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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
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Alignment Overview

Query: NF16843_low_2 (Length: 482)

Name: NF16843_low_2
Description: NF16843
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16843_low_2
NF16843_low_2
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (1-463)||(11279090-11279556)
chr7 (1-469)||(36222489-36222962)
chr7 (19-463)||(46846516-46846957)
chr7 (22-462)||(33312593-33313033)
chr7 (19-463)||(17863298-17863742)
chr7 (19-463)||(17866557-17867001)
chr7 (19-463)||(23759812-23760256)
chr7 (19-463)||(6966745-6967189)
chr7 (23-451)||(23107597-23108025)
chr7 (19-465)||(36843141-36843587)
chr7 (19-463)||(294462-294906)
chr7 (19-463)||(24783003-24783450)
chr7 (19-460)||(9765398-9765843)
chr7 (66-460)||(3862149-3862540)
chr7 (19-200)||(23313464-23313645)
chr7 (302-463)||(23313690-23313849)
chr7 (341-460)||(35773058-35773176)
chr7 (169-272)||(2719331-2719435)
chr7 (169-257)||(27796636-27796726)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (19-408)||(16294550-16294940)
chr2 (22-409)||(31626199-31626588)
chr2 (19-463)||(31527987-31528431)
chr2 (20-463)||(23673549-23673992)
chr2 (19-463)||(40017575-40018021)
chr2 (20-463)||(36326522-36326967)
chr2 (19-461)||(32575890-32576331)
chr2 (19-408)||(13709721-13710113)
chr2 (227-291)||(8426766-8426830)
chr2 (25-87)||(8427199-8427260)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (22-461)||(26712549-26712991)
chr5 (22-461)||(26982287-26982729)
chr5 (19-463)||(33574686-33575131)
chr5 (19-463)||(15532404-15532848)
chr5 (19-463)||(15542586-15543030)
chr5 (19-460)||(14616632-14617073)
chr5 (19-463)||(34405446-34405890)
chr5 (21-462)||(22159342-22159784)
chr5 (19-428)||(7650145-7650562)
chr5 (164-463)||(11989166-11989465)
chr5 (229-428)||(23993447-23993649)
chr5 (19-81)||(11989069-11989133)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (22-459)||(39563717-39564153)
chr3 (19-463)||(22626514-22626960)
chr3 (19-463)||(11138772-11139216)
chr3 (19-463)||(13979088-13979528)
chr3 (59-408)||(35366028-35366377)
chr3 (24-159)||(46731396-46731531)
chr3 (59-408)||(47411841-47412184)
chr3 (222-254)||(46731355-46731387)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (22-462)||(7199-7639)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (22-462)||(2290-2732)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (19-461)||(12171582-12172025)
chr4 (19-463)||(647407-647851)
chr4 (20-463)||(26062898-26063341)
chr4 (19-457)||(650679-651117)
chr4 (22-456)||(26060192-26060626)
chr4 (20-463)||(2541483-2541925)
chr4 (22-72)||(11649440-11649490)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (19-463)||(13492860-13493304)
chr1 (19-463)||(13495585-13496029)
chr1 (19-463)||(34065942-34066386)
chr1 (19-463)||(27282311-27282755)
chr1 (23-463)||(32506062-32506501)
chr1 (19-298)||(39546004-39546284)
chr1 (19-463)||(1936225-1936668)
chr1 (124-400)||(22104680-22104956)
chr1 (19-461)||(16190381-16190822)
chr1 (101-463)||(23990374-23990735)
chr1 (21-408)||(21152906-21153295)
chr1 (34-421)||(22456711-22457100)
chr1 (101-319)||(22453421-22453641)
chr1 (21-408)||(15296980-15297371)
chr1 (19-151)||(10764829-10764961)
chr1 (369-463)||(10759719-10759811)
chr1 (34-134)||(49147825-49147924)
chr1 (369-421)||(49147745-49147797)
chr1 (207-259)||(44650877-44650929)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (19-463)||(13017393-13017837)
chr6 (22-461)||(22247158-22247598)
chr6 (19-463)||(14790216-14790660)
chr6 (19-463)||(14795244-14795688)
chr6 (22-461)||(22221323-22221763)
chr6 (19-463)||(20527367-20527810)
chr6 (19-460)||(16883277-16883717)
chr6 (19-463)||(32704458-32704901)
chr6 (19-463)||(1838071-1838515)
chr6 (20-463)||(19664870-19665312)
chr6 (34-421)||(12983598-12983989)
chr6 (156-460)||(32426969-32427271)
chr6 (34-408)||(12980711-12981089)
chr6 (237-463)||(15534686-15534912)
chr6 (20-194)||(15534923-15535097)
chr6 (19-160)||(30978415-30978557)
chr6 (21-291)||(7769594-7769872)
chr6 (127-245)||(15538036-15538155)
chr6 (19-86)||(27649077-27649144)
chr6 (375-463)||(15537881-15537966)
chr6 (37-81)||(32427281-32427325)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (19-456)||(2807-3248)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (19-463)||(6014-6457)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (22-352)||(24389-24722)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (19-315)||(9606-9905)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (19-461)||(12575503-12575945)
chr8 (19-393)||(13096686-13097062)
chr8 (21-454)||(44007909-44008335)
chr8 (19-293)||(41778945-41779213)
chr8 (357-457)||(41779220-41779318)
chr8 (19-81)||(14418445-14418507)
chr8 (22-72)||(41836429-41836479)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (172-463)||(1-292)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (19-81)||(211-273)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11279556 - 11279090
Alignment:
Q  1 ttggtttttagaagattgag-----tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattattta 95  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11279556 ttggtttttagaagattgagagaagtatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattattta 11279457  T
Q  96 atttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  11279456 gtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttgacctaggattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatctgaaaccg 11279357  T
Q  196 ttggaagtatttaagaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtta 295  Q
    ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279356 ttggaggtattaatgaacgttaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtta 11279257  T
Q  296 aaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacac 394  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11279256 aaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatgttcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaagcac 11279157  T
Q  395 aaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279156 aaggtaatatgaataaagactaaactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 11279090  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 469
Target Start/End: Original strand, 36222489 - 36222962
Alignment:
Q  1 ttggtttttagaagattgag-----tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattattta 95  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36222489 ttggtttttagaagattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaatcaatgattattta 36222588  T
Q  96 atttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 195  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36222589 gtttcactacaaattaacttagtaattttacctaatctcttgacctagaattctcc-----agtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccg 36222683  T
Q  196 ttggaagtatttaagaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtta 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36222684 ttggaagtatttaagaacgttaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaatctattagctagttcagagtta 36222783  T
Q  296 aaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacac 394  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36222784 aaagcgagggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcatgttcataaagctagggctagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacac 36222883  T
Q  395 aaggtaatatgaa-taaagactaaacttttattgaatat----ttcaaaggagttcaacaaattagggttcccacaggtt 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36222884 aaggtaatatgaattaaagactaaactttcattgaatatgatattcaaa-gagttcaacaaattaggattcccataggtt 36222962  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 46846516 - 46846957
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  46846516 agtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaat 46846615  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||  |||| | |||    
T  46846616 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaactgaattcgaaaacgttggaggttttaaaagatcgtta 46846715  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  46846716 atccctatgtcataacctaataataatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacttagttcagagttaaaagtcagggttagtgatcatt 46846815  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846816 caatttccatgatcaatatgcatgttc---aagctagggttaatagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 46846912  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846913 aactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 46846957  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 33313033 - 33312593
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  33313033 atggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacgaattaacttagtaat 33312934  T
Q  122 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacattaatc 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||    
T  33312933 tctacccaatcttttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaaatgaattcgaaaccggcggaggtattaaaagaacgttaatc 33312834  T
Q  221 tctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaa 319  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  33312833 catatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacatattacctagttcagagttaaaagtcagggttagtggtcattcaa 33312734  T
Q  320 tttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaac 419  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33312733 tttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaat 33312634  T
Q  420 ttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccc 462  Q
    ||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33312633 tttcatt-aat-gttcaatggagttcaacaaattagggttccc 33312593  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 17863298 - 17863742
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  17863298 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 17863397  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||    
T  17863398 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 17863497  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  17863498 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 17863597  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  17863598 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 17863697  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17863698 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 17863742  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 17866557 - 17867001
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    ||||||||| || | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  17866557 agtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 17866656  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
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T  17866657 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 17866756  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  17866757 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 17866856  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  17866857 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 17866956  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
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T  17866957 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 17867001  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 23759812 - 23760256
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
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T  23759812 agtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 23759911  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacatta 217  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| |||    
T  23759912 taattctacccaatctcttgccctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccattggaggtattaacgaacgtta 23760011  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23760012 atccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcggagttaaaagccagggttagtggtcatt 23760111  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||  || | ||| || |||||| |||| || | | ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  23760112 caatttctatgatcaatatgcatattcacgacgctaggattaatagtctatcataaacgtacataaggtactaagcacaaagtaatatgaataaaaacta 23760211  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760212 aactttcatt-aat-gttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 23760256  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6967189 - 6966745
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||  |||    
T  6967189 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagt 6967090  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||    
T  6967089 aattctacccaatctcttaacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 6966990  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  6966989 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 6966890  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | || || ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  6966889 taatctctaagatcagtttgaatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 6966790  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6966789 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 6966745  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23108025 - 23107597
Alignment:
Q  23 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaatt 122  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  23108025 tggttaagaccttcgaatcatccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacaacagattaacttagtaact 23107926  T
Q  123 ctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacattaatct 221  Q
    ||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||  |||||| ||||||     
T  23107925 ctacccaattccttgagctataattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaattgtttgaggtattaaaagaacgttaatcc 23107826  T
Q  222 ctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaag-ggaggttagtggtcattcaat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||||    
T  23107825 ctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtcaaaagtctgggtcagtggtcattcaat 23107726  T
Q  321 ttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaact 420  Q
     || |  |||||| ||||| ||||||| | ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23107725 ctctactatcaatttgcatattcataacgttagggttaatagtcgatgataaacatgcaaaaagcattaaacaaaaagtaatatgaataaagactaaact 23107626  T
Q  421 tttattgaatatttcaaaggagttcaacaaa 451  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||    
T  23107625 ttcattga--aattcaaaggagttcaacaaa 23107597  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 465
Target Start/End: Original strand, 36843141 - 36843587
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  36843141 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaatt 36843240  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||| |||    
T  36843241 aactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgtta 36843340  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggagg-ttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  36843341 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccaggattagtggtcatt 36843440  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaac-atacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagact 415  Q
    |||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36843441 caatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacaatataaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaact 36843540  T
Q  416 aaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcccaca 465  Q
    | ||||| |||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36843541 agactttcattga--cattcaaa-gagttcaacaaattagagttcccaca 36843587  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 294906 - 294462
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  294906 agtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaacaaagt 294807  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | | ||| |||    
T  294806 aattatacccaatctcttgaactagaattctccccataagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggatgttttaacaaaacgtta 294707  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  294706 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 294607  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || | ||||||| ||||| |||||||| |||| | || | ||  || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || | ||    
T  294606 caatctctaagatcaatttgcatattcataaaactagagttaatagttcatgataaacatacaataagcattaaacataaagtaatatgaattaaaatta 294507  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  294506 tactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaactagggttccca 294462  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 24783450 - 24783003
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||  |||    
T  24783450 agtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgagagattaacaaagt 24783351  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||| |||    
T  24783350 aattatacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagattttaacagaacgtta 24783251  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttg---attacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtc 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||    
T  24783250 atccctatgtcataacctaataatgatatatctctagcttgattattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtc 24783151  T
Q  314 attcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaaga 413  Q
    ||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |    
T  24783150 attcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcatcaaacataaagtaatatggattaaaa 24783051  T
Q  414 ctaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24783050 ctagactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaactacggttccca 24783003  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9765843 - 9765398
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacga---------cagat 109  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||         |||||    
T  9765843 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgagtttcacggcagat 9765744  T
Q  110 taacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta- 208  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||| || || || || |     
T  9765743 taacaaagtaactctacccaatctcttgacctataattctccctgcaagtaaaatacccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattagaggttttaac 9765644  T
Q  209 agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggtta 307  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||  | |||||    
T  9765643 aaaacattagtccttatgtcataacctaataatcatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagaccagagtcaaaagtcagggtta 9765544  T
Q  308 gtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaa 407  Q
    |||||||||||||      ||||||| ||||| | ||||||||||||| || | ||||||  ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  9765543 gtggtcattcaat-----cgatcaatttgcatatccataaagctagggttaatagtcgatggtaaacatgcaaaacgcattaaacataaagtaatatgaa 9765449  T
Q  408 taaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttc 460  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9765448 taaaaactagacttttatt-cata-ttcaaagaagttcaacaaattagggttc 9765398  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 460
Target Start/End: Original strand, 3862149 - 3862540
Alignment:
Q  66 tgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataac 165  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| || ||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3862149 tgcactcctaattcaagaaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaac 3862248  T
Q  166 cc----gttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa--gaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttga 259  Q
    ||     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |  | |||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  3862249 cccttaattaatgtcttaagtgaattcaaaactgttggaagt-tttaaccgtcctttaatccctatatcataacctaataattttctatctctagcttaa 3862347  T
Q  260 ttacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggcta 358  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| | || ||| | || || | ||||  || ||       ||||||    
T  3862348 ttacttaggttaaacacaccacctagttcagagtttaaagccagggttagtggtcaattaagttctaagaccagtctgcaaatttat-------gggcta 3862440  T
Q  359 gtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggt 458  Q
    || ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3862441 gtagtcaataataaacatacacaaagcattaaaaacaagatgatataaataaaaactagactttcattg-atattt-aaaggagttcaacaaattagggt 3862538  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 23313464 - 23313645
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||   ||    
T  23313464 agtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacaacatattaacactgt 23313563  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttgga 200  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23313564 aactctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtggaaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttgga 23313645  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 302 - 463
Target Start/End: Original strand, 23313690 - 23313849
Alignment:
Q  302 aggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaa 401  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23313690 aggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggtttgtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaa 23313789  T
Q  402 tatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23313790 catgaataaagactagactttcattg-ata-ttcaaaggagtttaacaaattagagttccca 23313849  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 460
Target Start/End: Original strand, 35773058 - 35773176
Alignment:
Q  341 ttcataaagctagggctagtggtcgattataaaca-tacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaag 439  Q
    ||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    ||||||     
T  35773058 ttcataaagttagggttagtagttgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattga--cattcaaat 35773155  T
Q  440 gagttcaacaaattagggttc 460  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  35773156 gagttcaacaaattagagttc 35773176  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2719435 - 2719331
Alignment:
Q  169 ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttag 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| | ||||||| ||  ||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||| |||     
T  2719435 ttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtttttatagatcgttaatctataaatcataacttaacaattgtctatctctagcttaattaattaa 2719336  T
Q  268 gttaa 272  Q
    |||||    
T  2719335 gttaa 2719331  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27796726 - 27796636
Alignment:
Q  169 ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacat--taatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagctt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||  ||||| |||  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  27796726 ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaagaccattataatcgctaaatcataacttaacaattgtctatctctagctt 27796636  T

