View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16837_low_1 (Length: 640)

Name: NF16837_low_1
Description: NF16837
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16837_low_1
NF16837_low_1
[»] chr8 (127 HSPs)
chr8 (235-640)||(19807933-19808334)
chr8 (235-640)||(22237590-22237991)
chr8 (306-640)||(17460694-17461024)
chr8 (295-640)||(25483870-25484211)
chr8 (295-560)||(15635576-15635840)
chr8 (295-560)||(39694924-39695188)
chr8 (295-560)||(41680530-41680795)
chr8 (295-591)||(364148-364444)
chr8 (295-548)||(19882371-19882624)
chr8 (295-591)||(44522822-44523118)
chr8 (295-548)||(11775125-11775378)
chr8 (235-527)||(21321676-21321968)
chr8 (295-575)||(26454087-26454367)
chr8 (295-527)||(18024091-18024323)
chr8 (295-553)||(20454638-20454895)
chr8 (295-525)||(22207693-22207923)
chr8 (295-524)||(18833898-18834127)
chr8 (295-591)||(44432221-44432518)
chr8 (295-527)||(20178917-20179149)
chr8 (295-525)||(6573453-6573682)
chr8 (295-553)||(23478478-23478736)
chr8 (295-591)||(17795592-17795888)
chr8 (235-527)||(21326274-21326566)
chr8 (295-527)||(21861016-21861248)
chr8 (295-519)||(38185482-38185706)
chr8 (295-553)||(42559924-42560181)
chr8 (295-520)||(39363955-39364180)
chr8 (295-527)||(5760957-5761189)
chr8 (299-527)||(6102153-6102381)
chr8 (295-527)||(19140189-19140421)
chr8 (295-553)||(20455395-20455652)
chr8 (295-553)||(20460373-20460630)
chr8 (295-525)||(42818303-42818533)
chr8 (295-527)||(39936407-39936638)
chr8 (295-523)||(44476851-44477080)
chr8 (295-523)||(44480113-44480342)
chr8 (295-575)||(19880205-19880484)
chr8 (295-526)||(17437714-17437945)
chr8 (295-523)||(8728333-8728561)
chr8 (295-527)||(20084034-20084266)
chr8 (295-566)||(27941285-27941556)
chr8 (295-540)||(21579603-21579848)
chr8 (298-560)||(42265994-42266252)
chr8 (295-525)||(5082608-5082838)
chr8 (295-531)||(23914344-23914579)
chr8 (295-531)||(22258700-22258935)
chr8 (295-527)||(22483171-22483402)
chr8 (362-527)||(361675-361840)
chr8 (295-527)||(32950025-32950241)
chr8 (295-540)||(29763265-29763510)
chr8 (295-526)||(17501350-17501581)
chr8 (295-478)||(23660688-23660871)
chr8 (306-527)||(20517525-20517745)
chr8 (295-452)||(36732920-36733077)
chr8 (295-527)||(4381189-4381420)
chr8 (295-527)||(22344466-22344697)
chr8 (295-527)||(22356126-22356357)
chr8 (299-531)||(23670069-23670300)
chr8 (295-531)||(38988886-38989121)
chr8 (295-531)||(39019983-39020218)
chr8 (295-527)||(36305083-36305314)
chr8 (399-640)||(14397604-14397834)
chr8 (295-452)||(21399209-21399366)
chr8 (295-452)||(21793702-21793859)
chr8 (429-547)||(8414240-8414358)
chr8 (337-527)||(18816898-18817089)
chr8 (295-527)||(17978813-17979044)
chr8 (295-527)||(22474176-22474407)
chr8 (295-531)||(36405456-36405691)
chr8 (523-640)||(40492711-40492824)
chr8 (295-448)||(21513823-21513975)
chr8 (355-527)||(18815279-18815450)
chr8 (526-615)||(17439367-17439456)
chr8 (523-640)||(20533267-20533380)
chr8 (295-414)||(16198371-16198490)
chr8 (523-640)||(19154744-19154857)
chr8 (295-524)||(24907203-24907430)
chr8 (547-640)||(23943876-23943965)
chr8 (296-414)||(14397308-14397426)
chr8 (296-414)||(18677632-18677750)
chr8 (525-640)||(16799636-16799748)
chr8 (296-414)||(4541941-4542059)
chr8 (295-389)||(8414145-8414239)
chr8 (296-414)||(24485611-24485729)
chr8 (295-374)||(1484918-1484997)
chr8 (295-374)||(20045762-20045841)
chr8 (295-386)||(45290114-45290205)
chr8 (523-615)||(14103083-14103175)
chr8 (296-404)||(22002239-22002347)
chr8 (295-527)||(25757577-25757808)
chr8 (295-374)||(5852859-5852938)
chr8 (295-374)||(14409011-14409090)
chr8 (338-527)||(18118603-18118792)
chr8 (523-612)||(22525689-22525778)
chr8 (295-527)||(25295557-25295788)
chr8 (295-374)||(14824291-14824370)
chr8 (445-520)||(21345945-21346020)
chr8 (294-381)||(22313401-22313488)
chr8 (337-448)||(24624171-24624282)
chr8 (298-452)||(19331976-19332128)
chr8 (295-525)||(18827650-18827879)
chr8 (295-389)||(24238977-24239071)
chr8 (295-374)||(4483796-4483875)
chr8 (295-527)||(45559572-45559796)
chr8 (295-377)||(4233215-4233297)
chr8 (295-452)||(21495086-21495243)
chr8 (523-612)||(37515878-37515967)
chr8 (525-612)||(20501962-20502049)
chr8 (295-385)||(223324-223414)
chr8 (295-385)||(688095-688185)
chr8 (295-385)||(736947-737037)
chr8 (295-385)||(860842-860932)
chr8 (523-569)||(23668025-23668071)
chr8 (590-640)||(23659556-23659602)
chr8 (528-593)||(26222945-26223010)
chr8 (523-611)||(22253024-22253112)
chr8 (525-561)||(22996068-22996104)
chr8 (502-540)||(23410018-23410056)
chr8 (525-571)||(28397763-28397809)
chr8 (295-331)||(272183-272219)
chr8 (295-331)||(643630-643666)
chr8 (295-331)||(829436-829472)
chr8 (295-359)||(17150635-17150699)
chr8 (487-523)||(18122327-18122363)
chr8 (295-359)||(22007105-22007169)
chr8 (523-571)||(22381593-22381641)
chr8 (295-359)||(29759455-29759519)
[»] chr3 (170 HSPs)
chr3 (235-640)||(14966317-14966718)
chr3 (295-640)||(43550073-43550414)
chr3 (295-640)||(50243048-50243389)
chr3 (295-593)||(24152840-24153138)
chr3 (295-640)||(16643320-16643661)
chr3 (299-525)||(53646460-53646686)
chr3 (299-560)||(6158789-6159049)
chr3 (295-553)||(2248366-2248624)
chr3 (295-525)||(33564555-33564785)
chr3 (295-540)||(14641946-14642191)
chr3 (295-548)||(35961283-35961536)
chr3 (295-559)||(10833735-10833999)
chr3 (295-548)||(41930-42183)
chr3 (295-527)||(11192505-11192736)
chr3 (295-527)||(40807420-40807652)
chr3 (295-553)||(11913119-11913377)
chr3 (433-640)||(52989492-52989694)
chr3 (295-527)||(50351396-50351628)
chr3 (295-527)||(54875879-54876111)
chr3 (295-554)||(6819507-6819765)
chr3 (295-553)||(1988628-1988885)
chr3 (299-569)||(8928065-8928335)
chr3 (295-560)||(12275941-12276205)
chr3 (295-543)||(37038226-37038475)
chr3 (295-591)||(10989200-10989495)
chr3 (295-527)||(14441592-14441824)
chr3 (295-575)||(16979287-16979566)
chr3 (295-527)||(35064977-35065208)
chr3 (295-526)||(40812258-40812489)
chr3 (295-560)||(3394398-3394662)
chr3 (295-527)||(3803259-3803491)
chr3 (296-548)||(6805358-6805610)
chr3 (295-527)||(14508272-14508503)
chr3 (265-527)||(17693492-17693754)
chr3 (295-560)||(179103-179367)
chr3 (295-520)||(10541854-10542079)
chr3 (295-520)||(43889195-43889420)
chr3 (295-527)||(5206050-5206282)
chr3 (295-527)||(17538531-17538762)
chr3 (295-527)||(22306979-22307211)
chr3 (296-540)||(42324618-42324862)
chr3 (295-525)||(17044392-17044622)
chr3 (295-540)||(18367154-18367399)
chr3 (295-527)||(35354023-35354258)
chr3 (295-523)||(20248380-20248608)
chr3 (295-566)||(9533514-9533785)
chr3 (295-550)||(10554668-10554923)
chr3 (295-566)||(14763357-14763628)
chr3 (295-550)||(55292037-55292292)
chr3 (295-520)||(12511279-12511504)
chr3 (295-523)||(38311399-38311628)
chr3 (295-527)||(2841859-2842090)
chr3 (296-520)||(14671255-14671479)
chr3 (339-527)||(44273898-44274086)
chr3 (337-548)||(13029714-13029925)
chr3 (295-566)||(23371103-23371374)
chr3 (295-527)||(15931903-15932135)
chr3 (295-527)||(17519269-17519501)
chr3 (295-527)||(17534131-17534363)
chr3 (337-548)||(13026122-13026333)
chr3 (306-527)||(13519706-13519928)
chr3 (295-560)||(13522806-13523071)
chr3 (295-524)||(17670105-17670334)
chr3 (295-524)||(17685239-17685468)
chr3 (295-520)||(18699869-18700094)
chr3 (295-527)||(14519687-14519918)
chr3 (295-521)||(17513010-17513236)
chr3 (295-540)||(10563120-10563365)
chr3 (296-527)||(41172767-41172999)
chr3 (295-566)||(51300780-51301051)
chr3 (295-527)||(43928775-43929007)
chr3 (295-553)||(31224349-31224608)
chr3 (295-521)||(19443941-19444167)
chr3 (295-526)||(49900153-49900392)
chr3 (298-566)||(18889749-18890017)
chr3 (299-527)||(50348426-50348654)
chr3 (339-520)||(12470233-12470414)
chr3 (298-548)||(16324940-16325190)
chr3 (295-527)||(14152795-14153027)
chr3 (295-527)||(15565938-15566169)
chr3 (296-527)||(9511563-9511793)
chr3 (296-527)||(9519538-9519768)
chr3 (306-527)||(6156130-6156350)
chr3 (295-527)||(50755778-50756009)
chr3 (295-527)||(24546261-24546496)
chr3 (298-508)||(18893067-18893277)
chr3 (295-527)||(54330702-54330933)
chr3 (295-446)||(17046631-17046782)
chr3 (295-452)||(17938025-17938182)
chr3 (338-489)||(14567651-14567802)
chr3 (295-426)||(51602996-51603127)
chr3 (295-405)||(14647499-14647609)
chr3 (399-640)||(15465223-15465453)
chr3 (295-427)||(19568807-19568939)
chr3 (295-442)||(5215156-5215303)
chr3 (235-329)||(52989397-52989491)
chr3 (295-452)||(18739394-18739551)
chr3 (295-527)||(17207766-17207996)
chr3 (295-414)||(12305599-12305718)
chr3 (295-422)||(46723022-46723149)
chr3 (529-640)||(324383-324490)
chr3 (399-640)||(5223452-5223682)
chr3 (295-527)||(25104600-25104829)
chr3 (295-527)||(12952466-12952697)
chr3 (523-640)||(13919478-13919591)
chr3 (432-527)||(11258891-11258986)
chr3 (295-414)||(13436776-13436894)
chr3 (295-414)||(15465631-15465750)
chr3 (295-414)||(26054831-26054950)
chr3 (373-547)||(22652236-22652409)
chr3 (295-409)||(54521304-54521418)
chr3 (523-640)||(21837572-21837685)
chr3 (295-414)||(5223860-5223979)
chr3 (298-428)||(8631265-8631395)
chr3 (523-616)||(12378091-12378184)
chr3 (399-515)||(26055128-26055244)
chr3 (295-414)||(22764026-22764145)
chr3 (295-414)||(29544408-29544527)
chr3 (433-520)||(14682754-14682841)
chr3 (295-414)||(28848188-28848307)
chr3 (295-374)||(34159842-34159921)
chr3 (295-389)||(11258992-11259086)
chr3 (296-414)||(15978009-15978127)
chr3 (523-640)||(316268-316381)
chr3 (295-374)||(17463694-17463773)
chr3 (295-374)||(55477007-55477086)
chr3 (296-414)||(7780914-7781032)
chr3 (296-410)||(16453847-16453961)
chr3 (295-452)||(8023721-8023878)
chr3 (298-407)||(36528061-36528170)
chr3 (478-566)||(18892975-18893063)
chr3 (295-414)||(10247290-10247409)
chr3 (295-374)||(15412947-15413026)
chr3 (295-369)||(13151357-13151431)
chr3 (295-369)||(45606473-45606547)
chr3 (235-407)||(3264646-3264818)
chr3 (471-527)||(19568940-19568996)
chr3 (444-527)||(42353218-42353302)
chr3 (295-452)||(6002446-6002603)
chr3 (337-405)||(11986844-11986912)
chr3 (295-374)||(6468701-6468780)
chr3 (295-369)||(13153823-13153896)
chr3 (295-389)||(17759054-17759148)
chr3 (295-389)||(19060374-19060468)
chr3 (295-381)||(40039740-40039826)
chr3 (530-604)||(52523593-52523667)
chr3 (523-566)||(32402819-32402862)
chr3 (295-385)||(8269382-8269472)
chr3 (295-385)||(8276493-8276583)
chr3 (295-344)||(17956848-17956897)
chr3 (528-593)||(21618627-21618692)
chr3 (295-344)||(27840500-27840549)
chr3 (528-593)||(36166776-36166841)
chr3 (55-214)||(15570016-15570176)
chr3 (528-616)||(29172491-29172579)
chr3 (525-612)||(9577795-9577882)
chr3 (295-342)||(16820505-16820552)
chr3 (523-561)||(15207161-15207199)
chr3 (523-561)||(15246243-15246281)
chr3 (523-561)||(15265364-15265402)
chr3 (523-569)||(37427930-37427976)
chr3 (523-560)||(16059622-16059659)
chr3 (295-376)||(54039146-54039227)
chr3 (295-331)||(1468633-1468669)
chr3 (295-331)||(12808559-12808595)
chr3 (295-359)||(14528644-14528708)
chr3 (295-359)||(16934830-16934894)
chr3 (563-591)||(23274882-23274910)
chr3 (295-359)||(25058324-25058388)
chr3 (295-359)||(49231794-49231858)
[»] chr4 (123 HSPs)
chr4 (235-640)||(10056787-10057188)
chr4 (295-640)||(630299-630640)
chr4 (295-640)||(12611166-12611507)
chr4 (295-640)||(23802860-23803201)
chr4 (295-640)||(51463463-51463804)
chr4 (295-560)||(9638399-9638663)
chr4 (295-548)||(28385646-28385899)
chr4 (295-527)||(35660270-35660502)
chr4 (295-591)||(56115232-56115528)
chr4 (295-575)||(15008342-15008622)
chr4 (295-551)||(15990439-15990695)
chr4 (295-527)||(53630869-53631101)
chr4 (295-548)||(10694643-10694896)
chr4 (295-548)||(10908409-10908662)
chr4 (300-525)||(11479012-11479237)
chr4 (295-527)||(25091077-25091309)
chr4 (297-560)||(10704890-10705152)
chr4 (297-560)||(10918660-10918922)
chr4 (295-525)||(9923622-9923852)
chr4 (295-575)||(40619907-40620186)
chr4 (295-527)||(42875223-42875455)
chr4 (295-525)||(37019095-37019325)
chr4 (298-527)||(3337523-3337752)
chr4 (295-540)||(15447812-15448057)
chr4 (295-527)||(19435093-19435326)
chr4 (299-527)||(19609748-19609976)
chr4 (295-566)||(24046930-24047201)
chr4 (295-527)||(10356832-10357064)
chr4 (295-527)||(16997954-16998181)
chr4 (295-527)||(33243692-33243924)
chr4 (295-591)||(33849102-33849398)
chr4 (295-526)||(15114648-15114878)
chr4 (295-540)||(33186312-33186557)
chr4 (295-527)||(14549050-14549282)
chr4 (295-566)||(18212951-18213222)
chr4 (295-550)||(16277723-16277978)
chr4 (295-550)||(53387333-53387588)
chr4 (295-515)||(3485347-3485564)
chr4 (299-483)||(15011913-15012097)
chr4 (295-527)||(19566315-19566546)
chr4 (295-531)||(46740619-46740854)
chr4 (295-531)||(40229723-40229959)
chr4 (295-527)||(14630250-14630482)
chr4 (295-531)||(15344297-15344531)
chr4 (296-519)||(10237895-10238117)
chr4 (295-527)||(11425379-11425601)
chr4 (296-526)||(15214442-15214672)
chr4 (298-531)||(44024003-44024235)
chr4 (296-527)||(25513167-25513397)
chr4 (401-546)||(15883917-15884062)
chr4 (295-452)||(16026325-16026482)
chr4 (295-439)||(55582703-55582847)
chr4 (295-528)||(45314733-45314965)
chr4 (295-527)||(26445309-26445540)
chr4 (295-438)||(18108274-18108417)
chr4 (295-527)||(2425017-2425248)
chr4 (523-640)||(17333429-17333542)
chr4 (295-414)||(15534658-15534777)
chr4 (295-414)||(49547340-49547459)
chr4 (295-414)||(14049054-14049173)
chr4 (295-414)||(36038347-36038466)
chr4 (296-414)||(12033341-12033459)
chr4 (308-422)||(22725494-22725608)
chr4 (296-414)||(44615765-44615883)
chr4 (523-640)||(14825617-14825730)
chr4 (457-591)||(43251120-43251255)
chr4 (295-525)||(20595827-20596056)
chr4 (459-560)||(9871126-9871226)
chr4 (295-407)||(14185426-14185538)
chr4 (295-414)||(30147392-30147511)
chr4 (296-414)||(50221907-50222025)
chr4 (295-374)||(15117919-15117998)
chr4 (296-414)||(29267830-29267948)
chr4 (295-453)||(54364086-54364244)
chr4 (295-436)||(13046041-13046182)
chr4 (297-414)||(19243177-19243294)
chr4 (295-374)||(7640753-7640832)
chr4 (295-369)||(1837086-1837160)
chr4 (454-524)||(13036332-13036402)
chr4 (529-640)||(26050340-26050447)
chr4 (530-612)||(52243059-52243141)
chr4 (395-531)||(12622792-12622927)
chr4 (395-527)||(14508186-14508317)
chr4 (338-450)||(19081780-19081892)
chr4 (295-369)||(18239179-18239253)
chr4 (295-352)||(9871071-9871128)
chr4 (523-612)||(13591785-13591874)
chr4 (523-616)||(32306854-32306947)
chr4 (295-364)||(44772650-44772719)
chr4 (241-309)||(9886387-9886455)
chr4 (55-217)||(16386753-16386916)
chr4 (295-381)||(17376062-17376148)
chr4 (295-385)||(18247739-18247829)
chr4 (295-385)||(22355079-22355169)
chr4 (295-385)||(47357183-47357273)
chr4 (528-614)||(54798627-54798713)
chr4 (295-347)||(14873653-14873705)
chr4 (295-359)||(14951296-14951360)
chr4 (239-310)||(13234547-13234618)
chr4 (531-614)||(14280474-14280557)
chr4 (525-568)||(26789555-26789598)
chr4 (299-385)||(17146303-17146389)
chr4 (295-376)||(15287878-15287959)
chr4 (295-376)||(15294988-15295069)
chr4 (482-527)||(26922254-26922299)
chr4 (525-569)||(15791990-15792034)
chr4 (295-359)||(55377205-55377269)
chr4 (3-50)||(8123798-8123845)
chr4 (260-311)||(12230500-12230551)
chr4 (295-385)||(10643746-10643836)
chr4 (295-385)||(19020009-19020099)
chr4 (562-612)||(44928821-44928871)
chr4 (528-593)||(8574742-8574807)
chr4 (465-526)||(12134425-12134486)
chr4 (3-52)||(19804926-19804975)
chr4 (562-607)||(20157189-20157234)
chr4 (562-591)||(44102404-44102433)
chr4 (295-359)||(5683375-5683439)
chr4 (295-331)||(8374094-8374130)
chr4 (295-327)||(12622936-12622968)
chr4 (295-359)||(14995670-14995734)
chr4 (295-359)||(16731702-16731766)
chr4 (295-331)||(18168347-18168383)
[»] chr2 (110 HSPs)
chr2 (235-640)||(27472568-27472969)
chr2 (235-640)||(34873783-34874184)
chr2 (235-572)||(34858721-34859058)
chr2 (295-640)||(18358365-18358705)
chr2 (295-640)||(22173424-22173765)
chr2 (295-640)||(21081367-21081708)
chr2 (235-531)||(20915525-20915821)
chr2 (295-559)||(41301369-41301633)
chr2 (295-548)||(26903561-26903814)
chr2 (295-527)||(23969019-23969251)
chr2 (295-548)||(21915025-21915278)
chr2 (295-535)||(25183603-25183843)
chr2 (299-527)||(43707685-43707912)
chr2 (296-527)||(24273656-24273887)
chr2 (295-527)||(9975353-9975585)
chr2 (295-527)||(24781236-24781468)
chr2 (295-553)||(24883785-24884042)
chr2 (295-560)||(31520509-31520773)
chr2 (295-527)||(5031526-5031758)
chr2 (295-527)||(27484866-27485098)
chr2 (295-527)||(36839595-36839827)
chr2 (295-542)||(18388693-18388940)
chr2 (295-591)||(23338796-23339092)
chr2 (295-566)||(19662051-19662322)
chr2 (295-566)||(21073123-21073394)
chr2 (296-540)||(10039531-10039775)
chr2 (295-527)||(17306911-17307143)
chr2 (295-526)||(21368532-21368763)
chr2 (295-526)||(19201596-19201828)
chr2 (295-566)||(9242145-9242416)
chr2 (295-533)||(20590718-20590956)
chr2 (299-523)||(6482946-6483171)
chr2 (299-523)||(6486413-6486638)
chr2 (295-520)||(9785013-9785238)
chr2 (295-591)||(28349268-28349573)
chr2 (295-566)||(6260774-6261045)
chr2 (298-520)||(23068849-23069071)
chr2 (295-520)||(28652898-28653123)
chr2 (295-527)||(24515610-24515842)
chr2 (295-531)||(22690101-22690336)
chr2 (295-531)||(22694697-22694932)
chr2 (295-527)||(21316058-21316289)
chr2 (298-527)||(21335852-21336080)
chr2 (337-527)||(29113786-29113975)
chr2 (295-452)||(1384082-1384239)
chr2 (295-550)||(2524143-2524380)
chr2 (295-527)||(22686264-22686495)
chr2 (306-452)||(25587094-25587240)
chr2 (399-640)||(31345265-31345495)
chr2 (295-414)||(20261696-20261815)
chr2 (265-527)||(22332142-22332402)
chr2 (295-414)||(10684329-10684448)
chr2 (295-452)||(23778691-23778849)
chr2 (295-414)||(38967956-38968075)
chr2 (295-437)||(28345472-28345614)
chr2 (338-527)||(23609901-23610089)
chr2 (295-406)||(40911868-40911979)
chr2 (523-612)||(23004923-23005012)
chr2 (299-410)||(31345661-31345771)
chr2 (296-414)||(24897763-24897881)
chr2 (296-414)||(24900246-24900364)
chr2 (296-414)||(24902723-24902841)
chr2 (296-414)||(24905200-24905318)
chr2 (296-414)||(24907675-24907793)
chr2 (523-616)||(26392550-26392643)
chr2 (429-566)||(30643811-30643948)
chr2 (295-386)||(22255777-22255868)
chr2 (445-560)||(22501260-22501374)
chr2 (445-560)||(22509194-22509308)
chr2 (296-414)||(23136056-23136174)
chr2 (523-612)||(22412994-22413083)
chr2 (295-374)||(18809459-18809538)
chr2 (523-610)||(20520051-20520138)
chr2 (295-526)||(22786694-22786924)
chr2 (295-374)||(28577615-28577694)
chr2 (295-452)||(20272855-20273012)
chr2 (295-375)||(7186942-7187022)
chr2 (295-374)||(23711580-23711659)
chr2 (525-612)||(24697467-24697553)
chr2 (295-374)||(26505895-26505974)
chr2 (295-374)||(26508373-26508452)
chr2 (295-374)||(27920331-27920410)
chr2 (295-374)||(32039065-32039144)
chr2 (295-369)||(571919-571993)
chr2 (295-389)||(36734881-36734975)
chr2 (295-369)||(39682835-39682909)
chr2 (295-376)||(22501375-22501456)
chr2 (295-376)||(22509309-22509390)
chr2 (523-640)||(23287512-23287625)
chr2 (295-374)||(23131378-23131457)
chr2 (295-374)||(23133845-23133924)
chr2 (295-374)||(34402089-34402168)
chr2 (295-385)||(19887294-19887384)
chr2 (482-527)||(24841377-24841422)
chr2 (523-561)||(18546803-18546841)
chr2 (498-548)||(34492091-34492141)
chr2 (567-612)||(23708521-23708566)
chr2 (337-474)||(28031919-28032056)
chr2 (295-359)||(16900841-16900905)
chr2 (295-359)||(16994232-16994296)
chr2 (295-451)||(24302220-24302374)
chr2 (295-331)||(24383131-24383167)
chr2 (295-359)||(34823776-34823840)
chr2 (269-307)||(22497852-22497890)
chr2 (295-331)||(11232232-11232268)
chr2 (243-307)||(19445355-19445419)
chr2 (295-331)||(22514079-22514115)
chr2 (295-331)||(23760032-23760068)
chr2 (295-331)||(28776681-28776717)
chr2 (525-569)||(43947232-43947276)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (235-640)||(67409-67810)
scaffold0032 (339-451)||(62410-62522)
scaffold0032 (295-526)||(116801-117032)
[»] chr7 (176 HSPs)
chr7 (235-640)||(46580260-46580647)
chr7 (235-548)||(48812241-48812554)
chr7 (295-640)||(13647555-13647898)
chr7 (295-593)||(18456044-18456342)
chr7 (296-640)||(16998741-16999087)
chr7 (295-548)||(708951-709204)
chr7 (295-553)||(58814-59071)
chr7 (295-560)||(8756792-8757056)
chr7 (295-548)||(16462439-16462692)
chr7 (295-527)||(14415880-14416112)
chr7 (295-548)||(32160598-32160851)
chr7 (295-548)||(14191484-14191735)
chr7 (295-553)||(30820652-30820910)
chr7 (295-548)||(47975307-47975560)
chr7 (411-640)||(14273663-14273888)
chr7 (295-575)||(16550400-16550679)
chr7 (295-575)||(16614983-16615262)
chr7 (295-548)||(14188690-14188941)
chr7 (295-533)||(15213917-15214155)
chr7 (295-540)||(17070689-17070934)
chr7 (295-527)||(13745172-13745404)
chr7 (295-527)||(44374370-44374602)
chr7 (295-527)||(44383235-44383467)
chr7 (295-527)||(46386483-46386715)
chr7 (295-540)||(47094491-47094736)
chr7 (295-527)||(12371699-12371931)
chr7 (295-527)||(12465656-12465888)
chr7 (295-523)||(15167403-15167631)
chr7 (295-554)||(13408170-13408428)
chr7 (295-550)||(17505400-17505655)
chr7 (295-550)||(17547559-17547814)
chr7 (295-553)||(36685645-36685904)
chr7 (295-553)||(832419-832676)
chr7 (295-553)||(1197599-1197856)
chr7 (295-560)||(13699285-13699549)
chr7 (295-540)||(40555139-40555384)
chr7 (295-527)||(11066892-11067124)
chr7 (295-527)||(14928728-14928960)
chr7 (295-527)||(15352194-15352426)
chr7 (295-527)||(19282516-19282748)
chr7 (295-559)||(29004214-29004478)
chr7 (295-527)||(33001338-33001570)
chr7 (295-566)||(18872545-18872816)
chr7 (299-553)||(12755106-12755359)
chr7 (295-523)||(10896390-10896618)
chr7 (295-527)||(13147868-13148100)
chr7 (295-531)||(32433985-32434221)
chr7 (295-543)||(34957579-34957827)
chr7 (295-526)||(8851555-8851786)
chr7 (295-566)||(16008763-16009034)
chr7 (295-538)||(38828474-38828717)
chr7 (295-560)||(4325448-4325712)
chr7 (299-527)||(48743727-48743955)
chr7 (295-566)||(11661491-11661761)
chr7 (295-553)||(37727323-37727580)
chr7 (295-520)||(32301613-32301838)
chr7 (295-519)||(32771760-32771984)
chr7 (295-566)||(147803-148074)
chr7 (295-566)||(14422170-14422441)
chr7 (295-566)||(14566387-14566658)
chr7 (295-520)||(16580091-16580316)
chr7 (299-531)||(14153372-14153603)
chr7 (295-566)||(18607672-18607943)
chr7 (299-520)||(14258783-14259004)
chr7 (295-527)||(20585780-20586008)
chr7 (295-499)||(12323326-12323530)
chr7 (365-525)||(15119761-15119921)
chr7 (295-523)||(20619714-20619942)
chr7 (295-527)||(12127559-12127792)
chr7 (295-476)||(29052551-29052732)
chr7 (338-520)||(16585390-16585572)
chr7 (295-527)||(24270378-24270609)
chr7 (295-527)||(39292133-39292364)
chr7 (295-554)||(13864791-13865040)
chr7 (371-527)||(13745672-13745828)
chr7 (295-527)||(18875242-18875474)
chr7 (295-450)||(15720250-15720405)
chr7 (374-520)||(16460407-16460553)
chr7 (295-527)||(43277139-43277372)
chr7 (398-640)||(13918266-13918497)
chr7 (295-527)||(4691292-4691523)
chr7 (295-527)||(14161251-14161482)
chr7 (295-527)||(48213341-48213572)
chr7 (295-526)||(15978452-15978682)
chr7 (399-640)||(25926993-25927223)
chr7 (295-531)||(8514142-8514377)
chr7 (295-527)||(21538585-21538816)
chr7 (295-527)||(25941862-25942093)
chr7 (295-452)||(3287489-3287646)
chr7 (523-640)||(9177524-9177637)
chr7 (306-526)||(3192700-3192920)
chr7 (395-527)||(13894519-13894651)
chr7 (308-527)||(20252751-20252969)
chr7 (295-525)||(9743477-9743706)
chr7 (523-640)||(17017326-17017439)
chr7 (295-414)||(1856796-1856915)
chr7 (295-414)||(23664519-23664638)
chr7 (306-452)||(18080125-18080271)
chr7 (235-407)||(11309853-11310025)
chr7 (295-414)||(11303724-11303843)
chr7 (295-414)||(13917969-13918088)
chr7 (295-414)||(29800906-29801025)
chr7 (235-325)||(11091080-11091170)
chr7 (295-389)||(13897808-13897902)
chr7 (299-527)||(15576233-15576458)
chr7 (523-611)||(14044922-14045010)
chr7 (523-611)||(14354952-14355040)
chr7 (406-526)||(28719885-28720005)
chr7 (295-414)||(16108255-16108374)
chr7 (295-414)||(25926696-25926815)
chr7 (295-414)||(29797087-29797206)
chr7 (523-612)||(16091930-16092019)
chr7 (540-640)||(1858707-1858803)
chr7 (422-520)||(20487874-20487972)
chr7 (523-596)||(14036387-14036460)
chr7 (523-596)||(14346417-14346490)
chr7 (523-616)||(17060282-17060375)
chr7 (543-616)||(48991349-48991422)
chr7 (295-379)||(44190645-44190729)
chr7 (295-414)||(32125967-32126086)
chr7 (296-414)||(41523394-41523512)
chr7 (296-414)||(41525856-41525974)
chr7 (295-374)||(15376280-15376359)
chr7 (295-414)||(18431188-18431307)
chr7 (295-374)||(20384690-20384769)
chr7 (296-414)||(24702705-24702823)
chr7 (296-414)||(24705152-24705270)
chr7 (295-447)||(46473562-46473714)
chr7 (295-374)||(27217377-27217456)
chr7 (295-369)||(456843-456917)
chr7 (295-369)||(11392866-11392940)
chr7 (295-389)||(37538970-37539064)
chr7 (562-640)||(2529951-2530025)
chr7 (523-612)||(15008357-15008446)
chr7 (295-527)||(8563987-8564218)
chr7 (295-359)||(14105863-14105927)
chr7 (299-414)||(14948693-14948808)
chr7 (295-369)||(16233042-16233116)
chr7 (295-374)||(13869864-13869941)
chr7 (295-379)||(39431624-39431707)
chr7 (299-374)||(16410575-16410650)
chr7 (296-374)||(26355549-26355627)
chr7 (296-374)||(26358001-26358079)
chr7 (523-612)||(9725518-9725607)
chr7 (295-359)||(10001004-10001068)
chr7 (471-527)||(15720200-15720256)
chr7 (376-531)||(3136715-3136869)
chr7 (295-358)||(20487973-20488036)
chr7 (399-461)||(1857092-1857154)
chr7 (529-640)||(16996370-16996477)
chr7 (543-612)||(1867874-1867942)
chr7 (528-614)||(48273550-48273636)
chr7 (567-612)||(2280021-2280066)
chr7 (295-428)||(16065970-16066103)
chr7 (482-527)||(21675491-21675536)
chr7 (295-427)||(12191849-12191981)
chr7 (309-381)||(21660587-21660659)
chr7 (295-359)||(28720041-28720105)
chr7 (239-310)||(16379749-16379820)
chr7 (295-358)||(18628098-18628161)
chr7 (295-358)||(18640804-18640867)
chr7 (530-604)||(12255657-12255731)
chr7 (295-385)||(15760758-15760848)
chr7 (470-515)||(1858644-1858689)
chr7 (523-560)||(9033204-9033241)
chr7 (295-328)||(19194774-19194807)
chr7 (295-359)||(125991-126055)
chr7 (55-142)||(2078372-2078460)
chr7 (295-331)||(7822067-7822103)
chr7 (295-331)||(7829378-7829414)
chr7 (295-359)||(11287002-11287066)
chr7 (295-331)||(16383172-16383208)
chr7 (295-331)||(27102531-27102567)
chr7 (295-331)||(27109879-27109915)
chr7 (295-331)||(27175759-27175795)
chr7 (295-331)||(38784623-38784659)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (235-548)||(11100-11413)
[»] chr6 (124 HSPs)
chr6 (235-560)||(27851394-27851719)
chr6 (235-560)||(20733783-20734107)
chr6 (295-612)||(15817154-15817469)
chr6 (295-640)||(25619353-25619694)
chr6 (295-640)||(14979018-14979359)
chr6 (295-640)||(20556489-20556830)
chr6 (295-527)||(28947768-28948000)
chr6 (295-560)||(18658598-18658862)
chr6 (295-548)||(23956265-23956518)
chr6 (295-575)||(15173851-15174130)
chr6 (281-525)||(18928149-18928393)
chr6 (295-531)||(5834131-5834366)
chr6 (295-553)||(611139-611396)
chr6 (295-553)||(19825885-19826142)
chr6 (295-527)||(7827396-7827628)
chr6 (295-527)||(19655625-19655857)
chr6 (295-531)||(20177166-20177401)
chr6 (295-527)||(23491567-23491799)
chr6 (295-527)||(23497165-23497397)
chr6 (299-527)||(18708923-18709151)
chr6 (295-531)||(22158590-22158825)
chr6 (295-575)||(13764730-13765002)
chr6 (295-527)||(17318518-17318750)
chr6 (299-527)||(18702988-18703216)
chr6 (295-527)||(23150663-23150894)
chr6 (295-526)||(25601673-25601904)
chr6 (295-493)||(1254215-1254413)
chr6 (295-540)||(29847899-29848146)
chr6 (295-514)||(15891107-15891326)
chr6 (295-521)||(8767659-8767885)
chr6 (295-521)||(25347556-25347782)
chr6 (295-520)||(19773105-19773330)
chr6 (295-520)||(15705007-15705232)
chr6 (295-527)||(31734132-31734362)
chr6 (295-531)||(20182984-20183219)
chr6 (295-531)||(22152772-22153007)
chr6 (295-566)||(4477043-4477314)
chr6 (295-486)||(23655804-23655995)
chr6 (295-527)||(27125872-27126105)
chr6 (295-538)||(16133066-16133309)
chr6 (299-538)||(19443681-19443919)
chr6 (295-521)||(8759913-8760138)
chr6 (299-484)||(755-940)
chr6 (265-523)||(27317919-27318179)
chr6 (295-553)||(34296664-34296923)
chr6 (295-469)||(31022093-31022267)
chr6 (295-527)||(18455468-18455699)
chr6 (295-527)||(25921154-25921385)
chr6 (295-481)||(25807602-25807788)
chr6 (299-531)||(20411072-20411303)
chr6 (475-640)||(25752865-25753026)
chr6 (475-640)||(25755035-25755196)
chr6 (295-527)||(32259272-32259502)
chr6 (398-640)||(27556791-27557022)
chr6 (299-452)||(29044809-29044962)
chr6 (400-640)||(23415033-23415262)
chr6 (523-640)||(33443194-33443307)
chr6 (295-405)||(7430069-7430179)
chr6 (295-452)||(34141023-34141178)
chr6 (295-452)||(34153639-34153794)
chr6 (295-452)||(18585117-18585274)
chr6 (295-524)||(22556676-22556905)
chr6 (298-526)||(17857091-17857319)
chr6 (295-527)||(18398343-18398574)
chr6 (295-503)||(23838447-23838655)
chr6 (295-524)||(13285136-13285364)
chr6 (295-414)||(12942666-12942785)
chr6 (523-612)||(18696660-18696749)
chr6 (295-414)||(28288903-28289022)
chr6 (295-405)||(14594021-14594131)
chr6 (523-637)||(20224095-20224205)
chr6 (523-637)||(22118079-22118189)
chr6 (295-424)||(22806276-22806405)
chr6 (295-414)||(23415441-23415560)
chr6 (295-415)||(27330368-27330488)
chr6 (295-415)||(27391108-27391228)
chr6 (523-612)||(18706478-18706568)
chr6 (299-414)||(19858493-19858608)
chr6 (295-531)||(15938622-15938857)
chr6 (295-414)||(27557199-27557318)
chr6 (295-529)||(23221288-23221521)
chr6 (296-414)||(33862270-33862388)
chr6 (295-414)||(1540478-1540597)
chr6 (299-414)||(15891979-15892094)
chr6 (295-374)||(18334159-18334238)
chr6 (295-374)||(24423063-24423142)
chr6 (295-389)||(35057066-35057160)
chr6 (295-374)||(33864794-33864873)
chr6 (295-369)||(2290747-2290821)
chr6 (295-369)||(8055551-8055625)
chr6 (296-414)||(17883065-17883183)
chr6 (296-374)||(26924015-26924093)
chr6 (295-374)||(22782743-22782822)
chr6 (300-414)||(12742794-12742908)
chr6 (295-378)||(19234658-19234741)
chr6 (299-385)||(25175112-25175198)
chr6 (295-385)||(27654616-27654706)
chr6 (454-526)||(16135519-16135591)
chr6 (528-612)||(16448435-16448519)
chr6 (295-382)||(16135613-16135699)
chr6 (523-569)||(20078033-20078079)
chr6 (295-381)||(31163536-31163622)
chr6 (523-612)||(18453355-18453444)
chr6 (318-525)||(22523388-22523594)
chr6 (295-381)||(3007508-3007594)
chr6 (295-385)||(16826387-16826477)
chr6 (295-385)||(21776115-21776205)
chr6 (318-452)||(31161878-31162012)
chr6 (563-612)||(19362598-19362646)
chr6 (338-438)||(32277441-32277541)
chr6 (295-385)||(1555527-1555617)
chr6 (562-612)||(18456888-18456938)
chr6 (562-612)||(25644495-25644545)
chr6 (563-612)||(8227409-8227458)
chr6 (525-566)||(17229776-17229817)
chr6 (563-612)||(18896215-18896263)
chr6 (295-344)||(19609621-19609670)
chr6 (295-331)||(10488025-10488061)
chr6 (295-359)||(16240322-16240386)
chr6 (295-331)||(16377267-16377303)
chr6 (295-331)||(16384591-16384627)
chr6 (295-359)||(22226588-22226652)
chr6 (295-359)||(25904501-25904565)
chr6 (295-331)||(33315095-33315131)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (295-640)||(308-649)
[»] chr5 (106 HSPs)
chr5 (295-640)||(6765977-6766317)
chr5 (295-593)||(22412365-22412662)
chr5 (295-615)||(29448174-29448494)
chr5 (299-640)||(30138564-30138900)
chr5 (295-593)||(18418770-18419068)
chr5 (295-560)||(24277002-24277266)
chr5 (295-560)||(24384947-24385211)
chr5 (299-553)||(17812795-17813048)
chr5 (295-548)||(263260-263513)
chr5 (299-548)||(33472964-33473213)
chr5 (295-527)||(32607721-32607953)
chr5 (295-553)||(36460368-36460626)
chr5 (295-524)||(21399400-21399628)
chr5 (295-575)||(17011102-17011382)
chr5 (295-527)||(41875989-41876221)
chr5 (295-525)||(26761827-26762057)
chr5 (295-540)||(17875410-17875655)
chr5 (295-527)||(20197982-20198216)
chr5 (295-527)||(20565978-20566210)
chr5 (295-566)||(38145134-38145405)
chr5 (295-527)||(19921058-19921289)
chr5 (295-527)||(27868971-27869203)
chr5 (295-525)||(8833603-8833824)
chr5 (295-553)||(31456196-31456454)
chr5 (295-553)||(21557440-21557699)
chr5 (295-566)||(28370652-28370923)
chr5 (295-523)||(22750372-22750597)
chr5 (295-523)||(19511614-19511843)
chr5 (317-525)||(33895300-33895508)
chr5 (295-566)||(42960761-42961033)
chr5 (295-566)||(37598513-37598784)
chr5 (295-591)||(22758286-22758583)
chr5 (295-450)||(40917369-40917524)
chr5 (295-533)||(21554775-21555013)
chr5 (295-527)||(16062910-16063141)
chr5 (296-527)||(36509181-36509405)
chr5 (295-523)||(22336748-22336976)
chr5 (296-527)||(8504266-8504496)
chr5 (295-527)||(16605000-16605231)
chr5 (295-523)||(22340286-22340514)
chr5 (295-527)||(18744074-18744305)
chr5 (295-527)||(14026204-14026435)
chr5 (295-422)||(24617319-24617446)
chr5 (295-422)||(24713550-24713677)
chr5 (295-422)||(24746578-24746705)
chr5 (295-405)||(43243054-43243164)
chr5 (295-452)||(23199788-23199942)
chr5 (295-527)||(1627777-1628008)
chr5 (295-414)||(37804469-37804588)
chr5 (295-422)||(24668593-24668720)
chr5 (295-422)||(24738362-24738489)
chr5 (295-422)||(24751131-24751258)
chr5 (295-526)||(28901346-28901576)
chr5 (295-526)||(28937741-28937971)
chr5 (365-527)||(22111024-22111185)
chr5 (295-452)||(17908966-17909123)
chr5 (454-553)||(12122077-12122175)
chr5 (295-414)||(29351402-29351521)
chr5 (296-414)||(10732508-10732626)
chr5 (265-374)||(20909528-20909637)
chr5 (295-374)||(264335-264414)
chr5 (295-374)||(23065030-23065109)
chr5 (525-616)||(25576716-25576807)
chr5 (295-414)||(29346456-29346575)
chr5 (295-414)||(29348929-29349048)
chr5 (296-414)||(42244933-42245051)
chr5 (523-616)||(26740505-26740598)
chr5 (529-616)||(26732698-26732785)
chr5 (295-374)||(39245652-39245731)
chr5 (523-612)||(23469975-23470064)
chr5 (265-374)||(38619952-38620061)
chr5 (528-612)||(18318942-18319026)
chr5 (525-616)||(25574330-25574421)
chr5 (525-616)||(25575523-25575614)
chr5 (295-522)||(31478801-31479026)
chr5 (295-385)||(11903-11993)
chr5 (295-385)||(25426177-25426267)
chr5 (394-527)||(30613937-30614069)
chr5 (523-586)||(20572086-20572149)
chr5 (295-374)||(39363900-39363979)
chr5 (265-311)||(13938457-13938503)
chr5 (295-385)||(35791744-35791834)
chr5 (296-385)||(21074229-21074318)
chr5 (482-531)||(26749534-26749583)
chr5 (394-527)||(30611977-30612109)
chr5 (295-359)||(22367114-22367178)
chr5 (269-304)||(25582095-25582130)
chr5 (295-376)||(7424886-7424967)
chr5 (528-593)||(20765993-20766058)
chr5 (295-359)||(27183188-27183252)
chr5 (295-359)||(43444028-43444092)
chr5 (295-386)||(7528427-7528518)
chr5 (295-326)||(19499487-19499518)
chr5 (55-141)||(22249157-22249244)
chr5 (295-357)||(9776699-9776761)
chr5 (295-385)||(11342190-11342280)
chr5 (295-385)||(18778625-18778715)
chr5 (55-184)||(26039494-26039624)
chr5 (295-359)||(1168811-1168875)
chr5 (295-359)||(1220363-1220427)
chr5 (295-331)||(21933262-21933298)
chr5 (295-331)||(21939432-21939468)
chr5 (295-359)||(23506529-23506593)
chr5 (263-311)||(23908687-23908735)
chr5 (295-331)||(35581394-35581430)
chr5 (295-331)||(36990658-36990694)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (235-480)||(4568-4813)
scaffold0153 (235-389)||(11679-11833)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (295-640)||(332-672)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (295-640)||(22130461-22130802)
chr1 (295-640)||(13881012-13881353)
chr1 (295-640)||(45574448-45574778)
chr1 (295-560)||(21180721-21180985)
chr1 (295-560)||(24815248-24815512)
chr1 (295-540)||(44822518-44822763)
chr1 (295-527)||(21239691-21239923)
chr1 (295-541)||(50000883-50001130)
chr1 (295-527)||(7052451-7052684)
chr1 (295-552)||(20031286-20031543)
chr1 (295-548)||(46198121-46198374)
chr1 (295-527)||(20588103-20588335)
chr1 (295-527)||(20592641-20592873)
chr1 (295-560)||(8276388-8276652)
chr1 (303-527)||(14238016-14238240)
chr1 (295-566)||(28312733-28313004)
chr1 (295-560)||(7792248-7792512)
chr1 (295-527)||(38887483-38887716)
chr1 (295-519)||(19676143-19676367)
chr1 (299-527)||(41227104-41227332)
chr1 (295-519)||(42912482-42912706)
chr1 (299-527)||(51082640-51082868)
chr1 (295-538)||(2332606-2332849)
chr1 (296-527)||(51323699-51323930)
chr1 (295-527)||(21046445-21046677)
chr1 (295-548)||(29764030-29764287)
chr1 (295-560)||(16401060-16401324)
chr1 (295-527)||(20634030-20634263)
chr1 (295-527)||(4596241-4596473)
chr1 (295-527)||(12710312-12710544)
chr1 (295-527)||(16058710-16058942)
chr1 (299-527)||(41225851-41226079)
chr1 (295-527)||(45496369-45496602)
chr1 (295-591)||(296715-297011)
chr1 (295-560)||(22349980-22350244)
chr1 (295-521)||(23194947-23195173)
chr1 (295-566)||(20437623-20437894)
chr1 (298-553)||(38057050-38057304)
chr1 (295-531)||(14792958-14793193)
chr1 (295-527)||(22823803-22824034)
chr1 (295-527)||(50544276-50544507)
chr1 (295-527)||(1643020-1643249)
chr1 (295-527)||(39060520-39060752)
chr1 (295-523)||(16372178-16372407)
chr1 (295-527)||(24720090-24720321)
chr1 (295-531)||(44891869-44892103)
chr1 (295-452)||(9784739-9784896)
chr1 (295-527)||(17902158-17902389)
chr1 (523-640)||(27653081-27653194)
chr1 (523-616)||(20345973-20346066)
chr1 (295-527)||(18121029-18121260)
chr1 (295-406)||(21659689-21659800)
chr1 (372-591)||(294396-294624)
chr1 (295-414)||(13227340-13227459)
chr1 (345-452)||(6833713-6833820)
chr1 (295-526)||(16655793-16656023)
chr1 (295-414)||(29535528-29535647)
chr1 (296-414)||(16362395-16362513)
chr1 (296-414)||(21841243-21841361)
chr1 (296-414)||(21922859-21922977)
chr1 (295-407)||(10812765-10812877)
chr1 (296-414)||(41372948-41373066)
chr1 (295-374)||(13989382-13989461)
chr1 (529-614)||(16093748-16093833)
chr1 (523-612)||(52940736-52940825)
chr1 (296-404)||(23593301-23593409)
chr1 (525-616)||(21533735-21533825)
chr1 (523-610)||(26065114-26065201)
chr1 (295-369)||(21474653-21474727)
chr1 (523-612)||(35260939-35261028)
chr1 (530-605)||(16758831-16758906)
chr1 (295-385)||(22366527-22366617)
chr1 (306-381)||(20708730-20708805)
chr1 (525-612)||(21043142-21043229)
chr1 (525-612)||(22124458-22124545)
chr1 (525-569)||(47190817-47190861)
chr1 (523-566)||(48520787-48520830)
chr1 (522-560)||(42697112-42697150)
chr1 (540-612)||(14800707-14800779)
chr1 (540-612)||(14809581-14809653)
chr1 (295-331)||(17003963-17003999)
chr1 (295-359)||(21650889-21650953)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (303-640)||(105229-105560)
scaffold0023 (295-588)||(162647-162940)
scaffold0023 (295-374)||(94927-95006)
scaffold0023 (298-357)||(17202-17261)
scaffold0023 (295-343)||(154871-154919)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (294-640)||(12284-12626)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (295-640)||(566-905)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (295-640)||(15891-16229)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (300-640)||(1510-1846)
scaffold0125 (295-527)||(27724-27956)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (296-640)||(82302-82641)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (295-525)||(10843-11073)
scaffold0371 (395-487)||(17223-17315)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (295-560)||(19040-19304)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (295-548)||(21484-21737)
scaffold0026 (295-566)||(110872-111143)
scaffold0026 (295-527)||(146156-146388)
scaffold0026 (295-521)||(123956-124182)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (295-548)||(176195-176448)
scaffold0001 (295-544)||(168846-169095)
scaffold0001 (299-552)||(152610-152863)
scaffold0001 (295-540)||(77098-77343)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (295-548)||(3338-3591)
scaffold0338 (295-369)||(1-75)
scaffold0338 (295-359)||(8592-8656)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (295-575)||(5835-6114)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (295-540)||(3117-3362)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (299-540)||(5828-6069)
scaffold0108 (295-527)||(7179-7409)
scaffold0108 (523-566)||(3395-3438)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (295-524)||(64465-64694)
scaffold0051 (399-640)||(31272-31502)
scaffold0051 (295-414)||(31680-31799)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (295-527)||(21679-21911)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (295-527)||(28764-28996)
scaffold0180 (295-389)||(9997-10091)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (295-527)||(78488-78720)
scaffold0047 (523-640)||(22427-22540)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (295-566)||(9352-9623)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (295-553)||(395-653)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (295-588)||(2702-2994)
scaffold0109 (295-527)||(373-605)
scaffold0109 (299-525)||(5680-5906)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (295-527)||(5109-5341)
scaffold0737 (299-551)||(6077-6330)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (299-527)||(7956-8184)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (295-548)||(4433-4690)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (295-548)||(4433-4690)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (295-537)||(8478-8720)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (317-640)||(169415-169721)
scaffold0020 (296-526)||(143038-143268)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (295-520)||(5722-5947)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (295-591)||(22929-23225)
scaffold0077 (295-499)||(33791-33995)
scaffold0077 (295-521)||(17653-17879)
scaffold0077 (295-484)||(22575-22765)
scaffold0077 (395-521)||(23386-23512)
scaffold0077 (523-566)||(55543-55586)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (295-527)||(14982-15214)
scaffold0061 (295-527)||(24040-24272)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (317-608)||(1112-1390)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (296-527)||(58172-58403)
scaffold0064 (295-414)||(68438-68557)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (295-525)||(1130-1360)
scaffold0335 (295-359)||(6215-6279)
[»] scaffold0123 (4 HSPs)
scaffold0123 (295-569)||(6407-6681)
scaffold0123 (526-612)||(710-796)
scaffold0123 (524-612)||(25279-25367)
scaffold0123 (364-527)||(16362-16524)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (295-553)||(159346-159603)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (295-523)||(6984-7213)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (295-548)||(11903-12156)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (295-527)||(863-1095)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (295-527)||(39523-39755)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (300-526)||(1332-1558)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (295-525)||(5063-5293)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (299-525)||(7401-7627)
scaffold0546 (295-405)||(10313-10423)
scaffold0546 (479-527)||(11219-11267)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (265-527)||(9479-9741)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (298-548)||(70227-70477)
scaffold0057 (295-427)||(71935-72067)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (295-560)||(6191-6455)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (295-527)||(589-821)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (296-540)||(16175-16419)
scaffold0220 (295-540)||(13357-13602)
scaffold0220 (306-501)||(8686-8881)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (295-527)||(21157-21389)
scaffold0106 (523-566)||(19505-19548)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (295-527)||(22187-22419)
scaffold0080 (299-559)||(29124-29384)
scaffold0080 (299-559)||(34589-34849)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (295-575)||(22165-22444)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (235-420)||(767-952)
scaffold0686 (295-359)||(6949-7013)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (295-520)||(13061-13286)
scaffold0452 (295-526)||(8046-8277)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (299-496)||(106603-106800)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (296-540)||(7295-7539)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (295-527)||(1509-1741)
scaffold0334 (295-463)||(4-172)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (296-540)||(8468-8712)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (337-527)||(7823-8013)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (295-535)||(10636-10877)
scaffold0462 (295-531)||(740-974)
scaffold0462 (295-531)||(6246-6480)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (295-527)||(3843-4076)
scaffold0439 (299-527)||(11583-11811)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (306-527)||(7557-7778)
scaffold0364 (239-310)||(13877-13948)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (295-520)||(6944-7169)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (295-520)||(3701-3926)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (295-520)||(21499-21724)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (295-527)||(168861-169094)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (295-520)||(21083-21308)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (299-520)||(126179-126400)
scaffold0011 (295-531)||(32874-33109)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (295-527)||(30036-30268)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (297-553)||(35969-36224)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (295-527)||(7643-7875)
scaffold0104 (295-527)||(14274-14506)
scaffold0104 (295-519)||(26358-26582)
scaffold0104 (295-519)||(27740-27964)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (295-566)||(2123-2394)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (297-555)||(51355-51612)
scaffold0042 (304-432)||(67187-67315)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (295-523)||(10325-10554)
scaffold0039 (295-359)||(19919-19983)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (295-520)||(120341-120566)
scaffold0034 (295-487)||(29593-29785)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (295-527)||(12932-13164)
scaffold0111 (465-527)||(19369-19431)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (295-527)||(378-610)
scaffold0083 (295-527)||(5682-5914)
scaffold0083 (295-406)||(1480-1591)
scaffold0083 (295-331)||(11401-11437)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (348-524)||(8752-8928)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (295-527)||(1988-2220)
scaffold0241 (295-447)||(5413-5565)
scaffold0241 (439-527)||(5141-5229)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (307-591)||(138135-138419)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (345-527)||(7941-8123)
scaffold0529 (385-496)||(8152-8263)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (295-524)||(632-861)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (295-612)||(133089-133406)
scaffold0019 (306-566)||(133571-133831)
scaffold0019 (348-527)||(29582-29761)
scaffold0019 (295-386)||(33803-33894)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (295-494)||(23600-23799)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (376-527)||(22482-22633)
scaffold0146 (295-352)||(22627-22684)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (295-527)||(1135-1367)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (295-531)||(65377-65612)
scaffold0054 (522-569)||(75686-75733)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (295-527)||(186901-187133)
scaffold0005 (523-640)||(13979-14092)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (299-527)||(66432-66660)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (295-531)||(106-341)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (339-495)||(11101-11257)
scaffold0413 (562-591)||(15513-15542)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (337-537)||(12748-12948)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (296-526)||(747-977)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (295-531)||(8240-8476)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (295-427)||(21285-21417)
scaffold0117 (399-640)||(39401-39631)
scaffold0117 (296-373)||(42271-42348)
scaffold0117 (368-414)||(39809-39855)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (383-524)||(9711-9851)
scaffold0134 (295-374)||(38338-38417)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (295-531)||(18050-18285)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (295-531)||(62139-62374)
scaffold0063 (295-362)||(39305-39372)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (299-531)||(56397-56628)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (295-527)||(25940-26171)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (399-553)||(21040-21193)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (295-527)||(10135-10356)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (295-527)||(18589-18820)
scaffold0213 (295-359)||(28495-28559)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (523-640)||(9943-10056)
scaffold0107 (295-359)||(30496-30560)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (295-526)||(7931-8162)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (295-527)||(34689-34916)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (295-436)||(2403-2543)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (295-527)||(35913-36144)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (295-526)||(11603-11833)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (295-452)||(1-158)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (523-640)||(3186-3299)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (523-640)||(24456-24569)
scaffold0076 (295-331)||(38429-38465)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (295-438)||(1030-1173)
scaffold0825 (457-553)||(1373-1468)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (295-526)||(11614-11844)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (295-405)||(79-189)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (398-640)||(19951-20182)
scaffold0293 (295-414)||(19655-19774)
scaffold0293 (523-605)||(17682-17764)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (295-452)||(7251-7408)
scaffold0230 (296-414)||(14424-14542)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (295-439)||(2449-2593)
scaffold0256 (437-527)||(3059-3149)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (295-415)||(24459-24579)
scaffold0162 (482-531)||(24586-24635)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (523-640)||(4555-4668)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (295-526)||(2176-2406)
scaffold0409 (295-526)||(10431-10661)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (400-535)||(33334-33469)
scaffold0138 (298-414)||(33648-33764)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (523-634)||(2849-2956)
scaffold0357 (524-612)||(13303-13391)
scaffold0357 (524-612)||(15959-16047)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (523-616)||(8296-8389)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (399-640)||(17722-17952)
scaffold0200 (297-414)||(18130-18247)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (523-640)||(2285-2398)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (295-414)||(3500-3619)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (235-325)||(1361-1451)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (295-452)||(8016-8173)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (526-640)||(176-286)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (299-452)||(18526-18679)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (295-524)||(32671-32899)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (523-640)||(3744-3857)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (295-527)||(11743-11974)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (235-325)||(13060-13150)
scaffold0174 (295-452)||(20470-20627)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (295-404)||(16384-16493)
scaffold0369 (454-527)||(16525-16598)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (295-525)||(13168-13402)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (295-414)||(8495-8614)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (296-414)||(21225-21343)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (306-433)||(7784-7911)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (295-385)||(9606-9696)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (442-523)||(2377-2458)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (523-612)||(60573-60662)
scaffold0010 (264-311)||(142823-142870)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (295-414)||(6423-6542)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (300-414)||(53-168)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (295-374)||(13909-13988)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (295-374)||(40916-40995)
scaffold0044 (295-358)||(37886-37949)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (295-414)||(11766-11885)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (296-414)||(9718-9836)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (543-615)||(10643-10715)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (523-615)||(520-612)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (295-379)||(2319-2403)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (295-379)||(174544-174628)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (524-612)||(27526-27614)
scaffold0165 (562-612)||(27646-27696)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (525-640)||(621-732)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (523-605)||(85726-85807)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (295-531)||(874-1109)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (241-309)||(12089-12157)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (523-605)||(18026-18108)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (469-527)||(2364-2422)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (528-593)||(116608-116673)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (296-331)||(134770-134805)
scaffold0028 (296-331)||(137239-137274)
scaffold0028 (296-331)||(139708-139743)
scaffold0028 (296-331)||(142177-142212)
scaffold0028 (296-331)||(144646-144681)
[»] scaffold1405 (1 HSPs)
scaffold1405 (269-307)||(1214-1252)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (295-359)||(894-958)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (479-527)||(1-49)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (295-359)||(936-1000)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (525-561)||(1928-1964)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (55-130)||(12021-12097)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (523-571)||(29282-29330)
[»] scaffold1043 (1 HSPs)
scaffold1043 (264-311)||(856-903)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (337-452)||(17163-17278)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (295-386)||(35026-35117)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (295-344)||(1416-1465)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (525-578)||(10358-10411)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (562-591)||(11659-11688)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (295-359)||(18231-18295)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (295-359)||(53972-54036)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Original strand, 19807933 - 19808334
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19807933 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgtaagctttccaatgata 19808032  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19808033 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 19808132  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808133 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 19808232  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 634  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  19808233 gatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 19808328  T
Q  635 tgtata 640  Q
    ||||||    
T  19808329 tgtata 19808334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Original strand, 22237590 - 22237991
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22237590 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 22237689  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  22237690 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 22237789  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237790 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 22237889  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 634  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  22237890 gatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatt 22237985  T
Q  635 tgtata 640  Q
    ||||||    
T  22237986 tgtata 22237991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 306 - 640
Target Start/End: Original strand, 17460694 - 17461024
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17460694 tagataattttgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 17460793  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 505  Q
      || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  17460794 ccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgt 17460893  T
Q  506 ttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 605  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17460894 ttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgattt 17460993  T
Q  606 aatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  17460994 aatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 17461024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 25483870 - 25484211
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  25483870 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 25483969  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25483970 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 25484069  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25484070 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 25484169  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25484170 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 25484211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 15635576 - 15635840
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  15635576 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggagg 15635675  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15635676 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttc 15635775  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  15635776 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 15635840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 39694924 - 39695188
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39694924 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39695023  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39695024 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 39695123  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  39695124 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 39695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 41680530 - 41680795
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41680530 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41680629  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41680630 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 41680729  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41680730 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 364444 - 364148
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  364444 catgaaagttgtggataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 364345  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  364344 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 364245  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  364244 aattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 364148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19882624 - 19882371
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  19882624 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 19882525  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19882524 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 19882425  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  19882424 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 19882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Original strand, 44522822 - 44523118
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44522822 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44522921  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44522922 tcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 44523021  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||  ||||||||||    
T  44523022 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgacgtgtgaagctg 44523118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11775378 - 11775125
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  11775378 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11775279  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11775278 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 11775179  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  11775178 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 11775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 235 - 527
Target Start/End: Original strand, 21321676 - 21321968
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |     
T  21321676 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtttttgataatttggttagctttccaatggct 21321775  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  21321776 tagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttct 21321875  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21321876 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 21321968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26454367 - 26454087
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  26454367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggagg 26454268  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  26454267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttc 26454168  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  26454167 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 26454087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 18024091 - 18024323
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18024091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18024190  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18024191 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 18024290  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18024291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18024323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20454895 - 20454638
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  20454895 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 20454796  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  20454795 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttc 20454696  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20454695 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22207923 - 22207693
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22207923 catgaaagttgtaaataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 22207824  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  22207823 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttc 22207724  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22207723 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18834127 - 18833898
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18834127 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18834028  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18834027 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 18833928  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18833927 aattaaggggtttaagagtatttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 44432518 - 44432221
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  |||    
T  44432518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggag 44432419  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44432418 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 44432319  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44432318 caattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 44432221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 20178917 - 20179149
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20178917 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20179016  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20179017 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 20179116  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20179117 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20179149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 6573453 - 6573682
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  6573453 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttt-gagatatgatgaaaatactccaaggagg 6573551  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6573552 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttc 6573651  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  6573652 aattaagttgtttaagagtatctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23478736 - 23478478
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23478736 catgaaagttgtagataattgtgttacctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23478637  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23478636 tcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23478537  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  23478536 aactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtagaaatg 23478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 17795888 - 17795592
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  17795888 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 17795789  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17795788 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 17795689  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| ||||  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  17795688 aattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 17795592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 527
Target Start/End: Original strand, 21326274 - 21326566
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  21326274 cgagtataggaaaatcaacgtttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtctgcatgaaagctttagataatttggttagctttccaatggct 21326373  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  21326374 ttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttct 21326473  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21326474 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatttaacctatgtt 21326566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 21861016 - 21861248
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21861016 catgaaagttgtagataatttggttagctttctaaaggcttttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggagg 21861115  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21861116 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21861215  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21861216 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 21861248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 519
Target Start/End: Original strand, 38185482 - 38185706
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  38185482 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 38185581  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  38185582 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttc 38185681  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaa 519  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  38185682 aattaaggtgtttaagagtatttaa 38185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 42559924 - 42560181
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42559924 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42560023  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42560024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaactagaagtactatgagttc 42560122  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  42560123 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 42560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 39364180 - 39363955
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  39364180 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagagg 39364081  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  39364080 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 39363981  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||    
T  39363980 aattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 5761189 - 5760957
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5761189 catgaaagttgtcgataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5761090  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5761089 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttc 5760990  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5760989 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5760957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 6102153 - 6102381
