View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16811_low_23 (Length: 245)

Name: NF16811_low_23
Description: NF16811
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16811_low_23
NF16811_low_23
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (14-220)||(23408236-23408444)
chr3 (14-206)||(15878152-15878345)
chr3 (14-206)||(16369222-16369416)
chr3 (22-206)||(23077586-23077772)
chr3 (14-206)||(14878617-14878811)
chr3 (22-206)||(855962-856148)
chr3 (24-204)||(12172620-12172802)
chr3 (64-206)||(15067505-15067650)
chr3 (22-206)||(23053196-23053383)
chr3 (14-168)||(15051371-15051524)
chr3 (37-206)||(11862615-11862787)
chr3 (54-155)||(16796195-16796296)
chr3 (14-168)||(11298628-11298784)
chr3 (22-168)||(18384024-18384169)
chr3 (22-206)||(19726010-19726196)
chr3 (38-206)||(25476507-25476679)
chr3 (38-182)||(11424881-11425028)
chr3 (38-220)||(43840742-43840931)
chr3 (38-206)||(17487682-17487855)
chr3 (38-206)||(17499164-17499337)
chr3 (14-157)||(12496131-12496273)
chr3 (22-151)||(12038060-12038188)
chr3 (24-168)||(322455-322598)
chr3 (73-220)||(30029644-30029796)
chr3 (38-206)||(40213842-40214015)
chr3 (22-152)||(26196540-26196670)
chr3 (73-220)||(18438344-18438495)
chr3 (38-182)||(26686739-26686886)
chr3 (99-206)||(11849137-11849247)
chr3 (14-119)||(15060196-15060300)
chr3 (78-220)||(13210493-13210640)
chr3 (38-206)||(23083483-23083656)
chr3 (73-209)||(14572414-14572553)
chr3 (38-220)||(14972668-14972853)
chr3 (124-220)||(10542862-10542962)
chr3 (111-204)||(10542638-10542734)
chr3 (38-182)||(13442125-13442273)
chr3 (73-209)||(14576989-14577127)
chr3 (38-137)||(12852662-12852760)
chr3 (73-206)||(12399034-12399170)
chr3 (139-206)||(16796120-16796189)
chr3 (124-206)||(10542757-10542841)
chr3 (73-175)||(24340883-24340986)
chr3 (89-151)||(11557562-11557624)
chr3 (73-206)||(23274512-23274648)
chr3 (89-136)||(1982988-1983035)
chr3 (73-182)||(20698595-20698706)
chr3 (132-220)||(14682190-14682283)
chr3 (89-137)||(3390114-3390161)
chr3 (89-151)||(11595316-11595376)
chr3 (89-137)||(3403134-3403181)
chr3 (73-155)||(12510929-12511012)
chr3 (89-151)||(42325821-42325881)
chr3 (132-220)||(14670668-14670761)
chr3 (163-193)||(23408223-23408253)
chr3 (38-106)||(55476418-55476487)
chr3 (14-50)||(17525259-17525295)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (21-220)||(21714354-21714555)
chr1 (14-206)||(42865314-42865508)
chr1 (14-206)||(21788143-21788338)
chr1 (22-206)||(6151671-6151856)
chr1 (38-206)||(22131206-22131377)
chr1 (14-206)||(20091577-20091770)
chr1 (67-206)||(22468855-22468996)
chr1 (38-206)||(48603091-48603262)
chr1 (37-206)||(22831508-22831679)
chr1 (22-206)||(18182229-18182413)
chr1 (22-206)||(22449374-22449560)
chr1 (14-168)||(17678686-17678839)
chr1 (26-206)||(3473035-3473217)
chr1 (22-168)||(21022492-21022639)
chr1 (38-220)||(34509590-34509779)
chr1 (38-206)||(22532095-22532268)
chr1 (38-180)||(50210339-50210484)
chr1 (76-208)||(20847317-20847452)
chr1 (73-206)||(21477468-21477603)
chr1 (89-206)||(8761803-8761924)
chr1 (73-220)||(27250889-27251041)
chr1 (38-206)||(20135007-20135180)
chr1 (73-206)||(21161551-21161685)
chr1 (76-220)||(38801550-38801700)
chr1 (89-137)||(3705243-3705291)
chr1 (76-182)||(20916078-20916185)
chr1 (89-151)||(45489920-45489980)
chr1 (89-151)||(45310545-45310605)
chr1 (163-193)||(21714341-21714371)
chr1 (89-137)||(33050193-33050239)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (14-163)||(15041651-15041800)
chr6 (29-220)||(31164956-31165147)
chr6 (14-206)||(25642288-25642481)
chr6 (14-206)||(19862801-19862994)
chr6 (14-206)||(22334998-22335191)
chr6 (14-220)||(22432056-22432265)
chr6 (14-220)||(22438606-22438815)
chr6 (22-206)||(15894547-15894731)
chr6 (14-206)||(19872943-19873136)
chr6 (22-206)||(21740140-21740325)
chr6 (64-209)||(16965462-16965608)
chr6 (22-206)||(18906933-18907119)
chr6 (73-220)||(25629514-25629664)
chr6 (14-206)||(21766515-21766711)
chr6 (38-220)||(29060350-29060538)
chr6 (22-168)||(16523492-16523637)
chr6 (14-168)||(18180357-18180510)
chr6 (24-206)||(18692022-18692206)
chr6 (38-219)||(22805559-22805747)
chr6 (89-206)||(21830615-21830734)
chr6 (38-218)||(18409953-18410138)
chr6 (20-160)||(22074310-22074449)
chr6 (38-182)||(19303662-19303809)
chr6 (73-220)||(20638443-20638596)
chr6 (73-216)||(4185973-4186116)
chr6 (73-216)||(4738709-4738852)
chr6 (73-220)||(22780386-22780538)
chr6 (73-211)||(4186198-4186336)
chr6 (73-182)||(19773882-19773993)
chr6 (38-220)||(17287918-17288107)
chr6 (38-220)||(28496594-28496783)
chr6 (38-220)||(29809005-29809194)
chr6 (78-206)||(1561127-1561258)
chr6 (65-168)||(22408441-22408545)
chr6 (38-220)||(20076513-20076699)
chr6 (73-182)||(20361120-20361231)
chr6 (73-167)||(31155549-31155644)
chr6 (78-220)||(35245393-35245541)
chr6 (154-209)||(16960263-16960319)
chr6 (38-182)||(20593626-20593772)
chr6 (89-151)||(27553749-27553811)
chr6 (89-151)||(27567787-27567849)
chr6 (89-137)||(20908159-20908207)
chr6 (73-220)||(25611887-25612040)
chr6 (78-206)||(11185337-11185469)
chr6 (64-120)||(16929742-16929798)
chr6 (76-206)||(22831327-22831461)
chr6 (89-137)||(23657588-23657635)
chr6 (89-151)||(19790956-19791016)
chr6 (73-182)||(25603549-25603660)
chr6 (163-193)||(22432043-22432073)
chr6 (163-193)||(22438593-22438623)
chr6 (38-122)||(3852183-3852267)
chr6 (38-122)||(25754721-25754805)
chr6 (127-206)||(16920844-16920927)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (21-220)||(18154949-18155150)
chr7 (14-206)||(19649590-19649783)
chr7 (27-220)||(24054272-24054467)
chr7 (22-206)||(12186841-12187027)
chr7 (14-220)||(9703069-9703279)
chr7 (22-206)||(17138169-17138355)
chr7 (14-193)||(32216649-32216829)
chr7 (38-204)||(15211279-15211449)
chr7 (20-157)||(2760014-2760150)
chr7 (37-206)||(12321864-12322036)
chr7 (14-152)||(3271702-3271839)
chr7 (14-152)||(39268000-39268137)
chr7 (22-206)||(14429706-14429891)
chr7 (38-206)||(14258085-14258260)
chr7 (38-220)||(9508998-9509188)
chr7 (73-220)||(13032567-13032720)
chr7 (92-220)||(16579384-16579517)
chr7 (92-220)||(16586146-16586279)
chr7 (73-206)||(10063978-10064113)
chr7 (89-220)||(11996204-11996340)
chr7 (55-153)||(18301918-18302016)
chr7 (73-220)||(10588845-10589000)
chr7 (38-182)||(12698683-12698830)
chr7 (73-170)||(38227344-38227442)
chr7 (124-220)||(16461243-16461343)
chr7 (79-206)||(26211819-26211950)
chr7 (78-168)||(34200651-34200741)
chr7 (89-151)||(9446336-9446398)
chr7 (76-182)||(16386411-16386519)
chr7 (89-151)||(42203873-42203934)
chr7 (124-206)||(16461348-16461432)
chr7 (125-220)||(28505496-28505597)
chr7 (76-182)||(27847993-27848101)
chr7 (152-220)||(16461166-16461238)
chr7 (17-111)||(15580617-15580710)
chr7 (163-193)||(18155133-18155163)
chr7 (163-193)||(24054259-24054289)
chr7 (163-193)||(32216842-32216872)
chr7 (163-192)||(9703057-9703086)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (14-206)||(65899-66091)
scaffold0031 (38-206)||(128577-128750)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (21-220)||(36262-36463)
scaffold0131 (163-193)||(36249-36279)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (14-220)||(69601-69810)
scaffold0004 (163-193)||(69588-69618)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (14-220)||(19788-19996)
scaffold0139 (163-193)||(19775-19805)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (14-206)||(22741065-22741258)
chr2 (14-206)||(22799227-22799421)
chr2 (14-206)||(22758820-22759013)
chr2 (22-206)||(23019815-23020001)
chr2 (22-206)||(40622319-40622505)
chr2 (22-206)||(24673389-24673577)
chr2 (22-206)||(45678238-45678423)
chr2 (22-206)||(24680006-24680196)
chr2 (14-206)||(25963816-25964009)
chr2 (20-206)||(37524506-37524694)
chr2 (38-220)||(23060322-23060511)
chr2 (22-206)||(22812020-22812206)
chr2 (77-220)||(22336935-22337081)
chr2 (14-206)||(21318737-21318933)
chr2 (14-206)||(21327668-21327864)
chr2 (22-137)||(21916207-21916321)
chr2 (89-206)||(40428283-40428402)
chr2 (38-206)||(8946482-8946655)
chr2 (73-220)||(23654546-23654699)
chr2 (14-151)||(24716629-24716765)
chr2 (76-220)||(23072112-23072262)
chr2 (73-220)||(21900613-21900766)
chr2 (88-206)||(22731408-22731529)
chr2 (89-220)||(38292-38428)
chr2 (124-182)||(23657644-23657702)
chr2 (76-220)||(23103558-23103707)
chr2 (88-182)||(20308958-20309054)
chr2 (92-220)||(22738357-22738490)
chr2 (89-151)||(24174677-24174739)
chr2 (89-151)||(24655516-24655578)
chr2 (38-182)||(23076298-23076440)
chr2 (89-151)||(25961709-25961771)
chr2 (73-206)||(23040349-23040486)
chr2 (89-151)||(24869757-24869819)
chr2 (38-106)||(23130789-23130858)
chr2 (38-106)||(23133256-23133325)
chr2 (38-106)||(34402688-34402757)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (14-206)||(23776936-23777130)
chr8 (14-206)||(17354044-17354237)
chr8 (14-206)||(21168832-21169028)
chr8 (14-206)||(19898917-19899111)
chr8 (14-205)||(21162159-21162354)
chr8 (22-206)||(16184543-16184728)
chr8 (22-205)||(20466149-20466335)
chr8 (22-191)||(24755554-24755722)
chr8 (21-206)||(19982915-19983102)
chr8 (22-206)||(377092-377279)
chr8 (38-206)||(44384970-44385142)
chr8 (14-193)||(19259692-19259872)
chr8 (22-206)||(30643400-30643586)
chr8 (20-206)||(15611566-15611753)
chr8 (14-206)||(17926806-17926999)
chr8 (22-206)||(16410353-16410542)
chr8 (20-206)||(15603114-15603301)
chr8 (20-168)||(22010772-22010919)
chr8 (73-220)||(22626547-22626697)
chr8 (38-220)||(18879353-18879540)
chr8 (14-206)||(16861425-16861619)
chr8 (38-206)||(18818531-18818704)
chr8 (38-182)||(28649170-28649317)
chr8 (38-206)||(23406205-23406378)
chr8 (73-180)||(21919160-21919267)
chr8 (89-208)||(20856602-20856724)
chr8 (76-220)||(21249193-21249342)
chr8 (76-220)||(21255031-21255180)
chr8 (89-206)||(39095102-39095221)
chr8 (76-220)||(5866437-5866587)
chr8 (76-220)||(45131159-45131309)
chr8 (73-207)||(21924087-21924223)
chr8 (38-220)||(22874879-22875064)
chr8 (38-220)||(20536018-20536207)
chr8 (38-220)||(23648357-23648546)
chr8 (38-206)||(7372604-7372777)
chr8 (73-206)||(13508245-13508380)
chr8 (76-182)||(16199807-16199915)
chr8 (76-220)||(21389613-21389763)
chr8 (76-220)||(21396143-21396293)
chr8 (76-220)||(21778939-21779089)
chr8 (76-220)||(21790636-21790786)
chr8 (78-180)||(31971109-31971212)
chr8 (76-206)||(17140739-17140874)
chr8 (38-205)||(6759088-6759258)
chr8 (78-169)||(21490859-21490950)
chr8 (73-182)||(16092501-16092609)
chr8 (38-106)||(4483208-4483277)
chr8 (73-169)||(13597777-13597874)
chr8 (73-122)||(41598099-41598147)
chr8 (27-106)||(45290850-45290931)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (14-206)||(9064-9257)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (22-206)||(5917-6103)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (14-206)||(18059-18252)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (12-220)||(7916-8127)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (14-208)||(23201180-23201376)
chr5 (21-220)||(26703884-26704084)
chr5 (21-220)||(26973617-26973817)
chr5 (22-206)||(14078972-14079157)
chr5 (22-206)||(18770110-18770298)
chr5 (14-193)||(23501456-23501635)
chr5 (14-206)||(21873076-21873270)
chr5 (22-206)||(22032145-22032331)
chr5 (14-204)||(23511924-23512114)
chr5 (38-220)||(9077764-9077951)
chr5 (14-206)||(20805371-20805568)
chr5 (78-206)||(23571899-23572029)
chr5 (88-206)||(22107788-22107908)
chr5 (22-206)||(21366773-21366959)
chr5 (73-220)||(24493378-24493530)
chr5 (14-168)||(20766834-20766990)
chr5 (38-220)||(1096278-1096465)
chr5 (38-220)||(21997656-21997845)
chr5 (73-220)||(25431204-25431356)
chr5 (14-151)||(1859077-1859213)
chr5 (38-220)||(24529030-24529219)
chr5 (74-220)||(25421340-25421492)
chr5 (38-206)||(13095320-13095493)
chr5 (89-206)||(17919320-17919439)
chr5 (38-206)||(13025136-13025309)
chr5 (89-206)||(123480-123599)
chr5 (89-152)||(23439856-23439919)
chr5 (89-152)||(23451223-23451286)
chr5 (74-220)||(8287004-8287156)
chr5 (76-206)||(21293132-21293266)
chr5 (76-220)||(19660998-19661147)
chr5 (89-152)||(23458467-23458530)
chr5 (89-152)||(23462728-23462791)
chr5 (73-206)||(22074845-22074981)
chr5 (38-206)||(23390618-23390791)
chr5 (76-220)||(37723711-37723861)
chr5 (76-220)||(21808552-21808701)
chr5 (89-151)||(24221754-24221816)
chr5 (89-151)||(12028742-12028802)
chr5 (89-151)||(22757007-22757067)
chr5 (88-137)||(31342041-31342088)
chr5 (38-106)||(39363311-39363380)
chr5 (76-220)||(21729227-21729377)
chr5 (89-151)||(26680461-26680521)
chr5 (89-151)||(26952068-26952128)
chr5 (132-182)||(33895988-33896037)
chr5 (38-122)||(20806908-20806992)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (22-206)||(14195-14381)
scaffold0056 (89-220)||(17396-17532)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (22-206)||(15093597-15093783)
chr4 (14-220)||(13569308-13569518)
chr4 (14-220)||(44675438-44675648)
chr4 (22-206)||(15121909-15122095)
chr4 (14-206)||(23843300-23843494)
chr4 (22-206)||(12569838-12570022)
chr4 (22-206)||(15125150-15125336)
chr4 (38-206)||(17048435-17048606)
chr4 (14-206)||(16348764-16348957)
chr4 (14-168)||(16357052-16357205)
chr4 (22-206)||(16488186-16488371)
chr4 (22-160)||(13813127-13813264)
chr4 (38-182)||(16270358-16270505)
chr4 (38-220)||(7893512-7893701)
chr4 (38-220)||(22636245-22636434)
chr4 (73-206)||(12902582-12902718)
chr4 (73-220)||(16377680-16377832)
chr4 (73-220)||(7798584-7798736)
chr4 (73-206)||(16240129-16240265)
chr4 (38-152)||(631105-631218)
chr4 (88-206)||(5339150-5339271)
chr4 (76-220)||(14053464-14053614)
chr4 (38-206)||(44052654-44052828)
chr4 (73-182)||(3096144-3096254)
chr4 (25-160)||(12423560-12423696)
chr4 (76-206)||(23374516-23374649)
chr4 (88-182)||(15551668-15551763)
chr4 (89-151)||(15353485-15353547)
chr4 (73-182)||(14038510-14038618)
chr4 (76-220)||(17046295-17046445)
chr4 (89-151)||(16352029-16352091)
chr4 (92-137)||(25555374-25555417)
chr4 (163-192)||(13569296-13569325)
chr4 (38-122)||(51464034-51464118)
chr4 (112-160)||(13813292-13813340)
chr4 (112-160)||(13813381-13813429)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (14-206)||(15780-15973)
scaffold0297 (14-206)||(10623-10812)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (21-206)||(23668-23852)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (22-206)||(18563-18749)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (22-206)||(38588-38774)
scaffold0023 (76-206)||(119700-119833)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (14-206)||(1162-1355)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (22-206)||(7118-7303)
scaffold0114 (90-220)||(15641-15777)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (22-206)||(35028-35212)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-191)||(178739-178907)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (22-206)||(4913-5101)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (22-206)||(1702-1889)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (22-206)||(38925-39111)
scaffold0081 (22-206)||(23501-23687)
scaffold0081 (22-206)||(14485-14672)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (14-206)||(10317-10511)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (14-206)||(3564-3758)
scaffold0149 (14-206)||(7995-8189)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (14-206)||(16449-16643)
scaffold0096 (88-161)||(20881-20955)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (22-206)||(21912-22099)
scaffold0210 (22-206)||(29804-29991)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (22-206)||(2655-2840)
scaffold0158 (22-205)||(6322-6506)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (22-206)||(32269-32452)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (22-206)||(18816-19009)
scaffold0080 (38-220)||(39723-39912)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (22-206)||(46835-47023)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (38-206)||(193099-193271)
scaffold0017 (89-206)||(15388-15507)
scaffold0017 (89-206)||(19910-20029)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (89-206)||(281071-281190)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (90-206)||(3340-3458)
scaffold0165 (90-206)||(7404-7522)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (14-206)||(2185-2378)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (51-206)||(12584-12742)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (14-168)||(757-913)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (22-168)||(21633-21778)
scaffold0037 (38-122)||(81983-82067)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (38-220)||(27688-27874)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (22-206)||(4252-4438)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (22-168)||(21-167)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (38-160)||(539-662)
scaffold0484 (132-206)||(469-545)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (22-206)||(6514-6699)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (73-220)||(340106-340256)
scaffold0003 (22-151)||(414159-414287)
scaffold0003 (38-106)||(158616-158686)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (20-206)||(1587-1775)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (38-182)||(3312-3459)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (38-216)||(3272-3454)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (73-182)||(196-306)
scaffold0292 (38-220)||(3280-3469)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (38-220)||(8651-8840)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (22-206)||(1316-1502)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (22-152)||(167-297)
scaffold0327 (191-220)||(3608-3637)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (22-206)||(17220-17405)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (14-145)||(43967-44097)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (22-206)||(218-401)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (51-206)||(7265-7424)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (38-182)||(32793-32940)
scaffold0145 (73-182)||(32327-32437)
scaffold0145 (38-182)||(38612-38759)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (14-168)||(1693-1846)
scaffold0104 (14-168)||(9376-9529)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (22-168)||(73875-74020)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-151)||(30843-30980)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (73-220)||(51723-51875)
scaffold0011 (73-220)||(168138-168290)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (20-206)||(1622-1811)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (38-220)||(4955-5143)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (38-206)||(13038-13210)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (89-206)||(27300-27419)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (89-206)||(68698-68817)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (22-151)||(7352-7479)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (73-182)||(15965-16075)
scaffold0120 (75-219)||(17490-17636)
scaffold0120 (38-220)||(33078-33264)
scaffold0120 (38-220)||(45741-45927)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (22-206)||(14911-15095)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (89-206)||(5416-5535)
scaffold0476 (89-206)||(6611-6730)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (76-220)||(31876-32025)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (38-206)||(4537-4710)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (89-206)||(19462-19583)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (78-220)||(11609-11756)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (73-219)||(16759-16906)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (73-182)||(39329-39438)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (22-156)||(42505-42635)
scaffold0124 (40-137)||(24949-25045)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (73-182)||(75374-75483)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (78-220)||(10589-10737)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (78-220)||(13304-13452)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (89-206)||(7448-7567)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-182)||(25747-25894)
scaffold0026 (78-155)||(39736-39814)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (38-220)||(83-272)
scaffold0175 (79-220)||(33931-34078)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (73-169)||(1208-1304)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (76-206)||(4675-4807)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-206)||(48569-48740)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (88-220)||(46803-46941)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (124-220)||(116725-116825)
scaffold0034 (112-182)||(117037-117108)
scaffold0034 (124-206)||(116846-116930)
scaffold0034 (124-219)||(116935-117034)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (76-206)||(1774-1910)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (76-206)||(2563-2697)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (89-152)||(2446-2509)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (75-180)||(121619-121726)
scaffold0021 (76-206)||(174590-174724)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (76-182)||(1212-1320)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (73-182)||(4362-4470)
scaffold0228 (73-182)||(11944-12052)
scaffold0228 (73-182)||(21896-22004)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (89-206)||(33373-33494)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (76-182)||(1139-1247)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (142-219)||(4330-4407)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (38-206)||(1677-1850)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (150-220)||(4894-4966)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (124-206)||(7386-7470)
scaffold0278 (112-206)||(7489-7585)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (73-182)||(6283-6394)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (114-206)||(2099-2193)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (38-152)||(7942-8055)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (73-220)||(20718-20871)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (76-220)||(5291-5441)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (38-220)||(31968-32159)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (22-151)||(422640-422770)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (38-220)||(8289-8478)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (78-206)||(1821-1952)
scaffold0046 (73-220)||(28222-28375)
scaffold0046 (88-182)||(4402-4497)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (14-84)||(527-596)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (89-151)||(2614-2676)
scaffold0439 (89-151)||(10474-10536)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (76-206)||(51405-51540)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (117-206)||(195119-195210)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (89-151)||(205240-205300)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (89-137)||(8454-8500)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (89-153)||(4403-4465)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (90-137)||(2062-2107)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (80-220)||(16089-16236)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (142-220)||(10108-10189)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (132-193)||(1917-1979)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23408444 - 23408236
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23408444 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattttgatgtttaagagatcgagttcatgcattagcatacatttg 23408346  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  23408345 ttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaata 23408246  T
Q  211 gcgatggggg 220  Q
    ||||||||||    
T  23408245 gcgatggggg 23408236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 15878152 - 15878345
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15878152 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagttcatgcattagcatacatttg 15878250  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15878251 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 15878345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16369416 - 16369222
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16369416 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacattt 16369318  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16369317 gttgggagcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 16369222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 23077586 - 23077772
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt--aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23077586 aagatgatgttgaac-tccaaattagtgg-atatataagagatgatgattgagatgtttttaagagatcgagtccattcattagcatacatatgttgggg 23077683  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23077684 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattatctcaaactagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 23077772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 14878617 - 14878811
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14878617 agatgaataagatgatgttgaatctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 14878715  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14878716 gtagggggctcatgccctggagattagtactcaccacgatggagctttagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 14878811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 856148 - 855962
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  856148 aagatgatgtttatcctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattaacatacatttgttggagg 856050  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  856049 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccttgaaagtatattaatact 855962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12172802 - 12172620
Alignment:
Q  24 gatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172802 gatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 12172704  T
Q  123 catgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaata 204  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12172703 catgccctgtagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaata 12172620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15067650 - 15067505
Alignment:
Q  64 tgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttag 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15067650 tgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattag 15067551  T
Q  163 ctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15067550 ctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 15067505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 23053196 - 23053383
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23053196 aagataatgttgaac-tccaaattattggatgtatataagagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 23053294  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  23053295 gatcatgccttggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaactagaaatgggggcttatgccctggaaatatattaatact 23053383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15051524 - 15051371
