View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16849_low_2 (Length: 397)

Name: NF16849_low_2
Description: NF16849
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16849_low_2
NF16849_low_2
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (15-390)||(5845-6221)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (14-390)||(138296-138673)
scaffold0021 (124-390)||(76589-76853)
scaffold0021 (144-286)||(10003-10148)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (14-390)||(26071753-26072131)
chr7 (14-390)||(26095540-26095918)
chr7 (14-390)||(3893381-3893772)
chr7 (14-390)||(12753172-12753558)
chr7 (125-390)||(15824105-15824371)
chr7 (124-390)||(44863443-44863711)
chr7 (124-390)||(141869-142136)
chr7 (124-390)||(47287976-47288244)
chr7 (14-390)||(112784-113168)
chr7 (14-288)||(45453745-45454016)
chr7 (14-290)||(1938257-1938532)
chr7 (198-390)||(7286328-7286522)
chr7 (198-390)||(12545607-12545802)
chr7 (199-390)||(18305642-18305831)
chr7 (199-390)||(13867887-13868080)
chr7 (197-390)||(7290908-7291102)
chr7 (14-167)||(15913921-15914075)
chr7 (198-390)||(2192606-2192799)
chr7 (198-390)||(369143-369336)
chr7 (198-390)||(14253071-14253263)
chr7 (198-390)||(16480836-16481029)
chr7 (198-390)||(15952859-15953050)
chr7 (33-198)||(9058141-9058311)
chr7 (124-390)||(49049452-49049723)
chr7 (14-163)||(13388493-13388643)
chr7 (34-218)||(15761867-15762051)
chr7 (34-220)||(32496053-32496242)
chr7 (38-163)||(13376200-13376324)
chr7 (144-390)||(15629004-15629255)
chr7 (54-168)||(20587140-20587254)
chr7 (124-220)||(13867688-13867784)
chr7 (125-390)||(13272976-13273246)
chr7 (54-158)||(8565108-8565212)
chr7 (202-375)||(15762262-15762429)
chr7 (38-217)||(18255324-18255505)
chr7 (34-163)||(3058585-3058713)
chr7 (54-163)||(9322594-9322703)
chr7 (124-220)||(11285619-11285715)
chr7 (54-168)||(28718977-28719091)
chr7 (124-220)||(11582535-11582631)
chr7 (115-254)||(15952673-15952813)
chr7 (124-291)||(16571751-16571921)
chr7 (124-291)||(16593741-16593911)
chr7 (34-147)||(125378-125492)
chr7 (321-390)||(16571983-16572053)
chr7 (321-390)||(16593609-16593679)
chr7 (34-158)||(2027097-2027222)
chr7 (123-220)||(13038808-13038905)
chr7 (198-295)||(2024757-2024858)
chr7 (124-290)||(10862515-10862683)
chr7 (124-259)||(12249771-12249908)
chr7 (124-220)||(12545404-12545501)
chr7 (198-272)||(12545553-12545627)
chr7 (140-212)||(36051075-36051147)
chr7 (115-220)||(369364-369471)
chr7 (40-218)||(10988092-10988271)
chr7 (141-212)||(122987-123059)
chr7 (140-220)||(16210183-16210263)
chr7 (40-217)||(26010695-26010874)
chr7 (173-227)||(18305492-18305546)
chr7 (326-390)||(2024692-2024757)
chr7 (141-217)||(2192376-2192453)
chr7 (115-217)||(15518435-15518539)
chr7 (206-390)||(16416509-16416684)
chr7 (200-272)||(16480710-16480782)
chr7 (315-390)||(45455505-45455581)
chr7 (38-217)||(2436110-2436285)
chr7 (160-254)||(2024904-2024998)
chr7 (54-100)||(4483318-4483364)
chr7 (140-198)||(7291277-7291335)
chr7 (124-217)||(7821406-7821500)
chr7 (124-217)||(7828717-7828811)
chr7 (124-217)||(16416949-16417043)
chr7 (140-217)||(16480605-16480683)
chr7 (124-217)||(27103134-27103228)
chr7 (124-217)||(27110482-27110576)
chr7 (124-217)||(27175098-27175192)
chr7 (124-217)||(38785226-38785320)
chr7 (200-272)||(2192480-2192552)
chr7 (116-168)||(4483268-4483320)
chr7 (198-390)||(11582659-11582840)
chr7 (54-217)||(13757060-13757225)
chr7 (173-220)||(3055193-3055241)
chr7 (115-217)||(25293856-25293960)
chr7 (198-302)||(122854-122951)
chr7 (124-217)||(11514604-11514698)
chr7 (261-390)||(13038989-13039114)
chr7 (124-217)||(15443146-15443240)
chr7 (140-217)||(30263727-30263805)
chr7 (115-192)||(42057741-42057819)
chr7 (74-119)||(3193586-3193630)
chr7 (319-390)||(16209975-16210045)
chr7 (41-110)||(19066193-19066262)
chr7 (75-119)||(13460914-13460958)
chr7 (115-213)||(13912691-13912791)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (14-390)||(31626739-31627117)
chr6 (18-390)||(18775506-18775886)
chr6 (18-390)||(22428473-22428850)
chr6 (14-390)||(16104850-16105237)
chr6 (124-390)||(25646518-25646786)
chr6 (18-390)||(25745792-25746160)
chr6 (198-390)||(35017451-35017645)
chr6 (199-390)||(35011124-35011316)
chr6 (198-390)||(18128340-18128532)
chr6 (198-390)||(18578834-18579027)
chr6 (204-390)||(13622937-13623121)
chr6 (14-139)||(16083970-16084095)
chr6 (199-390)||(19627498-19627690)
chr6 (198-375)||(14628368-14628545)
chr6 (198-390)||(18004857-18005050)
chr6 (14-197)||(18128776-18128964)
chr6 (198-390)||(23975708-23975902)
chr6 (198-390)||(18843708-18843900)
chr6 (124-390)||(13016436-13016702)
chr6 (34-220)||(19984699-19984887)
chr6 (207-367)||(33316422-33316582)
chr6 (14-163)||(18383173-18383323)
chr6 (34-218)||(1554324-1554508)
chr6 (124-245)||(18422182-18422303)
chr6 (14-163)||(33323342-33323492)
chr6 (14-108)||(23151845-23151939)
chr6 (38-218)||(16238848-16239028)
chr6 (33-158)||(17790652-17790776)
chr6 (258-390)||(23151706-23151839)
chr6 (173-390)||(32896282-32896492)
chr6 (14-157)||(16889236-16889379)
chr6 (198-324)||(18825647-18825774)
chr6 (54-168)||(34965470-34965584)
chr6 (14-139)||(35137439-35137565)
chr6 (124-291)||(25369014-25369184)
chr6 (55-198)||(22846615-22846767)
chr6 (38-217)||(11214623-11214803)
chr6 (124-390)||(18397163-18397434)
chr6 (202-375)||(1553946-1554113)
chr6 (54-158)||(16134814-16134918)
chr6 (38-219)||(4989379-4989561)
chr6 (124-208)||(35017303-35017387)
chr6 (54-168)||(19852795-19852909)
chr6 (261-390)||(16827873-16828003)
chr6 (140-212)||(18740863-18740935)
chr6 (38-217)||(1659212-1659387)
chr6 (140-218)||(13622800-13622878)
chr6 (54-168)||(23220222-23220336)
chr6 (40-217)||(14628111-14628289)
chr6 (40-217)||(23976053-23976231)
chr6 (40-217)||(26088319-26088497)
chr6 (116-217)||(33316158-33316260)
chr6 (310-390)||(17787746-17787827)
chr6 (205-272)||(23975956-23976023)
chr6 (124-220)||(16827462-16827559)
chr6 (124-220)||(18004635-18004732)
chr6 (55-197)||(1651466-1651605)
chr6 (200-272)||(14628316-14628388)
chr6 (319-390)||(25173518-25173590)
chr6 (40-193)||(16650745-16650899)
chr6 (124-219)||(18825420-18825515)
chr6 (198-375)||(4989004-4989171)
chr6 (124-289)||(15738590-15738757)
chr6 (204-258)||(16238711-16238765)
chr6 (198-390)||(18740645-18740828)
chr6 (124-217)||(25174040-25174134)
chr6 (124-217)||(27655670-27655764)
chr6 (55-192)||(15861243-15861375)
chr6 (124-228)||(28196439-28196546)
chr6 (40-193)||(16557515-16557669)
chr6 (124-219)||(18843481-18843576)
chr6 (198-272)||(4989201-4989275)
chr6 (124-217)||(10487364-10487458)
chr6 (124-217)||(16377869-16377963)
chr6 (124-217)||(16385193-16385287)
chr6 (321-390)||(18422115-18422185)
chr6 (207-268)||(33316292-33316353)
chr6 (40-217)||(29870975-29871153)
chr6 (198-268)||(16827663-16827733)
chr6 (140-217)||(17343864-17343942)
chr6 (74-119)||(16374954-16374999)
chr6 (115-217)||(16230065-16230169)
chr6 (115-217)||(23993645-23993749)
chr6 (214-272)||(18004770-18004827)
chr6 (198-390)||(19984915-19985096)
chr6 (140-217)||(22227278-22227356)
chr6 (198-272)||(25173731-25173805)
chr6 (319-390)||(18835474-18835544)
chr6 (124-168)||(21930417-21930462)
chr6 (74-119)||(31162441-31162486)
chr6 (152-196)||(32896494-32896538)
[»] chr8 (99 HSPs)
chr8 (14-390)||(37605283-37605668)
chr8 (48-390)||(41243948-41244277)
chr8 (124-390)||(25120745-25121012)
chr8 (124-390)||(19994802-19995078)
chr8 (124-390)||(20479893-20480166)
chr8 (124-390)||(16416537-16416810)
chr8 (199-390)||(18610428-18610620)
chr8 (198-390)||(41508927-41509122)
chr8 (34-306)||(16203832-16204098)
chr8 (203-390)||(24719328-24719513)
chr8 (198-390)||(13664550-13664743)
chr8 (198-390)||(13723825-13724018)
chr8 (209-390)||(22008366-22008548)
chr8 (198-390)||(22909342-22909535)
chr8 (136-390)||(20655677-20655943)
chr8 (14-142)||(41245210-41245338)
chr8 (198-390)||(24108465-24108657)
chr8 (14-163)||(21192234-21192384)
chr8 (14-163)||(21696086-21696236)
chr8 (14-163)||(21199661-21199811)
chr8 (14-158)||(31195772-31195917)
chr8 (14-163)||(23835746-23835895)
chr8 (198-390)||(23509068-23509261)
chr8 (14-198)||(37655134-37655324)
chr8 (34-220)||(29758768-29758956)
chr8 (198-375)||(22323225-22323398)
chr8 (199-390)||(269950-270138)
chr8 (199-390)||(645782-645970)
chr8 (199-390)||(831517-831705)
chr8 (14-163)||(39448310-39448460)
chr8 (199-390)||(16043054-16043245)
chr8 (34-211)||(270226-270401)
chr8 (34-211)||(645519-645694)
chr8 (34-211)||(831254-831429)
chr8 (237-390)||(17343480-17343632)
chr8 (199-390)||(16041378-16041569)
chr8 (14-100)||(37609956-37610042)
chr8 (124-289)||(17731117-17731286)
chr8 (124-212)||(24719077-24719165)
chr8 (54-169)||(22498832-22498947)
chr8 (38-210)||(24930614-24930789)
chr8 (34-212)||(24387203-24387383)
chr8 (54-163)||(23116349-23116458)
chr8 (124-390)||(38531882-38532152)
chr8 (54-168)||(22312190-22312304)
chr8 (54-168)||(45560747-45560861)
chr8 (108-198)||(25294490-25294582)
chr8 (108-198)||(25756479-25756571)
chr8 (63-168)||(33170785-33170890)
chr8 (33-158)||(33612569-33612694)
chr8 (124-291)||(28543270-28543440)
chr8 (272-390)||(6776303-6776422)
chr8 (14-168)||(23153297-23153452)
chr8 (198-390)||(43375310-43375493)
chr8 (124-390)||(18768422-18768691)
chr8 (124-220)||(22008139-22008236)
chr8 (124-247)||(24108245-24108368)
chr8 (198-390)||(3433535-3433718)
chr8 (124-220)||(22323102-22323197)
chr8 (140-212)||(43375202-43375274)
chr8 (40-193)||(22089943-22090097)
chr8 (54-168)||(24238065-24238177)
chr8 (328-390)||(28543151-28543213)
chr8 (124-217)||(23509397-23509491)
chr8 (124-220)||(13664296-13664393)
chr8 (124-220)||(13723571-13723668)
chr8 (40-217)||(3433076-3433254)
chr8 (200-272)||(13664424-13664496)
chr8 (200-272)||(13723699-13723771)
chr8 (40-217)||(21853396-21853574)
chr8 (124-220)||(22909146-22909242)
chr8 (55-197)||(24547724-24547863)
chr8 (40-193)||(15320559-15320713)
chr8 (40-193)||(15500928-15501082)
chr8 (209-272)||(23509315-23509378)
chr8 (261-390)||(23631046-23631173)
chr8 (54-115)||(11543088-11543149)
chr8 (115-217)||(21846065-21846169)
chr8 (14-73)||(25294581-25294641)
chr8 (14-73)||(25756570-25756630)
chr8 (206-390)||(28835980-28836155)
chr8 (205-272)||(3433285-3433352)
chr8 (124-217)||(272786-272880)
chr8 (124-217)||(642969-643063)
chr8 (124-217)||(828775-828869)
chr8 (124-217)||(5236674-5236768)
chr8 (318-390)||(39448573-39448646)
chr8 (40-217)||(16874439-16874617)
chr8 (335-390)||(17731331-17731387)
chr8 (14-100)||(23148481-23148568)
chr8 (198-302)||(29758643-29758740)
chr8 (115-193)||(224737-224816)
chr8 (115-193)||(738360-738439)
chr8 (115-193)||(862255-862334)
chr8 (115-193)||(16675900-16675979)
chr8 (349-390)||(21695899-21695941)
chr8 (124-217)||(24662830-24662924)
chr8 (207-272)||(3433390-3433455)
chr8 (54-94)||(18043091-18043131)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (51-390)||(37760-38101)
[»] chr3 (134 HSPs)
chr3 (14-390)||(50113612-50113991)
chr3 (15-390)||(319099-319486)
chr3 (34-390)||(51159973-51160335)
chr3 (124-390)||(17098913-17099181)
chr3 (16-390)||(12351332-12351709)
chr3 (14-390)||(47786356-47786735)
chr3 (124-390)||(6148457-6148723)
chr3 (124-390)||(30204696-30204961)
chr3 (14-272)||(7852223-7852482)
chr3 (198-390)||(11812801-11812994)
chr3 (124-390)||(16183665-16183945)
chr3 (14-220)||(8630315-8630521)
chr3 (124-390)||(19572430-19572693)
chr3 (124-390)||(22145882-22146145)
chr3 (198-390)||(38166213-38166407)
chr3 (198-390)||(18737974-18738167)
chr3 (14-266)||(14060726-14060980)
chr3 (198-390)||(19944805-19944998)
chr3 (198-390)||(7851683-7851877)
chr3 (198-390)||(30140984-30141177)
chr3 (207-385)||(12796728-12796908)
chr3 (198-390)||(17936455-17936649)
chr3 (14-199)||(38812481-38812671)
chr3 (36-167)||(18008645-18008776)
chr3 (14-212)||(19230535-19230734)
chr3 (33-163)||(15874690-15874820)
chr3 (198-390)||(16819043-16819234)
chr3 (33-163)||(48420197-48420327)
chr3 (14-163)||(55442252-55442404)
chr3 (40-163)||(12490249-12490372)
chr3 (124-390)||(14287323-14287596)
chr3 (34-220)||(2048535-2048723)
chr3 (14-163)||(11330493-11330643)
chr3 (124-390)||(11199144-11199415)
chr3 (54-168)||(5229607-5229721)
chr3 (34-220)||(33340317-33340506)
chr3 (34-220)||(23490980-23491169)
chr3 (124-390)||(35121921-35122189)
chr3 (34-226)||(19945098-19945289)
chr3 (202-333)||(8630101-8630232)
chr3 (34-220)||(10737033-10737219)
chr3 (124-390)||(14296730-14297000)
chr3 (124-390)||(14302357-14302627)
chr3 (38-217)||(14846160-14846339)
chr3 (124-291)||(11062691-11062861)
chr3 (56-168)||(47983418-47983531)
chr3 (56-168)||(47992705-47992818)
chr3 (56-168)||(48001992-48002105)
chr3 (56-168)||(48011278-48011391)
chr3 (282-390)||(54045594-54045703)
chr3 (124-220)||(11813307-11813403)
chr3 (14-168)||(9592239-9592394)
chr3 (198-295)||(13815973-13816070)
chr3 (124-390)||(14523006-14523278)
chr3 (257-390)||(17958169-17958303)
chr3 (40-254)||(49230655-49230869)
chr3 (34-211)||(5227201-5227378)
chr3 (38-217)||(15939959-15940140)
chr3 (40-220)||(17913751-17913933)
chr3 (54-168)||(41660135-41660249)
chr3 (202-363)||(54686551-54686707)
chr3 (315-390)||(11062944-11063020)
chr3 (124-220)||(17957996-17958093)
chr3 (40-218)||(44227903-44228083)
chr3 (202-363)||(9304664-9304819)
chr3 (40-217)||(16819386-16819565)
chr3 (55-254)||(16259487-16259683)
chr3 (257-390)||(25057035-25057166)
chr3 (124-288)||(15516035-15516197)
chr3 (125-220)||(19262602-19262698)
chr3 (304-390)||(13815856-13815943)
chr3 (198-390)||(19230318-19230499)
chr3 (198-272)||(11813179-11813253)
chr3 (124-266)||(12563136-12563281)
chr3 (124-220)||(25057247-25057344)
chr3 (74-163)||(33370914-33371002)
chr3 (315-390)||(17536847-17536923)
chr3 (206-390)||(18908679-18908854)
chr3 (206-390)||(22273034-22273209)
chr3 (40-217)||(27839184-27839362)
chr3 (148-220)||(45581310-45581382)
chr3 (198-265)||(7851968-7852035)
chr3 (140-218)||(15860824-15860902)
chr3 (140-217)||(18905356-18905434)
chr3 (198-272)||(18908892-18908966)
chr3 (198-375)||(49230262-49230429)
chr3 (38-197)||(15613564-15613720)
chr3 (200-272)||(11813048-11813120)
chr3 (124-266)||(17137827-17137969)
chr3 (55-197)||(23081682-23081821)
chr3 (258-390)||(23490768-23490898)
chr3 (205-268)||(16819292-16819355)
chr3 (124-219)||(30141361-30141456)
chr3 (124-217)||(2450910-2451004)
chr3 (74-120)||(11517010-11517056)
chr3 (124-217)||(18909169-18909263)
chr3 (124-217)||(22273524-22273618)
chr3 (122-272)||(40938085-40938236)
chr3 (55-217)||(12266007-12266167)
chr3 (124-197)||(15574545-15574618)
chr3 (40-217)||(16745670-16745848)
chr3 (315-390)||(53900388-53900463)
chr3 (124-217)||(1469236-1469330)
chr3 (198-272)||(7851857-7851931)
chr3 (124-289)||(17536606-17536774)
chr3 (268-390)||(33340038-33340155)
chr3 (125-217)||(15470048-15470141)
chr3 (205-390)||(19262733-19262907)
chr3 (40-217)||(30151813-30151991)
chr3 (328-390)||(12563334-12563397)
chr3 (124-198)||(12951476-12951555)
chr3 (318-390)||(39654163-39654237)
chr3 (115-217)||(8269976-8270080)
chr3 (115-217)||(8277087-8277191)
chr3 (115-217)||(8305896-8306000)
chr3 (320-390)||(14061039-14061110)
chr3 (115-217)||(53769137-53769241)
chr3 (115-193)||(13956378-13956457)
chr3 (115-193)||(13977211-13977290)
chr3 (38-85)||(18905296-18905343)
chr3 (115-193)||(41268743-41268822)
chr3 (115-193)||(45859521-45859600)
chr3 (124-271)||(53900177-53900326)
chr3 (115-193)||(55314883-55314962)
chr3 (198-272)||(2451155-2451229)
chr3 (198-272)||(22273247-22273321)
chr3 (198-272)||(49230509-49230583)
chr3 (205-254)||(2451035-2451084)
chr3 (257-306)||(10736904-10736953)
chr3 (124-169)||(11883923-11883968)
chr3 (124-169)||(14291910-14291955)
chr3 (124-168)||(38377415-38377460)
chr3 (257-306)||(45581181-45581230)
chr3 (124-163)||(15989508-15989548)
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (14-390)||(4863551-4863943)
chr5 (14-390)||(27185318-27185699)
chr5 (74-390)||(21661268-21661593)
chr5 (124-390)||(21392432-21392698)
chr5 (198-390)||(34937571-34937764)
chr5 (198-390)||(10307-10500)
chr5 (198-390)||(10780112-10780305)
chr5 (14-167)||(32967661-32967815)
chr5 (198-390)||(43445708-43445901)
chr5 (33-163)||(23492532-23492662)
chr5 (198-390)||(28257781-28257970)
chr5 (198-390)||(22885041-22885234)
chr5 (33-198)||(24226976-24227146)
chr5 (204-390)||(25211796-25211982)
chr5 (204-390)||(25275948-25276134)
chr5 (33-169)||(21615535-21615671)
chr5 (201-390)||(17473704-17473892)
chr5 (14-158)||(7727112-7727257)
chr5 (207-375)||(19497952-19498120)
chr5 (14-169)||(19860756-19860912)
chr5 (14-167)||(28888441-28888598)
chr5 (124-272)||(11582266-11582414)
chr5 (198-390)||(11579922-11580113)
chr5 (124-270)||(1170321-1170467)
chr5 (14-163)||(13793659-13793809)
chr5 (33-163)||(37189637-37189767)
chr5 (124-390)||(23453184-23453454)
chr5 (124-390)||(23460428-23460698)
chr5 (124-390)||(23464689-23464959)
chr5 (40-272)||(1221351-1221584)
chr5 (199-390)||(23986165-23986359)
chr5 (248-390)||(1171320-1171464)
chr5 (198-390)||(9732592-9732782)
chr5 (198-390)||(1221638-1221826)
chr5 (54-168)||(11964472-11964586)
chr5 (124-390)||(24184869-24185137)
chr5 (124-390)||(24470555-24470804)
chr5 (124-220)||(21653052-21653148)
chr5 (40-220)||(11213222-11213404)
chr5 (40-220)||(110604-110785)
chr5 (54-168)||(20455627-20455741)
chr5 (124-254)||(22884887-22885017)
chr5 (140-220)||(17473568-17473648)
chr5 (140-306)||(23510313-23510473)
chr5 (198-390)||(29192671-29192857)
chr5 (202-383)||(17907853-17908030)
chr5 (54-254)||(35792767-35792964)
chr5 (124-254)||(16534750-16534881)
chr5 (198-390)||(35793162-35793345)
chr5 (198-272)||(10554-10628)
chr5 (140-254)||(18779790-18779904)
chr5 (124-220)||(22368188-22368285)
chr5 (40-217)||(19498280-19498458)
chr5 (124-220)||(28257998-28258093)
chr5 (205-272)||(9732495-9732562)
chr5 (40-220)||(10779799-10779980)
chr5 (186-390)||(11338584-11338802)
chr5 (198-390)||(25944566-25944750)
chr5 (198-390)||(11340599-11340782)
chr5 (40-217)||(11341116-11341294)
chr5 (198-390)||(18780052-18780235)
chr5 (115-217)||(25425102-25425206)
chr5 (205-272)||(11341018-11341085)
chr5 (124-217)||(10831-10925)
chr5 (198-375)||(110990-111157)
chr5 (124-198)||(5452432-5452511)
chr5 (206-272)||(19498182-19498248)
chr5 (54-217)||(43445390-43445555)
chr5 (40-217)||(4201586-4201764)
chr5 (115-217)||(9732360-9732464)
chr5 (198-390)||(16534391-16534574)
chr5 (151-247)||(25211623-25211719)
chr5 (151-247)||(25275775-25275871)
chr5 (319-375)||(25424680-25424736)
chr5 (208-272)||(25944472-25944536)
chr5 (200-272)||(43445582-43445654)
chr5 (124-217)||(21075192-21075286)
chr5 (124-217)||(21933863-21933957)
chr5 (124-217)||(21940033-21940127)
chr5 (198-272)||(22368337-22368411)
chr5 (124-217)||(29192321-29192415)
chr5 (124-217)||(35580735-35580829)
chr5 (124-217)||(37010867-37010961)
chr5 (124-198)||(3672421-3672497)
chr5 (200-272)||(10780011-10780082)
chr5 (319-390)||(22368602-22368674)
chr5 (40-217)||(24594981-24595159)
chr5 (54-193)||(23327458-23327598)
chr5 (115-217)||(27008492-27008596)
chr5 (198-268)||(110888-110957)
chr5 (318-390)||(7726919-7726993)
chr5 (116-217)||(25902021-25902123)
chr5 (214-272)||(29192583-29192641)
chr5 (124-217)||(37051465-37051559)
chr5 (258-295)||(21653228-21653265)
chr5 (34-66)||(21649463-21649495)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (124-390)||(256560-256827)
scaffold0011 (140-220)||(125009-125089)
scaffold0011 (140-218)||(72028-72106)
scaffold0011 (140-218)||(76409-76487)
scaffold0011 (140-212)||(192985-193057)
scaffold0011 (260-390)||(72191-72317)
scaffold0011 (260-390)||(76572-76698)
scaffold0011 (261-390)||(125173-125298)
scaffold0011 (257-390)||(192768-192897)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (14-390)||(21961053-21961440)
chr4 (102-390)||(12837900-12838192)
chr4 (26-390)||(12901269-12901631)
chr4 (124-390)||(44345057-44345333)
chr4 (123-390)||(33738477-33738732)
chr4 (198-390)||(18166874-18167067)
chr4 (14-198)||(8873978-8874162)
chr4 (198-390)||(34393385-34393580)
chr4 (198-390)||(53909555-53909750)
chr4 (124-390)||(16366361-16366624)
chr4 (33-218)||(14899948-14900136)
chr4 (199-390)||(19699414-19699606)
chr4 (199-390)||(19709999-19710191)
chr4 (14-167)||(34197658-34197812)
chr4 (198-390)||(7134310-7134503)
chr4 (198-390)||(8372607-8372800)
chr4 (14-167)||(37958550-37958704)
chr4 (198-390)||(15274470-15274663)
chr4 (14-158)||(27959563-27959708)
chr4 (34-220)||(109957-110143)
chr4 (14-163)||(12245745-12245895)
chr4 (198-390)||(26678179-26678370)
chr4 (124-390)||(44054168-44054427)
chr4 (124-390)||(45460611-45460894)
chr4 (33-163)||(15852829-15852959)
chr4 (33-155)||(41167447-41167569)
chr4 (34-272)||(15211762-15212004)
chr4 (124-390)||(13244606-13244861)
chr4 (196-390)||(53706635-53706828)
chr4 (124-390)||(13811287-13811558)
chr4 (124-390)||(30236147-30236411)
chr4 (198-390)||(22356424-22356616)
chr4 (217-390)||(20813715-20813890)
chr4 (209-390)||(47355509-47355688)
chr4 (124-212)||(53909431-53909519)
chr4 (14-198)||(41257842-41258031)
chr4 (54-168)||(5372228-5372342)
chr4 (54-168)||(10238967-10239081)
chr4 (245-390)||(18294600-18294746)
chr4 (54-163)||(47469867-47469976)
chr4 (38-190)||(16521294-16521447)
chr4 (40-220)||(5684404-5684586)
chr4 (58-168)||(50223696-50223806)
chr4 (124-216)||(43283043-43283138)
chr4 (198-390)||(15211515-15211698)
chr4 (310-390)||(8874265-8874346)
chr4 (124-220)||(10642586-10642683)
chr4 (40-217)||(19999005-19999183)
chr4 (216-272)||(34393610-34393666)
chr4 (124-193)||(52267125-52267196)
chr4 (154-230)||(53706515-53706591)
chr4 (206-308)||(55378542-55378646)
chr4 (205-272)||(8372854-8372921)
chr4 (205-272)||(18167097-18167164)
chr4 (124-390)||(18496065-18496334)
chr4 (140-210)||(54119906-54119976)
chr4 (151-272)||(7134088-7134208)
chr4 (257-390)||(9293712-9293843)
chr4 (124-220)||(9293924-9294021)
chr4 (257-390)||(10642374-10642505)
chr4 (40-219)||(22356065-22356244)
chr4 (115-217)||(15138134-15138238)
chr4 (198-390)||(19998517-19998700)
chr4 (115-217)||(26678522-26678626)
chr4 (115-217)||(47355803-47355907)
chr4 (205-268)||(26678428-26678491)
chr4 (140-217)||(8372951-8373029)
chr4 (124-217)||(14994678-14994772)
chr4 (140-217)||(18167195-18167273)
chr4 (124-217)||(18246668-18246762)
chr4 (206-272)||(19998907-19998973)
chr4 (34-80)||(25120617-25120663)
chr4 (140-220)||(15274361-15274442)
chr4 (207-272)||(19998780-19998845)
chr4 (205-273)||(13751910-13751978)
chr4 (319-390)||(18246178-18246250)
chr4 (208-272)||(47355705-47355769)
chr4 (144-270)||(7848776-7848902)
chr4 (198-390)||(16520801-16520985)
chr4 (257-390)||(54120066-54120195)
chr4 (317-383)||(55378691-55378757)
chr4 (14-51)||(34393690-34393727)
chr4 (115-217)||(14950498-14950602)
chr4 (205-306)||(109828-109922)
chr4 (124-184)||(15043381-15043443)
chr4 (124-184)||(15110981-15111043)
chr4 (207-272)||(16521015-16521080)
chr4 (124-180)||(53706465-53706521)
chr4 (160-254)||(16521168-16521263)
chr4 (124-217)||(10487149-10487243)
chr4 (124-217)||(16329508-16329602)
chr4 (55-97)||(17213378-17213420)
chr4 (198-272)||(18246391-18246465)
chr4 (54-100)||(24237479-24237525)
chr4 (246-290)||(43283140-43283185)
chr4 (326-385)||(5684742-5684802)
chr4 (115-217)||(13049739-13049843)
chr4 (124-168)||(17377040-17377084)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (14-390)||(59865-60250)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (14-390)||(35053141-35053515)
chr1 (124-390)||(22407894-22408162)
chr1 (124-390)||(2422733-2422997)
chr1 (14-272)||(5676091-5676355)
chr1 (198-390)||(41217544-41217739)
chr1 (206-390)||(5676350-5676535)
chr1 (14-195)||(41217945-41218126)
chr1 (14-220)||(20444214-20444420)
chr1 (199-390)||(20252342-20252534)
chr1 (14-220)||(37845956-37846162)
chr1 (14-220)||(20529978-20530185)
chr1 (124-262)||(49966013-49966151)
chr1 (33-163)||(38035130-38035260)
chr1 (14-158)||(13378250-13378395)
chr1 (198-390)||(9786123-9786315)
chr1 (124-390)||(35524082-35524350)
chr1 (35-158)||(19601713-19601836)
chr1 (14-163)||(36357826-36357976)
chr1 (33-163)||(37235470-37235600)
chr1 (38-212)||(20929955-20930131)
chr1 (14-163)||(21193694-21193844)
chr1 (38-217)||(22226459-22226638)
chr1 (124-290)||(22836911-22837078)
chr1 (198-327)||(22250776-22250905)
chr1 (55-149)||(8539490-8539584)
chr1 (55-149)||(8604729-8604823)
chr1 (38-220)||(22352601-22352785)
chr1 (34-212)||(44036401-44036582)
chr1 (124-390)||(51657986-51658255)
chr1 (54-163)||(5769744-5769853)
chr1 (124-220)||(20895390-20895486)
chr1 (124-272)||(20956627-20956776)
chr1 (38-254)||(15862938-15863149)
chr1 (54-168)||(20821476-20821590)
chr1 (218-390)||(18505646-18505817)
chr1 (14-168)||(5471872-5472028)
chr1 (124-220)||(9785899-9785995)
chr1 (124-390)||(21716430-21716707)
chr1 (14-80)||(20526725-20526791)
chr1 (54-168)||(41213197-41213311)
chr1 (198-364)||(20895514-20895660)
chr1 (55-168)||(22144923-22145036)
chr1 (198-272)||(41217793-41217867)
chr1 (198-390)||(15863325-15863508)
chr1 (198-390)||(21857753-21857934)
chr1 (124-254)||(22250622-22250752)
chr1 (198-390)||(17146820-17147003)
chr1 (124-220)||(27673257-27673355)
chr1 (124-220)||(22365155-22365252)
chr1 (115-217)||(17147258-17147362)
chr1 (200-272)||(22352498-22352570)
chr1 (198-272)||(15863221-15863295)
chr1 (198-390)||(22352285-22352468)
chr1 (140-209)||(21857966-21858035)
chr1 (124-197)||(35935166-35935239)
chr1 (54-217)||(7642105-7642270)
chr1 (124-217)||(17003302-17003396)
chr1 (257-390)||(22364943-22365074)
chr1 (40-217)||(22034325-22034503)
chr1 (55-197)||(45050185-45050324)
chr1 (245-358)||(20589963-20590078)
chr1 (341-390)||(22080190-22080240)
chr1 (124-217)||(41392929-41393023)
chr1 (124-217)||(51451090-51451184)
chr1 (115-217)||(20826805-20826909)
chr1 (115-193)||(5073884-5073963)
chr1 (124-163)||(18505816-18505855)
chr1 (115-193)||(18602627-18602706)
chr1 (268-306)||(20444085-20444123)
chr1 (268-306)||(20529825-20529863)
chr1 (124-168)||(77632-77677)
chr1 (261-306)||(37846241-37846286)
chr1 (245-288)||(27673216-27673260)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (14-390)||(12488-12874)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (14-308)||(6877821-6878117)
chr2 (124-390)||(36892360-36892628)
chr2 (124-390)||(25877618-25877882)
chr2 (15-390)||(8886450-8886814)
chr2 (18-253)||(22861923-22862158)
chr2 (14-218)||(25600431-25600635)
chr2 (33-272)||(24088880-24089120)
chr2 (14-198)||(19434958-19435144)
chr2 (199-390)||(42180210-42180402)
chr2 (34-251)||(43644471-43644688)
chr2 (14-168)||(19658470-19658625)
chr2 (198-390)||(21276342-21276535)
chr2 (14-220)||(15631864-15632071)
chr2 (204-390)||(24966425-24966609)
chr2 (33-163)||(4795-4925)
chr2 (14-163)||(25304094-25304244)
chr2 (207-375)||(12638003-12638171)
chr2 (14-141)||(27260130-27260257)
chr2 (205-390)||(21140139-21140325)
chr2 (33-163)||(23823027-23823157)
chr2 (33-163)||(23824971-23825101)
chr2 (33-163)||(23832106-23832236)
chr2 (14-169)||(43641346-43641502)
chr2 (124-390)||(7319718-7319989)
chr2 (14-163)||(19670629-19670778)
chr2 (34-212)||(22282601-22282782)
chr2 (14-163)||(24296071-24296221)
chr2 (124-390)||(28972272-28972543)
chr2 (124-390)||(31832-32102)
chr2 (36-212)||(22273368-22273547)
chr2 (115-272)||(12643600-12643758)
chr2 (198-390)||(12643812-12644000)
chr2 (122-390)||(269422-269693)
chr2 (198-290)||(25600309-25600401)
chr2 (125-390)||(24573051-24573320)
chr2 (198-308)||(15631702-15631812)
chr2 (38-217)||(22692768-22692949)
chr2 (38-217)||(22697415-22697596)
chr2 (124-390)||(22581588-22581858)
chr2 (304-390)||(4450084-4450171)
chr2 (54-168)||(18534350-18534464)
chr2 (58-168)||(24272579-24272689)
chr2 (40-168)||(22137341-22137469)
chr2 (140-220)||(461139-461219)
chr2 (198-390)||(3801123-3801306)
chr2 (198-390)||(38706810-38706993)
chr2 (140-212)||(9654507-9654579)
chr2 (40-217)||(12637665-12637843)
chr2 (140-220)||(20629034-20629114)
chr2 (40-217)||(21140355-21140533)
chr2 (198-390)||(34822315-34822498)
chr2 (140-218)||(24966692-24966770)
chr2 (124-273)||(22691607-22691758)
chr2 (124-273)||(22696254-22696405)
chr2 (40-217)||(21276027-21276205)
chr2 (205-272)||(12637873-12637940)
chr2 (304-390)||(22691823-22691910)
chr2 (304-390)||(22696470-22696557)
chr2 (304-390)||(25600173-25600260)
chr2 (33-193)||(24687161-24687322)
chr2 (40-217)||(3800613-3800791)
chr2 (319-390)||(8941712-8941784)
chr2 (319-390)||(19888848-19888920)
chr2 (198-375)||(25210909-25211076)
chr2 (40-217)||(34822676-34822854)
chr2 (205-272)||(34822578-34822645)
chr2 (321-390)||(6877721-6877791)
chr2 (124-217)||(19888362-19888456)
chr2 (198-306)||(20629142-20629243)
chr2 (198-306)||(43644713-43644814)
chr2 (40-217)||(12726531-12726709)
chr2 (198-270)||(25211108-25211180)
chr2 (205-272)||(3800822-3800889)
chr2 (124-217)||(5889880-5889974)
chr2 (198-390)||(9654615-9654792)
chr2 (124-217)||(11232835-11232929)
chr2 (124-217)||(14908022-14908116)
chr2 (124-217)||(22514682-22514776)
chr2 (124-217)||(28777283-28777377)
chr2 (318-390)||(22654339-22654412)
chr2 (140-197)||(24828161-24828218)
chr2 (140-197)||(24832613-24832670)
chr2 (140-220)||(720835-720918)
chr2 (115-217)||(8942124-8942228)
chr2 (40-217)||(23773015-23773193)
chr2 (115-193)||(17398170-17398249)
chr2 (198-272)||(3800969-3801043)
chr2 (124-217)||(20013601-20013695)
chr2 (321-390)||(22273164-22273233)
chr2 (124-217)||(23818658-23818752)
chr2 (198-272)||(24089074-24089146)
chr2 (147-197)||(25211379-25211429)
chr2 (199-252)||(461007-461060)
chr2 (261-306)||(23806359-23806404)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (14-390)||(4425-4805)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (14-390)||(13964-14354)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (124-390)||(31038-31304)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (124-390)||(20860-21128)
scaffold0008 (123-390)||(28450-28719)
scaffold0008 (38-212)||(129700-129877)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (14-306)||(249025-249313)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (14-220)||(3095-3301)
scaffold0447 (198-272)||(2737-2811)
scaffold0447 (198-272)||(2865-2939)
scaffold0447 (198-265)||(2616-2683)
scaffold0447 (198-272)||(2993-3067)
scaffold0447 (304-390)||(2475-2561)
[»] scaffold0383 (7 HSPs)
scaffold0383 (14-220)||(5703-5909)
scaffold0383 (124-254)||(813-943)
scaffold0383 (198-265)||(5480-5547)
scaffold0383 (198-272)||(5601-5675)
scaffold0383 (198-390)||(328-511)
scaffold0383 (304-390)||(5339-5425)
scaffold0383 (198-272)||(641-715)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (14-272)||(7842-8108)
scaffold0622 (198-374)||(7453-7631)
scaffold0622 (198-275)||(7682-7759)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (123-390)||(7012-7287)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (14-218)||(13680-13884)
scaffold0396 (38-217)||(15922-16103)
scaffold0396 (198-291)||(13914-14007)
scaffold0396 (315-390)||(14078-14154)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (124-390)||(535-802)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (14-220)||(3129-3335)
scaffold0434 (198-390)||(2907-3101)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (14-272)||(3784-4044)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (124-390)||(1046-1307)
[»] scaffold0195 (8 HSPs)
scaffold0195 (14-273)||(19799-20067)
scaffold0195 (14-219)||(17776-17983)
scaffold0195 (14-167)||(8140-8293)
scaffold0195 (14-167)||(13529-13682)
scaffold0195 (198-390)||(17526-17716)
scaffold0195 (198-390)||(19556-19746)
scaffold0195 (318-390)||(8466-8539)
scaffold0195 (318-390)||(13855-13928)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (14-197)||(27067-27250)
scaffold0120 (310-375)||(26889-26954)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (206-390)||(236412-236597)
scaffold0009 (14-219)||(236652-236857)
scaffold0009 (34-272)||(270545-270785)
scaffold0009 (198-390)||(270329-270515)
scaffold0009 (74-118)||(255963-256007)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (198-390)||(27950-28145)
scaffold0116 (124-272)||(28179-28327)
scaffold0116 (198-272)||(28125-28199)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (14-253)||(56369-56615)
scaffold0051 (218-390)||(56206-56370)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (199-390)||(3055-3248)
scaffold0269 (198-390)||(281-477)
scaffold0269 (38-198)||(577-739)
scaffold0269 (124-212)||(3430-3518)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (199-390)||(30650-30843)
scaffold0049 (124-212)||(31002-31090)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (14-273)||(8493-8754)
scaffold0190 (335-390)||(8387-8443)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (198-390)||(13548-13740)
scaffold0359 (124-248)||(13434-13557)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (124-390)||(15006-15271)
scaffold0138 (199-390)||(26451-26642)
scaffold0138 (14-107)||(23915-24009)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (124-308)||(3707-3893)
scaffold0673 (304-390)||(3927-4014)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (198-390)||(4638-4831)
scaffold0483 (38-220)||(4250-4435)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (198-390)||(49478-49671)
scaffold0109 (38-220)||(49090-49275)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (124-283)||(26416-26575)
scaffold0037 (14-134)||(70883-71003)
scaffold0037 (130-390)||(66322-66592)
scaffold0037 (321-390)||(26590-26660)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (198-390)||(21633-21827)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (198-390)||(156183-156376)
scaffold0023 (198-390)||(85966-86149)
scaffold0023 (42-218)||(34811-34989)
scaffold0023 (205-272)||(156062-156129)
scaffold0023 (124-217)||(155937-156031)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (14-167)||(71768-71922)
scaffold0058 (318-390)||(72093-72166)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (207-390)||(2474-2658)
scaffold0342 (124-390)||(4078-4346)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (198-388)||(77600-77793)
scaffold0034 (140-198)||(77919-77977)
scaffold0034 (245-292)||(35999-36047)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (14-164)||(2112-2262)
scaffold0610 (318-390)||(2438-2511)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (207-390)||(14849-15032)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (14-163)||(106409-106559)
scaffold0022 (144-390)||(113902-114150)
scaffold0022 (38-217)||(6649-6830)
scaffold0022 (55-168)||(130409-130522)
scaffold0022 (38-217)||(58936-59117)
scaffold0022 (124-220)||(108058-108156)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (199-390)||(17735-17928)
scaffold0292 (124-220)||(18055-18151)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (204-390)||(499-683)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (198-375)||(29653-29830)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (53-230)||(68785-68964)
scaffold0031 (214-387)||(68597-68773)
scaffold0031 (14-61)||(69394-69441)
scaffold0031 (173-390)||(30314-30531)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (198-390)||(33395-33580)
scaffold0184 (34-212)||(32688-32869)
scaffold0184 (124-247)||(33725-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (198-390)||(39264-39449)
scaffold0078 (34-212)||(39975-40156)
scaffold0078 (124-247)||(38996-39119)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (198-387)||(6984-7175)
scaffold0338 (124-208)||(7214-7298)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (14-163)||(4842-4991)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (241-390)||(23040-23190)
scaffold0158 (322-390)||(16376-16445)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (34-272)||(2627-2869)
scaffold0597 (198-390)||(2899-3083)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (140-390)||(19248-19489)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (200-359)||(94335-94495)
scaffold0044 (173-220)||(94695-94742)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (124-272)||(90600-90748)
scaffold0028 (33-142)||(78228-78337)
scaffold0028 (198-390)||(90802-91018)
scaffold0028 (56-217)||(128867-129026)
scaffold0028 (198-272)||(128730-128804)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (34-212)||(145016-145195)
scaffold0025 (34-212)||(147275-147454)
scaffold0025 (198-252)||(144926-144980)
scaffold0025 (198-252)||(147185-147239)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (14-163)||(7153-7303)
scaffold0095 (318-390)||(7416-7489)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (33-163)||(78342-78472)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (14-163)||(118094-118244)
scaffold0016 (124-208)||(163817-163901)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (36-218)||(54118-54300)
scaffold0032 (38-254)||(109582-109799)
scaffold0032 (198-272)||(109897-109971)
scaffold0032 (198-306)||(54011-54112)
scaffold0032 (199-252)||(110002-110055)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (34-212)||(197600-197778)
scaffold0004 (54-168)||(84942-85056)
scaffold0004 (54-168)||(26080-26194)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (121-390)||(1652-1925)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (198-333)||(16826-16961)
scaffold0315 (140-198)||(17070-17128)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (14-184)||(25101-25274)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (33-155)||(34006-34128)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (34-212)||(217246-217426)
scaffold0003 (206-390)||(5221-5396)
scaffold0003 (124-217)||(5661-5755)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (54-198)||(3244-3393)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (198-390)||(9930-10122)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (34-220)||(11532-11716)
scaffold0467 (257-306)||(11796-11845)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (38-217)||(4320-4501)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (124-383)||(6123-6386)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (41-212)||(5102-5274)
scaffold0266 (124-212)||(12788-12876)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (14-162)||(14101-14250)
scaffold0346 (198-274)||(15935-16011)
scaffold0346 (146-220)||(15833-15907)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (38-217)||(51511-51690)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (198-333)||(21158-21288)
scaffold0039 (124-220)||(20906-21002)
scaffold0039 (198-272)||(21030-21104)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (124-390)||(3125-3395)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (198-390)||(6410-6583)
scaffold0407 (124-220)||(6310-6406)
scaffold0407 (294-390)||(22-119)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (38-217)||(14779-14958)
scaffold0225 (38-217)||(28300-28479)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (33-168)||(211-346)
scaffold0786 (33-168)||(5266-5401)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (33-168)||(3799-3934)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (33-152)||(4568-4686)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (206-390)||(75550-75727)
scaffold0001 (124-195)||(72106-72177)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (34-158)||(1-126)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (209-332)||(25594-25718)
scaffold0134 (208-272)||(25735-25799)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-217)||(106479-106660)
scaffold0026 (198-390)||(27169-27352)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (124-289)||(31925-32093)
scaffold0103 (315-390)||(31776-31850)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (38-219)||(1292-1469)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (38-217)||(35-215)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (124-212)||(40010-40098)
scaffold0106 (319-390)||(37627-37697)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (54-158)||(55922-56026)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (202-363)||(44288-44443)
scaffold0066 (217-363)||(52457-52597)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (34-212)||(41190-41371)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (38-217)||(9426-9607)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (144-272)||(145283-145413)
scaffold0014 (318-390)||(144987-145060)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (38-212)||(7465-7641)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (268-363)||(12989-13085)
scaffold0130 (319-390)||(31120-31192)
scaffold0130 (214-272)||(31333-31391)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (140-218)||(1509-1587)
scaffold1140 (257-390)||(1298-1427)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (34-100)||(52771-52837)
scaffold0018 (34-100)||(56723-56789)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (198-390)||(804-987)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (125-217)||(1-94)
scaffold0384 (198-390)||(264-448)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (319-390)||(15167-15239)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (140-212)||(6826-6898)
scaffold0218 (198-390)||(6934-7115)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (304-390)||(4639-4725)
scaffold0450 (205-273)||(4528-4596)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (40-193)||(29855-30009)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (33-217)||(17586-17771)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (124-217)||(37768-37862)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (54-100)||(4532-4578)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (124-273)||(2839-2989)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (124-273)||(26542-26692)
scaffold0124 (124-217)||(3160-3254)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (74-118)||(12285-12329)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (124-217)||(25382-25476)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (349-390)||(7299-7341)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (143-216)||(7049-7125)


Alignment Details
Target: scaffold0240 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6221 - 5845
Alignment:
Q  15 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6221 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgtt 6122  T
Q  115 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6121 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattgat 6022  T
Q  215 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6021 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttaatgtaactatatgtatga 5922  T
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5921 gaatgttattattgatcaaatacatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 5845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 138296 - 138673
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  138296 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgt 138395  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  138396 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 138495  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatg 313  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138496 tgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtataagtatg 138595  T
Q  314 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  138596 aaaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgatgatgt 138673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 76853 - 76589
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  76853 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgca 76754  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||    
T  76753 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatatgaatattat 76654  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76653 ta---atcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 76589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10148 - 10003
Alignment:
Q  144 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  10148 tggtaccacatgcatgtatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattgctgaaatgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttg 10050  T
Q  241 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagata 286  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10049 atgattgttcatggcacatgtgattgatgattaattgatgtgagata 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 26071753 - 26072131
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26071753 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26071852  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26071853 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26071952  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26071953 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26072052  T
Q  313 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26072053 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 26095540 - 26095918
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26095540 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26095639  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26095640 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26095739  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26095740 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26095839  T
Q  313 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26095840 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26095918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3893772 - 3893381
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3893772 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 3893673  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  3893672 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 3893573  T
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag- 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||     
T  3893572 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggttttgatgtaagt 3893473  T
Q  304 -----tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
         ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3893472 atatatatatttatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3893381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12753558 - 12753172
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12753558 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttaaatacgatgtttttgt 12753459  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc---ttattgatatat----- 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||| || |         
T  12753458 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattg 12753359  T
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg-gggtttgatgtaag 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||   ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||| ||||    
T  12753358 gtgattggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagaatgtgatataag 12753259  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12753258 tat-tatttgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 12753172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 125 - 390
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824371
Alignment:
Q  125 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgtttggtgattatgtat 15824204  T
Q  225 gaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 324  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824205 gaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 15824304  T
Q  325 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15824305 attgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15824371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44863711 - 44863443
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44863711 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 44863612  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44863611 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgcgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtataagtatgagaatatta 44863512  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  44863511 ttattgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 44863443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 142136 - 141869
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  142136 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggttattgtgta 142037  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142036 tgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 141937  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  141936 tattgatcaagtgcatgatgattaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 141869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47288244 - 47287976
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  47288244 gtgacaaccttgggatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtaattggtgattgtgta 47288145  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47288144 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggtttttgatgtaagtatatgtacgagaatatta 47288045  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47288044 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 47287976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 112784 - 113168
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  112784 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaaggattgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 112883  T
Q  114 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-------tgatat 203  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||       ||  ||    
T  112884 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgat 112983  T
Q  204 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 303  Q
      ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  112984 tggtgattgataattgcgtatgaataaatgtgaattgttgtttgttcatgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattgagttttgatgtaag 113083  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||   |||| |   | || |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  113084 tattgatatgtg---actactattgatcaagtgcataatgtttattttgaaatattcatgctaaatgttatttggattatgatgatgt 113168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 45453745 - 45454016
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||    
T  45453745 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacga---ttttgt 45453841  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  45453842 tgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaat-tgtgattgg 45453940  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatatt 288  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45453941 tgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatatt 45454016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 1938257 - 1938532
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||      
