View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16773_low_8 (Length: 339)

Name: NF16773_low_8
Description: NF16773
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16773_low_8
NF16773_low_8
[»] chr4 (201 HSPs)
chr4 (91-325)||(11469149-11469385)
chr4 (91-325)||(11522076-11522312)
chr4 (1-216)||(56432517-56432732)
chr4 (1-216)||(45742630-45742844)
chr4 (4-217)||(24754076-24754288)
chr4 (4-215)||(34273046-34273256)
chr4 (4-215)||(50352064-50352274)
chr4 (1-218)||(6462515-6462730)
chr4 (4-165)||(32032818-32032978)
chr4 (4-165)||(53277013-53277173)
chr4 (4-216)||(36391853-36392064)
chr4 (1-165)||(38027182-38027345)
chr4 (1-217)||(41191452-41191667)
chr4 (1-215)||(625793-626003)
chr4 (4-215)||(6753525-6753735)
chr4 (4-215)||(9328067-9328277)
chr4 (1-216)||(20768040-20768254)
chr4 (1-216)||(30049908-30050122)
chr4 (4-215)||(43387820-43388030)
chr4 (4-215)||(50533884-50534093)
chr4 (1-164)||(55014790-55014952)
chr4 (4-215)||(10588075-10588284)
chr4 (1-215)||(17339078-17339291)
chr4 (1-215)||(31937076-31937289)
chr4 (1-215)||(36990914-36991127)
chr4 (1-215)||(37173833-37174046)
chr4 (4-165)||(20391265-20391425)
chr4 (4-215)||(35675747-35675957)
chr4 (4-215)||(44294789-44294999)
chr4 (4-215)||(47228555-47228765)
chr4 (4-215)||(47806860-47807070)
chr4 (4-215)||(52977982-52978192)
chr4 (4-162)||(30771575-30771732)
chr4 (1-215)||(36129914-36130127)
chr4 (4-210)||(47299065-47299270)
chr4 (1-215)||(49373519-49373730)
chr4 (4-210)||(50424681-50424886)
chr4 (1-210)||(54676552-54676761)
chr4 (6-219)||(4415961-4416172)
chr4 (4-165)||(37352593-37352753)
chr4 (4-165)||(37357492-37357652)
chr4 (1-165)||(37776560-37776721)
chr4 (4-165)||(51536217-51536377)
chr4 (1-164)||(14793849-14794009)
chr4 (13-212)||(18706480-18706676)
chr4 (1-216)||(28298194-28298409)
chr4 (4-164)||(29427540-29427699)
chr4 (1-217)||(50451049-50451264)
chr4 (1-217)||(50602922-50603136)
chr4 (4-215)||(5375385-5375594)
chr4 (1-215)||(13620680-13620891)
chr4 (4-215)||(20285848-20286058)
chr4 (4-215)||(33413518-33413728)
chr4 (1-212)||(47683092-47683301)
chr4 (4-218)||(1028515-1028728)
chr4 (4-165)||(4455111-4455272)
chr4 (1-215)||(29519988-29520201)
chr4 (1-218)||(46949989-46950203)
chr4 (4-217)||(4035823-4036034)
chr4 (4-165)||(4094800-4094959)
chr4 (4-165)||(15241529-15241689)
chr4 (1-165)||(39670774-39670938)
chr4 (1-218)||(51335790-51336006)
chr4 (6-164)||(13389741-13389895)
chr4 (1-217)||(20455008-20455220)
chr4 (1-216)||(48030312-48030524)
chr4 (1-217)||(48241474-48241689)
chr4 (1-165)||(55562950-55563113)
chr4 (4-216)||(17609849-17610058)
chr4 (1-128)||(38405649-38405775)
chr4 (4-215)||(53629792-53630001)
chr4 (1-219)||(51717922-51718139)
chr4 (1-217)||(54623799-54624013)
chr4 (4-216)||(2615771-2615983)
chr4 (4-165)||(4549717-4549876)
chr4 (3-215)||(26866688-26866900)
chr4 (4-149)||(37364583-37364727)
chr4 (1-165)||(37842225-37842386)
chr4 (1-215)||(45921431-45921641)
chr4 (4-165)||(49228545-49228705)
chr4 (1-149)||(40809622-40809769)
chr4 (1-208)||(45096991-45097195)
chr4 (1-217)||(52850278-52850493)
chr4 (1-216)||(375423-375637)
chr4 (4-215)||(1859144-1859352)
chr4 (11-165)||(23777637-23777788)
chr4 (4-215)||(55632087-55632296)
chr4 (1-135)||(20761649-20761782)
chr4 (4-165)||(422756-422915)
chr4 (3-216)||(6083283-6083494)
chr4 (1-215)||(26625828-26626039)
chr4 (4-165)||(29014152-29014311)
chr4 (8-165)||(30745630-30745786)
chr4 (1-165)||(9808422-9808585)
chr4 (1-216)||(18003942-18004154)
chr4 (1-165)||(25124069-25124232)
chr4 (1-165)||(29460529-29460692)
chr4 (1-212)||(41620517-41620725)
chr4 (1-216)||(49793090-49793302)
chr4 (1-160)||(1173616-1173774)
chr4 (4-215)||(5743487-5743696)
chr4 (1-164)||(15500436-15500598)
chr4 (4-210)||(20747175-20747379)
chr4 (4-215)||(25708507-25708715)
chr4 (1-82)||(54536006-54536087)
chr4 (5-165)||(20788981-20789140)
chr4 (1-145)||(47311360-47311503)
chr4 (1-212)||(16545808-16546017)
chr4 (4-215)||(19281918-19282118)
chr4 (4-165)||(25474866-25475024)
chr4 (8-215)||(38899876-38900079)
chr4 (4-215)||(39144404-39144613)
chr4 (4-149)||(8343973-8344115)
chr4 (1-215)||(34963384-34963595)
chr4 (1-123)||(45850548-45850669)
chr4 (8-169)||(48149017-48149177)
chr4 (1-217)||(8418170-8418385)
chr4 (1-124)||(30523849-30523969)
chr4 (1-215)||(36900936-36901147)
chr4 (4-216)||(52870643-52870853)
chr4 (1-216)||(13498311-13498524)
chr4 (4-82)||(33501756-33501834)
chr4 (1-215)||(33988620-33988828)
chr4 (6-216)||(34948482-34948689)
chr4 (1-215)||(39114713-39114924)
chr4 (1-79)||(46480844-46480922)
chr4 (4-165)||(17678346-17678506)
chr4 (1-216)||(18882350-18882566)
chr4 (1-165)||(54877840-54877999)
chr4 (1-165)||(37518055-37518216)
chr4 (1-165)||(37522271-37522432)
chr4 (4-215)||(39184273-39184480)
chr4 (46-165)||(49490036-49490154)
chr4 (1-82)||(32899063-32899144)
chr4 (1-82)||(41191360-41191441)
chr4 (1-142)||(18018731-18018871)
chr4 (1-165)||(37639712-37639874)
chr4 (91-165)||(42528504-42528578)
chr4 (43-148)||(31071765-31071869)
chr4 (1-149)||(55876446-55876591)
chr4 (1-68)||(6807492-6807559)
chr4 (1-217)||(18872715-18872929)
chr4 (28-164)||(20286101-20286236)
chr4 (1-216)||(26889726-26889937)
chr4 (8-148)||(39184082-39184221)
chr4 (1-216)||(28501212-28501424)
chr4 (91-149)||(36040875-36040933)
chr4 (1-164)||(49329541-49329703)
chr4 (91-212)||(468418-468539)
chr4 (43-125)||(53906107-53906188)
chr4 (1-81)||(28495517-28495597)
chr4 (1-169)||(10497412-10497579)
chr4 (91-169)||(38319651-38319729)
chr4 (1-215)||(13548980-13549191)
chr4 (95-164)||(23621509-23621578)
chr4 (96-217)||(39797432-39797553)
chr4 (1-82)||(41333875-41333955)
chr4 (1-82)||(47109645-47109725)
chr4 (1-215)||(53564181-53564393)
chr4 (2-81)||(42598538-42598615)
chr4 (1-165)||(48801444-48801606)
chr4 (27-149)||(5734528-5734650)
chr4 (1-82)||(6656570-6656649)
chr4 (93-218)||(46481303-46481429)
chr4 (91-164)||(13138777-13138850)
chr4 (1-134)||(20180742-20180873)
chr4 (1-81)||(30868623-30868704)
chr4 (1-81)||(23623769-23623848)
chr4 (46-165)||(18879549-18879665)
chr4 (5-149)||(52966161-52966303)
chr4 (1-215)||(6629301-6629509)
chr4 (2-165)||(29508855-29509016)
chr4 (8-78)||(36211393-36211463)
chr4 (4-82)||(51329609-51329686)
chr4 (1-81)||(17468023-17468100)
chr4 (1-82)||(23390173-23390253)
chr4 (1-82)||(30010677-30010757)
chr4 (1-82)||(35909774-35909854)
chr4 (1-80)||(52181011-52181087)
chr4 (4-82)||(3168263-3168338)
chr4 (2-38)||(27009668-27009704)
chr4 (96-164)||(32684648-32684716)
chr4 (96-164)||(38613458-38613526)
chr4 (1-37)||(49489965-49490001)
chr4 (4-71)||(706688-706755)
chr4 (4-71)||(729862-729929)
chr4 (1-36)||(5734472-5734507)
chr4 (3-82)||(19596268-19596346)
chr4 (1-39)||(4143562-4143600)
chr4 (181-218)||(3085442-3085479)
chr4 (96-165)||(17467941-17468010)
chr4 (112-165)||(32899153-32899206)
chr4 (1-34)||(39879917-39879950)
chr4 (1-72)||(5840120-5840188)
chr4 (1-82)||(7776769-7776853)
chr4 (1-72)||(20783330-20783398)
chr4 (6-58)||(30191841-30191893)
chr4 (184-216)||(32112137-32112169)
chr4 (3-39)||(49613987-49614023)
chr4 (5-41)||(50649098-50649134)
chr4 (42-82)||(51787664-51787704)
[»] chr5 (141 HSPs)
chr5 (1-215)||(43060235-43060448)
chr5 (1-168)||(14649232-14649398)
chr5 (1-216)||(35547260-35547474)
chr5 (4-218)||(6673055-6673268)
chr5 (1-217)||(27873169-27873384)
chr5 (4-215)||(1265949-1266159)
chr5 (1-216)||(21239098-21239312)
chr5 (4-210)||(4984943-4985148)
chr5 (4-217)||(22527690-22527902)
chr5 (1-218)||(22657765-22657981)
chr5 (1-210)||(23285901-23286108)
chr5 (1-216)||(8283932-8284145)
chr5 (1-165)||(10511295-10511458)
chr5 (1-217)||(20186499-20186714)
chr5 (1-216)||(40643093-40643307)
chr5 (4-210)||(42561176-42561381)
chr5 (1-215)||(14619249-14619462)
chr5 (1-217)||(7940450-7940663)
chr5 (4-165)||(10734348-10734508)
chr5 (4-165)||(17674485-17674645)
chr5 (4-165)||(28041178-28041338)
chr5 (4-165)||(31888943-31889103)
chr5 (4-217)||(34662202-34662414)
chr5 (1-218)||(3028010-3028228)
chr5 (4-216)||(15521769-15521980)
chr5 (4-208)||(16153082-16153285)
chr5 (4-215)||(5527974-5528184)
chr5 (1-165)||(23285085-23285250)
chr5 (1-209)||(4194688-4194893)
chr5 (4-217)||(15190642-15190854)
chr5 (1-165)||(20988039-20988200)
chr5 (4-164)||(3686581-3686740)
chr5 (1-168)||(28140744-28140910)
chr5 (4-216)||(41641094-41641309)
chr5 (4-210)||(4753045-4753250)
chr5 (1-215)||(4976113-4976327)
chr5 (1-218)||(16440928-16441142)
chr5 (4-162)||(31507448-31507605)
chr5 (1-215)||(39121514-39121727)
chr5 (4-218)||(41384000-41384212)
chr5 (4-209)||(32478144-32478348)
chr5 (1-165)||(12743874-12744037)
chr5 (1-216)||(17714563-17714781)
chr5 (1-216)||(20142085-20142297)
chr5 (1-165)||(24307965-24308128)
chr5 (1-165)||(24365195-24365358)
chr5 (1-165)||(34332268-34332431)
chr5 (4-164)||(40738461-40738619)
chr5 (4-215)||(9828393-9828602)
chr5 (6-165)||(12806696-12806854)
chr5 (1-218)||(14913645-14913860)
chr5 (1-169)||(39984815-39984984)
chr5 (4-165)||(25600887-25601047)
chr5 (4-217)||(40004237-40004448)
chr5 (4-216)||(3160354-3160565)
chr5 (1-165)||(9064957-9065120)
chr5 (4-216)||(16127258-16127468)
chr5 (1-165)||(19571762-19571925)
chr5 (1-215)||(34889102-34889316)
chr5 (6-165)||(20987797-20987955)
chr5 (12-215)||(38161616-38161817)
chr5 (1-164)||(40951867-40952029)
chr5 (1-218)||(13759273-13759487)
chr5 (1-215)||(23092464-23092677)
chr5 (4-219)||(32147290-32147502)
chr5 (4-169)||(186144-186307)
chr5 (4-165)||(7951611-7951770)
chr5 (1-165)||(9020745-9020906)
chr5 (1-217)||(32964131-32964343)
chr5 (1-165)||(7734884-7735047)
chr5 (1-165)||(9268117-9268280)
chr5 (4-215)||(13660861-13661068)
chr5 (4-164)||(14789604-14789762)
chr5 (1-165)||(32617600-32617763)
chr5 (4-215)||(3497628-3497837)
chr5 (4-215)||(13862822-13863032)
chr5 (1-150)||(21749995-21750143)
chr5 (7-217)||(14571285-14571491)
chr5 (1-150)||(20517909-20518054)
chr5 (1-163)||(9264025-9264186)
chr5 (1-165)||(38371798-38371960)
chr5 (3-149)||(22581562-22581706)
chr5 (1-216)||(41418310-41418521)
chr5 (1-82)||(14435934-14436015)
chr5 (45-218)||(26894742-26894913)
chr5 (4-144)||(17592629-17592767)
chr5 (1-149)||(35039063-35039210)
chr5 (1-128)||(8144544-8144670)
chr5 (1-165)||(18615886-18616053)
chr5 (1-163)||(33639343-33639503)
chr5 (1-144)||(39758958-39759100)
chr5 (1-82)||(30182972-30183053)
chr5 (32-165)||(26605478-26605610)
chr5 (6-165)||(31158256-31158411)
chr5 (91-164)||(13735701-13735774)
chr5 (53-218)||(26674480-26674645)
chr5 (53-218)||(26946086-26946251)
chr5 (91-215)||(23286387-23286511)
chr5 (4-129)||(37034233-37034357)
chr5 (7-142)||(12098634-12098768)
chr5 (4-215)||(24170134-24170343)
chr5 (32-215)||(39180461-39180643)
chr5 (1-135)||(15774887-15775020)
chr5 (94-215)||(30182083-30182204)
chr5 (1-219)||(39971010-39971226)
chr5 (4-135)||(3628982-3629111)
chr5 (1-135)||(9438915-9439050)
chr5 (4-78)||(15674913-15674985)
chr5 (1-80)||(26076213-26076292)
chr5 (1-82)||(6328628-6328708)
chr5 (1-82)||(11780886-11780967)
chr5 (1-82)||(28414509-28414589)
chr5 (52-149)||(13703682-13703778)
chr5 (1-81)||(25837141-25837220)
chr5 (1-165)||(41686940-41687100)
chr5 (1-165)||(31657734-31657896)
chr5 (1-165)||(37206169-37206332)
chr5 (47-165)||(8100263-8100380)
chr5 (1-216)||(24857555-24857767)
chr5 (1-211)||(31642191-31642399)
chr5 (1-71)||(42030423-42030493)
chr5 (1-215)||(21069637-21069849)
chr5 (1-144)||(1303402-1303541)
chr5 (1-80)||(8949949-8950027)
chr5 (91-215)||(14570801-14570927)
chr5 (1-164)||(15559584-15559749)
chr5 (1-80)||(16926587-16926664)
chr5 (7-82)||(27834076-27834150)
chr5 (7-82)||(37700225-37700300)
chr5 (1-82)||(18251148-18251232)
chr5 (1-82)||(5283179-5283259)
chr5 (6-70)||(16099375-16099437)
chr5 (1-219)||(23259963-23260179)
chr5 (1-165)||(16285015-16285177)
chr5 (1-71)||(7001445-7001514)
chr5 (4-81)||(9727504-9727579)
chr5 (178-215)||(8145142-8145179)
chr5 (1-38)||(26889678-26889715)
chr5 (1-81)||(35784745-35784822)
chr5 (1-81)||(8356364-8356443)
chr5 (4-56)||(23286309-23286360)
[»] chr2 (156 HSPs)
chr2 (1-216)||(40607701-40607915)
chr2 (4-218)||(8990201-8990414)
chr2 (1-218)||(31751066-31751285)
chr2 (4-216)||(34883675-34883886)
chr2 (4-215)||(32120944-32121154)
chr2 (4-215)||(36130855-36131065)
chr2 (4-217)||(40680725-40680937)
chr2 (1-216)||(12890034-12890246)
chr2 (4-216)||(13197472-13197683)
chr2 (1-216)||(26322117-26322331)
chr2 (1-215)||(40788914-40789125)
chr2 (4-169)||(1943620-1943784)
chr2 (1-218)||(8782463-8782679)
chr2 (1-169)||(11865111-11865279)
chr2 (4-165)||(16669676-16669836)
chr2 (4-217)||(20252208-20252420)
chr2 (1-165)||(18375242-18375405)
chr2 (4-208)||(37229447-37229650)
chr2 (4-215)||(8716719-8716929)
chr2 (1-215)||(1143082-1143295)
chr2 (4-218)||(34062492-34062705)
chr2 (4-216)||(25624732-25624939)
chr2 (4-217)||(41450514-41450726)
chr2 (4-161)||(45474369-45474525)
chr2 (4-216)||(5664637-5664848)
chr2 (4-216)||(16805619-16805829)
chr2 (1-165)||(19318879-19319042)
chr2 (1-135)||(6007652-6007785)
chr2 (1-215)||(8912700-8912911)
chr2 (1-218)||(25523497-25523712)
chr2 (1-218)||(34113528-34113742)
chr2 (1-215)||(2060316-2060529)
chr2 (1-217)||(2199976-2200192)
chr2 (4-165)||(20727685-20727845)
chr2 (1-165)||(7666328-7666491)
chr2 (1-216)||(15227975-15228187)
chr2 (1-165)||(28840688-28840851)
chr2 (1-165)||(45628705-45628868)
chr2 (4-215)||(1359791-1360000)
chr2 (4-215)||(7491844-7492053)
chr2 (1-216)||(7933420-7933633)
chr2 (4-216)||(16844901-16845110)
chr2 (4-215)||(39833827-39834036)
chr2 (1-144)||(41968028-41968170)
chr2 (1-164)||(43701021-43701183)
chr2 (1-215)||(19353191-19353404)
chr2 (1-215)||(38121335-38121548)
chr2 (4-217)||(8841485-8841696)
chr2 (4-165)||(15404535-15404694)
chr2 (1-165)||(22182749-22182910)
chr2 (1-217)||(23465134-23465346)
chr2 (1-165)||(1748466-1748629)
chr2 (1-165)||(5255584-5255746)
chr2 (3-215)||(7116126-7116336)
chr2 (1-145)||(7418564-7418707)
chr2 (1-216)||(20643481-20643693)
chr2 (4-216)||(22897390-22897600)
chr2 (4-215)||(2438225-2438434)
chr2 (1-216)||(15435701-15435913)
chr2 (4-215)||(16108303-16108512)
chr2 (4-215)||(23788969-23789178)
chr2 (4-165)||(4711777-4711936)
chr2 (1-165)||(7531653-7531814)
chr2 (1-212)||(41003946-41004154)
chr2 (4-135)||(3670317-3670447)
chr2 (1-215)||(11852012-11852222)
chr2 (4-215)||(24345417-24345627)
chr2 (1-216)||(44573710-44573920)
chr2 (1-217)||(17665521-17665735)
chr2 (1-216)||(24973797-24974013)
chr2 (1-165)||(11385994-11386155)
chr2 (4-165)||(29239421-29239580)
chr2 (1-165)||(18374527-18374689)
chr2 (11-163)||(19034465-19034616)
chr2 (4-215)||(17408122-17408331)
chr2 (1-215)||(10399286-10399499)
chr2 (1-82)||(40173227-40173308)
chr2 (4-165)||(11201733-11201892)
chr2 (1-165)||(40680489-40680649)
chr2 (4-208)||(16456700-16456902)
chr2 (4-144)||(19631018-19631156)
chr2 (4-144)||(19827919-19828057)
chr2 (4-128)||(36021077-36021199)
chr2 (4-215)||(27560206-27560415)
chr2 (4-206)||(9697969-9698169)
chr2 (1-82)||(30466257-30466338)
chr2 (1-165)||(38214530-38214691)
chr2 (12-165)||(15917914-15918066)
chr2 (6-165)||(32712615-32712771)
chr2 (11-165)||(45151798-45151949)
chr2 (4-165)||(23083543-23083707)
chr2 (1-128)||(30779825-30779951)
chr2 (1-215)||(34944243-34944449)
chr2 (1-142)||(3060445-3060585)
chr2 (28-164)||(12873040-12873175)
chr2 (1-165)||(1859598-1859760)
chr2 (4-165)||(42629422-42629574)
chr2 (1-149)||(13336581-13336726)
chr2 (3-165)||(15571236-15571396)
chr2 (47-165)||(32511069-32511186)
chr2 (1-169)||(41834452-41834620)
chr2 (91-164)||(44017791-44017864)
chr2 (91-215)||(8295321-8295445)
chr2 (1-82)||(12619939-12620022)
chr2 (60-164)||(8030889-8030992)
chr2 (4-164)||(9040934-9041092)
chr2 (4-216)||(29830583-29830792)
chr2 (91-165)||(12360506-12360579)
chr2 (6-165)||(13215649-13215806)
chr2 (1-62)||(8295460-8295521)
chr2 (16-165)||(10757816-10757965)
chr2 (3-135)||(5070388-5070517)
chr2 (1-165)||(2788163-2788324)
chr2 (4-149)||(15353291-15353430)
chr2 (1-217)||(30857936-30858150)
chr2 (1-215)||(28566151-28566363)
chr2 (94-212)||(30466108-30466225)
chr2 (1-216)||(41494447-41494660)
chr2 (4-134)||(1422251-1422378)
chr2 (45-135)||(7446945-7447034)
chr2 (5-82)||(11083514-11083591)
chr2 (1-82)||(31633672-31633752)
chr2 (1-82)||(8867717-8867794)
chr2 (4-164)||(16809044-16809201)
chr2 (4-164)||(16848325-16848482)
chr2 (1-80)||(18970554-18970632)
chr2 (1-217)||(41422510-41422724)
chr2 (1-82)||(43700750-43700833)
chr2 (1-216)||(9701069-9701282)
chr2 (4-150)||(18223727-18223873)
chr2 (11-169)||(29830813-29830970)
chr2 (109-215)||(44436752-44436858)
chr2 (1-82)||(3095431-3095511)
chr2 (4-58)||(12296255-12296311)
chr2 (3-82)||(6028474-6028552)
chr2 (6-149)||(6650985-6651127)
chr2 (96-206)||(12969520-12969630)
chr2 (1-39)||(16807086-16807124)
chr2 (1-39)||(16846367-16846405)
chr2 (4-82)||(44436312-44436390)
chr2 (1-82)||(4408602-4408682)
chr2 (1-82)||(21838748-21838828)
chr2 (108-165)||(24300281-24300338)
chr2 (1-82)||(30830168-30830248)
chr2 (1-82)||(34432026-34432106)
chr2 (1-215)||(36750709-36750921)
chr2 (179-219)||(6027614-6027654)
chr2 (1-77)||(40544463-40544538)
chr2 (1-39)||(16636447-16636485)
chr2 (1-82)||(3904578-3904659)
chr2 (96-169)||(4897661-4897734)
chr2 (96-169)||(4945055-4945128)
chr2 (1-82)||(11944463-11944543)
chr2 (96-169)||(12296347-12296420)
chr2 (5-82)||(26273384-26273461)
chr2 (1-61)||(11121137-11121197)
[»] chr8 (147 HSPs)
chr8 (1-218)||(5783971-5784188)
chr8 (1-216)||(29806047-29806260)
chr8 (4-216)||(34490516-34490727)
chr8 (4-215)||(50922-51132)
chr8 (4-215)||(14699452-14699662)
chr8 (1-216)||(44748287-44748501)
chr8 (1-215)||(5162304-5162517)
chr8 (1-215)||(8072953-8073166)
chr8 (1-217)||(18111801-18112014)
chr8 (1-212)||(44580701-44580913)
chr8 (4-216)||(8251760-8251971)
chr8 (4-208)||(8948178-8948381)
chr8 (4-216)||(28579638-28579849)
chr8 (4-216)||(32675584-32675795)
chr8 (1-164)||(257362-257524)
chr8 (1-164)||(658396-658558)
chr8 (1-164)||(844132-844294)
chr8 (1-216)||(33980464-33980675)
chr8 (1-218)||(23487061-23487275)
chr8 (1-216)||(40784890-40785103)
chr8 (1-165)||(23687990-23688151)
chr8 (4-161)||(38183393-38183549)
chr8 (4-216)||(4076171-4076382)
chr8 (4-216)||(13153927-13154137)
chr8 (4-216)||(29598223-29598434)
chr8 (4-164)||(35504407-35504566)
chr8 (4-215)||(1774342-1774552)
chr8 (4-215)||(8951255-8951465)
chr8 (1-215)||(9035365-9035576)
chr8 (4-215)||(18455720-18455930)
chr8 (4-218)||(18754141-18754355)
chr8 (4-215)||(28192002-28192212)
chr8 (4-215)||(38878721-38878931)
chr8 (1-212)||(39406562-39406772)
chr8 (3-217)||(2152067-2152279)
chr8 (1-219)||(26016565-26016780)
chr8 (1-165)||(26980800-26980963)
chr8 (1-165)||(44021056-44021219)
chr8 (1-215)||(2944098-2944309)
chr8 (1-215)||(32522669-32522880)
chr8 (4-215)||(36176930-36177140)
chr8 (4-215)||(40741265-40741474)
chr8 (4-215)||(41014504-41014714)
chr8 (1-159)||(12825003-12825159)
chr8 (1-216)||(5774047-5774262)
chr8 (1-165)||(11482944-11483107)
chr8 (4-216)||(42598543-42598753)
chr8 (1-163)||(8566255-8566414)
chr8 (1-215)||(8797121-8797334)
chr8 (4-215)||(33745724-33745932)
chr8 (4-165)||(4631381-4631540)
chr8 (4-149)||(16117278-16117422)
chr8 (4-149)||(16125537-16125681)
chr8 (4-165)||(36661753-36661913)
chr8 (4-216)||(34568489-34568700)
chr8 (1-165)||(38967193-38967356)
chr8 (4-215)||(11798605-11798814)
chr8 (1-215)||(39029178-39029388)
chr8 (1-163)||(7682862-7683022)
chr8 (1-218)||(25058039-25058253)
chr8 (5-215)||(44888680-44888889)
chr8 (1-165)||(7683388-7683550)
chr8 (4-165)||(16999047-16999207)
chr8 (4-165)||(28864335-28864494)
chr8 (4-217)||(29321122-29321333)
chr8 (1-165)||(18641201-18641364)
chr8 (4-215)||(12255096-12255304)
chr8 (4-215)||(12260639-12260847)
chr8 (12-165)||(5951168-5951318)
chr8 (1-165)||(16448577-16448740)
chr8 (1-169)||(31886717-31886882)
chr8 (1-209)||(33865367-33865572)
chr8 (1-165)||(35143346-35143507)
chr8 (4-164)||(5593470-5593628)
chr8 (1-165)||(45283614-45283777)
chr8 (1-164)||(24992566-24992728)
chr8 (1-218)||(32475057-32475267)
chr8 (7-165)||(36245743-36245900)
chr8 (1-164)||(42985340-42985501)
chr8 (1-168)||(44747095-44747260)
chr8 (1-215)||(4778591-4778802)
chr8 (1-82)||(30140214-30140295)
chr8 (6-164)||(45260274-45260431)
chr8 (4-165)||(29279246-29279405)
chr8 (1-218)||(38780966-38781181)
chr8 (4-216)||(43654031-43654241)
chr8 (8-215)||(44502620-44502828)
chr8 (6-215)||(44250949-44251158)
chr8 (4-165)||(45425085-45425242)
chr8 (4-165)||(17856605-17856764)
chr8 (1-149)||(41615972-41616123)
chr8 (4-164)||(42218174-42218330)
chr8 (12-149)||(5268035-5268171)
chr8 (6-82)||(21652311-21652387)
chr8 (6-165)||(21136905-21137063)
chr8 (5-82)||(31089750-31089825)
chr8 (46-149)||(44580922-44581024)
chr8 (1-165)||(5109931-5110093)
chr8 (29-166)||(26990680-26990816)
chr8 (1-81)||(110203-110285)
chr8 (91-218)||(40529304-40529430)
chr8 (1-82)||(36786599-36786679)
chr8 (91-215)||(7758822-7758946)
chr8 (7-216)||(14583963-14584169)
chr8 (1-165)||(36941319-36941480)
chr8 (91-215)||(42885054-42885178)
chr8 (1-165)||(17336468-17336629)
chr8 (91-210)||(28965509-28965628)
chr8 (1-82)||(35202970-35203048)
chr8 (1-82)||(11293785-11293865)
chr8 (1-169)||(25056725-25056890)
chr8 (7-82)||(39970100-39970175)
chr8 (1-82)||(12802742-12802820)
chr8 (1-212)||(23995580-23995788)
chr8 (1-82)||(43292823-43292901)
chr8 (1-81)||(13141592-13141669)
chr8 (1-169)||(23497774-23497942)
chr8 (9-81)||(19700841-19700913)
chr8 (1-61)||(42747361-42747421)
chr8 (4-164)||(14548516-14548674)
chr8 (1-80)||(26625927-26626005)
chr8 (1-80)||(44165294-44165372)
chr8 (1-82)||(23894733-23894811)
chr8 (1-164)||(35179651-35179812)
chr8 (1-82)||(5244452-5244532)
chr8 (4-82)||(11113911-11113991)
chr8 (91-164)||(17851361-17851434)
chr8 (1-82)||(36409728-36409808)
chr8 (1-61)||(14625680-14625740)
chr8 (6-82)||(15021187-15021263)
chr8 (1-37)||(28965643-28965679)
chr8 (1-166)||(30512816-30512977)
chr8 (46-82)||(35203134-35203170)
chr8 (49-165)||(9615956-9616070)
chr8 (4-165)||(13568737-13568891)
chr8 (96-215)||(19176136-19176255)
chr8 (178-216)||(36131251-36131289)
chr8 (1-82)||(40855928-40856009)
chr8 (4-62)||(41388573-41388631)
chr8 (91-149)||(42220523-42220581)
chr8 (8-57)||(7758759-7758808)
chr8 (13-82)||(16893816-16893885)
chr8 (1-82)||(24260778-24260859)
chr8 (4-68)||(42885315-42885380)
chr8 (46-82)||(2767764-2767800)
chr8 (178-218)||(12802608-12802648)
chr8 (1-81)||(28740988-28741067)
[»] chr7 (159 HSPs)
chr7 (4-217)||(8290901-8291113)
chr7 (1-216)||(4856805-4857019)
chr7 (4-215)||(41025923-41026133)
chr7 (4-217)||(36697958-36698170)
chr7 (4-216)||(39871440-39871651)
chr7 (1-215)||(27529229-27529439)
chr7 (4-215)||(31457997-31458207)
chr7 (4-215)||(40300230-40300440)
chr7 (1-216)||(25950830-25951045)
chr7 (1-217)||(30895558-30895773)
chr7 (4-215)||(32872202-32872412)
chr7 (4-215)||(39197718-39197928)
chr7 (1-218)||(2289840-2290056)
chr7 (4-218)||(34978904-34979117)
chr7 (4-165)||(6387375-6387535)
chr7 (4-217)||(17491513-17491725)
chr7 (4-217)||(17561489-17561701)
chr7 (4-165)||(25247518-25247678)
chr7 (4-165)||(29064284-29064444)
chr7 (4-217)||(44547424-44547636)
chr7 (1-165)||(9998337-9998500)
chr7 (1-164)||(12930371-12930531)
chr7 (1-164)||(35569478-35569638)
chr7 (4-215)||(26255096-26255305)
chr7 (1-215)||(43081252-43081465)
chr7 (4-165)||(1275560-1275720)
chr7 (4-165)||(8612402-8612562)
chr7 (4-217)||(29177080-29177291)
chr7 (4-217)||(29285864-29286076)
chr7 (4-165)||(31200191-31200351)
chr7 (4-165)||(48521076-48521236)
chr7 (1-165)||(7607458-7607621)
chr7 (4-216)||(33858694-33858904)
chr7 (4-216)||(36646464-36646675)
chr7 (1-216)||(37913076-37913288)
chr7 (4-218)||(38858295-38858507)
chr7 (1-165)||(41803294-41803459)
chr7 (8-165)||(2006525-2006681)
chr7 (4-165)||(29642971-29643130)
chr7 (6-217)||(7400127-7400339)
chr7 (4-216)||(32814432-32814643)
chr7 (1-216)||(9140357-9140571)
chr7 (1-215)||(21119557-21119771)
chr7 (4-215)||(21295151-21295360)
chr7 (2-169)||(23364060-23364226)
chr7 (4-215)||(41002982-41003191)
chr7 (1-144)||(47323353-47323495)
chr7 (4-215)||(7449270-7449478)
chr7 (1-167)||(10475749-10475914)
chr7 (4-165)||(36711126-36711285)
chr7 (1-150)||(44780217-44780363)
chr7 (8-217)||(46414835-46415044)
chr7 (1-165)||(787983-788146)
chr7 (4-165)||(7703648-7703807)
chr7 (4-165)||(18112994-18113154)
chr7 (1-216)||(1574718-1574930)
chr7 (1-208)||(11647660-11647864)
chr7 (3-216)||(19619034-19619244)
chr7 (4-215)||(41252189-41252398)
chr7 (1-215)||(43279705-43279915)
chr7 (1-165)||(47657490-47657651)
chr7 (4-134)||(17326952-17327081)
chr7 (1-215)||(32759556-32759769)
chr7 (1-165)||(6799370-6799531)
chr7 (3-212)||(9299100-9299311)
chr7 (3-212)||(9303649-9303860)
chr7 (46-210)||(17317446-17317609)
chr7 (1-160)||(21870160-21870318)
chr7 (4-165)||(23320701-23320865)
chr7 (1-128)||(24300028-24300154)
chr7 (1-165)||(26736530-26736699)
chr7 (1-144)||(28016370-28016512)
chr7 (4-165)||(34895907-34896067)
chr7 (6-216)||(34012348-34012555)
chr7 (1-165)||(42298252-42298413)
chr7 (1-128)||(12130135-12130259)
chr7 (1-165)||(43440934-43441097)
chr7 (7-165)||(43093238-43093395)
chr7 (4-165)||(9036757-9036916)
chr7 (1-212)||(23919735-23919943)
chr7 (1-165)||(30737836-30738000)
chr7 (1-216)||(41444201-41444415)
chr7 (91-212)||(10071287-10071409)
chr7 (1-215)||(19845492-19845706)
chr7 (4-135)||(38428227-38428356)
chr7 (7-145)||(38736521-38736656)
chr7 (12-165)||(3024634-3024784)
chr7 (1-164)||(48008985-48009149)
chr7 (1-215)||(19920563-19920773)
chr7 (45-215)||(26299316-26299484)
chr7 (4-165)||(28060768-28060926)
chr7 (4-149)||(31581745-31581888)
chr7 (1-164)||(41787302-41787461)
chr7 (4-162)||(46266203-46266358)
chr7 (1-212)||(42887905-42888114)
chr7 (4-159)||(10538958-10539116)
chr7 (5-82)||(27325996-27326073)
chr7 (1-165)||(38361201-38361361)
chr7 (1-216)||(45907244-45907456)
chr7 (2-82)||(27881913-27881993)
chr7 (4-164)||(7400548-7400707)
chr7 (45-165)||(9233444-9233563)
chr7 (1-144)||(26842835-26842984)
chr7 (4-151)||(3796058-3796204)
chr7 (1-215)||(31802947-31803157)
chr7 (91-212)||(31769245-31769366)
chr7 (1-81)||(32118049-32118127)
chr7 (1-142)||(23109140-23109280)
chr7 (1-82)||(21587539-21587620)
chr7 (1-82)||(21870916-21870997)
chr7 (1-82)||(20950863-20950942)
chr7 (1-165)||(27813550-27813712)
chr7 (1-217)||(35888310-35888522)
chr7 (1-61)||(40121079-40121139)
chr7 (4-165)||(45778046-45778209)
chr7 (8-149)||(47534735-47534875)
chr7 (1-149)||(32964220-32964366)
chr7 (96-215)||(44719127-44719246)
chr7 (1-216)||(22991570-22991782)
chr7 (1-215)||(30534705-30534915)
chr7 (1-82)||(3775961-3776041)
chr7 (1-215)||(9682602-9682813)
chr7 (1-82)||(16957767-16957847)
chr7 (91-164)||(18751898-18751970)
chr7 (1-82)||(21135380-21135460)
chr7 (1-82)||(49044945-49045025)
chr7 (1-57)||(17878201-17878257)
chr7 (4-144)||(49110854-49110993)
chr7 (6-165)||(3881371-3881528)
chr7 (6-215)||(19292839-19293045)
chr7 (109-216)||(33381505-33381611)
chr7 (94-216)||(12616299-12616421)
chr7 (1-82)||(23802008-23802088)
chr7 (91-168)||(24211061-24211138)
chr7 (1-163)||(37915195-37915354)
chr7 (1-82)||(43934721-43934801)
chr7 (1-215)||(44510169-44510380)
chr7 (1-81)||(45722140-45722219)
chr7 (1-149)||(2470900-2471047)
chr7 (1-165)||(24504734-24504896)
chr7 (1-52)||(33381443-33381494)
chr7 (1-82)||(33342269-33342348)
chr7 (4-165)||(5524825-5524985)
chr7 (96-165)||(12631735-12631804)
chr7 (4-73)||(20074988-20075056)
chr7 (12-61)||(31137239-31137288)
chr7 (1-82)||(33683009-33683089)
chr7 (1-82)||(47649003-47649083)
chr7 (1-81)||(46415120-46415199)
chr7 (5-39)||(2887791-2887825)
chr7 (1-82)||(20182105-20182184)
chr7 (91-165)||(32643668-32643742)
chr7 (178-215)||(20951002-20951039)
chr7 (5-82)||(28017075-28017152)
chr7 (96-165)||(32699622-32699691)
chr7 (91-168)||(43008141-43008217)
chr7 (96-144)||(3478869-3478917)
chr7 (1-82)||(8782035-8782119)
chr7 (1-81)||(25530707-25530787)
[»] chr3 (194 HSPs)
chr3 (1-165)||(1084778-1084941)
chr3 (4-216)||(7051547-7051758)
chr3 (4-216)||(7181349-7181560)
chr3 (1-209)||(51489373-51489580)
chr3 (4-215)||(9499324-9499534)
chr3 (4-217)||(43868101-43868313)
chr3 (4-215)||(12683009-12683219)
chr3 (1-215)||(17753359-17753572)
chr3 (1-215)||(19054679-19054892)
chr3 (4-210)||(54107358-54107563)
chr3 (4-217)||(23700612-23700824)
chr3 (4-217)||(23719067-23719279)
chr3 (4-217)||(23737523-23737735)
chr3 (4-165)||(30040844-30041004)
chr3 (1-216)||(10015615-10015827)
chr3 (1-217)||(26221286-26221501)
chr3 (1-216)||(28673120-28673332)
chr3 (4-216)||(35867910-35868121)
chr3 (1-216)||(43978159-43978371)
chr3 (1-165)||(46861670-46861833)
chr3 (1-216)||(10656690-10656904)
chr3 (1-215)||(20621510-20621721)
chr3 (4-215)||(45252773-45252983)
chr3 (1-216)||(53361679-53361893)
chr3 (1-215)||(47066934-47067147)
chr3 (1-215)||(50517346-50517559)
chr3 (4-165)||(7251109-7251269)
chr3 (6-215)||(48887775-48887983)
chr3 (1-218)||(50433213-50433429)
chr3 (4-165)||(52673237-52673397)
chr3 (1-217)||(1450240-1450455)
chr3 (4-216)||(22103756-22103967)
chr3 (1-211)||(8546908-8547117)
chr3 (1-215)||(45513461-45513674)
chr3 (4-217)||(54849361-54849573)
chr3 (4-165)||(45745828-45745988)
chr3 (1-216)||(2993258-2993470)
chr3 (1-165)||(13809633-13809796)
chr3 (1-216)||(19897662-19897874)
chr3 (4-216)||(25148949-25149160)
chr3 (4-215)||(36005502-36005713)
chr3 (4-216)||(44543781-44543991)
chr3 (1-165)||(49383393-49383556)
chr3 (1-215)||(8321925-8322136)
chr3 (2-216)||(12906237-12906451)
chr3 (1-215)||(15996599-15996810)
chr3 (4-215)||(20656137-20656347)
chr3 (4-215)||(21756486-21756696)
chr3 (1-215)||(45323913-45324124)
chr3 (1-216)||(46845316-46845530)
chr3 (4-215)||(46878266-46878476)
chr3 (4-215)||(54782744-54782954)
chr3 (1-215)||(6784463-6784675)
chr3 (12-217)||(32962939-32963144)
chr3 (1-215)||(43686501-43686714)
chr3 (4-210)||(49127025-49127230)
chr3 (1-215)||(53164163-53164376)
chr3 (4-165)||(31531238-31531398)
chr3 (4-165)||(32467475-32467635)
chr3 (1-215)||(33212397-33212609)
chr3 (4-217)||(33868446-33868657)
chr3 (1-165)||(50726610-50726771)
chr3 (1-165)||(50786077-50786238)
chr3 (1-165)||(52291253-52291414)
chr3 (1-216)||(4759174-4759389)
chr3 (4-215)||(26593592-26593802)
chr3 (6-218)||(32568994-32569205)
chr3 (1-216)||(43158562-43158774)
chr3 (4-164)||(44542301-44542460)
chr3 (4-215)||(4024052-4024261)
chr3 (1-215)||(21458982-21459195)
chr3 (1-215)||(46049812-46050023)
chr3 (1-164)||(49383657-49383819)
chr3 (4-165)||(1641927-1642086)
chr3 (1-165)||(12050219-12050380)
chr3 (1-165)||(31186808-31186969)
chr3 (4-165)||(35165790-35165949)
chr3 (4-217)||(43701176-43701388)
chr3 (4-165)||(45048849-45049009)
chr3 (1-216)||(27687985-27688196)
chr3 (4-216)||(37728712-37728922)
chr3 (1-165)||(43557277-43557440)
chr3 (1-216)||(48909871-48910083)
chr3 (1-165)||(50730375-50730538)
chr3 (1-165)||(50782316-50782479)
chr3 (1-164)||(52044540-52044700)
chr3 (1-165)||(53686821-53686984)
chr3 (1-164)||(38071246-38071408)
chr3 (1-215)||(27646131-27646343)
chr3 (4-210)||(46703032-46703237)
chr3 (4-217)||(10044840-10045049)
chr3 (4-209)||(17591373-17591576)
chr3 (1-216)||(24087162-24087373)
chr3 (4-216)||(36317483-36317692)
chr3 (4-215)||(50647772-50647981)
chr3 (1-215)||(10220933-10221143)
chr3 (4-215)||(16435065-16435273)
chr3 (1-78)||(23308074-23308151)
chr3 (8-169)||(26806212-26806371)
chr3 (1-150)||(40919019-40919167)
chr3 (4-164)||(22832437-22832595)
chr3 (1-165)||(42801606-42801769)
chr3 (4-215)||(14428610-14428818)
chr3 (1-216)||(17698858-17699069)
chr3 (4-218)||(20862193-20862406)
chr3 (1-219)||(23776321-23776535)
chr3 (4-208)||(25148466-25148665)
chr3 (4-163)||(54604415-54604573)
chr3 (1-217)||(14758836-14759047)
chr3 (1-82)||(33361525-33361606)
chr3 (1-210)||(35711281-35711486)
chr3 (4-165)||(36099015-36099173)
chr3 (4-165)||(52059073-52059232)
chr3 (1-165)||(9780064-9780226)
chr3 (1-165)||(35572282-35572442)
chr3 (9-208)||(46862198-46862396)
chr3 (3-165)||(41824158-41824318)
chr3 (7-165)||(53271642-53271798)
chr3 (8-165)||(39952321-39952476)
chr3 (4-164)||(26306435-26306593)
chr3 (1-165)||(42390728-42390891)
chr3 (1-164)||(48213803-48213963)
chr3 (4-216)||(51283890-51284100)
chr3 (1-216)||(1111473-1111686)
chr3 (1-215)||(16776710-16776924)
chr3 (45-215)||(49543677-49543846)
chr3 (1-82)||(37144312-37144393)
chr3 (1-218)||(17589701-17589916)
chr3 (4-215)||(26058546-26058748)
chr3 (45-162)||(41992393-41992509)
chr3 (1-165)||(44561521-44561683)
chr3 (1-218)||(52177797-52178013)
chr3 (2-150)||(33976548-33976691)
chr3 (1-82)||(25879271-25879352)
chr3 (1-215)||(47008327-47008539)
chr3 (2-215)||(15095198-15095409)
chr3 (7-164)||(36600194-36600349)
chr3 (1-81)||(41751011-41751091)
chr3 (12-216)||(30819877-30820079)
chr3 (1-169)||(34021820-34021986)
chr3 (1-216)||(41392704-41392918)
chr3 (1-165)||(42526450-42526612)
chr3 (1-217)||(45404373-45404586)
chr3 (34-165)||(20877683-20877813)
chr3 (1-164)||(28810946-28811107)
chr3 (1-168)||(29719536-29719701)
chr3 (1-164)||(32978533-32978692)
chr3 (6-214)||(1572332-1572537)
chr3 (1-82)||(19350201-19350282)
chr3 (1-82)||(54866405-54866486)
chr3 (91-215)||(9582243-9582367)
chr3 (45-162)||(46557751-46557867)
chr3 (1-169)||(29383060-29383227)
chr3 (1-71)||(39625281-39625352)
chr3 (1-165)||(43408552-43408716)
chr3 (1-216)||(48904088-48904301)
chr3 (5-82)||(13702684-13702761)
chr3 (91-164)||(20848612-20848685)
chr3 (4-61)||(20848985-20849042)
chr3 (12-165)||(22527457-22527608)
chr3 (1-215)||(42044079-42044289)
chr3 (1-82)||(54927915-54927996)
chr3 (1-81)||(4564370-4564449)
chr3 (102-210)||(7462921-7463029)
chr3 (4-165)||(31533417-31533576)
chr3 (1-164)||(8379728-8379889)
chr3 (1-128)||(38341037-38341160)
chr3 (93-164)||(54690581-54690652)
chr3 (27-149)||(18658309-18658431)
chr3 (91-165)||(39625707-39625781)
chr3 (91-164)||(7886975-7887048)
chr3 (43-141)||(55287335-55287432)
chr3 (1-81)||(21497636-21497715)
chr3 (6-62)||(35938513-35938569)
chr3 (1-165)||(12918663-12918825)
chr3 (1-169)||(42755387-42755553)
chr3 (91-166)||(46879067-46879142)
chr3 (3-82)||(48902536-48902614)
chr3 (112-165)||(25916450-25916503)
chr3 (1-82)||(31541154-31541234)
chr3 (1-82)||(32969051-32969131)
chr3 (1-82)||(40215054-40215134)
chr3 (92-165)||(41751383-41751456)
chr3 (1-36)||(18658253-18658288)
chr3 (1-82)||(4836518-4836596)
chr3 (1-82)||(28875077-28875156)
chr3 (1-39)||(31397950-31397988)
chr3 (92-149)||(7886475-7886532)
chr3 (1-58)||(16776571-16776628)
chr3 (1-82)||(49544004-49544084)
chr3 (115-144)||(50460038-50460067)
chr3 (96-165)||(52693606-52693675)
chr3 (1-61)||(22494485-22494544)
chr3 (94-134)||(25130731-25130771)
[»] chr6 (95 HSPs)
chr6 (1-216)||(11847570-11847784)
chr6 (1-216)||(34915367-34915581)
chr6 (4-216)||(25197151-25197362)
chr6 (4-215)||(33487833-33488041)
chr6 (4-217)||(30248645-30248857)
chr6 (1-217)||(31150072-31150285)
chr6 (1-220)||(8670130-8670346)
chr6 (1-217)||(9341836-9342051)
chr6 (1-216)||(15498628-15498840)
chr6 (4-215)||(34301659-34301869)
chr6 (1-165)||(13647953-13648116)
chr6 (1-206)||(31487195-31487399)
chr6 (4-215)||(287241-287451)
chr6 (1-165)||(20450005-20450168)
chr6 (1-217)||(23604458-23604675)
chr6 (1-218)||(402447-402661)
chr6 (4-210)||(6147388-6147593)
chr6 (1-215)||(13866593-13866806)
chr6 (4-217)||(5457410-5457622)
chr6 (1-215)||(2090658-2090872)
chr6 (1-216)||(25045467-25045681)
chr6 (6-164)||(9660506-9660663)
chr6 (1-212)||(17227352-17227561)
chr6 (1-165)||(1147093-1147254)
chr6 (4-209)||(12105891-12106095)
chr6 (4-165)||(23397967-23398126)
chr6 (4-165)||(25024333-25024493)
chr6 (1-216)||(15966986-15967198)
chr6 (1-215)||(1729928-1730138)
chr6 (1-216)||(7772175-7772389)
chr6 (1-215)||(31091445-31091656)
chr6 (1-215)||(925759-925970)
chr6 (4-216)||(9388617-9388829)
chr6 (1-165)||(34126191-34126352)
chr6 (4-165)||(34741516-34741675)
chr6 (1-165)||(16122304-16122467)
chr6 (4-215)||(13010947-13011157)
chr6 (4-215)||(230934-231142)
chr6 (1-215)||(13690556-13690768)
chr6 (1-164)||(33773628-33773792)
chr6 (1-164)||(19097627-19097787)
chr6 (4-162)||(10195821-10195978)
chr6 (4-148)||(5576207-5576348)
chr6 (5-165)||(12143829-12143986)
chr6 (1-165)||(19418948-19419111)
chr6 (8-204)||(1779876-1780070)
chr6 (1-165)||(15355379-15355541)
chr6 (6-165)||(344914-345071)
chr6 (4-215)||(8743188-8743396)
chr6 (1-165)||(23578250-23578413)
chr6 (1-165)||(390373-390534)
chr6 (4-149)||(345574-345717)
chr6 (4-165)||(17175292-17175452)
chr6 (1-216)||(6418477-6418690)
chr6 (1-160)||(9299254-9299411)
chr6 (1-82)||(20373167-20373246)
chr6 (4-149)||(235825-235966)
chr6 (1-166)||(31711674-31711836)
chr6 (1-215)||(32614989-32615199)
chr6 (6-165)||(11656174-11656333)
chr6 (3-216)||(13901640-13901850)
chr6 (4-215)||(22852158-22852368)
chr6 (4-135)||(17952186-17952316)
chr6 (4-164)||(3177232-3177388)
chr6 (1-165)||(16272792-16272953)
chr6 (4-120)||(8175750-8175865)
chr6 (5-164)||(15287190-15287346)
chr6 (4-149)||(15126530-15126673)
chr6 (8-169)||(18106003-18106162)
chr6 (1-216)||(11161850-11162065)
chr6 (11-79)||(26211032-26211102)
chr6 (91-149)||(11104638-11104696)
chr6 (1-218)||(22998870-22999085)
chr6 (1-218)||(23789319-23789534)
chr6 (91-215)||(29036126-29036249)
chr6 (1-216)||(11200593-11200806)
chr6 (1-215)||(9038642-9038852)
chr6 (1-66)||(11104699-11104764)
chr6 (1-82)||(27581518-27581598)
chr6 (1-81)||(2746368-2746448)
chr6 (1-165)||(22710316-22710476)
chr6 (1-165)||(4175292-4175454)
chr6 (4-165)||(6417925-6418080)
chr6 (43-82)||(11840502-11840541)
chr6 (1-82)||(4823103-4823181)
chr6 (5-82)||(6840100-6840175)
chr6 (1-82)||(28980680-28980762)
chr6 (96-209)||(8637193-8637306)
chr6 (1-82)||(33012490-33012570)
chr6 (1-164)||(8217546-8217705)
chr6 (43-82)||(17545390-17545429)
chr6 (116-169)||(8345286-8345339)
chr6 (182-219)||(13208833-13208870)
chr6 (6-82)||(493510-493585)
chr6 (1-81)||(28236028-28236107)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-216)||(9250-9464)
[»] chr1 (176 HSPs)
chr1 (1-215)||(36694854-36695067)
chr1 (1-215)||(36710955-36711168)
chr1 (4-218)||(52431001-52431214)
chr1 (1-165)||(15289984-15290147)
chr1 (1-216)||(5765815-5766028)
chr1 (1-219)||(9413151-9413366)
chr1 (1-163)||(14347174-14347335)
chr1 (4-165)||(11907055-11907215)
chr1 (4-217)||(50008310-50008522)
chr1 (4-216)||(11741396-11741607)
chr1 (1-165)||(28052239-28052402)
chr1 (1-216)||(45285634-45285848)
chr1 (1-217)||(4102540-4102753)
chr1 (1-217)||(52601989-52602202)
chr1 (1-216)||(6089734-6089946)
chr1 (1-149)||(14090076-14090223)
chr1 (1-216)||(42275984-42276199)
chr1 (1-215)||(34931079-34931290)
chr1 (4-216)||(50246757-50246967)
chr1 (1-215)||(24855281-24855494)
chr1 (1-215)||(38261340-38261553)
chr1 (1-216)||(50937778-50937991)
chr1 (1-165)||(27530427-27530589)
chr1 (1-215)||(39324527-39324738)
chr1 (4-165)||(47300720-47300880)
chr1 (4-216)||(27037268-27037479)
chr1 (1-212)||(31238722-31238930)
chr1 (1-165)||(39873509-39873672)
chr1 (1-164)||(40614731-40614891)
chr1 (1-208)||(41855299-41855503)
chr1 (4-215)||(16456636-16456846)
chr1 (4-215)||(30290265-30290475)
chr1 (4-215)||(46075695-46075904)
chr1 (4-215)||(49907021-49907231)
chr1 (1-164)||(51810927-51811089)
chr1 (1-215)||(8472049-8472259)
chr1 (1-215)||(12814612-12814824)
chr1 (4-210)||(45794349-45794554)
chr1 (4-165)||(16575919-16576079)
chr1 (1-165)||(19792688-19792849)
chr1 (4-165)||(42872161-42872321)
chr1 (4-164)||(9202333-9202491)
chr1 (7-216)||(15616133-15616342)
chr1 (1-165)||(27575461-27575624)
chr1 (1-164)||(34503287-34503449)
chr1 (1-165)||(36674122-36674285)
chr1 (1-215)||(41317593-41317805)
chr1 (4-216)||(45039411-45039621)
chr1 (4-215)||(943464-943674)
chr1 (1-217)||(15100354-15100575)
chr1 (4-215)||(15811060-15811269)
chr1 (1-215)||(21630930-21631144)
chr1 (4-215)||(23541979-23542188)
chr1 (1-218)||(229232-229449)
chr1 (4-216)||(2279952-2280163)
chr1 (1-218)||(25509206-25509419)
chr1 (1-165)||(38530976-38531137)
chr1 (4-165)||(39750209-39750368)
chr1 (4-169)||(50008020-50008183)
chr1 (1-163)||(51422251-51422414)
chr1 (4-164)||(8104117-8104275)
chr1 (7-165)||(1767694-1767849)
chr1 (1-169)||(9378925-9379094)
chr1 (1-164)||(23530596-23530758)
chr1 (1-163)||(26549843-26550002)
chr1 (4-210)||(30289690-30289894)
chr1 (1-215)||(48067719-48067932)
chr1 (1-134)||(896876-897008)
chr1 (1-216)||(2489226-2489437)
chr1 (1-215)||(3934606-3934818)
chr1 (1-149)||(43395497-43395642)
chr1 (1-149)||(31086747-31086894)
chr1 (8-216)||(37951781-37951987)
chr1 (1-164)||(28888247-28888409)
chr1 (4-215)||(39363022-39363231)
chr1 (4-215)||(44649629-44649838)
chr1 (1-216)||(7763576-7763787)
chr1 (4-210)||(32169782-32169986)
chr1 (11-215)||(3549032-3549233)
chr1 (1-165)||(8923494-8923655)
chr1 (21-165)||(11352908-11353051)
chr1 (1-165)||(15892388-15892551)
chr1 (1-149)||(25271257-25271401)
chr1 (1-217)||(28885927-28886143)
chr1 (4-165)||(44646321-44646480)
chr1 (4-215)||(7783991-7784202)
chr1 (1-165)||(38613525-38613688)
chr1 (4-216)||(39497432-39497642)
chr1 (1-149)||(43668226-43668373)
chr1 (4-215)||(1039209-1039418)
chr1 (4-215)||(1046115-1046324)
chr1 (4-165)||(10383869-10384030)
chr1 (1-82)||(25283938-25284019)
chr1 (4-134)||(31465746-31465875)
chr1 (1-134)||(37585034-37585164)
chr1 (4-165)||(1048080-1048239)
chr1 (1-210)||(13343778-13343986)
chr1 (1-126)||(25228285-25228409)
chr1 (4-205)||(35984490-35984689)
chr1 (1-165)||(48853868-48854029)
chr1 (1-145)||(9715430-9715573)
chr1 (1-165)||(15763365-15763528)
chr1 (1-209)||(37588948-37589153)
chr1 (1-216)||(45038187-45038400)
chr1 (1-82)||(44454651-44454732)
chr1 (6-149)||(7212388-7212530)
chr1 (1-135)||(14171611-14171742)
chr1 (1-165)||(15111631-15111798)
chr1 (4-216)||(18237093-18237301)
chr1 (4-215)||(43456449-43456658)
chr1 (93-215)||(48022906-48023028)
chr1 (1-82)||(32149135-32149216)
chr1 (1-81)||(44529499-44529577)
chr1 (4-165)||(9700578-9700737)
chr1 (4-165)||(10433370-10433531)
chr1 (1-165)||(26544554-26544715)
chr1 (1-149)||(27974980-27975127)
chr1 (4-135)||(36880450-36880577)
chr1 (1-165)||(39425655-39425817)
chr1 (4-164)||(47263506-47263667)
chr1 (4-165)||(4592628-4592788)
chr1 (4-164)||(45335936-45336095)
chr1 (4-165)||(47068838-47068997)
chr1 (4-216)||(32153621-32153832)
chr1 (1-216)||(15302569-15302782)
chr1 (1-216)||(17483732-17483944)
chr1 (91-169)||(31636043-31636121)
chr1 (91-165)||(32908299-32908373)
chr1 (6-165)||(38174926-38175079)
chr1 (4-163)||(46506241-46506398)
chr1 (5-82)||(18114300-18114377)
chr1 (93-165)||(5858305-5858377)
chr1 (91-218)||(44455536-44455662)
chr1 (4-149)||(47296394-47296538)
chr1 (1-82)||(2637011-2637091)
chr1 (1-82)||(27479730-27479810)
chr1 (5-82)||(30761029-30761106)
chr1 (91-164)||(51561791-51561864)
chr1 (1-82)||(1837397-1837484)
chr1 (1-81)||(45810122-45810202)
chr1 (4-165)||(47429215-47429374)
chr1 (10-82)||(47754457-47754529)
chr1 (1-80)||(4389743-4389821)
chr1 (1-165)||(30996794-30996956)
chr1 (1-209)||(51467298-51467503)
chr1 (1-149)||(52428954-52429099)
chr1 (95-169)||(39647709-39647783)
chr1 (91-165)||(39867569-39867643)
chr1 (1-215)||(4279953-4280163)
chr1 (1-82)||(9424899-9424980)
chr1 (4-217)||(22567064-22567278)
chr1 (1-82)||(23893522-23893602)
chr1 (1-215)||(29437679-29437891)
chr1 (91-215)||(27530759-27530882)
chr1 (1-81)||(49549134-49549213)
chr1 (1-82)||(18172448-18172527)
chr1 (1-82)||(1427331-1427411)
chr1 (3-81)||(35693195-35693275)
chr1 (1-82)||(38920366-38920446)
chr1 (1-82)||(48363839-48363919)
chr1 (6-82)||(26768517-26768592)
chr1 (6-78)||(31338977-31339049)
chr1 (3-82)||(41619995-41620071)
chr1 (5-81)||(1197995-1198073)
chr1 (1-48)||(32906791-32906838)
chr1 (1-80)||(39627061-39627139)
chr1 (116-215)||(44530546-44530645)
chr1 (91-149)||(33163312-33163370)
chr1 (115-165)||(47754068-47754118)
chr1 (28-77)||(8905548-8905597)
chr1 (96-165)||(19349257-19349326)
chr1 (91-144)||(35160225-35160278)
chr1 (1-78)||(37850262-37850338)
chr1 (1-69)||(51561155-51561220)
chr1 (1-80)||(4371591-4371667)
chr1 (178-218)||(48853811-48853851)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-216)||(164213-164425)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-215)||(5151-5362)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (1-215)||(10008-10219)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-215)||(18497-18708)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-216)||(6436-6647)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (7-217)||(51512-51721)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (4-216)||(258949-259160)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (1-212)||(1723-1933)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (1-215)||(4489-4700)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (4-215)||(6967-7177)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (1-212)||(45516-45726)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-215)||(3438-3650)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (4-165)||(4125-4285)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-164)||(45722-45882)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (4-215)||(117846-118055)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (4-219)||(12061-12273)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (4-217)||(24459-24669)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-165)||(355127-355288)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (4-165)||(31514-31674)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (4-218)||(47637-47849)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (4-165)||(5113-5273)
scaffold0308 (4-215)||(14176-14385)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (3-144)||(93856-93996)
scaffold0039 (98-215)||(103982-104098)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (4-135)||(9581-9711)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (4-165)||(61680-61840)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-165)||(19783-19947)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (4-165)||(8268-8427)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (1-165)||(4401-4562)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (1-165)||(369-531)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (4-216)||(65466-65675)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-165)||(48705-48866)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (1-165)||(4812-4972)
scaffold0443 (103-216)||(4680-4792)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-82)||(18486-18567)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (1-215)||(3610-3819)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (26-216)||(1294-1484)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-215)||(17464-17676)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (6-164)||(8410-8566)
scaffold0280 (1-63)||(13388-13450)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-82)||(40691-40772)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-164)||(24270-24421)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (91-165)||(9579-9653)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (6-163)||(32993-33148)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-216)||(246455-246667)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (91-145)||(34175-34229)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (5-82)||(56056-56133)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (1-82)||(1959-2042)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (96-215)||(11577-11696)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-81)||(36190-36269)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 201)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 325
Target Start/End: Original strand, 11469149 - 11469385
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnn-ttctcaaaaaga 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||         |||||||||||     
T  11469149 tgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaaagg 11469248  T
Q  190 -ttttataattagggacggaggtagtataagcctttaataaaaagaaaatcactggttatattgtatgtcatgtgatcaactattcagtttaaactatta 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11469249 gttttataattagggacggaggtagtataagtctttaataaaaagaaaatcatcggttatattgtatgtcatgtgatcaactattcagtttaaactatta 11469348  T
Q  289 agctccgctcaaaaaagtttaaactattgacctatgc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11469349 agctccgctcaaaaaagtttaaactattgacctatgc 11469385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11522312 - 11522076
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnn-ttctcaaaaaga 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||         |||||||||||     
T  11522312 tgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaaagg 11522213  T
Q  190 -ttttataattagggacggaggtagtataagcctttaataaaaagaaaatcactggttatattgtatgtcatgtgatcaactattcagtttaaactatta 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11522212 gttttataattagggacggaggtagtataagtctttaataaaaagaaaatcatcggttatattgtatgtcatgtgatcaactattcagtttaaactatta 11522113  T
Q  289 agctccgctcaaaaaagtttaaactattgacctatgc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11522112 agctccgctcaaaaaagtttaaactattgacctatgc 11522076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 56432732 - 56432517
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||| ||||    
T  56432732 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataa 56432633  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||        ||||||||| | | |||||||||    
T  56432632 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 56432533  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  56432532 gggacggaggtagtat 56432517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 45742630 - 45742844
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        ||||||||||    
T  45742630 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatggaag-aaaaagatgtataataa 45742728  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  45742729 atagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 45742828  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  45742829 gggacggagggagtat 45742844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24754288 - 24754076
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  24754288 actattgttattacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 24754190  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24754189 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 24754090  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  24754089 acggagggagtata 24754076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 34273046 - 34273256
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||| |||||||    
T  34273046 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtatgataaata 34273144  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  34273145 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 34273244  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  34273245 acggagggagta 34273256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50352274 - 50352064
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  50352274 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 50352176  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  50352175 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagag 50352076  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  50352075 acggagggagta 50352064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6462515 - 6462730
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  6462515 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataat-a 6462612  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| |||         ||||||||  || |||||||||    
T  6462613 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataataagggacagaaaaaaatctcaaaagaatcttataatta 6462712  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6462713 gggacggaggtagtataa 6462730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 32032818 - 32032978
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  32032818 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 32032916  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  32032917 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctggaaataacaaaggggtcttataaaaag 32032978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 53277013 - 53277173
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  53277013 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 53277111  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  53277112 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 53277173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36392064 - 36391853
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  36392064 actattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 36391966  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||| ||    
T  36391965 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaagg 36391866  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  36391865 acggagggagtat 36391853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38027345 - 38027182
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  38027345 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaagatgtataataa 38027247  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  38027246 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 38027182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 41191452 - 41191667
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  41191452 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 41191550  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  41191551 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataatta 41191650  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    | |||||||||||||||    
T  41191651 gagacggaggtagtata 41191667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 625793 - 626003
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  625793 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 625889  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||| ||||||| | |||||||||    
T  625890 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttc-caaaaaggtcttataatta 625988  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  625989 gggacggaggtagta 626003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6753735 - 6753525
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  6753735 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 6753637  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6753636 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 6753537  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  6753536 acggagggagta 6753525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 9328067 - 9328277
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  9328067 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 9328165  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  9328166 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 9328265  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  9328266 acggagggagta 9328277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20768040 - 20768254
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  20768040 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 20768138  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | |||||||||||| |||        |||| |||| | |||||||||||    
T  20768139 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggttttataatta 20768238  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
     |||||||||||||||    
T  20768239 aggacggaggtagtat 20768254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 30049908 - 30050122
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  30049908 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttgctttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 30050006  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  30050007 ataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggaccaaattttttttcaaaagagtcttataatta 30050106  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  30050107 gggacggaggtagtat 30050122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 43387820 - 43388030
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  43387820 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 43387918  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  43387919 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattaggg 43388018  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  43388019 acggaggaagta 43388030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50534093 - 50533884
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  50534093 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagtttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 50533995  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  50533994 ggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag-gaccaaaaaaattctcaaaatgatcttataattaggg 50533896  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  50533895 acggagggagta 50533884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 55014790 - 55014952
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  55014790 attattattgtttttacaattttatcttttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 55014888  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||||||    
T  55014889 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaa 55014952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10588284 - 10588075
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  10588284 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 10588186  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10588185 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatgttataattaggg 10588087  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  10588086 acggagggagta 10588075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17339291 - 17339078
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||    
T  17339291 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaaaatgtatgataa 17339193  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  17339192 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 17339093  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | |||||||||||||    
T  17339092 gagacggaggtagta 17339078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31937289 - 31937076
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  31937289 attactattgtttttacaattttatcatttaagaaagagtgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 31937191  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  31937190 acaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 31937091  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  31937090 gggacggaggtagta 31937076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36991127 - 36990914
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||    
T  36991127 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaaaatgtatgataa 36991029  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | |||||||||    
T  36991028 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataatta 36990929  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | |||||||||||||    
T  36990928 gagacggaggtagta 36990914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37174046 - 37173833
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  37174046 attactattgtttttacagttttatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaatatgtataataa 37173948  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||         |||||||| | | |||||||||    
T  37173947 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaactctcaaaagggtcttataatta 37173848  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||| ||||||||    
T  37173847 gggacgaaggtagta 37173833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 20391265 - 20391425
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  20391265 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 20391363  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20391364 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaag 20391425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 35675747 - 35675957
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  35675747 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 35675845  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        || |||||| | | ||||||||||||    
T  35675846 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattaggg 35675945  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  35675946 acggagggagta 35675957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44294999 - 44294789
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  44294999 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 44294901  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  44294900 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 44294801  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  44294800 acggagggagta 44294789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 47228555 - 47228765
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  47228555 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 47228653  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  47228654 ggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 47228753  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  47228754 acggaggaagta 47228765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47807070 - 47806860
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  47807070 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 47806972  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  47806971 ggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 47806872  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  47806871 acggagggagta 47806860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52978192 - 52977982
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  52978192 actattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaggatgtataataaata 52978094  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  52978093 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 52977994  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  52977993 acggagggagta 52977982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30771732 - 30771575
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  30771732 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 30771634  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaa 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||    
T  30771633 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 30771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 36129914 - 36130127
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||    
T  36129914 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgtttccaacatgttatctattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 36130012  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||         |||||||| | | |||||||||    
T  36130013 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataatta 36130112  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    || ||||||||||||    
T  36130113 ggaacggaggtagta 36130127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 47299065 - 47299270
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  47299065 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 47299163  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | |||||||||||     
T  47299164 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtattataattagga 47299263  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  47299264 acggagg 47299270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 49373519 - 49373730
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||        |||| |||||    
T  49373519 attactattgtttttacaattttatcctttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaag---aaaaatgtacaataa 49373615  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| | |        ||||||||| | | |||||||||    
T  49373616 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggccaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 49373715  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  49373716 gggacggaggtagta 49373730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 50424681 - 50424886
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  50424681 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 50424779  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||| |    
T  50424780 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagag 50424879  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  50424880 acggagg 50424886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54676761 - 54676552
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  54676761 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 54676663  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagc-aaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||    
T  54676662 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataatt 54676563  T
Q  200 agggacggagg 210  Q
    |||||||||||    
T  54676562 agggacggagg 54676552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4416172 - 4415961
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||        |||||||||||||||    
T  4416172 tattgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaaga-tgtataataaatagg 4416075  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggac 205  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  4416074 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaacattctcaaaagggtcttataattagggac 4415975  T
Q  206 ggaggtagtataag 219  Q
    ||||||||||||||    
T  4415974 ggaggtagtataag 4415961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37352753 - 37352593
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  37352753 actattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 37352655  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  37352654 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaag 37352593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37357652 - 37357492
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  37357652 actattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 37357554  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  37357553 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaag 37357492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 37776560 - 37776721
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  37776560 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataatta 37776656  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37776657 ataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaag 37776721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 51536377 - 51536217
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  51536377 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 51536279  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  51536278 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataataaagaggtcttataaaaag 51536217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 14793849 - 14794009
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  14793849 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 14793945  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  14793946 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 14794009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 18706480 - 18706676
Alignment:
Q  13 tttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgt 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||    
T  18706480 tttacaattttatcctttaagagagag--atcgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggtgtgt 18706576  T
Q  113 atgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggta 212  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  18706577 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaatgattttctaattagagacggaggta 18706676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28298194 - 28298409
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||  |||||||         ||||||||||    
T  28298194 attattattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataa 28298293  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  28298294 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 28298393  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28298394 gggacggaggtagtat 28298409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29427699 - 29427540
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| ||||||    
T  29427699 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtatattaaata 29427601  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  29427600 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 29427540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 50451049 - 50451264
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  50451049 attactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatatataataa 50451147  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||  |||||||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  50451148 ataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttttaaatagtaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 50451247  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    || |||||| |||||||    
T  50451248 ggaacggagttagtata 50451264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 50602922 - 50603136
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  50602922 attactattgtttttacaattttattctttaagagagatagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag--aaaaaatgtataataa 50603019  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||        ||||||||| | | |||||||||    
T  50603020 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtattataatta 50603119  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    | |||||| ||||||||    
T  50603120 gagacggatgtagtata 50603136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 5375385 - 5375594
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  5375385 actattgtttttacaattttatccgttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 5375483  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  5375484 ggggca-gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 5375582  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  5375583 acggagggagta 5375594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13620680 - 13620891
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  13620680 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 13620776  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  13620777 atagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaaggatcttataatta 13620876  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  13620877 gggacggaggtagta 13620891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 20285848 - 20286058
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  20285848 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaata 20285946  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||   |||||||||||||| |||        || |||||| ||| ||||||||||||    
T  20285947 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataattaggg 20286046  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  20286047 acggaggaagta 20286058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33413728 - 33413518
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  33413728 actattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 33413630  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  33413629 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaaggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggg 33413530  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  33413529 acggagggagta 33413518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47683301 - 47683092
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  47683301 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaggtgtataat-a 47683204  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||  |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  47683203 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaatggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataatta 47683104  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||    
T  47683103 gggacggaggta 47683092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1028728 - 1028515
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  1028728 actattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 1028630  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||||     
T  1028629 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagga 1028530  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  1028529 acggagggagtataa 1028515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4455272 - 4455111
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||    
T  4455272 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaata 4455173  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4455172 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 4455111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 29519988 - 29520201
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  29519988 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatatataataa 29520086  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  29520087 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataatta 29520186  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  29520187 gggacggaggtagta 29520201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46950203 - 46949989
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  46950203 attagtattgttttcacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 46950107  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||  ||        ||||||||| | | |||||||||    
T  46950106 ataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaatattctcaaaagggtcttataatta 46950007  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46950006 gggacggaggtagtataa 46949989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4036034 - 4035823
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  4036034 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaata-tgtataataaata 4035937  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  4035936 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 4035837  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  4035836 acggagggagtata 4035823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 4094800 - 4094959
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  4094800 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagggttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagagaaaga-tgtataataaata 4094897  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4094898 gagatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaaag 4094959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15241689 - 15241529