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Target: chr2 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16294940 - 16294550
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16294940 agtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagt 16294841  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacattaa 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16294840 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaagaacgttaa 16294741  T
Q  219 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggag-gttagtggtcattc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16294740 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaagccagagttagtggtcattc 16294641  T
Q  318 aatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294640 aatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacacaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 16294550  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 22 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 31626588 - 31626199
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31626588 atggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaattattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 31626489  T
Q  122 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacattaatc 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  31626488 tctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaatc 31626389  T
Q  221 tctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaa 319  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  31626388 cttatgttataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaa 31626289  T
Q  320 tttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaata 409  Q
    |||| || ||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31626288 tttctataatcaatatgtatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaaacattaaacacagggtaatatgaata 31626199  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31528431 - 31527987
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31528431 agtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttag 31528332  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacatta 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||    
T  31528331 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaacgaacgtta 31528232  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  31528231 atccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcatt 31528132  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||| || |||||| |||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  31528131 caatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaacta 31528032  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528031 aactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 31527987  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Original strand, 23673549 - 23673992
Alignment:
Q  20 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 119  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||  ||||    
T  23673549 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaagta 23673648  T
Q  120 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaa 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||| ||||    
T  23673649 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacagttggaggttttaacagaacgttaa 23673748  T
Q  219 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattc 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | || ||||||||||||    
T  23673749 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggatagtggtcattc 23673848  T
Q  318 aatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaa 417  Q
    ||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||     
T  23673849 aatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactag 23673948  T
Q  418 acttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23673949 actttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattaaggttccca 23673992  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40018021 - 40017575
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaa---tttcacgacagattaactt 115  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||||     
T  40018021 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaactc 40017922  T
Q  116 agtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaaca 214  Q
    |||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||     
T  40017921 agtacttctccccaatcctttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccc-ttattctcttaagtgaattcgaaactgttggaggtattaaaagaacg 40017823  T
Q  215 ttaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggaggtt-agtggtc 313  Q
    |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||    
T  40017822 ttaattcatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcaaagtcaaaagccagggtcagtggtc 40017723  T
Q  314 attcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaaga 413  Q
    ||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40017722 attcaatctctacgatcaatttgcatattcataaagatagggtcagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaaga 40017623  T
Q  414 ctaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40017622 ctaaactttcattga--aattcaaaggagttcaacaaattagggttccca 40017575  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 36326967 - 36326522
Alignment:
Q  20 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 119  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||    
T  36326967 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaatttaacgatagattaacaaagta 36326868  T
Q  120 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattc----gaaaccgttggaagtattta-agaaca 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||     ||||| |||||| ||||| | |||||     
T  36326867 attctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattaatttgaaactgttggaggtattaacagaacg 36326768  T
Q  215 ttaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtc 313  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||  | |||||||||||    
T  36326767 ttaatccctgtgtcatagcctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcaaagtcaaaagccagggttagtggtc 36326668  T
Q  314 attcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaaga 413  Q
    ||||||| || | |||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  36326667 attcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaac--acaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaa 36326570  T
Q  414 ctaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36326569 ctagactttcattg-ata-ttcaaatgagttcaacaaactagggttccca 36326522  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Original strand, 32575890 - 32576331
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32575890 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattatttagtttcacgacagattaacttagt 32575989  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    || |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||  |||||| |||    
T  32575990 aactctaccaaatcccttgacctagaattctccccacaagtgacaaccccttaatctcttgactgaattcgaaattgttggaggtattaaaagaacgtta 32576089  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  | ||| |||| |||||    
T  32576090 atccctatgtcgtaacctaataaagatctatctttagcttgattatttaggttaaacatattacctagttcatagtcaaaagacagggtcagtgatcatt 32576189  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| |  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||   ||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  32576190 caatctatacgatcaatttgcatattcataaagttaggatcagtagtcaatgataaacatgcaaaaagcatt-aacaaaaagtaatatggataaagacta 32576288  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32576289 aactttcattga--aattcaaaggagttcaacaaattagggttcc 32576331  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13710113 - 13709721
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaa-gttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || ||| | |||| |||| ||||||||||||||| || |  |||||||||| || ||  || ||||||||||  ||    
T  13710113 agtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaatttaggcaatgattatctagttcaacaacagattaacaaag 13710014  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatt 216  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || || | | ||| ||    
T  13710013 taattctacccgatctcttgacccataattctcccctcaagtgacaaccccataatctctttagtgaattcgaaatcgttggaggttttaacaaaacgtt 13709914  T
Q  217 aatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggagg-ttagtggtcat 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||||    
T  13709913 aatccctatgtcataacctaataatgatctatatctagcttgattacttgggttaaacttatcacctaggtcagagtcaaaatccagggttagtggtcat 13709814  T
Q  316 tcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
    ||||| || | ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13709813 tcaatctctaagatcaatttacatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaat 13709721  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8426830 - 8426766
Alignment:
Q  227 tcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcaga 291  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  8426830 tcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacatgtttcctagatcaga 8426766  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8427260 - 8427199
Alignment:
Q  25 gttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatg 87  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8427260 gttaagacattcgaatcatccgatgttcttatttggtaatttgcacccct-gttcaatcaatg 8427199  T