T  1938257 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagagttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttta 1938356  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    | |||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||     
T  1938357 t-catcaaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaacgtgattgg 1938455  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 290  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1938456 tgattacgtatgcataattgtgtattgatatttgtccatgacacatgtgattggtggttattgatgtgagatattgg 1938532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 7286328 - 7286522
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 296  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  7286328 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttg 7286427  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7286428 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgttgattatgatgatgt 7286522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 12545607 - 12545802
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  12545607 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattgttgatgtgagatattggggttttt 12545706  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  12545707 gatgtaagtatatgtataagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtaatgtggactatgatgatgt 12545802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 18305642 - 18305831
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18305642 gatatatgtgattgacgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttggt 18305741  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18305742 gtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18305831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 13867887 - 13868080
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||    
T  13867887 gatatatgtgattggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattgagattatga 13867986  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13867987 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 13868080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 197 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7291102 - 7290908
Alignment:
Q  197 ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttg 296  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7291102 ttgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttg 7291003  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7291002 atgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7290908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 15913921 - 15914075
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15913921 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 15914020  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15914021 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 15914075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 2192606 - 2192799
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2192606 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 2192705  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  2192706 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatgataatgt 2192799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 369336 - 369143
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  369336 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtgatgattgatgtgagatattggggtttga 369237  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  369236 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 369143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 14253071 - 14253263
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14253071 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgt-catgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattggggtttga 14253169  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14253170 tgtaagtattgatttgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 14253263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 16480836 - 16481029
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16480836 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 16480935  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16480936 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcatgtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 16481029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 15952859 - 15953050
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15952859 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 15952958  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  15952959 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 15953050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 198
Target Start/End: Original strand, 9058141 - 9058311
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9058141 ttgtagctttaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 9058240  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9058241 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 9058311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 49049452 - 49049723
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||    
T  49049452 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattgatgaaatgtgaatgattagtgt 49049551  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  49049552 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatgtggat 49049649  T
Q  319 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49049650 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 49049723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13388643 - 13388493
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13388643 catcatagtcatgttgagtcttatagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaatacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttctg 13388544  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13388543 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13388493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Original strand, 15761867 - 15762051
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  15761867 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 15761965  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  15761966 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 15762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 32496053 - 32496242
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32496053 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaacgcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32496152  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32496153 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 32496242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13376324 - 13376200
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13376324 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgg-tgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgag 13376226  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13376225 gtgattcggtaccatatgcatttatg 13376200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15629255 - 15629004
Alignment:
Q  144 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 240  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  15629255 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtgcatgaataaatgtgagttg 15629156  T
Q  241 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatta-ttgatcaagtac 337  Q
    ||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||  | ||||||| | ||||| ||||||    
T  15629155 atgattgttcataacacatctgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatatggatattatgatttgattaagtac 15629058  T
Q  338 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15629057 atgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 15629004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 20587140 - 20587254
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587140 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 20587239  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20587240 tgcatatatgtgtcg 20587254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 13867688 - 13867784
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13867688 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgt 13867784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13273246 - 13272976
Alignment:
Q  125 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 221  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  13273246 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtg 13273147  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
     ||| |||| ||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  ||| | || | |||| | |||    
T  13273146 catggataaatgtgatttgatgattgttccagacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatatcgggattatg--gtatgaatgtatatgtggata 13273049  T
Q  320 ttatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||    
T  13273048 ttattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcttgtcaactgttatgtgaattatgatgatgt 13272976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Original strand, 8565108 - 8565212
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8565108 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttattgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 8565207  T
Q  154 tgcat 158  Q
    |||||    
T  8565208 tgcat 8565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 375
Target Start/End: Original strand, 15762262 - 15762429
Alignment:
Q  202 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15762262 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 15762354  T
Q  301 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15762355 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 15762429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 18255324 - 18255505
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  18255324 gttgtaaaagggctaagcgcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 18255422  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18255423 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18255505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3058713 - 3058585
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  3058713 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 3058615  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3058614 tttggagatttggtaccacatgcatttatg 3058585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 9322594 - 9322703
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9322594 actcttttacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 9322693  T
Q  154 tgcatgtatg 163  Q
    ||||| ||||    
T  9322694 tgcatatatg 9322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11285715 - 11285619
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11285715 gtgacgaccttgagttaatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattaatgattgt 11285619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28719091 - 28718977
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28719091 actcgtttacttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatgtgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgacttggtaccaca 28718992  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  28718991 tgcatatatgtgtcg 28718977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 11582535 - 11582631
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11582535 gtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 11582631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 254
Target Start/End: Original strand, 15952673 - 15952813
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  15952673 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattgg 15952772  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15952773 agattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15952813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 16571751 - 16571921
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16571751 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16571850  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 291  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16571851 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16571921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16593911 - 16593741
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16593911 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16593812  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 291  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16593811 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 125492 - 125378
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  125492 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtaaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 125393  T
Q  133 ttgaggtgatttggt 147  Q
    ||  || ||||||||    
T  125392 ttttggagatttggt 125378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Original strand, 16571983 - 16572053
Alignment:
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16571983 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16572053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16593679 - 16593609
Alignment:
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16593679 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16593609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2027222 - 2027097
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||| | |||||||||    
T  2027222 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcggaggtgacgacc 2027123  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    ||   | |||||||||||||||||||    
T  2027122 ttttcgagatttggtaccacatgcat 2027097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Original strand, 13038808 - 13038905
Alignment:
Q  123 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13038808 agtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttattgatatatgtgattggtgattgt 13038905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2024858 - 2024757
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatg----tgattggtgattattgatgtaagatattggggt 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2024858 tgatgtatatgattgatgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattgattggtgattattgatgtgagatattgcggt 2024759  T
Q  294 tt 295  Q
    ||    
T  2024758 tt 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 290
Target Start/End: Original strand, 10862515 - 10862683
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10862515 gtgacgaccttgaagtgatttgctactgcatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacataagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 10862614  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgg 290  Q
      ||| |||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10862615 tcatg-ataaatgtg-gttgatgattgttcatgacacatgtgattggtggttacttaatgtaagatattgg 10862683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Original strand, 12249771 - 12249908
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||    
T  12249771 gtgacgactttgaagtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatttcgaaatgtgattagtgaatgtg 12249870  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacat 259  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  12249871 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacat 12249908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 12545404 - 12545501
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgattt-ggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  12545404 gtgacgaccttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 12545501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 12545553 - 12545627
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12545553 tgatatatgggattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtgattggtgatt 12545627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36051147 - 36051075
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051147 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttattgatatatgtgattg 36051075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 369471 - 369364
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  369471 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattg 369372  T
Q  213 atgattgt 220  Q
     |||||||    
T  369371 gtgattgt 369364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10988271 - 10988092
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  10988271 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 10988174  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10988173 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 10988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122987
Alignment:
Q  141 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 122987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16210263 - 16210183
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  16210263 gatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgatttgtgattgt 16210183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 26010695 - 26010874
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaa-gtgacgaccttgag 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||||||||      
T  26010695 tgtaaaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26010793  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  26010794 gagatttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 26010874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 227
Target Start/End: Original strand, 18305492 - 18305546
Alignment:
Q  173 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18305492 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgtttatgaa 18305546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2024757 - 2024692
Alignment:
Q  326 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2024757 ttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2024692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Original strand, 2192376 - 2192453
Alignment:
Q  141 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  2192376 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 2192453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 15518435 - 15518539
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15518435 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 15518534  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  15518535 gtgat 15518539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16416684 - 16416509
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16416684 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 16416592  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16416591 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 16416509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 16480710 - 16480782
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16480710 atatttgtgattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 16480782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Original strand, 45455505 - 45455581
Alignment:
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45455505 gaatatcattattgatcaagtatatgatttttgaattaaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 45455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2436285 - 2436110
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||       
T  2436285 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgtgatgtgttttat-catcaaaggtgacgaccttttt 2436191  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  2436190 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 2436110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2024998 - 2024904
Alignment:
Q  160 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2024998 tatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2024904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4483364 - 4483318
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483364 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 4483318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7291335 - 7291277
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7291335 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 7291277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7821500 - 7821406
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7821500 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7821406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7828811 - 7828717
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7828811 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16417043 - 16416949
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  16417043 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 16416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Original strand, 16480605 - 16480683
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  16480605 gatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 16480683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 27103134 - 27103228
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27103134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 27110482 - 27110576
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27110482 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27110576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27175192 - 27175098
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27175192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 38785226 - 38785320
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38785226 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 38785320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 2192480 - 2192552
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2192480 atatttgttattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 2192552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4483320 - 4483268
Alignment:
Q  116 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4483320 catcgaaggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 4483268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 11582659 - 11582840
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  11582659 tgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtccatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 11582751  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||| ||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11582752 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattaatcaaatgcatgatgtt--aattgaactattcatgataactgttatttggattatgataatgt 11582840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13757225 - 13757060
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  13757225 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 13757127  T
Q  152 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  13757126 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 13757060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3055241 - 3055193
Alignment:
Q  173 gtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  3055241 gtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 3055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 25293856 - 25293960
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  25293856 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 25293955  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  25293956 gtgat 25293960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 122951 - 122854
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  122951 tgataaatgtaattggtgattgtgaattaatagttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 122859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11514698 - 11514604
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  11514698 gtgacgaccttgtagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 11514604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 13038989 - 13039114
Alignment:
Q  261 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 358  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||||||| |||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  13038989 tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattatggatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 13039081  T
Q  359 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13039082 tcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13039114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 15443146 - 15443240
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  15443146 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 15443240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Original strand, 30263727 - 30263805
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  30263727 gatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 30263805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 42057741 - 42057819
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 192  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  42057741 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 119
Target Start/End: Original strand, 3193586 - 3193630
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3193586 atgtaagacgggtgtgaaatgttacat-tgatgtttttgttgcatc 3193630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16210045 - 16209975
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16210045 attattattgatcaaatgcatgatgttaata--gaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 16209975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 19066262 - 19066193
Alignment:
Q  41 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttt 110  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  19066262 gtaaaaggggtgtgctcttttacttcggcgaaaatgtaagacggacgtgaaatcttacataggatgtttt 19066193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13460958 - 13460914
Alignment:
Q  75 tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13460958 tgtaatacgggagtgaaatcttacatttgatgtttttgttgcatc 13460914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 213
Target Start/End: Original strand, 13912691 - 13912791
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||  || |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13912691 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13912790  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  13912791 a 13912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31627117 - 31626739
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31627117 catcatagtcgtgttgagaatgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 31627018  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31627017 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 31626918  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31626917 tgattgtgtatgaataattgtgaattaatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 31626818  T
Q  313 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31626817 gagaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattaagatgatgt 31626739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18775886 - 18775506
Alignment:
Q  18 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  18775886 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtctttgttgta 18775787  T
Q  118 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------gtgat 210  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   | ||       |||||    
T  18775786 tcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaaatgtgaatggtgat 18775687  T
Q  211 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgt 310  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18775686 tggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtttatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattttt 18775587  T
Q  311 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18775586 ttttgaattttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 18775506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22428850 - 22428473
Alignment:
Q  18 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22428850 atagtcgtgttgagtttgtagttgtaaaagggttcaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcgtacatacgatgtttttgttgca 22428751  T
Q  118 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||| ||||    
T  22428750 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgat 22428651  T
Q  218 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtat--atgtatg 313  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||  || |||     
T  22428650 tgtgtatgaataactatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgatgtaagtattgatatatt 22428551  T
Q  314 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22428550 tgagtattattgttgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22428473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16105237 - 16104850
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16105237 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16105138  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  16105137 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggttatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgatta 16105038  T
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt-ggggtttgatgtaag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16105037 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattaattgatgtgagatattgggggtatgatgtaag 16104938  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16104937 tattgttatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttataacgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16104850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 25646518 - 25646786
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  25646518 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatttgattggtgattgtgtg 25646617  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25646618 tgaatagttgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaaatattggggttttgatgtaagtatatgtatgtgaatatta 25646717  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25646718 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 25646786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 390
Target Start/End: Original strand, 25745792 - 25746160
Alignment:
Q  18 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25745792 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 25745891  T
Q  118 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgat 210  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  || || |     |||||    
T  25745892 tcgagggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgat 25745991  T
Q  211 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatg 309  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||  ||              
T  25745992 tggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacacgtgattggggatttattaatgtgagatattggggttt--tg---------- 25746079  T
Q  310 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25746080 -atgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 25746160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 35017451 - 35017645
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35017451 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 35017550  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35017551 atgtaagtatatctatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgatatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35017645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 35011124 - 35011316
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35011124 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 35011223  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35011224 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35011316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18128532 - 18128340
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18128532 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatatgattggagattattgatgtgagatattggggtttga 18128433  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18128432 tgtaagtatatgtatgggaatgtaattattgatcaagtgcatgatgtttaga-tgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18128340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18579027 - 18578834
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18579027 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttga 18578928  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18578927 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcatatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatcatgt 18578834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 390
Target Start/End: Original strand, 13622937 - 13623121
Alignment:
Q  204 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13622937 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 13623036  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13623037 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13623121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16084095 - 16083970
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16084095 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16083996  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16083995 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 16083970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19627690 - 19627498
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19627690 gatatatatgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19627591  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19627590 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataataatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19627498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Original strand, 14628368 - 14628545
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14628368 tgatacatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 14628467  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||||||||   | || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  14628468 tgtaagtattgatgtgggaatattattaatgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatt 14628545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 18004857 - 18005050
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18004857 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18004956  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  18004957 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatgttcatgttaactattatttggattatgataatgt 18005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18128964 - 18128776
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  18128964 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcgaagattatgtaagacaggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 18128865  T
Q  114 tgc-----atcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
     ||     |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18128864 ggcatcgaatcgaaggtgacgaactggaggtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 18128776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23975902 - 23975708
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23975902 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 23975803  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23975802 tgtaagtattgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 18843708 - 18843900
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 296  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18843708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 18843807  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18843808 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattaaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18843900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 13016436 - 13016702
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat--atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||| |  || | || |||||| |||||||||||| |||  | |||||  | |||||||    
T  13016436 gtgacgaccttgagatgatatggtaccacatgcatatttgtgtcggtctatatacacatcatg-catgagtcttatcgattgaatgtgacaggtgattgt 13016534  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatat 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||    
T  13016535 gtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatattttttagaatat 13016633  T
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13016634 tattattgatcaaatgcttgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgtatttggattatgatgatgt 13016702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 19984699 - 19984887
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  19984699 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 19984798  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19984799 ttttggatatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19984887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 207 - 367
Target Start/End: Original strand, 33316422 - 33316582
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33316422 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 33316521  T
Q  307 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaa 367  Q
       | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  33316522 tgatgtgggaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaa 33316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 18383173 - 18383323
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18383173 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggtttagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 18383272  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18383273 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 18383323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1554508 - 1554324
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  1554508 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 1554410  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  1554409 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 1554324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 124 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18422303 - 18422182
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18422303 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 18422204  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatt 245  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18422203 tgaataattgtgaattgatatt 18422182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33323492 - 33323342
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33323492 catcatagtcatgttgagttttgcaattgtaaaagggttgagcttttttactacggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 33323393  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  33323392 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccaaatgcatttatg 33323342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23151939 - 23151845
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23151939 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtt 23151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16239028 - 16238848
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga- 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||       
T  16239028 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttt 16238930  T
Q  137 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16238929 ggagattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 16238848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 158
Target Start/End: Original strand, 17790652 - 17790776
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  17790652 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttatatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 17790750  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  17790751 tagaggtgattcggtaccacatgcat 17790776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23151839 - 23151706
Alignment:
Q  258 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23151839 atgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaaata 23151740  T
Q  358 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23151739 tccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 23151706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32896492 - 32896282
Alignment:
Q  173 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-t 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32896492 gtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatt 32896393  T
Q  272 tattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg 370  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||          |||||  ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||    
T  32896392 tattgatatgagttattggggttatgatgtaagtat----------atatttatatcgatcaagtacataatgtttgaattaaattattcatggtaactg 32896303  T
Q  371 tta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  32896302 ttatttggattatgatgatgt 32896282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 16889236 - 16889379
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  16889236 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagcgattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tgttg 16889334  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 157  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16889335 atgcatcgaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgca 16889379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 324
Target Start/End: Original strand, 18825647 - 18825774
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 296  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18825647 tgatgtatatgattggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 18825746  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattatt 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18825747 atgtaagtatatatatgagaatattatt 18825774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34965584 - 34965470
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965584 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 34965485  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  34965484 tgcatatatgtgtcg 34965470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 35137439 - 35137565
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35137439 catcatagtcatgttgagttttgcagttgtaaaagggttgagctcttttactacgaagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 35137538  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35137539 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 35137565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 25369014 - 25369184
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25369014 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 25369113  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggg 291  Q
    | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25369114 gcatgaataaatgtg-attgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattacttaatgtaagatattggg 25369184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22846767 - 22846615
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat----gcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacc 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  22846767 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatcgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgcggtgatttggtact 22846668  T
Q  151 acatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 198  Q
    |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22846667 acatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 22846615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11214803 - 11214623
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga- 136  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||       
T  11214803 gttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttt 11214705  T
Q  137 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11214704 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgat 11214623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18397434 - 18397163
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg--tgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | || | |   | || |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  18397434 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatataagtgccggtctagatacacatcatg-catgagtcttattggtgatttgtgattgatgatttt 18397336  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | |||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| | |  |||| || |||||| |||| ||||    
T  18397335 gcatgaataaatgtgattggatacttgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagttgttgagatcgtgatatatgtatatatatgtgaat 18397236  T
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18397235 attattattgaccaagtacacgaagtttaaattgaaatattcatgttaaacgttatgtggattatgatgatgt 18397163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1554113 - 1553946
Alignment:
Q  202 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1554113 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 1554021  T
Q  301 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  1554020 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 1553946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16134918 - 16134814
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16134918 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgaagaccttgaggtgatttggtaccaca 16134819  T
Q  154 tgcat 158  Q
    |||||    
T  16134818 tgcat 16134814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4989561 - 4989379
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||    
T  4989561 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttg 4989464  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattg 219  Q
      | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4989463 ttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattg 4989379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Original strand, 35017303 - 35017387
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35017303 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 35017387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19852909 - 19852795
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19852909 actcttttatttcgatgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 19852810  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19852809 tgcatatatgtgtcg 19852795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 16827873 - 16828003
Alignment:
Q  261 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 360  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  16827873 tgattgatgattattgatgtgagataatggggtttgatgtaagtattgacgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 16827972  T
Q  361 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16827973 atattaactgttatttggattatgataatgt 16828003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18740935 - 18740863
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18740935 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 18740863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 1659212 - 1659387
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1659212 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1659306  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1659307 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgat 1659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Original strand, 13622800 - 13622878
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13622800 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 13622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23220336 - 23220222
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23220336 actcttttacttcagtgataatataagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatggataacgaccttgaggtgatttggtaccaca 23220237  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23220236 tgcatatatgtgtcg 23220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 14628111 - 14628289
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  14628111 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 14628208  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  14628209 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 14628289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23976231 - 23976053
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23976231 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23976134  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23976133 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23976053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26088497 - 26088319
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  26088497 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26088400  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26088399 gagatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 26088319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 33316158 - 33316260
Alignment:
Q  116 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 214  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  33316158 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 33316257  T
Q  215 gat 217  Q
    |||    
T  33316258 gat 33316260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17787827 - 17787746
Alignment:
Q  310 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  17787827 tatgataatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattattattttgattatgatgatgt 17787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23976023 - 23975956
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23976023 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23975956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 16827462 - 16827559
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  16827462 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtcttaaatgatgtatgtgatttatgattgt 16827559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 18004635 - 18004732
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  18004635 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattgt 18004732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 197
Target Start/End: Original strand, 1651466 - 1651605
