View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16832_low_22 (Length: 334)

Name: NF16832_low_22
Description: NF16832
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16832_low_22
NF16832_low_22
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (1-313)||(35015027-35015339)
chr6 (1-306)||(19983162-19983466)
chr6 (1-312)||(18583391-18583702)
chr6 (31-312)||(26089809-26090091)
chr6 (31-312)||(18002395-18002677)
chr6 (31-312)||(23994997-23995279)
chr6 (31-312)||(15742120-15742401)
chr6 (32-273)||(4991186-4991427)
chr6 (27-296)||(15889601-15889871)
chr6 (27-296)||(22585441-22585711)
chr6 (27-296)||(22590272-22590542)
chr6 (55-297)||(15004831-15005072)
chr6 (31-270)||(25640456-25640694)
chr6 (124-270)||(32276756-32276902)
chr6 (252-312)||(13014822-13014882)
chr6 (252-312)||(32898864-32898924)
chr6 (257-311)||(25744331-25744385)
chr6 (161-270)||(19629447-19629556)
chr6 (252-312)||(18570353-18570413)
chr6 (252-312)||(22441008-22441068)
chr6 (252-322)||(18432708-18432777)
chr6 (252-313)||(18777219-18777280)
chr6 (161-273)||(16300010-16300122)
chr6 (161-273)||(18823417-18823529)
chr6 (161-273)||(18839272-18839384)
chr6 (161-257)||(21931333-21931429)
chr6 (252-312)||(31628342-31628402)
chr6 (179-268)||(26512260-26512349)
chr6 (179-268)||(26517376-26517465)
chr6 (136-230)||(17374924-17375018)
chr6 (252-310)||(16106592-16106650)
chr6 (252-310)||(16086093-16086151)
chr6 (30-63)||(1650020-1650053)
chr6 (161-226)||(19175311-19175376)
chr6 (162-226)||(16136423-16136487)
chr6 (31-63)||(16232199-16232231)
chr6 (31-63)||(19610325-19610357)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-313)||(22274795-22275107)
chr2 (1-312)||(22284029-22284340)
chr2 (31-312)||(9652796-9653077)
chr2 (31-312)||(21273949-21274230)
chr2 (1-273)||(15633327-15633599)
chr2 (32-273)||(25213162-25213403)
chr2 (31-270)||(7321633-7321872)
chr2 (226-312)||(23836791-23836878)
chr2 (1-63)||(19794599-19794661)
chr2 (1-63)||(20627208-20627270)
chr2 (226-311)||(25876006-25876091)
chr2 (1-63)||(43642851-43642913)
chr2 (109-226)||(20279571-20279688)
chr2 (252-312)||(32465932-32465992)
chr2 (161-296)||(33128135-33128270)
chr2 (226-312)||(6879511-6879597)
chr2 (161-273)||(24826748-24826860)
chr2 (123-273)||(28031230-28031380)
chr2 (252-312)||(271244-271304)
chr2 (168-273)||(17204445-17204550)
chr2 (252-312)||(25602098-25602158)
chr2 (252-312)||(36890798-36890858)
chr2 (252-312)||(4448246-4448306)
chr2 (252-312)||(28974123-28974183)
chr2 (27-68)||(19666843-19666884)
chr2 (30-63)||(19689314-19689347)
chr2 (161-238)||(25595168-25595245)
chr2 (31-63)||(463043-463075)
chr2 (31-63)||(3798520-3798552)
chr2 (31-63)||(8944153-8944185)
chr2 (31-63)||(12635785-12635817)
chr2 (31-63)||(12641559-12641591)
chr2 (31-63)||(12728699-12728731)
chr2 (31-63)||(14906354-14906386)
chr2 (31-63)||(16935900-16935932)
chr2 (31-63)||(17006560-17006592)
chr2 (31-63)||(22863235-22863267)
chr2 (31-63)||(23820388-23820420)
chr2 (248-312)||(24341513-24341577)
chr2 (31-63)||(36982364-36982396)
chr2 (31-63)||(42177886-42177918)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (2-313)||(126488-126799)
chr7 (1-313)||(32493916-32494228)
chr7 (1-313)||(111139-111451)
chr7 (1-296)||(1936887-1937177)
chr7 (31-312)||(2028995-2029276)
chr7 (31-312)||(42056188-42056470)
chr7 (31-312)||(2190085-2190367)
chr7 (31-312)||(3049657-3049937)
chr7 (35-170)||(15516765-15516901)
chr7 (79-270)||(39291457-39291648)
chr7 (33-273)||(13352065-13352306)
chr7 (256-312)||(39046740-39046796)
chr7 (1-63)||(3060271-3060333)
chr7 (226-312)||(143713-143800)
chr7 (228-314)||(35094888-35094974)
chr7 (226-308)||(44865308-44865391)
chr7 (226-312)||(47289855-47289942)
chr7 (110-294)||(15977820-15978004)
chr7 (252-312)||(3895099-3895159)
chr7 (252-310)||(11287493-11287551)
chr7 (168-273)||(371203-371308)
chr7 (1-62)||(7283926-7283987)
chr7 (161-296)||(8563369-8563505)
chr7 (252-312)||(15822544-15822604)
chr7 (252-312)||(7284173-7284233)
chr7 (252-308)||(12369953-12370009)
chr7 (252-312)||(12759061-12759121)
chr7 (252-312)||(26070377-26070437)
chr7 (252-312)||(26094164-26094224)
chr7 (252-313)||(12248233-12248295)
chr7 (164-210)||(15575874-15575920)
chr7 (136-210)||(17984753-17984827)
chr7 (278-312)||(45452305-45452339)
chr7 (252-312)||(13274861-13274922)
chr7 (20-65)||(13377849-13377894)
chr7 (252-312)||(16570118-16570179)
chr7 (252-312)||(16595483-16595544)
chr7 (31-68)||(25124445-25124482)
chr7 (31-63)||(7293333-7293365)
chr7 (31-63)||(11516544-11516576)
chr7 (31-63)||(13758677-13758709)
chr7 (31-63)||(14113903-14113935)
chr7 (31-63)||(15441478-15441510)
chr7 (31-63)||(15862226-15862258)
chr7 (31-63)||(15927875-15927907)
chr7 (31-63)||(16212071-16212103)
chr7 (86-226)||(18151259-18151399)
chr7 (31-63)||(18979938-18979970)
chr7 (31-63)||(30262043-30262075)
chr7 (31-63)||(36052971-36053003)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-313)||(31150-31462)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-313)||(41382-41694)
scaffold0078 (31-63)||(36980-37012)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-313)||(5953-6265)
scaffold0686 (1-177)||(5747-5923)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-313)||(79937-80249)
scaffold0034 (252-313)||(46238-46299)
scaffold0034 (252-313)||(40731-40792)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (1-313)||(44034841-44035153)
chr1 (1-313)||(21860084-21860396)
chr1 (32-313)||(15861327-15861608)
chr1 (108-313)||(22367092-22367296)
chr1 (1-124)||(41218667-41218790)
chr1 (1-63)||(41394527-41394589)
chr1 (226-308)||(22403196-22403279)
chr1 (252-312)||(41212146-41212206)
chr1 (252-312)||(49967724-49967784)
chr1 (252-312)||(35522432-35522492)
chr1 (161-270)||(20254430-20254539)
chr1 (168-273)||(21650076-21650181)
chr1 (252-312)||(21718302-21718362)
chr1 (252-313)||(27329868-27329929)
chr1 (252-313)||(35054829-35054890)
chr1 (20-61)||(27675120-27675161)
chr1 (161-237)||(40436291-40436367)
chr1 (252-312)||(9784177-9784234)
chr1 (30-63)||(45051726-45051759)
chr1 (179-270)||(20194140-20194232)
chr1 (248-312)||(20445754-20445818)
chr1 (248-312)||(20531519-20531583)
chr1 (31-63)||(37844374-37844406)
chr1 (31-63)||(46523695-46523727)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (8-313)||(17955861-17956166)
chr3 (2-313)||(45581704-45582016)
chr3 (1-312)||(3992624-3992935)
chr3 (31-313)||(30153015-30153297)
chr3 (1-313)||(7854055-7854367)
chr3 (1-313)||(54037994-54038306)
chr3 (1-312)||(2844265-2844576)
chr3 (32-313)||(54685202-54685483)
chr3 (31-312)||(53771115-53771397)
chr3 (31-313)||(33341954-33342236)
chr3 (31-312)||(23492447-23492728)
chr3 (31-312)||(16261527-16261809)
chr3 (31-312)||(38167988-38168269)
chr3 (31-286)||(28558271-28558526)
chr3 (1-250)||(55513006-55513255)
chr3 (31-273)||(18970034-18970277)
chr3 (20-270)||(15550714-15550964)
chr3 (108-273)||(48421690-48421855)
chr3 (252-312)||(16996172-16996232)
chr3 (252-312)||(317621-317681)
chr3 (252-312)||(50112164-50112224)
chr3 (226-312)||(22144358-22144445)
chr3 (1-63)||(15857133-15857195)
chr3 (1-63)||(19232089-19232151)
chr3 (228-312)||(6154419-6154504)
chr3 (252-312)||(12349843-12349903)
chr3 (252-312)||(13817586-13817646)
chr3 (252-312)||(19570801-19570861)
chr3 (226-312)||(6146832-6146919)
chr3 (226-312)||(53898541-53898628)
chr3 (78-224)||(11402752-11402898)
chr3 (1-63)||(16744011-16744073)
chr3 (247-309)||(34439451-34439513)
chr3 (161-273)||(8275874-8275986)
chr3 (161-273)||(9303129-9303241)
chr3 (252-312)||(12349652-12349712)
chr3 (161-273)||(14285075-14285187)
chr3 (252-312)||(17100727-17100787)
chr3 (252-312)||(17101412-17101472)
chr3 (252-312)||(54424086-54424146)
chr3 (167-273)||(19946812-19946918)
chr3 (161-226)||(14177040-14177105)
chr3 (168-273)||(16934010-16934115)
chr3 (161-273)||(8268774-8268886)
chr3 (252-312)||(14298495-14298555)
chr3 (252-312)||(14304122-14304182)
chr3 (86-230)||(17393590-17393735)
chr3 (252-312)||(19260952-19261012)
chr3 (252-312)||(35123770-35123830)
chr3 (226-312)||(16182032-16182118)
chr3 (136-226)||(12539066-12539156)
chr3 (252-312)||(17523002-17523062)
chr3 (136-207)||(37915290-37915361)
chr3 (161-241)||(38375718-38375798)
chr3 (161-270)||(10913001-10913111)
chr3 (27-68)||(13301360-13301401)
chr3 (27-68)||(13312016-13312057)
chr3 (252-312)||(14295512-14295573)
chr3 (252-312)||(14301139-14301200)
chr3 (30-63)||(15615137-15615170)
chr3 (232-273)||(39656453-39656494)
chr3 (31-68)||(51961031-51961068)
chr3 (31-63)||(2050115-2050147)
chr3 (31-63)||(2449152-2449184)
chr3 (31-63)||(8268650-8268682)
chr3 (31-63)||(8275750-8275782)
chr3 (161-273)||(11477220-11477332)
chr3 (265-313)||(12560362-12560410)
chr3 (31-63)||(14842487-14842519)
chr3 (31-63)||(16933869-16933901)
chr3 (31-63)||(17912398-17912430)
chr3 (31-63)||(18911300-18911332)
chr3 (31-63)||(19260749-19260781)
chr3 (226-274)||(38527841-38527889)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (1-313)||(162048-162360)
scaffold0016 (1-313)||(166134-166446)
scaffold0016 (252-311)||(164290-164349)
scaffold0016 (20-65)||(116440-116485)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (1-313)||(25119077-25119389)
chr4 (1-308)||(5682398-5682704)
chr4 (31-313)||(14951835-14952117)
chr4 (31-312)||(15272211-15272493)
chr4 (27-262)||(19559483-19559719)
chr4 (31-133)||(15135907-15136010)
chr4 (108-273)||(34177617-34177781)
chr4 (79-273)||(49071800-49071994)
chr4 (252-312)||(53704846-53704906)
chr4 (226-312)||(34395331-34395418)
chr4 (123-273)||(14500208-14500358)
chr4 (1-63)||(54118138-54118200)
chr4 (252-312)||(820029-820089)
chr4 (252-312)||(8872584-8872644)
chr4 (252-312)||(30457977-30458037)
chr4 (252-312)||(44055989-44056049)
chr4 (252-312)||(53907812-53907872)
chr4 (252-311)||(44346902-44346961)
chr4 (161-273)||(14996241-14996353)
chr4 (161-273)||(16522932-16523044)
chr4 (252-312)||(16732243-16732303)
chr4 (252-312)||(21959576-21959636)
chr4 (256-312)||(55376714-55376770)
chr4 (226-312)||(23270020-23270107)
chr4 (157-222)||(21417471-21417536)
chr4 (161-273)||(8045058-8045170)
chr4 (161-273)||(9295808-9295920)
chr4 (252-313)||(30232609-30232670)
chr4 (167-244)||(32460743-32460820)
chr4 (161-273)||(9795330-9795442)
chr4 (161-216)||(12133631-12133686)
chr4 (252-313)||(12837313-12837374)
chr4 (252-312)||(45458968-45459028)
chr4 (179-270)||(16225211-16225301)
chr4 (167-273)||(19697408-19697514)
chr4 (167-273)||(19707993-19708099)
chr4 (30-63)||(14996445-14996478)
chr4 (31-63)||(7131982-7132014)
chr4 (248-312)||(10104374-10104438)
chr4 (31-63)||(13246737-13246769)
chr4 (31-63)||(15287162-15287194)
chr4 (31-63)||(15294271-15294303)
chr4 (248-312)||(15675213-15675277)
chr4 (31-63)||(16327840-16327872)
chr4 (31-63)||(16609013-16609045)
chr4 (31-63)||(17145574-17145606)
chr4 (31-63)||(20001030-20001062)
chr4 (31-63)||(26680517-26680549)
chr4 (248-312)||(31115704-31115768)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (32-313)||(11342758-11343039)
chr5 (31-313)||(2031883-2032165)
chr5 (44-312)||(21205000-21205268)
chr5 (31-312)||(21650769-21651050)
chr5 (31-273)||(16105757-16105999)
chr5 (109-261)||(22662653-22662805)
chr5 (35-273)||(25004929-25005165)
chr5 (226-312)||(21397166-21397253)
chr5 (252-312)||(4865337-4865397)
chr5 (226-312)||(21646826-21646912)
chr5 (252-312)||(1168317-1168377)
chr5 (161-273)||(7529014-7529126)
chr5 (226-312)||(24475654-24475738)
chr5 (252-312)||(28261595-28261655)
chr5 (161-270)||(17909622-17909731)
chr5 (252-312)||(20712150-20712210)
chr5 (168-273)||(9730419-9730524)
chr5 (252-312)||(24183245-24183305)
chr5 (252-313)||(11584124-11584188)
chr5 (1-62)||(11584374-11584435)
chr5 (161-273)||(108862-108974)
chr5 (252-312)||(11337299-11337359)
chr5 (252-312)||(21906791-21906851)
chr5 (259-312)||(3673936-3673989)
chr5 (252-312)||(19405611-19405672)
chr5 (31-63)||(7425631-7425663)
chr5 (31-63)||(20623286-20623318)
chr5 (31-63)||(21233442-21233474)
chr5 (248-312)||(22053957-22054021)
chr5 (31-63)||(23507270-23507302)
chr5 (31-63)||(25900320-25900352)
chr5 (31-63)||(35791015-35791047)
chr5 (31-63)||(37053061-37053093)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (1-313)||(24716732-24717044)
chr8 (1-312)||(274517-274828)
chr8 (1-312)||(641021-641332)
chr8 (1-312)||(826827-827138)
chr8 (31-313)||(41506709-41506991)
chr8 (1-313)||(39115348-39115660)
chr8 (31-293)||(24385652-24385914)
chr8 (166-312)||(16038916-16039062)
chr8 (122-272)||(22321437-22321587)
chr8 (31-270)||(21259391-21259630)
chr8 (27-273)||(17502274-17502521)
chr8 (55-273)||(23217990-23218208)
chr8 (79-273)||(4233968-4234162)
chr8 (226-312)||(22234890-22234976)
chr8 (1-63)||(16404870-16404932)
chr8 (252-312)||(41246732-41246792)
chr8 (226-312)||(19993141-19993227)
chr8 (226-312)||(37611742-37611829)
chr8 (123-273)||(22886440-22886590)
chr8 (109-226)||(18118259-18118376)
chr8 (161-270)||(22147555-22147664)
chr8 (166-272)||(2545061-2545167)
chr8 (161-270)||(18612523-18612632)
chr8 (161-270)||(18619428-18619537)
chr8 (252-312)||(20481679-20481739)
chr8 (248-312)||(20561740-20561804)
chr8 (252-312)||(20573305-20573365)
chr8 (248-312)||(20647938-20648002)
chr8 (252-312)||(20654018-20654078)
chr8 (167-263)||(21494496-21494592)
chr8 (161-270)||(16002113-16002223)
chr8 (168-273)||(3431317-3431422)
chr8 (31-65)||(31194217-31194251)
chr8 (252-312)||(21681076-21681137)
chr8 (31-63)||(5238404-5238436)
chr8 (31-63)||(13662182-13662214)
chr8 (31-63)||(13720845-13720877)
chr8 (31-63)||(16872968-16873000)
chr8 (31-63)||(22907128-22907160)
chr8 (31-63)||(24661162-24661194)
chr8 (31-63)||(43373392-43373424)
chr8 (31-63)||(43685863-43685895)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (31-312)||(55655-55936)
scaffold0032 (31-134)||(108075-108179)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (31-312)||(878-1159)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (31-312)||(13285-13567)
scaffold0251 (203-312)||(21432-21541)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (31-312)||(17304-17585)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-313)||(322-633)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (31-312)||(6443-6724)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-313)||(30164-30479)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (31-313)||(12418-12702)
scaffold0039 (279-313)||(19049-19083)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (30-312)||(193396-193668)
scaffold0004 (165-312)||(186560-186706)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (31-277)||(4346-4593)
scaffold0303 (108-312)||(5-209)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (99-312)||(15023-15236)
scaffold0175 (31-63)||(882-914)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (31-313)||(9882-10148)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-172)||(42568-42736)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (32-273)||(130670-130911)
scaffold0028 (248-312)||(89578-89642)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (161-312)||(9537-9688)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (27-296)||(44009-44279)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (161-312)||(95049-95204)
scaffold0037 (252-312)||(24841-24901)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-273)||(1374-1643)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (108-273)||(219-384)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (27-271)||(3732-3981)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (136-273)||(5996-6133)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (226-312)||(32277-32363)
scaffold0091 (226-312)||(41940-42026)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (226-312)||(14948-15034)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (252-312)||(15584-15644)
scaffold0077 (1-62)||(15337-15398)
scaffold0077 (30-63)||(36836-36869)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (226-312)||(6932-7018)
scaffold0673 (252-312)||(935-995)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (226-312)||(254900-254987)
scaffold0011 (226-312)||(261506-261593)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (123-273)||(17812-17962)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (252-312)||(5359-5419)
scaffold0480 (252-312)||(8994-9055)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (252-312)||(132363-132423)
scaffold0021 (252-312)||(88349-88409)
scaffold0021 (253-312)||(11761-11821)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (123-273)||(5572-5722)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (252-312)||(11821-11881)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (161-273)||(34442-34554)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (252-312)||(38372-38432)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (252-312)||(146675-146735)
scaffold0025 (31-63)||(146906-146938)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (161-296)||(61256-61391)
scaffold0023 (31-63)||(48903-48935)
scaffold0023 (31-63)||(153924-153956)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (252-312)||(22765-22825)
scaffold0008 (31-63)||(128095-128127)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (226-312)||(4359-4445)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (226-312)||(11740-11827)
scaffold0359 (252-312)||(1391-1451)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (252-310)||(70735-70793)
scaffold0001 (161-273)||(164995-165107)
scaffold0001 (259-312)||(60880-60933)
scaffold0001 (31-63)||(172210-172242)
scaffold0001 (31-63)||(177913-177945)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (252-312)||(218-278)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (252-312)||(7643-7703)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (252-312)||(10011-10071)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (161-269)||(11862-11970)
scaffold0162 (31-63)||(26340-26372)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (161-273)||(49877-49989)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (252-312)||(85406-85466)
scaffold0014 (248-312)||(159373-159438)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (123-270)||(5338-5485)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-62)||(1701-1762)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-62)||(94-155)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-62)||(19820-19881)
scaffold0122 (2-62)||(24125-24185)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (247-312)||(48221-48286)
scaffold0068 (247-312)||(61669-61734)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (252-312)||(689-749)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (173-296)||(17355-17478)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (252-312)||(631-691)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (252-308)||(21590-21646)
scaffold0120 (252-312)||(31285-31345)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (2-62)||(20493-20553)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (252-312)||(253102-253162)
scaffold0012 (31-63)||(247366-247398)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (252-310)||(118076-118134)
scaffold0035 (259-312)||(109582-109635)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (168-273)||(6252-6357)
[»] scaffold0310 (4 HSPs)
scaffold0310 (1-62)||(6274-6335)
scaffold0310 (25-62)||(4-41)
scaffold0310 (252-312)||(227-287)
scaffold0310 (252-312)||(6521-6581)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (252-312)||(95-155)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (252-312)||(25032-25092)
scaffold0158 (252-312)||(25285-25345)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (252-312)||(11681-11741)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (248-312)||(33736-33800)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (252-312)||(5015-5075)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (252-312)||(112658-112718)