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  6102153 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 6102252  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6102253 agtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6102352  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  6102353 aggatatttaagagtatttaacctatgtt 6102381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19140421 - 19140189
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  19140421 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggagg 19140322  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19140321 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19140222  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19140221 aactagggtgtttaacagtatttaacctatgtt 19140189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20455652 - 20455395
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20455652 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20455553  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20455552 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20455453  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20455452 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20460630 - 20460373
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20460630 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20460531  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20460530 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20460431  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20460430 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 42818303 - 42818533
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  42818303 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 42818402  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42818403 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42818502  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42818503 aactagggtgtttaagagtatttaatctatg 42818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 39936407 - 39936638
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39936407 catgaaagttgtagataattgagttagctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39936506  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39936507 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 39936606  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39936607 aact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39936638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 44477080 - 44476851
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  44477080 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44476981  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  44476980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44476881  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44476880 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 44480342 - 44480113
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  44480342 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44480243  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  44480242 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44480143  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44480142 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19880484 - 19880205
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  19880484 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggagg 19880385  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19880384 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 19880285  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| | |||  || |||| ||||||||||||||    
T  19880284 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttggggca-gaaacgaagttgtatataatattaatg 19880205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 17437714 - 17437945
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17437714 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 17437813  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||     
T  17437814 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggatttt 17437913  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17437914 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 17437945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Original strand, 8728333 - 8728561
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  8728333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtagg 8728432  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  8728433 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 8728531  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8728532 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 20084034 - 20084266
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  20084034 catgaaagttttagataattatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagagg 20084133  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20084134 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctcaaa-ctagaagtactaggagttt 20084232  T
Q  495 aactaaggtat-ttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||    |||||| |||||||||||||||    
T  20084233 aattaagggggcttaagattatttaacctatgtt 20084266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 27941285 - 27941556
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  27941285 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtagg 27941384  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  27941385 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgc 27941484  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27941485 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 27941556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 21579603 - 21579848
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  21579603 catgaaagttgtagataattttgttagatttctagtggctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 21579702  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21579703 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttc 21579802  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21579803 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 21579848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 298 - 560
Target Start/End: Original strand, 42265994 - 42266252
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42265994 gaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 42266093  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| ||   ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  42266094 tagtgaaatctt---aaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaat 42266190  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  42266191 taaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttaatc-ttgggataggaatggaagttg 42266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 5082608 - 5082838
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||   | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  5082608 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 5082707  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5082708 tctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5082807  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  5082808 aattaaggggtttaagagtatttaacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23914579 - 23914344
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||     
T  23914579 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtagg 23914480  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23914479 tcctattgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt- 23914381  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
     | |||||  ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23914380 tattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttatga 23914344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 22258700 - 22258935
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  22258700 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 22258799  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22258800 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22258898  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22258899 aattaaggtgtttaagagtatttaaactatgttatga 22258935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22483402 - 22483171
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  22483402 catgaaagttttagataattgtgtaagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 22483303  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  22483302 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22483204  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22483203 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22483171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 362 - 527
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361840
Alignment:
Q  362 tttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  462 tcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 361840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32950241 - 32950025
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32950241 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttga----------------ttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32950158  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  32950157 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttt 32950058  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32950057 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 32950025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 29763265 - 29763510
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  29763265 catgaaagttgtagataattttgttagctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 29763364  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || ||||   ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  29763365 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttc 29763464  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||| |    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29763465 aattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgtgaattgatctt 29763510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 17501581 - 17501350
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||  |      
T  17501581 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaag 17501482  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17501481 tcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 17501382  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17501381 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23660871 - 23660688
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  23660871 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggagg 23660772  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 478  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23660771 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 306 - 527
Target Start/End: Original strand, 20517525 - 20517745
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||| | |||||| |||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  20517525 tagataactgtgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaa 20517624  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 505  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |    
T  20517625 ttttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgt 20517723  T
Q  506 ttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20517724 ttaagagtatttaacctatgtt 20517745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 36732920 - 36733077
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36732920 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgagg 36733019  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  36733020 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 36733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 4381189 - 4381420
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||     
T  4381189 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggagg 4381288  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  4381289 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 4381387  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4381388 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 4381420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22344697 - 22344466
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22344697 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22344598  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  22344597 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22344499  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22344498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22344466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22356357 - 22356126
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22356357 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22356258  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  22356257 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22356159  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22356158 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22356126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 299 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 23670300 - 23670069
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  23670300 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtctt 23670201  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| |    
T  23670200 agtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaatt 23670102  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23670101 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 23670069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 38989121 - 38988886
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||     
T  38989121 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 38989022  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  |||||    
T  38989021 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 38988923  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38988922 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 38988886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 39020218 - 39019983
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||     
T  39020218 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 39020119  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  |||||    
T  39020118 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 39020020  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39020019 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 39019983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 36305314 - 36305083
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  36305314 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgagg 36305215  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||| |    
T  36305214 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtcc 36305116  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36305115 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 36305083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397834
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 14397796  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  14397797 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 14397834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 21399366 - 21399209
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21399366 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21399267  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21399266 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 21793859 - 21793702
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21793859 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21793760  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21793759 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21793702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 429 - 547
Target Start/End: Original strand, 8414240 - 8414358
Alignment:
Q  429 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  8414240 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttg 8414339  T
Q  529 tgagttgatctttggggta 547  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  8414340 tgagttggtccttggggta 8414358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 337 - 527
Target Start/End: Original strand, 18816898 - 18817089
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttg--gtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  18816898 ggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttct 18816997  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18816998 aagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18817089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 17978813 - 17979044
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || | | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  17978813 catgaaagttgtagataattgtgttagagttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagagg 17978912  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| ||||||    
T  17978913 tcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttc 17979011  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17979012 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgtt 17979044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22474407 - 22474176
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||     
T  22474407 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggagg 22474308  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| | |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22474307 tcttagtgaaattttatgaaaactccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22474209  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22474208 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 22474176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 36405456 - 36405691
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | | |  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  36405456 catgaaaattgtagataattgtgttagctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 36405555  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  36405556 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 36405654  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36405655 aattaatgtgtttaatagtatttaacctaagttatga 36405691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 40492711 - 40492824
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||     
T  40492711 atgttgtgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtg 40492806  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40492807 atgtaatatatttgtata 40492824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21513975 - 21513823
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  21513975 catgaaagttgtagataattgtgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gagg 21513877  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaa 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||    
T  21513876 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaa 21513823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 355 - 527
Target Start/End: Original strand, 18815279 - 18815450
Alignment:
Q  355 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  18815279 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 18815378  T
Q  455 gaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18815379 gattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 18815450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 526 - 615
Target Start/End: Original strand, 17439367 - 17439456
Alignment:
Q  526 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgata 615  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17439367 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgata 17439456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533380
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttga----tagta 20533362  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||| |||||||    
T  20533363 atgtaatataattgtata 20533380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16198490 - 16198371
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  16198490 catgaaagttgtatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggagg 16198391  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16198390 tcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 19154744 - 19154857
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||    
T  19154744 atgttacgagttgatccttggtgtaggaatggaggttatatgtaatattaatgatgatttgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tacta 19154839  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19154840 atgtaatatatttgtata 19154857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 24907430 - 24907203
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||| ||| || |||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||     
T  24907430 catgaatgttttatataattgtgttagctttctagtggctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggagg 24907331  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |  |||  ||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  24907330 tttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttatggattgtttc-caacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 24907233  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24907232 aattaagttgtttaagaatatttaacctat 24907203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 547 - 640
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23943965
Alignment:
Q  547 aggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 23943965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 14397308 - 14397426
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  14397308 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14397407  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  14397408 cttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 18677632 - 18677750
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  18677632 atgaaagttgtagataattttgttacctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 18677731  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  18677732 cttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 525 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16799748 - 16799636
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatc-tttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 623  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  16799748 gttaagagttgatcctttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaa 16799653  T
Q  624 tgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||    
T  16799652 tgtaatatatttgtata 16799636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 4541941 - 4542059
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  4541941 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 4542040  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  4542041 cttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Original strand, 8414145 - 8414239
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8414145 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 8414239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 24485611 - 24485729
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  24485611 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggt 24485710  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24485711 cttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1484997 - 1484918
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1484997 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 1484918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 20045762 - 20045841
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20045762 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20045841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Original strand, 45290114 - 45290205
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  45290114 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactc 45290205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 615
Target Start/End: Original strand, 14103083 - 14103175
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga-tttaatgttgata 615  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  14103083 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttg-tataatatgattttaatgttgata 14103175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22002347 - 22002239
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| | ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  22002347 atgaaagttgtagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggt 22002248  T
Q  396 cttagtgaa 404  Q
    |||||||||    
T  22002247 cttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25757808 - 25757577
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||   | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  25757808 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25757709  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  25757708 tcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 25757610  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25757609 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25757577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 5852859 - 5852938
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5852859 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 5852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 14409011 - 14409090
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14409011 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 14409090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 527
Target Start/End: Original strand, 18118603 - 18118792
Alignment:
Q  338 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 437  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| ||||  || |||| || || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  18118603 gtttgacttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaag 18118702  T
Q  438 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta-ggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||||||||||||| ||  |  | | |||| |||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18118703 tcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgtt 18118792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525689
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgttg 22525689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25295788 - 25295557
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||   | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  25295788 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25295689  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  25295688 tcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 25295590  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25295589 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14824370 - 14824291
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14824370 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaattatttttggtttatgagttatg 14824291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 520
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346020
Alignment:
Q  445 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 21346020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22313488 - 22313401
Alignment:
Q  294 tcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  22313488 tcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaatgttttgtgaattttgagttatgatgaaaa 22313401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24624282 - 24624171
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24624282 ggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaa 24624183  T
Q  437 gttaatccaaaa 448  Q
    || || ||||||    
T  24624182 gtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 452
Target Start/End: Original strand, 19331976 - 19332128
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   | |||    
T  19331976 gaaagttttagataattgtgttagctttgcaatagtttttgtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtct 19332075  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||| |||   |||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||||| ||||    
T  19332076 tagtaaaa--ctttgaaaatttagcataaatattcctaagttaaaccaaatctta 19332128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18827879 - 18827650
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||   |||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  18827879 catgaaagttttagataaagatgttagatttccaatggatttggtttggcttaaaaatgattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtaga 18827780  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||| ||||| | ||| | ||  |||||||||  || ||  | |||| ||| ||||||||| || |||||||||||      
T  18827779 tcttgctgaaattttacgaaaattcaacataattatttttgagcgaatccaaaagatatggtttgattccaaaactcaaaacttga-gtactaggagtct 18827681  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || || | | ||||||||||||||| |||||    
T  18827680 aattaggatgtttaagagtatttaaactatg 18827650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24239071 - 24238977
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24239071 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaa 24238977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4483875 - 4483796
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  4483875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 4483796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 45559572 - 45559796
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactcc-aatgag 393  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | |||||||||||||||| |||||| | |||        |||||||||||||| ||||||    
T  45559572 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaattgttttggtttgacttgaaaataatttttagattt-------ggatgaaaatactccaaatgag 45559664  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||| ||    
T  45559665 -tcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggattt 45559762  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
     || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45559763 taattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 45559796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4233297 - 4233215
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatg 377  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  4233297 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggctttcgtttgacttaaaaataatttttagattttgagatatgatg 4233215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 21495086 - 21495243
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||     
T  21495086 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggagg 21495185  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21495186 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaagtcaacccaaacctta 21495243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 37515967 - 37515878
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | | |||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  37515967 atgttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttg 37515878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 525 - 612
Target Start/End: Original strand, 20501962 - 20502049
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  20501962 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttg 20502049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 223324 - 223414
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  223324 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 688095 - 688185
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  688095 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 736947 - 737037
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  736947 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 860842 - 860932
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  860842 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23668025
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataata 23668025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 590 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23659602 - 23659556
Alignment:
Q  590 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  23659602 tgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 23659556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 26222945 - 26223010
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26222945 atgagttggtctttcgggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 26223010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 611
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253112
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 611  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || || |  ||| ||||||||||||| |||||    
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgtt 22253112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 525 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22996104 - 22996068
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 561  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22996104 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 22996068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 23410056 - 23410018
Alignment:
Q  502 gtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23410056 gtatttaagagtatttaacatatgttgtgagttgatctt 23410018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 525 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28397809 - 28397763
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 571  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28397809 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatatt 28397763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 272183 - 272219
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  272183 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 272219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 643666 - 643630
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  643666 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 643630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 829472 - 829436
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  829472 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 829436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 17150635 - 17150699
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | | |||| |||||  |||||||||||    
T  17150635 catgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgattttt 17150699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 487 - 523
Target Start/End: Original strand, 18122327 - 18122363
Alignment:
Q  487 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18122327 aggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 22007105 - 22007169
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  22007105 catgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 22007169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 523 - 571
Target Start/End: Original strand, 22381593 - 22381641
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 571  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22381593 atgttatgggtttatccttggggtaggaatcgaggttgattataatatt 22381641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29759519 - 29759455
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  29759519 catgaaaggtttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 29759455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 170)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14966718 - 14966317
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14966718 cgagcatacgaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataatttttttagcttttcaatgaca 14966619  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14966618 ttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 14966519  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966518 aagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 14966419  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 634  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  14966418 gatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 14966323  T
Q  635 tgtata 640  Q
    ||||||    
T  14966322 tgtata 14966317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 43550073 - 43550414
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  43550073 catgaaagttgtagataattttgttaattttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 43550172  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43550173 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 43550272  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43550273 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 43550372  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  43550373 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 43550414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 50243389 - 50243048
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  50243389 catgaaagttgtagataattgagttacatttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 50243290  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50243289 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 50243190  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  50243189 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 50243090  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  50243089 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 50243048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 295 - 593
Target Start/End: Original strand, 24152840 - 24153138
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24152840 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24152939  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24152940 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 24153039  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    || |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24153040 aattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 24153138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16643661 - 16643320
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  16643661 catgaaagttgtagacaattgagttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 16643562  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16643561 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttc 16643462  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16643461 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaagataacattactgatgatctgtgaagctgtta 16643362  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  16643361 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 16643320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 299 - 525
Target Start/End: Original strand, 53646460 - 53646686
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53646460 aaagttgtagataattttgttagatttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatctt 53646559  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  53646560 agtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatt 53646659  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53646660 aaggtgtttaagagtatttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 299 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 6159049 - 6158789
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6159049 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 6158950  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6158949 agtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6158850  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6158849 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6158789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 2248366 - 2248624
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2248366 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2248465  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2248466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 2248565  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2248566 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatg 2248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33564785 - 33564555
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33564785 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33564686  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33564685 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttc 33564586  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33564585 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 14641946 - 14642191
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  14641946 catgaaagttttagataatttcgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 14642045  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14642046 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14642145  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14642146 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 14642191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 35961283 - 35961536
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  35961283 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 35961382  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35961383 tcttagtgaaattttatgaaaaattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 35961482  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35961483 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 559
Target Start/End: Original strand, 10833735 - 10833999
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10833735 catgaaagttttagaaaattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10833834  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  10833835 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10833934  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 559  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10833935 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtt 10833999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 42183 - 41930
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  42183 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggagg 42084  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42083 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 41984  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  41983 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 11192736 - 11192505
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11192736 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttt-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11192638  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11192637 ccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 11192538  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11192537 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 40807652 - 40807420
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40807652 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40807553  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40807552 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 40807453  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40807452 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 40807420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11913377 - 11913119
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11913377 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 11913278  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11913277 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 11913178  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  11913177 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 11913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 433 - 640
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989694
Alignment:
Q  433 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgag 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  533 ttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatata 632  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  52989592 ttgatcctt-gggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatata 52989686  T
Q  633 tttgtata 640  Q
    ||||||||    
T  52989687 tttgtata 52989694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 50351396 - 50351628
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50351396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50351495  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  50351496 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttt 50351595  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50351596 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 50351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 54875879 - 54876111
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54875879 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggagttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54875978  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54875979 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 54876078  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  54876079 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6819765 - 6819507
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6819765 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6819666  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  6819665 tcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatgagttc 6819566  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 554  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  6819565 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgggttgatc-ttgggataggaatgg 6819507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 1988628 - 1988885
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1988628 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1988727  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  1988728 tcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttc 1988827  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1988828 aattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 299 - 569
Target Start/End: Original strand, 8928065 - 8928335
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8928065 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtctt 8928164  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||| |    
T  8928165 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 8928264  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  8928265 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataata 8928335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 12276205 - 12275941
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12276205 catgaaaattttagataatttggttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12276106  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12276105 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 12276006  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  12276005 aattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 12275941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37038475 - 37038226
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgag 393  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  37038475 catgaaagttttagataattttattagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagag 37038376  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37038375 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 37038276  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 543  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37038275 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagttgatctttgg 37038226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Original strand, 10989200 - 10989495
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  10989200 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtctgacatgaaaataatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggagg 10989298  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10989299 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 10989398  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  10989399 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatatcaatgaaagttatataggatattaaggatgatctgtgaagctg 10989495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14441824 - 14441592
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14441824 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14441725  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14441724 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14441625  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14441624 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14441592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16979566 - 16979287
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16979566 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16979467  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16979466 tcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 16979367  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16979366 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16979287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 35064977 - 35065208
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  35064977 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgagg 35065076  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35065077 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttc 35065175  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35065176 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 35065208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40812489 - 40812258
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40812489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40812390  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40812389 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 40812290  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40812289 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 40812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 3394398 - 3394662
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3394398 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3394497  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  3394498 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattc 3394597  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3394598 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 3394662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 3803491 - 3803259
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  3803491 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 3803392  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3803391 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 3803292  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3803291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3803259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 296 - 548
Target Start/End: Original strand, 6805358 - 6805610
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6805358 atgaaagttgtggataattatgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 6805457  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6805458 cctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttca 6805557  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  6805558 attaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttggggtag 6805610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14508503 - 14508272
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  14508503 catgaaagttgtagataattgagttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14508404  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14508403 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14508305  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508304 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 265 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17693754 - 17693492
Alignment:
Q  265 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 364  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | | |||||||  ||||| | ||||||||||     
T  17693754 tttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttc 17693655  T
Q  365 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17693654 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 17693555  T
Q  465 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17693554 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17693492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 179103 - 179367
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||     
T  179103 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtagg 179202  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  179203 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttg 179302  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  179303 aattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaggttg 179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 10541854 - 10542079
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| |||     
T  10541854 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggagg 10541953  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10541954 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10542053  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  10542054 aattaaggggtttaacagtatttaac 10542079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 43889195 - 43889420
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  43889195 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 43889294  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43889295 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 43889394  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  43889395 aattaagggttttaagagtatttaac 43889420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 5206050 - 5206282
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5206050 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5206149  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5206150 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5206249  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5206250 aattatggtgtttaagattatttaacctatgtt 5206282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17538762 - 17538531
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  | | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17538762 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccaatt-ctttggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17538664  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17538663 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17538564  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17538563 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 22306979 - 22307211
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||     
T  22306979 catgaaagttgtagataatttagttatctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 22307078  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22307079 tcttactgaaatcctatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22307178  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22307179 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22307211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Original strand, 42324618 - 42324862
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  42324618 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggt 42324717  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42324718 cttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 42324817  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42324818 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 42324862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17044622 - 17044392
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||| |||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17044622 catgaaatttatagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17044523  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  17044522 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttc 17044423  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17044422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 18367154 - 18367399
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| |||     
T  18367154 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggagg 18367253  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18367254 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttc 18367353  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18367354 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 18367399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 35354258 - 35354023
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgat---ttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatg 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35354258 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacg 35354159  T
Q  392 agatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggag 491  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35354158 agatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggag 35354059  T
Q  492 ttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35354058 tttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 35354023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Original strand, 20248380 - 20248608
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20248380 catgaaagttgtagataattttgttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20248479  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20248480 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 20248579  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20248580 aattaaggtgtttaaaagtatttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 9533785 - 9533514
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  9533785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9533686  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  9533685 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 9533586  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9533585 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 9533514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 10554923 - 10554668
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10554923 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 10554824  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  10554823 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10554724  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 550  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  10554723 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 14763357 - 14763628
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14763357 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14763456  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  14763457 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14763556  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14763557 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 14763628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 550
Target Start/End: Original strand, 55292037 - 55292292
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  55292037 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 55292136  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  55292137 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 55292236  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 550  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  55292237 aattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagtagacctttgaggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12511504 - 12511279
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  12511504 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 12511405  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12511404 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 12511305  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  12511304 aattaaggggtttaagagtatttaac 12511279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Original strand, 38311399 - 38311628
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  38311399 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38311498  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  38311499 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 38311598  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38311599 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 2841859 - 2842090
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||     
T  2841859 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 2841958  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2841959 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 2842057  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2842058 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2842090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 296 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14671479 - 14671255
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  14671479 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 14671380  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14671379 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 14671280  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||    
T  14671279 attaaggggtttaacagtatttaac 14671255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 339 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 44274086 - 44273898
Alignment:
Q  339 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 438  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44274086 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 44273987  T
Q  439 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44273986 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgtt 44273898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 337 - 548
Target Start/End: Original strand, 13029714 - 13029925
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13029714 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13029813  T
Q  437 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 536  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13029814 gttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13029913  T
Q  537 tctttggggtag 548  Q
    || |||||||||    
T  13029914 tcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 23371103 - 23371374
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  23371103 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 23371202  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  23371203 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 23371302  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23371303 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 23371374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 15931903 - 15932135
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15931903 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15932002  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15932003 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15932102  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15932103 aactagggtgtttaagagtatttcatctatgtt 15932135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 17519269 - 17519501
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  17519269 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17519368  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17519369 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17519468  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17519469 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 17534131 - 17534363
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  17534131 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17534230  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17534231 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17534330  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17534331 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17534363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 337 - 548
Target Start/End: Original strand, 13026122 - 13026333
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13026122 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13026221  T
Q  437 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 536  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13026222 gttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13026321  T
Q  537 tctttggggtag 548  Q
    || |||||||||    
T  13026322 tcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 306 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 13519928 - 13519706
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13519928 tagataattatgttagctttctattgactttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 13519829  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggta 504  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||      
T  13519828 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaaggggg 13519729  T
Q  505 tttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13519728 tttaagagtatttaacctatgtt 13519706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 13522806 - 13523071
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  13522806 catgaaagttttagagaattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtagg 13522905  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  13522906 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtt 13523005  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13523006 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 13523071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Original strand, 17670105 - 17670334
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17670105 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 17670204  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17670205 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 17670304  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17670305 aattagggtgtttaagagtatttaatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Original strand, 17685239 - 17685468
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17685239 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17685338  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  17685339 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattc 17685438  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17685439 aattagggtgtttaagagtatttaatctat 17685468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 18699869 - 18700094
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18699869 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 18699968  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18699969 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagttt 18700068  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||    
T  18700069 agttaagggatttaagagtatttaac 18700094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14519918 - 14519687
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14519918 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14519819  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14519818 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14519720  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14519719 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14519687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17513236 - 17513010
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17513236 catgaaagttgtagattattttgttagctttctaattgagttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17513137  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  17513136 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 17513037  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  17513036 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10563365 - 10563120