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  1651466 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 1651560  T
Q  153 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1651561 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 1651605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 14628316 - 14628388
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14628316 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 14628388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25173590 - 25173518
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25173590 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25173518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 16650745 - 16650899
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16650745 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16650843  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16650844 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16650899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Original strand, 18825420 - 18825515
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 219  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18825420 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18825515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4989171 - 4989004
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4989171 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 4989079  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||||||||  |||| |     |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  4989078 tgtaagtattaatgtgt-----tattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttatttgttatt 4989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15738757 - 15738590
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| |  ||| | | |||||||| ||||||||    
T  15738757 gtgacgacgttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatgatgacatgagtttatttggtgaaatgtgattaatgattgt 15738658  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 289  Q
      ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||||||    
T  15738657 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacgtgtgaacggtgattgtttaatgtaagatattg 15738590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16238765 - 16238711
Alignment:
Q  204 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacaca 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16238765 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacaca 16238711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18740828 - 18740645
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||    
T  18740828 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttttgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatatctggatgtga 18740736  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18740735 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattcaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18740645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25174134 - 25174040
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  25174134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25174040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 27655670 - 27655764
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27655670 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 27655764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15861375 - 15861243
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15861375 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 15861281  T
Q  155 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 192  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15861280 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 28196439 - 28196546
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  28196439 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatataagtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 28196538  T
Q  221 gtatgaat 228  Q
    | ||||||    
T  28196539 gcatgaat 28196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 16557515 - 16557669
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16557515 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16557613  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    | ||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16557614 gagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16557669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Original strand, 18843481 - 18843576
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 219  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18843481 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18843576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4989275 - 4989201
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  4989275 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 4989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10487458 - 10487364
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10487458 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 10487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 16377869 - 16377963
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16377869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 16385193 - 16385287
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16385193 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16385287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18422185 - 18422115
Alignment:
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  18422185 tattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 18422115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Original strand, 33316292 - 33316353
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  33316292 tgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgtttctgatacatgtgattggt 33316353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 29870975 - 29871153
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  29870975 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29871072  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  29871073 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 29871153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Original strand, 16827663 - 16827733
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 268  Q
    |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16827663 tgatttatatgattggtgattatgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggt 16827733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Original strand, 17343864 - 17343942
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17343864 gattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtgat 17343942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16374999 - 16374954
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16374999 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttacatc 16374954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16230169 - 16230065
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  16230169 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 16230070  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  16230069 gtgat 16230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23993749 - 23993645
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  23993749 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 23993650  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  23993649 gtgat 23993645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 18004770 - 18004827
Alignment:
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18004770 tgattgtgaatgaatagttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 18004827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 19984915 - 19985096
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||     ||||  |||| |||  |||||||| |||||||| ||| |||    
T  19984915 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaatcgataattgttca-----catg--attgatgacgattgatgtgagatattgaggtgtga 19985007  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    | |||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19985008 tataagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19985096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Original strand, 22227278 - 22227356
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22227278 gattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25173805 - 25173731
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  25173805 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 25173731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Original strand, 18835474 - 18835544
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18835474 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18835544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21930462 - 21930417
Alignment:
Q  124 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21930462 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 21930417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 119
Target Start/End: Original strand, 31162441 - 31162486
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 119  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31162441 atgtaagacggatgtcaaatcttacatatgatgtttttgttgcatc 31162486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  152 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta 196  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 99)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37605668 - 37605283
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  37605668 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgt 37605569  T
Q  114 tgcatcgaaagtgac-gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  37605568 tgcatcgaaggtgacagaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattg 37605469  T
Q  213 a-------tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37605468 atgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgaaatattggggtttgatgtaagta 37605369  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  37605368 tatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttagattatgatgatgt 37605283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41244277 - 41243948
Alignment:
Q  48 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41244277 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggt 41244178  T
Q  148 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 247  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||    
T  41244177 accacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttattgatatatgtgattgagg--------------attgtgtattgatatttg 41244092  T
Q  248 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttta 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41244091 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttta 41243992  T
Q  348 tattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41243991 aattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41243948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25121012 - 25120745
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25121012 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttgataattgtgta 25120913  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120912 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatttatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 25120813  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25120812 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25120745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 19994802 - 19995078
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  19994802 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgtg 19994901  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatg--------taagtatatgtatga 314  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||        ||  ||||| |||||    
T  19994902 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagttattggggttttgatgtatatatatatatatatatatga 19995001  T
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  19995002 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactattattttgattatgatgatgt 19995078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20480166 - 20479893
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||     
T  20480166 gtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgctcggtgattatgtg 20480067  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagta------tatgtatgaga 316  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||      ||| |||||||    
T  20480066 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatatttgggttttgatgtaagtatatatgtatatatgaga 20479967  T
Q  317 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20479966 atatcatt-ttgatcaaatgcatgatgtttatattgaactatccatgttaagtgttattttgattatgatgatgt 20479893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16416810 - 16416537
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
T  16416810 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattcatatatgtgttcggtgattgtgtg 16416711  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgaga 316  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||      ||| |||  ||    
T  16416710 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattattgattattgatgtgagatattggggttttgatgtgagtatatatgtatatatttga 16416611  T
Q  317 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  16416610 atatcattattgatcaa-tgtatgatgtttatattgaactatccatgttaattattattttgattatgatgatgt 16416537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18610620 - 18610428
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18610620 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 18610521  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18610520 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 18610428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 41508927 - 41509122
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41508927 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgagtggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41509026  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41509027 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcctgatgtttgaattgaaatatccatattaactgttatttggattatgatgatgt 41509122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 16203832 - 16204098
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||| | ||||||| |||||||||    
T  16203832 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgaattgatccatcgaaggtgacgacc 16203931  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataatt 232  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  16203932 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatattt 16204031  T
Q  233 gtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    ||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  16204032 gtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggagtgtgatgcaagtat 16204098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 203 - 390
Target Start/End: Original strand, 24719328 - 24719513
Alignment:
Q  203 tatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaa 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  24719328 tatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgcaa 24719427  T
Q  303 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24719428 gtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24719513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 13664550 - 13664743
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13664550 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13664649  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13664650 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13664743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 13723825 - 13724018
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13723825 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13723924  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13723925 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13724018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 390
Target Start/End: Original strand, 22008366 - 22008548
Alignment:
Q  209 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  22008366 attgatgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattg 22008465  T
Q  309 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22008466 atgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttaactgttatttggattatgataatgt 22008548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 22909342 - 22909535
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||    
T  22909342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatttgagatattgggatttga 22909441  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22909442 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 22909535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 390
Target Start/End: Original strand, 20655677 - 20655943
Alignment:
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatga 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||     |||||| |||||||||||||    
T  20655677 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatga 20655776  T
Q  227 ataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 324  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||  |||| | ||||||||    
T  20655777 ataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggatcatgatataagtatacatatgtggatattatt 20655876  T
Q  325 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20655877 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 20655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41245338 - 41245210
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41245338 catcatagtcgtgttgaaattgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 41245239  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgat 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41245238 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgat 41245210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 24108465 - 24108657
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 296  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  24108465 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgacatattggagttttg 24108564  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  24108565 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 24108657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 21192234 - 21192384
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21192234 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21192333  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21192334 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21192384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21696236 - 21696086
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21696236 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 21696137  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  21696136 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatg 21696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 21199661 - 21199811
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21199661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21199760  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21199761 ttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21199811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 31195772 - 31195917
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31195772 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacgatatttttg 31195871  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31195872 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcat 31195917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23835895 - 23835746
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23835895 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 23835796  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  23835795 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtg-ttcggtaccacatgcatttatg 23835746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23509261 - 23509068
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  23509261 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgatgattgatgtgcgatattggggtttga 23509162  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |  | ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23509161 tgtaagtattgatgcgggaatattattattgaccaaatgtaggatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 23509068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 37655134 - 37655324
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37655134 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37655233  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37655234 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggcaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 37655324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29758956 - 29758768
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt-tttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  29758956 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 29758857  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29758856 ttttggagatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 29758768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Original strand, 22323225 - 22323398
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  22323225 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 22323324  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||||| ||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22323325 tgtaagcattgttatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcatgttaactgttatt 22323398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 270138 - 269950
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  270138 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 270039  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270038 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 269950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 645782 - 645970
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  645782 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 645881  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  645882 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 645970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 831517 - 831705
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  831517 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 831616  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  831617 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 831705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 39448310 - 39448460
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39448310 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 39448409  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39448410 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 39448460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 16043054 - 16043245
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 297  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16043054 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16043153  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16043154 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16043245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 270401 - 270226
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  270401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 270304  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 211  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  270303 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 270226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Original strand, 645519 - 645694
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  645519 tgtagttgtaaaagggttgatctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 645616  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 211  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  645617 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 645694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Original strand, 831254 - 831429
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  831254 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 831351  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 211  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  831352 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 831429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17343632 - 17343480
Alignment:
Q  237 attgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagta 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||   | || |||||||||||||||||||||     
T  17343632 attgatatttgttcatgacacatgtgattggcgattattgatgtgggatattggggtttgatg--agtattgatgtgggaatattattattgatcaagtg 17343535  T
Q  337 catgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17343534 catgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17343480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 16041378 - 16041569
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 297  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16041378 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16041477  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16041478 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16041569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37610042 - 37609956
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610042 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 37609956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Original strand, 17731117 - 17731286
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17731117 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 17731216  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 289  Q
    |||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17731217 gtataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattaattgatgtgagatattg 17731286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 24719077 - 24719165
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24719077 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatatgattg 24719165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Original strand, 22498832 - 22498947
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498832 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 22498931  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcga 169  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22498932 tgcatatatgtgtcga 22498947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 24930614 - 24930789
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  24930614 gttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 24930713  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgat 210  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24930714 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgat 24930789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 24387203 - 24387383
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||   ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  24387203 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 24387302  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24387303 cttttga-gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatgattg 24387383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 23116349 - 23116458
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23116349 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 23116448  T
Q  154 tgcatgtatg 163  Q
    ||||| ||||    
T  23116449 tgcatatatg 23116458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 38532152 - 38531882
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||  || ||| | | ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  38532152 gtgacgaccttgaagtgatatggtaccccatgcatatatgtgtcgaactaggtgtacagcatgacatgagtcttatgggtgaaatgtgattgatgattgt 38532053  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || | | ||||||| |||  | ||    
T  38532052 gcat-aataattgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattacttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatat--ggat 38531957  T
Q  319 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  38531956 attcttatttgattaagtgcatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatatgaattatgatgatgt 38531882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22312304 - 22312190
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22312304 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgactttgaggtgatttggtaccaca 22312205  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22312204 tgcatatatgtgtcg 22312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 45560747 - 45560861
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45560747 actcttttaattcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgttaccaca 45560846  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||||||||| ||||    
T  45560847 tgcatgtatgtgtcg 45560861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25294582 - 25294490
Alignment:
Q  108 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25294582 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25756571 - 25756479
Alignment:
Q  108 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25756571 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25756479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33170890 - 33170785
Alignment:
Q  63 cttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 162  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33170890 cttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 33170791  T
Q  163 gcgtcg 168  Q
    | ||||    
T  33170790 gtgtcg 33170785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 158
Target Start/End: Original strand, 33612569 - 33612694
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  33612569 ttgtagctttaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 33612668  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33612669 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 33612694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28543440 - 28543270
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  28543440 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatttgattggtgattgt 28543342  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 291  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28543341 gcatgaataaatgtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattggg 28543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 390
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776422
Alignment:
Q  272 tattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgt 6776402  T
Q  372 ta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  6776403 tatttggattatgataatgt 6776422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 23153297 - 23153452
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  23153297 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatatactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttg 23153396  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    || || |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23153397 ttacaccatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 23153452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 43375310 - 43375493
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  43375310 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 43375402  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  43375403 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 43375493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 18768422 - 18768691
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  18768422 gtgacgactttgaagtgaaatggtaccatatgcatgtatgtgtcgaacttggtgcataacatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 18768521  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | |||| ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || | | ||||||  |||  | ||    
T  18768522 gcatga-taaatatg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattggaattatggtatgagtata--tatttggat 18768617  T
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18768618 attattattgagtaagtacatgatatttgaattgatttattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 18768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 22008139 - 22008236
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22008139 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22008236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 24108245 - 24108368
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| |||     
T  24108245 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtg 24108344  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttg 247  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  24108345 tgaataattgtgaattgatgtttg 24108368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 3433535 - 3433718
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3433535 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3433627  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3433628 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3433718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 22323102 - 22323197
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  22323102 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgataaatgtgtttggtgattgt 22323197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 43375202 - 43375274
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43375202 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 43375274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 22089943 - 22090097
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22089943 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22090041  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  22090042 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 22090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24238177 - 24238065
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24238177 actcttttacttcggcgataatgtaagatgg--acgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgagctgatttggtaccaca 24238080  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24238079 tgcatatatgtgtcg 24238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28543213 - 28543151
Alignment:
Q  328 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28543213 gatcaagtacatgatgttta-attgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 28543151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23509491 - 23509397
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23509491 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 13664296 - 13664393
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13664296 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13664393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 13723571 - 13723668
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13723571 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13723668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 3433076 - 3433254
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3433076 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3433173  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3433174 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3433254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 13664424 - 13664496
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13664424 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13664496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 13723699 - 13723771
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13723699 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13723771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 21853396 - 21853574
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  21853396 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 21853493  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21853494 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21853574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 22909146 - 22909242
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||||||||    
T  22909146 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaaatgtgattgatgattgt 22909242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24547863 - 24547724
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  24547863 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 24547769  T
Q  153 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24547768 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24547724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 15320559 - 15320713
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15320559 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15320657  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15320658 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15320713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 15500928 - 15501082
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15500928 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15501026  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15501027 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15501082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23509378 - 23509315
Alignment:
Q  209 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23509378 attgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 23631046 - 23631173
Alignment:
Q  261 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 360  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  23631046 tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 23631142  T
Q  361 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  23631143 atgttaactgttatttggattatgataatgt 23631173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11543149 - 11543088
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 115  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11543149 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttg 11543088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 21846065 - 21846169
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21846065 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 21846164  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  21846165 gtgat 21846169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 25294641 - 25294581
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 73  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25294641 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25294581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 25756630 - 25756570
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 73  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25756630 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25756570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28836155 - 28835980
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  28836155 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 28836063  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28836062 tta--atgtgta-attattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcaggttaactgttatttggattatgataatgt 28835980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 3433285 - 3433352
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3433285 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3433352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 272786 - 272880
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  272786 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 272880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 643063 - 642969
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  643063 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 828869 - 828775
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  828869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 828775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5236768 - 5236674
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5236768 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Original strand, 39448573 - 39448646
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39448573 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 39448646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 16874439 - 16874617
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16874439 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16874536  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16874537 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 16874617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 390
Target Start/End: Original strand, 17731331 - 17731387
Alignment:
Q  335 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17731331 tacatgatatttaaattgaatcattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 17731387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23148568 - 23148481
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23148568 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctctttaacttcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacat 23148481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29758740 - 29758643
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||       |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29758740 tgataaatgtaattggtgattgtgaatgaatagttgtgaattgataattgttaatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 29758648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 224737 - 224816
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  224737 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 224816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 738360 - 738439
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  738360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 738439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 862255 - 862334
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  862255 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 862334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 16675900 - 16675979
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16675900 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16675979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21695941 - 21695899
Alignment:
Q  349 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21695941 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 21695899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 24662830 - 24662924
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24662830 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 24662924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 3433390 - 3433455
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3433390 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3433455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Original strand, 18043091 - 18043131
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatc 94  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  18043091 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatc 18043131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 51 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 38101 - 37760
Alignment:
Q  51 tgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacc 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  38101 tgaacttttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtacc 38002  T
Q  151 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 250  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38001 acatgcatgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttagtgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttc 37902  T
Q  251 atgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttata 349  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37901 atgacacttgttattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaa 37802  T
Q  350 ttgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37801 ttgaaatatccatggtaactgttatttggattatgatgatgt 37760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 134)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 50113612 - 50113991
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50113612 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgcaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttat 50113711  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50113712 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 50113811  T
Q  213 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgt 310  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  50113812 gtgattgtgtatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgattgatgattaattgatgtgagatattggggttctaatgtaagtat-tga 50113910  T
Q  311 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  50113911 atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 50113991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Original strand, 319099 - 319486
Alignment:
Q  15 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  319099 atcatagtcgtgttgagattgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 319198  T
Q  115 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatat---at--gt 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||  ||    
T  319199 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgcgattggt 319298  T
Q  208 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag-- 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||      
T  319299 gattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatatgagatattggggttttgatgtaagta 319398  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  319399 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 319486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 51159973 - 51160335
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctt----acatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgac 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    |||| ||||||   ||||| ||||||| |||||    
T  51159973 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgac 51160072  T
Q  129 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 228  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51160073 gaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaat 51160172  T
Q  229 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattg 328  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  51160173 aactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggtttgatgtaagtattgatttgagaatattattattg 51160272  T
Q  329 atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  51160273 atcaagtgcatgatgtttaaattgagatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 51160335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17099181 - 17098913
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17099181 gtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 17099082  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17099081 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatttatgagaatatta 17098982  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17098981 ttattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 17098913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 390
Target Start/End: Original strand, 12351332 - 12351709
Alignment:
Q  16 tcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12351332 tcatagtggtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttg 12351431  T
Q  116 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||   | |||||| || ||    
T  12351432 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccagtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtcttgttttgaaatgtgactggtg 12351531  T
Q  216 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatg 313  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||  |||||||   ||||    
T  12351532 attgtgtatgaataattatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgacataagtattgatatg 12351631  T
Q  314 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     || ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12351632 tgagtattattgttgatcaactgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12351709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 47786356 - 47786735
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47786356 catcatagtcatgttgag-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 47786454  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgat 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  47786455 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgat 47786554  T
Q  211 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatat 308  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  47786555 tggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgagattagtgattaattgatgtgagatattgggattgtgatataagtatat 47786654  T
Q  309 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  47786655 atatgtgaaaactattattgatcaagtacatgatgtt--aattgatatattcatgataacagttatttggattatgatgatgt 47786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 6148457 - 6148723
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  6148457 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatat--gtgattggtgattgtgtg 6148554  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6148555 tgaatacttgtgaattgatattcgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatgtgtatgagaatatta 6148654  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6148655 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 6148723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30204961 - 30204696
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  30204961 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttgtg--tcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 30204864  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30204863 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaacattat 30204764  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30204763 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatccatattaacttttatttggattatgatgatgt 30204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7852482 - 7852223