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  15241689 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 15241591  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  15241590 ggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 15241529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39670938 - 39670774
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  39670938 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaagatgtataataa 39670839  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  39670838 ataggggtatgtagataaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaag 39670774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51336006 - 51335790
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  51336006 attacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagggagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 51335908  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  51335907 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 51335808  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
      || |||||||||||||    
T  51335807 aagatggaggtagtataa 51335790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 13389741 - 13389895
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||| ||||||    
T  13389741 tattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa--aaaaagatgtataattaatagg 13389836  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  13389837 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaa 13389895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 20455008 - 20455220
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  20455008 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 20455104  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  20455105 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatggcaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 20455203  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  20455204 gggacggaggtagtata 20455220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48030524 - 48030312
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  48030524 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataa 48030428  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  48030427 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 48030328  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||| ||||| |||||    
T  48030327 gggatggagggagtat 48030312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 48241474 - 48241689
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||        ||||||||||    
T  48241474 attactattgtttttacaattttatcctttatgagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttactggtgattgaag-aaaaagatgtataataa 48241572  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||  | |||||||| ||| |||        |||||||||   | |||||||||    
T  48241573 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaaagatcttataagaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtgttataatta 48241672  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||| ||||    
T  48241673 gggacggaggtaatata 48241689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 55562950 - 55563113
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  55562950 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 55563048  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  55563049 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 55563113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 17609849 - 17610058
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  17609849 actattgtttttacaattttattctttaagaaaaatgt-tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 17609946  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17609947 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 17610045  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  17610046 acggagggagtat 17610058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 38405649 - 38405775
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||    
T  38405649 attattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaag-aaaaagatgtataataa 38405747  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38405748 ataggggcatgtatgtaaagaaataatt 38405775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53630001 - 53629792
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  53630001 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 53629904  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  53629903 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 53629804  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    | ||||| ||||    
T  53629803 atggagggagta 53629792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 51717922 - 51718139
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  51717922 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataacaa 51718020  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||        || ||||||   |||||||||||    
T  51718021 atatggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtattataaaaagggacaaaaaaatttatcaaaagagttttataatta 51718120  T
Q  201 gggacggaggtagtataag 219  Q
     | ||||||||||||||||    
T  51718121 agaacggaggtagtataag 51718139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54624013 - 54623799
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaaca-tgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||     
T  54624013 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaaa--gatggtttatgttttcaacattgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataatt 54623917  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| |  ||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||    
T  54623916 aataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatt 54623817  T
Q  200 agggacggaggtagtata 217  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  54623816 agggacggaggtaatata 54623799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 2615771 - 2615983
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  2615771 actattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaat 2615869  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||| ||||||    
T  2615870 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttatgattagg 2615969  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    |||||||| |||||    
T  2615970 gacggagggagtat 2615983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 4549717 - 4549876
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  4549717 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 4549814  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4549815 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaag 4549876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 26866688 - 26866900
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||  | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||        |||||||||||    
T  26866688 tactattgtttttacagttttatccttaagagagagatagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgatacaagaaaaata-tgtataataaa 26866786  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattag 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||        ||||||||| | | |||||||||     
T  26866787 taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaa 26866886  T
Q  202 ggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||    
T  26866887 ggacggaggtagta 26866900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37364727 - 37364583
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  37364727 actattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 37364629  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  37364628 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 37364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37842386 - 37842225
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  37842386 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataa 37842290  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37842289 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 37842225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45921641 - 45921431
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  45921641 attactattgcttttacaattttatcctttaagagagagggttaatttatgtttt---catgttatttattgctgattgaa-taaaaagatgtataataa 45921546  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||        ||||||||||| | |||||||||    
T  45921545 ataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgcaaataggaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataatta 45921446  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||  ||||||||    
T  45921445 gggacaaaggtagta 45921431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 49228545 - 49228705
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  49228545 actattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 49228643  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  49228644 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttgaaataacaaaggggtcttataaaaag 49228705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40809769 - 40809622
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||    
T  40809769 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagttgtattataa 40809671  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  40809670 atagggacatgtatgtaaataaataattaatgtagttaaaaatagcaaa 40809622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 45096991 - 45097195
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  45096991 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaag-aaaatcatgtataataa 45097087  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  45097088 ataagggtatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 45097187  T
Q  201 gggacgga 208  Q
    ||||||||    
T  45097188 gggacgga 45097195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 52850278 - 52850493
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  52850278 attactattatttttacaattttatcctttaagagagatagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 52850376  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  ||||||||||  || ||         ||||||||||||| |||||||||    
T  52850377 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataattagggataaaaaaaattctcaaaaagatcttataatta 52850476  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
     ||||||||||| ||||    
T  52850477 aggacggaggtaatata 52850493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 375637 - 375423
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  375637 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcagcattctatttattgctgattgaag-aaaaaaatatataataa 375539  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | |||||||||||| |||         |||||||| | | |||||||||    
T  375538 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataatta 375439  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
     |||||||||||||||    
T  375438 aggacggaggtagtat 375423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1859352 - 1859144
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||        |||||||||||||    
T  1859352 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgatacttattgctg-ttgaagaaaaaga-tgtataataaata 1859256  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  1859255 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 1859156  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  1859155 acggagggagta 1859144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 23777637 - 23777788
Alignment:
Q  11 tttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||||| ||    
T  23777637 tttttacaattttatcctttaagagagat--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataattaataggggcat 23777733  T
Q  111 gtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23777734 gtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaag 23777788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 55632087 - 55632296
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  55632087 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 55632184  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  55632185 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagag 55632284  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  55632285 acggagggagta 55632296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 20761649 - 20761782
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  20761649 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 20761747  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20761748 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 20761782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 422756 - 422915
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        |||||||||||||    
T  422756 actattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgt-tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaga-tgtataataaata 422853  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  422854 ggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 422915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6083494 - 6083283
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||        ||||||||||||    
T  6083494 tactattgtttttacagttttatc-tttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaaga-tgtataataaat 6083397  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||        ||||||||||| | ||||||||| |    
T  6083396 agagctatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaatattctcaaaaaggtcttataattaag 6083297  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    ||||||| ||||||    
T  6083296 gacggagatagtat 6083283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26625828 - 26626039
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   || | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  26625828 attactattgtttttataattttatcctttaagagaga---attgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataata 26625923  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||         |||||||| | | ||||||||    
T  26625924 aataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataatt 26626023  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||| ||||    
T  26626024 agggacggagggagta 26626039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 29014152 - 29014311
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  29014152 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 29014249  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  29014250 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaag 29014311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 30745630 - 30745786
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||    
T  30745630 ttgtttttacaattttatcctttaagaaataatgttagtttatgttttcaacctgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaatagggg 30745728  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30745729 tatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaag 30745786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 9808422 - 9808585
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  9808422 attactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 9808520  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  9808521 ataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaag 9808585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18004154 - 18003942
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  18004154 attagtattctttttacaattttatcttttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 18004058  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||||  | |||||||||    
T  18004057 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaaggtagttgaaaataacaaaaggatcttataaaaagggacaacaaaaattctcaaaaaagtgttataatta 18003958  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  18003957 gggacggaggtagtat 18003942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 25124069 - 25124232
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  25124069 attactattgtttttacaattttatcctttaataaagagggttgacttatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 25124167  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  25124168 ataggggcatgtatgtaaataaataattaatgaagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 25124232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 29460529 - 29460692
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  29460529 attattattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaag-aaaaagatgtataataa 29460627  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  29460628 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaag 29460692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41620725 - 41620517
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  41620725 attactattgcttttacaattttatcctttaagagatagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 41620629  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||   |  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||         ||||||||| | | |||||||||    
T  41620628 atgaagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaatgtcttataaaaagagataaaaataattctcaaaagggtcttataatta 41620529  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||    
T  41620528 gggacggaggta 41620517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49793302 - 49793090
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        || |||||||    
T  49793302 attacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaag-aaaaagatgaataataa 49793206  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||| |||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  49793205 ataaggaaatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 49793106  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  49793105 gggacggaggtagtat 49793090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1173774 - 1173616
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  1173774 attactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaggatgtataataa 1173676  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttata 160  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  1173675 ataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 1173616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 5743487 - 5743696
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  5743487 actattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 5743584  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  5743585 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattaggg 5743684  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  5743685 acggagggagta 5743696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 15500436 - 15500598
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||        ||||||||||    
T  15500436 attactattatttttacaattttatcctttatgagagaggggtggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaag-aaaaagatgtataataa 15500534  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    || || | |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||    
T  15500535 atcggagcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20747379 - 20747175
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  20747379 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 20747282  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||   || ||||||||||||    
T  20747281 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggacaataaaaattctcaaaggaatcttataattaggg 20747182  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  20747181 acggagg 20747175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 25708507 - 25708715
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  25708507 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 25708604  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  25708605 ggggcatgtatgtaaacaaaaaatcaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 25708703  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  25708704 acggagggagta 25708715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 54536006 - 54536087
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54536006 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 54536087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20789140 - 20788981
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  20789140 ctattgtttttacaactttatcctttaagagagataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaatag 20789042  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| || ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  20789041 gggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 20788981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47311503 - 47311360
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  47311503 attattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 47311405  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  47311404 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 47311360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16545808 - 16546017
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  16545808 attactattatttttacaattttatcttttaagagagaaggttggtttatcttttcaacatgttatttattgatgattgaag-aaaaagatgtataataa 16545906  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| |||||   |||||||||||  |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  16545907 ata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatatcaaatgattcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 16546005  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
     |||||||||||    
T  16546006 aggacggaggta 16546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 19281918 - 19282118
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||     
T  19281918 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag--aaaaaatgtataataaat- 19282014  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
            ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19282015 --------tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 19282106  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||| ||| ||||    
T  19282107 acgtagggagta 19282118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25475024 - 25474866
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||    
T  25475024 actattgtttttacaattttatcctttaagagataat--tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagac-gtataataaata 25474928  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  25474927 ggattatgtatgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataacaaaagagtcttataaaaag 25474866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 38899876 - 38900079
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||||| ||||||||    
T  38899876 ttgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatatataattaatagggg 38899972  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacgg 207  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  38899973 catgtatataaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaagtgatcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacgg 38900071  T
Q  208 aggtagta 215  Q
    | ||||||    
T  38900072 atgtagta 38900079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39144613 - 39144404
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  39144613 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 39144516  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||  ||        |||| |||| ||| ||||||||||||    
T  39144515 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggaacaaaaaaaattcttaaaaggatcttataattaggg 39144416  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  39144415 acggagggagta 39144404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8344115 - 8343973
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8344115 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8344017  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    | || |  ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  8344016 gaggca--tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 8343973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34963595 - 34963384
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  34963595 attattattggttttacaattttatcctttaagagagagagtt-gtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataat-a 34963499  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| || |||||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  34963498 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatgatcttataaaaaacgacaaatttttttctcaaaatgttcttataatta 34963399  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||| ||||||||    
T  34963398 gggacgaaggtagta 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 45850548 - 45850669
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  45850548 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 45850646  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaa 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  45850647 ataggggcatgtatgtaaagaaa 45850669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 48149017 - 48149177
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| | |||| | |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||| ||    
T  48149017 ttgtttttataattttatcctctaaaatagagagttgatttatgctctcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataatatatagagg 48149115  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48149116 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaaagagac 48149177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 8418170 - 8418385
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||   | |||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||        | || |||||    
T  8418170 attagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaagaaaaaaa-tataaaataa 8418268  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||||    
T  8418269 ataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaatggatcttataaaaagagatataaatttttctcaaaaaggttttataatta 8418368  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||| ||||||||||||    
T  8418369 gggagggaggtagtata 8418385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 30523849 - 30523969
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  30523849 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 30523945  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaat 124  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  30523946 atatgggcatgtatgtaaagaaat 30523969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 36900936 - 36901147
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  36900936 attagtattgtttttacaattttatcctt-aagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 36901031  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnt-tctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    |||||| |||||| |||          |||||||| ||| ||||||||    
T  36901032 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaagggagtcttacaaaaagggacaaaaaaaaaatctcaaaaggatcttataatt 36901131  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  36901132 agggacggaggtagta 36901147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52870853 - 52870643
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  52870853 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 52870756  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||| |    
T  52870755 ggggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagag 52870656  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  52870655 acggagggagtat 52870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 13498311 - 13498524
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| || | |||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  13498311 attactattgtatttacaattttatccttaaaaa-agagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 13498408  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| |||        |||||||||| || |||||||||    
T  13498409 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaacttttttctcaaaaacatcttataatta 13498508  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  13498509 gggacggaggtagtat 13498524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 33501756 - 33501834
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33501756 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 33501834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33988620 - 33988828
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  33988620 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 33988716  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| || ||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        |||| |||||  | |||||||||    
T  33988717 ataggggcatgtatgtaa--aaataattaatatagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac-aaaaaaattcttaaaaacgtcttataatta 33988813  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  33988814 gggacggaggtagta 33988828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Original strand, 34948482 - 34948689
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |  |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||| |    
T  34948482 tattgtttttacaattttatcttttaagagagagt--tgatttatgttttccgtatgctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataag 34948578  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggac 205  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  34948579 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaagtgatcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaatggtcttataattaggaac 34948678  T
Q  206 ggaggtagtat 216  Q
    ||| |||||||    
T  34948679 ggatgtagtat 34948689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 39114713 - 39114924
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  39114713 attattattgtatttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaata-tgtataataa 39114811  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||        |  |||||| ||| |||||||||    
T  39114812 ataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaat--tcaaaaggatcttataatta 39114909  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  39114910 gggacggaggtagta 39114924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 46480844 - 46480922
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46480844 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattg 46480922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 17678346 - 17678506
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  17678346 actattatttttacaattttatcctt-aagagagagtgttagtttatgttttccatattatatttattgctgattgaaggaaaaagatgtataataaata 17678444  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  || ||| ||||||||||||| |||||  || |||||||||||  |||||||||||||    
T  17678445 gggacatatatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaataagtcttataaaaag 17678506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18882566 - 18882350
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  18882566 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattatatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 18882468  T
Q  101 atagggg--tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||| ||| |||||  ||         ||||||||||| | |||||||    
T  18882467 ataggggcatatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggttttagaaaaaaggataaaaaattttctcaaaaaggtcttataat 18882368  T
Q  199 tagggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  18882367 tagggacggagatagtat 18882350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 54877840 - 54877999
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |   |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||    
T  54877840 attactattatttttacaattttatcttttaagagagtgt--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa---aaaaaatgtataataa 54877934  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  54877935 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 54877999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37518216 - 37518055
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||        |||||||| |    
T  37518216 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaaga-tgtataatta 37518120  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37518119 ataggggcatgaatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 37518055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37522432 - 37522271
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||        |||||||| |    
T  37522432 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaaga-tgtataatta 37522336  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37522335 ataggggcatgaatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 37522271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39184480 - 39184273
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||   |||| | |||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||        |||||||||||||    
T  39184480 actattgtttttacaattttatccttaaa---agagagttagtttatgttttccatatattatttattgctagttgaagaaaaata-tgtataataaata 39184385  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  39184384 gggacatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaatggtcttataattaggg 39184285  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    |||||| |||||    
T  39184284 acggagttagta 39184273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Original strand, 49490036 - 49490154
Alignment:
Q  46 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  49490036 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaaga-tgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 49490134  T
Q  146 caaattggtcttataaaaag 165  Q
     |||  ||||||||||||||    
T  49490135 gaaaggggtcttataaaaag 49490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 32899063 - 32899144
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32899063 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 32899144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 41191360 - 41191441
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41191360 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 41191441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18018871 - 18018731
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||        | ||||||||    
T  18018871 attactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattaaag-aaaaagatatataataa 18018773  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaa 142  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18018772 atatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 18018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 37639712 - 37639874
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||         ||||||||||    
T  37639712 attactattgtttttacaattttatcttttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgccgattgaa-caaaaatatgtataataa 37639810  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  37639811 ata-ggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 37639874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 42528504 - 42528578
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42528504 tgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 42528578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31071869 - 31071765
Alignment:
Q  43 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaa 142  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31071869 tagtttttgttttcagcatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaataaggatatgtatgtaaaaaaataattaatgtagctgaaaa 31071771  T
Q  143 tagcaa 148  Q
    ||||||    
T  31071770 tagcaa 31071765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 55876591 - 55876446
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  55876591 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagagaat--tggtttatgttttcatcatgatatttattgttgattgaagaaaatta-tgtataataa 55876495  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  55876494 ataagggcatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 55876446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 6807559 - 6807492
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttattt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6807559 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattt 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18872929 - 18872715
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||        |  | |||||    
T  18872929 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatacaaaataa 18872832  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||  | |||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  18872831 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacctggaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 18872732  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  18872731 gggacggaggtagtata 18872715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20286236 - 20286101
Alignment:
Q  28 tttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataat 127  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  20286236 tttaagagagagagttgatttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatagggatatatatgtaatgaaataat 20286138  T
Q  128 ttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    | |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||    
T  20286137 taatgtagttggaaatagtaaataagtcttataaaaa 20286101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 26889726 - 26889937
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   || |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  26889726 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagggagt--taatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaagaaaaaga-tgcaaaataa 26889821  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||  |||||||||||  | ||        || |||||| ||| |||||||||    
T  26889822 ataagggtatgtttgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgtgtcttataaaactaaacaattttttttttcaaaaggatcttataatta 26889921  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  26889922 gggacggaggtagtat 26889937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 39184082 - 39184221
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||        | |||||||||||||||    
T  39184082 ttgtttttacaattttatcctttaagatagagaattagtttatgttttcaacataatatttactgtcgattgaagaaaaata-tatataataaatagggg 39184180  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaa 148  Q
     ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  39184181 catgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaa 39184221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28501212 - 28501424
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  28501212 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 28501309  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||  ||||| |  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  28501310 ata-aggtatcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 28501408  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28501409 gggacggaggtagtat 28501424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 36040875 - 36040933
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36040875 tgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 36040933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 49329703 - 49329541
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  49329703 attacttttgtttttacaattttatcatttaagaaagtgggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatatataataa 49329605  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||  || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  49329604 ataaaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataaaaaatgagtcttataaaaa 49329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 468418 - 468539
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||| ||||||| |||        ||||||||| | |    
T  468418 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttttaaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggt 468517  T
Q  191 tttataattagggacggaggta 212  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  468518 cttataattaggaacggaggta 468539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 53906188 - 53906107
Alignment:
Q  43 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaata 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53906188 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaatgatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaata 53906107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28495597 - 28495517
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  28495597 attactattgcttttacaattttatcctttaagagagagatttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaa 28495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10497579 - 10497412
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||  |||||| || |||||||||        | || |||||    
T  10497579 attactattatttttacaattttatcctttaagagagaagactagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgattgaag-aaaaggatataaaataa 10497481  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||  || ||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  10497480 ataggggtatgttggtaaagaactaattaatgtatttggaaaaaccaaatagatcttataaaaagagac 10497412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38319729 - 38319651
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  38319729 tgtacaataaataggactatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagctcttataaaaaaagac 38319651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13549191 - 13548980
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||        |||| |||||    
T  13549191 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaag--aaaaaatgtaaaataa 13549095  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  |||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  13549094 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataatta 13548995  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  13548994 gggacggaggtagta 13548980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23621578 - 23621509
Alignment:
Q  95 taataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  23621578 taataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 23621509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39797553 - 39797432
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttat 195  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||||| | ||||    
T  39797553 aataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaatgattttttcaaaaaggtcttat 39797454  T
Q  196 aattagggacggaggtagtata 217  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39797453 aattagggacggaggtagtata 39797432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 41333875 - 41333955
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  41333875 attattattgtttttacaattttatc-tttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41333955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 47109645 - 47109725
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  47109645 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 47109725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 53564181 - 53564393
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||        || | |||||    
T  53564181 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaag-aaaaatatgcaaaataa 53564278  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| || ||  || ||||| ||||| |||| |||||||||  ||        ||||||||| | | |||||||||    
T  53564279 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatctacttggaaatatcaaatgggtcatataaaaaggaacaatcttttttctcaaaagggtcttataatta 53564378  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  53564379 gggacggaggtagta 53564393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 81
Target Start/End: Original strand, 42598538 - 42598615
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  42598538 ttactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttagtttatggtttcaatatgctacttattgttgattgaa 42598615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 48801444 - 48801606
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        |||| |||||    
T  48801444 attattatagtttttacaattttatcctt-aagagaaagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgtaaaataa 48801541  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||| | |||||  |||||||| ||| |   ||||||||||||    
T  48801542 ataagggtatgttggtaaagaaataactaatgtaattgaaaatatcaattgtatcttataaaaag 48801606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Original strand, 5734528 - 5734650
Alignment:
Q  27 ctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgt-aaagaaata 125  Q
    |||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  5734528 ctttaagagatagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaata 5734626  T
Q  126 atttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||| |||||| || ||||||||||    
T  5734627 attaatgtagttggaaatagcaaa 5734650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 6656570 - 6656649
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6656570 attaatattgtttttacaattttatc--ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 6656649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 218
Target Start/End: Original strand, 46481303 - 46481429
Alignment:
Q  93 tataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattgg-tcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagatt 191  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  || |||||||||||| |||        ||||||||||| |     
T  46481303 tataataaataggggctttcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggacaagaaaaattctcaaaaaggtc 46481402  T
Q  192 ttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46481403 ttataattagggatggaggtagtataa 46481429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13138850 - 13138777
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13138850 tgtaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaa 13138777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20180742 - 20180873
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||| |||  ||||  |||||||||||||| ||||        | ||||||||    
T  20180742 attaatattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagattatgcttttcacatactatttattgctgatcgaagaaaaaaaat-tataataa 20180839  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgta 134  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20180840 atagtggtatgtatgaaaagaaataattaatgta 20180873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 30868623 - 30868704
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  30868623 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa 30868704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23623848 - 23623769
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23623848 attactattgtttt-acaattttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaa 23623769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18879665 - 18879549
Alignment:
Q  46 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||| || ||||||    
T  18879665 tttatgttttcaacatgttatttattgatgatagaag-aaagaaatgtataataaataagagtatgtaggtaaagaaataattaa--tagttggaaatag 18879569  T
Q  146 caaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  18879568 caaaggggacttataaaaag 18879549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 52966303 - 52966161
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||   | |||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||    
T  52966303 ctattatttttacaattttatccttaaa-agaggaagttagtttatgttttacatatgatatttattgctaattgaagaaaaaaa-tgtataataaatag 52966206  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  52966205 ggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 52966161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 6629301 - 6629509
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  6629301 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaataa 6629395  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        || || ||||| | |||||||||    
T  6629396 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagcgtcttataaaaagggacaaattattttttc-aaaaggtcttataatta 6629494  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  6629495 gggacggaggtagta 6629509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29509016 - 29508855
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||        || | ||||||    
T  29509016 ttactattgtttttacaattttatcc-ttaaaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattattgattgaag-aaaaagatgcaaaataaa 29508919  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    || |||| |||  ||||| |||||||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  29508918 taagggtttgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatatcaaaatggtcttataaaaag 29508855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 36211463 - 36211393
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatt 78  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  36211463 ttgtttttacaattttatcttttaagatcgagagttagtttatgttttcaacatattattcattgttgatt 36211393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 51329609 - 51329686
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  51329609 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagataattagtttatatttttcatatgttatttattgctgattgaag 51329686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17468100 - 17468023
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  17468100 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa 17468023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 23390173 - 23390253
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  23390173 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 23390253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 30010677 - 30010757
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  30010677 attactattgtttttacaattttatcc-ttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 30010757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35909854 - 35909774
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| || ||||||    
T  35909854 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttggttgaag 35909774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 52181011 - 52181087
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  52181011 attactattgtttttacaattttatcctt---gagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattga 52181087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 3168263 - 3168338
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |  ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  3168263 actattgtttttacaattttatcatttaagagagag---ttatttatgttttcaacatactatttatcgttgattgaag 3168338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Original strand, 27009668 - 27009704
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagaga 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27009668 ttactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 27009704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32684716 - 32684648
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  32684716 aataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaccggtcttataaaaa 32684648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38613526 - 38613458
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  38613526 aataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaa 38613458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 49489965 - 49490001
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagag 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49489965 attactattgtttttacaattttatcctttaagagag 49490001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 706755 - 706688
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttatt 71  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  706755 actattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttatt 706688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 729862 - 729929
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttatt 71  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  729862 actattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttatt 729929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 5734472 - 5734507
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagaga 36  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5734472 attactattgtttttacaattttatcctttaagaga 5734507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 19596268 - 19596346
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  | || || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19596268 tactattgcttttacaattttatcctt-aagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 19596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 4143600 - 4143562
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagag 39  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4143600 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagag 4143562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3085479 - 3085442
Alignment:
Q  181 tcaaaaagattttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3085479 tcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtataa 3085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17468010 - 17467941
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  17468010 aataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagggatcttataaaaag 17467941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 165
Target Start/End: Original strand, 32899153 - 32899206
Alignment:
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  32899153 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 32899206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 39879950 - 39879917
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaaga 34  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39879950 attactattgtttttacaattttatcctttaaga 39879917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 5840120 - 5840188
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattg 72  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5840120 attattattatttttacaattttatcctt-aagagagagt--tagtttatgtttttaacatgatatttattg 5840188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 7776769 - 7776853
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag----tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||    ||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||    
T  7776769 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgtcgattgaag 7776853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20783398 - 20783330
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattg 72  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||||||  |||||||||    
T  20783398 attactattatttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattg 20783330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 30191893 - 30191841
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaa 58  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  30191893 tattgttgttacaattttatcatttaagagagagggttagcgtatgttttcaa 30191841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32112169 - 32112137
Alignment:
Q  184 aaaagattttataattagggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32112169 aaaagatcttataattagggacggaggtagtat 32112137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 49613987 - 49614023
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagag 39  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49613987 tactattgtttttacaattttatccttgaagagagag 49614023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 50649134 - 50649098
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagaggg 41  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50649134 ctattgtttttacaattttatcctttaagaaagaggg 50649098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 51787704 - 51787664
Alignment:
Q  42 atagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  51787704 atagtttatgttttcaacatactatttatcgctgattgaag 51787664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 141)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 43060235 - 43060448
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  43060235 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa-aaaaaagatgtataataa 43060333  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  43060334 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 43060433  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  43060434 gggacggaggtagta 43060448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14649398 - 14649232
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  14649398 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa-taaaaagatgtataataa 14649300  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagaga 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14649299 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagaga 14649232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35547474 - 35547260
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  35547474 attactattatttttacaattttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaaga-tgtataataa 35547376  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||        |||||||||| || |||||||||    
T  35547375 ataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaaatcttataatta 35547276  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  35547275 gggacggaggtagtat 35547260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 6673055 - 6673268
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  6673055 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 6673153  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  6673154 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 6673253  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  6673254 acggagggagtataa 6673268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 27873169 - 27873384
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  27873169 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 27873267  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  27873268 ataagggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 27873367  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    ||||||||| |||||||    
T  27873368 gggacggagatagtata 27873384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1266159 - 1265949
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  1266159 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 1266061  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  1266060 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 1265961  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  1265960 acggagggagta 1265949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21239312 - 21239098
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||    
T  21239312 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 21239214  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||        ||||||||| | | || ||||||    
T  21239213 acaggggcatgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttctaatta 21239114  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  21239113 gggacggaggtagtat 21239098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 4984943 - 4985148
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        | |||||||||||    
T  4984943 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatctataataaata 4985041  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4985042 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggttttataattaggg 4985141  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  4985142 acggagg 4985148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22527902 - 22527690
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  22527902 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 22527804  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  22527803 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 22527704  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  22527703 acggagggagtata 22527690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22657981 - 22657765
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  22657981 attactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 22657883  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | |||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  22657882 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 22657783  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22657782 gggacggaggtagtataa 22657765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23285901 - 23286108
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  23285901 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga-tgattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 23285998  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||| || |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  23285999 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagatgtcttataaatagggacaaacaaaattctcaaaatgatcttataatta 23286098  T
Q  201 gggacggagg 210  Q
    ||||||||||    
T  23286099 gggacggagg 23286108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 8283932 - 8284145
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  8283932 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa-aaaaaagatgtataataa 8284030  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||         |||||||| | |||||||||||    
T  8284031 ataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaa-tctcaaaagggttttataatta 8284129  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  8284130 gggacggaggtggtat 8284145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 10511295 - 10511458
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  10511295 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 10511393  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10511394 ataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatgagtcttataaaaag 10511458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20186714 - 20186499
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||    
T  20186714 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtatgataa 20186616  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  20186615 ataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataatta 20186516  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  20186515 gggacggatgtagtata 20186499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40643307 - 40643093
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  40643307 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 40643209  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||  |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  40643208 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 40643109  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  40643108 gggacggaggtagtat 40643093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 42561176 - 42561381
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||    
T  42561176 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaagatgtataataaata 42561274  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  42561275 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaagg 42561374  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  42561375 acggagg 42561381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14619462 - 14619249
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  14619462 attactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataa 14619364  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||        ||||||||| | | |||||||||    
T  14619363 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 14619264  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||| ||||||||    
T  14619263 gggacgaaggtagta 14619249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7940663 - 7940450
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  7940663 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 7940567  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  7940566 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 7940467  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  7940466 gggacggaggtagtata 7940450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 10734348 - 10734508
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  10734348 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 10734446  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10734447 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 10734508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 17674485 - 17674645
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  17674485 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 17674583  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  17674584 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaag 17674645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 28041178 - 28041338
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  28041178 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 28041276  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  28041277 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 28041338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31889103 - 31888943
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  31889103 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 31889005  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  31889004 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 31888943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34662414 - 34662202
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  34662414 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 34662316  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||         |||||||| | | ||||||||||||    
T  34662315 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaactctcaaaagggtcttataattaggg 34662216  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  34662215 acggagggagtata 34662202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3028228 - 3028010
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag--tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||    
T  3028228 attagtattgtttttacaattttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaata-tgtataat 3028130  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||    
T  3028129 taataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataat 3028030  T
Q  199 tagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3028029 tagggacggaggtagtataa 3028010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 15521769 - 15521980
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  15521769 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-gaaaaaatgtataataaata 15521867  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||  |||        ||||||||| | ||||||||||||||    
T  15521868 ggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataattaggg 15521967  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  15521968 acggagggagtat 15521980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 16153082 - 16153285
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  16153082 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 16153180  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  16153181 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 16153280  T
Q  204 acgga 208  Q
    |||||    
T  16153281 acgga 16153285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5528184 - 5527974
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  5528184 actactgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 5528086  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||  |||        ||||||||||| | ||||||||| ||    
T  5528085 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaagg 5527986  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  5527985 acggagggagta 5527974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23285250 - 23285085
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  23285250 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataat 23285152  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23285151 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 23285085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4194893 - 4194688
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  4194893 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagt--tggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaaga-tgtataataa 4194797  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||| |||||| |||        ||||||||||| | |||||||||    
T  4194796 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttacaaaaagggacaaaattttttctcaaaaaggtcttataatta 4194697  T
Q  201 gggacggag 209  Q
    |||||||||    
T  4194696 gggacggag 4194688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 15190642 - 15190854
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  15190642 actattgtttttacaattttatcatttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 15190740  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||||   | ||||||||||||    
T  15190741 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggg 15190840  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  15190841 acggagggagtata 15190854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 20988039 - 20988200
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  20988039 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 20988135  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  20988136 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaag 20988200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 3686581 - 3686740
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  3686581 actattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 3686679  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  3686680 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 3686740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 28140744 - 28140910
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttatt-gctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||        |||||||||    
T  28140744 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttatccgctgattgaagaaaaaga-tgtataata 28140841  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagaga 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28140842 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagaga 28140910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41641309 - 41641094
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  41641309 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 41641211  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaa----taatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||    
T  41641210 ggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatgatcttataatt 41641111  T
Q  200 agggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41641110 agggacggagggagtat 41641094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 4753045 - 4753250
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  4753045 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 4753143  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||   ||||||||||||| |||        |||| |||| | | ||||||||||||    
T  4753144 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaattaacaaaaatgtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattaggg 4753243  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  4753244 acggagg 4753250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4976113 - 4976327
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||    
T  4976113 attactattgcttttacaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa--aaaaagatgtataat 4976210  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||| | |||        || |||||| | | |||||||    
T  4976211 aaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaaggggacaaaaatatttttcaaaagggtcttataat 4976310  T
Q  199 tagggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  4976311 tagggacggaggtagta 4976327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16441142 - 16440928
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||| |    
T  16441142 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaag-aaaaaaatgtataatta 16441046  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||| || |||        |||| |||| | | |||||||||    
T  16441045 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataatta 16440946  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16440945 gggacggagggagtataa 16440928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 31507448 - 31507605
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  31507448 actattgtttttacaattttatcctttaatagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 31507546  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaa 162  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  31507547 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaa 31507605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 39121514 - 39121727
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  39121514 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaag-aaaaagatgtataataa 39121612  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  39121613 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaatggtcttataatta 39121712  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  39121713 gggacggatgtagta 39121727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 41384000 - 41384212
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  41384000 actattgtttttacaattttgtcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 41384097  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||| |||||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41384098 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaggagacaacaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 41384197  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  41384198 acggagggagtataa 41384212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32478348 - 32478144
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  32478348 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 32478250  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  32478249 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 32478150  T
Q  204 acggag 209  Q
    ||||||    
T  32478149 acggag 32478144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12744037 - 12743874