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15051524 agatgaataagatgatcttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacattt 15051427  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15051426 gttggggcctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaa 15051371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11862787 - 11862615
Alignment:
Q  37 ctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagc 135  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11862787 ctccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 11862689  T
Q  136 ttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagc-gatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| ||||||||||| || |||| ||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11862688 tttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 11862615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16796296 - 16796195
Alignment:
Q  54 atataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatg 153  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16796296 atataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatg 16796197  T
Q  154 ga 155  Q
    ||    
T  16796196 ga 16796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 11298628 - 11298784
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||     
T  11298628 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 11298727  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||    
T  11298728 tgttgggggttcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 11298784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 18384024 - 18384169
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18384024 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 18384121  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18384122 cttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaa 18384169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 19726010 - 19726196
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19726010 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgcggg 19726107  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
     ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19726108 ttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 19726196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 25476507 - 25476679
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||||||||| |  ||||||| |||    
T  25476507 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccctggag 25476606  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  25476607 ctttgtactcaacaagatggagctttagctcaaatagtgatgggggttgatgccctgtaagtatattaatact 25476679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 11424881 - 11425028
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  11424881 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 11424980  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11424981 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagtgatgggggct 11425028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43840931 - 43840742
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  43840931 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggag 43840832  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  43840831 ctttgtactcaacacgaaagagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 43840742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17487855 - 17487682
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  17487855 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggag 17487756  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  17487755 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17487682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17499337 - 17499164
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  17499337 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggag 17499238  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  17499237 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17499164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12496273 - 12496131
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||  || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12496273 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagattatttagatgattgagtccatgcattagcatacattt 12496176  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagc 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  12496175 gttgggggctcatgccctggagctttttactcaccatgatggagc 12496131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 12038060 - 12038188
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12038060 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttatatgatagagtccatgcattagcatacatttgttggggg 12038157  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  12038158 ctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 12038188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 322598 - 322455
Alignment:
Q  24 gatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322598 gatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgcatatgacatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 322501  T
Q  123 catgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
     |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  322500 tatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaa 322455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30029796 - 30029644
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcata-catt-tgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat 169  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  30029796 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagtgatgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacatgttggagctttagctcaatt 30029697  T
Q  170 agcgatgggggctcatgccctgaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  30029696 agcgatgggggcttatgcctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 30029644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 40213842 - 40214015
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||| |  ||||  ||| ||| |||    
T  40213842 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtggatggcttgatgtcctggag 40213941  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  40213942 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 40214015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 152
Target Start/End: Original strand, 26196540 - 26196670
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26196540 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggg 26196637  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  26196638 gctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 26196670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18438495 - 18438344
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18438495 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttggaggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagttttagctcaaatag 18438396  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact-tatagcgatggggg 220  Q
     || |||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18438395 tgaagggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatggggg 18438344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26686886 - 26686739
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||    
T  26686886 tccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagag 26686787  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26686786 ctttgtactcaacatgttggagttttagctcaattagcgatgggggct 26686739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11849247 - 11849137
Alignment:
Q  99 attagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagc-gatgggggctcatgccctg-aagt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||| | | |||||||| |||||||| ||||    
T  11849247 attagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagt 11849148  T
Q  196 atattaatact 206  Q
    |||||||||||    
T  11849147 atattaatact 11849137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15060300 - 15060196
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15060300 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacattt 15060203  T
Q  113 gttgggg 119  Q
    |||||||    
T  15060202 gttgggg 15060196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 220
Target Start/End: Original strand, 13210493 - 13210640
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgat 175  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13210493 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgat 13210591  T
Q  176 gggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13210592 gggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 13210640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 23083483 - 23083656
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||||||||| |  ||||| | |||    
T  23083483 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccttggag 23083582  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  23083583 ttttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 23083656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14572553 - 14572414
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14572553 agatgtttaagaggtcgagtctatgcatttgcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattag 14572454  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttat 209  Q
    ||||| |||| | |||| || |||||||||||||||||||    
T  14572453 cgatgagggcttgatgctctggaagtatattaatacttat 14572414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14972853 - 14972668
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||||||||| |  ||| ||| |||    
T  14972853 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgtcctggag 14972754  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14972753 cctt-tgctcaacacgatggagctttagctcaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagggatggggg 14972668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 10542862 - 10542962
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgggg 219  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  10542862 atgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 10542961  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  10542962 g 10542962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 10542638 - 10542734
Alignment:
Q  111 ttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaata 204  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  10542638 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaata 10542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13442273 - 13442125
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||  ||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  13442273 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaatatttcattgttgggggcttgatgccctggag 13442174  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggct 182  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442173 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggct 13442125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 14576989 - 14577127
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcata-catttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaata 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14576989 agatgtttaagaggtcgagtccatgcatttgcatttcattt-ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctc-aata 14577086  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttat 209  Q
    |||||| |||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  14577087 gcgatgagggcttgatgccctggacgtatattaatacttat 14577127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 137
Target Start/End: Original strand, 12852662 - 12852760
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12852662 tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtttagatgatagagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctt 12852760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12399170 - 12399034
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  12399170 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttggtggcttgatgccctggagcactgtactcaccacgttggagcattagctcaaatta 12399072  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  12399071 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 12399034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16796189 - 16796120
Alignment:
Q  139 gtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16796189 gtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 16796120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Original strand, 10542757 - 10542841
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  10542757 atgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattagtact 10542841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 24340883 - 24340986
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24340883 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatag 24340982  T
Q  172 cgat 175  Q
    ||||    
T  24340983 cgat 24340986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 11557562 - 11557624
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  11557562 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 11557624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23274648 - 23274512
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaata 170  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||     |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  23274648 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaata 23274549  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccctgaagtatattaatact 206  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  23274548 gcgataggggcttgatgccctggagtataataatact 23274512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Original strand, 1982988 - 1983035
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagct 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1982988 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagct 1983035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 20698595 - 20698706
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||    ||||||||||| | || |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||    
T  20698595 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgattccctggagctttgtactcaccacgttggagctttaactcaaatta 20698694  T
Q  171 gcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||    
T  20698695 gcgatgggggct 20698706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14682283 - 14682190
Alignment:
Q  132 gagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14682283 gagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 14682190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 3390114 - 3390161
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3390114 gagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatgccctggagctt 3390161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 11595316 - 11595376
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  11595316 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 11595376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 3403134 - 3403181
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3403134 gagtccatgcattaacatac-tttgttgggggctcatgccctggagctt 3403181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12511012 - 12510929
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatgga 155  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  12511012 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgga 12510929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42325881 - 42325821
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||    
T  42325881 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcataccctggagctttgtcctcaccacga 42325821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14670761 - 14670668
Alignment:
Q  132 gagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  14670761 gagctttgtagtcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagcatattaatactcaaatagcgatggggg 14670668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23408253 - 23408223
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23408253 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 23408223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 55476487 - 55476418
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  55476487 tccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatgtttaagaggtcgagtctatgcattagcat 55476418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 50
Target Start/End: Original strand, 17525259 - 17525295
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg 50  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17525259 agatgatcaaaatgatgttgaacctccaaattattgg 17525295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21714555 - 21714354
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714555 caagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 21714457  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgg 217  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21714456 ctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 21714357  T
Q  218 ggg 220  Q
    |||    
T  21714356 ggg 21714354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 42865314 - 42865508
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42865314 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 42865412  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42865413 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaactagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatact 42865508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 21788143 - 21788338
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt--aagagaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  21788143 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgtttttaagagatcgagtctatgcattagcatacata 21788241  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21788242 tgttgggggctcataccctggagcttagtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 21788338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6151856 - 6151671
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6151856 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 6151759  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6151758 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 6151671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 22131206 - 22131377
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtata-tataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagct 136  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22131206 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 22131305  T
Q  137 tagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22131306 ttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 22131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 20091577 - 20091770
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  20091577 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgtttttgatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatttg 20091675  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20091676 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataatgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatact 20091770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 206
Target Start/End: Original strand, 22468855 - 22468996
Alignment:
Q  67 tgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctca 166  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22468855 tgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatatatttgttgggggctcatgccctggagcttagtacccaacacgatggagctttagctca 22468954  T
Q  167 aa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22468955 aattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 22468996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48603262 - 48603091
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtata-tataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagct 136  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48603262 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 48603163  T
Q  137 tagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603162 ttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatact 48603091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 22831508 - 22831679
Alignment:
Q  37 ctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaag-agaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagc 135  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22831508 ctccaaattattgg-atatatatgagatgaatattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 22831606  T
Q  136 ttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22831607 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 22831679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 18182229 - 18182413
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182229 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 18182326  T
Q  122 tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18182327 tcatgccctggagctttgtactcaccacgaaggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 18182413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 22449374 - 22449560
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22449374 aagatgatgctgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 22449471  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||  | | |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22449472 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttaggggcttatgccctgaaagtatattaatact 22449560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 17678686 - 17678839
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  17678686 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatat 17678783  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17678784 gttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaa 17678839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 3473035 - 3473217
Alignment:
Q  26 tgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3473035 tgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 3473132  T
Q  125 tgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    | |||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3473133 taccctggagctttgtcctcaccacgatggagcttttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 3473217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21022639 - 21022492
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattga-gatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022639 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatgagatgataatttaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 21022541  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21022540 g-ctcatgccctagagctttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaa 21022492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34509779 - 34509590
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  34509779 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 34509680  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  34509679 cattgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggtccttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 34509590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22532268 - 22532095
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  22532268 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 22532169  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22532168 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattaccgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 22532095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Original strand, 50210339 - 50210484
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  50210339 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 50210438  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatggggg 180  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210439 cattgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatggggg 50210484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Original strand, 20847317 - 20847452
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  20847317 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 20847415  T
Q  174 atgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatactta 208  Q
    || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847416 attggggcttgatgccctggaagtatattaatactta 20847452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21477603 - 21477468
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21477603 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaattag 21477504  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccctgaagtatattaatact 206  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  21477503 cgataggggcttgatgccctggagtataataatact 21477468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 8761803 - 8761924
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcata-catttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||   |  | |||||||| ||    
T  8761803 gagtccatgcattagcataacatatgttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttat 8761902  T
Q  186 gccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  8761903 gccctgaaagtatattaatact 8761924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 27250889 - 27251041
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tag 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  | ||||  | ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||    
T  27250889 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcattgataggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagctttagctcaaattag 27250988  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  27250989 cgatgggggcttgatgtcctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 27251041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20135180 - 20135007
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||  ||||||| |||    
T  20135180 tccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatcagcatttcatagttgggggcttgatgccctggag 20135081  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  20135080 ctttatactcaacacgttggagctttagatcatttagcgatgggggcttgatgccctgtaagtatattaatact 20135007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21161685 - 21161551
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctagagcttagtactcaacacga-tggagctttagctcaaata 170  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  21161685 agatgtttaagatgtcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgattggagctttagctcaaaca 21161586  T
Q  171 gcgatgggggctcatgccctga-agtatattaatact 206  Q
     |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21161585 -cgataggggcttatg-cctgacagtatattaatact 21161551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 38801550 - 38801700
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||  ||||    
T  38801550 tgtttaagaggtcgagtccatgcataagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattaactcaaaattagc 38801648  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  38801649 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 38801700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 3705243 - 3705291