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||  ||     
T  10563365 catgaaagttgcagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtagg 10563266  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10563265 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10563166  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10563165 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 10563120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 41172767 - 41172999
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |  ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  41172767 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 41172866  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41172867 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 41172966  T
Q  496 actaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41172967 attaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 41172999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 51301051 - 51300780
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  ||     
T  51301051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtagg 51300952  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  51300951 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 51300852  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51300851 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 51300780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 43929007 - 43928775
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  43929007 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggagg 43928908  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43928907 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttc 43928808  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43928807 aattaaggtgcttaagagtatttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 31224349 - 31224608
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  31224349 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 31224448  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31224449 tcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 31224548  T
Q  495 aactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || || |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||||||| ||||||    
T  31224549 aattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgacccttggggtcggaatg 31224608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19444167 - 19443941
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  19444167 catgaaagttgtagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 19444068  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| | | ||||||    
T  19444067 tcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttc 19443968  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||| ||| |||||||||    
T  19443967 aattaaggtgtttgagaatatttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 49900392 - 49900153
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||   | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  49900392 catgaaagttgtagataattaagttagcttttcagtggatttggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49900293  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttcta--------agttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtact 486  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49900292 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtact 49900193  T
Q  487 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49900192 agaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgt 49900153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 298 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18890017 - 18889749
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||   || |||    
T  18890017 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtct 18889918  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  |||||| ||||||||| || ||||||||     
T  18889917 tagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaat 18889818  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18889817 taaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattata 18889749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 50348426 - 50348654
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  50348426 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 50348525  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |    
T  50348526 ggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaatt 50348625  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50348626 aaggggtttaagagtatttaacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 339 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12470414 - 12470233
Alignment:
Q  339 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 438  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12470414 tttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatt 12470315  T
Q  439 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  12470314 taatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12470233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 298 - 548
Target Start/End: Original strand, 16324940 - 16325190
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16324940 gaaagttgtagataattttgttatctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 16325039  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||     
T  16325040 tagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaat 16325139  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    |||||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  16325140 taaggtgtttatgaatatttatcctaagttgtgagttggtccttggggtag 16325190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 14152795 - 14153027
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  14152795 catgaaagttgtagatttttgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 14152894  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14152895 tcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14152994  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14152995 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14153027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 15566169 - 15565938
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15566169 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15566070  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |   |  ||||| ||||||    
T  15566069 tcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttc 15565971  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15565970 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15565938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 9511563 - 9511793
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9511563 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9511662  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | |    
T  9511663 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9511761  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9511762 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9511793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 9519538 - 9519768
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9519538 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9519637  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | |    
T  9519638 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9519736  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9519737 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9519768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 306 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 6156350 - 6156130
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6156350 tagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 6156251  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 505  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |    
T  6156250 ttttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgt 6156152  T
Q  506 ttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6156151 ttaagagtatttaacctatgtt 6156130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 50755778 - 50756009
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  50755778 catgaaagttttagataatcgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtgg 50755877  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  50755878 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50755976  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50755977 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50756009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 24546496 - 24546261
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24546496 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 24546397  T
Q  395 tcttagtgaaattttttga----aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagga 490  Q
    ||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| ||    
T  24546396 tcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatga 24546298  T
Q  491 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24546297 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24546261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 298 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18893277 - 18893067
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||    
T  18893277 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtct 18893178  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  18893177 tagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaat 18893078  T
Q  498 taaggtattta 508  Q
    |||||| ||||    
T  18893077 taaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 54330702 - 54330933
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||     
T  54330702 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggagg 54330801  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  54330802 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 54330900  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54330901 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54330933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17046782 - 17046631
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17046782 catgaaagttatagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17046683  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaa 446  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046682 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17938182 - 17938025
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||     
T  17938182 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggagg 17938083  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  17938082 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 17938025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 338 - 489
Target Start/End: Original strand, 14567651 - 14567802
Alignment:
Q  338 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 437  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14567651 gtttgaattgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14567750  T
Q  438 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagg 489  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14567751 ttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtactagg 14567802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 426
Target Start/End: Original strand, 51602996 - 51603127
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51602996 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 51603095  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataa 426  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  51603096 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 405
Target Start/End: Original strand, 14647499 - 14647609
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14647499 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14647598  T
Q  395 tcttagtgaaa 405  Q
    ||||| |||||    
T  14647599 tcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465223
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 15465261  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    || ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15465260 ataatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 15465223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 427
Target Start/End: Original strand, 19568807 - 19568939
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  19568807 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcagg 19568906  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 427  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| |||||    
T  19568907 tcttagtgaaatcttagcaaaattcagtataac 19568939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5215303 - 5215156
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  5215303 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5215204  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 442  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5215203 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 329
Target Start/End: Original strand, 52989397 - 52989491
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 329  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989397 cgagcataggaaaatcaatttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 52989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18739551 - 18739394
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18739551 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18739452  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  18739451 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 18739394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17207996 - 17207766
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  17207996 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtttt-gagttatgatgaaaatactccaaggagg 17207898  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  17207897 tcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 17207799  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17207798 aaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12305718 - 12305599
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12305718 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12305619  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  12305618 tcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 46723022 - 46723149
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  46723022 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 46723121  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 422  Q
    ||||| | |||| || ||||||||||||    
T  46723122 tcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 324490 - 324383
Alignment:
Q  529 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  324490 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaa 324395  T
Q  629 tatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||    
T  324394 tatatttgtata 324383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 5223682 - 5223452
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5223682 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 5223583  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| |||||||||||   |   || ||||    ||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5223582 aaggtgtttaagagtataata---atattatttagtg----tcggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 5223490  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  5223489 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 5223452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 25104600 - 25104829
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  25104600 catgaaagtt-tagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 25104697  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  |||||    
T  25104698 tcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttc 25104796  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25104797 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 25104829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12952697 - 12952466
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  12952697 catgaaagttttagataatagtgttaaatttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12952598  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  || ||| ||| ||    
T  12952597 tcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctc 12952499  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12952498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12952466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919478
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagc----g 13919496  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13919495 atgtaatatatttgtata 13919478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 432 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258891
Alignment:
Q  432 tctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11258891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13436894 - 13436776
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13436894 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa-gaga 13436796  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||| |||||| |||| ||||    
T  13436795 tctcagtgaatttttatgaa 13436776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15465750 - 15465631
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15465750 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15465651  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  15465650 tcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 26054831 - 26054950
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  26054831 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26054930  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  26054931 tcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 373 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652236
Alignment:
Q  373 tgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctca 472  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  473 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggta 547  Q
    || || |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 54521418 - 54521304
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  54521418 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54521319  T
Q  395 tcttagtgaaatttt 409  Q
    |||||||||| ||||    
T  54521318 tcttagtgaattttt 54521304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837572
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||    
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatga----tagta 21837590  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| |||||||||    
T  21837589 atgtaataaatttgtata 21837572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5223979 - 5223860
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  5223979 catgaaagttgtagatagttgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggagg 5223880  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  5223879 tcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 298 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8631395 - 8631265
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  8631395 gaaagttttagataatgatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatct 8631296  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataact 428  Q
    || |||||||||  |||||||| | ||||||    
T  8631295 tattgaaattttacgaaaattccgtataact 8631265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 12378184 - 12378091
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12378184 atgttttgagttgatccttagggtagcaatggaggttaaatacaatattaatgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag 12378091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 399 - 515
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  499 aaggtatttaagagtat 515  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 22764026 - 22764145
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22764026 catgaaagttatagataattgagttagcttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaga 22764125  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  22764126 tcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 29544408 - 29544527
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  29544408 catgaaagttgtagataatttgtttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29544507  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||| ||||| |||| ||||    
T  29544508 tcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682754
Alignment:
Q  433 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 14682754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 28848188 - 28848307
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28848188 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28848287  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  28848288 tcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34159921 - 34159842
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34159921 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 34159842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11259086 - 11258992
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11259086 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaa 11258992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15978127 - 15978009
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  | | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  15978127 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 15978028  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  15978027 cttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 316381 - 316268
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||||||    |||||    
T  316381 atgttatgagttgatcattgggatatgaatggaggttgattatgatattactgatgctatgtgaatctattgtaatgtgatttaatgttga----tagta 316286  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  316285 atgtaatatatttgtata 316268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17463773 - 17463694
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17463773 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 17463694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 55477086 - 55477007
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  55477086 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 55477007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 7780914 - 7781032
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| || ||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| |    
T  7780914 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggt 7781013  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  7781014 cttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 410
Target Start/End: Original strand, 16453847 - 16453961
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  16453847 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 16453946  T
Q  396 cttagtgaaattttt 410  Q
    ||||||||| |||||    
T  16453947 cttagtgaatttttt 16453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8023878 - 8023721
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  8023878 catgaaagttttagataaatatgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtagg 8023779  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    | || ||| |||||   ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  8023778 ttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaactta 8023721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36528170 - 36528061
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  36528170 gaaagttttagataattttgtcagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtct 36528071  T
Q  398 tagtgaaatt 407  Q
    ||| ||||||    
T  36528070 tagcgaaatt 36528061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 478 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892975
Alignment:
Q  478 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 10247290 - 10247409
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||| |||| ||  |||     
T  10247290 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggagg 10247389  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  10247390 tcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15413026 - 15412947
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15413026 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 15412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 13151357 - 13151431
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13151357 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgag 13151431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 45606473 - 45606547
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45606473 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgttttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 45606547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 407
Target Start/End: Original strand, 3264646 - 3264818
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    || || ||   || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |     
T  3264646 cgagcttaggaaaaccaacttttctggaattttctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagcttcccagtggcc 3264745  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 407  Q
      |||||||| ||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  3264746 atggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 3264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 527
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19568996
Alignment:
Q  471 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19568996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 527
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353302
Alignment:
Q  444 caaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggta-tttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgtt 42353302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6002603 - 6002446
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||  ||     
T  6002603 catgaaggttttagataattatgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtagg 6002504  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||| | ||||||||    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| |||||    
T  6002503 tcttggggaaattttaaagaaatttagcataactatttccaagtcattccaatactta 6002446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 405
Target Start/End: Original strand, 11986844 - 11986912
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  11986844 ggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 6468701 - 6468780
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  6468701 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtccgtttgacttgaaaataattttcggtttatgagttatg 6468780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 13153823 - 13153896
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13153823 catgaaagttgtagata-ttgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgag 13153896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Original strand, 17759054 - 17759148
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  17759054 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 17759148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Original strand, 19060374 - 19060468
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  19060374 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 19060468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Original strand, 40039740 - 40039826
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 381  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  40039740 catgaaagttttagataattttgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaatattttatggattttgagttatgatgaaaa 40039826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 604
Target Start/End: Original strand, 52523593 - 52523667
Alignment:
Q  530 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 604  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52523593 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgagaagctgttataagatgatt 52523667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 566
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32402862
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattata 32402862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 8269382 - 8269472
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  8269382 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 8276493 - 8276583
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  8276493 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Original strand, 17956848 - 17956897
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  17956848 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgac 17956897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21618692 - 21618627
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21618692 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 21618627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27840549 - 27840500
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  27840549 catgaaagttgtagataattttgttagccttctaatgactttggtttgac 27840500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 36166841 - 36166776
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36166841 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 36166776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15570176 - 15570016
Alignment:
Q  55 agattgtttccaagaaagaagcatcctccagaggtgca-tttctatcatcagcgcttccttcccagccagcatcacaattaccaatcaacattgagtttt 153  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |  ||||| |||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| |||| | | |||| ||    
T  15570176 agattatttcctagatagaaacatcctccaaaggtactctttctgtcatcagcacttcctgcctagtcagcatcacaataacccatcagcttagagtctt 15570077  T
Q  154 cattgtgagaatacagaattccataatcacttgtacagttgatgtatttcaggattctctt 214  Q
    ||||||  || || |  || |||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||||    
T  15570076 cattgtatgagtataagatcccataatcacttatactattgatgtatttcagtatcctctt 15570016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 616
Target Start/End: Original strand, 29172491 - 29172579
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||  ||||| || ||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  29172491 atgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttgatag 29172579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 525 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 9577882 - 9577795
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9577882 gttataagttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 9577795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16820552 - 16820505
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  16820552 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 16820505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15207161
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 561  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 15207161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246243
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 561  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttga 15246243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15265402 - 15265364
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 561  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15265402 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttga 15265364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427930
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 37427930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16059659 - 16059622
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16059659 atgttatgagttggtctttggggtaggaatggaagttg 16059622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 54039146 - 54039227
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 376  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  54039146 catgaatgttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 54039227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 1468633 - 1468669
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1468633 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 1468669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12808595 - 12808559
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12808595 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 12808559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 14528644 - 14528708
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||  |||||||||||    
T  14528644 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgattttt 14528708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 16934830 - 16934894
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  16934830 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgattttt 16934894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 563 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 23274910 - 23274882
Alignment:
Q  563 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274910 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 23274882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25058388 - 25058324
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  25058388 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 25058324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49231858 - 49231794
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  49231858 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 49231794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 123)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10057188 - 10056787
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10057188 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcaccaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 10057089  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10057088 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttct 10056989  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10056988 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagtt 10056889  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 634  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  10056888 gatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 10056793  T
Q  635 tgtata 640  Q
    ||||||    
T  10056792 tgtata 10056787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 630299 - 630640
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  630299 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 630398  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  630399 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 630498  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  630499 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 630598  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  630599 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 630640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12611507 - 12611166
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  12611507 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgagg 12611408  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12611407 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 12611308  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12611307 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctatta 12611208  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  12611207 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 12611166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 23802860 - 23803201
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  23802860 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggagg 23802959  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23802960 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23803059  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23803060 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 23803159  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  23803160 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 23803201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 51463463 - 51463804
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||     
T  51463463 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggagg 51463562  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||     
T  51463563 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 51463662  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51463663 aattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctatta 51463762  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  51463763 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 51463804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 9638663 - 9638399
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9638663 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9638564  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9638563 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 9638464  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9638463 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 9638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28385899 - 28385646
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28385899 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28385800  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28385799 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 28385700  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||    
T  28385699 aattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagttggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 35660502 - 35660270
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35660502 catgaaagttttagatagttttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 35660403  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35660402 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 35660303  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35660302 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 35660270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Original strand, 56115232 - 56115528
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  56115232 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 56115331  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  56115332 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttc 56115431  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
     | |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  56115432 tattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 56115528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15008622 - 15008342
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15008622 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15008523  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15008522 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 15008423  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15008422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 15008342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15990695 - 15990439
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15990695 catgaaagttttagataatttagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15990596  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15990595 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 15990496  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 551  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15990495 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 53630869 - 53631101
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  53630869 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 53630968  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53630969 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 53631068  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53631069 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 53631101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 10694643 - 10694896
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  10694643 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10694742  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10694743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10694842  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10694843 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 10908409 - 10908662
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  10908409 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10908508  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10908509 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10908608  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10908609 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10908662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 300 - 525
Target Start/End: Original strand, 11479012 - 11479237
Alignment:
Q  300 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11479012 aagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtctta 11479111  T
Q  400 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 499  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11479112 gtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatta 11479211  T
Q  500 aggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  11479212 aggtgtttaagattatttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25091309 - 25091077
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25091309 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25091210  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25091209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttc 25091110  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25091109 aactagggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 25091077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 297 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 10705152 - 10704890
Alignment:
Q  297 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 396  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  10705152 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10705053  T
Q  397 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 496  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10705052 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10704953  T
Q  497 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10704952 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10704890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 297 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 10918922 - 10918660
Alignment:
Q  297 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 396  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  10918922 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10918823  T
Q  397 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 496  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10918822 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10918723  T
Q  497 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10918722 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9923852 - 9923622
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9923852 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9923753  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9923752 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 9923653  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  9923652 aattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40620186 - 40619907
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40620186 catgaaagttgtaaataattgtgctagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 40620087  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  40620086 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagtta 40619987  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  40619986 aattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 40619907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 42875455 - 42875223
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42875455 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42875356  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42875355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42875256  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42875255 aactagggtgtttaggagtatttaacctatgtt 42875223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37019325 - 37019095
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37019325 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37019226  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  37019225 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 37019126  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37019125 aactaaggtgtttaagagtatttaacctatg 37019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 298 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 3337752 - 3337523
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3337752 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtct 3337653  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3337652 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaat 3337553  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3337552 taaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3337523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 15447812 - 15448057
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| | || | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15447812 catgaaagttgtaggtaattgagttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15447911  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15447912 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttc 15448011  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15448012 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttgatctt 15448057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 19435093 - 19435326
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19435093 catgaaagttgtagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagg 19435192  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19435193 tcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19435292  T
Q  495 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  19435293 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 19435326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19609976 - 19609748
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19609976 aaagttgtagataattgagttacctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 19609877  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19609876 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaact 19609777  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19609776 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 24046930 - 24047201
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |   ||     
T  24046930 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtagg 24047029  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24047030 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24047129  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  24047130 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattata 24047201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 10356832 - 10357064
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10356832 catgaaagttgtagataatggagttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggagg 10356931  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10356932 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 10357031  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10357032 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 10357064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16998181 - 16997954
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16998181 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16998082  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     |||||||| |||||     
T  16998081 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttg 16997987  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16997986 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16997954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 33243692 - 33243924
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |     
T  33243692 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagggg 33243791  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33243792 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 33243891  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || | |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  33243892 aattgaggtgtttaagagtagctaacctatgtt 33243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 33849398 - 33849102
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  33849398 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 33849299  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33849298 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 33849199  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| | ||||||||    
T  33849198 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtttgaagctg 33849102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15114878 - 15114648
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  15114878 catgaaagttgtagataatttagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtagg 15114779  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15114778 tcttagtgaaatttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 15114680  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15114679 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33186557 - 33186312
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33186557 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 33186458  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33186457 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 33186358  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33186357 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 33186312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14549282 - 14549050
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||     
T  14549282 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggagg 14549183  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14549182 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttc 14549083  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14549082 aactagggtgtttaagagtatttagcctatgtt 14549050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18213222 - 18212951
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18213222 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18213123  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18213122 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18213023  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18213022 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18212951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 295 - 550
Target Start/End: Original strand, 16277723 - 16277978
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  16277723 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 16277822  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | ||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  16277823 ttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 16277922  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 550  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  16277923 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 295 - 550
Target Start/End: Original strand, 53387333 - 53387588
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  53387333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 53387432  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||    
T  53387433 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttc 53387532  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 550  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  53387533 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 295 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3485564 - 3485347
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | || | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3485564 catgaaagttgtagataattgtgttagttttctagtggcgtcagtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaga 3485465  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||     
T  3485464 tcttagtgaa--ttgttaaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc-caaccccaagactagaagtactaggagttt 3485368  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtat 515  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  3485367 aattaaggtgtttaagagtat 3485347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 483
Target Start/End: Original strand, 15011913 - 15012097
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  15011913 aaagttgtagataattaagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 15012012  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagt 483  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15012013 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 19566315 - 19566546
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19566315 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19566414  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  19566415 tcttactgaaattttgtgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 19566513  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19566514 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 46740854 - 46740619
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||      
T  46740854 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacg 46740755  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  46740754 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 46740656  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46740655 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 46740619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 40229959 - 40229723
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  40229959 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 40229860  T
Q  395 tctt-agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||    
T  40229859 tcttaagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagtt 40229761  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40229760 caattaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 40229723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14630482 - 14630250
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14630482 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14630383  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14630382 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14630283  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14630282 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 14630250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 15344531 - 15344297
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15344531 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15344432  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||| ||| |   || |||  ||||| ||  | |||||| ||||||    
T  15344431 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttc 15344334  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15344333 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 15344297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 296 - 519
Target Start/End: Original strand, 10237895 - 10238117
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  10237895 atgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 10237994  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| ||||| |    
T  10237995 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaa 10238093  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaa 519  Q
    | ||| || |||||||||||||||    
T  10238094 attaatgtgtttaagagtatttaa 10238117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 11425601 - 11425379
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |  | | ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  11425601 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 11425502  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11425501 tcttagtgaaa----------attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 11425412  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11425411 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11425379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 296 - 526
Target Start/End: Original strand, 15214442 - 15214672
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |    
T  15214442 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 15214541  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  15214542 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagttta 15214641  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15214642 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 298 - 531
Target Start/End: Original strand, 44024003 - 44024235
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  44024003 gaaagttgtagataattgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtct 44024102  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||||     
T  44024103 tagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 44024201  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44024202 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 44024235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25513397 - 25513167
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  25513397 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 25513298  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |   |  |||||||||| || |  |||||| |||||||    
T  25513297 cttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttca 25513199  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25513198 attacggtgtttaagaatatttaacctatgtt 25513167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 546
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884062
Alignment:
Q  401 tgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa 500  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  501 ggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggt 546  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 16026325 - 16026482
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16026325 catgaaagttttagataattgtgctagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16026424  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  16026425 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataagtatttctaagttaacccaaaactta 16026482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 55582847 - 55582703
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55582847 catgaaagttttagataatcgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 55582748  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 439  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  55582747 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 528
Target Start/End: Original strand, 45314733 - 45314965
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45314733 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45314832  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||| |   || |||| ||||| || |  | | || ||||||    
T  45314833 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttc 45314931  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 528  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45314932 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtta 45314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 26445540 - 26445309
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  26445540 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26445441  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || |||    
T  26445440 tcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttc 26445342  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26445341 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26445309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 438
Target Start/End: Original strand, 18108274 - 18108417
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18108274 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18108373  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18108374 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 2425017 - 2425248
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||     
T  2425017 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggagg 2425116  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||  |||||  | |  | |||| ||||||    
T  2425117 tcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttc 2425215  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2425216 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2425248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333429
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||    
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt----gttagta 17333447  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17333446 atgtaatatatttgtata 17333429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15534777 - 15534658
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  15534777 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15534678  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  15534677 tcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 49547340 - 49547459
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  49547340 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49547439  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  49547440 tcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14049173 - 14049054
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  14049173 catgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggagg 14049074  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  14049073 tcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36038466 - 36038347
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||     
T  36038466 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggagg 36038367  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  36038366 tcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 12033341 - 12033459
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  12033341 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 12033440  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  12033441 cttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 308 - 422
Target Start/End: Original strand, 22725494 - 22725608
Alignment:
Q  308 gataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 407  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||     
T  22725494 gataattttgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatc 22725593  T
Q  408 ttttgaaaattcagc 422  Q
    || ||||||||||||    
T  22725594 ttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 44615883 - 44615765
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  44615883 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 44615784  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  44615783 cttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825617
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14825635  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14825634 atgtaatatatttgtata 14825617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 457 - 591
Target Start/End: Original strand, 43251120 - 43251255
Alignment:
Q  457 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 555  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |    
T  43251120 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaa 43251219  T
Q  556 ggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251220 agttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 43251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 20595827 - 20596056
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||  | | ||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  20595827 catgaaagttttagatacatgtattagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtagg 20595926  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||| ||  | || | ||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  20595927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttg-agttataggagttc 20596025  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||    
T  20596026 aattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 459 - 560
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871226
Alignment:
Q  459 aattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggt 558  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagt 9871224  T
Q  559 tg 560  Q
    ||    
T  9871225 tg 9871226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14185538 - 14185426
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  14185538 catgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 14185439  T
Q  395 tcttagtgaaatt 407  Q
    |||||| ||||||    
T  14185438 tcttagcgaaatt 14185426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30147511 - 30147392
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  30147511 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 30147412  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  30147411 tcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 50221907 - 50222025
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  50221907 atgaaagttgtagataagtttgttggctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 50222006  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  50222007 cttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 15117919 - 15117998
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15117919 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15117998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29267948 - 29267830
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||   | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  29267948 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 29267849  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    || |||||| |||| ||||    
T  29267848 ctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 453
Target Start/End: Original strand, 54364086 - 54364244
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||   |     
T  54364086 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtggg 54364185  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttag 453  Q
    |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  54364186 tcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttag 54364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 436
Target Start/End: Original strand, 13046041 - 13046182
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||||||||||  ||     
T  13046041 catgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtagg 13046140  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    |||| || |||||||  ||||||||| ||||||  |||||||    
T  13046141 tcttggtaaaattttacgaaaattcaacataaccatttctaa 13046182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 19243294 - 19243177
Alignment:
Q  297 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   | || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19243294 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtc 19243195  T
Q  397 ttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  19243194 ttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 7640753 - 7640832
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  7640753 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 7640832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 1837086 - 1837160
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1837086 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 1837160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 524
Target Start/End: Original strand, 13036332 - 13036402
Alignment:
Q  454 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  13036332 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 13036402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 529 - 640