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7852482 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 7852383  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 212  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||||    
T  7852382 tggatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattg 7852283  T
Q  213 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
     ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7852282 gtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgatt 7852223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11812994 - 11812801
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11812994 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 11812895  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11812894 tgtaagtataaatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 11812801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 16183665 - 16183945
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  16183665 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtctg 16183764  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-------------gatgtaagtatatgt 310  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||  ||||| |    
T  16183765 tgaatgattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttttgatatatatatatatatatatatatat 16183864  T
Q  311 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16183865 atgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 16183945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8630521 - 8630315
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  8630521 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 8630422  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  8630421 ggcatcgaaggtgacgacctggaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattaa 8630322  T
Q  214 tgattgt 220  Q
    |||||||    
T  8630321 tgattgt 8630315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 19572430 - 19572693
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19572430 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgagtggtgattgtgaa 19572529  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 321  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  19572530 tgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 19572624  T
Q  322 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19572625 attattgatcaaacacatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19572693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 22145882 - 22146145
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  22145882 gtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtcttattgatatatgtgattggtgattgcata 22145981  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||   |||| |||   |||    
T  22145982 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgttagatattgggg-tggatgtatgtattgatatgtgaa---tat 22146077  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22146078 tattgatcaagtgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 22146145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 38166407 - 38166213
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 296  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  38166407 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggagttttg 38166308  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38166307 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 38166213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18738167 - 18737974
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18738167 tgatatatgtaattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattgaagattattgatgtgagatattggggtttga 18738068  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18738067 tgtaagtatatgtatgagaatagtactattgatcaagtgcatgatgtttatattggaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18737974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 14060726 - 14060980
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14060726 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagatgggggtgaactcttacattcgatatttttg 14060825  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 209  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |    
T  14060826 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtaaaatgtaa 14060925  T
Q  210 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 266  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14060926 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattg 14060980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19944998 - 19944805
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19944998 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttga 19944899  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19944898 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19944805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7851877 - 7851683
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 296  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  7851877 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttgtc 7851778  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7851777 atataagtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatactaactgttatttggattatgatgatgt 7851683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30141177 - 30140984
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  30141177 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 30141078  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30141077 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 30140984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 207 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12796908 - 12796728
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12796908 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 12796809  T
Q  307 --atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 385  Q
      ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12796808 tgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgat 12796728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17936649 - 17936455
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17936649 tgatatatatgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatttgagattattgatgtgagatattggggtttga 17936550  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat-attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17936549 tataagtatatgtatgggaatattataattgatcaagtgcatgatgtttatgatgaaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 17936455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 38812481 - 38812671
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  38812481 catcatagtcatgttgagtctagtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacggg-gtgaaatattacatacgatgtttttg 38812579  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttattg 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38812580 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatggtgacatgagtcttattg 38812671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Original strand, 18008645 - 18008776
Alignment:
Q  36 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18008645 tagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttg 18008744  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18008745 aggtgattcagtaccacatgcatttatgcgtc 18008776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19230734 - 19230535
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  19230734 catcatagttatgttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 19230635  T
Q  114 tgcatcgaaa-gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    | |||||||| |||||||| ||  || |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19230634 ttcatcgaaaggtgacgacgttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgataaatgtgattg 19230535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15874820 - 15874690
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15874820 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 15874721  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15874720 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15874690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16819234 - 16819043
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16819234 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 16819135  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16819134 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16819043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48420327 - 48420197
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48420327 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgacc 48420228  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48420227 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 48420197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 55442252 - 55442404
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55442252 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 55442351  T
Q  114 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55442352 tgcattgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatg 55442404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 163
Target Start/End: Original strand, 12490249 - 12490372
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12490249 tgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgagat 12490348  T
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    
T  12490349 gattcggtaccacatgcatttatg 12490372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14287596 - 14287323
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||    
T  14287596 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattttg 14287497  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggt-ttgatgtaag--tatatgtatgagaa 317  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |  || | ||||  ||||| |||| |||    
T  14287496 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgttgattaattgatgtgaggtattggaatcatggtataagtatatatatatgtgaa 14287397  T
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14287396 cgttattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14287323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2048723 - 2048535
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  2048723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 2048624  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2048623 ttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 2048535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 11330493 - 11330643
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11330493 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 11330592  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  11330593 ttgcatcaaaggtgacaaccttgaggtgactcggtaccacatgcatttatg 11330643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 11199144 - 11199415
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| | ||   || ||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  11199144 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtggcgggctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgt 11199242  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | |||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |  || | || |||||| |||| ||||    
T  11199243 gcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaatattggaatgatggtatatgtatatatatgtgaat 11199342  T
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11199343 attattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattgttcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11199415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 5229607 - 5229721
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229607 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5229706  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5229707 tgcatatatgtgtcg 5229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33340506 - 33340317
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  33340506 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 33340407  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33340406 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 33340317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23491169 - 23490980
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  23491169 tgtagttgtaaaaaggttgtgctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 23491070  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  23491069 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 23490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35122189 - 35121921
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| || |||||||||||||| ||   |   ||||||| ||||||||    
T  35122189 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacattatgacatgagtcttgttttgaatcgtgattggtgattgtg 35122090  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  |||||| ||||||| | ||||  ||      
T  35122089 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaatttgggattttgatataagtatttatatgtaaa-- 35121992  T
Q  320 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35121991 -tattattgatcaagtacacgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35121921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19945289 - 19945098
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | ||||||||||    
T  19945289 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggtggttttgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgacct 19945191  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatga 226  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||    
T  19945190 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtttatga 19945098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8630232 - 8630101
Alignment:
Q  202 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgta 301  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8630232 atatgtgattggtaattgtgcatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggagattatgaatgtgagatattggggtttgatgta 8630133  T
Q  302 agtatatgtatgagaatattattattgatcaa 333  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8630132 agtatatgtatgtggatattgttattgatcaa 8630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10737219 - 10737033
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  10737219 tgtagttgtaaaagggttgagctcttctacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtggcgacct 10737121  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  10737120 tttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgattgt 10737033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14297000 - 14296730
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14297000 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14296902  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14296901 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14296802  T
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14296801 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14296730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14302627 - 14302357
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14302627 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14302529  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14302528 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14302429  T
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14302428 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14302357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 14846160 - 14846339
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14846160 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggggggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14846258  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14846259 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgat 14846339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 291
Target Start/End: Original strand, 11062691 - 11062861
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  11062691 gtgacgaccttgaagtgaaacggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcaggacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 11062790  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 291  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11062791 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattggg 11062861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47983531 - 47983418
Alignment:
Q  56 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47983531 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47983432  T
Q  155 gcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||| |||| ||||    
T  47983431 gcatatatgtgtcg 47983418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47992818 - 47992705
Alignment:
Q  56 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47992818 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47992719  T
Q  155 gcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||| |||| ||||    
T  47992718 gcatatatgtgtcg 47992705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48002105 - 48001992
Alignment:
Q  56 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48002105 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48002006  T
Q  155 gcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||| |||| ||||    
T  48002005 gcatatatgtgtcg 48001992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48011391 - 48011278
Alignment:
Q  56 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48011391 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48011292  T
Q  155 gcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||| |||| ||||    
T  48011291 gcatatatgtgtcg 48011278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 282 - 390
Target Start/End: Original strand, 54045594 - 54045703
Alignment:
Q  282 agatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  54045594 agatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactattatttggatt 54045693  T
Q  381 atgatgatgt 390  Q
    ||||||||||    
T  54045694 atgatgatgt 54045703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11813403 - 11813307
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11813403 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgctgattgt 11813307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 9592239 - 9592394
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  9592239 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacacatgatgtgtttg 9592338  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9592339 ttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 9592394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13816070 - 13815973
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 295  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13816070 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgacgtgagatattggagttt 13815973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 14523006 - 14523278
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  || |||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  14523006 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggaacacatcatg-cataagtcttattggtgaaatgtaattgatgattgt 14523104  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatg---taagtatatgtatgaga 316  Q
    | ||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | || || | |  |||||   || |||| | || | ||    
T  14523105 gcatgcataagtgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgaataattgagctga-atctttgagaatgatggtatatgtatttatacgtga 14523203  T
Q  317 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14523204 atattattattgatcaagtacatgatggttaaattggaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14523278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Original strand, 17958169 - 17958303
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17958169 catgtgattggtgattattgatgtgagatattgggggatatgatgtaagtattaatatgggagtattattattgatcaagtacatgatgtttactttgaa 17958268  T
Q  355 ttattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 390  Q
     ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17958269 atatccatgttaactgttatt-gattatgttgatgt 17958303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49230869 - 49230655
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||| |||      
T  49230869 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacgttgtt 49230772  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 237  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  49230771 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 49230672  T
Q  238 ttgatatttgttcatga 254  Q
    |||||| ||||||||||    
T  49230671 ttgataattgttcatga 49230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5227378 - 5227201
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc- 132  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||| ||| |  ||||||| |||||||||     
T  5227378 tgtagttgtaaaagggttgg-ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgttt-tatcatcgaatgtgacgacct 5227281  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgatt 211  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5227280 ttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgatt 5227201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 15939959 - 15940140
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| |  |||| | |||||||||||     
T  15939959 gttgtaaaagggctgaacttttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tctatcggaggtgacgaccttt 15940057  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15940058 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgat 15940140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 17913751 - 17913933
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||| | ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  17913751 tgtaaaagggttaagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacgtacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 17913849  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17913850 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgattgt 17913933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41660249 - 41660135
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41660249 actcttttatttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 41660150  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41660149 tgcatatatgtgtcg 41660135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 54686707 - 54686551
Alignment:
Q  202 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt--gatg 299  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  54686707 atatgtgatcggtaattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggtttttgatg 54686615  T
Q  300 taagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 363  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  54686614 taagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 54686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Original strand, 11062944 - 11063020
Alignment:
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11062944 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11063020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 17957996 - 17958093
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgattgt 17958093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44228083 - 44227903
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  44228083 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 44227985  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  44227984 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 44227903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 363
Target Start/End: Original strand, 9304664 - 9304819
Alignment:
Q  202 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  9304664 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 9304756  T
Q  301 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 363  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  9304757 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 9304819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16819565 - 16819386
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16819565 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgcaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16819467  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16819466 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 16819386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16259683 - 16259487
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  16259683 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 16259589  T
Q  153 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 252  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  16259588 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaatatttgtcaattgataattgttcat 16259489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25057166 - 25057035
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25057166 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaa 25057072  T
Q  355 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  25057071 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 25057035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15516197 - 15516035
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15516197 gtgacgaccttgaagtgatttcgtaccacatgcatatat----cgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 15516102  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 288  Q
      ||| |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  15516101 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 15516035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262698
Alignment:
Q  125 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19262698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13815943 - 13815856
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13815943 tatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 13815856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19230499 - 19230318
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19230499 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 19230407  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19230406 tgtaagtattaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19230318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11813253 - 11813179
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11813253 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacccatgtgattggtgatt 11813179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Original strand, 12563136 - 12563281
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12563136 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatggcatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 12563235  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 266  Q
    | |||| ||| ||||  |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  12563236 gcatgattaaatgtgatttgatgatttctcatgacacatgtgattg 12563281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25057344 - 25057247
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  25057344 gtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 25057247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 163
Target Start/End: Original strand, 33370914 - 33371002
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33370914 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgat-tttttgttgcaccatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 33371002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Original strand, 17536847 - 17536923
Alignment:
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17536847 gaatattattattgatcaagtgcatgaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 17536923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18908854 - 18908679
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18908854 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 18908762  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18908761 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18908679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22273209 - 22273034
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22273209 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 22273117  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22273116 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 22273034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27839362 - 27839184
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  27839362 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 27839265  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27839264 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgatgat 27839184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581310
Alignment:
Q  148 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 45581310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7852035 - 7851968
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 265  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852035 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 7851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Original strand, 15860824 - 15860902
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15860824 gatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 15860902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Original strand, 18905356 - 18905434
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18905356 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18905434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18908966 - 18908892
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18908966 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 18908892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 49230429 - 49230262
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  49230429 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatattggggtgtga 49230337  T
Q  298 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  49230336 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtccatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatt 49230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15613720 - 15613564
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  15613720 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 15613626  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15613625 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15613564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11813120 - 11813048
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11813120 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgaaacatgtaattggtgatt 11813048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17137969 - 17137827
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat-atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||    
T  17137969 gtgacaaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtgaattaggtgcacatcatgacatgagtgttattggtgtaatgtggttgatgattgtg 17137870  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 266  Q
     || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17137869 cat-aataaatgtg-attgatgtttgttcatgacacatgtgattg 17137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 197
Target Start/End: Original strand, 23081682 - 23081821
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  23081682 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 23081776  T
Q  153 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23081777 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 23081821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23490898 - 23490768
Alignment:
Q  258 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  23490898 atgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttactattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaa 23490804  T
Q  356 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23490803 tactcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23490768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16819355 - 16819292
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16819355 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 16819292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30141456 - 30141361
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 219  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  30141456 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 30141361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 2450910 - 2451004
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2450910 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 2451004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 120
Target Start/End: Original strand, 11517010 - 11517056
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517010 atgtaaaacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 11517056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18909263 - 18909169
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18909263 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18909169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22273618 - 22273524
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22273618 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40938236 - 40938085
Alignment:
Q  122 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | || ||| |||| |||    
T  40938236 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgagctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgaatgataatt 40938138  T
Q  219 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40938137 gtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgatt 40938085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 12266007 - 12266167
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  12266007 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 12266101  T
Q  153 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  12266102 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 12266167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15574618 - 15574545
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15574618 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15574545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 16745670 - 16745848
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16745670 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16745767  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16745768 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 16745848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Original strand, 53900388 - 53900463
Alignment:
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  53900388 gaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattatttatg-taactgttgtttggattatgatgatgt 53900463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 1469236 - 1469330
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1469236 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 1469330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7851931 - 7851857
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  7851931 tgatatatgtggttgatggttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtggttgatgatt 7851857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Original strand, 17536606 - 17536774
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| |  | ||    
T  17536606 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtattggt 17536704  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 289  Q
    |  ||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  17536705 gcgtgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacagatgtgatcggtgattaattgatgtgagttattg 17536774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33340155 - 33340038
Alignment:
Q  268 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||| ||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||| |    
T  33340155 tgattattgatgttagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattagtgatcaaatgcatgttgtt--aattgaattattcatgat 33340063  T
Q  366 aattgttattggattatgatgatgt 390  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  33340062 aactgttattggattatgataatgt 33340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 217
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470141
Alignment:
Q  125 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  15470048 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15470141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 390
Target Start/End: Original strand, 19262733 - 19262907
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 304  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19262733 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 19262825  T
Q  305 at--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg-ttattggattatgatgatgt 390  Q
    ||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||    
T  19262826 attaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgctaattggattatgataatgt 19262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30151991 - 30151813
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30151991 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 30151894  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  30151893 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 30151813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Original strand, 12563334 - 12563397
Alignment:
Q  328 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12563334 gattaagtacatgatatttaaattgaattattcatgttaagtgttatgtgaattatgatgatgt 12563397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12951555 - 12951476
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12951555 gtgacgaccttgaagtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 12951476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 39654237 - 39654163
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39654237 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 39654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 8269976 - 8270080
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8269976 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8270075  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  8270076 gtgat 8270080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 8277087 - 8277191
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8277087 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8277186  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  8277187 gtgat 8277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 8305896 - 8306000
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8305896 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8305995  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  8305996 gtgat 8306000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 390
Target Start/End: Original strand, 14061039 - 14061110
Alignment:
Q  320 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14061039 ttatcattgattaagtacatgatgttga-attgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 14061110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53769241 - 53769137
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  53769241 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 53769142  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  53769141 gtgat 53769137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 13956378 - 13956457
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13956378 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13956457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 13977211 - 13977290
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13977211 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13977290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 85
Target Start/End: Original strand, 18905296 - 18905343
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggg 85  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18905296 gttgtaaaagggttgggctcttttactttggagattatgtaaggcggg 18905343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41268822 - 41268743
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  41268822 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 41268743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45859600 - 45859521
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  45859600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 45859521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 271
Target Start/End: Original strand, 53900177 - 53900326
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| | |||||    
T  53900177 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcggtctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaattgt 53900275  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 271  Q
    | |||||||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53900276 gcatgaatatacgtgatttgatacttgtttatgacacatgtgattgatgat 53900326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 55314962 - 55314883
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  55314962 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 55314883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 2451155 - 2451229
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  2451155 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 2451229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22273321 - 22273247
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  22273321 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 22273247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 49230583 - 49230509
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  49230583 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 49230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Original strand, 2451035 - 2451084
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2451035 tgtgattgatgtttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2451084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10736953 - 10736904
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  10736953 catgtgattggtgattattaatgtgagatattggagtgtgacgtaagtat 10736904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 169
Target Start/End: Original strand, 11883923 - 11883968
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 169  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11883923 gtgacgactttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 11883968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14291955 - 14291910
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 169  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14291955 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcga 14291910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Original strand, 38377415 - 38377460
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38377415 gtgacgacctttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcg 38377460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45581230 - 45581181
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45581230 catgagattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 45581181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15989548 - 15989508
Alignment:
Q  124 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15989548 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 15989508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4863943 - 4863551
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4863943 catcataatcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 4863844  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------g 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||       |    
T  4863843 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgg 4863744  T
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4863743 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 4863644  T
Q  306 ------tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
          ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||    
T  4863643 tatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattaaattattcatgattaactgttgttttgattatgatgatgt 4863551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 27185318 - 27185699
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27185318 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27185417  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  27185418 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 27185517  T
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27185518 tgattgataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttgtacatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 27185617  T
Q  307 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
       |||| |||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27185618 tgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcataatgtttatattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 27185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 74 - 390
Target Start/End: Original strand, 21661268 - 21661593
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21661268 atgtaagactggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataag 21661367  T
Q  174 tgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || ||     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661368 tgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 21661467  T
Q  267 gtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 365  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  21661468 gtgattattgttgtgagatattggggtcttgatgtaagcatatgtatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgtt 21661567  T
Q  366 aattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  21661568 aactgttatttggattatgatgatgt 21661593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21392698 - 21392432
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21392698 gtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgta 21392599  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392598 tgaataattggaaactgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatttt 21392500  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21392499 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21392432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34937764 - 34937571
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34937764 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgttagatattggggtttga 34937665  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34937664 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34937571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10500 - 10307
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10500 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10401  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10400 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 10780112 - 10780305
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10780112 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10780211  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10780212 tgtaagtattgatgtgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10780305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 32967661 - 32967815
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32967661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 32967760  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32967761 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 32967815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 43445708 - 43445901
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43445708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 43445807  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  43445808 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 43445901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23492662 - 23492532
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23492662 ttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23492563  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23492562 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23492532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28257970 - 28257781
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28257970 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 28257871  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28257870 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcattttaactgttattttgattatgatgatgt 28257781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 22885041 - 22885234
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22885041 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggcgatcattgatgtgagatattggggtttga 22885140  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||    
T  22885141 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgatgactgttatttggattatgataatgt 22885234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 198
Target Start/End: Original strand, 24226976 - 24227146
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24226976 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 24227075  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24227076 ttgaggtgattcggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 24227146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 204 - 390
Target Start/End: Original strand, 25211796 - 25211982
Alignment:
Q  204 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25211796 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25211895  T
Q  303 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25211896 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25211982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 204 - 390
Target Start/End: Original strand, 25275948 - 25276134
Alignment:
Q  204 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25275948 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25276047  T
