740
Alignment:
Q  110 ttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  15088508 ttgttgcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtctt 15088607  T
Q  210 caaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgc 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  15088608 caaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgc 15088707  T
Q  310 atctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  15088708 atctcctgatgaattagagcttctggtgatctt 15088740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16112163 - 16111860
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16112163 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttaatgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 16112064  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16112063 ttccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 16111964  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||| |  ||| | ||| || |||||||  |||||| |||||||||||    
T  16111963 caatgccttcaatttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagcttt 16111864  T
Q  301 aagt 304  Q
    ||||    
T  16111863 aagt 16111860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 331524 - 331877
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  331524 atcaccaatgatattttgcctgatttggttgatgtcctatgaaggatcaatttgaaaaccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 331623  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |  || |||||||    
T  331624 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgct-tttgagcaataagcatc 331722  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttc-aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  || |||||||  |||||||||||||||||    
T  331723 caatgccttcagatcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctt 331822  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  331823 taagtc-cgcatctcctgatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 331877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9710081 - 9709729
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | || |  |||||  |||||||||||| ||||    
T  9710081 atcaccaatgatcttttgcctggtatggttattgtcctatgaaggatgaatttcaaatgcattcccattgtgaataaacatcattgcaggcagagctgtt 9709982  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||| | | ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  9709981 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 9709882  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  9709881 taatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttt 9709782  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9709781 a--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 9709729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39284843 - 39284490
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  39284843 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccgttccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcatagctgtt 39284744  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39284743 atctttgtcctgtagtagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatc 39284644  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||   | |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  39284643 caatgccttcaaattcatttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagcttt 39284545  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
     | |||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  39284544 gattctctcatcttctgatgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39284490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16310186 - 16309961
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16310186 atcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatccattccaagtataagggaacattgttgcagacagagttgtt 16310087  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16310086 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 16309987  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaata 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  16309986 caatgccttcaaatcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41842552 - 41842209
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41842552 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtataaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 41842453  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  41842452 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatc 41842353  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||||| | | ||  || |||| ||||||||||||| |   |||| |||| |||||| | ||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||    
T  41842352 caatgtcttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-tt 41842254  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgct 345  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41842253 aagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgct 41842209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 48237183 - 48236829
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctat--gaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttg 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||| | | || ||||||||  |||||||||||| ||    
T  48237183 atcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatatgaagggtcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctg 48237084  T
Q  99 ttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  48237083 tttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagca 48236984  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  || ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  48236983 tctgatgccttcaaatcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagct 48236884  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  48236883 ttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 48236829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 14426426 - 14426776
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||   |||||| | || |||||||| |||||||||| || | ||    
T  14426426 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaggaatgaacaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctatt 14426525  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14426526 tttcttatcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 14426625  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| | | |||||||||    
T  14426626 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagcttt 14426725  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  14426726 aag--ttgcatctcctgatgaactgcaccttctgatgaacttgcttctgatga 14426776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13018784 - 13018421
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |  || ||||    
T  13018784 atcaccaatgatcttttgcttgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaaaattgttgcagtcgtagctgtt 13018685  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  13018684 attcttgtcctgtagcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatc 13018585  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | |    | ||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  13018584 caatgccttcaacttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctt 13018486  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctga 364  Q
    |||||||  | ||| |  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  13018485 taagtct--cgtcttcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgaggtgcttctga 13018421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35952967 - 35952630
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||| |||||||  ||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35952967 atcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcataagaatgatcaatttcaaatgtattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 35952868  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  35952867 attcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatc 35952768  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||| || ||| ||||| |||| | |||||||| |    
T  35952767 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagcct 35952668  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  35952667 taag--ttgcatcctctgatgaactgcaacttctggtgat 35952630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 143 - 382
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692602
Alignment:
Q  143 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| |||         ||||||||||||||||||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  243 tccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T
Q  343 gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13692563 gcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13692602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19237313 - 19237022
Alignment:
Q  8 atgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  19237313 atgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccttgtctggaggaacatcgttgcaggcatagttgttatccttg 19237214  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcc 207  Q
    | |||  |||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19237213 ttttgatgcaga--cacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcc 19237116  T
Q  208 ttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 302  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  19237115 ttcaaatcctttcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Original strand, 14193019 - 14193243
Alignment:
Q  27 agttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||| |||| | | |||||| || |||||||| ||    
T  14193019 agttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatggttgcaggaagagctgtttttcttgtcttttaacagagacaaaa 14193118  T
Q  127 actgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaata 226  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14193119 acagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaata 14193218  T
Q  227 gttgttgcttcactcttccagtctt 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  14193219 gtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 4821353 - 4821688
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4821353 atcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacattgttgtaggcagagctgtt 4821452  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4821453 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatc 4821552  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||| |||  ||| | ||| || |||   || |||| | |||||||||||    
T  4821553 caatgccttcaaat-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagcttt 4821651  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  ||| |||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  4821652 aag--ttgtatctccggatgaactgcagcttctggtgat 4821688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 33605565 - 33605917
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||| ||||||| |||||| | |  | || ||||| ||||||| || || ||||    
T  33605565 atcaccaatgattttttgcctgatatggttatttttctaagaatgatcaatttcaaatgcattcc-attgcgaagaaacatcgttgcagacaaagctgtt 33605663  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     |   |||||||||||||||||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33605664 tttgttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 33605763  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| || || | || ||||||||||    
T  33605764 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagctt 33605863  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  33605864 ta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 33605917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2265797 - 2265462
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||| || ||||    
T  2265797 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcgtaagaaggatcaatttcaaatgcattcctattaagaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 2265698  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||     
T  2265697 tttcttgtcttgtagcaaagaca-aaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatt 2265599  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| || ||||||||||||||  ||| | ||| || ||||  || |||| | ||| |||||||    
T  2265598 aaataccttcaaatccttccaaaatagccgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagcttt 2265499  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2265498 aag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 2265462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 8182809 - 8183144
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || || |||||| ||||| |||||||||||    
T  8182809 atcaccaatgatcctttgcctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattattgcatgcagagttgtt 8182908  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  8182909 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 8183008  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    || || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || || |  ||  ||||| ||| |||||||    
T  8183009 aagtgtctttcaatcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagcttt 8183107  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
     ||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  8183108 gag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 8183144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12174619 - 12174357
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| || | || |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  12174619 atcaccaatgatcctttgtctaatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattctcattgtgaaggagcatcgttgcaggcagagctgtt 12174520  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  12174519 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtactaaaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 12174421  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctta 263  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12174420 ccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcctta 12174357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48063099 - 48062891
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  48063099 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 48063000  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  48062999 tttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 48062900  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  48062899 caatgcctt 48062891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Original strand, 13683479 - 13683605
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13683479 caataatcttttgcctgatatggtcattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttttcct 13683578  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgag 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13683579 tgtcttgtagcagagacacaaaatgag 13683605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19711285 - 19711059
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||| |||||||||| |||| | | ||    
T  19711285 tgatcctttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttg 19711186  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcc 207  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| ||||||    
T  19711185 tcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgcc 19711086  T
Q  208 ttcaaatcctttcaaaatagttgttgc 234  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  19711085 ttcaaatcctttcaaattagtcgttgc 19711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 1292909 - 1293157
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | || || ||||||  ||||||||||| ||||    
T  1292909 atcaccaatgatcctttgtctgataaggttattgtcctatgaaggataaaattcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattaatgcaggcagagctgtt 1293008  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  1293009 tttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 1293108  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 258  Q
     ||||         |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  1293109 caatg---------cctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttttgcaat 1293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19339529 - 19339324
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | ||||   ||||||||||| | |||||||||    
T  19339529 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtgctatgaacgatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtatagacattgttgcaagtagagttgtt 19339430  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19339429 atccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 19339330  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  19339329 caatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 4494456 - 4494628
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  4494456 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaaaatcgttgcaggcagagctgtt 4494555  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 173  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494556 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 14425326 - 14425651
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| | |  |  ||||||||| | || |||| ||||    
T  14425326 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtaaacaaacattgttacnggtagagctgtt 14425425  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14425426 atccttgtcttgttgcaaagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 14425525  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||         | |||||||||||  |||||   |||  ||||||||||||||||| |||   ||| || ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  14425526 caatg---------catttcaaaatagccgttgccatacttntccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagcttt 14425615  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtga 338  Q
    |||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14425616 aag--ttgcatctcctgatgaactntagcttctggtga 14425651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13034121 - 13033988
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  || ||||    
T  13034121 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaactttgttgcaggcgtagctgtt 13034022  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagta 134  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13034021 attcttgtcatgtagcagagacacaaactgagta 13033988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542978
Alignment:
Q  148 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 247  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16543053  T
Q  248 tcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||||| |||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  16543052 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaact 16542978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 324
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622684
Alignment:
Q  148 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 247  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16622609  T
Q  248 tcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||||| |||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  16622610 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaact 16622684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15704768 - 15704445
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| |  | || || |||||| ||||||||| | ||    
T  15704768 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggaacaatttcaaatgtattcccattgagaagaaatattgtttcaggcagagctatt 15704669  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||         |  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  15704668 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtaca---------aacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 15704579  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  15704578 caatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 15704479  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggt 336  Q
    |||  || ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15704478 aag--tttcatcttctgatgaactacaacttctggt 15704445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 302
Target Start/End: Original strand, 13880603 - 13880768
Alignment:
Q  137 agagatagtggttgtac-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||| ||||||    
T  13880603 agaggtagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgct 13880702  T
Q  236 tcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  13880703 tcactcttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16314814 - 16314708
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  16314814 caatgatcttttgcctgacatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccaatatgtaggaatattgttgcaggcagagctgttatcct 16314715  T
Q  106 tgtcttg 112  Q
    |||||||    
T  16314714 tgtcttg 16314708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27871597 - 27871803
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || |  |||||| ||||||| |||| ||||    
T  27871597 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaataaacattattgcaggtagagctgtt 27871696  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  27871697 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataagcat 27871796  T
Q  200 caaatgc 206  Q
    | |||||    
T  27871797 ccaatgc 27871803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24794994 - 24794813
Alignment:
Q  2 tcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| | ||||  ||||||||| ||  |||||||||||    
T  24794994 tcatcattgatcctttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaacgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcgtgcagagttgtt 24794895  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 182  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24794894 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9098514 - 9098283
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || ||||    
T  9098514 atcaccaatgatctttttcccgatttggttattatactatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacatcgttgcaggcatagctgtt 9098415  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||  | ||| |||          || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9098414 attcttgtcctgatgtagacaca----------aagagag-tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatc 9098326  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctt 243  Q
     ||||| ||||||||||||  || |||  ||||||||||||||    
T  9098325 taatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcactctt 9098283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13894171 - 13893958
Alignment:
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||| |||  ||||    
T  13894171 tgtcttgttgcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatg 13894073  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  13894072 ccttcaaatccttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagta 13893974  T
Q  306 ttgcatctcctgatga 321  Q
    || ||||| |||||||    
T  13893973 tttcatcttctgatga 13893958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032046
Alignment:
Q  139 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||| | | ||  |||||||||||||||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  239 ctcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtct 306  Q
    |||| |  |||||||||||| | ||   | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatac-taggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct 13032046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16545956 - 16545840
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | || | | |    
T  16545956 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatttttctt 16545857  T
Q  107 gtcttgtagcagagaca 123  Q
    |||||||||||||||||    
T  16545856 gtcttgtagcagagaca 16545840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Original strand, 16619706 - 16619822
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | || | | |    
T  16619706 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatttttctt 16619805  T
Q  107 gtcttgtagcagagaca 123  Q
    |||||||||||||||||    
T  16619806 gtcttgtagcagagaca 16619822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21381708 - 21381502
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  21381708 atcaacaatgatcttttgcctgatatggttattatcctatgaagaatcaatttcaaatgcattcccaatgtgtatagacattgttgcaggcagagctgtt 21381609  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca-cttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |  | ||||| | ||  |||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||    
T  21381608 atccttgtcttgttgcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacattttcgtacagacgtactatgtcaacgctctttgaagaataggcat 21381509  T
Q  200 caaatgc 206  Q
    | |||||    
T  21381508 ccaatgc 21381502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13472787 - 13472667
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |    
T  13472787 atcaccaatgatcttttgcctgatat-gttgttgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaccattgttgcaggcatagctgct 13472689  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagac 122  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  13472688 atccttgtcctgtagcagagac 13472667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 334
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  250 ttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13472665 - 13472555
Alignment:
Q  195 agcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttg 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||     
T  13472665 agcatcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttta 13472566  T
Q  294 aagctttaagt 304  Q
    |||||||||||    
T  13472565 aagctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32264998 - 32264816
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttg-t 99  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||| ||||| || |    
T  32264998 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcgttcccaatgtgaataaacattgttgcagacagagctgtt 32264899  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 182  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| || ||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||    
T  32264898 ttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacactctgtacaaacgtactatgtcaacgct 32264816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48806151 - 48805953
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||  ||||||| ||||| |||||| |||| | | ||    
T  48806151 tgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgtataaacattgtttgcatgcagagctgtttttcttg 48806052  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| | ||  |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||  |||||  |||||| |||||    
T  48806051 tcttgtagcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaatagcatccaatgc 48805953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 15088428 - 15088516
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcag 89  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||||    
T  15088428 atcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattgttgcag 15088516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2266601 - 2266502
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2266601 atcaccaatgatcctttgtctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcctattaagaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 2266502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4412242 - 4412079
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| | |  |  ||||||||| |||||||||| |||    
T  4412242 atcaccaatgatcttttgtctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcgaattcgttcccaatgtaaataaacattgtttgcaggcagagctgt 4412143  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtaca 163  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4412142 tttccttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtaca 4412079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8999164 - 8999014
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||||       
T  8999164 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-at 8999066  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  8999065 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 8999014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9099320 - 9099219
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| || ||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || ||||    
T  9099320 atcaccaatgatctttttcccgatttggttattatactatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacatcgttgcaggcatagctgtt 9099221  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  9099220 at 9099219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 383
Target Start/End: Original strand, 14193241 - 14193337
Alignment:
Q  289 ctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  14193241 ctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctgatgac 14193337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11087274 - 11087124
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   |  |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  11087274 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacatttatgcaggcagagctgttat-ct 11087176  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||||||   |||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11087175 tgtcttgtagtgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacactt 11087124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556664
Alignment:
Q  167 gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 254  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16556861 - 16556774
Alignment:
Q  8 atgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagag 95  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | | || |||||||| |||||||||||||    
T  16556861 atgatgtttttcctgatatagttattttcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagag 16556774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Original strand, 16608801 - 16608888
Alignment:
Q  8 atgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagag 95  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | | || |||||||| |||||||||||||    
T  16608801 atgatgtttttcctgatatagttattttcctatgaaggatcaatttcaaatgcattccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagag 16608888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608998
Alignment:
Q  167 gtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 254  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12734392 - 12734247
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||    
T  12734392 atctcttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaatttattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttgtct-tgtct 12734294  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | ||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12734293 tatagcgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacactt 12734247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 18441270 - 18441415
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  18441270 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 18441368  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  18441369 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18441415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26209774 - 26209629
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  26209774 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 26209676  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  26209675 tgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacactt 26209629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 29590067 - 29590212
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  29590067 atcttttgcctgatttgggtgtagtcatatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 29590165  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| |  || ||||||||||||||||    
T  29590166 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacactt 29590212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 602648 - 602828
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||  | | ||  ||||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  602648 caatgatcctttgcctgatttggatatagtcctatgaagaattgatttcaaatccattctgaatttgagggaacatttctgcaggcagagctgtttttct 602747  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacaca-aactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||| ||||||  ||||| | ||| ||||| | |||  ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  602748 tgtcctgtagcgtagacaaagaacagagtagtggaggaagtggttgtacgcttcgtacaaatgcattttgtcaactctctt 602828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3476543 - 3476421
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  3476543 gtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 3476445  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  3476444 agtggaggtagtggttgtacactt 3476421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13174836 - 13174777