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050447
Alignment:
Q  529 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 628  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||| |    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttga----tagtaatgtga 26050435  T
Q  629 tatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||    
T  26050436 tatatttgtata 26050447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 530 - 612
Target Start/End: Original strand, 52243059 - 52243141
Alignment:
Q  530 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52243059 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 52243141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 395 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12622927 - 12622792
Alignment:
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  12622927 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttc 12622829  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12622828 aattaaggtgtttaagagtatttaacctattttatga 12622792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 395 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14508317 - 14508186
Alignment:
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  14508317 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatgagttc 14508219  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508218 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 450
Target Start/End: Original strand, 19081780 - 19081892
Alignment:
Q  338 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 437  Q
    ||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  19081780 gtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaag 19081879  T
Q  438 ttaatccaaaact 450  Q
    | || ||||||||    
T  19081880 tcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 18239179 - 18239253
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18239179 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtctgtttcacttgaaaatgattttcggtttatgag 18239253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 352
Target Start/End: Original strand, 9871071 - 9871128
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaat 352  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  9871071 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatgactttggtttgacttgaaaat 9871128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Original strand, 13591785 - 13591874
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  13591785 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttg 13591874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32306947
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatag 32306947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 44772650 - 44772719
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 364  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44772650 catgaaagttgtagataattgtattatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggttt 44772719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9886455 - 9886387
Alignment:
Q  241 taggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtaga 309  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9886455 taggaaaatcaacttttctaccactttcttttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 9886387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 16386753 - 16386916
Alignment:
Q  55 agattgtttccaagaaagaagcatcctccagaggtgc-atttctatcatcagcgcttccttcccagccagcatcacaattaccaatcaacattgagtttt 153  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||| |||| | | |||| ||    
T  16386753 agattatttcctagaaagaaacatcctccagaggtactttttctgtcatcagcacttcctgcccaatcagcatcacaataacccatcagcttagagtctt 16386852  T
Q  154 cattgtgagaatacagaattccataatcacttgtacagttgatgtatttcaggattctcttcac 217  Q
    || |||  || || |  || ||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||    
T  16386853 cactgtatgagtataagatcccataatcacttgtactattgatgtattttagtatcctcttcac 16386916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Original strand, 17376062 - 17376148
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg-acatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 381  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  17376062 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttaggttt-acttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 17376148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18247829 - 18247739
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  18247829 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 22355079 - 22355169
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  22355079 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47357273 - 47357183
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  47357273 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 528 - 614
Target Start/End: Original strand, 54798627 - 54798713
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 614  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  54798627 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 54798713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 14873653 - 14873705
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttg 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14873653 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttg 14873705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14951360 - 14951296
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  14951360 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 14951296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13234618 - 13234547
Alignment:
Q  239 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 310  Q
    |||||||||||||| | || ||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13234618 cataggaaaatcaattgttctgtcactttatgttccgaattaggtttggtagtcttcatgaaagttgtagat 13234547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 14280557 - 14280474
Alignment:
Q  531 agttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 614  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  14280557 agttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 14280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 525 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 26789598 - 26789555
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataat 568  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26789598 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataat 26789555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 385
Target Start/End: Original strand, 17146303 - 17146389
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  17146303 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 15287878 - 15287959
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15287878 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15287959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 15294988 - 15295069
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15294988 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15295069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922299
Alignment:
Q  482 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26922299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 525 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 15792034 - 15791990
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15792034 gttatgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataata 15791990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 55377205 - 55377269
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  55377205 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 55377269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8123845 - 8123798
Alignment:
Q  3 tatagattgaatactgcttcatgttctcgggattcttcagtttcttct 50  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8123845 tataggttgaatactgcctcatgttctcaggagtcttcagtttcttct 8123798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12230551 - 12230500
Alignment:
Q  260 ggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  12230551 ggaattttcggttctgaattaggatttggtgtcttcatcaaagttgtagata 12230500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10643836 - 10643746
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  10643836 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19020099 - 19020009
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  19020099 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 612
Target Start/End: Original strand, 44928821 - 44928871
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||    
T  44928821 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttg 44928871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 8574742 - 8574807
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8574742 atgagttggtctttagggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 8574807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 526
Target Start/End: Original strand, 12134425 - 12134486
Alignment:
Q  465 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12134425 aaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 19804975 - 19804926
Alignment:
Q  3 tatagattgaatactgcttcatgttctcgggattcttcagtttcttcttc 52  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  19804975 tataggttgaatactgcttcatgttttcaggagtcttcagttccttcttc 19804926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 607
Target Start/End: Original strand, 20157189 - 20157234
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaa 607  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  20157189 atatgatattaatgatgatctgtgaagttgttatatgatgatttaa 20157234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 44102433 - 44102404
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102433 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 44102404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 5683375 - 5683439
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||||||||    
T  5683375 catgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgattttt 5683439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8374130 - 8374094
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8374130 catgaaagttgtagataattttgttaactttctaatg 8374094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12622968 - 12622936
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttcc 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12622968 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcc 12622936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14995734 - 14995670
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  14995734 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgattttt 14995670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16731766 - 16731702
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  16731766 catgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 16731702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18168383 - 18168347
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18168383 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 18168347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 110)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27472969 - 27472568
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27472969 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcattaaagttgtagataattttgttagctttccagtgaaa 27472870  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27472869 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 27472770  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27472769 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagtt 27472670  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 634  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||    
T  27472669 gatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaatatgatttaatgttga----tagtaatataatatatt 27472574  T
Q  635 tgtata 640  Q
    ||||||    
T  27472573 tgtata 27472568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Original strand, 34873783 - 34874184
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34873783 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 34873882  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34873883 ttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 34873982  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873983 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 34874082  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 634  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||    
T  34874083 gatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----aagtattgtaatatatt 34874178  T
Q  635 tgtata 640  Q
    ||||||    
T  34874179 tgtata 34874184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 235 - 572
Target Start/End: Original strand, 34858721 - 34859058
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34858721 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 34858820  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34858821 ttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 34858920  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858921 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 34859020  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatta 572  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34859021 gatccttgggataggaatggaggttgaatataatatta 34859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 18358365 - 18358705
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18358365 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18358464  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18358465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18358564  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18358565 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcgaagctgtta 18358664  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    | |||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  18358665 t-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtata 18358705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 22173424 - 22173765
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  22173424 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 22173523  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22173524 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttc 22173623  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22173624 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 22173723  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  22173724 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 22173765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 21081367 - 21081708
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21081367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21081466  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21081467 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21081566  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21081567 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtgaagctgtta 21081666  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  21081667 taatatgatttaatgttga----tactaatgtaatatatttgtata 21081708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 235 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 20915821 - 20915525
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |     
T  20915821 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttatgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagatttagataattttgttagttttccaattgct 20915722  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||     
T  20915721 ttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttcc 20915622  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915621 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacctatgctatga 20915525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 295 - 559
Target Start/End: Original strand, 41301369 - 41301633
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41301369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41301468  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41301469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 41301568  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 559  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41301569 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 41301633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26903814 - 26903561
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26903814 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 26903715  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26903714 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 26903615  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  26903614 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 23969019 - 23969251
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |  |||     
T  23969019 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggagg 23969118  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23969119 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23969218  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23969219 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23969251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21915278 - 21915025
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| | ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||     
T  21915278 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggagg 21915179  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21915178 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21915079  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21915078 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25183843 - 25183603
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25183843 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25183744  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  25183743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttc 25183644  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 535  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25183643 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 43707685 - 43707912
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43707685 aaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 43707784  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  43707785 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaatt 43707883  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43707884 aaggtgtttaagattatttaacctatgtt 43707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 24273656 - 24273887
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24273656 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 24273755  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24273756 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 24273855  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24273856 attaaggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 24273887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 9975585 - 9975353
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9975585 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9975486  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9975485 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 9975386  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9975385 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 9975353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 24781236 - 24781468
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24781236 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 24781335  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24781336 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24781435  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24781436 aactagggtgtttaagaatatttaacctatgtt 24781468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24884042 - 24883785
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24884042 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24883943  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24883942 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttc 24883843  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24883842 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttgatc-ttgggataggaatg 24883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 31520773 - 31520509
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31520773 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31520674  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  31520673 tcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttc 31520574  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  31520573 aattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagttg 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 5031526 - 5031758
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5031526 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5031625  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5031626 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 5031725  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  5031726 aactaggctgtttaagagtatttaacatatgtt 5031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 27484866 - 27485098
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||     
T  27484866 catgaaagatgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtagg 27484965  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27484966 tcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 27485065  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27485066 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 36839827 - 36839595
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36839827 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36839728  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36839727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36839628  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36839627 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36839595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 542
Target Start/End: Original strand, 18388693 - 18388940
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18388693 catgaaagttgtagataattgggttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18388792  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18388793 tcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18388892  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttg 542  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||| ||||    
T  18388893 aattaaggtgtttaagagtattttactcatgttgagagttgatttttg 18388940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Original strand, 23338796 - 23339092
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23338796 catgaaagttgtagataattttactagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23338895  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23338896 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 23338995  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  23338996 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 23339092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 19662051 - 19662322
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  19662051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 19662150  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  19662151 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 19662250  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19662251 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 19662322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 21073123 - 21073394
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |      
T  21073123 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 21073222  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||    
T  21073223 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttc 21073322  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21073323 aattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 21073394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Original strand, 10039531 - 10039775
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  10039531 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 10039630  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10039631 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 10039730  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  10039731 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 10039775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17307143 - 17306911
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  17307143 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17307044  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17307043 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttc 17306944  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  17306943 aactaaggtgtttaagatcatttaacatatgtt 17306911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21368763 - 21368532
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||   | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  21368763 catgaaagttttagataattgtgttagctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21368664  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21368663 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21368564  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21368563 aaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 19201596 - 19201828
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgag 393  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19201596 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggag 19201695  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201696 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 19201795  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
     || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201796 taattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 19201828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 9242416 - 9242145
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  9242416 catggaagttttagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaga 9242317  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  9242316 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 9242217  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9242216 aactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattata 9242145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 533
Target Start/End: Original strand, 20590718 - 20590956
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  20590718 catgaaagctgtagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 20590817  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  20590818 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 20590917  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 533  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20590918 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 6483171 - 6482946
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  6483171 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6483072  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||     
T  6483071 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6482972  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  6482971 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 6486638 - 6486413
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  6486638 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6486539  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||     
T  6486538 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6486439  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  6486438 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9785238 - 9785013
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  9785238 catgaaagttgttgataattgtgttagctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9785139  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9785138 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 9785039  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  9785038 aattaaggggtttaacagtatttaac 9785013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 28349573 - 28349268
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  28349573 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 28349474  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataattcaaaacctcaaaactagaagtac 485  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28349473 tcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactagaagtac 28349374  T
Q  486 taggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtg 585  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28349373 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaatgatgatctgtg 28349274  T
Q  586 aagctg 591  Q
    ||||||    
T  28349273 aagctg 28349268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 6260774 - 6261045
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  6260774 catgaaagttgtagataattttgttaactttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 6260873  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||      
T  6260874 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtga 6260973  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  6260974 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattata 6261045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 298 - 520
Target Start/End: Original strand, 23068849 - 23069071
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  23068849 gaaagttgtagataattgagtttgttttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtct 23068948  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||     
T  23068949 tagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaat 23069048  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  23069049 taaggggtttaagagtatttaac 23069071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 28652898 - 28653123
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||     
T  28652898 catgaaagttgtagataattgagttagattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 28652997  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28652998 tcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 28653097  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28653098 aactagggtgtttaagagtatttaac 28653123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 24515842 - 24515610
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  24515842 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggagg 24515743  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24515742 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 24515643  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24515642 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 24515610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22690336 - 22690101
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22690336 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22690237  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| ||||||    
T  22690236 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttc 22690138  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22690137 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22690101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22694932 - 22694697
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22694932 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22694833  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| ||||||    
T  22694832 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttc 22694734  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22694733 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22694697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 21316058 - 21316289
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  21316058 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 21316157  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  21316158 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 21316256  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21316257 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 298 - 527
Target Start/End: Original strand, 21335852 - 21336080
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21335852 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 21335951  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||  || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||||     
T  21335952 tagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 21336050  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21336051 taagatgtttaagagtatttaacctatgtt 21336080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 337 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 29113975 - 29113786
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||    
T  29113975 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcctaa 29113876  T
Q  437 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29113875 gtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 29113786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 1384082 - 1384239
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  1384082 catgaaagttgtagataattgtattagctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgagg 1384181  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1384182 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaactcaaaactta 1384239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 550
Target Start/End: Original strand, 2524143 - 2524380
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       
T  2524143 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg--- 2524239  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa-gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
                 || |||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2524240 -------------ttatgaaaattcagcataacc---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagtt 2524323  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 550  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2524324 caatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagttgacctttagggtagga 2524380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22686495 - 22686264
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||     
T  22686495 catgaacgttttagatatttttattagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtagg 22686396  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22686395 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22686297  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22686296 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22686264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 306 - 452
Target Start/End: Original strand, 25587094 - 25587240
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25587094 tagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 25587193  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  25587194 ttttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaactta 25587240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345265
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatttgtgaagctattataat 31345303  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||| ||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  31345302 atgaattagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 31345265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20261815 - 20261696
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  20261815 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20261716  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  20261715 tcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22332402 - 22332142
Alignment:
Q  265 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 364  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||||   ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| | ||    
T  22332402 tttctgttttgaattggcttttggagtgaacataaatgttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagatt 22332303  T
Q  365 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 464  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  |||     
T  22332302 ttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtg-aattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttcc 22332204  T
Q  465 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||| |||||| | |  |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22332203 aaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgtt 22332142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 10684329 - 10684448
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  10684329 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10684428  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  10684429 tcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 23778691 - 23778849
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  23778691 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 23778790  T
Q  395 tcttagtgaaattttttg-aaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    | |||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  23778791 ttttagtgaaattttacgaaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 23778849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38968075 - 38967956
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  38968075 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 38967976  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  38967975 tcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 28345472 - 28345614
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  28345472 catgaaaattttagataattgtgttagctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 28345571  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 437  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28345572 tcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaag 28345614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 338 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 23610089 - 23609901
Alignment:
Q  338 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 437  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  23610089 gtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaag 23609990  T
Q  438 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23609989 tcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23609901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40911979 - 40911868
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40911979 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgaga 40911880  T
Q  395 tcttagtgaaat 406  Q
    ||||||||||||    
T  40911879 tcttagtgaaat 40911868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004923
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgttg 23004923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31345771 - 31345661
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31345771 aaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 31345672  T
Q  399 agtgaaattttt 410  Q
    ||| ||||||||    
T  31345671 agt-aaattttt 31345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 24897763 - 24897881
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24897763 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24897862  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24897863 cttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 24900246 - 24900364
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24900246 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24900345  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24900346 cttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 24902723 - 24902841
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24902723 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24902822  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24902823 cttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 24905200 - 24905318
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24905200 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24905299  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24905300 cttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 24907675 - 24907793
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24907675 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24907774  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24907775 cttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392550
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatag 26392550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 566
Target Start/End: Original strand, 30643811 - 30643948
Alignment:
Q  429 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 528  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  30643811 gtttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 30643910  T
Q  529 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  30643911 tgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattata 30643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22255868 - 22255777
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 386  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22255868 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactc 22255777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 445 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501260
Alignment:
Q  445 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 544  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22501276  T
Q  545 gtaggaatggaggttg 560  Q
     |||||||||| ||||    
T  22501275 ataggaatggaagttg 22501260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 445 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509194
Alignment:
Q  445 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 544  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22509210  T
Q  545 gtaggaatggaggttg 560  Q
     |||||||||| ||||    
T  22509209 ataggaatggaagttg 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23136174 - 23136056
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  23136174 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 23136075  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  23136074 cttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Original strand, 22412994 - 22413083
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22412994 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 22413083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18809538 - 18809459
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18809538 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18809459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 523 - 610
Target Start/End: Original strand, 20520051 - 20520138
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 610  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  20520051 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgt 20520138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 22786694 - 22786924
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||| ||||  |      
T  22786694 catgaaagttttagctaattttattagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaag 22786793  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| ||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22786794 tcttggtaaatttttgtgaaaatt-tgcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagttt 22786892  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    ||   ||  |||  ||||||||||||||||||    
T  22786893 aatcgagagattggagagtatttaacctatgt 22786924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28577694 - 28577615
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28577694 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 28577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 20273012 - 20272855
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |  | |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  20273012 catgaaagttttagataatctcgttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtagg 20272913  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||| || || ||||   ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20272912 tcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7187022 - 7186942
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatga 375  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7187022 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 23711580 - 23711659
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23711580 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 23711659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 525 - 612
Target Start/End: Original strand, 24697467 - 24697553
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24697467 gttatgagtagatccttagggtaggagtggaggttgtatttaatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttatgttg 24697553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26505974 - 26505895
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26505974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26505895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26508452 - 26508373
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26508452 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26508373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 27920331 - 27920410
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27920331 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 32039065 - 32039144
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32039065 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 32039144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 571993 - 571919
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  571993 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 571919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Original strand, 36734881 - 36734975
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36734881 catgaaagttttagataatgttgttagatttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaa 36734975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39682909 - 39682835
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39682909 catgaaagttgtagctaattgtgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 39682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22501456 - 22501375
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 376  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22501456 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22509390 - 22509309
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 376  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22509390 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287512
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||| | |||    |||||    
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatga----tagta 23287530  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23287529 atgtgatatatttgtata 23287512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23131457 - 23131378
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23131457 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23131378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23133924 - 23133845
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23133924 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23133845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 34402089 - 34402168
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  34402089 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 34402168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 19887294 - 19887384
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  19887294 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 24841422 - 24841377
Alignment:
Q  482 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24841422 gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 24841377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 561
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18546841
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 561  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 18546841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 548
Target Start/End: Original strand, 34492091 - 34492141
Alignment:
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  34492091 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 567 - 612
Target Start/End: Original strand, 23708521 - 23708566
Alignment:
Q  567 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  23708521 atattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttg 23708566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 474
Target Start/End: Original strand, 28031919 - 28032056
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  28031919 ggtttggcttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 28032018  T
Q  437 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaa 474  Q
    || || ||||| |||| ||| || ||| |||| |||||    
T  28032019 gtcaacccaaaccttatggattatttccaaacttcaaa 28032056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16900905 - 16900841
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  16900905 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 16900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16994296 - 16994232
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  16994296 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 16994232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 24302374 - 24302220
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||| | ||| ||| |||| |||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||| |||  ||     
T  24302374 catgaaagttttagataaagatgttagctttctaatggcttcgatttaactt-aaaatgtttttaggtttt-gtgctatgatgaaaatactacaagtagg 24302277  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactt 451  Q
    ||||  || |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  24302276 tcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24383167 - 24383131
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24383167 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 24383131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34823840 - 34823776
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  |  |||||||||||    
T  34823840 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgattttt 34823776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Original strand, 22497852 - 22497890
Alignment:
Q  269 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22497852 tgttccgaattaggtctgggagtcttcatgaaagttgta 22497890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 11232232 - 11232268
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11232232 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 11232268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 307
Target Start/End: Original strand, 19445355 - 19445419
Alignment:
Q  243 ggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 307  Q
    |||||||||| || | || || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19445355 ggaaaatcaaattgtgtgcaactttatgttccgaattaggtttggaagtctgcatgaaagttgta 19445419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 22514079 - 22514115
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22514079 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 22514115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 23760032 - 23760068
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23760032 catggaagttttagataattttgttagctttccaatg 23760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 28776681 - 28776717
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28776681 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 28776717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 525 - 569
Target Start/End: Original strand, 43947232 - 43947276
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43947232 gttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataata 43947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 67810 - 67409
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  67810 cgagcataggaaaatccacttttatgaaattttctgttctgaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttcctatggct 67711  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  67710 ttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 67611  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  67610 aagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagtt 67511  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 634  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  67510 gatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattacttatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 67415  T
Q  635 tgtata 640  Q
    | ||||    
T  67414 tttata 67409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Original strand, 62410 - 62522
Alignment:
Q  339 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  62410 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagt 62509  T
Q  439 taatccaaaactt 451  Q
     || |||||||||    
T  62510 caaaccaaaactt 62522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 116801 - 117032
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||  | ||||| |||     
T  116801 catgaaagtttcagataattgtgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggagg 116900  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  116901 tcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagttt 117000  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   |||||||||||| |||||||||    
T  117001 aagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 176)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 235 - 640
Target Start/End: Original strand, 46580260 - 46580647
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  46580260 cgagcataggaaaatcaaattttcctgaattttctattctgaattgggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagttttccaatgact 46580359  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||             
T  46580360 ttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaattcagcata--------- 46580450  T
Q  435 aagttaatccaaaactta-gggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 533  Q
        ||||  |  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580451 ----taat--attactgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagt 46580544  T
Q  534 tgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat 633  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  46580545 tgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatat 46580640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 235 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48812554 - 48812241
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  48812554 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttccgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggct 48812455  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48812454 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 48812355  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48812354 aagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 48812255  T
Q  535 gatctttggggtag 548  Q
    | || |||||||||    
T  48812254 ggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13647898 - 13647555
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13647898 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13647799  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13647798 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 13647699  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  13647698 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcgaagctatta 13647599  T
Q  595 ta--atatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  13647598 taatatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 13647555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 295 - 593
Target Start/End: Original strand, 18456044 - 18456342
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18456044 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18456143  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18456144 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18456243  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18456244 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttaaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 18456342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 296 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16999087 - 16998741
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16999087 atgaaagtagtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagat 16998988  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagt------actagg 489  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||      || | |    
T  16998987 cttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatg 16998888  T
Q  490 agttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagc 589  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16998887 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtgaagc 16998788  T
Q  590 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
     |||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  16998787 agttataatatgatttaatgttga----taataatgtaatatatttgtata 16998741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 708951 - 709204
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  708951 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 709050  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  709051 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 709150  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  709151 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 709204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 58814 - 59071
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  58814 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 58913  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  58914 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 59013  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  59014 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 59071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 8756792 - 8757056
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  8756792 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 8756891  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8756892 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 8756991  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8756992 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16462692 - 16462439
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16462692 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16462593  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16462592 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 16462493  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16462492 aattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 14415880 - 14416112
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  14415880 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 14415979  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14415980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14416079  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14416080 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14416112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 32160598 - 32160851
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32160598 catgaaagttgtagataattgtcttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32160697  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32160698 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32160797  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  32160798 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 32160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 14191484 - 14191735
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14191484 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14191581  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14191582 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttc 14191681  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14191682 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 30820652 - 30820910
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30820652 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggaga 30820751  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30820752 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 30820851  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  30820852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 30820910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 47975307 - 47975560
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  47975307 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 47975406  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  47975407 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttc 47975506  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  47975507 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcgtccttggggtag 47975560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 411 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14273888 - 14273663
Alignment:
Q  411 tgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaag 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  14273888 tgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaag 14273789  T
Q  511 agtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 610  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273788 agtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 14273689  T
Q  611 tgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||    
T  14273688 tga----tagtaatgtaatatatttgtata 14273663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Original strand, 16550400 - 16550679
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16550400 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16550499  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16550500 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16550599  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16550600 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16615262 - 16614983
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16615262 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16615163  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16615162 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16615063  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16615062 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16614983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 14188690 - 14188941
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14188690 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14188787  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14188788 tctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttc 14188887  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14188888 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15214155 - 15213917
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15214155 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15214056  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15214055 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 15213956  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 533  Q
    || || ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  15213955 aattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtgagt 15213917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 17070689 - 17070934
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17070689 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17070788  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17070789 tcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttc 17070888  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17070889 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttgatctt 17070934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 13745172 - 13745404
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  13745172 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 13745271  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13745272 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13745371  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13745372 aattaaggtgtttcagagtatttaacctatgtt 13745404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 44374602 - 44374370
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44374602 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44374503  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44374502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44374403  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44374402 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44374370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 44383467 - 44383235
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44383467 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44383368  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44383367 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44383268  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44383267 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44383235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 46386483 - 46386715
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  46386483 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 46386582  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46386583 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46386682  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46386683 aactatggtgtttaagagtatttaacctatgtt 46386715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 47094736 - 47094491
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  47094736 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 47094637  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  47094636 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttc 47094537  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47094536 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 47094491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12371931 - 12371699
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||     
T  12371931 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggagg 12371832  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12371831 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12371732  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  12371731 aactaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 12371699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 12465656 - 12465888
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12465656 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12465755  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12465756 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttc 12465855  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || | | |||||||||||||||| ||||||    
T  12465856 aattaggatgtttaagagtatttaacttatgtt 12465888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 15167631 - 15167403
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  15167631 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 15167532  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  15167531 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 15167432  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  15167431 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13408428 - 13408170
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  13408428 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtagg 13408329  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13408328 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 13408229  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 554  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13408228 aattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatgg 13408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 550
