View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16815_low_3 (Length: 864)

Name: NF16815_low_3
Description: NF16815
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16815_low_3
NF16815_low_3
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (133-849)||(20083231-20083962)
chr7 (442-728)||(32684682-32684970)
chr7 (442-728)||(45198808-45199095)
chr7 (442-724)||(46822033-46822317)
chr7 (442-830)||(35495950-35496333)
chr7 (442-728)||(34773725-34774013)
chr7 (442-714)||(26492393-26492667)
chr7 (442-728)||(20116596-20116883)
chr7 (444-728)||(22927647-22927933)
chr7 (442-712)||(23085551-23085823)
chr7 (442-714)||(2843016-2843290)
chr7 (444-714)||(42311308-42311578)
chr7 (442-728)||(6558891-6559179)
chr7 (444-675)||(13592287-13592518)
chr7 (442-709)||(35261332-35261599)
chr7 (442-728)||(42066837-42067124)
chr7 (442-728)||(1448607-1448893)
chr7 (451-728)||(46339068-46339347)
chr7 (444-728)||(35667009-35667295)
chr7 (443-669)||(433467-433695)
chr7 (452-670)||(7640560-7640780)
chr7 (442-705)||(21266428-21266694)
chr7 (445-727)||(17222779-17223061)
chr7 (442-728)||(23425148-23425435)
chr7 (442-728)||(31235559-31235855)
chr7 (442-724)||(32521704-32521986)
chr7 (442-669)||(1485031-1485261)
chr7 (442-728)||(23786589-23786877)
chr7 (442-727)||(26583729-26584012)
chr7 (498-728)||(48207915-48208147)
chr7 (14-182)||(20073232-20073405)
chr7 (442-728)||(6002035-6002329)
chr7 (442-728)||(19560012-19560298)
chr7 (492-724)||(46818241-46818475)
chr7 (579-728)||(42408376-42408527)
chr7 (442-655)||(34899399-34899614)
chr7 (442-637)||(28044548-28044745)
chr7 (442-551)||(17611584-17611693)
chr7 (457-655)||(39171397-39171597)
chr7 (445-648)||(40993248-40993453)
chr7 (442-643)||(48061518-48061721)
chr7 (442-728)||(14627673-14627942)
chr7 (458-575)||(36143913-36144030)
chr7 (492-655)||(19404602-19404764)
chr7 (492-655)||(42978694-42978856)
chr7 (442-655)||(48316611-48316819)
chr7 (442-655)||(12141099-12141315)
chr7 (521-655)||(17499535-17499669)
chr7 (521-655)||(17553545-17553679)
chr7 (86-171)||(20081676-20081762)
chr7 (196-279)||(20081884-20081964)
chr7 (442-655)||(37837251-37837465)
chr7 (508-655)||(19296954-19297100)
chr7 (445-655)||(8001341-8001553)
chr7 (490-551)||(24351178-24351239)
chr7 (444-553)||(37849030-37849139)
chr7 (442-731)||(46244043-46244335)
chr7 (634-728)||(17611139-17611234)
chr7 (444-575)||(28407712-28407846)
chr7 (21-79)||(20103950-20104008)
chr7 (462-655)||(47590395-47590590)
chr7 (442-573)||(9977002-9977136)
chr7 (351-417)||(20072955-20073020)
chr7 (521-654)||(13796803-13796935)
chr7 (442-635)||(43369549-43369741)
chr7 (469-608)||(3861076-3861214)
chr7 (489-564)||(25255401-25255476)
chr7 (490-553)||(46822586-46822649)
chr7 (681-726)||(17499675-17499720)
chr7 (681-726)||(17553494-17553539)
chr7 (118-178)||(20095815-20095876)
chr7 (676-713)||(36143878-36143915)
chr7 (442-547)||(40741763-40741868)
chr7 (444-553)||(45349593-45349705)
chr7 (509-553)||(9137738-9137782)
chr7 (498-558)||(42408523-42408583)
chr7 (482-526)||(48208152-48208196)
chr7 (79-130)||(20102997-20103048)
chr7 (509-564)||(45482391-45482446)
chr7 (515-553)||(5348460-5348498)
chr7 (509-551)||(35141401-35141443)
chr7 (515-553)||(38798966-38799004)
chr7 (442-553)||(41553228-41553340)
chr7 (507-548)||(31240295-31240336)
chr7 (442-564)||(35664928-35665052)
chr7 (496-553)||(40761935-40761992)
[»] chr2 (116 HSPs)
chr2 (442-728)||(9986117-9986405)
chr2 (442-728)||(7015486-7015774)
chr2 (442-728)||(8805884-8806172)
chr2 (442-728)||(27248926-27249214)
chr2 (442-728)||(2808248-2808535)
chr2 (442-728)||(36234026-36234304)
chr2 (442-728)||(459051-459337)
chr2 (442-768)||(4228116-4228429)
chr2 (442-728)||(8971403-8971690)
chr2 (444-728)||(27949444-27949730)
chr2 (442-727)||(37613901-37614187)
chr2 (442-712)||(83956-84227)
chr2 (442-728)||(21570183-21570470)
chr2 (444-655)||(38575263-38575474)
chr2 (478-771)||(17319302-17319590)
chr2 (442-728)||(41431046-41431334)
chr2 (442-728)||(4192856-4193143)
chr2 (442-728)||(20046857-20047145)
chr2 (442-728)||(25087055-25087341)
chr2 (442-713)||(22421768-22422034)
chr2 (482-728)||(40659747-40659995)
chr2 (507-728)||(32913259-32913481)
chr2 (444-669)||(40625834-40626061)
chr2 (444-728)||(30420696-30420973)
chr2 (482-731)||(27477163-27477414)
chr2 (442-714)||(3725212-3725486)
chr2 (442-608)||(34600354-34600520)
chr2 (508-728)||(32678952-32679173)
chr2 (548-725)||(6173653-6173832)
chr2 (442-712)||(9374338-9374603)
chr2 (444-728)||(45128222-45128496)
chr2 (578-728)||(3269022-3269174)
chr2 (578-728)||(3269581-3269733)
chr2 (578-728)||(3270140-3270292)
chr2 (538-655)||(33229011-33229129)
chr2 (442-568)||(31580430-31580556)
chr2 (450-651)||(41712572-41712774)
chr2 (442-655)||(31788548-31788763)
chr2 (442-655)||(4778845-4779060)
chr2 (442-644)||(7646581-7646785)
chr2 (626-727)||(34599006-34599108)
chr2 (442-551)||(6174013-6174121)
chr2 (444-655)||(29173512-29173728)
chr2 (442-551)||(30923250-30923359)
chr2 (445-553)||(7558647-7558755)
chr2 (442-645)||(36942915-36943119)
chr2 (445-655)||(1421768-1421979)
chr2 (442-644)||(18763571-18763775)
chr2 (442-564)||(24461625-24461746)
chr2 (442-655)||(25508861-25509076)
chr2 (442-568)||(39641081-39641207)
chr2 (442-645)||(4903938-4904143)
chr2 (442-655)||(38445258-38445473)
chr2 (442-581)||(3268610-3268749)
chr2 (442-532)||(21132048-21132138)
chr2 (619-728)||(26025363-26025473)
chr2 (444-550)||(28037283-28037389)
chr2 (442-532)||(33228763-33228853)
chr2 (442-655)||(33585528-33585743)
chr2 (442-655)||(37876399-37876614)
chr2 (442-560)||(37994470-37994590)
chr2 (442-562)||(5427662-5427785)
chr2 (577-712)||(39641769-39641905)
chr2 (442-553)||(1415750-1415864)
chr2 (444-655)||(17248943-17249155)
chr2 (448-547)||(32197533-32197632)
chr2 (442-553)||(32448410-32448523)
chr2 (444-610)||(4100473-4100635)
chr2 (442-655)||(36691966-36692181)
chr2 (444-549)||(39284341-39284446)
chr2 (444-552)||(11985028-11985139)
chr2 (498-655)||(19062199-19062360)
chr2 (492-655)||(17994572-17994738)
chr2 (442-655)||(33923797-33924012)
chr2 (442-654)||(4041387-4041601)
chr2 (577-728)||(8308189-8308340)
chr2 (450-574)||(8809451-8809580)
chr2 (442-550)||(36324052-36324160)
chr2 (490-655)||(10237060-10237224)
chr2 (442-565)||(12236833-12236956)
chr2 (442-549)||(31193129-31193239)
chr2 (515-645)||(9169127-9169256)
chr2 (490-655)||(14955621-14955785)
chr2 (627-728)||(38293567-38293669)
chr2 (445-506)||(8308337-8308398)
chr2 (444-553)||(12677246-12677358)
chr2 (445-518)||(13718948-13719021)
chr2 (581-725)||(18113890-18114035)
chr2 (443-564)||(35220510-35220634)
chr2 (507-655)||(27097268-27097414)
chr2 (503-551)||(31128642-31128690)
chr2 (641-728)||(31580564-31580652)
chr2 (509-568)||(5071108-5071167)
chr2 (444-550)||(30399824-30399933)
chr2 (586-712)||(32197715-32197842)
chr2 (442-488)||(14416427-14416473)
chr2 (493-655)||(29279417-29279578)
chr2 (442-655)||(10929757-10929971)
chr2 (509-553)||(11561417-11561461)
chr2 (509-553)||(22597482-22597526)
chr2 (448-532)||(23903557-23903641)
chr2 (442-506)||(26025271-26025335)
chr2 (442-553)||(11189418-11189529)
chr2 (513-564)||(11798271-11798322)
chr2 (602-637)||(20036628-20036663)
chr2 (446-575)||(21612409-21612541)
chr2 (694-732)||(10548238-10548276)
chr2 (682-728)||(12647970-12648016)
chr2 (603-637)||(29812449-29812483)
chr2 (617-655)||(30400005-30400043)
chr2 (496-553)||(11931204-11931261)
chr2 (604-637)||(11937695-11937728)
chr2 (507-564)||(12554042-12554099)
chr2 (442-487)||(32913489-32913534)
chr2 (683-728)||(34128735-34128780)
chr2 (512-553)||(44441711-44441752)
[»] chr4 (103 HSPs)
chr4 (442-768)||(9528652-9528975)
chr4 (442-728)||(25273909-25274197)
chr4 (442-728)||(53616425-53616713)
chr4 (442-728)||(4643884-4644172)
chr4 (442-728)||(38706485-38706773)
chr4 (442-730)||(44947436-44947726)
chr4 (442-728)||(10389529-10389817)
chr4 (442-728)||(34024213-34024500)
chr4 (445-771)||(46990909-46991231)
chr4 (442-713)||(10359324-10359595)
chr4 (442-713)||(20569296-20569571)
chr4 (442-728)||(51318011-51318299)
chr4 (442-731)||(9283934-9284225)
chr4 (442-728)||(43153793-43154077)
chr4 (442-729)||(1531933-1532222)
chr4 (461-728)||(35964770-35965038)
chr4 (442-728)||(43444419-43444706)
chr4 (442-728)||(47417688-47417972)
chr4 (442-669)||(2115363-2115592)
chr4 (455-769)||(18138705-18139012)
chr4 (455-769)||(49125918-49126225)
chr4 (445-727)||(50766290-50766574)
chr4 (444-728)||(6972836-6973122)
chr4 (444-669)||(45227818-45228045)
chr4 (482-728)||(49410249-49410497)
chr4 (442-716)||(3335939-3336207)
chr4 (442-714)||(12265494-12265775)
chr4 (442-728)||(37188374-37188657)
chr4 (450-759)||(35261191-35261497)
chr4 (442-713)||(52097691-52097964)
chr4 (442-613)||(9645299-9645470)
chr4 (443-728)||(868188-868476)
chr4 (442-636)||(56199215-56199410)
chr4 (449-768)||(32952540-32952846)
chr4 (456-724)||(27593619-27593886)
chr4 (442-655)||(32766616-32766831)
chr4 (442-655)||(56040438-56040653)
chr4 (442-655)||(19853304-19853519)
chr4 (571-728)||(29965661-29965820)
chr4 (442-669)||(49680623-49680844)
chr4 (455-644)||(48257437-48257628)
chr4 (469-608)||(21090290-21090429)
chr4 (584-713)||(14183843-14183974)
chr4 (442-655)||(53811130-53811335)
chr4 (581-728)||(8009275-8009424)
chr4 (577-728)||(31381582-31381735)
chr4 (442-645)||(2520891-2521096)
chr4 (442-655)||(13634217-13634432)
chr4 (442-609)||(1931526-1931693)
chr4 (482-553)||(29966529-29966600)
chr4 (442-553)||(19896416-19896529)
chr4 (444-645)||(43510308-43510511)
chr4 (442-553)||(47320205-47320318)
chr4 (625-728)||(2624522-2624627)
chr4 (442-551)||(21686034-21686146)
chr4 (442-553)||(26633463-26633577)
chr4 (442-560)||(2624647-2624765)
chr4 (442-532)||(4142556-4142649)
chr4 (444-559)||(28857598-28857715)
chr4 (492-652)||(54021965-54022123)
chr4 (442-653)||(21662541-21662754)
chr4 (442-653)||(21671305-21671518)
chr4 (446-551)||(17949119-17949228)
chr4 (446-551)||(17952971-17953080)
chr4 (442-655)||(22611285-22611507)
chr4 (581-714)||(23100719-23100853)
chr4 (507-558)||(22301048-22301099)
chr4 (442-550)||(8670691-8670796)
chr4 (581-727)||(28834164-28834309)
chr4 (442-553)||(35348510-35348626)
chr4 (442-655)||(36204172-36204386)
chr4 (442-551)||(27360032-27360141)
chr4 (490-551)||(43853648-43853709)
chr4 (507-655)||(9048766-9048913)
chr4 (455-655)||(24098874-24099074)
chr4 (508-655)||(10496437-10496583)
chr4 (482-553)||(21554625-21554696)
chr4 (442-655)||(53444220-53444436)
chr4 (450-532)||(7273605-7273687)
chr4 (661-731)||(18048894-18048964)
chr4 (639-728)||(56194627-56194717)
chr4 (482-547)||(7006533-7006598)
chr4 (489-546)||(12199536-12199593)
chr4 (442-523)||(31381491-31381571)
chr4 (507-551)||(11299870-11299914)
chr4 (637-728)||(21090178-21090272)
chr4 (448-532)||(21364928-21365012)
chr4 (495-575)||(27652124-27652204)
chr4 (503-551)||(40006533-40006581)
chr4 (660-728)||(52944325-52944393)
chr4 (509-564)||(38943887-38943942)
chr4 (509-564)||(43157098-43157153)
chr4 (581-655)||(4142685-4142759)
chr4 (444-553)||(7008350-7008457)
chr4 (661-731)||(9048675-9048745)
chr4 (681-731)||(21405537-21405587)
chr4 (490-655)||(36161813-36161977)
chr4 (515-553)||(36194911-36194949)
chr4 (442-553)||(51888004-51888117)
chr4 (682-728)||(52204380-52204426)
chr4 (496-553)||(7083538-7083595)
chr4 (492-553)||(43095831-43095892)
chr4 (539-655)||(52944413-52944528)
[»] chr1 (98 HSPs)
chr1 (442-730)||(50148386-50148676)
chr1 (442-724)||(9686980-9687263)
chr1 (442-712)||(5324334-5324605)
chr1 (442-728)||(30879094-30879381)
chr1 (469-728)||(5701277-5701538)
chr1 (442-728)||(51871881-51872169)
chr1 (442-728)||(7342740-7343028)
chr1 (442-728)||(25406059-25406347)
chr1 (442-728)||(50271915-50272203)
chr1 (442-728)||(35584398-35584681)
chr1 (444-728)||(39927332-39927617)
chr1 (442-728)||(50165874-50166162)
chr1 (442-728)||(11453953-11454243)
chr1 (442-728)||(19715670-19715958)
chr1 (442-728)||(51868420-51868708)
chr1 (444-830)||(18569088-18569468)
chr1 (442-728)||(9172508-9172796)
chr1 (442-728)||(9180490-9180778)
chr1 (444-714)||(45805606-45805877)
chr1 (443-830)||(28035062-28035441)
chr1 (442-712)||(20266336-20266608)
chr1 (470-728)||(40880816-40881075)
chr1 (442-728)||(33291193-33291481)
chr1 (442-728)||(45425842-45426129)
chr1 (444-728)||(3871426-3871711)
chr1 (488-728)||(7997807-7998049)
chr1 (517-713)||(7311956-7312153)
chr1 (442-728)||(38520310-38520594)
chr1 (442-728)||(9919407-9919692)
chr1 (450-714)||(40646702-40646971)
chr1 (442-728)||(34519150-34519434)
chr1 (542-728)||(39987407-39987593)
chr1 (450-655)||(19723405-19723611)
chr1 (442-666)||(41081479-41081704)
chr1 (469-768)||(48365568-48365863)
chr1 (442-655)||(32676910-32677119)
chr1 (444-614)||(31130370-31130540)
chr1 (444-608)||(11709484-11709648)
chr1 (543-728)||(14545537-14545722)
chr1 (442-589)||(48217596-48217743)
chr1 (442-608)||(27914882-27915045)
chr1 (442-587)||(31836995-31837140)
chr1 (442-728)||(27872756-27873044)
chr1 (442-655)||(33816943-33817157)
chr1 (442-655)||(33876413-33876627)
chr1 (442-655)||(47132988-47133202)
chr1 (579-728)||(31836825-31836975)
chr1 (442-615)||(11462274-11462449)
chr1 (442-713)||(30818139-30818399)
chr1 (450-655)||(35484191-35484398)
chr1 (444-553)||(24583332-24583443)
chr1 (442-655)||(14872724-14872939)
chr1 (442-569)||(44637596-44637723)
chr1 (442-655)||(7337455-7337670)
chr1 (444-730)||(5855918-5856204)
chr1 (444-551)||(24583138-24583247)
chr1 (490-655)||(36775553-36775717)
chr1 (445-575)||(49627077-49627208)
chr1 (445-553)||(13144608-13144718)
chr1 (442-644)||(4413210-4413414)
chr1 (442-553)||(44543458-44543570)
chr1 (442-564)||(12635345-12635469)
chr1 (442-655)||(32395083-32395297)
chr1 (442-655)||(44915724-44915939)
chr1 (442-576)||(27456647-27456789)
chr1 (496-592)||(31919137-31919232)
chr1 (508-655)||(5983921-5984067)
chr1 (508-655)||(7836657-7836803)
chr1 (507-654)||(31984247-31984393)
chr1 (442-525)||(39987641-39987724)
chr1 (442-553)||(49504387-49504501)
chr1 (442-562)||(21687555-21687678)
chr1 (442-553)||(34878070-34878184)
chr1 (492-575)||(15431511-15431594)
chr1 (442-561)||(32678936-32679055)
chr1 (444-532)||(799629-799717)
chr1 (453-553)||(19061095-19061197)
chr1 (442-553)||(26535522-26535636)
chr1 (631-725)||(44637442-44637537)
chr1 (442-552)||(10776253-10776366)
chr1 (442-488)||(36894200-36894246)
chr1 (483-532)||(5600972-5601021)
chr1 (442-553)||(27579920-27580034)
chr1 (442-553)||(19596252-19596366)
chr1 (509-553)||(28677869-28677913)
chr1 (509-568)||(15312357-15312416)
chr1 (442-553)||(29738457-29738570)
chr1 (513-564)||(40862568-40862619)
chr1 (658-728)||(1602087-1602157)
chr1 (509-551)||(13969378-13969420)
chr1 (687-725)||(29837646-29837684)
chr1 (661-731)||(31692495-31692564)
chr1 (496-653)||(3228356-3228512)
chr1 (442-487)||(15836273-15836318)
chr1 (509-550)||(33177336-33177377)
chr1 (490-551)||(34412935-34412996)
chr1 (496-553)||(34567013-34567070)
chr1 (791-840)||(50272259-50272308)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (442-728)||(4808985-4809273)
chr8 (442-729)||(23851269-23851558)
chr8 (442-728)||(44099711-44099997)
chr8 (442-728)||(29777240-29777528)
chr8 (469-728)||(43192149-43192409)
chr8 (442-731)||(14906698-14906989)
chr8 (442-728)||(43889899-43890187)
chr8 (442-728)||(9619132-9619420)
chr8 (470-728)||(11464192-11464452)
chr8 (442-727)||(11725703-11725990)
chr8 (442-728)||(34611825-34612113)
chr8 (442-724)||(33896107-33896395)
chr8 (442-728)||(28239854-28240150)
chr8 (444-728)||(32724258-32724544)
chr8 (442-725)||(9498374-9498659)
chr8 (470-728)||(2655891-2656151)
chr8 (442-724)||(27746890-27747172)
chr8 (456-728)||(16794313-16794586)
chr8 (442-728)||(39152917-39153205)
chr8 (442-728)||(42447807-42448090)
chr8 (442-645)||(44578135-44578339)
chr8 (442-727)||(33298877-33299163)
chr8 (442-724)||(9072743-9073027)
chr8 (451-728)||(37565663-37565942)
chr8 (442-727)||(33342459-33342742)
chr8 (476-728)||(11196910-11197158)
chr8 (537-728)||(35580478-35580670)
chr8 (443-728)||(19876232-19876506)
chr8 (442-665)||(43135359-43135579)
chr8 (507-728)||(15046915-15047136)
chr8 (450-597)||(11267162-11267309)
chr8 (445-731)||(15596946-15597233)
chr8 (442-655)||(23230727-23230942)
chr8 (442-655)||(16928547-16928762)
chr8 (442-559)||(24099047-24099166)
chr8 (577-714)||(17949270-17949409)
chr8 (442-553)||(1236488-1236601)
chr8 (442-644)||(7883031-7883235)
chr8 (442-655)||(31013398-31013613)
chr8 (442-553)||(30568111-30568225)
chr8 (442-655)||(15344392-15344608)
chr8 (442-655)||(15433457-15433673)
chr8 (442-655)||(15524761-15524977)
chr8 (503-655)||(37971367-37971518)
chr8 (442-645)||(9637199-9637404)
chr8 (442-561)||(3240557-3240680)
chr8 (442-552)||(21237974-21238086)
chr8 (444-655)||(33214463-33214676)
chr8 (442-655)||(17693403-17693619)
chr8 (445-655)||(33347318-33347526)
chr8 (442-519)||(12654295-12654372)
chr8 (442-551)||(17949718-17949827)
chr8 (443-655)||(45445602-45445816)
chr8 (492-655)||(24186504-24186666)
chr8 (495-566)||(18994201-18994272)
chr8 (492-655)||(27110308-27110470)
chr8 (462-569)||(7198006-7198115)
chr8 (442-564)||(8412312-8412437)
chr8 (442-528)||(17427000-17427086)
chr8 (442-655)||(28086602-28086818)
chr8 (443-645)||(40211091-40211297)
chr8 (492-553)||(14544738-14544799)
chr8 (488-553)||(43431937-43432002)
chr8 (509-553)||(1809960-1810004)
chr8 (442-655)||(10377773-10377973)
chr8 (442-550)||(34680663-34680771)
chr8 (507-551)||(36033591-36033635)
chr8 (509-564)||(12243954-12244009)
chr8 (661-728)||(15889577-15889644)
chr8 (791-830)||(17949173-17949212)
chr8 (509-564)||(23970921-23970976)
chr8 (489-532)||(41060103-41060146)
chr8 (490-553)||(42046406-42046469)
chr8 (498-564)||(41896691-41896757)
chr8 (444-493)||(2120549-2120598)
chr8 (445-497)||(16644724-16644777)
chr8 (496-553)||(17019432-17019489)
chr8 (475-528)||(17430683-17430736)
chr8 (496-553)||(17549869-17549926)
chr8 (682-727)||(34609830-34609875)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (442-728)||(25162447-25162735)
chr3 (442-726)||(25631301-25631587)
chr3 (442-728)||(29503473-29503760)
chr3 (442-728)||(32607480-32607768)
chr3 (442-728)||(46934653-46934938)
chr3 (442-725)||(12116112-12116397)
chr3 (442-728)||(35498975-35499261)
chr3 (442-728)||(36906133-36906421)
chr3 (442-728)||(44907174-44907461)
chr3 (442-711)||(50611193-50611464)
chr3 (442-728)||(3848694-3848982)
chr3 (442-727)||(4178577-4178864)
chr3 (447-728)||(49552004-49552287)
chr3 (442-768)||(17237781-17238104)
chr3 (442-728)||(22803033-22803329)
chr3 (442-695)||(46178613-46178867)
chr3 (456-728)||(30648508-30648782)
chr3 (542-768)||(36734568-36734790)
chr3 (444-725)||(39917176-39917457)
chr3 (442-768)||(38854814-38855134)
chr3 (470-728)||(31794082-31794339)
chr3 (486-714)||(14464535-14464765)
chr3 (442-768)||(51202039-51202352)
chr3 (442-731)||(21488099-21488392)
chr3 (442-728)||(37169242-37169528)
chr3 (457-655)||(21916559-21916757)
chr3 (442-730)||(25849819-25850097)
chr3 (513-728)||(42719528-42719745)
chr3 (444-710)||(38440368-38440626)
chr3 (442-669)||(2342533-2342747)
chr3 (443-644)||(48650527-48650730)
chr3 (442-655)||(52922909-52923124)
chr3 (442-644)||(21533601-21533805)
chr3 (442-561)||(50194128-50194249)
chr3 (442-552)||(628716-628828)
chr3 (442-635)||(4711583-4711778)
chr3 (442-655)||(35175485-35175699)
chr3 (442-655)||(53807651-53807865)
chr3 (492-655)||(32701572-32701734)
chr3 (442-645)||(54149082-54149287)
chr3 (442-552)||(46979775-46979885)
chr3 (442-655)||(6954488-6954703)
chr3 (442-655)||(21313117-21313332)
chr3 (442-655)||(21431694-21431911)
chr3 (442-655)||(38545880-38546095)
chr3 (442-655)||(46304313-46304527)
chr3 (442-614)||(9998589-9998763)
chr3 (442-645)||(40487416-40487621)
chr3 (444-655)||(45568239-45568452)
chr3 (442-655)||(40556783-40556998)
chr3 (442-553)||(43017070-43017184)
chr3 (455-655)||(7448719-7448921)
chr3 (455-655)||(7456861-7457063)
chr3 (442-655)||(10229557-10229772)
chr3 (442-655)||(33579961-33580176)
chr3 (442-614)||(44959767-44959939)
chr3 (442-598)||(10108374-10108532)
chr3 (442-562)||(47041840-47041963)
chr3 (442-553)||(24396291-24396402)
chr3 (445-655)||(4821888-4822098)
chr3 (514-655)||(38859979-38860121)
chr3 (445-553)||(43488386-43488496)
chr3 (558-687)||(6910603-6910731)
chr3 (442-633)||(10233173-10233366)
chr3 (490-655)||(16235507-16235671)
chr3 (490-553)||(27856347-27856410)
chr3 (661-731)||(4396362-4396432)
chr3 (442-564)||(9797326-9797451)
chr3 (442-488)||(20464757-20464803)
chr3 (442-532)||(30830178-30830268)
chr3 (681-731)||(24396526-24396580)
chr3 (450-530)||(6823407-6823487)
chr3 (493-564)||(14859661-14859732)
chr3 (496-655)||(19619795-19619952)
chr3 (456-551)||(20911398-20911493)
chr3 (509-564)||(29776428-29776483)
chr3 (442-553)||(36461229-36461343)
chr3 (509-564)||(40365545-40365600)
chr3 (490-553)||(42460931-42460994)
chr3 (490-553)||(53508404-53508467)
chr3 (788-830)||(2342408-2342450)
chr3 (605-655)||(23799867-23799917)
chr3 (442-488)||(36910558-36910604)
chr3 (78-135)||(26320388-26320445)
chr3 (508-561)||(30293348-30293401)
chr3 (450-532)||(32881159-32881243)
chr3 (664-713)||(46322356-46322405)
[»] chr5 (78 HSPs)
chr5 (442-728)||(3271177-3271465)
chr5 (442-728)||(34881734-34882021)
chr5 (444-708)||(20257473-20257738)
chr5 (442-728)||(19259587-19259874)
chr5 (442-711)||(781422-781692)
chr5 (443-728)||(18677242-18677528)
chr5 (442-728)||(27266634-27266922)
chr5 (442-709)||(21060058-21060326)
chr5 (442-728)||(41184216-41184503)
chr5 (442-728)||(16981306-16981596)
chr5 (442-728)||(4954008-4954296)
chr5 (456-728)||(42579904-42580178)
chr5 (444-711)||(35475115-35475383)
chr5 (442-728)||(7246975-7247263)
chr5 (442-728)||(43148747-43149031)
chr5 (442-728)||(7150110-7150398)
chr5 (442-769)||(30298188-30298513)
chr5 (442-728)||(7241799-7242088)
chr5 (442-830)||(2057609-2057996)
chr5 (445-695)||(15570958-15571208)
chr5 (442-728)||(10649660-10649946)
chr5 (442-771)||(7612834-7613159)
chr5 (442-728)||(19280712-19281008)
chr5 (442-709)||(27751961-27752229)
chr5 (442-712)||(7886715-7886985)
chr5 (455-669)||(11768077-11768290)
chr5 (442-614)||(30298976-30299148)
chr5 (444-768)||(28235566-28235891)
chr5 (455-706)||(22978712-22978964)
chr5 (542-728)||(26578268-26578456)
chr5 (442-590)||(43008090-43008238)
chr5 (555-713)||(43261707-43261867)
chr5 (536-728)||(42886494-42886688)
chr5 (622-723)||(27576306-27576408)
chr5 (442-655)||(9113517-9113732)
chr5 (442-655)||(13007310-13007525)
chr5 (442-655)||(34945474-34945689)
chr5 (442-655)||(8088005-8088219)
chr5 (445-553)||(8771959-8772067)
chr5 (442-655)||(13422014-13422228)
chr5 (442-551)||(11976727-11976839)
chr5 (442-649)||(14082188-14082397)
chr5 (442-655)||(24229576-24229791)
chr5 (449-655)||(25980239-25980446)
chr5 (457-655)||(38597878-38598078)
chr5 (442-655)||(6011930-6012145)
chr5 (442-727)||(13468619-13468901)
chr5 (490-655)||(2979149-2979313)
chr5 (444-553)||(8096293-8096404)
chr5 (442-564)||(8984781-8984902)
chr5 (442-655)||(26877901-26878115)
chr5 (619-728)||(36344444-36344554)
chr5 (582-666)||(6445951-6446036)
chr5 (442-564)||(10332340-10332464)
chr5 (442-655)||(10722842-10723057)
chr5 (442-551)||(14726253-14726365)
chr5 (442-523)||(30371844-30371925)
chr5 (442-551)||(41418204-41418312)
chr5 (550-623)||(41418605-41418678)
chr5 (625-724)||(30371746-30371846)
chr5 (442-519)||(37483274-37483347)
chr5 (442-608)||(26825558-26825726)
chr5 (674-728)||(35921037-35921091)
chr5 (442-532)||(36057103-36057193)
chr5 (442-553)||(38007539-38007653)
chr5 (517-655)||(41630583-41630720)
chr5 (442-568)||(27576160-27576282)
chr5 (509-553)||(27241402-27241446)
chr5 (508-655)||(31391614-31391760)
chr5 (509-553)||(42505141-42505185)
chr5 (490-553)||(14211409-14211472)
chr5 (490-553)||(19103310-19103373)
chr5 (509-564)||(39591369-39591424)
chr5 (581-655)||(6216979-6217053)
chr5 (581-655)||(19100552-19100626)
chr5 (690-731)||(1582148-1582189)
chr5 (690-731)||(1602626-1602667)
chr5 (515-655)||(39567351-39567490)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (444-728)||(7880879-7881165)
chr6 (442-728)||(17237061-17237348)
chr6 (442-728)||(25064250-25064538)
chr6 (442-727)||(12652959-12653246)
chr6 (442-728)||(35001604-35001892)
chr6 (444-728)||(7875821-7876107)
chr6 (442-724)||(8496985-8497270)
chr6 (442-728)||(4984342-4984630)
chr6 (442-728)||(23947092-23947381)
chr6 (442-727)||(4088475-4088762)
chr6 (443-728)||(4468572-4468853)
chr6 (442-728)||(16419172-16419460)
chr6 (446-769)||(8027897-8028217)
chr6 (456-728)||(8196196-8196470)
chr6 (444-728)||(33740355-33740641)
chr6 (442-713)||(28634888-28635169)
chr6 (462-727)||(33110626-33110893)
chr6 (445-650)||(17334846-17335052)
chr6 (485-728)||(10228693-10228938)
chr6 (442-614)||(12059548-12059720)
chr6 (442-713)||(25337599-25337869)
chr6 (461-655)||(16892610-16892805)
chr6 (469-728)||(33543429-33543683)
chr6 (442-655)||(606287-606502)
chr6 (442-655)||(33052960-33053175)
chr6 (577-728)||(12165854-12166006)
chr6 (442-593)||(9341443-9341596)
chr6 (456-655)||(23128701-23128902)
chr6 (442-655)||(3913366-3913581)
chr6 (442-655)||(7027951-7028157)
chr6 (442-655)||(12170551-12170766)
chr6 (442-655)||(29319669-29319885)
chr6 (442-553)||(32327012-32327126)
chr6 (442-532)||(3173987-3174077)
chr6 (442-568)||(12168852-12168980)
chr6 (442-637)||(31296921-31297117)
chr6 (442-655)||(67793-68008)
chr6 (444-517)||(34489428-34489501)
chr6 (543-635)||(34489331-34489421)
chr6 (548-614)||(20619597-20619663)
chr6 (490-655)||(546114-546278)
chr6 (444-575)||(21426480-21426614)
chr6 (492-655)||(29255291-29255453)
chr6 (514-728)||(4351853-4352059)
chr6 (442-553)||(7514995-7515108)
chr6 (581-655)||(25398651-25398725)
chr6 (660-730)||(26588499-26588569)
chr6 (682-731)||(34185742-34185791)
chr6 (442-550)||(1450528-1450636)
chr6 (492-655)||(30493615-30493777)
chr6 (492-655)||(30608360-30608522)
chr6 (490-553)||(30776847-30776910)
chr6 (442-553)||(32060060-32060174)
chr6 (442-526)||(34185486-34185572)
chr6 (444-489)||(11321338-11321383)
chr6 (442-655)||(28981260-28981474)
chr6 (455-644)||(7975993-7976183)
chr6 (787-830)||(4984693-4984736)
chr6 (484-598)||(8518934-8519049)
chr6 (513-564)||(8644549-8644600)
chr6 (486-699)||(1703971-1704184)
chr6 (581-655)||(8266718-8266792)
chr6 (442-532)||(14174863-14174956)
chr6 (442-532)||(14179399-14179492)
chr6 (444-518)||(15612366-15612440)
chr6 (442-532)||(24590366-24590456)
chr6 (443-488)||(679371-679416)
chr6 (496-553)||(4663545-4663602)
chr6 (445-546)||(14866633-14866734)
chr6 (491-564)||(20226024-20226097)
chr6 (491-564)||(22120008-22120081)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (442-768)||(201148-201470)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (446-688)||(8745-8989)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (442-768)||(16095-16418)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (442-725)||(83212-83498)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (511-712)||(6335-6538)
[»] scaffold0495 (1 HSPs)
scaffold0495 (485-728)||(5412-5657)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (442-728)||(361574-361862)
[»] scaffold0136 (2 HSPs)
scaffold0136 (485-729)||(34600-34844)
scaffold0136 (442-553)||(9834-9948)
[»] scaffold0884 (1 HSPs)
scaffold0884 (442-643)||(1765-1968)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (492-655)||(65887-66049)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (442-655)||(15574-15789)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (442-655)||(57881-58095)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (442-553)||(36465-36576)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (442-553)||(53193-53304)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (450-547)||(4402-4499)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (503-655)||(50858-51009)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (492-655)||(6112-6274)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (645-728)||(453946-454030)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (442-559)||(14664-14783)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (492-553)||(1527-1588)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (442-598)||(71662-71820)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (681-728)||(20412-20459)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (448-532)||(9452-9536)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (492-655)||(71145-71307)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 133 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 20083962 - 20083231
Alignment:
Q  133 atcccttttatgcttcaaaacctttcatttctattatcggaaactctattcttgnnnnnnnatttgattggattttgatgaatggttatcatcaattctc 232  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20083962 atccctttttttcttcaaagcctttcatttctattatcggaaactctattcttgtttttttatttgattgaattttgatgaatggtgatcattaattctc 20083863  T
Q  233 tctttactgatctctgaagggcgttttacattttttagaatctcaatttcaatcagtccaagaaattataatgttgctgacaataacaataaatattccc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20083862 tctttactgatctctgaagggcgttttacaatttttagaatctcaatttcaatcagtccaagaaattataatgttgctgacaataacaataaatattccc 20083763  T
Q  333 tnnnnnnnnnnnnnnnnn---catgatacacacattcgtggcaacttttgtattcattctaaagttttgcaatctgtagagttcataatggctaaataag 429  Q
    |                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20083762 taaaaaaaaaaaaacaataaacatgatacacacattcgtggcaacttttgtattcattctaaagttttgcaatctgtagagttcataatggctaaataag 20083663  T
Q  430 tcgnnnnnnnnn----------acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaat 519  Q
    ||                    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20083662 tcttttttttttctttttttttacaaaaacaaaatgatatttattcattcaaatcgatatagtacatcatttaacatcgctacaaatgtaaatgatgaat 20083563  T
Q  520 ctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca--tgtct 617  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  20083562 ctgcgaacaaactaataacatcaaagttaatagcgtataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatactcacatgtct 20083463  T
Q  618 tcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtct 717  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20083462 ccggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgtct 20083363  T
Q  718 cacaagacgacaaattaaccaacacaccatcacacttagatgtcgaaatcatgaggnnnnnnncctagatatatatgtgaaaattgcttaattagattga 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20083362 cacaagacgacaaattaaccaacacaccatcacacttagatgtcgaaatcatgaagaaaaaaacctagatatatatgtgaaaattgcttatttagattga 20083263  T
Q  818 aatagagagaaaataatgaatagtggtatttt 849  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  20083262 aatagaaagaaaaagatgaagagtggtatttt 20083231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 32684970 - 32684682
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  32684970 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagactacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaacttacagcatc 32684871  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||| || |||||||||||||    
T  32684870 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatatccatggcctccagatctgtaacgttgacgccc 32684771  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  32684770 aaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 32684682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 45198808 - 45199095
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  45198808 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatc 45198907  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  45198908 caagttaatagtatataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaatcaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 45199007  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||| |||||    
T  45199008 aaatctttgattgaataaccgatc-ttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacagcgccgcacaaaacgac 45199095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 46822317 - 46822033
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  46822317 acaaaaacaaaatgatattaattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 46822218  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  46822217 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 46822118  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  46822117 aaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 46822033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 442 - 830
Target Start/End: Original strand, 35495950 - 35496333
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  35495950 acaaaaacaaaatgatattcaatcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaagggatgaatctacgaacaaactcacatcatc 35496049  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  35496050 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 35496149  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| |||||||| | ||||||||||     | | |||    
T  35496150 aaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaggacgggaaatgaaacaacgccgcacaagacga-----tgaacaa 35496244  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatcatgaggnnnnnnncctagatatatatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaa 830  Q
    || |||| ||||||||||||  |||||||  | |       |||||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35496245 caaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaacctag--atctatgtgaaaatcacttaattagattgaaatagagagaaaa 35496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 34774013 - 34773725
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||    
T  34774013 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctgcaaacaaactcacagcatc 34773914  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  34773913 caagttaatagtatataacgatataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 34773814  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||||||    
T  34773813 aaatctttgattgaacgatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacaggaaatcaaacaacgccgcataagacgac 34773725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 442 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 26492667 - 26492393
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  26492667 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatc 26492568  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | | ||||| ||||||||||||||||    
T  26492567 caagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccaaggcatccggatctgcaacgttgacgccc 26492468  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||| |||||| |||   ||||||| |||||||||||||    
T  26492467 aaatctttgattgaataatcgacctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcgcgaagacgggaaatcaaacaacg 26492393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 20116883 - 20116596
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  20116883 acaaaaccaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattccacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 20116784  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| | || || | ||||||||||||||||    
T  20116783 caagttaatagcatat-acgacataatgcctacaaaaatatttgataaaattaaagtgaccggaatatctatgacctctgggtctgcaacgttgacgccc 20116685  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  20116684 aaagttttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggtaaatcaaacaacgacgcacaagacgac 20116596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Original strand, 22927647 - 22927933
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | || |||    
T  22927647 aaaaataaaatgatattcattaattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcaacca 22927746  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22927747 agttgatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaa 22927846  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22927847 atctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 22927933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 23085823 - 23085551
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  23085823 acaaaaataaaattatattgattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatc 23085724  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||  |    
T  23085723 caaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggtctccagatctgcaacgttgacgttc 23085624  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  23085623 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaa 23085551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 442 - 714
Target Start/End: Original strand, 2843016 - 2843290
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | | ||||    
T  2843016 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatc 2843115  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||| ||||||| |    
T  2843116 taagctaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacattgacgctc 2843215  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2843216 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacg 2843290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 444 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42311578 - 42311308
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||    
T  42311578 aaaaacaaaatgatattcatttattcaaatcgagagattacattattcaacactgctagaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcag--catcca 42311481  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42311480 agttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacggccaa 42311381  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  42311380 atctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcacgaagacggaaaatcaaacaacg 42311308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 6559179 - 6558891
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| || |||||||||||   ||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  6559179 acaaaaacaaaatgatattcattcatttaaattgagagattatatcattcaacactactaaaaacgtaaatgatgaatatgtgaacaaactcatagcatc 6559080  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  6559079 caagttaatagcatataacgacataatgcttgcaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 6558980  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6558979 aaatctttgattgaataatcgatttttcaaaatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcgaacaacgtcgtacaagacgac 6558891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 444 - 675
Target Start/End: Original strand, 13592287 - 13592518
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |    
T  13592287 aaaaacaaaatgagatccattcattaaaatcgatagagtacat-attcaacactgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatcga 13592385  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  13592386 agttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgctcaaa 13592485  T
Q  644 tctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaa 675  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  13592486 tctttgattgaataatcgatcttccaatataaa 13592518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 35261599 - 35261332
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  35261599 acaaaaacagaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcatttaacaccactaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatc 35261500  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||| | |    
T  35261499 caagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacacatgcctccggatctgcaacattgacgtcta 35261400  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaa 709  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  35261399 aatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcaaatgaaca-cgcacaaagacggaaaatcaaa 35261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 42066837 - 42067124
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||    
T  42066837 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaataaatatgcgaacatactcacaacatc 42066936  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt-cggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||||  ||| || | | ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42066937 caagttaatagcacatatcggcgttatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcttccggatctgcaacgttgacgccc 42067036  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | |||||||||||    
T  42067037 aaatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacagcgccgcacaagacgac 42067124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 1448607 - 1448893
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | || ||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  1448607 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagatattatatcattcaacaccgctgaaaacctaaaggatgaatctgcgaacaaac--acaacatc 1448704  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |  | ||||| ||||||||||||  ||    
T  1448705 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatagggtccggatctgcaacgttgacatcc 1448804  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  1448805 aaatctttgattgaataatggatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaatacgac 1448893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 451 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 46339347 - 46339068
Alignment:
Q  451 aaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaat 550  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||  | || ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||    
T  46339347 aaatgatattctttcattcaaatcaagagattacatcattcaacactgttaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaat 46339248  T
Q  551 agcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttg 649  Q
    | | ||||||||||||||   | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46339247 aacatataacgacataatgcatgcaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgccttcgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttg 46339148  T
Q  650 attgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| ||| |||||||||| || || ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  46339147 attgaacaatagatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 46339068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Original strand, 35667009 - 35667295
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||||    
T  35667009 aaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcaagagaatataccattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatttgtgaacaaactcacgacatcca 35667108  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||| | |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || || || |||||| ||||||| |||    
T  35667109 agttaatatcatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccgaatctgcaacattgacgctcaa 35667208  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  35667209 atcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaaaaacgccgcacaagacgac 35667295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 443 - 669
Target Start/End: Original strand, 433467 - 433695
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  433467 caaaaataaaaagatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatcc 433566  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| | || ||||| ||||||||| ||| |||    
T  433567 aagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttaacgtcca 433666  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaa 669  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  433667 aatctttgattgaataatcgatctttcaa 433695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 452 - 670
Target Start/End: Original strand, 7640560 - 7640780
Alignment:
Q  452 aatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7640560 aatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaata 7640659  T
Q  552 gcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttga 650  Q
    || ||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| | | | ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  7640660 gcatataacgacataatgcctataaaaatatatgatgaaattaaagtgaccagaatatccatgacatccagatttgcaatgttgacgcccaaatatttga 7640759  T
Q  651 ttgaa-aatcgatctttcaaa 670  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  7640760 ttgaataatcgatctttcaaa 7640780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 442 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 21266694 - 21266428
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagag--tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| | | ||    
T  21266694 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagagattacaccattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacagca 21266595  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||    
T  21266594 tccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtcaccgaaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgc 21266495  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaat 705  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  21266494 tcaaatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcagatgaacaccgcaagaagacggaaaat 21266428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 445 - 727
Target Start/End: Original strand, 17222779 - 17223061
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||||||  ||| || |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17222779 aaaataaaataatctttattcattcaaatcgggaga-tatatcatttaacaccgctaaaaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaa 17222877  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||  || ||||||||||||  |||||    
T  17222878 gttactagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggccttcaaatctgcaacgttgacatccaaa 17222977  T
Q  644 tctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  17222978 tctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaaca-cgcatgaagaaggaaaatcaaaccacgccgcacaagacga 17223061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 23425148 - 23425435
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||| ||||| | ||||    
T  23425148 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattaagagattacattattcaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctatgaacatactaacagcatc 23425247  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| | || ||||| |||||| |||| ||||    
T  23425248 caagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaagtaaagtgactagaatatccatggcctccggatctgcaacattgatgccc 23425347  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |  | |||||||||||    
T  23425348 aaatctttgttttaataatcgatc-ttcaaaataaatcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacagcaccgcacaagacgac 23425435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 31235559 - 31235855
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||| | | ||||    
T  31235559 acaaaaacaaactgatattcatttattcaaatcgataggttacatcattcaatatcgctaaaaacgtaaagaatgaatttgtgaacaaactcacagcatc 31235658  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt---------cggatatgcaacgt 632  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  31235659 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgatcggaatacccatgtcttccatgcctccggatttgcaacgt 31235758  T
Q  633 tgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||   |||||||||||    
T  31235759 tgacgctcaaagatttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacgatacgagaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 31235855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 724
Target Start/End: Original strand, 32521704 - 32521986
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  32521704 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatggattacatcattcaacaccgttaaaatcgtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatc 32521803  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||| |  ||||   ||||| |||| ||| |    
T  32521804 caagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaataaaagtgtctggaatactcatg-ccccggaacagcaacattgatgccta 32521902  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  32521903 aatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccacaacaaaacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 32521986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 669
Target Start/End: Original strand, 1485031 - 1485261
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  1485031 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaagtttacaacatc 1485130  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatg-ataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||| ||||||| |    
T  1485131 caagttaatagcatataagggcataatgcctacaaaaatatatgaaaaaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaatgttgacgtc 1485230  T
Q  640 caaatctttgattgaa-aatcgatctttcaa 669  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1485231 caaatctttgattgaataatcgatttttcaa 1485261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 23786877 - 23786589
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||| ||| | || ||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  23786877 acaaaaataaaaatatattcattcattcaattagagagattacatcattcaacacagctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 23786778  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||| ||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| | || |||| || ||||||||||       
T  23786777 taagttgatagcatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgacaggaatatccatgacctcgggatctggaacgttgacgttt 23786678  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | || ||||||||    
T  23786677 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacaacgccgcagaagacgac 23786589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 26584012 - 26583729
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca-t 540  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || || | | || |    
T  26584012 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgtgagattacatcattcaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataagctcacagcatt 26583913  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || || || ||||||||||||||     
T  26583912 caaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatgacctccgaatctgcaacgttgacgc- 26583814  T
Q  640 caaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
        |||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||  |||  ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||    
T  26583813 ----tctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacattgcacgaagactggaaatcaaacaacgccgcacaagacga 26583729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 498 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 48208147 - 48207915
Alignment:
Q  498 gctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaa-tagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaa 596  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  48208147 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaaaatactcacaacatccaagttaaatagcatataacggcataatgccaacaaaaatatatgataaaattaaa 48208048  T
Q  597 gtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattg-aaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaaca 694  Q
    |||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||| |    
T  48208047 gtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgtataatggatc-ttcaaaatgaatcaaatgaacaccgcaaga 48207949  T
Q  695 agacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| |||||||||| ||   |||||||||||    
T  48207948 agacgggaaatcaaacagcgcagcacaagacgac 48207915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20073405 - 20073232
Alignment:
Q  14 atgaagtaagataagttttaacgtgattgat---actacatttttataattaatgtggaatttggacaattttgtttagttggctagtatgtgtggataa 110  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   || |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20073405 atgaagtaagataagtttaaatgtgattgatgatacaacatttttatgattaatgtgaaatttggacacatttgtttagttggctattacgtgtgtataa 20073306  T
Q  111 gggagtagatgagattaatgtaatc--ccttttatgcttcaaaacctttcatttctattatcggaaactctatt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20073305 gggagtagatgagattaatgtaatcctcttttttttcttcaaagcctttcatttctatcatcggaaactctatt 20073232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 6002329 - 6002035
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| | | ||||    
T  6002329 acaaaaacaaactaatattcattcattcaaatcgataggttacattattcaacatcgttaaaaacgtaaatgataaatctgtgaataaactcacatcatc 6002230  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgt---------cttcggatatgcaacgt 632  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||         |||||||| ||||||||    
T  6002229 caagttaatagc--ataatggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaggtgaccggaatactcatgtcttccataccttcggatctgcaacgt 6002132  T
Q  633 tgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||||| || | |||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  6002131 tgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcgacgatacgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 6002035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 19560298 - 19560012
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| | ||| ||| ||||||| || ||| ||||||  ||||||| |||||||| | | | ||      
T  19560298 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaatcgagagattgcattatttaacatcgttaaaaaagtaaag--tgaatctacgaacaaattcacatcaat 19560201  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||    
T  19560200 caagttaatagcatataacggcataatgtgtacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggtctccggatctgcaaggttgacgtcc 19560101  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| |||||||  ||| || | |  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19560100 aaatctttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacacatcaagaaaatgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 19560012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 492 - 724
Target Start/End: Original strand, 46818241 - 46818475
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatct--gcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttc-tacagaaatatatgata 588  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  46818241 aacatagctaaaaacgtaaaggatgtatctctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgtcgtacaaaaatatatgata 46818340  T
Q  589 aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacac 687  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||| |||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||| || || ||  || |||||||    
T  46818341 aaattaaagtgaacggaatacacatgactctggatctgcaacgttg-cg-ccaattctttgactgaacaatcgatcttttaatatgaattaaatgaacac 46818438  T
Q  688 cgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  46818439 cgcaacaatacgagaaatcaaacaacgccgcacaaga 46818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 42408527 - 42408376
Alignment:
Q  579 atatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaa 676  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  42408527 atatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 42408428  T
Q  677 caactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  42408427 caaatgaataccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 42408376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 34899399 - 34899614
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  34899399 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaattgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 34899498  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    ||||||||||||||| || |||| || |||   |||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | || || |||||||||||||     
T  34899499 atccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcataca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccgaatttgcaacgttgacgt 34899597  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  34899598 ccaaatcattggttgaa 34899614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 442 - 637
Target Start/End: Original strand, 28044548 - 28044745
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  28044548 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcataac 28044647  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||| |||| | ||  ||||||||||||  || | |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  28044648 atccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtcta-aaaataatatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacg 28044745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17611693 - 17611584
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17611693 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcattcaacattgctaaaaacataagggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 17611594  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  17611593 caagttaata 17611584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 457 - 655
