View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16854_low_1 (Length: 547)

Name: NF16854_low_1
Description: NF16854
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16854_low_1
NF16854_low_1
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (122-534)||(22502526-22502938)
chr5 (122-538)||(20342125-20342541)
chr5 (122-538)||(25847918-25848334)
chr5 (126-538)||(14887104-14887516)
chr5 (122-538)||(37545605-37546022)
chr5 (122-538)||(24798506-24798922)
chr5 (122-534)||(22381046-22381458)
chr5 (122-534)||(22236029-22236441)
chr5 (122-534)||(23080198-23080610)
chr5 (122-534)||(17269442-17269854)
chr5 (122-534)||(20821300-20821712)
chr5 (122-523)||(22461810-22462211)
chr5 (137-534)||(23442417-23442814)
chr5 (122-517)||(21890868-21891263)
chr5 (122-534)||(28923877-28924289)
chr5 (122-534)||(28895051-28895463)
chr5 (122-534)||(20773607-20774019)
chr5 (122-534)||(24749663-24750075)
chr5 (122-534)||(24735720-24736132)
chr5 (168-534)||(21564121-21564487)
chr5 (243-534)||(24737015-24737306)
chr5 (11-122)||(25850129-25850240)
chr5 (150-520)||(26738842-26739212)
chr5 (11-123)||(20344335-20344447)
chr5 (11-122)||(37541584-37541695)
chr5 (228-520)||(21984520-21984812)
chr5 (11-122)||(14885194-14885305)
chr5 (11-122)||(24796600-24796711)
chr5 (11-123)||(22504732-22504844)
chr5 (228-520)||(25423068-25423360)
chr5 (231-534)||(23516406-23516709)
chr5 (150-520)||(23573621-23573991)
chr5 (122-534)||(20468205-20468617)
chr5 (138-517)||(22333012-22333391)
chr5 (13-120)||(22464007-22464114)
chr5 (13-123)||(17267539-17267649)
chr5 (13-123)||(28893147-28893257)
chr5 (13-123)||(28921973-28922083)
chr5 (13-122)||(20777967-20778076)
chr5 (138-463)||(22134604-22134929)
chr5 (138-534)||(18775642-18776038)
chr5 (13-123)||(20823506-20823616)
chr5 (324-520)||(21343669-21343865)
chr5 (270-534)||(21662297-21662560)
chr5 (228-499)||(20798660-20798931)
chr5 (13-123)||(22234125-22234235)
chr5 (228-534)||(23440090-23440396)
chr5 (138-463)||(14999864-15000189)
chr5 (231-520)||(23471108-23471397)
chr5 (228-463)||(16356438-16356673)
chr5 (228-463)||(34566430-34566665)
chr5 (294-520)||(20573400-20573626)
chr5 (324-534)||(21404701-21404911)
chr5 (37-123)||(28914642-28914728)
chr5 (37-123)||(28929910-28929996)
chr5 (138-463)||(27685525-27685850)
chr5 (138-463)||(37291621-37291946)
chr5 (228-463)||(27668705-27668940)
chr5 (228-463)||(40708716-40708951)
chr5 (122-456)||(21498145-21498479)
chr5 (122-463)||(22348361-22348700)
chr5 (228-399)||(19769960-19770131)
chr5 (16-123)||(21562232-21562339)
chr5 (228-463)||(27610290-27610525)
chr5 (228-463)||(41770778-41771013)
chr5 (138-463)||(29476198-29476523)
chr5 (11-123)||(20466302-20466414)
chr5 (35-123)||(21679005-21679093)
chr5 (11-123)||(23473298-23473410)
chr5 (150-377)||(11210831-11211058)
chr5 (228-463)||(27518343-27518578)
chr5 (270-500)||(21665758-21665987)
chr5 (227-377)||(21937402-21937552)
chr5 (446-534)||(21625383-21625471)
chr5 (11-123)||(21337497-21337609)
chr5 (11-119)||(22136743-22136851)
chr5 (11-123)||(26736930-26737042)
chr5 (122-265)||(21831852-21831995)
chr5 (122-313)||(23503511-23503702)
chr5 (227-377)||(24581215-24581365)
chr5 (11-104)||(27520496-27520589)
chr5 (150-301)||(21339423-21339574)
chr5 (11-119)||(18781189-18781297)
chr5 (11-107)||(22350006-22350102)
chr5 (11-107)||(37289699-37289795)
chr5 (25-116)||(21409212-21409303)