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13174836 caatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcc 13174777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Original strand, 15216414 - 15216536
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  15216414 gtcctatgacagatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgcagacaaaaacagagt 15216512  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  15216513 agtggaggtagtggttgtacactt 15216536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7339883 - 7339832
Alignment:
Q  271 ttaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7339883 ttaaatccattaaacaatttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 7339832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 18419189 - 18419334
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  |||||| |||| |||| |   |||||    
T  18419189 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgttgttt-tgtct 18419287  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  18419288 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18419334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19236957 - 19236907
Alignment:
Q  333 tggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  19236957 tggtgatgttgcttctgatgaggtggttctgacgaacttgcttctgatgac 19236907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 7488183 - 7488119
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  7488183 atcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctaagagggaacaatttcaaatccattcc 7488119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37985846 - 37985525
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37985846 atcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 37985747  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37985746 atccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 37985647  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37985646 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 37985547  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaa 322  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  37985546 aagtcttgcatctcatgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 16632317 - 16632697
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16632317 atcatcaatgatcttttgcctaatatcgttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcagacagagctgtt 16632416  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16632417 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatc 16632516  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16632517 caatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 16632616  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||    
T  16632617 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctgatg 16632697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 37435769 - 37435373
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37435769 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagttgcaggcagagctgtt 37435670  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| ||||||||||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  37435669 tttcttgtcttatagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 37435570  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37435569 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 37435470  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37435469 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 37435373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29680778 - 29680410
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29680778 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctctgaaggatcaattttaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 29680679  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29680678 atccttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 29680579  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29680578 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagcttt 29680479  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  29680478 aagtcttgcatctcctggtaaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 29680410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12811409 - 12811028
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12811409 atcaccaatgatcttttgcctgatatgtttattgtcctttgaatgatcaatttcaaatccattccttgtatgtaggaacattgttgcaggctgagttgtt 12811310  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  12811309 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatc 12811213  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12811212 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagcttt 12811113  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  12811112 aagtcttgcatctcctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatgac 12811028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 45833271 - 45833655
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45833271 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtt 45833370  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||| |||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45833371 tttcttgttttgtagcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatc 45833470  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45833471 caatgcattcaaatactttcaaaatagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 45833570  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  45833571 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctgatgac 45833655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 55380167 - 55380519
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  55380167 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 55380266  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55380267 attattgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 55380366  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||     ||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  55380367 caatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctt 55380465  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  55380466 taagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctgatgatcttgcttctgatga 55380519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 19666249 - 19666567
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  19666249 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaagaatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctatt 19666348  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  19666349 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtatt 19666448  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  19666449 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagcttt 19666548  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgat 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19666549 aagtcttgcatctcctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 3395467 - 3395808
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3395467 atcaccaatgatccttagcctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 3395566  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3395567 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatc 3395666  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  3395667 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagattt 3395766  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  3395767 aagtcttgcatctcctgatgaactatagcttctagtgatctt 3395808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14605138 - 14604758
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||||||   ||||||||| ||||    
T  14605138 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattg---caggcagagctgtt 14605042  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14605041 tttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 14604942  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaa-tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  || | ||||||||||||    
T  14604941 caatgctttcaaatccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctt 14604842  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14604841 taagtcttggatctcctgatgaagtttagcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 14604758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19621295 - 19620962
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19621295 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcatatgaagaatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaaaattgttgcaggcagagctgtt 19621196  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19621195 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatc 19621096  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19621095 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttt 19620996  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19620995 aactcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14904590 - 14904249
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14904590 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctgtt 14904491  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14904490 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatc 14904391  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| || || | | |||||||||||    
T  14904390 caatgtcttcaaatcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagcttt 14904291  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14904290 aggtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatctt 14904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 19884580 - 19884916
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  19884580 atcaccaatgatcttt-gcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtt 19884678  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19884679 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 19884778  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  19884779 caatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagcttt 19884877  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  19884878 aagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 19884916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22675755 - 22675433
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||||| | ||    
T  22675755 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgtaggcagagctatt 22675656  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22675655 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcat 22675556  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22675555 caaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 22675456  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    ||  | ||||||||||| |||||||    
T  22675455 ta--tgttgcatctcctaatgaact 22675433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 41 - 309
Target Start/End: Original strand, 9140829 - 9141097
Alignment:
Q  41 gaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagag 140  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||    
T  9140829 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagaaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttatagcagagacacaaactgagtagtgaag 9140928  T
Q  141 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9140929 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttact 9141028  T
Q  241 cttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgc 309  Q
     |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9141029 tttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19912115 - 19911760
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||    
T  19912115 atcaccaattatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattcccagtatataggaacattgttgcaagtagagctgtt 19912016  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19912015 attcttgtcttgtagcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcat 19911916  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  19911915 ccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctt 19911816  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19911815 taagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 56034451 - 56034803
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  56034451 atcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagttgtaggcagagctgtt 56034550  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  56034551 atccttgtcttgtagtagagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatc 56034650  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  56034651 caatgccttcaaattatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagcttt 56034750  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  56034751 aagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 56034803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 6641561 - 6641942
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |  ||||    
T  6641561 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatatctgtt 6641660  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| | ||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6641661 attcttgtcctatagcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatc 6641760  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||  || |||  |||| ||||||||||   |||||| |||||| ||     |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6641761 aaatgccttcaaatccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttt 6641859  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    || |||  ||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  6641860 aaatctctcatcttctgatgaaattcagcttctggtgatattgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttatgatgac 6641942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 10072812 - 10073134
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||| || | ||||    
T  10072812 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggtagggctgtt 10072911  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| ||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||    
T  10072912 tttcttgtcttatagcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctc 10073011  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10073012 caatgccttcaaatcctttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagcttt 10073110  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10073111 aagtcttgcatctcctgatgaact 10073134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 368
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601345
Alignment:
Q  122 cacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttca 221  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  222 aaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcgagatga 12601298  T
Q  322 actttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaa 368  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12601299 gctttaacttctagtgatcttgcttctgatgagatgcttcttatgaa 12601345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 10692728 - 10693064
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  10692728 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 10692827  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10692828 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatc 10692927  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  10692928 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagcttt 10693027  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  10693028 aag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 10693064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 10906494 - 10906830
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  10906494 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 10906593  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10906594 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatc 10906693  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  10906694 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagcttt 10906793  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  10906794 aag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 10906830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13576348 - 13575996
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | || |  |||||  |||||||||||| ||||    
T  13576348 atcaccaatgatcttttgcctggtatggttattgtcctatgaaggatgaatttcaaatgcattcccattgtgaataaacatcattgcaggcagagctgtt 13576249  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||| | | ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  13576248 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 13576149  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13576148 taatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttt 13576049  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13576048 a--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 13575996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 54679805 - 54680157
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  54679805 atcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgttgcagacggagttgtt 54679904  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa--ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
     | | |||||| ||||||||||| |||  | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| ||    
T  54679905 tttcttgtcttttagcagagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaaca 54680004  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || |  ||||| |||| | |||||||||    
T  54680005 tccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagct 54680102  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  54680103 ttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 54680157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 23750399 - 23750755
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23750399 atcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttaaaattcattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 23750498  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttca-aagaacaagcat 199  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| || |||||||||    
T  23750499 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcat 23750595  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagct 298  Q
    |||||||||| || | | ||  ||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||   | ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23750596 caaatgcctttaacttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagct 23750694  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  23750695 ttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggttatctttaacttctgatgagatg 23750755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 383
Target Start/End: Original strand, 40846003 - 40846360
Alignment:
Q  28 gttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaa 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  40846003 gttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaatgttgcaggcggagctgttattcttgtcttgtagcagagatacaaa 40846102  T
Q  128 ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatag 227  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| | | ||  || |||    
T  40846103 ctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaacttcatttgaattag 40846202  T
Q  228 ttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttt 326  Q
    | ||||||||||| | |  |||||||||||||| ||   | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||     
T  40846203 tcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttc 40846301  T
Q  327 aacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  40846302 agcttccggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 40846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 3483607 - 3483952
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | || |||||||  |||||| ||| |  | ||    
T  3483607 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgtgaaggaacaacgttgcaagcaaaactatt 3483706  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||| |||||||||||||| |||| |||||         |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  3483707 tttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagta---------gtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatc 3483797  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |   |||||||||||    
T  3483798 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagcttt 3483897  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3483898 aagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatga 3483952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 412878 - 413231
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  412878 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttactgttctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagaactgtt 412977  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacaca-aactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | ||| |||||||| ||||| | ||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  412978 tttcttgttttgtagcaaagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacat 413077  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
      |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  413078 tcaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctt 413177  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  413178 taag--ttgaatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 413231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 17247120 - 17247503
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | || || |||||  |||| ||||||| ||||    
T  17247120 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatctttgctggcagagctgtt 17247219  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | || ||||||| ||||||| ||| | ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||    
T  17247220 tttcttgccttgtagtagagacaaaaaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacat 17247319  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  17247320 tcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcact-ttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctt 17247418  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||   | ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  17247419 taag--attcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 17247503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 29121246 - 29121550
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgt- 99  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| || | || |||||||| |||||||||||||||||     
T  29121246 atcaccaatgttcttttgcctgatatggttattgtcctaagaagggtcaatttcaaatgcattctcattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtg 29121345  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
    | | | ||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29121346 ttttcttgtcttgtaacagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcat 29121445  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | |||||||| |    
T  29121446 ccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagcct 29121545  T
Q  300 taagt 304  Q
    |||||    
T  29121546 taagt 29121550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 6517362 - 6517698
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6517362 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgccctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgggaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 6517461  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  6517462 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 6517561  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
      |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || || ||| |||||||||||    
T  6517562 tcatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagcttt 6517661  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6517662 aag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 6517698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 8105515 - 8105913
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8105515 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 8105614  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | | |||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  8105615 tttcttatcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 8105713  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||  || ||| ||||| |||||| ||||||||     
T  8105714 ccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagcc 8105813  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgat 395  Q
    |||||  |||||||  || ||||||   ||||||||||||| ||   ||||||||  |  || ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  8105814 ttaag--ttgcatcctctaatgaacggcaacttctggtgatttttaacttctgataaacttgcttctgatgaactcacttctgatgaacttgcttctgat 8105911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17398908 - 17398598
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17398908 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 17398809  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  17398808 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 17398709  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||         |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||   ||| || ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  17398708 caatg---------cctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagcttt 17398619  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaac 323  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  17398618 aag--ttgcatctcctgatgaac 17398598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3105653 - 3105304
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  3105653 atcaccaatgatcctttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatatgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 3105554  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  3105553 atccttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatc 3105454  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||| | ||  ||||||||||||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| |  |||| | |||||||||||    
T  3105453 caatacttttcaatcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagcttt 3105355  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  3105354 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatgaacttgcttttgatga 3105304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 352
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833626
Alignment:
Q  177 aacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  277 ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg 352  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 14833626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 12600635 - 12600759
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12600635 atcaacaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagcatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 12600734  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacaca 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  12600735 atccttgtcttgtagcagagacaca 12600759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 11915578 - 11915835
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||  | |||||||| |||||||    
T  11915578 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaataatcaatttcaaatccattccaattatgaaggaacaccggtgcaggcatagttgtt 11915677  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| | | ||| ||| |||| ||||| | |||   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  11915678 gttcttgtcttattgtagacaca-aaacagagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatc 11915776  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11915777 caatgccttcaaatccatttgaaatagtcgttgcttcactcttttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16853380 - 16853602
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| | |  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16853380 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatgtgttcctaatgagaaggaacatcgttgcaggcagagttgtt 16853479  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  16853480 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatc 16853579  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
     ||||| ||||||||| ||||||    
T  16853580 caatgctttcaaatcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 56533295 - 56533033
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||  |||| || | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  56533295 atcatcaatgatcattttcctgatatggttattgtcctaaacaggatcaatttcaaatgtattctcattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 56533196  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     |   |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||| |||    
T  56533195 tttattgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacat 56533097  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctta 263  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  56533096 ctaatgcattcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatcctta 56533033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25651335 - 25651084
Alignment:
Q  4 atcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaa-tccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttat 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| | |  | ||||||||  |||||||| ||| |||| |    
T  25651335 atcaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaaatacattccaattgagaaggaacatctttgcaggccgagctgtttt 25651236  T
Q  103 ccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaa 202  Q
     | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||  ||||| ||||||  |    
T  25651235 tcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattca 25651137  T
Q  203 atgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgc 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25651136 atgccttcaaatccttccaaaatagccgttgcttcacttttcaagtcttctgc 25651084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22190723 - 22190928
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22190723 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtt 22190822  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||  ||||||    
T  22190823 atctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaatcagcatc 22190922  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  22190923 caatgc 22190928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 17540273 - 17540530
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  17540273 atcaccaatgatcttatgcctgatttggttattatcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacactggtgcaggcatagttgtt 17540372  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||| | | ||||| ||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| | |||||    
T  17540373 gttcttgtcctattgcagacaca-aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatc 17540471  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     | || ||||| |||| |   || |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  17540472 cactggcttcacatccatctgaattagttgttgcttcattctttcagtcttttgcaatg 17540530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 16939893 - 16940150
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||| |  | || |||||||| |||||||||| ||||    
T  16939893 atcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcttacgaaggatcaatttcaaatgtatttccattgagaagaaacattgtagcaggcagagctgtt 16939992  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| || |||| ||||  || | | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||     
T  16939993 tttcttgtcttgtagtagggacaaaaacatagcagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcatt 16940092  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 258  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  16940093 caatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat 16940150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 40860544 - 40860749
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  40860544 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcagtcagagctgtt 40860643  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  40860644 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 40860743  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  40860744 caatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39419961 - 39419787
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  39419961 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttg 39419862  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 182  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39419861 tcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 363