Target Start/End: Original strand, 39171397 - 39171597
Alignment:
Q  457 tatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  39171397 tatttattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcatagcacccaagttaatagc 39171496  T
Q  554 gtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattg 653  Q
     || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  39171497 atacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttg 39171595  T
Q  654 aa 655  Q
    ||    
T  39171596 aa 39171597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 445 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 40993453 - 40993248
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  40993453 aaaacaaaacgatattcattcatttaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacc 40993354  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||   ||    
T  40993353 caagttaataacatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg-cttctgaatatgcaacgttgaaatcc 40993256  T
Q  641 aaatcttt 648  Q
    ||||||||    
T  40993255 aaatcttt 40993248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 48061721 - 48061518
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48061721 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcaggtacaaacatctctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataac 48061622  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||| ||||| ||||  |  |||| ||||||||||||||    
T  48061621 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcaccgaaatactcatgcttaaggatctgcaacgttgacgc 48061523  T
Q  639 ccaaa 643  Q
     ||||    
T  48061522 tcaaa 48061518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 14627673 - 14627942
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | | | ||||    
T  14627673 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcatttgacaccgcta-aaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaaatcacagcatc 14627771  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcgga-tatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||| ||                 ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| | || || | |||||||||||||| |    
T  14627772 caagttaat-gc-----------------ctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgctc 14627853  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| | ||||||| |  ||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14627854 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaataaacaccgtactaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaatacgac 14627942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 458 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36144030 - 36143913
Alignment:
Q  458 atttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtat 557  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||  |||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||||  |||    
T  36144030 atttattcatccaaattgatagagtacatcattcaacaccgctaaaaacataaataatgaatctgctaattaactcacaccatccaagttaatagtatat 36143931  T
Q  558 aacgacataatttctaca 575  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  36143930 aacgacataatgtctaca 36143913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 19404602 - 19404764
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |||| || ||   ||||| ||  |||||||||||    
T  19404602 aacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcgtgcaacggcaaaaagcctaca-aataatatgataaaa 19404700  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
       |||| || | ||||| ||||  | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19404701 tctaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 19404764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 42978856 - 42978694
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| | | |||||||||||    
T  42978856 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacatata-atatgataaaa 42978758  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |  |||| |||| |||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42978757 cctaagtcaccgaaatacccatccttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaa 42978694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 48316611 - 48316819
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||   |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| | | || |    
T  48316611 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtata-ca---aacatcgctaaaaacctaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacc 48316706  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  || |  ||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||| |||    
T  48316707 caagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcgccgaaatacccatgcttccggatctgcagcgttgacgtcca 48316805  T
Q  642 aatctttgattgaa 655  Q
    |||| ||| |||||    
T  48316806 aatcattgcttgaa 48316819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 12141099 - 12141315
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| | |||    
T  12141099 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaac 12141198  T
Q  539 -atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
     | ||||||||||||| || |||| || |||   |||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  12141199 aacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcataca-aataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacg 12141297  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
     ||||||| ||| |||||    
T  12141298 tccaaatcattggttgaa 12141315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 521 - 655
Target Start/End: Original strand, 17499535 - 17499669
Alignment:
Q  521 tgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcg 620  Q
    |||||||||| | | |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||       
T  17499535 tgcgaacaaattcacaacaacaaagttaatagcatataacgacattatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatactcgtatctata 17499634  T
Q  621 gatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17499635 gatctccaacgttgatgcccaaatctttgattgaa 17499669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 521 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 17553679 - 17553545
Alignment:
Q  521 tgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcg 620  Q
    |||||||||| | | |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||       
T  17553679 tgcgaacaaattcacaacaacaaagttaatagcatataacgacattatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatactcgtatctata 17553580  T
Q  621 gatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17553579 gatctccaacgttgatgcccaaatctttgattgaa 17553545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 171
Target Start/End: Original strand, 20081676 - 20081762
Alignment:
Q  86 ttagttggctagtatgtgtggataagggagtagatgagattaatgtaatccctt-ttatgcttcaaaacctttcatttctattatcg 171  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20081676 ttagttggctattatgtgtgtataagggagtggatgagattaatgtaatcctttgtttttcttcaaagcctttcatttctattatcg 20081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 279
Target Start/End: Original strand, 20081884 - 20081964
Alignment:
Q  196 ttgattggattttgatgaatggttatcatcaattctctctttactgatctctgaagggcgttttacattttttagaatctcaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20081884 ttgattggattttgatgaatggttatca---attctcactttcttgatctctggagggcgttttacattttttaggatctcaat 20081964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 37837251 - 37837465
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | | |    
T  37837251 acaaaaacaaac-gatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagc 37837349  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| |   ||||||||||||  |||| |||| ||| | ||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  37837350 acccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctaca-agtaatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacgc 37837448  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  37837449 ccaaatcattggttgaa 37837465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 508 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 19297100 - 19296954
Alignment:
Q  508 taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaat 607  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||  || |||  ||||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||    
T  19297100 taaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatataacagcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagttaccgaaat 19297002  T
Q  608 acccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  19297001 acccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaa 19296954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 655
Target Start/End: Original strand, 8001341 - 8001553
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | || |    
T  8001341 aaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtgcatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacc 8001440  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| || |||| || |||  ||| | ||  ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||  | || || ||||||||||||| |||    
T  8001441 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctata-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgattccgaatctgcaacgttgacgtcca 8001539  T
Q  642 aatctttgattgaa 655  Q
    |||| ||| |||||    
T  8001540 aatcattgcttgaa 8001553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24351239 - 24351178
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24351239 tcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcatagcatccaagttaata 24351178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 37849139 - 37849030
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| |  ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| | | ||||||    
T  37849139 aaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgataaattacttatttcaacaccgctaaaaatgtaaagaataaatctgcaaacaaactcacagcatcca 37849040  T
Q  544 agttaatagc 553  Q
    ||||||||||    
T  37849039 agttaatagc 37849030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 731
Target Start/End: Original strand, 46244043 - 46244335
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataa---- 537  Q
    |||||||||||| |||||| |||||   ||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||        
T  46244043 acaaaaacaaaacgatattcattca---aaattaatagagtacatcatttaatatcgctaaaaacgtaaataatgaatctgcaaacaaactcataagtca 46244139  T
Q  538 ---catccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttg 634  Q
       ||||| |||||||| | || || |||| |||  ||||| | | ||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||| |  ||||||||||    
T  46244140 caacatccgagttaataacatacaatgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaattaaagtgaccaaaatatcaatgtcttcgaacctgcaacgttg 46244238  T
Q  635 acgcccaaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    |||| |||||| |||||  | || |||| |||||| |  || ||| |||||||| |||||||| |    ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  46244239 acgctcaaatcattgatgaataaccgatttttcaataggaaccaaatgaacaccacaacaagatgatggatcaaacaacgtcgcataagatgacaaa 46244335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 17611234 - 17611139
Alignment:
Q  634 gacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17611234 gacgctcaaatctttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaagacagaaaatcaaacaactccgcacaagacgac 17611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 575
Target Start/End: Original strand, 28407712 - 28407846
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||| | | |||    
T  28407712 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtaaatctgcgaacaaactcacagcat 28407811  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctaca 575  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  28407812 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaca 28407846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20104008 - 20103950
Alignment:
Q  21 aagataagttttaacgtgattgatactacatttttataattaatgtggaatttggacaa 79  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20104008 aagataagtttaaatgtgattgatactgcatttttataattaatgtgaaatttggacaa 20103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 47590590 - 47590395
Alignment:
Q  462 attcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtata 558  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||    | |||||||||  ||| ||||||| | ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| || |    
T  47590590 attcattcaaatcgatagagtatatcagatataaacatcgctgaaaacgtaaagggtaaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcttaca 47590491  T
Q  559 acgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||| || |||  ||||| | | ||||||||||||  ||||  ||| ||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  47590490 acggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcgccgaaatactcatgcttccggatgtgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaa 47590395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 573
Target Start/End: Original strand, 9977002 - 9977136
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||| | | |||    
T  9977002 acaaaaacaaaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaaaaaattcacaac 9977101  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttcta 573  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  9977102 atccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtcta 9977136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 20073020 - 20072955
Alignment:
Q  351 catgatacacacattcgtggcaacttttgtattcattctaaagttttgcaatctgtagagttcataa 417  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20073020 catgatacacacattggtggtaactttcgtattcattctaaag-tttgcaatttgcagagttcataa 20072955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 521 - 654
Target Start/End: Original strand, 13796803 - 13796935
Alignment:
Q  521 tgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcg 620  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||  | ||    
T  13796803 tgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcacctaaatactcatgcttccg 13796901  T
Q  621 gatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  13796902 gatctgcaacgttgacggtcaaatcattggttga 13796935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 635
Target Start/End: Original strand, 43369549 - 43369741
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||  |||||||| | | |||     
T  43369549 acaaaaataaaacgatattcattcatttaaattgatagattacatcattcaatatcgctgaaaacgtaaaggataaatttgtaaacaaacttacatcata 43369648  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttga 635  Q
    |||||||||| | || |||| || |||  ||| | ||  ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||  | ||||| |||||||||||    
T  43369649 caagttaatatcatacaacggcaaaatgcctata-aataatatgataaaattaaagtgactagaatactcatgcatccggatctgcaacgttga 43369741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 3861214 - 3861076
Alignment:
Q  469 caaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | || ||     
T  3861214 caaattgatagagtaccccattcaacatcactaaaaacgtaaattatgaatatgtgaacaaactcataacatccaagttgataacatataatggcaaaaa 3861115  T
Q  569 ttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata 608  Q
      ||||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3861114 gcctacacata-atatgataaaattaaagtgaccgaaata 3861076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 489 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 25255476 - 25255401
Alignment:
Q  489 ttcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  25255476 ttcaatatcgctaaaaacgtaaagggtgtatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgaca 25255401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Original strand, 46822586 - 46822649
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46822586 tcaacatcgctacaaacgtaaaaagtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagc 46822649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 681 - 726
Target Start/End: Original strand, 17499675 - 17499720
Alignment:
Q  681 tgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacg 726  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17499675 tgaataccgcaacaagacggaaaatcaaacaatgtcgcacaagacg 17499720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 681 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 17553539 - 17553494
Alignment:
Q  681 tgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacg 726  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17553539 tgaataccgcaacaagacggaaaatcaaacaatgtcgcacaagacg 17553494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20095876 - 20095815
Alignment:
Q  118 gatgagattaatgtaatcccttt-tatgcttcaaaacctttcatttctattatcggaaactc 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20095876 gatgagattaatgtaatccttttattttcttcaaagcctttgatttctattatcggaaactc 20095815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 36143915 - 36143878
Alignment:
Q  676 acaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36143915 acaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 36143878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 40741868 - 40741763
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||  | ||  ||| |  |||||||| |||||||||| | |||||     
T  40741868 acaaaaataaaatgatattaattcattcaaattgatatagtacatcatttaacatcgtaaaaagcgtagataatgaatctacgaacaaactcacaacata 40741769  T
Q  542 caagtt 547  Q
    ||||||    
T  40741768 caagtt 40741763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Original strand, 45349593 - 45349705
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaac-atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    ||||| |||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||     
T  45349593 aaaaaaaaaacgatattcattaatttaaatcgatagagtacatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaacaaactcacaacac 45349692  T
Q  541 ccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||    
T  45349693 ccaagttaatagc 45349705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9137782 - 9137738
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  9137782 aaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacatccatgttaatagc 9137738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 42408583 - 42408523
Alignment:
Q  498 gctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtata 558  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  42408583 gctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatata 42408523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 482 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48208196 - 48208152
Alignment:
Q  482 tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48208196 tacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaa 48208152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20103048 - 20102997
Alignment:
Q  79 attttgtttagttggctagtatgtgtggataagggagtagatgagattaatg 130  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20103048 attttgtttagtagtccattatgtgtgtataagggagtagatgagattaatg 20102997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 45482446 - 45482391
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  45482446 aaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgaca 45482391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 553
Target Start/End: Original strand, 5348460 - 5348498
Alignment:
Q  515 tgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5348460 tgaaactgcgaacaaactaacaacatccaagttaatagc 5348498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 509 - 551
Target Start/End: Original strand, 35141401 - 35141443
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  35141401 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaata 35141443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38799004 - 38798966
Alignment:
Q  515 tgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38799004 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagc 38798966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 41553228 - 41553340
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||| ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||| | | ||    
T  41553228 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattaatagaatacatcagaatcaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctaggaacaaactcacagca 41553327  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
     |||||||||||||    
T  41553328 -ccaagttaatagc 41553340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31240336 - 31240295
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagtta 548  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31240336 gtaaatgatgaatctgcgaagaaacttataacatccaagtta 31240295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 564
Target Start/End: Original strand, 35664928 - 35665052
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||| || ||| ||||| |   |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||| | |  |    
T  35664928 acaaaaacaaaacaatatttattcatttaaattgagagaatacattagaatcaacatcgctaaaaacgtaaaggagaaatctgtgaacaaactcacagta 35665027  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
     ||||||||||||| || |||||||    
T  35665028 cccaagttaatagcatacaacgaca 35665052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40761992 - 40761935
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  40761992 tcgctaaaaaagaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatatcatccatgttaatagc 40761935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 116)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 9986117 - 9986405
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9986117 acaaaaacaaaatgatattcattcatccaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 9986216  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||    
T  9986217 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatggcctccgaatctgcaacgttgacgccc 9986316  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9986317 aaatctttaattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 9986405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 7015486 - 7015774
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  7015486 acaaaaacaaaatgatatttattcattcaaatcgagagattacatcattcaacacagctaaaaacgtaacgaatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 7015585  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  7015586 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagcgacgggaatatccatggcattcggatctgcaacgttgacgccc 7015685  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7015686 aaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 7015774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 8806172 - 8805884
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  8806172 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaatctcacaacatc 8806073  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || || || |||||||||||||||     
T  8806072 caagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccgaatctgcaacgttgacgcca 8805973  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8805972 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccacacgaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 8805884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 27248926 - 27249214
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27248926 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattatatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 27249025  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||| ||||||| ||||||||    
T  27249026 caagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctcaggatctgcaacgctgacgccc 27249125  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  27249126 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 27249214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 2808248 - 2808535
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| | | ||||    
T  2808248 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattgtatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaac-aactcacatcatc 2808346  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt-cggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||     
T  2808347 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcttccggatctgcaacgttgacgcca 2808446  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2808447 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacatcgcaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 2808535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 36234304 - 36234026
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  36234304 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 36234205  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||||          |||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  36234204 caagttaatagc----------ataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 36234115  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36234114 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 36234026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 459051 - 459337
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||  |||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  459051 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcattcaacaccactaaaaacataaaagat-aatctacgaacaaactcaaaacatc 459149  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
     ||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| |    
T  459150 aaagttaatagcatataatggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaaatgactgaaatacctatgcatccggatctgcaacgttgacgccta 459249  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  459250 aatctttgattaaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtcgtacaagacgac 459337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 442 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 4228429 - 4228116
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4228429 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 4228330  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-aaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||  || ||||| |||||||||   |||    
T  4228329 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaaattaaagtgatcggaatatccatgacctccggatctgcaacgtt---gcc 4228233  T
Q  640 caaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaacca 738  Q
     ||||||||||||||| ||||||||        | || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||     ||    
T  4228232 taaatctttgattgaataatcgatc--------tgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----ca 4228146  T
Q  739 acacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  4228145 acaaaccatcacacttagatgatgaaatca 4228116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 8971403 - 8971690
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  8971403 acaaaaacaaaatgatatccattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaagaatgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacagcatc 8971502  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | || |||| ||||||||||||  ||    
T  8971503 caagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatcaatgacatctggatctgcaacgttgacatcc 8971602  T
Q  641 aaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||  || || ||| |||||| ||||  |||| || |||||||||||||   |||||||||||    
T  8971603 aaatctttaattgataattgatctttcattatgaatcaaatgaacatcgcacgaagatgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 8971690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 27949730 - 27949444
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | | || ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  27949730 aaaaacaaaatgatattcattcatttaaatcgagatattatatcattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctccgaacaaactcacaacatcca 27949631  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27949630 agttaatagcatacaacgtcataatgtctataaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctttggatctgcaacgttgacgcccaa 27949531  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  27949530 atctttgattgaataattgatctttcgatatgaatcaaatgaacatcgcaagaagacgggaaatcaaacaacgccgtacaagacgac 27949444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Original strand, 37613901 - 37614187
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  37613901 acaaaaacaaaaccatattcatccattcaaatcgatagagtacactattcaacatcgctaaaatagtaaaggatgaatctgcgaacaaactcggggcatc 37614000  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |  |    
T  37614001 caagttaataacatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgattggaatactcatgtctcccgatctgcaacgttgacacaaa 37614100  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37614101 aatatttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgacgcacaagacga 37614187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 712
Target Start/End: Original strand, 83956 - 84227
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  83956 acaaaaataaaatggtattcattcattcaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 84055  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||| ||    
T  84056 caagttaatagcatataacggcataatgcctacgaaaatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatgacatccggatctgcaacgttgacgtcc 84155  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  84156 aaatctttgattgaataatcgat-tttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaa 84227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 21570183 - 21570470
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| | | |||     
T  21570183 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacataaaggctgaatctgcgaacaaacttacagcatt 21570282  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| | || ||||| |||||| |||||||||    
T  21570283 caagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaacggaatattcatggcctccggatctgcaacattgacgccc 21570382  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| | ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  21570383 aaatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcaaatgaacaccgcgagaagacgggaaactaaacaacgtcacacaagacgac 21570470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 444 - 655
Target Start/End: Original strand, 38575263 - 38575474
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38575263 aaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgcta-aaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatcca 38575361  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    || ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  38575362 agataatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaa 38575461  T
Q  643 atctttgattgaa 655  Q
    |||||||||||||    
T  38575462 atctttgattgaa 38575474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 478 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 17319590 - 17319302
Alignment:
Q  478 agagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacaga 577  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| | |    
T  17319590 agagtgcatcattcaacaccggtaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacgacatccaagttaataacatataacgacataatgcctataca 17319491  T
Q  578 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatc-tttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaa 675  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |     
T  17319490 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgctcaaatcttttgattgaataatcgatc-ttcaatatgag 17319392  T
Q  676 acaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacacaccatcacacttagatgtcgaaatcatga 771  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||     |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  17319391 tcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatc-aacaacgctgcacaagacgaagaa-----caacacaccaccacactcagatgacgaaatcatga 17319302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 41431334 - 41431046
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  41431334 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacattattcaacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaataaactcacaacatc 41431235  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||  ||    
T  41431234 caagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaatatccatggtctctggatctgcaacgttgacatcc 41431135  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  41431134 aaatctttgattgaataatcgatctttcaattggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 41431046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 4193143 - 4192856
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |  |||    
T  4193143 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacgccgctaaaaacgtaaaggatgaatctccgaacacactcacagtatc 4193044  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | || ||||| |||||||||||||| |    
T  4193043 taagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgctc 4192944  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  4192943 aaatctttgacggaataatcgatc-ttcaaaatgaatcagatgaacactgcaagaagacgggaaatcaaacaacaccacacaagacgac 4192856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 20046857 - 20047145
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||||    
T  20046857 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaaatcacagcatc 20046956  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||| | ||    
T  20046957 caagttaataagatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgtcc 20047056  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || ||||||||| || |||||   ||||||||||||| | |||||||||||    
T  20047057 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgtaagaagacatgaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 20047145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 25087341 - 25087055
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  25087341 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccacta-aaacgtaaaggatgaatctgggaacaaactcacatcatc 25087243  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||| | || ||||||||||||| ||    
T  25087242 caagttaatagcatataacggcttaatgcctaca-aaatatatgataagattaaagtgactggaatatccatggcttctgaatctgcaacgttgacgtcc 25087144  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||  || ||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25087143 aaatcattgattgaataatcgatcttttaatatgaataaattgaacactgcaagaagaagggaaagcaaacaacgtcgcacaagacgac 25087055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 442 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 22422034 - 22421768
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||  |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  22422034 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattatgtcattcaataccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatc 22421935  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    ||||||||| || |||||   |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22421934 caagttaattgcatataatagcatagtgtctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata------tctccggatctgtaacgttgacgccca 22421841  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  22421840 aatcattgattgaataatcgatctttcaatacgaatcaaatgaacaccgcaagaagatgggaaatcaaacaac 22421768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 482 - 728
Target Start/End: Original strand, 40659747 - 40659995
Alignment:
Q  482 tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaata 581  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  40659747 tacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatggctacagaaata 40659846  T
Q  582 tatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaa 679  Q
     || || ||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  || |||    
T  40659847 aattatgaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctccaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcagtaagaatcaa 40659946  T
Q  680 ctgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     ||| || || |  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  40659947 atgagcatcggacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 40659995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 507 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 32913481 - 32913259
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaa 606  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32913481 gtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgtaa 32913382  T
Q  607 tacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaa 704  Q
    || |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||  ||||||||| || |||||||||||    
T  32913381 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaagacggaaaa 32913283  T
Q  705 tcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||| || | |||||||||||    
T  32913282 tcaaacagcgccgcacaagacgac 32913259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 444 - 669
Target Start/End: Original strand, 40625834 - 40626061
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40625834 aaaaacaaaatgatattcatccattcaaatcgagagattacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcataacattca 40625933  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| |||||  | |||||  ||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||| | |  ||||| |||||||||||||  |||    
T  40625934 agttaatagcatataaaaagataatgcctacaaaaacataacataaaattaaagtgaccggaatatccatggccgccggatctgcaacgttgacgatcaa 40626033  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaa 669  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40626034 atctttgattgaataatcgatctttcaa 40626061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 30420973 - 30420696
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30420973 aaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatcca 30420874  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacata---atttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||| ||||||| ||||   ||| |  | | |||            ||||||||| |||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  30420873 agttaatagcatataacggcatatccattgcctccggaat------------taaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcc 30420786  T
Q  640 caaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30420785 caaatctttgattgaacaatctatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 30420696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 482 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 27477414 - 27477163
Alignment:
Q  482 tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaata 581  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  | |||||  |||||  ||||| |||||    
T  27477414 tacatcattcaacattgttaaaaatgtaaatgatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagtatttaacggtataatgcctacaaaaata 27477315  T
Q  582 tatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaa 679  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||    
T  27477314 tatgataaaattaaagtgaccgaaatatctatggtcttccgatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcaa 27477216  T
Q  680 ctgaacaccgc-aacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||| |||||    
T  27477215 atgaacaccgcaaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaagactacaaa 27477163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 442 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 3725486 - 3725212
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| | | ||||    
T  3725486 acaaaaacaaaatgatattcatttattcaaatcgagagattacatcatttaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatctgtaaacaaacttacatcatc 3725387  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||  ||||||| ||||||| | ||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||| | || |||| | |||||||||||| |    
T  3725386 caaactaatagcatataacggcgtaatgcctacaaaaatatatgaaaaaattaaagtgatcggaatatctatggcctctggatctacaacgttgacgctc 3725287  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||  ||||||| ||  ||||||  |||||||||||||    
T  3725286 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaacgaacaccacacaaagacgagaaatcaaacaacg 3725212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 442 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 34600520 - 34600354
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   | ||||    
T  34600520 acaaaaacaaaatgatatccattcattcaaatcgagagattacatcgttcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcgcatcatc 34600421  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata 608  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34600420 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 34600354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 508 - 728
Target Start/End: Original strand, 32678952 - 32679173
Alignment:
Q  508 taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaat 607  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32678952 taaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatc-aagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaat 32679050  T
Q  608 acccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaat 705  Q
    | | || | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||| ||||| ||||| | |||     
T  32679051 atctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataagaataaaatgaacatcgcaagaagacaggaaag 32679150  T
Q  706 caaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||| | |||||||||||    
T  32679151 caaacaacgccacacaagacgac 32679173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 548 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 6173832 - 6173653
Alignment:
Q  548 aatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatct 646  Q
    |||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6173832 aatagcatataactgcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatct 6173733  T
Q  647 ttgattgaaa-atcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || || ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6173732 ttgattgaatgatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagatggaaaatcaaacaacgccacacaagac 6173653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 442 - 712
Target Start/End: Original strand, 9374338 - 9374603
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||| | | ||||||    
T  9374338 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgacagagtacatcattcaacacggctaaaaacgtaaatgatgaatatgcgaaaaaattcacaacatc 9374437  T
Q  542 caagttaa----tagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||| ||||    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||  ||          ||| |||    
T  9374438 caaattaatgagtagcatataacgacataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgtctggaatactcatgtccccg----------gtttacg 9374527  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
     | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9374528 tcaaaatctttgattgaataatcgttctttcaaaatgaatcaaatgaacaccacaacaagacggaaaaacaaacaa 9374603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 45128496 - 45128222
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||            |||||| | ||||||||    
T  45128496 aaaaataaaatgatattcattaattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacataaagga------------caaactcacaacatcca 45128409  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt-cggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  45128408 aattaatagcatataacaacataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgtccaa 45128309  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| |  ||  || |||||||||||| |||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  45128308 atctttgattgaataattgatatttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagatgagaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 45128222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 728
Target Start/End: Original strand, 3269022 - 3269174
Alignment:
Q  578 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaa 675  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3269022 aatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 3269121  T
Q  676 acaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  3269122 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaaaacgac 3269174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 728
Target Start/End: Original strand, 3269581 - 3269733
Alignment:
Q  578 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaa 675  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3269581 aatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 3269680  T
Q  676 acaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  3269681 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaaaacgac 3269733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 728
Target Start/End: Original strand, 3270140 - 3270292
Alignment:
Q  578 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaa 675  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3270140 aatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 3270239  T
Q  676 acaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  3270240 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaaaacgac 3270292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 538 - 655
Target Start/End: Original strand, 33229011 - 33229129
Alignment:
Q  538 catccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgac 636  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | || ||||| ||||||||||||    
T  33229011 catccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgac 33229110  T
Q  637 gcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33229111 gcccaaatctttgattgaa 33229129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 442 - 568
Target Start/End: Original strand, 31580430 - 31580556
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  31580430 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattgtacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 31580529  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31580530 caagttaatagcatataacggcataat 31580556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 450 - 651
Target Start/End: Original strand, 41712572 - 41712774
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaa 549  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || | | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||  |||||||    
T  41712572 aaaatgatattcattcatttaaattgaaaaattacatcattcaacatcactaaaaatgtaaatgataaatctgcgaacaaactcacaatatataagttaa 41712671  T
Q  550 tagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatcttt 648  Q
    || | ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| | || || || |||||||||||||| |||||||||    
T  41712672 taacatataactgcataatacctacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccggaatattcatggcctccgtatctgcaacgttgacgctcaaatcttt 41712771  T
Q  649 gat 651  Q
    |||    
T  41712772 gat 41712774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 31788763 - 31788548
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  31788763 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 31788664  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    ||||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||| ||||||  |||| || | ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||     
T  31788663 atccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgttaaaacctaagtcactgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgt 31788565  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  31788564 ccaaatcattgcttgaa 31788548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 4779060 - 4778845
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  4779060 acaaaaacaaaactatattcattcattcaaatcgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 4778961  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | |||| |||||| | || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  4778960 acccaaattaataacatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgt 4778862  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  4778861 ccaaatcattggttgaa 4778845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 7646785 - 7646581
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    | || ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  7646785 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgataaagtacatcaaatataaagatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaac 7646686  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||  | ||||| |||||||||||||     
T  7646685 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgt 7646587  T
Q  639 ccaaat 644  Q
    ||||||    
T  7646586 ccaaat 7646581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 626 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 34599108 - 34599006
Alignment:
Q  626 gcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  34599108 gcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 34599009  T
Q  725 cga 727  Q
    |||    
T  34599008 cga 34599006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6174121 - 6174013
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6174121 acaaaaacaaaatt-tattcatttattcaaatcgagagattatatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 6174023  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  6174022 caagttaata 6174013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 655
Target Start/End: Original strand, 29173512 - 29173728
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||  || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  29173512 aaaaacaaaatgatatttattcattcaaattgattgattacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacac 29173611  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctacaga-aat-atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||| | || ||| ||| |||   |||| | ||| |||||||||||   |||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |    
T  29173612 caaagttaataacatacaacaacaaaatgcatacaaataataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacac 29173711  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||  |||||||||    
T  29173712 ccaaataattgattgaa 29173728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 30923250 - 30923359
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||  ||||||||||||||||||| | |||||     
T  30923250 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcatttaacattgctaaaatcgtaaataatgaatctgcgaacaaacttacaacatt 30923349  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  30923350 caagttaata 30923359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 445 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7558755 - 7558647
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  7558755 aaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcatttaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcatagcatccaa 7558656  T
Q  545 gttaatagc 553  Q
    |||||||||    
T  7558655 gttaatagc 7558647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 645
Target Start/End: Original strand, 36942915 - 36943119
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| | | |    
T  36942915 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcaatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacatactcacagc 36943014  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | |||  |||||||| ||  ||| ||||||  ||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36943015 acccagattaatagcata-cacggcataatgcctaca-aataatatgataaaattcaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgc 36943112  T
Q  639 ccaaatc 645  Q
    |||||||    
T  36943113 ccaaatc 36943119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 445 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 1421979 - 1421768
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  || | |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| |    
T  1421979 aaaaaaaaatgatattcattcattcaaatcgataaagtacatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagg-tgaatctgcaaacaaactcacaacacc 1421881  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||    
T  1421880 caagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtcca 1421782  T
Q  642 aatctttgattgaa 655  Q
    |||| ||| |||||    
T  1421781 aatcattgcttgaa 1421768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 18763775 - 18763571
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaac-atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  18763775 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcaatagagtacatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 18763676  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| ||| | ||||  | ||||| || |||||||||||    
T  18763675 acccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgtaacgttgacgc 18763577  T
Q  639 ccaaat 644  Q
    ||||||    
T  18763576 ccaaat 18763571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24461746 - 24461625
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |    
T  24461746 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacataat-caacatcgctaaaaacgtaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacacc 24461648  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgaca 564  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  24461647 aaagttaatagcatataacgaca 24461625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 25508861 - 25509076
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     ||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||| | | |    
T  25508861 acaaaaacaaaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcatatacaaacatcggtaaaaacataaacgatgaatctgcgaacaaactcacatc 25508960  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||| | || |||| || |||  ||||| ||  ||| |||||||   |||| | || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  25508961 acccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctaca-aataatacgataaaatctaagtcatcgaaatacccatgtttccggatttgcaacgttgacgc 25509059  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  25509060 ccagatcattgattgaa 25509076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 568
Target Start/End: Original strand, 39641081 - 39641207
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| | | ||||    
T  39641081 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaactcgatgaagtacatcattcaacaatactaaaaacgtaaagaatgaatttgcgaacaaactcacatcatc 39641180  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  39641181 caagttaatcgcatataacgacataat 39641207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 645
Target Start/End: Original strand, 4903938 - 4904143
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    | || || |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  4903938 acaaaaacaaaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcaaatataaatattgctaaaaacgtaaaggctgaatctacgaacaaactcacaac 4904037  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||   |||| |||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||||     
T  4904038 atccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctaca-aataatatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatg-cttctggatctgcaacgttgaca 4904135  T
Q  638 cccaaatc 645  Q
    ||||||||    
T  4904136 cccaaatc 4904143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 38445473 - 38445258
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  38445473 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacattgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagc 38445374  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | | ||||||||| | || || | || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||| |  | ||||| |||||||||||||     
T  38445373 accaaagttaataacatacaatggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccacgcttccggatctgcaacgttgacgt 38445275  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  38445274 ccaaatcattggttgaa 38445258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 581
Target Start/End: Original strand, 3268610 - 3268749
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||| |||| || |||||||| |||||||| | | ||||    
T  3268610 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattatatcattcaacaccgctaaaaatataaatgacgaatctgcaaacaaactcacagcatc 3268709  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaata 581  Q
    |||||||||| | ||||| | ||||||  ||||| |||||    
T  3268710 caagttaataccatataaaggcataatgcctacaaaaata 3268749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 21132138 - 21132048