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Target: chr5 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 461
Target Start/End: Original strand, 26712549 - 26712991
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26712549 atggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 26712648  T
Q  122 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacattaatc 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  26712649 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatc 26712748  T
Q  221 tctatgtcataacctaata---atgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  26712749 cctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcatt 26712848  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712849 caatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 26712948  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712949 aactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 26712991  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 461
Target Start/End: Original strand, 26982287 - 26982729
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26982287 atggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 26982386  T
Q  122 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacattaatc 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  26982387 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatc 26982486  T
Q  221 tctatgtcataacctaata---atgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  26982487 cctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcatt 26982586  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982587 caatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 26982686  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982687 aactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 26982729  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 33575131 - 33574686
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33575131 agtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 33575032  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacatt 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||    
T  33575031 taattctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaatgtt 33574932  T
Q  217 aatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcat 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  33574931 aatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagttagggttagtggtcat 33574832  T
Q  316 tcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagact 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33574831 tcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaact 33574732  T
Q  416 aaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574731 aaactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 33574686  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 15532404 - 15532848
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15532404 agtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttag 15532503  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacatta 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||    
T  15532504 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaacgaacgtta 15532603  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15532604 atccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcatt 15532703  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||| || |||||| |||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15532704 caatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaacta 15532803  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532804 aactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 15532848  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 15542586 - 15543030
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15542586 agtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttag 15542685  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacatta 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||    
T  15542686 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttgatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaacgaacgtta 15542785  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15542786 atccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcatt 15542885  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||| || |||||| |||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15542886 caatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaacta 15542985  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542986 aactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 15543030  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 14616632 - 14617073
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  14616632 agtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 14616731  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | | ||| |||    
T  14616732 aattctacccaatctcttgacctataattctccccgcaagtgacaagcccttaatctcttgagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacaaaacgtta 14616831  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  14616832 atccatatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccatggttagtggtcatt 14616931  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  14616932 caatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtattcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaacta 14617031  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttc 460  Q
     ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14617032 gactttcattg-atattt-aaaggagttcaacaaactagggttc 14617073  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34405890 - 34405446
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  34405890 agtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 34405791  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||    
T  34405790 aattctacccaatctcttgacctagaattctcctcgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 34405691  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  34405690 atccctatctcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 34405591  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  34405590 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 34405491  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405490 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 34405446  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 22159784 - 22159342
Alignment:
Q  21 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||| ||||||||  |||||    
T  22159784 tatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatctagttcaacgatagattaacaaagtaa 22159685  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaat 219  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||| |||||    
T  22159684 ctctacccaatctcttgacctagagttctccccacaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaat 22159585  T
Q  220 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattca 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  22159584 ccctatgtcataacctaataatgatctatctctagtttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccagggttaatggtcattca 22159485  T
Q  319 atttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaac-atacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaa 417  Q
    || || |  |||||| || || |||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  22159484 atctctaacatcaatttgtatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactag 22159385  T
Q  418 acttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccc 462  Q
    ||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159384 actttcattga--cattcaaaggagttcaacaaattagggttccc 22159342  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 428
Target Start/End: Original strand, 7650145 - 7650562
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | || ||||||||   ||    
T  7650145 agtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaaagatagattaacaaggt 7650244  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| || || | ||||  |||    
T  7650245 aattctactcaatctctttacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttgagtgaattcgaaatcgctggaggttttaatagaaggtta 7650344  T
Q  218 atctctatgtcataacctaa---------taatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggaggttag 308  Q
    ||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||    
T  7650345 atccctatgtcataacctaaataacctaataatgatctatctctagcttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagcg--gttag 7650442  T
Q  309 tggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
    |||| ||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  7650443 tggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaacatgaat 7650542  T
Q  409 aaagactaaacttttattga 428  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  7650543 aaagactagactttcattga 7650562  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 164 - 463
Target Start/End: Original strand, 11989166 - 11989465
Alignment:
Q  164 acccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgatta 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11989166 accccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatctctatgttaaaacctaataatgatctatctctaacttgatta 11989265  T
Q  263 cttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtg 361  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||| || || ||||||||||||||| ||||     
T  11989266 cataggttaaacctaatacctagatcagagtcaaaagcgaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcataaagctagggttagta 11989365  T
Q  362 gtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989366 gtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 11989463  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 428
Target Start/End: Original strand, 23993447 - 23993649
Alignment:
Q  229 ataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatg 327  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||| ||||| | |||||  | || |||||||||||||| ||| | |    
T  23993447 ataacctaataattgtctatctctagcttaatttcttaggttaaccatatttcctagatcagattcaaaagtcatggctagtggtcattcaagttctaag 23993546  T
Q  328 atcaatatgcattttcataaagctagggc---tagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttta 424  Q
    |||||| |  |  ||||  | ||||| ||   |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||||    
T  23993547 atcaatctatacattcaagatgctagtgctagtagtagtcaatcataaacatacaaacaacattaaacataaggaaatatgaataaa-actatattttta 23993645  T
Q  425 ttga 428  Q
    ||||    
T  23993646 ttga 23993649  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Original strand, 11989069 - 11989133
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctc--atatggtaatttgcactcctagttcaa 81  Q
    |||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11989069 agtaaggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactcctagttcaa 11989133  T

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Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 459
Target Start/End: Original strand, 39563717 - 39564153
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39563717 atggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttatttagtttcacgacagattaacttagtaat 39563816  T
Q  122 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacattaatc 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  39563817 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatc 39563916  T
Q  221 tctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaa 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  39563917 cctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcaga-ttaaaagtcagggttagtggtcattcaa 39564015  T
Q  320 tttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaac 419  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564016 tttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaac 39564115  T
Q  420 ttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggtt 459  Q
    ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39564116 tttcatt-aat-gttcaaaggagttcaacaaattagggtt 39564153  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 22626514 - 22626960
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22626514 agtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 22626613  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||    
T  22626614 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgtt 22626713  T
Q  217 aatctctatgtcataacctaataatgatc-tatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtca 314  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22626714 aatccctatatcataacctaataatgatcttatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtca 22626813  T
Q  315 ttcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagac 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||| || ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  22626814 ttcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaac 22626913  T
Q  415 taaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626914 taaactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 22626960  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 11138772 - 11139216
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11138772 agtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 11138871  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||| ||    
T  11138872 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattcgaaaccataggaggtattaaacgaacgtt 11138971  T
Q  217 aatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcat 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  11138972 aatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattactgaggttaaacctatta-ctatttcagagttaaaagccagggttagtggccat 11139070  T
Q  316 tcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagact 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||  || ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  11139071 tcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtttatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaact 11139170  T
Q  416 aaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139171 aaactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 11139216  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13979528 - 13979088
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13979528 agtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaaacaatgattatttagtttcatgacagattaacttagt 13979429  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||| |||    
T  13979428 aactctatccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttcgaggtattaaaagaacgtta 13979329  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||    
T  13979328 atccctatgtcataacctaataatgatctatctccaacttgattacttaagttaaaactattacctagttcagagtcgaaagtcagggtcagtggtcatt 13979229  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||   |||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  13979228 caatctctacgatcaatttgca-tttcataaagctagggtcagtagtcgatgata---atacgaaaaacattaaacaaaaagtaatatgaaaaaagacta 13979133  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13979132 aactttcattta--aattcaaaggagttcaacaaattagggttccca 13979088  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 35366377 - 35366028
Alignment:
Q  59 ggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaag 158  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||    ||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  35366377 ggtaatttgcaccccaa-ttcaatcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttgacctagaactctctccgcgag 35366279  T
Q  159 tgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagctt 257  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| | ||  ||||| || || | ||  | ||||||  |  |||||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  35366278 tgacaatcccttaatctcttaagtgaattcaagactcttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcatagcctaataattttctatctctaactt 35366179  T
Q  258 gattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaag-ggaggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggc 356  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| ||||  ||||  | ||||| ||    
T  35366178 aattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccaaggctagtggtcattcaagttttaagatcaatttgcacattcacgatgctagtgc 35366079  T
Q  357 tagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35366078 tagtagtcaataataaacata-aaacaacattaaacacaaggtaatatgaat 35366028  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46731531 - 46731396
Alignment:
Q  24 ggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattc 123  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||  ||||| ||    
T  46731531 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacatattaacaaagtaactc 46731432  T
Q  124 tatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 159  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46731431 tacccaatctcttgacctggagttctccccgcaagt 46731396  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 47412184 - 47411841
Alignment:
Q  59 ggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaag 158  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47412184 ggtaatttgcacccacaattcaatcaatgttcatctaatttaacaacagattaacacgataattctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaag 47412085  T
Q  159 tgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagctt 257  Q
    |||         |||||||||||||||||||  ||  || ||  | || | ||    |||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| |||    
T  47412084 tga--------caatctcttaagtgaattcgggactattagagattttaacagtctgttaatctctgagtcacaatctaataattttctatctctaactt 47411993  T
Q  258 gattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggagg-ttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggc 356  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||| | ||||||| | ||| ||||  ||| ||| ||    
T  47411992 aattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaaggcaggactagtgatcattcaagttctaagatcaattttcatattcaagaagttagtgc 47411893  T
Q  357 tagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
    |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  47411892 tagtagtcaataataaacatacaaacaacattaaacacaaggtaatatgaat 47411841  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46731387 - 46731355
Alignment:
Q  222 ctatgtcataacctaataatgatctatctctag 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46731387 ctatgtcataacctaataatgatccatctctag 46731355  T