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  12744037 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataacaa 12743939  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||   |||||||||||||    
T  12743938 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaag 12743874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17714781 - 17714563
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagg-gatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnn--tgtataa 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||||    
T  17714781 attactattgttttgacaattttattttttaagagagagatgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgtataa 17714682  T
Q  98 taaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataa 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||| |||        ||||| ||||||||||||||    
T  17714681 taaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataagaagggacaaaaaaaattctctaaaagattttataa 17714582  T
Q  198 ttagggacggaggtagtat 216  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  17714581 ttagagacggatgtagtat 17714563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20142085 - 20142297
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| | |    
T  20142085 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtatattta 20142181  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||  ||||| | | |||||||||    
T  20142182 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataatta 20142281  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  20142282 gggacggaggtagtat 20142297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 24307965 - 24308128
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||        ||||||||||    
T  24307965 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaacatgttatttattacttattgaagaaaaaga-tgtataataa 24308063  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24308064 ataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaag 24308128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24365358 - 24365195
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||        ||||||||||    
T  24365358 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaacatgttatttattacttattgaagaaaaaga-tgtataataa 24365260  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24365259 ataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaag 24365195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34332431 - 34332268
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||    
T  34332431 attactattgtttttacaattatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 34332333  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  34332332 ataggggtatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaag 34332268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40738619 - 40738461
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||    
T  40738619 actattgtttttacaattttatcctt-atgagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctcattgaagaaaaaga-tgtataataaata 40738522  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  40738521 gaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40738461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9828602 - 9828393
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  9828602 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 9828505  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  9828504 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 9828405  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  9828404 acggagggagta 9828393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12806854 - 12806696
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||    
T  12806854 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataacaaatagg 12806756  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||   |||||||||||||    
T  12806755 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaag 12806696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14913860 - 14913645
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  14913860 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagatag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaaga-tgtataatta 14913764  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||         ||||||||| | | ||||||||    
T  14913763 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatt 14913664  T
Q  200 agggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  14913663 agggacggagggagtataa 14913645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39984984 - 39984815
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  39984984 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 39984886  T
Q  101 at--aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  39984885 atagagaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagagac 39984815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 25600887 - 25601047
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||         |||||||||||||    
T  25600887 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaa-taaaaagatgtataataaata 25600985  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  ||||||||||||||    
T  25600986 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaag 25601047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 40004237 - 40004448
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        | |||||||||||    
T  40004237 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tatataataaata 40004334  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  40004335 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 40004434  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  40004435 acggagggagtata 40004448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 3160354 - 3160565
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  3160354 actattgtttttacaaatttatcctttaagagagatggttagtttatgttttcaacatactatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 3160452  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    | |  ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    |||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3160453 gagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaaatagcaaaggaatcttataaaaagggacaaaaaattttctcaaaatgatcttataattaggg 3160552  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||| |||||||    
T  3160553 acggatgtagtat 3160565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9065120 - 9064957
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  9065120 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 9065022  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  9065021 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 9064957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16127468 - 16127258
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  16127468 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 16127371  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  16127370 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 16127271  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  16127270 acggagggagtat 16127258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19571762 - 19571925
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  19571762 attaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 19571860  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  19571861 ataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaag 19571925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 34889102 - 34889316
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||    
T  34889102 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttgatttatgtattcaacatgttatttattgctggttgaa-aaaaaagatgtataataa 34889200  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttc-tcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||   ||||||||||||| |||        ||| |||||||||| ||||||||    
T  34889201 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaagatgtcttataaaaagggacaattttttttcttcaaaaagatcttataatt 34889300  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    | ||||||||||||||    
T  34889301 aaggacggaggtagta 34889316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20987955 - 20987797
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  20987955 tattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatagg 20987857  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  20987856 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 20987797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 38161616 - 38161817
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatg 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| ||| |||||| |||    
T  38161616 ttttacaattttatccttta-gagatagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaa-tgtatagtaagtaggggcatg 38161713  T
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggt 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||        ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  38161714 tatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattcacaaaaaggtcttataattagggacgtaggt 38161813  T
Q  212 agta 215  Q
    ||||    
T  38161814 agta 38161817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 40951867 - 40952029
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  40951867 attacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 40951965  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  40951966 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaa 40952029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 13759273 - 13759487
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  13759273 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 13759369  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  13759370 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 13759469  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    || |||||||||||||||    
T  13759470 ggaacggaggtagtataa 13759487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23092464 - 23092677
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  23092464 attactattgttgttacaattttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagt-tgtataaaaa 23092562  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||| |||||||||| |||        ||||||||| | | ||||| |||    
T  23092563 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttatagtta 23092662  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | |||||||||||||    
T  23092663 gagacggaggtagta 23092677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32147502 - 32147290
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  32147502 actattgcttttacaattttatcctt-aagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 32147405  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  32147404 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 32147306  T
Q  204 acggaggtagtataag 219  Q
    ||||||| ||||||||    
T  32147305 acggagggagtataag 32147290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 186307 - 186144
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  186307 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 186210  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  186209 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaatggtcttataaaaaaagac 186144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7951770 - 7951611
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  7951770 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 7951673  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  7951672 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 7951611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9020906 - 9020745
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  9020906 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 9020810  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  9020809 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 9020745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32964343 - 32964131
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||||| |    
T  32964343 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagtg--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgcataatta 32964247  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||         |||||||| | | |||||||||    
T  32964246 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaa-tctcaaaatggtcttataatta 32964148  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  32964147 gggacggaggtagtata 32964131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7735047 - 7734884
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  7735047 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataa 7734949  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  7734948 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttataaaaag 7734884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 9268117 - 9268280
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  9268117 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaaga-tgtataataa 9268215  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  9268216 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 9268280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13661068 - 13660861
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  13661068 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagt--tagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 13660973  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  13660972 ggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagag 13660873  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  13660872 acggagggagta 13660861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14789762 - 14789604
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  14789762 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagggttaatttatgttttctatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 14789665  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14789664 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcagagaggtcttataaaaa 14789604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 32617600 - 32617763
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        |||||| |||    
T  32617600 attactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtatattaa 32617698  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  32617699 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaag 32617763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 3497628 - 3497837
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  3497628 actattgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 3497725  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||     
T  3497726 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagga 3497825  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  3497826 acggagggagta 3497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 13862822 - 13863032
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||        |||||||||||||    
T  13862822 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgacagaag-aaaaagatgtataataaata 13862920  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||   || |||||||||| |||        ||||||||| | |  |||||||||||    
T  13862921 ggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcatataattaggg 13863020  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  13863021 acggagggagta 13863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21750143 - 21749995
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  21750143 attactattgtttttataattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 21750045  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaat 150  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  21750044 atagggacatgtatgtaaagaaataatcaatgtagttgaaaatagaaaat 21749995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14571491 - 14571285
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||        |||||||||| |||||    
T  14571491 attgtttttacaattttatcctt-aagagagagt--tagtttatgttttgcatatgttattcattgttgattgaagaaaaata-tgtataataagtaggg 14571396  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||| ||||| |||        |||||||||| || |||||||||||||||    
T  14571395 gtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttatgaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaatatcttataattagggacg 14571296  T
Q  207 gaggtagtata 217  Q
    |||||||||||    
T  14571295 gaggtagtata 14571285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20518054 - 20517909
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  20518054 attactattgtttttataattttatccttta---gagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaagaatgtataataa 20517959  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaat 150  Q
    || |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20517958 atgggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaat 20517909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9264186 - 9264025
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  9264186 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 9264088  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  9264087 ataagagcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaa 9264025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 38371798 - 38371960
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  38371798 attaatattatttttacaattttattctttaatagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaag-aaaaagatgtataataa 38371894  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattgg-tcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  || ||||||||||||    
T  38371895 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggatcttataaaaag 38371960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 22581562 - 22581706
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||    
T  22581562 tactattgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaa-aaaaaagatgtataataaat 22581659  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22581660 agaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 22581706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41418521 - 41418310
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  41418521 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaag-aaaatgatgtataataa 41418423  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||||||| ||| |||||    
T  41418422 ata--tgtatgtatgtaaagaaataattaatgtatttagaaatagaaaaagggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaagatcttacaatta 41418326  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  41418325 gggacggaggtagtat 41418310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14436015 - 14435934
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14436015 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 14435934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 26894742 - 26894913
Alignment:
Q  45 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||    
T  26894742 gtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-attaatgtagttggaaata 26894839  T
Q  145 gcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
    |||||| |||||||||||||| ||         ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26894840 gcaaatgggtcttataaaaagggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtataa 26894913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 17592629 - 17592767
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  17592629 actattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 17592726  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  17592727 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 17592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 35039210 - 35039063
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  35039210 attactattgtttttacaaatttatcattcaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 35039112  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||| ||  || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  35039111 ataaggacatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 35039063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8144544 - 8144670
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  8144544 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 8144642  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8144643 ttaggggcatgtatgtaaagaaataatt 8144670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 18615886 - 18616053
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtt----tatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtata 96  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||     
T  18615886 attactattaattttacaattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtatg 18615984  T
Q  97 ataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18615985 ataaatatggacatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaag 18616053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33639503 - 33639343
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  33639503 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagataaagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaa-aaaaaagatgtataataa 33639406  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33639405 ataggggcatatatgtagaaaaataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataaaa 33639343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39759100 - 39758958
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  39759100 attacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 39759002  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  39759001 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 39758958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30183053 - 30182972
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30183053 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 30182972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Original strand, 26605478 - 26605610
Alignment:
Q  32 agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttat 131  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  26605478 agagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaa-tgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaat 26605576  T
Q  132 gtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26605577 gtagttggaaatatcaaaggggtcttataaaaag 26605610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 31158256 - 31158411
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   | |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||        |||||||||||||||    
T  31158256 tattgtttttataattttatcctt-aagagagagt--tggtttatgttttccatatgctatttattgcttattgaagaaaaata-tgtataataaatagg 31158351  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31158352 gacatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagaaaagtggtcttataaaaag 31158411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13735774 - 13735701
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  13735774 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 13735701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 26674480 - 26674645
Alignment:
Q  53 tttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattg 152  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||      
T  26674480 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatga 26674578  T
Q  153 gtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||| |||         || || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26674579 gtcttataaaaagggacaaaaaaaaattatctaaagaattttataattagggacggaggtagtataa 26674645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 26946086 - 26946251
Alignment:
Q  53 tttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattg 152  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||      
T  26946086 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatga 26946184  T
Q  153 gtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||| |||         || || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946185 gtcttataaaaagggacaaaaaaaaattatctaaagaattttataattagggacggaggtagtataa 26946251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Original strand, 23286387 - 23286511
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | |    
T  23286387 tgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggt 23286486  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  23286487 cttataattagggacggaggtagta 23286511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 37034357 - 37034233
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  37034357 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 37034259  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataattt 129  Q
    | || |||||| ||||||||| ||||    
T  37034258 gaggcatgtatttaaagaaatgattt 37034233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12098768 - 12098634
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||        ||| ||||||| ||||    
T  12098768 attgtttttacaattttatcctttaagagagatagctagtttatatttttaacattctatttattgctcattgaag-aaaaagatgtttaataaagaggg 12098670  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaa 142  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  12098669 gtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagttgaaaa 12098634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24170343 - 24170134
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  24170343 actactgtttttacaattttatc-ttaaagagagagaattagtttatgttttctatatgctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 24170246  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaat-tggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    || | ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  | |||||||||||| |||        |||||||||   |||||||||||||    
T  24170245 ggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagatcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagagttttataattagg 24170147  T
Q  203 gacggaggtagta 215  Q
    || ||||||||||    
T  24170146 gatggaggtagta 24170134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39180643 - 39180461
Alignment:
Q  32 agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttat 131  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  39180643 agagagagagttaatttatgttttcaacatgttatttattgatgatttaagaaaaaga-tgtataataattagggacatgtatgtaaagaaataattaat 39180545  T
Q  132 gtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagta 215  Q
    |||| || ||||| ||||   || |||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||    
T  39180544 gtagttggaaataacaaaaatgttttataaaaagggacaaataaaattctcaaaatggtcttataattagggacggatgtagta 39180461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 15774887 - 15775020
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||        |||| |||||    
T  15774887 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgttgattaaag-aaaaagatgtacaataa 15774985  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||    
T  15774986 ataggggcatatatgtaaaaaaataattaatgtag 15775020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30182204 - 30182083
Alignment:
Q  94 ataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagatttt 193  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | ||||    
T  30182204 ataataaatagggccatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtttt 30182105  T
Q  194 ataattagggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  30182104 ataattagggacagatgtagta 30182083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39971226 - 39971010
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||        || | |||||    
T  39971226 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaag-aaaaagatgcaaaataa 39971129  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
     || ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  | |||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  39971128 ttaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataatta 39971029  T
Q  201 gggacggaggtagtataag 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39971028 gggacggaggtagtataag 39971010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3629111 - 3628982
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        | |||||||||||    
T  3629111 actattgtttttacaatgttatcctttaagctagagt--tagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaaaaattatataataaata 3629014  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
     |||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  3629013 agggtgtgcaagtaaagaaataattaatgtag 3628982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 9438915 - 9439050
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttt-aagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||        |||||||||    
T  9438915 attattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgtgttttcaacatgctatttattgctgatcaaagaaaaaaagtgtataata 9439014  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  9439015 aatagggatatgtaggtaaaaaaataattaatgtag 9439050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15674985 - 15674913
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatt 78  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15674985 actattgcttttacaattttatcttttaagagagagt--tagtttatattttcaacatgttatttattgctgatt 15674913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 26076213 - 26076292
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26076213 attattattatttttacaattttattctttaagaaagagagttagtttgtgttttcaacatattatttattgctgattga 26076292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 6328628 - 6328708
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6328628 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 6328708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11780967 - 11780886
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11780967 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatattttcaacattctatttattgttgattgaag 11780886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 28414509 - 28414589
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28414509 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 28414589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 149
Target Start/End: Original strand, 13703682 - 13703778
Alignment:
Q  52 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  13703682 ttttcaacatgttatttattgttgtttgaagaaaaaaa-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatagcaaa 13703778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 25837220 - 25837141
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  25837220 attactattgtttttacaattttatccttaaa-agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 25837141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 41686940 - 41687100
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  41686940 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaatatgcaaaataa 41687035  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  41687036 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaag 41687100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31657896 - 31657734
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  31657896 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaagtgcaaaataa 31657799  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  31657798 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaag 31657734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37206332 - 37206169
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||  || |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||        | || |||||    
T  37206332 attactattatttttacaattttatcctttaaaaaagcaggttagtgtatgttttcaacataatatttaatgctgattgaag-aaaaatatataaaataa 37206234  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | |||||||||| |||||||||  |||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  37206233 acaggggtatgtttgtaaagaatcaattaatgtacatgaaaatatcaaaaagttcttataaaaag 37206169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 8100263 - 8100380
Alignment:
Q  47 ttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||     
T  8100263 ttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaa-aaaaaaaatgtatgataaataagagtatgtaagtaaagaagtaattaatgttgttggaaataga 8100361  T
Q  147 aaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  8100362 aaattgatcttataaaaag 8100380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24857767 - 24857555
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  24857767 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaagtgcaaaataa 24857671  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  |||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  24857670 ataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataatta 24857571  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  24857570 gggacggaggtagtat 24857555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31642399 - 31642191
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||        || | |||||    
T  31642399 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattg-aggaaaaagatgcaaaataa 31642302  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||| || | |||||||||    
T  31642301 ataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctcaaagaggtcttataatta 31642202  T
Q  201 gggacggaggt 211  Q
    |||||||||||    
T  31642201 gggacggaggt 31642191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 42030423 - 42030493
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttatt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  42030423 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaggagagttagcttatgttttcaacattctatttatt 42030493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21069849 - 21069637
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||   | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  21069849 attactattatttttacaattttatcctt-aagagaggtagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaa-tgcaaaataa 21069752  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| |||| ||||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  21069751 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 21069652  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  21069651 gggacagaggtagta 21069637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 1303402 - 1303541
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  1303402 attactattatttttacaattttatcctt-aagagagagt--tagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag-aaaacgatgcaaaataa 1303497  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  1303498 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaata 1303541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8950027 - 8949949
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  8950027 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattga 8949949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Original strand, 14570801 - 14570927
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnntt--ctcaaaaag 188  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||   ||||||||    
T  14570801 tgtataataagtaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttttcttcaaaaag 14570900  T
Q  189 attttataattagggacggaggtagta 215  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  14570901 gtcttataattagggacggaggtagta 14570927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15559749 - 15559584
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttta---agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |   |||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | ||    
T  15559749 attactattgtttttacaattttattcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaa 15559651  T
Q  98 taaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| || ||||||||   ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  15559650 taactaagggtatgttgataaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaa 15559584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16926664 - 16926587
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  16926664 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagaga-agagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattga 16926587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27834150 - 27834076
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27834150 attgtttttacaattttatcatt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27834076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 37700300 - 37700225
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  37700300 attgtttttacaattttatcctttaagagagaaaattagtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaag 37700225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18251232 - 18251148
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttta---agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |   | |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  18251232 attactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattgaag 18251148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 5283259 - 5283179
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  | || | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  5283259 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 5283179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 16099437 - 16099375
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttat 70  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  16099437 tattgtttttacaattttatcctttaag--agagggttagtgtatgttttcaacatagtatttat 16099375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23259963 - 23260179
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||        || | |||||    
T  23259963 attaatattgtttttacaattttatcctt-aagagaaagtgttaatttatgttttcaacataatatttattgttggttgaagaaaaaga-tgcaaaataa 23260060  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| | |||| |  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||    |||||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  23260061 ataagagtatattagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaagggtcttataatta 23260160  T
Q  201 gggacggaggtagtataag 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23260161 gggacggaggtagtataag 23260179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 16285015 - 16285177
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |   || ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||        || | |||||    
T  16285015 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagattgaattaatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaagaaaaaga-tgcaaaataa 16285112  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16285113 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaag 16285177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7001514 - 7001445
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttatt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  7001514 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatt 7001445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 9727579 - 9727504
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||| |||||| |||| || | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  9727579 actattatttttataattatatcttttaagagagagt--tagtttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaa 9727504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 8145142 - 8145179
Alignment:
Q  178 ttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8145142 ttctcaaaaatgttttataattagggacggaggtagta 8145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 26889678 - 26889715
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagaga 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26889678 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga 26889715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 35784745 - 35784822
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  35784745 attattattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 35784822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 8356364 - 8356443
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| || ||| || | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  8356364 attactgttgtttttacaattttatacttaaa-agatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 8356443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 23286309 - 23286360
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttc 56  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  23286309 actattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatattttc 23286360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 156)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40607915 - 40607701
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  40607915 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttaaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 40607817  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  40607816 ataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 40607717  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  40607716 gggacggagggagtat 40607701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8990414 - 8990201
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8990414 actattgtttttacaatgttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8990316  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||| |||        ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8990315 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattaggg 8990216  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  8990215 acggagggagtataa 8990201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31751285 - 31751066
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattg--aagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||         ||||||||    
T  31751285 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataat 31751186  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||| ||||| | | |||||||    
T  31751185 aaataggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttcacaaaagggtcttataat 31751086  T
Q  199 tagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31751085 tagggacggaggtagtataa 31751066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 34883675 - 34883886
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  34883675 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 34883773  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  34883774 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 34883873  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  34883874 acggagggagtat 34883886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32121154 - 32120944
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  32121154 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 32121056  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| ||||||||||||    
T  32121055 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaaggatcttataattaggg 32120956  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  32120955 acggagggagta 32120944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 36130855 - 36131065
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  36130855 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 36130953  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  36130954 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 36131053  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  36131054 acggagggagta 36131065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40680937 - 40680725
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  40680937 actattgattttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaag-aaaaagatgtataataaata 40680839  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  40680838 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 40680739  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||| | ||||||    
T  40680738 acggatggagtata 40680725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 12890034 - 12890246
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  12890034 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 12890130  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  12890131 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataatta 12890230  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  12890231 gggacggaggtagtat 12890246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 13197472 - 13197683
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  13197472 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 13197570  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||  |||        |||||||||  || ||||||||||||    
T  13197571 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattaggg 13197670  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  13197671 acggagggagtat 13197683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 26322117 - 26322331
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  26322117 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 26322215  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  26322216 ataggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 26322315  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  26322316 gggacggaggtagtat 26322331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 40788914 - 40789125
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  40788914 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 40789010  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  40789011 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataatta 40789110  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  40789111 gggacggaggtagta 40789125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1943784 - 1943620
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  1943784 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 1943686  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  1943685 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagagac 1943620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8782679 - 8782463
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  8782679 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 8782581  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| | |||||||||||||  ||        ||||||||| | | |||||||||    
T  8782580 atatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaaggttcttataatta 8782481  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    | ||||||||||||||||    
T  8782480 gagacggaggtagtataa 8782463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 11865111 - 11865279
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  11865111 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataa 11865210  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  11865211 ataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagac 11865279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16669836 - 16669676
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||     
T  16669836 actattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaatg 16669738  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16669737 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaag 16669676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20252420 - 20252208
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  20252420 actattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 20252322  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  20252321 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagtgacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattaggg 20252222  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  20252221 acggagggagtata 20252208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18375405 - 18375242
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  18375405 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgagtgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 18375307  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  18375306 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgtaaatagcaaatgagtcttataaaaag 18375242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37229650 - 37229447
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||||||||||    
T  37229650 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatatataataaata 37229552  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  37229551 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaagaaattctcaaaatggtcttataattaggg 37229452  T
Q  204 acgga 208  Q
    |||||    
T  37229451 acgga 37229447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 8716719 - 8716929
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8716719 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8716817  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  8716818 ggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 8716917  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  8716918 acggagggagta 8716929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 1143082 - 1143295
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  1143082 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataa 1143180  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   ||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||| ||    
T  1143181 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaggatcttataacta 1143280  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | |||||||||||||    
T  1143281 gagacggaggtagta 1143295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 34062492 - 34062705
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||||||    
T  34062492 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaag-aaaaagatgtataataaata 34062590  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  34062591 ggggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 34062690  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  34062691 acggagggagtataa 34062705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25624939 - 25624732
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  25624939 actattgtttttacaattttatcctttaagaaag---gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 25624844  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  25624843 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 25624745  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  25624744 acggagggagtat 25624732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41450726 - 41450514
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  41450726 actattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 41450628  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  41450627 ggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 41450528  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  41450527 acggagggagtata 41450514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 45474525 - 45474369
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  45474525 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 45474427  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataa 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||    
T  45474426 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataa 45474369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5664848 - 5664637
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  5664848 actattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 5664750  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  5664749 ggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 5664650  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  5664649 acggagggagtat 5664637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 16805619 - 16805829
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  16805619 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 16805716  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16805717 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 16805816  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  16805817 acggagggagtat 16805829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19318879 - 19319042
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||        ||||||||||    
T  19318879 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaag-aaaaagatgtataataa 19318977  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19318978 atagggacgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 19319042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6007785 - 6007652
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  6007785 attactattgtttttacaattttatccttcaagagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa-aaaaaaaatgtataataa 6007687  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6007686 ataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtag 6007652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8912700 - 8912911
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  8912700 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 8912796  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  8912797 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 8912896  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  8912897 gggacggaggtagta 8912911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25523712 - 25523497
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  25523712 attactattgtttttacaatttaatcctttaagagag--ggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaaaatgtataataa 25523616  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttc-tcaaaaagattttataatt 199  Q
    || || | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||        ||| |||||| | | ||||||||    
T  25523615 attggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaagagacaattttttttcttcaaaatggtcttataatt 25523516  T
Q  200 agggacggaggtagtataa 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  25523515 aggaacggaggtagtataa 25523497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34113742 - 34113528
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  34113742 attactattgtttttacaattttatcctttaagagataat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataa 34113646  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  34113645 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 34113546  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    |||||||| | |||||||    
T  34113545 gggacggatggagtataa 34113528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2060529 - 2060316
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||    
T  2060529 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagat--tataataa 2060432  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||         ||||||||| | | ||||||||    
T  2060431 atatgggaatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattataaaaagggacaaattttttttctcaaaagggtcttataatt 2060332  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  2060331 agggacggaggtagta 2060316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2200192 - 2199976
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | |||    
T  2200192 attactattatttttacaattttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtacagtaa 2200094  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaa-gattttataatt 199  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||        ||| |||||| | | ||||||||    
T  2200093 atagggtcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattcacaaaaagggtcttataatt 2199994  T
Q  200 agggacggaggtagtata 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2199993 agggacggaggtagtata 2199976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 20727685 - 20727845
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  20727685 actattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 20727783  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  20727784 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 20727845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7666491 - 7666328
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||| |||||    
T  7666491 attactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaaggttggtatatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtacaataa 7666393  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  7666392 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgcgtcttataaaaag 7666328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15227975 - 15228187
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  15227975 attactattgtttttacaattttatccttcgagagagaat--tggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataa 15228071  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  15228072 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 15228171  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  15228172 gggacggagggagtat 15228187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28840851 - 28840688
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  28840851 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaag-aaaaagatgtataataa 28840753  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  28840752 atagagacatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 28840688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 45628705 - 45628868
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  45628705 attactattgtttttacaattttaccctttaaaaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 45628803  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  45628804 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaag 45628868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1360000 - 1359791
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  1360000 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 1359903  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1359902 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctccaaaggatcttataattaggg 1359803  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  1359802 acggagggagta 1359791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7492053 - 7491844
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  7492053 actattgtttttacaattttatcctt-aagagaaagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaata-tgtataataaata 7491956  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  7491955 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 7491856  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  7491855 acggagggagta 7491844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7933633 - 7933420
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  7933633 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag-aaaaacatgtataataa 7933535  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||  ||||||| ||  || || |||||||| | |||||||||||||||||||        ||  |||||| || |||||||||    
T  7933534 atagaggcatgtatgtaaaacaataattaatacagttggaaatagcaga-tggtcttataaaaagagacaaaaaaaatttacaaaaaaatcttataatta 7933436  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
     |||||||||||||||    
T  7933435 aggacggaggtagtat 7933420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 16844901 - 16845110
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  16844901 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 16844998  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16844999 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 16845097  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  16845098 acggagggagtat 16845110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 39833827 - 39834036
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  39833827 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 39833924  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  39833925 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 39834024  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    || |||| ||||    
T  39834025 actgagggagta 39834036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 41968028 - 41968170
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  41968028 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtataataa 41968126  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  41968127 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 41968170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43701183 - 43701021
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  43701183 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 43701085  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||    
T  43701084 ataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19353404 - 19353191
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  19353404 attattattgtttttacaattttatcctttaagaatgagtgttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataa 19353306  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | |||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  19353305 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 19353206  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | |||||||||||||    
T  19353205 gcgacggaggtagta 19353191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 38121335 - 38121548
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  38121335 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 38121433  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||        |||||||||   | |||| ||||    
T  38121434 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggtaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttattatta 38121533  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  38121534 gggacggaggtagta 38121548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 8841485 - 8841696
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  8841485 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8841582  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||| ||    
T  8841583 ggggcgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaagg 8841682  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  8841683 acggagggagtata 8841696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 15404535 - 15404694
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  15404535 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat-ttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 15404632  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  15404633 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 15404694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 22182749 - 22182910
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||| |    
T  22182749 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 22182845  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  22182846 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 22182910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23465346 - 23465134
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  23465346 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaa-tgtataataa 23465250  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | ||||||||||     
T  23465249 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaatttttttt-tcaaaagggttttataattt 23465151  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  23465150 gggacggaggtagtata 23465134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 1748466 - 1748629
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  1748466 attacaattatttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 1748564  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  1748565 ataagggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaag 1748629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5255746 - 5255584
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  5255746 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 5255648  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  5255647 atagggacatgtatgtaaagaaataa-taatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaag 5255584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 7116126 - 7116336
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||        ||||||||||||    
T  7116126 tactattgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaaga-tgtataataaat 7116223  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||    
T  7116224 agggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttataattagg 7116323  T
Q  203 gacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||    
T  7116324 gacggaggtagta 7116336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7418707 - 7418564
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  7418707 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaatgatgtataataa 7418609  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  7418608 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 7418564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20643693 - 20643481
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  20643693 attagtattctttttacaattttatcttttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 20643597  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||  | |||||||||    
T  20643596 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaacaaaaattctcaaaaaagtgttataatta 20643497  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  20643496 gggacggaggtagtat 20643481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22897600 - 22897390
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  22897600 actattgtttttacaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataataaata 22897503  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22897502 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 22897403  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  22897402 acggagggagtat 22897390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2438434 - 2438225
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  2438434 actattgtttttacaattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 2438337  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  2438336 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 2438237  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  2438236 acggagggagta 2438225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15435701 - 15435913
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  15435701 attactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctaattgaag-aaaaagatgtataataa 15435799  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||||| || |||||||||    
T  15435800 atagggacatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaa-atcttataatta 15435897  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  15435898 gggacagaggtagtat 15435913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 16108303 - 16108512
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  16108303 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 16108400  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||||  || ||||||||||||    
T  16108401 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattaggg 16108500  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  16108501 acggagggagta 16108512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23789178 - 23788969
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  23789178 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 23789081  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||| ||    
T  23789080 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaagg 23788981  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  23788980 acggagggagta 23788969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4711936 - 4711777
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  4711936 actattgtttttacaattttatc-tttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 4711839  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  || |||||||||||    
T  4711838 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggccttataaaaag 4711777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7531814 - 7531653
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  7531814 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatttgt--tttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataa 7531718  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7531717 ataggggcatgcatgtaatgaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaag 7531653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41004154 - 41003946
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||| |    
T  41004154 attaatattgtttttataattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaag-aaaaagatgtataatta 41004058  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  41004057 ataggggcatccatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 41003958  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    || |||||||||    
T  41003957 ggaacggaggta 41003946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 3670317 - 3670447
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  3670317 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 3670415  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3670416 ggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtag 3670447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 11852012 - 11852222
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||| |    
T  11852012 attagtattatttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaagatgtataatta 11852108  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  11852109 ataggggcatgcatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 11852207  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  11852208 gggacggaggtagta 11852222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24345627 - 24345417
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |   ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  24345627 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 24345529  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||| ||| | | ||||||||||||    
T  24345528 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcgaaagggtcttataattaggg 24345429  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||    
T  24345428 acggaggtagta 24345417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 44573710 - 44573920
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||        |||||||| |    
T  44573710 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagat--ggatggtttatgtttt-aacatgttatttattgttaattgaagaaaaaga-tgtataatta 44573805  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  44573806 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 44573904  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
     |||||||||||||||    
T  44573905 aggacggaggtagtat 44573920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17665735 - 17665521
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  17665735 attaatattgtttttacaattttatcttttaagagagag--atgatatatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataatta 17665639  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagaga-cnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| ||          ||||||||||| | ||||||||    
T  17665638 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggataaaagaaaattctcaaaaaggtcttataatt 17665539  T
Q  200 agggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||| |||||||    
T  17665538 agggacggagctagtata 17665521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24974013 - 24973797
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  24974013 attactattgtttttataattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaaga-tgtataataa 24973915  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaaga--ttttataat 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | |||||||||||| |||        |||| |||| ||  || ||||||    
T  24973914 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaatttcttaaaaggatcttatataat 24973815  T
Q  199 tagggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24973814 tagggacggaggtagtat 24973797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 11385994 - 11386155
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||        | |||||| |    
T  11385994 attagtattgtttttacaattttatcctttaagtgagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaag-aaaaaaatatataatta 11386090  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  11386091 atagggacatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttataaaaag 11386155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 29239421 - 29239580
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  29239421 actattgtttttagaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 29239518  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  29239519 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 29239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 18374527 - 18374689
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  18374527 attactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataa 18374624  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||   |||||||||||||    
T  18374625 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttataaaaag 18374689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19034616 - 19034465
Alignment:
Q  11 tttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtat 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||        ||||||||||||||||| ||    
T  19034616 tttttacaattttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcat 19034518  T
Q  111 gtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  19034517 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 17408122 - 17408331
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  17408122 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 17408219  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  17408220 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 17408319  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  17408320 acggagggagta 17408331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10399286 - 10399499
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||| || |||||||        |||||| |||    
T  10399286 attacttttatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattactcattgaagaaaaaga-tgtatagtaa 10399384  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||| | |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  10399385 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaacgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 10399484  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||| ||||||||||    