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3705243 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctt 3705291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20916185 - 20916078
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  20916185 tgtttaagaggttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 20916087  T
Q  174 atgggggct 182  Q
    || ||||||    
T  20916086 attggggct 20916078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 45489920 - 45489980
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  45489920 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 45489980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 45310545 - 45310605
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  45310545 gagtccatgcactagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 45310605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21714371 - 21714341
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714371 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 21714341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 33050193 - 33050239
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33050193 gagtccatgtattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctt 33050239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 15041651 - 15041800
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15041651 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatataaaagagttgatgattgagatttttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 15041750  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15041751 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagc 15041800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Original strand, 31164956 - 31165147
Alignment:
Q  29 tgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt--aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31164956 tgttgaacctccaaattactgg-atatataagagatgattaacgagatgtttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt-gttgggggctcatg 31165053  T
Q  127 ccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31165054 ccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctcgaatagcgatgggggctcatgccctgaagtatattaatacttatagcgatggggg 31165147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 25642288 - 25642481
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25642288 agatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattgg-ataaataagagatgatgattaagatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttg 25642386  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25642387 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 25642481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19862994 - 19862801
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  19862994 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacataag 19862896  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19862895 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 19862801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 22334998 - 22335191
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22334998 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-atgaataagagatgatgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 22335096  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  22335097 ttgggggctcatgccctggagctttgtacgcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttttgccctggaagtatattaatact 22335191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22432265 - 22432056
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22432265 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg-tataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcatttgcatacatttg 22432167  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tat 209  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  22432166 ttgggggctcatgctctggaactttgtactcaacacgatggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaat 22432067  T
Q  210 agcgatggggg 220  Q
    |||||||||||    
T  22432066 agcgatggggg 22432056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22438815 - 22438606
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22438815 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg-tataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcatttgcatacatttg 22438717  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tat 209  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  22438716 ttgggggctcatgctctggaactttgtactcaacacgatggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaat 22438617  T
Q  210 agcgatggggg 220  Q
    |||||||||||    
T  22438616 agcgatggggg 22438606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 15894547 - 15894731
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15894547 aagatgatgttgaac-tccaacttattgg-atatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 15894644  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15894645 cttatgccctagagcttagtacacaacacgatggagcattagctcaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 15894731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19873136 - 19872943
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  19873136 agatgatcaagatgatgttaaaccttcaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacataat 19873038  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19873037 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 19872943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 21740140 - 21740325
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaag-agaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21740140 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atatatatgagatgaagattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 21740237  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctgaa-gtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21740238 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatcagctcaaaataacaatgggggctcatgccctgaaggtatattaatact 21740325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 16965462 - 16965608
Alignment:
Q  64 tgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagc 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16965462 tgataattgagatgtttaagagatcgagtccatgcattagtattcatatgatgggggcttatgctctggagcttagtactcaccacgatggagctttagc 16965561  T
Q  164 tc-aaatagcgatgggggctcatgccctgaagtatattaatacttat 209  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16965562 tcaaaataacgattggggctcttgccctgaagtatattaatacttat 16965608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18907119 - 18906933
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907119 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 18907022  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18907021 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 18906933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 25629514 - 25629664
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629514 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 25629613  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629614 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagcgatggggg 25629664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21766711 - 21766515
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  21766711 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagcccatgcattagcatacatt 21766612  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21766611 tgttgggggctcatgccctggagttttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccttgaaagtatattaatact 21766515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29060538 - 29060350
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  29060538 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 29060439  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact-tatagcgatggggg 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29060438 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatggggg 29060350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 16523492 - 16523637
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523492 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 16523589  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16523590 cttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaa 16523637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18180510 - 18180357
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  18180510 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatat 18180413  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18180412 gttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaa 18180357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 206
Target Start/End: Original strand, 18692022 - 18692206
Alignment:
Q  24 gatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18692022 gatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggct 18692119  T
Q  123 catgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
     ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18692120 tatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 18692206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22805747 - 22805559
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataaga-gttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  22805747 tccaaattattggattatataagaagttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 22805648  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatactt--atagcgatgggg 219  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22805647 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcatttagcgatgggggcttgatgccttggaagtatattaatacttaaatagcgatgggg 22805559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 21830615 - 21830734
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| ||||    
T  21830615 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgc 21830714  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  21830715 cctgaaagtatattaatact 21830734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 18409953 - 18410138
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  18409953 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 18410052  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggg 218  Q
    | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18410053 ccttgtactccacacaatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagtgatggg 18410138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Original strand, 22074310 - 22074449
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22074310 acaagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtgcatgcattagcatacatttgttggg 22074407  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcttt 160  Q
    |||||||||||| |||| | || |||| |||||| |||||||    
T  22074408 ggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgattgagcttt 22074449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 19303662 - 19303809
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  19303662 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagtatttcattgttgggggcttgatgccctggag 19303761  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303762 ccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 19303809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 20638443 - 20638596
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20638443 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgacgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 20638542  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  20638543 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 20638596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 4185973 - 4186116
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  4185973 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattatcatacatttgttgggggcttactgctccggggctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaa-ct 4186071  T
Q  172 cgatgggggctcatgccctga-agtatattaatacttatagcgatg 216  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  4186072 cgatgggggcttatg-cctgacagtatattaatactaataacgatg 4186116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 4738709 - 4738852
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  4738709 agatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaa-ct 4738807  T
Q  172 cgatgggggctcatgccctga-agtatattaatacttatagcgatg 216  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||    
T  4738808 cgatgggggcttatg-cctgacaatatattaatactaataacgatg 4738852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 22780386 - 22780538
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  || || | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22780386 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgataccttggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattag 22780485  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22780486 cgatgggggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 22780538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4186336 - 4186198
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  4186336 agatgtttaagaggtcgaggtcatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaa-ct 4186238  T
Q  172 cgatgggggctcatgccctga-agtatattaatacttatag 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  4186237 cgatgggggcttatg-cctgacagtatattaatactaatag 4186198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 19773882 - 19773993
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  19773882 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 19773981  T
Q  171 gcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||    
T  19773982 gcgatgggggct 19773993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 17287918 - 17288107
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    |||||| |||||  |||||||  ||    
T  17287918 tccaaattattggattatataagaggttgccgaattaagatgcttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgtgggcttgatgccctgaag 17288017  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17288018 ctttgtactcaacacgttggagttttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 17288107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 28496594 - 28496783
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||| ||||  ||||||| |||    
T  28496594 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggag 28496693  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || | ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  28496694 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgtgagcttgatgccttggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 28496783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 29809005 - 29809194
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||| ||||  ||||||| |||    
T  29809005 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggag 29809104  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || | ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  29809105 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgtgagcttgatgccttggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 29809194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1561258 - 1561127
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgat 175  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  1561258 tttaagaggtcgaatccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgat 1561160  T
Q  176 gggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  1561159 gggggcttgatgccctggaagtatattaatact 1561127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 168
Target Start/End: Original strand, 22408441 - 22408545
Alignment:
Q  65 gatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagc 163  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||| ||||||||||| || ||    
T  22408441 gatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgtcctggagctttgtcgtcaccacgatggagcatttgc 22408540  T
Q  164 tcaaa 168  Q
    |||||    
T  22408541 tcaaa 22408545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20076699 - 20076513
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgat-tgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| || | | ||||||||||||    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  20076699 tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagattttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 20076600  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20076599 ccttatgctcaacacgatggagctttcgctcaa-tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactaatagcgatggggg 20076513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 20361120 - 20361231
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20361120 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttatactcaacacgttggagttttagctcaaatta 20361219  T
Q  171 gcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||    
T  20361220 gcgatgggggct 20361231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Original strand, 31155549 - 31155644
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaa 167  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31155549 agatgtttaagatgtcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaa 31155644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35245541 - 35245393
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcga 174  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||    
T  35245541 tttaagaggtcgagtctatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcga 35245443  T
Q  175 tgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  35245442 tgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 35245393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Original strand, 16960263 - 16960319
Alignment:
Q  154 gagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccctgaagtatattaatacttat 209  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16960263 gagctttagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaagtatattaatacttat 16960319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20593772 - 20593626
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||    ||| ||||||||  ||||||| |||    
T  20593772 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgctgggggcttgatgccctggag 20593673  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20593672 ccttgtgctcaacacgatggagctttagctc-aatagcgatgggggct 20593626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 27553749 - 27553811
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  27553749 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 27553811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 27567787 - 27567849
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  27567787 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 27567849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 20908159 - 20908207
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20908159 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctt 20908207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 25611887 - 25612040
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaa-ata 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| ||    ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| || | |||||| |||||||||  ||    
T  25611887 agatgtttaagaggtcgtgtccatgcattaggatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaattta 25611986  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25611987 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 25612040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11185469 - 11185337
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcga 174  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| ||  || ||||||| | || |||||| ||||||||||  ||||||    
T  11185469 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggatttttgtactcaccgcgttggagcattagctcaaaattagcga 11185371  T
Q  175 tgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  11185370 tgggggcttgatgccctagaagtatattaatact 11185337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 16929742 - 16929798
Alignment:
Q  64 tgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  16929742 tgataattgagatgttaaagagatcgagtccatgcattagcattcatatgatggggg 16929798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22831461 - 22831327
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  || |||| |||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||  ||||    
T  22831461 tgtttaagaggtcgagtccatacattagcattcata-gttgggggcttgattccctggagctttgtactcacgacgttggagcattagctaaaaattagc 22831363  T
Q  173 gatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  22831362 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 22831327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Original strand, 23657588 - 23657635
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  23657588 gagtccatgcattagcatacctt-gttgggggctcatgccctggagctt 23657635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 19790956 - 19791016
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  19790956 gagttcatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 19791016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 25603549 - 25603660
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaa-ata 170  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||    |||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||| || | |||||| |||||||||  ||    
T  25603549 agatgtttaagaggtcgtgtccatgcattagcatttcattgttgagggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaattta 25603648  T
Q  171 gcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||    
T  25603649 gcgatgggggct 25603660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22432073 - 22432043
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22432073 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 22432043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22438623 - 22438593
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22438623 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 22438593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Original strand, 3852183 - 3852267
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||  |||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3852183 tccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 3852267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25754805 - 25754721
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||  |||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25754805 tccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 25754721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 16920844 - 16920927
Alignment:
Q  127 ccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  16920844 ccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaatagcaatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 16920927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 18154949 - 18155150
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18154949 caagatgaagttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattgagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 18155047  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgg 217  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  18155048 ctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 18155147  T
Q  218 ggg 220  Q
    |||    
T  18155148 ggg 18155150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 19649590 - 19649783
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19649590 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatatttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 19649688  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19649689 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 19649783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24054467 - 24054272
Alignment:
Q  27 gatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054467 gatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagtgatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 24054369  T
Q  127 ccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  24054368 ccctggagctttgtactcaacgcgatggagctttagctcaaatagagatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 24054272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12187027 - 12186841
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187027 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 12186929  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12186928 ctcatgccctagagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 12186841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9703279 - 9703069
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9703279 agatgatcaagatgatgttcaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaatatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 9703181  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--ta 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |    
T  9703180 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctgaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaa 9703081  T
Q  209 tagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||||    
T  9703080 tagcgatggggg 9703069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 17138169 - 17138355
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17138169 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 17138267  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17138268 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 17138355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 32216649 - 32216829
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  32216649 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggt-tacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 32216747  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  32216748 gttgggggctcatgccctggagcttagtacttaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttgaa 32216829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15211449 - 15211279
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtata-tataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagc 135  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  15211449 tccaaattattggactaatataagagatgatgattaagatgttttaagagttagagtccatgcattagcatacataagttgggggcttatgccctggagc 15211350  T
Q  136 ttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaata 204  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15211349 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattaacgatgggggctcatgccctggaagtatattaata 15211279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2760150 - 2760014
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760150 acaagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 2760053  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagc 157  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||    
T  2760052 ggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagc 2760014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 12321864 - 12322036
Alignment:
Q  37 ctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagag 134  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12321864 ctccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggag 12321962  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctgaa-gtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  12321963 ctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaacgtatatttatact 12322036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3271839 - 3271702