Target Start/End: Original strand, 17505400 - 17505655
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  17505400 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17505499  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17505500 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17505599  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 550  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17505600 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 17547814 - 17547559
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  17547814 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17547715  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17547714 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17547615  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 550  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17547614 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 36685645 - 36685904
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36685645 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36685744  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36685745 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36685844  T
Q  495 aactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  36685845 aattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 36685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 832419 - 832676
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  832419 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 832518  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  832519 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 832618  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  832619 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 832676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 1197599 - 1197856
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1197599 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1197698  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  1197699 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 1197798  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1197799 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1197856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 13699285 - 13699549
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13699285 catgaaagctttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13699384  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  13699385 ccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 13699484  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  13699485 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttt-ggataggaatggaagttg 13699549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 40555139 - 40555384
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  40555139 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaag 40555238  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40555239 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 40555338  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  40555339 aattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttgatctt 40555384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 11067124 - 11066892
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||     
T  11067124 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggagg 11067025  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11067024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 11066925  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11066924 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 11066892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 14928728 - 14928960
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  14928728 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 14928827  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14928828 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 14928927  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14928928 aattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgtt 14928960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 15352194 - 15352426
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  15352194 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 15352293  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15352294 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 15352393  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15352394 aattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgtt 15352426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19282748 - 19282516
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | || | | |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19282748 catgaaagttgtagataattgtgttagctttttagtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19282649  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19282648 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 19282549  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19282548 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19282516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 29004478 - 29004214
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  29004478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggagg 29004379  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    || ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| ||||||    
T  29004378 tcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 29004279  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 559  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||    
T  29004278 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtt 29004214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 33001570 - 33001338
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33001570 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33001471  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33001470 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 33001371  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33001370 aattaaggtgtttaagagaatttaacctatgtt 33001338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18872816 - 18872545
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18872816 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18872717  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18872716 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18872617  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18872616 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18872545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 12755106 - 12755359
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12755106 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 12755205  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||| |    
T  12755206 ggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaatt 12755305  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12755306 aaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12755359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Original strand, 10896390 - 10896618
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  10896390 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 10896489  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  10896490 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 10896589  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||    
T  10896590 aattaagctgtttaagagtatttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 13147868 - 13148100
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13147868 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13147967  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  13147968 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatc 13148067  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13148068 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13148100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 32433985 - 32434221
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  32433985 catgaaagttgtagataattgagctagtgttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32434084  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32434085 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32434184  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32434185 aactagggtgtttaagagtatttaatctatgttatga 32434221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34957827 - 34957579
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  34957827 catgaaagttgtagataattttgttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtagg 34957728  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||   ||||||||||||||| || ||||||    
T  34957727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttc 34957628  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 543  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34957627 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttgg 34957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 8851555 - 8851786
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8851555 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggagg 8851654  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8851655 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 8851754  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8851755 aattaaggggtttaagattatttaacctatgt 8851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 16009034 - 16008763
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16009034 catgaaagttgtagataattttgctagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16008935  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  16008934 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 16008835  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16008834 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 16008763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 38828717 - 38828474
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  38828717 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 38828618  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38828617 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 38828518  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 538  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  38828517 aattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatc 38828474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 4325712 - 4325448
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4325712 catgaatgttgtagataattgcgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 4325613  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4325612 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 4325513  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  4325512 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 4325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 48743955 - 48743727
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  48743955 aaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaactt 48743856  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  48743855 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaatt 48743756  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  48743755 aaggtgtttaggagtatttaacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 11661761 - 11661491
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  11661761 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 11661662  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  11661661 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 11661562  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11661561 aattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-ccctggggtaggaatggaggttgattata 11661491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 37727323 - 37727580
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||     
T  37727323 catgaaagttgtatataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 37727422  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  37727423 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttc 37727522  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  37727523 aatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 37727580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32301838 - 32301613
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  32301838 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 32301739  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  32301738 tcttaatgaaattttatgaaaatacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagttt 32301639  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  32301638 aattaaggggtttaagagtatttaac 32301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 32771984 - 32771760
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||     
T  32771984 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtagg 32771885  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  32771884 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 32771785  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaa 519  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  32771784 aattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 148074 - 147803
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  148074 catgaaagttgtagataattctgttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 147975  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  147974 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 147875  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  147874 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgattata 147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 14422441 - 14422170
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14422441 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14422342  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  14422341 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14422242  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14422241 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgattata 14422170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 14566658 - 14566387
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14566658 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14566559  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  14566558 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 14566459  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14566458 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 14566387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16580316 - 16580091
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |  ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  16580316 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggagg 16580217  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16580216 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 16580117  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16580116 aattaaggggtttaacagtatttaac 16580091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 531
Target Start/End: Original strand, 14153372 - 14153603
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14153372 aaagttgtagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14153471  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| |||||||| |    
T  14153472 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaatt 14153570  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14153571 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18607943 - 18607672
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18607943 catggaagttttagatacttttgtcagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18607844  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||  ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18607843 tcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18607744  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18607743 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18607672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14259004 - 14258783
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||  || ||||    
T  14259004 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtctt 14258905  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14258904 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 14258805  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  14258804 aaggggtttaagagtatttaac 14258783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 20586008 - 20585780
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  20586008 catgaaagttgtagataattgagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggagg 20585909  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20585908 t----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 20585813  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20585812 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 20585780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 295 - 499
Target Start/End: Original strand, 12323326 - 12323530
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||   | | | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||     
T  12323326 catgaaagttgtagataattgagttagctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggagg 12323425  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12323426 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 12323525  T
Q  495 aacta 499  Q
    |||||    
T  12323526 aacta 12323530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 365 - 525
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  365 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  465 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20619942 - 20619714
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  20619942 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 20619843  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||     
T  20619842 tcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggatttt 20619743  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||    
T  20619742 aattaaggggtttaagagtatttaaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 12127559 - 12127792
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||   || | || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12127559 catgaaagtagtagataattgagttagctatcacgtggcttctgtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggag 12127658  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12127659 gtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 12127758  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12127759 caaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 12127792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 476
Target Start/End: Original strand, 29052551 - 29052732
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29052551 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29052650  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 476  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29052651 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 338 - 520
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585572
Alignment:
Q  338 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 437  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  438 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16585572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 24270378 - 24270609
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24270378 catgaaagttttagataattgtgttagctttcaaatggaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 24270477  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| |  ||||||    
T  24270478 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttc 24270576  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24270577 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24270609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 39292133 - 39292364
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  39292133 catgaaaattttagataattttgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 39292232  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  39292233 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 39292331  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39292332 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39292364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 554
Target Start/End: Original strand, 13864791 - 13865040
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  13864791 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggagg 13864890  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13864891 tcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttc 13864990  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 554  Q
    ||         |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13864991 aa---------ttaagagtatttaatccatgttatgagttgatc-ttgggataggaatgg 13865040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 371 - 527
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745828
Alignment:
Q  371 tatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct 470  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  471 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13745828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 18875242 - 18875474
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||      
T  18875242 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatg 18875341  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  ||| |   || ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  18875342 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagttt 18875441  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18875442 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 18875474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 295 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15720405 - 15720250
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  15720405 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggagg 15720306  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 450  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15720305 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 374 - 520
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460553
Alignment:
Q  374 gatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaa 473  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  474 aactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaac 16460553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 43277139 - 43277372
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  43277139 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 43277238  T
Q  395 tcttagtgaaatttt-ttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||| || ||  ||||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43277239 tcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 43277338  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
     || |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  43277339 taattaaggggtttaagagtatttaacatatgtt 43277372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 398 - 640
Target Start/End: Original strand, 13918266 - 13918497
Alignment:
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  13918266 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 13918365  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 597  Q
    |||||| |||||||||||       || |||||| ||  | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13918366 taaggtgtttaagagtat------aatattatgatttagtgttt-gggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 13918458  T
Q  598 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  13918459 tatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 13918497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 4691292 - 4691523
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  4691292 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 4691391  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||     
T  4691392 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagtta 4691490  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4691491 aattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 4691523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 14161251 - 14161482
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||     
T  14161251 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaagg 14161350  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14161351 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14161449  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14161450 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 48213341 - 48213572
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  48213341 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 48213440  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| | |   |||||| ||||||    
T  48213441 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttc 48213539  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48213540 aattaaggtgtttaagaatatttaacctatgtt 48213572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 15978452 - 15978682
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  15978452 catgaaagttttagataattgtgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 15978551  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||  || ||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15978552 tctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggtt- 15978650  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   |||||||| | |||||||||||    
T  15978651 aattaagaggtttaagagcacttaacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927223
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgtcggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 25927185  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25927186 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 25927223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 8514142 - 8514377
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |  | | ||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  8514142 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcgagttgctttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggagg 8514241  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  8514242 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttc 8514340  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8514341 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatga 8514377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 21538585 - 21538816
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  21538585 catgaaagttttagataattttgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 21538684  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||  || |  ||| |||| |||||||| |  ||||||  |||||    
T  21538685 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttc 21538783  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21538784 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21538816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25942093 - 25941862
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||     
T  25942093 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 25941994  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||| || || ||||| |||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  25941993 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 25941895  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25941894 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25941862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3287646 - 3287489
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  3287646 catgacagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 3287547  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3287546 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 3287489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 9177524 - 9177637
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||    
T  9177524 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttga----tagta 9177619  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9177620 atgtaatatatttgtata 9177637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 306 - 526
Target Start/End: Original strand, 3192700 - 3192920
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||| |||||| ||| || || | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  3192700 tagataattgtgttagttttgcagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaa 3192799  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 505  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |   |  ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||   |    
T  3192800 ttttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggt 3192899  T
Q  506 ttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3192900 ttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 13894651 - 13894519
Alignment:
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13894651 tcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 13894552  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13894551 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13894519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 308 - 527
Target Start/End: Original strand, 20252751 - 20252969
Alignment:
Q  308 gataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 407  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20252751 gataattgtattagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaatt 20252850  T
Q  408 ttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt 507  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| ||    |||||| |||||||| |||| | |||    
T  20252851 ttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgttt 20252949  T
Q  508 aagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20252950 aagagtatttaacctatgtt 20252969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 9743477 - 9743706
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  9743477 catgaaagttgtagataattgttttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggagg 9743576  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  9743577 tcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttc 9743675  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  9743676 aattaaggcgtttaagcgtatttaacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017439
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 17017421  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17017422 atgtaatatatttgtata 17017439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 1856796 - 1856915
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1856796 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1856895  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1856896 tcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 23664519 - 23664638
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  23664519 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23664618  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  23664619 tcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 306 - 452
Target Start/End: Original strand, 18080125 - 18080271
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||| |||||||||| || || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18080125 tagataattgtgttagctttacagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 18080224  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||  ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  18080225 tttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaactta 18080271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11310025 - 11309853
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||    || || ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |     
T  11310025 cgagcttaggaaaatcaacttttctggaatttcctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccattggct 11309926  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||    
T  11309925 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaataccccaagggaatcttagcgaaatt 11309853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 11303843 - 11303724
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  11303843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11303744  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  11303743 tcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 13917969 - 13918088
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13917969 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13918068  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  13918069 tcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29801025 - 29800906
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
T  29801025 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29800926  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29800925 tcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11091170 - 11091080
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  11091170 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaagtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 11091080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13897902 - 13897808
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13897902 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 13897808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 15576233 - 15576458
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  || | ||    
T  15576233 aaagttgtagataatt--gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggtttt 15576330  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |   ||||| |||||||| |    
T  15576331 agtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaatt 15576429  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  15576430 aaggtgtttaagggtatttaacttatgtt 15576458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 14045010 - 14044922
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14045010 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14044922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 14355040 - 14354952
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14355040 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14354952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 406 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719885
Alignment:
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 505  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||   |    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggt 28719906  T
Q  506 ttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28719905 ttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 16108255 - 16108374
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  16108255 catgaaagttgtagataattttgttacctttttaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16108354  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  16108355 tcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 25926696 - 25926815
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25926696 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25926795  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  25926796 tcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29797206 - 29797087
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
T  29797206 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29797107  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29797106 tcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091930
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgttg 16091930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 540 - 640
Target Start/End: Original strand, 1858707 - 1858803
Alignment:
Q  540 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 639  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  1858707 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtat 1858802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20487972 - 20487874
Alignment:
Q  422 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  20487972 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaac 20487874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 14036460 - 14036387
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 596  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036460 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14036387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 14346490 - 14346417
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 596  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14346490 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060375
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttgatag 17060375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 543 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 48991422 - 48991349
Alignment:
Q  543 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48991422 gggtaggaatagaggttgaatacaatattgatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 48991349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 44190645 - 44190729
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44190645 catgaaagttgtagataattgcgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 32126086 - 32125967
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  32126086 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 32125987  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  32125986 tcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41523512 - 41523394
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41523512 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41523413  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41523412 cttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41525974 - 41525856
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41525974 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41525875  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41525874 cttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 15376280 - 15376359
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15376280 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15376359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18431307 - 18431188
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||| ||  ||     
T  18431307 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtagg 18431208  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  18431207 tcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 20384690 - 20384769
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20384690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20384769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24702823 - 24702705
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24702823 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24702724  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24702723 cttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24705270 - 24705152
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24705270 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24705171  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24705170 cttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 46473714 - 46473562
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||| |||||||| ||||   ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  46473714 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatagttttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcggg 46473615  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 447  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  46473614 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27217456 - 27217377
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27217456 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27217377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 456917 - 456843
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  456917 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaattttggtttatgag 456843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 11392866 - 11392940
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11392866 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 11392940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 37539064 - 37538970
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  37539064 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaa 37538970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 640
Target Start/End: Original strand, 2529951 - 2530025
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||    
T  2529951 atataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtgatgtaatatatttgtata 2530025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Original strand, 15008357 - 15008446
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15008357 atgttatgagttgaaccttcgagtatgaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 15008446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 8563987 - 8564218
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||   |  || |||  |||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||   |     
T  8563987 catgaaagttttagataattgtgttagcttttcaatggttttcgtgtgatgtgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 8564086  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || | ||  |  ||| ||||  ||||| | |  |||||| || |||    
T  8564087 tcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttc 8564185  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8564186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8564218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 14105863 - 14105927
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||    
T  14105863 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgattttt 14105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 414
Target Start/End: Original strand, 14948693 - 14948808
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  || || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14948693 aaagttgtagataattttgttagccttccaatggctttagtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14948792  T
Q  399 agtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||| |||| ||||    
T  14948793 agtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16233116 - 16233042
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16233116 catggaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 16233042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13869941 - 13869864
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  13869941 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtg--gtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 13869864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 39431624 - 39431707
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39431624 catgaaagttgtagataattgtgttaacttttcagtgactttggcttgacttggaaatgatttttgg-ttttgagatatgatgaa 39431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16410650 - 16410575
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16410650 aaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 16410575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Original strand, 26355549 - 26355627
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26355549 atgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26355627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Original strand, 26358001 - 26358079
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26358001 atgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26358079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Original strand, 9725518 - 9725607
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  9725518 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttg 9725607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 10001004 - 10001068
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  10001004 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 10001068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 471 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720200
Alignment:
Q  471 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 15720200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 3136869 - 3136715
Alignment:
Q  376 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 475  Q
    ||||||||||||||  || |||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||    
T  3136869 tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaa 3136770  T
Q  476 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || | ||||||| ||||| || || | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3136769 cttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgtttaacctatgatatga 3136715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20488036 - 20487973
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  20488036 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgccggtttgactttaaaatgatttt 20487973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 461
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 461  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996370
Alignment:
Q  529 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 628  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||    | ||||||||| |    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgtga 16996382  T
Q  629 tatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||    
T  16996381 tatatttgtata 16996370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 612
Target Start/End: Original strand, 1867874 - 1867942
Alignment:
Q  543 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  1867874 gggtaggaatggaggttatatatgatattaatgatgatctgtgaagct-ttttaagatgatttgatgttg 1867942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 48273636 - 48273550
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 614  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  48273636 atgagttggtctttggggtaggaatggtagctgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 48273550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 567 - 612
Target Start/End: Original strand, 2280021 - 2280066
Alignment:
Q  567 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2280021 atatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 2280066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16066103 - 16065970
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||| |||| || | | | |||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||  ||     
T  16066103 catgaaagtattagataaagttgttagatttctaacggctttggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtagg 16066004  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataact 428  Q
    |||| ||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  16066003 tcttggtgcaattttacaaaaattcagcataact 16065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675536
Alignment:
Q  482 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21675536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12191981 - 12191849
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |||||||  ||     
T  12191981 catgaaagttttagataattctgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtagg 12191882  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 427  Q
    |||| |   ||||||  ||||||||||||||||    
T  12191881 tcttggaagaattttacgaaaattcagcataac 12191849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21660659 - 21660587
Alignment:
Q  309 ataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 381  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21660659 ataattatgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 21660587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28720105 - 28720041
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||| ||||||||||||    
T  28720105 catgaaagttttagataattttattagctttccaattggtttggtttgacttaaaaatgattttt 28720041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Original strand, 16379749 - 16379820
Alignment:
Q  239 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 310  Q
    ||||||||||| || |||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379749 cataggaaaatgaatttttctgccactttatgttttgaattagatttgggagtcttcatgaaagtcgtagat 16379820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18628161 - 18628098
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 358  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | || |||| || |||||||||||||    
T  18628161 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggcgtccgttttacctgaaaatgatttt 18628098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18640867 - 18640804
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 358  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||| || | |||||||||||    
T  18640867 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggcgtcggttttacctaaaaatgatttt 18640804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 530 - 604
Target Start/End: Original strand, 12255657 - 12255731
Alignment:
Q  530 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 604  Q
    |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12255657 gagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataatatattaatgatgatctatgaagttgttataagatgatt 12255731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 15760758 - 15760848
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  15760758 catgaaagttataaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 515
Target Start/End: Original strand, 1858644 - 1858689
Alignment:
Q  470 tcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 515  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  1858644 tcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 560
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033241
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttg 9033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19194807 - 19194774
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttcca 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19194807 catgaaagttttagataattttgttagctttcca 19194774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 126055 - 125991
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||| ||||    
T  126055 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagtttt 125991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 2078372 - 2078460
Alignment:
Q  55 agattgtttccaagaaagaagcatcctccagaggtgc-atttctatcatcagcgcttccttcccagccagcatcacaattaccaatcaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||| || || ||| ||||  | |||||||||| |||||||||    
T  2078372 agattgtttccaagaaagaaacatcctcctgatgtgctttttctgtcatctgcactacctgcccaatctgcatcacaataaccaatcaa 2078460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7822103 - 7822067
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7822103 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 7822067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7829414 - 7829378
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7829414 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 7829378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11287066 - 11287002
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| |||  |||||||||||    
T  11287066 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgattttt 11287002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16383208 - 16383172
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16383208 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatg 16383172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 27102531 - 27102567
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27102531 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27102567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 27109879 - 27109915
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27109879 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27109915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27175795 - 27175759
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27175795 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27175759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 38784623 - 38784659
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38784623 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 38784659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 235 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11413 - 11100
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |     
T  11413 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctattctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggct 11314  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11313 ttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttct 11214  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11213 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 11114  T
Q  535 gatctttggggtag 548  Q
    | || |||||||||    
T  11113 ggtccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 124)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 235 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 27851719 - 27851394
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  27851719 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttttgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggat 27851620  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  27851619 ttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttct 27851520  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27851519 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtc 27851420  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  27851419 gaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 235 - 560
Target Start/End: Original strand, 20733783 - 20734107
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  20733783 cgagcattggaaaatcaatttttctggaattttctattctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggct 20733882  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  20733883 ttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa-tctatgaaaattcagcataactgtttct 20733981  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20733982 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtc 20734081  T
Q  535 gatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || | |||||||||||||| ||||||    
T  20734082 gacccttggggtaggaatgaaggttg 20734107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 295 - 612
Target Start/End: Original strand, 15817154 - 15817469
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  15817154 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaagg 15817253  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  15817254 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtc 15817353  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15817354 aattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-ta 15817451  T
Q  595 taatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  15817452 taatatgatttgatgttg 15817469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 25619353 - 25619694
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  25619353 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 25619452  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  25619453 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttc 25619552  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||    
T  25619553 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgatgttgtta 25619652  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25619653 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 25619694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 14979018 - 14979359
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  14979018 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 14979117  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14979118 tcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 14979217  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  14979218 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactgaggatctgtgaagctgtta 14979317  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  14979318 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 14979359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 20556489 - 20556830
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  20556489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 20556588  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  20556589 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagtta 20556688  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  20556689 aattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatatgagaagctatta 20556788  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  20556789 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 20556830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 28948000 - 28947768
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28948000 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28947901  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28947900 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 28947801  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28947800 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 28947768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 18658862 - 18658598
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||     
T  18658862 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggagg 18658763  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18658762 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18658663  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18658662 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 18658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23956518 - 23956265
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23956518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23956419  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23956418 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 23956319  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  23956318 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 23956265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Original strand, 15173851 - 15174130
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15173851 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 15173950  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15173951 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15174050  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15174051 aattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 15174130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 281 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18928393 - 18928149
Alignment:
Q  281 ggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaa 380  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18928393 ggtttgggtgtatacatgaaagttgtagagaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaa 18928294  T
Q  381 atactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 480  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18928293 atactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactaga 18928194  T
Q  481 agtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18928193 agtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattttacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 5834131 - 5834366
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  5834131 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 5834230  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5834231 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttc 5834329  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5834330 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 5834366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 611396 - 611139
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  611396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 611297  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  611296 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttc 611197  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  611196 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 19825885 - 19826142
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19825885 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19825984  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19825985 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19826084  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19826085 aattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 7827628 - 7827396
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  7827628 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 7827529  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7827528 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 7827429  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7827428 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7827396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 19655625 - 19655857
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19655625 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19655724  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19655725 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19655824  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19655825 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19655857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 20177401 - 20177166
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  20177401 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 20177302  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20177301 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttc 20177203  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20177202 aattaaggtgtctaagagtatttaacctatgttatga 20177166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 23491567 - 23491799
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     
T  23491567 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23491666  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23491667 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23491766  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23491767 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23491799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 23497165 - 23497397
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     
T  23497165 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23497264  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23497265 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23497364  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23497365 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23497397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18709151 - 18708923
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  18709151 aaagttgtagatcattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18709052  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18709051 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 18708952  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18708951 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18708923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 22158590 - 22158825
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22158590 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22158689  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22158690 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttc 22158788  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22158789 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 22158825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13765002 - 13764730
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||       || ||||||||||||||||||| |||     
T  13765002 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttg-------agttatgatgaaaatactccaaggagg 13764910  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13764909 tcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 13764810  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||| || ||||  |||||||||||||    
T  13764809 aattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaat-gaagttgtttataatattaatg 13764730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 17318518 - 17318750
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17318518 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 17318617  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17318618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17318717  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17318718 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17318750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18703216 - 18702988
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  18703216 aaagttgtagattattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18703117  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18703116 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 18703017  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18703016 agggtttttaagagtatttaacctatgtt 18702988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 23150663 - 23150894
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  23150663 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtagg 23150762  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23150763 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 23150862  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23150863 aact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23150894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 25601673 - 25601904
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  25601673 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggagg 25601772  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  25601773 ttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagttt 25601872  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25601873 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 25601904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1254413 - 1254215
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  1254413 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 1254314  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1254313 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 29847899 - 29848146
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  29847899 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 29847998  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaa--ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagt 492  Q
    ||||| |||||| || ||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29847999 tcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagt 29848098  T
Q  493 tcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  29848099 tcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 29848146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 514
Target Start/End: Original strand, 15891107 - 15891326
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15891107 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 15891206  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||    
T  15891207 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttc 15891306  T
Q  495 aactaaggtatttaagagta 514  Q
    || || ||| ||||||||||    
T  15891307 aattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Original strand, 8767659 - 8767885
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||     
T  8767659 catgaaagttgtagatacttttgttagctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggagg 8767758  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8767759 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 8767858  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  8767859 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 25347782 - 25347556