T  10399485 gggatggaggtagta 10399499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 40173227 - 40173308
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40173227 attactattgtttttacaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 40173308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11201892 - 11201733
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  11201892 actattgtttttacaattttatcctt-aagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 11201795  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  11201794 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaag 11201733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 40680489 - 40680649
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  40680489 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 40680585  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || ||  || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  40680586 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatataattggaaatagcaaa-gggtcttataaaaag 40680649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 16456700 - 16456902
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  16456700 actattgtttttacaattttatcctt-aagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 16456797  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  16456798 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 16456897  T
Q  204 acgga 208  Q
    |||||    
T  16456898 acgga 16456902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 19631018 - 19631156
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  19631018 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 19631115  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  19631116 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 19631156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 19827919 - 19828057
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  19827919 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 19828016  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  19828017 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 19828057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 36021077 - 36021199
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  36021077 actattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcgacatgttatttattgttgattgaag--aaaaaatgtataataaata 36021174  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  36021175 ggggcatgtatgtaaagaaataatt 36021199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27560415 - 27560206
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | || ||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  27560415 actattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagagttaatttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaata-tgtataataaata 27560318  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  27560317 ggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaatttttctcaaaagggtcttataattaggg 27560218  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  27560217 acggagggagta 27560206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Original strand, 9697969 - 9698169
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||  | ||  || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  9697969 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatatttttcatatactacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 9698066  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | || |||||||||    
T  9698067 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttgtaattaggg 9698166  T
Q  204 acg 206  Q
    |||    
T  9698167 acg 9698169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30466338 - 30466257
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30466338 attactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 30466257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38214691 - 38214530
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||| |    
T  38214691 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaagatgtataatta 38214595  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | ||||||||||||    
T  38214594 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaag 38214530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 15917914 - 15918066
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatg 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| ||  | |    
T  15917914 ttttacagttttaccctttaagagagagagttgatttacgttttgaacatgttatttattactgattgaag-aaaaaaatgtataataaataaggacaag 15918012  T
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  15918013 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 15918066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 32712615 - 32712771
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |   ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| ||||||    
T  32712615 tattgattttacaattttatcctttaagagataa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaa-tgtataattaatagg 32712711  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  32712712 gacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 32712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45151949 - 45151798
Alignment:
Q  11 tttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtat 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        | ||||||||||| ||| ||    
T  45151949 tttttacaattttatcctt-aagagagagt--tagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaagatatataataaataagggcat 45151853  T
Q  111 gtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  45151852 gtatgtaaaaatataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 45151798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23083707 - 23083543
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattt--taccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  23083707 actattgtttttacaatttaatattccttaagagagagagagttggtttatgttttccatatcttatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataata 23083609  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23083608 aataggggtatgtatgtaaaaaaattattaatgtagttcgaaatagcaaatgggtcttataaaaag 23083543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 30779825 - 30779951
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  30779825 attacaattgtttttacaaatttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 30779923  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30779924 ataagggcatgtatgtaaagaaataatt 30779951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 34944243 - 34944449
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||     ||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  34944243 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttc-----gttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 34944334  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| || |||||||||||| |||        ||||||||  ||| |||||||||    
T  34944335 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaacagcaaaatgttcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaagggatcttataatta 34944434  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||| |||||    
T  34944435 gggacggagatagta 34944449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 3060445 - 3060585
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||        | ||||||||    
T  3060445 attactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattaaag-aaaaagatatataataa 3060543  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaa 142  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3060544 atatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 3060585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12873175 - 12873040
Alignment:
Q  28 tttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataat 127  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  12873175 tttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagac-gtataatagatagtgatatgtatgtaaagaaataat 12873077  T
Q  128 ttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    | |||||| || ||||| |||   |||||||||||||    
T  12873076 taatgtagttggaaataacaagggggtcttataaaaa 12873040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1859760 - 1859598
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||   | |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||        || |||||||    
T  1859760 attactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaattggtttatattttcaacatcttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgaataataa 1859662  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  1859661 ata-aggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 1859598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42629574 - 42629422
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        ||||||||| |||    
T  42629574 actattgtttttacaattttatcctttaagt--------tagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatatata 42629484  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  42629483 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 42629422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 13336581 - 13336726
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||    
T  13336581 attactattgtttttacaattttatcttttaaaagagagt--tggtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaa-taaaatgatgtataataa 13336677  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  13336678 ataggggcatatatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 13336726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15571396 - 15571236
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||        ||||||||||||    
T  15571396 tactattgtttttatagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaag-aaaaagatgtataataaat 15571299  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||    
T  15571298 aggaacatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaag 15571236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32511186 - 32511069
Alignment:
Q  47 ttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagc 146  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32511186 ttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatacgaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagc 32511088  T
Q  147 aaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  32511087 aaataggtcttataaaaag 32511069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41834620 - 41834452
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||| || |    
T  41834620 attagtattatttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttctacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtatgatta 41834524  T
Q  101 ataggggtatgtatgta---aagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||||||| ||| |||||   || |||||||| |||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41834523 ataggggcatgcatgtatgtaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagagac 41834452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44017864 - 44017791
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  44017864 tgtataataaataggggtatgtaagtaaataaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 44017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8295445 - 8295321
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||| |||| || |||        ||||||||| |||    
T  8295445 tgtataataaatatgggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaagagggacaaaaaaaattctcaaaaggat 8295346  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    
T  8295345 cttataattagggacgaaggtagta 8295321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12620022 - 12619939
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggata--gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12620022 attactattgttttcacaattttgtcctttaagagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag 12619939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 164
Target Start/End: Original strand, 8030889 - 8030992
Alignment:
Q  60 atgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| || ||||||    
T  8030889 atgttatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtgatcttat 8030987  T
Q  160 aaaaa 164  Q
    |||||    
T  8030988 aaaaa 8030992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 9040934 - 9041092
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||    
T  9040934 actattgtttttacaattttatcctt-aagagatatagttagtttatgtttttcatatgttatttattgctgattcaag-aaaaaaatgtataataaata 9041031  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| || ||| |||||||| ||||   ||||||||||||    
T  9041032 ggggcatgtatgtaaaaaaatcattaatatagttgaaaataacaaacgagtcttataaaaa 9041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 29830583 - 29830792
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  | ||||||||||||||||  || |||||  |||| || ||||        |||||| |||||    
T  29830583 actattgtttttacaattttatcatttagagagagatagttagtttatgttttcaatttgctatttgatgcttatcgaagaaaaaga-tgtatagtaaat 29830681  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  ||||||||||||| |||        || |||||||| | |||||||||||    
T  29830682 aggggtatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc-aatgagtcttataaaaagggac--aacaaattttcaaaaaggtcttataattagg 29830778  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||    
T  29830779 gacggaggtagtat 29830792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12360579 - 12360506
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  12360579 tgtataataa-taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaag 12360506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 13215649 - 13215806
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        |||| |||||||| |    
T  13215649 tattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgtaaaataaataag 13215746  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  13215747 ggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaagggtcttataaaaag 13215806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8295521 - 8295460
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatg 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  8295521 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatg 8295460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 10757816 - 10757965
Alignment:
Q  16 acaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtat 114  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        ||||||||||||| | | ||||||    
T  10757816 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataataaataagagcatgtat 10757914  T
Q  115 gtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10757915 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 10757965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5070517 - 5070388
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  5070517 tactattgtttttataattttattctttaagagagatggttggtttatgttttcaaca--ttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaat 5070421  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    |  || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5070420 ataggcatgtatgtaaataaataattaatgtag 5070388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 2788163 - 2788324
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |        |||| |||||    
T  2788163 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgagg--aaaaaatgtaaaataa 2788259  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||| | |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  2788260 ataagggtatgttggcaaagaaataagtaatgtacttggaaataccaaagtggtcttataaaaag 2788324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 15353291 - 15353430
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||     || ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||        | |||||||||||    
T  15353291 actattgtttttacaattttatcgtttaagagagt----taatttattttttcaacatactatttattgttgattgaagaaaaga--tatataataaata 15353384  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15353385 ggggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 15353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30858150 - 30857936
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  30858150 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 30858053  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  30858052 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacatggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 30857953  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    ||||||| |||||||||    
T  30857952 gggacgggggtagtata 30857936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28566363 - 28566151
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||        |  | |||||    
T  28566363 attagtattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaagaaaaagatt-caaaataa 28566266  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| | ||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||  |||||||||||||  ||        ||||||||| | | |||||||||    
T  28566265 ataagagtatgttagtaaataaataattaatgtatttgaaaataccaaatgagtcttataaaaaggaacaattttttttctcaaaagggtcttataatta 28566166  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  28566165 gggacggaggtagta 28566151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30466225 - 30466108
Alignment:
Q  94 ataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagatttt 193  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||         ||||||||| ||| ||    
T  30466225 ataataaataagggcatgtatgaaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag-gaaaaaaaaaattctcaaaaggatctt 30466127  T
Q  194 ataattagggacggaggta 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30466126 ataattagggacggaggta 30466108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41494447 - 41494660
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  41494447 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 41494544  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||   || |||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  41494545 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 41494644  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  41494645 gggacggaggtagtat 41494660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 1422251 - 1422378
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  1422251 actattgtttttacaattttatgctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 1422348  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgta 134  Q
     ||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  1422349 -gggcatgcatgtaaagaaataattaatgta 1422378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 7447034 - 7446945
Alignment:
Q  45 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  7447034 gtttatgttttcaacatattatttattgcagattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataagtaatgtag 7446945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 11083514 - 11083591
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  11083514 ctattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttaatgtatattttcagcatagtatttaatgctgattgaag 11083591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 31633672 - 31633752
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  31633672 attactattgtttttacaattttgtcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 31633752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 8867794 - 8867717
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  8867794 attactattatttttacgattttatcctttaagagagag----agtttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaag 8867717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 16809044 - 16809201
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||         |||||| ||||||    
T  16809044 actattgtttttacaattttatcttttaa-agagagagttagtttatattttcaaaatgtaatttaatgccgattgaa--aaaaagatgtatattaaata 16809140  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    | |  ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16809141 gagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16809201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 16848325 - 16848482
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||         |||||| ||||||    
T  16848325 actattgtttttacaattttatcttttaa-agagagagttagtttatattttcaaaatgtaatttaatgccgattgaa--aaaaagatgtatattaaata 16848421  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    | |  ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16848422 gagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16848482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 18970554 - 18970632
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  18970554 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattga 18970632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41422724 - 41422510
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  41422724 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagaatttatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 41422627  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||   || |||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  41422626 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 41422527  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  41422526 gggacggaggtagtata 41422510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43700833 - 43700750
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttta-agagagag-ggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  43700833 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 43700750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9701282 - 9701069
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||   || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  9701282 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagatagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaat-tgcaaaataa 9701185  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  9701184 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 9701085  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
     |||||||||||||||    
T  9701084 aggacggaggtagtat 9701069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 18223727 - 18223873
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||         ||||||||||| |    
T  18223727 actattgtttttacaattttatcatttaagagagttagttagtttatgttttcaaagtgatatttattgttgattgaaagaaaaagatgtataataaaaa 18223826  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaat 150  Q
     |||||| || ||||| |||||||| || ||| || ||||| |||||    
T  18223827 tgggtatataagtaaataaataattaatatagttggaaataacaaat 18223873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29830970 - 29830813
Alignment:
Q  11 tttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtat 110  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||        |||||||||||||  |||||    
T  29830970 tttttacaattttatcatttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgttgacggtag--aaaaaatgtataataaataaaggtat 29830873  T
Q  111 gtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaa-attggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||| | |||||| |||    ||||||||||||||||||    
T  29830872 gtaagtaaaaaaataattaatgtagtttaaaataacaaggggggtcttataaaaagagac 29830813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Original strand, 44436752 - 44436858
Alignment:
Q  109 atgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacgga 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  44436752 atgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaattttctcaaaagggtcttatcattagggacgga 44436851  T
Q  209 ggtagta 215  Q
    |||||||    
T  44436852 ggtagta 44436858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3095511 - 3095431
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  3095511 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 3095431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Original strand, 12296255 - 12296311
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  12296255 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagagagttagtatatgttttcaa 12296311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6028552 - 6028474
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6028552 tactattgtttttataattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 6028474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 149
Target Start/End: Original strand, 6650985 - 6651127
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||||||   |||  |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||        ||||||||||||||     
T  6650985 tattgtttttacaattttatcattcaaaagagagaattagagtatgttttcaacgtgttatttattgttgattg-aggaaaaaaatgtataataaataga 6651083  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    | ||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  6651084 gatatatacgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcaaa 6651127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12969630 - 12969520
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttat 195  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||        ||||||||| |||  |||    
T  12969630 aataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatatatttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagagacaaaataatttctcaaaaggatcctat 12969531  T
Q  196 aattagggacg 206  Q
    |||||||||||    
T  12969530 aattagggacg 12969520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 16807086 - 16807124
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagag 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16807086 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 16807124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 16846367 - 16846405
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagag 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16846367 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 16846405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 44436312 - 44436390
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||    
T  44436312 actattgtttttacaaatttatcttttaagaaagagagttagtttatgttttcaagatactatatattgttgattgaag 44436390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 4408602 - 4408682
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4408602 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 4408682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21838828 - 21838748
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  21838828 attactattgtttttacaatttta-tctttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 21838748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 165
Target Start/End: Original strand, 24300281 - 24300338
Alignment:
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  24300281 tatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 24300338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 30830168 - 30830248
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  30830168 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 30830248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 34432026 - 34432106
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  34432026 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagggagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 34432106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 36750709 - 36750921
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  36750709 attacaattttttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 36750806  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
     || ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  36750807 ttaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 36750906  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  36750907 gggacggaagtagta 36750921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6027654 - 6027614
Alignment:
Q  179 tctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtataag 219  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027654 tctcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtataag 6027614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 40544538 - 40544463
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgat 77  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40544538 attactattgtttttataattttatccttaaa-agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgat 40544463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 16636447 - 16636485
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagag 39  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16636447 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag 16636485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3904659 - 3904578
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| | |  ||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  3904659 attactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Original strand, 4897661 - 4897734
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  4897661 aataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaagagac 4897734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Original strand, 4945055 - 4945128
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  4945055 aataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaagagac 4945128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 11944463 - 11944543
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||   || || |||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  11944463 attactattgtttttacaatttta-tctttaagagaaagaattaattcatgttttcaacataatatttatcgttgattgaag 11944543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Original strand, 12296347 - 12296420
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  12296347 aataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaatatcaaagatgtcttataaaaagagac 12296420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 26273384 - 26273461
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||  |||||  |||||| || |||||||||    
T  26273384 ctattgttattacaattttatcctttaagagagatgattagtgtatgtttctaacatcatatttaatgttgattgaag 26273461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11121197 - 11121137
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 61  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| | | || ||||||||||||||    
T  11121197 attactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacat 11121137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 147)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 5783971 - 5784188
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttt-aagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||    
T  5783971 attactattgtttttacaattttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataata 5784069  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||||||| ||||||||    
T  5784070 aataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataatt 5784169  T
Q  200 agggacggaggtagtataa 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5784170 agggacggaggtagtataa 5784188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 29806047 - 29806260
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  29806047 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtataataa 29806145  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | |||||||||||    
T  29806146 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggttttataatta 29806244  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  29806245 gggacggaggtagtat 29806260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34490727 - 34490516
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  34490727 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 34490629  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34490628 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattaggg 34490529  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  34490528 acggagggagtat 34490516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 50922 - 51132
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  50922 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 51020  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  51021 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 51120  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  51121 acggagggagta 51132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14699662 - 14699452
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  14699662 actattgtttttacaattttatcgtttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 14699564  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14699563 agggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 14699464  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  14699463 acggaggaagta 14699452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 44748287 - 44748501
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  44748287 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 44748385  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||        |||||||||  || |||||||||    
T  44748386 ataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataatta 44748485  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  44748486 gggacggaggtagtat 44748501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5162517 - 5162304
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  5162517 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 5162419  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  5162418 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 5162319  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  5162318 gggacggaggtagta 5162304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8072953 - 8073166
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  8072953 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 8073051  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||         |||||||| | | |||||| ||    
T  8073052 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacagatcttataaaaagggacaaatttttctctcaaaagggtcttataacta 8073151  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  8073152 gggacggaggtagta 8073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 18111801 - 18112014
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  18111801 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataa 18111897  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||  ||||| | | |||||||||    
T  18111898 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataatta 18111997  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  18111998 gggacggaggtagtata 18112014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44580701 - 44580913
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-nnnnnnnntgtataata 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         |||||||||    
T  44580701 attactattatttttacaattttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataata 44580800  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||    
T  44580801 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaaggtcttataatt 44580900  T
Q  200 agggacggaggta 212  Q
    |||||||||||||    
T  44580901 agggacggaggta 44580913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 8251760 - 8251971
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8251760 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8251858  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  8251859 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 8251958  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  8251959 acggagggagtat 8251971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 8948178 - 8948381
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8948178 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8948276  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  8948277 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 8948376  T
Q  204 acgga 208  Q
    |||||    
T  8948377 acgga 8948381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28579849 - 28579638
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  28579849 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 28579751  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  28579750 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 28579651  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  28579650 acggagggagtat 28579638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 32675584 - 32675795
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  32675584 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 32675682  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  32675683 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattaggg 32675782  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  32675783 acggagggagtat 32675795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 257362 - 257524
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  257362 attactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaatatgtataataa 257460  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  257461 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 658558 - 658396
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  658558 attactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaatatgtataataa 658460  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  658459 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 844294 - 844132
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  844294 attactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaatatgtataataa 844196  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  844195 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33980675 - 33980464
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  33980675 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 33980579  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||        ||||||||||  | |||||||||    
T  33980578 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac-aaaaaatttctcaaaaaagtcttataatta 33980480  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  33980479 gggacggaggtagtat 33980464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23487275 - 23487061
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  23487275 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 23487179  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  23487178 atagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 23487079  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23487078 gggacggaggtagtataa 23487061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40785103 - 40784890
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||        ||||||||||    
T  40785103 attactattgcttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 40785005  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||        ||||||||||| | |||||||||    
T  40785004 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaaggtcttataatta 40784906  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  40784905 gggacggaggtagtat 40784890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 23687990 - 23688151
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  23687990 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 23688086  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  23688087 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 23688151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Original strand, 38183393 - 38183549
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  38183393 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 38183491  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataa 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  38183492 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataa 38183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4076382 - 4076171
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  4076382 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaata 4076284  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||| |||        ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4076283 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtattataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggattttataattaggg 4076184  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||| ||| |||||    
T  4076183 acgaaggaagtat 4076171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13154137 - 13153927
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  13154137 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 13154040  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  13154039 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 13153940  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  13153939 acggagggagtat 13153927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29598434 - 29598223
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  29598434 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 29598336  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||| |    
T  29598335 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaatgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagag 29598236  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  29598235 acggagggagtat 29598223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 35504407 - 35504566
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  35504407 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 35504505  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  35504506 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1774552 - 1774342
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  1774552 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 1774454  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  1774453 ggggcatgtatgtaaagaaatcattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 1774354  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  1774353 acggagggagta 1774342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 8951255 - 8951465
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8951255 actattgtttttccaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8951353  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  8951354 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 8951453  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  8951454 acggagggagta 8951465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 9035365 - 9035576
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  9035365 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 9035461  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||        ||||||||| | | |||||||||    
T  9035462 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaagacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataatta 9035561  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  9035562 gggacggagggagta 9035576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18455930 - 18455720
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  18455930 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 18455832  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||| |||| | | ||||||||||||    
T  18455831 ggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattaggg 18455732  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  18455731 acggagggagta 18455720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18754355 - 18754141
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  18754355 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 18754257  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag-ctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||    
T  18754256 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagg 18754157  T
Q  203 gacggaggtagtataa 218  Q
    |||||||| |||||||    
T  18754156 gacggagggagtataa 18754141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 28192002 - 28192212
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  28192002 actattgtttatacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 28192100  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  28192101 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 28192200  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  28192201 acggagggagta 28192212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38878931 - 38878721
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  38878931 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 38878833  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||| |    
T  38878832 ggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagag 38878733  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  38878732 acggagggagta 38878721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39406772 - 39406562
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  39406772 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaaga-tgtataataa 39406674  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||||| | |||||||||    
T  39406673 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttatcaaaaaggtcttataatta 39406574  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
     |||||||||||    
T  39406573 aggacggaggta 39406562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 2152067 - 2152279
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||        ||||||||||||    
T  2152067 tactattgtttttacagttttatcgtt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaaga-tgtataataaat 2152164  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||    
T  2152165 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagg 2152264  T
Q  203 gacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||    
T  2152265 gacggaggtagtata 2152279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26016780 - 26016565
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  26016780 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga---attgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataata 26016685  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | ||||||||    
T  26016684 aataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagcggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataatt 26016585  T
Q  200 agggacggaggtagtataag 219  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  26016584 agggacggagggagtataag 26016565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 26980800 - 26980963
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        ||||||||||    
T  26980800 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgatcgaag-aaaaagatgtataataa 26980898  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  26980899 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaag 26980963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44021219 - 44021056
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  44021219 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaatatctataataa 44021121  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  44021120 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaag 44021056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 2944098 - 2944309
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  2944098 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatatataataa 2944194  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  2944195 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 2944294  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  2944295 gggacggagggagta 2944309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 32522669 - 32522880
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  32522669 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagt--tggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 32522765  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  32522766 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 32522865  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | |||||||||||||    
T  32522866 gcgacggaggtagta 32522880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 36176930 - 36177140
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  36176930 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 36177028  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||||   | ||||||||||||    
T  36177029 agggcatctatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggg 36177128  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  36177129 acggagggagta 36177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40741474 - 40741265
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  40741474 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 40741377  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  40741376 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattaggg 40741277  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  40741276 acggagggagta 40741265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41014714 - 41014504
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  41014714 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 41014616  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||  ||         |||||||||||| ||||||||||||    
T  41014615 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaaatctcaaaaagatcttataattaggg 41014516  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  41014515 acggagggagta 41014504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12825159 - 12825003
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||| ||||    
T  12825159 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaag-aaaaatatgtat-ataa 12825062  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttat 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  12825061 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaatgatcttat 12825003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5774262 - 5774047
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||      
T  5774262 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatgg 5774164  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||        |||||||||   | ||||||||    
T  5774163 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataatt 5774064  T
Q  200 agggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  5774063 agggacggaggtagtat 5774047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 11482944 - 11483107
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  11482944 attactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaga-tgtataataa 11483042  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11483043 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagtggtcttataaaaag 11483107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 42598543 - 42598753
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  42598543 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaacgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-gaaaagatgtataataaata 42598641  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  42598642 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtctaataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagag 42598740  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||| ||| |||||    
T  42598741 acgaagggagtat 42598753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8566414 - 8566255
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  8566414 attactattgtttttacaattttatcctttatgagagagt--tggtttatgttttcaacatgtcatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 8566318  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  8566317 ataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8566255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 8797121 - 8797334
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||    
T  8797121 attactattgtttttacaattatatcctttaagagagagggttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 8797219  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||  || ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  8797220 atatcggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 8797319  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
     ||||||| ||||||    
T  8797320 aggacggaagtagta 8797334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 33745724 - 33745932
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  33745724 actattgtttttacaattttatcctttgagaaaaaggt-tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 33745821  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||||     
T  33745822 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataattagga 33745920  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  33745921 acggagggagta 33745932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 4631381 - 4631540
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  4631381 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 4631478  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4631479 ggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 4631540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 16117278 - 16117422
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  16117278 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 16117376  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  16117377 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 16117422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 16125537 - 16125681
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  16125537 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 16125635  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  16125636 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 16125681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 36661753 - 36661913
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||| |    
T  36661753 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaaca 36661851  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  36661852 ggggcatgtatataaagaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 36661913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34568700 - 34568489
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||| |    
T  34568700 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttattttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaaca 34568602  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  34568601 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 34568502  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  34568501 acggagggagtat 34568489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38967356 - 38967193
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  38967356 attattattgtttttacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataa 38967258  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  38967257 atagggatatgtatgtaaagaaataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaag 38967193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11798814 - 11798605
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  11798814 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 11798717  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  11798716 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 11798617  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    || |||| ||||    
T  11798616 acagagggagta 11798605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39029388 - 39029178
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  39029388 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--attagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 39029292  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  39029291 ataggggcatgcatgtaaagaaat-attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaattttctcaaaagggtcttataatta 39029193  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  39029192 gggacggagggagta 39029178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 7682862 - 7683022
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||    
T  7682862 attactattgtttttacaattttatcctttaa-agagataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaata-tgtataataa 7682959  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  7682960 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25058253 - 25058039
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||        ||||||||||    
T  25058253 attactattgtttttacaattttatcctttaagagata--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaag-aaaaagatgtataataa 25058157  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||| |||||||||  |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  25058156 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggttttataaaaaaggacaaaaaaaattttcaaaatgatcttataatta 25058057  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  25058056 gggatggaagtagtataa 25058039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44888889 - 44888680
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        ||| ||||||||||    
T  44888889 ctattatttttacaattttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaag-aaagagctgtgtaataaatag 44888791  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggga 204  Q
    ||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||||||    
T  44888790 ggtcatgtatgaaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattaggga 44888691  T
Q  205 cggaggtagta 215  Q
    |||||||||||    
T  44888690 cggaggtagta 44888680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 7683388 - 7683550
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||         ||||||||||    
T  7683388 attactattgtttttacaattttatcctttaa-agagagaattggtttatgttttcaacatgttatatatcgctgattgaa-aaaaaagatgtataataa 7683485  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  7683486 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 7683550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16999207 - 16999047
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  16999207 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatcttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 16999109  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||| || ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  16999108 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaataacaaaaggatcttataaaaag 16999047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 28864335 - 28864494
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  28864335 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 28864432  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  28864433 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 28864494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 29321122 - 29321333
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||        ||||| |||||||    
T  29321122 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctaattgaagaaaaaga-tgtatgataaata 29321219  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  29321220 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggg 29321319  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    | ||||||||||||    
T  29321320 atggaggtagtata 29321333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 18641201 - 18641364
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  18641201 attactattgtttttataattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttaaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 18641299  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  18641300 atagggttatgtatgtaaagaaataattaatttagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaag 18641364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12255304 - 12255096
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  12255304 actattgtttttacaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 12255207  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  12255206 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctc-aaaggatcttataattaggg 12255108  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  12255107 acggagggagta 12255096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12260847 - 12260639
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  12260847 actattgtttttacaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 12260750  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  12260749 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctc-aaaggatcttataattaggg 12260651  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  12260650 acggagggagta 12260639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5951318 - 5951168
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||||| |||    
T  5951318 ttttacaattttatcctttaagaggtag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataattaataggggcatg 5951222  T
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5951221 tatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 5951168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 16448577 - 16448740
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  16448577 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaa-aaaaaagatgtataataa 16448675  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  16448676 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 16448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31886882 - 31886717
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||    
T  31886882 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagt--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtatgataa 31886786  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |  |||||| |||||||||    
T  31886785 atagaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaataatcttatgaaaagagac 31886717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33865367 - 33865572
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  33865367 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagatag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 33865463  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  33865464 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 33865563  T
Q  201 gggacggag 209  Q
    |||||||||    
T  33865564 gggacggag 33865572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 35143346 - 35143507
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  35143346 attactattgtttttacaattttgtcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttttttattggtgattgaag-aaaaaaatgtataataa 35143442  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  35143443 ataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaataagtcttataaaaag 35143507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5593628 - 5593470
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||        |||||||||||||    
T  5593628 actattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaata-tgtataataaata 5593531  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  5593530 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 5593470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 45283614 - 45283777
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  45283614 attattattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 45283712  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  ||||||||||| | |||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  45283713 atagggacatgtatgtaaaaagataattaatgtagttggaaataacaaagatgtcttataaaaag 45283777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24992728 - 24992566
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  24992728 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 24992630  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||    
T  24992629 ataggagcatgaatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 24992566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 32475057 - 32475267
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  32475057 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga---attgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataata 32475152  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||    | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||| ||||| | | ||||||||    
T  32475153 aataggg----gcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcccaaaagggtcttataatt 32475248  T
Q  200 agggacggaggtagtataa 218  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  32475249 agggacagagggagtataa 32475267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 36245743 - 36245900
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||    
T  36245743 attgtttttacaattttctcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggg 36245840  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaa-taatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36245841 gcatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatcttataaaaag 36245900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 42985340 - 42985501
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||        |||||||| |    
T  42985340 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttaattgaag-aaaaagatgtataat-a 42985437  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  42985438 atatagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagagtcttataaaaa 42985501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44747260 - 44747095
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  44747260 attactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaa-tgtataataa 44747162  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagaga 168  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  44747161 atagggc-atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagaga 44747095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4778802 - 4778591
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||| |    
T  4778802 attactattgtttttacagttttatccattaagagagagggttggtttat-ttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtataat-a 4778706  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||  |||||||| ||||  ||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  4778705 ataggggcatatatgtaaagaattaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttatagaaaggaacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 4778606  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | ||||||| |||||    
T  4778605 gagacggagatagta 4778591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30140295 - 30140214
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30140295 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag 30140214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45260431 - 45260274
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||| |    
T  45260431 tattgtttttacaattttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaag-aaagagctgtataataaataag 45260333  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||    
T  45260332 gtcatgtatggaaataaataattaatgtagttgaaaatagcaaatagattttataaaaa 45260274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29279405 - 29279246
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||        |||||||||||||    
T  29279405 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaattgaagaaaaaga-tgtataataaata 29279308  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  29279307 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaag 29279246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 38780966 - 38781181
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  38780966 attactattatttttataattt-atcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 38781063  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| | || |||||| |||  ||||||||||| || |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  38781064 ataagggcatgtatgtaaagaaataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaagagggacagaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 38781163  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
     |||||||||||||||||    
T  38781164 tggacggaggtagtataa 38781181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 43654031 - 43654241
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||        |||||||||||||    
T  43654031 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtag-aaaaatatgtataataaata 43654128  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||   ||||||||||||| |||        |||||||||   | ||||||||||||    
T  43654129 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaagatgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggg 43654228  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  43654229 acggagggagtat 43654241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44502828 - 44502620
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttacccttta---agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  44502828 ttgtttttacaattttatccttaagagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaatag 44502730  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggga 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||         |||||||| ||| |||||||||||||    
T  44502729 gggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaa-tctcaaaaggatcttataattaggga 44502631  T
Q  205 cggaggtagta 215  Q
    |||||| ||||    
T  44502630 cggagggagta 44502620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 44250949 - 44251158
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||        ||||||||||||||    
T  44250949 tattatttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaaga-tgtataataaatag 44251047  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggga 204  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||||    
T  44251048 ggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaggga 44251147  T
Q  205 cggaggtagta 215  Q
    |||||| ||||    
T  44251148 cggagggagta 44251158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45425242 - 45425085
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  45425242 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagt--taatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaata-tgtataataaata 45425147  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45425146 aggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaaag 45425085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 17856605 - 17856764
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  17856605 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 17856702  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||  ||||||||||||||    
T  17856703 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaag 17856764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 41616123 - 41615972
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagg---gatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtata 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||    
T  41616123 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagatgtttgatttatttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaaga-tgtata 41616025  T
Q  97 ataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||    
T  41616024 ataaacaggggcatgtatgtaaagatataattaatgtagttgaaaataacaaa 41615972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 42218174 - 42218330
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||   ||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  42218174 actattgtttttacaattttatctttta---gagagagttagtttatgtcttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 42218269  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  | |||||||||||    
T  42218270 ggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaa 42218330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 5268171 - 5268035
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatg 111  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||   || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||        ||||||||||||||||| |||    
T  5268171 ttttacaaatttatcctttatgagagagaattaatttatgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatg 5268073  T
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  5268072 tatgtaaagaaataattaatgtagttgaaagtagcaaa 5268035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 21652311 - 21652387
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21652311 tattgtttttaccattttatcctttaaaagagagggttagtttatgttttcaacataatatttattgctgattgaag 21652387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21137063 - 21136905
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||        |||||||||||||||    
T  21137063 tattatttttccaattttatcatttaagagatagagttaatttatgttttcaacatgttatttattattcattgaagaaaaaaa-tgtataataaatagg 21136965  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     ||||||| ||||||||||| || |||||  || |||||||||||  |||||||||||||    
T  21136964 agtatgtaagtaaagaaatagttgatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 21136905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 31089750 - 31089825
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31089750 ctattgtttttacaattttatcctttaagagagagt--tagtttatgttttcaacatgctatttattactgattgaag 31089825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Original strand, 44580922 - 44581024
Alignment:
Q  46 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||     
T  44580922 tttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaa-tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataa 44581020  T
Q  146 caaa 149  Q
    ||||    
T  44581021 caaa 44581024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5110093 - 5109931
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||         || | |||||    
T  5110093 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttatagttgattgaa-aaaaaagatgcaaaataa 5109996  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5109995 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgggtcttataaaaag 5109931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 26990680 - 26990816
Alignment:
Q  29 ttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26990680 ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 26990778  T
Q  129 tatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaaga 166  Q
     |||||  || ||||| ||||   ||||||||||||||    
T  26990779 aatgtatttggaaataacaaacgcgtcttataaaaaga 26990816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 110285 - 110203
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagag--ggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  110285 attactattgtttttacaatcttatcctttaagagagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattggtgattgaa 110203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40529430 - 40529304