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaac-gagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3271839 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagataattgagtccatgcattagcatacattt 3271742  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271741 gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 3271702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 39268000 - 39268137
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39268000 agatgatcaagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacattt 39268097  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  39268098 gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 39268137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14429891 - 14429706
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14429891 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt-gttggggg 14429795  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14429794 cttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 14429706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14258260 - 14258085
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcata-catttgttgggggc--tcatgccctag 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||   | ||||||| |    
T  14258260 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatacattagcatttcatttgttggggggcatgatgccctgg 14258161  T
Q  133 agcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14258160 agctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattgcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 14258085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9509188 - 9508998
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  9509188 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 9509089  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatggggg-ctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  9509088 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 9508998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13032720 - 13032567
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaata 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13032720 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaata 13032621  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13032620 gcaatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 13032567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16579517 - 16579384
Alignment:
Q  92 tccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccc 189  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  16579517 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccc 16579418  T
Q  190 t-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16579417 tggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 16579384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 220
Target Start/End: Original strand, 16586146 - 16586279
Alignment:
Q  92 tccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccc 189  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  16586146 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccc 16586245  T
Q  190 t-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16586246 tggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 16586279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 10063978 - 10064113
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  10063978 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaattag 10064077  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccctgaagtatattaatact 206  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  10064078 cgataggggcttgatgccctgaagtataataatact 10064113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 220
Target Start/End: Original strand, 11996204 - 11996340
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggc-tcat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  11996204 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgat 11996302  T
Q  186 gccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11996303 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 11996340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18302016 - 18301918
Alignment:
Q  55 tataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatg 153  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  18302016 tatatgagatgatgattaagatgtttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgatg 18301918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10589000 - 10588845
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatt---tgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  10589000 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcag-cattcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 10588902  T
Q  169 -tagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
     ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10588901 ttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 10588845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12698830 - 12698683
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  ||||||| || ||| ||| || |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||| ||| |||    
T  12698830 tccaaattattggattatataaaaggttgttgaattaagatgtctaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgtcctggag 12698731  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12698730 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggct 12698683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38227442 - 38227344
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaata 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38227442 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagaatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctatagctcaaata 38227344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 16461243 - 16461343
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatgggg 219  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16461243 atgccctggagctttgtactcaaaacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 16461342  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  16461343 g 16461343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26211950 - 26211819
Alignment:
Q  79 ttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctca-aatagcgatg 176  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  26211950 ttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcagattagcgatg 26211852  T
Q  177 ggggc--tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  26211851 ggggccttgatgccctggaagtatattaatact 26211819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34200741 - 34200651
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  34200741 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 34200651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 9446336 - 9446398
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  9446336 gagtccatgcattagcatacttttgtcgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 9446398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Original strand, 16386411 - 16386519
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||  |||     
T  16386411 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttttactcaccacgttggagcattagctcaaaattagt 16386509  T
Q  173 gatgggggct 182  Q
    ||||||||||    
T  16386510 gatgggggct 16386519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42203934 - 42203873
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  42203934 gagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 42203873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Original strand, 16461348 - 16461432
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  16461348 atgccctggagctttgtactcaacacgttgaagctttagctcaattagcgatgagggcttgatgccctgaaagtatattagtact 16461432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Original strand, 28505496 - 28505597
Alignment:
Q  125 tgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggg 218  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  28505496 tgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 28505595  T
Q  219 gg 220  Q
    ||    
T  28505596 gg 28505597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Original strand, 27847993 - 27848101
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||  ||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||  ||||    
T  27847993 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaaaattagc 27848091  T
Q  173 gatgggggct 182  Q
    ||||||||||    
T  27848092 gatgggggct 27848101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 16461166 - 16461238
Alignment:
Q  152 tggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16461166 tggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 16461238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15580710 - 15580617
Alignment:
Q  17 tgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15580710 tgaataagatgatgatgaac-tccaaattattgg-atgtatgagagattgatgattaagatgtttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 15580617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Original strand, 18155133 - 18155163
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18155133 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 18155163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24054289 - 24054259
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054289 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 24054259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Original strand, 32216842 - 32216872
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216842 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 32216872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9703086 - 9703057
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703086 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctga 9703057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 65899 - 66091
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  65899 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 65997  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  65998 ttgggggctcatgccctggagctttgaactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 66091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 128750 - 128577
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  128750 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 128651  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccc-tgaagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  128650 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgcccttgaagtatattaatact 128577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36463 - 36262
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36463 caagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 36365  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgg 217  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  36364 ctcatgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 36265  T
Q  218 ggg 220  Q
    |||    
T  36264 ggg 36262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36279 - 36249
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36279 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 36249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 69810 - 69601
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  69810 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 69712  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tat 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  69711 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaat 69612  T
Q  210 agcgatggggg 220  Q
    |||||||||||    
T  69611 agcgatggggg 69601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 69618 - 69588
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69618 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 69588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19996 - 19788
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19996 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagataatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 19898  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tata 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  19897 ttgggggctcatgccctggagttttgtactcaacacgatggagctttagctcaattagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaata 19798  T
Q  211 gcgatggggg 220  Q
    ||||||||||    
T  19797 gcgatggggg 19788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19805 - 19775
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19805 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctgaa 19775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 22741065 - 22741258
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22741065 agatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattgg-ataaataagagatgatgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 22741163  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22741164 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 22741258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 22799227 - 22799421
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22799227 agatgaataagatgatgttgaatctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagaccgagtccatgcattagcatacatat 22799325  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22799326 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 22799421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 22758820 - 22759013
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22758820 agatgatcaagatgatgttgaacatccaaattattgg-ataaataagagatgatgattaagatgtataagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 22758918  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  22758919 ttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcctatgccctggaagtatataaatact 22759013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 23019815 - 23020001
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23019815 aagatgatgtcgaacctccaaattattgg-atatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 23019913  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  23019914 ctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggtgaattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggatgtatattaatact 23020001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 40622319 - 40622505
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40622319 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgtggg 40622417  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40622418 ctcatgcccttgagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataacgatgtgggctcatgccctgaaagtatattaatact 40622505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24673577 - 24673389
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24673577 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 24673479  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc--aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24673478 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatact 24673389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 45678238 - 45678423
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaag-agaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45678238 aagatgatgttgaac-tccaaattattggaa-atatatgagatgatgattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 45678335  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  45678336 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctaatgcactgaaagtatattaatact 45678423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24680196 - 24680006
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg---tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgg 117  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24680196 aagatggtgttgaacttc-aaattattggatatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtcaatgcattagcatacatttgttgg 24680098  T
Q  118 gggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc--aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24680097 gggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 24680006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 25963816 - 25964009
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25963816 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacattt 25963913  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25963914 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 25964009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37524694 - 37524506
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37524694 acaagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 37524597  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37524596 ggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 37524506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23060511 - 23060322
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  23060511 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 23060412  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23060411 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 23060322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 22812020 - 22812206
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22812020 aagatgatgttgaacg-ccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 22812117  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccc-tgaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  22812118 gctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaatattgttgggggcttatgcccttaaagtatattaatact 22812206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22337081 - 22336935
Alignment:
Q  77 gtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgat 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22337081 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacaatggagctttagctcaaattgcgat 22336982  T
Q  176 gggggctcatgccct-gaagtatattaatact-tatagcgatggggg 220  Q
    ||||  | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22336981 ggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaatagcgatggggg 22336935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 21318737 - 21318933
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgat-tgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcataca 109  Q
    |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21318737 agatgaatgagatgttgttgaac-tccaaattattggatgtatataaga--tgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcataca 21318833  T
Q  110 tttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc--aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  21318834 tatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatattaatact 21318933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 21327668 - 21327864
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgat-tgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcataca 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21327668 agatgaataagatgttgttgaac-tccaaattattggatgtatataaga--tgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcataca 21327764  T
Q  110 tttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc--aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  21327765 tatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatgttaatact 21327864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 137
Target Start/End: Original strand, 21916207 - 21916321
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916207 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 21916304  T
Q  121 ctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||| ||||||    
T  21916305 ctcatgccctggagctt 21916321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40428402 - 40428283
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |  | || ||||| ||||    
T  40428402 gagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgagggcttatgc 40428303  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  40428302 cctgaaagtatattaatact 40428283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8946655 - 8946482
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||| ||| ||  ||||||| |||    
T  8946655 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttagggacttgatgccctggag 8946556  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  8946555 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgtcctggaagtatattaatact 8946482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 23654546 - 23654699
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||  | |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23654546 agatgtttaagaggtcgagtccatgcactagcattcattgttggggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 23654645  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23654646 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 23654699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 24716629 - 24716765
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgt-ttaagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||  ||||  ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  24716629 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgggttaaatgattgagtccatgcattaacatacattt 24716726  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  24716727 gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 24716765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 23072112 - 23072262
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  23072112 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgctctagagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 23072210  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23072211 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 23072262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 21900613 - 21900766
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaa-ata 170  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||    
T  21900613 agatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaattta 21900712  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21900713 gcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21900766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 22731408 - 22731529
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcat 185  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||  || |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |    
T  22731408 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgattccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttggt 22731507  T
Q  186 gccc-tgaagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  22731508 gcccttgaagtatattaatact 22731529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 220
Target Start/End: Original strand, 38292 - 38428
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggc-tcat 185  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||    
T  38292 gagtccatgcattagcattca-ttgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 38390  T
Q  186 gccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  38391 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 38428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23657702 - 23657644
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23657702 atgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 23657644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 23103558 - 23103707
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  23103558 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcactca-ttgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcg 23103656  T
Q  174 atgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  23103657 atgggggcttgatgccctgaaagtatattactactcaaatagcgatggggg 23103707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20309054 - 20308958
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20309054 cgagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaattagcgatgggggct 20308958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 220
Target Start/End: Original strand, 22738357 - 22738490
Alignment:
Q  92 tccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccc 189  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  22738357 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctctgtactcaacacgttggagctttaactcaattagtgatgggggcttgatgccc 22738456  T
Q  190 t-gaagtatattaatactta--tagcgatggggg 220  Q
    | |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22738457 tggaagtatattaatactcaattagcgatggggg 22738490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24174739 - 24174677
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  24174739 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 24174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 24655516 - 24655578
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  24655516 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 24655578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23076440 - 23076298
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||  |     
T  23076440 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggccgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgaac 23076341  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076340 ctttgtac-----acgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 23076298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 25961709 - 25961771
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  25961709 gagtcaatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 25961771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 23040349 - 23040486
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||    ||||||||||||  ||||| |  |  || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  23040349 agatgtttaagaggtcgagtgcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttgaaattttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 23040448  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  23040449 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 23040486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24869819 - 24869757
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  24869819 gagtccatggattagcatacttttgttaggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 24869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23130858 - 23130789
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23130858 tccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 23130789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23133325 - 23133256
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23133325 tccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 23133256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 34402688 - 34402757
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34402688 tccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 34402757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 23776936 - 23777130
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23776936 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattgagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 23777034  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  23777035 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatact 23777130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 17354044 - 17354237