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21132138 acaaaatcaaaatgatattcattcattcaaatcgaaaaattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaagggatgaatctgcgaacaaact 21132048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 619 - 728
Target Start/End: Original strand, 26025363 - 26025473
Alignment:
Q  619 cggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtct 717  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |     
T  26025363 cggatctgcaacattgacacccaaatttttgattgaataaccgatctttcaagatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgaaaaatcaaacaacgccg 26025462  T
Q  718 cacaagacgac 728  Q
    |||||||||||    
T  26025463 cacaagacgac 26025473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 28037389 - 28037283
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  28037389 aaaaataaaatgatattcattcattcagatcgatatagtacatcatttaacatcgttaaaaatgtaaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatataca 28037290  T
Q  544 agttaat 550  Q
    |||||||    
T  28037289 agttaat 28037283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Original strand, 33228763 - 33228853
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33228763 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattatatcattcaacaccgctaaaaacgtaacggatgaatctgcgaacaaact 33228853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 33585528 - 33585743
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  || | ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  33585528 acaaaaacaaaacgatattctttcattcaaatcaatagagtacatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaac 33585627  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||   |||| ||  ||||||||||||| || | |||| | ||| ||||  | ||||| |||||||||||||     
T  33585628 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcataca-aataatatgataaaacttaaatcaccgaattactcatgcttccggatctgcaacgttgacgt 33585726  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  33585727 ccaaatcattgcttgaa 33585743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 37876399 - 37876614
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||   | |    
T  37876399 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaatctgcgaacaaactcgcatc 37876498  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| ||  ||| || |||  ||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  37876499 acccaagttaatagcatacgacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaatttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgatgc 37876597  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||| || ||| |||||    
T  37876598 ccaagtcattggttgaa 37876614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 37994590 - 37994470
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  37994590 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaacatccctaaaatcgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaaca 37994491  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataac 560  Q
     ||||||||||||| ||||||    
T  37994490 cccaagttaatagcatataac 37994470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 562
Target Start/End: Original strand, 5427662 - 5427785
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  5427662 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 5427761  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacga 562  Q
    | ||||||||||||| || |||||    
T  5427762 acccaagttaatagcatacaacga 5427785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 712
Target Start/End: Original strand, 39641769 - 39641905
Alignment:
Q  577 aaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaa 675  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||||| | || || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| || ||    
T  39641769 aaatatatgataaaataaaagtgactgaaatactcgtgcctccggatctgcaacgttgatgcccaaattttggattgaataattgatctttcaatatgaa 39641868  T
Q  676 acaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
      || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39641869 ttaaatgaataccgcaacaagacgggaaatcaaacaa 39641905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1415864 - 1415750
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || | |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| | |||    
T  1415864 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatacaaacatcgctaaaaacgttaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaac 1415765  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||||||||||    
T  1415764 acccaagttaatagc 1415750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 444 - 655
Target Start/End: Original strand, 17248943 - 17249155
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||   |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | || |    
T  17248943 aaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgataaaatacatcagaatcaagatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacc 17249042  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgata-aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| || |||| || ||| |||||| ||  |||||||| || ||||| | ||| |||||| | ||  |  |||| ||||||||||||| ||    
T  17249043 caagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaca-aataatatgatataatctaaa-tcaccagaatactcttgcttatggatctgcaacgttgacgtcc 17249140  T
Q  641 aaatctttgattgaa 655  Q
    ||||| |||||||||    
T  17249141 aaatcattgattgaa 17249155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 547
Target Start/End: Original strand, 32197533 - 32197632
Alignment:
Q  448 acaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagtt 547  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  32197533 acaaaatgatatttaatcattcaaattgatataatacatcattcaacaccgctaaaaatatataggataaatatgcgaacaaactcacaacatccaagtt 32197632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 32448410 - 32448523
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||  | |||| ||| ||| |||| |||| |||||||||  ||||||||| | ||||    
T  32448410 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaagatcactaaaaatataaatgatgaatctatgaacaaactcacaaca 32448509  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||||    
T  32448510 tccaagttaatagc 32448523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4100635 - 4100473
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacat-cattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||   |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||    
T  4100635 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacataca---aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaaca-cc 4100540  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacc 610  Q
    ||||||||| | || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  4100539 aagttaatatcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacc 4100473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 36692181 - 36691966
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| | |||    
T  36692181 acaaaaacaaaacgatatacattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaac 36692082  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||| ||| | ||||  || |||| ||||| |||||||     
T  36692081 aaccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgctttaggatctgcaatgttgacgt 36691983  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  36691982 ccaaatcattgcttgaa 36691966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 549
Target Start/End: Original strand, 39284341 - 39284446
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||| || |||| ||||  |||||| |||||||||||| |||| || ||    
T  39284341 aaaaacaaaatggtatttattcattcaaattgatatattacatcattcaatatcgttaaaaatataaataatgaatttgcgaacaaactcataatattca 39284440  T
Q  544 agttaa 549  Q
    ||||||    
T  39284441 agttaa 39284446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 552
Target Start/End: Original strand, 11985028 - 11985139
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| | | |||||    
T  11985028 aaaaaaaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaattcacaacat 11985127  T
Q  541 ccaagttaatag 552  Q
    ||||||||||||    
T  11985128 ccaagttaatag 11985139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 655
Target Start/End: Original strand, 19062199 - 19062360
Alignment:
Q  498 gctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacaga---aata-tatgataaaact 593  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| |   |||| ||||||||||||    
T  19062199 gctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaattaaataatatgataaaact 19062298  T
Q  594 aaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
     |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19062299 taagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgaaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 19062360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 17994572 - 17994738
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatag----cgtataacgacataatttctacagaaatatatgat 587  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    | || || | || |||  ||||| ||  |||||||    
T  17994572 aacatcgctacaaacgtaacggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacatacaatggcaaaatgcctaca-aataatatgat 17994670  T
Q  588 aaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||| | |||| |||| |||||| |||  | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17994671 aaaatttaagtcaccgaaatacctatggttccggatgtgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 17994738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 33924012 - 33923797
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || | || ||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| | | |    
T  33924012 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatacaaaaatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacagc 33923913  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| ||   || || ||  ||||||||||||  |||| |||| ||| | ||||  | ||||| | ||||||||||||    
T  33923912 acccaagttaatagcataaaacgacaaaacgcctgca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgc 33923814  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  33923813 ccaaatcattggttgaa 33923797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 654
Target Start/End: Original strand, 4041387 - 4041601
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  || | || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  4041387 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgatagtgtacatcagatacaaaaatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 4041486  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | | ||||||||||| |  |||  || |||  ||||| ||  |||||||||| |  |||| | || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||     
T  4041487 acctaagttaatagcatgcaacagcaaaatggctaca-aataatatgataaagcctaagttatcgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgt 4041585  T
Q  639 ccaaatctttgattga 654  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  4041586 ccaaatcattggttga 4041601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 577 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 8308340 - 8308189
Alignment:
Q  577 aaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaa 675  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||||   |||  | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  8308340 aaatatatgataaagttaaagtgattggaatagttatgcatccggatctgcaacgttgacgtccaattctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 8308241  T
Q  676 acaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     ||| |||| || ||||||| || | |||||||||||||   |||||||||||    
T  8308240 tcaaatgaaaactgcaacaatacag-aaatcaaacaacgctgcacaagacgac 8308189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 8809580 - 8809451
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc----attcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     || ||| |||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  8809580 aaaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatataagatacaaacatcactaaaaacgtaaaagatggatctgcgaacaaactcacaacatccaa 8809481  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctac 574  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  8809480 gttaatagcatacaacgacaaaatgtctac 8809451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 36324160 - 36324052
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||  ||||||||| | | ||||||    
T  36324160 acaaaaacaaaacgatatacatttattcaaattgatatattacatcattcaacatcgttaaaaacgtaacggatgaatacgcgaacaaattcacaacatc 36324061  T
Q  542 caagttaat 550  Q
    |||||||||    
T  36324060 caagttaat 36324052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 655
Target Start/End: Original strand, 10237060 - 10237224
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-a 588  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| |    
T  10237060 tcaatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgatga 10237158  T
Q  589 aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||| | | | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10237159 aatctaaa-tcatcagaatacccatg-cttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 10237224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 565
Target Start/End: Original strand, 12236833 - 12236956
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | |  |||    
T  12236833 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaattgagagattatatcattcagcactgctaaaaatgtaaagaatgaatctgcgaataaactcagagtatc 12236932  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacat 565  Q
    ||| |||||||  |||||||||||    
T  12236933 caaattaatagaatataacgacat 12236956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 549
Target Start/End: Original strand, 31193129 - 31193239
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||    
T  31193129 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaac 31193228  T
Q  539 atccaagttaa 549  Q
    | |||| ||||    
T  31193229 acccaatttaa 31193239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 645
Target Start/End: Original strand, 9169127 - 9169256
Alignment:
Q  515 tgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg 614  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| || |||| || |||  ||||| | | ||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  9169127 tgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataagacttaagtcaccgaaatacccatg 9169225  T
Q  615 tcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatc 645  Q
      | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9169226 cttccggatctgcaacgttgacgtccaaatc 9169256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 14955785 - 14955621
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataa 589  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| | || || || | ||| |||||| ||  |||||||||    
T  14955785 tcaatatcgctaaaaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaataacatacaatgataaaatgtctaca-aataatatgataa 14955687  T
Q  590 aa-ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||| | | | |||||| ||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14955686 aatctaaa-tcatcagaatacacatgtttctggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaa 14955621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 38293669 - 38293567
Alignment:
Q  627 caacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||| || ||||| ||| ||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  38293669 caacgttgacgctcgaatcattgattgaacaatcaatcttttaatataaaccaaatgaacattgcaataagacgggatatcaaacaacgtcacacaagac 38293570  T
Q  726 gac 728  Q
    |||    
T  38293569 gac 38293567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 8308398 - 8308337
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaat 506  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  8308398 aaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacatcgttcaacatcgctaaaaat 8308337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Original strand, 12677246 - 12677358
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| |||| |     
T  12677246 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgacagattacatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaataaactcataatac 12677345  T
Q  541 ccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||    
T  12677346 ccaagttaatagc 12677358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Original strand, 13718948 - 13719021
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaa 518  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  13718948 aaaataaaatgatattcattcattcaaaatgatagagtgcatcattcaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaa 13719021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 18114035 - 18113890
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaatc-gatctttcaaaataaaacaa 679  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||| | || |||| |||| ||||||||||||  ||||||| || |||||| | | ||| |||||| || || ||     
T  18114035 atatgataaaattaaattgatcgaaatatcgatatctttggatctgcaacgttgacatccaaatcatttattgaataactgatatttcaatatgaaccat 18113936  T
Q  680 ctgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18113935 attaacaccgcaataagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagac 18113890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 35220634 - 35220510
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaac-atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | | ||    
T  35220634 caaaaacaaaacgacattcattcattcaaattgatagagtacatcagatacaaagatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagca 35220535  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
     ||||||||||||| || |||||||    
T  35220534 cccaagttaatagcatacaacgaca 35220510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 655
Target Start/End: Original strand, 27097268 - 27097414
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaa 606  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||  || |||| || |||| ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||    
T  27097268 gtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagtatacaacggcaaaattcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaa 27097366  T
Q  607 tacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || |||||  | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  27097367 ta-ccatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaa 27097414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 551
Target Start/End: Original strand, 31128642 - 31128690
Alignment:
Q  503 aaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31128642 aaatgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaata 31128690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 641 - 728
Target Start/End: Original strand, 31580564 - 31580652
Alignment:
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  31580564 aaatctttgatttaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaatacgggaaataaaacaacgccgcacaagacgac 31580652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 509 - 568
Target Start/End: Original strand, 5071108 - 5071167
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  5071108 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcataat 5071167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 550
Target Start/End: Original strand, 30399824 - 30399933
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  30399824 aaaaataaaatgatattcatttattcaaattgatcgagtacatcagatataaatatcgcaaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacac 30399923  T
Q  541 ccaagttaat 550  Q
    | ||||||||    
T  30399924 ctaagttaat 30399933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 586 - 712
Target Start/End: Original strand, 32197715 - 32197842
Alignment:
Q  586 ataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaa 684  Q
    |||||| || ||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || | || || ||| || || || ||| ||||    
T  32197715 ataaaattagagtgaccagaataaccatgcatccggatctgcaacattgacgcccaaatatttgattaaatagtcaatattttaatatgaatcaaatgaa 32197814  T
Q  685 caccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  32197815 caccgcaacaagacaggaaatcaaacaa 32197842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14416473 - 14416427
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  14416473 acaaaaacaaaatgatatttattcattcaaattgatagaatacatca 14416427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 655
Target Start/End: Original strand, 29279417 - 29279578
Alignment:
Q  493 acatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaac 592  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| | |||| |  |||||||||| || |||| || |||  ||||| | | |||||||||||     
T  29279417 acatcgctaaaaacgtaaatggtgaatatgcgaacaaactcacaacaccatagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaat 29279515  T
Q  593 taaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    | |||| |||| || || ||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  29279516 ttaagtcaccgaaaaactcatgtttccggatctgcaacattgacgcacaaatcattgattgaa 29279578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 10929971 - 10929757
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||| || ||||   |||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||| |||||||| | | ||    
T  10929971 acaaaaacaaaaagatattcattcgttcaaattgatagaatatatcaaaatcaagatcgctaaaaacataaagggtgaatatgcaaacaaactcacagca 10929872  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||| |||  ||| | ||  ||||||||||| | || | ||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||| | |    
T  10929871 tccaagttaatagcattcaacaacaaaatgcctata-aataatatgataaaatttaaatcaccagaatacacatgcttccggatctgcaacgttgatgtc 10929773  T
Q  640 caaatctttgattgaa 655  Q
    |||||| |||||||||    
T  10929772 caaatcattgattgaa 10929757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 553
Target Start/End: Original strand, 11561417 - 11561461
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11561417 aaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacatccatgttaatagc 11561461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22597526 - 22597482
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22597526 aaaggatgaatctgtgaacaaactcataacatccatgttaatagc 22597482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 23903641 - 23903557
Alignment:
Q  448 acaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||||||| |  || || ||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  23903641 acaaaatgatactcgtttattcaaattgatagattacatcattcaagatcgttaaaaatggaaaggatgagtttgcgaacaaact 23903557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 506
Target Start/End: Original strand, 26025271 - 26025335
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaat 506  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  26025271 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgagagattatatcattcaacattgctaaaaat 26025335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 11189418 - 11189529
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||   ||| ||||||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||| ||| || || |||||| ||| ||||    
T  11189418 acaaaaacaaaacaatattcatttattttaattgatagagtacatcgtttaacatcgtaaaaaaagtaaaggataaatatgtgagcaaactcatatcatc 11189517  T
Q  542 caagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||    
T  11189518 caagttaatagc 11189529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 564
Target Start/End: Original strand, 11798271 - 11798322
Alignment:
Q  513 gatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  11798271 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgaca 11798322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20036663 - 20036628
Alignment:
Q  602 cggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20036663 cggaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgacg 20036628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21612541 - 21612409
Alignment:
Q  446 aaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacat--cattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaac--aaactaataacatc 541  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||   | |||||||||||| ||| ||||||| | |||||  ||||  ||||| |||  | |    
T  21612541 aaacaaaacgatatttattcattcaaattgatagaatacattagaatcaacatcgctaaaaacgtaaagggtaaatctatgaacaaaaactcatatgacc 21612442  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctaca 575  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  21612441 caagttaatagcatacaacgaca-aatttctaca 21612409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 694 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 10548276 - 10548238
Alignment:
Q  694 aagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaat 732  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10548276 aagacgaaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacaaat 10548238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 682 - 728
Target Start/End: Original strand, 12647970 - 12648016
Alignment:
Q  682 gaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  12647970 gaacaccgcaacaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 12648016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 603 - 637
Target Start/End: Original strand, 29812449 - 29812483
Alignment:
Q  603 ggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29812449 ggaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgacg 29812483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 617 - 655
Target Start/End: Original strand, 30400005 - 30400043
Alignment:
Q  617 ttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30400005 ttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 30400043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11931261 - 11931204
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11931261 tcgctaaaaataaaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 11931204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 637
Target Start/End: Original strand, 11937695 - 11937728
Alignment:
Q  604 gaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11937695 gaatactcatgtcttcggatatgcaacgttgacg 11937728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 564
Target Start/End: Original strand, 12554042 - 12554099
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | || |||||||    
T  12554042 gtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatatcatacaacgaca 12554099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 32913534 - 32913489
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc 487  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  32913534 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatc 32913489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 728
Target Start/End: Original strand, 34128735 - 34128780
Alignment:
Q  683 aacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  34128735 aacaccacaacaagacgcacaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 34128780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 512 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44441752 - 44441711
Alignment:
Q  512 ggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  44441752 ggatgaatctgcgaacaaactcatagcatccatgttaatagc 44441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 103)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 442 - 768
Target Start/End: Original strand, 9528652 - 9528975
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  9528652 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatt 9528751  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || | ||| ||||||||||||| ||    
T  9528752 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccagatctgcaacgttgacggcc 9528851  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||     |||    
T  9528852 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----caa 9528946  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||    
T  9528947 caaaccatcacacttagatgatgaaatca 9528975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 25274197 - 25273909
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25274197 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 25274098  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  25274097 taagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 25273998  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  25273997 aaatttttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 25273909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 53616425 - 53616713
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  53616425 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 53616524  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  53616525 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatataatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 53616624  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  53616625 aaatctttgattgaacaattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 53616713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 4644172 - 4643884
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  4644172 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatc 4644073  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||  || ||||| |||||| |||||||||    
T  4644072 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaataatatatgataaaattaaattgaccggaatattcatgacctccggatctgcaactttgacgccc 4643973  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  4643972 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 4643884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 38706485 - 38706773
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  38706485 acaaaaacaaaatcatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 38706584  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  38706585 caagttaatagcatataacgacataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggcctccggatttgcaacgttgatgccc 38706684  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||  ||||||| |||| ||||||||   |||||||||||    
T  38706685 aaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaattaacaccgcacgaagacgggaaatgaaacaacgctgcacaagacgac 38706773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 442 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 44947726 - 44947436
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||  |||||||| | ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44947726 acaaaaatgaaatgataatcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 44947627  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  44947626 caagttaataacatataacggcacaatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggccttcggatctgcaacgttgacgccc 44947527  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaa 730  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  44947526 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatattaatcaaatgaacaccacacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacaacaa 44947436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 10389529 - 10389817
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  |||||||||| | | ||||    
T  10389529 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacaccattcaacaccgctaaaaacataaaggatgaatccacgaacaaactcacagcatc 10389628  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||| |    
T  10389629 caagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctc 10389728  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10389729 aaatcgttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 10389817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 34024213 - 34024500
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34024213 acaaaagcaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacaccattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 34024312  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||| |    
T  34024313 caagttaatagcatataacaacataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctc 34024412  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34024413 aaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaa-agaacaccgcaagaagatggaaaatcaaacaacgtcatacaagacgac 34024500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 445 - 771
Target Start/End: Original strand, 46990909 - 46991231
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  46990909 aaaaaaaaatgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcattcaacgccactaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaa 46991008  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
    ||||| ||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||   ||| |||||||||||| |||||||    
T  46991009 gttaacagcatagaacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcgggatacatatgtctctagatctgcaacgttgacacccaaat 46991108  T
Q  645 ctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacaca 743  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||     |||||||    
T  46991109 ctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagatgggaaatcaaacaacgccacagaagacgacaaa-----caacaca 46991203  T
Q  744 ccatcacacttagatgtcgaaatcatga 771  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  46991204 ccaccacactcagatgacaaaatcatga 46991231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 713
Target Start/End: Original strand, 10359324 - 10359595
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| | | ||||    
T  10359324 acaaaaacaaaatgatattcattcatccaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaag-atgaatttgcgaacaaactcacatcatc 10359422  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||   ||| ||||||||||| |||||    
T  10359423 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaaataaagtgactggaatatccatgcctcaagatctgcaacgttgatgccca 10359522  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  10359523 aatcttttattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccacaagaagacgggaaatcaaacaac 10359595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 20569571 - 20569296
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  20569571 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatc 20569472  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaa--atatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||| |    
T  20569471 caagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctttggatttgcaacgttgacac 20569372  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20569371 caaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaac 20569296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 51318299 - 51318011
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  51318299 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacactgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatc 51318200  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  51318199 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgccc 51318100  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||  ||||||||| |||| ||||||||| || || ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||||||||||    
T  51318099 aaattgttgattgaacaatcaatctttcaatatgaatcaaattaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaatgccgcacaagacgac 51318011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 442 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 9284225 - 9283934
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  9284225 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctacgaacaaactcacaacatc 9284126  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    || | ||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||  || || || | ||| ||||||||||||||||    
T  9284125 catgataatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactgaaatattcattgcctccagatctgcaacgttgacgccc 9284026  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9284025 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaa 9283934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 43153793 - 43154077
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||    
T  43153793 acaaaaacaaa-tgatatttattcattcaaatcgagagattgcatcattcaatatcgctaaaaacgtaaaggatgaatc---gaacaaactcacaacatc 43153888  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| || ||||||||||| |    
T  43153889 caagttaacagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgtaacgttgacgctc 43153988  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  43153989 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgac 43154077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 442 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 1532222 - 1531933
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  1532222 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacgtcattcaacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatc 1532123  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  1532122 caagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgtccagaatatccatgacctccggttctgcaacgttgacgccc 1532023  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgaca 729  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||| || || ||| | |||||||||  ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1532022 aaatttttgattgaataattgatctttcaacatgaatcaaataaacaccgcacgaagacaggaaatcaaacaacgccacacaagacgaca 1531933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 461 - 728
Target Start/End: Original strand, 35964770 - 35965038
Alignment:
Q  461 tattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataac 560  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| |||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  35964770 tattcattcaaatcgatagaggacaccattcaacaccgctaaaaacgtaaagaatgagtttgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataac 35964869  T
Q  561 gacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatc 659  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35964870 aacataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactgaaatactcatgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatc 35964969  T
Q  660 gatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||| || || || ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  35964970 gatcttttaatatgaatcaaatgaacaccacaataagacgggaaatcaaacaacgccacacaggacgac 35965038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 43444706 - 43444419
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  43444706 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgttaagaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatt 43444607  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43444606 caaattaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatattcattgtc-tcggatctgcaacgttgacgccc 43444508  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43444507 atatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgtagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 43444419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 47417972 - 47417688
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  47417972 acaaaaacaaaatgatattcattca----aatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatt 47417877  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  47417876 caagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaatggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 47417777  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  47417776 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 47417688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 442 - 669
Target Start/End: Original strand, 2115363 - 2115592
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  2115363 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatc 2115462  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  2115463 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 2115562  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaa 669  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2115563 aaatttttgattgaacaatcgatctttcaa 2115592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 769
Target Start/End: Original strand, 18138705 - 18139012
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcg 554  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  18138705 gatattcattcattcaaatcaataaagtacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggag---tctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagca 18138801  T
Q  555 tataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18138802 tataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgcccccagatctgcaacgttgacgcccaaatatgtgattga 18138901  T
Q  655 a-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacacaccatcacact 753  Q
    | |||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||     |||||||||| ||||||    
T  18138902 ataatcgatctttcaatagaaatcaaatgaacactgcaacaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----caacacaccaccacact 18138996  T
Q  754 tagatgtcgaaatcat 769  Q
     || || |||||||||    
T  18138997 caggtgacgaaatcat 18139012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 769
Target Start/End: Original strand, 49125918 - 49126225
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcg 554  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  49125918 gatattcattcattcaaatcaataaagtacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggag---tctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagca 49126014  T
Q  555 tataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49126015 tataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgcccccagatctgcaacgttgacgcccaaatatgtgattga 49126114  T
Q  655 a-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacacaccatcacact 753  Q
    | |||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||     |||||||||| ||||||    
T  49126115 ataatcgatctttcaatagaaatcaaatgaacactgcaacaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----caacacaccaccacact 49126209  T
Q  754 tagatgtcgaaatcat 769  Q
     || || |||||||||    
T  49126210 caggtgacgaaatcat 49126225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 445 - 727
Target Start/End: Original strand, 50766290 - 50766574
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||| | | ||| |||    
T  50766290 aaaacaaaatgatattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtagatgatgaatctacgaacaaactcacagcattcaa 50766389  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  50766390 gttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaa 50766489  T
Q  644 tctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  50766490 tctttgattgaacaatagatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacga 50766574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 6973122 - 6972836
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||  |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  6973122 aaaaacaaaatgatattcattcatttaaattgagaggttacatcattcaacaccgttaaaaatgtgaaggatgaatctgtgaacaaactcatagcatcca 6973023  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  6973022 agttaatagcatataacggcataatacctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaa 6972923  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || ||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6972922 acctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacactgcaagaagacaggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 6972836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 444 - 669
Target Start/End: Original strand, 45227818 - 45228045
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  45227818 aaaaaaaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatcca 45227917  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| || || ||||||||||||||||||    
T  45227918 agttaataacatataaccgcataatgcccacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggtctccgaatctgcaacgttgacgcccaa 45228017  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaa 669  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45228018 atctttgattgaataatcgatctttcaa 45228045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 482 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 49410497 - 49410249
Alignment:
Q  482 tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaata 581  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  49410497 tacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaata 49410398  T
Q  582 tatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaa 679  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||    
T  49410397 tatgataaaattaaagtgacaggaatattcacggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaa 49410298  T
Q  680 ctgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  49410297 atgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 49410249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 442 - 716
Target Start/End: Original strand, 3335939 - 3336207
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||     
T  3335939 acaaaaacaaaacaatattcattcattcaaatcaatagagtacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcaaaacatt 3336038  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||||  ||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||      |||||| ||||| ||||| | ||||| |||    
T  3336039 caagttattagcatataacggcgtaatgcctacaaatatatatgataaaattaaaatgatcgga------atgtctccggatctgcaatgctgacg-cca 3336131  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtc 716  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3336132 aatctttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagatggaaaatcaaacaacgtc 3336207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 442 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 12265775 - 12265494
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  12265775 acaaaaacaaactgatattcattcattcaaatcgataggttacatcattcaacatcgctaaaaacgtaatg-atgaatctgtgaacaaactcacaacatc 12265677  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt---------cggatatgcaacgt 632  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  12265676 aaagttaatagcatataacggcataatgcctaaaaaaatatatgataaaattaaagtgattggaatacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgt 12265577  T
Q  633 tgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||| |||| | |||  |||||||||||||    
T  12265576 tgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaagtgaacaccacaacgatacgagaaatcaaacaacg 12265494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 37188374 - 37188657
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||| | | ||||    
T  37188374 acaaaaacaaaatgatattcattca----aatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgcaaaagataaatctgcgaacacactcacagcatc 37188469  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  37188470 caagttaatagcatataatgacacaatgcctacaaaattatatgataaaattaaagtgacaggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 37188569  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || | ||||| |||||    
T  37188570 aaatctttgattgaataatcgatc-ttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaaaaaggcgggaaatcaaacagcgccgcacaaaacgac 37188657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 450 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 35261497 - 35261191
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaa 549  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  35261497 aaaatgatattcattcattcaaatcgat-gagtacatcattcaacacttctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaa 35261399  T
Q  550 tagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttg 649  Q
    |||| |||||   |||||| |||||| | |||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||| ||||||    
T  35261398 tagcatataagtgcataatgtctacaaacatatctgataaaattaaaatgaccgaaata-ccatgtctccggatctgcaacgttga-aaccaattctttg 35261301  T
Q  650 attgaa-----aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacacac 744  Q
    ||||||     | | ||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     ||||||||    
T  35261300 attgaatgaatagttgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcagaagacgacaaa-----caacacac 35261206  T
Q  745 catcacacttagatg 759  Q
    || ||||||||||||    
T  35261205 caccacacttagatg 35261191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 442 - 713
Target Start/End: Original strand, 52097691 - 52097964
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  52097691 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcaacagagtacatcattcgataccgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaataaactcacaacatc 52097790  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgac-gccc 640  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | | ||| |||||||||||| ||||    
T  52097791 caagttaataccatataacgtcataatgcctacaaagatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgcatccagatctgcaacgttgacggccc 52097890  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||  ||| || | || ||||||||||||    
T  52097891 aaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacactacaagaataggggaaatcaaacaac 52097964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 613
Target Start/End: Original strand, 9645299 - 9645470
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  9645299 acaaaaacaaaataatatttattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgcaaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 9645398  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat 613  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9645399 caagttaatagcatataacggcataatacctacaaaagtatatgataaaattaaagtgaccggaatatccat 9645470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 443 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 868476 - 868188
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  ||||||| ||| || |||||| |||| ||||| |||  |||||| |||||||| ||||||| | | || || |    
T  868476 caaaaataaaatgatattcattcgtttaaatcgagagattatatcatttaacaccgctaaaaacataaaggttgaatctgtgaacaaaatcacaatattc 868377  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttcta-cagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| | ||||||| ||  ||    
T  868376 aagttaatagcatataacggcataatgcctaccaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctacaacgttcacatcc 868277  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  868276 aaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 868188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 442 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 56199410 - 56199215
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  56199410 acaaaaataaaatggtattcattcattcaaatcgagagatcacatcattcaacactgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 56199311  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgac 636  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  56199310 caagttaatagcatgtaacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaatattcatggctttcggatctgcaacgttgac 56199215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 449 - 768
Target Start/End: Original strand, 32952540 - 32952846
Alignment:
Q  449 caaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagtta 548  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || | || || |||||   |||||||| |||||||||| ||||       ||||    
T  32952540 caaaatgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcatttaatattgataaaactgtaatatatgaatctacgaacaaactcataa-------gtta 32952632  T
Q  549 atagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatcttt 648  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  32952633 atagcatataacgacataatgcctacaaaaatataagataaaattaaattgaccggaatatccatgactccggacctgcaacattgacgctcaaatcttt 32952732  T
Q  649 gattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacacaccat 747  Q
    ||||||| |||||   |||||| || ||  || ||||||||| |||||||  ||||||||||||||  | || |||||||||||     ||||||||||     
T  32952733 gattgaataatcgtattttcaatatgaattaaatgaacaccgtaacaaga-tgaaaatcaaacaac-ccgcataagacgacaaa-----caacacaccaa 32952825  T
Q  748 cacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  32952826 cacacttagatgacgaaatca 32952846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 456 - 724
Target Start/End: Original strand, 27593619 - 27593886
Alignment:
Q  456 atatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgt 555  Q
    ||||||||  || |||||||||||| || ||| ||||||| || |  |||  ||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  27593619 atatttatatattcaaatcgatagattatatcgttcaacaccgttgaaaacttaaag-atgaatctatgaacaaactcacaacatccaagttaatagcat 27593717  T
Q  556 ataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || | ||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  27593718 ataacggcataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgacaggaatactcatggctccagatctgcaatgttgac-tccaaatcttttattgaa 27593816  T
Q  656 -aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
     |||||||||||||| || ||  || | |||| ||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  27593817 taatcgatctttcaatatgaattaaataaacatcgcaaaaagacgggaaatcaaaaaaagtcgcacaaga 27593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 32766831 - 32766616
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| | | |    
T  32766831 acaaaaacaaaacaatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgcaaagggtgaatctgagaacaaactcacagc 32766732  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||     
T  32766731 acccaagttaatagcatacaacgacataatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacattgacgt 32766633  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| |||||||||    
T  32766632 ccaaatcattgattgaa 32766616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 56040438 - 56040653
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| | | |    
T  56040438 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacagc 56040537  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||    
T  56040538 atccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatg-cttctggatctgcaacgttgccg 56040635  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  56040636 cccaaatcattggttgaa 56040653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 19853304 - 19853519
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  19853304 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 19853403  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaat-atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||  |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||  | ||||| |||||||||||||    
T  19853404 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcct--agaaataatatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacg 19853501  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
     ||||||| ||| |||||    
T  19853502 tccaaatcattggttgaa 19853519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 571 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 29965820 - 29965661
Alignment:
Q  571 ctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttca 668  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29965820 ctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattacctccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcaatctttca 29965721  T
Q  669 aaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  29965720 atatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 29965661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 442 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 49680844 - 49680623
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||       ||||| | |||||     
T  49680844 acaaaaataaaataatattcattcatttaaatcgagaggttacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggataaatc-------aaactcacaacatt 49680752  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |  ||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  49680751 caagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatatcattgcatccggatctgcaacgttgacgccca 49680652  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaa 669  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  49680651 aatatttgattgaacaatctatctttcaa 49680623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 455 - 644
Target Start/End: Original strand, 48257437 - 48257628
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  48257437 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaaaatccaagttaata 48257536  T
Q  552 gcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
    || || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  48257537 gcatacaacggcaaaatacctaca-aataatatgataaaactcaagtcaccgaaatacccatgttttcggatctgtaacgttgacgtccaaat 48257628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 469 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21090429 - 21090290
Alignment:
Q  469 caaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21090429 caaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacactatccaagttaataacatataacgacataat 21090330  T
Q  569 ttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata 608  Q
      ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21090329 gcctacaaaagtagatgataaaattaaagtgaccggaata 21090290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 584 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 14183974 - 14183843
Alignment:
Q  584 tgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaa-tcgatctttcaaaataaaacaact 681  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||| |    
T  14183974 tgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggttctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaatagtcgatctttcaatatgaatcaaat 14183875  T
Q  682 gaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14183874 gaacaccgcatgaagacagaaaatcaaacaac 14183843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 53811335 - 53811130
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||      ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |    
T  53811335 acaaaaacaaaacgatattcattcatttaaatcgatagagtacat------acatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaa-ctcacaacacc 53811243  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| || |||| || |||  ||||| | | ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| |||    
T  53811242 caagttaatagcatacaacgccaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtcca 53811144  T
Q  642 aatctttgattgaa 655  Q
    |||| ||| |||||    
T  53811143 aatcattggttgaa 53811130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 581 - 728
Target Start/End: Original strand, 8009275 - 8009424
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaaca 678  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||   |  || ||    
T  8009275 atatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggtcttcggatatacaacgttgacgcccaaatttttgattgaataatcaatctttctgtaagaatca 8009374  T
Q  679 actgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  8009375 aatgaacaccgtatgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 8009424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 577 - 728
Target Start/End: Original strand, 31381582 - 31381735
Alignment:
Q  577 aaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcgga-tatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataa 674  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| | || || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |    
T  31381582 aaatatatgataaaattaaagtgaccggagtattcatgacctccgaatttgcaatgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatga 31381681  T
Q  675 aacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  31381682 atcaaattaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 31381735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 2521096 - 2520891
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  2521096 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtccatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 2520997  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa-ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  2520996 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatacgataaaatctaaa-tcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacg 2520899  T
Q  638 cccaaatc 645  Q
     |||||||    
T  2520898 tccaaatc 2520891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13634432 - 13634217
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| | | | |    
T  13634432 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctccgaacaaattcacagc 13634333  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||| ||||||||  || | || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||     
T  13634332 acccaagttaatagcatacaacggcaaaataactaca-aataataagataaaacctaaatcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgt 13634234  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  13634233 ccaaatcgttgcttgaa 13634217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 609
Target Start/End: Original strand, 1931526 - 1931693
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||| ||  | || | ||||||| ||||||   ||||||||| | | | || |    
T  1931526 acaaaaataaaatgatattcattcgttcaaatcaatagagaacatcattcaccactgttaaagatgtaaaagatgaagaagcgaacaaattcacagcaac 1931625  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatac 609  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1931626 aaagttaatagcatataacgacattatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatac 1931693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 29966600 - 29966529
Alignment:
Q  482 tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29966600 tacatcattcaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagc 29966529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 19896416 - 19896529
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||    
T  19896416 acaaaaacaaaatgatattcattcatttaaattaatagaatacatcataatcaacatcgttaaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcatatca 19896515  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||||    
T  19896516 tccaagttaatagc 19896529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43510511 - 43510308
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaac-atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||     
T  43510511 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgataaagtacatcaaatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcac 43510412  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    ||||||||||  | || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||| |    
T  43510411 ccaagttaatgacatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg-cttcaggatctgcaacattgacgtc 43510314  T
Q  640 caaatc 645  Q
    ||||||    
T  43510313 caaatc 43510308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 47320205 - 47320318
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||   |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  47320205 acaaaaacaaaattatattcattcattcaaatcgatagaatacatcagaatcaagatcgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacagca 47320304  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
     |||||||||||||    
T  47320305 cccaagttaatagc 47320318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 625 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 2624627 - 2624522
Alignment:
Q  625 tgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcga-tctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaa 722  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  2624627 tgcaacgttgacgcccaattctttgattgaataatcgaatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaagacgggaaatcaaactacgccgcacaa 2624528  T
Q  723 gacgac 728  Q
    ||||||    
T  2624527 gacgac 2624522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 21686034 - 21686146
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | | |    
T  21686034 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctacaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagc 21686133  T
Q  539 atccaagttaata 551  Q
    | |||||||||||    
T  21686134 acccaagttaata 21686146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 26633463 - 26633577
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  26633463 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 26633562  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    ||| ||| |||||||    
T  26633563 atctaagctaatagc 26633577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 2624765 - 2624647
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||| | |||| |    
T  2624765 acaaaaacaaaacgatatttattcattaaaatcgatggagtacaccattcaacgccgctaaaaaaataaagaatgaatttgcgaacaaactcacaacacc 2624666  T
Q  542 caagttaatagcgtataac 560  Q
    | | |||||||| ||||||    
T  2624665 ccatttaatagcatataac 2624647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Original strand, 4142556 - 4142649
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4142556 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcaaatacaaacattgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaact 4142649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 28857715 - 28857598
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| | ||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |  |    
T  28857715 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatataatacatcggaatcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagctgc 28857616  T
Q  542 caagttaatagcgtataa 559  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28857615 caagttaatagcatataa 28857598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 54022123 - 54021965
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| | || ||||||| ||| |||||| | | |||||||||||    
T  54022123 aacatcgctaaaaacgtaaataatgaatctacgaacaaattcataacattcaagttaataacatacaacgaca-aatgtctacaaata-atatgataaaa 54022026  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgatt 652  Q
       |||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  54022025 tctaagtcaccgaaatatccatgttttcggatctgcaacgttgacatccaaatcattgatt 54021965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 21662754 - 21662541
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  | ||| |||||||| |||  |||| | |||| |||||||||| || | |||    
T  21662754 acaaaatcaaaacgatatttattcattcaaagtgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaac 21662655  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |  |||||||||||| || |||  || | | |||||| | | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  21662654 actcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgc 21662556  T
Q  639 ccaaatctttgattg 653  Q
     |||||| |||||||    
T  21662555 tcaaatcattgattg 21662541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 21671518 - 21671305
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  | ||| |||||||| |||  |||| | |||| |||||||||| || | |||    
T  21671518 acaaaatcaaaacgatatttattcattcaaagtgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaac 21671419  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |  |||||||||||| || |||  || | | |||||| | | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  21671418 actcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgc 21671320  T
Q  639 ccaaatctttgattg 653  Q
     |||||| |||||||    
T  21671319 tcaaatcattgattg 21671305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 551
Target Start/End: Original strand, 17949119 - 17949228
Alignment:
Q  446 aaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgct-acaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  17949119 aaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcagatacaaacatcgctaaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacc 17949218  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  17949219 caagttaata 17949228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 551
Target Start/End: Original strand, 17952971 - 17953080
Alignment:
Q  446 aaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgct-acaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  17952971 aaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcagatacaaacatcgctaaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacc 17953070  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  17953071 caagttaata 17953080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 22611507 - 22611285
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacat-------cgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaac 531  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | |||||       ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22611507 acaaaaacaaaacgatatttattcatttaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcattaaacgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaac 22611408  T
Q  532 taataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacg 631  Q
    | | | || |||| |||||| | || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  22611407 tcacagcacccaatttaataccatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacg 22611309  T
Q  632 ttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||    
T  22611308 ttgacgtccaaatcattggttgaa 22611285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 23100853 - 23100719
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaa 679  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| || || |||    
T  23100853 atatgatacaattaaattgaccgaaatacccatgacatcggatctgcaactttgacactcaaatcattgattgaataattgatctttcaatatgaatcaa 23100754  T
Q  680 ctgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
     |||||||| |||| | |  |||||||||||||||    
T  23100753 atgaacaccacaaccaaatagaaaatcaaacaacg 23100719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 22301099 - 22301048
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtata 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  22301099 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatata 22301048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 8670796 - 8670691
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | |||| |    
T  8670796 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacatca---aacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacaacagc 8670700  T
Q  542 caagttaat 550  Q
    |||||||||    
T  8670699 caagttaat 8670691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 727
Target Start/End: Original strand, 28834164 - 28834309
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaac 680  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||| |||||| |  || |||     
T  28834164 atatgataaaattaaagtgaccggaatagtcatgtctccggatctacaacgttgacactaaaatcgttgattgaaact-gatgtttcaataagaaccaaa 28834262  T
Q  681 tgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
     |||   ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  28834263 cgaatttcgcaacaagacagaaaatcaaacaacattgcacaagacga 28834309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35348626 - 35348510
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgat--agagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaata 536  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  35348626 acaataacaaaacgatattcattcaaccaaatcgataaagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcaca 35348527  T
Q  537 acatccaagttaatagc 553  Q
    ||| |||||||||||||    
T  35348526 acacccaagttaatagc 35348510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 36204172 - 36204386
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||   |||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  36204172 acaaaaacaaaacgatattctttcattcaaattgacagaatacatcagaatcaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgtgaacaaactcacaaca 36204271  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa-ctaaagtgaccggaatacccatgtctt-cggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||| |||||| | ||||| | || ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||| |||||  | | |||| ||||| |||||||||||||    
T  36204272 tccaaattaataacatataatggcaaaatatctaca-aataatatgataaaatctaaa-tcaccagaatattc-tctcttccggatctgcaacgttgacg 36204368  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
     ||||||| |||||||||    
T  36204369 tccaaatcattgattgaa 36204386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 27360032 - 27360141
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||  || ||| | |||||||||| | ||| ||    
T  27360032 acaaaaataaaatgatattcattctttcaaattgatagagtatatcatttaacatcgctaaaaacataaaaaataaatttacgaacaaactcacaacgtc 27360131  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  27360132 caagttaata 27360141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43853709 - 43853648
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43853709 tcaacatcgctaaaaatgtaaatggttaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaata 43853648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 9048913 - 9048766
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaa 606  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| | |||| ||||||| |||||  || |||||| |||  ||||| | | ||||||||||| | || | | | |||    
T  9048913 gtaaagggtgaatctgtaaacaaactcacaacacccaagtttatagcacatgacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatttaaatcatcagaa 9048815  T
Q  607 tacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9048814 tacccatgttttcagatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaa 9048766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 655
Target Start/End: Original strand, 24098874 - 24099074
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||| ||| ||||||  || ||||||||||||||| | | || |||||||||||    
T  24098874 gatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagagtggatctgcgaacaaactcacagca-ccaagttaata 24098972  T
Q  552 gcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgat 651  Q
    || |  |||| || |||  ||||| | | ||||||||||||  |||| || | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  24098973 gcatc-aacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgct 24099070  T
Q  652 tgaa 655  Q
    ||||    
T  24099071 tgaa 24099074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 508 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 10496583 - 10496437
Alignment:
Q  508 taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaat 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||  ||  || |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||| |||    
T  10496583 taaaggatgaatctgcgaacaaactcaaagcacccaagttaatagcatacgacagcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaactcaccgaaat 10496485  T
Q  608 acccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  10496484 acccatgcttacggatctgcaaagttgacgcccaaatcattggttgaa 10496437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 553
Target Start/End: Original strand, 21554625 - 21554696
Alignment:
Q  482 tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21554625 tacatcaatcaacattgctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcattgcatccaagttaatagc 21554696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 53444436 - 53444220
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa--catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataa 537  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |  | |||  |||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||| | |     
T  53444436 acaaaaacaaaataatattcattcattcaaatagatagattacattagatacaaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctacgaacaaactcacag 53444337  T
Q  538 catccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    || ||||||||||||| || ||||  | ||| |||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| ||| | ||||  | ||||| | |||| ||||||    
T  53444336 cacccaagttaatagcataaaacggaaaaatatctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacattgacg 53444238  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  53444237 cccaaatcattggttgaa 53444220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 532
Target Start/End: Original strand, 7273605 - 7273687
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||||| || || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7273605 aaaacgatattcattcattcaaattgatagagtatattattcaacaccgttaaaaacgtaaatgataaatctgcgaacaaact 7273687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 661 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 18048964 - 18048894
Alignment:
Q  661 atctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||||| || || |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18048964 atctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaa 18048894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 56194717 - 56194627
Alignment:
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  56194717 ccaaatctttgattaaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 56194627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 547
Target Start/End: Original strand, 7006533 - 7006598
Alignment:
Q  482 tacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagtt 547  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  7006533 tacatcattcaatatcgctagaaatatatatgatgaatctgtgaacaaacacataacatccaagtt 7006598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 546
Target Start/End: Original strand, 12199536 - 12199593
Alignment:
Q  489 ttcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagt 546  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  12199536 ttcaacatcgctacaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagt 12199593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 31381491 - 31381571
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgc 523  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  31381491 acaaaaataaaatcttattcgttcattcaaatcgagagattacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaa-gatgaatctgc 31381571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 507 - 551
Target Start/End: Original strand, 11299870 - 11299914
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  11299870 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaata 11299914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 637 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 21090272 - 21090178
Alignment:
Q  637 gcccaaatctttgattgaa---aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||||||||   |||  ||| ||||| || || ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21090272 gcccaaatctttgattgaatataatttatccttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaaaacgaaaaatcaaacaacgtcgtacaagacgac 21090178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 532
Target Start/End: Original strand, 21364928 - 21365012
Alignment:
Q  448 acaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||||||| |  || || ||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  21364928 acaaaatgatactcgtttattcaaattgatagattacatcattcaagatcgttaaaaatggaaaggatgagtttgcgaacaaact 21365012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 495 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27652204 - 27652124
Alignment:
Q  495 atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctaca 575  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  27652204 atcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaca 27652124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 503 - 551
Target Start/End: Original strand, 40006533 - 40006581
Alignment:
Q  503 aaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  40006533 aaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcgaaacatccaagttaata 40006581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 660 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 52944393 - 52944325
Alignment:
Q  660 gatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  52944393 gatctttcaatatgaaacaaacgaacaccgcaacaagacgcaaaattaaacaacgccgcacaaaacgac 52944325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Original strand, 38943887 - 38943942
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  38943887 aaaggatgaatctgtgaacaaactcatatcatccatgttaatagcataaaacgaca 38943942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 43157153 - 43157098
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  43157153 aaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgaca 43157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 655
Target Start/End: Original strand, 4142685 - 4142759
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  4142685 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaa 4142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Original strand, 7008350 - 7008457
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||   |||||||  ||| ||||||| |||||||| | |||||| |    
T  7008350 aaaaacaaaatgatattcattcatttaaattgatagtgtatatcattcaatatcact--caatgtaatagataaatctgcaaacaaactcacaacatcta 7008447  T
Q  544 agttaatagc 553  Q
    |||| |||||    
T  7008448 agttgatagc 7008457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 661 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 9048745 - 9048675
Alignment:
Q  661 atctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  9048745 atctttcaaaagaaaccaaacgaacaccgcaacaagacccgaaatcagacaacgccgcacaagacgacaaa 9048675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 681 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 21405587 - 21405537
Alignment:
Q  681 tgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21405587 tgaacaccgcatcaagacgaaaaatcaaacaatgtcgcccaagacgacaaa 21405537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 36161977 - 36161813
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataa 589  Q
    ||||||||| || ||| ||||||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||  |||  ||||| ||  |||||||||    
T  36161977 tcaacatcgttaaaaacgtaaagagtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacgaccaaatgcctaca-aataatatgataa 36161879  T
Q  590 aa-ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||| | ||   ||||| ||||| ||||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  36161878 aatctaaa-tcacgaaaatactcatgttttcggatctgtaacgttggcgtccaaatcattgattgaa 36161813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36194949 - 36194911
Alignment:
Q  515 tgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36194949 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagc 36194911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 51888004 - 51888117
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||||   |||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||| | ||||    
T  51888004 acaaaaataaaatgacattcattcattcaaattgatagaatatatcagaatcaagatcactaaaaatgtaaagggtggatatgcgaacaaactcacaaca 51888103  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
     | |||||||||||    
T  51888104 cctaagttaatagc 51888117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 682 - 728
Target Start/End: Original strand, 52204380 - 52204426
Alignment:
Q  682 gaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52204380 gaacaccgtaacaagacgcaaaatcaaacaatgtcacacaagacgac 52204426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Original strand, 7083538 - 7083595
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  7083538 tcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 7083595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43095892 - 43095831
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  43095892 aacatccctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaattaatagc 43095831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 539 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 52944528 - 52944413
Alignment:
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa-ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  52944528 atccaagttaatagcatataactacaaaatgcctacaaaaa-atatgatgaaatctaaa-tcaccagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacg 52944431  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
     ||||||| | |||||||    
T  52944430 tccaaatcatcgattgaa 52944413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 98)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 442 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 50148676 - 50148386
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||    
T  50148676 acaaaaataaaatgatattctttcattcaaatcgagagattacatcattcaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaaacaactcacaacatc 50148577  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt-cggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50148576 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcttccggatctgcaacgttgacgccc 50148477  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaa 730  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  50148476 acatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaatgtcgcacaagacgacaa 50148386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 442 - 724
Target Start/End: Original strand, 9686980 - 9687263
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  9686980 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 9687079  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | || |||| |||||| |||||||||    
T  9687080 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctctggatctgcaac-ttgacgccc 9687178  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  9687179 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaaga 9687263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 712
Target Start/End: Original strand, 5324334 - 5324605
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  5324334 acaaaaacaaaatgttattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaagcatgaatctgcgaac-aactcacaacatc 5324432  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||||    
T  5324433 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggcccccggatctgcaacgttgacgccc 5324532  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5324533 aaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaagacgggaaatcaaacaa 5324605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 30879381 - 30879094
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30879381 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 30879282  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
      |||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||||    
T  30879281 atagttaatagtatataacaacataatgtctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccattgcctccgaatctgcaacgttgacgccc 30879182  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  30879181 aaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacg-cgcacaagacgac 30879094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 469 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 5701538 - 5701277
Alignment:
Q  469 caaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5701538 caaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataat 5701439  T
Q  569 ttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatcttt 666  Q
      ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5701438 gcctacacaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgtctccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcgatattt 5701339  T
Q  667 caaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  5701338 caatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 5701277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 51872169 - 51871881
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  51872169 acaaaaatagaatgatattcattcattcaaattgagagattacatccttcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 51872070  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||  |    
T  51872069 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttc 51871970  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51871969 aaatatttgattgaataatcgatctttcaataagaataaaatgaacaccgcaagaagacggaaaagcaaacaacgtcgcacaagacgac 51871881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7343028 - 7342740
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  7343028 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcactcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 7342929  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  7342928 caagttaatagcatataacatcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtcc 7342829  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7342828 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaacgcaagaagacgggaaaacaaacaacgccgcacaagacgac 7342740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 25406059 - 25406347
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  25406059 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 25406158  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| |     
T  25406159 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatgacctctggatctgcaacgttgacgtcg 25406258  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  25406259 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccacacaagacgac 25406347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 50271915 - 50272203
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  50271915 acaaaaataaaataatatttattcattcaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaaggtaacggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 50272014  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  50272015 taagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgacaaaattaaagtgactggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 50272114  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  50272115 aaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaaacgac 50272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 35584398 - 35584681
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  35584398 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaataccgcta-aaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatc 35584496  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||    ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  35584497 caagttaat----tataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattggctccggatctgcaacgttgacgccc 35584592  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35584593 aaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 35584681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Original strand, 39927332 - 39927617
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  39927332 aaaaacaaaacgatattcattcattgaaatagatatagtatatcgttcaacatcgctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatcca 39927431  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    | ||||||   ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  39927432 aattaataagatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgattggaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgacatccaaa 39927531  T
Q  644 tctttgatt-gaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||| ||| || || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  39927532 ttttttattggataaccgatctttcaatatgaaacaaatgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgac 39927617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 50165874 - 50166162
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  50165874 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 50165973  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | || ||||| | ||||||||||| ||    
T  50165974 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccagaatacccatggcctccggatctacaacgttgacgtcc 50166073  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||  ||| |||| |||| | |||||||||||    
T  50166074 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgagaaagcaaataacgccgcacaagacgac 50166162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 11454243 - 11453953
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11454243 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 11454144  T
Q  542 caagttaatagc--gtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    ||||||||||||   ||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||  || ||||| ||||| ||||||||    
T  11454143 caagttaatagcatatataatggcataatgcctacataaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatctatgacctccggatctgcaatgttgacgc 11454044  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||    
T  11454043 tcaaatctttgattgaataatcgctctttcaagatgaatcaaatgaataccgcaaaaagacgggaaatcaaacagcgctgcacaagacgac 11453953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 19715670 - 19715958
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||    
T  19715670 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatc 19715769  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcg-gatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  19715770 caagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctctagatctgcaacgttgacgccc 19715869  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  19715870 aaatctttgatttaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 19715958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 51868420 - 51868708
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  51868420 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatc 51868519  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||| |||| | ||| ||||||||||||| ||    
T  51868520 caagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaatattcatggtctccagatctgcaacgttgacgtcc 51868619  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  51868620 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataagaataaaatgaacaccgcaagaagacgagaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 51868708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 444 - 830
Target Start/End: Original strand, 18569088 - 18569468
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||| |||||||||| |||| |||  |||||  ||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  18569088 aaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgacataatacaccattcaacattgctaaaaacataaagcttgaatttgcgaataaactcacaacatcca 18569187  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  18569188 aattaatagcatataacgacataatgcctacaaaagtatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcctctggatctgcaacgttgacacccaaa 18569287  T
Q  644 tctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacac 742  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  |||||| ||| ||     ||||||    
T  18569288 tcttcaattgaataatcgatctttcaatatgaattaaatgaacaccgcaacaagacgggaaatctaacaacaccggacaagatgacgaa-----caacac 18569382  T
Q  743 accatcacacttagatgtcgaaatcatgaggnnnnnnncctagatatatatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaa 830  Q
    |||| |||||| | ||| |||||||| || |       |||||  || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18569383 accaccacactcaaatgacgaaatcacgaagaagaaaacctag--atctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaa 18569468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9172796 - 9172508
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  9172796 acaaaaataaaaagatattcattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 9172697  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | || ||||| ||||||||||||| ||    
T  9172696 caagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtcc 9172597  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9172596 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 9172508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9180778 - 9180490
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  9180778 acaaaaataaaaagatattcattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 9180679  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||||  ||| || ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | || ||||| ||||||||||||| ||    
T  9180678 caagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtcc 9180579  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9180578 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 9180490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 444 - 714
Target Start/End: Original strand, 45805606 - 45805877
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  45805606 aaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatcca 45805705  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||  |||    
T  45805706 agttaata-catataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaa 45805804  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    ||  || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  45805805 atctttgattgaataatcgatctttcaatcggaatgaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacg 45805877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 443 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 28035441 - 28035062
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| | || ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||     
T  28035441 caaaaataaaatgatattcattcattcaatt-gagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgc--acaaactcacaacatca 28035345  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28035344 aagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatttatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaatgttgacgccca 28035245  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaac 740  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||     ||||    
T  28035244 aatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----caac 28035150  T
Q  741 acaccatcacacttagatgtcgaaatcatgaggnnnnnnncctagatatatatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaa 830  Q
    | |||| ||||||||||||  |||||||  | |       |||||  || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28035149 aaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaacctag--atctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaa 28035062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 20266608 - 20266336
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  20266608 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacattattcaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatc 20266509  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| || || || || ||||||||||| ||||    
T  20266508 caagttaattgcatataacggcataatgtctacaaaagtatatgatgaaattaaagtgactggaacatccattgcctccgaatctgcaacgttgatgccc 20266409  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||  |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20266408 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgtccaccgcacgaagacgggaaatcaaacaa 20266336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 470 - 728
Target Start/End: Original strand, 40880816 - 40881075
Alignment:
Q  470 aaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatt 569  Q
    ||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  40880816 aaatcgagagattatattattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgcatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatg 40880915  T
Q  570 tctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttc 667  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  40880916 cctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgat-tttt 40881014  T
Q  668 aaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    || || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  40881015 aatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 40881075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 33291193 - 33291481
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |  || ||| ||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||    
T  33291193 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacaccaataaaaacgtaaatgatgaatctgctaacaaactcacagcatc 33291292  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || || || ||||||||||||||||    
T  33291293 caagttaacagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgccc 33291392  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||||  |   ||||||||| || || ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  33291393 aaatctttgattgaattacttatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgacgacggaaaatcaaacaacaccgcacaagacgac 33291481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 45425842 - 45426129
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||    
T  45425842 acaaaaacaaaat-atattcattcattcaaattgagagattacatcatttaatatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaataaactcacagcatc 45425940  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| |    
T  45425941 caagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaatattcatggccttcggatctgcaacgttgacgctc 45426040  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||  | || || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  45426041 aaatttttgattgaataatcgatctttcgatatgaatcaaatgaacaccgcacgatgatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 45426129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 3871711 - 3871426
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||    
T  3871711 aaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattaaacaccgctaaaaacataaaggat-aatcaacgaacaaactcacaacatcca 3871613  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||  |||| | || |||| |||||||||||| |||||    
T  3871612 agttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgttaaaattatagtgaccgaaatatacatgacctctggatctgcaacgttgacacccaa 3871513  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaa-ataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  3871512 atctttgattgaataatcgatctttcaaatataaatcaa-agaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 3871426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 488 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7998049 - 7997807
Alignment:
Q  488 attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat 587  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  7998049 attcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgat 7997950  T
Q  588 aaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaac 685  Q
     ||| ||||||||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||    
T  7997949 gaaattaaagtgaccggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttggttgaacaatcgatatttcaatatgaatcaaatgaac 7997850  T
Q  686 accgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    || |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7997849 actgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 7997807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 517 - 713
Target Start/End: Original strand, 7311956 - 7312153
Alignment:
Q  517 aatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc 616  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      
T  7311956 aatctgcgaacaaacttataatatccaagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccgaaatactcatgca 7312055  T
Q  617 ttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
      ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7312056 accggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgtttgaattatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 7312153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 38520310 - 38520594
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  |||| || | | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  38520310 acaaaaacaaaatcatattcattcatttaaattgagaaattacatcattcaacatcactaaaaacgtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatc 38520409  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||    
T  38520410 caagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatacgataaaattaaagtgactggaatatccatgcctccgaatctgcaacgttgacgcaca 38520509  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |   ||||||| || |||||||||||||| || || ||  ||||||||| || || |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  38520510 a---tttgatttaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgac 38520594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 9919692 - 9919407
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||    
T  9919692 acaaaaataaaatgatattcatt-attcaaatcgagagattacatcattcaa-accgctaaaaatgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatc 9919595  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| | || ||||| |||||| ||||||  |    
T  9919594 caagttaatagcatataacggcataa-tgctacaaaaatatatgatcaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccggatttgcaacattgacgttc 9919496  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  9919495 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgtacaagacgac 9919407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 450 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 40646971 - 40646702
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaa-ctaataacatccaagtta 548  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||   ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||    
T  40646971 aaaatgatattcattcattcaaatcgagagattaa--cattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaaactcacaacatccaagata 40646874  T
Q  549 atagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctt 647  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40646873 atagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattatagtgaccagaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctt 40646774  T
Q  648 tgattgaa-----aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    ||||||||      ||||||||||||| || || ||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40646773 tgattgaacaatcgatcgatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacg 40646702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 34519434 - 34519150
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  34519434 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagggattacatcatccattaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatc 34519335  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||    | ||    
T  34519334 caagttaatagcaaataatgacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgt----gtcc 34519239  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  34519238 aaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccacaagaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaaaacgac 34519150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 542 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 39987593 - 39987407
Alignment:
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  39987593 caagttaatagcatataacagcataatgcctata-aaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgccca 39987495  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39987494 attctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcagcaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 39987407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 450 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 19723611 - 19723405
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaa 549  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  19723611 aaaattatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaa 19723512  T
Q  550 tagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatcttt 648  Q
    || | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19723511 taacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaaccgaaatatccatcgcctccggatctgctacgttgacgcccaaatcttt 19723412  T
Q  649 gattgaa 655  Q
    |||||||    
T  19723411 gattgaa 19723405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 442 - 666
Target Start/End: Original strand, 41081479 - 41081704
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  41081479 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcattcaacagtgctaaaaacgtaaaacatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 41081578  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    | |||||||| | ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||| |||| || ||    
T  41081579 cgagttaataacatataactgcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccagaatacacatgcctccggatctgcaacattgatgctca 41081678  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatcttt 666  Q
     || |||||||||| |||||||||||    
T  41081679 gatttttgattgaataatcgatcttt 41081704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 469 - 768
Target Start/End: Original strand, 48365568 - 48365863
Alignment:
Q  469 caaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || | ||| ||| | ||| ||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48365568 caaatcgataaagtgcatcattcagcaccactaaaaacgcaaatgattaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaataacttataacgacataat 48365667  T
Q  569 ttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttc 667  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  48365668 tcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaatcggaatacttatgctcccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaataatcgatccttc 48365767  T
Q  668 aaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacacaccatcacacttagatgtcgaaatc 767  Q
    || || || ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||| ||     |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  48365768 aatatgaatcaaatgaacaccgctacaagacaaaaaatcaaacaacgttgcacaagatgacgaa-----caacacaccaccacactcagatgacgaaatc 48365862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 32676910 - 32677119
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  32676910 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaatcaagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 32677009  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||     ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | || || || ||||||||||||||||    
T  32677010 caagttaa-----tataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgccc 32677104  T
Q  641 aaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||||||||||    
T  32677105 aaatctttgattgaa 32677119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 444 - 614
Target Start/End: Original strand, 31130370 - 31130540
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||||||    
T  31130370 aaaaacaaactgatattcattcattcaaatcgacaggttacatcattcaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatcca 31130469  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg 614  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31130470 agttaatagaatataacgacataatgcctacaaaaatacataataaaattaaagtgaccggaacacccatg 31130540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 444 - 608
Target Start/End: Original strand, 11709484 - 11709648
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  11709484 aaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatcta 11709583  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata 608  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11709584 aattaatagcatatcacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 11709648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 543 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 14545722 - 14545537
Alignment:
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  14545722 aagttaatagcgtataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaaatgatcggaatactcatggcctccggatctgcaacgttgacgccca 14545623  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  14545622 aatctttgattgaataatcgatc-ttcaaaataaatcagatgaacaccgcaagaagacgg-gaatcaaacagcgtcgcacaagacgac 14545537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 442 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 48217743 - 48217596
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  48217743 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcatttaacactgctaaaaatgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatc 48217644  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataa 589  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  48217643 caagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataa 48217596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 442 - 608
Target Start/End: Original strand, 27914882 - 27915045
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||||||| | | ||||    
T  27914882 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcaagatattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaat---cgaacaaactcacagcatc 27914978  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata 608  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27914979 caaattaatagcatataacgacaaaatacctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaata 27915045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 442 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 31837140 - 31836995
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||    
T  31837140 acaaaaacaaaatgatattcattcatttaaatcgagagattatatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagtatc 31837041  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat 587  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  31837040 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgat 31836995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 27873044 - 27872756