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Target: scaffold0063 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 462
Target Start/End: Original strand, 7199 - 7639
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7199 atggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 7298  T
Q  122 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacattaatc 220  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  7299 tctattcaatctcttgacttagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatc 7398  T
Q  221 tctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaa 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||| ||||    
T  7399 cctatgtcataacctaataatgatctatctctagctttattacttaggttaaacctattacctagttctgagtaaaaagccagggttagtggtcaatcaa 7498  T
Q  320 tttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaac 419  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  7499 attctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaagcattaaactcaaagtaatatgaataaaaactaaac 7598  T
Q  420 ttttattgaatat-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccc 462  Q
    ||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7599 tttcatt---tatgttcaaaggagttcaacaaattagggttccc 7639  T

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Target: scaffold0500 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2290
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||   |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2732 atggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 2633  T
Q  122 --tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacattaa 218  Q
      ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |    
T  2632 attctactcaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccctaaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttga 2533  T
Q  219 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggagg-ttagtggtcattc 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||     
T  2532 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtcaaacctattacctagttcagagtaaaaagccagggttagtggtcattt 2433  T
Q  318 aatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaa 417  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2432 attttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagttgatgataaacatacataaagcattaaacacaaagtaatatgaataaagactaa 2333  T
Q  418 acttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccc 462  Q
    ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332 actttcattga--agttcaaaggagttcaacaaattagggttccc 2290  T

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Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 12172025 - 12171582
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12172025 agtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 12171926  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacatt 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||    
T  12171925 taattctacccaatctcttgacctacaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgtt 12171826  T
Q  217 aatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcat 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||||||    
T  12171825 aatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattaagaattaaaagccagggttagtggtcat 12171726  T
Q  316 tcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagact 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12171725 tcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaact 12171626  T
Q  416 aaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    ||||||| |||||    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12171625 aaactttcattga--tgttcaaaggagttcaacaaatttgggttcc 12171582  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 647407 - 647851
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    ||||||||||||   |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  647407 agtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 647506  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||    
T  647507 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 647606  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||    
T  647607 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatt 647706  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  647707 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 647806  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647807 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 647851  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Original strand, 26062898 - 26063341
Alignment:
Q  20 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 119  Q
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T  26062898 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagta 26062997  T
Q  120 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaa 218  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||| || |    
T  26062998 actctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttta 26063097  T
Q  219 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattc 317  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  26063098 tccatatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggtt-aacctattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattc 26063196  T
Q  318 aatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaac-atacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26063197 aatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttattagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaacta 26063296  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| |||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26063297 gactttcattga--cattcaaaggagttcaacaaatcagggttccca 26063341  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 650679 - 651117
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  650679 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 650778  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||    
T  650779 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 650878  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||    
T  650879 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatt 650978  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||    | || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  650979 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagttagggttaggaaacaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 651078  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattaggg 457  Q
     ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  651079 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattaggg 651117  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26060626 - 26060192
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 121  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||| ||| ||||||||  |||||     
T  26060626 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagcttcccgatagattaacaaagtaac 26060527  T
Q  122 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatc 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||    
T  26060526 tctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaaataacaaccccttaatgtcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatc 26060427  T
Q  221 tctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaa 319  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  26060426 cctatgtcataacctaataatggtctatctctagcttgattacttaagttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcatggttagtggtcattcaa 26060327  T
Q  320 tttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaac 419  Q
    | || | ||||||| || || ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||    
T  26060326 tctctaagatcaatttgtatattcatgaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaatctagac 26060227  T
Q  420 ttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagg 456  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  26060226 ttttattg-ata-ttcaaaagagttcaacaaactagg 26060192  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 2541925 - 2541483
Alignment:
Q  20 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 119  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||  ||||    
T  2541925 gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagta 2541826  T
Q  120 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaa 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || | | || || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | || || | ||  | ||||    
T  2541825 attttatccaatctcttgacctaaaattcttctcggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcaaaaccattgaaggttttaacagtccgttaa 2541726  T
Q  219 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaag-ggaggttagtggtcattc 317  Q
    || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||    
T  2541725 tccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagttcagagttaaaagccggtgttagtggtcaatc 2541626  T
Q  318 aatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaa 417  Q
    || ||| | |||||   ||||   | || |||||||| || || ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  2541625 aagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacatacgaaaatcattaaacacaagataatatgaataaaaactag 2541526  T
Q  418 acttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||||||||||   || | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2541525 acttttattg---atatgaaaggaattcaacaaattagagttccca 2541483  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 11649440 - 11649490
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactc 72  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11649440 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 11649490  T