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17354044 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagaaatcgagtccatgcattagcatacatttg 17354142  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  17354143 ttaggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatact 17354237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 21168832 - 21169028
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagt--ccatgcattagcatacat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21168832 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtttccatgcattagcatacat 21168930  T
Q  111 ttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21168931 atgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 21169028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19899111 - 19898917
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19899111 agatgatcaagacgatgttgaacctccaaattattgg-atacctaagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 19899013  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19899012 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattcgctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 19898917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 21162159 - 21162354
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagt--ccatgcattagcatacat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21162159 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacttaagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtttccatgcattagcatacat 21162257  T
Q  111 ttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatac 205  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21162258 atgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatac 21162354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16184728 - 16184543
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16184728 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 16184631  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  16184630 cttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagaatattaatact 16184543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Original strand, 20466149 - 20466335
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466149 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatataagagatgattattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 20466247  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatac 205  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20466248 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctgaaagtatattaatac 20466335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24755722 - 24755554
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24755722 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 24755625  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctg 191  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24755624 cttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaataacgatgggggctcaagccctg 24755554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19983102 - 19982915
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19983102 caagacgatgttgaacctccaaattattag-atacataaaagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 19983004  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19983003 gctcatgccctggagcttagtagtcaacacgatggagcactagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 19982915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 377279 - 377092
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  377279 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatccatttgcatacatttgttgggg 377181  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  377180 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataatgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatact 377092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 44384970 - 44385142
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtata-tataagagttgatgattgagatgtttaagagaa-cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagc 135  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44384970 tccaaattattggactaatataagagatgatgattgtgatgtttaagagattcgagtccatgcattagcattcatttgttgggggctcatgccctggagc 44385069  T
Q  136 ttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44385070 tttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattaacgattgaggcttatgccctggaagtatattaatact 44385142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 19259692 - 19259872
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  19259692 agatgaataagatgatgttgtacctccaaattattgg-atatatatgagatgataattaagatgttttaatagattgagtccatgcagtagcatacattt 19259790  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  19259791 gttgggggctcatgccctagaactttttcctcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 19259872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 30643400 - 30643586
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643400 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 30643497  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30643498 gctcatgccctggaactttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 30643586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 15611566 - 15611753
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611566 acaagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtcttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 15611663  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15611664 ggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 15611753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 17926806 - 17926999
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| | |||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  17926806 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagtatacattt 17926903  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17926904 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 17926999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 16410353 - 16410542
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410353 aagatgatgttgaatatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatggtttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 16410452  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagc-gatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| ||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16410453 gctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 16410542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 15603114 - 15603301
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603114 acaagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtcttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 15603211  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15603212 ggctcatgccctggagatttctactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 15603301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Original strand, 22010772 - 22010919
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22010772 acaagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttagg 22010869  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||    
T  22010870 ggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 22010919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22626697 - 22626547
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||| ||||  ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22626697 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttggaggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgattgagctttagctcaaatag 22626598  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22626597 cgatgggggcttgatgccctggaagtataataatacttatagcgatggggg 22626547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 18879353 - 18879540
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagct 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |  | ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18879353 tccaaattattggattatataagaggttgtcattaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagct 18879452  T
Q  137 tagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18879453 ttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatggtggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 18879540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 16861425 - 16861619
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  16861425 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgttgattaagatgttttaggtgattgagtccatgcattaacatacatat 16861522  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16861523 gttgggggcacatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 16861619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 18818531 - 18818704
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||||||||| |  ||||||| |||    
T  18818531 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccctggag 18818630  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  18818631 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 18818704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 28649170 - 28649317
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||| | |||    
T  28649170 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggag 28649269  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649270 ccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 28649317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23406378 - 23406205
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  23406378 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 23406279  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  23406278 ctttgtactcaacacgttggagccttagctcaattagcgatggtggcttgatgccctggaagtatattaatact 23406205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Original strand, 21919160 - 21919267
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21919160 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgcgggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatag 21919258  T
Q  172 cgatggggg 180  Q
    |||||||||    
T  21919259 cgatggggg 21919267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Original strand, 20856602 - 20856724
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||  |||||||||||||||||||||   |  | |||||||| |||    
T  20856602 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagtcttgtcctcacaacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatg 20856701  T
Q  187 ccctg-aagtatattaatactta 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  20856702 ccctgaaagtatattaatactta 20856724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21249342 - 21249193
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  21249342 tgtttaagaggccgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 21249244  T
Q  174 atgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21249243 atgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21249193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21255180 - 21255031
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  21255180 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 21255082  T
Q  174 atgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21255081 atgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21255031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 39095102 - 39095221
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  39095102 gagtctatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatgaagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgc 39095201  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  39095202 cctgaaagtatattaatact 39095221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 5866437 - 5866587
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  5866437 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 5866535  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5866536 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 5866587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 45131159 - 45131309
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  45131159 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 45131257  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  45131258 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 45131309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Original strand, 21924087 - 21924223
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagc 172  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||    |||||||||  | ||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  21924087 agatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttggggcttaatgccctggagctttgtacgcaacaagttggagctttagctcaattagc 21924186  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatactt 207  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  21924187 gatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactt 21924223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22875064 - 22874879
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  22875064 tccaaattattggactatataagaggttgttgatttaagatatttaagaggtcgagtccatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 22874965  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22874964 cctt-tgctcaacacgatggagctttagctcaa-tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagcgacggggg 22874879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20536207 - 20536018
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||  | |||||||||||||||||    |||||||||| |  |||||||||||    
T  20536207 tccaaattattgaattatataagagattgttgaattaagatgtctaagaggtctagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccctagag 20536108  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  20536107 ctttgtactcaccacgttggagctttagcttaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 20536018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23648546 - 23648357
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||      ||||||||||  ||||||| |||    
T  23648546 tccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcacagttgggggcttgatgccctggag 23648447  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatactta--tagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  23648446 ctttgtactcaacacattggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtctattaatactcaattagcgatggggg 23648357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7372777 - 7372604
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||   |||||||||||| | |||    ||||||||||||  |||| || |||    
T  7372777 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggttgagtccatgcatcaacatttcattgttgggggcttgatgcactggag 7372678  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  7372677 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatattgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 7372604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 13508245 - 13508380
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  13508245 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaattag 13508344  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccctgaagtatattaatact 206  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  13508345 cgataggggcttgatgccctggagtatagtaatact 13508380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Original strand, 16199807 - 16199915
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  16199807 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 16199905  T
Q  173 gatgggggct 182  Q
    ||||||||||    
T  16199906 gatgggggct 16199915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 21389613 - 21389763
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  21389613 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagc 21389711  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21389712 gatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21389763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 21396143 - 21396293
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  21396143 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 21396241  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21396242 gatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21396293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 21778939 - 21779089
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  21778939 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagc 21779037  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21779038 gatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21779089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 21790636 - 21790786
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  21790636 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 21790734  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21790735 gatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21790786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31971212 - 31971109
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaa-atagcgat 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  31971212 tttaagagatcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaatttagcgat 31971114  T
Q  176 ggggg 180  Q
    |||||    
T  31971113 ggggg 31971109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17140874 - 17140739
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa---tag 171  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||   |||    
T  17140874 tgtttaagaggtcgagtccatacattagtattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaattag 17140776  T
Q  172 cgatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  17140775 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17140739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6759258 - 6759088
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  6759258 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 6759159  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatac 205  Q
    | |  | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  6759158 cctt-tgctcaatacgatggagctttagctc-aatagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 6759088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21490950 - 21490859
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat 169  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  21490950 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattcgtt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaat 21490859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 16092501 - 16092609
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||| ||||  ||||||| |||| |  | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16092501 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagcctt-tgctcaatacgatggagctttagctc-aatag 16092598  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
    |||||||||||    
T  16092599 cgatgggggct 16092609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4483277 - 4483208
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4483277 tccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 4483208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 169
Target Start/End: Original strand, 13597777 - 13597874
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat 169  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||     |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  13597777 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaaat 13597874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41598147 - 41598099
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41598147 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggct 41598099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 45290850 - 45290931
Alignment:
Q  27 gatgttgaacctccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45290850 gatgttgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 45290931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 9064 - 9257
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9064 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagaaatcgagtccatgcattagcatacatttg 9162  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9163 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6103 - 5917
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6103 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 6005  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6004 ctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggagcttatgccctggaagtatattaatact 5917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18059
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatttg 18154  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18153 ttgggggctcataccctggagcttagtactgaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 18059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 7916 - 8127
Alignment:
Q  12 tgagatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7916 tgagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattaacatacatt 8014  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--t 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||       
T  8015 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaattagtgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaa 8114  T
Q  208 atagcgatggggg 220  Q
    |||||||||||||    
T  8115 atagcgatggggg 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23201376 - 23201180
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23201376 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattatgatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 23201278  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatactta 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23201277 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgcactggaagtatattaatactta 23201180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26704084 - 26703884
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704084 caagatgatgttgaacctctaaattattgg-ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatagatttgttggggg 26703986  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgg 217  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||    
T  26703985 ctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aatagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgg 26703887  T
Q  218 ggg 220  Q
    |||    
T  26703886 ggg 26703884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26973817 - 26973617
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973817 caagatgatgttgaacctctaaattattgg-ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatagatttgttggggg 26973719  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgg 217  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||    
T  26973718 ctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aatagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgg 26973620  T
Q  218 ggg 220  Q
    |||    
T  26973619 ggg 26973617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14079157 - 14078972
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14079157 aagatgatgttgaacctccaa-ttattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatgtgttggggg 14079060  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14079059 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 14078972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 18770110 - 18770298
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18770110 aagatgatgttgaacctccaaattattggatatatagatgagatgatgattaagatgttttaagagactgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 18770209  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18770210 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 18770298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 23501456 - 23501635
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23501456 agatgatcaagatgatgttgaacttccaaaatattgg-ataaatacgagatgatgtttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttg 23501554  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23501555 ttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaatagcgatgggggctcatgccatgaa 23501635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21873270 - 21873076
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21873270 agatgaataagatgatgttgaccctccaaattattgg-atacatatgagatgatcattaacatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 21873172  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21873171 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcaatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 21873076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22032331 - 22032145
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22032331 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgaggg 22032233  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22032232 ctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 22032145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23512114 - 23511924
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttta--agagaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||     
T  23512114 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgtttataagagatcgagctcatgcattagcatacata 23512016  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaata 204  Q
    ||||||   || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23512015 tgttgg---cttatgccctggagcttagtactcaccacgatggagctttagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaata 23511924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9077951 - 9077764
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgat-tgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| || | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  9077951 tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 9077852  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077851 ccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagcgatggggg 9077764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20805568 - 20805371
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||     
T  20805568 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacata 20805469  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20805468 tgttgggggctcatgcccttgagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 20805371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23572029 - 23571899
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatg 176  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  23572029 tttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgtttggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagcttaaattagcgatg 23571930  T
Q  177 ggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23571929 ggggcttatgccctggaagtatattaatact 23571899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 22107788 - 22107908
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatg 186  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22107788 cgagtctatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatg 22107887  T
Q  187 ccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  22107888 ccctggaagtatattaatact 22107908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 21366773 - 21366959