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123672
Alignment:
Q  221 aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  321 aactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctg 363  Q
    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23123628 aacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttctg 23123672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 376
Target Start/End: Original strand, 15139283 - 15139482
Alignment:
Q  180 gctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatcca 279  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15139283 gctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcca 15139382  T
Q  280 tttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac-tttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttc 376  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||| ||||||| |||||    
T  15139383 ttgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatgaacttgcttc 15139482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 20977341 - 20977516
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  20977341 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttg 20977440  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  20977441 tcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 20977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 23123396 - 23123527
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  23123396 atcaccaatgatcttttgcctgatatggtaattgtcctctgaaggatcaatttcaaattcattccatgtatgtaggaacattgttgtaggaggagctgtt 23123495  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgag 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23123496 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgag 23123527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41115003 - 41114746
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||| || ||||    
T  41115003 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacactggtgcaggcatagctgtt 41114904  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| | ||| | ||| || | ||||  | || |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |||  || |||||||    
T  41114903 gttcttgtcttattgcatacaca-aatcagagtggtggaaatagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatc 41114805  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     ||||||||||||| | ||  ||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  41114804 caatgccttcaaattcatttgaaatagccgttgcttcattcttctagtcttttgcaatg 41114746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 38513762 - 38513939
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||| | |  |    
T  38513762 tgatcctttgtctgatatggttattgtcgtatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgtttttctcg 38513861  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38513862 tcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 38513939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27188866 - 27188690
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| | |||| |||||||| |||||||||||| |||||| | ||    
T  27188866 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattttaaatgtgttcccaatgtgtatgaacattgtttgcaggcagagatgttattcttg 27188767  T
Q  108 tcttgtagcagagac-acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  27188766 tcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 27188690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3499879 - 3499704
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||| | | ||    
T  3499879 tgatcctttgcctgatatggttatttttctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttg 3499780  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    ||||||| |||||||| |  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3499779 tcttgtaacagagacaaactcagagtagtagaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctc 3499704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15475370 - 15475193
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| | || |  ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||    
T  15475370 tgatcttttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatcctatcccaatgtgcataaacattgtttgtaggcagagctgttatccttg 15475271  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||| | ||  || ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  15475270 tcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtattggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctt 15475193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 44397733 - 44397850
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||| |||| | |     
T  44397733 caatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaatgattaaattcaaatccattcccattctaaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttct 44397832  T
Q  106 tgtcttgtagcagagaca 123  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44397833 tgtcttgtagcagagaca 44397850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9751767 - 9751569
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || |  ||||||||| ||||||| || |||| | | ||    
T  9751767 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcatagctgtttttcttg 9751668  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||  |||||  |||||| |||||    
T  9751667 tcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgc 9751569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 1672273 - 1672450
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacatt-gttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||  |||||| ||||| |||||| | ||    
T  1672273 tgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattatttgcagacagagctgttattcttg 1672372  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    | |||||||  |||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  1672373 ttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctt 1672450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 1674748 - 1674925
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacatt-gttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||  |||||| ||||| |||||| | ||    
T  1674748 tgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattatttgcagacagagctgttattcttg 1674847  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    | |||||||  |||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  1674848 ttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgttctt 1674925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 16848424 - 16848574
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |  | |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16848424 atcaccaatgatcctttgcttgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgagaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 16848523  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgt 151  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  16848524 tttcttgtcttgtaggagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 16848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17700992 - 17700866
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| | ||    
T  17700992 tgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcactttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttg 17700893  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagta 134  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  17700892 tcttgtagcagagacaaaaacagagta 17700866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8685676 - 8685509
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||| || |||| |||  | ||||    
T  8685676 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccatttcaagtctggaggaacactggtgcatgcatggctgtt 8685577  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 169  Q
     | | |||| | | ||||| ||| || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685576 gttcttgtcctattgcagacaca-aatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17788278 - 17788067
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||  | |||||||| |  ||||    
T  17788278 atcaccaatgatcttttgcctgattttgttattgtcgtatgaaggatcaatttcaaatccactccaagtatggaggaacaccggtgcaggcacaactgtt 17788179  T
Q  101 atccctgtcttgtagcag-agacacaaact-gagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctcttcaaagaacaagc 197  Q
     |     |||||||  || ||||| ||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| ||||    
T  17788178 gt-----tcttgtactagcagacaaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagc 17788084  T
Q  198 atcaaatgccttcaaat 214  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  17788083 atctaatgcctttaaat 17788067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36210287 - 36210131
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||   |     
T  36210287 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttatgcaggcagagctgtttatct 36210188  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  36210187 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 36210131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14154214 - 14154015
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||| |||||| || |||||||||||   | || |||||||||||||||||||||| | || | | | |||| ||    
T  14154214 tttgcctgatatgaatgttgtcctatgaaagatcaatttgaaatccattcctgttgtgaaggaacattgttgcaggcagagctatttttcttctcttata 14154115  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaa-ttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 213  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||  ||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  14154114 gcagagacaaaaacagagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaagttgtacaatatcaacgttctttgaagtataagcatccaatgctttcaaa 14154015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14778620 - 14778473
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  14778620 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 14778522  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  14778521 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 14778473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33378288 - 33378488
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||| |||  ||||    
T  33378288 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggtagaactgtt 33378387  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  33378388 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacact--------ttgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatc 33378479  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  33378480 caatgcctt 33378488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 55731722 - 55731837
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |  | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  55731722 atcaccaatgatcctttgcatgatatggttattgtcctaagaaagatcaatttcaaatgcattcccattgagaatgaacattgttgcaggcagagctgtt 55731821  T
Q  101 atccctgtcttgtagc 116  Q
     | | |||||||||||    
T  55731822 tttcttgtcttgtagc 55731837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18007232 - 18007087
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||    
T  18007232 atcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttgcaggcagagctgtt-ttcttgtct 18007134  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  |||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  18007133 tgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 18007087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 324
Target Start/End: Original strand, 55731844 - 55731977
Alignment:
Q  188 aagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa 287  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||   ||||||||| ||||||  ||| | ||| || |||||||| |||||    
T  55731844 aagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaa 55731942  T
Q  288 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  55731943 cttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaact 55731977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17993971 - 17993824
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||| |||||  ||||||||||| | |||| |     
T  17993971 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacatttctgcaggcagagctattat-ct 17993873  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  17993872 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtaca 17993824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 11901066 - 11901322
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |    || ||||| |  ||||    
T  11901066 atcaccaatgatctgttgcctgatttggttattgtcctatgaggtatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaaaaccagtgtaggcacaactgtt 11901165  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||  |  ||||||| ||| | || || || |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| || |||| |||||||    
T  11901166 gttcttg--tactagcagacacaaatacagattagtgtagatagtgattgtacacttcgtacaattgtccttttctaacgttctccagagaataagcatc 11901263  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     ||||||||||||  ||||  || |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  11901264 caatgccttcaaaatcttttgaattagtcgttgcttcatgtttctagtcttctgcaatg 11901322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Original strand, 55651455 - 55651577
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  55651455 gtcctatgaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 55651553  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  55651554 agtggaggtagtggttgtacactt 55651577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 15014621 - 15014572
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaa 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15014621 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaa 15014572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14710956 - 14710809
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||  |  |||||||| |||||| |     
T  14710956 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctataggcagagctgttat-ct 14710858  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  14710857 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 14710809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 11535953 - 11536098
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  11535953 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 11536051  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  11536052 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11536098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 376
Target Start/End: Original strand, 22089733 - 22089841
Alignment:
Q  269 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatg 366  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  22089733 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctt-aattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatgaggtacttctgatg 22089831  T
Q  367 aactagcttc 376  Q
     ||| |||||    
T  22089832 cacttgcttc 22089841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 103
Target Start/End: Original strand, 19242129 - 19242226
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatc 103  Q
    |||||||||||| |||||| | | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19242129 caatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaatgatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatc 19242226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 10300642 - 10300787
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  10300642 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 10300740  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||| | |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10300741 tgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10300787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 11515143 - 11515288
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||    
T  11515143 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtct 11515241  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  11515242 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11515288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 49002130 - 49001985
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||    
T  49002130 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtct 49002032  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  49002031 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 49001985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 339
Target Start/End: Original strand, 14571183 - 14571237
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14571183 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 14571237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Original strand, 24713562 - 24713683
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  24713562 gtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagc-gtgacaaaaacagagt 24713659  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  24713660 agtggaggtagtggttgtacactt 24713683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16819525 - 16819420
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||| |||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  16819525 atcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 16819427  T
Q  111 tgtagca 117  Q
    |||||||    
T  16819426 tgtagca 16819420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 17540632 - 17540670
Alignment:
Q  329 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17540632 cttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 17540670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31266949 - 31266804
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  31266949 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaaaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 31266851  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  |||||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  31266850 tgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31266804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41114642 - 41114604
Alignment:
Q  329 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41114642 cttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 41114604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18774828 - 18774724
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  18774828 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattatgcaggcagagctgttat-cttgtct 18774730  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  18774729 tgtagc 18774724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 102)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 49643039 - 49642658
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49643039 atcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 49642940  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49642939 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatc 49642840  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49642839 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagcttt 49642740  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgat 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  49642739 aagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaccttgcttctgat 49642658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 31303268 - 31303651
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31303268 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgccctctgaaggatcaatttcaaatccattgctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 31303367  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31303368 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatc 31303467  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  31303468 aaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagcttt 31303567  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31303568 aagtctttcatctcctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 31303651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 37467215 - 37467567
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37467215 atcataaatgatcttttgcctgatatggttattgtcttatgaatgatcaatttcaaatccattcccagtatgcaggaacattgttgcgggcagagctgtt 37467314  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37467315 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 37467414  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  37467415 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagattt 37467514  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  37467515 aagttttgcatctcctgatgaactactgcttctggtgatcttgcttctgatga 37467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 383
Target Start/End: Original strand, 13948223 - 13948602
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  13948223 caatgatctttttcctaatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccacgtacgtaggaacattgttgcaggcagatctgttatcct 13948322  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13948323 tgtcttgtagtagagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg 13948422  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13948423 ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtc 13948522  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13948523 ttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgac 13948602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 20646036 - 20646421
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20646036 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagaactgtt 20646135  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646136 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 20646235  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  | ||||| |||| |||| |||| || ||| ||||||    
T  20646236 caatgctttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctt 20646335  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20646336 taagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 20646421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14393281 - 14392899
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  14393281 atcaccaatgatcttatgcatgatattgttattgtcctatggaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgccgcaggcagagctgtt 14393182  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14393181 attcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 14393082  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14393081 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaacttt 14392982  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||||||    
T  14392981 aagtcttgtatctcctaatgaacttcagcttctagtgatcttgcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatgac 14392899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29951715 - 29951335
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  29951715 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 29951616  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29951615 atccttgtccagtagcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatc 29951516  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29951515 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagcttt 29951416  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  29951415 aagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 29951335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30000869 - 30000489
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  30000869 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 30000770  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30000769 atccttgtccagtagcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatc 30000670  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30000669 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagcttt 30000570  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  30000569 aagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 30000489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 2561070 - 2561408
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2561070 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggtagagctgtt 2561169  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  2561170 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatc 2561269  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2561270 caatttcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 2561369  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  2561370 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 2561408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12963362 - 12963010
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||  |||| ||||    
T  12963362 atcaccaatgatcttttgcctgatatgtttattgtcctatgaacgatcgctttcaaatccattctaattatgaaggaacattgttgcagatagagctgtt 12963263  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12963262 attcttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatc 12963163  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  12963162 caatgctttcaaaaccttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagcttt 12963063  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12963062 aagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttgcttctgatga 12963010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 15903080 - 15903465
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  15903080 atcaccaacgatcttttgcctgatatggttgatgtcctctgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtgggtacattgttgcaggcagagctgtt 15903179  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaac-aagcat 199  Q
    |||| |||| | ||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15903180 atccttgtcatttagtagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcat 15903279  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  15903280 gcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctt 15903379  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15903380 taagtcttgcatctcctgataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatgac 15903465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16658895 - 16658541
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16658895 atcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcatatgaaggattaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 16658796  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16658795 attcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatc 16658696  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| || |||||||  | |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||     
T  16658695 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttc 16658596  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16658595 aagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38177920 - 38177566
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38177920 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattctcattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtt 38177821  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||||||| || |||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38177820 tttcttgtcttgtagcagagtcaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatc 38177721  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38177720 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagcttt 38177621  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  38177620 aagtcttgcatctcctaataaactagagcttctgatgatcttctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 28581988 - 28582373
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28581988 atcaccaatgatcttttgcctgctatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 28582087  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||| ||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28582088 tttcttgttttgtaccagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 28582187  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28582188 caatgccattaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 28582287  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||  |||||| ||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  28582288 aagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 28582373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17239196 - 17238847
Alignment:
Q  4 atcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  17239196 atcaatgatcttttgcctgatatggtttttgtcctatggaggatcagtttcaaatcaattcaaagtatgaaggaacattactgcaggcagagctgttatt 17239097  T
Q  104 cctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaa 203  Q
    | |||||| ||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  17239096 cttgtcttatagtagagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaa 17238997  T
Q  204 tgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaag 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  17238996 tgctttcaaatcctttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaag 17238897  T
Q  304 tcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17238896 tcttgcatctccttatgcacttcatcttctggtgatcttgcttctgatga 17238847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49553766 - 49553400
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||| || |||||||    
T  49553766 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcagacaaagttgtt 49553667  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | |||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  49553666 tttcctgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatc 49553567  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  49553566 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaacttt 49553467  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  49553466 aagtcttgcatctcctgatgaacttcggcttctggtgatcttacttctgatgagatgcttctaatga 49553400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 6090614 - 6090998
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |  |  |||| || |||||||| |||| ||||    
T  6090614 atcaccaatgatcttttgtctgatatgattattgtcctatgaagaatcaatttcaaatccataccaattgagagggaatatcgttgcaggaagagctgtt 6090713  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  6090714 tttcttgtcttgcagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcatt 6090813  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  6090814 caatgccttcaaatcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagtttt 6090913  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  6090914 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 6090998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 52920290 - 52920671
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |  |    ||||| |||||||||| || ||||    
T  52920290 atcatcaatgatcttttgcctgatatggtt--tgtcatatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagaaaacatcgttgcaggcatagctgtt 52920387  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||| |||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52920388 tttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatc 52920487  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  52920488 aaatgccttcaaatacttt-aaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaacttt 52920586  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  52920587 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 52920671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19889220 - 19888869
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19889220 atcaccaatgatcttttgactgatatggttattttactatgaatgatcaatttcaaatccattctcagtatgttggaacattgttgcaggtagagttgtt 19889121  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||||||||||||    
T  19889120 atccttatcttgtagcagagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatc 19889023  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaaca-acctttgaagctt 299  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| ||||  | ||| ||||||    
T  19889022 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctt 19888923  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19888922 taagtcttgcatctcttgatgaactttagcttctagtgatcttgcttctgatga 19888869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47405698 - 47405346
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  47405698 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtt 47405599  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  47405598 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatc 47405499  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47405498 aaatgccttcaaatcctttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 47405399  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  | ||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47405398 a--tgttgcatctcgtgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47405346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13780861 - 13780575