scaffold0022 (179-270)||(67997-68089)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (252-310)||(9063-9121)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (173-270)||(12637-12734)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (252-312)||(70687-70748)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (161-240)||(902-981)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (278-312)||(3373-3407)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (31-65)||(5990-6024)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (31-65)||(57392-57426)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (164-213)||(10992-11041)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (173-226)||(7112-7165)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (160-225)||(244855-244920)
scaffold0009 (31-63)||(272330-272362)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (31-63)||(1431-1463)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (31-63)||(1492-1524)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (31-63)||(9183-9215)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (31-63)||(2700-2732)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (31-63)||(12418-12450)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (31-63)||(1430-1462)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (31-63)||(22857-22889)
scaffold0141 (31-63)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (31-63)||(1496-1528)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 35015027 - 35015339
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015027 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 35015126  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015127 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 35015226  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015227 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 35015326  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  35015327 ttcatgatcaatg 35015339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 19983162 - 19983466
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983162 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 19983261  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983262 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 19983361  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19983362 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttt-aaaactatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgt 19983460  T
Q  301 ttcatg 306  Q
    ||||||    
T  19983461 ttcatg 19983466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18583702 - 18583391
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18583702 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcctgttctatgcatcattg 18583603  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583602 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 18583503  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583502 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 18583403  T
Q  301 ttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  18583402 ttcatgatcaat 18583391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26089809
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 26089992  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26089991 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcataatgta 26089892  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26089891 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 26089809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002677
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgggcataagtgattatcatgaacc 18002494  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002495 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttcatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 18002594  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002595 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 18002677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23994997
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 23995180  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995179 caatatttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 23995080  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995079 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 23994997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742401
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatcctttggttaattctttttctcttgttc-atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 15742218  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatg-ttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742219 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgattatgttaatttgatgattaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15742318  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742319 tgaaaatgggtaatttgtatattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 15742401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991186
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgtttaattctttttctcttgattttatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 4991328  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  4991327 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgtt-atttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 4991229  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  4991228 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 4991186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 296
Target Start/End: Original strand, 15889601 - 15889871
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||  ||    
T  15889601 taattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaatacgtgattattgtg 15889700  T
Q  126 aatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 225  Q
    || |||| |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15889701 aacccaacctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttcatga 15889800  T
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15889801 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaactgatgaattatgacat-gttgttgatgaattgtgat 15889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 296
Target Start/End: Original strand, 22585441 - 22585711
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  22585441 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttg 22585540  T
Q  126 aatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 225  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22585541 aacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 22585640  T
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  22585641 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 22585711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 296
Target Start/End: Original strand, 22590272 - 22590542
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  22590272 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttg 22590371  T
Q  126 aatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 225  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22590372 aacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 22590471  T
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  22590472 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 22590542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 297
Target Start/End: Original strand, 15004831 - 15005072
Alignment:
Q  55 cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttattt 154  Q
    |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  15004831 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagagattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgt 15004930  T
Q  155 gatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattat 254  Q
      ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  15004931 tgtagtgatatgtttgagtatgt-aatttgatgttgattgaattgttgatgaggaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattat 15005029  T
Q  255 gctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgata 297  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15005030 gttcaattgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgata 15005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 25640456 - 25640694
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| ||    
T  25640456 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttaggtaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 25640555  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||  ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25640556 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtag-gatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtag 25640654  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  25640655 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 25640694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 270
Target Start/End: Original strand, 32276756 - 32276902
Alignment:
Q  124 tgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcat 223  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  | |  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  32276756 tgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcat 32276855  T
Q  224 gatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  32276856 aatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaatt 32276902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 13014822 - 13014882
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13014822 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaat 13014882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32898924 - 32898864
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32898924 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 32898864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 311
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744385
Alignment:
Q  257 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 311  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 25744385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19629556 - 19629447
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  19629556 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 19629457  T
Q  261 ttggtgaatt 270  Q
    ||| ||||||    
T  19629456 ttgatgaatt 19629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18570413 - 18570353
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18570413 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18570353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22441068 - 22441008
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22441068 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaat 22441008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18432777 - 18432708
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatgtgatgatgt 322  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18432777 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat-tgatgatgt 18432708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18777280 - 18777219
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18777280 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatg 18777219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 16300010 - 16300122
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||  ||    
T  16300010 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcctaa 16300109  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| | |||||||    
T  16300110 ttgataaattatg 16300122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 18823417 - 18823529
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   || ||||||| ||    
T  18823417 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaagttatgcttaa 18823516  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  18823517 ttgatgacttatg 18823529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 18839272 - 18839384
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  18839272 gataagtttgagtatgttaactgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 18839371  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  18839372 ttgatgacttatg 18839384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21931429 - 21931333
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgct 257  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||  |||| |||||||||    
T  21931429 gatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaattatgct 21931333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31628402 - 31628342
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31628402 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 31628342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26512349 - 26512260
Alignment:
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa 268  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26512349 aatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaa 26512260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26517465 - 26517376
Alignment:
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa 268  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26517465 aatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaa 26517376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 17374924 - 17375018
Alignment:
Q  136 ttgaaattcgtgct-tatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  17374924 ttgaaattcgtgctctagttg-tagtgatatgtttgagtatgctaatttgttgataattgaattattgatgatgaaattacatgttcatggtgtat 17375018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16106650 - 16106592
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatca 310  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16106650 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatca 16106592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16086151 - 16086093
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatca 310  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16086151 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatca 16086093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650053
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1650053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19175376 - 19175311
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 226  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  19175376 gatatgtttgagtatataaaattgatgataattgaattgttgttgataaaattgcatgttcatgat 19175311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16136487 - 16136423
Alignment:
Q  162 atatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 226  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16136487 atatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaatagtttttgatgaaattgcatgttcatgat 16136423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16232231 - 16232199
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232231 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16232199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19610357 - 19610325
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610357 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 19610325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22275107 - 22274795
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275107 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 22275008  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275007 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 22274908  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22274907 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggttgtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgt 22274808  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  22274807 ttcatgatcaatg 22274795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22284340 - 22284029
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22284340 gtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcatatttg 22284241  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22284240 attatgagaataagtgattatcatgaactcaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttaatgttaaatgaattgt 22284141  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22284140 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagttagtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgt 22284041  T
Q  301 ttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  22284040 ttcatgatcaat 22284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9653077
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttttcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 9652895  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652896 aatctttgaaattcgtggttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 9652995  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9652996 gaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaat 9653077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 21273949 - 21274230
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21273949 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 21274047  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274048 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 21274147  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21274148 tgaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaat 21274230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15633599 - 15633327
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633599 gtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcacttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 15633500  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||  | |  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  15633499 attatgagaataagtgattataatgaacccaattcttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgt 15633400  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    || |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15633399 tggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 15633327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213162
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 25213304  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  25213303 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 25213205  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  25213204 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 25213162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7321872 - 7321633
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||  |  |||||| | |||||||||  || ||||  |||||||||| |||  |||| ||    
T  7321872 taaggtaagggggttagaattcattataatcacttagttaatttctactctcttttcctatgcatacgtgcttatttgaataagtgactattgtgaaccc 7321773  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||  ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  7321772 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattttttatgatgaaatttcatgtttatgatgtat 7321673  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  7321672 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 7321633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 23836791 - 23836878
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23836791 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 23836878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 19794599 - 19794661
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19794599 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19794661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20627208 - 20627270
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20627208 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcat 20627270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 25876006 - 25876091
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 311  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25876006 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaa 25876091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 43642851 - 43642913