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25347782 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25347683  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||    
T  25347682 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttc 25347583  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  25347582 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 19773105 - 19773330
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  19773105 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 19773204  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19773205 tcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19773304  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  19773305 aattaaggggtttaagagtatttaac 19773330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 15705007 - 15705232
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||     
T  15705007 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtagg 15705106  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15705107 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 15705206  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  15705207 aattaaggggtttaagagtatttaac 15705232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 31734362 - 31734132
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31734362 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31734263  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31734262 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtact--gagttc 31734165  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31734164 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 31734132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 20183219 - 20182984
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20183219 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 20183120  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||     
T  20183119 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagttt 20183021  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20183020 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 20182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 22152772 - 22153007
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22152772 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 22152871  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||     
T  22152872 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagttt 22152970  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22152971 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 22153007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 4477314 - 4477043
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||     
T  4477314 catgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtagg 4477215  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  4477214 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 4477115  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4477114 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 4477043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23655995 - 23655804
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23655995 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23655896  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtact 486  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23655895 tcttagtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 27125872 - 27126105
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||    
T  27125872 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaag 27125971  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27125972 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 27126071  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27126072 caactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 27126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 538
Target Start/End: Original strand, 16133066 - 16133309
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16133066 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16133165  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||| |  |  ||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| ||||||    
T  16133166 tcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 16133265  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 538  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16133266 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 16133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 538
Target Start/End: Original strand, 19443681 - 19443919
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||    
T  19443681 aaagttgtagaaaattt-gttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtctt 19443779  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| || ||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||| |    
T  19443780 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaatt 19443879  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 538  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19443880 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 19443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Original strand, 8759913 - 8760138
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  8759913 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctgtggattgacatgaaaataatttt-ggtttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 8760011  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8760012 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttc 8760111  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  8760112 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 940 - 755
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  940 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 841  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 484  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  840 agtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 265 - 523
Target Start/End: Original strand, 27317919 - 27318179
Alignment:
Q  265 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt--ccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggt 362  Q
    |||||||| ||||||||  || |||||   ||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||| || | | | |||||| |||||| ||||||||||    
T  27317919 tttctgttttgaattagcctttggagtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctatatccagtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggt 27318018  T
Q  363 ttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt 462  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  27318019 tcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataatt 27318118  T
Q  463 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  27318119 caaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaaccta 27318179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 34296664 - 34296923
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgtt-agctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| | | | || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34296664 catgaaagttgtagatatttttttttagcttcccaaaggctttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggag 34296763  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  34296764 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtt 34296863  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
     || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  34296864 taattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 34296923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 295 - 469
Target Start/End: Original strand, 31022093 - 31022267
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31022093 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaga 31022192  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacc 469  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31022193 tcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 18455468 - 18455699
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  18455468 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 18455567  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| ||||||    
T  18455568 ttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttc 18455666  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18455667 aattaaggtctttaagagtatttaacctatgtt 18455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 25921385 - 25921154
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25921385 catgaaagttttagataattgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25921286  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| ||||||    
T  25921285 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttc 25921187  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25921154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 295 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25807788 - 25807602
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  25807788 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 25807689  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaa 481  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  25807688 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 299 - 531
Target Start/End: Original strand, 20411072 - 20411303
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20411072 aaagttgtagacaattgtgttagcattccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatctt 20411171  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || |||||||| |    
T  20411172 agtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaatt 20411270  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20411271 aagttgtttaagagtatttaacctatgttatga 20411303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752865
Alignment:
Q  475 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 574  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattact 25752927  T
Q  575 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25752926 gatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 25752865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755035
Alignment:
Q  475 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 574  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattact 25755097  T
Q  575 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25755096 gatgatctttgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 25755035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32259502 - 32259272
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  32259502 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 32259403  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| || || || |  |||||| ||||||    
T  32259402 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aagcttg-tgtactatgagttc 32259305  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32259304 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 32259272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 398 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27557022 - 27556791
Alignment:
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  27557022 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgagttcaat 27556923  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 597  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27556922 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 27556830  T
Q  598 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  27556829 tatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 27556791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 299 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 29044962 - 29044809
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29044962 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatctt 29044863  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29044862 agtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 29044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 400 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415033
Alignment:
Q  400 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 499  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  500 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataata 599  Q
    |||| ||||||| |||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23415162 aggtgtttaagaatata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataata 23415070  T
Q  600 tgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  23415069 tgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 23415033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443194
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 33443212  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33443211 atgtaatatatttgtata 33443194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 7430179 - 7430069
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7430179 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 7430080  T
Q  395 tcttagtgaaa 405  Q
    ||||| |||||    
T  7430079 tcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 34141023 - 34141178
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  34141023 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34141120  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34141121 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 34153639 - 34153794
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  34153639 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34153736  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34153737 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18585274 - 18585117
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18585274 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18585175  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  18585174 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 18585117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 22556905 - 22556676
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||     
T  22556905 catgaaacttgtagataattgtgtttgatttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaagg 22556806  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22556805 tcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagttt 22556706  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22556705 cattaaggggtttaagagtatttaacctat 22556676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 298 - 526
Target Start/End: Original strand, 17857091 - 17857319
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  17857091 gaaagttttagataattgtgttagatttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtct 17857190  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    | |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||||| || ||     
T  17857191 tggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaat 17857290  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17857291 taagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18398574 - 18398343
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||     
T  18398574 catgaaagttttagataattgtgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggagg 18398475  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| |||||||| |  || ||| ||| ||    
T  18398474 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctc 18398376  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18398375 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 18398343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23838655 - 23838447
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |      
T  23838655 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatg 23838556  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  23838555 tcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgc 23838456  T
Q  495 aactaaggt 503  Q
    || ||||||    
T  23838455 aattaaggt 23838447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 13285364 - 13285136
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||     
T  13285364 catgaaaattttagataattatgttagctttctagtggctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggagg 13285265  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  13285264 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 13285166  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13285165 atttaaggtgtttaagagtatttaacctat 13285136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12942785 - 12942666
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12942785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12942686  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  12942685 tcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696660
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgttg 18696660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 28288903 - 28289022
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  28288903 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28289002  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  28289003 tcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 405
Target Start/End: Original strand, 14594021 - 14594131
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14594021 catgaaagttgtagataattttgttagctttccgatggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14594120  T
Q  395 tcttagtgaaa 405  Q
    ||||| |||||    
T  14594121 tcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224095
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 20224110  T
Q  623 atgtaatatatttgt 637  Q
    |||||||||||||||    
T  20224109 atgtaatatatttgt 20224095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118079
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 22118094  T
Q  623 atgtaatatatttgt 637  Q
    |||||||||||||||    
T  22118093 atgtaatatatttgt 22118079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22806405 - 22806276
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22806405 catgaaatttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22806306  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcat 424  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22806305 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23415560 - 23415441
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23415560 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23415461  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  23415460 tcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 415
Target Start/End: Original strand, 27330368 - 27330488
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27330368 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27330467  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaa 415  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27330468 tcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 415
Target Start/End: Original strand, 27391108 - 27391228
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27391108 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27391207  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaa 415  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27391208 tcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18706568 - 18706478
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggg-gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18706568 atgttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttg 18706478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 414
Target Start/End: Original strand, 19858493 - 19858608
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19858493 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatctt 19858592  T
Q  399 agtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||| |||| ||||    
T  19858593 agtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 15938622 - 15938857
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || | ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||     
T  15938622 catgaaagttatagatgaattttttggttttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtagg 15938721  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||  |||||| | | |||  |||||||||    
T  15938722 tcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttc 15938820  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15938821 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 15938857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27557318 - 27557199
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  27557318 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatg 27557219  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  27557218 tcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 23221521 - 23221288
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    |     
T  23221521 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatttttttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtggg 23221422  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  23221421 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcctaagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 23221323  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttat 529  Q
    || |||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  23221322 aattaagatgtttaagagtattaaacctaggttat 23221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 33862388 - 33862270
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  33862388 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 33862289  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  33862288 cttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 1540478 - 1540597
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||     
T  1540478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggagg 1540577  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1540578 tcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 414
Target Start/End: Original strand, 15891979 - 15892094
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||    | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15891979 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgttttgtgttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 15892078  T
Q  399 agtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15892079 agtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 18334159 - 18334238
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18334159 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18334238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24423142 - 24423063
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24423142 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 24423063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35057160 - 35057066
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35057160 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaa 35057066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33864873 - 33864794
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33864873 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 33864794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 2290747 - 2290821
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2290747 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 2290821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8055625 - 8055551
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8055625 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 8055551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 17883065 - 17883183
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||| | | ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  17883065 atgaaagttgtagataatttctttagctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 17883164  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  17883165 cttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Original strand, 26924015 - 26924093
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26924015 atgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22782822 - 22782743
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22782822 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccactggcgtcagtttgacttgaaaatgatatttggtttatgagttatg 22782743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12742908 - 12742794
Alignment:
Q  300 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||   | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12742908 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctta 12742809  T
Q  400 gtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||| |||| ||||    
T  12742808 gtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19234741 - 19234658
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 378  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||||| ||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19234741 catgatagttttagacaattgtgttagattttcattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25175198 - 25175112
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||    
T  25175198 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatgattaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 27654616 - 27654706
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  27654616 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16135591 - 16135519
Alignment:
Q  454 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16135591 ggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 528 - 612
Target Start/End: Original strand, 16448435 - 16448519
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16448435 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgatggtctatgaagttgttataacatgattcaatgttg 16448519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16135699 - 16135613
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaat 382  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  16135699 catgaaagttttagttaattttgttagctttccaatggctttggtttaactt-aaaatgatttttatattttgagatatgatgtaaat 16135613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 569
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078079
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 20078079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 31163622 - 31163536
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 381  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  31163622 catgaaggttttagataattatgttatatttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 31163536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453355
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttg 18453355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 525
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523594
Alignment:
Q  318 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 417  Q
    ||||||||| |||| | | | |||| ||| || ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||  ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  418 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg-tatttaagagtatt 516  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| ||  |  |   ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22523488 tcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttg-agtactaggagtttaa-taaggatgtttaagagtatt 22523585  T
Q  517 taacctatg 525  Q
    |||||||||    
T  22523586 taacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Original strand, 3007508 - 3007594
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 381  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  3007508 catgaaggttttagataattaggttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 3007594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 16826387 - 16826477
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  16826387 catgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 21776115 - 21776205
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||   |||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  21776115 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 452
Target Start/End: Original strand, 31161878 - 31162012
Alignment:
Q  318 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 417  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||  || |||| | ||||||||  | ||||    
T  31161878 ttagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaat 31161977  T
Q  418 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    | ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||    
T  31161978 ttagcatgactatttccaagtcaacccaaaactta 31162012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 563 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 19362646 - 19362598
Alignment:
Q  563 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19362646 tataatattactgatgatctgtgaaactgttataa-atgatttaatgttg 19362598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 32277441 - 32277541
Alignment:
Q  338 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 437  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||||||||||    
T  32277441 gtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaag 32277540  T
Q  438 t 438  Q
    |    
T  32277541 t 32277541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1555617 - 1555527
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  1555617 catgaaagttttaaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18456938 - 18456888
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||    
T  18456938 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg 18456888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 25644545 - 25644495
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  25644545 atatgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttg 25644495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 612
Target Start/End: Original strand, 8227409 - 8227458
Alignment:
Q  563 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||    
T  8227409 tataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg 8227458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 566
Target Start/End: Original strand, 17229776 - 17229817
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17229776 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 17229817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 612
Target Start/End: Original strand, 18896215 - 18896263
Alignment:
Q  563 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  18896215 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataa-aagatttaatgttg 18896263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19609670 - 19609621
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||    
T  19609670 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgac 19609621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10488061 - 10488025
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10488061 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 10488025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16240386 - 16240322
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  16240386 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 16240322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 16377267 - 16377303
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377267 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 16377303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 16384591 - 16384627
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16384591 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 16384627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 22226588 - 22226652
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  22226588 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 22226652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25904565 - 25904501
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  25904565 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 25904501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 33315095 - 33315131
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33315095 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 33315131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 308
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  649 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 550  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  549 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 450  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  449 aattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgtta 350  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  349 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 106)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 6766317 - 6765977
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  6766317 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 6766218  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6766217 tcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 6766118  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6766117 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtgaagctgtta 6766018  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    | |||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  6766017 t-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtata 6765977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 295 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22412662 - 22412365
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22412662 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22412563  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22412562 tcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22412463  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22412462 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 22412365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 295 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 29448494 - 29448174
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  29448494 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggagg 29448395  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29448394 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttc 29448295  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29448294 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtgaagttgtta 29448195  T
Q  595 taatatgatttaatgttgata 615  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  29448194 taatatgatttgatgttgata 29448174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 299 - 640
Target Start/End: Original strand, 30138564 - 30138900
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  30138564 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtttt 30138663  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30138664 agtgaaccttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 30138762  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30138763 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 30138862  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  30138863 atgatttaatgtt----cgtagtaatgtaatatatttgtata 30138900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 295 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18419068 - 18418770
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18419068 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18418969  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18418968 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18418869  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18418868 aattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataacctgtgaagctgtt 18418770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 24277002 - 24277266
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24277002 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24277101  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24277102 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24277201  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24277202 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24277266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 24385211 - 24384947
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24385211 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24385112  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24385111 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24385012  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24385011 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17813048 - 17812795
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17813048 aaagttgtagataatttttttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 17812949  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  17812948 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaatt 17812849  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17812848 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 17812795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 263513 - 263260
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  263513 catgaaagttatagataattgtgttagctttccgatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggagg 263414  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  263413 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 263314  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  263313 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 299 - 548
Target Start/End: Original strand, 33472964 - 33473213
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33472964 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 33473063  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  33473064 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaatt 33473163  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  33473164 aaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 33473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 32607721 - 32607953
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  32607721 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32607820  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32607821 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 32607920  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32607921 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32607953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36460626 - 36460368
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36460626 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36460527  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36460526 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 36460427  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  36460426 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 36460368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Original strand, 21399400 - 21399628
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  21399400 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 21399498  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21399499 ttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21399598  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21399599 aattaaggtgtttaagagtatttaacctat 21399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17011382 - 17011102
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  17011382 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggagg 17011283  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17011282 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttc 17011183  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  17011182 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 17011102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 41875989 - 41876221
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  41875989 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 41876088  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  41876089 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagtta 41876188  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41876189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 41876221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26762057 - 26761827
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  26762057 catgaaagttgtagataaatgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 26761958  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26761957 tcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 26761858  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26761857 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 17875655 - 17875410
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  17875655 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 17875556  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17875555 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 17875456  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  17875455 aattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttgatctt 17875410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 20197982 - 20198216
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg--agatatgatgaaaatactccaatga 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  20197982 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaagga 20198081  T
Q  393 gatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagt 492  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20198082 ggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagt 20198181  T
Q  493 tcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | || |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20198182 ttaattaaggggtataagagtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 20566210 - 20565978
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20566210 catgaaagttgtagataattgagttaaattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20566111  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20566110 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttc 20566011  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20566010 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20565978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 38145134 - 38145405
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  38145134 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38145233  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  38145234 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgc 38145333  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38145334 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 38145405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19921289 - 19921058
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19921289 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtggttt-ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaa 19921191  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921190 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19921091  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921090 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 19921058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 27868971 - 27869203
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27868971 catgaaagttgtagataattctgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27869070  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  27869071 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 27869170  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27869171 aattaaggtgtttgagagtatttaacctatgtt 27869203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 8833603 - 8833824
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8833603 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggagg 8833694  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8833695 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 8833794  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
     | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  8833795 -attaagttgtttaagagtatttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31456454 - 31456196
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31456454 catgaaagttgtagataattgagttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31456355  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  31456354 tcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttt 31456255  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||    
T  31456254 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 21557440 - 21557699
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  21557440 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatg 21557539  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21557540 tcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttc 21557639  T
Q  495 aactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  21557640 aattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 21557699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 28370652 - 28370923
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  28370652 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 28370751  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  28370752 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 28370851  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28370852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 28370923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 22750597 - 22750372
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |      
T  22750597 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcatg---ttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 22750501  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  22750500 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 22750401  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22750400 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 19511843 - 19511614
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  19511843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 19511744  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | || || ||    
T  19511743 tcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaatt 19511644  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19511643 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 317 - 525
Target Start/End: Original strand, 33895300 - 33895508
Alignment:
Q  317 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 416  Q
    |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  33895300 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaa 33895399  T
Q  417 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 516  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  33895400 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T
Q  517 taacctatg 525  Q
    |||||||||    
T  33895500 taacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 42961033 - 42960761
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  42961033 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 42960934  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  42960933 tcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 42960834  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat-ctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42960833 aattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattata 42960761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 37598513 - 37598784
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  37598513 catgaaagttgtaaataattttgttagatttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 37598612  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||  ||||||||||||| || || |||| |    
T  37598613 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgc 37598712  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37598713 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 37598784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Original strand, 22758286 - 22758583
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg-agatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |  |||    
T  22758286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggag 22758385  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  22758386 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagtt 22758485  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22758486 caattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtataagatattaaggatgatatgtgaagctg 22758583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 295 - 450
Target Start/End: Original strand, 40917369 - 40917524
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  40917369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggagg 40917468  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40917469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 295 - 533
Target Start/End: Original strand, 21554775 - 21555013
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  21554775 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtagg 21554873  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21554874 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttc 21554973  T
Q  495 aactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagt 533  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21554974 aattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16063141 - 16062910
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16063141 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16063042  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  16063041 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 16062943  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16062942 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16062910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 36509181 - 36509405
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||| |||| |||||| || ||||||||||||| || | | |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  36509181 atgagagttttagatatttatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaa--------ggtttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggt 36509272  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36509273 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 36509372  T
Q  496 actaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  36509373 attaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 36509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 22336976 - 22336748
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22336976 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 22336877  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||      
T  22336876 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22336777  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22336776 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Original strand, 8504266 - 8504496
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  8504266 atgaaagttgtagataattatgttagctttcctgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 8504365  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   |  |||| ||||| || |  |||||| || ||||    
T  8504366 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattca 8504464  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8504465 attaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 16605000 - 16605231
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16605000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16605099  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  16605100 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 16605198  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16605199 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 16605231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 22340514 - 22340286
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22340514 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtagg 22340415  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||      
T  22340414 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22340315  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22340314 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18744305 - 18744074
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18744305 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18744206  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| ||||||    
T  18744205 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 18744107  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18744106 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 14026204 - 14026435
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14026204 catgaaagttttagataattatgttatatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14026303  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||     
T  14026304 tcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttg 14026402  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14026403 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14026435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 24617319 - 24617446
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24617319 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24617418  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 422  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24617419 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 24713550 - 24713677
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24713550 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24713649  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 422  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24713650 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 24746578 - 24746705
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24746578 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24746677  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 422  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24746678 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 405
Target Start/End: Original strand, 43243054 - 43243164
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43243054 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 43243153  T
Q  395 tcttagtgaaa 405  Q
    ||||| |||||    
T  43243154 tcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 23199788 - 23199942
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23199788 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggagg 23199884  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  23199885 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 23199942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 1627777 - 1628008
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | || | | |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  1627777 catgaaagttttagataattgtgttatctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggagg 1627876  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  1627877 tcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 1627975  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1627976 aattaacgtgtttaagagtatttaacctatgtt 1628008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 37804469 - 37804588
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  37804469 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37804568  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  37804569 tcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 24668593 - 24668720
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24668593 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24668692  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 422  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24668693 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 24738362 - 24738489
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24738362 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24738461  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 422  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24738462 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 24751131 - 24751258
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24751131 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24751230  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 422  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24751231 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28901576 - 28901346
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  28901576 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28901477  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28901476 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28901378  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  28901377 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28937971 - 28937741
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  28937971 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28937872  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28937871 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28937773  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  28937772 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 365 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111024
Alignment:
Q  365 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||     
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  465 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||| ||||| || |  |||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22111024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17909123 - 17908966
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  17909123 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 17909024  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  17909023 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtctctaagtcaacccaaacctta 17908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 454 - 553
Target Start/End: Original strand, 12122077 - 12122175
Alignment:
Q  454 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12122077 ggaataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12122175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29351521 - 29351402
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29351521 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29351422  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29351421 tcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 10732508 - 10732626
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  10732508 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggt 10732607  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  10732608 cttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20909637 - 20909528
Alignment:
Q  265 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 364  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909637 tttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 20909538  T
Q  365 ttgagatatg 374  Q
     |||| ||||    
T  20909537 atgagttatg 20909528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 264335 - 264414
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  264335 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 264414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23065109 - 23065030
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23065109 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23065030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 525 - 616
Target Start/End: Original strand, 25576716 - 25576807
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25576716 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatag 25576807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29346575 - 29346456
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29346575 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29346476  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29346475 tcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29349048 - 29348929
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29349048 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29348949  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29348948 tcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 42244933 - 42245051
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  42244933 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 42245032  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  42245033 cttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740598
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgatag 26740598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 529 - 616
Target Start/End: Original strand, 26732698 - 26732785
Alignment:
Q  529 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  26732698 tgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgatag 26732785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39245731 - 39245652
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  39245731 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaattattttcggtttatgagttatg 39245652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469975
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttg 23469975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38620061 - 38619952
Alignment:
Q  265 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 364  Q
    |||||||| ||||||||  || || || | |||||||||||||||||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38620061 tttctgttttgaattagcctttggtgtatacatgaaagttgtagataattgtgttagattttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggttt 38619962  T
Q  365 ttgagatatg 374  Q
     |||| ||||    
T  38619961 atgagttatg 38619952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 528 - 612
Target Start/End: Original strand, 18318942 - 18319026
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18318942 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgacgacctgtgaagctgttataacatgattcaatgttg 18319026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 525 - 616
Target Start/End: Original strand, 25574330 - 25574421
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25574330 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag 25574421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 525 - 616
Target Start/End: Original strand, 25575523 - 25575614
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25575523 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag 25575614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 31479026 - 31478801
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||  |||||| | ||||||  ||||||||||||||| || | ||     
T  31479026 catgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactacagt-agg 31478928  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||| ||  |||||  || ||  |  ||| ||| ||||||||| | |||||||||||||     
T  31478927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaactcaaaacttg-agtactaggagttt 31478829  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacct 522  Q
    || || | | ||||||||||||||||||    
T  31478828 aattatgatgtttaagagtatttaacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11993 - 11903
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  11993 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25426267 - 25426177
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  25426267 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 30614069 - 30613937
Alignment:
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   |  |||  ||||| || |  |||||| |||||    
T  30614069 atcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttg-tgtactatgagtt 30613971  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30613970 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30613937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572086
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtga 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| |||||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtga 20572086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39363979 - 39363900
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  39363979 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 39363900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13938503 - 13938457
Alignment:
Q  265 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13938503 tttctgttccgaattaggtttgggcgtcttcatgaaagttgtagata 13938457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 35791744 - 35791834
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  35791744 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 385
Target Start/End: Original strand, 21074229 - 21074318
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  21074229 atgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 26749583 - 26749534
Alignment:
Q  482 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26749583 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 26749534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 30612109 - 30611977
Alignment:
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||||| |  |||||| |||||    
T  30612109 atcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagtt 30612011  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30612010 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30611977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 22367114 - 22367178
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  22367114 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 22367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 304
Target Start/End: Original strand, 25582095 - 25582130
Alignment:
Q  269 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25582095 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 25582130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7424967 - 7424886
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  7424967 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 7424886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 20765993 - 20766058
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20765993 atgagttggtctttggggttggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 20766058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 27183188 - 27183252
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  27183188 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 27183252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 43444028 - 43444092
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  43444028 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 43444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7528518 - 7528427
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 386  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7528518 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactc 7528427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19499518 - 19499487
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499518 catgaaagttgtagataattttgttagctttc 19499487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22249244 - 22249157
Alignment:
Q  55 agattgtttccaagaaagaagcatcctccagaggtgcattt-ctatcatcagcgcttccttcccagccagcatcacaattaccaatca 141  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22249244 agattatttcctagaaagaaacatcctccaaaggtactttttctgtcatcagcacttcctgcccagtcagcatcacaataacccatca 22249157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9776761 - 9776699
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattt 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||| |||| |||||    
T  9776761 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggattt 9776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11342280 - 11342190
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  11342280 catgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Original strand, 18778625 - 18778715
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  18778625 catgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 184
Target Start/End: Original strand, 26039494 - 26039624
Alignment:
Q  55 agattgtttccaagaaagaagcatcctccagaggtgcatttc-tatcatcagcgcttccttcccagccagcatcacaattaccaatcaacattgagtttt 153  Q
    ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||| | |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  || |||| |   |||||||    
T  26039494 agattatttcctaggaaggaacatccaccagaggtacgtttcctatcatctgcacttcctgcccagccagcatcacaatagcccatcagctcagagtttt 26039593  T