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13780861 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctcaaaaggatcaatttcaaatctattccatgtacgtaggaacattgttgcaggcaaagctgtt 13780762  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13780761 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatc 13780662  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  13780661 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20627708 - 20627356
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20627708 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtt 20627609  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||||||||| | ||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  20627608 tttcttatcttgtagcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatc 20627509  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | |||||||||||    
T  20627508 caatgccttcaaatccattcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagcttt 20627409  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  20627408 aag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgattttcagcttctgatga 20627356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 41494895 - 41495179
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||   |||| || |||||| ||| || |||||| | | |||||||    
T  41494895 tttgcctgatatggttattgatctatgaatgatcaatttcaaattcattccaagtataagggaatatcgttgcatgcatagctgttattcttatcttgta 41494994  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 214  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41494995 gcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaat 41495094  T
Q  215 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41495095 cctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18121891 - 18121558
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |  |  ||||||        |  |||||||||    
T  18121891 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaattgagagggaaca--------gatagagttgtt 18121800  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| | || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||     
T  18121799 tttcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcatt 18121700  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18121699 caatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttt 18121600  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  18121599 aaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatctt 18121558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 40799756 - 40800108
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40799756 atcaacaatgatcttttccttgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 40799855  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  40799856 tttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatc 40799955  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40799956 caattccttcaaatactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 40800055  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  |  |||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  40800056 a--tgatgcatctcttgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 40800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12726507 - 12726155
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| | |  |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12726507 atcaccaatgatcttttgtgtgatatggttattatcctatgaaggatcaatttcaaattcagtccaattgagagggaacatcgttccaggcagagttgtt 12726408  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||    
T  12726407 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatc 12726308  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  12726307 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagcttt 12726208  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  12726207 aagtcttgaatctcctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgtttctcatga 12726155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 16032407 - 16032757
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  16032407 atcaccaatgattttttgcctgatatggtcattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatttcaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagttgtt 16032506  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    ||   |||| ||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16032507 attgttgtcatgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatc 16032606  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||| ||  ||     |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16032607 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttt 16032705  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||  ||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  16032706 aagtctctcatcttctgatg-acttcaacttcgggtgatattgcttatgatga 16032757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18143021 - 18142677
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |  |  ||||||        |  |||||||||    
T  18143021 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaattgagagggaaca--------gatagagttgtt 18142930  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| | || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||     
T  18142929 tttcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcatt 18142830  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  18142829 caatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagcttt 18142730  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    || |||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  18142729 aaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctgatgaacttgcttctgatga 18142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 47207588 - 47207941
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | || | |||||| ||||||||| ||  ||||    
T  47207588 atcaccaatgattttttgcctgatatggtcattgtcctatgaagaatcaatttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatcgttgcaggctgaactgtt 47207687  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47207688 tttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 47207787  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  47207788 caatgccttcaaatcatttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagttt 47207887  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47207888 ta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 47207941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22804300 - 22804048
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22804300 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaaagttgcaggcagagctgtt 22804201  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22804200 attcttgtcctgtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatc 22804101  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 253  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  22804100 gaatgccttcaagtcctttcaaaatagccgttgcttcactcttctggtcttct 22804048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 313
Target Start/End: Original strand, 13823973 - 13824263
Alignment:
Q  14 ttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgt 113  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  13823973 ttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgt 13824072  T
Q  114 agcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13824073 agcagagacaaaaacagagta---------gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13824163  T
Q  214 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13824164 tcatttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 14955310 - 14955706
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | ||    
T  14955310 atcatcaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctatt 14955409  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14955410 tttcttgtcttgtagcagagata-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatc 14955508  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | |||||||||||    
T  14955509 caatgccttcaaatactttcaaaatagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcttt 14955608  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
     ||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||  |  |||||||||  |  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14955609 gag--ttacatctcctgatgaactgcaacttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 14955706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 11223446 - 11223766
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  11223446 atcaccaatgatattttgcctgatgtagttattgtcctatgaaggatcaattttaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagttgtt 11223545  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11223546 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 11223644  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || | |||||| || ||||| |||| | |||||||||      
T  11223645 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctca 11223744  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||  ||| |||||||||||||||    
T  11223745 aag--ttgtatctcctgatgaact 11223766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 2784947 - 2785344
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2784947 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtccaaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattcttgcaggcagagctgtt 2785046  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| || | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||||||||    
T  2785047 tttcttgtcttgtagcagagaca-aatcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 2785145  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||    
T  2785146 ccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctt 2785245  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatg 396  Q
    ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  |||||| ||  |  || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2785246 taag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctaataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttcagatg 2785343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24775810 - 24775490
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24775810 atcaccaatgattctttgcctaatat-gttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 24775712  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||     
T  24775711 ttacttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcatt 24775612  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  24775611 caatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 24775512  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  24775511 aag--ttgcatctcctgatgaact 24775490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 20724970 - 20725350
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||| | |||||    
T  20724970 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctgaaggaacatcgttgcaagcataattgtt 20725069  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20725070 attcttgtcctgtagtagagaca-aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatc 20725168  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || | | ||||| |||  || |||| |||||||||||||    
T  20725169 caatgtcttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagcttt 20725267  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    || |||  || ||  |||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||    
T  20725268 aattctctcagcttatgatgatcttcagcttctggtgatgtttcttttgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatgac 20725350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 33583112 - 33583510
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  33583112 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 33583211  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  33583212 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaatagagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 33583310  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat-ccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |  || || ||| ||||  |||||| ||||||||     
T  33583311 ccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagcc 33583410  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgat 395  Q
    |||||  |||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  33583411 ttaag--ttgcatcctctgatgaactacaacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctgacgaacttgtttctgat 33583508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 138 - 342
Target Start/End: Original strand, 14969346 - 14969550
Alignment:
Q  138 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14969346 gagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttt 14969445  T
Q  238 actcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||    
T  14969446 actcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttctggtg 14969545  T
Q  338 atctt 342  Q
    |||||    
T  14969546 atctt 14969550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 46350120 - 46349738
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  46350120 atcatcaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaacgatcaatttcaa-tgcattcc-attgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 46350023  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacaca-aactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     |   |||||||||||||||||| | |||  |||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||   ||||||||||||    
T  46350022 ttttttgtcttgtagcagagacaaagaacatagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcat 46349923  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||| |||||| |||||||  |    
T  46349922 ccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtct 46349823  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||| |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  46349822 taag--ttgcttctcctgatgaactgcaacttctggtgattttcagcttctaatgaacttgcttctgatgaactcgcttctgatgac 46349738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 53057004 - 53056621
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | || | ||||||  |||||| || |  ||||    
T  53057004 atcagcaattattttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattaccattgtgaatgaacatctttgcagacataactgtt 53056905  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  53056904 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatc 53056805  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||  || |||||||| |||| | |||||| | ||    
T  53056804 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaacctt 53056705  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||  ||||||| | |||||||||  | ||||| ||||| ||  |||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53056704 aag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctagtgatttttggcttctgataaacttgtttttgatgaactaacttctgatgac 53056621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Original strand, 22140651 - 22140996
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||||||| | || | |     
T  22140651 caatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaacgcgttcccaatgtgcaggaacattgttgcaggcagagctatttttct 22140750  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22140751 tgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg 22140850  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
      |||||| || ||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||| ||||   ||| || ||||| || |||| | |||||| |||||||      
T  22140851 ttttcaaaacccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag-- 22140948  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||    
T  22140949 ttgcatctcctgatgaactgtagcttctgatgaactagcttctgatga 22140996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12389149 - 12388845
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  12389149 atcaccaacgatcttttgcctgatttggttattgtccaatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctaaaggaacatcgttgcaggcatagttgtt 12389050  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || |  ||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12389049 attctagtcttgttgcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatc 12388950  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||| ||||  || |||| || |||||||| |||   ||||||||||| | || |   |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12388949 caatgccttaaaattcttttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttt 12388851  T
Q  301 aagtct 306  Q
    ||||||    
T  12388850 aagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25398532 - 25398168
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |  |  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25398532 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattttaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtt 25398433  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     |   |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||  ||     
T  25398432 tttattgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatg 25398333  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||                  || || ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25398332 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctt------------------cattgtttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagcttt 25398251  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||  |||||| ||   |||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25398250 aagtcttgcatcttatgatgagac---aacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25398168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19249688 - 19249385
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||  || ||||    
T  19249688 atcaccaatgatcttttgcctgattttgttattgtcctatgaaggatcaatttcgaatccattccaagtctgaaggaacactgttgcaggcgtagctgtt 19249589  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | || ||||| ||||||||| ||||   ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19249588 attcttgacttgttgcagagaca-aaacaatgtagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatc 19249490  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  19249489 caatgccttcaaatccttttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagcttt 19249391  T
Q  301 aagtct 306  Q
    ||||||    
T  19249390 aagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 5213460 - 5213822
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5213460 atcaccaatgatcctttgcctgatatggctattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcacgcagagctgtt 5213559  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||  || || |||||||    
T  5213560 tttcttgtcttgtagcatagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgct-tttgaataataagcatc 5213657  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  5213658 taatgccttcaaatccttccaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 5213757  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||| ||||||  || |||||||||    
T  5213758 aag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctgataaacttgcttatgatgaactgcttctgatga 5213822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 29855291 - 29855613
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||||  |||||||| |||  ||||    
T  29855291 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaaagcattcccattgtgaaggaacaacgttgcaggtagaactgtt 29855390  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  29855391 tttcttgtcttgtagcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatc 29855490  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | ||  |||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | |||||||  |    
T  29855491 caatgccttcaaattctttcaaactagccgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtct 29855590  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    ||||  ||||||| | |||||||||    
T  29855591 taag--ttgcatcccatgatgaact 29855613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 21640749 - 21641084
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||    
T  21640749 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttggaggcagagctgtt 21640848  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||  ||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  || || |||||||    
T  21640849 attcttgtcttgtaaaagagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatc 21640948  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||   ||| || ||||| |  |||| | ||||| |||||    
T  21640949 caatgcttttcaatccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggcttt 21641047  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21641048 aag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 21641084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 49666682 - 49666356
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49666682 atcaccaatgatcctttgcctgatatgattattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 49666583  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||  ||||             
T  49666582 tttcttgtcttgtagcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaaga--------- 49666492  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    | ||| |||  ||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  49666491 atatgtctttcaatcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagcttt 49666393  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  49666392 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 49666356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 11868151 - 11868335
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11868151 atcaccaatgatcttttgcctgataaggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgcgaaggaacatcgttgcaggctgagttgtt 11868250  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
     | | ||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11868251 tttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctt 11868335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21605931 - 21605726
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||    
T  21605931 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattatcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttggaggcagagctgtt 21605832  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  21605831 attcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 21605732  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  21605731 caatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21636947 - 21636742
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| | | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  21636947 atcatcaatgatcatttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatgtgttccaaatgtgaataaacattgttgcaggcagagttgtt 21636848  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  21636847 ttgcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 21636748  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  21636747 caatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 50300115 - 50300367
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50300115 atcatcaatgatcctttgcctgatatgattattgtcctaagaaggatcaatttaaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcagacagagctgtt 50300214  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc-ttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| |||         |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||  |||    
T  50300215 tttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagag---------tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacat 50300304  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctta 263  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50300305 ccaatgcgttcaaatcccttc-aaatagcagttgcttcacttttccagtcttctgcaatcctta 50300367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 17668288 - 17668417
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17668288 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctttaaaggatcaatttcaaatagattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 17668387  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactg 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17668388 atccttgtcttgtagcagagacacaaactg 17668417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30054494 - 30054310
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| | ||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  30054494 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggaataaattcaaatgcgttcccaatgtgagtaaacattgttgcaggcagagctgtt 30054395  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  30054394 atctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30054310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46796644 - 46796333
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||  |  | || |||||||||||||||| || ||||    
T  46796644 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcatatgaaagatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaacattgttgcaggcatagctgtt 46796545  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  46796544 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatc 46796445  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||         ||||||||| |||  ||||    ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  46796444 taatg---------cctttcaaattagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttt 46796355  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  46796354 aag--ttgcatctcctgatgaact 46796333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1728285 - 1728129
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  1728285 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttg 1728186  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaa 164  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1728185 tcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9700306 - 9700131
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  9700306 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattttaaatgtgttcccaatgtgtatgaacattgtttgcaggcagagatgttattcttg 9700207  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9700206 tcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 9700131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 40850859 - 40851055
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || |  |||||||||| |||||||||||||    
T  40850859 atcagcaatgatccttttcctgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgaaggcagagttgtt 40850958  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||         |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  40850959 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagag---------tagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 40851049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11909303 - 11909079
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatag-ttattgtcctatgaaggatcaaa-ttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttg 98  Q
    |||| |||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||| ||    
T  11909303 atcaccaatgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctg 11909204  T
Q  99 ttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
    || | | ||||||||| || ||||| ||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  11909203 tttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagca 11909104  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  11909103 tccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23538434 - 23538185
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||  |||| ||||| || |||| | | |||    
T  23538434 tgatcttttctctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtctggaggaacaccgttgtaggcatagctgttgttcttgt 23538335  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcct 208  Q
    | | | | ||| | | ||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||  |||||||    
T  23538334 cctattgaagacata-aaacaatgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgcct 23538236  T
Q  209 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
    |||||| ||||  |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23538235 tcaaattcttttgaaataaccgttgtttcattcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12752897 - 12752683
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||| | | || ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12752897 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaatgatcacgttcaaagccattcctattctgaaggaacatttttgcaggcagagctgtt 12752798  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||  | ||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||    
T  12752797 tttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagttgtggagatagtggtcgtacact--------ttgtactttgtcaacgctctttgaaggataagtatc 12752706  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  12752705 caatgccttcaattcctttcaaa 12752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 51340893 - 51341107
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  51340893 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtactatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcgggcagagctgtt 51340992  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  51340993 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttc--------gtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatc 51341084  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  51341085 caatgccttcaattcctttcaaa 51341107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 12968189 - 12968506
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||  || |||||||  ||||| |||||| ||||| | |  || ||||| || ||||    
T  12968189 atcaccaatgatctattgcctgatttggttattgtcatgtgaaggagaaatttcaaatatattccaagtatggaggaatactagtgtaggcatagctgtt 12968288  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||  | | ||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  12968289 gttcttgtactattgcagacaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatc 12968387  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |  || |||||||||||||||||     
T  12968388 caatgccttcaaattcttttgaattagtcgttacttcatgcttctagtcttctgcaatg-atagatgtgattaaaacatttaaacaacctttgaagcttc 12968486  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatg 320  Q
    || |||| || || ||||||    
T  12968487 aaatctttcagcttctgatg 12968506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 353
Target Start/End: Original strand, 11869137 - 11869302
Alignment:
Q  188 aagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| | | |||| | |||||| ||| |||| |||||    
T  11869137 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcattaaacaa 11869236  T
Q  288 cctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
      |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  11869237 attttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 11869302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 3238584 - 3238703
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||| | | |||    
T  3238584 tgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccattccgaaggaacattgttgcaggcagagatgtttttcttgt 3238683  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaac 128  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  3238684 cttgtagcagagacaaaaac 3238703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 16812095 - 16812184
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcagg 90  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  16812095 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcagg 16812184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 45861849 - 45861693
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  45861849 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 45861750  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
     |   |||||||||||  ||||| ||||  |||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  45861749 ttttttgtcttgtagcgtagacataaacatagtagtggaggtagtggtcgtacactt 45861693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26417948 - 26417698
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||| || |  || | |       
T  26417948 caatgatctgttccctgatttggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacaccggtgcagacacatctgctgtt-- 26417851  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||| | | ||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| ||| |||||||  |||||| ||||    
T  26417850 tgtcctattgcagacaca-aaacagagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatg 26417752  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
    ||||||||| ||||  || |||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26417751 ccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcattcttctagtcttctggaatg 26417698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 10529234 - 10529389
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  10529234 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt-ttct 10529332  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  10529333 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttcgtac 10529389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15833288 - 15833486