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||  |||        ||||||||| |||    
T  40529430 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaaggac-aaaaaaattctcaaaaggat 40529332  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40529331 cttataattagggacggagggagtataa 40529304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36786679 - 36786599
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  36786679 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 36786599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Original strand, 7758822 - 7758946
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        |||||||||   |    
T  7758822 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaagtgt 7758921  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  7758922 cttataattagggacggagggagta 7758946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 14583963 - 14584169
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||    | |||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||        | ||||||||| ||||    
T  14583963 attgtttttacaattttatcctt-aagagagaaaatttgtttatgtttttcatatgttatttattggtaattgaagaaaaga--tatataataaacaggg 14584059  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacg 206  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||| |||    
T  14584060 gcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacg 14584159  T
Q  207 gaggtagtat 216  Q
    ||||||||||    
T  14584160 gaggtagtat 14584169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36941480 - 36941319
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | ||||    
T  36941480 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagag-tagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaata 36941385  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  36941384 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatagatcttataaaaag 36941319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42885178 - 42885054
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | |    
T  42885178 tgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggt 42885079  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  42885078 cttataattagggacggagggagta 42885054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17336629 - 17336468
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  17336629 attactattgtttt-acaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 17336533  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  17336532 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatacaaaaaaggtcttataaaaag 17336468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28965628 - 28965509
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | |    
T  28965628 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggt 28965529  T
Q  191 tttataattagggacggagg 210  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  28965528 tttataattatggacggagg 28965509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35203048 - 35202970
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35203048 attattattgtttttacaattttatccttta---gagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 35202970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11293865 - 11293785
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11293865 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 11293785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 25056725 - 25056890
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||||||  || ||||   |||||||||        ||||||||||    
T  25056725 attattattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttcaacatacta-ttat---tgattgaagaaaaaaaatgtataataa 25056820  T
Q  101 ata-ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  25056821 atagggggtatataggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacatatcattctaataaaaagagac 25056890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 39970175 - 39970100
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  39970175 attgtttttacaattgtatcctttaaaagagagggttagtgtatgttttcaatataatatttactgctgattgaag 39970100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12802820 - 12802742
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  12802820 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagt--taatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 12802742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23995788 - 23995580
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  23995788 attactgttgtttttacaattttatccttga-gagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaataa 23995692  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | |||||||||||    
T  23995691 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggttttataatta 23995592  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||    
T  23995591 gggacggaggta 23995580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 43292823 - 43292901
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  43292823 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 43292901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13141669 - 13141592
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  13141669 attactattgtttttacaattttatc-tttaagagagag--ataatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaa 13141592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23497942 - 23497774
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattg-aagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||         || | ||||    
T  23497942 attattattgtttttccaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaagaaaaagatgcaaaata 23497844  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  23497843 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttataaataccaaaagggtcttataaaaagagac 23497774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 19700841 - 19700913
Alignment:
Q  9 tgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||  |||||| || ||||||||    
T  19700841 tgtttttacaattttatcctttaagagaaagggttagtgtatgttttgaacataatatttaatgttgattgaa 19700913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 42747421 - 42747361
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  42747421 attactattttttttacaattttattctttaagagagagggttggtttatattttcaacat 42747361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 14548516 - 14548674
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || |||||  | |  |||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  14548516 actattgtgtttacaattttatccttaaa-agagatagtttatttatggtttccatatgctatttattgctgattgaagaccaata-tgtataataaata 14548613  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    | || ||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  14548614 gaggcatgtatgtacataaataattaatatagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaa 14548674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26626005 - 26625927
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  26626005 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattga 26625927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 44165294 - 44165372
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  44165294 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattga 44165372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 23894733 - 23894811
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23894733 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagt--taatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 23894811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35179812 - 35179651
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||   || ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||        || | |||||    
T  35179812 attaatattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaag-aaaaaggtgcaaaataa 35179715  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  35179714 ataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaa 35179651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 5244452 - 5244532
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  5244452 attactattgtttttagaattttatcctt-aagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 5244532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11113991 - 11113911
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  11113991 actattgtttttactattttatcctttaagagatagagagttgttttatgtttttaacatgatatttatcgctgattgaag 11113911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Original strand, 17851361 - 17851434
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| || |||||| |||   ||||||||||||    
T  17851361 tgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatatagttggaaatagtaaaagagtcttataaaaa 17851434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36409808 - 36409728
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   || |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||    
T  36409808 attactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagaattaatttatgtttttaatatgatatttattgttgattgaag 36409728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14625740 - 14625680
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 61  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | | |||||||||||||||    
T  14625740 attattattgtttttacaattttatcctttaagaaagaggattggcttatgttttcaacat 14625680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 15021187 - 15021263
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||  | |||| || |||||||||    
T  15021187 tattgtttttacaattttaacctttaagagagatgattagtgtatgttttgaacataatctttaatgttgattgaag 15021263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 28965679 - 28965643
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagag 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28965679 attactattgtttttacaattttatcctttaagagag 28965643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30512977 - 30512816
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    |||||| | |||||| ||||||||||||  |||||| || | |||||||        | || |||||    
T  30512977 attactattgtttttacaattttatcctt----agagagagctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaag-aaaaagatataaaataa 30512883  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaa-taatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaaga 166  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  30512882 ataggggtatgttggtaaaaaaattaattaatgtacttgaaaataccaaaggggtcttataaaaaga 30512816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35203170 - 35203134
Alignment:
Q  46 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35203170 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 35203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Original strand, 9615956 - 9616070
Alignment:
Q  49 atgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaa 148  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |  |||||| ||    
T  9615956 atgttttacacatgttatatattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggtatgtagttaaagaaataattaacgtagtttgaaatag-aa 9616053  T
Q  149 attggtcttataaaaag 165  Q
    ||  |||||||||||||    
T  9616054 atgagtcttataaaaag 9616070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 13568737 - 13568891
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |  | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||        |||||||||||||    
T  13568737 actattgtttttacaattttatcctt-aagagaaagagtga-tttatgttttccatatgctatttattgttgatggaagaaaaaga-tgtataataaata 13568833  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||||    |||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  13568834 ggggcatgtatgtaaag----aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 13568891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19176255 - 19176136
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttat 195  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        | ||||||| | | ||||    
T  19176255 aataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaattactcaaaagggtcttat 19176156  T
Q  196 aattagggacggaggtagta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  19176155 aattaaggacggaggtagta 19176136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 216
Target Start/End: Original strand, 36131251 - 36131289
Alignment:
Q  178 ttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtat 216  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36131251 ttctcgaaaagatcttataattagggacggaggtagtat 36131289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 40856009 - 40855928
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatg-ttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||| | || | |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  40856009 attattattgtttttacaatttta-tctttaagataaagagttagtttatgttttccatatgtttatttattgttgattgaag 40855928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 41388573 - 41388631
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatg 62  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  | || |||||||||||||||||    
T  41388573 actattatttttacaattttatcctttaagagatatagctaatttatgttttcaacatg 41388631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42220581 - 42220523
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  42220581 tgtataataaatagaagtatgtatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaa 42220523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 7758759 - 7758808
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttca 57  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  7758759 ttgtttttacgattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 7758808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16893885 - 16893816
Alignment:
Q  13 tttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  | |||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  16893885 tttacaattttatcttttaagagagaaagttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaag 16893816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 24260778 - 24260859
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  24260778 attactattgcttttacaattctatcctttaaaagagagaattagtgtatgttttcaagatagtatttaatactgattgaag 24260859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 42885380 - 42885315
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccct-ttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttattt 68  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  42885380 actattgtttttacaattttatcttcttaagaaagaacgttagtttatgttttcaatatgttattt 42885315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2767800 - 2767764
Alignment:
Q  46 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2767800 tttatgttttcaacatgttatttatttttgattgaag 2767764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12802648 - 12802608
Alignment:
Q  178 ttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12802648 ttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtataa 12802608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28741067 - 28740988
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | || ||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  28741067 attattattgtttttacaattttatcc-ttaagagcgagagttaatttatattttctatatattatttattgctcattgaa 28740988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 159)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8291113 - 8290901
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8291113 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8291015  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  8291014 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaagggatcttataattaggg 8290915  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  8290914 acggaggaagtata 8290901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4857019 - 4856805
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  4857019 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaagatgtataataa 4856921  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||||||| |||||||||    
T  4856920 ataggggaatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatattataatta 4856821  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4856820 gggacggagatagtat 4856805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 41025923 - 41026133
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  41025923 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 41026021  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  41026022 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 41026121  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  41026122 acggagggagta 41026133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 36697958 - 36698170
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  36697958 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 36698056  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||         ||||||||| | | ||||||||||||    
T  36698057 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagtggtcttataaaaagggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 36698156  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  36698157 acggagggagtata 36698170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 39871440 - 39871651
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  39871440 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 39871538  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  39871539 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggg 39871638  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  39871639 acggagggagtat 39871651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27529439 - 27529229
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  27529439 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 27529343  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  27529342 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaatttttttt-tcaaaaggatcttataatta 27529244  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  27529243 gggacggaggtagta 27529229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31458207 - 31457997
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  31458207 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 31458109  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  31458108 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 31458009  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  31458008 acggaggaagta 31457997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40300440 - 40300230
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  40300440 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 40300342  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||         |||||||| | | ||||||||||||    
T  40300341 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggg 40300242  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  40300241 acggagggagta 40300230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25951045 - 25950830
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-nnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||||    
T  25951045 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataata 25950946  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||    
T  25950945 aatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatatagcaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaaggtcttataatt 25950847  T
Q  200 agggacggaggtagtat 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  25950846 aaggacggaggtagtat 25950830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30895773 - 30895558
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || |||||||    
T  30895773 attactattgtttttacaaatttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgaataataa 30895675  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||         | |||||||||| |||||||||    
T  30895674 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatttcaaaaagatcttataatta 30895575  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  30895574 gggacggaggtagtata 30895558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 32872202 - 32872412
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  32872202 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 32872300  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  32872301 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 32872400  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  32872401 acggagggagta 32872412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39197928 - 39197718
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  39197928 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 39197830  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  39197829 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 39197730  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  39197729 acggagggagta 39197718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2289840 - 2290056
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||    
T  2289840 attactattatatttacaattttatcttttaagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-taaaaagatgtataataa 2289938  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| |||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  2289939 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttagaaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 2290038  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2290039 gggacggaggtagtataa 2290056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 34978904 - 34979117
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  34978904 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 34979002  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||||   | ||||||||||||    
T  34979003 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggg 34979102  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  34979103 acggagggagtataa 34979117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6387535 - 6387375
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  6387535 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacattttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 6387437  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  6387436 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaag 6387375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17491725 - 17491513
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  17491725 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 17491627  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||      
T  17491626 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagta 17491527  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||||||||||    
T  17491526 acggaggtagtata 17491513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 17561489 - 17561701
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  17561489 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 17561587  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||      
T  17561588 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagta 17561687  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||||||||||    
T  17561688 acggaggtagtata 17561701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 25247518 - 25247678
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  25247518 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 25247616  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  25247617 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 25247678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 29064284 - 29064444
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  29064284 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 29064382  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  29064383 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 29064444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44547636 - 44547424
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  44547636 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 44547538  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  44547537 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 44547438  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  44547437 acggagggagtata 44547424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9998500 - 9998337
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  9998500 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagggatgaataatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 9998402  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| |||||||    
T  9998401 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttgtaaaaag 9998337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12930531 - 12930371
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  12930531 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 12930435  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  12930434 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 12930371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 35569478 - 35569638
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  35569478 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 35569574  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  35569575 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 35569638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26255305 - 26255096
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  26255305 actaatgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 26255207  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  26255206 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 26255108  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  26255107 acggagggagta 26255096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43081465 - 43081252
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  43081465 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 43081367  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  43081366 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 43081267  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||| ||||||||    
T  43081266 gggacgaaggtagta 43081252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 1275560 - 1275720
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  1275560 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 1275658  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  1275659 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 1275720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 8612402 - 8612562
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  8612402 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8612500  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  8612501 ggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 8612562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 29177080 - 29177291
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  29177080 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 29177177  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29177178 ggggcgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaaggatcttataattaggg 29177277  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  29177278 acggagggagtata 29177291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 29285864 - 29286076
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  29285864 actattgtttttagaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaata 29285962  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  29285963 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 29286062  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  29286063 acggagggagtata 29286076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 31200191 - 31200351
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  31200191 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 31200289  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  31200290 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 31200351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48521236 - 48521076
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  48521236 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 48521138  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  48521137 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 48521076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 7607458 - 7607621
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  7607458 attactattgtttttacaattttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 7607556  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  7607557 ataggggcatgtatgtaaagaaataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcataaaaag 7607621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 33858694 - 33858904
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  33858694 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 33858792  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  33858793 ggggcatgtatgtaaagaaataatcaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 33858891  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  33858892 acggagggagtat 33858904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 36646464 - 36646675
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  36646464 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 36646562  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | || |||||||||    
T  36646563 ggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaagaattctcaaaagggtcttctaattaggg 36646662  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  36646663 acggagggagtat 36646675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37913288 - 37913076
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  37913288 attactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataataa 37913190  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  37913189 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggac--aaaaaattctcaaaatgatcttataatta 37913092  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||| |||||||    
T  37913091 gggacggaagtagtat 37913076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38858507 - 38858295
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  38858507 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttcgtttatgtttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 38858410  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  38858409 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 38858310  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  38858309 acggagggagtataa 38858295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 41803294 - 41803459
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-nnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||    
T  41803294 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatataata 41803393  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  41803394 aataggggcatgtatgtaaagaaataattattatagttgaaaataataaaggggtcttataaaaag 41803459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2006681 - 2006525
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||    
T  2006681 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaatagggg 2006583  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  | |||||||||||    
T  2006582 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagccttataaaaag 2006525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 29642971 - 29643130
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  29642971 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 29643069  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  29643070 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataac-aaggggtcttataaaaag 29643130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7400339 - 7400127
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaa---gagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  7400339 tattgtttttacaattttatcctttaattagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaa-tgtataataaat 7400241  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7400240 aggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttc-caaaaggatcttataattagg 7400142  T
Q  203 gacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||    
T  7400141 gacggaggtagtata 7400127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32814643 - 32814432
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  32814643 actattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 32814545  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  32814544 gggtcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 32814445  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  32814444 acggagggagtat 32814432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9140357 - 9140571
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  9140357 attattattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 9140455  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  9140456 agaggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 9140555  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||| ||||||    
T  9140556 gggacggagatagtat 9140571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21119771 - 21119557
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  21119771 attactattgtttttacaattttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaacaatgtataataa 21119673  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagag-acnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   |||||||||||| || ||        ||||||||| ||| ||||||||    
T  21119672 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaaaaagaacataaaaaattctcaaaaggatcttataatt 21119573  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  21119572 agggacggaggtagta 21119557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21295360 - 21295151
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  21295360 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 21295263  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  21295262 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 21295163  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  21295162 acggagggagta 21295151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23364226 - 23364060
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        || ||||||||    
T  23364226 ttactattgtttttacaaatttatcctttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaag-aaaaagatgaataataaa 23364128  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    || | | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23364127 taagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaagagac 23364060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 41002982 - 41003191
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  41002982 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagatagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 41003079  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||| ||    
T  41003080 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaagg 41003179  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  41003180 acggagggagta 41003191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 47323353 - 47323495
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  47323353 attattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataa 47323451  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47323452 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 47323495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7449478 - 7449270
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  7449478 actattgattttacaattttatcctttaagaaaaatgt-tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 7449381  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  7449380 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaatggtcttataattaggg 7449282  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  7449281 acggagggagta 7449270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10475914 - 10475749
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||||||||     
T  10475914 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtattggtttatgttttcaacatgtcatttattgctaattgaag-aaaaagatgtataatat 10475816  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagag 167  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10475815 atagggtcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagag 10475749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 36711126 - 36711285
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||    
T  36711126 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtcagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa--aaaaaaatgtataataaata 36711223  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  36711224 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 36711285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 44780217 - 44780363
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  44780217 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa---aaaaaatctataataa 44780313  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaat 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  44780314 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaat 44780363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Original strand, 46414835 - 46415044
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||        ||||||||||||||| |    
T  46414835 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattttttgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggag 46414934  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacgg 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||  ||         ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  46414935 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaaggataaaaataattctcaaaatggtcttataattagggacgg 46415034  T
Q  208 aggtagtata 217  Q
    ||||||||||    
T  46415035 aggtagtata 46415044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 788146 - 787983
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  788146 attactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagaa-gtataataa 788048  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  788047 ataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 787983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 7703648 - 7703807
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  7703648 actattgtttttacaattttatcctttaggaaagaaggttagtt-atgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 7703745  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  7703746 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 7703807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 18112994 - 18113154
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||||||||    
T  18112994 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 18113092  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  18113093 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggttttataaaaag 18113154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1574930 - 1574718
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| | |    
T  1574930 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aataatatgtatattta 1574834  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        || | |||| | | |||||||||    
T  1574833 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacacattttttttttaaaagggtcttataatta 1574734  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1574733 gggacggaggtagtat 1574718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 11647660 - 11647864
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  11647660 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataatta 11647756  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  11647757 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 11647856  T
Q  201 gggacgga 208  Q
    ||||||||    
T  11647857 gggacgga 11647864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19619244 - 19619034
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||        ||||||||||||    
T  19619244 tactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatatttgcaacatgttatttgttgctaattgaag-aaaaagatgtataataaat 19619146  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||  |||||||  ||||| |||        ||||||||||||| ||||||||| |    
T  19619145 aggggtatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaattgcaaa-gggtcttaagaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaagatcttataattaag 19619048  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||| ||||    
T  19619047 gacggaggttgtat 19619034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 41252189 - 41252398
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  41252189 actattgtttttacaattttatcctttaaga-ataaggttagtttatgttttcaagatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 41252286  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  41252287 ggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 41252386  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  41252387 acggagggagta 41252398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43279915 - 43279705
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  43279915 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagt--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 43279819  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||| |||||    
T  43279818 ata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtaggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttacaatta 43279720  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  43279719 gggacggatgtagta 43279705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47657490 - 47657651
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  47657490 attactattgtttttacaattttatcttttaagacaga---attgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataata 47657585  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  47657586 aataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaag 47657651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17327081 - 17326952
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  17327081 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 17326983  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgta 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17326982 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 17326952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32759769 - 32759556
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  32759769 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 32759673  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac--nnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||          || |||||||| | |||||||    
T  32759672 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttcttttcaaaaaggtcttataat 32759573  T
Q  199 tagggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  32759572 tagggacggaggtagta 32759556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 6799370 - 6799531
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  6799370 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 6799466  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||    
T  6799467 ataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaag 6799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9299311 - 9299100
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagaga----gagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    ||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||        ||||||||    
T  9299311 tactattgtttttacagttttatcctt-aagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaaga-tgtataat 9299214  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||        |||||||||  || |||||||    
T  9299213 aaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagtatcttataat 9299114  T
Q  199 tagggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||||    
T  9299113 tagggacggaggta 9299100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9303860 - 9303649
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagaga----gagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    ||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||        ||||||||    
T  9303860 tactattgtttttacagttttatcctt-aagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaaga-tgtataat 9303763  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||| |||        |||||||||  ||||||||||    
T  9303762 aaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgtaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagtattttataat 9303663  T
Q  199 tagggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||||    
T  9303662 tagggacggaggta 9303649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17317609 - 17317446
Alignment:
Q  46 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||     
T  17317609 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 17317511  T
Q  146 caaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggagg 210  Q
    ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17317510 caaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagg 17317446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 21870160 - 21870318
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || |||||||    
T  21870160 attacaattgtttttacaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaag-aaaaagatgaataataa 21870258  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttata 160  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  21870259 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 21870318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23320865 - 23320701
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattg---aagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||         ||||||||||    
T  23320865 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaaagatgtataataa 23320766  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23320765 ataaggacatgtatgtaaagaaataattgatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 23320701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24300028 - 24300154
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||        ||||||||||    
T  24300028 attactattgtttttataattttatcctttaaaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaag-aaaaagatgtataataa 24300126  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24300127 atatgggtatgtatgtaaagaaataatt 24300154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26736699 - 26736530
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag------tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgta 94  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||    
T  26736699 attactattgtttttacaattatatccttgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaaga-tgta 26736601  T
Q  95 taataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  26736600 taataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaag 26736530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 28016370 - 28016512
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        ||||||||||    
T  28016370 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaag-aaaaaggtgtataataa 28016468  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  28016469 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 28016512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34896067 - 34895907
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||        |||||||||||||    
T  34896067 actattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgaagaaaattgatgtataataaata 34895969  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  34895968 aggatatgtatgtacagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaag 34895907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Original strand, 34012348 - 34012555
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||    
T  34012348 tattgtttttacaattttatccttaaa-agagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataacaaatagg 34012445  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggac 205  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  34012446 ggcttgtatgtaaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 34012544  T
Q  206 ggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||    
T  34012545 ggaggtagtat 34012555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 42298252 - 42298413
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  42298252 attactattatttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 42298348  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  42298349 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaggggtcttatgaaaag 42298413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12130259 - 12130135
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  12130259 attactattgtttttacaatgat--cctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 12130163  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12130162 ataggggcatgtatgtaaagaaataatt 12130135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 43440934 - 43441097
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  43440934 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 43441032  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  43441033 ataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttataaaaag 43441097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 43093238 - 43093395
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||| ||    
T  43093238 attgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataaataagg 43093336  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||  || ||||||||||    
T  43093337 gcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatagcaaatgagttttataaaaag 43093395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 9036757 - 9036916
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||        |||||||||||||    
T  9036757 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaata-tgtataataaata 9036854  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  9036855 ggggcatgtatgtaaacaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 9036916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23919943 - 23919735
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||        |||||||| |    
T  23919943 attagtattgtttttacaattttatcttttaagagaaag--atggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaaga-tgtataatta 23919847  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||  ||        || |||||| | |||||||||||    
T  23919846 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaaggaacaaatatttttttcaaaagggttttataatta 23919747  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||    
T  23919746 gggacggaggta 23919735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 30737836 - 30738000
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagaga-----gagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        |||||    
T  30737836 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaaagagggttggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtat 30737934  T
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  30737935 aataaataggggtat----gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaag 30738000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41444415 - 41444201
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||   || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||         || |||||||    
T  41444415 attacaattgtttttacaaatttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataa-taaaaagatgaataataa 41444317  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  41444316 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 41444217  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    | |||| |||||||||    
T  41444216 gagacgaaggtagtat 41444201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 10071287 - 10071409
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaaga 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||         || |||||||||    
T  10071287 tgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaatagcaaataggtcttataaaaagggacaatttttttttttcaaaaaga 10071386  T
Q  190 ttttataattagggacggaggta 212  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  10071387 tcttataattagggacggaggta 10071409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19845492 - 19845706
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | ||||    
T  19845492 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaata 19845590  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||  |||        ||||||||| ||| ||||||||    
T  19845591 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggatcttataatt 19845690  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  19845691 agggacggaggtagta 19845706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38428356 - 38428227
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||| |    
T  38428356 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataaaca 38428259  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38428258 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 38428227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38736656 - 38736521
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||   || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||    
T  38736656 attgtttttacaattttattctttaagagaa--ggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaataagg 38736560  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38736559 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 38736521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3024784 - 3024634
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||||| ||     
T  3024784 ttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataattaataggggcata 3024688  T
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  3024687 tatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaag 3024634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 48009149 - 48008985
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||        ||||||||    
T  48009149 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatttatgctttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataat 48009051  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  | |||||||||||    
T  48009050 aaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaagggttcttataaaaa 48008985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19920773 - 19920563
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||        |||||||||    
T  19920773 attactattatttttaca-ttttatcctttaagagaga---attgatttatgttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaata-tgtataata 19920679  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||  ||        ||||||||| | | ||||||||    
T  19920678 aataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatt 19920579  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||| ||||    
T  19920578 agggacggagggagta 19920563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26299484 - 26299316
Alignment:
Q  45 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||    
T  26299484 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttagaaata 26299386  T
Q  145 gcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagta 215  Q
    | |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26299385 gtaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaagtagta 26299316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28060926 - 28060768
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  28060926 actattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 28060829  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  28060828 ggggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaag 28060768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31581888 - 31581745
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||        |||||||||||||    
T  31581888 actattgtttttataattttatc-tttaagagagagagttagtttatattttccatacgttatttattgctaattgaagaaaaaga-tgtataataaata 31581791  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  31581790 gggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 31581745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41787461 - 41787302
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||    
T  41787461 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaaa--ggttggtttatgttttaaacatgttatttattgccgattgaag-aaaaaaatgtataataa 41787365  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||   |||||||||||    
T  41787364 ataagggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaa 41787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 46266203 - 46266358
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||         |||||||||||    
T  46266203 actattgtttttacaatttaatcctttatatatagagagttagtttatgttttcaacatgatatttatagctgattgaagaagaa----gtataataaat 46266298  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaa 162  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  46266299 aggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 46266358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 42887905 - 42888114
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  42887905 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 42888002  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  ||  |||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  42888003 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggtaataccaaaggggtcttataaaaagtgacaattttttttttcaaaaggatcttataatta 42888102  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||    
T  42888103 gggacggaggta 42888114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 10538958 - 10539116
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattg-----aagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||        |||| |||    
T  10538958 actattgtttttacaattttatcctttaatagagagt--tagtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaaaaaaagaaaaaaaatgtaaaat 10539055  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttat 159  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  10539056 aaataagggtatttaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 10539116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 27325996 - 27326073
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325996 ctattgtttttataattttatcctttaagatagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 27326073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38361361 - 38361201
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        | ||||||||    
T  38361361 attactattgtttttacaattttatcatt---gagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatagctgattgaag-aaaaagatatataataa 38361266  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||   |||||||||||||    
T  38361265 atattagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctcgaaatagcaaagaagtcttataaaaag 38361201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45907456 - 45907244
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  45907456 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga---attgatttatgtttccaatatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataata 45907361  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | ||||||||    
T  45907360 aataggggcatacatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtattataatt 45907261  T
Q  200 agggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||| |||||    
T  45907260 agggacggagggagtat 45907244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Original strand, 27881913 - 27881993
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27881913 ttactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 27881993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 7400548 - 7400707
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  7400548 actattgtttttacaagtttatcctttaaaagaaagaattaatttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 7400646  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
     ||||||| |  ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  7400647 agggtatgcaaataaagaaataattaatgcagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaa 7400707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 165
Target Start/End: Original strand, 9233444 - 9233563
Alignment:
Q  45 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  9233444 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatgtagttggaaata 9233542  T
Q  145 gcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  9233543 gcaaatgagtcttataaaaag 9233563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26842984 - 26842835
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttt-------tcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||       |||||||  |||||||||||||||||||        |||    
T  26842984 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaagtttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgt 26842886  T
Q  94 ataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26842885 ataataaataagggcatgtatggaaagaaataattaatgtagttgaaaata 26842835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 3796058 - 3796204
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||   || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||        |||| ||||||||    
T  3796058 actattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgctgatggaag-aaaaagatgtaaaataaata 3796156  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaatt 151  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||    
T  3796157 gaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaatt 3796204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 31802947 - 31803157
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||        || | |||||    
T  31802947 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttagtttatgttttcaacataatatttattgtttattaaag-aaaaagatgcaaaataa 31803042  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| || ||  || ||||||||||   |||||||||||   |||        ||||||||||||| |||||||||    
T  31803043 ataggggtatggaggtaaagaaataattaatataattggaaatagcaaagcagtcttataaaagtggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataatta 31803142  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  31803143 gggacggaggtagta 31803157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 31769245 - 31769366
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| ||         ||||||||| | |    
T  31769245 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggataaaaaaaattctcaaaagggt 31769344  T
Q  191 tttataattagggacggaggta 212  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  31769345 cttataattagggacggaggta 31769366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 32118049 - 32118127
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32118049 attactattgttattacaattttatcctttaagagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 32118127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23109280 - 23109140
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        || |||||||    
T  23109280 attacaattttttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag-aaaaagatgaataataa 23109182  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaa 142  Q
    ||| ||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23109181 ataaggacatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 23109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21587620 - 21587539
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21587620 attactattgtttttacaattttattttttaaaagagagaatttgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 21587539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 21870916 - 21870997
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21870916 attacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaag 21870997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 20950863 - 20950942
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20950863 attattattgtttttacaattttatcctttaagagaga---attgatttatgttttcaacatgttatttattgcttattgaag 20950942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27813712 - 27813550
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||        |||| |||||    
T  27813712 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattg-aggaaaaagatgtaaaataa 27813615  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||| || ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  27813614 ataagggtaggttggtaaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaag 27813550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35888522 - 35888310
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  35888522 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 35888427  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||   || ||||| |||| || |||||||||||| |||        || |||||||| | |||||||||    
T  35888426 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgttcttggaaataccaaaatgctcttataaaaagggacaaattattttttcaaaaaggtcttataatta 35888327  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  35888326 gggacggaggtagtata 35888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 40121079 - 40121139
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 61  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40121079 attactattgtatttacaattttatcctttaagagagagaaatagtttatgttttcaacat 40121139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 45778046 - 45778209
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgta--taataaa 101  Q
    |||||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        | ||   ||||||    
T  45778046 actattatttttataattttatcttttaagagaaagaattagtttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaatatgtataataaataaa 45778145  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    || ||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  45778146 taagggtatgcaagtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 45778209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 47534735 - 47534875
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||    
T  47534735 ttgtttttacaattttatcctt-aagagagagttat--tttatgttttccatatgttatttattgctaattgaagaaaaaa--tgtataataaatagggg 47534829  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttat----gtagctgaaaatagcaaa 149  Q
     |||||||||||||||||||| ||    |||| |||||||||||||    
T  47534830 catgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttgaaaatagcaaa 47534875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 32964220 - 32964366
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  32964220 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 32964317  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  32964318 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaa 32964366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44719246 - 44719127
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttat 195  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||    
T  44719246 aataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggacacaaaatattctcaaaatggtcttat 44719147  T
Q  196 aattagggacggaggtagta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  44719146 aattaaggacggaggtagta 44719127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22991570 - 22991782
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||        || | |||||    
T  22991570 attactattgtttttaca-ttttatccta-aagagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaag-aaaaagatgcaaaataa 22991666  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||||||||    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| | |||||||||||| |||           |||||| ||| |||||||||    
T  22991667 ataggggtatggtgataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatggatcttataaaaagggacaaaaaaaaaattcaaaaggatcttataatta 22991766  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22991767 gggacggaggtagtat 22991782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30534915 - 30534705
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  30534915 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 30534820  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  30534819 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagtgtcttataatta 30534720  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  30534719 gggacggaggtagta 30534705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3776041 - 3775961
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3776041 attactattgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 3775961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9682813 - 9682602
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||        |||| |||||    
T  9682813 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaag--aaaaaatgtaaaataa 9682717  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  |||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  9682716 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataatta 9682617  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  9682616 gggacggaggtagta 9682602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16957847 - 16957767
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16957847 attattattgtttttacaattttatcgtttaa-agagatggttgatttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaag 16957767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Original strand, 18751898 - 18751970
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18751898 tgtataataaatatgggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttgaaaatagcagagtggtcttataaaaa 18751970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21135460 - 21135380
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  21135460 attaccattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 21135380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 49044945 - 49045025
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  49044945 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 49045025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 17878201 - 17878257
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttca 57  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17878201 attactattgtttttataattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttca 17878257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 49110854 - 49110993
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| | | || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||        |||||||||||||    
T  49110854 actattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgtttttaacatgttatttattgccaattgaag--aaaagatgtataataaata 49110951  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaaga-aataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  49110952 gggatatgtaagtaaaaataataattaatgtagttgaaaata 49110993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 3881371 - 3881528
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||         |||| |||||||| |    
T  3881371 tattgtttttaaaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa-taaaaagatgtaaaataaataag 3881468  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  3881469 ggtatgttggtaaaaaaataatctatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaag 3881528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19293045 - 19292839
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||||| |    
T  19293045 tattgtttttacaattttattctt-aagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataaataag 19292948  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggac 205  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||  |  |||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19292947 ggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttagaaatactaaaggggtcttataaaaagggac-aatttttttctcaaaaggatcttataattagggac 19292849  T
Q  206 ggaggtagta 215  Q
    ||||||||||    
T  19292848 ggaggtagta 19292839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Original strand, 33381505 - 33381611
Alignment:
Q  109 atgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacgga 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||         |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  33381505 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaa-tctcaaaagggtcttataattagggacgga 33381603  T
Q  209 ggtagtat 216  Q
    ||||||||    
T  33381604 ggtagtat 33381611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 12616299 - 12616421
Alignment:
Q  94 ataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagatttt 193  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | |||||||||||| ||         ||||||||| | | ||    
T  12616299 ataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaagggatcaaaaaaattctcaaaagggtctt 12616398  T
Q  194 ataattagggacggaggtagtat 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  12616399 ataataagggacggaggtagtat 12616421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 23802008 - 23802088
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  23802008 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 23802088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 24211061 - 24211138
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagaga 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  24211061 tgtataataaatcggggtatgtagataaagaaataattaatgtagtttaaaataacaaagagatcttataaaaagaga 24211138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37915354 - 37915195
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  37915354 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaataa 37915258  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||  |||||||||||    
T  37915257 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaatgagtcttataaaa 37915195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43934801 - 43934721
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  43934801 attacaattgtttttacaattttatcctt-aagagagagggtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 43934721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 44510169 - 44510380
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  44510169 attactattgtttt-acaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 44510265  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
     || ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  44510266 gtaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaatggtcttataatta 44510365  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  44510366 gggacggagggagta 44510380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 45722219 - 45722140