Q  154 cattgtgagaatacagaattccataatcact 184  Q
    || |||| || || | |||||||||||||||    
T  26039594 cactgtgtgagtataaaattccataatcact 26039624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 1168811 - 1168875
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| |||  |||||||||||    
T  1168811 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttt 1168875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 1220363 - 1220427
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  1220363 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 1220427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 21933262 - 21933298
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21933262 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 21933298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 21939432 - 21939468
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21939432 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 21939468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23506593 - 23506529
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  23506593 catgaaagttttagataattatgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 23506529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23908735 - 23908687
Alignment:
Q  263 attttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 311  Q
    ||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23908735 attttctattcctaattaggttttggtgtcttcatgaaagttgtagata 23908687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35581430 - 35581394
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35581430 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 35581394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 36990658 - 36990694
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36990658 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 36990694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 235 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4813 - 4568
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4813 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 4714  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 434  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4713 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 4614  T
Q  435 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4613 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 235 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11833 - 11679
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11833 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 11734  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11733 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 332
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||     
T  672 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggagg 573  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  572 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 473  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  472 aattaaggt-gttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctttta 374  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  373 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 22130461 - 22130802
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22130461 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22130560  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22130561 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 22130660  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22130661 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactgatgatctgtgaagctacta 22130760  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  22130761 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 22130802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 13881012 - 13881353
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||   | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||     
T  13881012 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggagg 13881111  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13881112 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttc 13881211  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13881212 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgaagctgtta 13881311  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  13881312 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 13881353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Original strand, 45574448 - 45574778
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45574448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45574547  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||           |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45574548 tcttggtgaaat-----------tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttc 45574636  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  45574637 aattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 45574736  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  45574737 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 45574778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 21180721 - 21180985
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21180721 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21180820  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||    
T  21180821 tcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttc 21180920  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21180921 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatggaagttg 21180985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 24815248 - 24815512
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24815248 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24815347  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24815348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24815447  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24815448 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Original strand, 44822518 - 44822763
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44822518 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44822617  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44822618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttc 44822717  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44822718 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 44822763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 21239691 - 21239923
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21239691 catgaaagttttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21239790  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21239791 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21239890  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21239891 aattaaggtgtttaagaatttttaacctatgtt 21239923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 50001130 - 50000883
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50001130 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50001031  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50001030 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 50000931  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcttt 541  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50000930 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcttt 50000883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 7052451 - 7052684
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7052451 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7052550  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7052551 tattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7052650  T
Q  495 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7052651 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 7052684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 552
Target Start/End: Original strand, 20031286 - 20031543
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  20031286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggagg 20031385  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20031386 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 20031485  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 552  Q
    || |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20031486 aattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaat 20031543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 46198121 - 46198374
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  46198121 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 46198220  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46198221 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46198320  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  46198321 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtccttggggtag 46198374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 20588335 - 20588103
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20588335 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20588236  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20588235 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20588136  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20588135 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20588103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 20592873 - 20592641
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20592873 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20592774  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20592773 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20592674  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20592673 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20592641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 8276388 - 8276652
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8276388 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 8276487  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  8276488 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttc 8276587  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8276588 aattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8276652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 303 - 527
Target Start/End: Original strand, 14238016 - 14238240
Alignment:
Q  303 ttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtg 402  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14238016 ttgtagataattgtgttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 14238115  T
Q  403 aaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg 502  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14238116 aaattttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaagg 14238215  T
Q  503 tatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  14238216 tgtttaagagtatctaacctatgtt 14238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 28313004 - 28312733
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  28313004 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 28312905  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  28312904 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 28312805  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28312804 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 28312733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 7792248 - 7792512
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7792248 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7792347  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||    
T  7792348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttc 7792447  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7792448 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttgatc-ttgggataggaatggaagttg 7792512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 38887483 - 38887716
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  38887483 catgaaagttgtagataattttgttagctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagagg 38887582  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  38887583 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagttt 38887682  T
Q  495 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38887683 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 38887716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 19676367 - 19676143
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   |  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19676367 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19676268  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19676267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19676168  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaa 519  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  19676167 aactagggtgtttaagagtatttaa 19676143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 41227104 - 41227332
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41227104 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 41227203  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41227204 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41227303  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  41227304 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41227332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 42912706 - 42912482
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42912706 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 42912607  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42912606 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 42912507  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaa 519  Q
    || || ||| |||||||||||||||    
T  42912506 aattagggtgtttaagagtatttaa 42912482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 51082868 - 51082640
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  51082868 aaagttgtagataattgtattatctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 51082769  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  51082768 agtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaatt 51082669  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51082668 aaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 51082640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 538
Target Start/End: Original strand, 2332606 - 2332849
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  2332606 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 2332705  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2332706 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 2332805  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 538  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2332806 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 2332849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 51323930 - 51323699
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51323930 atgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 51323831  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  51323830 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttca 51323731  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51323730 attaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 51323699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 21046445 - 21046677
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  21046445 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagagg 21046544  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21046545 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 21046644  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21046645 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 21046677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 29764030 - 29764287
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29764030 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29764129  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 490  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  29764130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 29764229  T
Q  491 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  29764230 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16401324 - 16401060
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  16401324 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggagg 16401225  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16401224 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 16401125  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16401124 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttgatc-ttgggacaggaatggaggttg 16401060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 20634030 - 20634263
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20634030 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20634129  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20634130 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 20634229  T
Q  495 aactaag-gtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20634230 aattaagagggtttaagagtatttaacctatgtt 20634263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 4596241 - 4596473
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4596241 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4596340  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  4596341 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttc 4596440  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4596441 aactagggtgcttaagagtatttaacctatgtt 4596473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12710544 - 12710312
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  12710544 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12710445  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12710444 tcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 12710345  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12710344 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 16058710 - 16058942
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16058710 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16058809  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16058810 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 16058909  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  16058910 aactagggtgtttaagattatttaagctatgtt 16058942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 41225851 - 41226079
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41225851 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 41225950  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41225951 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41226050  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  41226051 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41226079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 45496602 - 45496369
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45496602 catgaaaattttagataattgtgttagctttctaatgactttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 45496503  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||     
T  45496502 tcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagttt 45496403  T
Q  495 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45496402 aattaaggggatttaagagtatttaacctatgtt 45496369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 297011 - 296715
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  297011 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 296912  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  296911 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 296812  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  296811 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 296715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 22350244 - 22349980
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22350244 catgaaatttgtagataactgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22350145  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22350144 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttc 22350045  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22350044 aattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 22349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Original strand, 23194947 - 23195173
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||| | |||     
T  23194947 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagagg 23195046  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  23195047 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttc 23195146  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  23195147 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 20437623 - 20437894
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20437623 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20437722  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| |    
T  20437723 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgc 20437822  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20437823 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgactata 20437894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Original strand, 38057050 - 38057304
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || | |  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |    
T  38057050 gaaagttttagataattttgttagctttctagtggctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtat 38057149  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  38057150 tagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaat 38057249  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  38057250 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttaatc-ttgggataggaatg 38057304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 14792958 - 14793193
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14792958 catgaaagttgtacataattgtgttagctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggagg 14793057  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14793058 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14793156  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14793157 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14793193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 22823803 - 22824034
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22823803 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22823902  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  22823903 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22824001  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22824002 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 22824034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 50544507 - 50544276
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50544507 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50544408  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| || |  |||||| ||||||    
T  50544407 ttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50544309  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50544308 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50544276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 1643249 - 1643020
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  1643249 catgaaagttttagataattgtgttaactttccaatggctttagtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 1643152  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  1643151 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 1643053  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1643052 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 39060752 - 39060520
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaa-tgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39060752 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 39060653  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || ||||  |||| || |  |||||| |||||    
T  39060652 gtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagtt 39060554  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39060553 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 39060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 16372407 - 16372178
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16372407 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16372308  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct-caaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||| || ||||| || ||||     
T  16372307 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtg 16372208  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||    
T  16372207 aaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 24720090 - 24720321
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||     
T  24720090 catgaaagttgtagataattgagttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggagg 24720189  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| ||||||    
T  24720190 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 24720288  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720289 agttaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24720321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 44892103 - 44891869
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  44892103 catgaaagttgtagataattttgttagatttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaga 44892004  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| |||| |    
T  44892003 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtac 44891905  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44891904 aattaaggtgtttaagagta-ttaacctatgttatga 44891869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 9784739 - 9784896
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  9784739 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaga 9784838  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||| |||||||||| | |||||||  ||||||| | || |||| || ||||||||||    
T  9784839 tcttggtgaaattttataaaaattccacataactatctccaagtcaacccaaaactta 9784896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 17902158 - 17902389
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | |     
T  17902158 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtgg 17902257  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| | |   |||||| ||||||    
T  17902258 tcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttc 17902356  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17902357 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17902389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653194
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||    
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttga----tagta 27653176  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27653177 atgtattatatttgtata 27653194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 20346066 - 20345973
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346066 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 20345973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18121260 - 18121029
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18121260 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18121161  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  | |||| || |||    
T  18121160 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgcactatgaattc 18121062  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18121061 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18121029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21659800 - 21659689
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21659800 catgaaagtcttagataattttgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21659701  T
Q  395 tcttagtgaaat 406  Q
    ||||||||||||    
T  21659700 tcttagtgaaat 21659689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 372 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294396
Alignment:
Q  372 atgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataatt 462  Q
    |||||| |||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  463 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaa 562  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgta 294425  T
Q  563 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  294424 taggatattaatgatgatctgtgatgctg 294396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13227459 - 13227340
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  13227459 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 13227360  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  13227359 tcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 345 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6833820 - 6833713
Alignment:
Q  345 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || ||    
T  6833820 ttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaaccc 6833721  T
Q  445 aaaactta 452  Q
    ||||||||    
T  6833720 aaaactta 6833713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16656023 - 16655793
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  16656023 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 16655924  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16655923 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 16655825  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  16655824 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29535647 - 29535528
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  29535647 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 29535548  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29535547 tcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16362513 - 16362395
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  16362513 atgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 16362414  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  16362413 cttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21841361 - 21841243
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21841361 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21841262  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21841261 cttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Original strand, 21922859 - 21922977
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21922859 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21922958  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21922959 cttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 407
Target Start/End: Original strand, 10812765 - 10812877
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10812765 catgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10812864  T
Q  395 tcttagtgaaatt 407  Q
    |||||| ||||||    
T  10812865 tcttagcgaaatt 10812877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41373066 - 41372948
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41373066 atgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41372967  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41372966 cttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13989461 - 13989382
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13989461 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 13989382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 529 - 614
Target Start/End: Original strand, 16093748 - 16093833
Alignment:
Q  529 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 614  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16093748 tgagttgatccttggggtagaattggagattgaatataatgttagtgatgatctgtgaagctgttataagatgattgaatgttgat 16093833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940825
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttg 52940825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Original strand, 23593301 - 23593409
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||   | |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  23593301 atgaaagtcgtagataatttagttatctttccaatggctttggtttggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggt 23593400  T
Q  396 cttagtgaa 404  Q
    |||||||||    
T  23593401 cttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 525 - 616
Target Start/End: Original strand, 21533735 - 21533825
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||    
T  21533735 gttatgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgatag 21533825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 26065201 - 26065114
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 610  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  26065201 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggatgttgtatatgatgttaatgataatctgtgaagttgttataagaggatttgatgt 26065114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Original strand, 21474653 - 21474727
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21474653 catgaaagttgtagatacttgtgttagccttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 21474727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Original strand, 35260939 - 35261028
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  35260939 atgttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtatatgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttg 35261028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 16758906 - 16758831
Alignment:
Q  530 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 605  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758906 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 16758831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22366617 - 22366527
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  22366617 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 381
Target Start/End: Original strand, 20708730 - 20708805
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 381  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  20708730 tagataattttgctatctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 20708805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 525 - 612
Target Start/End: Original strand, 21043142 - 21043229
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  21043142 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 21043229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 525 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22124545 - 22124458
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22124545 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 22124458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 525 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 47190861 - 47190817
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47190861 gttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 47190817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 48520830 - 48520787
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48520830 atgttataagttgatcattggggtaggaatggaggttgattata 48520787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 522 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 42697150 - 42697112
Alignment:
Q  522 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42697150 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaagttg 42697112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 540 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 14800779 - 14800707
Alignment:
Q  540 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14800779 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 14800707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 540 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 14809653 - 14809581
Alignment:
Q  540 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14809653 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttg 14809581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17003999 - 17003963
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17003999 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 17003963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 21650889 - 21650953
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  21650889 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgattttt 21650953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 303 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 105560 - 105229
Alignment:
Q  303 ttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  105560 ttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtg 105461  T
Q  403 aaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg 502  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  105460 aaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaag 105361  T
Q  503 tatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga 602  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  105360 tgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatatga 105263  T
Q  603 tttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||| |||||    | ||||||||| |||||||||||||    
T  105262 tttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtata 105229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 162940 - 162647
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  162940 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaagg 162841  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  162840 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 162741  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 588  Q
    || |||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  162740 aattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaag 162647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 95006 - 94927
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  95006 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 94927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 357
Target Start/End: Original strand, 17202 - 17261
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattt 357  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  17202 gaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgattt 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 343
Target Start/End: Original strand, 154871 - 154919
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttga 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  154871 catgaaagttttagataattttgttagctttataatgacgttggtttga 154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 294 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12284
Alignment:
Q  294 tcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  12626 tcatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggag 12527  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  12526 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtt 12427  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  12426 caattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaatctatt 12327  T
Q  594 ataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  12326 ataatatggtttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 12284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 905 - 566
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  905 catgaaagttgtagataattttgttagcttacgaatgactttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 806  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  805 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttc 706  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  705 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttgatc-ttggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-ta 608  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||| |||||||||||||    
T  607 taatataatttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtata 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 295 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16229 - 15891
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16229 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16130  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||    
T  16129 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttc 16030  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16029 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtgatgatctgtgaagctgtta 15930  T
Q  595 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||    || |||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15929 taa---catataatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 15891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 300 - 640
Target Start/End: Original strand, 1510 - 1846
Alignment:
Q  300 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  1510 aagttgtagataattgagttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtctt 1609  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1610 agtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaatt 1709  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1710 aaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaaatgttataat 1808  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  1809 atgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 1846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27724
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||     
T  27956 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggagg 27857  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27856 tcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtac 27757  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27756 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 27724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 296 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 82641 - 82302
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  82641 atgaaagttgtagataattaagttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggt 82542  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  82541 cttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttca 82442  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttat 595  Q
    | ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  82441 attaaggt-gttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattgt 82343  T
Q  596 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  82342 aatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 82302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 10843 - 11073
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10843 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 10942  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10943 tcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 11042  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11043 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 395 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 17223
Alignment:
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 487  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17315 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 19040 - 19304
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19040 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaga 19139  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19239  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19240 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21737 - 21484
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21737 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21638  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21637 tcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21538  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21537 aattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 111143 - 110872
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  111143 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 111044  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  111043 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 110944  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  110943 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 110872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 146388 - 146156
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || | | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  146388 catgaaagttgtagataattgagtttgctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 146289  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  146288 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 146189  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || | | ||||||||||||||| |||||||    
T  146188 aattaggatgtttaagagtatttaatctatgtt 146156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Original strand, 123956 - 124182
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  123956 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatggctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgagg 124055  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  124056 tgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 124155  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  124156 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 176448 - 176195
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  176448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 176349  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  176348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 176249  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  176248 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 176195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 295 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 169095 - 168846
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  169095 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 168996  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  168995 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 168896  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 544  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  168895 aattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggg 168846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Original strand, 152610 - 152863
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  152610 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 152709  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  152710 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaatt 152809  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 552  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  152810 aaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaat 152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 77343 - 77098
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  77343 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 77244  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  77243 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttc 77144  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  77143 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttgatctt 77098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 3338 - 3591
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3338 catgaaagttgtcaataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 3437  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3438 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 3537  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  3538 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 75 - 1
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 369  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  75 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8656 - 8592
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  | |||||||||    
T  8656 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgattttt 8592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6114 - 5835
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  6114 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 6015  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6014 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 5915  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  5914 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 3362 - 3117
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3362 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3263  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3262 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 3163  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3162 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttgatctt 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5828
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6069 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 5970  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5969 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 5870  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5869 aaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 7179 - 7409
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| |||     
T  7179 catgaaagttttatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtttta-agttatgataaaaatactccaaggagg 7277  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||  | |  |||||| |||||     
T  7278 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagtta 7376  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7377 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3395
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattata 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Original strand, 64465 - 64694
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  64465 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 64564  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  64565 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 64664  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  64665 aattaaggtgtttaagagtagttaacctat 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31272
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||| | || |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtat------aataatat-aatttagtgttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatttgtgaagctattataat 31310  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  31309 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 31272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31799 - 31680
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || | | || || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31799 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31700  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  31699 tcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 21911 - 21679
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  21911 catgaaagttgttgataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21812  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21811 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21712  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21711 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 21679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 28764 - 28996
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28764 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28863  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 28963  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28964 aattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgtt 28996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10091 - 9997
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 78720 - 78488
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78720 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 78621  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78620 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 78521  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  78520 aactaaggtgttaaagagtatttaacctatgtt 78488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22427
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 22445  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22444 atgtaatatatttgtata 22427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 9352 - 9623
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  9352 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 9451  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  9452 tcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtac 9551  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9552 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 9623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 395
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 554  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  553 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttc 454  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  453 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2702
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  2994 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 2895  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2894 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttc 2796  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 588  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||  |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2795 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttttataggatattaaggatgatctgtgaag 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 373 - 605
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  373 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggagg 472  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  473 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagttt 572  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  573 aattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 299 - 525
Target Start/End: Original strand, 5680 - 5906
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  5680 aaagatgtagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtctt 5779  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5780 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 5879  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5880 aaggtgtttaagagtatcaaacctatg 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 5109 - 5341
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5109 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5208  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5308  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5309 aactagggtgtttaagagtatttaaactatgtt 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 551
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6330
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6077 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 6176  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6177 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6276  T
Q  499 aagg-tatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 551  Q
    | || | |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  6277 agggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8184
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7956 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 8055  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8056 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 8155  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  8156 aaggtgtttatgattatttaacccatgtt 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4433
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 490  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  491 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4433
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 490  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  491 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8720 - 8478
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||      
T  8720 catgaaagttgtagataattatgttagctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaag 8621  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8620 tcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttc 8521  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 537  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8520 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgat 8478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 640
Target Start/End: Original strand, 169415 - 169721
Alignment:
Q  317 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 416  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||    
T  169415 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 169514  T
Q  417 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 516  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||    
T  169515 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatatt 169601  T
Q  517 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |       
T  169602 taacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaatattta--- 169698  T
Q  617 ctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  169699 -taataatgtaatatatttgtata 169721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 296 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 143268 - 143038
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   |  ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |    
T  143268 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggt 143169  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  143168 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 143069  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  143068 attaaggggtttaagagtatttaacctatgt 143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 5722 - 5947
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  5722 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 5821  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5822 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5921  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  5922 aattaaggggtttaacagtatttaac 5947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 23225 - 22929
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  23225 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 23126  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23125 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttc 23026  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23025 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 22929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 295 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 33995 - 33791
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  33995 catgaaagttgtagataattgagttagcattccagtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33896  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33895 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 33796  T
Q  495 aacta 499  Q
    |||||    
T  33795 aacta 33791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 295 - 521
Target Start/End: Original strand, 17653 - 17879
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||      
T  17653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatg 17752  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17753 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 17852  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  17853 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 295 - 484
Target Start/End: Original strand, 22575 - 22765
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactcca-atgag 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |   |||    
T  22575 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggag 22674  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 484  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22675 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 521
Target Start/End: Original strand, 23386 - 23512
Alignment:
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  23386 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 23485  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacc 521  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  23486 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 566
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55586
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 55586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 14982 - 15214
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14982 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15081  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15082 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15181  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15182 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 24040 - 24272
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24040 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24139  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24239  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24240 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 317 - 608
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1390
Alignment:
Q  317 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 416  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||    
T  1112 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 1211  T
Q  417 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 516  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||    
T  1212 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatatt 1298  T
Q  517 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaat 608  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1299 taacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaat 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 296 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 58403 - 58172
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  58403 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagat 58304  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  58303 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 58204  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  58203 actagggtgtttaagagtatttaacctgtgtt 58172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 68557 - 68438
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||   |     
T  68557 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttgg 68458  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  68457 tcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1130
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1360 catgaaagttgtagataattgagtaagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggata 1261  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1260 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 1161  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1160 aattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6279
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  6215 catgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgattttt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6407
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6681 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6582  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6581 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 6482  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  6481 aattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatgcaagttgattataata 6407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 526 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 710
Alignment:
Q  526 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  796 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttg 710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 524 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 25367 - 25279
Alignment:
Q  524 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  25367 tgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttg 25279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16362
Alignment:
Q  364 tttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  464 aaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
     |||| |||||  |  | |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16424 caaacttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 16362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 159346 - 159603
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  159346 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 159445  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  159446 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 159545  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    || ||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  159546 aattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7213
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatc-ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  6984 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtag 7083  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7084 atcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 7183  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
     || |||||  |||||||||||||||||||    
T  7184 taattaaggggtttaagagtatttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 548
Target Start/End: Original strand, 11903 - 12156
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||     
T  11903 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggagg 12002  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12003 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12102  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  12103 aattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttggggtag 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 863 - 1095
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  863 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 962  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  963 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 1062  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1063 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 39755 - 39523
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39755 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39656  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  39655 gcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 39556  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||||    
T  39555 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 39523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 300 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1558 - 1332
Alignment:
Q  300 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 399  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||    
T  1558 aagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtctta 1459  T
Q  400 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 499  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1458 gtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatta 1359  T
Q  500 aggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1358 aggggtttaagagtatttaacctatgt 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 5063 - 5293
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  5063 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaagg 5162  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5163 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttc 5262  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5263 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 299 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7627 - 7401
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  7627 aaagatgtagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtctt 7528  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7527 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 7428  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7427 aaggtgtttaagagtatcaaacctatg 7401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 405
Target Start/End: Original strand, 10313 - 10423
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  10313 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 10412  T
Q  395 tcttagtgaaa 405  Q
    |||||||||||    