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43642851 gtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcat 43642913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20279688 - 20279571
Alignment:
Q  109 aataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 208  Q
    |||||||||||||  ||||   |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20279688 aataagtgattatggtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcatgttatagagatatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatg 20279589  T
Q  209 aaattgcaagttcatgat 226  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20279588 aaattgcatgttcatgat 20279571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32465992 - 32465932
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32465992 tatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 32465932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33128270 - 33128135
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  33128270 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 33128171  T
Q  261 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    ||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  33128170 ttgatgacttatgacat-gttgttgttgaattgtgat 33128135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6879597 - 6879511
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6879597 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaat 6879511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 24826748 - 24826860
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  24826748 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 24826847  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  24826848 ttgatgacttatg 24826860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Original strand, 28031230 - 28031380
Alignment:
Q  123 atgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 222  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  | |  | | |||| |||| | ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  28031230 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagttttagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 28031329  T
Q  223 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    | |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28031330 taatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 28031380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 271304 - 271244
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  271304 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 271244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17204550 - 17204445
Alignment:
Q  168 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 267  Q
    |||| ||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  17204550 ttgagtatgttaattgcatcataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 17204451  T
Q  268 attatg 273  Q
     |||||    
T  17204450 cttatg 17204445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25602158 - 25602098
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25602158 tatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 25602098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890858
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36890798 tatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaat 36890858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 4448246 - 4448306
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4448246 tatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaat 4448306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28974183 - 28974123
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28974183 tatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaat 28974123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19666884 - 19666843
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 68  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19666884 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 19666843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25595245 - 25595168
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgg 238  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || | |||||||||    
T  25595245 gatatgtttgagtacatgaatttggtgataaatgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgg 25595168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 463043
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 463043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 3798520 - 3798552
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3798520 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 3798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 8944185 - 8944153
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8944185 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8944153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 12635785 - 12635817
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12635785 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12635817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 12641559 - 12641591
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12641559 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 12728731 - 12728699
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12728731 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12728699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16935932 - 16935900
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16935932 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16935900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 17006592 - 17006560
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17006592 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17006560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863235
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22863235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 24341513 - 24341577
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  24341513 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaat 24341577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982396
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36982396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 42177886 - 42177918
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42177886 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 42177918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 126799 - 126488
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  126799 tgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctattgttctatgcataattga 126700  T
Q  102 ttatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126699 ttatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgcagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgtt 126600  T
Q  202 gatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126599 gatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtt 126500  T
Q  302 tcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||||    
T  126499 tcatgatcaatg 126488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 32493916 - 32494228
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32493916 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 32494015  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32494016 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgtttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgt 32494115  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494116 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 32494215  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||| ||||    
T  32494216 ttcatgattaatg 32494228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 111139 - 111451
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111139 gtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 111238  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  111239 attatgaaaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatggt 111338  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111339 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 111438  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  111439 ttcatgatcaatg 111451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 1936887 - 1937177
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936887 gtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 1936986  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936987 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 1937086  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1937087 tcatgatgaaattgcaagttcatgat-----aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaattatgat 1937177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2028995
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattttttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 2029177  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2029176 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtac 2029077  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2029076 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 2028995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056470
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 42056287  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056288 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 42056387  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056388 tgaaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 42056470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 2190085 - 2190367
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2190085 taaggtaaggcggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgtacc 2190184  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190185 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 2190284  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190285 tgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 2190367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049657
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 3049838  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049837 aatctttgaaattcgtgtttatattgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattg-ggatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 3049739  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049738 gaatatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 3049657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516901
Alignment:
Q  35 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaat 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 15516864  T
Q  134 ctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttg 170  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15516865 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttg 15516901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Original strand, 39291457 - 39291648
Alignment:
Q  79 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgtt 178  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||| | ||  ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||    
T  39291457 tctctttttctatgcataagtacttatttgaataagtgattattgtgaacctaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtt 39291556  T
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39291557 aatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttgatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaatt 39291648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13352306 - 13352065
Alignment:
Q  33 aggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcca 131  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||| ||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| |||    
T  13352306 aggtaagggggttagatttcaagcataatcacttaattagtttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaataagtgattattgtgaaccca 13352207  T
Q  132 atctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 231  Q
    | | |||||||||||||| || |  ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  13352206 acccttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttaatttgatgatatttgatttgttgatggtgaaattgcatgttcatgatgtata 13352107  T
Q  232 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13352106 taaatgggtagtattttaattatgctcaattgatgaattatg 13352065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046796
Alignment:
Q  256 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 39046796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 3060333 - 3060271
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3060333 gtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcat 3060271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 143800 - 143713
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  143800 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 143713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35094974 - 35094888
Alignment:
Q  228 tatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatgt 314  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35094974 tatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaatgt 35094888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44865391 - 44865308
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 308  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44865391 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 44865308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 47289942 - 47289855
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47289942 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 47289855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Original strand, 15977820 - 15978004
Alignment:
Q  110 ataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgct-tatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 208  Q
    |||||||||||| |||||   ||| |||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  15977820 ataagtgattattatgaactaaatgtttgaaattcatgctctagttg-tagtgatatgtttgagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatg 15977918  T
Q  209 aaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtg 294  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||| || ||  | |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  15977919 aaattgcatgttcatggtgtatatatatggatacttgatgaattatactcaaatgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtg 15978004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3895099
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3895159 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 3895099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287493
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11287551 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatca 11287493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 371308 - 371203
Alignment:
Q  168 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 267  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  371308 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 371209  T
Q  268 attatg 273  Q
     |||||    
T  371208 cttatg 371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 7283926 - 7283987
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7283926 gtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 296
Target Start/End: Original strand, 8563369 - 8563505
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||  |||| | ||||||||||    
T  8563369 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatatataaatgagtatattgtgagttatgctcaa 8563468  T
Q  261 ttgg-tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgat 296  Q
     ||| |||||| ||   |||||||| ||| |||||||    
T  8563469 atggatgaattgtgttaggttgttgttgatttgtgat 8563505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 15822544 - 15822604
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15822544 tatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 15822604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 7284173 - 7284233
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7284173 tatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 7284233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370009
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  12369953 tatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgat 12370009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12759061
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12759121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaat 12759061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070437
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26070377 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 26070437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094224
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26094164 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 26094224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Original strand, 12248233 - 12248295
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  12248233 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatg 12248295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 15575874 - 15575920
Alignment:
Q  164 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15575874 atgtttggatatgttaatttgatgttaattaagttgttgatgatgaa 15575920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 210
Target Start/End: Original strand, 17984753 - 17984827
Alignment:
Q  136 ttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 210  Q
    ||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17984753 ttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattgttgatgatgaa 17984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 312
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452339
Alignment:
Q  278 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 45452339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13274922 - 13274861
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  13274922 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 13274861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13377894 - 13377849
Alignment:
Q  20 ttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 65  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13377894 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt 13377849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 16570118 - 16570179
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16570118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaat 16570179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16595544 - 16595483
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16595544 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaat 16595483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124445
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 68  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 25124445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13758709 - 13758677
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13758709 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15862258 - 15862226
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862258 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15862226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15927907 - 15927875
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15927907 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15927875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16212071
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16212071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 226
Target Start/End: Original strand, 18151259 - 18151399
Alignment:
Q  86 ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttga 185  Q
    |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  ||||   || | |||||||||||||| || |  ||| |||||| ||   ||||||||||||     