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  45722219 attaccattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 45722140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 2470900 - 2471047
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||| | |  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||        ||||||||||    
T  2470900 attactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttattgctaattaaag-aaaaagatgtataataa 2470998  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||| || |||| |||||    
T  2470999 ataaaggtatatatgaaaagaattaattaatgtagttggaaattgcaaa 2471047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24504896 - 24504734
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | || ||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  24504896 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagcgagagagttaatttctattttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 24504799  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  24504798 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaag 24504734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 33381443 - 33381494
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgt 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||    
T  33381443 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgt 33381494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33342348 - 33342269
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  33342348 attactattgtttttacaattaaatcatttaagagaga--gttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaag 33342269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 5524825 - 5524985
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |  ||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||        | ||||||||||    
T  5524825 actattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttgatttatgttttccatatgc-atttattgctgattaaagaaaaaga-tatataataaat 5524922  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
      ||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  5524923 gagggcatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaag 5524985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Original strand, 12631735 - 12631804
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12631735 aataaataggagtatggtggtaaagaaatgattaatgtaattgaaaataccaaattggtcttataaaaag 12631804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20075056 - 20074988
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgc 73  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| | ||| || |||||||    
T  20075056 actattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgc 20074988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 31137239 - 31137288
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 61  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  31137239 ttttacaattttatcctttaagagagagggttggtgtatgttttcaacat 31137288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 33683009 - 33683089
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  33683009 attaatattgcttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaag 33683089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 47649003 - 47649083
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  47649003 attactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 47649083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 46415120 - 46415199
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  46415120 attattattgtttttacaattttattctt-aagggagagagttagtttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 46415199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 39
Target Start/End: Original strand, 2887791 - 2887825
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagag 39  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2887791 ctattgtttttacaattttacactttaagagagag 2887825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 20182105 - 20182184
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||    |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  20182105 attactattgtttttacaatcttatccttacagagagatt--tagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 20182184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 32643668 - 32643742
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  32643668 tgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatatgtcttataaaaag 32643742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 20951002 - 20951039
Alignment:
Q  178 ttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20951002 ttctcaaaaagatcttataattaaggacggaggtagta 20951039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28017152 - 28017075
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| || | ||||||||||| ||  |||||| || |||||||||    
T  28017152 ctattgtttttataattttatccgttaagaaagagggttaatgtatgttttcaatataatatttaatgttgattgaag 28017075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Original strand, 32699622 - 32699691
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  32699622 aataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaag 32699691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43008217 - 43008141
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagaga 168  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  43008217 tgtataataattaggggtatttaggtaaagaagtaattaatatagttgaaa-taacaaaggggtcttataaaaagaga 43008141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Original strand, 3478869 - 3478917
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  3478869 aataaataggggtatgttagtaaagaaataattaatgtagtttaaaata 3478917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 8782035 - 8782119
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag----tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||    |||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  8782035 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagagagtaaatttaagttttcaatataatatttattgttgattgaag 8782119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 25530787 - 25530707
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||| |||||||| |||||  |||||| || ||||||||    
T  25530787 attacaattgtttttataattttatcttttaagagagaatgttagtgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaa 25530707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 194)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 1084778 - 1084941
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  1084778 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 1084876  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  1084877 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaaaggatcttataaaaag 1084941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 7051547 - 7051758
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  7051547 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 7051645  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7051646 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 7051745  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  7051746 acggagggagtat 7051758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7181560 - 7181349
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  7181560 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 7181462  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  7181461 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggg 7181362  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  7181361 acggagggagtat 7181349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51489580 - 51489373
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  51489580 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatggaag-aaaaagatgtataataa 51489482  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||   | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  51489481 ataaatgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacaagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataatta 51489382  T
Q  201 gggacggag 209  Q
    |||||||||    
T  51489381 gggacggag 51489373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 9499324 - 9499534
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  9499324 actattgtttttacaattttatcctttaagagagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 9499422  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  9499423 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 9499522  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  9499523 acggagggagta 9499534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43868313 - 43868101
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  43868313 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 43868215  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  43868214 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 43868115  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  43868114 acggagggagtata 43868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 12683009 - 12683219
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  12683009 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 12683107  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  12683108 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggactaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaggg 12683207  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  12683208 acggagggagta 12683219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17753359 - 17753572
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  17753359 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 17753457  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||| |||| |||||||||||    
T  17753458 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcagaaaggttttataatta 17753557  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  17753558 gggacggaggtagta 17753572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19054679 - 19054892
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  19054679 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 19054777  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||| |||| |||||||||||    
T  19054778 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcagaaaggttttataatta 19054877  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  19054878 gggacggaggtagta 19054892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54107563 - 54107358
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  54107563 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 54107465  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54107464 ggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataataaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataatcaggg 54107365  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  54107364 acggagg 54107358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 23700612 - 23700824
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||||||    
T  23700612 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaag-aaaaagatgtataataaata 23700710  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  23700711 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 23700810  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  23700811 acggagggagtata 23700824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 23719067 - 23719279
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||||||    
T  23719067 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaag-aaaaagatgtataataaata 23719165  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  23719166 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 23719265  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  23719266 acggagggagtata 23719279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 23737523 - 23737735
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||||||    
T  23737523 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaag-aaaaagatgtataataaata 23737621  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  23737622 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 23737721  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  23737722 acggagggagtata 23737735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 30040844 - 30041004
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  30040844 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 30040942  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30040943 ggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaaag 30041004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10015615 - 10015827
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  10015615 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 10015711  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  10015712 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 10015811  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  10015812 gggacggaggtagtat 10015827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26221501 - 26221286
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  26221501 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-agaaagatgtataataa 26221403  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||||   | |||||||||    
T  26221402 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataatta 26221303  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26221302 gggacggagggagtata 26221286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 28673120 - 28673332
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  28673120 attactgttgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaag-aaaaatatgtataataa 28673216  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  28673217 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 28673316  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  28673317 gggacggaggtagtat 28673332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 35867910 - 35868121
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  35867910 actattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 35868008  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  35868009 ggggtgtgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 35868108  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  35868109 acggagggagtat 35868121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43978371 - 43978159
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||| |    
T  43978371 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 43978275  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||        |||| |||| | | |||||||||    
T  43978274 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagagacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataatta 43978175  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  43978174 gggacggaggaagtat 43978159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46861833 - 46861670
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  46861833 attactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 46861735  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46861734 ataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 46861670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10656904 - 10656690
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  10656904 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 10656806  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  10656805 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 10656706  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10656705 ggggcggaggtagtat 10656690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20621510 - 20621721
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  20621510 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 20621606  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  20621607 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataatta 20621706  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  20621707 gggacggaggtagta 20621721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45252983 - 45252773
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  45252983 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 45252885  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  45252884 agggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 45252785  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  45252784 acggagggagta 45252773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 53361679 - 53361893
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  53361679 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 53361777  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  53361778 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataatta 53361877  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  53361878 gggacggagggagtat 53361893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47067147 - 47066934
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || |||||||    
T  47067147 attactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaatgatgaataataa 47067049  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  47067048 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaagggtcttataatta 47066949  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  47066948 gggacggaggaagta 47066934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 50517346 - 50517559
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  50517346 attattattgtttttacaattttatcctttaagggggagggttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 50517444  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  50517445 ataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtattataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 50517544  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  50517545 gggacggaggtagta 50517559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 7251109 - 7251269
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  7251109 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 7251207  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  7251208 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaag 7251269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 48887775 - 48887983
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||| |||    
T  48887775 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtatgataaacagg 48887873  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggac 205  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||        |||||||||  || ||||||||| ||||    
T  48887874 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagaatcttataattatggac 48887973  T
Q  206 ggaggtagta 215  Q
    ||||||||||    
T  48887974 ggaggtagta 48887983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 50433213 - 50433429
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  50433213 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 50433311  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| | |  |||||||||||||| |||        |||||| || | | |||||||||    
T  50433312 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcacaagggtcttataatta 50433411  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50433412 gggacggaggtagtataa 50433429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52673397 - 52673237
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  52673397 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaata 52673299  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  52673298 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaggtggaaataacaaatgggtcttataaaaag 52673237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1450455 - 1450240
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  1450455 attactattgtttttacaattttagcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 1450357  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        |||||||||   | |||||||||    
T  1450356 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataatta 1450257  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||| ||||||||||    
T  1450256 gggacgaaggtagtata 1450240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 22103756 - 22103967
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  22103756 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 22103854  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  22103855 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 22103954  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  22103955 acggagggagtat 22103967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8547117 - 8546908
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||| |||    
T  8547117 attactattgttttgacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtatagtaa 8547019  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  8547018 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 8546919  T
Q  201 gggacggaggt 211  Q
     ||||||||||    
T  8546918 aggacggaggt 8546908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 45513461 - 45513674
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  45513461 attactatcgtttttacaattttatcctttaagagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 45513557  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttc--tcaaaaagattttataat 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        |||  |||||| | | |||||||    
T  45513558 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctttcaaaagggtcttataat 45513657  T
Q  199 tagggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  45513658 tagggacggaggtagta 45513674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54849573 - 54849361
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||     
T  54849573 actattgtttttacaattttatcatttaagagagatggttactttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaatatgtataataaat- 54849475  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| |||        |||| |||||| | |||||||||| |    
T  54849474 ggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataacaaatggatcttataaaaagggacaacaaaaattcttaaaaaggtcttataattagag 54849375  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    || |||||||||||    
T  54849374 acagaggtagtata 54849361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45745988 - 45745828
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  45745988 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 45745890  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  45745889 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 45745828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2993470 - 2993258
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        |||||||| |    
T  2993470 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag-aaaaagatgtataatta 2993374  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| |||         |||||||| ||| |||||||||    
T  2993373 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaatgatcttataatta 2993274  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  2993273 gggacggaggtagtat 2993258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 13809633 - 13809796
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  13809633 attactattgtttttacaattttattcttcaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 13809731  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  13809732 ataggggcatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaag 13809796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 19897662 - 19897874
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  19897662 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 19897758  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||| |||   ||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  19897759 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 19897858  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  19897859 gggacggaggtagtat 19897874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 25148949 - 25149160
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  25148949 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 25149047  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  25149048 ggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 25149147  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  25149148 acggagggagtat 25149160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36005713 - 36005502
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  36005713 actattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 36005615  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||||||         |||||||||| || |||||||||||    
T  36005614 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagagacaaaaaaaaattctcaaaaaaatcttataattagg 36005515  T
Q  203 gacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||    
T  36005514 gacggaggaagta 36005502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44543991 - 44543781
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  44543991 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 44543894  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  44543893 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattaggg 44543794  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  44543793 acggagggagtat 44543781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 49383556 - 49383393
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  49383556 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 49383458  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  49383457 ataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 49383393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8322136 - 8321925
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  8322136 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 8322040  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  8322039 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 8321940  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  8321939 gggacggaggtagta 8321925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 12906237 - 12906451
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  12906237 ttactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaa 12906335  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaa-gattttataatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||  |||||||||| ||| |||        || ||||||| | | |||||||||    
T  12906336 taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatggaaaaggggtcttataagaagggacaaaaaaatttatcaaaaagggtcttataatta 12906435  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  12906436 gggacggaggtagtat 12906451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 15996599 - 15996810
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| | |    
T  15996599 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtatattta 15996695  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  15996696 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataatta 15996795  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  15996796 gggacggaggtagta 15996810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 20656137 - 20656347
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        ||||||||||||     
T  20656137 actattgcttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaag-aaaaagatgtataataaatt 20656235  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||        |||||||||  || |||||||||||     
T  20656236 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagga 20656335  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  20656336 acggagggagta 20656347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21756696 - 21756486
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  21756696 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 21756598  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  21756597 ggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 21756498  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  21756497 acggagggagta 21756486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 45323913 - 45324124
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  45323913 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 45324009  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||         ||||||||| | | |||||||||    
T  45324010 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataaaaaaaattctcaaaatggtcttataatta 45324109  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||    
T  45324110 aggacggaggtagta 45324124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 46845316 - 46845530
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||        ||||||||||    
T  46845316 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 46845414  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  46845415 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 46845514  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  46845515 gggacggaggtagtat 46845530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 46878266 - 46878476
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  46878266 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 46878364  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||| ||    
T  46878365 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaagg 46878464  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  46878465 acggagggagta 46878476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 54782744 - 54782954
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  54782744 actattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 54782842  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  54782843 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 54782942  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||| ||| ||||    
T  54782943 acgaagggagta 54782954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6784675 - 6784463
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  6784675 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 6784577  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  6784576 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag-aaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 6784478  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||    
T  6784477 aggacggaggtagta 6784463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 32962939 - 32963144
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||| |||    
T  32962939 ttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatg 32963037  T
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggagg 210  Q
     |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||         ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32963038 catgtaaagaaataattaatgtagttgcaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggagg 32963137  T
Q  211 tagtata 217  Q
     ||||||    
T  32963138 gagtata 32963144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43686714 - 43686501
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  43686714 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 43686616  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        |||| |||| | | |||||||||    
T  43686615 ataggggtatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaagggaccaaaaaaattctaaaaagggtattataatta 43686516  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    || ||||||||||||    
T  43686515 ggaacggaggtagta 43686501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 49127025 - 49127230
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  49127025 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 49127123  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  49127124 ggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 49127223  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  49127224 acggagg 49127230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53164376 - 53164163
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        || |||||||    
T  53164376 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgcataataa 53164278  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||   ||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  53164277 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 53164178  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  53164177 gggacggaggtagta 53164163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 31531238 - 31531398
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  31531238 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 31531336  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  31531337 ggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaatgtcttataaaaag 31531398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32467635 - 32467475
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  32467635 actattgtttttacaattttatcctttacgaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 32467537  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  32467536 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 32467475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33212609 - 33212397
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  33212609 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 33212511  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||    |||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  33212510 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagatggaaatagaaaagaaatcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 33212412  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  33212411 gggacggaggtagta 33212397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33868657 - 33868446
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  33868657 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 33868560  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33868559 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataactaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 33868460  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  33868459 acggagggagtata 33868446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 50726610 - 50726771
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  50726610 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaatta-tgtataataa 50726706  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50726707 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 50726771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 50786238 - 50786077
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  50786238 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaatta-tgtataataa 50786142  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50786141 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 50786077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 52291253 - 52291414
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  52291253 attagtattgtttttacaattttattctttaagagagag--ataatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataatta 52291349  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  52291350 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 52291414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 4759174 - 4759389
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggg-atagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  4759174 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataata 4759272  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||    
T  4759273 aataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatt 4759372  T
Q  200 agggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  4759373 agggacggaggtagtat 4759389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 26593592 - 26593802
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||    
T  26593592 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaagatgtataataaata 26593690  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  26593691 tgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 26593790  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  26593791 acggagggagta 26593802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32569205 - 32568994
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||||||||||    
T  32569205 tattatttttacaattttatcatttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgtcgattgaag-aaaaagatgtataataaatagg 32569107  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggac 205  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32569106 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataattagggac 32569007  T
Q  206 ggaggtagtataa 218  Q
    ||| | |||||||    
T  32569006 ggatggagtataa 32568994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43158562 - 43158774
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  43158562 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 43158658  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  43158659 atagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaattttttttctcaaaatgatcttataatta 43158758  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  43158759 gggacggaggaagtat 43158774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 44542301 - 44542460
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  44542301 actattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 44542399  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
     |   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   ||||||||||||    
T  44542400 agaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaaaatgtcttataaaaa 44542460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4024261 - 4024052
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  4024261 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 4024164  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||         |||||||| | | ||||||||||||    
T  4024163 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggg 4024064  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  4024063 acggagggagta 4024052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21459195 - 21458982
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| || | || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||    
T  21459195 attactattgttttgacaattttatcctttacgatatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaagatgtataataa 21459097  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||| ||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  21459096 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggtgtcctataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 21458997  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  21458996 gggacggaggtagta 21458982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 46049812 - 46050023
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  46049812 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 46049908  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  46049909 ataggggcatacatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaaggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 46050008  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  46050009 gggacggagggagta 46050023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 49383657 - 49383819
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  49383657 attactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaaaatatataataa 49383755  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||  |||||||||||||    
T  49383756 atagagacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaa 49383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 1641927 - 1642086
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  1641927 actattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgt-tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 1642024  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  1642025 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaagtcttataaaaag 1642086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12050219 - 12050380
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  12050219 attactattgtttttacaattttatcctttgagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 12050315  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12050316 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaag 12050380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31186969 - 31186808
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  31186969 attattattgtttttacaattttatcctttaagagaaagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 31186873  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31186872 atatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 31186808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 35165790 - 35165949
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  35165790 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaata 35165888  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  35165889 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaag 35165949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43701388 - 43701176
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||| ||||||||    
T  43701388 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtacaataaata 43701290  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  43701289 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 43701190  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    || |||| ||||||    
T  43701189 acagagggagtata 43701176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 45048849 - 45049009
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  45048849 actattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 45048947  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  45048948 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 45049009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27688196 - 27687985
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||        |||||||| |    
T  27688196 attactattgtttttacaattttatcctttaagagag--ggttggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaag-aaaaatatgtataat-a 27688101  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  27688100 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaatttgtcaaaagggtcttataatta 27688001  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
     |||||||||||||||    
T  27688000 aggacggaggtagtat 27687985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37728922 - 37728712
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  37728922 actattgtatttacaattttatc-tttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 37728825  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  37728824 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaacaaatattctcaaaagggtcttataattaggg 37728725  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  37728724 acggagggagtat 37728712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 43557277 - 43557440
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        ||||||||||    
T  43557277 attactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtaattgaagaaaaaga-tgtataataa 43557375  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43557376 ataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgtagttgaaaatagcaaatggatcttataaaaag 43557440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48910083 - 48909871
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||||||||||    
T  48910083 attactattgtttttacaattttattatttaagagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaaa-tgtataataa 48909987  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  48909986 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagtaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 48909887  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  48909886 gggactgaggtagtat 48909871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 50730538 - 50730375
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||        ||||||||||    
T  50730538 attactattgtttttataattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaag-aaaaatatgtataataa 50730440  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  50730439 atagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaag 50730375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 50782316 - 50782479
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||        ||||||||||    
T  50782316 attactattgtttttataattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaag-aaaaatatgtataataa 50782414  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  50782415 atagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaag 50782479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 52044700 - 52044540
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  52044700 attagtattatttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 52044604  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  52044603 atagggacatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 52044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 53686821 - 53686984
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        || |||||||    
T  53686821 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgcataataa 53686919  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  53686920 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 53686984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38071408 - 38071246
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  38071408 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagaggattggtttatgctttcaacatgttatttattgatgattgaag-aaaaatatgtataataa 38071310  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  38071309 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaaatgagtcttataaaaa 38071246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27646131 - 27646343
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  27646131 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 27646228  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  27646229 ataagggtatcttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaaaggatcttataatta 27646328  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  27646329 gggacggaggtagta 27646343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46703237 - 46703032
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  46703237 actattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 46703139  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |  | |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  46703138 gaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 46703039  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  46703038 acggagg 46703032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10045049 - 10044840
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  10045049 actattgtttttacaattttatcctg-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 10044952  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| ||||||||||||    
T  10044951 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaagggacaatttttttt-tcaaaaggatcttataattaggg 10044854  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  10044853 acggagggagtata 10044840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 17591373 - 17591576
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  17591373 actattgtttttacaattttatc-tttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 17591470  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17591471 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 17591570  T
Q  204 acggag 209  Q
    | ||||    
T  17591571 agggag 17591576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24087162 - 24087373
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||   ||||    
T  24087162 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggcctatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaatatgt---ataa 24087257  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||||| | |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  24087258 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagaaaacgggtcttataaaacgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 24087357  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  24087358 gggacggaggtagtat 24087373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 36317483 - 36317692
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||        |||||||||||||    
T  36317483 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattactgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 36317580  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||        |||||||||| || |||||||||||     
T  36317581 ggagcatgtatgtgaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac-aaaataattctcaaaaaaatcttataattagga 36317679  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||||    
T  36317680 acggaggtagtat 36317692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 50647772 - 50647981
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  50647772 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 50647869  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||| |    
T  50647870 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaattttttctcaaaagggtcttataattagag 50647969  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  50647970 acggagggagta 50647981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10221143 - 10220933
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  10221143 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaag-aaaattatgtataataa 10221047  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  10221046 ataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 10220948  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  10220947 gggacggagggagta 10220933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 16435065 - 16435273
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  16435065 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 16435162  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  16435163 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataattagag 16435261  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  16435262 acggagggagta 16435273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23308151 - 23308074
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatt 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23308151 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagggttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatt 23308074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 26806212 - 26806371
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        ||||||||||||| |||    
T  26806212 ttgtttttacaattttatcctt-aagagagaaggttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatatggg 26806309  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  26806310 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaaagac 26806371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40919167 - 40919019
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        | ||||||||    
T  40919167 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatatataataa 40919069  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaat 150  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||    
T  40919068 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaat 40919019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 22832437 - 22832595
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||        |||||||||||||    
T  22832437 actattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaata-tgtataataaata 22832534  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22832535 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 22832595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 42801606 - 42801769
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  42801606 attactattgtttttataattttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaaga-tgtataataa 42801704  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  || ||||||||||    
T  42801705 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaag 42801769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14428818 - 14428610
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  14428818 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 14428721  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  14428720 -gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataagaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggg 14428622  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  14428621 acggagggagta 14428610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 17698858 - 17699069
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |    
T  17698858 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtttaatta 17698954  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  17698955 ataggggcgtgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaaggac-aaaaaatttctcaaaatggtcttataatta 17699053  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17699054 gggacggaggtagtat 17699069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20862406 - 20862193
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||        ||||||||||||    
T  20862406 actattgcttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatt-attgctgattgaagaaaaata-tgtataataaat 20862309  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||    
T  20862308 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagg 20862209  T
Q  203 gacggaggtagtataa 218  Q
    |||||| | |||||||    
T  20862208 gacggatggagtataa 20862193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23776321 - 23776535
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  23776321 attactattgtttttacaattttattctttaatagagagggttggattatgttttcaac--gttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 23776417  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||| ||| |||         ||||||||| || |||||||||    
T  23776418 atagaggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttataacaagggacaaaaaaaa-tctcaaaaaaatcttataatta 23776516  T
Q  201 gggacggaggtagtataag 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23776517 gggacggaggtagtataag 23776535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25148665 - 25148466
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  25148665 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaaattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 25148567  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||    | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  25148566 ggg----gcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 25148471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 54604415 - 54604573
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  54604415 actattgtttttacaattttatcctttaagaatgaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 54604513  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||  | ||||||||||    
T  54604514 ggggcatggatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaa 54604573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14759047 - 14758836
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||| |    
T  14759047 attagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaaaatgtataatta 14758951  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||| || |   |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  14758950 atagaggca--aatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataatta 14758853  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14758852 gggacggaggtaatata 14758836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 33361525 - 33361606
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361525 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 33361606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35711486 - 35711281
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  35711486 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tcatttgtgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataa 35711390  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||| ||||| | |||||||||    
T  35711389 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctc-aaaaggtcttataatta 35711291  T
Q  201 gggacggagg 210  Q
    ||||||||||    
T  35711290 gggacggagg 35711281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36099173 - 36099015
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||        |||||||||||||    
T  36099173 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatcgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 36099076  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  36099075 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaa-gggtcttataaaaag 36099015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 52059073 - 52059232
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  52059073 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtttgtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 52059170  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  52059171 ggggcatgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 52059232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 9780064 - 9780226
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||        ||||||||||    
T  9780064 attattattgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaata-tgtataataa 9780161  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  9780162 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 9780226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 35572282 - 35572442
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||        ||||||||    
T  35572282 attactattgattttacaattttatcctttaagggagagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttactgctgattgaag-aaaaagatgtataat 35572380  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||      ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35572381 aaatagg-----ttatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 35572442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Original strand, 46862198 - 46862396
Alignment:
Q  9 tgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggt 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |   |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||     
T  46862198 tgtttttacaattttatcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataataaataggggc 46862296  T
Q  109 atgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacgga 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  46862297 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 46862396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41824318 - 41824158
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||        ||||||||||||    
T  41824318 tactattgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaaag-tgtataataaat 41824221  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||   |||||||||||||    
T  41824220 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagatgtcttataaaaag 41824158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53271798 - 53271642
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  53271798 attgtttttacaattttatcctt-aagagagggagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaataggg 53271701  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  53271700 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagggatcttataaaaag 53271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39952476 - 39952321
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||    
T  39952476 ttgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctatttatttctgattgaagaaaaata-tgtataataaatatggg 39952379  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  39952378 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaag 39952321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 26306435 - 26306593
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | || ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||        |||||||||||||    
T  26306435 actattgtttttacaattttatcctt-aagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaaga-tgtataataaata 26306532  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  26306533 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaa 26306593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 42390728 - 42390891
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||        ||||||||||    
T  42390728 attactattgtttttgcaattttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaag-aaaaaaatgtataataa 42390826  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| ||| || || | ||| ||||   |||||||||||||    
T  42390827 atagggacatgtatgtaaataaataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttataaaaag 42390891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 48213963 - 48213803
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||| |    
T  48213963 attagtattatttttacaagtttatcctttaagagagaa--atggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtataatta 48213867  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||| ||||||||    
T  48213866 atatgggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaa 48213803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 51283890 - 51284100
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat-aaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||| ||||    
T  51283890 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttacgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaaat 51283987  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||    
T  51283988 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggattttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataattagg 51284086  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    |||||||| |||||    
T  51284087 gacggagggagtat 51284100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 1111473 - 1111686
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  1111473 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 1111570  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||||||        ||||||||| | | |||||||||    
T  1111571 ataagggtatcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 1111670  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||| ||||||    
T  1111671 gggacggagatagtat 1111686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 16776710 - 16776924
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttt-aagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |  |||||| ||||||||||||        | || ||||    
T  16776710 attactattgtttttacaaatttgtccttttaagagagagggttagtgtatgttttcaatgtagtatttaatgctgattgaag-aaaaagatataaaata 16776808  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||||        ||||||||| |||  |||||||    
T  16776809 aataggggtatattggtaaagaattaattaatgtacttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaattttttttctcaaaaggatcctataatt 16776908  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  16776909 agggacggaggtagta 16776924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49543846 - 49543677
Alignment:
Q  45 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  49543846 gtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaa-aaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 49543748  T
Q  145 gcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagta 215  Q
    |||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||    
T  49543747 gcaaaagagtcttataaaaagggacaacaaattttctcaaaagggtcttataattagggacggaagtagta 49543677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 37144312 - 37144393
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37144312 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag 37144393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 17589701 - 17589916
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  17589701 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 17589798  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| |||| |||  |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  17589799 ataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagtgtcttataatta 17589898  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17589899 gggacggaggtagtataa 17589916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26058748 - 26058546
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  26058748 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgt----tattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 26058654  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||    |||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  26058653 ggg----gtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 26058558  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  26058557 acggaggaagta 26058546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 162
Target Start/End: Original strand, 41992393 - 41992509
Alignment:
Q  45 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  41992393 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataattaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 41992491  T
Q  145 gcaaattggtcttataaa 162  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  41992492 gcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 44561521 - 44561683
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  44561521 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 44561618  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  44561619 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaag 44561683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 52178013 - 52177797
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgtt--atttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||        ||||||||    
T  52178013 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattggtttatgttt-caacattctctatttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataat 52177916  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||  | | |||||||||| |||        ||||||||| | |  ||||||    
T  52177915 aaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaactag-aaagagatattataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcctataat 52177817  T
Q  199 tagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52177816 tagggacggaggtagtataa 52177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33976691 - 33976548
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaa 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||    
T  33976691 ttactattgcttttataattttatccttt----gagatggatgatttatgttttcaacatgttatttatggctgattgaagaaaaaga-tgtataataaa 33976597  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaat 150  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  33976596 tatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaat 33976548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25879352 - 25879271
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25879352 attactattgtttttacaattttatcttttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 25879271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 47008327 - 47008539
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||        || | |||||    
T  47008327 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 47008424  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||||||||   | |||||||||    
T  47008425 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagtgtcttataatta 47008524  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  47008525 gggacggaggtagta 47008539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15095409 - 15095198
Alignment:
Q  2 ttactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||        || | ||||||    
T  15095409 ttactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataaa 15095312  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattag 201  Q
    || |||||  |  ||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | ||||||||||||    
T  15095311 taagggtagtttggtaaacaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggttttataattag 15095212  T
Q  202 ggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||    
T  15095211 ggacggaggtagta 15095198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36600349 - 36600194
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||        ||||||||||||||||    
T  36600349 attgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattgccgattcaagaaaaaga-tgtataataaataggg 36600252  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
      |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36600251 acatgtatataaagaagtaattaatgtagttgaaaatagcaaataggtgttataaaaa 36600194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 41751011 - 41751091
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41751011 attactattgtttttacaattttatcctttgagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaa 41751091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30819877
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatg 111  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||        |||| |||||||| |||||||    
T  30820079 ttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaaga-tgtaaaataaataagggtatg 30819982  T
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggt 211  Q
    |  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  30819981 ttagtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttatagttagggacggaggt 30819882  T
Q  212 agtat 216  Q
    |||||    
T  30819881 agtat 30819877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 34021820 - 34021986
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  34021820 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 34021917  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  34021918 ataagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaagagac 34021986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41392704 - 41392918
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||         | | | |||    
T  41392704 attactattgtttttacaattatatcctttaagagatagagttggtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatggga-agtaa 41392802  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||| |||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  41392803 ataagggtatgttgataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttacaaaaagggacgaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 41392902  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  41392903 gggacggaggtagtat 41392918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 42526450 - 42526612
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  42526450 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaagaggtgcaaaataa 42526547  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  |||  |||||| |||||||    
T  42526548 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatactaaagaggtcttgtaaaaag 42526612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45404586 - 45404373
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||        || | |||||    
T  45404586 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaaa--tgcaaaataa 45404490  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||| ||||||||||||||||||        || |||||| | | |||||||||    
T  45404489 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatgggtcttataaaaagagacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 45404390  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  45404389 gggacggatgtagtata 45404373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20877813 - 20877683
Alignment:
Q  34 agagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgt 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  20877813 agagagagttagtttacgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgt 20877715  T
Q  134 agctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20877714 agttgaaaatagcaaaaagatcttataaaaag 20877683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 28810946 - 28811107
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  28810946 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 28811043  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   ||||||||||||    
T  28811044 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaa 28811107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 29719536 - 29719701
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  29719536 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 29719633  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagaga 168  Q
    | | ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  29719634 agaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggttttataaaaagaga 29719701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32978692 - 32978533
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||         | |||||||    
T  32978692 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga---attgatttatgttttcaatatgatatttattgttgattaaa-aaaaattatatataata 32978597  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  32978596 aataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaa 32978533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1572537 - 1572332
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |         |||||||| |||| |    
T  1572537 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagt--taatttatgttttccatatgttatttattgttgattggaaaaaaaaaatgtataatgaatatg 1572441  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggac 205  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1572440 ggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 1572341  T
Q  206 ggaggtagt 214  Q
    |||| ||||    
T  1572340 ggagttagt 1572332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 19350201 - 19350282
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19350201 attattattgtttttataaatttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 19350282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 54866486 - 54866405
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54866486 attactattgtttttacaattttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 54866405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9582367 - 9582243
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | |    