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366773 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 21366870  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21366871 cttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 21366959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24493530 - 24493378
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493530 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 24493431  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  24493430 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 24493378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20766990 - 20766834
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||     
T  20766990 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttaaatgattgagtccatgcattagcatacata 20766891  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||    
T  20766890 tgttgggggttcatgccctatagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 20766834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1096465 - 1096278
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  1096465 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 1096366  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatactt-atagcgatggggg 220  Q
    | | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1096365 ccttgtgctcaacatgatggagctttagctcaaatagcgatggggcttgatgccctgaaagtatattaatacttaatagcgatggggg 1096278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 21997656 - 21997845
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  21997656 tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 21997755  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21997756 ctttgtactcaacatgatggagcttgagctcaaatagcgatgggggctttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21997845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25431356 - 25431204
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25431356 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatggcctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaattag 25431257  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25431256 cgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 25431204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 1859077 - 1859213
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1859077 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagttgattgagtccatgcattagcatacattt 1859174  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  1859175 gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 1859213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24529219 - 24529030
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgat-gattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  | |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  24529219 tccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 24529120  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  24529119 ctttgtacttaatacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 24529030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25421492 - 25421340
Alignment:
Q  74 gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagc 172  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25421492 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctttatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaattagc 25421393  T
Q  173 gatggggg--ctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25421392 gatggggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 25421340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13095493 - 13095320
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  | |||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||| |||    
T  13095493 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttgggggcttgatgccctggag 13095394  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  13095393 ctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 13095320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 17919320 - 17919439
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| |  | |||||||| ||||    
T  17919320 gagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcattaactcaaataaatgttgggggcttatgc 17919419  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  17919420 cctgaaagtatattaatact 17919439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13025309 - 13025136
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  | |||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||| |||    
T  13025309 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttgggggcttgatgccctggag 13025210  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  13025209 ctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaatagtgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 13025136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 123480 - 123599
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  123480 gagtccatgcattagcaatgatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgc 123579  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  123580 cctgaaagtatattaatact 123599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23439919 - 23439856
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  23439919 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcaccacgat 23439856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23451286 - 23451223
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  23451286 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcaccacgat 23451223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 8287004 - 8287156
Alignment:
Q  74 gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tag 171  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| |||    
T  8287004 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtacccaccacgttggagctttagctcaaattag 8287103  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  8287104 cgatggaggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 8287156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 21293132 - 21293266
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  21293132 tgtttaagaggtcgagtccatgaattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 21293230  T
Q  173 gatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  21293231 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 21293266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 19660998 - 19661147
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  19660998 tgtttaagaggttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccatggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 19661096  T
Q  174 atgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19661097 atgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 19661147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23458530 - 23458467
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  23458530 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 23458467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23462791 - 23462728
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  23462791 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 23462728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22074981 - 22074845
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||| ||    
T  22074981 agatgcttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgtttgagtattagctcaaatta 22074883  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22074882 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 22074845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 23390618 - 23390791
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  23390618 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggag 23390717  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||    
T  23390718 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcattcagtgatgggggcttgataccctggaagtatattaatact 23390791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37723861 - 37723711
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||  ||||    
T  37723861 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaattagc 37723763  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  37723762 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcgaatagcgatggggg 37723711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 21808552 - 21808701
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  21808552 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagccttcatt-gttgggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 21808650  T
Q  174 atggggg-ctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21808651 atgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21808701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24221816 - 24221754
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  24221816 gagtccatgcattaacatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 24221754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 12028742 - 12028802
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  12028742 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 12028802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22757067 - 22757007
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  22757067 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 22757007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31342088 - 31342041
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31342088 cgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctt 31342041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 39363380 - 39363311
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39363380 tccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 39363311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 21729227 - 21729377
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||  | |||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  21729227 tgtttaagaggtcgagttcatgcattagccgtcattgttggggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 21729326  T
Q  174 atggggg-ctcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21729327 atgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 21729377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26680521 - 26680461
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  26680521 gagtccatgcattatcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 26680461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26952128 - 26952068
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  26952128 gagtccatgcattatcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 26952068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 182
Target Start/End: Original strand, 33895988 - 33896037
Alignment:
Q  132 gagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33895988 gagctttgtactcaacacgatgaagctttagctc-aatagtgatgggggct 33896037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Original strand, 20806908 - 20806992
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||  |||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20806908 tccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtttaagaattcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 20806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 14195 - 14381
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14195 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 14293  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14294 gcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 14381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 220
Target Start/End: Original strand, 17396 - 17532
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatg 186  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17396 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggaggtttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatg 17495  T
Q  187 ccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17496 ccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 17532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15093783 - 15093597
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttta-agagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15093783 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatataagagatgatgattaagatgtttttagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 15093685  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15093684 ctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcgatggtggcttatgccctggaagtatattaatact 15093597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13569518 - 13569308
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13569518 agatgatcaagatgatgttcaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaatatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 13569420  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--ta 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |    
T  13569419 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctgaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaa 13569320  T
Q  209 tagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||||    
T  13569319 tagcgatggggg 13569308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44675648 - 44675438
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44675648 agatgatcaagacgatgttgaacctccaaattactgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 44675550  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact--ta 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |    
T  44675549 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaa 44675450  T
Q  209 tagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||||    
T  44675449 tagcgatggggg 44675438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 15121909 - 15122095
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15121909 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 15122007  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15122008 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacaatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 15122095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23843494 - 23843300
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23843494 agatgatcaaaatgatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 23843396  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23843395 gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattggctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 23843300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12570022 - 12569838
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12570022 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 12569925  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12569924 cttataccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 12569838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 15125150 - 15125336
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15125150 aagatgatgtcgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 15125248  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15125249 ctcattccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 15125336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 17048435 - 17048606
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtata-tataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagct 136  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17048435 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 17048534  T
Q  137 tagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  17048535 ttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcatatgccctggaagtatattaatact 17048606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 16348764 - 16348957
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16348764 agatgaataagatgatgttgaac-tctaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacattt 16348861  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16348862 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 16348957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 16357052 - 16357205
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16357052 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacattt 16357149  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16357150 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 16357205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 16488186 - 16488371
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16488186 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtacatgcattagcatacattcgttgggg 16488283  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
     |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16488284 -ctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 16488371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Original strand, 13813127 - 13813264
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813127 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttggggg 13813224  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcttt 160  Q
    ||||||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||    
T  13813225 ctcatgccctgaagctttgtcctcaccacgattgagcttt 13813264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 16270358 - 16270505
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  16270358 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 16270457  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16270458 ctttggactcaacacgatggagctttagctcaaatagagatgggggct 16270505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7893701 - 7893512
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  7893701 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 7893602  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7893601 ctttgtactcaacacgttgaagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 7893512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22636434 - 22636245
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  22636434 tccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 22636335  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22636334 ctttgtgctcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 22636245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12902718 - 12902582
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  12902718 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 12902620  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  12902619 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 12902582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 16377680 - 16377832
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16377680 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattag 16377779  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16377780 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 16377832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7798736 - 7798584
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  7798736 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaataag 7798637  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7798636 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 7798584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 16240129 - 16240265
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    ||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16240129 agatgtttaacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgatgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctcagatag 16240228  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  16240229 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 16240265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Original strand, 631105 - 631218
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  631105 tccaaattattgg-atatatatgagatgataattaagatgtttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctt 631203  T
Q  138 agtactcaacacgat 152  Q
     || |||| ||||||    
T  631204 tgtcctcaccacgat 631218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 5339150 - 5339271
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaat-agcgatgggggctcat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||| ||    
T  5339150 cgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagccttgtcatcaccacgatggagctttagctctaaataattgttgggggcttat 5339249  T
Q  186 gccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  5339250 gccctgaaagtatattaatact 5339271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 14053464 - 14053614
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  14053464 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 14053562  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14053563 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatggggg 14053614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44052828 - 44052654
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||| || | ||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  44052828 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgaatctacgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 44052729  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  44052728 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 44052654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3096254 - 3096144
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||| ||    
T  3096254 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgaagcattagctcaaatta 3096156  T
Q  171 gcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||    
T  3096155 gcgatgggggct 3096144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12423696 - 12423560
Alignment:
Q  25 atgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttta-aga--gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||  |||  ||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12423696 atgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtttttagattgattgagtccatgcgttaacatacatttgttgggggc 12423599  T
Q  122 tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcttt 160  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||    
T  12423598 tcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagcttt 12423560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 23374516 - 23374649
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  23374516 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcg 23374614  T
Q  174 atgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  23374615 attggggcttgatgccctggaagtataataatact 23374649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15551763 - 15551668
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15551763 cgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggct 15551668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 15353485 - 15353547
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  15353485 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 15353547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14038618 - 14038510
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||| |  | ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14038618 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaacatgatggagctttagctc-aatag 14038521  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
    |||||||||||    
T  14038520 cgatgggggct 14038510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17046445 - 17046295
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| || | |||| |||| | ||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  17046445 tgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattca-tagttgagggcttgatgccctggagctttgcactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 17046347  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17046346 gatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 17046295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 16352029 - 16352091
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||    
T  16352029 gagtccatgcattagcatacttctgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccacga 16352091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25555417 - 25555374
Alignment:
Q  92 tccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25555417 tccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctt 25555374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13569325 - 13569296
Alignment:
Q  163 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569325 ctcaaatagcgatgggggctcatgccctga 13569296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Original strand, 51464034 - 51464118
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||  |||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  51464034 tccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 51464118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 160
Target Start/End: Original strand, 13813292 - 13813340
Alignment:
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcttt 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||    
T  13813292 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagcttt 13813340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 160
Target Start/End: Original strand, 13813381 - 13813429
Alignment:
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcttt 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||    
T  13813381 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagcttt 13813429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 15780 - 15973
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15780 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttg 15878  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15879 ttgcgggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattaactcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 15973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 10623 - 10812
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10623 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaat-attgg-ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattaggatacatttg 10720  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  10721 ttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaat--taatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 10812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23852 - 23668
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23852 caagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 23754  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  23753 ctcatgccatggagctttgtactcaacacgatagagctttagctc-aatagtgatgggggcttatgccctggaggtatattaatact 23668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 18563 - 18749
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18563 aagaagatgttgaacctccaaattattgg-atacataagagatgaagattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 18661  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18662 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 38588 - 38774
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38588 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atttataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 38686  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38687 ctcatgccctggagcttagtactcaacacgattgagcattagctcaaattagcaatgggggcttatgccctagaagtatattaatact 38774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 119833 - 119700