T  18151259 ttctatgcataaattcttatttgaataagtgattattgtgaacttaaccgttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgattaggtatgttaatttgt 18151358  T
Q  186 tgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 226  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  18151359 tgataattgaattgttgatgacgaatttgtatgttcatgat 18151399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 18979938 - 18979970
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18979938 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052971
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36052971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 31150 - 31462
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31150 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattg 31249  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31250 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 31349  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31350 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 31449  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  31450 ttcatgatcaatg 31462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41694 - 41382
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41694 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattg 41595  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41594 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 41495  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41494 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 41395  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  41394 ttcatgatcaatg 41382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 5953 - 6265
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5953 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 6052  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6053 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgatttgt 6152  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6153 taatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 6252  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  6253 ttcatgatcaatg 6265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 5747 - 5923
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5747 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 5846  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||    
T  5847 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttctgttgtagagatgtgtttgaatatgt 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 80249 - 79937
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80249 gtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 80150  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  80149 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgt 80050  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  80049 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgt 79950  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||| ||||    
T  79949 ttcatgattaatg 79937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46238
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  46299 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatg 46238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40792 - 40731
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  40792 tatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatg 40731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 44034841 - 44035153
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034841 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 44034940  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44034941 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcttgtttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgt 44035040  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035041 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 44035140  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  44035141 ttcatgatcaatg 44035153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21860396 - 21860084
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860396 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattg 21860297  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860296 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtacttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 21860197  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860196 taatgatgaaattgcaagttcatgatgaatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 21860097  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||| ||||    
T  21860096 ttcatgattaatg 21860084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861608
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcca 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 15861426  T
Q  132 atctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861427 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 15861526  T
Q  232 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861527 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 15861608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 108 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22367296 - 22367092
Alignment:
Q  108 gaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367296 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 22367197  T
Q  208 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367196 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa-tatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 22367098  T
Q  308 tcaatg 313  Q
    ||||||    
T  22367097 tcaatg 22367092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41218790 - 41218667
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41218790 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 41218691  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcat 124  Q
    |||||| |||||||||||| ||||    
T  41218690 attatgggaataagtgattctcat 41218667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 41394589 - 41394527
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41394589 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 41394527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 22403196 - 22403279
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 308  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22403196 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 22403279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41212206 - 41212146
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41212206 tatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 41212146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49967784 - 49967724
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49967784 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaat 49967724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522492
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 35522492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20254539 - 20254430
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||    
T  20254539 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttatgaaattatgcttaa 20254440  T
Q  261 ttggtgaatt 270  Q
    ||| ||||||    
T  20254439 ttgatgaatt 20254430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Original strand, 21650076 - 21650181
Alignment:
Q  168 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 267  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  21650076 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 21650175  T
Q  268 attatg 273  Q
     |||||    
T  21650176 cttatg 21650181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21718362 - 21718302
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21718362 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaat 21718302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27329929
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  27329868 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatg 27329929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35054890 - 35054829
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35054890 tatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatg 35054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27675161 - 27675120
Alignment:
Q  20 ttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatc 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27675161 ttggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 237
Target Start/End: Original strand, 40436291 - 40436367
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatg 237  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  40436291 gatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatg 40436367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 9784177 - 9784234
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  9784177 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaat 9784234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051726
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 45051726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20194232 - 20194140
Alignment:
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-aattggtgaatt 270  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  20194232 aatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgataatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaatt 20194140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20445818 - 20445754
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20445818 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaat 20445754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20531583 - 20531519
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaat 20531519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844406
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 46523727 - 46523695
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46523727 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 46523695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 313
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17956166
Alignment:
Q  8 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataatcgattatga 17955960  T
Q  108 gaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955961 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtctgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 17956060  T
Q  208 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956061 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 17956160  T
Q  308 tcaatg 313  Q
    ||||||    
T  17956161 tcaatg 17956166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581704
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggg-ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 45581917  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45581916 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgaattgt 45581817  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45581816 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgt 45581717  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||| ||||    
T  45581716 ttcatgattaatg 45581704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3992935 - 3992624
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992935 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 3992836  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992835 attatgagaataagtaattatcatgaactcaacctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 3992736  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3992735 tgatgatgaaattgcaggttcatgatgtaggaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagt 3992636  T
Q  301 ttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  3992635 ttcatgatcaat 3992624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153015
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttaattaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 30153198  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153197 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 30153098  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153097 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 30153015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7854367 - 7854055
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854367 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 7854268  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854267 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 7854168  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7854167 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggataattggtaaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgt 7854068  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  7854067 ttcatgatcaatg 7854055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 54037994 - 54038306
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54037994 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 54038093  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54038094 attatgggaataagtgattatcatgaactcaatgtttgacattcgtgcttatattgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 54038193  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54038194 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgt 54038293  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||| ||||    
T  54038294 ttcatgattaatg 54038306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2844576 - 2844265
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2844576 gtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttgattctttttctcttattctatgcataattg 2844477  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844476 attatgggaataagcgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatttttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 2844377  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  2844376 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagt 2844277  T
Q  301 ttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  2844276 ttcatgatcaat 2844265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Original strand, 54685202 - 54685483
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcca 131  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54685202 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 54685301  T
Q  132 atctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685302 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 54685401  T
Q  232 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685402 aaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 54685483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771115
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 53771298  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771297 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 53771198  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771197 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 53771115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33341954
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 33342137  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342136 aatctttgaaattcgtgctaatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 33342037  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342036 gaaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatg 33341954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492447
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 23492629  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23492628 aatctttgaaattcttgcttatgttgtagagatatgtttgaatgtgttaatttgatgttaaatgaattgttgattatgaaattgcaagttcatgatgtat 23492529  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492528 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 23492447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261527
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcgtaattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16261710  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261709 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 16261610  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261609 cgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 16261527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38167988
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 38168170  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168169 aatctttgaaattcgtacttatgttgtagaaatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 38168070  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38168069 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaat 38167988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28558526 - 28558271
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28558526 taaggtaagagggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttccatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacct 28558427  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558426 aatctttgaaattcgtgcttatgtgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgataaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 28558327  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558326 gaaaatgggtagtttgtaaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 55513255 - 55513006
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513255 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 55513156  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55513155 attatggaaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattcgatgttaaatgaattgt 55513056  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513055 tgatgatgaaattgcaagttaatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 55513006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18970277 - 18970034
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  18970277 taaggtaagggggttagatttcaatcataaccacttagttagtttcttttctctttttctatgcataagtgattatttgaataagtgattattatgaacc 18970178  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    |||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18970177 caatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttaagtatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcatgatgta 18970078  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18970077 tgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaattatg 18970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15550964 - 15550714
Alignment:
Q  20 ttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgatt 119  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||  || ||||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  15550964 ttggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctctttttatgcataagtgctaatttgaataagtgatt 15550865  T
Q  120 atcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagt 219  Q
    ||  |||| ||||  ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15550864 attgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgt 15550765  T
Q  220 tcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  15550764 tcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 15550714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48421855 - 48421690
Alignment:
Q  108 gaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 207  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  48421855 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcatgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttggtgat 48421756  T
Q  208 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  48421755 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaattggtgaattatg 48421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 16996172 - 16996232
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996172 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 16996232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 317621 - 317681