T  9582367 tgtaaaataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggt 9582268  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||| ||||||||||    
T  9582267 cttataattagggatggaggtagta 9582243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 162
Target Start/End: Original strand, 46557751 - 46557867
Alignment:
Q  45 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  46557751 gtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 46557849  T
Q  145 gcaaattggtcttataaa 162  Q
    | |||  | |||||||||    
T  46557850 gaaaagggatcttataaa 46557867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29383227 - 29383060
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||||        | || |||||    
T  29383227 attattattgtttttacaattttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttaatattgattgaag-aaaaagatataaaataa 29383129  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  29383128 ataagggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagagac 29383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 39625281 - 39625352
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagttta-tgttttcaacatgttatttatt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39625281 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagtttgtttatttttttcaacatgttatttatt 39625352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 43408552 - 43408716
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  43408552 attagtattgtttttacaattttatc-tttaagagaaag--acgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 43408647  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatt----tatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    || |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43408648 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaag 43408716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 48904088 - 48904301
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  48904088 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 48904185  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        || | |||| | | |||||||||    
T  48904186 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttttttaaaagggtcttataatta 48904285  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  48904286 gggacggaggtagtat 48904301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 13702684 - 13702761
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  13702684 ctattcttttaacaattttatcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgctgattgaag 13702761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20848685 - 20848612
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  20848685 tgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 20848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20849042 - 20848985
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  20849042 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 20848985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 22527457 - 22527608
Alignment:
Q  12 ttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggt-at 110  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||        ||||||||||||||| |  ||    
T  22527457 ttttacaattttatcctt-aagagaaagtgttagtttatgtttccat-atgctatttattgttgattgaagaaaaaaa-tgtataataaataggagccat 22527553  T
Q  111 gtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  22527554 gtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaag 22527608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 42044079 - 42044289
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  42044079 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag---aaaaatgcaaaataa 42044174  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| || ||  || ||| | ||||  | ||||||||||||||||        || | |||| ||| |||||||||    
T  42044175 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaacaccaaaaagatcttataaaaagagacaaattatttttttaaaaggatcttataatta 42044274  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  42044275 gggacggaggtagta 42044289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 54927915 - 54927996
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  54927915 attactattgtttttataattttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 54927996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4564449 - 4564370
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  4564449 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaa 4564370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 7462921 - 7463029
Alignment:
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattag 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7462921 taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattag 7463020  T
Q  202 ggacggagg 210  Q
     ||||||||    
T  7463021 agacggagg 7463029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31533576 - 31533417
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  | |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  31533576 actattatttttacaattttatcctt-aggagagaaagttagtttatgttttctatatgctatttattgcagattgaagaaaaaga-tgtataataaata 31533479  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | |  |||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||| | | ||||||||||||    
T  31533478 gagacatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaattggatcttataaaaag 31533417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8379889 - 8379728
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||        |  | |||||    
T  8379889 attactactgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaagaaaaaaatt-caaaataa 8379792  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  8379791 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgggtcttataaaaa 8379728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38341160 - 38341037
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        |||| |||||    
T  38341160 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagt--taatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgtaaaataa 38341065  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatt 128  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  38341064 ataagggtatgtttgtaaagaattaatt 38341037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 164
Target Start/End: Original strand, 54690581 - 54690652
Alignment:
Q  93 tataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  54690581 tataataaatagaggcatgcatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaa 54690652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Original strand, 18658309 - 18658431
Alignment:
Q  27 ctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgt-aaagaaata 125  Q
    |||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  18658309 ctttaagagatagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaata 18658407  T
Q  126 atttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||| |||||| || ||||||||||    
T  18658408 attaatgtagttggaaatagcaaa 18658431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 39625707 - 39625781
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  39625707 tgtataataaatagagacatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagttttataaaaag 39625781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Original strand, 7886975 - 7887048
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  7886975 tgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 7887048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 55287432 - 55287335
Alignment:
Q  43 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  55287432 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-taaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataattaatgtagttgaaa 55287335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 21497636 - 21497715
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||    
T  21497636 attattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaa 21497715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 35938569 - 35938513
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatg 62  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  35938569 tattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtgtatgttttcaacatg 35938513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12918663 - 12918825
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||||        || | |||||    
T  12918663 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 12918760  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  12918761 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaaggatcttataaaaag 12918825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42755553 - 42755387
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  42755553 attactattgtttttataattttatccttaaa-agagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaa-tgcaaaataa 42755456  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  42755455 ataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaaaggtcttataaaaagagac 42755387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 46879142 - 46879067
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaaga 166  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    |||||||||||||    
T  46879142 tgtatcataaacatgggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaattcttataaaaaga 46879067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 48902536 - 48902614
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  48902536 tactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 48902614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25916503 - 25916450
Alignment:
Q  112 tatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25916503 tatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaatgggtcttataaaaag 25916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31541234 - 31541154
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  31541234 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 31541154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 32969051 - 32969131
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  32969051 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 32969131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 40215054 - 40215134
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||  |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  40215054 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 40215134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 165
Target Start/End: Original strand, 41751383 - 41751456
Alignment:
Q  92 gtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  41751383 gtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaag 41751456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 18658253 - 18658288
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagaga 36  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18658253 attactattgtttttacaattttatcctttaagaga 18658288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 4836518 - 4836596
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  4836518 attactattgtttttacgattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaag 4836596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 28875077 - 28875156
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||| |||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  28875077 attactattgtttttacaattttatc--ttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaag 28875156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 31397988 - 31397950
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagag 39  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31397988 attactattgtttttacaattatatcctttaagagagag 31397950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7886532 - 7886475
Alignment:
Q  92 gtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  7886532 gtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 7886475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 16776571 - 16776628
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaa 58  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  16776571 attattattgtttttacaaatttgtcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaa 16776628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 49544004 - 49544084
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||||||| || ||  |||||| || |||||||||    
T  49544004 attactattggttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaag 49544084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 50460067 - 50460038
Alignment:
Q  115 gtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50460067 gtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 50460038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Original strand, 52693606 - 52693675
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  52693606 aataaataagggtatgttgttaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaag 52693675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 22494485 - 22494544
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 61  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  22494485 attactattatttttacaattttatcc-ttaagagagagagttgatttatgttttcaacat 22494544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25130771 - 25130731
Alignment:
Q  94 ataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgta 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25130771 ataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgta 25130731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 95)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11847784 - 11847570
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  11847784 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 11847686  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        |||| |||| ||| |||||||||    
T  11847685 atagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaaggatcttataatta 11847586  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  11847585 gggacggaggaagtat 11847570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 34915367 - 34915581
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  34915367 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 34915465  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  34915466 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 34915565  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  34915566 gggacggaggtagtat 34915581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25197362 - 25197151
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  25197362 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 25197264  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| ||         ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25197263 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggataaaaaaatttctcaaaaggatcttataattaggg 25197164  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  25197163 acggagggagtat 25197151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33488041 - 33487833
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  33488041 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 33487943  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  33487942 ggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagagac--aaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 33487845  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  33487844 acggagggagta 33487833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30248857 - 30248645
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  30248857 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 30248759  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  30248758 ggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 30248659  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  30248658 acggagggagtata 30248645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 31150072 - 31150285
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  31150072 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 31150168  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||| ||    
T  31150169 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataaata 31150268  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  31150269 gggacggaggtagtata 31150285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8670346 - 8670130
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  8670346 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 8670250  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | | |||||||    
T  8670249 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtctgataatta 8670150  T
Q  201 gggacggaggtagtataagc 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8670149 ggaacggaggtagtataagc 8670130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9342051 - 9341836
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  9342051 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 9341953  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||  |||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  9341952 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 9341853  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  9341852 gggacggaggtagtata 9341836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15498840 - 15498628
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  15498840 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 15498744  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  15498743 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 15498644  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  15498643 gggacggaggtagtat 15498628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 34301659 - 34301869
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  34301659 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 34301757  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  34301758 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 34301857  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  34301858 acggagggagta 34301869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 13647953 - 13648116
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | ||||||||    
T  13647953 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatt-tataataa 13648051  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  13648052 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaag 13648116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 31487195 - 31487399
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  31487195 attactattgtttttacaatttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 31487293  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||  |||||||||||||  |||        ||||||||| | |||||||||||    
T  31487294 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaagaaattctcaaaagggttttataatta 31487393  T
Q  201 gggacg 206  Q
    ||||||    
T  31487394 gggacg 31487399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 287241 - 287451
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||    
T  287241 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaagatgtataataaata 287339  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  287340 ggggcatgtatgtaaagaaataactgatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 287439  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  287440 acggagggagta 287451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 20450005 - 20450168
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  20450005 attactattgttttgacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 20450103  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  20450104 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 20450168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23604675 - 23604458
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||    
T  23604675 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtgtaataa 23604577  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac--nnnnnnnnttctcaaaaagattttataat 198  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||          ||||||||| | | |||||||    
T  23604576 ataagggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaaatttctcaaaagggtcttataat 23604477  T
Q  199 tagggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23604476 tagggacggaggtagtata 23604458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 402447 - 402661
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  402447 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 402543  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  402544 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 402643  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  402644 gggacggaggtagtataa 402661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6147593 - 6147388
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  6147593 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 6147495  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||     
T  6147494 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggaccaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagga 6147395  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  6147394 acggagg 6147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13866806 - 13866593
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  13866806 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagt--tggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 13866710  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttct--caaaaagattttataat 198  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||        ||||  ||||| | | |||||||    
T  13866709 atatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttcttccaaaagggtcttataat 13866610  T
Q  199 tagggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  13866609 tagggacggaggtagta 13866593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5457622 - 5457410
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  5457622 actattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 5457524  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||  ||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  5457523 gaaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 5457424  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  5457423 acggagggagtata 5457410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2090872 - 2090658
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  2090872 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 2090774  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | |||| ||||||| |||         ||||||||| | | ||||||||    
T  2090773 ataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttgtaaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatt 2090674  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  2090673 agggacggaggtagta 2090658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 25045467 - 25045681
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||        ||||||||||    
T  25045467 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 25045565  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  25045566 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 25045665  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  25045666 gggacggaggtagtat 25045681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 9660506 - 9660663
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        |||||||||||||||    
T  9660506 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaa-tgtataataaatagg 9660604  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  9660605 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 9660663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17227352 - 17227561
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  17227352 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 17227450  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  17227451 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagaaaataggtcttataaaaagggac-aaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 17227549  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||    
T  17227550 gggacggaggta 17227561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 1147093 - 1147254
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  1147093 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 1147189  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  1147190 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaag 1147254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 12105891 - 12106095
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  12105891 actattatttttacaattttattctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 12105989  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  12105990 ggggcgtgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 12106089  T
Q  204 acggag 209  Q
    ||||||    
T  12106090 acggag 12106095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 23397967 - 23398126
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  23397967 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 23398064  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23398065 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 23398126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 25024333 - 25024493
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  25024333 actattgtttttacatttttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 25024431  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  25024432 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggatcttataaaaag 25024493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15966986 - 15967198
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  15966986 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 15967084  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||  |||        |||||||||  |  |||||||||    
T  15967085 ataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaatgacaaaaaaaattctcaaaagaa--ttataatta 15967182  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  15967183 gggacggaggtagtat 15967198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 1729928 - 1730138
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  1729928 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 1730024  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  1730025 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaatt-tcaaaaggatcttataatta 1730123  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  1730124 gggacggagggagta 1730138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7772389 - 7772175
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  7772389 attactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 7772291  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||  |||        |||||||||   | |||||||||    
T  7772290 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataatta 7772191  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7772190 gggacggaggtagtat 7772175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31091656 - 31091445
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||| | |    
T  31091656 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaatatgtatattta 31091560  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  31091559 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 31091460  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  31091459 gggacggaggtagta 31091445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 925759 - 925970
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  925759 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga---attgttttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataata 925854  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||    
T  925855 aataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatt 925954  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  925955 aggaacggagggagta 925970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 9388617 - 9388829
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  9388617 actattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaat 9388715  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | |||||||||||    
T  9388716 atgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagg 9388815  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    |||||||| |||||    
T  9388816 gacggagggagtat 9388829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34126352 - 34126191
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  34126352 attactattgtttttacaattttatcttttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataataa 34126256  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||||    
T  34126255 ataggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagccttataaaaag 34126191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34741675 - 34741516
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  34741675 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 34741578  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34741577 ggggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaag 34741516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16122467 - 16122304
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  16122467 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 16122369  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  16122368 atagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 16122304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 13010947 - 13011157
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        |||||||||||||    
T  13010947 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgcttattgaag-aaaaagatgtataataaata 13011045  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||  || |||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  13011046 ggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagcgacaaaaaattttctcaaaaggatcttataattaagg 13011145  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||    
T  13011146 acggaggtagta 13011157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 230934 - 231142
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||        |||||||||||||    
T  230934 actattgtttttacaattttatcttttaagaaataaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgactgaag-aaaaagatgtataataaata 231032  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  231033 cgggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaa-tggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 231130  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  231131 acggagggagta 231142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 13690556 - 13690768
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | | ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  13690556 attactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatcattatatttattgctgattcaagaaaaaga-tgtataataa 13690654  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  13690655 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaataagtcttataaaaagggacaaattttttt-tcaaaaggatcttataatta 13690753  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    || ||||||||||||    
T  13690754 ggaacggaggtagta 13690768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33773792 - 33773628
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||        ||||||||    
T  33773792 attactattgtttttacaattttatcatttaagagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaaga-tgtataat 33773694  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||||    
T  33773693 aaatagggatatgtatgtagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtattataaaaa 33773628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 19097627 - 19097787
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  19097627 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 19097723  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  19097724 ataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 19097787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 10195821 - 10195978
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        | |||||||||||    
T  10195821 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaaaatatataataaata 10195919  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaa 162  Q
      || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||    
T  10195920 atggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 10195978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 5576207 - 5576348
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  5576207 actattatttttacaattttatcctttaagtgagagt--tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 5576303  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaa 148  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5576304 gggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaa 5576348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12143986 - 12143829
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||        ||||||||||||||    
T  12143986 ctattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaatta-tgtataataaatag 12143890  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12143889 gggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagcaaaggggttttataaaaag 12143829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19418948 - 19419111
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||         |||| |||||    
T  19418948 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa-aaaagagatgtacaataa 19419046  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | ||||||||||||    
T  19419047 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaag 19419111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 204
Target Start/End: Original strand, 1779876 - 1780070
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||    
T  1779876 ttgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaata-tgtataataaatagggg 1779973  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggga 204  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1779974 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggga 1780070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 15355379 - 15355541
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||        ||||||||||    
T  15355379 attaccattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaag-aaaaaaatgtataataa 15355477  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  15355478 ataagggcatgtatgtaaag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 15355541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 345071 - 344914
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  345071 tattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaatagg 344974  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  344973 gacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 344914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8743396 - 8743188
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  8743396 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 8743299  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  8743298 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 8743200  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  8743199 acggagggagta 8743188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 23578250 - 23578413
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||        | ||||||||    
T  23578250 attagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatttttgattaaag-aaaaagatatataataa 23578348  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||   ||||||||||||    
T  23578349 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttgaaaataacaaatgaatcttataaaaag 23578413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 390534 - 390373
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  390534 attagtattgtttttacaattttatt-tttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataatta 390438  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  390437 atatgggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagatgtcttataaaaag 390373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 345574 - 345717
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||        |||||||||||||    
T  345574 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctggttgaag-aaagagatgtataataaata 345671  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    || | ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||    
T  345672 ggcgcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaaa 345717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 17175292 - 17175452
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  | | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  17175292 actattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaagttggtttatgttttgaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaata 17175390  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| | || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  17175391 ggggcatgtatataaagaaataattaatgttgttggaaataacaaatggatcttataaaaag 17175452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6418477 - 6418690
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  6418477 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 6418574  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  6418575 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaaggatcttataatta 6418674  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    | ||||| ||||||||    
T  6418675 gagacgggggtagtat 6418690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 9299254 - 9299411
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  9299254 attactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataa 9299352  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttata 160  Q
    ||| |||||||  || |||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||    
T  9299353 ataagggtatg-ctggaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttata 9299411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20373246 - 20373167
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373246 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 20373167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 235966 - 235825
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |         |||||||||||||    
T  235966 actattgtttttacaattttgtcatttaagagaaatat-tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgga---aaaaaatgtataataaata 235871  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  235870 ggggtatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaa 235825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 31711674 - 31711836
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||||| |    
T  31711674 attagtattgtatttacaattttattctttaagagagag--atgatttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatatataatta 31711770  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaaga 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||  | |||||||||||||    
T  31711771 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaga 31711836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32615199 - 32614989
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  32615199 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaataa 32615103  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  || ||||||||||| ||         ||||||||| | | |||||||||    
T  32615102 ataggggtatggttgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgggacttataaaaaggga-taaaaaaattctcaaaaggttcttataatta 32615004  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  32615003 gggacggaggtagta 32614989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 11656174 - 11656333
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctt-taagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | | |||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||        |||||||||||||     
T  11656174 tattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaaga-tgtataataaataa 11656272  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11656273 aagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 11656333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13901850 - 13901640
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||        |||| |||||||    
T  13901850 tactattgtttttacatttttatcctttaagagaaagagttagtttatgttttcgaaatgatatttcttgttgattgaag-aaaaatatgtaaaataaat 13901752  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| || ||  || ||||| ||||  |||||| |||||||||||        ||||||||| | | |||||||||||    
T  13901751 atgggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaaggggtcttgtaaaaagagac--acaaaattctcaaaagggtcttataattagg 13901654  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||    
T  13901653 gacggaggtagtat 13901640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 22852158 - 22852368
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||  | ||  ||||||||||||||||||         ||||||| |||||    
T  22852158 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatatttttcatatactatttattgctgattgaaaaaaaaaaatgtataacaaata 22852256  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||         ||| |||| | | ||||||||||||    
T  22852257 gggacatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaaatcttaaaatggtcttataattaggg 22852356  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||    
T  22852357 acggaggtagta 22852368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 17952186 - 17952316
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  17952186 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 17952284  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    |||  ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  17952285 gggacatgtatgtaaaaaaatatttaatgtag 17952316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3177388 - 3177232
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||   ||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  3177388 actattttttttacaattttatcctt-aagagagagt--tagttcatattttccatatgatatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 3177293  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||  | |||||||||||    
T  3177292 ggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagggatcttataaaaa 3177232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 16272792 - 16272953
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||   |  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  16272792 attagtattatttttacaattttatcctttaacaaagagt--tgatttttgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 16272888  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| |||||||    
T  16272889 ataggggcatgtatgtaaagaaataattgatgtagttggaaatagcaaaggggtcttttaaaaag 16272953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8175865 - 8175750
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  8175865 actattgtttttacaattttatccttcaagagagagagttagtttatgttttccatatactatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 8175767  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaag 120  Q
    |||  ||||||||||||    
T  8175766 gggacatgtatgtaaag 8175750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15287346 - 15287190
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || | |||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        | |||||||||||     
T  15287346 ctattgtttttacaattttatcctt-aatatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatatataataaata- 15287250  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||    
T  15287249 ggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 15287190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15126673 - 15126530
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnn-tgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||   |||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||         | ||||||||||    
T  15126673 actattgtttttacaatttcatccttta---gagagaattggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgtagaaaaaaaaatctataataaat 15126577  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  15126576 aggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagcaaa 15126530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 18106003 - 18106162
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||     
T  18106003 ttgtttttacaattttatcctt-aagagagaaagttagttcatattttccatatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataacaaataggga 18106100  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
      || |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  18106101 cgtgcatgtaaagaaataattaatgtacttggaaataacaaaagggtcttataaaaagagac 18106162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11162065 - 11161850
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | ||||    
T  11162065 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaata 11161967  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||| ||||| ||  |||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||    
T  11161966 aataagggtacgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaaaagggtcttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggctcttataatt 11161867  T
Q  200 agggacggaggtagtat 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  11161866 aaggacggaggtagtat 11161850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26211102 - 26211032
Alignment:
Q  11 tttttacaattttaccctttaagagagagggat--agtttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 79  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26211102 tttttacaattttatcctttaagagaaagagatttagtttatgttttcaacatgttatttattactgattg 26211032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11104696 - 11104638
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  11104696 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 11104638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22998870 - 22999085
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  22998870 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 22998967  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||  || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||| ||    
T  22998968 ataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataacta 22999067  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22999068 gggacggaggtagtataa 22999085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23789534 - 23789319
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  23789534 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 23789437  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||  || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||| ||    
T  23789436 ataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataacta 23789337  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23789336 gggacggaggtagtataa 23789319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29036249 - 29036126
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| |||    
T  29036249 tgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaggat 29036151  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||    
T  29036150 cttataattaggaacggagggagta 29036126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11200806 - 11200593
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  11200806 attactattgattttacaattgtatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 11200709  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||  || ||||| |||   ||| |||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  11200708 ataagggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaacagggttttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggctcttataatta 11200609  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11200608 gggacggaggtagtat 11200593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9038852 - 9038642
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  9038852 attactattgtttttataattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag---aaaaatgcaaaataa 9038757  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  9038756 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaatgattttttcaaaagggtcttataatta 9038657  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  9038656 gggacggagggagta 9038642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11104764 - 11104699
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttat 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||| ||||||||||    
T  11104764 attactattgtttttacaattttatcatttaagagagagaattggtttatgttttaaacatgttat 11104699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27581598 - 27581518
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  27581598 attactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 27581518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 2746368 - 2746448
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  2746368 attattattgtttttacaaatttatcctttaagagagagaattagcttatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaa 2746448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22710476 - 22710316
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  22710476 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 22710381  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  22710380 ataagggtattttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaag 22710316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4175454 - 4175292
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  4175454 attactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 4175357  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4175356 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtatttggaaatatcaaagaggtcttataaaaag 4175292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6418080 - 6417925
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||        ||||| |||||||    
T  6418080 actattggttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtatgataaata 6417983  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |    | | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  6417982 g----aggcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 6417925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11840541 - 11840502
Alignment:
Q  43 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11840541 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 11840502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4823181 - 4823103
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4823181 attactattgtttttataattttatcctt-aagagagagt--taatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 4823103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 6840100 - 6840175
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |   || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6840100 ctattgtttttacaattttatcctataagagagtgt--taatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaag 6840175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 28980680 - 28980762
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  28980680 attactattgtttttacaattttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 28980762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Original strand, 8637193 - 8637306
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttat 195  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| || ||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||        ||||||||| | | ||||    
T  8637193 aataaataagggtatgttagtaaagaaatgattaatatacttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaaagacaattatttttctcaaaagggtcttat 8637292  T
Q  196 aattagggacggag 209  Q
    ||||||||||||||    
T  8637293 aattagggacggag 8637306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 33012490 - 33012570
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  33012490 attaatattgtttttacaattttgtc-tttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 33012570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 8217546 - 8217705
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  8217546 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 8217641  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| || |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||   ||||||||||||    
T  8217642 ataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagtcttataaaaa 8217705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17545429 - 17545390
Alignment:
Q  43 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17545429 tagtttttgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 17545390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8345339 - 8345286
Alignment:
Q  116 taaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  8345339 taaagaaataattaatgtatttgaaaatatcaaattagtcttataataagagac 8345286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13208870 - 13208833
Alignment:
Q  182 caaaaagattttataattagggacggaggtagtataag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13208870 caaaaagatcttataattagggaaggaggtagtataag 13208833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 493510 - 493585
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||    
T  493510 tattgattttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttaatgttgattgaag 493585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 28236028 - 28236107
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  28236028 attactattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 28236107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9250 - 9464
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  9250 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataa 9348  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||    
T  9349 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataatta 9448  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  9449 gggacggaggtagtat 9464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 176)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36695067 - 36694854
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  36695067 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 36694969  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  36694968 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 36694869  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  36694868 gggacggagggagta 36694854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36711168 - 36710955
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  36711168 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 36711070  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  36711069 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 36710970  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  36710969 gggacggagggagta 36710955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 52431001 - 52431214
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  52431001 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 52431099  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  52431100 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 52431199  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  52431200 acggagggagtataa 52431214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15290147 - 15289984
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  15290147 attactattgtttttacaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 15290049  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15290048 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 15289984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 5765815 - 5766028
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  5765815 attactattgtttttacaattttctcctt-aagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 5765912  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||         ||| ||||| | | |||||||||    
T  5765913 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataacaagagataaaaaaaattcacaaaagggtcttataatta 5766012  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  5766013 gggacggaggtagtat 5766028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 9413151 - 9413366
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  9413151 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 9413247  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  9413248 ataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 9413347  T
Q  201 gggacggaggtagtataag 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9413348 gggacggaggtagtataag 9413366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14347335 - 14347174
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  14347335 attactattatttttacaattttatcctttaagagggagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 14347237  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  14347236 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggttttataaaa 14347174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 11907055 - 11907215
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  11907055 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 11907153  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  11907154 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 11907215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 50008310 - 50008522
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  50008310 actattatttttgcaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 50008408  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | ||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  50008409 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaatgatcttataattaggg 50008508  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  50008509 acggagggagtata 50008522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11741607 - 11741396
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  11741607 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatcttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 11741509  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  11741508 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 11741409  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  11741408 acggagggagtat 11741396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28052402 - 28052239
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||    
T  28052402 attactattgtttttataattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggag-aaaaagatgtataataa 28052304  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28052303 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaag 28052239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 45285634 - 45285848
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  45285634 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 45285732  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  || |||||||||| |||        |||||||||   | |||||||||    
T  45285733 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaataagttttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagagtcttataatta 45285832  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  45285833 gggacggaggtggtat 45285848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 4102540 - 4102753
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||| |    
T  4102540 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 4102636  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  4102637 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 4102736  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  4102737 gggacggagggagtata 4102753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52602202 - 52601989
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||| |    
T  52602202 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 52602106  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        |||| |||| | | |||||||||    
T  52602105 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataatta 52602006  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  52602005 gggacggagggagtata 52601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6089946 - 6089734
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  6089946 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 6089850  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  6089849 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 6089750  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  6089749 gagacggaggtagtat 6089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 14090076 - 14090223
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  14090076 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtaatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 14090174  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  14090175 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 14090223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 42275984 - 42276199
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  42275984 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 42276082  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||         ||||||||| | | ||||||||    
T  42276083 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaatttttttctcaaaagggtcttataatt 42276182  T
Q  200 agggacggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  42276183 agggacggaggtagtat 42276199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34931290 - 34931079
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  34931290 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagt--tggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 34931194  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  34931193 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 34931094  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    || ||||||||||||    
T  34931093 ggaacggaggtagta 34931079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 50246757 - 50246967
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  50246757 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 50246855  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||| ||||        ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  50246856 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaatagac-aaaaaaattctcaaaaggatcttataattacgg 50246954  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  50246955 acggagggagtat 50246967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24855494 - 24855281
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  24855494 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 24855396  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  24855395 ataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataatta 24855296  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  24855295 gggacggatgtagta 24855281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38261553 - 38261340
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  38261553 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 38261455  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  38261454 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 38261355  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||    
T  38261354 aggacggaggtagta 38261340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50937991 - 50937778
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  50937991 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataataa 50937893  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||||  |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  50937892 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaaggac-aaaaaaattctcaaaatggtcttataatta 50937794  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  50937793 gggacggaggtagtat 50937778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 27530427 - 27530589
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||    
T  27530427 attagtattgcttttacaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa--aaaaagatgtataataa 27530524  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  27530525 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaag 27530589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39324738 - 39324527
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||||||     
T  39324738 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgaataatag 39324640  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||| | ||        |||||||||  ||||||||||||    
T  39324639 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaaatac--aaaaaattctcaaaagaattttataatta 39324542  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  39324541 gggacggaagtagta 39324527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 47300720 - 47300880
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  47300720 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 47300818  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  47300819 ggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtctcataaaaag 47300880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27037479 - 27037268
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  27037479 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 27037381  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  27037380 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 27037281  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||||    
T  27037280 acggaggtagtat 27037268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31238930 - 31238722
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||    
T  31238930 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaag-aaaaagatgtataataa 31238834  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||  | | |||||||||    
T  31238833 acaggggcatgtatgtaaagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaacgggtcttataatta 31238734  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
    ||||||||||||    
T  31238733 gggacggaggta 31238722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 39873509 - 39873672
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  39873509 attattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 39873607  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  39873608 atagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaag 39873672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 40614731 - 40614891
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  40614731 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 40614827  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  40614828 ataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40614891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 41855299 - 41855503
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  41855299 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 41855395  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  41855396 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 41855495  T
Q  201 gggacgga 208  Q
    ||||||||    
T  41855496 gggacgga 41855503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16456846 - 16456636
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  16456846 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataaata 16456748  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | ||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||  |||||||||||||| |||        |||||| || | | ||||||||||||    
T  16456747 ggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacagaaaaatttctcagaagggtcttataattaggg 16456648  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  16456647 acggagggagta 16456636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30290475 - 30290265
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  30290475 actattgtttttacaattttatccttttagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 30290377  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  30290376 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggg 30290277  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  30290276 acggagggagta 30290265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 46075695 - 46075904
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||||||||    
T  46075695 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt-aag-aaaaagatgtataataaata 46075792  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  46075793 ggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattaggg 46075892  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  46075893 acggagggagta 46075904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49907231 - 49907021
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  49907231 actattgttttaacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttattttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 49907133  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  49907132 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 49907033  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  49907032 acggagggagta 49907021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 51811089 - 51810927
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||| |||    
T  51811089 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttatgttttcaacatgttattgattgctgattgaag-aaaaagatgtatagtaa 51810991  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||| |||||    
T  51810990 ataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctgaaaatggaaaataagtcttacaaaaa 51810927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8472259 - 8472049
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| | |    
T  8472259 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagatga----tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagtta 8472164  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  8472163 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 8472064  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  8472063 gggacggaagtagta 8472049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12814612 - 12814824
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||| |    
T  12814612 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttactgttgattgaag-aaaaagatgtataat-a 12814709  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  12814710 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagtgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataatta 12814809  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
     ||||||||||||||    
T  12814810 tggacggaggtagta 12814824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45794554 - 45794349
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  45794554 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 45794456  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | || |||||||||    
T  45794455 ggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttctaattaggg 45794356  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  45794355 acggagg 45794349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 16575919 - 16576079
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  16575919 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 16576017  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| || ||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16576018 ggggcatatatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 16576079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19792688 - 19792849
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  19792688 attactattgtttttacaattttatcctttaagataaag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 19792784  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  19792785 atagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaag 19792849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 42872161 - 42872321
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  42872161 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 42872259  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||   ||||||||||||||    
T  42872260 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaag 42872321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 9202333 - 9202491
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  9202333 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaata 9202430  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  9202431 ggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 9202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15616342 - 15616133
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatag 104  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||        ||||||| ||||||    
T  15616342 attgtttttacaattttatc-tttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattaaaggaaaaatatgtataaaaaatag 15616244  T
Q  105 gggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||        |||||||||| || |||||||||||||    
T  15616243 gggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaattgatcttataaaaatggac-acaaaaattctcaaaaaaatcttataattaggga 15616145  T
Q  205 cggaggtagtat 216  Q
    |||| |||||||    
T  15616144 cggaagtagtat 15616133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 27575461 - 27575624
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  27575461 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 27575559  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  | ||||||||||||    
T  27575560 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaag 27575624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34503449 - 34503287
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  34503449 attactattgcttttataattttatcttttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa-aaaaaaaatgtataataa 34503351  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||   |||||||||||    
T  34503350 atatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaa 34503287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 36674122 - 36674285
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  36674122 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 36674220  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||  ||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  36674221 atagggacatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttaaaaatagcaaaaggatcttataaaaag 36674285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41317805 - 41317593
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| | |    