chr5 (227-377)||(27011088-27011238)
chr5 (11-107)||(14997942-14998038)
chr5 (11-107)||(22331090-22331186)
chr5 (11-107)||(27612441-27612537)
chr5 (11-107)||(27683603-27683699)
chr5 (11-104)||(19772050-19772143)
chr5 (11-104)||(27666693-27666786)
chr5 (11-104)||(40710870-40710963)
chr5 (11-107)||(29474276-29474372)
chr5 (11-107)||(41772929-41773025)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (122-538)||(3264721-3265137)
chr4 (122-538)||(11207158-11207574)
chr4 (122-538)||(29453464-29453880)
chr4 (122-534)||(44661793-44662205)
chr4 (122-534)||(33222851-33223263)
chr4 (126-532)||(20890918-20891323)
chr4 (122-532)||(16145847-16146257)
chr4 (122-534)||(1649204-1649616)
chr4 (122-534)||(51606108-51606520)
chr4 (122-523)||(15003291-15003692)
chr4 (122-534)||(15245857-15246269)
chr4 (150-534)||(15070346-15070730)
chr4 (122-418)||(15359017-15359313)
chr4 (265-534)||(42702836-42703105)
chr4 (122-394)||(27900459-27900731)
chr4 (11-123)||(11205253-11205365)
chr4 (11-122)||(3262815-3262926)
chr4 (11-122)||(29451558-29451669)
chr4 (11-122)||(44659887-44659998)
chr4 (150-534)||(14159425-14159809)
chr4 (138-520)||(16252128-16252510)
chr4 (228-520)||(7090380-7090671)
chr4 (150-522)||(14652253-14652625)
chr4 (138-520)||(12523623-12524005)
chr4 (183-395)||(16752665-16752877)
chr4 (156-518)||(14851067-14851429)
chr4 (13-123)||(15357143-15357253)
chr4 (228-499)||(15149779-15150050)
chr4 (16-123)||(16149850-16149957)
chr4 (16-123)||(16153996-16154103)
chr4 (13-123)||(1647300-1647410)
chr4 (13-123)||(15258067-15258177)
chr4 (13-119)||(27902529-27902635)
chr4 (150-534)||(16355140-16355524)
chr4 (339-478)||(18164333-18164472)
chr4 (150-520)||(14680514-14680884)
chr4 (138-520)||(18227129-18227511)
chr4 (13-123)||(51604815-51604925)
chr4 (138-463)||(14303661-14303985)
chr4 (405-534)||(15319516-15319645)
chr4 (13-123)||(15001388-15001498)
chr4 (150-278)||(15077824-15077952)
chr4 (228-463)||(19778566-19778801)
chr4 (228-463)||(29039177-29039412)
chr4 (122-363)||(15414953-15415194)
chr4 (426-523)||(15415210-15415307)
chr4 (228-517)||(23955697-23955986)
chr4 (138-522)||(14266582-14266966)
chr4 (228-463)||(12476604-12476839)
chr4 (228-463)||(18297209-18297444)
chr4 (228-522)||(27711281-27711575)
chr4 (228-463)||(8386416-8386651)
chr4 (13-123)||(15072498-15072608)
chr4 (347-520)||(14927151-14927324)
chr4 (228-517)||(40472990-40473279)
chr4 (11-107)||(16218385-16218481)
chr4 (11-107)||(16221705-16221801)
chr4 (228-399)||(8053396-8053567)
chr4 (324-463)||(15364390-15364529)
chr4 (13-115)||(8708058-8708160)
chr4 (31-123)||(14849147-14849239)
chr4 (11-123)||(23443245-23443356)
chr4 (229-313)||(55375392-55375476)
chr4 (122-277)||(8706108-8706263)
chr4 (464-534)||(15359326-15359396)
chr4 (227-377)||(16445244-16445394)
chr4 (11-104)||(8051384-8051477)
chr4 (19-123)||(14696252-14696356)
chr4 (199-298)||(16676447-16676546)
chr4 (227-377)||(9290925-9291075)
chr4 (231-377)||(14997406-14997552)
chr4 (228-313)||(13247799-13247884)
chr4 (11-104)||(18225207-18225300)
chr4 (11-104)||(27713494-27713587)
chr4 (11-107)||(12478755-12478851)
chr4 (11-107)||(16234753-16234849)
chr4 (11-107)||(16353268-16353364)
chr4 (11-107)||(19776554-19776650)
chr4 (11-107)||(23957902-23957998)
chr4 (17-107)||(15145652-15145742)
chr4 (227-313)||(15293189-15293275)
chr4 (11-104)||(8388570-8388663)
chr4 (11-104)||(17092910-17093003)