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15833288 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattccta--ttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 15833385  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||  ||||| | ||| |||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  15833386 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacact--------ttgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcatc 15833477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 37412494 - 37412650
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  | || |  ||||||| ||||||||| || |||| | | ||    
T  37412494 tgatcattttcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgagttccccatgtgcataaacattgtttgcaggcatagctgttttacttg 37412593  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaa 164  Q
    ||||||||   ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37412594 tcttgtagtgaagacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 14969249 - 14969332
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt 84  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  14969249 atcaccaatgatatttttcctgatatagttattgtcctataaaggatcaatttcaaatccattcccattgtaaaggaacattgt 14969332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15850891 - 15851092
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  || |||||||| | ||    
T  15850891 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctggaggcagagctatt 15850990  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtgg-ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||||||||        ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  15850991 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtttgtacact--------ttgtactttgtcaactctctttgaaggacaagcat 15851082  T
Q  200 caaatgcctt 209  Q
    | ||||||||    
T  15851083 ccaatgcctt 15851092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 2246456 - 2246601
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  2246456 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttatgcaggcagagctgttgt-cttgtct 2246554  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  2246555 tgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacactt 2246601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 16077018 - 16077163
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||    
T  16077018 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacattgctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 16077116  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16077117 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16077163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31114132 - 31113987
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    ||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  31114132 atcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaaaccattcctaacttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtct 31114034  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  |||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  31114033 tgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 31113987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 41045657 - 41045778
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactga 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||||| | ||    
T  41045657 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaatcaga 41045755  T
Q  132 gtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    ||  | ||| |||||||||||||    
T  41045756 gtcgtggaggtagtggttgtaca 41045778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29933705 - 29933559
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaa-ttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtc 109  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| | || ||  ||||    
T  29933705 atcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctattgtct-tgtc 29933607  T
Q  110 ttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  29933606 ttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29933559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29982859 - 29982713
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaa-ttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtc 109  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| | || ||  ||||    
T  29982859 atcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctattgtct-tgtc 29982761  T
Q  110 ttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  29982760 ttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29982713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45858875 - 45858804
Alignment:
Q  152 acacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45858875 acacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 49990143 - 49990258
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||| || ||||    
T  49990143 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgtt 49990242  T
Q  101 atccctgtcttgtagc 116  Q
     | | |||||||||||    
T  49990243 tttcttgtcttgtagc 49990258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 51989295 - 51989144
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||| |||||| | | | ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  51989295 caatgatctttttcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttttct 51989196  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||||| || |  | ||| ||||||||||||||||    
T  51989195 tgtcttgtagcgtagacacaaacagattcgtggaggtagtggttgtacactt 51989144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 13148148 - 13148212
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13148148 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcc 13148212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 22151133 - 22151253
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |   || | |||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  22151133 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaacatttctgcaggcagagctgtttttct 22151232  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaa 126  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  22151233 tgtcttgtagcgtagacacaa 22151253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Original strand, 27883495 - 27883617
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  27883495 gtcctttgaagaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 27883593  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  27883594 agtggaggtagtggttgtacactt 27883617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 383
Target Start/End: Original strand, 41495182 - 41495240
Alignment:
Q  327 aacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41495182 aacttctggtgatcttcagtttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 41495240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 1064227 - 1064372
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  |||||| |||| |||| ||  |||||    
T  1064227 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggtagagctgttgtct-tgtct 1064325  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  1064326 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1064372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29906326 - 29906181
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    ||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||| |||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  29906326 atcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 29906228  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  29906227 tgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaactt 29906181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29947491 - 29947346
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    ||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||| |||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  29947491 atcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 29947393  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  29947392 tgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaactt 29947346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29996645 - 29996500
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    ||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || ||||| |||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  29996645 atcttttgcttgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 29996547  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  29996546 tgtagcgtagacaaaaatagagtagtataggtagtggttgtaaactt 29996500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13199390 - 13199243
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||| ||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  13199390 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggatcatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 13199292  T
Q  111 tgtagcagagac--acaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||| ||||  | |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  13199291 tgtagcatagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 13199243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 6253301 - 6253365
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  6253301 atcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgaaggaacaatttcaaattcattcc 6253365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 397
Target Start/End: Original strand, 33598015 - 33598130
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctga 379  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||    
T  33598015 aacaacttttgaagccttaagt--tgcatcctctgatgaactacaacttttggtgatttttagcttctgatagacttgcttctgatgaactcgcttctga 33598112  T
Q  380 tgaccttgtttctgatga 397  Q
     || ||||||||||||||    
T  33598113 cgaacttgtttctgatga 33598130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15651216 - 15651162
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15651216 atcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 15651162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15662851 - 15662797
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15662851 atcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcc 15662797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21636612 - 21636574
Alignment:
Q  359 ttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21636612 ttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 21636574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Original strand, 12396978 - 12397015
Alignment:
Q  28 gttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12396978 gttattgtcctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 12397015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21605658 - 21605604
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21605658 aacaacttttgaagctttaagt--tccatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 21605604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12388799 - 12388751
Alignment:
Q  335 gtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||    
T  12388799 gtgatgttgcttctgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatgac 12388751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 383
Target Start/End: Original strand, 13824254 - 13824298
Alignment:
Q  339 tcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13824254 tcttgcatctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 13824298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16199752 - 16199704
Alignment:
Q  335 gtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16199752 gtgatgttgcttctgatgaggtgcttcttatgaacttgcttctgatgac 16199704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22766800 - 22766736
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  22766800 atcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgagggaacaatttcaaaaccattcc 22766736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 26203 - 25819
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 26104  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26103 atccttgtcttgtaagagagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatc 26004  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26003 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgcttt 25904  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  25903 aagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgtttttcatgaacgtgcttctgatgac 25819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44651
Alignment:
Q  151 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  251 tctgcaatgcttaaatgagattaaatccattt 282  Q
    ||| |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatccattt 44651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 5)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 49215 - 49584
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  49215 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacatttttataggcagagttgtt 49314  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49315 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 49414  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49415 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagcttt 49514  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaa 368  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49515 aagacttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaa 49584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Original strand, 32373 - 32722
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||     
T  32373 caatgatcgtttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacatttttgcaggcaaagctgttatcct 32472  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32473 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 32572  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32573 cattcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtc 32672  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||||||  |||||||||||    
T  32673 ttgcatctcctgatgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatga 32722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 464 - 351
Alignment:
Q  110 ttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcctt 209  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||    
T  464 ttgtagcgaagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgcctt 365  T
Q  210 caaatcctttcaaa 223  Q
    ||||||||||||||    
T  364 caaatcctttcaaa 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 466
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  599 atcaccaatgatcgtttgcctgatttacttgttgtcctataaaggatcaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtt 500  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagta 134  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  499 tttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagta 466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 56967 - 56822
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  56967 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 56869  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  56868 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 56822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 383
Target Start/End: Original strand, 363 - 742
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  363 caatgatctttttcctaatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccacgtacgtaggaacattgttgcaggcagatctgttatcct 462  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  463 tgtcttgtagtagagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg 562  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  563 ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtc 662  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  663 ttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgac 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18465
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18849 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctttgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaccattgttgtaggcagagctgtt 18750  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18749 atccttgtcttgtaccagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatc 18650  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18649 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 18550  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    || |||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18549 aaatcttgtgtctcctgatgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 18465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 13602055 - 13602439
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  13602055 atcaccaaggatcttttgtctaatatggttattgtcctatgaaggatcaaatttaaatccattcccagtatgtaggagcattgttgcaggcaaagctgtt 13602154  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13602155 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatc 13602254  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13602255 caatgccttcaattcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 13602354  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13602355 aagtcttgcatctcctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 13602439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 15302083 - 15302435
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15302083 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatgaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcatagctgtt 15302182  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15302183 atccttgtcttgtagcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 15302282  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15302283 caatgcctttaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgcttt 15302382  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15302383 aagtcttgcatctcctaatgagctttagcttttggtgatcttgcttctgatga 15302435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 9717726 - 9718110
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9717726 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattctcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 9717825  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9717826 tttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 9717925  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9717926 aaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 9718025  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||   ||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  9718026 aagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctgatgac 9718110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 23284447 - 23284831
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23284447 atcaccaatgatcttttgtctgatatgtttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 23284546  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23284547 attcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcatt 23284646  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23284647 caatgccttcaaatcctttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 23284746  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  23284747 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 23284831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 24116711 - 24117095
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  24116711 atcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaagaacattgttgaaggcagagctgtt 24116810  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116811 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 24116910  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||| |||||||||||||||||||   | | |||||||| ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  24116911 caatgctttcaaatcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctt 24117010  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctga-tgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24117011 taagtcttgcatcttctgatgaacttcatcttctggtgatcttgcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 24117095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20112966 - 20112624
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  20112966 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatctattccaagtatgagggaacaatgttgcagggagagctgtt 20112867  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20112866 attcttgtcttgtcgcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 20112767  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20112766 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctt 20112667  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  20112666 taagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttcaggtgatctt 20112624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12715678 - 12715333
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  12715678 tgatcttttgcctgatatggttgttgtcctctgaatgatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggaagagccgttatccttgt 12715579  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |    
T  12715578 cttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctt 12715479  T
Q  209 tcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctttaagtctt 307  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  12715478 tcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctt 12715379  T
Q  308 gcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12715378 gcatctcctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 12715333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 19623862 - 19624228
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19623862 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatccattctaagtatgaaggaacattgctgcaggcagagctgtt 19623961  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtact-ttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19623962 attcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcat 19624060  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19624061 ccaatgctttcaaatcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctt 19624160  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19624161 taagacttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgtttctgatgagatgcttctgatga 19624228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 32544148 - 32544471
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32544148 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 32544247  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  32544248 tttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatc 32544347  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32544348 caatgcctttaaatcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 32544447  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32544448 aagtcttgcatctcctgatgaact 32544471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 15987116 - 15987437
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  15987116 atcaccaacgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 15987215  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15987216 atccttgtcctgtagtagagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 15987315  T
Q  201 aaatgccttcaaat-cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  15987316 caatgccttcaaatcccttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctc 15987415  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    |||||||  ||||| |||||||    
T  15987416 taagtctctcatcttctgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14100701 - 14100373
Alignment:
Q  4 atcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatc 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || || ||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  14100701 atcaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaagaaacatcgttgcatgcagagttgttttc 14100602  T
Q  104 cctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaa 203  Q
      |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  14100601 t-tgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaa 14100504  T
Q  204 tgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  14100503 tgccttcaaatcctttcaaaatagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaag 14100404  T
Q  304 tcttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14100403 tcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15531890 - 15531509
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15531890 atcaccaatgatcttttaccgggtataattattgtcctatgaaggatcaatttgaaatccattcccattgtgaaggaatatcgttgcaggcagagctgtt 15531791  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| | || ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15531790 tttcttgtcttgtagcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 15531691  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15531690 caatgccttcaaatcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagcttt 15531591  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgat 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15531590 aagtcttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgatcttatgattctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 15531509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26972492 - 26972140
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||| | ||    
T  26972492 atcaccaatgatcttttgcctgatatttttattatcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcagacagagctttt 26972393  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  26972392 tttcttgtcttgtagcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatc 26972295  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26972294 caatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 26972195  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26972194 aagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatga 26972140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 18378196 - 18378496
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacatt-gttgcaggcagagttgt 99  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18378196 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattatcctctgaaagatcaatttcaaaactattcccagtatgtaggaatatttgttgcaggtagagttgt 18378295  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18378296 tatccttgttttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcat 18378395  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  18378396 ccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagctt 18378495  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  18378496 t 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 19086041 - 19086372
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19086041 atcaccaatgatattttgcctaatattgttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgatgcaggcagagctgtt 19086140  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19086141 attcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 19086240  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaa-caacctttgaagctt 299  Q
     ||||          ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || || || ||| |||||    
T  19086241 caatg----------ctttcaaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctt 19086329  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19086330 taagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatctt 19086372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 21624984 - 21625363
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| | |||||||| |||| | ||    
T  21624984 atcaccaatgatcttttgcctgatatagttattatcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacgtcgttgcaggtagagctatt 21625083  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||||  |||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||     
T  21625084 tttcttgtcttgtagcacggacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatg 21625183  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21625184 caatgccttcaaatgctttc-aaatagccgttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgt 21625282  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga-actttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatg 381  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||    
T  21625283 aagtcttgcatctcctgatgagac---aacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttatgatgaacttgcctctgatg 21625363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 51 - 383
Target Start/End: Original strand, 13435465 - 13435799
Alignment:
Q  51 attcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttg 150  Q
    ||||||||||||||||| |  |  || |||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| | |  ||||| | ||| |||||||||    
T  13435465 attcaaatccattcccaatgagaggggacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatagagtagtggaggtagtggttg 13435564  T
Q  151 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13435565 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatct 13435664  T
Q  251 tctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttct 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||    
T  13435665 tctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttatggtgatcttctgcttct 13435764  T
Q  349 gatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  13435765 gatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatgac 13435799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 29917900 - 29918250
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | || | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  29917900 atcaccaatgattttttgcctgatatggtcattgtcctatgaagaatcaatttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatctttgcaggcagagctgtt 29917999  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29918000 tttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 29918099  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
      ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29918100 tgatgccttcaaatcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagcttt 29918198  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  29918199 aagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctgatg 29918250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 18435439 - 18435793
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattccca--gtatgtaggaacattgttgcaggcagagttg 98  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  18435439 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccatagtaagt--gaacatcgttgcaggcagagctg 18435536  T
Q  99 ttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
    || | | |||||||||||||||||| |||| | ||| | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18435537 tttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagca 18435636  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  18435637 tccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagct 18435736  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  18435737 ttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 18435793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16265416 - 16265064
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||  |||||||||||| | ||    
T  16265416 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgcgaaggaacatctttgcaggcagagctatt 16265317  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  16265316 tttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatc 16265217  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| |||||| ||||||||  || | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16265216 caatgcattcaaaacctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttt 16265117  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  | ||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  16265116 a--tgttgcatctcttgacgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 16265064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20730970 - 20730649
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || | || ||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  20730970 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcacattgtgaaggaacatctttgtaggcagagctgtt 20730871  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||| |||||| |||| ||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  20730870 tttcttgtcttgtagctgagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatc 20730771  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  20730770 caatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt 20730671  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
       | || ||||||||||||||||    
T  20730670 --ttgttacatctcctgatgaact 20730649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20488184 - 20487847