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Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13493304 - 13492860
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  13493304 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 13493205  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||    
T  13493204 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaacgtta 13493105  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  13493104 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 13493005  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  13493004 caatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaacta 13492905  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13492904 gactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaactagggttccca 13492860  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13496029 - 13495585
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||   |||    
T  13496029 agtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctactttaacgacagattaagaaagt 13495930  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta--agaacatt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||    
T  13495929 aattatatccaatctcttgacctagaattctacccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggt-tttagcagaacgtt 13495831  T
Q  217 aatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcat 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  13495830 aatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagctagggttagtggtcat 13495731  T
Q  316 tcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagact 415  Q
    ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  13495730 tcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaact 13495631  T
Q  416 aaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13495630 agactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaactagggttccca 13495585  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34066386 - 34065942
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||  |||    
T  34066386 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagt 34066287  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||    
T  34066286 aattctacccaatctcttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaacgtta 34066187  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  34066186 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctaggtcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 34066087  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  34066086 taatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacgtacaaaaagcattaaacataacgtaatatgaattaaaacta 34065987  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     | ||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34065986 gattttcattg-ata-ttcaaaaaagttcaacaaattaggattccca 34065942  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 27282311 - 27282755
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||  ||||| |||||||  |||    
T  27282311 agtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagttcaacgaccgattaacaaagt 27282410  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||  |||||| |||    
T  27282411 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaaaagaacgtta 27282510  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  27282511 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccagggttagtggtcatt 27282610  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || | ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  27282611 caatctctaagatcaattttcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaagatacaaaaaggattaaacataaagtaatatgaattaaaacta 27282710  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27282711 gactttcattg-ata-ttcaaaggtgttcaacaaattagggttccca 27282755  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 23 - 463
Target Start/End: Original strand, 32506062 - 32506501
Alignment:
Q  23 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaatt 122  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||||    
T  32506062 tggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaatt 32506161  T
Q  123 ctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatct 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||     
T  32506162 ctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaacagaacgttaatcc 32506261  T
Q  222 ctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaat 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  32506262 ctatgtcataacctaataatgacctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaat 32506361  T
Q  321 ttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaact 420  Q
     || | |||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||   | || |||| |||    
T  32506362 ctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaatat---ttaaaactagact 32506458  T
Q  421 tttattgaatatt-tcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    || |||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32506459 ttcattg-atattcaaaaaggagttcaacaaactagggttccca 32506501  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39546284 - 39546004
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||    
T  39546284 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgacagattaacaaagt 39546185  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | ||||| |||    
T  39546184 aactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggttttaatagaacgtta 39546085  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaa 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  39546084 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaa 39546004  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1936668 - 1936225
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  |||    
T  1936668 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatctagcttcacgaaagattaacaaagt 1936569  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    || |||| | ||||||||||  || | |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||  |||||  |||    
T  1936568 aactctaccaaatctcttgatttatagttctccccgcaagtaacaatcccttaatctcttaagtgaatttgaaa-cgtttgaggttttaaaagaatgtta 1936470  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |  ||||  | ||||||||||||||    
T  1936469 ttccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcatgattacttaggttaaacttattacctggatcaaattcgaaagccatggttagtggtcatt 1936370  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  1936369 taatctctaagatcaattttcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaacta 1936270  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1936269 gacttccattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattatggttccca 1936225  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 124 - 400
Target Start/End: Original strand, 22104680 - 22104956
Alignment:
Q  124 tatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacattaatctct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  22104680 tatccaatctcttgacctagaattctccccgtaagtgacagacc-ttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggtattaaagaacgttaatccct 22104778  T
Q  224 atgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggag-gttagtggtcattcaattt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||    
T  22104779 atgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaaaccagaattagtggtcattcaattt 22104878  T
Q  323 ccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggta 400  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  22104879 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagagttagtagtcgatgataaacctacacaaaacattaaacacaaggta 22104956  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Original strand, 16190381 - 16190822
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||  | |    
T  16190381 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaaat 16190480  T
Q  119 aat-tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaat----ctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaac 213  Q
    ||| | || |||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||| || ||           
T  16190481 aatatatacccaatctcttgacccataattctccccacgagtgacaaccccttaattaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtttt------- 16190573  T
Q  214 attaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaag-ggaggttagtggt 312  Q
       |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  16190574 ---aatccctatgtcataacctaatattgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagttaaaagccaaggttagtggt 16190670  T
Q  313 cattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaag 412  Q
    ||| |||| || | ||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||     
T  16190671 catccaatctctaggatcaatttgcatattcataaagctaaggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaa 16190770  T
Q  413 actaaacttttattgaatatt----tcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    |||| ||||| |||| |||||    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16190771 actagactttcattg-atattcaaattaaaggagttcaacaaattagggttcc 16190822  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 463
Target Start/End: Original strand, 23990374 - 23990735
Alignment:
Q  101 acgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttgga 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23990374 acgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaaactcttaagtgaattcgaaaccgttgga 23990473  T
Q  201 agtattta-agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaag 299  Q
     || || | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  23990474 ggttttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaag 23990573  T
Q  300 gga-ggttagtggtcattcaatttc--cat--gatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacac 394  Q
      | |||||||||||||||||| ||   ||  ||||||| ||||| |||||||||||     |||| ||| || ||||||||||||||| |||| || |     
T  23990574 ccagggttagtggtcattcaatctcttaattagatcaatttgcatattcataaagct-----tagtagtcaatgataaacatacaaaaaacattgaagat 23990668  T
Q  395 aaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||  |||| ||||| || |||| || ||| || |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23990669 aatataatgtgaattaaaactagac-tttcttaaata-ttcagaggagttcaacaaattagtgttccca 23990735  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21153295 - 21152906
Alignment:
Q  21 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  21153295 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacagattaacacagtaa 21153196  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaat 219  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || | ||  | |||||    
T  21153195 ttctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatttgaaacctttggaggttttaatagtccgttaat 21153096  T
Q  220 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattca 318  Q
    | |||  ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||  | || |||||||||||||    
T  21153095 ccctaaatcataacctaataactgtctatctctagcttaattacttaggttaaatatattccctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattca 21152996  T
Q  319 atttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
    | ||| | | ||||| | ||  ||||  | ||||| |||||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  21152995 agttctaagttcaatttacacattcaagatgctagtgctagtagtcaatcataaacatataaacaacattaaacagaaggaaatatgaat 21152906  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 421
Target Start/End: Original strand, 22456711 - 22457100
Alignment:
Q  34 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 133  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  22456711 ttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaacaaagtaattctacccaatct 22456809  T
Q  134 cttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataa 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||  | ||||||  |  |||||||    
T  22456810 cttgacctagaattctctccgcaagtgacaactc-ttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcataa 22456908  T
Q  233 cctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatca 331  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||    
T  22456909 cctaataattttctatctcttgcttaattacttaggttaaacctattacctaaaacagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatca 22457008  T
Q  332 atatgcattttcataaa-gctagggctagtggtc--gattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactt 421  Q
     | ||||| |||| ||| ||||| |||||| |||   || ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  22457009 gtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtagtcaatataataaacatacaaacaacattgaaca-aaggtaatatgaattaaaactagactt 22457100  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 319
Target Start/End: Original strand, 22453421 - 22453641
Alignment:
Q  101 acgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttgga 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22453421 acgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaactgttgga 22453520  T
Q  201 agtattta-agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaag 299  Q
     || || | ||  | ||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22453521 ggttttaacagtccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacctattacctaaatcagagtcaaaag 22453620  T
Q  300 gga-ggttagtggtcattcaa 319  Q
      | || ||||||||||||||    
T  22453621 ccagggctagtggtcattcaa 22453641  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15297371 - 15296980
Alignment:
Q  21 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||| || | ||||||||||  | || || ||| |||||||||||||  |||||    
T  15297371 tatgattaagaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcaccccaa-ttcaatcaatattcatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 15297273  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaat 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| || || | ||  | |||||    
T  15297272 ttctacccaatctcttgacctagaattctctctgcaagtgacaacccttaaatctcttaagtgaatttgaaactgttggaggttttaacagtccgttaat 15297173  T
Q  220 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggag-gttagtggtcattca 318  Q
    |  |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||  || | |||||||||||||    
T  15297172 ccatgagtcataacctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaaactattacctagatcagattcaaaagccagagctagtggtcattca 15297073  T
Q  319 atttccatgatcaatatgcattttcataaa-gctagggctagtggtc--gattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
    | ||| | ||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| | |   || ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15297072 agttctaagatcaatttgcatattcaaaaatgctagtgctagtagacaatataataaacattgaaacaacattaaacacaaggtaatatgaat 15296980  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10764961 - 10764829
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  10764961 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 10764862  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctcc 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10764861 aattctacccaatctcttgacctagaattctcc 10764829  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10759811 - 10759719
Alignment:
Q  369 ataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10759811 ataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatga-tatt-caaaggagttcaacaaattagggttccca 10759719  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 49147924 - 49147825
Alignment:
Q  34 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 133  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  49147924 ttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatct 49147826  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 49147797 - 49147745
Alignment:
Q  369 ataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactt 421  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  49147797 ataaacatacaaacaacattaaacacaaggtaatatgaattaaaactagactt 49147745  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 44650877 - 44650929
Alignment:
Q  207 taagaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttga 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  44650877 taagaacgttaatttctatgtcataaccaaataatcatctatccctagattga 44650929  T