chr4 (228-360)||(12132442-12132574)
chr4 (11-107)||(14301740-14301836)
chr4 (11-107)||(40475195-40475291)
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (122-538)||(6679106-6679522)
chr8 (122-534)||(12304757-12305169)
chr8 (122-538)||(804043-804459)
chr8 (122-538)||(14565137-14565553)
chr8 (122-538)||(6603653-6604069)
chr8 (122-534)||(29303796-29304208)
chr8 (122-534)||(22061803-22062215)
chr8 (122-534)||(31416844-31417256)
chr8 (255-538)||(28982352-28982635)
chr8 (255-538)||(28987572-28987855)
chr8 (146-534)||(21324803-21325192)
chr8 (122-534)||(1266238-1266649)
chr8 (138-534)||(21681856-21682252)
chr8 (122-534)||(23654926-23655338)
chr8 (261-534)||(16265127-16265400)
chr8 (122-534)||(31571212-31571624)
chr8 (122-526)||(20007857-20008261)
chr8 (122-526)||(20010270-20010674)
chr8 (122-534)||(19851410-19851822)
chr8 (122-534)||(19857446-19857858)
chr8 (324-538)||(27347221-27347435)
chr8 (122-534)||(21840416-21840828)
chr8 (122-388)||(22051008-22051274)
chr8 (122-266)||(16271594-16271738)
chr8 (150-520)||(15533393-15533763)
chr8 (150-520)||(19977980-19978350)
chr8 (150-523)||(20388109-20388482)
chr8 (228-534)||(21167013-21167319)
chr8 (11-123)||(16269688-16269800)
chr8 (11-122)||(4984248-4984359)
chr8 (150-520)||(23650054-23650424)
chr8 (11-122)||(6605864-6605975)
chr8 (11-122)||(28983117-28983228)
chr8 (11-122)||(28988336-28988447)
chr8 (13-123)||(21323745-21323855)
chr8 (13-123)||(31569308-31569418)
chr8 (14-123)||(27356741-27356850)
chr8 (232-520)||(21250955-21251243)
chr8 (228-520)||(32600157-32600449)
chr8 (122-532)||(20396495-20396905)
chr8 (24-122)||(14567348-14567446)
chr8 (13-123)||(22053068-22053178)
chr8 (13-119)||(31414935-31415041)
chr8 (13-119)||(23657136-23657242)
chr8 (13-122)||(19984386-19984495)
chr8 (13-123)||(20008387-20008497)
chr8 (138-520)||(22046386-22046768)
chr8 (231-520)||(21922214-21922503)
chr8 (199-520)||(30313591-30313912)
chr8 (228-520)||(21394341-21394633)
chr8 (228-520)||(21788834-21789126)
chr8 (13-123)||(19861640-19861750)
chr8 (13-123)||(21927633-21927743)
chr8 (13-115)||(22061145-22061247)
chr8 (228-520)||(22987214-22987506)
chr8 (150-534)||(16408443-16408827)
chr8 (228-520)||(22032045-22032337)
chr8 (228-520)||(22164667-22164959)
chr8 (228-463)||(17674499-17674734)
chr8 (228-463)||(19112760-19112995)
chr8 (11-116)||(23887240-23887345)
chr8 (138-454)||(22120560-22120876)
chr8 (228-520)||(22133517-22133809)
chr8 (228-522)||(19485346-19485640)
chr8 (228-520)||(20018226-20018518)
chr8 (13-121)||(20390293-20390401)
chr8 (231-376)||(22377932-22378077)
chr8 (231-376)||(22384107-22384252)
chr8 (122-295)||(23949158-23949330)
chr8 (324-520)||(15441194-15441390)
chr8 (122-182)||(20976021-20976081)
chr8 (11-123)||(22246897-22247009)
chr8 (268-534)||(23948888-23949154)
chr8 (17-107)||(29301896-29301986)
chr8 (11-116)||(22522758-22522863)
chr8 (11-104)||(19482528-19482621)
chr8 (11-104)||(20016727-20016820)
chr8 (11-80)||(20394597-20394666)
chr8 (11-107)||(18858798-18858894)
chr8 (11-99)||(22375917-22376005)
chr8 (11-123)||(22422356-22422468)
chr8 (228-377)||(20652809-20652958)
chr8 (11-107)||(21253165-21253261)
chr8 (11-107)||(21920212-21920308)
chr8 (11-123)||(23652246-23652358)
chr8 (122-377)||(16877465-16877720)
chr8 (11-104)||(30311608-30311701)
chr8 (11-104)||(32602369-32602462)
chr8 (231-377)||(21850816-21850962)