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317621 tatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 317681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 50112164 - 50112224
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50112164 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 50112224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 22144358 - 22144445
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22144358 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 22144445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 15857133 - 15857195
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15857133 gtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19232151 - 19232089
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19232151 gtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 19232089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 312
Target Start/End: Original strand, 6154419 - 6154504
Alignment:
Q  228 tatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6154419 tatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 6154504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 12349843 - 12349903
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12349843 tatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 12349903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13817646 - 13817586
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13817646 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaat 13817586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 19570801 - 19570861
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19570801 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaat 19570861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 6146832 - 6146919
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6146832 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaat 6146919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 53898541 - 53898628
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  53898541 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaat 53898628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11402898 - 11402752
Alignment:
Q  78 ttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgt 177  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||  ||||||||||||||  ||||   |||  |||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||| |    
T  11402898 ttctctagttctatgcacaagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatat 11402799  T
Q  178 taatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 224  Q
     ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  11402798 gaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcatg 11402752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 16744011 - 16744073
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  16744011 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcat 16744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 309
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439513
Alignment:
Q  247 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 8275874 - 8275986
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  8275874 gataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 8275973  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  8275974 ttgatgaattatg 8275986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 9303129 - 9303241
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  9303129 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 9303228  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  9303229 ttgatgacttatg 9303241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349712
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12349652 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 12349712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14285187 - 14285075
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   ||| |||||| ||    
T  14285187 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaaatatgcttaa 14285088  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  14285087 ttgatgaattatg 14285075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100727
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17100787 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17100727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101412
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17101472 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17101412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54424086
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54424146 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 54424086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19946918 - 19946812
Alignment:
Q  167 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtg 266  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||| ||    
T  19946918 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagtagttgtgaaattatgcttaattgatg 19946819  T
Q  267 aattatg 273  Q
    | |||||    
T  19946818 atttatg 19946812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 226
Target Start/End: Original strand, 14177040 - 14177105
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 226  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14177040 gatatgtttcagtatgttcatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 14177105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Original strand, 16934010 - 16934115
Alignment:
Q  168 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 267  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  16934010 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 16934109  T
Q  268 attatg 273  Q
     |||||    
T  16934110 cttatg 16934115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 8268774 - 8268886
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||| ||| |||   |||||||||| ||    
T  8268774 gataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaattggttgttatgaaattatgcttaa 8268873  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  8268874 ttgatgaattatg 8268886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14298555 - 14298495
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14298555 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaat 14298495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14304182 - 14304122
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14304182 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaat 14304122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17393735 - 17393590
Alignment:
Q  86 ttctatgcataattgatta--tgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgct-tatttgatagagatatgtttgaatatgttaatt 182  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||   |||  |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  17393735 ttctatgcataattgcttaattgaga-taagtgattattatgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttg-tagtgatatgtttgggtatgttaatt 17393638  T
Q  183 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    || || ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17393637 tgttgataattgaattattgacgatgaaattgcatgttcatgctgtat 17393590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 19260952 - 19261012
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19260952 tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 19261012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35123830 - 35123770
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35123830 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaat 35123770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 16182032 - 16182118
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16182032 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaat 16182118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 226
Target Start/End: Original strand, 12539066 - 12539156
Alignment:
Q  136 ttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 226  Q
    ||||||||||||||  | |  ||| |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12539066 ttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatggttgagtatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 12539156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523062
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17523002 tatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaat 17523062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 37915290 - 37915361
Alignment:
Q  136 ttgaaattcgtgct-tatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 207  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37915290 ttgaaattcgtgctctagttg-tagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttgatgat 37915361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Original strand, 38375718 - 38375798
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggta 241  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  38375718 gatatgtttgagtacatgaatttgatgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatttgtgaaaatgggta 38375798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10913111 - 10913001
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-a 259  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||  |||| |||| ||||| |    
T  10913111 gatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctcta 10913012  T
Q  260 attggtgaatt 270  Q
    |||| ||||||    
T  10913011 attgttgaatt 10913001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Original strand, 13301360 - 13301401
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 68  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13301360 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13301401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Original strand, 13312016 - 13312057
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 68  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13312016 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13312057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14295573 - 14295512
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  14295573 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 14295512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14301200 - 14301139
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  14301200 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaat 14301139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15615137
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15615137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39656494 - 39656453
Alignment:
Q  232 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  39656494 aaaatgggtagtttgtgaattatattcaattggtgaattatg 39656453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961068
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 68  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 51961068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2050115
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2050115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 8268650 - 8268682
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8268650 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 8275750 - 8275782
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8275750 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 11477220 - 11477332
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||| | | || ||||  || |||||| ||| |||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  11477220 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgatttgtggttaataaaataacatgttcataatgcatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 11477319  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  11477320 ttgatgaattatg 11477332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560410
Alignment:
Q  265 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatg 12560410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842519
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18911332 - 18911300
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18911332 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18911300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260781
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38527889 - 38527841
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgc 274  Q
    ||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38527889 tgtatgaaaatgggtatgtgggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 162048 - 162360
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162048 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 162147  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  162148 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgt 162247  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  162248 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 162347  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  162348 ttcatgatcaatg 162360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 166134 - 166446
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166134 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 166233  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  166234 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgt 166333  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  166334 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 166433  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  166434 ttcatgatcaatg 166446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 164349 - 164290
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164349 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 164290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Original strand, 116440 - 116485
Alignment:
Q  20 ttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  116440 ttggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattt 116485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 25119077 - 25119389
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119077 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattg 25119176  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119177 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatcttgaaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 25119276  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25119277 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgt 25119376  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  25119377 ttcatgatcaatg 25119389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 5682398 - 5682704
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5682398 gtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcatttagttaatt-ttttcctcttgttctatgcataattg 5682496  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682497 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 5682596  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682597 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaattgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 5682696  T
Q  301 ttcatgat 308  Q
    ||||||||    
T  5682697 ttcatgat 5682704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14951835
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 14952018  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952017 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 14951918  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951917 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 14951835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272493
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15272310  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272311 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaacgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15272410  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15272411 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaat 15272493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19559719 - 19559483
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||    
T  19559719 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcaattagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatg 19559620  T
Q  126 aatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 225  Q
     | ||||  |||||||||| |||| || |  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19559619 tacccaacttttgaaattcctgctcatgttgtagtgatatgtttgagcatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 19559520  T
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt 262  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19559519 tgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaatt 19559483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15136010
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15136006  T
Q  130 caat 133  Q
    ||||    
T  15136007 caat 15136010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 34177617 - 34177781
Alignment:
Q  108 gaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  34177617 gaataagtgattattgtgaatccaatcttgaaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaattacatgataattgaattgttgatgat 34177716  T
Q  208 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
     |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  34177717 aaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtag-ttgagaattatgttcaattggtgaattatg 34177781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49071994 - 49071800
Alignment:
Q  79 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgtt 178  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  |||| |||| | |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||    
T  49071994 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatcattgtgaacccaaccgttgaaattcgtgctcatattgtagtgatatgtttgagtatgtt 49071895  T
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||  || ||  | || |||||||||||| |||||||||    
T  49071894 aatttgatgttaattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgatatatgtatatgaatacttgatgaaatatgctcaattgatgaattatg 49071800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 53704846 - 53704906
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704846 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 53704906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34395418 - 34395331
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34395418 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 34395331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Original strand, 14500208 - 14500358
Alignment:
Q  123 atgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 222  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  | |  | | |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||    
T  14500208 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaatttaatgataaatgaattattggtgatgaaataacatgttca 14500307  T
Q  223 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14500308 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 14500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 54118138 - 54118200
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54118138 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 54118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 820029 - 820089
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  820029 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 820089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 8872584 - 8872644
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8872584 tatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 8872644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30458037 - 30457977