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Target: chr6 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 13017393 - 13017837
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttca-atcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13017393 agtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 13017492  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacatta 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||    
T  13017493 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaacgaacgtta 13017592  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  13017593 atccctatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaagagccagggttagtggtcatt 13017692  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||| || |||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  13017693 caatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaacta 13017792  T
Q  417 aacttttattgaatat-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017793 aactttcatt---tatgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 13017837  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22247598 - 22247158
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Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
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T  22247598 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaa 22247499  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacattaat 219  Q
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T  22247498 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgttaat 22247399  T
Q  220 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattca 318  Q
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T  22247398 ccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 22247299  T
Q  319 atttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaa 418  Q
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T  22247298 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctatggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaaccaaa 22247199  T
Q  419 cttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
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T  22247198 ctttcattga--tgttcaaaagagttcaacaaattagggttcc 22247158  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 14790660 - 14790216
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Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  14790660 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 14790561  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
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T  14790560 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 14790461  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
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T  14790460 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 14790361  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  14790360 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 14790261  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790260 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 14790216  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 14795688 - 14795244
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  14795688 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 14795589  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||    
T  14795588 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 14795489  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  14795488 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 14795389  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  14795388 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaacta 14795289  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795288 gactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 14795244  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22221763 - 22221323
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Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
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T  22221763 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaa 22221664  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacattaat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || | ||| ||  ||| |||||    
T  22221663 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgttaat 22221564  T
Q  220 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattca 318  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  22221563 ccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattaccttttttagatttaaaagccagggttagtggtcattca 22221464  T
Q  319 atttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaa 418  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22221463 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaa 22221364  T
Q  419 cttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    |||| |||||    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22221363 ctttcattga--tgttcaaaagagttcaacaaattagggttcc 22221323  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 20527367 - 20527810
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  20527367 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaatt 20527466  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || | ||||| |||    
T  20527467 aactttacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaatttgaaaccgttggaggttttaacagaacgtta 20527565  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
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T  20527566 atccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 20527665  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||    
T  20527666 caatctctaaaatcaatttgcatattcataaagctagggttaggagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaatataaagtaatatgaataaagatta 20527765  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
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T  20527766 gactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacacattaaggttccca 20527810  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16883717 - 16883277
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  16883717 agtatggttaagacattcgaatccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatgttcacgaaagattaacacaat 16883618  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | |||||||||    
T  16883617 aaccctacccaatctcttgacctagaattctccccacaagtggcaaccccttaatctcttatgtgaattcaaaaccgttggaggttttaacagaacatta 16883518  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16883517 atccctatg-catcacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagtgagggttagtggtcatt 16883419  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  16883418 caatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaagataaagtaacatgaataaagacta 16883319  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttc 460  Q
     ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883318 gactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttc 16883277  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 32704458 - 32704901
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  32704458 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagt 32704557  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||    
T  32704558 aattctacccaatctcttgaaatagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgtta 32704657  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  32704658 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctatcttgattacttaggttaaacttattacttagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatt 32704757  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
     ||| || | ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| | || ||||    
T  32704758 taatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaat-tgacttaaaacta 32704856  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32704857 gactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 32704901  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1838515 - 1838071
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||    
T  1838515 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatg-taattcgcactcctagttcaatcaacgattatttagttcaacgacagattaacaaagt 1838417  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||  | || | | ||| |||    
T  1838416 aactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaactccttaatctcttaagtgaatttgaaaccattggagattttaacataacgtta 1838317  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  1838316 atccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcatt 1838217  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaac-atacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagact 415  Q
    |||| || |  |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  1838216 caatctctaacatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaact 1838117  T
Q  416 aaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    | ||||| |||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1838116 agactttcattga--cattcaaaggagttcaataaattagggttccca 1838071  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Original strand, 19664870 - 19665312
Alignment:
Q  20 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 119  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||    
T  19664870 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtt-cacgacagattaacaaagta 19664968  T
Q  120 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaa 218  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  | || | ||||| ||||    
T  19664969 actctacccaatatcttgacctagagttctccccgcaagtaacatccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcattggagattttaatagaacgttaa 19665068  T
Q  219 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattc 317  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||| ||||||    
T  19665069 tccctatgtcataacctaat-atgatctatctctatcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagaattaaaagtcagggttagtgatcattc 19665167  T
Q  318 aatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaac-atacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    ||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19665168 aatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaacta 19665267  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| |||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19665268 gactttcattga--cattcaaatgagttcaacaaattagggttccca 19665312  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 421
Target Start/End: Original strand, 12983598 - 12983989
Alignment:
Q  34 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 133  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||| || || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12983598 ttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatct 12983696  T
Q  134 cttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataa 232  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||  | ||||||  | ||||||||    
T  12983697 cttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagtccgttaatccatgtgtcataa 12983796  T
Q  233 cctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatca 331  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||    
T  12983797 cctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatca 12983896  T
Q  332 atatgcattttcataaa-gctagggctagtggtc--gattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactt 421  Q
     | ||||| |||| ||| ||||| ||||||  ||   || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  12983897 gtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtactcaatataataaacatacagacagcattaaacacaaggtaatatgaattaaaactagactt 12983989  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 32427271 - 32426969
Alignment:
Q  156 aagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctag 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32427271 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtattaacagaatgttaatccctatgtcataacataataatgatctatctctag 32427172  T
Q  255 cttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggag-gttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctag 353  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||   || ||||||||||||||||| || | |||| || |||||  || |||||| ||    
T  32427171 attgattacttaggttaaacttattacctagatc--agtcaaaatccagagttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatactcctaaagccag 32427074  T
Q  354 ggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaatt 453  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  32427073 ggttagtggtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaact 32426976  T
Q  454 agggttc 460  Q
    |||||||    
T  32426975 agggttc 32426969  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 408
Target Start/End: Original strand, 12980711 - 12981089
Alignment:
Q  34 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 133  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||| || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12980711 ttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatct 12980809  T
Q  134 cttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctatgtcataa 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || || | ||  | ||||||  |  |||||||    
T  12980810 cttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccgcttaatctcttaagtgaattcgaaattgttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcataa 12980909  T
Q  233 cctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatca 331  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||    
T  12980910 cctaatacttttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatca 12981009  T
Q  332 atatgcattttcataaa-gctagggctagtggtc--gattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 408  Q
     | ||||| |||| ||| ||||| |||||| |||   || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12981010 gtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtagtcaatataataaacatacagacaacattaaacacaaggtaatatgaat 12981089  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 15534912 - 15534686
Alignment:
Q  237 ataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaag-ggaggttagtggtcattcaatttccatgatcaatat 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||   || |||||||||| ||||| || |  |||||| |    
T  15534912 ataatgatctatcactagcttgattacttatgttaaacctattaccaagatcagagttaaaagtcaagtttagtggtcactcaatctctaacatcaattt 15534813  T
Q  336 gcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaac-atacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatattt 434  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||    ||    
T  15534812 tcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattga--catt 15534715  T
Q  435 caaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534714 caaaggagttcaacaaattagggttccca 15534686  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15535097 - 15534923
Alignment:
Q  20 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 119  Q
    ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||  ||||    
T  15535097 gtatggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagta 15534998  T
Q  120 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaacc 194  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15534997 actctaaccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaacc 15534923  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 30978415 - 30978557
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30978415 agtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 30978514  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978515 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 30978557  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 7769594 - 7769872
Alignment:
Q  21 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||  |||||    
T  7769594 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaacaaagtaa 7769693  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctag----aattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaag---tgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaa 212  Q
    |||||  |||||| |||||||||    ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| ||   ||||||||||| | ||||| || || | ||      
T  7769694 ttctactcaatcttttgacctagctataattctctctgcaagtgctaaccccttaatctcttcagtgatgaattcgaaatctttggaggttttaacagtc 7769793  T
Q  213 cattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcaga 291  Q
    | |||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  7769794 cgttaatccctaaatcataacctaataattgtctatctctaacttaattacttaggttaaacatatttcctagatcaga 7769872  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15538155 - 15538036
Alignment:
Q  127 ccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacattaatctctat 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||| |||||| ||||    
T  15538155 ccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacaccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaatccctat 15538056  T
Q  226 gtcataacctaataatgatc 245  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15538055 gtcataacttaataatgatc 15538036  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27649144 - 27649077
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaat 86  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  27649144 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaattcaagcaat 27649077  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 15537966 - 15537881
Alignment:
Q  375 atacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
    |||||||||||||||| || || ||| |||||||||| | || ||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15537966 atacaaaaagcattaa-cataaagtactatgaataaaaattagactttcattgaca--ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 15537881  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 32427325 - 32427281
Alignment:
Q  37 gaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaa 81  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32427325 gaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaa 32427281  T