Q  303 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25276048 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25276134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21615671 - 21615535
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21615671 ttgtagctgtaaaagagttgaactcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 21615572  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21615571 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 21615535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 201 - 390
Target Start/End: Original strand, 17473704 - 17473892
Alignment:
Q  201 tatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgt 300  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17473704 tatatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttgatgt 17473803  T
Q  301 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| || ||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17473804 aagtat-tg-atgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17473892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7727257 - 7727112
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7727257 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaggggttgagctattttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 7727158  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7727157 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 7727112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19498120 - 19497952
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498120 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 19498021  T
Q  307 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
       | || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  19498020 tgatgtgtgaatattattaatgatcatgtacgtaatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatt 19497952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19860912 - 19860756
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19860912 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagagttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19860813  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 169  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19860812 ttgtatcgaaggtgacgaccttggggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 19860756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28888598 - 28888441
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888598 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 28888499  T
Q  113 ttgcatcgaa---agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    ||||||||||     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28888498 ttgcatcgaagatgatgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 28888441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11582414 - 11582266
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11582414 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 11582315  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11582314 tgaataactgtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgatt 11582266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11580113 - 11579922
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 296  Q
    |||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||    
T  11580113 tgatgtatatgattggtgactgcgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattactgatgtgagatattggagttttg 11580014  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  11580013 atgtaagtata--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 270
Target Start/End: Original strand, 1170321 - 1170467
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1170321 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 1170420  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 270  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1170421 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatgtgatttgtga 1170467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13793809 - 13793659
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  13793809 catcatagtcatgttgagtcttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgagatcttatatacgatgtttttg 13793710  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13793709 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13793659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 37189637 - 37189767
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37189637 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37189736  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37189737 ttgaggtgattcggtaccacttgcatttatg 37189767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23453454 - 23453184
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23453454 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23453355  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23453354 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23453258  T
Q  319 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23453257 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23453184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23460698 - 23460428
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23460698 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23460599  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23460598 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23460502  T
Q  319 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23460501 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23460428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23464959 - 23464689
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23464959 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23464860  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23464859 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23464763  T
Q  319 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23464762 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23464689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 272
Target Start/End: Original strand, 1221351 - 1221584
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||| ||||      
T  1221351 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaacttgtt 1221449  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 237  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |    
T  1221450 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaa 1221549  T
Q  238 ttgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1221550 ttgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 1221584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 23986165 - 23986359
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatatt-ggggtttg 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| ||    
T  23986165 gatatatgtgaatgatgattgtgtatgaataactgtgaattaatatttgttcctgacacatatgattggtgattacttgatgtgaaacattgggggtatg 23986264  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23986265 atgtaagtattgatatgagagtattattatttatcaagtgcatgatgtttatatagaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23986359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 248 - 390
Target Start/End: Original strand, 1171320 - 1171464
Alignment:
Q  248 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 346  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1171320 ttcatgataaatgtgattgatgtttattaatgtgagatattggggctttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 1171419  T
Q  347 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1171420 atattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgatgatgt 1171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 9732592 - 9732782
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  9732592 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgcgagatattgggatgtga 9732691  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9732692 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatcttgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 9732782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 1221638 - 1221826
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1221638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttga 1221737  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  1221738 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 1221826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11964586 - 11964472
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11964586 actcttttacttcggtgataatgtaatacgggtttgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtggtttggtaccaca 11964487  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||||||||| ||||    
T  11964486 tgcatgtatgtgtcg 11964472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 24184869 - 24185137
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  24184869 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaagtgtgattggtgattgtg 24184968  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||| | || |||| |  |||| | |||| |||      
T  24184969 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatggaattggtgattaattgatgtgagaaattgagattatgatatttgtatttatatgtgaa-- 24185066  T
Q  320 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24185067 -tattattgatcaattacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24185137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24470804 - 24470555
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||            
T  24470804 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttactgatatatgtgattgctg-------- 24470713  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
          |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||   | || |   |||||    
T  24470712 ------attgtgaattgataattgttcgtgacatatgtgattgattattattgttgtgagatattggggtgtgatgtaaatattattgtgtg---attat 24470622  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24470621 tattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaactattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 24470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 21653052 - 21653148
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21653052 gtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 21653148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 11213222 - 11213404
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11213222 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11213320  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  11213321 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgattgt 11213404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 110604 - 110785
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  110604 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 110701  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  110702 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 110785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 20455627 - 20455741
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20455627 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgatcttgaggtgatttggtaccaca 20455726  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20455727 tgcatatatgtgtcg 20455741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Original strand, 22884887 - 22885017
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| |    
T  22884887 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaa 22884986  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22884987 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Original strand, 17473568 - 17473648
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17473568 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 17473648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23510473 - 23510313
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtat 238  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  23510473 gatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaat 23510374  T
Q  239 tgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    ||||| ||||||   |||    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23510373 tgataattgttc---aca----tgattgatgactattgatgtgagatattggggtatgatgcaagtat 23510313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 29192671 - 29192857
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  29192671 tgataaatgtgattggtgattgtgattgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgcgagatatcggggtttga 29192763  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  29192764 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 29192857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17908030 - 17907853
Alignment:
Q  202 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  17908030 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggttttggtgt 17907938  T
Q  301 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtta-ttggattatg 383  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  17907937 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgattaactgttatttggattatg 17907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 35792767 - 35792964
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || ||||||||||||    
T  35792767 actcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtacca 35792861  T
Q  152 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttca 251  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  35792862 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagatcgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 35792961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16534881 - 16534750
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgt 222  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||  |||||||     
T  16534881 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattggagattgtga 16534782  T
Q  223 atgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16534781 atgaataattgtgaattgataattgttcatga 16534750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 35793162 - 35793345
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  35793162 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 35793254  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35793255 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 35793345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10628 - 10554
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 18779790 - 18779904
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||| | ||||| |||    
T  18779790 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaacatttgtgaatt 18779889  T
Q  240 gatatttgttcatga 254  Q
    |||| ||||||||||    
T  18779890 gataattgttcatga 18779904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 22368188 - 22368285
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22368188 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattgt 22368285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19498458 - 19498280
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19498458 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19498361  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19498360 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28258093 - 28257998
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  28258093 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttatcgataaatgtggttggtgattgt 28257998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 9732495 - 9732562
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9732495 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 9732562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 10779799 - 10779980
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  10779799 tgtaaaagggttgagctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 10779896  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  10779897 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 10779980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 390
Target Start/End: Original strand, 11338584 - 11338802
Alignment:
Q  186 catgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaaga 284  Q
    |||||||||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11338584 catgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtg-attgataattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagt 11338682  T
Q  285 tattggggt-------------ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 371  Q
    ||||||| |             |  || ||  ||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11338683 tattgggatcatgatatatatatatatatatatatatatatatgaatgttgttattgatcaagtacatgatcttttaattgaaatattcatgttaattgt 11338782  T
Q  372 tat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  11338783 tatgtggattatgatgatgt 11338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 25944566 - 25944750
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 296  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  25944566 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattaatgtgagatattagggtgtg 25944658  T
Q  297 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25944659 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 25944750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11340782 - 11340599
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||        |||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  11340782 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataatcgttcata-------tgattgatgaatatttatgtgagatatcggggtgtga 11340690  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11340689 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 11340599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11341294 - 11341116
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11341294 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11341197  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11341196 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11341116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 18780052 - 18780235
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  18780052 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 18780144  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18780145 tgtaagtatta--atgtgta-attattattaatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18780235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25425206 - 25425102
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25425206 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 25425107  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  25425106 gtgat 25425102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11341085 - 11341018
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11341085 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgaatggtgatt 11341018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10831
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10925 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Original strand, 110990 - 111157
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  110990 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 111082  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  111083 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 111157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Original strand, 5452432 - 5452511
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5452432 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 5452511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19498248 - 19498182
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19498248 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19498182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 43445390 - 43445555
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  43445390 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 43445488  T
Q  152 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  43445489 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtgat 43445555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 4201586 - 4201764
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    ||  ||||||||| |||||||||||      
T  4201586 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgacatcgaaaggtgacgaccttgtt 4201683  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4201684 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 4201764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 9732360 - 9732464
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  9732360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattg 9732459  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  9732460 gtgat 9732464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16534574 - 16534391
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||  | ||||| |||    
T  16534574 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagacttcggggtgtga 16534482  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16534481 tgtaagtatta--atgtgta-attattgttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaattattatctggattatgataatgt 16534391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211719
Alignment:
Q  151 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 247  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275871
Alignment:
Q  151 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 247  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25275871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25424736 - 25424680
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  25424736 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatt 25424680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 25944472 - 25944536
Alignment:
Q  208 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25944472 gattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 25944536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 43445582 - 43445654
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  43445582 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggcgatt 43445654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 21075192 - 21075286
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21075192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21075286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 21933863 - 21933957
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21933863 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21933957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 21940033 - 21940127
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21940033 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21940127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 22368337 - 22368411
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22368337 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcaggatacatgtaattggtgatt 22368411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 29192321 - 29192415
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  29192321 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgat 29192415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35580829 - 35580735
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35580829 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 35580735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 37010867 - 37010961
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37010867 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37010961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3672497 - 3672421
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  3672497 gtgacgaccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactagatgcatatcaagacatgagtcttatt 3672421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 10780011 - 10780082
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10780011 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 10780082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Original strand, 22368602 - 22368674
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22368602 attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgataatgt 22368674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24595159 - 24594981
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  24595159 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 24595062  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24595061 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 24594981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23327598 - 23327458
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  23327598 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23327500  T
Q  152 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  23327499 catgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtc 23327458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27008596 - 27008492
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  27008596 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 27008497  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  27008496 gtgat 27008492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Original strand, 110888 - 110957
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 268  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  110888 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgata-ttgttcatgatacatgtaattggt 110957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7726993 - 7726919
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7726993 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttagctgttatctggattatgatgatgt 7726919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 25902021 - 25902123
Alignment:
Q  116 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 214  Q
    ||||||| |||||||||||   | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| |    
T  25902021 catcgaaggtgacgaccttatagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggt 25902120  T
Q  215 gat 217  Q
    |||    
T  25902121 gat 25902123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 29192583 - 29192641
Alignment:
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  29192583 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 29192641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37051559 - 37051465
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  37051559 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 37051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 295
Target Start/End: Original strand, 21653228 - 21653265
Alignment:
Q  258 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21653228 atgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggttt 21653265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21649495 - 21649463
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttc 66  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21649495 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttc 21649463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 256560 - 256827
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  256560 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 256659  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256660 tgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 256759  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  256760 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaaatattcatattaactgttatttggattatgatgatgt 256827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Original strand, 125009 - 125089
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  125009 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 125089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Original strand, 72028 - 72106
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72028 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Original strand, 76409 - 76487
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  76409 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 76487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 193057 - 192985
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193057 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 192985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 390
Target Start/End: Original strand, 72191 - 72317
Alignment:
Q  260 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 357  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  72191 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 72283  T
Q  358 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  72284 ttcatgataactgttatttggattatgatgatgt 72317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 390
Target Start/End: Original strand, 76572 - 76698
Alignment:
Q  260 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 357  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  76572 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 76664  T
Q  358 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76665 ttcttgataactgttatttggattatgatgatgt 76698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 125173 - 125298
Alignment:
Q  261 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 358  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  125173 tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 125265  T
Q  359 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  125266 tcatgataactgttatttagattatgatgatgt 125298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 192897 - 192768
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  192897 catgtaattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 192805  T
Q  355 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  192804 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 192768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 21961053 - 21961440
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21961053 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 21961152  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  21961153 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgttta 21961252  T
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||| ||||    
T  21961253 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagctattgggagtatgatttaag 21961352  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21961353 tattgatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21961440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 390
Target Start/End: Original strand, 12837900 - 12838192
Alignment:
Q  102 cgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12837900 cgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctttttg 12837999  T
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgat 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12838000 atatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggttttgat 12838099  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12838100 ataagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12838192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 390
Target Start/End: Original strand, 12901269 - 12901631
Alignment:
Q  26 gttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12901269 gttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggt 12901368  T
Q  126 gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatat-----gtgattgatgattg 219  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || |     ||||||| ||||||    
T  12901369 gacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttgaaatgtgattggtgattggtgattg 12901468  T
Q  220 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 317  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||          |    
T  12901469 tgtacgaataactgtgaattgattattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat----------a 12901558  T
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12901559 tatttatattgatcaagtacatgatgtttgaatt-aattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12901631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44345333 - 44345057
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||     
T  44345333 gtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatatgtttggtgattgtgtg 44345234  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaa--------gtatatgtatga 314  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||    
T  44345233 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatatga 44345134  T
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  44345133 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttgttttgattatgatgatgt 44345057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33738732 - 33738477
Alignment:
Q  123 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33738732 agtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgt 33738633  T
Q  223 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                
T  33738632 atgaataattgtgaattgatatttgctcatggcacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatg------------ 33738545  T
Q  322 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
      |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33738544 --tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 33738477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18167067 - 18166874
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18167067 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18166968  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18166967 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 18166874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 8873978 - 8874162
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  8873978 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaatgggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 8874077  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8874078 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 8874162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34393580 - 34393385
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 295  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  34393580 tgatatatgtgattggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacagatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 34393481  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34393480 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34393385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 53909555 - 53909750
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 295  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  53909555 tgataaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 53909654  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  53909655 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgatgatgt 53909750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 16366361 - 16366624
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  16366361 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattagtgattgtgaa 16366460  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 321  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  16366461 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatgattattgatgtgagatattagggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 16366555  T
Q  322 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16366556 attattgatcaaacgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactattatttggattatgatgatgt 16366624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14900136 - 14899948
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14900136 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggtgattttgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcggaggtgacgacc 14900037  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14900036 ttgaggtgatttggtatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 14899948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 19699414 - 19699606
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19699414 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19699513  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19699514 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 19709999 - 19710191
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19709999 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19710098  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19710099 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19710191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 34197658 - 34197812
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34197658 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 34197757  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34197758 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 34197812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 7134310 - 7134503
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7134310 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgggatattggggtttga 7134409  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7134410 tgtaattattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7134503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8372800 - 8372607
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8372800 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 8372701  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8372700 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcttgttaactgttatttggattatgataatgt 8372607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 37958550 - 37958704
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37958550 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37958649  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37958650 ttgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 37958704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 15274470 - 15274663
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15274470 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 15274569  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15274570 tgtaagtattgatgtgggaattttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15274663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27959708 - 27959563
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27959708 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 27959609  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27959608 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 27959563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 110143 - 109957
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  110143 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 110045  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  110044 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 109957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 12245745 - 12245895
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12245745 catcatagtcatgttgagtcttgtatttgtaaaagggtttagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 12245844  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12245845 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 12245895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26678370 - 26678179
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  26678370 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgataggtgaatattgatgtgacatattggggtttga 26678271  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  26678270 tgtaagtattgatatgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 26678179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44054427 - 44054168
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  44054427 gtgacggccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 44054328  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatt 321  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||          |||||    
T  44054327 tgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgactggtgatttattgatatgagatattgggattatgatgtaagtat----------atatt 44054238  T
Q  322 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
      ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44054237 tatatcgatcaagtacatgatgtttgaattaaattaattatgttaactgttatttggattatgatgatgt 44054168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 45460611 - 45460894
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgatt- 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| |||||     
T  45460611 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccgcatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaactgtgattggtgattt 45460710  T
Q  219 -------gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatg 309  Q
           |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||     
T  45460711 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatgaattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 45460810  T
Q  310 --tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  45460811 catatgtgaatattatcattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattattatgatgt 45460894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 15852829 - 15852959
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15852829 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactttggtgaaatcttacatacgatgttttttttgcatcgaaggtgacgacc 15852928  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15852929 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15852959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 41167447 - 41167569
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41167447 ttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatctcacatacgatgtttttgttacatcgaaggtgacgacc 41167546  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  41167547 ttgaggtgattcggtaccacatg 41167569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15212004 - 15211762
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||| |    
T  15212004 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgtc 15211905  T
Q  132 cttga-ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattgatgattgtgtatgaata 229  Q
    |||   ||  |||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||    
T  15211904 ctttttggatatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgagta 15211805  T
Q  230 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
     || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15211804 tttttgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15211762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13244861 - 13244606
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13244861 gtgacgaccctgaaatgatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 13244762  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 321  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  13244761 tgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 13244674  T
Q  322 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13244673 attattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 390
Target Start/End: Original strand, 53706635 - 53706828
Alignment:
Q  196 attgatatatgtgatt-gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt 294  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  53706635 attgatatatgtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtg 53706734  T
Q  295 tgatgtaagta--tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||   || ||||      ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53706735 tgatgtaagtactaatttatg-----tttactattgatcaaatgcatgatgtttatactgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 53706828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 13811287 - 13811558
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || || |||||||    
T  13811287 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgcgaatgttgattgt 13811386  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||| | || | |||  | ||    
T  13811387 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcattacacgtgtgattggtgattaatggatgtaagatattgggattatg--gtatgaatttatatttggat 13811484  T
Q  319 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13811485 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 13811558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 30236147 - 30236411
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgattg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| ||| ||    
T  30236147 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaattgtgattggtgactg 30236246  T
Q  220 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 317  Q
    ||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||          
T  30236247 tgtatgaataactgtgaattattgattgttcatgacacatgtaattggtgatttattgatgtgagatattgcagttatgatataagtatatata------ 30236340  T
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
       |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30236341 ---tattattgatcaggtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 30236411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 22356424 - 22356616
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttg 296  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22356424 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 22356523  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| ||||||   |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22356524 atgcaagtattgttatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattattgttaactgttatttggattatgataatgt 22356616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 390
Target Start/End: Original strand, 20813715 - 20813890
Alignment:
Q  217 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatga 314  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||  |||     
T  20813715 ttgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattaatgaattattgatgtgaaatattgggattatgatataagtatatacatgt 20813814  T
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20813815 gtgaat-attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 20813890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47355688 - 47355509
Alignment:
Q  209 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 307  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  47355688 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 47355589  T
Q  308 tgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 390  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||    |||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47355588 gttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatcatgt---aattgaaatgttcgtgataactgttattggattatgataatgt 47355509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 53909431 - 53909519
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909431 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 53909519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 41257842 - 41258031
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaag-ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttttt 111  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||  ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  41257842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagggtg--ctcttctacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatattttt 41257939  T
Q  112 gttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41257940 gttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 41258031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 5372228 - 5372342
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5372228 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaagtcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 5372327  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5372328 tgcatatatgtgtcg 5372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 10238967 - 10239081
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238967 actcttttactttggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttgttgcatcatgtgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 10239066  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10239067 tgcatatatgtgtcg 10239081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 390
Target Start/End: Original strand, 18294600 - 18294746
Alignment:
Q  245 ttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgt 344  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18294600 ttgttcatgatttatgtgatcggtgattattgatgtgagatattgggatttaatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtagatgatat 18294699  T
Q  345 ttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18294700 ttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18294746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 47469867 - 47469976
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47469867 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttggggttatttggtaccaca 47469966  T
Q  154 tgcatgtatg 163  Q
    ||||| ||||    
T  47469967 tgcatatatg 47469976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16521447 - 16521294
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  16521447 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttg-tccatcggaggtgacgaccttt 16521349  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga 190  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16521348 tgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 5684404 - 5684586
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  5684404 tgtaaaagagttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 5684502  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  5684503 gagatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 5684586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 168
Target Start/End: Original strand, 50223696 - 50223806
Alignment:
Q  58 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 157  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50223696 ttttacttcggtgataatgtaagacgggtatgaaatctaacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgaccttgaggtgatttggtatcacatgca 50223795  T
Q  158 tgtatgcgtcg 168  Q
    | |||| ||||    
T  50223796 tatatgtgtcg 50223806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 216
Target Start/End: Original strand, 43283043 - 43283138
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatga 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  43283043 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatga 43283138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15211698 - 15211515