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20488184 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 20488085  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20488084 tttcttgtcttgtagcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 20487985  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagatt-aaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| | ||| || ||  ||||| |||||| |||||||| |    
T  20487984 caatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagcct 20487885  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||  |||||||  ||||||||||  ||||||| |||||    
T  20487884 taag--ttgcatcctctgatgaactgcaacttctagtgat 20487847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 22802024 - 22802376
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| | |  || ||||  ||||||||||||| ||||    
T  22802024 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtactatgaatgatcaatttgaaaggcattcccattttcaagaaacaacgttgcaggcagagctgtt 22802123  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  22802124 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatc 22802223  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||| |||||||| | || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22802224 caatgcctttaaattctttcaaacttgtcgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 22802323  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22802324 a--tgttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgattttcagcttctgatga 22802376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 16336010 - 16336346
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  16336010 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgaggagaaacattgttgcaggcagagctgtt 16336109  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||     
T  16336110 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatt 16336209  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||     
T  16336210 caatgccttctaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttc 16336309  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  16336310 aag--ttgcatctcctgatgatctacaacttctggtgat 16336346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 19470554 - 19470934
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||  |||| | ||| |||||||    
T  19470554 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatccattccaagtctgaaggaacaccgttggaagcatagttgtt 19470653  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||| ||||||||| ||  | |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  19470654 attcttgtcttgttgcagagacataacat-agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatc 19470752  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||   | |||||||||  || |||||||||||||||||     
T  19470753 caatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttc 19470851  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |  |||  |||||  |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  19470852 agttctctcatcttttgatgatcttcaacttcttgtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 19470934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 21618126 - 21618463
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | ||    
T  21618126 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctatt 21618225  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     |   |||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  21618226 tttattgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcat 21618325  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| ||||||||||    
T  21618326 ccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctt 21618425  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  21618426 taag--ttgcatcttctgatgaactacagcttctggtgat 21618463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 26943459 - 26943719
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| |  ||||    
T  26943459 atcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtttgaaggaacatcgttgaaggcataactgtt 26943558  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| | ||||| ||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26943559 attcttgtcctatagcaaagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatc 26943658  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgct 261  Q
     ||||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26943659 caatgccttctaatcctattgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgct 26943719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 339
Target Start/End: Original strand, 16877120 - 16877432
Alignment:
Q  25 atagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacac 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||     
T  16877120 atagttattgtcctatgatggatcaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaggcaa 16877219  T
Q  125 aaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaa 224  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||  |||||| ||| |||||||||||||| || |    
T  16877220 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaaga 16877319  T
Q  225 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16877320 tagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 16877417  T
Q  325 ttaacttctggtgat 339  Q
      ||||| |||||||    
T  16877418 acaacttttggtgat 16877432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 350
Target Start/End: Original strand, 19688689 - 19688996
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactga 131  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |  |  ||||| | ||||||||||||| | || | | ||||||||| |||||||| |||| ||    
T  19688689 ttgtcctatgaaggaacaatttcaaatccattccagttgagagggaacgtagttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacaga 19688788  T
Q  132 gtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 231  Q
    |||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19688789 gta---------gtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcct 19688879  T
Q  232 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaactt 331  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||    
T  19688880 tgcttcactcttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaacttcagctt 19688977  T
Q  332 ctggtgatcttgcttctga 350  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  19688978 ctgatgaacttgcttctga 19688996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 15954589 - 15954907
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  15954589 atcaccaatgaacttttgtctgat---gttattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagctgtt 15954685  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||     
T  15954686 tttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatt 15954785  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  15954786 caatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 15954885  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    |||  ||||||||| |||||||||    
T  15954886 aag--ttgcatctcttgatgaact 15954907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19833298 - 19832962
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  | || |||||||||||| |||||| ||||    
T  19833298 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaagaaacattgttgcaagcagagctgtt 19833199  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaag-aacaagcat 199  Q
     | | ||| ||| |||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||||||||    
T  19833198 tttcttgttttgaagcagacaca-aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcat 19833100  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| | ||| ||||||    
T  19833099 ccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctt 19833000  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  19832999 taag--ttgcatctcctgatgaactacatcttctggtgat 19832962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22076673 - 22076337
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||| ||| |  | || |||| |||||||||||||| ||||    
T  22076673 atcaccaatgattctttgcatgatatggttattgtcctacgaagtatcaatttcaaatgtatttccattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtt 22076574  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22076573 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 22076474  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  ||| | ||| |||||||| || |||| | ||| |||||||    
T  22076473 aaatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagcttt 22076374  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  22076373 aag--ttgcatctcctgatgaactacatcttctggtgat 22076337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 25593951 - 25594155
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  25593951 atcaccaatgaccttttggctgatatggttattgtcctctaaaggatcaatttcaaatccattccatgtacgtacgaacattattgcaagcagagctgtt 25594050  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25594051 attcttttcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatc 25594150  T
Q  201 aaatg 205  Q
     ||||    
T  25594151 caatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 383
Target Start/End: Original strand, 25597558 - 25597746
Alignment:
Q  197 catcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaag 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25597558 catccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaag 25597657  T
Q  297 ctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25597658 ctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttcagatgac 25597746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 12423144 - 12423399
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||| |  | || ||||| | ||||||||||||||||    
T  12423144 atcaccaatgattttttgcctgatatggttattgtcctacaaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacatggctgcaggcagagttgtt 12423243  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| |||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||     
T  12423244 tttcttgtcttatagcggagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcata 12423343  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgca 256  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  12423344 caatgccttccaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgca 12423399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21235007 - 21235229
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  | |||||||||| ||||    
T  21235007 atcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcttcgcaggcagagctgtt 21235106  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||||||| | | | ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21235107 tttcttgtcttgtagcagagacaaatatcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcat 21235206  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaa 222  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
T  21235207 cgaatgccttcaaatgctttcaa 21235229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451595
Alignment:
Q  148 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  248 tcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatc 340  Q
    |||||||||||||||| | || | | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 34451595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10640611 - 10640384
Alignment:
Q  74 aggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 173  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| | |||| ||||| ||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10640611 aggaacatcgttgcaggcatagctgttattcttgtcatgtagtagagaca-aaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttt 10640513  T
Q  174 gt-caacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagatt 272  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | ||||    
T  10640512 tttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgatt 10640414  T
Q  273 aaatccatttaacaacctttgaagctttaa 302  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10640413 aaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33352192 - 33351939
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  33352192 atcaccaatgatcctttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcagacagagctgtt 33352093  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  33352092 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt-gaagaataaacatc 33351994  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgca 256  Q
     ||||  ||  ||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||    
T  33351993 caatgtttttcaatcctttcaaaatag-ccttgctatacttttccagtcttctgca 33351939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Original strand, 12348915 - 12349196
Alignment:
Q  40 tgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaataga 139  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||||| | || || ||||||||||||| ||||| |||| |   |||||||||| || |||| |||| ||||| | ||    
T  12348915 tgaaagatcaatttcaaaagcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcagacagagctgttttttttgtcttgtagtagggacaaaaacagagtagtgga 12349014  T
Q  140 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  12349015 gatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatac 12349114  T
Q  240 tcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    | ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| |  |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  12349115 ttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgatgaact 12349196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19066284 - 19066079
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | || |   ||||||||| ||||| || ||||    
T  19066284 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaatagacattgttgtaggcaaagctgtt 19066185  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19066184 atccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 19066085  T
Q  201 aaatgc 206  Q
     |||||    
T  19066084 caatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 17381405 - 17381598
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |  | |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17381405 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagatggatcaatttcaaatc-attcccattgcgaaggaacgtcgttgcaggcagagctgtt 17381503  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa 195  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17381504 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaa 17381598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17316784 - 17316609
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  17316784 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttg 17316685  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  17316684 tcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 17316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 19482642 - 19482817
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  |||||||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  19482642 tgatccttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatacgttcccaatgtgtataaacattgtctgcaggcagagctgttattcttg 19482741  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  19482742 tcttttagtagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 19482817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 20635602 - 20635763
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20635602 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacattgctgcaggcagagctgtt 20635701  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  20635702 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtac 20635763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 16915309 - 16915409
Alignment:
Q  4 atcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatc 103  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  16915309 atcaatgatcttttgccttatatggttattgttctatgaaagatcaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacatcgttgtaggcatagttgttatc 16915408  T
Q  104 c 104  Q
    |    
T  16915409 c 16915409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7586418 - 7586268
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  7586418 caatgatctgttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 7586320  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  7586319 tgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacactt 7586268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14051647 - 14051425
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| || || |||||||||||||  | | || || ||||||  ||||||||||| ||||    
T  14051647 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacatttctgcaggcagagctgtt 14051548  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||  ||| | |||||||    
T  14051547 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaa-tgtactttgtcgactctctttgaaggataagcatc 14051449  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaa 224  Q
     |||| |||||||| | |||||||    
T  14051448 caatgacttcaaattccttcaaaa 14051425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25686885 - 25686761
Alignment:
Q  32 ttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactga 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||  ||||| |||| ||    
T  25686885 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaga 25686787  T
Q  132 gtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25686786 gtagtagaggtagtggttgtacactt 25686761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17608572 - 17608417
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17608572 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 17608473  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
     | | |||||||||||  ||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17608472 tttcttgtcttgtagcgtagaca-aaacaaagtagtggaggtagtggttgtacactt 17608417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 21128110 - 21128265
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  21128110 atcaccaattatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaagaatcgcattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagatgtt 21128209  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    || | |||||||||||  |||||||||| ||||  | ||  ||||||||||||||||    
T  21128210 at-cttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaagtagtggttgtacactt 21128265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 26589489 - 26589667
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||| | ||||  || |||||| | |||||| | |||| | | ||    
T  26589489 tgatcctttgcctggtatggttattgtcctatgaaggatcgatttcaaatgagttcccaatgtgtataaatattgtttgtaggcagggctgtttttcttg 26589588  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacac-ttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  26589589 tcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgctctt 26589667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 22386685 - 22386846
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  || |||||||||   |   || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22386685 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttaaaatccattaatatcttgaaggaacattactgcaggcagagctgtt 22386784  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22386785 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttggtac 22386846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14070328 - 14070106
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | | |  |||||||||||| || || |||||||||||||  | | || || ||||||  ||||||||||| ||||    
T  14070328 atcaccaatgatcttttgtctgatttggatgatgtcctatgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacatttctgcaggcagagctgtt 14070229  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||  ||| | |||| ||||| | |||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||  ||| | |||||||    
T  14070228 tttcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaa-tgtactttgtcgactctctttgaaggataagcatc 14070130  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaa 224  Q
     |||| |||||||| | |||||||    
T  14070129 caatgacttcaaattccttcaaaa 14070106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 25675204 - 25675342
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||    
T  25675204 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgta 25675302  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    ||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  25675303 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 25675342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25735711 - 25735573
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||    
T  25735711 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgta 25735613  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    ||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  25735612 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 25735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9933828 - 9933683
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||    
T  9933828 atcttttgcctgattttggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattccttcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttgtct-tgtct 9933730  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  9933729 tgtagcatagacagaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactt 9933683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 11205985 - 11206130
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| | ||| |    
T  11205985 atcttttgcctgatttggatattgtactatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtgt 11206083  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||| ||||| || | ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  11206084 tgtagcatagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11206130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 324
Target Start/End: Original strand, 21235240 - 21235317
Alignment:
Q  245 cagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
    ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21235240 cagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaact 21235317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 4292765 - 4292910
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||     
T  4292765 atcttttgcctgatttaggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcc 4292863  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  4292864 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4292910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 11235538 - 11235683
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  11235538 atcttttgcctgatttggatattgtcctatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtct 11235636  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| ||   || || | ||| ||||||||||||||||    
T  11235637 tgtagcgtagacaaaagtagaatagtggaggtagtggttgtacactt 11235683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18826395 - 18826250
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | ||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||||| |  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  18826395 atcttttgcctgatttgggtaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 18826297  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  18826296 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18826250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17741836 - 17741714
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| |   |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  17741836 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagatgttgtat-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 17741738  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  17741737 agtggaggtagtggttgtacactt 17741714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18834768 - 18834646
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||||| |  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  18834768 gtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 18834670  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    | | ||| ||||||||||||||||    
T  18834669 agtggaggtagtggttgtacactt 18834646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19452781 - 19452722
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19452781 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcc 19452722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 25679280 - 25679418
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||| |||| || | | | |||||||||    
T  25679280 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgatgt-cttgtcttgta 25679378  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    ||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  25679379 gcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 25679418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17745916 - 17745793
Alignment:
Q  34 gtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagt 133  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  17745916 gtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 17745818  T
Q  134 aatagagatagtggttgtacacttc 158  Q
    | | ||| || ||||||||||||||    
T  17745817 agtggaggtaatggttgtacacttc 17745793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 23006315 - 23006251
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23006315 atcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgagggaacaatttcaaatccattcc 23006251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 23782051 - 23782115
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23782051 atcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgagggaacaatttcaaatccattcc 23782115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 19625691 - 19625769
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattc-aaatccattcccagtatgtaggaa 78  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  19625691 atcaccaatgatctgttgcctgatttggttattgtcctatgaaggaagaatttcaaaatccattccttgtatggaggaa 19625769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 19875715 - 19875773
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatc 59  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  19875715 atcaccaatgatcttttgcttgatttggttattgtcctatgaatgaacaatttcaaatc 19875773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22076329 - 22076291
Alignment:
Q  359 ttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22076329 ttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 22076291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 23296606 - 23296676
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtat 71  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  23296606 atcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctaagaagaaacaatttcaaatccattccaagtat 23296676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Original strand, 25930493 - 25930568
Alignment:
Q  138 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 214  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  25930493 gagatagtggttgtacaatt-gtactattatccttttccaacgctcttcaaggaataagcatccaatgacttcaaat 25930568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 30451774 - 30451738
Alignment:
Q  29 ttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30451774 ttattgtcctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 30451738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5536
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||| | ||| ||||    
T  5918 atcatcaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaacgatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattgttgcagacggagctgtt 5819  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5818 atccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatc 5719  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5718 caatgccttcatatcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctct 5619  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5618 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttcaggtgatcttgcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 5536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19700 - 19318
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  19700 atcaccaacgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 19601  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||||||   |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19600 attcttgtcttgttaaagagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 19501  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19500 caatgcttttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagcttt 19401  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19400 aagtcttgcatctcctcatgaactacaacttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 19318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 99433 - 99039
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |  | || |||| |||| |||| |||| ||||    
T  99433 atcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgtattccgattgagaagaaacaatgtttcaggtagagctgtt 99334  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  || |||  ||||| |||||||    
T  99333 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtca--gcgctttgaagaataagcatc 99236  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||| ||| |||||||   ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  99235 caatgccttgtaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 99137  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |  || ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  99136 aag--ttgcacttcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttacttttgatgaccttgcttctgatga 99039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 12092 - 12476
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||  |||    
T  12092 atcaccaatgatctttttcctgatatgattattgtcctctgaagaatcaatttcaaattcattccatgtatgtaggaacattggtgtaggcagagcagtt 12191  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12192 atccttgtcttgtagcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatc 12291  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  12292 caatgctttcaaattctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagcttt 12391  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12392 aagtcttgtgtctcctgatgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 12476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21199 - 20815
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||    
T  21199 atcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttgaaatccattccaagtgtgacggaacattgttgcaggcaaagctgtt 21100  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  21099 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatc 21000  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20999 caatgccttcaaatcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttt 20900  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20899 aagtcttgcatctcttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgac 20815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 212240 - 212620
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||||||   ||||||||| ||||    
T  212240 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattg---caggcagagctgtt 212336  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212337 tttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 212436  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaa-tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  || | ||||||||||||    
T  212437 caatgctttcaaatccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctt 212536  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  212537 taagtcttggatctcctgatgaagtttagcttctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgac 212620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6073
Alignment:
Q  177 aacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  277 ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg 352  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 6073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 61110 - 61257
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  61110 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-ct 61208  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  61209 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 61257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 246193 - 246139
Alignment:
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  246193 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 246139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 1543 - 1895
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1543 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacattgttgcaggcagagctgtt 1642  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||| ||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1643 tttcttgtcttctagcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatc 1742  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1743 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttt 1842  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1843 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10336 - 9997