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30458037 tatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 30457977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44056049 - 44055989
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44056049 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 44055989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 53907812 - 53907872
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53907812 tatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaat 53907872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44346961 - 44346902
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44346961 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaa 44346902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14996353 - 14996241
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  14996353 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaaagaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 14996254  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  14996253 ttgatgaattatg 14996241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16523044 - 16522932
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  16523044 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 16522945  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  16522944 ttgatgacttatg 16522932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732243
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16732303 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 16732243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959636
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21959576 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 21959636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376770
Alignment:
Q  256 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 55376770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 23270020 - 23270107
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23270020 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaat 23270107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21417536 - 21417471
Alignment:
Q  157 tagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21417536 tagagatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttca 21417471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8045170 - 8045058
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||| ||    
T  8045170 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 8045071  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  8045070 ttgatgacttatg 8045058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9295920 - 9295808
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  9295920 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtaatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 9295821  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  9295820 ttgatgacttatg 9295808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232670
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  30232609 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatg 30232670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 244
Target Start/End: Original strand, 32460743 - 32460820
Alignment:
Q  167 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtt 244  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32460743 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaaggggtagtt 32460820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9795442 - 9795330
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||| | |||||| ||||||   |||||||| | ||    
T  9795442 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattcttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtcaaaatgagtagttgtgaaattatgtttaa 9795343  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    |||||||||||||    
T  9795342 ttggtgaattatg 9795330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Original strand, 12133631 - 12133686
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 216  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12133631 gatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttaatgatgaaattgca 12133686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837374
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12837313 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatg 12837374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 45458968 - 45459028
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaat 45459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 270
Target Start/End: Original strand, 16225211 - 16225301
Alignment:
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| || | ||||| || ||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16225211 aatttgatggtatttgaattgttgttgtttaaattacatgttcatgaa-tatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaatt 16225301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Original strand, 19697408 - 19697514
Alignment:
Q  167 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtg 266  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||  || |||||| |||||||| |||| || |||   |||||||||| ||||| ||    
T  19697408 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttagttatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatg 19697507  T
Q  267 aattatg 273  Q
    |||||||    
T  19697508 aattatg 19697514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Original strand, 19707993 - 19708099
Alignment:
Q  167 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtg 266  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||  || |||||| |||||||| |||| || |||   |||||||||| ||||| ||    
T  19707993 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttagttatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatg 19708092  T
Q  267 aattatg 273  Q
    |||||||    
T  19708093 aattatg 19708099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14996478 - 14996445
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14996478 ttaaggtaagggggttagttattatcataatcat 14996445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 7131982 - 7132014
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7131982 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7132014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 10104374 - 10104438
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  10104374 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaat 10104438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246737
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13246737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 15287162 - 15287194
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287162 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 15294271 - 15294303
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294271 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15294303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 15675213 - 15675277
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  15675213 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaat 15675277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 17145574 - 17145606
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17145574 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17145606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20001062 - 20001030
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20001062 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 20001030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31115768 - 31115704
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  31115768 aaattatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaat 31115704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11343039 - 11342758
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcca 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11343039 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 11342940  T
Q  132 atctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342939 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 11342840  T
Q  232 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342839 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 11342758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2032165 - 2031883
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2032165 taaggtaagggggttagttttcatcataatcgtttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 2032066  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2032065 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 2031966  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031965 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 2031883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 44 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21205268 - 21205000
Alignment:
Q  44 ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaatt 143  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21205268 ttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatt 21205169  T
Q  144 cgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagt 243  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205168 cgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagt 21205069  T
Q  244 ttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205068 ttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21205000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21651050 - 21650769
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21651050 taaggtaagggggttaatatttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctgtgcatagttgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 21650951  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650950 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 21650851  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21650850 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 21650769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105757
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16105900  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||    
T  16105899 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgta 16105801  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16105800 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 16105757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Original strand, 22662653 - 22662805
Alignment:
Q  109 aataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 208  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22662653 aataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatg 22662752  T
Q  209 aaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaat 261  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22662753 aaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaat 22662805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25005165 - 25004929
Alignment:
Q  35 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatc 134  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||| |||| || | |   ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25005165 gtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtttagt--ttttcaattgttgtatgaataagtgctcaattgaataagtgattattgtgaacccaatc 25005068  T
Q  135 tttgaaattcgtgcttat-ttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaa 233  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| | ||||||||| | | ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  25005067 tttgaaattcgtgctcatgttga-agtgatatgtttgagtgtgttaatttaaggataattgaattgttaattatgaaattgcatgttcatgatgtatgta 25004969  T
Q  234 aatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  25004968 aatgggtagtttgagaattatgctcaattggtgatttatg 25004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21397253 - 21397166
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21397253 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 21397166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865337
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865397 tatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 4865337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 21646826 - 21646912
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646826 tgtatgaaaatgggtatgtatgaaaat-atgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21646912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168377
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1168317 tatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 1168377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7529126 - 7529014
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  7529126 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 7529027  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  7529026 ttgatgaattatg 7529014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24475738 - 24475654
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24475738 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat 24475654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28261655 - 28261595
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28261655 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaat 28261595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17909731 - 17909622
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  17909731 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 17909632  T
Q  261 ttggtgaatt 270  Q
    ||| ||||||    
T  17909631 ttgatgaatt 17909622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20712210 - 20712150
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20712210 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaat 20712150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Original strand, 9730419 - 9730524
Alignment:
Q  168 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 267  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  9730419 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 9730518  T
Q  268 attatg 273  Q
     |||||    
T  9730519 cttatg 9730524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183305
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  24183245 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaat 24183305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11584188 - 11584124
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584188 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 11584124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11584435 - 11584374
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584435 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 108862 - 108974
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  108862 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaattaacatgttcataatgtatgaaaatggattgttgtgaaattatgcttaa 108961  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| ||| |||||    
T  108962 ttgatgacttatg 108974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337359
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11337299 tatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 11337359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21906851 - 21906791
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21906851 tatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 21906791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673936
Alignment:
Q  259 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 3673936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19405672 - 19405611
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19405672 tatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 19405611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 7425663 - 7425631
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7425663 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 22053957 - 22054021
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22053957 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaat 22054021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507270
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23507270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 35791015 - 35791047
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35791015 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 35791047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 24716732 - 24717044
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716732 gtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 24716831  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716832 attatgagaataagtgattatcatgaacccgatctttgaaattcgtggttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 24716931  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24716932 tgataatgaaattgcaagttcacgatgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgt 24717031  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||| ||||||    
T  24717032 ttcatgttcaatg 24717044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 274828 - 274517
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  274828 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattg 274729  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  274728 attatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgt 274629  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  274628 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagt 274529  T
Q  301 ttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  274528 ttcatgatcaat 274517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 641021 - 641332
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  641021 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattg 641120  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  641121 attatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgt 641220  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  641221 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagt 641320  T
Q  301 ttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  641321 ttcatgatcaat 641332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 826827 - 827138
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  826827 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattg 826926  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  826927 attatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgt 827026  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  827027 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagt 827126  T
Q  301 ttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  827127 ttcatgatcaat 827138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 41506709 - 41506991
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  41506709 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 41506808  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506809 aatctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 41506908  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506909 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 41506991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39115660 - 39115348
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115660 gtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 39115561  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115560 attatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgacattcgtgcttatgttgtaaagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 39115461  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39115460 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtaatttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgt 39115361  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  39115360 ttcatgatcaatg 39115348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385914