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||    
T  15211698 tgataaatgtgattggtgattgttaatgaatatttgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattgaggtgtga 15211606  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  ||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15211605 tgtaagtatgaatgtatga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15211515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 8874265 - 8874346
Alignment:
Q  310 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8874265 tatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 8874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10642683 - 10642586
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  10642683 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 10642586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19999183 - 19999005
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19999183 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19999086  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19999085 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19999005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34393666 - 34393610
Alignment:
Q  216 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393666 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 34393610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 52267125 - 52267196
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  52267125 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706591
Alignment:
Q  154 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 230  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttggtgattgtgtgtgaataa 53706591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 308
Target Start/End: Original strand, 55378542 - 55378646
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  55378542 gtgattgatgattgtgtatgaatatttgtgatttgatgattgttcatgacacataagattggtgattaattgatgtgagatattggaattatgatgtaag 55378641  T
Q  304 tatat 308  Q
    |||||    
T  55378642 tatat 55378646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8372921 - 8372854
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8372921 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 8372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18167164 - 18167097
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18167164 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 18167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 18496065 - 18496334
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga-tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||| || | | || ||| |||||| ||||    
T  18496065 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaactaggtgcacatcatgacatgagttttaatggtgaaatatgagtgatgactgtg 18496164  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
     || ||||| ||||  |||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || || | | | ||||| | ||   |||    
T  18496165 cataaataaatgtgatttgatgattattcatgaaacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatggtatgaatatatttgtg---ata 18496261  T
Q  320 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||  ||| || | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18496262 ttattatcggattaaatgcatgatatttaaattgaactattcatgttatttgttatatggattatgatgatgt 18496334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 210
Target Start/End: Original strand, 54119906 - 54119976
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 210  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54119906 gatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgat 54119976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 272
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134208
Alignment:
Q  151 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 250  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtg-ttgcgaatgaatatttgtgaattgatatttattc 7134186  T
Q  251 atgacacatgtgattggtgatt 272  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  7134187 ctgatacatgtgattggtgatt 7134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9293843 - 9293712
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  9293843 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa 9293749  T
Q  355 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9293748 atatccatgttatctgttatttggattatgataatgt 9293712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9294021 - 9293924
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||    
T  9294021 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattgt 9293924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10642505 - 10642374
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  10642505 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 10642411  T
Q  355 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  10642410 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 10642374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Original strand, 22356065 - 22356244
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22356065 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22356162  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  22356163 gagatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 22356244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 15138134 - 15138238
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15138134 gcatcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 15138233  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  15138234 gtgat 15138238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19998700 - 19998517
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  19998700 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 19998608  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| |||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  19998607 tgtgagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttgactgttatttggattatgataatgt 19998517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26678626 - 26678522
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  26678626 gcatcgaaagatgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattg 26678527  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  26678526 gtgat 26678522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 47355907 - 47355803
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47355907 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 47355808  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  47355807 gtgat 47355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26678491 - 26678428
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26678491 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 26678428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8373029 - 8372951
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8373029 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8372951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14994772 - 14994678
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  14994772 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 14994678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18167273 - 18167195
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18167273 gatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 18167195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18246762 - 18246668
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18246762 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18246668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19998973 - 19998907
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19998973 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19998907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Original strand, 25120617 - 25120663
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 80  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25120617 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 25120663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Original strand, 15274361 - 15274442
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  15274361 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 15274442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19998845 - 19998780
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  19998845 tgattggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtaattggtgatt 19998780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Original strand, 13751910 - 13751978
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13751910 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacatatgtgattggtgatta 13751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18246250 - 18246178
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  18246250 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 18246178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47355769 - 47355705
Alignment:
Q  208 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  47355769 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 47355705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848776
Alignment:
Q  144 tggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgat 242  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||| |||||  ||| |    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttgaaat-tgtgagtggtgattgtgtgcgaatagttgtggtttggt 7848804  T
Q  243 atttgttcatgacacatgtgattggtga 270  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  7848803 atttgtttaggacccatgtgattggtga 7848776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16520985 - 16520801
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16520985 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatatagatgtaagatatcggggtgtga 16520893  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatg-tttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  16520892 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgttttaaattgaaatatccatgttaactattatttagattatgatgatgt 16520801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Original strand, 54120066 - 54120195
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||| | | |||||||||   ||||||    
T  54120066 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcgaatgcatgatgtt--aattgaa 54120158  T
Q  355 ttattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54120159 atatccatgttaattgttaattggattatgttgatgt 54120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 383
Target Start/End: Original strand, 55378691 - 55378757
Alignment:
Q  317 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatg 383  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  55378691 atattattattgattaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacagttattggattatg 55378757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 34393727 - 34393690
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393727 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 34393690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14950602 - 14950498
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  14950602 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattg 14950503  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  14950502 gtgat 14950498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 109922 - 109828
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 304  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  109922 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 109830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15043443 - 15043381
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 184  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15043443 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15043381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 184
Target Start/End: Original strand, 15110981 - 15111043
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 184  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15110981 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16521080 - 16521015
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  16521080 tgattggtgattgtgtatgaataattgttaattgatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 16521015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 180
Target Start/End: Original strand, 53706465 - 53706521
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatat 180  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  53706465 gtgacgaccctgaggtgatctagtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatat 53706521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16521263 - 16521168
Alignment:
Q  160 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga-gtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16521263 tatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgatggcttattttgaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 16521168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10487243 - 10487149
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  10487243 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 10487149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 16329508 - 16329602
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16329508 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 16329602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 97
Target Start/End: Original strand, 17213378 - 17213420
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctta 97  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17213378 ctcttttacttcggcgaaaatgtaagacgggtgtgaaatctta 17213420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18246465 - 18246391
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  18246465 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtggattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 18246391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24237525 - 24237479
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  24237525 actcttttacttcggcgataatgtaagacgtgcgtgaaatcttacat 24237479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Original strand, 43283140 - 43283185
Alignment:
Q  246 tgttcatgacacatgtgattggtgattattg-atgtaagatattgg 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43283140 tgttcatgacatatgtgattggtgattgttgaatgtaagatattgg 43283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 385
Target Start/End: Original strand, 5684742 - 5684802
Alignment:
Q  326 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 385  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5684742 ttgatcaagtgcatgatgtttaatttgtaatattcatgttaactgttatttggattatgat 5684802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 13049739 - 13049843
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13049739 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13049838  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  13049839 gtgat 13049843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Original strand, 17377040 - 17377084
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17377040 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacattcatatatgtgtcg 17377084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 60250 - 59865
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60250 catcatattcgtgttgatattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 60151  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  60150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 60051  T
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat-tattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagt 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||    
T  60050 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatgtattgatgtgagatattgggaatatgatataagt 59951  T
Q  305 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || | | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  59950 at-tatttgtggatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 59865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35053515 - 35053141
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35053515 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtagaagggttgaactcttttacttatgagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 35053416  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga---- 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||        
T  35053415 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatgg 35053316  T
Q  210 ---ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
       ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||              
T  35053315 tgtttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattgtggtttg---------- 35053226  T
Q  307 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  35053225 atgtatgagaatgttattattgatcaagtacatggtgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 35053141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 22407894 - 22408162
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22407894 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 22407993  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22407994 tgaataattgtgaattgatatttgctcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatatta 22408093  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22408094 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 22408162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 2422733 - 2422997
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  2422733 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 2422832  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2422833 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa---tat 2422929  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2422930 tattgatcaagtgtatgatgtttatattgaaatatccatgttaattgttatttggattatgttgatgt 2422997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 5676091 - 5676355
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5676091 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctcttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 5676190  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg----- 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||         
T  5676191 tgcattgaaggtgacgaccttgaggtgatacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 5676290  T
Q  209 --attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676291 taattggtgattgtgtatgaataattatgtattgatatttg-tcatgacacatgtgattggtgatt 5676355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41217739 - 41217544
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41217739 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41217640  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41217639 gatgtaagtatatttatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41217544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Original strand, 5676350 - 5676535
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676350 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagta 5676449  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5676450 tatgcatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttataatgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 5676535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41218126 - 41217945
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41218126 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 41218027  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41218026 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgtatatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 41217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20444420 - 20444214
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20444420 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20444321  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20444320 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 20444221  T
Q  214 tgattgt 220  Q
    |||||||    
T  20444220 tgattgt 20444214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20252534 - 20252342
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20252534 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 20252435  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20252434 gtaagtattgatatgataatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20252342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 37845956 - 37846162
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  37845956 catcatagtcatgttgaaattgtagttgtaaaagggctgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 37846055  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  37846056 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 37846155  T
Q  214 tgattgt 220  Q
    |||||||    
T  37846156 tgattgt 37846162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20530185 - 20529978
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20530185 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20530086  T
Q  114 tgcatcgaa-agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    | |||||||  | |||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20530085 ttcatcgaagggggacgacgttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 20529986  T
Q  213 atgattgt 220  Q
     |||||||    
T  20529985 gtgattgt 20529978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49966151 - 49966013
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49966151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 49966052  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtg 262  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49966051 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtg 49966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 38035130 - 38035260
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38035130 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgacc 38035229  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38035230 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 38035260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 13378250 - 13378395
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13378250 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 13378349  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13378350 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 13378395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 9786123 - 9786315
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  9786123 tgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacaaatgtgattggagattattgatgtgagacattgggg-ttga 9786221  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9786222 tgtaagtacatgtatgaggatattattattgatcaagtgtatgatgtttatgatgaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 9786315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 35524082 - 35524350
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  35524082 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcacgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 35524181  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| | |||| |||||    
T  35524182 tatgaataactgtgatttggtgattgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatgtaagtatttatatgtgaata 35524281  T
Q  320 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  35524282 tt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 35524350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19601836 - 19601713
Alignment:
Q  35 gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacctt 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19601836 gtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgttgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctt 19601737  T
Q  135 gaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19601736 gaggtgattcggtaccacatgcat 19601713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 36357826 - 36357976
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  36357826 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaagactggagtgaaatcttacatacgatgtttttg 36357925  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36357926 ttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 36357976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 37235470 - 37235600
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37235470 ttgtagctataaaatggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37235569  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37235570 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 37235600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20930131 - 20929955
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  20930131 gttgtaaaatggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttacatcggaggtgacgaccttt 20930032  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20930031 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 20929955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21193844 - 21193694
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21193844 catcatagtcatgttgagttttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21193745  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21193744 ttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 21193694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22226638 - 22226459
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  22226638 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 22226540  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22226539 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 22226459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 290
Target Start/End: Original strand, 22836911 - 22837078
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22836911 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgatgattgtt 22837010  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattgg 290  Q
     ||| |||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22837011 catg-ataaatgtg-attgaagattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattgg 22837078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 327
Target Start/End: Original strand, 22250776 - 22250905
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22250776 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 22250875  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattatt 327  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22250876 tgtaagtattgatatgagaatattattatt 22250905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 149
Target Start/End: Original strand, 8539490 - 8539584
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8539490 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8539584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 149
Target Start/End: Original strand, 8604729 - 8604823
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8604729 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22352785 - 22352601
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22352785 gttgtaaaagggttgagctctcttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 22352687  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22352686 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22352601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 44036401 - 44036582
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  44036401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 44036500  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44036501 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 44036582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 51657986 - 51658255
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||    
T  51657986 gtgacgaccttggagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtggaatgtgaatgatgattgt 51658085  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tg--atgtaagtatatgtatgaga 316  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||| | |||||||||         
T  51658086 gtatgaataaatgtgatttgataattgttcatgccacatgcgattggtgattaattgatgtaagatattggaattatggtatgaatgtatatgta----g 51658181  T
Q  317 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51658182 atattatt-gtgattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 51658255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Original strand, 5769744 - 5769853
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5769744 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5769843  T
Q  154 tgcatgtatg 163  Q
    ||||| ||||    
T  5769844 tgcatatatg 5769853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 20895390 - 20895486
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20895390 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20895486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Original strand, 20956627 - 20956776
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20956627 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 20956726  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
      ||| || |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20956727 tcatg-attattgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgatt 20956776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 254
Target Start/End: Original strand, 15862938 - 15863149
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  15862938 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 15863032  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 237  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  15863033 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 15863132  T
Q  238 ttgatatttgttcatga 254  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15863133 ttgataattgttcatga 15863149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20821590 - 20821476
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20821590 actcttttacttcggcgataatgtaagacgggcgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgataccaca 20821491  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20821490 tgcatatatgtgtcg 20821476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505646
Alignment:
Q  218 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa 317  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   |||| |      
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatttgggtgtgatgtaagtattaatatgtg-t 18505719  T
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18505718 gattattattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18505646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 5471872 - 5472028
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||| | |  | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5471872 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaatgaggggtactcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttg 5471971  T
Q  113 ttgcatc-gaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5471972 ttgcatcatggggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5472028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 9785899 - 9785995
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  9785899 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 9785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21716707 - 21716430
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||  ||| |  || ||||||| | |||||    
T  21716707 gtgacgaccttgagataatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtctatttggtgaattgtgattggtaattgt 21716609  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt------tga-tgtaagtatatgtat 312  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||      ||  |||  |||||| |||    
T  21716608 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagattatggtatgtgtgtgtgtatatatat 21716509  T
Q  313 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21716508 atgaatattattattgatcaagtacatgatgtttataatgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 21716430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20526791 - 20526725
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20526791 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 20526725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 41213197 - 41213311
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213197 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttattgtatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 41213296  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41213297 tgcatatatgtgtcg 41213311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 364
Target Start/End: Original strand, 20895514 - 20895660
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                        
T  20895514 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtttatgacacatgtgattggtgattattga-------------------- 20895593  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgt 364  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20895594 tgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgt 20895660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Original strand, 22144923 - 22145036
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144923 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaattttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 22145022  T
Q  155 gcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||| |||| ||||    
T  22145023 gcatatatgtgtcg 22145036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41217867 - 41217793
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217867 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 41217793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 15863325 - 15863508
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  15863325 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 15863417  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15863418 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatggttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15863508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21857934 - 21857753
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||     ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21857934 tgataaatgtgattggtgattatgaatgaatatttgtgcattgataattgttca-----catg--attgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 21857842  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21857841 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatacatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 21857753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Original strand, 22250622 - 22250752
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | |||||||||  || |||| |    
T  22250622 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttggaaatgtgattggagactgtgaa 22250721  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22250722 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22250752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17147003 - 17146820
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| | |||| ||||| |||    
T  17147003 tgatatacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgaaatatcggggtgtga 17146911  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17146910 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17146820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27673355 - 27673257
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27673355 gtgacgcccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtctatttgataaatgtgattgatgattgt 27673257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22365252 - 22365155
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  22365252 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 22365155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17147362 - 17147258
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17147362 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 17147263  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  17147262 gtgat 17147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22352570 - 22352498
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22352570 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 22352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 15863221 - 15863295
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15863221 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15863295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22352468 - 22352285
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22352468 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgaaaattgttcata-------tgattgatgaatattgatatgagatattggggtgtga 22352376  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||  |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22352375 tgtaagtattaatgcgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgataatgt 22352285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21858035 - 21857966
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga 209  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21858035 gatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgacatatgtga 21857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Original strand, 35935166 - 35935239
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35935166 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 35935239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 7642105 - 7642270
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 151  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  7642105 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 7642203  T
Q  152 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  7642204 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtgat 7642270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17003396 - 17003302
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17003396 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17003302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22365074 - 22364943
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  22365074 catgtgatggatgattattgacgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 22364980  T
Q  355 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  22364979 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 22364943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22034503 - 22034325
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22034503 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22034406  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  22034405 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 22034325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45050324 - 45050185
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||| ||||||  || |||||||||||||    
T  45050324 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccac 45050230  T
Q  153 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    |||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  45050229 atgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttat 45050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 358
Target Start/End: Original strand, 20589963 - 20590078
Alignment:
Q  245 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgat 342  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| || || ||||     
T  20589963 ttgttcatgatacatgcgattggtgatttattgatgtgagatattgtgattatgatataagtatatacatgtggatattattattgattaaatatatgag 20590062  T
Q  343 gtttatattgaattat 358  Q
     |||| ||||||||||    
T  20590063 atttaaattgaattat 20590078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22080240 - 22080190
Alignment:
Q  341 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22080240 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22080190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41393023 - 41392929
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41393023 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 41392929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51451184 - 51451090
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  51451184 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 51451090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 20826805 - 20826909
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  20826805 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 20826904  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  20826905 gtgat 20826909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 5073884 - 5073963
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  5073884 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 5073963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18505855 - 18505816
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18505855 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatg 18505816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 18602627 - 18602706
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  18602627 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 18602706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20444123 - 20444085
Alignment:
Q  268 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20444123 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20444085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20529863 - 20529825
Alignment:
Q  268 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20529863 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20529825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Original strand, 77632 - 77677
Alignment:
Q  124 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  77632 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 77677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 306
Target Start/End: Original strand, 37846241 - 37846286
Alignment:
Q  261 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37846241 tgattgatgatcattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 37846286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27673260 - 27673216
Alignment:
Q  245 ttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  27673260 ttgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 27673216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12874 - 12488
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12874 catcatagtcgtgttgagattgtagtcataaaaggcttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 12775  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12774 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaaatgtgattgg 12675  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg---tttgatgtaag------ 303  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||   |||||||||||          
T  12674 tgattgtgtatgaataattttgaattaat-gttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggggttttgatgtaagtatata 12576  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12575 tatatatatgagaatattattattcatcaagtgcatgatgtctatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6878117 - 6877821
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6878117 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 6878018  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  6878017 tgcatcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 6877918  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagtatat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6877917 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgaatggtgatttattaatgtcagatatttgggttttgatgtaagtatat 6877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 36892360 - 36892628
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36892360 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 36892459  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892460 tgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtaagctattggggttttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 36892559  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36892560 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 36892628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 25877618 - 25877882
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25877618 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 25877717  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||| |||   |||    
T  25877718 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgcgagatattggggattgatgtaagtattgttatgtgaa---tat 25877814  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25877815 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25877882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8886814 - 8886450
Alignment:
Q  15 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8886814 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 8886715  T
Q  115 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 214  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8886714 gcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatgtgtgattggt 8886615  T
Q  215 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtat 312  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| |    
T  8886614 gattgtgagtgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgcgagatattggagtgtgatgtaggtattgatgtgt 8886522  T
Q  313 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8886521 g-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 8886450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22862158 - 22861923
Alignment:
Q  18 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22862158 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 22862059  T
Q  118 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   |  |||||||| ||||    
T  22862058 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaagtgtgattggtgat 22861959  T
Q  218 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 253  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  22861958 tgtgaatgaatatttgtgaattgataatcgttcatg 22861923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25600635 - 25600431
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25600635 catcatagtctcgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 25600536  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  25600535 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtaatatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 25600436  T
Q  214 tgatt 218  Q
    |||||    
T  25600435 tgatt 25600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 272
Target Start/End: Original strand, 24088880 - 24089120
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24088880 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacgtcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgacc 24088979  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaata 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  24088980 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatg-ata 24089078  T
Q  230 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24089079 aatgtg-attgatgattgttcatgataaatgtgattgatgatt 24089120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 19434958 - 19435144
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19434958 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgaaaaagggttgagctcttt-acttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacgtacgatgtttttg 19435056  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19435057 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 19435144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Original strand, 42180210 - 42180402
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  42180210 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 42180309  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42180310 gtaagtattgatatgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 42180402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Original strand, 43644471 - 43644688
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | || |||| ||||||| ||    
T  43644471 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtgaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgcttgattcaacgaaggtgacgatct 43644570  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattg 233  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  43644571 tttggagatttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttg 43644670  T
Q  234 tgtattgatatttgttca 251  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43644671 tgaattgataattgttca 43644688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19658625 - 19658470
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19658625 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19658526  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19658525 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 19658470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 21276342 - 21276535
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21276342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatcgatgtgagatattggggtttga 21276441  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   | || |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21276442 tgtaagtattgatgtgggaatatgattattgatcaaatgcatgatgcttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 21276535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15632071 - 15631864
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |     
T  15632071 catcatagtcgtgttgtatttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgttcaaga 15631972  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
     ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15631971 ggcatcaaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattg 15631872  T
Q  213 atgattgt 220  Q
     |||||||    
T  15631871 gtgattgt 15631864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 204 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24966609 - 24966425
Alignment:
Q  204 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24966609 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 24966510  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  24966509 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaacttttatttggattatgatgatgt 24966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 4795 - 4925
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4795 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 4894  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4895 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25304244 - 25304094