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatattt-attcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||    ||| |||| || ||||||  | || ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  27873044 acaaaaacaaaatgatatttcattcatttaaattcggagattacaccaatcaacaatgttaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacat 27872945  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     |||||||||| | ||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||  || | |||| ||| | |||||||||||| |    
T  27872944 tcaagttaataacatataacggcataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaaatgattggaatattcacgccttccgatctacaacgttgacgctc 27872845  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||  | ||  || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27872844 aaatctttaattgaataatcgatccttcaatttgaattaaatgaacaccgcaagaagacaaaaaatcaaacaacgtcgaacaagacgac 27872756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 33816943 - 33817157
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||| | | | | |||||||||| |  |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||    
T  33816943 acaaaaacaaaatgatcttcattcattcaaatcaaaatatttcatcattcaatactgctaaaaacataaaggatgaatccgcgaacaaactcacatcatc 33817042  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||   ||    
T  33817043 caagttaataacatataatgacataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatatcc 33817142  T
Q  641 aaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||||||||||    
T  33817143 aaatctttgattgaa 33817157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 33876413 - 33876627
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||| | | | | |||||||||| |  |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||    
T  33876413 acaaaaacaaaatgatcttcattcattcaaatcaaaatatttcatcattcaatactgctaaaaacataaaggatgaatccgcgaacaaactcacatcatc 33876512  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||   ||    
T  33876513 caagttaataacatataatgacataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatatcc 33876612  T
Q  641 aaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||||||||||    
T  33876613 aaatctttgattgaa 33876627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 47133202 - 47132988
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  47133202 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacaaca 47133103  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-aaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||  ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||     
T  47133102 tccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctaca-aaaaatatgatgaaatctaaa-tcaccagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgt 47133005  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| | |||||||    
T  47133004 ccaaatcatcgattgaa 47132988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 579 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 31836975 - 31836825
Alignment:
Q  579 atatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaac 677  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |    
T  31836975 atatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgctccggttctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatttttcaatatgaatc 31836876  T
Q  678 aactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  31836875 aaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacaccgcacaagacgac 31836825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 442 - 615
Target Start/End: Original strand, 11462274 - 11462449
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||| | | |    
T  11462274 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacagc 11462373  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgt 615  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  11462374 acccaagttaatagcatacaacgacaaaattcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgt 11462449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 442 - 713
Target Start/End: Original strand, 30818139 - 30818399
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || |||||| | | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||             | ||||||    
T  30818139 acaaaaacaaaaagatattcattaattcaaatcaagaaattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatc-------------acaacatc 30818225  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |  ||||| | ||||||| |||||     
T  30818226 caagttaatagcatataacgctataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggccaccggatctacaacgttaacgcct 30818325  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||||    
T  30818326 aaatctttgattgaataatcgatctttcgataagaatcaaatgaacaccgcacaatgacgggagatcaaacaac 30818399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 450 - 655
Target Start/End: Original strand, 35484191 - 35484398
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagt 546  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  35484191 aaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggcgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagt 35484290  T
Q  547 taatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatct 646  Q
    ||||||| || |||| || |||   |||| ||  ||||||||||||  || | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  35484291 taatagcatacaacggcaaaatgcttaca-aataatatgataaaaccgaaatcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatca 35484389  T
Q  647 ttgattgaa 655  Q
    ||| |||||    
T  35484390 ttgcttgaa 35484398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24583443 - 24583332
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  24583443 aaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagaatacatcagaatcaagatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcacc 24583344  T
Q  542 caagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||    
T  24583343 caagttaatagc 24583332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 14872939 - 14872724
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||   | | ||||||| ||||| |||||||||||| | | |    
T  14872939 acaaaaacaaaatgatattcattcatttaaatcgatagagtacatcacatacaaacatcgcagaagaagtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagc 14872840  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    ||||||||||||||| || |||| || |||  ||||| | | ||||||||||||  |||| |||  ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  14872839 atccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaagtcaccaaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgc 14872741  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  14872740 ccaaatcattggttgaa 14872724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 44637723 - 44637596
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||    
T  44637723 acaaaaataaaatgatattcattcattccaatcgatagagtacattattcaacacagctaaaatcgtaaaggatggatctgcgaataaactcacagcatc 44637624  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatt 569  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  44637623 caagttaataacatataacggcataatt 44637596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 7337455 - 7337670
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  7337455 acaaaaatataacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaatataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 7337554  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| |  |||  || |||  ||||| ||  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  7337555 agccaagttaatagcatgcaacagcaaaatgcctaca-aataatatgataaaaccaaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgt 7337653  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
     |||||| ||| |||||    
T  7337654 gcaaatcattgcttgaa 7337670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 5856204 - 5855918
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || | || ||| ||||| ||||||| || ||||||| |   ||||| ||    
T  5856204 aaaaccaaaattatattcattcattcaaattgatagagtacatcgttcaatattgttaaaaaagtaaatgatgaatttgtgaacaaatttgcaacattca 5856105  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||  | |  |  ||||| |||||||| ||||    
T  5856104 agttaatagcatacaacggcaaaatttctaca-aataatatggtaaaattaaagtgattggaataccaatgcatccaaacctgcaatgttgacgcacaaa 5856006  T
Q  644 tctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaa 730  Q
    || || | |||| ||| ||||||| || | |||  || | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  5856005 tcattaactgaacaattgatcttttaataaaaacaaaataaacaccacaacaagacgtaaaatcaaacaatgtcgcacaagatgacaa 5855918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24583247 - 24583138
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | || |    
T  24583247 aaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagaatacatcagaatcaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacc 24583148  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  24583147 caagttaata 24583138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 490 - 655
Target Start/End: Original strand, 36775553 - 36775717
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-a 588  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||| |    
T  36775553 tcaatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgatga 36775651  T
Q  589 aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||| | ||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36775652 aatctaaa-tcaccgggatacccatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 36775717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 445 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 49627208 - 49627077
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  49627208 aaaaaaaaatgatattcattcatc-aaatcgatagaatacatcagaatcaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacaccc 49627110  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctaca 575  Q
    || |||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  49627109 aaattaatagcatacaacggcaaaatgtctaca 49627077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 553
Target Start/End: Original strand, 13144608 - 13144718
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattc--aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||| ||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  13144608 aaaaaaaaatgatatgcatttattcaaattgatagagtacatcaatacaaacatcgttaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatcc 13144707  T
Q  543 aagttaatagc 553  Q
    |||||||||||    
T  13144708 aagttaatagc 13144718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 4413414 - 4413210
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | | | |    
T  4413414 acaaaaacaaaacgatatttattcgttcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaattcacagc 4413315  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |  ||| |||||||| || |||  || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| ||||  ||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  4413314 actcaatttaatagcatacaacagcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgc 4413216  T
Q  639 ccaaat 644  Q
    ||||||    
T  4413215 ccaaat 4413210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44543570 - 44543458
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  44543570 acaaaaacaaaatgatattcat-cattcaaatcaatagaatacatcagaatcaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagca 44543472  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
     |||||||||||||    
T  44543471 cccaagttaatagc 44543458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12635469 - 12635345
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||| | |||||   |||||||||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12635469 acaaaaacaaaacgatattcattcatttaaattgatagaatgcatcagaatcaacatcgctaaaaacataaaaggtgaatctccgaacaaactaacaaca 12635370  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||| || |||||||    
T  12635369 tccaagttaatagcatacaacgaca 12635345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 32395297 - 32395083
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||  | ||| || || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| | | |    
T  32395297 acaaaaacaaaacgatattcatccattcaaatcgatagagtacatcaaatacaaacaccgttaaaaacgtaaagggtgaatc-gcgaacaaacttacagc 32395199  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || | || || |||  ||| | | | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||| || |||||||||||||     
T  32395198 acccaagttaatagcatacagcggcaaaatgcctataaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcgaatctgcaacgttgacgt 32395100  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  32395099 ccaaatcattggttgaa 32395083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 44915939 - 44915724
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |    
T  44915939 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacatc 44915840  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||  ||||| || |||| || |||  ||||| ||  |||||||||||   |||  |||| ||||| ||||  | ||||| |||||| |||||||    
T  44915839 acccaagtcgatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaatctaagaaaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgc 44915741  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| |||||||||    
T  44915740 ccaaatcattgattgaa 44915724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 27456789 - 27456647
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttc------aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaacta 533  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||      ||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||||     
T  27456789 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcacattcgacacaaacatcgttaaaaacgtaaaagatgaatttgcgaacaaactc 27456690  T
Q  534 ataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacag 576  Q
    | |||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  27456689 acaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacag 27456647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 496 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 31919232 - 31919137
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaac 592  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  31919232 tcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcgcaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctaca-aataatatgataaaac 31919137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 508 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 5984067 - 5983921
Alignment:
Q  508 taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaat 607  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| | | ||||||||||||  |||| |||| |||    
T  5984067 taaagggtgaatatgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaacataagtcaccgaaat 5983969  T
Q  608 acccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  5983968 acccatgcttccggatctgcagcgttgacgcccaaatcattggttgaa 5983921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 508 - 655
Target Start/End: Original strand, 7836657 - 7836803
Alignment:
Q  508 taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaat 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| |||    
T  7836657 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaat 7836755  T
Q  608 acccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
     | |||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7836756 tcacatgcctccagatattcaacgttgacgcccaaatcattggttgaa 7836803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 31984393 - 31984247
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaa 606  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || ||||||| |||   || | | | ||||||||||||  |||| |||| ||    
T  31984393 gtaaagggtaaatctgcgaacaaagtcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcttaaaaata-atatgataaaacctaagtcaccgaaa 31984295  T
Q  607 tacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31984294 tacccatgcttccggatttgcaacgttgacgcccaaatcattgattga 31984247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39987724 - 39987641
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcga 525  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39987724 acaaaaccaaaacgatattcattcattcaaattgataaattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcga 39987641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 49504387 - 49504501
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacat--cattc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||   || | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  49504387 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacataagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 49504486  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||||||||||    
T  49504487 acccaagttaatagc 49504501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21687678 - 21687555
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  21687678 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaaaggtgaatctgctaacaaactcacaac 21687579  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacga 562  Q
    | |||| |||||||| || |||||    
T  21687578 acccaaattaatagcataaaacga 21687555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 34878070 - 34878184
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca---ttcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||      |||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||||| | |||    
T  34878070 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatggaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgtgaacaaactcacaac 34878169  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||||||||||    
T  34878170 acccaagttaatagc 34878184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 15431511 - 15431594
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctaca 575  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  15431511 aacattgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagtgaatagcatacaacgataaaatgtctaca 15431594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 561
Target Start/End: Original strand, 32678936 - 32679055
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| || || || |   |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  32678936 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatggaatatattagaatcaacatcgctaaaaacgta--ggatgaatctgcgaacaaactcacaaca 32679033  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacg 561  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  32679034 tccaagttaatggcatataacg 32679055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 532
Target Start/End: Original strand, 799629 - 799717
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  799629 aaaaacaaaacgatatttattgatttaaattgataaagtacatcattcaacatcattaaaaacgtaaatgatgaatatgtgaacaaact 799717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19061197 - 19061095
Alignment:
Q  453 atgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaat 550  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||   |||| ||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19061197 atgatattcattcattcaaattgatataatacatcagaatcaagatcgctaaaaacataaaagatgaatgtgcgaacaaactcacaacatccaagttaat 19061098  T
Q  551 agc 553  Q
    |||    
T  19061097 agc 19061095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26535636 - 26535522
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | |||    
T  26535636 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcagatacaaacatagctaaaaacgtaaatgataaatctacgaacaaactcacaac 26535537  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    |  ||||||||||||    
T  26535536 actcaagttaatagc 26535522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 631 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 44637537 - 44637442
Alignment:
Q  631 gttgacgcccaaatctttgattgaaaatc-gatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    ||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  44637537 gttgacgcctaaatctttgatgtaatatttgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtaacaagacgggaaaccaaacaacgtcgcacaagac 44637442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 552
Target Start/End: Original strand, 10776253 - 10776366
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | | |    
T  10776253 acaaaaacaaaatgatattcgttcattcaaattgatagagtatatcagatgcaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaaattgcgaacaaactcacagc 10776352  T
Q  539 atccaagttaatag 552  Q
    | ||||||||||||    
T  10776353 acccaagttaatag 10776366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Original strand, 36894200 - 36894246
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca 488  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36894200 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatca 36894246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5601021 - 5600972
Alignment:
Q  483 acatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5601021 acatcattcaacattgctaaaaatgtaaataatgaatctgcgaacaaact 5600972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 27579920 - 27580034
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattca---acatcgctacaaatg-taaaggatgaatctgcgaacaaactaataa 537  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||  |   ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  27579920 acaaaaataaaataatattcatttattcaaattgatagagtacatcatatacaaacaacgcta-aaatgataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaa 27580018  T
Q  538 catccaagttaatagc 553  Q
    || |||||||||||||    
T  27580019 cacccaagttaatagc 27580034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 19596252 - 19596366
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattca---acatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||| |   |   | ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||  || |    
T  19596252 acaaaaacaaaatgatattcgttcattcaaatcaatagattacattagatagaaatatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcgtagc 19596351  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||    
T  19596352 atccaagttaatagc 19596366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 553
Target Start/End: Original strand, 28677869 - 28677913
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  28677869 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 28677913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 568
Target Start/End: Original strand, 15312357 - 15312416
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  15312357 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaataacataaaacggcataat 15312416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 29738457 - 29738570
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||  || | |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | | |    
T  29738457 acaaaaacaaac-gatattcaatcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacagc 29738555  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||||||||||    
T  29738556 acccaagttaatagc 29738570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 564
Target Start/End: Original strand, 40862568 - 40862619
Alignment:
Q  513 gatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  40862568 gatgaatctgcgaacaaactcaaaacatccatgttaatagcataaaacgaca 40862619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 658 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 1602157 - 1602087
Alignment:
Q  658 tcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1602157 tcgatctttcaatagaaatcaaacgaacgccgcaacaagatgcaaaatcaaacaacgtcgcagaagacgac 1602087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 509 - 551
Target Start/End: Original strand, 13969378 - 13969420
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  13969378 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaata 13969420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 687 - 725
Target Start/End: Original strand, 29837646 - 29837684
Alignment:
Q  687 ccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29837646 ccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagac 29837684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 661 - 731
Target Start/End: Original strand, 31692495 - 31692564
Alignment:
Q  661 atctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||||| || || |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  31692495 atctttcaatatgaaccaac-gaacaccgcaacaagaagcaaaatcaaacaacaccgcacaagacgacaaa 31692564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 3228512 - 3228356
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaa 595  Q
    |||||| ||| ||||||  |||| | ||||||||||  | | || ||||||||||| | ||||||| || |||  ||||| | | ||||||||||||  |    
T  3228512 tcgctaaaaacgtaaagagtgaaaccgcgaacaaacacacatcacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaaccta 3228414  T
Q  596 agtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattg 653  Q
    | | | || |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3228413 aatcatcgaaatatccatgatttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattg 3228356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 15836318 - 15836273
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc 487  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15836318 acaaaagcaaaatgatatttattcattcaaattgatagattacatc 15836273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 509 - 550
Target Start/End: Original strand, 33177336 - 33177377
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaat 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  33177336 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaat 33177377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 551
Target Start/End: Original strand, 34412935 - 34412996
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  34412935 tcaatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaata 34412996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34567070 - 34567013
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  34567070 tcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 34567013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 791 - 840
Target Start/End: Original strand, 50272259 - 50272308
Alignment:
Q  791 tatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaataatgaatag 840  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  50272259 tatgtgaaaattacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaatag 50272308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 4809273 - 4808985
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4809273 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 4809174  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  4809173 taagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 4809074  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4809073 aaatccttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 4808985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 442 - 729
Target Start/End: Original strand, 23851269 - 23851558
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  23851269 acaaaaacaaaatgataatcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaaagtaaaagataaatctgcgaacaaactcacaacatc 23851368  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||| || || ||||| ||||||||||||| ||    
T  23851369 taagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagttaccgaaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtcc 23851468  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgaca 729  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23851469 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagacgaca 23851558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 44099711 - 44099997
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  44099711 acaaaaacaaaatgatatttattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgctaacaaactcacaacatc 44099810  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||| | || ||||| ||||||||| ||||||    
T  44099811 caagttaatagcatataacgacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtg--cggaatattcatggcctccggatctgcaacgttcacgccc 44099908  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  44099909 aactctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 44099997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 29777528 - 29777240
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  29777528 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 29777429  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||    
T  29777428 caagttaatagcatataacgacataatgcctccaaaaatatatgataatattaaagtcaccggaatatccatggtctccggatctgcaatgttgacgtcc 29777329  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  29777328 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaatgtcgcacaagacgac 29777240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 469 - 728
Target Start/End: Original strand, 43192149 - 43192409
Alignment:
Q  469 caaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43192149 caaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcagaacatccaagttaatagcatataacggcataat 43192248  T
Q  569 ttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttc 667  Q
       |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  43192249 ggatacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatattcatgtctccggatctgcaacgttgacacccaaatatttgatcgaataatcgatctttc 43192348  T
Q  668 aaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43192349 aaaatgaatcaaatgaacaccacaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 43192409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 731
Target Start/End: Original strand, 14906698 - 14906989
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  14906698 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatc 14906797  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || |  || ||||||||||||||||    
T  14906798 caagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccaaatctgcaacgttgacgccc 14906897  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |  || ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14906898 aaatcattgattgaacaatcgatcttttaatacgaatcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaa 14906989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 43889899 - 43890187
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| ||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | | | ||||    
T  43889899 acaaaaacaaaatgatattcattcatttaaattgagagattacattattcaacaatgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaaatcacagcatc 43889998  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  43889999 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 43890098  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  43890099 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaaaatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacgggaaatcaaataacgtcgcacaagacgac 43890187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 9619132 - 9619420
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| || | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  9619132 acaaaaataaaattatattcattcattcaaattgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 9619231  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  9619232 caagttaatagcatataacggcataatacttacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaaagttgacgccc 9619331  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  9619332 aaatctttgatttaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 9619420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 470 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 11464452 - 11464192
Alignment:
Q  470 aaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatt 569  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  11464452 aaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatg 11464353  T
Q  570 tctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttc 667  Q
     ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11464352 cctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttc 11464253  T
Q  668 aaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    || || || ||| |||||||||||  |||||   ||||||||||||| | |||||||||||    
T  11464252 aatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagactagaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 11464192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 11725990 - 11725703
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaa-tgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||    
T  11725990 acaaaaacaaaaatgatattcattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcat 11725891  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  11725890 ccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggagtatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcc 11725791  T
Q  640 caaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| || | || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11725790 caaatctttaattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcagatgaacaccgcaagaaaatgggaaatcaaacaatgtcgcacaagacga 11725703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 34612113 - 34611825
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34612113 acaaaaataaaatgatattcattcattaaaatcgagagattacatcattgaacatcactaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 34612014  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || || || ||||||||||||||||    
T  34612013 caagttaatagcatataacaagataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgccc 34611914  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||||  |   ||||||||| || || ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34611913 aaatctttgattgaattacttatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgacgacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 34611825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 33896395 - 33896107
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  33896395 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacatc 33896296  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatat----gataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgac 636  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||    ||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||    
T  33896295 caagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatagataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgac 33896196  T
Q  637 gcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  33896195 gtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaattggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaaacaaacaacgccgcacaaga 33896107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 28240150 - 28239854
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  28240150 acaaaaacaaactgatattcattcattcaaatcgataggttacgtcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatc 28240051  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt---------cggatatgcaacgt 632  Q
     ||||||||||  ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  28240050 taagttaatagaatataacggcataatgcttacaaaaataaatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgt 28239951  T
Q  633 tgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||||||    
T  28239950 tgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatattaatcaaatgaacaccgcaacaatacgaggaatcaaacaacgccgcacaagacgac 28239854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Original strand, 32724258 - 32724544
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  32724258 aaaaataaaattatattcattcatttgaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctacgaacaaactcacaacatcca 32724357  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  32724358 agttaatagtatataacgacataatgcctacaaaaatataagataagattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaa 32724457  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| ||||||| |||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  32724458 atctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacactgcacgaagactggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 32724544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 725
Target Start/End: Original strand, 9498374 - 9498659
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  9498374 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatc 9498473  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||| | |||||||| || ||    
T  9498474 caagttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgacaggaatatccattgccttcggatctacaacgttgtcgtcc 9498573  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  9498574 aaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaaagccgcacaagac 9498659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 470 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 2656151 - 2655891
Alignment:
Q  470 aaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatt 569  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  2656151 aaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatg 2656052  T
Q  570 tctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttc 667  Q
     ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2656051 cctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcgacgttgacacccaaatctttgattgaacaatcgatctttc 2655952  T
Q  668 aaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    || || || ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  2655951 aatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 2655891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 724
Target Start/End: Original strand, 27746890 - 27747172
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||| | | ||||||    
T  27746890 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcaatgaattacatcattcaataccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcaaataaatttacaacatc 27746989  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||    
T  27746990 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgat-aaataaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctacaacgttgatgccca 27747088  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||  ||| |||||||    
T  27747089 aatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaaaacaggaaatcaaacactgtcgcacaaga 27747172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 456 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 16794586 - 16794313
Alignment:
Q  456 atatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgt 555  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | || || ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |    
T  16794586 atattcattcattcaaatcgatatattacatcattcaagaccgataaaatagtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataccat 16794487  T
Q  556 ataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  16794486 ataacgtcataatgtctacaaaaatatatgataaaattatatagaccagaatacccatgccttcgattctgcaacgttgatgttcaattctttgattgaa 16794387  T
Q  656 -aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
     ||| |||||||||| || || ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16794386 taattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtaacaatacgggaaatcaaacgacgttgcacaagacgac 16794313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 39152917 - 39153205
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39152917 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgataaagtacattattcaacactgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcttaacatc 39153016  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctac-agaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||    
T  39153017 taagttaatagcacataacaacataatgcctacaaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatacccatgcctccggatctgcaacgctgacaccc 39153116  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||  | || ||| |||| | || |||||||||  ||||| |||||||   |||||||||||    
T  39153117 aaatttttaattgaataatcaatctttcaatgtgaatcaaatgaaaatcgtaacaagacgcgaaatcgaacaacgcgacacaagacgac 39153205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 42447807 - 42448090
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||||||||     || |||||| | ||| |||||||||||| |   ||| ||| |||||| |||||| || ||||||||| | ||||||    
T  42447807 acaaaaacaaaatgatatt-----attcaaatctaaagattacatcattcaatactactaaaaacgtaaagaatgaatatgtgaacaaactcacaacatc 42447901  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  42447902 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgtctggaatattcatggccttcggatctgcaacgttgacgccc 42448001  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  42448002 aaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgaaaaatcaaacaatgccgcacaagacgac 42448090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44578339 - 44578135
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||  | || ||| | |||||||||||||| || |||||| | | ||||    
T  44578339 acaaaaataaaatgatattcatttattcaaatcgagagattacatcattcaacactgttaaaaacgcaaaggatgaatctgtgatcaaacttacatcatc 44578240  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44578239 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgtcattcggatctgcaacgttgacgccc 44578140  T
Q  641 aaatc 645  Q
    |||||    
T  44578139 aaatc 44578135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 33299163 - 33298877
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||  |||| |||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33299163 acaaaaacaaaacgatattctttcatttaaattgatagaatacatcattcaacacccctaaaattgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 33299064  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||  | || || ||||||||||||| |||    
T  33299063 taagttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtgactagaatactcatgcatccgtatctgcaacgttgacgacca 33298964  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||| | || || ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||  | ||||||||||    
T  33298963 aatctttaattgaataatcactctttcgatatgaatcaaatgaacaccgcagcaagacgagaaatcaaacaacaccacacaagacga 33298877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 442 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 9073027 - 9072743
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||| | | ||||    
T  9073027 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgtgagcaaactcacagcatc 9072928  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||   |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| | || || || ||||||||||||  ||    
T  9072927 caagttaatagcatataacggaataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtcatcggaatatccatggcctccgaatctgcaacgttgacatcc 9072828  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| |||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  9072827 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagatgggaaagcaaacaacgccgcacaaga 9072743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 451 - 728
Target Start/End: Original strand, 37565663 - 37565942
Alignment:
Q  451 aaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaat 550  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  37565663 aaatgatattcattcatgcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaat 37565762  T
Q  551 agcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttg 649  Q
    ||| ||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  37565763 agcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaatcaaagtgaccggaatatccatcgcattcggatctgcaacgttaacgcccaaatcttta 37565862  T
Q  650 attgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||  |   ||||||||| || || ||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  37565863 attgaattacttatctttcaatatgaatcaaatgaacgccgcacgacgaaggaaaatcaaacaatgccgcacaagacgac 37565942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 33342742 - 33342459
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||     
T  33342742 acaaaaacaaaccgatattcattcattcaaatcaatagattacattattcaacaccgcta-aaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatt 33342644  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || | ||| ||||||| ||||| |||    
T  33342643 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaatatatatgataaaattaaagtgacctgaatactcatgcctccagatctgcaacg-tgacgtcca 33342545  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    | |||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |||| | || |||||||    
T  33342544 attctttgattgaataattgatc-ttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaatacgggaaatcaaaaaacgccgcataagacga 33342459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 476 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 11197158 - 11196910
Alignment:
Q  476 atagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctaca 575  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||| ||| ||||||  |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||    
T  11197158 atagattacatcattcaacattgttaaaaacgtaaatgataaatctgtaaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctaca 11197059  T
Q  576 gaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataa 674  Q
     |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || |    
T  11197058 aaaatatataataaaattaaagtgatcggaatatccatc----cggatctgcaacgttgacgcccaaatcgttgattgaataatcgatctt-caatatga 11196964  T
Q  675 aacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11196963 atcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 11196910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 537 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 35580670 - 35580478
Alignment:
Q  537 acatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgac 636  Q
    ||||| || |||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||| |     
T  35580670 acatctaaattaatagcgtataatggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatatccatgcatccggatctgcaacgttcat 35580571  T
Q  637 gcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35580570 gcctaaatctttgagtgaataatcgatcattcaatatgaatcaaacgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 35580478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 443 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 19876506 - 19876232
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||    
T  19876506 caaaaataaaatgatatttattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacatactcacagcatcc 19876407  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||             ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| | |||||    
T  19876406 aagttaag------------cataatgcctacaaaaatatatgatcaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggatctgcaacgttcaggccca 19876319  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  19876318 aatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcaaatgaacaccacaagaagacggggaatcaaacaacgccgcacaagacgac 19876232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 442 - 665
Target Start/End: Original strand, 43135359 - 43135579
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||     ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  43135359 acaaaagcaaaatgatattcattcattcaaatcgagagatta-----ttcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacatactcacaacatc 43135453  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt-cggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  43135454 caagttaataacatataacggcataatgcctacgaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatacatggcttccggatctgaaacgttgacgccc 43135553  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctt 665  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43135554 aaatctttgattgaataatcgatctt 43135579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 507 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 15047136 - 15046915
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaa 606  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  15047136 gtaaaagatgaatctgcgaacaaacttacaacattcaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaatcggaa 15047037  T
Q  607 tacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatc 706  Q
    ||| |||| ||  |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||| || || ||| | |||| |||| |||||| | |||||    
T  15047036 tacacatgcctctggatctgcaacgttgacgtccaaaacttttattggaaatcgatttttcaatatcaatcaaataaacatcgcaccaagacaggaaatc 15046937  T
Q  707 aaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| |  | |||||||||||    
T  15046936 aaacagcaccgcacaagacgac 15046915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 450 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11267309 - 11267162
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaa 549  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  11267309 aaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcgacaccgctaaaaacgtaaaggatgaaactgcgaacaaactcacagcatccaagttaa 11267210  T
Q  550 tagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaag 597  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11267209 tagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaag 11267162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 445 - 731
Target Start/End: Original strand, 15596946 - 15597233
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||| | ||| |||||   | ||| || |||| |||| | ||||||| |    
T  15596946 aaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtatgtcattcaaccccgcaaaaaacgtaaactttaaatatgtgaaccaacttacaacatccga 15597045  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
    ||||||||| |||| |||||||||   |||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||| | ||| ||  |||| | |||||||||||| |||||    
T  15597046 gttaatagcatatatcgacataatgcatacaaaagtatatgagaaaattaaagtgaccgaaatatctatgactatggatctacaacgttgacgctcaaat 15597145  T
Q  645 ctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||| ||||||| || ||||| || || || || ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  15597146 cttcgattgaataaccgatcgtttaatatgaatcaaatgaacaccgtaacaaaacggaaaatcaaccaaggcctcacaagacgacaaa 15597233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 23230942 - 23230727
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  23230942 acaaaagcaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaagtgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaac 23230843  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  23230842 acccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgc 23230744  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||| || ||| |||||    
T  23230743 ccaagtcattggttgaa 23230727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 16928547 - 16928762
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  16928547 acaaagacagaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 16928646  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || || | || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||| |     
T  16928647 acccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatacccacgctttcggatctgcaacgttgatgt 16928745  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  16928746 ccaaatcattggttgaa 16928762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 559
Target Start/End: Original strand, 24099047 - 24099166
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  24099047 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgacagaatacatcagaatcaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaaca 24099146  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataa 559  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  24099147 tccaagttaatagcatataa 24099166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 577 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 17949409 - 17949270
Alignment:
Q  577 aaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataa 674  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  17949409 aaatatatgataaaattaaagtgaccgtaatatccatggcctccggatctggaacgttgacgcccaaatctctgattgaataatcgatctttcaatatga 17949310  T
Q  675 aacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    |  || |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  17949309 ataaaatgaacaccacacgaagacggcaaatcaaacaacg 17949270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 1236488 - 1236601
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  | |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  1236488 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagaatacatcagaatcaagattgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagca 1236587  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
     |||||||||||||    
T  1236588 cccaagttaatagc 1236601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 644
Target Start/End: Original strand, 7883031 - 7883235
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  7883031 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcaatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 7883130  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||  || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||| |||||     
T  7883131 acccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgctgacgt 7883229  T
Q  639 ccaaat 644  Q
    ||||||    
T  7883230 ccaaat 7883235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 31013398 - 31013613
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| || ||||||| ||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  31013398 acaaaaacaaaacgatagtcattcattcatatcgataaagtacatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 31013497  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| || | ||||| ||||  | || || |||||||||||||     
T  31013498 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcactgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgt 31013596  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| |||||||||    
T  31013597 ccaaatcattgattgaa 31013613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 30568111 - 30568225
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattca---acatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||  |   ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  30568111 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgatagattacatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 30568210  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||||||||||    
T  30568211 acccaagttaatagc 30568225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 15344608 - 15344392
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaaca--tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataa 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |     
T  15344608 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaaaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacag 15344509  T
Q  538 catccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgata-aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttga 635  Q
    || ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  |||||||| || ||||| | ||| |||||| | || |||| |||| |||||||||||    
T  15344508 cacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgatataatctaaa-tcaccagaatactcttg-cttctggatctgcaacgttga 15344412  T
Q  636 cgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  15344411 cgtccaaatcattgattgaa 15344392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 15433673 - 15433457
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaaca--tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataa 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |     
T  15433673 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaaaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacag 15433574  T
Q  538 catccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgata-aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttga 635  Q
    || ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  |||||||| || ||||| | ||| |||||| | || |||| |||| |||||||||||    
T  15433573 cacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgatataatctaaa-tcaccagaatactcttg-cttctggatctgcaacgttga 15433477  T
Q  636 cgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  15433476 cgtccaaatcattgattgaa 15433457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 15524977 - 15524761
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaaca--tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataa 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |     