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattccttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattattatgaaccc 24385751  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385752 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgataatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 24385851  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24385852 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgt 24385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 16038916 - 16039062
Alignment:
Q  166 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggt 265  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16038916 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagt 16039015  T
Q  266 gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16039016 gaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 16039062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 272
Target Start/End: Original strand, 22321437 - 22321587
Alignment:
Q  122 catgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321437 catgaacccaatctttgaaattcgtgctcaggttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 22321536  T
Q  222 atgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321537 atgacgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 22321587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 21259391 - 21259630
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| ||    
T  21259391 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 21259490  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||  ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21259491 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtat 21259590  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21259591 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 21259630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17502521 - 17502274
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 125  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||    
T  17502521 taattgagataagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatg 17502422  T
Q  126 aatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 225  Q
    || ||||||||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17502421 aacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatga 17502322  T
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17502321 tgtatataaaagggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatg 17502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23218208 - 23217990
Alignment:
Q  55 cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttattt 154  Q
    |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||| |    
T  23218208 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgcttatgt 23218109  T
Q  155 gatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattat 254  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  23218108 ggtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttaatgatgtatataaatggctagtttgtgaattat 23218009  T
Q  255 gctcaattggtgaattatg 273  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  23218008 gttcaattgatgaattatg 23217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4234162 - 4233968
Alignment:
Q  79 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgtt 178  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| || |   || ||||||||||| ||||||    
T  4234162 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgcagtgatatgtttgagtatgtt 4234063  T
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  4234062 aatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattattttcaattgatgaattatg 4233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 22234890 - 22234976
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234890 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 22234976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 16404870 - 16404932
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16404870 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41246792 - 41246732
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41246792 tatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 41246732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 19993141 - 19993227
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  19993141 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaat 19993227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37611829 - 37611742
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37611829 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 37611742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22886590 - 22886440
Alignment:
Q  123 atgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |  | |  ||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  22886590 atgaatccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtaataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 22886491  T
Q  223 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22886490 taatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaactatg 22886440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Original strand, 18118259 - 18118376
Alignment:
Q  109 aataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 208  Q
    |||||||||||||  ||||   |||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  18118259 aataagtgattattgtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcgtgttatagagatatgtttgcgtatataaatttgatgataattgaattgttgttgatg 18118358  T
Q  209 aaattgcaagttcatgat 226  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18118359 aaattgcatgttcatgat 18118376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22147664 - 22147555
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  22147664 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 22147565  T
Q  261 ttggtgaatt 270  Q
    ||| ||||||    
T  22147564 ttgatgaatt 22147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2545167 - 2545061
Alignment:
Q  166 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggt 265  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |    
T  2545167 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatattcataatgtgtgaaaatgggtagttgtaaaattatgcttaattgat 2545068  T
Q  266 gaattat 272  Q
    |||||||    
T  2545067 gaattat 2545061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18612632 - 18612523
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  18612632 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaa 18612533  T
Q  261 ttggtgaatt 270  Q
    ||| ||||||    
T  18612532 ttgatgaatt 18612523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18619537 - 18619428
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  18619537 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaa 18619438  T
Q  261 ttggtgaatt 270  Q
    ||| ||||||    
T  18619437 ttgatgaatt 18619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20481739 - 20481679
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20481739 tatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaat 20481679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561804
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 20573305 - 20573365
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20573305 tatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 20573365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20648002
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20648002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 20654018 - 20654078
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20654018 tatgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20654078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Original strand, 21494496 - 21494592
Alignment:
Q  167 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattg 263  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||    
T  21494496 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaaggggtagttgtgaaattatgcttaattg 21494592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16002223 - 16002113
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-a 259  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||| |    
T  16002223 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataatttaattgttgttgatgaaattgtatgttcatgatatgtgaaaatgagtatattgtaaattgtgctcta 16002124  T
Q  260 attggtgaatt 270  Q
    |||| ||||||    
T  16002123 attgttgaatt 16002113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Original strand, 3431317 - 3431422
Alignment:
Q  168 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 267  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||| |||    
T  3431317 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttgtgaaattatgcttaattgatga 3431416  T
Q  268 attatg 273  Q
     |||||    
T  3431417 cttatg 3431422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 65
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194251
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 65  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcattt 31194251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21681137 - 21681076
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaa-ttatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21681137 tatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaat 21681076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 13662182 - 13662214
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662182 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13662214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 13720845 - 13720877
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13720845 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13720877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 16872968 - 16873000
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16872968 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16873000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373424
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43373424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55655
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 55837  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55836 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtag 55737  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55736 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 55655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 134
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108179
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctctt-gttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 108174  T
Q  130 caatc 134  Q
    |||||    
T  108175 caatc 108179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 878 - 1159
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 977  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  978 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagaggtttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 1077  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13567
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 13384  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13385 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 13484  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13485 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 13567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 203 - 312
Target Start/End: Original strand, 21432 - 21541
Alignment:
Q  203 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21432 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 21531  T
Q  303 catgatcaat 312  Q
    ||||||||||    
T  21532 catgatcaat 21541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17585
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcatttaggtaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataattgattatcatgaaccc 17403  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17404 aatctttgaaattagtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgattttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 17503  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17504 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 17585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 322 - 633
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  322 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatctagttaattctttt-ctcttgttctatgcataattg 420  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  421 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatatttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 520  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  521 agatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgt 620  T
Q  301 ttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||    
T  621 ttcatgatcaatg 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 312
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6724
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgataataggtgcttatcatgaaccc 6542  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6543 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtcaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 6642  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6643 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaat 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30479 - 30164
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30479 gtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcatttagttaattatttttctcttgttctatgcataattg 30380  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379 attatgggaataagtgattatcatgaaccctatctttgaaattcatgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 30280  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatta---tgcatggttgttgatgaattgtgata 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |   || |||||||||||||||||||||||    
T  30279 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgttgtttgaaattgtatggttgttgatgaattgtgata 30180  T
Q  298 tgtttcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  30179 tgtttcatgatcaatg 30164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12702
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttcttttgttctatgcataattgattatgggaataagttattatcatgaaccc 12517  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaa--tgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12518 aatctttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgtgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 12617  T
Q  229 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12618 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 12702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 313
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19083
Alignment:
Q  279 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatg 19083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 312
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193668
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 193495  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193496 caatcattgaaattcgtgc---------agagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 193586  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  193587 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaat 193668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 312
Target Start/End: Original strand, 186560 - 186706
Alignment:
Q  165 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186560 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgg 186659  T
Q  265 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  186660 tgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaat 186706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4593
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacc 4445  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4446 caatctttgaaattagtgcttatgttgtagagatatgtttaaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 4545  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 312
Target Start/End: Original strand, 5 - 209
Alignment:
Q  108 gaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 104  T
Q  208 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  105 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatga 204  T
Q  308 tcaat 312  Q
    |||||    
T  205 tcaat 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 99 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 15023
Alignment:
Q  99 tgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236 tgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtcgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 15137  T
Q  199 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15136 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtttattttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 15037  T
Q  299 gtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  15036 gtttcatgatcaat 15023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 882 - 914
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 9882 - 10148
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa-ttgattatgagaataagtgattatcatgaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataaattgattatgaaaataagtgattatcatgaacc 9981  T
Q  130 caatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 10081  T
Q  230 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatg 313  Q
    ||||||||||||                 |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10082 tgaaaatgggta-----------------aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatg 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 42736 - 42568
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42736 gtgaagctagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 42640  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  42639 attatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatggttgaa 42568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130670
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatcc 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 130812  T
Q  131 aatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  130811 aatctttgaaattcgtgctcatgttgtagagatatgtttggatacgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 130713  T
Q  231 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  130712 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 130670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89642
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaat 89642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Original strand, 9537 - 9688
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9537 gataagtttgagtatgttaattgattgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagtttatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 9636  T
Q  261 ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9637 ttagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 9688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 296
Target Start/End: Original strand, 44009 - 44279
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 125  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||    
T  44009 taattgaggtaacggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctcttttgctatgcataagtgattatttgaataagtgattattgtg 44108  T
Q  126 aatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 225  Q
    || | ||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44109 aacctaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatggtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 44208  T
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    |||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  44209 tgtatgtaaataagtagtttgtgagttatgctcaattgacgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 44279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 95204 - 95049
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttt----gtaaattatgc 256  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||||||||||    