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | || ||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  10336 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattccaattgtgaaggaatatcgttgctggcagagctgtt 10237  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10236 tttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatc 10137  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10136 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctt 10037  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10036 taagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15000 - 14816
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | || ||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  15000 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcaattccaattgtgaaggaatatcgttgctggcagagctgtt 14901  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
     | | |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14900 tttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 353
Target Start/End: Original strand, 15003 - 15352
Alignment:
Q  4 atcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  15003 atcaatgatcttttgcctgatatggtttttgtcctatggaggatcagtttcaaatcaattcaaagtatgaaggaacattactgcaggcagagctgttatt 15102  T
Q  104 cctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaa 203  Q
    | |||||| ||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  15103 cttgtcttatagtagagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaa 15202  T
Q  204 tgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaag 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15203 tgctttcaaatcctttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaag 15302  T
Q  304 tcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15303 tcttgcatctccttatgcacttcatcttctggtgatcttgcttctgatga 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 15682 - 16011
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  15682 aatgatcttttgccttatatgattattgtcctatgaaagatcaatttcaaaaccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagcagttatcctt 15781  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaa-ttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15782 gtctagtagcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg 15881  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaa-cctttgaagctttaagt 304  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| |||||| |||  | |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  15882 ccttcaagtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagt 15981  T
Q  305 cttgcatctcctgatgaactttaacttctg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15982 cttgcatctcctgatgaactttagcttctg 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 382
Target Start/End: Original strand, 16005 - 16044
Alignment:
Q  343 gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16005 gcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatga 16044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16361 - 16298
Alignment:
Q  8 atgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtat 71  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  16361 atgatctatttcctgatttggttattgtcctatgaaggaacaatttcaaattcattccaagtat 16298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 7588 - 7940
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7588 atcaccaatgatctattgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 7687  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||     
T  7688 tttcttgtcttgtagcagagaca--aactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacata 7785  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7786 caatgcctttaaatccttccaaaatagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttt 7885  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7886 aagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 7940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 13460 - 13739
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |    
T  13460 aatgatcttttgcttgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatccattcacaatatgtagaaacattgttgcaggaagagatattatcctt 13559  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13560 gtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgc 13659  T
Q  207 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaaca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13660 cttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 353
Target Start/End: Original strand, 13818 - 13861
Alignment:
Q  310 atctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13818 atctcctgatgagctttagcttctggtgatcttgcttctgatga 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27657 - 27305
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |  |  | |||||  |||||||||||| ||||    
T  27657 atcaccaatgatctttttcctaatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattccaattgagaggaaacatcattgcaggcagagctgtt 27558  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27557 tttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatc 27458  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27457 caatgccttcgaatcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagcttt 27358  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  27357 aagtcttgcatctcctgatgaacttcagcatctggtgatcttgcttctgatga 27305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 9852 - 10204
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| | || |  ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  9852 atcaccaatgatcttttgtgtgatatggttattatcctatgaaggatcaatttcaaattcaatccaattaagagggaacatcgttacaggcagagatgtt 9951  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  9952 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatc 10051  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  10052 caatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagcttt 10151  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10152 aagtcttgcatctcctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgcttctgatga 10204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 18914 - 19255
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  18914 atcaccaatgatcttttgcctgatacggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgcgaaggaacatcattgcaggcagagctgtt 19013  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  19014 tttcttttcttgtagcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatc 19113  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  19114 aaatgcctttaaatccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagcttt 19213  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt 342  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  19214 aagtcttgtatcacctgatgaaatagagcttctggtgatctt 19255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22359 - 21962
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  22359 atcaccaatgatcattttcctgatatggttattgtcctaagagggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 22260  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  22259 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatc 22160  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||| |||||||  || ||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||||| |||||| ||||    
T  22159 caatgccttccaatccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaaccttt 22060  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat--cttgcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  |||||||| || |||||||  |||||||||||||     |||||||||  |  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22059 aag--ttgcatcttctaatgaactacaacttctggtgattcacagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 21962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 339
Target Start/End: Original strand, 9519 - 9778
Alignment:
Q  77 aacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtc 176  Q
    |||||||| | |||||||| |||| | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  9519 aacattgtcgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtc 9618  T
Q  177 aacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat 276  Q
    |||||| ||   |||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||| |  || || |||    
T  9619 aacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaat 9717  T
Q  277 ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    || |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  9718 ccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 9778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 22559 - 22913
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || | || |||||||  | ||||||||| | ||||    
T  22559 atcaccaatgatcctttgcctgatatgattattgtcctatgaaagatcaattttaaatgcattcgcattgtgaaggaacaacgatgcaggcagtgctgtt 22658  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  22659 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatc 22758  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22759 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttt 22858  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  22859 aagtcttgcatctcctgatgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatga 22913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 5890 - 6241
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| || ||||    
T  5890 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacaacgttgcaggcatagatgtt 5989  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5990 attcttgtcctgtagcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 6089  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||   | |||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  6090 caatgccttcaaatccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcttt 6188  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    || |||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6189 aaatctctcatcttctgatgaacttcaacttctagtgatattgcttctgatga 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 103454 - 103821
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |  |  |||||||  ||| |||||||| ||||    
T  103454 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcgtccgaaggatcaatttcaaatccattcccattgagagggaacatcattgtaggcagagctgtt 103553  T
Q  101 atccctgtcttgtagcaga-gacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcat 199  Q
     | | |||||||||||||| || | ||||  |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  103554 tttcttgtcttgtagcagaagaaaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcat 103653  T
Q  200 caaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctt 299  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  103654 ccaatgccttaatatcatttcaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctt 103753  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  103754 taagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgtccttgcttctgatgagatacttctgatga 103821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 83 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5093 - 4791
Alignment:
Q  83 gttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 182  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||   ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5093 gttgcaagcagagttgtttttcttgtcttgtagcagggacaaaaacatggtaatggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgct 4994  T
Q  183 cttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccattt 282  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||     
T  4993 ctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattg 4894  T
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgat 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4893 aacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgat 4794  T
Q  381 gac 383  Q
    |||    
T  4793 gac 4791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 9839 - 10176
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  9839 atcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatttcaagtatgaatgaacattgttgcaggcatagctgtt 9938  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9939 atccttgtcttgtagcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 10038  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacc-tttgaagctt 299  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||  ||||||||||||||   |||||||||||||| ||   | ||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  10039 gaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctt 10137  T
Q  300 taagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtga 338  Q
    |||||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  10138 taagtctcttatcttctgatgaacttcagcttctggtga 10176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36898 - 36619
Alignment:
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36898 tgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatg 36799  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  36798 ccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtc 36699  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  36698 ttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 36619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 383
Target Start/End: Original strand, 42107 - 42386
Alignment:
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  42107 tgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatg 42206  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  42207 ccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtc 42306  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  42307 ttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatgac 42386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 36962 - 36904
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatc 59  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36962 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatc 36904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 42043 - 42101
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatc 59  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42043 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatc 42101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 90283 - 89931
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || || |||||  ||||||||| || ||||    
T  90283 atcaccaatgatctatttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacatcattgcaggcaaagctgtt 90184  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  90183 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 90084  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  90083 caatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagcttt 89984  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  89983 aag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatga 89931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 9786 - 10151
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || | |     
T  9786 atcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagcttta 9885  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9886 attcttgtcctgtagcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 9985  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||| | ||  || |||| |||| | ||||||||   ||||||||||||| || | | |||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  9986 taatgccttcaaattcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagcttt 10084  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  10085 aagtttctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatattgcttctaatgaggtgcttctgatga 10151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 352
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30460
Alignment:
Q  177 aacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  277 ccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatg 352  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatg 30460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 215725 - 215342
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  215725 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccaatgtgaaagaacattgttgcaggcagagctgtt 215626  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||  |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  215625 tttcttgtcttgtagcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 215526  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||| | ||||||| |||    
T  215525 caatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagtttt 215426  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||  |||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||  |||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  215425 aag--ttgcatctcctgataaactgcagcttctggtgattttcggcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 215342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 127721 - 127862
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||    
T  127721 tttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgta 127819  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||  ||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  127820 gcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactt 127862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7841 - 7693
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |   || | |||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  7841 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagcatcaagttcaaattcattcatatcttgaatgaacatttctgcaggcagagctgttatact 7742  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||  | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  7741 tgtcttgtagcgcagacacactcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 157
Target Start/End: Original strand, 140905 - 141021
Alignment:
Q  40 tgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaataga 139  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||    
T  140905 tgaaggatcaacttcaaactcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgga 141003  T
Q  140 gatagtggttgtacactt 157  Q
    | ||||||||||||||||    
T  141004 ggtagtggttgtacactt 141021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1927 - 1606
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  1927 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtt 1828  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||| | |  || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  1827 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatc 1728  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||| |||| | |||||||||||    
T  1727 cagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcttt 1628  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaact 324  Q
     ||  |||||||||||||||||||    
T  1627 gag--ttgcatctcctgatgaact 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 78594 - 78258
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  78594 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatccatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagttgtt 78495  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  78494 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatc 78395  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||  | || | | |||||||||||    
T  78394 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagcttt 78295  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||   |||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  78294 aag--ctgcatctcatgatgaactacagcttctggtgat 78258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 60686 - 61022
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  60686 atcatcaatgatcctttgcctgatatggttattttcctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtt 60785  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||     
T  60786 tttcatgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatt 60885  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||| || |||||| ||||||| |||    
T  60886 caatgccttccaatccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagtttt 60985  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  60986 aag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 61022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 142980 - 143325
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  142980 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 143079  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     |   | |||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||         |||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  143080 ttttttttcttgtagcatagacaaaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt---------gtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatc 143170  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  143171 caatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagcttt 143270  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
     ||||||||||||| ||||||| |  | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  143271 gagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 883 - 533
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||   |||||| | || |||||||| |||||||||| || | ||    
T  883 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaggaatgaacaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctatt 784  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | | |||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  783 tttcttatcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatc 684  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||  |||| | | |||||||||    
T  683 caatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagcttt 584  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatga 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  583 aag--ttgcatctcctgatgaactgcaccttctgatgaacttgcttctgatga 533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1969 - 1658
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| | |  |  ||||||||| | || |||| |||||||| ||||||||     
T  1969 tttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtaaacaaacattgttactggtagagctgttatccttgtcttgtt 1870  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 214  Q
    ||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||             
T  1869 gcaaagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg--------- 1779  T
Q  215 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 314  Q
    | |||||||||||  |||||   ||| |||||||||||||||||| |||   ||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1778 catttcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctc 1682  T
Q  315 ctgatgaactttaacttctggtga 338  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  1681 ctgatgaactgtagcttctggtga 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6968 - 6571
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |  | |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  6968 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttatcgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccattgcgaaggaacatcgttgcatgcagagctgtt 6869  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | ||| |||||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  6868 tttcttgtgttgtagcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatc 6769  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  || || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  6768 caatgccttcaaatcttttcaaaatagtcggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 6669  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||  |  |||||||||  |  || ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||    
T  6668 aag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgataaacttgcttctgatgaactagcttttgatgaacttgctcctgatga 6571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2212 - 2027
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  2212 tgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattccaagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgt 2113  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 197  Q
    |||||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 cttgtaccagagacacatactgag---tggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 632
Alignment:
Q  183 cttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccattt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||     
T  832 cttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattg 733  T
Q  283 aacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatga 382  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  732 aacagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 633  T
Q  383 c 383  Q
    |    
T  632 c 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 148 - 383
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10060
Alignment:
Q  148 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||   |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  248 tcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttc 347  Q
    ||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatcttgctta 10024  T
Q  348 tgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10025 tgatgagatgcttctgattaacttgcttctgatgac 10060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7858
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7707 atcaccaatgatcatttttctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 7806  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgta 152  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  7807 attcttgtcttctagtagagacacaaactgagtagaggagatagtggttgta 7858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5830 - 5510
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||   || ||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  5830 atcaccaacgatcctttgcttgatatggttattgtccaatgaaggatcagtttaaaatgcattcccatagtgaaggaacatcattgcaggtagagctgtt 5731  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  5730 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatc 5631  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  5630 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatcttt 5531  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaac 323  Q
    ||   |||||||| |||||||||    
T  5530 aa--attgcatcttctgatgaac 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 3189 - 3584
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| | |  | | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  3189 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgcattcctatt--gaaagaacatctttgcaggcagagctgtt 3286  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  ||||| || ||||    
T  3287 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatc 3386  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  ||| | ||| || ||||| || |||| | |||||||||||    
T  3387 caatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagcttt 3486  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgat-gagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    |||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||  |  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3487 aag--ttgcatctcctgatgaactatagcttctggtgattttcagcttctgataaacttgcttctgatgaacttgcttctgatgaccttgcttctgatga 3584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Original strand, 9052 - 9373
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgta 114  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |  | || |||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||    
T  9052 tttgcctgatatggttattctcctaagaaggatcaatttcaaatgtattcctattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgta 9151  T
Q  115 gcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaat 214  Q
    ||| ||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  9152 gcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaat 9251  T
Q  215 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 314  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  9252 ccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctc 9348  T
Q  315 ctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  9349 ctgatgaactacaacttctggtgat 9373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36410 - 36031
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||| | |  ||||    
T  36410 atcaccaatgatctttttcctgatttagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacactggtgcaggtatatctgtt 36311  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||| | | |||||  || |||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  36310 gttcttgtcctattgcaga--caaaaatcaggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatc 36213  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  36212 caatgcctttaaaaccatttgaaatagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttc 36114  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    || | |  ||  | ||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  36113 aattttctcagattctgatgatcttcagcttatggtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 36031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35024 - 34827
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| | || |  |||||||||||||||| || | || | | |||    
T  35024 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcaaagctatttttcttgt 34925  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgc 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  34924 cttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25888 - 25519
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||| ||||||||||| || | | |     
T  25888 caatgatcctttgcctgatatggttattatcctataaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatttgaataaacattgatgcaggcagagctgcttttct 25789  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatg 205  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||    
T  25788 tgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatg 25689  T
Q  206 ccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtc 305  Q
             | ||||||||||  ||||||   ||| |||||||||| ||||||   ||   ||| || ||||| |  |||||| |||||| |||||||      
T  25688 ---------catttcaaaatatctgttgccatacttttccagtcttttgcaatttctaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaaactttaag-- 25600  T
Q  306 ttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat--cttgcttctgatg-agatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||   | |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  25599 ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatgac 25519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44146 - 43828
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |  |||||||| ||| |||||| |||||||    
T  44146 atcaccaatgatctttttcctaatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccatgtctagaggaacatcgtttcaggcatagttgtt 44047  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  44046 attcttgtcttgttgcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatc 43948  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
     |||||||||||||| |||  || |||   ||||||||||||||   |||||||||||| |||   | |||||||||  || |||| ||||||||| |||    
T  43947 caatgccttcaaatctttttgaattagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagtttt 43849  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    ||||||  ||||| |||||||    
T  43848 aagtctctcatcttctgatga 43828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43803 - 43749
Alignment:
Q  329 cttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  43803 cttctggtgatgttgcttctgattaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 43749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 306
Target Start/End: Original strand, 158977 - 159242
Alignment:
Q  40 tgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaataga 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| | || | |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  158977 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgtaggaatagatattattcatgtcctgtagcagagacacaaacaaagtagtaga 159076  T
Q  140 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 239  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  || |||  ||||||||||    
T  159077 ggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttcac 159176  T
Q  240 tcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtct 306  Q
    |||||   |||| ||||||| ||| | | |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    
T  159177 tcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtct 159242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 353
Target Start/End: Original strand, 39488 - 39662
Alignment:
Q  181 ctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccat 280  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | ||||||||||||||    
T  39488 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 39587  T
Q  281 ttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  39588 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 353