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25304244 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctattttacttcggagattatgtaagaagggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 25304145  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25304144 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 25304094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 12638003 - 12638171
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12638003 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtgattattgatgtgagacattggggtttgatgtaagtat 12638102  T
Q  307 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
       | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  12638103 tgatgtgggaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 12638171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27260257 - 27260130
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27260257 catcatagtcatgttgtgtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27260158  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtga 141  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27260157 tgcatcaaaggtgacgaccttgaggtga 27260130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 205 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21140325 - 21140139
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 304  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21140325 tgtgattgatgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 21140226  T
Q  305 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||   | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  21140225 attgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 21140139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 23823027 - 23823157
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23823027 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23823126  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23823127 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23823157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 23824971 - 23825101
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23824971 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23825070  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23825071 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23825101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 23832106 - 23832236
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23832106 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23832205  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23832206 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23832236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43641502 - 43641346
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  43641502 catcatagtcatgttgagtcttgtagccgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgttttta 43641403  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  43641402 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcga 43641346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7319989 - 7319718
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  7319989 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 7319890  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    |||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  ||| | |||| || | | ||    
T  7319889 gtatgaatgaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggattatg--gtatgaatatatacgtggat 7319792  T
Q  319 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7319791 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 7319718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 19670629 - 19670778
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  19670629 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tcttg 19670727  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  19670728 atgcatcgaaggtgacgaccttgaggagattcggcaccacatgcatttatg 19670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22282782 - 22282601
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  22282782 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 22282683  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22282682 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22282601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 24296071 - 24296221
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  24296071 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtaagacttgggtgaaatcttacatacgatgttttag 24296170  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24296171 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 24296221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28972543 - 28972272
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28972543 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 28972445  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggttt--gatgtaagtatatgtatgagaa 317  Q
    | |||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||  ||  | | || |||||| | || |||    
T  28972444 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaattttgggaattatggtatatgtatatatgtgtgaa 28972345  T
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28972344 tattattattgatcaagtacatgatgttta-attgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 28972272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 31832 - 32102
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31832 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 31931  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||   ||  | ||| | |||| |||| | |||    
T  31932 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtgattatttgatgtgagatattgaaattata-gtatgaatatatatgtg-ata 32029  T
Q  320 ttattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32030 ttattatcgaattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22273547 - 22273368
Alignment:
Q  36 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||||    
T  22273547 tagttgtaaaagagttgagctcttttacttaagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgacct 22273448  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22273447 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22273368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 12643600 - 12643758
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12643600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattgg 12643699  T
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12643700 tgattgtgtatgaatatttctgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 12643812 - 12644000
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12643812 tgatgtatatgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagacattggggtttga 12643911  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  12643912 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 12644000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 269693 - 269422
Alignment:
Q  122 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| | |||    
T  269693 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaatt 269595  T
Q  219 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgaga 316  Q
    ||| || ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |  || | || ||||||  ||| ||    
T  269594 gtgcataaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagatcatggtatatgtatat--atgtga 269497  T
Q  317 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  269496 atattgttattgatcaaattcatgatgtttatatttaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 269422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25600401 - 25600309
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600401 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 25600309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 390
Target Start/End: Original strand, 24573051 - 24573320
Alignment:
Q  125 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 221  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  24573051 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgggtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgaagattgtg 24573150  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
     || ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||     
T  24573151 cataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---att 24573247  T
Q  320 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||  ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24573248 ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 24573320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15631812 - 15631702
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15631812 tgatatatatgattgataatggtgtatgaataattgtaagttgatattcgttcatgacacatgtgattggagattattgatgtgagatattggagtttga 15631713  T
Q  298 tgtaagtatat 308  Q
    |||||||||||    
T  15631712 tgtaagtatat 15631702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22692949 - 22692768
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22692949 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgacctta 22692851  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22692850 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22692768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22697596 - 22697415
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22697596 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgacctta 22697498  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22697497 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 22581588 - 22581858
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22581588 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 22581687  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | || ||| | | ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||    
T  22581688 gcataaatgaatatgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgacgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---at 22581784  T
Q  319 attattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||  ||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22581785 attattatcggattaaataaatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 22581858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Original strand, 4450084 - 4450171
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4450084 tatatatatgagaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4450171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18534464 - 18534350
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18534464 actcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgcaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacgttgaggtgatttggtaccaca 18534365  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18534364 tgcatatatgtgtcg 18534350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24272689 - 24272579
Alignment:
Q  58 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 157  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24272689 ttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgca 24272590  T
Q  158 tgtatgcgtcg 168  Q
    | |||| ||||    
T  24272589 tatatgtgtcg 24272579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 22137341 - 22137469
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 139  Q
    |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  22137341 tgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggt 22137440  T
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22137441 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 22137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 461219 - 461139
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  461219 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 461139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 3801123 - 3801306
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3801123 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3801215  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3801216 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3801306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 38706810 - 38706993
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||    
T  38706810 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggtgtgtga 38706902  T
Q  298 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  38706903 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 38706993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 9654507 - 9654579
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9654507 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttattgatatatgtgattg 9654579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 12637665 - 12637843
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12637665 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12637762  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  12637763 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 12637843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Original strand, 20629034 - 20629114
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629034 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20629114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21140533 - 21140355
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21140533 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21140436  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21140435 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 21140355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34822498 - 34822315
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  34822498 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 34822406  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  34822405 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 34822315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24966770 - 24966692
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24966770 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttattgatatatgtgattggtgatt 24966692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Original strand, 22691607 - 22691758
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 220  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22691607 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22691705  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22691706 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22691758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Original strand, 22696254 - 22696405
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 220  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22696254 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22696352  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22696353 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22696405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 21276027 - 21276205
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21276027 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21276124  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  21276125 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 21276205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 12637873 - 12637940
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12637873 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Original strand, 22691823 - 22691910
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22691823 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22691910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Original strand, 22696470 - 22696557
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22696470 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22696557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25600260 - 25600173
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25600260 tatatgtgtgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 25600173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Original strand, 24687161 - 24687322
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt-gacga 130  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||||| |||||    
T  24687161 ttgttgttgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagttgacga 24687259  T
Q  131 ccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24687260 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 24687322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 3800613 - 3800791
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3800613 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3800710  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3800711 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3800791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8941784 - 8941712
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8941784 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 8941712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Original strand, 19888848 - 19888920
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19888848 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 19888920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25211076 - 25210909
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||    
T  25211076 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatactgatgtgagatatcggggtgtga 25210984  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  25210983 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 25210909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34822854 - 34822676
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  34822854 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 34822757  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  34822756 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 34822676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34822645 - 34822578
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  34822645 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 34822578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6877791 - 6877721
Alignment:
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6877791 tattattgttcaagtgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 6877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 19888362 - 19888456
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19888362 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19888456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 306
Target Start/End: Original strand, 20629142 - 20629243
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  20629142 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catgtgattgataattattgatgtgagataatggggtgtga 20629234  T
Q  298 tgtaagtat 306  Q
    |||||||||    
T  20629235 tgtaagtat 20629243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 306
Target Start/End: Original strand, 43644713 - 43644814
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43644713 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 43644805  T
Q  298 tgtaagtat 306  Q
    |||||||||    
T  43644806 tgtaagtat 43644814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12726709 - 12726531
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12726709 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12726612  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  12726611 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 12726531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25211180 - 25211108
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 270  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  25211180 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacaagtaattggtga 25211108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 3800822 - 3800889
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3800822 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3800889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 5889880 - 5889974
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5889880 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5889974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 9654615 - 9654792
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  9654615 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtga 9654707  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||| |   ||||||||||||||| | ||||      |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9654708 tgtaagtattaatatgtg---attattattgatcaaatgcatg------atattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 9654792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 11232835 - 11232929
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11232835 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 14908022 - 14908116
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14908022 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 22514682 - 22514776
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22514682 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22514776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 28777283 - 28777377
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28777283 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 28777377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22654412 - 22654339
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22654412 tattattattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 22654339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 24828161 - 24828218
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24828161 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24828218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 24832613 - 24832670
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24832613 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24832670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 720918 - 720835
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  720918 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 720835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8942228 - 8942124
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8942228 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 8942129  T
Q  213 atgat 217  Q
     ||||    
T  8942128 gtgat 8942124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23773193 - 23773015
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23773193 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23773096  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23773095 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23773015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 17398170 - 17398249
Alignment:
Q  115 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  17398170 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 17398249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 3800969 - 3801043
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3800969 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20013695 - 20013601
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  20013695 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 20013601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22273233 - 22273164
Alignment:
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  22273233 tattattgatcaaatacatgatgatta-attgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgt 22273164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23818752 - 23818658
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23818752 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23818658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 24089074 - 24089146
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24089074 tgataaatgtgattgatgattgttcatga-taaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattgatgatt 24089146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211379
Alignment:
Q  147 taccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 25211379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 461060 - 461007
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 252  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  461060 gataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgacttgataattgttcat 461007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 306
Target Start/End: Original strand, 23806359 - 23806404
Alignment:
Q  261 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23806359 tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtgatgtaagtat 23806404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4425
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4805 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 4706  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||   ||||| |         
T  4705 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattg 4606  T
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | || ||| ||  |||||       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4605 gtgattggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgtt-------catgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggagtatgatgtaag 4513  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4512 tattgatatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttatattgacttattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14354 - 13964
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14354 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaattcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtcaaatcttacatacgatgtttttgt 14255  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt---------attgatata 204  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||  ||     
T  14254 tgcatcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgatt 14155  T
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaa 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  14154 ggtgattgacgattgtgtatgaatgtctgtgatttgatgattgttcatgacacatacgattgatgacttattaatgtgagatattggggttatgatataa 14055  T
Q  303 gtatat--gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14054 gtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31304 - 31038
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31304 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 31205  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31204 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatttttatgagaatattat 31106  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31105 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 31038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21128 - 20860
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  21128 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgtgta 21029  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatta 322  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028 tgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttatgattggtgattattgatgtgagatattgggattatgatgtaagtatatgtatgagaatatta 20929  T
Q  323 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || || ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20928 ttgttaatcaaatgcatgatgcttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28719 - 28450
Alignment:
Q  123 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  28719 agtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgagt 28620  T
Q  223 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 321  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28619 atgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttgtgattggtgattattgatgtgagatattcagatcatgatgtaagtctatgtatgagaatatt 28520  T
Q  322 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28519 attgttgatcaaatgcatgatgtttcaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 28450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 129700 - 129877
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||   ||||| ||||| | |||| ||| ||     
T  129700 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacaatgttgagttgttccatcggaggtgaagacgttt 129799  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129800 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 249025 - 249313
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  249025 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttaggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 249124  T
Q  114 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 210  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  249125 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgat 249224  T
Q  211 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    || |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  249225 tggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 249313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3301 - 3095
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3301 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 3202  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  3201 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 3102  T
Q  214 tgattgt 220  Q
    |||||||    
T  3101 tgattgt 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2811 - 2737
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2811 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2939 - 2865
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2939 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2683 - 2616
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2683 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 2993
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3067 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2475
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2561 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 7)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5703
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5909 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 5810  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  5809 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 5710  T
Q  214 tgattgt 220  Q
    |||||||    
T  5709 tgattgt 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 813
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| |    
T  943 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgaagattgtgaa 844  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 254  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  843 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5547 - 5480
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5675 - 5601
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 511 - 328
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  511 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 419  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  418 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgataatgt 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5425 - 5339
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5425 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 641
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  715 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgatacatgtaattggtgatt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8108 - 7842
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8108 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8009  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    | || |         
T  8008 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgagtg 7909  T
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7908 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgattggtgatt 7842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 198 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7631 - 7453
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  7631 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtgattattgatgggagatattggggttttt 7532  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7531 gatgtaagtatatgtatgagaatattattcttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttat 7453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7682
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 275  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7759 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 7682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 123 - 390
Target Start/End: Original strand, 7012 - 7287
Alignment:
Q  123 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7012 agtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgt 7111  T
Q  223 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgag 315  Q
     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||||    
T  7112 gtgaataattgaaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatgag 7211  T
Q  316 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  7212 aatatcattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaattattcatgttaacttttattttgattatgatgatgt 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 13680 - 13884
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13680 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 13779  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  13780 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 13879  T
Q  214 tgatt 218  Q
    |||||    
T  13880 tgatt 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16103 - 15922
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  16103 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 16005  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16004 tggagatttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Original strand, 13914 - 14007
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13914 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatgttggg 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Original strand, 14078 - 14154
Alignment:
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14078 gaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 14154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 535
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  802 gtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtaattacgta 703  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  702 tgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattat 603  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  602 tattgatcaagtgcatgatgcttaaattgaaatattcatgctaactgttatttgtattatgatgatgt 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3335 - 3129
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3335 catcatagtcttgttgagtttgtagttgaaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 3236  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||     
T  3235 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttattgataaatgtggttgg 3136  T
Q  214 tgattgt 220  Q
    |||||||    
T  3135 tgattgt 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3101 - 2907
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 296  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||  ||  |    
T  3101 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattagtgactattgctgtgagatattggaattggg 3002  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3001 atataggtatatttatgtgaatactattattgttcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 3784 - 4044
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3784 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 3883  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||    
T  3884 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtattattggtgaaatgtga 3983  T
Q  210 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1307
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1046 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgggta 1145  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   || | |||          
T  1146 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattgatacgtgaa------ 1239  T
Q  324 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  1240 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgataactattattttgattatgatgatgt 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 8)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20067 - 19799
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20067 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 19968  T
Q  114 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat---- 205  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  || || |        
T  19967 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 19868  T
Q  206 -gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19867 ggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattgctgatta 19799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17983 - 17776
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17983 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 17884  T
Q  114 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 211  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||    
T  17883 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 17784  T
Q  212 gatgattg 219  Q
    | ||||||    
T  17783 ggtgattg 17776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 8140 - 8293
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8140 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 8239  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8240 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 13529 - 13682
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13529 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 13628  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13629 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 13682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17716 - 17526
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17716 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 17617  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17616 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19746 - 19556
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19746 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 19647  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  19646 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 19556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8539
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8466 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Original strand, 13855 - 13928
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13855 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27250 - 27067
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27250 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27151  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttat 27067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26954 - 26889
Alignment:
Q  310 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26954 tatgtgaatattatttttgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatt 26889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 236597 - 236412
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  236597 gtgattggtgattgtgtatgaataatggtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtcagatattggggttcgatgtaagta 236498  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  236497 tatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaattgttatttgaattatgatgatgt 236412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 236857 - 236652
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  236857 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagaaaggtgtgaaatcttacatacgatgttaaagt 236758  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 213  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  236757 agcatcgaaggtgacgacctagaggtgataaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 236658  T
Q  214 tgattg 219  Q
    ||||||    
T  236657 tgattg 236652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 270785 - 270545
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||     
T  270785 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgat 270686  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 230  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||     
T  270685 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatat 270586  T
Q  231 ttgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  270585 ttgtgaattgata-ttattcatgatacatgtaattggtgatt 270545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 270515 - 270329
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  270515 tgataaatgtgattggttattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtttga 270423  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270422 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 270329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Original strand, 255963 - 256007
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  255963 atgtaagacgggtatgaaatcttacatttgatgtttttgttgcat 256007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28145 - 27950
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28145 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 28046  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28045 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 27950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28327 - 28179
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  28327 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttgatgattgagta 28228  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  28227 tgaataactgtgaattgatatttgttaatgatatatgtggttgatgatt 28179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28199 - 28125
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  28199 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatt 28125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 56615 - 56369
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  56615 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtttgaattcttacatacgatgtttttgt 56516  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat--- 210  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||       
T  56515 tgcatcgaatgtgacgaccttttggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgt 56416  T
Q  211 ----tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 253  Q
        |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  56415 tgaatgatgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttgttcatg 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56206
Alignment:
Q  218 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgag 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||             
T  56370 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgac-catgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat--------- 56281  T
Q  316 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  56280 -atatttatattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 56206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3248 - 3055
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3248 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttga 3149  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3148 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatttttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 281
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 296  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  477 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattgttgaggtaagatattggggttttg 378  T
Q  297 atgtaag--tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  377 atgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgataatgt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 577
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  739 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 640  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  639 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3518 - 3430
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3518 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30843 - 30650
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-ga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  30843 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggttttga 30744  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30743 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 30650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31090 - 31002
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31090 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 31002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8754 - 8493
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8754 catcatagtcttgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8655  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 211  Q
    || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  || ||||    
T  8654 tgaatcggaggtgacggccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgagatt 8555  T
Q  212 gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  8554 ggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacgtgtgagtggtgatta 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8387
Alignment:
Q  335 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8443 tacatgacgtttatagtgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 8387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 13548 - 13740
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13548 tgatatttgtgattggtgattgtgtataaataattgtgaattgatatt-gttcatgacacatgtgattagtgaatattgatgtgagatattggggtttga 13646  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13647 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 248
Target Start/End: Original strand, 13434 - 13557
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13434 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtctt-ttgatatatgtgtttagtgattgtgta 13532  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgt 248  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||    
T  13533 tgagtaattgttaaatgatatttgt 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 15006 - 15271
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatga-ttgtgt 222  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||     
T  15006 gtgacgaccctgagatgattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatacatgtgactggtgatttgtga 15105  T
Q  223 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatat 320  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||     ||    
T  15106 atgaatattagtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgattattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtatg-----at 15200  T
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15201 tattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26642 - 26451
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  26642 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattatgaatgtgagatattgggg-ttgat 26544  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26543 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Original strand, 23915 - 24009
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt 107  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23915 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgt 24009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 308
Target Start/End: Original strand, 3707 - 3893
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||     
T  3707 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttgttgatatatgtgattgatgatggtgtg 3806  T
Q  224 tgaataattgtgtattgata-tttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatat 308  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3807 tgaataattgtgaattgatattttgttcatgacacatgtgattagtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatat 3893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Original strand, 3927 - 4014
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  3927 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattataatgatgt 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 4638 - 4831
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 4737  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4738 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 4250 - 4435
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  4250 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 4349  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4350 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 49478 - 49671
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49478 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 49577  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49578 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 49671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 49090 - 49275
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  49090 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 49189  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49190 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 49275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 283
Target Start/End: Original strand, 26416 - 26575
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26416 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 26515  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaag 283  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26516 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtaag 26575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 70883 - 71003
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  70883 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagataggtgtgaaatcttccatacgatgtttttgt 70982  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgacctt 134  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  70983 tgcatcgaaggtgacgacctt 71003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 390
Target Start/End: Original strand, 66322 - 66592
Alignment:
Q  130 accttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg-------tgt 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||       |||    
T  66322 accttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattttgaagtgtgattggtgattgggaattgtgt 66421  T