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  119833 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgagggcttgatgccctggagctctgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 119735  T
Q  174 atgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  119734 atgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 119700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1355 - 1162
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1355 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattttgatttttaagatatcgagtccatgcattagcatacatttg 1257  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1256 ttgggggctcatgttctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcatatgccctagaagtatattaatact 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7303 - 7118
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7303 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttttggg 7205  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
     ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7204 ttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 220
Target Start/End: Original strand, 15641 - 15777
Alignment:
Q  90 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctc-at 185  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  15641 agtccatgcattaacattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 15739  T
Q  186 gccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15740 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 15777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 35028 - 35212
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35028 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 35125  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35126 cttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 35212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 178907 - 178739
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178907 caagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 178809  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccctg 191  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  178808 ctcataccctggagctttgtacttaacatgatggagctttagctc-aatagcgatgggggcttatgccctg 178739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 4913 - 5101
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  4913 aagatgatgttgaacctccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcaatagcatagatatgttgggg 5012  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5013 gcttatgccctaaagcttagtactcaacatgatggagcattagctcaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1889 - 1702
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1889 aagatgatgttgaacctccaaaatattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 1791  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc--aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1790 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatact 1702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39111 - 38925
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39111 aagatgatgttgagcctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 39013  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  39012 ctcatgccctggagcttagtactcaacacgatgcagcattagctcaaattagcgaagggggcttataccctggaagtatattaatact 38925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23687 - 23501
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23687 aagatgatgttgagcctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 23589  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23588 ctcatgccctggagcttagtactcaacacgatgtagctttttctcaaattatcgatgggggcttattccctggaagtatattaatact 23501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14672 - 14485
Alignment:
Q  22 aagatgatgtt-gaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14672 aagatgatgtttgaacctccaaattatttg-atacataagggatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 14574  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  14573 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatgtagcattagctcaaattagcgaagggggcttattccctggaagtatattaatact 14485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10511 - 10317
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10511 agatgatcaagacgatgttgaacctccaaattcttgg-atacctaagagatgacgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 10413  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  10412 gttgggtgctcatgcccttgagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 10317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3758 - 3564
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  3758 agatgatcaagatgattctgaacctccaaattactgg-atatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagtatacatat 3660  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  3659 gttaggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatttatact 3564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8189 - 7995
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  8189 agatgatcaagatgattctgaacctccaaattactgg-atatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagtatacatat 8091  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  8090 gttaggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatatttatact 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 16449 - 16643
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16449 agatgaacaatatgatgttgaatctctaaattattgg-atacataagagatgatgattatgacgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatat 16547  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16548 gttgggggatcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 16643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20955 - 20881
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagcttta 161  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20955 cgagtccatgcattagcatttcattgttggggccttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagcttta 20881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 21912 - 22099
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcat-acatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21912 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacatttgttgggg 22010  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22011 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 22099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 29804 - 29991
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcat-acatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29804 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacatttgttgggg 29902  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29903 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 29991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2840 - 2655
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2840 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagtgattgagtccatgcattaccatacatttgttggggg 2743  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2742 ctcatgcccttgagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataatgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 2655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6506 - 6322
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6506 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atatatatgagatgatgattaagatgttttaagggattgagtccatgcattaccatacatttgttggggg 6409  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatac 205  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6408 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataatgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatac 6322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32452 - 32269
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32452 aagatgatgtcgaacctccaaattattgg-atacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattatcatacatatgttggggg 32354  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32353 ctcatgccctgaagcttag---tcaacacgatggagcattagctcaaattaacgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 32269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 18816 - 19009
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-------tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttg 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18816 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttg 18914  T
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  18915 ttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatggggtcttatgccctgaaagtatattaatact 19009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39912 - 39723
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  || ||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||| |||    
T  39912 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgggtccatgcattagcatttcattgttggggacttgatgccctggag 39813  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  39812 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggagcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 39723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 46835 - 47023
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgtttaa-gagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46835 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttatgagattgagtccatgcattagcatacatttgttaggg 46934  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  46935 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatact 47023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 193099 - 193271
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtata-tataagagttgatgattgagatg-tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagc 135  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  193099 tccaaattattggactaatataagagatgatgattaagatgctttaacagttagagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagc 193198  T
Q  136 ttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  193199 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattaacgatgggggctcatgccctggaagtatattaatact 193271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 15388 - 15507
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  15388 gagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctcaaataattgttgggggcttatgc 15487  T
Q  188 cct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  15488 cctaaaagtatattaatact 15507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 19910 - 20029
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  19910 gagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctcaaataattgttgggggcttatgc 20009  T
Q  188 cct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  20010 cctaaaagtatattaatact 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 281071 - 281190
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  281071 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggctcatgc 281170  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  281171 cctgaaagtatattaatact 281190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3340
Alignment:
Q  90 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgcc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3458 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgcc 3359  T
Q  189 ct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||||||||||||    
T  3358 ctggaagtatattaatact 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7404
Alignment:
Q  90 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgcc 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7522 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcttatgcc 7423  T
Q  189 ct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||||||||||||    
T  7422 ctggaagtatattaatact 7404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 2185 - 2378
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2185 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtattagatgattgagtccatgcattagcatacattt 2282  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2283 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12742 - 12584
Alignment:
Q  51 tatatataagagttgatgattgagatgttt-aagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacac 149  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  12742 tatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccac 12643  T
Q  150 gatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | || || |||||||| |||||||    
T  12642 gatggagcattagctcaaattagtgatgggggcttacgctctggaagtatactaatact 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 757
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  913 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtgtatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 814  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||    
T  813 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 21633 - 21778
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21633 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 21730  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21731 ctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaa 21778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 82067 - 81983
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 122  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||  |||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  82067 tccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 81983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27874 - 27688
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgat-tgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| || | | ||||||||||||   |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  27874 tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 27775  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27774 ccttgtactaaacacgatggagctttagctcaaatagcgatggggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagcgatggggg 27688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4438 - 4252
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtt-taaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4438 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 4341  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | || |||| |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  4340 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggaacatttgctcaaaataatgttgggggtgcatgccctgaaagtatattaatact 4252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 167 - 21
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 70  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  69 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaa 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 662 - 539
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtata-tataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagct 136  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  662 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcaggccctggagct 563  T
Q  137 tagtactcaacacgatggagcttt 160  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||    
T  562 ttgtactcaccacaatggagcttt 539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 545 - 469
Alignment:
Q  132 gagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  545 gagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatact 469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 6514 - 6699
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| | |||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6514 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagataatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 6611  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || |||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6612 cttatgccctagagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatact 6699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 340106 - 340256
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  340106 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctaaaattg 340205  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  340206 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactaatagcgatggggg 340256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 414159 - 414287
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  414159 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaaaatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacttttgttggggg 414256  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  414257 ctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 414287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 158616 - 158686
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattga-gatgtttaagagaacgagtccatgcattagcat 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  158616 tccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 158686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 1587 - 1775
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga--gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgg 117  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||  ||| |||||||| |||||||| |||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1587 acaagatgatattgaac-tccaaattattgg-atttatgtgagatgatgattaagatgttttagattgattgagtccatacattagcatacatttgttgg 1684  T
Q  118 gggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1685 gggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 1775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 3312 - 3459
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||    
T  3312 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatatttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagag 3411  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3412 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 3459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 3272 - 3454
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgat-tgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| || | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  3272 tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 3371  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatg 216  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  3372 ccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaa-acttgtagcgatg 3454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 306 - 196
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  306 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttctttgttgggggcttgatgccctggagctttgcactcaacacgatggagctttagctcaaatag 207  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
    |||||||||||    
T  206 cgatgggggct 196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3469 - 3280
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcata-catttgttgggggctc-atgccctaga 133  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  3469 tccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattt-ttgggggctagatgccctaga 3371  T
Q  134 gcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||    
T  3370 gatttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggacgtatattaatactcaaatagcgatggggg 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 8651 - 8840
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  8651 tccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 8750  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  8751 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagtgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 8840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1502 - 1316
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1502 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgaggtgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 1405  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||  ||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1404 cttatgccctggagctttgtactcaccacgatagagcattttctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 297 - 167
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  297 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgaaagagtccatgcattagcatacatttgttgggg 200  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  199 gctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 220
Target Start/End: Original strand, 3608 - 3637
Alignment:
Q  191 gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3608 gaagtatattaatacttatagcgatggggg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 17220 - 17405
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtt-taaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17220 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgatcgagtccatgcattagcatacaattgtt-ggg 17316  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17317 gctaatgccctggagcttcatactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 17405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44097 - 43967
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44097 agatgaataagatgatgttgaac-tctaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacattt 44000  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactca 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43999 gttgggggctcatgccctggagctttgtactca 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 218
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||   |||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  401 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgag---atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 307  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||   |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  306 ctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Original strand, 7265 - 7424
Alignment:
Q  51 tatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaaca 148  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||    
T  7265 tatatatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtaatcacca 7364  T
Q  149 cgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    ||||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  7365 cgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtttattaatact 7424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32940 - 32793
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  32940 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 32841  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32840 ctttggactcaacacgatggagctttagctcaaatagagatgggggct 32793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32437 - 32327
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32437 agatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttggactcaacacgatggagctttagctcaaatag 32338  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
     ||||||||||    
T  32337 agatgggggct 32327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38759 - 38612
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  | |||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  38759 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagttctagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 38660  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  38659 ctttgtactcaacacgatggagctttagcgcaaatatcgatgggggct 38612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1846 - 1693
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||| ||||  || ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1846 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgttgattaagatagtttagatgattgagtctatgcattagcatacattt 1749  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  1748 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaa 1693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9529 - 9376
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||| ||||  || ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  9529 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgttgattaagatagtttagatgattgagtctatgcattagcatacattt 9432  T
Q  113 gttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  9431 gttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaa 9376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 73875 - 74020
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73875 aagatgatgttgaaa-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 73972  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa 168  Q
    || ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  73973 cttatgccctggagctttgtactaaccacgatggagcatttgctcaaa 74020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 30843 - 30980
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  30843 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatt 30940  T
Q  112 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  30941 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 30980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51875 - 51723
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  51875 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattag 51776  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  51775 cgatgggggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 51723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 168138 - 168290
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  168138 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 168236  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  168237 gcgatgggggcttgatgccctggaagtattttaatactcaaatagcgatggggg 168290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1811 - 1622
Alignment:
Q  20 acaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttta-aga--gaacgagtccatgcattagcatacatttgttg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||| ||||||||  |||||||  |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1811 acaagatgatgttgaac-tccaaattattag-atgtatatgagatgatgattaggatgtttttagattgattgagtccatgcattagcatacatttgttg 1714  T
Q  117 ggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||| || |||||||| |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1713 ggggctcatgccctggagctttgtcctcaccatgatggagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 1622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 4955 - 5143
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  4955 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggag 5054  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatggggg-ctcatgccct-gaagtatattaatact-tatagcgatggggg 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  5055 ctttgtactcaacacgatggagctttagctcaactagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatgctcaatagcgatggggg 5143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13210 - 13038
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagc 135  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    |||||||||  | ||||||| ||||    
T  13210 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggcttgatgccctggagc 13111  T
Q  136 ttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  13110 tttgtactcaccacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 13038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 27300 - 27419
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  27300 gagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgc 27399  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  27400 cctgaaagtatattaatact 27419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 68817 - 68698