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Target: scaffold0352 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 456
Target Start/End: Original strand, 2807 - 3248
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    ||||| |||||| | || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||    
T  2807 agtatcgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatatagtttcacgaaagattaaggtagt 2906  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatt-taagaacatta 217  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||| |||    
T  2907 aattctaccaaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaactattggaggtattaaaagaacgtta 3006  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    
T  3007 atccttgtgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacgtattacctagttcagagttgaaagccatggttagtgttcatt 3106  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcat-aaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacaca---aggtaatatgaataaag 412  Q
    ||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  3107 caaattctgtgatcaatttgcatattcataaaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacacaaagaagtaatatgagtaaag 3206  T
Q  413 actaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagg 456  Q
    |||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||||    
T  3207 actaaactttcattta--aattcaaatgagttcaacaaattagg 3248  T

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Target: scaffold0567 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 463
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6457
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||  | |    
T  6014 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaat 6113  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || | ||||| |||    
T  6114 aactctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcattggaggttttaacagaacgtta 6213  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcatt 316  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  6214 aaccctatgtcataacctaataatgatctatctctaggttgattacttagattaaacttattacctagttcagagtcaaaagtcagggttagtggtcatt 6313  T
Q  317 caatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagacta 416  Q
    |||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||     
T  6314 caatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaacact- 6412  T
Q  417 aacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6413 gactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattaaggttccca 6457  T

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Target: scaffold0264 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 352
Target Start/End: Original strand, 24389 - 24722
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  24389 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaa 24488  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacattaat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||| |||||    
T  24489 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttatgtgaattcgaaaccattggaggaattaaataaacgttaat 24588  T
Q  220 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattca 318  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  24589 ccctatatcataacctaataatgatatatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 24688  T
Q  319 atttccatgatcaatatgcattttcataaagcta 352  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24689 atttctatgatcaatatgcatattcataaagcta 24722  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9905 - 9606
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9905 agtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttag 9806  T
Q  118 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacatt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||    
T  9805 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgtt 9706  T
Q  217 aatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcat 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  9705 aatccctatatcataacctaataatgatctatctttagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcat 9606  T

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Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Original strand, 12575503 - 12575945
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||  |||    
T  12575503 agtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatctagtttaacgacagattaacaaagt 12575602  T
Q  119 aattctatccaatctcttga-cctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaaca--t 215  Q
    ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |  |    
T  12575603 aattctacctaatctcttaaacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaattagaaaccattggaggt-tttaacaatacgt 12575700  T
Q  216 taatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtca 314  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||  | ||||||| ||||    
T  12575701 taatccttatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttatgttaaacctattaccttgatcaaagtcaaaagccaaggttagtagtca 12575800  T
Q  315 ttcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagac 414  Q
    |||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||    
T  12575801 ttcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggctagttgttgatgataaagatacaaaaagcgttgaacacaaagtaatatgaataaaaac 12575900  T
Q  415 taaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 461  Q
    || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575901 tagactttcattg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 12575945  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13097062 - 13096686
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  13097062 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctatg-taatttgcactcctaatttaagcaatgattatctagttcaatgaaagattaacaaagt 13096964  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-agaacatta 217  Q
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T  13096963 aattctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatgtcttaagtgaatttgaaaccgtgggaggttttaacagaacgtaa 13096864  T
Q  218 atctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagg---gaggttagtggtca 314  Q
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T  13096863 atccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttagcttaaacttattacctaggtcagagttaaaaggccaggagttagtgatca 13096764  T
Q  315 ttcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaaca 393  Q
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T  13096763 ttcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggatagtagtcgatgataaacatac-aaaagcattaaaca 13096686  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 44008335 - 44007909
Alignment:
Q  21 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 120  Q
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T  44008335 tatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacgatagatta-----gtaa 44008241  T
Q  121 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacattaat 219  Q
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T  44008240 ctctaccaaatccctcgacctagaattctccc-gcaagtgacaactccttaatctcataagtgaatttgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaat 44008142  T
Q  220 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagggag-gttagtggtcattca 318  Q
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T  44008141 ccctgtgtcgtaacctaacaatgatctatttctagcttgattagttaggttaaacttattacctagttcagaatcaaaagccagagtcagtgttcattca 44008042  T
Q  319 atttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaa 418  Q
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T  44008041 atctctacggtcaatttgcattttcataaagctagggtcaatagtcgatgataaacata-aaaaagcattaaacaaagagtaataagaataaagactaaa 44007943  T
Q  419 cttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaatta 454  Q
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T  44007942 ctttaattga--aattcaaaggagttcaacaaatta 44007909  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 41778945 - 41779213
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 118  Q
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T  41778945 agtatggttaagaccttcaaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaat 41779044  T
Q  119 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgataacccgttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaacattaa 218  Q
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T  41779045 aactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatatcttaagtgaattcaaaacc------aaaatgttattatgtcaa 41779138  T
Q  219 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagt 293  Q
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T  41779139 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagt 41779213  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 357 - 457
Target Start/End: Original strand, 41779220 - 41779318
Alignment:
Q  357 tagtggtcgattataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagg 456  Q
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T  41779220 tagtggtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatggataaagactaaactttcattg-atattt-aaaggagttcaacaaattagg 41779317  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14418507 - 14418445
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaa 81  Q
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T  14418507 agtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 14418445  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 41836429 - 41836479
Alignment:
Q  22 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactc 72  Q
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T  41836429 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 41836479  T

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Target: scaffold0665 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 172 - 463
Target Start/End: Original strand, 1 - 292
Alignment:
Q  172 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacattaatctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 270  Q
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T  1 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 100  T
Q  271 aaacctattacctagttcagagttaaaaggga-ggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcattttcataaagctagggctagtggtcgatta 369  Q
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T  101 aaacttattacctagatcagagtcaaaaaccagggttagtagtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatga 200  T
Q  370 taaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttttattgaatatttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 463  Q
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T  201 taaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatg-ata-ttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 292  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Original strand, 211 - 273
Alignment:
Q  19 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaa 81  Q
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T  211 agtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 273  T

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