T  95204 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatagatagtttatttgtaaattatgc 95105  T
Q  257 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  95104 tcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 95049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 24841 - 24901
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24841 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 24901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1374 - 1643
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattg 100  Q
    |||||||| ||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | |   ||||  ||||| |||| |||| ||    
T  1374 gtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtagt---tttcatttgttgtatgaataagtg 1470  T
Q  101 attatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgt 200  Q
     |||   |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1471 cttaattgaataaatgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgt 1570  T
Q  201 tgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1571 tgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgagtagtttgagaattatgctcaattgatgaattatg 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 219
Alignment:
Q  108 gaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 207  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  384 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcttgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 285  T
Q  208 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  284 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgtgtagtttgtgaattatgctcaattgttgaattatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Original strand, 3732 - 3981
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 125  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  3732 taattgaggtaaaggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtg 3831  T
Q  126 aatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatat----gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 221  Q
    || ||||  ||||||||||||||| || |  ||| |||||    |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3832 aaaccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttc 3931  T
Q  222 atgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatta 271  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  3932 atgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaatta 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6133 - 5996
Alignment:
Q  136 ttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaa 235  Q
    |||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||    
T  6133 ttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatataagtaaa 6034  T
Q  236 tgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  6033 tgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgatttatg 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32363 - 32277
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32363 tgtatgaaaatgggtatgtttgaaaat-atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 32277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 41940 - 42026
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41940 tgtatgaaaatgggtatgtttg-aaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 42026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14948
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 14948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15644
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15584 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 15644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15337 - 15398
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15337 gtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 36836 - 36869
Alignment:
Q  30 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7018
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6932 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 7018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 935 - 995
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  935 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaat 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 254900 - 254987
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  254900 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 254987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 261506 - 261593
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  261506 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 261593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17962 - 17812
Alignment:
Q  123 atgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 222  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  | |  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  17962 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 17863  T
Q  223 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  17862 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 17812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 5359 - 5419
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5359 tatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 5419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 8994 - 9055
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  8994 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaat 9055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 132363 - 132423
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  132363 tatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 132423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 88409 - 88349
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  88409 tatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 88349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11761
Alignment:
Q  253 atgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaat 11761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Original strand, 5572 - 5722
Alignment:
Q  123 atgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  | |  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  5572 atgaatctaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 5671  T
Q  223 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 273  Q
    | |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||  |||||||||    
T  5672 taatgtatgaaaatgggttgttttgaaattatgcttaattaatgaattatg 5722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11881
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11821 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaat 11881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 34442 - 34554
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  34442 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 34541  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  34542 ttgatgaattatg 34554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38432 - 38372
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38432 tatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 38372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146675
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146735 tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 146675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146906
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 296
Target Start/End: Original strand, 61256 - 61391
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  61256 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 61355  T
Q  261 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    ||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  61356 ttgatgacttatgacat-gttgttgttgaattgtgat 61391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48903
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 48903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 153924 - 153956
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  153924 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 153956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22825 - 22765
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22825 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128127
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 128127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4359
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4445 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaat 4359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11827
Alignment:
Q  226 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11740 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 11827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1391
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1451 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Original strand, 70735 - 70793
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  70735 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatca 70793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 164995 - 165107
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||    
T  164995 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttcttatgaaattatgcttaa 165094  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  165095 ttgatgaattatg 165107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60880
Alignment:
Q  259 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 60880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172210
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 172210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177913
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 177913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 218
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  278 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7643
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  7703 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaat 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 10011
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10071 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 10011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11970 - 11862
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  11970 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 11871  T
Q  261 ttggtgaat 269  Q
    ||| |||||    
T  11870 ttgatgaat 11862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26372
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 273
Target Start/End: Original strand, 49877 - 49989
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || ||    
T  49877 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatacttaa 49976  T
Q  261 ttggtgaattatg 273  Q
    ||| |||||||||    
T  49977 ttgatgaattatg 49989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85406
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  85466 tatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 85406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159373
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 159373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5485 - 5338
Alignment:
Q  123 atgaatccaatctttgaaattcgtgcttatttgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 222  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  | |  | | |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  5485 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 5386  T
Q  223 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  5385 taatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 5338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1762 - 1701
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1762 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 94
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  155 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19820 - 19881
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19820 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 24125 - 24185
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24125 tgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48221
Alignment:
Q  247 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 48221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61669
Alignment:
Q  247 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat 61669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 689 - 749
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  689 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Original strand, 17355 - 17478
Alignment:
Q  173 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 272  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| | |   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17355 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgctgtgaaattatgcttaattgatgacttat 17454  T
Q  273 g-catggttgttgatgaattgtgat 296  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||    
T  17455 gacat-gttgttgttgaattgtgat 17478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 631 - 691
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  631 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21590
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21646 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 21590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31345 - 31285
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31345 tatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaat 31285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20553 - 20493
Alignment:
Q  2 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20553 tgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 253102 - 253162
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 253162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247398
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 247398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118134
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatca 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  118076 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatca 118134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109635
Alignment:
Q  259 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 109635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Original strand, 6252 - 6357
Alignment:
Q  168 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 267  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||| |||    
T  6252 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattaagcttaattgatga 6351  T
Q  268 attatg 273  Q
     |||||    
T  6352 cttatg 6357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 6274 - 6335
Alignment:
Q  1 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6274 gtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  25 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 227 - 287
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  227 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaat 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 6521 - 6581
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6521 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaat 6581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 95
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  155 tatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 25032
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  25092 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaat 25032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25285
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  25345 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaat 25285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 11681 - 11741
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11681 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaat 11741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33736
Alignment:
Q  248 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaat 33736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 5015
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5075 tatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 112658 - 112718
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  112658 tatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 112718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 270
Target Start/End: Original strand, 67997 - 68089
Alignment:
Q  179 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-aattggtgaatt 270  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  67997 aatttggtgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaatt 68089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 9063
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  9121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatca 9063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 270
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12734
Alignment:
Q  173 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 270  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||  || ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12637 tatgttaacttgttgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgttatatataaatgaataattgataaattatgctcaattgatgaatt 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 70748 - 70687
Alignment:
Q  252 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  70748 tatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 70687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 902 - 981
Alignment:
Q  161 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 240  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  902 gatatgtttgagtaaatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggt 981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3373
Alignment:
Q  278 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 3373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 65
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6024
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 65  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 65
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57426
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 65  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 57426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Original strand, 10992 - 11041
Alignment:
Q  164 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaatt 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  10992 atgtttgagtatgtgaatttgatgttgattgagttgttgatgatgaaatt 11041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7165
Alignment:
Q  173 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 226  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7112 tatgttaacttgttgataattgaattgttgatgatgaatttgcatgttcatgat 7165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Original strand, 244855 - 244920
Alignment:
Q  160 agatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 225  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  244855 agatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattatggatgatgaaattgtatgttcatga 244920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272330
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 272330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1463
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1431 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1524
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1492 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9183
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2700
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2732 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1430
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University