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  68817 gagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgc 68718  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  68717 cctgaaagtatattaatact 68698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7479 - 7352
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7479 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatac-tttgttggggg 7383  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  7382 ctcatgccctagagctttgtcctcaccacga 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16075 - 15965
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16075 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaaacgatggagctttagttcaaatag 15976  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
    |||||||||||    
T  15975 cgatgggggct 15965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 219
Target Start/End: Original strand, 17490 - 17636
Alignment:
Q  75 atgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcg 173  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||    |||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17490 atgtttaagaggttgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttaatgccctagagccttgtgctcaacacgatggagctatagctcaa-tagcg 17588  T
Q  174 atgggggctc-atgccctg-aagtatattaatacttatagcgatgggg 219  Q
    ||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17589 atacgggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagcgatgggg 17636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 33078 - 33264
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgat-tgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| || | | |||||||||||||   ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  33078 tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 33177  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33178 ccttgtgctcaacacgatggagctttagctc-aatagcgataagagcttgatgccctggaagtatattaatacttataccgatggggg 33264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45927 - 45741
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgat-tgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| || | | |||||||||||||   ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  45927 tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 45828  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45827 ccttgtgctcaacacgatggagctttagctc-aatagcgataagagcttgatgccctggaagtatattaatacttataccgatggggg 45741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15095 - 14911
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgttt-aaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||| ||| |||||||| |||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15095 aagatgatgttgaac-tccaacttattggg-tgtatatgagatgatgattaagatattttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 14998  T
Q  120 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14997 gctca--ccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 14911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5535 - 5416
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||| ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  5535 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgc 5436  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  5435 cctgaaagtatattaatact 5416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6730 - 6611
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||| ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  6730 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgggggcttatgc 6631  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  6630 cctgaaagtatattaatact 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32025 - 31876
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  32025 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 31927  T
Q  174 atgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  31926 atgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 31876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4537
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||    
T  4710 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttaggggcttgatgccctggag 4612  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  4611 ctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 4537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 19462 - 19583
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcata-catttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||   |  | |||||||| ||    
T  19462 gagtccatgcattagcataacatatgttgggggctcatgccctagagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttat 19561  T
Q  186 gccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  19562 gccctgaaagtatattaatact 19583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 220
Target Start/End: Original strand, 11609 - 11756
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgat 175  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  11609 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgat 11707  T
Q  176 gggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11708 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 11756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 16759 - 16906
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||| ||||  |||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16759 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctgaagcctt-tgctcaacacgatggagctttagctcaa-tag 16856  T
Q  172 cgatgggggctc-atgccctg-aagtatattaatacttatagcgatgggg 219  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16857 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttatagcgatgggg 16906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39438 - 39329
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagc 172  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  39438 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgattgagctttggcctaaatagc 39339  T
Q  173 gatgggggct 182  Q
    ||||||||||    
T  39338 gatgggggct 39329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42635 - 42505
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||   |||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42635 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtatatgag---atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 42541  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggag 156  Q
     ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  42540 atcatgccctggaggtttgtactcaccacgatggag 42505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 137
Target Start/End: Original strand, 24949 - 25045
Alignment:
Q  40 caaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||   ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24949 caaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtttagatgatagagtccttgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctt 25045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 75374 - 75483
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagc 172  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  75374 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgattgagctttggcctaaatagc 75473  T
Q  173 gatgggggct 182  Q
    ||||||||||    
T  75474 gatgggggct 75483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 220
Target Start/End: Original strand, 10589 - 10737
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcga 174  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||    
T  10589 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcga 10687  T
Q  175 tgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10688 tgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 10737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13452 - 13304
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcga 174  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||    
T  13452 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcga 13354  T
Q  175 tgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13353 tgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 13304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 7448 - 7567
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgc 187  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||| ||||    
T  7448 gagtccatgcattagcattaatatgttgggggctcatgccctgaagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgc 7547  T
Q  188 cctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  7548 cctgaaagtatattaatact 7567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25894 - 25747
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    ||||||| ||||  ||||||| |||    
T  25894 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtataagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggag 25795  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25794 ctttgtactaaacacgatggagctttagctcaaataacgatgggggct 25747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39814 - 39736
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatgga 155  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39814 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgataccctggagctttgtactcaacacgatgga 39736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 83
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  272 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 173  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| ||||| ||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  172 ctttgtacttaatgcgttggagctttagctcaattagagatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 83  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34078 - 33931
Alignment:
Q  79 ttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgat 175  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||  | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  34078 ttaagaggtcgagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctgcaactttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaattagcgat 33980  T
Q  176 gggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33979 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 33931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 169
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1304
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat 169  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1208 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaat 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4807 - 4675
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcga 174  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4807 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagttttgtactcaccacgttggagctttaggtcaattagcga 4709  T
Q  175 tgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  4708 tgggggcttgatgccttggaagtatattaatact 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 48569 - 48740
Alignment:
Q  21 caagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||        
T  48569 caagatgatgttgaatctccaaattattgg-atgaataagagatgatgtttacgatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatatgttg---- 48663  T
Q  121 ctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
               |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48664 -----------gagctttgtactcaccacaatggagctttagctcaaaataaagatgggggctcatgccctggaagtatattaatact 48740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46941 - 46803
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggc-tc 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |     
T  46941 cgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactccccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttg 46843  T
Q  184 atgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  46842 atgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 46803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 116825 - 116725
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgggg 219  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  116825 atgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 116726  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  116725 g 116725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 117108 - 117037
Alignment:
Q  112 tgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggct 182  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  117108 tgttgggggcttgatgccctagagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggct 117037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 116930 - 116846
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  116930 atgccctgaagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattagtact 116846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 117034 - 116935
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatactt--atagcgatgggg 219  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  117034 atgccctggagctttgtactcaacacgttggagttttagctcaattagcgataggggcttgttgccctggaagtatattaatacttaaatagcgatgggg 116935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1910 - 1774
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa----ta 170  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    ||    
T  1910 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaaatta 1812  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  1811 gcgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatact 1774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Original strand, 2563 - 2697
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||  || |    
T  2563 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactcacaacgttggagcattagctcaaaattaac 2661  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2662 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 2697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2509 - 2446
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  2509 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgat 2446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 121726 - 121619
Alignment:
Q  75 atgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaa-atagc 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  121726 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaatttagc 121627  T
Q  173 gatggggg 180  Q
    ||||||||    
T  121626 gatggggg 121619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 174724 - 174590
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||  |||||  || |||||||  ||||    
T  174724 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagaatttgctcaaaattagc 174626  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  174625 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 174590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Original strand, 1212 - 1320
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  1212 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 1310  T
Q  173 gatgggggct 182  Q
    ||||||||||    
T  1311 gatgggggct 1320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4470 - 4362
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4470 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacgatggagctttagctc-aatag 4373  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
    |||||||||||    
T  4372 cgatgggggct 4362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12052 - 11944
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12052 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacgatggagctttagctc-aatag 11955  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
    |||||||||||    
T  11954 cgatgggggct 11944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22004 - 21896
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatag 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22004 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacgatggagctttagctc-aatag 21907  T
Q  172 cgatgggggct 182  Q
    |||||||||||    
T  21906 cgatgggggct 21896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33494 - 33373
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcata-catttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcat 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||   |  | |||||||| ||    
T  33494 gagtccatgcattagcataacatatgttgcgggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttat 33395  T
Q  186 gccctgaa-gtatattaatact 206  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  33394 gccctgaatgtatattaatact 33373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1247 - 1139
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  1247 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttcatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 1149  T
Q  173 gatgggggct 182  Q
    ||||||||||    
T  1148 gatgggggct 1139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4407 - 4330
Alignment:
Q  142 ctcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatgggg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4407 ctcaacacgatggagctttagctc-aattgcgatgagggcttatgccctggaagtatattaatacttataacgatgggg 4330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1850 - 1677
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| |||    
T  1850 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggag 1751  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||    
T  1750 ctttgtactcaacacgttggagctttagctcattcagtgatgggggcttgataccctggaagtatattaatact 1677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 220
Target Start/End: Original strand, 4894 - 4966
Alignment:
Q  150 gatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatacttatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4894 gatggagctttagctcaaatagcgatgggggcttgatggcctggaagtatattaatacttatagcaatggggg 4966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7470 - 7386
Alignment:
Q  124 atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||    
T  7470 atgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtaaattaatact 7386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7585 - 7489
Alignment:
Q  112 tgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  7585 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagttttagctcaattatcgatggggcttgatgccctggaagtatattaatact 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 6283 - 6394
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaata 170  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    ||||||| ||||  |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6283 agatgtttaagaggtcgagtctatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaata 6382  T
Q  171 gcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||    
T  6383 gcgatgggggct 6394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 2099
Alignment:
Q  114 ttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2193 ttgggggcttataccctggagcttactactcaccacgatggagcattagctcaaattaaagatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8055
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||   ||  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7942 tccaaattattgg-atgtatatgagatgatgattaagatgtttagatgatagagtccctacattagcatacattcgttgggggctcatgccctggagctt 8040  T
Q  138 agtactcaacacgat 152  Q
     || |||| ||||||    
T  8041 tgtcctcaccacgat 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20871 - 20718
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||    |||||||||| |  ||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20871 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattaggatttcattgttgggggattgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 20772  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  20771 gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 20718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 5291 - 5441
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagc 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| || | ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  5291 tgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagc 5389  T
Q  173 gatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5390 gatgggggcttgataccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 5441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32159 - 31968
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatga-ttgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagag 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||  | |||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||| |||    
T  32159 tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 32060  T
Q  135 cttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    ||| ||||||| |||  ||| || ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  32059 ctttgtactcaccacattggggcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 31968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 422640 - 422770
Alignment:
Q  22 aagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatg-tttaaga--gaacgagtccatgcattagcatacatttgttggg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || || | ||| |||||||| ||||| ||| |||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  422640 aagatgatgttgaac-tccaaattattgg-atgtaaatgagatgatgattaagatggttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttggg 422737  T
Q  119 ggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||| |||||    
T  422738 ggcttatgccctggagctttgtcctcaccacga 422770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8478 - 8289
Alignment:
Q  38 tccaaattattggtatatataagag-ttgatgattgagatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagc 135  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| || |    
T  8478 tccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggatc 8380  T
Q  136 ttagtactcaacacgatggagctttagctca--aatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    || ||||||| |||  |||||| ||||||||  | ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  8379 tttgtactcaccacattggagcattagctcaacattagcgatggggacttgatgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatggggg 8289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1952 - 1821
Alignment:
Q  78 tttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgat 175  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  1952 tttaagaggtcgagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgat 1854  T
Q  176 gggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
     ||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  1853 tggggcttgatgccctagaagtataataatact 1821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28375 - 28222
Alignment:
Q  73 agatgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-ta 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||| ||    
T  28375 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggaggtttagctcaaatta 28276  T
Q  171 gcgatgggggc-tcatgccctg-aagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
     | |||||||| | | |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  28275 acaatgggggcttaaagccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 28222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4497 - 4402
Alignment:
Q  88 cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggct 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  4497 cgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcacctcgttggagcattagctcaaattagcgattggggct 4402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 596 - 527
Alignment:
Q  14 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggtatatataagagttgatgattgagatgtttaaga 84  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  596 agatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-ataaataagagatgatgtttatgatgtttaaga 527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 2614 - 2676
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||    
T  2614 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccacga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 10474 - 10536
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||    
T  10474 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccacga 10536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 51540 - 51405
Alignment:
Q  76 tgtttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa---tag 171  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||   |||    
T  51540 tgtttaagaggtcgagtccatgcatgagcattc-ttagttgggggcttaatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattag 51442  T
Q  172 cgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact 206  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  51441 cgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 51405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 206
Target Start/End: Original strand, 195119 - 195210
Alignment:
Q  117 ggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaat-agcgatgggggctcatgccctg-aagtatattaatact 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  195119 ggggctcatgccctggagcttaatcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 195210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 151
Target Start/End: Original strand, 205240 - 205300
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 151  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  205240 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 205300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8500 - 8454
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8500 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctt 8454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Original strand, 4403 - 4465
Alignment:
Q  89 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatg 153  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||    
T  4403 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctgaagctttgtcctcaccacgatg 4465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 2062
Alignment:
Q  90 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctt 137  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2107 agtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctt 2062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16236 - 16089
Alignment:
Q  80 taagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagctcaaa---tagcgat 175  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || | |||||| || | || |||| |||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||   |||||||    
T  16236 taagagatcgagtccatgcaatagcattca-tagttgggcgcttgataccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgat 16138  T
Q  176 gggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16137 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 16089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10189 - 10108
Alignment:
Q  142 ctcaacacgatggagctttagctcaaatagcgatgggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatggggg 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10189 ctcaacacgatggagctttagcac-aatagtgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 10108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1979 - 1917
Alignment:
Q  132 gagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaatagcgatgggggctcatgccctgaa 193  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  1979 gagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctcatgccctgaa 1917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University