T  15524977 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaaaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacag 15524878  T
Q  538 catccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgata-aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttga 635  Q
    || ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  |||||||| || ||||| | ||| |||||| | || |||| |||| |||||||||||    
T  15524877 cacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgatataatctaaa-tcaccagaatactcttg-cttctggatctgcaacgttga 15524781  T
Q  636 cgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  15524780 cgtccaaatcattgattgaa 15524761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 503 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 37971518 - 37971367
Alignment:
Q  503 aaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgacc 602  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  || |||||||||  |||| |||    
T  37971518 aaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatgtgataaaacctaagtcacc 37971420  T
Q  603 ggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    | ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  37971419 gaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaa 37971367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 645
Target Start/End: Original strand, 9637199 - 9637404
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||  || | |||||| ||| ||| ||||| | |||| || |||||||||| |||||    
T  9637199 acaaaaacaaaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaatggtgaaactacgaacaaactcataac 9637298  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| |||  ||| | ||  ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| | || || ||||||||||||||    
T  9637299 acccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccta-aaaataatatgataaaacctaagttaccgaaatactcatgtttccgaatctgcaacgttgacgc 9637397  T
Q  639 ccaaatc 645  Q
     ||||||    
T  9637398 tcaaatc 9637404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 3240680 - 3240557
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaat--gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataa 537  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||| ||||| |   |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  3240680 acaaaaacaaaacgatgttcattcattcaaattgatagaatacattagaatcaacatcgctaaaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaa 3240581  T
Q  538 catccaagttaatagcgtataacg 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  3240580 catccaagttaatagcatataacg 3240557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21238086 - 21237974
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  21238086 acaaaaacaaaacaatattcattcattcaaattgatagaatacatcataatcaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaaca 21237987  T
Q  540 tccaagttaatag 552  Q
     ||| ||||||||    
T  21237986 cccatgttaatag 21237974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 655
Target Start/End: Original strand, 33214463 - 33214676
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |    | ||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||     
T  33214463 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacattagatataaacgtcgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactaacagcac 33214562  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    | ||||||||||| || |||| || ||| |||| | ||  ||||||||||||  |||| | || ||| | ||||  | ||||| ||||||||||| ||||    
T  33214563 caaagttaatagcataaaacggcaaaatgtcta-aaaataatatgataaaacataagtcatcgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgaagccc 33214661  T
Q  641 aaatctttgattgaa 655  Q
    ||||| ||| |||||    
T  33214662 aaatcattggttgaa 33214676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 17693403 - 17693619
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| | |||    
T  17693403 acaaaaacaaaacgatattcattcactcaaattgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaatgtaaagagtgaatctacgaccaaactcacaac 17693502  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgac-ataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||| | || ||| || | |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| | || ||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  17693503 atccaagttaataacatacaacaacaaaaatgcctaca-aataatatgataaaacataagtcatcgaaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacg 17693601  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  17693602 cccaaatcattggttgaa 17693619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 655
Target Start/End: Original strand, 33347318 - 33347526
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | || || || ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  33347318 aaaacaaaacgatatttattcattcaagccgataaaatatataat-caacatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacacctaa 33347416  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
     |||||||| || || |||| |||  ||||| ||  ||||||||||     ||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  33347417 tttaatagcatacaatgacaaaatgcctaca-aataatatgataaattctgagtcaccgaaatacccatgctttcggatccgcaacgtcgacgcctaaat 33347515  T
Q  645 ctttgattgaa 655  Q
    | |||||||||    
T  33347516 cattgattgaa 33347526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 12654372 - 12654295
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaat 519  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  12654372 acaaaaataaaatgatatttattcattcaaatcgatataatacatcatttaacatcgttaaaaacgtaaatgatgaat 12654295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17949827 - 17949718
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | | || ||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  17949827 acaaaatcaaaatgatattcattcattcaaattgagaaattatatcattcaacaccgctaaaaacgtgaagggtgaatctgcgaacaaactcccaacatc 17949728  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    || |||||||    
T  17949727 cacgttaata 17949718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 655
Target Start/End: Original strand, 45445602 - 45445816
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||||  || | ||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||||||| | ||||    
T  45445602 caaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatggattacatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaaca 45445701  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| |||  ||||| ||  |||||||||||   |||| |||  ||| | ||||  | ||||| | |||||||||||||    
T  45445702 tccaagttaatagcataaaacaacaaaatgcctaca-aataatatgataaaatctaagtcaccaaaattcacatgcttccggattttcaacgttgacgcc 45445800  T
Q  640 caaatctttgattgaa 655  Q
    |||||| ||| |||||    
T  45445801 caaatcattggttgaa 45445816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 24186504 - 24186666
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||  ||  ||| || |||  ||| | | | |||||||||||    
T  24186504 aacatcgataaaaacgtaaaagatgaatctgctaacaaactcataacacctaagttaatagtatacgacggcaaaatgcctataaata-atatgataaaa 24186602  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
     | |||| || | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24186603 tttaagtcactgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaa 24186666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 495 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18994272 - 18994201
Alignment:
Q  495 atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacata 566  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  18994272 atcgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaaatcacaacatccatgttaatagcataaaacgacata 18994201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 27110308 - 27110470
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| | ||| |||||| ||  |||||||||||    
T  27110308 aacatcactaaaaatgcaaaagatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgataaaatgtctaca-aataatatgataaaa 27110406  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
       |||| ||   ||||| ||||  | | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27110407 tctaagtcactaaaatacacatgcttccagatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaa 27110470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 569
Target Start/End: Original strand, 7198006 - 7198115
Alignment:
Q  462 attcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataa 559  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||   |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||| || ||    
T  7198006 attcattcaaattgatagaatacatcagaatcaagatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacaacacccaaattaatagcatacaa 7198105  T
Q  560 cgacataatt 569  Q
    ||||| ||||    
T  7198106 cgacaaaatt 7198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 564
Target Start/End: Original strand, 8412312 - 8412437
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||| || ||||  | ||| |||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  8412312 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcaatagattaaatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcaaacaaactcacaac 8412411  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    | ||||||||||||| || |||||||    
T  8412412 acccaagttaatagcataaaacgaca 8412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 17427000 - 17427086
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaaca 528  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||   ||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  17427000 acaaaaacaaaacgatattcattcatttgaattgatagattacaatattcaacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgccaaca 17427086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 28086602 - 28086818
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||| ||||||||  || | |||||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||||| |||      
T  28086602 acaaaaacaaaacgatattcatttattcaaattgatatagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtagatgatgaatatgtgaacaaactcatagt 28086701  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa-ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    |   ||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||| ||||| | || | |||||| |||| | ||||| ||||||||||||     
T  28086702 acttaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaatctaaaatcactgaaataccaatgtttacggatctgcaacgttgact 28086800  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
     ||||||| |||||||||    
T  28086801 tccaaatcattgattgaa 28086818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 645
Target Start/End: Original strand, 40211091 - 40211297
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca---ttcaacatcgctacaaa--tgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataa 537  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||||||| | |     
T  40211091 caaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatataaacatcgctaaaaacgcgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacat 40211190  T
Q  538 catccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    || |||  |||||||| || |||| ||||||   |||| ||  |||||||||||   |||| | || ||||| ||||  | ||||| | |||||||||||    
T  40211191 cacccagattaatagcatacaacggcataatgcttaca-aataatatgataaaatccaagtcaacgaaatactcatgcttccggatctacaacgttgacg 40211289  T
Q  638 cccaaatc 645  Q
    ||||||||    
T  40211290 cccaaatc 40211297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 553
Target Start/End: Original strand, 14544738 - 14544799
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14544738 aacatcgctaaaaacgtaatggatgaatctgcaaacaaactcacaccatccaagttaatagc 14544799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43432002 - 43431937
Alignment:
Q  488 attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  43432002 attcaacatcgctaaaaatgaaatggattaatctgctaacaaattcacaacatccaagttaatagc 43431937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 553
Target Start/End: Original strand, 1809960 - 1810004
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1809960 aaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagc 1810004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 10377973 - 10377773
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||            ||||||| ||| || || | ||||||||||| |||||| | | || |    
T  10377973 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagt------------atcgctaaaaacgtgaatggtgaatctgcgagcaaactcacagcacc 10377886  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||| | |||    
T  10377885 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgtcca 10377787  T
Q  642 aatctttgattgaa 655  Q
    |||| ||| |||||    
T  10377786 aatcattggttgaa 10377773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 550
Target Start/End: Original strand, 34680663 - 34680771
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| ||| ||||||  || |||  |||| ||| |||||||||| ||||| | |||||     
T  34680663 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaattgatataatacattatttaacatcattaaaaacataaatgataaatctgcgaataaactcacaacata 34680762  T
Q  542 caagttaat 550  Q
    |||||||||    
T  34680763 caagttaat 34680771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 507 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36033635 - 36033591
Alignment:
Q  507 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36033635 gtaaaagataaatctgcgaacaaactcataacatccaagttaata 36033591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Original strand, 12243954 - 12244009
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | || |||||||    
T  12243954 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaataacataaaacgaca 12244009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 661 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 15889644 - 15889577
Alignment:
Q  661 atctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||| || || ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15889644 atctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcaaccagaaggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 15889577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 791 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 17949212 - 17949173
Alignment:
Q  791 tatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaa 830  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17949212 tatgtgaaaatcgcttatttagattgaaatagagagaaaa 17949173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Original strand, 23970921 - 23970976
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  23970921 aaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgaca 23970976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 532
Target Start/End: Original strand, 41060103 - 41060146
Alignment:
Q  489 ttcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41060103 ttcaacatcactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 41060146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42046469 - 42046406
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  42046469 tcaatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagc 42046406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 41896757 - 41896691
Alignment:
Q  498 gctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  41896757 gctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgaca 41896691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2120598 - 2120549
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaa 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  2120598 aaaaacaaaatgataattattcatttaaattgatagagtaaatcattcaa 2120549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16644777 - 16644724
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatc-caaatcgatagagtacatcattcaacatc 497  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16644777 aaaacaaaatgatattcattcatttcaaattgatagagtatatcattcaacatc 16644724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17019489 - 17019432
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17019489 tcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 17019432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 528
Target Start/End: Original strand, 17430683 - 17430736
Alignment:
Q  475 gatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaaca 528  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  17430683 gatagattatatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgccaaca 17430736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17549926 - 17549869
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17549926 tcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 17549869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 682 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 34609875 - 34609830
Alignment:
Q  682 gaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34609875 gaacaccgcaacaagacacaaaatcaaataacgtcgcacaagacga 34609830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 25162735 - 25162447
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  25162735 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatccgcgaacaaactcacaacatc 25162636  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  || ||||| |||||||||||||  |    
T  25162635 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccattacctccggatctgcaacgttgacggtc 25162536  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  25162535 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaaacaaatgaacaccgcacgaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 25162447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 442 - 726
Target Start/End: Original strand, 25631301 - 25631587
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  25631301 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 25631400  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc-ttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | ||||| | ||||||||||||||    
T  25631401 caagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcatccggatctacaacgttgacgccc 25631500  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacg 726  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  25631501 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatgaaacaacgccgcacaagacg 25631587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 29503760 - 29503473
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |  |||    
T  29503760 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcaatagattacattattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatatgcgaacatactcacagaatc 29503661  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  29503660 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 29503561  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  29503560 aaatctttgattgaataatcgatc-ttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaagacgac 29503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 32607768 - 32607480
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32607768 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 32607669  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  32607668 caggttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgccc 32607569  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  32607568 aaatctttgattgaacaatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgac 32607480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 46934938 - 46934653
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  46934938 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattgcatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatc 46934839  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgt-cttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||||||||     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||    
T  46934838 caagttaatagcatataacgacatgc---ctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgaactccggatctgcaatgttgacgccc 46934742  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  46934741 aaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacaccgcacaagacgac 46934653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 442 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 12116397 - 12116112
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  12116397 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctaagaacaaactcacaacatc 12116298  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |    
T  12116297 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactagaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctc 12116198  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  12116197 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagac 12116112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 35498975 - 35499261
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  35498975 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagggattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaaaaaacttacaacatc 35499074  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||  |  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  35499075 caaattaatagcatataacgacataa--tgcacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccattgtctccggatttgcaatgttaacgccc 35499172  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  35499173 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 35499261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 36906421 - 36906133
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  36906421 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatc 36906322  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | | || || ||||  ||||||||||||||||    
T  36906321 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaatatctattgcctccggaactgcaacgttgacgccc 36906222  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||  ||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36906221 aaatctttgattgaacaattgatctttcaatatgaatcaaatgaacactacacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 36906133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 44907174 - 44907461
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44907174 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagatattacatcattcaacaacgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 44907273  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata-cccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |  || || ||||| ||||||||||||||||    
T  44907274 caaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatattcgttgcctccggatctgcaacgttgacgccc 44907373  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||  ||||  | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  44907374 aaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaattaaatgaacaccgcacgaagataggaaatcaaacaacg-cgcacaagacgac 44907461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 442 - 711
Target Start/End: Original strand, 50611193 - 50611464
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  50611193 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacccatatcatc 50611292  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||  ||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  50611293 caagttaatagcatataactgtataatgcctacaaaaacatatgataaaatttaagtgacccgaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 50611392  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaaca 711  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  50611393 aaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaggacggaaaatgaaaca 50611464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 3848694 - 3848982
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  3848694 acaaaaataaaaagatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 3848793  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | || ||||| ||||||||||||| ||    
T  3848794 caagttaatagcatatagcggcataatgcctacaaatatatatgataaaattaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtcc 3848893  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| |||| || ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3848894 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagatgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 3848982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 4178864 - 4178577
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    | ||||    
T  4178864 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacactgctaaaaacgtaaaggatgaatctatgaacaaacatgcatcatc 4178765  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||| ||||||||||    
T  4178764 caagttaatagcatataacagcataatgcctagaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaatgttgacgccc 4178665  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  4178664 aaatctttgtttgaataatggatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatgaaacaacgccgcacaagacga 4178577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 447 - 728
Target Start/End: Original strand, 49552004 - 49552287
Alignment:
Q  447 aacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagt 546  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||   | | ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  49552004 aacaaaatgatattcattcattcaaatcataaaattacatcattcaacactgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacagcatccaagt 49552103  T
Q  547 taatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatc 645  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  49552104 taatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatc 49552203  T
Q  646 tttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||  || |||||||||||| || |||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  49552204 tttgattgaataatcgatctttcaatgtgaataaaatgaacaccgcaagaaaacgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 49552287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 17238104 - 17237781
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||    
T  17238104 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggaagaatcagcgaacaaactcacatcatc 17238005  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  17238004 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatataataaaattaaagtgaccggaatatccatagcctccggatctgcaacgttgacgccc 17237905  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || || || ||| | ||||||||   || ||   | ||||||||||| | ||||||||||||||     |||    
T  17237904 aaatctttgattgaataatcgatattttaatatgaatcaaatcaacaccgcgcgaaaacaagatatcaaacaacgccgcacaagacgacaaa-----caa 17237810  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    || |||| ||||||||||||  |||||||    
T  17237809 caaaccaccacacttagatgatgaaatca 17237781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 22803329 - 22803033
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||| | | ||||    
T  22803329 acaaaaataaattgatattcattcatttaaatcgataggttacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggataaatttgtgaacaaactcacagcatc 22803230  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt---------cggatatgcaacgt 632  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  22803229 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgatcggaatacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgt 22803130  T
Q  633 tgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||| | |||  ||||||||||||| | || ||||||||    
T  22803129 tgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacgatacgagaaatcaaacaacgccgcataagacgac 22803033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 442 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 46178867 - 46178613
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| | || ||||||||||| || || ||| ||||| ||| || ||||||||||||| | | ||||    
T  46178867 acaaaaacaaaacgattttcattcattcaaatcgatatattatatcattcaacaccgttaaaaacgtaaaagataaaactgcgaacaaactcacatcatc 46178768  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  46178767 caagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaataaaagtgaccggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgccca 46178668  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaa 695  Q
    | |||||||||||| |||| || |||||| || || ||| ||||||| |||||||    
T  46178667 attctttgattgaataatcaatatttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaa 46178613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 456 - 728
Target Start/End: Original strand, 30648508 - 30648782
Alignment:
Q  456 atatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgt 555  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  30648508 atattcattcattcaaatcgagagattacataattcaacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcat 30648607  T
Q  556 ataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||| | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30648608 ataacgacatattgcctataaaaatatatgataaaattaaagttaccgaaatattcatggccgccggatttgcaacgttgacgtccaaatctttgattga 30648707  T
Q  655 a-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | |||||||||||||| || ||  || |||||||||||| |||| || ||| ||||||||  | |||||||||||    
T  30648708 ataatcgatctttcaatatgaataaaatgaacaccgcaagaagatgggaaagcaaacaacaccgcacaagacgac 30648782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 542 - 768
Target Start/End: Original strand, 36734568 - 36734790
Alignment:
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  36734568 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaaccgaaatactcatgcctccagatctgcaacgttgacgccca 36734667  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaac 740  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||     ||||    
T  36734668 aatctttgattcaataatcgatctttcattatgaatcaaatgaacaccgcaataagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----caac 36734762  T
Q  741 acaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  36734763 acaccatcacatttggatgacgaaatca 36734790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 444 - 725
Target Start/End: Original strand, 39917176 - 39917457
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| |||||||||||  |||||  |||| || ||| || ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  39917176 aaaaataaaatgatattctttcattaaaattgagagatta-atcattcaacacctctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaataaactcacaacatcca 39917274  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  || ||||| |||||||||||||  |||    
T  39917275 agttaatagcatataaaggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacggtcaa 39917374  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  39917375 atctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagac-gaaaatcaaacaacgtcgtacaagac 39917457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 442 - 768
Target Start/End: Original strand, 38854814 - 38855134
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |   |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| | | ||||    
T  38854814 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacgtcattcacc---gctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaaaaaactcacatcatc 38854910  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || | || ||||| ||||||||||||||||    
T  38854911 caagttaataacatataacggtataatgactacaaaaatatatgataaaattaaagtgcccggaatatcaatggcctccggatttgcaacgttgacgccc 38855010  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  | ||||| | || |||||||| | |||||||| || ||     |||    
T  38855011 aaatattcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaggacgggagatgaaacaacgccacacaagacaacgaa-----caa 38855105  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||    
T  38855106 caaaccatcacacttagatgatgaaatca 38855134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 470 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 31794339 - 31794082
Alignment:
Q  470 aaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatt 569  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |   |||||||||||||||| ||||||||| || |     
T  31794339 aaatcgatagaatacattattcaatatcgctaaaaacgtaaagaatgaacctgcgaataaactcact-catccaagttaatagcatataacgacgta-tg 31794242  T
Q  570 tctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttca 668  Q
     |||||  | |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31794241 cctacaacagtatatgataaaattaaactgaccggaatactcatgcctccgaatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatctttca 31794142  T
Q  669 aaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | || || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  31794141 atatgaatcaaatgaacaccgcaacaagatagaaaatcaaacaacgccgcacaaaacgac 31794082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 486 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 14464765 - 14464535
Alignment:
Q  486 tcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatg 585  Q
    |||||||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||  ||||||  ||||| |||||||||    
T  14464765 tcattcaacaccgttaaaaacgtaacggatgaatctgcgaacaaactcagaacatccaagttaatagtatataacagcataatgcctacaaaaatatatg 14464666  T
Q  586 ataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactga 683  Q
    | |||| ||||||||| |||| | ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||    
T  14464665 acaaaattaaagtgactggaacatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatga 14464566  T
Q  684 acaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacg 714  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  14464565 acaccgcacgaagacgggaaattaaacaacg 14464535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 442 - 768
Target Start/End: Original strand, 51202039 - 51202352
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| | || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  51202039 acaaaaacaaaatgatatttattcattcaaatcgagagattacattatttatcaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 51202138  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||          |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  51202139 caagttaa----------cgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgggatattcatcgcctccggatttgcaacgttgacgccc 51202228  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| || || ||| |||||||||||  | || || ||||||||||||| | ||||||||||||||     |||    
T  51202229 aaatctttgattgaattactgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgacgatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaa-----caa 51202323  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    || |||| ||||||||||||  |||||||    
T  51202324 caaaccaccacacttagatgatgaaatca 51202352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 442 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 21488392 - 21488099
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| | |  ||     
T  21488392 acaaaaataaaatgatattcatttattcaaatcaatagagtatatcatttaacatcactaaaaattttaaggatgaatctgcgaataaactcacagtatt 21488293  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcg---gatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |||||||||||| |||||    |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| | |||| || |    ||| | ||||||||||||    
T  21488292 caagttaatagcatataagagtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactagaatgctcatgcctcctccagatctacaacgttgacgc 21488193  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21488192 ccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaataaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaa 21488099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 37169528 - 37169242
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| || |||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |     
T  37169528 acaaaaacaaaacgacattctttcattcaaatcaatagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatccgcgaagaaactcacaacctt 37169429  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| | |    
T  37169428 caagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatcaaattaaaatgattggaatacacatatctccggatctgcaacgttgacgtcta 37169329  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||||| |||||| ||| |||| ||| | || || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  37169328 attctttaattgaataattgatc-ttcgatatgaatcaaatgagcaccgcaacaatacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 37169242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 457 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 21916757 - 21916559
Alignment:
Q  457 tatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgta 556  Q
    |||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  21916757 tattcatttatccaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgagaacaaactcacatcatccaagttaatagcata 21916658  T
Q  557 taacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
     |  | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21916657 caggggcataatatctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggtttccggatctgcaacgttgacgctcaaat-tttgattgaa 21916559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 442 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 25850097 - 25849819
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||           ||||||| |||||||||||| | |||| |    
T  25850097 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcaataaagtacatcattcaacgccgcta-----------gatgaatatgcgaacaaactcacaacacc 25850009  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||   |||| |||||||  |||||  ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  25850008 caagttaatagtatataacgacataatgcttacaaaaatatacaataaagttaaagtgactggaatattcatgtctccggatctgcaacgttgacgctaa 25849909  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaa 730  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||    
T  25849908 aatctttaattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaataaaacaacgctgcacaagacgacaa 25849819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 513 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 42719745 - 42719528
Alignment:
Q  513 gatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca 612  Q
    ||||||||| |||||||||| | |  || ||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  42719745 gatgaatctacgaacaaacttacagtattcaagttaatggcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattca 42719646  T
Q  613 tgtcttcgga-tatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaac 710  Q
     | | || || | ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42719645 cgacctccgaatctgcaacgttgacctccgaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaac 42719546  T
Q  711 aacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| | |||||||||||    
T  42719545 aacgccgcacaagacgac 42719528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 444 - 710
Target Start/End: Original strand, 38440368 - 38440626
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||    
T  38440368 aaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgaaagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgagcaaactcacagcatcca 38440467  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  |          ||||| |||| |||||||| |||||||  ||| | || | ||| ||||| ||||||||||||    
T  38440468 agttaatagcatataacagcataatgcc----------tatgacaaaattaaagtgatcggaatattcatggcctccagatctgcaatgttgacgcccaa 38440557  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaac 710  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||  |||  |||||| ||||||||||    
T  38440558 atctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacattgcacgaagacgaaaaatcaaac 38440626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 442 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 2342747 - 2342533
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| || |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  2342747 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcgtttaacaccgctaaagacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 2342648  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgt-cttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||               |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || || || ||||||||||||||||    
T  2342647 caagtta---------------ataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatatcctccgaatttgcaacgttgacgccc 2342563  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaa 669  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2342562 aaatctttgattgaataatcgatatttcaa 2342533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 443 - 644
Target Start/End: Original strand, 48650527 - 48650730
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaac-atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  48650527 caaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaatatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaaca 48650626  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
     ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||   ||| ||| ||||||||||||| |    
T  48650627 cccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatactcattctttcagatctgcaacgttgacgtc 48650725  T
Q  640 caaat 644  Q
    |||||    
T  48650726 caaat 48650730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 52922909 - 52923124
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  52922909 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 52923008  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||  | |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  52923009 agccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgt 52923107  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  52923108 ccaaatcattggttgaa 52923124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 442 - 644
Target Start/End: Original strand, 21533601 - 21533805
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||| | | |    
T  21533601 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtaaatctgcgaacaaactcacagc 21533700  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  21533701 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgc 21533799  T
Q  639 ccaaat 644  Q
    ||||||    
T  21533800 ccaaat 21533805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 442 - 561
Target Start/End: Original strand, 50194128 - 50194249
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  50194128 acaaaagcaaaatgatattcattcattcaaattgatataatacatcagaatcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaaca 50194227  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacg 561  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  50194228 tccaagttaatagcatataacg 50194249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 552
Target Start/End: Original strand, 628716 - 628828
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  628716 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcaaaatcaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaaca 628815  T
Q  540 tccaagttaatag 552  Q
     ||||||||||||    
T  628816 cccaagttaatag 628828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4711778 - 4711583
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  4711778 acaaaaataaaacgatattcattcaaccaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcactaaaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaac 4711679  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttga 635  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  4711678 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttga 4711583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 35175699 - 35175485
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  35175699 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcataatcaacatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaaca 35175600  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
      |||||||||||| || || |||| |||  ||||| ||  ||||||| |||   || | | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |    
T  35175599 ctcaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctaca-aacaatatgatgaaatataaatcatcagaatactcatgttttcggatctgcaacgttgatgtc 35175501  T
Q  640 caaatctttgattgaa 655  Q
    |||||| |||||||||    
T  35175500 caaatcattgattgaa 35175485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 53807651 - 53807865
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  53807651 acaaaaacaaaatgatattcattcattaaaatcaatagaatacatcagaatcaagatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacacca 53807750  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgata-aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacg 637  Q
     ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  |||||||| || ||||| | ||| |||||| | || |||| ||||||||||||||||||    
T  53807751 cccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgatataatctaaa-tcaccagaatactcttg-cttctggatatgcaacgttgacg 53807847  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
     ||||||| |||||||||    
T  53807848 tccaaatcattgattgaa 53807865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 32701734 - 32701572
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| || |||| || |||  ||||||| | |||| ||||||    
T  32701734 aacatcgctaaaaatataaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttcatagcatacaacggcaaaatgcctacagata-atatcataaaa 32701636  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||  ||| ||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32701635 cttaagtcgccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 32701572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 54149287 - 54149082
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||| | | |    
T  54149287 acaaaaattaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaactaactcacatc 54149188  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||| ||||||||| || |||||||||||  ||||| ||  |||||||||||   |||| |||| |||| |||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  54149187 acccaggttaatagcatacaacgacataatgcctaca-aataatatgataaaatccaagtcaccgaaatagccatgcttccggatctgcaacgttgacgc 54149089  T
Q  639 ccaaatc 645  Q
    |||||||    
T  54149088 ccaaatc 54149082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 552
Target Start/End: Original strand, 46979775 - 46979885
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||  || || ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  46979775 acaaaaacaaaactattttcattcattaaaattgatagagtacattattcaacagcactaaaaacgtaaaggattaatctgcaaacaaactcataacatc 46979874  T
Q  542 caagttaatag 552  Q
    |||||||||||    
T  46979875 caagttaatag 46979885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 6954488 - 6954703
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | |    
T  6954488 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacttcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagc 6954587  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  || |||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||| | ||||||     
T  6954588 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatttgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcagcattgacgt 6954686  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  6954687 ccaaatcattggttgaa 6954703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 21313332 - 21313117
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||  | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | | |    
T  21313332 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgattgagtatatcagatacaaacaccgctaaaaatgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagc 21313233  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  |||||||||||   |||| |||| ||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||     
T  21313232 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatggctaca-aataatatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgatttcagatatgctacgttgacgt 21313134  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| |||||||||    
T  21313133 ccaaatcattgattgaa 21313117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 21431911 - 21431694
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa---catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaata 536  Q
    ||||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||  | |||   |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || | |    
T  21431911 acaaaaataaaacgacattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaatctcaca 21431812  T
Q  537 acatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgac 636  Q
     || ||||||||||| | || |||| || |||  ||||| | | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  21431811 gcacccaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgac 21431713  T
Q  637 gcccaaatctttgattgaa 655  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  21431712 gtccaaatcgttggttgaa 21431694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 38546095 - 38545880
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || | |||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||   | |    
T  38546095 acaaaaacaaaacgatatttattcattcaaatcgatagattacctcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgggaacaaactcccacc 38545996  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||  ||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  38545995 acccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcacctaaattcgcatgttttcggatcttcaacgttgacgc 38545897  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  38545896 ccaaatcattggttgaa 38545880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 46304313 - 46304527
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  46304313 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcagatacaaacat-gctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 46304411  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |  |||||||||||| || |||| ||  ||  ||||| | | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  46304412 actcaagttaatagcatacaacggcaacatgcctacatata-atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaatgttgacgc 46304510  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    | ||||| ||| |||||    
T  46304511 ctaaatcattggttgaa 46304527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 9998763 - 9998589
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | |    
T  9998763 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagc 9998664  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg 614  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  9998663 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg 9998589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 40487621 - 40487416
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || | |||||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||| | |||    
T  40487621 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatttgcgaacaaactcacaac 40487522  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||| | ||||||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| |||||| |||  | ||||| ||||| |||||||     
T  40487521 acccaagttaataacatataacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaatgttgacgt 40487423  T
Q  639 ccaaatc 645  Q
    |||||||    
T  40487422 ccaaatc 40487416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 444 - 655
Target Start/End: Original strand, 45568239 - 45568452
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | ||     
T  45568239 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacatcac 45568338  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||  |||| |||||  | ||||| ||||| ||||||| ||    
T  45568339 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcacccaaatatccatgcttccggatctgcaaagttgacgtcc 45568437  T
Q  641 aaatctttgattgaa 655  Q
    ||||| ||| |||||    
T  45568438 aaatcattgtttgaa 45568452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 40556998 - 40556783
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||  || | |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  40556998 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgacatagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 40556899  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||  ||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||  | ||||| | |||||||||||     
T  40556898 acccaagtgcatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttacaacgttgacgt 40556800  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  40556799 ccaaatcattggttgaa 40556783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43017184 - 43017070
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||    
T  43017184 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgtgaataaactcacaac 43017085  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | | |||||||||||    
T  43017084 acctaagttaatagc 43017070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 655
Target Start/End: Original strand, 7448719 - 7448921
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||    | ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | | || | |||||||||    
T  7448719 gatattcattcattcaaattgatagagtacaacagatataaacatcgataaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaata 7448818  T
Q  552 gcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgat 651  Q
    || || | || || ||| |||||| | | ||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  7448819 gcatacagcggcaaaatgtctacaaata-atatgatgaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggt 7448917  T
Q  652 tgaa 655  Q
    ||||    
T  7448918 tgaa 7448921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 655
Target Start/End: Original strand, 7456861 - 7457063
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat---tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||    | ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | | || | |||||||||    
T  7456861 gatattcattcattcaaattgatagagtacaacagatataaacatcgataaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaata 7456960  T
Q  552 gcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgat 651  Q
    || || | || || ||| |||||| | | ||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  7456961 gcatacagcggcaaaatgtctacaaata-atatgatgaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggt 7457059  T
Q  652 tgaa 655  Q
    ||||    
T  7457060 tgaa 7457063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 10229772 - 10229557
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | |    
T  10229772 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagc 10229673  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||  ||||  || |||| |||||||||  ||     
T  10229672 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaataatcatgcttttggatctgcaacgttatcgt 10229574  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  10229573 ccaaatcattggttgaa 10229557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 33580176 - 33579961
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || | |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||    
T  33580176 acaaaaacaagacgatattcattcattcaaatcgatagattacatcaaatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaac 33580077  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||| ||| | | ||  | ||||| | ||||||||||||    
T  33580076 acccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcaccgaaattcacgtgcttccggatcttcaacgttgacgc 33579978  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  33579977 ccaaatcattggttgaa 33579961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 614
Target Start/End: Original strand, 44959767 - 44959939
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||| | | |    
T  44959767 acaaaaacaaaat--tattcattcattcaaatcgatagaatacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaataaactcacagc 44959864  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg 614  Q
    ||||||||||||||| || || | || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  44959865 atccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatg 44959939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 10108532 - 10108374
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | |    
T  10108532 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagc 10108433  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagt 598  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  10108432 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagt 10108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 562
Target Start/End: Original strand, 47041840 - 47041963
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||  || | ||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |    