T  10413 tcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 479 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11219
Alignment:
Q  479 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 265 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9479
Alignment:
Q  265 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 364  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9741 tttctgttttgaattgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagttt 9642  T
Q  365 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||     
T  9641 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattcc 9542  T
Q  465 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9541 aaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 298 - 548
Target Start/End: Original strand, 70227 - 70477
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  70227 gaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 70326  T
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  70327 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaat 70426  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 548  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  70427 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttggtccttggggtag 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 72067 - 71935
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  72067 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 71968  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 427  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  71967 tcttagtgaaaccttatgaaaattcaggataac 71935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 6455 - 6191
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  6455 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtagg 6356  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 6256  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 560  Q
    || |||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6255 aattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 589
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  || | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  821 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 722  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  721 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtcc 622  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  621 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16419 - 16175
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| |    
T  16419 atgaaagttttagatacttttgctagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggt 16320  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16319 cttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttca 16220  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16219 atgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 16175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 13602 - 13357
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  13602 catgaaagttttagatatttttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggagg 13503  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13403  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13402 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 306 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8881 - 8686
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8881 tagatatttttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 8782  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaag 501  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8781 tcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 21389 - 21157
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21389 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21290  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21289 tcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttc 21190  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 566
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19548
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattata 19548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 22187 - 22419
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22187 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 22286  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22287 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttc 22386  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22387 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 299 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 29384 - 29124
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  29384 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 29285  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |    
T  29284 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 29185  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 559  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29184 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 29124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 299 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34589
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  34849 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 34750  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |    
T  34749 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 34650  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 559  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34649 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 34589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 295 - 575
Target Start/End: Original strand, 22165 - 22444
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  22165 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggagg 22264  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  22265 tcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttc 22364  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  22365 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 22444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 235 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 952 - 767
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  952 cgagcataggaaaatcaacttttctggatttctctgttctgaattaggtttaggaatcttcatcaaagttgtagataattttgttagctttccaatgact 853  T
Q  335 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattca 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  852 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 6949 - 7013
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  6949 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Original strand, 13061 - 13286
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  13061 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 13160  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13161 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 13260  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  13261 aattaaggggtttaagagtatttaac 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 8046 - 8277
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||   | |||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||| ||||  |      
T  8046 catgaaaattttagataattttgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaag 8145  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  8146 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagttt 8245  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   |||||||||||||||| |||||    
T  8246 aattaagaggtttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 299 - 496
Target Start/End: Original strand, 106603 - 106800
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  106603 aaagttgtagataattgagttagctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 106702  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 496  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106703 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 7539 - 7295
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  7539 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 7440  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7439 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 7340  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  7339 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 1741 - 1509
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  1741 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 1642  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1641 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttc 1542  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1541 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 4
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  172 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 73  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 463  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  72 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 8712 - 8468
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  8712 atgaaagttgtagataattgcgttagctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggt 8613  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8612 gttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 8513  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 540  Q
    | |||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  8512 attaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 8468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 337 - 527
Target Start/End: Original strand, 7823 - 8013
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7823 ggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 7922  T
Q  437 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7923 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 10877 - 10636
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10877 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 10778  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt-ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10777 acttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagtt 10678  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 535  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10677 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 974 - 740
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     
T  974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 876  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | |||    
T  875 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattc 777  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  776 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 6480 - 6246
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     
T  6480 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 6382  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | |||    
T  6381 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattc 6283  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6282 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 6246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 4076 - 3843
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4076 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggaga 3977  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3976 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagttt 3877  T
Q  495 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  3876 aattaagggggttttagagtatttaacctatgtt 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11583
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||    
T  11811 aaagttgtagataattaagttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtctt 11712  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    || ||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  11711 agcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaatt 11612  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11611 acggtgtttaagagtatttgacctatgtt 11583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 306 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7557
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  7778 tagataattttgttagctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaa 7679  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 505  Q
    | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  7678 tcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgt 7579  T
Q  506 ttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  7578 ttattagtatttaacctatgtt 7557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13948 - 13877
Alignment:
Q  239 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 310  Q
    |||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13948 cataggaaaatcaatttttctgccactttatgttccgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagat 13877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7169 - 6944
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || | | |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  7169 catgaaagttgtagataattgagttagctctccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtagg 7070  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7069 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagttt 6970  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  6969 aattaaggggtttaagagtatttaac 6944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3926 - 3701
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  3926 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 3827  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3826 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagttt 3727  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||| | ||||||||    
T  3726 aattaaggggtttaacaatatttaac 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21724 - 21499
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  21724 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtagg 21625  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  21624 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagttt 21525  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  21524 aattaaggggtttaagagtatttaac 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 169094 - 168861
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  169094 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaga 168995  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  168994 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagttt 168895  T
Q  495 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||| ||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  168894 aattaagggggttttagagtatttaacttatgtt 168861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21308 - 21083
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21308 catgaaaattgtaggtaattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaga 21209  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21208 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21109  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21108 aattaaggggtttaatagtatttaac 21083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 126400 - 126179
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  126400 aaagttgtagataattgagttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 126301  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  126300 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 126201  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  126200 aaggggtttaagagtatttaac 126179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33109 - 32874
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  33109 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcttgtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 33010  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  33009 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 32911  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32910 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 32874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 30268 - 30036
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  30268 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagt 30169  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  30168 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagttt 30069  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  30068 aattaaggtgtttaagagtatctaacttatgtt 30036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 297 - 553
Target Start/End: Original strand, 35969 - 36224
Alignment:
Q  297 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 396  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  35969 tgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtt 36068  T
Q  397 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 496  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36069 ttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaa 36168  T
Q  497 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
     |||||| ||||||||||||  ||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36169 ttaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 7875 - 7643
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  7875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 7776  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7775 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7676  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7675 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14506 - 14274
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14506 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 14407  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14406 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14307  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14306 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 26582 - 26358
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  26582 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 26483  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  26482 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 26383  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaa 519  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  26382 aattaaggtgtttaagagtatttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 295 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27964 - 27740
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  27964 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 27865  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  27864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 27765  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaa 519  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  27764 aattaaggtgtttaagagtatttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Original strand, 2123 - 2394
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  2123 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 2222  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  2223 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 2322  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2323 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 2394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 297 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 51612 - 51355
Alignment:
Q  297 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 396  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||    
T  51612 tgaaagttttagataattttgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtc 51513  T
Q  397 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 496  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  51512 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaa 51413  T
Q  497 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 555  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51412 ataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgga 51355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 304 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 67315 - 67187
Alignment:
Q  304 tgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtga 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  67315 tgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtga 67216  T
Q  404 aattttttgaaaattcagcataactgttt 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  67215 aattttatgaaaattcagcataaccgttt 67187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 523
Target Start/End: Original strand, 10325 - 10554
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10325 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10424  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10425 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10524  T
Q  495 aactaa-ggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    || ||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  10525 aattaagggggtttatgagtatttaaccta 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Original strand, 19919 - 19983
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  19919 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgattttt 19983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 120566 - 120341
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  120566 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtagg 120467  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  120466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 120367  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaac 520  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  120366 aattaaggggtttaagagtatttaac 120341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 295 - 487
Target Start/End: Original strand, 29593 - 29785
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29593 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29692  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 487  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29693 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta 29785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 12932 - 13164
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||     
T  12932 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggagg 13031  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13032 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 13131  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13132 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 527
Target Start/End: Original strand, 19369 - 19431
Alignment:
Q  465 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19369 aaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 378 - 610
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  378 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 477  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  478 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 577  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  578 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5914
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  5682 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5781  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  5782 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 5881  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5882 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 5914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1480
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1591 catgaaagttgtagataattgtgctagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1492  T
Q  395 tcttagtgaaat 406  Q
    ||||||||||||    
T  1491 tcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 11401 - 11437
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11401 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 11437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 348 - 524
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8928
Alignment:
Q  348 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  448 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactat 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 2220 - 1988
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2220 catgaaaattgtagataaatgagttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2121  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  2120 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttc 2021  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
     | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2020 tattagggtatttaagggtatttaacctatgtt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5565 - 5413
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||     
T  5565 catgaaagttgtagataattaagttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 5466  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 447  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 439 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5141
Alignment:
Q  439 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 307 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 138419 - 138135
Alignment:
Q  307 agataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 406  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||     
T  138419 agataatttagttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaac 138320  T
Q  407 tttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatt 506  Q
     || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  138319 cttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 138220  T
Q  507 taagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    || |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  138219 tacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatttgtgaagctg 138135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 345 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7941
Alignment:
Q  345 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 444  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8123 ttgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcc 8024  T
Q  445 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8023 aaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 496
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8263
Alignment:
Q  385 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 484  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  485 ctaggagttcaa 496  Q
    ||| ||||||||    
T  8252 ctatgagttcaa 8263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 632
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |  | | |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||     
T  861 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggagg 762  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  761 tcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 662  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  661 aactagggggtttaagagtatttaacctat 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 295 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 133406 - 133089
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  ||     
T  133406 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtagg 133307  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  133306 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 133207  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 594  Q
    || ||||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||  | | ||    
T  133206 aattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtgagtcagata 133107  T
Q  595 taatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  133106 taatatgatttgatgttg 133089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 306 - 566
Target Start/End: Original strand, 133571 - 133831
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  133571 tagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaa 133670  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 505  Q
    | || ||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| |    
T  133671 tcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgt 133770  T
Q  506 ttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 566  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  133771 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 133831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 348 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29582
Alignment:
Q  348 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 447  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  448 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 29582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 33894 - 33803
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 386  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33894 catggaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 295 - 494
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23799
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23600 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23699  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23700 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 376 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22482
Alignment:
Q  376 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 475  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  476 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 22482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22684 - 22627
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaat 352  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  22684 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaat 22627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 1367 - 1135
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  1367 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 1268  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1267 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 1168  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1167 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 65377 - 65612
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  65377 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 65476  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  65477 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 65575  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65576 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 65612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 569
Target Start/End: Original strand, 75686 - 75733
Alignment:
Q  522 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 569  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  75686 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 75733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 186901 - 187133
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  186901 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 187000  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  187001 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 187100  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  187101 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 187133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14092
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14074  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14075 atgtaatatatttgtata 14092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 299 - 527
Target Start/End: Original strand, 66432 - 66660
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||    
T  66432 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtctt 66531  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || || | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66532 agtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaatt 66631  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  66632 aaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 341 - 106
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||    
T  341 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggaga 242  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  241 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 143  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  142 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 339 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11101
Alignment:
Q  339 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  439 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 591
Target Start/End: Original strand, 15513 - 15542
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15513 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 15542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 337 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 12948 - 12748
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  12948 ggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaa 12849  T
Q  437 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 536  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||  |||||||    
T  12848 gttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga 12749  T
Q  537 t 537  Q
    |    
T  12748 t 12748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 296 - 526
Target Start/End: Original strand, 747 - 977
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |    
T  747 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 846  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 495  Q
    ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  847 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagttta 946  T
Q  496 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  947 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8476 - 8240
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttttt-gagatatgatgaaaatactccaatgag 393  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8476 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 8377  T
Q  394 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 493  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || ||    
T  8376 gtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaatt 8278  T
Q  494 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8277 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 8240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21417 - 21285
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21417 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21318  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 427  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21317 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39401
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 39439  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  39438 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 39401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42348 - 42271
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatat 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| || | | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42348 atgaaagttgtagataattgtgttatctatccagtggctttggtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatat 42271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  368 agatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 524
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9851
Alignment:
Q  383 actccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaag 482  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  483 tactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctat 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38417 - 38338
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38417 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 38338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18285
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18050 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcagg 18149  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  18150 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 18248  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18249 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 18285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 62374 - 62139
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  62374 catgaaagttgtagataactgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 62275  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || |||    
T  62274 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattc 62176  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62175 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 62139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 362
Target Start/End: Original strand, 39305 - 39372
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggt 362  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39305 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 299 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 56628 - 56397
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  56628 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 56529  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |    
T  56528 agtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaatt 56430  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56429 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 56397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25940
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  26171 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggagg 26072  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | |||     |  || | |||||||| |  |||||| ||||||    
T  26071 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatggatcgtcttcaatcttcaaaacttg-tgtactatgagttc 25973  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25972 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 399 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 21040
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21193 agtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 21094  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21093 aagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatg 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10135
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  10356 catgaaagttttagaaaattgtgttagatttcaagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 10257  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||          |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10256 tcttagtgaa-ttttatgaaaagtccgc----------ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10168  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10167 aattaaggggtttgagagtatttaacctatgtt 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18820 - 18589
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||      
T  18820 catgaaagttgtagatatttgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaag 18721  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  18720 tcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 18622  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18621 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 18589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28559 - 28495
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  28559 catgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 28495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10056
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 10038  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10039 atgtaatatatttgtata 10056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30560 - 30496
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  30560 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 30496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8162 - 7931
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||||  |      
T  8162 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaag 8063  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8062 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7963  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  7962 aattaagaggtttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 34916 - 34689
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  34916 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 34817  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  34816 tcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 34722  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34721 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 34689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2543 - 2403
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  2543 catgaaagttgtagataattttgttag-tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagagg 2445  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2444 tcttagtgaagttttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 35913 - 36144
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| || ||      
T  35913 catgaaagttttagataattttgctagctttccaatgacttcagttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatg 36012  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  ||||||||||||     
T  36013 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagttt 36111  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36112 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11833
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||  ||||  ||     
T  11603 catgaaagttctagataatttagttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcagg 11702  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11703 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11802  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  11803 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 1
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  158 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 59  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  58 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3299
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||    
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttga----tagta 3281  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3282 atgtaatatatttgtata 3299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24569
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  24456 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 24551  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24552 atgtaatatatttgtata 24569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38465 - 38429
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 38429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 438
Target Start/End: Original strand, 1030 - 1173
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  1030 catgaaagttttagataatttttttatctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 1129  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 438  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  1130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 457 - 553
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1468
Alignment:
Q  457 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 553  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1373 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 11614 - 11844
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| | |     
T  11614 catgaaagtttaagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcgg 11713  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11714 tcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11813  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||| |   |||||||||||||||||||||    
T  11814 aattaa-gaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 405
Target Start/End: Original strand, 79 - 189
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  79 catgaaagtcgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 178  T
Q  395 tcttagtgaaa 405  Q
     |||| |||||    
T  179 acttaatgaaa 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 640
Target Start/End: Original strand, 19951 - 20182
Alignment:
Q  398 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 497  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  19951 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 20050  T
Q  498 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 597  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| || |   | ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20051 taaggtgtttaagagtat------aataatatga-tttagtgtaggggtaggaatgtggattgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 20143  T
Q  598 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||    
T  20144 tatgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttttata 20182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 19655 - 19774
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19655 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19754  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  19755 tcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17682
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 605  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||||||||||    
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgattt 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 7251 - 7408
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  7251 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 7350  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  7351 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14542 - 14424
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||   | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  14542 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14443  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  14442 cttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 439
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2593
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  2449 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 2548  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 439  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2549 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 437 - 527
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3149
Alignment:
Q  437 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 415
Target Start/End: Original strand, 24459 - 24579
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24459 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaga 24558  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaa 415  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  24559 tcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 531
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24635
Alignment:
Q  482 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 24635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4668
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||    
T  4555 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatga----tagta 4650  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4651 atgtaatatatttgtata 4668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 2176 - 2406
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  ||     
T  2176 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 2275  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2276 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 2375  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  2376 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 526
Target Start/End: Original strand, 10431 - 10661
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  ||     
T  10431 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 10530  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10531 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 10630  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 526  Q
    || ||||   ||| ||||| ||||||||||||    
T  10631 aattaagaggtttgagagt-tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 400 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33334
Alignment:
Q  400 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 499  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  500 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 298 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 33764 - 33648
Alignment:
Q  298 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  33764 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtct 33665  T
Q  398 tagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  33664 tagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 2956 - 2849
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2956 atgttatgaattgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattaatgatgacctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2861  T
Q  623 atgtaatatatt 634  Q
    ||||||||||||    
T  2860 atgtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 524 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13303
Alignment:
Q  524 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13391 tgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 13303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 524 - 612
Target Start/End: Original strand, 15959 - 16047
Alignment:
Q  524 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15959 tgttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 8389 - 8296
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 616  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 399 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17722
Alignment:
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 498  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  499 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 598  Q
    ||| | |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 17760  T
Q  599 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 640  Q
    |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  17759 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtata 17722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 297 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18247 - 18130
Alignment:
Q  297 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18247 tgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 18148  T
Q  397 ttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  18147 ttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2398
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2380  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    || |||||||||||||||    
T  2381 atttaatatatttgtata 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3500
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  3619 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggagg 3520  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  3519 tcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1361
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1451 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 8016 - 8173
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||     
T  8016 catgaaaactgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggagg 8115  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  8116 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaacccaaaactta 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 526 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 176
Alignment:
Q  526 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 625  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  286 ttatgagttgaaccttgggataggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatg 191  T
Q  626 taatatatttgtata 640  Q
    |||||||||||||||    
T  190 taatatatttgtata 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 452
Target Start/End: Original strand, 18526 - 18679
Alignment:
Q  299 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| || || | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18526 aaagtcgtagacaattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtctt 18625  T
Q  399 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18626 agtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaaccaaaactta 18679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 32899 - 32671
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| || ||| ||||  |      
T  32899 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaag 32800  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||  | || |||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  32799 tcttgataaatttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 32701  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 524  Q
    || ||||   ||  ||||||||||||||||    
T  32700 aattaagaagttggagagtatttaacctat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3744
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 622  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 3762  T
Q  623 atgtaatatatttgtata 640  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3761 atgtaatatatttgtata 3744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 527
Target Start/End: Original strand, 11743 - 11974
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |     
T  11743 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggggg 11842  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  11843 tcttagtgaaattttatgaaaatttcacataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 11941  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11942 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13150 - 13060
Alignment:
Q  235 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  13150 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattgtctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 13060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 452
Target Start/End: Original strand, 20470 - 20627
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||  ||     
T  20470 catgaaagttttagataattgtgttagtgttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtagg 20569  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 452  Q
    |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||| || || |||||||    
T  20570 tcttggagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccgaaactta 20627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 295 - 404
Target Start/End: Original strand, 16384 - 16493
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16384 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 16483  T
Q  395 tcttagtgaa 404  Q
    ||||||||||    
T  16484 tcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 527
Target Start/End: Original strand, 16525 - 16598
Alignment:
Q  454 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  16525 ggaataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgtt 16598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 525
Target Start/End: Original strand, 13168 - 13402
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttt---tgagatatgatgaaaatactccaat 390  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| |||| |   |||| ||||||||||| |||| ||     
T  13168 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaag 13267  T
Q  391 gagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagga 490  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  | | |||| ||||||||| ||||| || ||    
T  13268 gaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaactataagtattacga 13367  T
Q  491 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 525  Q
    ||| || ||||   |||||||||||||||| ||||    
T  13368 gtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 8614 - 8495
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  8614 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggagg 8515  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  8514 tcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21343 - 21225
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21343 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21244  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21243 cttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 433
Target Start/End: Original strand, 7784 - 7911
Alignment:
Q  306 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7784 tagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 7883  T
Q  406 ttttttgaaaattcagcataactgtttc 433  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  7884 ttttacgaaaattccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9696 - 9606
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9696 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatact 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  442 tccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 523  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 612
Target Start/End: Original strand, 60573 - 60662
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  60573 atgttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttg 60662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 142870 - 142823
Alignment:
Q  264 ttttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 311  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  142870 ttttctgttcagaattaggatttggtgtcttcatgaaagttgtagata 142823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6423
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || |||     
T  6542 catgaaagttgcagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggagg 6443  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  6442 tcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 168 - 53
Alignment:
Q  300 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  168 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 69  T
Q  399 agtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||| |||| ||||    
T  68 agtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13988 - 13909
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13988 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40995 - 40916
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40995 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatg 40916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37949 - 37886
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 358  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||||||||||    
T  37949 catgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgatttt 37886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 11885 - 11766
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    | || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  11885 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttagagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11786  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaa 414  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  11785 tcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 9836 - 9718
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   | ||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  9836 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 9737  T
Q  396 cttagtgaaattttttgaa 414  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  9736 cttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 543 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10715 - 10643
Alignment:
Q  543 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga-tttaatgttgata 615  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10715 gggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttaatgttgata 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 615
Target Start/End: Original strand, 520 - 612
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga-tttaatgttgata 615  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  520 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttg-tataatatgattttaatgttgata 612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 2319 - 2403
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2319 catgaaagttgtagataattgcgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 174544 - 174628
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  174544 catgaaagttgtagataattgcgttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 612
Target Start/End: Original strand, 27526 - 27614
Alignment:
Q  524 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27526 tgttatgagttgaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 612
Target Start/End: Original strand, 27646 - 27696
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 612  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27646 atatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 525 - 640
Target Start/End: Original strand, 621 - 732
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 624  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |  ||| |||||| |||| | |||||||    |||||||    
T  621 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttga----tagtaat 716  T
Q  625 gtaatatatttgtata 640  Q
    || |||||||||||||    
T  717 gtgatatatttgtata 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 85807 - 85726
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 605  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  85807 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttggatatgatattaatgatgatccgcgaagct-atataatatgattt 85726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1109 - 874
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 394  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| |||  |||||  |  ||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||   |     
T  1109 catgaaagttttatataattgtgttagatttataatgattttagtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 1010  T
Q  395 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 494  Q
    ||||||  ||| |||   |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||| ||  |  ||| ||||  |||||||  | |||||  ||||||    
T  1009 tcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttagtcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaact-tatgtactttgagttc 911  T
Q  495 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 531  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  910 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 309
Target Start/End: Original strand, 12089 - 12157
Alignment:
Q  241 taggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtaga 309  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12089 taggaaaatcaacttttctaccactttcttttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 12157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 605
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18108
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 605  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||||||||||    
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgattt 18108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2364
Alignment:
Q  469 ctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgtt 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116608
Alignment:
Q  528 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 593  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  116673 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 116608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 134805 - 134770
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134805 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 134770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 137274 - 137239
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137274 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 139743 - 139708
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139743 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 139708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 142212 - 142177
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142212 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 142177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 144681 - 144646
Alignment:
Q  296 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144681 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 144646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1405 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1405
Description:

Target: scaffold1405; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1252 - 1214
Alignment:
Q  269 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1252 tgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgta 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 894
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| || |||||||||||    
T  958 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgattttt 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 479 - 527
Target Start/End: Original strand, 1 - 49
Alignment:
Q  479 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 527  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 936
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  1000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 525 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 1964 - 1928
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 561  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1964 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 1928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12097 - 12021
Alignment:
Q  55 agattgtttccaagaaagaagcatcctccagaggtgc-atttctatcatcagcgcttccttcccagccagcatcaca 130  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||    
T  12097 agattatttcctagaaagaaacatcctccagaggtactatttctatcatcagcactttctgaccagtcagcatcaca 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 571
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29330
Alignment:
Q  523 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 571  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtatt 29330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1043 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1043
Description:

Target: scaffold1043; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 856 - 903
Alignment:
Q  264 ttttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 311  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  856 ttttctgttcagaattaggatttggtgtcttcatgaaagttgtagata 903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17278 - 17163
Alignment:
Q  337 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 436  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||  || | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  17278 ggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagaaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 17179  T
Q  437 gttaatccaaaactta 452  Q
    || || ||||| ||||    
T  17178 gtcaacccaaacctta 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Original strand, 35026 - 35117
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 386  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35026 catgaaagttttagagaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatactc 35117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1416
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  1465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgac 1416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 10358
Alignment:
Q  525 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 578  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  10411 gttatgagttgatccttggtgtaggaatagaggttgattataatgtttatgatg 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 11688 - 11659
Alignment:
Q  562 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11688 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 11659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18295 - 18231
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  18295 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgattttt 18231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54036 - 53972
Alignment:
Q  295 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 359  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  54036 catgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgattttt 53972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University