Target Start/End: Original strand, 137548 - 137722
Alignment:
Q  181 ctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccat 280  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | ||||||||||||||    
T  137548 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 137647  T
Q  281 ttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  137648 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 137722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 37285 - 37463
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtagg-aacattgttgcaggcagagttgt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   |||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  37285 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaa-tcgatagggaacatcgttgcaggcagggatgt 37383  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 179  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37384 ttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 135345 - 135523
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtagg-aacattgttgcaggcagagttgt 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   |||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  135345 atcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaa-tcgatagggaacatcgttgcaggcagggatgt 135443  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 179  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  135444 ttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Original strand, 159288 - 159336
Alignment:
Q  335 gtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  159288 gtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatgac 159336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 40522 - 40839
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||  |||||||||| || ||||    
T  40522 atcaccaatgatctttttcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaaatctgaaggaacaccgttgcaggcatagctgtt 40621  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | ||||| |  |||||  || |||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  40622 attcttgtctagatgcaga--cataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatc 40719  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagcttt 300  Q
    | |||||||||||| ||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  || |||||||||  || |||| ||||||||||||     
T  40720 atatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttc 40818  T
Q  301 aagtcttgcatctcctgatga 321  Q
    || |||  ||||| |||||||    
T  40819 aattctctcatcttctgatga 40839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2958 - 2702
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||| |  | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2958 atcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgtatccccattgagaaggaacattattgcaggcagagctgtt 2859  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||    
T  2858 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatc 2759  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 258  Q
     ||||| ||| || |||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||    
T  2758 caatgctttccaa-ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18026 - 17873
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgt 108  Q
    |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||   | |||    
T  18026 tgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgt 17927  T
Q  109 cttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17926 cttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 17873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17993 - 17785
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  17993 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgatggatcaaattcaaatgcgtttccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgtt 17894  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||| | |||||||    
T  17893 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatc 17794  T
Q  201 aaatgcctt 209  Q
     ||||||||    
T  17793 caatgcctt 17785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 74464 - 74682
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||| |  | ||    
T  74464 atcaccaatgatatttttcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaatatcattgcatgcatatctatt 74563  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||| | ||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  74564 attcttgtcctatagcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatc 74663  T
Q  201 aaatgccttcaaatccttt 219  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  74664 taattccttcaaatccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 397
Target Start/End: Original strand, 74718 - 74846
Alignment:
Q  269 gattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaa 368  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  || || |||||||  || | ||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||    
T  74718 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttctggtgatgttgtttctgatgaggtgcttatgatgaa 74817  T
Q  369 ctagcttctgatgaccttgtttctgatga 397  Q
    || |||| |||||| |||| |||||||||    
T  74818 cttgcttatgatgaacttgcttctgatga 74846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 1201 - 1410
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||  || |||||||    
T  1201 atcaccaatgatcttttgcatgatttgttaattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaatatcgttgcaaacatagttgtt 1300  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||| | ||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  1301 attcttgtcttattgcagacaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatc 1399  T
Q  201 aaatgccttca 211  Q
     ||||||||||    
T  1400 taatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 1
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||  || |||||||    
T  210 atcaccaatgatcttttgcatgatttgttaattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaatatcgttgcaaacatagttgtt 111  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    || | |||||| | ||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  110 attcttgtcttattgcagacaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatc 12  T
Q  201 aaatgccttca 211  Q
     ||||||||||    
T  11 taatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1491
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| || || ||||| || ||||    
T  1748 atcaccaatgatcttttgccttatttggttattgtcctatgaaggatcaatttccaatccattccatgtatggaggaacactggtgtaggcatagctgtt 1649  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||| | | ||||| ||| |||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || | ||    
T  1648 gttcttgtcctattgcagacaca-aaataaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtc 1550  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1549 caatgccttcaaatccttttgaaatagtcgttgcttcactcctatagtcttctgcaatg 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38312 - 38086
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  38312 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattttgatggaacatttctgcaggcagagctgtt 38213  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  38212 tttcttgtcttgtagcatagaca-aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatc 38114  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 228  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38113 caatgccttcaaatcctttcaaattagt 38086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 9789 - 9946
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9789 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccatgtttgtagaaacattgttgcaggcagagctgtt 9888  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttc 158  Q
     ||| ||| |||||||||||| | |||| ||||| |  || |||||||||||||||||    
T  9889 ttccttgttttgtagcagagataaaaacagagtagtgcaggtagtggttgtacacttc 9946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2919 - 2738
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  |||||||||| ||| |||||||||    
T  2919 atcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgtaggtagagttgtt 2820  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 182  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  2819 atctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7386 - 7048
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||  ||| |  | || |||| |||||||||||||| ||||    
T  7386 atcaccaatgattttttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgtatatccattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtt 7287  T
Q  101 atccctgtcttgtagcag-agacacaaa-ctgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
     |   ||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||  ||||| |||||    
T  7286 ttttttgtcttgtagcagcagacataaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagca 7187  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagct 298  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  | | | | | || ||||| |  |||| | |||||||||    
T  7186 tccaatgctttccaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagct 7087  T
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  7086 ttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 7048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 850
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  1048 atcaccaatgatccattgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcagacagagctgtt 949  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  948 atccttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatc 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 5511 - 5767
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||  | |||||||| |  ||||    
T  5511 atcaccaatgatctgttgcccgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtaaggaggaacaccggtgcaggcacaactgtt 5610  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatc 200  Q
     | | |||  | | ||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  5611 gttcttgtactattgcagacaca-aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttc-caacgttctccaaagaataagcatc 5708  T
Q  201 aaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 259  Q
     ||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5709 caatgccttcaaattcatttgaaatagtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatg 5767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25614 - 25393
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct-gtcttgt 113  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||| | || || ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||    
T  25614 tttgcgtgatatggttattgtcgtatgaaggatcaatttcaaacgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgttttttcttgtcttgt 25515  T
Q  114 agcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaa 213  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||| ||  ||| |||||| |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  214 tcctttcaaaatagttgttgct 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  25414 tcctttcaaaatagtcgttgct 25393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15954 - 15811
Alignment:
Q  15 tttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttg-ttatccctgtcttgt 113  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||| | || || ||||||||||||||||||| || || | | ||||||||    
T  15954 tttgcgtgatatggttattgtcgtatgaaggatcaatttcaaacgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgttttttcttgtcttgt 15855  T
Q  114 agcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15854 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23549 - 23455
Alignment:
Q  242 ttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  23549 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 84278 - 84429
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  84278 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccaatccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtt 84377  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgta 152  Q
     | | |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  84378 tttcttgtcttgtagtagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgta 84429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 268667 - 268728
Alignment:
Q  4 atcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  268667 atcaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 268728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 7271 - 7448
Alignment:
Q  9 tgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagttgttatccctg 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||| | | ||    
T  7271 tgatcctttgcctgatatggttattgtcctattaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttg 7370  T
Q  108 tcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7371 tcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9338 - 9238
Alignment:
Q  297 ctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgaccttgtttctgatg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  9338 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaactttcttctgatgaccttgcttctgatg 9239  T
Q  397 a 397  Q
    |    
T  9238 a 9238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4837
Alignment:
Q  234 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttct 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaactttt 4889  T
Q  334 ggtgatct--tgcttctgatgagatgtttctgatgaactagcttctgatgac 383  Q
    ||||||||   |||||| || ||||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  4888 ggtgatctccagcttctaataagatgcttttgatgaacttgcttttgatgac 4837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2027 - 1803
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatag-ttattgtcctatgaaggatcaaa-ttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttg 98  Q
    |||| |||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||| ||    
T  2027 atcaccaatgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctg 1928  T
Q  99 ttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagca 198  Q
    || | | ||||||||| || ||||| ||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  1927 tttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagca 1828  T
Q  199 tcaaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  1827 tccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 87828 - 87644
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |   ||||||||| |||||||||||||    
T  87828 atcaccaattatcgtttgcctgagatggttattatcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaatagacattgttgtaggcagagttgtt 87729  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  87728 atcattgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctt 87644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 610 - 789
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgttatcc 104  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  610 caatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagcatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattc 709  T
Q  105 ctgtcttgtagcagagac-acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctc 183  Q
     ||||||||||||||||| | |||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  710 ttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctc 789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 165100 - 164940
Alignment:
Q  75 ggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttg 174  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  165100 ggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttg 165001  T
Q  175 tcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 235  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  165000 tcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65321
Alignment:
Q  172 ttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagat 271  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  272 taaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 65321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144366
Alignment:
Q  172 ttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagat 271  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  272 taaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 144366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 65633 - 65501
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||  | | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  65633 atcaccaatgatccttttcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcaaa-tgtgaataaacattgttgcaggcagagttgtt 65535  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagta 134  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  65534 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagta 65501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 144678 - 144546
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||  | | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  144678 atcaccaatgatccttttcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcaaa-tgtgaataaacattgttgcaggcagagttgtt 144580  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagta 134  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  144579 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagta 144546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 59445 - 59503
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  59445 aatgatctcttgcttgatttagttattgtcctaggaaggaacaatttcaaatccattcc 59503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5553 - 5397
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| | | ||   |||||||||||||||||| ||||    
T  5553 atcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtatatagacattgttgcaggcagagctgtt 5454  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||| | |||||||||||||||| |  | ||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  5453 atccttttcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactt 5397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5813
Alignment:
Q  234 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaaccttt-gaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttc 332  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  5935 cttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttc 5836  T
Q  333 tggtgatctt--gcttctgatga 353  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  5835 tggtgatctttagcttctgatga 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 5889 - 6043
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |  | || |||| | |||||||||||| | ||    
T  5889 atcatcaaagatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaacaatattgcaggcagagatatt 5988  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacac 155  Q
     | | |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  5989 tttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15804 - 15628
Alignment:
Q  47 tcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtg 146  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  15804 tcaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggagatagtg 15705  T
Q  147 gttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaa 223  Q
    || ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||  ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15704 gtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 15628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 2873 - 3016
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccct 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||| ||| ||||||||||||| |||| |   |    
T  2873 aatgatattttgccttatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggagcatcgttgcaggcagagctgtttt--tt 2970  T
Q  107 gtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgta 152  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| | ||| |||||||||||    
T  2971 gtcttgtagcagggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgta 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1163 - 1002
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||  ||||    
T  1163 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagaactgtt 1064  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | ||||||||||   ||||| || |  |||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  1063 tttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1356 - 1195
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||  ||||    
T  1356 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaaggaacatttctgcaggcagaactgtt 1257  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | ||||||||||   ||||| || |  |||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  1256 tttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 16838 - 16999
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16838 atcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttatgcaggcagagctgtt 16937  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||  ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16938 tttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 16999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6750 - 6589
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  6750 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 6651  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||| | || | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  6650 tttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 6589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 339
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8150
Alignment:
Q  149 tgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagt 248  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  249 cttctgcaatgcttaaatgagattaaatccatttaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgat 339  Q
    |||||||||| |||| | ||| || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtgat 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40536 - 40388
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||| || |||||| |     
T  40536 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgttatact 40437  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtaca 154  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||    
T  40436 tgtcttgtagcgaagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 40388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 59082 - 58973
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||||| |     
T  59082 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttatact 58983  T
Q  106 tgtcttgtag 115  Q
    ||||| ||||    
T  58982 tgtctcgtag 58973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 10602 - 10725
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagttgt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || | || |  |||||||| ||||||||||| |||    
T  10602 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttctcaatgtgcataaacattgtatgcaggcagagctgt 10701  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagaca 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  10702 tatccttgtcctgtagcagagaca 10725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 20503 - 20626
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagttgt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||   |||||  | || |  ||||||| |||||||||||| |||    
T  20503 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatatcaaatgtgttccctatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgt 20602  T
Q  100 tatccctgtcttgtagcagagaca 123  Q
    ||||| |||||| |||||||||||    
T  20603 tatccttgtcttttagcagagaca 20626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 7167 - 7352
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  7167 atcaccaatgatattttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacttttctgcaggcagagctgtt 7266  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagac-acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
     | | |||||||||||  |||| | |||| ||| | | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  7267 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaacactctt 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 61620 - 61776
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || ||||||||| ||| |||||||| ||||   |     
T  61620 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttgtaggcagagctgtttatct 61719  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  61720 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 61776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1739
Alignment:
Q  4 atcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || ||||||||| ||  |||||||| |||| |     
T  1897 atcaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttttaggcagagctgttttt 1798  T
Q  104 cctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    | |||||||||||  ||||| || | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1797 cttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtac 1739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4124 - 3939
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||||| ||  |||||| |||| ||||    
T  4124 atcagcaatgatattttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacttttctgcaggtagagctgtt 4025  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagac-acaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 185  Q
     | | |||||||||||  |||| | |||| ||| | | ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4024 tttcttgtcttgtagcgtagacgaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctt 3939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2022 - 1945
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaa 78  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2022 atcaccaatgatctgttgtctgatttggttatcgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattccaagtatggaggaa 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20604 - 20444
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || ||| |||||  | ||||||||| ||||    
T  20604 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg-acatttctacaggcagagctgtt 20506  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  20505 tttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtac 20444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 40568 - 40718
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    |||| |||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | |     
T  40568 caataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-ct 40666  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  40667 tgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Original strand, 3113 - 3164
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaat 58  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3113 aatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaat 3164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1227 - 1118
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||| ||||| |||||| |     
T  1227 caatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcagacagagctgttat-ct 1129  T
Q  106 tgtcttgtagc 116  Q
    |||||||||||    
T  1128 tgtcttgtagc 1118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5161
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  5000 atcaccaatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt 5099  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | |||||||||||  |||||||  | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5100 tttcttgtcttgtagcgtagacacacgcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 5161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 144789 - 144853
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  144789 atcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggattaatttcaaattcattcc 144853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 475473 - 475317
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||   |     
T  475473 caatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatct 475374  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  475373 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 475317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 481993 - 481837
Alignment:
Q  6 caatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccc 105  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| ||||   |     
T  481993 caatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttatct 481894  T
Q  106 tgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||  | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  481893 tgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtac 481837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 156854 - 156790
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  156854 atcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcc 156790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13462 - 13391
Alignment:
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatgaac 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13462 ttaagtcttgcatctc-tgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaac 13391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 533 - 462
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaa 78  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  533 aatgatctattgcctgatttggttattgtcctttgaaggaacaatttcaaatccattccttgtatggaggaa 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 60799 - 60729
Alignment:
Q  299 ttaagtcttgcatctcctgatgaactttaacttctggtgatctt--gcttctgatgagatgtttctgatga 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  60799 ttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatga 60729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12301 - 12156
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||||| |  ||||||| ||| |||| | | |||||    
T  12301 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcggagctgttgt-cttgtct 12203  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  12202 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 35608 - 35753
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||    
T  35608 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtct-tgtct 35706  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  35707 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Original strand, 5366 - 5511
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | | |||||    
T  5366 atcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtct 5464  T
Q  111 tgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacactt 157  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  5465 tgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacactt 5511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1380
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  1276 atcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 1374  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  1375 tgtagc 1380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Original strand, 1891 - 1995
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  1891 atcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 1989  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  1990 tgtagc 1995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 11644 - 11804
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || |||| || |  ||||||||||| ||||    
T  11644 atcaccaatgatcttttacctgatttggtagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggatcaattctgcaggcagagctgtt 11743  T
Q  101 atccctgtcttgtagcagagacacaaactgagtaatagagatagtggttgtacacttcgtac 162  Q
     | | | |||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  11744 tttcttatcttgtagcgtagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttttacactttgtac 11804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Original strand, 58372 - 58476
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  58372 atcttttgcctgatttaggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 58470  T
Q  111 tgtagc 116  Q
    ||||||    
T  58471 tgtagc 58476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 12087 - 12147
Alignment:
Q  7 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattccca 67  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  12087 aatgatcctttgccagatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcgttccca 12147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Original strand, 789 - 894
Alignment:
Q  11 atcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccctgtct 110  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||| |||||| |  ||||||||||| |||||| | |||||    
T  789 atcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtct 887  T
Q  111 tgtagca 117  Q
    |||||||    
T  888 tgtagca 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31948
Alignment:
Q  1 atcatcaatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcc 65  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  32012 atcaccaatgatctattgcttgatttggttattgtactatcaaggaacaatttcaaatccattcc 31948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University