T  41317805 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtatattta 41317709  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttc-tcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||| |||||| | | ||||||||    
T  41317708 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttcttcaaaagggtcttataatt 41317609  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  41317608 agggacggaggtagta 41317593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45039621 - 45039411
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  45039621 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 45039524  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  45039523 agggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 45039424  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  45039423 acggagggagtat 45039411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 943464 - 943674
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  943464 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 943562  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||   ||||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  943563 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaggagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 943662  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  943663 acggagggagta 943674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15100575 - 15100354
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag------tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgta 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  15100575 attactattatttttacaattttatcctttaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaa-tgta 15100477  T
Q  95 taataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagatttta 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||    
T  15100476 taataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatctta 15100377  T
Q  195 taattagggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||| | |||| |||||||    
T  15100376 taattaggaaaggagctagtata 15100354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 15811060 - 15811269
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  15811060 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 15811157  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  15811158 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 15811257  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  15811258 acggagggagta 15811269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 21630930 - 21631144
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttacccttt-aagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||    
T  21630930 attactattgtttttacaaatttatccttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaag-aaaaagatgtataata 21631028  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        |  |||||| | | ||||||||    
T  21631029 aataggggcatgtatgtagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttgtttcttcaaaagggtcttataatt 21631128  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  21631129 agggacggaggtagta 21631144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23542188 - 23541979
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  23542188 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 23542091  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  23542090 ggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 23541991  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  23541990 acggagggagta 23541979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 229232 - 229449
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  229232 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 229328  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtct--tataaaaagagac-nnnnnnnnttctcaaaaagattttataa 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||         ||||||||| ||||||||||    
T  229329 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttatataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaaggattttataa 229428  T
Q  198 ttagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  229429 ttaggaacggaggtagtataa 229449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2280163 - 2279952
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  2280163 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 2280065  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaa-gattttataattagg 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||| ||||||||| |||        |||||||||| | | |||||||||||    
T  2280064 ggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtc-tataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaagggtcttataattagg 2279966  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    |||||||| |||||    
T  2279965 gacggaggaagtat 2279952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25509419 - 25509206
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  25509419 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataatta 25509323  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  25509322 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 25509224  T
Q  201 gggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25509223 gggacggaggtagtataa 25509206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 38530976 - 38531137
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  38530976 attaatattgtttttataattttatcctttaagagggag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 38531072  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  38531073 ataggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttataaaaag 38531137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 39750209 - 39750368
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  39750209 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 39750306  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  39750307 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 39750368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50008183 - 50008020
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  50008183 actattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaa--tgtataataaata 50008086  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  50008085 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagagac 50008020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 51422251 - 51422414
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||    
T  51422251 attattattgtttttacaattttatgctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaag-gaaaagatgtataataa 51422349  T
Q  101 atagggg--tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||    
T  51422350 ataggggcatatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 51422414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 8104117 - 8104275
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        |||||||||||||    
T  8104117 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaata 8104215  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||    
T  8104216 ggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-cggtcttataaaaa 8104275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 1767694 - 1767849
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||||    
T  1767694 attgtttttacaattttatcatttaagagagaa--atggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataattaataggg 1767790  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1767791 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 1767849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 9378925 - 9379094
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggata--gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  9378925 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagagtcggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataat 9379023  T
Q  99 aaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  9379024 aagtagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagagac 9379094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23530758 - 23530596
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  23530758 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 23530660  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||    
T  23530659 ataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 23530596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26550002 - 26549843
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  26550002 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--attgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 26549906  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  26549905 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgggtcttaaaaaa 26549843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 30289690 - 30289894
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  30289690 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 30289787  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  30289788 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 30289887  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  30289888 acggagg 30289894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 48067719 - 48067932
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  48067719 attactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataa 48067817  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  48067818 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataatta 48067917  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    | |||||||||||||    
T  48067918 gagacggaggtagta 48067932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 896876 - 897008
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  896876 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 896974  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgta 134  Q
    |||| || ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  896975 atagaggcatgcatgtaaacaaataattaatgta 897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 2489226 - 2489437
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||    
T  2489226 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgta-aaaaaagatgtataataa 2489322  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        || |||||| | |||||||||||    
T  2489323 atatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaaagttcttataaaaagggacaaaaaaattt-tcaaaagggttttataatta 2489421  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||||| |||||||||    
T  2489422 gggacgaaggtagtat 2489437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3934818 - 3934606
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  3934818 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 3934720  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    |||||   |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| | |        || |||||| ||| |||||||||    
T  3934719 ataggaacatgtatctaaacaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaaggggc-aaaaaaattatcaaaaggatcttataatta 3934621  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  3934620 gggacggaggtagta 3934606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 43395497 - 43395642
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  43395497 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataatta 43395593  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  43395594 atagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 43395642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 31086747 - 31086894
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  31086747 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattgatttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataa 31086845  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  31086846 agaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 31086894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 37951781 - 37951987
Alignment:
Q  8 ttgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagggg 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||    
T  37951781 ttgtttttacaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaata-tgtataataaatagggg 37951878  T
Q  108 tatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacgg 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  37951879 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgg 37951978  T
Q  208 aggtagtat 216  Q
    ||| |||||    
T  37951979 agggagtat 37951987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 28888247 - 28888409
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  28888247 attactattgtttttacaattttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 28888345  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||| |||||    
T  28888346 ataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaa 28888409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 39363022 - 39363231
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  39363022 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 39363119  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  39363120 ggggcgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 39363219  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  39363220 acggagggagta 39363231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44649838 - 44649629
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  44649838 actattgtttttacaattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataataaata 44649741  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  44649740 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 44649641  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  44649640 acggagggagta 44649629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7763576 - 7763787
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||        |  ||||| |    
T  7763576 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagatt--ataatta 7763671  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  7763672 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 7763771  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7763772 gggacggaggtagtat 7763787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 32169782 - 32169986
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  32169782 actattgtttttacaattttattctttaagaaagaaggtta-tttatattttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 32169879  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||| ||    
T  32169880 ggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaagg 32169979  T
Q  204 acggagg 210  Q
    |||||||    
T  32169980 acggagg 32169986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3549233 - 3549032
Alignment:
Q  11 tttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtat 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |   ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||| |||||||| ||    
T  3549233 tttttacaattttatcctttaagagataa--atgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataattaataggggcat 3549137  T
Q  111 gtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggagg 210  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  3549136 gtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaatttattttttcaaaaggatcttataattagagacggagg 3549037  T
Q  211 tagta 215  Q
    |||||    
T  3549036 tagta 3549032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 8923494 - 8923655
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  8923494 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 8923590  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||    
T  8923591 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaag 8923655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 11352908 - 11353051
Alignment:
Q  21 tttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaag 120  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11352908 tttatcctttaagagagggagttagtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaa-aaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaa 11353006  T
Q  121 aaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     ||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  11353007 taataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 11353051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 15892388 - 15892551
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||         ||||||||||    
T  15892388 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacattctatttattactgattgaa-aaaaaagatgtataataa 15892486  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||    
T  15892487 ataggagcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaag 15892551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25271401 - 25271257
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||    
T  25271401 attactattgtttttacaattttat--tttaagagagaggaatggtttatgttatcaacatgtta-ttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 25271306  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  25271305 ataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaa 25271257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 28885927 - 28886143
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||| | ||||    
T  28885927 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtttcataa 28886025  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttc-tcaaaaagattttataatt 199  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||  |||||| |||||| |||         || |||||| | | ||||||||    
T  28886026 ataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttacaaaaagggacaattttttctcttcaaaatggtcttataatt 28886125  T
Q  200 agggacggaggtagtata 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28886126 agggacggaggtagtata 28886143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44646480 - 44646321
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  44646480 actattgtttttacaattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 44646383  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  44646382 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 44646321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7784202 - 7783991
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  7784202 actattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaag-aaaaatatgtataataaat 7784104  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||| |||        ||||||||| | | |||||||||||    
T  7784103 agaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattagg 7784004  T
Q  203 gacggaggtagta 215  Q
    |||||||| ||||    
T  7784003 gacggagggagta 7783991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38613688 - 38613525
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  38613688 attactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaag-aaaaatatgtataataa 38613590  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||  |||  ||||||||||||||    
T  38613589 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttataaaaag 38613525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39497642 - 39497432
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  39497642 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagatagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 39497545  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     | | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  39497544 agagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 39497445  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  39497444 acggagggagtat 39497432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 43668226 - 43668373
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||    
T  43668226 attactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgatg-aaaaagatgtataataa 43668324  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  43668325 atagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaa 43668373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 1039209 - 1039418
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||        |||||||||||||    
T  1039209 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 1039306  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  1039307 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 1039406  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  1039407 acggagggagta 1039418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 1046115 - 1046324
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||        |||||||||||||    
T  1046115 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 1046212  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  1046213 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 1046312  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  1046313 acggagggagta 1046324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 10383869 - 10384030
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttacccttta-agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||        | ||||||||||    
T  10383869 actattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattactaattgaagaaaaaga-tatataataaat 10383967  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  10383968 aggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 10384030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25284019 - 25283938
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25284019 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 25283938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31465875 - 31465746
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||||||    
T  31465875 actaatgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattaaag-aaaaagatgtataataaata 31465777  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgta 134  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  31465776 ggggtatgtatgtaaaggaatagttaatgta 31465746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37585164 - 37585034
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||||||||||    
T  37585164 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataa 37585068  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgta 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37585067 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 37585034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 1048080 - 1048239
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  1048080 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaa-tgtataataaata 1048177  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||    
T  1048178 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaag 1048239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13343986 - 13343778
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||        |||| |||||    
T  13343986 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaag-aaaaagatgtacaataa 13343888  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||  |||||||||||||  ||        ||||||||| | | |||||||||    
T  13343887 ataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagaaaataagtcttataaaaaggaacaaaaaatattctcaaaagggtcttataatta 13343788  T
Q  201 gggacggagg 210  Q
    ||||||||||    
T  13343787 gggacggagg 13343778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25228409 - 25228285
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  25228409 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 25228311  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataa 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25228310 ataggggcatgtatgtaaagaaataa 25228285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Original strand, 35984490 - 35984689
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  35984490 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 35984587  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||  | | |||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35984588 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttaaaaataacaaagggattttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 35984687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48854029 - 48853868
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||        |||||||| |    
T  48854029 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--atggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaaga-tgtataatta 48853933  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  48853932 ataggggcatgtatgtaaagaaagaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 48853868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9715573 - 9715430
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  9715573 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 9715475  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  9715474 attggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 9715430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15763528 - 15763365
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||        ||||||||||    
T  15763528 attactattgtttttaaaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattactgactgaag-aaaaaaatgtataataa 15763430  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| | | ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  15763429 atatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaag 15763365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37589153 - 37588948
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  37589153 attaatattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattccatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataa 37589055  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| || ||| |||||||| |||         |||||||||||| |||||||||    
T  37589054 ata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag-aaaatgatctaataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaaagatcttataatta 37588957  T
Q  201 gggacggag 209  Q
    || ||||||    
T  37588956 ggaacggag 37588948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 45038187 - 45038400
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | | | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  45038187 attactattgtttttacaattttatcatttaagaaagagagttggctaatgttttcaacattctatttattgctgattgaa--aaaaaaatgtataataa 45038284  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | |  ||||||||| |||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  45038285 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagaataggggtcttatagaaagggacaaaaaattttctcaaaagggtcttataatta 45038384  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    | |||||| |||||||    
T  45038385 gcgacggatgtagtat 45038400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 44454651 - 44454732
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44454651 attactattgattttacaattttatcctttaagagagatggatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgatagaag 44454732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 149
Target Start/End: Original strand, 7212388 - 7212530
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||        |||||||||||||      
T  7212388 tattgtttttataattttatcctttatgaaagatggttagtttatgttttcaacatgatatttattgttcattcaag-aaaaatatgtataataaataaa 7212486  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  7212487 ggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 7212530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14171742 - 14171611
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  14171742 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag-aaaattatgtataataa 14171646  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  14171645 ataggggcatgcatgtaaaaaaataattaatgtag 14171611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15111798 - 15111631
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtt----tatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtata 96  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||     
T  15111798 attactattaattttacaattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtatg 15111700  T
Q  97 ataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  15111699 ataaatatggacatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaag 15111631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18237301 - 18237093
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  18237301 actattgtttttacaattctatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 18237204  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |  | |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||        |||||||||   | ||||||||||||    
T  18237203 gaagcatgtatgtaaagaaataagtaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac--aaaaaattctcaaaagagtcttataattaggg 18237106  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||||    
T  18237105 acggaggtagtat 18237093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 43456449 - 43456658
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||        |||||||||||||    
T  43456449 actattgtttttacaattttatcc-ttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgcaattttttgctgattgaag-aaaaagatgtataataaata 43456546  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| | ||||||||| |||||| | |||||| || |||||||||||   |||||||||| | |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  43456547 ggggcaggtatgtaaataaataactaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaacgggaccaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 43456646  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||    
T  43456647 acggaggtagta 43456658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48023028 - 48022906
Alignment:
Q  93 tataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattt 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||| || |||||||||||| |||        ||||||||||| ||     
T  48023028 tataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaatgatcttataaaaagggacatatttttttctcaaaaaggttc 48022929  T
Q  193 tataattagggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48022928 tataattagggacggaggtagta 48022906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 32149135 - 32149216
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32149135 attactattgtttttacaattttatcttttaaaatagagagttagtttatgttttgaacatgttatttattgctgattgaag 32149216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 44529499 - 44529577
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44529499 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaa 44529577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 9700578 - 9700737
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  9700578 actattgattttacaattttatccttta-gaaagagagatagtttatattttcaacatgctatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataaata 9700675  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  || ||||||||||||||||| || ||  || ||||| |||   ||||||||||||||    
T  9700676 gggacatatatgtaaagaaataattaatttaattggaaataacaaggaggtcttataaaaag 9700737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10433531 - 10433370
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||    
T  10433531 actattgtttttacaattttattctt-aagagagagagaattagtatatattttcaacatgttatttattgctgattgaa-taaaaagatgtataataaa 10433434  T
Q  102 taggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    || ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||    
T  10433433 tatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatgagtcttataaaaag 10433370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26544715 - 26544554
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        ||||||||      
T  26544715 attagtattgtttttacaattttatcctttatgagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaaga-tgtataattt 26544619  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  26544618 ataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaatagaaaagaggtcttataaaaag 26544554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 27974980 - 27975127
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggg-atagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |    
T  27974980 attactattgtttttacaattttattttttaagagagagagtata-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataaca 27975077  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    |||| | | ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  27975078 aatatgtgcatgtatgtaaataaataattaatgcagttgaaaataacaaa 27975127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 36880450 - 36880577
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  36880450 actattgtatttacaattttatcctttaagaaat---gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 36880545  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  36880546 ggggcatatatgtaaagaaataattaatgtag 36880577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 39425655 - 39425817
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  39425655 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaatgatgcaaaataa 39425752  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  39425753 ataagggtatgttggtaatgaaataatttatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaag 39425817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 47263667 - 47263506
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnn---tgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||           ||||||||||    
T  47263667 actattgtttttacaattttatcctt-aagattgagagttagtttatgtttttcatatgttatt-attgctgattgaagaaaaagatgtatgtataataa 47263570  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||    
T  47263569 atagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaa 47263506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4592788 - 4592628
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||        |||||||||||||    
T  4592788 actattgtttttataattttatcctataagagatagagttagtttatgttttcaacatattatttattgctagttgaag-aaaaagatgtataataaata 4592690  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
     ||  |||||||||||| |||| || |||||  |||||||| ||||   |||||||||||||    
T  4592689 tggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtacttgaaaatatcaaaggtgtcttataaaaag 4592628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45336095 - 45335936
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||         ||||||||||||     
T  45336095 actattgttcttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaa-aaaaaaaatgtataataaatg 45335997  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |  | |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||    
T  45335996 gaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggggtcttataaaaa 45335936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47068997 - 47068838
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  47068997 actattatttttacaattttatccttaaa-agagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 47068900  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  47068899 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaag 47068838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 32153621 - 32153832
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        |||  ||||||||    
T  32153621 actattgtttttataattttatcctttaagatggagagttagtttatgttttgaacatgttatttattgttgattgaag-aaaataatgtgaaataaata 32153719  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||||||||||||||| |||||||  || ||  |  ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || | |||||| | ||||||||| ||    
T  32153720 agggtatgtatgtaaataaataataaatctatttagaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaacatatttttttaaaaaggtcttataattaagg 32153819  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    |||||||||||||    
T  32153820 acggaggtagtat 32153832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15302569 - 15302782
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        |  | |||||    
T  15302569 attactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatacaaaataa 15302666  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| || |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  15302667 ataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaaggatcttataatta 15302766  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    |||| |||||||||||    
T  15302767 gggatggaggtagtat 15302782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17483944 - 17483732
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  17483944 attactattgattttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaataa 17483848  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  ||||||||||||||||||        || |||||| | | |||||||||    
T  17483847 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagagacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 17483748  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17483747 gggacggaggtagtat 17483732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Original strand, 31636043 - 31636121
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31636043 tgtagaataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagagac 31636121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 32908299 - 32908373
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  32908299 tgtataataaataggggcatgtatgtaaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaag 32908373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38175079 - 38174926
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||||    ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||| |    
T  38175079 tattgtttttacaattttattcttt----gagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-tgaaaagatgtataataaataag 38174985  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||  |||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  38174984 ggcgtgtatgtaaa-aaataattaatgtagttaaaaatagcaaaatagtcttataaaaag 38174926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 46506241 - 46506398
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| | |  ||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||        |||||||||||||    
T  46506241 actattatttttacaattttatcctt-aagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtttattgctcattgaagaaaaaga-tgtataataaata 46506338  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  46506339 ggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 18114300 - 18114377
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  18114300 ctattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttaatatatgttttcaatataatatttaatgctgattgaag 18114377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5858377 - 5858305
Alignment:
Q  93 tataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  5858377 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 5858305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Original strand, 44455536 - 44455662
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||  | |||||||||||  |||        |||||||||| ||    
T  44455536 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaagagatcttataaaaaaggac-aaaaaaattctcaaaaaaat 44455634  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44455635 cttataattaggaacggaggtagtataa 44455662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 47296394 - 47296538
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctg---attgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||        ||||||||||    
T  47296394 actattgttttcacaattttgtccttta-gagagagg--tagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattattgaag-aaaaagatgtataataa 47296489  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  47296490 ataggggcatatatgtaaacaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 47296538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 2637011 - 2637091
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  2637011 attactattgtttttataattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 2637091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27479810 - 27479730
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27479810 attactattgtttttacaattttatcctt-aagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27479730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30761106 - 30761029
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| || | |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  30761106 ctattgtttttacaattttattctttaagagaaagagttagtgtatgttttcaacatggtatttaatactgattgaag 30761029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Original strand, 51561791 - 51561864
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  51561791 tgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaatgtgtcttataaaaa 51561864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 1837397 - 1837484
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag------tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837397 attactattgcttttacaatattatccttcaagagagagagagagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 1837484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 45810202 - 45810122
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  45810202 attactattatttttacaattttatcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 45810122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 47429215 - 47429374
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||| ||||| |||        ||||||||||||     
T  47429215 actattatttttacaattttattcttta-gagagagagttagtttatattctcaatatattatttattgttgattaaagaaaaaga-tgtataataaatg 47429312  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  47429313 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaag 47429374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 47754529 - 47754457
Alignment:
Q  10 gtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47754529 gtttttacaaatttatcctttaagatagagagtttgtttatgttttcaacatactatttattgctgattgaag 47754457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4389821 - 4389743
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  4389821 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattga 4389743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30996956 - 30996794
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  || |||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  30996956 attactattgtttttataattttatcctt-aagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaag-aaaaagatgcaaaataa 30996859  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| || |||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  30996858 ataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatggatcttataaaaag 30996794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 51467298 - 51467503
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  51467298 attactattgtttttataattttatcctt-aagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaataa 51467394  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| || ||  || ||||| ||||  ||| |||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  51467395 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaataccaaaagggtgttataaaaagggacaaattattttttcaaaaggatcttataatta 51467494  T
Q  201 gggacggag 209  Q
    |||||||||    
T  51467495 gggacggag 51467503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 52429099 - 52428954
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  52429099 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag--aaaaaatgcaaaataa 52429003  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  52429002 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaa 52428954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 39647709 - 39647783
Alignment:
Q  95 taataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagac 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  39647709 taataaataggagtatgtatgtaaagaaatggttaatgtagttggaaatagtaaatggatcttataaaaagagac 39647783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 39867569 - 39867643
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  39867569 tgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 39867643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4279953 - 4280163
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||        |||| |||||    
T  4279953 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagcgagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag---aaaaatgtaaaataa 4280048  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| || || ||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||| | |||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  4280049 ataaggttaagttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatggatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 4280148  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  4280149 gggacggaggtagta 4280163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9424980 - 9424899
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  9424980 attaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaag 9424899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22567278 - 22567064
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||| | || ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||        ||||| |||||||    
T  22567278 actattgtttttacaattttattatt-aagagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtattataaata 22567181  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttct---caaaaagattttataatta 200  Q
     ||  |||||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||   ||||| ||||||| |||        ||||   ||||| ||| |||||||||    
T  22567180 tggacatgtatgtaaggaaataattaatatagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaaaagggacaactttttttcttctcaaaaggatcttataatta 22567081  T
Q  201 gggacggaggtagtata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  22567080 gggacggaggtagtata 22567064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 23893522 - 23893602
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23893522 attaccattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 23893602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 29437679 - 29437891
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |  |||||||||| || ||  ||||||||| ||| |||||        || | |||||    
T  29437679 attactattgtttttacaattttatcctt-aatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgaatgaagaaaaaaa-tgcaaaataa 29437776  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        || ||||||   | |||||||||    
T  29437777 ataagggtatgttggtaaagaaataattgatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataatta 29437876  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  29437877 gggacggaggtagta 29437891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27530882 - 27530759
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagat 190  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||  ||||||||||||| |||        ||||| | | | |    
T  27530882 tgtataataaatagtgacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc-aatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcgatagggt 27530784  T
Q  191 tttataattagggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  27530783 tttataattaaggacggaggtagta 27530759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 49549213 - 49549134
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  49549213 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaa 49549134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18172527 - 18172448
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    ||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18172527 attactgttgtttttacaattttatcctttaagagtt--ggatgatttatgtttttaacatgttatttatagttgattgaag 18172448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1427411 - 1427331
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||    
T  1427411 attactattggttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaag 1427331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 35693275 - 35693195
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  || ||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||    
T  35693275 tactattgtttttacaattttatccttgaagagagagagagttattttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaa 35693195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38920446 - 38920366
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||    
T  38920446 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaag 38920366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 48363839 - 48363919
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  48363839 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 48363919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26768592 - 26768517
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||| |||||||||  |||||| || |||||||||    
T  26768592 tattgtttttacaattttaacctttaagagagaaagttagtgtatg-tttcaacatagtatttaatgttgattgaag 26768517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Original strand, 31338977 - 31339049
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatt 78  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  31338977 tattgtttttacaatttcatcctttaaaagagagagtttgtttctgttttcaacatgctatttcttgttgatt 31339049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 41619995 - 41620071
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  41619995 tactattgtttttacaatttta-tctttaagagaga--gttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaag 41620071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Original strand, 1197995 - 1198073
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaaga--gagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  1197995 ctattgtttttaaaattttatcttttaagagggagagagttaatttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaa 1198073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 32906791 - 32906838
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagttt 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  32906791 attactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagatggttt 32906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 39627061 - 39627139
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  | || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  39627061 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaatagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattga 39627139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 215
Target Start/End: Original strand, 44530546 - 44530645
Alignment:
Q  116 taaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||  |||        ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  44530546 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaaaagtcttataattaggaacggaggtagta 44530645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Original strand, 33163312 - 33163370
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaa 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| ||||||||    
T  33163312 tgtataataaataagggtatgtaggtaaagaaataattaatctaattgaacatagcaaa 33163370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47754118 - 47754068
Alignment:
Q  115 gtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  47754118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 47754068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8905597 - 8905548
Alignment:
Q  28 tttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgat 77  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8905597 tttaagaaagagagttagtttatgtttttgacatgttatttattgctgat 8905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19349326 - 19349257
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19349326 aataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggtcttataaaaag 19349257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 35160225 - 35160278
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35160225 tgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 35160278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 37850262 - 37850338
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatt 78  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  37850262 attactattgtttttgcaattttatcc-ttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgatt 37850338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 51561155 - 51561220
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttattta 69  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  51561155 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagaaa--gatggtttatgtttt-aacatattattta 51561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 4371591 - 4371667
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || ||||| ||||||||||  || |||||| |||||||    
T  4371591 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaga--gttaatttatattttcaacataatacttattgttgattga 4371667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48853851 - 48853811
Alignment:
Q  178 ttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtataa 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48853851 ttctcaaaagggttttataattatggacggaggtagtataa 48853811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 164425 - 164213
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  164425 attactattgtttttacaattttattctttaagagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga-tgtataataa 164329  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  164328 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataatta 164229  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  164228 gggacggaggtagtat 164213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5362 - 5151
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  5362 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataat-a 5265  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  5264 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 5166  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  5165 gggacggaggtagta 5151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10008 - 10219
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  10008 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataat-a 10105  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  10106 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 10204  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  10205 gggacggaggtagta 10219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18708 - 18497
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  18708 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataat-a 18611  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  18610 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 18512  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  18511 gggacggaggtagta 18497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6647
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  6436 attactattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaaatgtataataa 6532  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||| ||||| | | |||||||||    
T  6533 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttc-caaaagggtcttataatta 6631  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  6632 gggacggaggtagtat 6647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Original strand, 51512 - 51721
Alignment:
Q  7 attgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggg 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||    
T  51512 attgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaataggg 51610  T
Q  107 gtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacg 206  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  51611 gtatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacg 51710  T
Q  207 gaggtagtata 217  Q
    |||| ||||||    
T  51711 gagggagtata 51721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 258949 - 259160
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  258949 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 259047  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  259048 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 259147  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  259148 acggagggagtat 259160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1933 - 1723
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  1933 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaaga-tgtataataa 1835  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||||| | |||||||||    
T  1834 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttatcaaaaaggtcttataatta 1735  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
     |||||||||||    
T  1734 aggacggaggta 1723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4489 - 4700
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  4489 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataatta 4585  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||        |||||||||  || |||||||||    
T  4586 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataatta 4685  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  4686 gggacggaggtagta 4700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 6967 - 7177
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  6967 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 7065  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||  |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  7066 ggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 7165  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  7166 acggaggaagta 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45726 - 45516
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  45726 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaaga-tgtataataa 45628  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||||| | |||||||||    
T  45627 ataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttatcaaaaaggtcttataatta 45528  T
Q  201 gggacggaggta 212  Q
     |||||||||||    
T  45527 aggacggaggta 45516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3650 - 3438
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  3650 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaa-aaaaaagatgtataataa 3552  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | |||||||||    
T  3551 atcggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatta 3453  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    |||||||||||||||    
T  3452 gggacggaggtagta 3438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 4125 - 4285
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  4125 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 4223  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4224 ggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 4285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45882 - 45722
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  45882 attagtattgtttttacaattttatcctttaagagagag--atggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 45786  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  45785 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 45722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 118055 - 117846
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  118055 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaata 117958  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  117957 ggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggg 117858  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  117857 acggaggaagta 117846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12273 - 12061
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  12273 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaata-tgtataataaata 12176  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  12175 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 12077  T
Q  204 acggaggtagtataag 219  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12076 acggagggagtataag 12061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 24459 - 24669
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  24459 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 24557  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    ||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| ||| |||||||||||     
T  24558 gggg--cgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagcgacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagga 24655  T
Q  204 acggaggtagtata 217  Q
    ||||||| ||||||    
T  24656 acggagggagtata 24669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 355127 - 355288
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        ||||||||||    
T  355127 attactattgtttttacaattttatcctttaagagagaat--tggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattga-ggaaaattatgtataataa 355223  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  355224 ataggggcaagtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 355288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 31514 - 31674
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  31514 actattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 31612  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  31613 gaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 31674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47849 - 47637
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  47849 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaata-tgtataataaata 47752  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   ||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||||||    
T  47751 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 47652  T
Q  204 acggaggtagtataa 218  Q
    ||||||| |||||||    
T  47651 acggagggagtataa 47637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 5113 - 5273
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  5113 actattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 5211  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||    
T  5212 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 5273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 14176 - 14385
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  14176 actattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaatatgtataataaata 14274  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||   | ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||| ||    
T  14275 gggacatgtatgtaaagaaataattaatgta-taggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacagaaaaaattctcaaaagggtcttataattaagg 14373  T
Q  204 acggaggtagta 215  Q
    ||||||| ||||    
T  14374 acggagggagta 14385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 93996 - 93856
Alignment:
Q  3 tactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        | ||||||||||    
T  93996 tactattgtttttacaattttaacctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaag-aaaaagatatataataaat 93898  T
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaata 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  93897 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 93856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 215
Target Start/End: Original strand, 103982 - 104098
Alignment:
Q  98 taaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataa 197  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| || |||||  |||||||| ||||    ||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||    
T  103982 taaataggggtatggtggtaaagaaatatttaatgtaattgaaaatatcaaaggtttcttataaaaagagacaaaaaaa-ttctcaaaaagatcttataa 104080  T
Q  198 ttagggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  104081 ttagggacggaggtagta 104098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 9581 - 9711
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        |||||||||||||    
T  9581 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataataaata 9679  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtag 135  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9680 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 9711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 61680 - 61840
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||    
T  61680 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaatatgttatttattgttgattgaa-aaaaaagatgtataataaata 61778  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |  ||||||||||||||    
T  61779 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacataggggtcttataaaaag 61840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19783 - 19947
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  19783 attactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaag-aaaaaaatgtataataa 19881  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattgg-tcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||  || ||||||||||||    
T  19882 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggatcttataaaaag 19947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8427 - 8268
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||          |||||||||||    
T  8427 actattgtntttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatat--tataataaata 8330  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||   ||||||||||||||    
T  8329 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaag 8268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 4401 - 4562
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  4401 attagtattgtttttacagttttatcctttaagagagag--atgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaag-aaaaagatgtataatta 4497  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  4498 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 4562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 369 - 531
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||        ||||||||||    
T  369 attaccattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaag-aaaaaaatgtataataa 467  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  468 ataagggcatgtatgtaaag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 65466 - 65675
Alignment:
Q  4 actattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||        |||||||||||||    
T  65466 actattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaaga-tgtataataaata 65563  T
Q  104 ggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattaggg 203  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        ||||||||||| | ||||||||||||    
T  65564 tgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaggg 65662  T
Q  204 acggaggtagtat 216  Q
    ||||||| |||||    
T  65663 acggagggagtat 65675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48866 - 48705
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||        |||||||| |    
T  48866 attaatattgtttttacaattttatcctttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaag-aaaaagatgtataatta 48770  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  48769 ataggagcatctatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 48705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4972 - 4812
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||        |||||||| |    
T  4972 attactattgcttttacaattt-atcctttaagagagagggttggtttttgttt-caacatgttatttattgctaattgaag-aaaaagatgtataat-a 4877  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||    
T  4876 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaag 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4792 - 4680
Alignment:
Q  103 aggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||||    
T  4792 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaatt-tcaaaatgatcttataattagg 4694  T
Q  203 gacggaggtagtat 216  Q
    ||| ||||||||||    
T  4693 gacagaggtagtat 4680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18567 - 18486
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18567 attattattgtttttacaattttatcctttaagagagggggtttgtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaag 18486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 3610 - 3819
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatag-tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataata 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||||||    
T  3610 attactactgtttttacaattttatcctttaagagaga---attgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatta-tgtataata 3705  T
Q  100 aataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatt 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||        ||||||||| | | ||||||||    
T  3706 aataggggcatgcatgtaaagaaat-attaatatagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaaattctcaaaagggtcttataatt 3803  T
Q  200 agggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3804 agggacggagggagta 3819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1484
Alignment:
Q  26 cctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaa 123  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1294 cctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaag-aaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaa 1392  T
Q  124 taatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataattagggacggaggtagtat 216  Q
    ||||| | |||| || ||||||||||   |||| |||||||| |||        || |||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  1393 taattaacgtagttggaaatagcaaaggagtctcataaaaagggacaaaaaaaatt-tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtat 1484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17676 - 17464
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||        || | |||||    
T  17676 attactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag-aaaaaaatgcaaaataa 17579  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| ||| |||||||||    
T  17578 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaaggatcttataatta 17479  T
Q  201 gggacggaggtagta 215  Q
    ||||||||| |||||    
T  17478 gggacggagatagta 17464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8566
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||        ||||||||||||| |    
T  8410 tattgtttttacaattttatcctttta-agagagagttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaag-aaaaagatgtataataaataag 8507  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||  ||||| ||||||    
T  8508 ggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaattgtaaatgagtcttctaaaaa 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 13388 - 13450
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  13388 attactattgtttttacaattttatcatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacatgt 13450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 40691 - 40772
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40691 attactcttatttttacaattttattctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 40772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24421 - 24270
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||       | | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||        ||||||||||    
T  24421 attactattgtttttacaattttatcctttaag-------gttggtttatgttttcaacatgttatatattggcgattgaagaaaaaaa-tgtataataa 24330  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaa 164  Q
    |||| || ||||||||||| |||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  24329 atagaggcatgtatgtaaataaata----atgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 24270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Original strand, 9579 - 9653
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaag 165  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   |||||||||||||    
T  9579 tgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaag 9653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 32993 - 33148
Alignment:
Q  6 tattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataaatagg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || |||||  | ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||        |||| ||||||||||    
T  32993 tattgtttttacaattttatcctcaaa-agagatagttagtttatgttttcaacaatatatttattgttgattgaag-aaaaatatgtaaaataaatagg 33090  T
Q  106 ggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaa 163  Q
    ||||||   |||||||||||||| ||| || |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33091 ggtatggcagtaaagaaataattaatgcagttagaaataccaaaatggtcttataaaa 33148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 246667 - 246455
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagnnnnnnnntgtataataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||         | | |||||    
T  246667 attactattgtttttacaattttatcc-ttaaaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaa--gcaaaataa 246571  T
Q  101 ataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttataatta 200  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  |||||||||||||| |||        || |||||| | | |||||||||    
T  246570 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 246471  T
Q  201 gggacggaggtagtat 216  Q
    || |||||||||||||    
T  246470 ggaacggaggtagtat 246455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34229 - 34175
Alignment:
Q  91 tgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatag 145  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  34229 tgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 34175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 56133 - 56056
Alignment:
Q  5 ctattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||    
T  56133 ctattgtttttacacttttattctttaagagagtgggttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaag 56056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 1959 - 2042
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagaggga--tagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||| ||| |||| |||||  |||||| || |||||||||    
T  1959 attactattgtttttacaattttattctttaagagagagagagttagtgtatatttttaacatagtatttaatgttgattgaag 2042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 215
Target Start/End: Original strand, 11577 - 11696
Alignment:
Q  96 aataaataggggtatgtatgtaaagaaataatttatgtagctgaaaatagcaaattggtcttataaaaagagacnnnnnnnnttctcaaaaagattttat 195  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||  | |||||| ||||  ||||||||||||||||||        || |||||| | || |||    
T  11577 aataaataagggtatgttagtaaataaataattaatgtacttaaaaataccaaaggggtcttataaaaagagacaaattatcttttcaaaaggtttctat 11676  T
Q  196 aattagggacggaggtagta 215  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  11677 aattagagacggaggtagta 11696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 36190 - 36269
Alignment:
Q  1 attactattgtttttacaattttaccctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  36190 attactattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 36269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University