Q  223 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatat 320  Q
    |||| ||| | || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||||||||||||   |||| ||||||    
T  66422 atgagtaactatggattgatgattgttcatgattcatgtgattggtgattaattgatatgagatattgagattatgatgtaagtattgatatgtgaatat 66521  T
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  66522 tattattgagcaagtacatgatgattatattgaattattcatgttaaatgtcatttggattatgatgatgt 66592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Original strand, 26590 - 26660
Alignment:
Q  321 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26590 tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 26660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 21633 - 21827
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 296  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21633 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacattttttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 21732  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21733 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatttatgctaactgttatttggattatgatgatgt 21827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 156183 - 156376
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  156183 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggagtttga 156282  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  156283 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 156376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 85966 - 86149
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  85966 tgataaatgtgattgttgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 86058  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| |||     || ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  86059 tgtaagtattaatgtgtga-----ttgttattgatcaaatgcatgatgtttatagtgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 86149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34989 - 34811
Alignment:
Q  42 taaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  |     
T  34989 taaaaggattgaactcttttacttcg-atattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 34891  T
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  34890 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 34811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 156062 - 156129
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  156062 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 156129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 155937 - 156031
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  155937 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 156031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 71768 - 71922
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  71768 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttg 71867  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  71868 ttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgatttggtaccacaggcatttatgcgtc 71922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Original strand, 72093 - 72166
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  72093 tattatcattgattaagtatatgatatttgaaatgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 72166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 207 - 390
Target Start/End: Original strand, 2474 - 2658
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2474 tgattggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 2573  T
Q  307 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  2574 tgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4346 - 4078
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  4346 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgtatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 4247  T
Q  222 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
    ||||||||| ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||    
T  4246 tatgaataactgtgatttggtgagtgttcatgacacatgtgattggttattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatgtatatgtgaata 4147  T
Q  320 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4146 ctatt---gatcaagcacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 4078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 198 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 77793 - 77600
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||  |||    
T  77793 tgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtggttatggatgtgagatattagggttttt 77694  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgat 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  77693 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaaatgttatttggattatgatgat 77600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 77977 - 77919
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  77977 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatt 77919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36047 - 35999
Alignment:
Q  245 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36047 ttgttcatgatacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggg 35999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 164
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2262
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 113  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2112 catcatagtcatgtagagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 2211  T
Q  114 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgc 164  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  2212 tgaatcgaaggtgacgatcttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgc 2262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2511
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2438 tattatcattgattaagtatatgaaatttggattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 2511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 207 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15032 - 14849
Alignment:
Q  207 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 305  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15032 tgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 14933  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  14932 tatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 14849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 106409 - 106559
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  106409 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 106508  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  106509 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Original strand, 113902 - 114150
Alignment:
Q  144 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 241  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||  |||     
T  113902 tggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcaagacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtataaataactatgatttgg 114001  T
Q  242 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacat 339  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  114002 tgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttatatgtgaatatt---attgatcaagtacat 114098  T
Q  340 gatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  114099 gatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 114150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 6649 - 6830
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  6649 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 6747  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6748 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 6830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 130522 - 130409
Alignment:
Q  55 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 154  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130522 ctcttttacttcggtgataacgtaagaccggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 130423  T
Q  155 gcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||| |||| ||||    
T  130422 gcatatatgtgtcg 130409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59117
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  58936 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 59034  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
         |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  59035 ttaaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 59117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 108156 - 108058
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  108156 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaacttggtgcacatcatgacatgagtcttattgggaaatgtgattgatggttgt 108058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17928 - 17735
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |  |||    
T  17928 gatatatgtgattggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaggtattgggataatga 17829  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17828 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatggtgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattttgatgatgt 17735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18055
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 18055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 390
Target Start/End: Original strand, 499 - 683
Alignment:
Q  204 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 303  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  499 atgtgattggtgatggtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattggggtttgatgtaag 598  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  599 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 198 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29830 - 29653
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29830 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataacggtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 29731  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 375  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  29730 tgtaagtattgatttgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 29653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 68964 - 68785
Alignment:
Q  53 aactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  68964 aactcttttacttgggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatggtaccac 68865  T
Q  153 atgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 230  Q
    |||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  68864 atgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtatgaataa 68785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 68773 - 68597
Alignment:
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat-tgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgta 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | ||    
T  68773 tgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacatgtgattggtgattaactgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttata 68674  T
Q  312 tgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 387  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  68673 tgcgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 68597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 69441 - 69394
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctttt 61  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  69441 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactctttt 69394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30531 - 30314
Alignment:
Q  173 gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 271  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  30531 gtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgattgataattgtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgat 30434  T
Q  272 t-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaatt 369  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||   ||| | |||| |||| | ||||||||||  ||| || | |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  30433 tgattgatgtgagata-tggggattatagtatgaatatatatgtg-atattattatcggattaaatgcatgatatttgaattgaattattcatgttaatt 30336  T
Q  370 gttat-tggattatgatgatgt 390  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  30335 attatatagattatgatgatgt 30314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33580 - 33395
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  33580 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 33481  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33480 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 32688 - 32869
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32688 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32787  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32788 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 32869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33848 - 33725
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  33848 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 33749  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttg 247  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  33748 tgaataattgtgaattgatgtttg 33725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 39264 - 39449
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  39264 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 39363  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  39364 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40156 - 39975
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  40156 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 40057  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40056 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 39975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 38996 - 39119
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  38996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 39095  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttg 247  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  39096 tgaataattgtgaattgatgtttg 39119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 198 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7175 - 6984
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  7175 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacgtgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 7076  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 387  Q
    |  ||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7075 agataagtatacatgtatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 6984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7298 - 7214
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7298 gtgacgaccttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 7214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 4842 - 4991
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtatgacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 4941  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4942 ttgcatc-aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23190 - 23040
Alignment:
Q  241 atatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatg 340  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23190 atatttgttcagaacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatg 23091  T
Q  341 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23090 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16376
Alignment:
Q  322 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16445 attattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2869
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  2627 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 2726  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtg--catatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 228  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  2727 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaat 2826  T
Q  229 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    | ||||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  2827 atttgtg-attaatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 2899 - 3083
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 296  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  2899 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattgatgtgagatatcggggtgtg 2991  T
Q  297 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt-ggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2992 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattaatgatcaagtgcattatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 19248 - 19489
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 239  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||    
T  19248 gatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtctttttgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaatt 19347  T
Q  240 gatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtac 337  Q
    |||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |    
T  19348 gataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgc 19435  T
Q  338 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19436 atgatgtttatattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 19489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 94495 - 94335
Alignment:
Q  200 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgat 298  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||    
T  94495 atatatgtgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattgggattatgat 94396  T
Q  299 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattatt 359  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  94395 ataattatatatatgagaatattattattgatccagtacatgatgtttgaattgaattatt 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 94742 - 94695
Alignment:
Q  173 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  94742 gtgcatatcatgacatgagtcttatatataaatgtgattggtgattgt 94695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Original strand, 90600 - 90748
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  90600 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 90699  T
Q  224 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90700 agaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 90748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 78337 - 78228
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  78337 ttgtagttgtaaaagggttcagctcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 78238  T
Q  133 ttgaggtgat 142  Q
    ||||||||||    
T  78237 ttgaggtgat 78228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 90802 - 91018
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-g 296  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  90802 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattggggttttg 90901  T
Q  297 atgtaag----------------------tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta- 373  Q
    |||||||                      ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  90902 atgtaagtatatacatatatatatatatatatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttat 91001  T
Q  374 ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||    
T  91002 ttggattatgatgatgt 91018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 129026 - 128867
Alignment:
Q  56 tcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  129026 tcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 128932  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  128931 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattgatgat 128867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 128804 - 128730
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  128804 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 128730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 145195 - 145016
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  145195 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 145096  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  145095 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 145016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 147454 - 147275
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||| ||||    
T  147454 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgatgacc 147355  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  147354 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 147275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 144980 - 144926
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 252  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  144980 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 144926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 147239 - 147185
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 252  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  147239 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 147185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 7153 - 7303
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7153 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 7252  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7253 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 7303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7489
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7416 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 78342 - 78472
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  78342 ttgtaggtgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaacc 78441  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  78442 ttgaggtgattcagtaccacatgcatttatg 78472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 118094 - 118244
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  118094 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagatggctgtgaaatcttacatacgatgtttttg 118193  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 163  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  118194 ttgaatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgcatatatg 118244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 163901 - 163817
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163901 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 54300 - 54118
Alignment:
Q  36 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||     
T  54300 tagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcagagattatgtaagctgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaagtgacgaccttt 54202  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 218  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54201 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgatt 54118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 254
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109799
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  109582 gttgtaaaatggttgatctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 109680  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtg 235  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| |||||    
T  109681 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtg 109780  T
Q  236 tattgatatttgttcatga 254  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  109781 aattgataattgttcatga 109799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 109897 - 109971
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109897 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 54112 - 54011
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  54112 tgataaatgtgattggtgatagtgaattaataattgtgaattgataattgttcatg-------tgattggtgattattgatgtgagatattggagtgtga 54020  T
Q  298 tgtaagtat 306  Q
     ||||||||    
T  54019 cgtaagtat 54011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 252
Target Start/End: Original strand, 110002 - 110055
Alignment:
Q  199 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 252  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  110002 gatatatgtgattagtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 110055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 197600 - 197778
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  197600 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtcttt-tatcatcgaaggtgacgacct 197698  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  197699 tttggagatttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 197778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 85056 - 84942
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85056 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 84957  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  84956 tgcatatatgtgtcg 84942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26194 - 26080
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26194 actcttttacttcggtgataatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacctttaggtgatttggtaccaca 26095  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcg 168  Q
    ||||| |||| ||||    
T  26094 tgcatatatgtgtcg 26080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1925 - 1652
Alignment:
Q  121 aaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgat 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1925 aaagagacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgat 1826  T
Q  218 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgaga 316  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||| | |||| |||| |     
T  1825 tgtgcatgaataaatgtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagatattgggattata-gtatgaatatatatgtg- 1728  T
Q  317 atattattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1727 atattattatcgaattaagtacatgatgtttaaattaaattactcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16826
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16961 tgatgtatatgattggtgattgtgtgtgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 16862  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 333  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  16861 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaa 16826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17128 - 17070
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17128 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 17070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 25101 - 25274
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25101 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggtgtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 25200  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 184  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  25201 ttgcatttaaggtgacgaccttgaggtgattttgtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34128 - 34006
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  34128 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacaggtgtgaaatgttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgact 34029  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  34028 ttgaggtgattcggtaccacatg 34006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 217246 - 217426
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  217246 tgtaattgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggg-gtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 217344  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  217345 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 217426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5396 - 5221
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5396 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 5304  T
Q  306 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  5303 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 5221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5755 - 5661
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  5755 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3393 - 3244
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3393 actcttatacttcggtgattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctagaggtgatttggtaccaca 3294  T
Q  154 tgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg---acatgagtcttatt 198  Q
    ||||| |||| |||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3293 tgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatt 3244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 9930 - 10122
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9930 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttattcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10029  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| |   | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  10030 tgtaagtgttgatttgagaataatattatcgataaagtgcatgatg-ttaaattgaaaaatacatgttaactgtcatttggattatgataatgt 10122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 11532 - 11716
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 133  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  11532 tgtagttgtaaaagggtggt--tcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 11628  T
Q  134 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  11629 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgattgt 11716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Original strand, 11796 - 11845
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  11796 catgtgattgatgattattgatgagaaatattggggtgtgatgtaagtat 11845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4501 - 4320
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  4501 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 4403  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4402 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6123
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6386 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 6287  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 319  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  | ||| | |||| | || | |||    
T  6286 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattata-gtatgaatatatgtgtg-ata 6189  T
Q  320 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatg 383  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6188 ttattatcggattaagtacatgatatttaaattgaattactcatgttaatttttatgtggattatg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Original strand, 5102 - 5274
Alignment:
Q  41 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgagg 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  ||||||| ||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||  ||    
T  5102 gtaaaagggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcggcagtgaacccttacatacgatgtttacttgtc-catcggaggtgacgaccttttgg 5200  T
Q  139 tgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5201 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 12788 - 12876
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12788 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 14101 - 14250
Alignment:
Q  14 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14101 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaaagaggggtactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttg 14200  T
Q  113 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 162  Q
    |||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14201 ttgcatcatgggtaacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 14250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 274
Target Start/End: Original strand, 15935 - 16011
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15935 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattat 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15907
Alignment:
Q  146 gtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattcataaatgtggttggtgattgt 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51690 - 51511
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||| ||||||  |    
T  51690 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtcaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgatgaccttttg 51592  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51591 gagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 51511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 333
Target Start/End: Original strand, 21158 - 21288
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-- 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  21158 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggttttt 21250  T
Q  296 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 20906 - 21002
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20906 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaatgatatatgtgattggtgattgt 21002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Original strand, 21030 - 21104
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 21104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 390
Target Start/End: Original strand, 3125 - 3395
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||  || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| | |||||||     
T  3125 gtgacgaccttgaagtgaaatggtatcacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaattatgattgc 3223  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 318  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  3224 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgagattatg--gtatgaatatatatgtggat 3321  T
Q  319 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3322 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 6410 - 6583
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  6410 tgataaatgtggttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgat------------------- 6490  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6491 -gtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 6583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 220
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6406
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6310 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattaatgattgt 6406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 390
Target Start/End: Original strand, 22 - 119
Alignment:
Q  294 ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22 ttgatgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14958 - 14779
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14958 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggtgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14860  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14859 gagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28479 - 28300
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  28479 gttgtaaaagggttgagctcttttaattcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 28381  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||| |||  || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28380 gagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 28300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 211
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  346 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 247  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  246 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5401 - 5266
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  5401 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 5302  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5301 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3934 - 3799
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  3934 ttgtggttgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 3835  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3834 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4568
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  4686 ttgtagttgtaaaagggttgggctcttttacttcagagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 4588  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccac 152  Q
    | |||||||||  |||||||    
T  4587 tggaggtgattcagtaccac 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 390
Target Start/End: Original strand, 75550 - 75727
Alignment:
Q  206 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  75550 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagatattggggttatgatgtaag 75649  T
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |         |||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  75650 tatatat---------ttatga-cgatcaagtacatgatgtttgaattaaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 75727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 72106 - 72177
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 195  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  72106 gtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 132  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  126 tgtagttgtaaaagggttgagcttttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgagc 27  T
Q  133 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 158  Q
    ||  || |||||||||||||||||||    
T  26 ttttggagatttggtaccacatgcat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25718 - 25594
Alignment:
Q  209 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 307  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  25718 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 25619  T
Q  308 tgtatgagaatattattattgatca 332  Q
      |||| ||||||| ||||||||||    
T  25618 gttatgtgaatatttttattgatca 25594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25799 - 25735
Alignment:
Q  208 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25799 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 25735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 106660 - 106479
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  106660 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 106562  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  106561 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgat 106479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27352 - 27169
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  27352 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgctcata-------tgatcgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 27260  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27259 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 27169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32093 - 31925
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 220  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| |||||    
T  32093 gtgacgaccttgaggtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattgataattgt 31995  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 289  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31994 gtatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattg 31925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31850 - 31776
Alignment:
Q  315 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  31850 gaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatg-taaatgttatgtgggttatgatgatgt 31776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1469
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 137  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1292 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaag----gagtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1386  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattg 219  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1387 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 35
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc-ttga 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | ||||||||| ||      
T  215 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttt 117  T
Q  137 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    || || |||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  116 ggagaattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgat 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40098 - 40010
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40098 gtgacaaccctgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 40010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37697 - 37627
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  37697 attattattgatcaaatgcatgatgttaat--tgaattattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 37627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 56026 - 55922
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  56026 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggggattttgtaccaca 55927  T
Q  154 tgcat 158  Q
    |||||    
T  55926 tgcat 55922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44443 - 44288
Alignment:
Q  202 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | || |||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  44443 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgtttattgatgtgagatattggggttttggtgt 44351  T
Q  301 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 363  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  44350 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 44288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 52597 - 52457
Alignment:
Q  217 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgag 315  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |    
T  52597 ttgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgattgatgactattgatctgagatattggggttttgatttaagtatatgcatgtg 52505  T
Q  316 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 363  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52504 aatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatg 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41371 - 41190
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||    |||| ||||| | ||||||||    
T  41371 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgtagattatgtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcggaggtgacgac 41272  T
Q  132 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc-ttattgatatatgtgattg 212  Q
    |||  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  41271 cttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttttatatatgtgattg 41190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 9426 - 9607
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt-tgcatcgaaagtgacgaccttga 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||  ||| ||    | | ||||| | |||| ||||||      
T  9426 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggggttgaacccttacatatgatattgacatgtccatcggaggtgatgacctttt 9525  T
Q  137 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9526 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 145413 - 145283
Alignment:
Q  144 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 241  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145413 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgagtagtgattgtgtatgaataactgtgaattga 145314  T
Q  242 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  145313 tgatttttcatgacacatgtgattggtgatt 145283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144987
Alignment:
Q  318 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  145060 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattaatcatgttaattgttatgtggattatgataatgt 144987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7641 - 7465
Alignment:
Q  38 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||  |||| || |||||||   ||| | ||||  | |||| ||||||     
T  7641 gttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaaggctggggtgaacccttatatacgatgttgacttg-tccatcagaggtgatgaccttt 7543  T
Q  136 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 212  Q
     || |||||||||| |||||||| |||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7542 tggagatttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 363
Target Start/End: Original strand, 12989 - 13085
Alignment:
Q  268 tgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  12989 tgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 13085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31192 - 31120
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  31192 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31391 - 31333
Alignment:
Q  214 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  31391 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 31333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1509
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1587 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1298
Alignment:
Q  257 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  1427 catgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 1335  T
Q  355 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  1334 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 52771 - 52837
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  52771 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 52837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 56723 - 56789
Alignment:
Q  34 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  56723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 56789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 804
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  987 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 895  T
Q  298 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  894 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 217
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  125 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 264 - 448
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 296  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| |||| | ||    
T  264 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattggtcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcgggggtgtg 356  T
Q  297 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  357 atgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 390
Target Start/End: Original strand, 15167 - 15239
Alignment:
Q  319 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15167 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6898
Alignment:
Q  140 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6826 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatatgattg 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Original strand, 6934 - 7115
Alignment:
Q  198 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |       ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  6934 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattggt-------catatgattgatgactattgatgtgagatattgggatgtga 7026  T
Q  298 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 390  Q
     ||||||||  |||| ||     |||| |||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7027 agtaagtattaatgtgtg-----attactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 7115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 390
Target Start/End: Original strand, 4639 - 4725
Alignment:
Q  304 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4639 tatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 4725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Original strand, 4528 - 4596
Alignment:
Q  205 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4528 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatta 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30009 - 29855
Alignment:
Q  40 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30009 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29911  T
Q  138 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 193  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  29910 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 29855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 217
Target Start/End: Original strand, 17586 - 17771
Alignment:
Q  33 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacga 130  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||    
T  17586 ttgttgttgtaaaagggatga-ctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacga 17683  T
Q  131 ccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    |||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17684 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37862 - 37768
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37862 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4578 - 4532
Alignment:
Q  54 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4578 actcttttacttcggagataatgtaagacggacgtgaaatcttacat 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2989
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  2839 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 2936  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  2937 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Original strand, 26542 - 26692
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 220  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26542 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 26639  T
Q  221 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 273  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  26640 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 26692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3254
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  3160 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12285
Alignment:
Q  74 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12329 atgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcat 12285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25476 - 25382
Alignment:
Q  124 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  25476 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 25382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7299
Alignment:
Q  349 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7341 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7125 - 7049
Alignment:
Q  143 ttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatat-atgtgattgatga 216  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  7125 ttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcataacatgagtctatttgatgtaatgtgattgatga 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University