T  47041840 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatagatagattacatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcatatc 47041939  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacga 562  Q
    | | ||||||||||| || |||||    
T  47041940 acctaagttaatagcataaaacga 47041963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 24396291 - 24396402
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||  |||| ||||||| || | ||||||  | |||||     
T  24396291 acaaaaacaaaacgatattcattaattcaaattgatagagtacatcattcaatattgctaaaaacttaaatgatgaatttgtgtacaaacacacaacatt 24396390  T
Q  542 caagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||    
T  24396391 caagttaatagc 24396402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 4822098 - 4821888
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| |   ||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| | | || ||    
T  4822098 aaaataaaatgatattcattcattcaaattgataaaatacattagaatcaacattgctaaaaacataaagaatgaatctgcgaacaaactcacatcaccc 4821999  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    ||||||||||| ||||||  || |||  ||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||| || ||||| || |||||||  | ||||    
T  4821998 aagttaatagcatataacagcaaaatgcctaca-aaaaatatgatgaaattaaa-tcaccagaatacccatgcctccggatttgtaacgttggtgtccaa 4821901  T
Q  643 atctttgattgaa 655  Q
    ||| | |||||||    
T  4821900 atcatggattgaa 4821888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 655
Target Start/End: Original strand, 38859979 - 38860121
Alignment:
Q  514 atgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccgga--ataccc 611  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||  |  ||||||    
T  38859979 atgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccaaaatataccc 38860077  T
Q  612 atgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  38860078 atgttttcggatctgcaacgttgacgaccaagtcattggttgaa 38860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 553
Target Start/End: Original strand, 43488386 - 43488496
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacat--cattc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||   || | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | || |    
T  43488386 aaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacattagatacaaacatcgcta-aaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacc 43488484  T
Q  542 caagttaatagc 553  Q
    ||| ||||||||    
T  43488485 caaattaatagc 43488496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 558 - 687
Target Start/End: Original strand, 6910603 - 6910731
Alignment:
Q  558 aacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-a 656  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||| |  || | |||| ||||||| ||||||| |||||||| |    
T  6910603 aacgacataatgactgtagaaatatatgataaaattaaattgactggaata--catgtctccatatctacaacattgacgctcaaatctatgattgaata 6910700  T
Q  657 atcgatctttcaaaataaaacaactgaacac 687  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  6910701 atcgatctttcaatatgaatcaaatgaacac 6910731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 10233366 - 10233173
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| | || |||  |||||| ||||| | |||||||||| | | |    
T  10233366 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcaaatacaaacatagataaaaacataaagggtgaatgtacgaacaaactcacagc 10233267  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgtt 633  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||    
T  10233266 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgtt 10233173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 16235671 - 16235507
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-a 588  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| |   ||||||| |    
T  16235671 tcaatatcgctaaaaacgtatagggtaaatctgcgaacaaactcacaccatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-agtaatatgatga 16235573  T
Q  589 aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||| | ||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16235572 aatctaaa-tcaccagaatacccatg-cttcttgatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 16235507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27856410 - 27856347
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  27856410 tcaatatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagc 27856347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 661 - 731
Target Start/End: Original strand, 4396362 - 4396432
Alignment:
Q  661 atctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||||| || || |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4396362 atctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaa 4396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 564
Target Start/End: Original strand, 9797326 - 9797451
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||  || | ||||||||||  || ||||||| ||||| | | |||||||| | | |    
T  9797326 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatatagtacatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatatacaaacaaactcacagc 9797425  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    | ||||||||||||| || |||||||    
T  9797426 acccaagttaatagcatacaacgaca 9797451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Original strand, 20464757 - 20464803
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca 488  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20464757 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatca 20464803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 30830268 - 30830178
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | |||||  ||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30830268 acaaaaacaaaacgatattcattctttcaaattcatatagtacatcgttcaacatccttaaaaatgtaaaagatgaatatgcgaataaact 30830178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 681 - 731
Target Start/End: Original strand, 24396526 - 24396580
Alignment:
Q  681 tgaacaccgcaacaagacg----gaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24396526 tgaacaccgcaacaagacggacggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacaaa 24396580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 530
Target Start/End: Original strand, 6823407 - 6823487
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaa 530  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||    
T  6823407 aaaatgatattcattcatttaaattgatagattacattattaaacatcgctaaaaacctaaatgatgaatctgtgaacaaa 6823487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14859732 - 14859661
Alignment:
Q  493 acatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  14859732 acatcgctaaaaatgtatagggtgaatctgctaacaatctcacaacacccaagttaatagcatacaacgaca 14859661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 19619952 - 19619795
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaa 595  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  |||||||||||   |    
T  19619952 tcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgatcaaactcaaaacatcttagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaatcta 19619854  T
Q  596 agtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||| |||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  19619853 agtcaccgaaattctcatg-cttcggatctacaacgttgacacctaaatcattgattgaa 19619795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 551
Target Start/End: Original strand, 20911398 - 20911493
Alignment:
Q  456 atatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaata 551  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||| | | ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20911398 atattcattcattcaaatagacagagtgcattattcaacatcactaaaaacgtaaaagtttaacatgcgaacaaacttacaacatccaagttaata 20911493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Original strand, 29776428 - 29776483
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  29776428 aaaggatgaatctgcgatcaaactcacaacaaccatgttaatagcgtaaaacgaca 29776483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 36461229 - 36461343
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |    
T  36461229 acaaaatcaaaacaatattaattcattcaaattgatagagtacattagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgctaacaaactcacagc 36461328  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    |  ||||||||||||    
T  36461329 actcaagttaatagc 36461343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 40365600 - 40365545
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  40365600 aaaggatgcatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgaca 40365545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42460994 - 42460931
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||    
T  42460994 tcaatatcgctataaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagtacccaagttaatagc 42460931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 53508467 - 53508404
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  53508467 tcaatatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaacatccaagttaatagc 53508404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 788 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 2342450 - 2342408
Alignment:
Q  788 atatatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaa 830  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2342450 atatatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaa 2342408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 605 - 655
Target Start/End: Original strand, 23799867 - 23799917
Alignment:
Q  605 aatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23799867 aatactcatgttttcggatctgcaacgttgacgccgaaatcattgattgaa 23799917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Original strand, 36910558 - 36910604
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca 488  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36910558 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatca 36910604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Original strand, 26320388 - 26320445
Alignment:
Q  78 aattttgtttagttggctagtatgtgtggataagggagtagatgagattaatgtaatc 135  Q
    ||||||| |||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26320388 aattttgattagttggttattacctgtgtataagagagtagatgagattaatgtaatc 26320445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 508 - 561
Target Start/End: Original strand, 30293348 - 30293401
Alignment:
Q  508 taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacg 561  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  30293348 taaaagatgaatctgcaaataaactcatgacatccaagttaatagcatataacg 30293401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 532
Target Start/End: Original strand, 32881159 - 32881243
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||| |||  |||| | | ||||||||||||||||    
T  32881159 aaaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcataatcaaaatcgctaaaaacataaatggtaaatctgcgaacaaact 32881243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 664 - 713
Target Start/End: Original strand, 46322356 - 46322405
Alignment:
Q  664 tttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    |||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46322356 tttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaacaagacggaaaaacaaacaac 46322405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 78)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 3271177 - 3271465
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3271177 acaaaaacaaaatgataatcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcataacatc 3271276  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||| ||    
T  3271277 caagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggtctcctgatctgcaacgttgacgtcc 3271376  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  3271377 aaatctttgattaaataatggatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 3271465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 34882021 - 34881734
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  34882021 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatc 34881922  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  34881921 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatataattaaagtga-cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 34881823  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  34881822 aaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 34881734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 444 - 708
Target Start/End: Original strand, 20257473 - 20257738
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||    
T  20257473 aaaaacaaaacgatattcattaattcaaatcgatagattatatcattcaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatcca 20257572  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||| ||||    
T  20257573 agttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccacgtttccggatctacaacgttgacgcgcaaa 20257672  T
Q  644 tctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaa 708  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20257673 tctttgattgaataatcgatacttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaa 20257738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 19259587 - 19259874
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| | | ||||    
T  19259587 acaaaaacaaaatgatatttatccattcaaatcgagagattacatcgttcaacatcgctaaaaacgtaaagaataaatctgcgaacaaactcacagcatc 19259686  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  19259687 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctttggatctgcaacgttgacgccc 19259786  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||  |||||||  |||||||||||  | |||||||||||    
T  19259787 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcacgaagacgg-gaatcaaacaacaccgcacaagacgac 19259874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 781692 - 781422
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  781692 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtgaaggatgaatctgcgaatatactcacaacatc 781593  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt-cggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  781592 caagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttgacgctc 781493  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaaca 711  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||||| || ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  781492 aaatttttgattgaataattgatc-ttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaaca 781422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 443 - 728
Target Start/End: Original strand, 18677242 - 18677528
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  18677242 caaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaa-ggatgaatctgcgaacaaacacacaacatcc 18677340  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |    
T  18677341 aagttaatagcatataacggcataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggatctgcaatgttgacgccaa 18677440  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | | ||||||| || |||||||||||||| || || ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18677441 attatttgattaaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtacgaagacggaaaatcaaacaacgtcccacaagacgac 18677528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 27266634 - 27266922
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  27266634 acaaaaacaaaatggtattcgttcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 27266733  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||||||  |    
T  27266734 caagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacggtc 27266833  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||  | | |||||||||||    
T  27266834 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacagtgccgcacaagacgac 27266922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 709
Target Start/End: Original strand, 21060058 - 21060326
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  21060058 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacatactcacaacatc 21060157  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  21060158 caagttgatagaatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 21060257  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaa 709  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |  ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  21060258 aaatctttgattgaataatcgatc-ttcaaaatgaattagatgaacactgcaagaagacgggaaatcaaa 21060326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 41184216 - 41184503
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  41184216 acaaaaacaaaatgatatgcattcattcaaatcgagagattacatcatt-aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 41184314  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  |  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  41184315 caagttaatagcatataacggcataatgccggcaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 41184414  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||  ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  41184415 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaacgaacaccacacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 41184503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 16981596 - 16981306
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16981596 acaaaaataaaatgatattcatttattcaaatcgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 16981497  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaa--atatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  || ||||| ||||||| ||||||    
T  16981496 caagttaatagcatataacgatataatgcctacaaaaatatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgatgacgc 16981397  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  16981396 ccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaaggaacaccgcaagaagacggaaaattaaacaatgccgcacaagacgac 16981306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 4954296 - 4954008
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  4954296 acaaaaataagatgatatttattcattcaaatcgagagattacatcgttcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatc 4954197  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| | || || || ||||||||||||| ||    
T  4954196 aaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgtcc 4954097  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| |||  |||||||| | |||||||||||    
T  4954096 aaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagaaaacaacgccgcacaagacgac 4954008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 42580178 - 42579904
Alignment:
Q  456 atatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgt 555  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   |||||||| | | ||| |||||||||||| |    
T  42580178 atattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctataaacaaactcacagcattcaagttaatagcat 42580079  T
Q  556 ataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42580078 ataacggcataatatctgcaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 42579979  T
Q  655 a-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||||||||||| || || ||  || ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42579978 ataatcgatctttaaatatgaataaaatgaacactgcacgaagacagaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 42579904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 444 - 711
Target Start/End: Original strand, 35475115 - 35475383
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  35475115 aaaaataaaatgatattcattcattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatatacgaacatactcacaacatcca 35475214  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  35475215 agttaatagcatataacgacgttatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcttctgaatctgcaacgttgacgcccaa 35475314  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaaca 711  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  35475315 atctttgattgaataatcgatcttt-aatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaaca 35475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7247263 - 7246975
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  7247263 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 7247164  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||  |    
T  7247163 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttc 7247064  T
Q  641 aaatctttgattg-aaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||| |  ||  || |||||||||||| ||||| | |||  ||| |||| | |||||||||||    
T  7247063 aaatctttgattgtataatcgatctatcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacaggaaaaaaaataacgccgcacaagacgac 7246975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 43149031 - 43148747
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43149031 acaaaaatacaatgatattcattcattcaaatcgagagattatatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 43148932  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || | ||| ||||||||||| | ||    
T  43148931 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccagatctgcaacgttgaggtcc 43148832  T
Q  641 aaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||| |  ||  || |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||    
T  43148831 aaatctttga---ataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaacgcaagaagacgggaaagcaaacaacaccgcacaagacgac 43148747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 7150110 - 7150398
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||| | | ||||    
T  7150110 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattatatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaacaaatctgcgaacaaactcacagcatc 7150209  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  7150210 caaattaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccgaaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtcc 7150309  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7150310 aaatctttgattgaataattgatctttcaatgggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 7150398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 30298513 - 30298188
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  30298513 acaaaaacaaaatgatattcatttatttaaatcgagagactatatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacatactcacaacatc 30298414  T
Q  542 caagttaatagc--gtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    ||||||||||||   ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | || | ||| ||||||||||||||    
T  30298413 caagttaatagcatatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatggcctccagatctgcaacgttgacgc 30298314  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaacc 737  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||     |    
T  30298313 ccaaatctttgattgaataatcaatc-ttcaatatgaatcaaataaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaa-----c 30298220  T
Q  738 aacacaccatcacacttagatgtcgaaatcat 769  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30298219 aacaaaccaccacacttagatgatgaaatcat 30298188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7242088 - 7241799
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  7242088 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 7241989  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagt-gaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||      
T  7241988 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtt 7241889  T
Q  640 caaatctttgattg-aaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| |  ||  || |||||||||||| ||||| | |||  ||| |||| | |||||||||||    
T  7241888 caaatctttgattgtataatcgatctatcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacaggaaagaaaataacgccgcacaagacgac 7241799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 442 - 830
Target Start/End: Original strand, 2057609 - 2057996
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgat-----agagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaata 536  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |      ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||| | |    
T  2057609 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcaaattaagagaatacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatgtgcgag-aaactcaca 2057707  T
Q  537 acatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttga 635  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||    
T  2057708 acatctaagttaactgcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattatagtgaccggaatatccatggcatctggatctgcaacgttga 2057807  T
Q  636 cgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaatta 734  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||       
T  2057808 cgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcgcaagacgacgaa--- 2057904  T
Q  735 accaacacaccatcacacttagatgtcgaaatcatgaggnnnnnnncctagatatatatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaa 830  Q
      ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| | |       |||||  || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2057905 --caacaaaccaccacacttagatgatgaaatcataaagaaaaaaacctag--atctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaa 2057996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 445 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 15571208 - 15570958
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15571208 aaaacaaaacgatattcattcattcaaatccatagattacatcattcaacaccactaaaaacataatggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaa 15571109  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||| |||| |    
T  15571108 gttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatacacatgactccggatgtgcaacgttaacgtccaatt 15571009  T
Q  645 ctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaa 695  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||| || || ||| |||||||| ||||||    
T  15571008 atttgattgaataatagatc-ttcaatatgaatcaaatgaacaccacaacaa 15570958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 10649946 - 10649660
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||    
T  10649946 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgttaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaac--actcacaacatc 10649849  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||| | ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  10649848 caatttaataccatataacggcataatgcctacaaaaacatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 10649749  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||| |||||||||| |||  || ||||   |  || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  10649748 aaatatttgattgaataataaatttttctgtaagaatcaaatgaacaccgcacgaagacggtaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 10649660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 771
Target Start/End: Original strand, 7612834 - 7613159
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || ||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||     
T  7612834 acaaaaacaaaacgatattcatttattcat-tcgatagagttcatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacatt 7612932  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgacc-ggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  || ||   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  7612933 caatttaatagcatagaacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaacttggccaaaaatactcatgccttcggatctgcaatgttgacaccc 7613032  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
     ||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||| ||     |||    
T  7613033 caatcttaaattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacgagaaatcaaacaacattgcacaagacgacgaa-----caa 7613127  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatcatga 771  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  7613128 cacaccaccacactcagatgacaaaatcatga 7613159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 19280712 - 19281008
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatg---------aatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||          ||||||||||||||||    
T  19280712 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacattattcaacaccgctaaaaacataaaggatataaatgataaatctgcgaacaaact 19280811  T
Q  533 aataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacg 631  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | || ||||| |||||||    
T  19280812 cacaacatccaagttaatagcatataacg-cataatgcctacaaaaatatatgataatattaaagtcaccggaatatccatagcctccggatctgcaacg 19280910  T
Q  632 ttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  || ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||   |||||||||||    
T  19280911 ttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacactgcaagaagatggaaaagcaaacaacgctgcacaagacgac 19281008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 442 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 27752229 - 27751961
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| | | ||||    
T  27752229 acaaaaacgaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctacgaacatactcacagcatc 27752130  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | || | ||| |||||||||||| |||    
T  27752129 caagttaatagcatataatggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccagatctgcaacgttgacaccc 27752030  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaa 709  Q
    | ||||||||| ||| |||| ||  ||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27752029 atatctttgatcgaataatcaat-attcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaa 27751961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 442 - 712
Target Start/End: Original strand, 7886715 - 7886985
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||| ||||||||| | |  |||    
T  7886715 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaat-gagagattacatcattcaacaccgctaagaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagtatc 7886813  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||| | |||     
T  7886814 caagttaatagcatataacagaataatgcctaca-aaaaatatgataaaactatagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttaatgcca 7886912  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7886913 aaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcagacaaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaa 7886985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 455 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11768290 - 11768077
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcg 554  Q
    |||||| ||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||     
T  11768290 gatattcattcattaaaatcgatatgttacattattcaacatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagataatagca 11768191  T
Q  555 tataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||| || | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11768190 tataacggcataatggctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccataata--catgcctccagatttgcaacattgacgctcaaatctttgattga 11768093  T
Q  655 a-aatcgatctttcaa 669  Q
    | ||||||||||||||    
T  11768092 ataatcgatctttcaa 11768077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 442 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 30299148 - 30298976
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| | | || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  30299148 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaatcgagatattaaatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacatactcagaacatc 30299049  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg 614  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  30299048 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatg 30298976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 444 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 28235891 - 28235566
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacat---cgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||| | ||||||||||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  28235891 aaaaacaaaatgatattcattcatataaattgagagattgcatcattcaacaataccgcta-aaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacat 28235793  T
Q  541 ccaagttaatagc--gtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| | || | ||| | || | ||||||    
T  28235792 ccaagttaatagcatatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcgaaatatccatggcctccagatctacatctttgacg 28235693  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaac 736  Q
    ||  |||||||||||||| | | |||||||||| |  ||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |         
T  28235692 cctgaatctttgattgaatacttgatctttcaataagaataaaatgaacaccgcaagaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaga----- 28235598  T
Q  737 caacacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  28235597 caacaaaccatcacacttagatgatgaaatca 28235566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 455 - 706
Target Start/End: Original strand, 22978712 - 22978964
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcg 554  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| |||||| ||||| | | |||||||  |||||||     
T  22978712 gatattcattcattctaatcgataaagtacatcattcaacactgctaataacgtaaaggatgaatttgcgaataaacttaaatcatccaaactaatagca 22978811  T
Q  555 tataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22978812 tataacggcataatggctacaaaaatattttataaaatgaaagtgaccgaaatacccatgcctcagaatctgcaatgttgacgcccaaatctttgattta 22978911  T
Q  655 a-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatc 706  Q
    | |||   |||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22978912 ataatttttctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaaaacggaaaatc 22978964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26578456 - 26578268
Alignment:
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||||    
T  26578456 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatattcattgcttccggatctgcaacattgacgccc 26578357  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26578356 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacactgcacgaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 26578268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 442 - 590
Target Start/End: Original strand, 43008090 - 43008238
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  43008090 acaaaaacaaaataatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaggataaatttgagaacaaactcataacatc 43008189  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaa 590  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  43008190 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 43008238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 555 - 713
Target Start/End: Original strand, 43261707 - 43261867
Alignment:
Q  555 tataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattg 653  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43261707 tataacgacataatgcctacaaaaatatatgataacattaaagtgaccggaatatccatgaccttcggatctgcaactttgactcccaaatctttgattg 43261806  T
Q  654 aa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    || ||||||| |||||| || || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43261807 aataatcgatttttcaatatgaatcaaataaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaac 43261867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 536 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 42886688 - 42886494
Alignment:
Q  536 aacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat---gtcttcggatatgcaacgt 632  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  42886688 aacattcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatattataaaattaaattgaccggaata-ccatgccgtcttcggatctgcaacgt 42886590  T
Q  633 tgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  42886589 tgacg-tcaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatcaaatgaacactgcaacaaggcgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 42886494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 622 - 723
Target Start/End: Original strand, 27576306 - 27576408
Alignment:
Q  622 atatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcac 720  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27576306 atatgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatataaaataaatgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgtcgcac 27576405  T
Q  721 aag 723  Q
    |||    
T  27576406 aag 27576408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 9113517 - 9113732
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  9113517 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcagaac 9113616  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||  | |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| |||| | |||  | ||||| |||||||||||||     
T  9113617 acccaagttaatagcatacaacggaaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatatctatgcttccggatctgcaacgttgacgt 9113715  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  9113716 ccaaatcattggttgaa 9113732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13007525 - 13007310
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | |    
T  13007525 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagc 13007426  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  13007425 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgt 13007327  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  13007326 ccaaatcattggttgaa 13007310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 34945689 - 34945474
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  34945689 acaaaaataaaacgatattctttcattaaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 34945590  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| |||  ||| | ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  34945589 acccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctata-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgt 34945491  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  34945490 ccaaatcattggttgaa 34945474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 8088005 - 8088219
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||||  ||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8088005 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgatagaatgcatcagattcaagattgctaaaaaggtaaaagatgaatctgcgaacaaactcataaca 8088104  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgata-aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
     ||||||||||||| || || | || |||  ||||| ||  |||||||| || ||||| | ||| |||||| | ||| || |||| |||||||||||||     
T  8088105 cccaagttaatagcatacaaaggcaaaatgcctaca-aataatatgatataatctaaa-tcaccagaatactcttgtttttggatctgcaacgttgacgt 8088202  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| |||||||||    
T  8088203 ccaaatcattgattgaa 8088219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 445 - 553
Target Start/End: Original strand, 8771959 - 8772067
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  8771959 aaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaggatgaatttgcaaacaaactcatagcatccaa 8772058  T
Q  545 gttaatagc 553  Q
    |||||||||    
T  8772059 gttaatagc 8772067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 13422228 - 13422014
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattca---acatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||  |   ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  13422228 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgataga-tacatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaac 13422130  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||||| || ||||  | |||  ||||| | | |||||||||||   |||| |||| ||||| |||| |||| | || |||||| ||||||    
T  13422129 atccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacatata-atatgataaaatataagtcaccgaaatacacatg-cttcagaatctgcaacattgacg 13422032  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13422031 cccaaatcattgattgaa 13422014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 11976727 - 11976839
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11976727 acaaaaataaaatgatattaattcattaaaattgatagattacatcagatgcaaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaac 11976826  T
Q  539 atccaagttaata 551  Q
    |||||||||||||    
T  11976827 atccaagttaata 11976839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 649
Target Start/End: Original strand, 14082188 - 14082397
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||  || | |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||   | |    
T  14082188 acaaaaacaaaacgatatccattcattcaaatcgatagagcacatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcccatc 14082287  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |  | ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  14082288 atcgaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgc 14082386  T
Q  639 ccaaatctttg 649  Q
    |||||||||||    
T  14082387 ccaaatctttg 14082397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 24229576 - 24229791
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca---ttcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| | | |    
T  24229576 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaagagtgaatctgcgaacaaactcacagc 24229675  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| || | |||| |||||    ||||| |||||| ||||||     
T  24229676 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcacagaaatatccatgctaccggatctgcaacattgacgt 24229774  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  24229775 ccaaatcattgcttgaa 24229791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 449 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 25980446 - 25980239
Alignment:
Q  449 caaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaag 545  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | || |||||    
T  25980446 caaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcagatgcaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacatcacccaag 25980347  T
Q  546 ttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatc 645  Q
    |||||||| ||||||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| | || ||||||||||  | || || |||||| ||||||||||||||    
T  25980346 ttaatagcatataacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtca-cgaaatacccatgcttccgaatctgcaactttgacgcccaaatc 25980249  T
Q  646 tttgattgaa 655  Q
     ||| |||||    
T  25980248 attggttgaa 25980239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 38598078 - 38597878
Alignment:
Q  457 tatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  38598078 tattcattcattcaaattgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagc 38597979  T
Q  554 gtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattg 653  Q
     || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| || | ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  38597978 atacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttg 38597880  T
Q  654 aa 655  Q
    ||    
T  38597879 aa 38597878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 6011930 - 6012145
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  6011930 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatc 6012029  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||  | |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||| || | ||||||||||  | ||||| | |||| ||||||     
T  6012030 acccaagttaatagcataaaacggtagaatgcctaca-aataatatgatcaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctacaacattgacgt 6012128  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  6012129 ccaaatcattggttgaa 6012145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 13468901 - 13468619
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||| |||  |||| ||||||| | |||||||||| | || |||    
T  13468901 acaaaaacaaaacaatattcattcaatcaaatcaataaagtacaccattcaacatatctaaaaacataaatgatgaatttacgaacaaactcacaaaatc 13468802  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
     ||||||||||| ||| |||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||||| |  |||||  |||| | || || |||||||||||| | |     
T  13468801 aaagttaatagcatatgacgacaaaatgcctacacata-atatgataaaactaaagtgatcaaaatactgatgtttccgaatctgcaacgttgacactcg 13468703  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    |||| ||||||||| || |||||||   | |  || ||| ||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13468702 aatcattgattgaataaccgatctt---ataagaaccaaatgaacaccgaaacaagactagaaatcaagcaacgtcacacaagacga 13468619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 490 - 655
Target Start/End: Original strand, 2979149 - 2979313
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-a 588  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||| |    
T  2979149 tcaatatcgctaaaaatgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcacaatgcctaca-aataatatgatga 2979247  T
Q  589 aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || ||||| | ||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2979248 aatctaaa-tcaccagaatacccgtg-cttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 2979313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Original strand, 8096293 - 8096404
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacat-cattc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | || |    
T  8096293 aaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaccacc 8096392  T
Q  542 caagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||    
T  8096393 caagttaatagc 8096404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 564
Target Start/End: Original strand, 8984781 - 8984902
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  8984781 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcaaaatcaacatcgctagc---gtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaaca 8984877  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  8984878 tccaagttaatagtatataacgaca 8984902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 26877901 - 26878115
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattca---acatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||  |   |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26877901 acaaaatcaaaacgatattcattcattcgaattgatagagtacatcatatacaaacattggtaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaac 26878000  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| | |  ||||| ||  |||||||||||   |||| |||  |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  26878001 atccaagttaatag-atacaacgacaaagtgcctaca-aataatatgataaaatctaagtcaccaaaatacccatg-cttctggatctgcaatgttgacg 26878097  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
    |||||||| |||||||||    
T  26878098 cccaaatcattgattgaa 26878115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 619 - 728
Target Start/End: Original strand, 36344444 - 36344554
Alignment:
Q  619 cggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaaaa-tcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtct 717  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| || || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |     
T  36344444 cggatctgcaatgttcacgcccaactctttgattgaaaaattaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaaaacggaaaatcaaacaacgccg 36344543  T
Q  718 cacaagacgac 728  Q
    |||||||||||    
T  36344544 cacaagacgac 36344554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 582 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 6446036 - 6445951
Alignment:
Q  582 tatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatcttt 666  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6446036 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgtcttcgaaactgcaacgttgacgtctaaacctttgattgaataatcgatcttt 6445951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 564
Target Start/End: Original strand, 10332340 - 10332464
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||    
T  10332340 acaaaaacaaaacaatatccattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatca 10332439  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||    
T  10332440 cccaagttaatagcatataaagaca 10332464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 10723057 - 10722842
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaac-atcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||  ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||    
T  10723057 acaaaaacaaaacgatatttattcattcaaattgatcgagtacatcaaatacaaatatcgctaaaaatgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacaac 10722958  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |  |||||||||| | || | ||  | |||  ||||| | | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||  || |||| | ||||||||||||    
T  10722957 actcaagttaataacatacagcggaaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttttggatctacaacgttgacgc 10722859  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| |||||||||    
T  10722858 ccaaatcattgattgaa 10722842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 14726253 - 14726365
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || | |||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| | | |    
T  14726253 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacagc 14726352  T
Q  539 atccaagttaata 551  Q
    |||||||||||||    
T  14726353 atccaagttaata 14726365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 30371925 - 30371844
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgc 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  30371925 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatagagagattacatcattaaacaccgctaaaaacgtaagggatgaatctgc 30371844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 551
Target Start/End: Original strand, 41418204 - 41418312
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    |||   ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  41418204 acaaaaacaaaacgatatt-attcattcaaattgatagagtacatcatttaacatcgtggaaaactaaaaagatgattctgcgaacaaactcacaacatc 41418302  T
Q  542 caagttaata 551  Q
    ||||||||||    
T  41418303 caagttaata 41418312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 623
Target Start/End: Original strand, 41418605 - 41418678
Alignment:
Q  550 tagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggat 623  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  41418605 tagcatataacgacataatgtccacaaaaatatatgataaaattaaagtgagcggaatatccatgtctccggat 41418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 625 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 30371846 - 30371746
Alignment:
Q  625 tgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaag 723  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||  |||| || ||||||||||||| | ||||||    
T  30371846 tgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaattaaatgaacaccgcacgaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaag 30371747  T
Q  724 a 724  Q
    |    
T  30371746 a 30371746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 37483347 - 37483274
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaat 519  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  37483347 acaaaaacaaaatgatattcattca----aatcgatagattacatcattcaacatcgctaaaaacataaaggatgaat 37483274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26825726 - 26825558
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | |    
T  26825726 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtatatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagc 26825627  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaata 608  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  26825626 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaata 26825558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Original strand, 35921037 - 35921091
Alignment:
Q  674 aaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35921037 aaacaaatgaacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacaacgtctcataagacgac 35921091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Original strand, 36057103 - 36057193
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||  || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36057103 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgatataatacattatttaacatcattaaaaacgtaaatgataaatctgcgaacaaact 36057193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38007653 - 38007539
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||  || | |||||||||| ||| ||||| | ||||| || ||||||||| | | |    
T  38007653 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagattacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgtgaacaaactcacagc 38007554  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||||||||||    
T  38007553 acccaagttaatagc 38007539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 517 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 41630720 - 41630583
Alignment:
Q  517 aatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtc 616  Q
    |||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |||||| | | |||||||||||   |||| || | ||||| |||| |    
T  41630720 aatctgtgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata-atatgataaaatctaagtcacggaaatacacatg-c 41630623  T
Q  617 ttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41630622 ttctggatgtgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 41630583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 568
Target Start/End: Original strand, 27576160 - 27576282
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatg-taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||||||| || |||||  |||  ||||| || |||||||||| | |||||    
T  27576160 acaaaaacaaaacaatattcattcattcaaatcgatagag----tcattcaacatcgataaaaatgaaaaaaaatgaagctacgaacaaactca-aacat 27576254  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  27576255 ccaacttaatagcatataaagacataat 27576282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27241446 - 27241402
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27241446 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccacgttaatagc 27241402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 508 - 655
Target Start/End: Original strand, 31391614 - 31391760
Alignment:
Q  508 taaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaat 607  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||   | |||  ||||| | | ||||||||||||  |||| |||| |||    
T  31391614 taaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacatata-atatgataaaacctaagtcaccgaaat 31391712  T
Q  608 acccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31391713 actcat-ccttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaa 31391760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 553
Target Start/End: Original strand, 42505141 - 42505185
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  42505141 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 42505185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14211472 - 14211409
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  14211472 tcaatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagc 14211409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Original strand, 19103310 - 19103373
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  19103310 tcaatatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcatagcaccaaagttaatagc 19103373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 39591424 - 39591369
Alignment:
Q  509 aaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||    
T  39591424 aaaggttgaatctgcgaacaaactcataacatccatgttaataacataaaacgaca 39591369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 6217053 - 6216979
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||  | || || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6217053 atatgataaaatttaagtcaccgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 6216979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 655
Target Start/End: Original strand, 19100552 - 19100626
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||| || |||||||| |  |||||| |||||||||    
T  19100552 atatgataaaattaaagtgactggaatactcatgtcttaagatctggaacgttgatgttcaaatcattgattgaa 19100626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 731
Target Start/End: Original strand, 1582148 - 1582189
Alignment:
Q  690 caacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1582148 caacaagacgaaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaa 1582189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 1602667 - 1602626
Alignment:
Q  690 caacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1602667 caacaagacgaaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaa 1602626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 39567490 - 39567351
Alignment:
Q  515 tgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa-ctaaagtgaccggaatacccat 613  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||| | || ||||||| ||| |||||| | | ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  39567490 tgaatctacgaacaaactcacaacacccaaggtaataacatacaacgacaaaatgtctacaaata-atatgatgaaatctaaa-tcaccagaatacccat 39567393  T
Q  614 gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || |  |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  39567392 gtttctggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgattgaa 39567351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Original strand, 7880879 - 7881165
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||    
T  7880879 aaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaagtcacagcatcca 7880978  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  7880979 agttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaa 7881078  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7881079 atctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaattgaacaccgcatgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 7881165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 17237061 - 17237348
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  17237061 acaacaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacacactcacaacatc 17237160  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||| |||    
T  17237161 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacaccc 17237260  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  17237261 aaatctttgattgaataatcgatc-ttcaaaatgaatcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatccaacagcgccgcacaagacgac 17237348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 25064538 - 25064250
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25064538 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 25064439  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | || ||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |    
T  25064438 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgccgggcatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctc 25064339  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  25064338 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaaaacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 25064250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 12653246 - 12652959
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12653246 acaaaaacaaaatgatattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtacaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 12653147  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || | ||| ||||||||||||| ||    
T  12653146 caagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaattaaagcgaccggaatatccatgacctccagatctgcaacgttgacggcc 12653047  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12653046 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacga 12652959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 35001892 - 35001604
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  35001892 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcaaaagattacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatc 35001793  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  35001792 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatgaccttcggatctgcaacgttgacgtcc 35001693  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  35001692 aaatctttgattgaataattgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 35001604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Original strand, 7875821 - 7876107
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||    
T  7875821 aaaaacaaaatgatattcattcatttaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaagtcacagcatcca 7875920  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  7875921 agttaatagcatataactgcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaa 7876020  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || || ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7876021 atctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaatcaattgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 7876107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 442 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 8497270 - 8496985
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  8497270 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 8497171  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctac-agaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  | || |||| |||||||||| ||||    
T  8497170 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcatcaggatctgcaacgttgccgcc 8497071  T
Q  640 caaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaaga 724  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  8497070 caaatctttgattgaagaatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaaga 8496985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 4984342 - 4984630
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  4984342 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacatcatc 4984441  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  || || || ||||||||||| ||||    
T  4984442 taagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatgacctccgaatctgcaacgttgatgccc 4984541  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  4984542 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacacctcacgaagacgggaaatcaaacaacaccgcacaagacgac 4984630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 23947092 - 23947381
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  23947092 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacgccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatc 23947191  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa-ctaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| | || ||||| |||||| ||||||||    
T  23947192 caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaatttaaagtgaccagaatatccatggcctccggatctgcaacattgacgcc 23947291  T
Q  640 caaatctttgatt-gaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  23947292 caaatcgttgattggattatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 23947381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 442 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 4088762 - 4088475
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  4088762 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgagagattatttcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatc 4088663  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  4088662 caagttaatggcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgccc 4088563  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |  || ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  4088562 aaatctttgattgaacaatcgatctttctgtaagaatcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacga 4088475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 443 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 4468853 - 4468572
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcc 542  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |      ||    
T  4468853 caaaaacaaaatgatattcattcatttaaatcgagagtttacatcattcaacaccgctaaaagtgtaaaggatgaatctgcgaacaaactca------cc 4468760  T
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgccca 641  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| |||    
T  4468759 aagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatgacctctggatctgcaacgttgacggcca 4468660  T
Q  642 aatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  4468659 aatctttgattgaataatcgatccttcaatataaatcaaatgaacactgcatgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgac 4468572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 16419460 - 16419172
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||      
T  16419460 acaaaaataaaatgatattcatttattcaaattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacaat 16419361  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||| ||    
T  16419360 caagttaatagcatatgacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtcc 16419261  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16419260 aaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 16419172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 446 - 769
Target Start/End: Original strand, 8027897 - 8028217
Alignment:
Q  446 aaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaag 545  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||    
T  8027897 aaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacattattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacatcatcaaag 8027996  T
Q  546 ttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
    |||||||| ||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  8027997 ttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatgaccttcggatctgcaatgttaacgcccaaat 8028096  T
Q  645 ctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacaca 743  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || ||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||     ||||| |    
T  8028097 ctttgattgaataaccgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgtacgatgacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----caacaaa 8028191  T
Q  744 ccatcacacttagatgtcgaaatcat 769  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  8028192 ccaccacacttagatgatgaaatcat 8028217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 456 - 728
Target Start/End: Original strand, 8196196 - 8196470
Alignment:
Q  456 atatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgt 555  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||| |    
T  8196196 atattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatttgcgaacacactcacagcatccaagttaatagcat 8196295  T
Q  556 ataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattga 654  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8196296 ataacgacataatgcctacaaaaatatgcgataaaattaaagtgaccggaatatacatggcctccggatctacaacgttgacgcccaaatcgttgattga 8196395  T
Q  655 a-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    | ||||||||||||   |  || ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  8196396 ataatcgatctttctgtaagaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 8196470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 444 - 728
Target Start/End: Original strand, 33740355 - 33740641
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatcca 543  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||    
T  33740355 aaaaacaaaataatattcattcatttaaatcaagagattacatcattcaacactgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatcca 33740454  T
Q  544 agttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaa 642  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | || ||||| |||||||||||||| |||    
T  33740455 agttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaa 33740554  T
Q  643 atctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| |||||||| | ||||| |||||    
T  33740555 atcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaggacggtaaatgaaacaacgccgcacaaaacgac 33740641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 442 - 713
Target Start/End: Original strand, 28634888 - 28635169
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  28634888 acaaaaacaaactgatattcattcattcaaatcgataggttacatcattcaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 28634987  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtctt---------cggatatgcaacgt 632  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||         ||||| |||||| |    
T  28634988 caagttaatcgcatataacggcataatgcctacaaaaatacatgataaaattaaagtgaccggagtatccatgtcttccatgcctccggatctgcaacat 28635087  T
Q  633 tgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| || || ||| ||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  28635088 tgacgctcaaatctttgattgaataattaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacgatacgagaaatcaaacaac 28635169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 462 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 33110893 - 33110626
Alignment:
Q  462 attcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacg 561  Q
    |||||| ||||||||  || || |||||||||||  || | ||| ||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  33110893 attcattcaaatcgagtgattatatcattcaacactgccaaaaacgtaaaggatgaatatgcaaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 33110794  T
Q  562 acataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg-tcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatc 659  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33110793 acataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaataatc 33110694  T
Q  660 gatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacga 727  Q
    ||||||| || || || ||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||    
T  33110693 gatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgagaaatcaaacaacaccgcacaagacga 33110626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 445 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 17335052 - 17334846
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17335052 aaaaaaaaatcatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaa 17334953  T
Q  545 gttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaa 643  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17334952 gttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacacccaaa 17334853  T
Q  644 tctttga 650  Q
    |||||||    
T  17334852 tctttga 17334846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 485 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 10228938 - 10228693
Alignment:
Q  485 atcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatat 584  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  10228938 atcattcaacaccgttaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatat 10228839  T
Q  585 gataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactg 682  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||  || ||    
T  10228838 gataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatagaaataaaatg 10228739  T
Q  683 aacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  10228738 aacaccacaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 10228693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 442 - 614
Target Start/End: Original strand, 12059548 - 12059720
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12059548 acaaaaataaaatgatattcattcatttaaatcaagagattatatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 12059647  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg 614  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12059648 caagttaatagcatataacgacataattcctacaaaaaaatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatg 12059720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 442 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 25337869 - 25337599
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatga--tatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||   ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| | | ||    
T  25337869 acaaaaacaaaatgagatatttattcattcaaattaatagagtacatcatttaacactactaaaaatataaatgatgaatgtgcgaacaaacttacacca 25337770  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcc 639  Q
    | |||||||||| | |||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||  |||| |||||| |||| ||     
T  25337769 ttcaagttaatatcatataacaatataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaggtgactggaataccaatgcctctggatttgcaaccttgatgct 25337670  T
Q  640 caaatctttgattgaaaatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaac 713  Q
    ||||||||| |   | |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25337669 caaatctttca---ataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacgaaaaatcaaacaac 25337599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 461 - 655
Target Start/End: Original strand, 16892610 - 16892805
Alignment:
Q  461 tattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataac 560  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16892610 tattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccactaaaaacgtaaatgatgattctgcgaacaaacttacgacatccaagttaatagcatataac 16892709  T
Q  561 gacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaataccca-tgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    | ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16892710 ggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcctaaatctttaattgaa 16892805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 469 - 728
Target Start/End: Original strand, 33543429 - 33543683
Alignment:
Q  469 caaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataat 568  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||  |||| | | |||||    
T  33543429 caaatcgatagagtatatcattcaacatcgt---aaatgtaaaggaggaatctgtgaacaaactcacaacatccgagttaatagtatatagcaatataat 33543525  T
Q  569 ttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttc 667  Q
     |||||| |||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||  | ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  33543526 gtctacaaaaatatataataaaattaaa-tggtcggaatacccatgcttccggatctgcaacattgacacccaaatttttgattgaatagtcgatctttc 33543624  T
Q  668 aaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    || || ||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33543625 aatatgaa--taatgaacaccgcaacaagacagaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 33543683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 606502 - 606287
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  606502 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 606403  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || || | || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |     
T  606402 acccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgatgt 606304  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  606303 ccaaatcattggttgaa 606287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 33052960 - 33053175
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | | |    
T  33052960 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaaatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagc 33053059  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    ||||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| || | ||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  33053060 atccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgt 33053158  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
     |||||| ||| |||||    
T  33053159 tcaaatcattggttgaa 33053175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 577 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 12166006 - 12165854
Alignment:
Q  577 aaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataa 674  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |    
T  12166006 aaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatagcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaataatcaatctttcaatatga 12165907  T
Q  675 aacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |  || |||||||||||| || |||  ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  12165906 attaaatgaacaccgcaagaa-acgtgaaatcgaacaacgccgcacaagacgac 12165854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 593
Target Start/End: Original strand, 9341443 - 9341596
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  9341443 acaaaaacaaaacgatactcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaac 9341542  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaact 593  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||    
T  9341543 acccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aacaatatgataaaact 9341596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 23128902 - 23128701
Alignment:
Q  456 atatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatag 552  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | || |||| |||||||    
T  23128902 atattcattcattcaaatagacagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatag 23128803  T
Q  553 cgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgatt 652  Q
    | || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  23128802 catacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatcattgatt 23128704  T
Q  653 gaa 655  Q
    |||    
T  23128703 gaa 23128701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 3913366 - 3913581
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||    
T  3913366 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgcatctgcgaacaaactcacaac 3913465  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacg 637  Q
    | ||||||||||||| || || | || |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  3913466 acccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatg-cttctggatctgcaacgttgacg 3913563  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
     | ||||| ||| |||||    
T  3913564 tctaaatcattgcttgaa 3913581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 7028157 - 7027951
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||||           ||| | | | ||||||    
T  7028157 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattatatcattcaacaccgctgaaaatgcaaagga-----------acatattcacaacatc 7028069  T
Q  542 caagttaata---gcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||||||||   || ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | || ||||| | ||| |||||||    
T  7028068 caagttaataatagcatataacgccataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccggatctacaaggttgacg 7027969  T
Q  638 cccaaatctttgattgaa 655  Q
    | ||||||||||||||||    
T  7027968 ctcaaatctttgattgaa 7027951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 12170766 - 12170551
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | | |    
T  12170766 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatatgcgagcaaactcacagc 12170667  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||  || |||  ||||| ||  ||||||| ||||  || | |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||      
T  12170666 acccaagttaatagcatacaacagcaaaatgcctaca-aataatatgatcaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacat 12170568  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  12170567 ccaaatcattgcttgaa 12170551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 29319669 - 29319885
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||  | ||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  29319669 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattaataaagtatatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataac 29319768  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || ||||  | |||   |||| ||  ||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||  | ||||| |||||||||||||     
T  29319769 aaccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcttacaaaataatatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttgcaacgttgacgt 29319868  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
     |||||| ||| |||||    
T  29319869 tcaaatcattggttgaa 29319885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 32327012 - 32327126
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | | |    
T  32327012 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagc 32327111  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||||||||||    
T  32327112 acccaagttaatagc 32327126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Original strand, 3173987 - 3174077
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3173987 acaaaaacaaaataatattcgttcattcaaatcgaaaaattacatcattcaacaccgctaagaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 3174077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 12168980 - 12168852
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  12168980 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcga--gattacatcattcaacaccgctaaaaacttaaaggatgaatctgctaataaactcacaacatc 12168883  T
Q  542 caag----ttaatagcgtataacgacataat 568  Q
     |||    |||||||| ||||||||||||||    
T  12168882 aaagttaattaatagcatataacgacataat 12168852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 31297117 - 31296921
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | | ||    
T  31297117 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcagaatcaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaaaatgcgaacaaactcaaatca 31297018  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacg 637  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||   || | ||| |||||| ||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31297017 tccaaattaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aacaatatgataaaatataaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacg 31296921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 67793 - 68008
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  67793 acaaaaataaaacggtattcattcattcaaatcgatagagtatatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 67892  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||| | ||  ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||     
T  67893 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctata-aataatatgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttaacgt 67991  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
     |||||| ||| |||||    
T  67992 acaaatcgttggttgaa 68008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 34489501 - 34489428
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatga 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  34489501 aaaaacaaaatgatatttattcattcaaatcgatagattacattattcaaaaccgctaaaaacgtaaaggatga 34489428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 543 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 34489421 - 34489331
Alignment:
Q  543 aagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttga 635  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||    
T  34489421 aagttaatagcatataacgacataatggctacaaaaatata-gataaaattaaagtgaccggaatacccatatc-tcgaatctgcaacgttga 34489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 548 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20619663 - 20619597
Alignment:
Q  548 aatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatg 614  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20619663 aatagcatataacgacataattcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatg 20619597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 546278 - 546114
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-a 588  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||| |    
T  546278 tcaatatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgatga 546180  T
Q  589 aaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    || |||||   ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  546179 aatctaaa-ccaccagaatacccatg-cttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 546114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 575
Target Start/End: Original strand, 21426480 - 21426614
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacat 540  Q
    |||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| | | ||     
T  21426480 aaaaacaacacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaacggtgaatatgcgaacaaactcacagcac 21426579  T
Q  541 ccaagttaatagcgtataacgacataatttctaca 575  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21426580 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaca 21426614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 29255291 - 29255453
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||     |||  ||||| | | |||||||||||    
T  29255291 aacatcgctaaaaacgtaatgggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagtgaaatgcctacaaata-atatgataaaa 29255389  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
       |||| |||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29255390 tctaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 29255453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 728
Target Start/End: Original strand, 4351853 - 4352059
Alignment:
Q  514 atgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat 613  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  ||||  |||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||    
T  4351853 atgaatctgcgaataaactcaaaacgtccaagttaatagcacataa-aacataatgcctacaaaaatatatgataacattaaagcgactgaaatacccat 4351951  T
Q  614 gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa 712  Q
    |  | ||||        ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  || |||| |||||| || ||||| |||||||| ||    
T  4351952 gcttccgga--------gttgacgtccaaatctttgattaaataatcgatctttcaatatgaattaaatgaataccgcaccatgacgggaaatcaaataa 4352043  T
Q  713 cgtctcacaagacgac 728  Q
    || | || ||||||||    
T  4352044 cgccacataagacgac 4352059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 7514995 - 7515108
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||  || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |  |    
T  7514995 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtgcatcagatataaaatcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacagaa 7515094  T
Q  540 tccaagttaatagc 553  Q
     |||||||||||||    
T  7515095 accaagttaatagc 7515108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 25398725 - 25398651
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25398725 atatgataaaattaaagtgatcggaaaacttatgtctccggatcagcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 25398651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 660 - 730
Target Start/End: Original strand, 26588499 - 26588569
Alignment:
Q  660 gatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaa 730  Q
    |||||||||| || || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26588499 gatctttcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaa 26588569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 682 - 731
Target Start/End: Original strand, 34185742 - 34185791
Alignment:
Q  682 gaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaa 731  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34185742 gaacaccacaacaagacgcaaaatcaaacaacgtcacacaagacgacaaa 34185791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 550
Target Start/End: Original strand, 1450528 - 1450636
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||  || |||  |||| ||| ||| |||||||||||| | |||||     
T  1450528 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaatcgatataatacattatttaacatcattaaaaacataaatgataaatttgcgaacaaactcacaacata 1450627  T
Q  542 caagttaat 550  Q
    |||||||||    
T  1450628 caagttaat 1450636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 30493777 - 30493615
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  | |||||||||    
T  30493777 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaattcacaacacccaggttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aacaacatgataaaa 30493679  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
       || | |||  ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30493678 tataaatcaccaaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaa 30493615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 30608360 - 30608522
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||| || ||||  | |||  ||||| ||  |||||||||||    
T  30608360 aacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatttgcaaacaatctcacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctaca-aataatatgataaaa 30608458  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
       |||| |||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  30608459 tataagtcaccgaaatacccatgattccagatctgcaacgttgacacccaaatcattggttgaa 30608522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30776910 - 30776847
Alignment:
Q  490 tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  30776910 tcaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagc 30776847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32060174 - 32060060
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||| | |||||||  | ||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||    
T  32060174 acaaaaataaaacgatattcattcattcaaattgatatattacatcagatacaaacttcgctaaaaatgtaaagggtaaatctgcgaacaaacttacaac 32060075  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||||||||    
T  32060074 atccaatttaatagc 32060060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 526
Target Start/End: Original strand, 34185486 - 34185572
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaa 526  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||    
T  34185486 acaaaaataaaatgatattcattcattcaaattgatagagtatatcagattcaacatcgctaaaaaagtaaaaggtgaatctacgaa 34185572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 489
Target Start/End: Original strand, 11321338 - 11321383
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat 489  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11321338 aaaaacaaaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcat 11321383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 28981474 - 28981260
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    ||||||| |||| |||||| || | | ||||| |||||| |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| | ||||    
T  28981474 acaaaaataaaacgatattcatacgttcaaattgatagaatacatcagaatcaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgtgaacaaactcacaaca 28981375  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa-ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
     | ||||||||||| || ||| ||| |||| ||||| |   ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||   ||||||| ||||| |||||||     
T  28981374 ccaaagttaatagcatacaacaacaaaattcctaca-agcaatatgataaaatctaaa-tgaccaaaatacccatactttcggatctgcaatgttgacgt 28981277  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    | | ||| |||||||||    
T  28981276 caagatcattgattgaa 28981260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 455 - 644
Target Start/End: Original strand, 7975993 - 7976183
Alignment:
Q  455 gatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatag 552  Q
    |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||   ||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  7975993 gatattcattcatttaaattgatagaatacatcagaatcaacattgctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatag 7976092  T
Q  553 cgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
    | || |||| || |||  ||||| ||   |||||||||| | || | ||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  7976093 catacaacggcaaaatgcctaca-aacggtatgataaaatttaaatcaccagaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaat 7976183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 787 - 830
Target Start/End: Original strand, 4984693 - 4984736
Alignment:
Q  787 tatatatgtgaaaattgcttaattagattgaaatagagagaaaa 830  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4984693 tatatatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaa 4984736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 598
Target Start/End: Original strand, 8518934 - 8519049
Alignment:
Q  484 catcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca-taatttctacagaaatat 582  Q
    ||||||||||||  | || ||| |||| | ||||||||| |||||  || | | ||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  8518934 catcattcaacacggttaaaaacgtaaggaatgaatctgtgaacactctcacaccattcaagttaatagcatgtaacgacaataatatctacaaaaatat 8519033  T
Q  583 atgataaaactaaagt 598  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8519034 atgataaaattaaagt 8519049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 8644600 - 8644549
Alignment:
Q  513 gatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  8644600 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgaca 8644549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 486 - 699
Target Start/End: Original strand, 1703971 - 1704184
Alignment:
Q  486 tcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatg 585  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | ||| | | ||| || ||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||  |||||    
T  1703971 tcattcaacatcgctaaaaacgtagatgataattttgcaaataaacttacaacatttaagttaatagcgtacaacgacaaaatgtctata-aataatatg 1704069  T
Q  586 ataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaa 684  Q
    ||| || ||||||||| ||||||  ||||  | ||||| | ||||||||| |  |||||| || |||||| ||||||| |||| |    || ||| ||||    
T  1704070 atacaattaaagtgactggaatattcatgcatccggatctacaacgttgatgttcaaatcatttattgaataatcgatatttcgattagaaccaaatgaa 1704169  T
Q  685 caccgcaacaagacg 699  Q
    |||||||||||||||    
T  1704170 caccgcaacaagacg 1704184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 8266792 - 8266718
Alignment:
Q  581 atatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8266792 atatgataaaattaaagtgattggaatacccttgcctccgggtctacaatgttgacgcccaaatcattgattgaa 8266718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Original strand, 14174863 - 14174956
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||  || | ||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  14174863 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatatattacatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaact 14174956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Original strand, 14179399 - 14179492
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||  || | ||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  14179399 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaatcgatatattacatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaact 14179492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 518
Target Start/End: Original strand, 15612366 - 15612440
Alignment:
Q  444 aaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaa 518  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||    
T  15612366 aaaaacaaaactatattcattcattcagatcgataaagtacatcattcaacaccactaaaaacgtaaaagatgaa 15612440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 532
Target Start/End: Original strand, 24590366 - 24590456
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||| | ||| || | | ||| | |||||||||||||| |||||    
T  24590366 acaaaaataaaatcatatttattcattcatattgattgagtacatcattcatcgtcgatatagacgtataagatgaatctgcgaataaact 24590456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 679416 - 679371
Alignment:
Q  443 caaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca 488  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  679416 caaaaacaaaatgttatttattcattcaaattgatagaatacatca 679371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Original strand, 4663545 - 4663602
Alignment:
Q  496 tcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  4663545 tcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 4663602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14866734 - 14866633
Alignment:
Q  445 aaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaa 544  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||||| || ||| |||||| ||| |||  |||| ||||||| | |||||||||| | |||||| ||    
T  14866734 aaaacaaaatgatattcattcattcatattaatagagtatattattgaacatcactaaaaacataaatgatgaatttacgaacaaactcacaacatcgaa 14866635  T
Q  545 gt 546  Q
    ||    
T  14866634 gt 14866633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20226097 - 20226024
Alignment:
Q  491 caacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||||| || |||||||    
T  20226097 caacatcgctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgaca 20226024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22120081 - 22120008
Alignment:
Q  491 caacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgaca 564  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||||| || |||||||    
T  22120081 caacatcgctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgaca 22120008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 442 - 768
Target Start/End: Original strand, 201148 - 201470
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |  |||    
T  201148 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagattacatcattcaacaccactaaaaatgtaaaggatgaatttgtgaacatactcacagaatc 201247  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| | ||||||||||||||    
T  201248 caatttaatagcatataacggcatgatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctacggatctacaacgttgacgccc 201347  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||| || | |||||||| || ||     |||    
T  201348 aaatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatgaatcaaatgaacaccacaagaagacgtgaaatcaaacagcgccgcacaagactacgaa-----caa 201441  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||    
T  201442 caaaccatcacacttagatgatgaaatca 201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 446 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 8989 - 8745
Alignment:
Q  446 aaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaag 545  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||||   |  |||||||    
T  8989 aaacaaaatgatattcattcattcaaatcgagagattacatcattcaacaccgtttaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcgcagtatccaag 8890  T
Q  546 ttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaat 644  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8889 ttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgcccaaat 8790  T
Q  645 ctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacacc 688  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||    
T  8789 ctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacacc 8745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 442 - 768
Target Start/End: Original strand, 16095 - 16418
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||    
T  16095 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaattgagatattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggaagaatcagcgaacaaactcacatcatc 16194  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  16195 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatataataaaattaaagtgaccggaatatccatagcctccggatctgcaacgttgacgccc 16294  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaa 739  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || || || ||| | ||||||||   || ||   | ||||||||||| | ||||||||||||||     |||    
T  16295 aaatctttgattgaataatcgatattttaatatgaatcaaatcaacaccgcgcgaaaacaagatatcaaacaacgccgcacaagacgacaaa-----caa 16389  T
Q  740 cacaccatcacacttagatgtcgaaatca 768  Q
    || |||| ||||||||||||  |||||||    
T  16390 caaaccaccacacttagatgatgaaatca 16418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 442 - 725
Target Start/End: Original strand, 83212 - 83498
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  83212 acaaaaacaaaatgatattcattcattcaaatcaagagattacatcattcaa-atcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatc 83310  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataattt--ctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttc-ggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||| | || | || |||||||||||||     
T  83311 caagttaatagcatataacggcataatatgcctacaaaaatgtatggtaaaattaaagtgaccggaaaatccatgacctctgaatctgcaacgttgacgg 83410  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagac 725  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  83411 ccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaataccgcacgaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaagac 83498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 511 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 6538 - 6335
Alignment:
Q  511 aggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacc 610  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  6538 aggatgaatctgcgtacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcatacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccggattatt 6439  T
Q  611 cat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaa 708  Q
    ||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6438 catggcctttggatctgcaacgttgatgcccaaatatttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaa 6339  T
Q  709 acaa 712  Q
    ||||    
T  6338 acaa 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 98; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 485 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 5657 - 5412
Alignment:
Q  485 atcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatat 584  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  5657 atcattcaacaccgttaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatat 5558  T
Q  585 gataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactg 682  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||  || ||    
T  5557 gataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatagaaataaaatg 5458  T
Q  683 aacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  5457 aacaccacaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgac 5412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 442 - 728
Target Start/End: Original strand, 361574 - 361862
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  361574 acaaaaataaaatgatattcattcattcatattgagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacacactcacaacatc 361673  T
Q  542 caagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccat-gtcttcggatatgcaacgttgacgccc 640  Q
    |||||||| | | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||| | || ||||| | ||||||||||| ||    
T  361674 caagttaacaacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgactggagtatccatggcctccggatctacaacgttgacgtcc 361773  T
Q  641 aaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||   |  || ||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  361774 aaatctttgattgaataattaatctttctgtaagaatcaaatgaacactgcaccaagacaggaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 361862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Original strand, 34600 - 34844
Alignment:
Q  485 atcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatat 584  Q
    |||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  || || ||| ||| |||  ||||| | | ||||    
T  34600 atcattcaacatcaataaaaatatagaggatgaatctgcgaacaaacttacaacatctaagttaaaggcatacaacaacaaaatgcctacaaata-atat 34698  T
Q  585 gataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattg-aaaatcgatctttcaaaataaaacaactga 683  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | | | |||||||||| || || ||| |||    
T  34699 gataaaattaaagtgactggaaaactcatgtctccggatttgcaacgttgacgcataaatcattgattgcatagtagatctttcaatatgaatcaaatga 34798  T
Q  684 acaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgaca 729  Q
    || | ||||||| |||  ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  34799 accctgcaacaaaacgagaaatcaaacaatgtcgcagaagacgaca 34844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 9834 - 9948
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttcaa-catcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |    
T  9834 acaaagacaaaacaatattcattcattcaaatcgatagagtacaccagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagc 9933  T
Q  539 atccaagttaatagc 553  Q
    | |||||| ||||||    
T  9934 acccaagtcaatagc 9948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0884 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0884
Description:

Target: scaffold0884; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 643
Target Start/End: Original strand, 1765 - 1968
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatca--ttc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||  | | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1765 acaataacaaaatgatattcattcattcaaatcgatagaatgcatcaggtacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataac 1864  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||| | || |||  || |||  ||||| ||  ||||||||||||  || | |||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1865 acccaagttaataacatacaacagcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaaatcaccgaaatacttatgttttcggatctgcaacgttgacgc 1963  T
Q  639 ccaaa 643  Q
    |||||    
T  1964 ccaaa 1968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 56; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 65887 - 66049
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||    
T  65887 aacatcggtaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaa 65985  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    |  |||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  65986 cataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggcacccaaatcattggttgaa 66049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 15789 - 15574
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcatt---caacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |    |||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||| | | |    
T  15789 acaaaaacaaaacgatatttattccttcaaatcgattgagtacatcagttacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatctgcgaacaaactcacagc 15690  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||| |||| |||| |||||  | ||||| ||||| |||||||     
T  15689 acccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaatgttgacgt 15591  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  15590 ccaaatcattggttgaa 15574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 655
Target Start/End: Original strand, 57881 - 58095
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcat--tcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataaca 539  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||   | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||    
T  57881 acaaaaacaaaacgatattcattcatttaaattgatagaatacatcagaattaacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagca 57980  T
Q  540 tccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgat-aaaactaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgc 638  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||  ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||| |||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||     
T  57981 tccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctaca-aaaaatatgatgaaatctaaa-tcaccagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgt 58078  T
Q  639 ccaaatctttgattgaa 655  Q
    ||||||| | |||||||    
T  58079 ccaaatcatcgattgaa 58095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 36465 - 36576
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||| | || ||     
T  36465 acaaaaacaaaacgatattctttcattcaaattgatagagtacttcattcaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatcaacgaacaaactcacaatata 36564  T
Q  542 caagttaatagc 553  Q
    ||||||||||||    
T  36565 caagttaatagc 36576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Original strand, 53193 - 53304
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatc 541  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  53193 acaaaaacaaaacgatattcattcattcaaattgatatagtacatcattcaacatcactaaaaacataaaagataaatctacgaacaaactaacaacctc 53292  T
Q  542 caagttaatagc 553  Q
    ||| ||||||||    
T  53293 caatttaatagc 53304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 450 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 4499 - 4402
Alignment:
Q  450 aaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagtt 547  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  4499 aaaatgatattcattcatttaaatcaagagattacatcattcaacaccgctaaaaacgtaagggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagtt 4402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 503 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 51009 - 50858
Alignment:
Q  503 aaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagtgacc 602  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| || || | || |||  ||||| | | ||||||||||||| |||| |||    
T  51009 aaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacttaagtcacc 50911  T
Q  603 ggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
    | |||| |||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50910 gaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaa 50858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 6274 - 6112
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| ||  |||||||||||    
T  6274 aacatcactaaaaatgtaaaaggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcttgtaacaacaaaatgtctaca-aataatatgataaaa 6176  T
Q  592 -ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
     ||||| | ||| |||||| ||||  | ||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  6175 tctaaa-tcaccagaatacacatgcttccggatctgcaacattgacatccaaatcattgattgaa 6112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 645 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 454030 - 453946
Alignment:
Q  645 ctttgattgaa-aatcgatctttcaaaataaaacaactgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  454030 ctttgattgaataatcgatctttcaatatgagtcaaatgaacaccgcaacaagactgaaaatcaaacaacgccgcccaagacgac 453946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 559
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14783
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattca---acatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||  |   ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | | |    
T  14664 acaaaaacaaaatga-attcattcattcaaattgataaagtacatcatatacaaacatcactaaaaatataaaggatgaatttgcgaacaaactcacagc 14762  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataa 559  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  14763 acccaagttaatagcatataa 14783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1588 - 1527
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagc 553  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1588 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagc 1527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 598
Target Start/End: Original strand, 71662 - 71820
Alignment:
Q  442 acaaaaacaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatc--attc-aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataac 538  Q
    |||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | |    
T  71662 acaaaaacaaaaagatactcagtcattcaaattgatagagtacatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagc 71761  T
Q  539 atccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaactaaagt 598  Q
    | ||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  71762 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca-aataatatgataaaacttaagt 71820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 681 - 728
Target Start/End: Original strand, 20412 - 20459
Alignment:
Q  681 tgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtctcacaagacgac 728  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20412 tgaacaccgcaagaaaacggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 532
Target Start/End: Original strand, 9452 - 9536
Alignment:
Q  448 acaaaatgatatttattcatccaaatcgatagagtacatcattcaacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaact 532  Q
    ||||||||||| |  || || ||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  9452 acaaaatgatactcgtttattcaaattgatagattacatcattcaagatcgttaaaaatggaaaggatgagtttgcgaacaaact 9536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 71145 - 71307
Alignment:
Q  492 aacatcgctacaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactaataacatccaagttaatagcgtataacgacataatttctacagaaatatatgataaaa 591  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||| || ||| ||| |||  ||||| ||  |||| ||||||    
T  71145 aacatcgctaaaaacgtaaaggattaatctacaaacaaacttacaacacccaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctaca-aataatataataaaa 71243  T
Q  592 ctaaagtgaccggaatacccatgtcttcggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 655  Q
       |||| | |  ||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  71244 tctaagtcatcaaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacaccccaatcattgattgaa 71307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University