chr8 (11-104)||(17672487-17672580)
chr8 (228-313)||(21196978-21197063)
chr8 (11-107)||(19864557-19864653)
chr8 (11-107)||(21165002-21165098)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (122-538)||(11306177-11306593)
chr7 (122-538)||(8212042-8212458)
chr7 (122-538)||(49152220-49152636)
chr7 (122-534)||(12455626-12456037)
chr7 (122-507)||(16950385-16950770)
chr7 (122-534)||(6413434-6413846)
chr7 (122-534)||(13021280-13021692)
chr7 (122-534)||(26118519-26118910)
chr7 (122-534)||(1321-1733)
chr7 (122-534)||(14129796-14130208)
chr7 (122-534)||(14433614-14434026)
chr7 (137-534)||(18053882-18054279)
chr7 (122-534)||(14264158-14264570)
chr7 (122-534)||(14286290-14286702)
chr7 (150-534)||(23199685-23200069)
chr7 (150-534)||(23505812-23506196)
chr7 (122-534)||(15102517-15102927)
chr7 (122-522)||(19147146-19147546)
chr7 (122-522)||(20746545-20746945)
chr7 (138-517)||(16072224-16072603)
chr7 (122-534)||(13665476-13665872)
chr7 (220-534)||(26288049-26288362)
chr7 (125-534)||(12206717-12207126)
chr7 (122-296)||(12456940-12457114)
chr7 (138-522)||(11388358-11388741)
chr7 (379-534)||(15340419-15340574)
chr7 (122-313)||(15340575-15340766)
chr7 (13-123)||(13966678-13966788)
chr7 (11-122)||(26092806-26092917)
chr7 (11-122)||(49154431-49154542)
chr7 (13-122)||(11301223-11301332)
chr7 (11-122)||(26116598-26116709)
chr7 (138-520)||(17268-17650)
chr7 (150-520)||(11553066-11553436)
chr7 (122-469)||(15624539-15624886)
chr7 (150-520)||(14954556-14954926)
chr7 (122-243)||(13968582-13968703)
chr7 (13-123)||(12458769-12458879)
chr7 (13-123)||(14139808-14139918)
chr7 (13-123)||(15342560-15342670)
chr7 (13-122)||(18051963-18052072)
chr7 (150-520)||(12687437-12687807)
chr7 (13-123)||(13675581-13675691)
chr7 (122-520)||(15203815-15204213)
chr7 (13-122)||(13023487-13023596)
chr7 (13-123)||(15100613-15100723)
chr7 (13-123)||(23503880-23503990)
chr7 (13-119)||(14284386-14284492)
chr7 (13-119)||(16948482-16948588)
chr7 (13-122)||(11386439-11386548)
chr7 (13-122)||(16070307-16070416)
chr7 (13-123)||(14262255-14262365)
chr7 (13-123)||(19614804-19614914)
chr7 (231-520)||(15154697-15154986)
chr7 (138-499)||(18177699-18178060)
chr7 (147-463)||(11237174-11237490)
chr7 (17-123)||(19149340-19149445)
chr7 (17-123)||(20748739-20748844)
chr7 (231-520)||(14037743-14038032)
chr7 (231-520)||(14347773-14348062)
chr7 (138-463)||(15161009-15161334)
chr7 (138-522)||(23516721-23517105)
chr7 (228-463)||(8707598-8707833)
chr7 (13-123)||(12204810-12204920)
chr7 (228-517)||(8198567-8198856)
chr7 (228-463)||(44791393-44791628)
chr7 (155-534)||(21661886-21662262)
chr7 (228-520)||(14332333-14332625)
chr7 (228-463)||(18551800-18552035)
chr7 (234-463)||(13686057-13686286)
chr7 (405-534)||(15479335-15479464)
chr7 (228-463)||(10870988-10871223)
chr7 (19-116)||(48813290-48813387)
chr7 (11-107)||(14041839-14041935)
chr7 (11-107)||(14351869-14351965)
chr7 (11-123)||(15146914-15147026)
chr7 (227-377)||(7823979-7824129)
chr7 (227-377)||(27107815-27107965)
chr7 (178-301)||(35964842-35964965)
chr7 (11-104)||(14334543-14334636)
chr7 (11-104)||(18179892-18179985)
chr7 (11-107)||(8709749-8709845)
chr7 (11-104)||(15380-15473)
chr7 (228-313)||(14936490-14936575)
chr7 (11-107)||(11235243-11235339)
chr7 (11-107)||(11551132-11551228)
chr7 (11-107)||(15159087-15159183)
chr7 (150-277)||(9596236-9596363)
chr7 (227-313)||(15364083-15364169)
chr7 (11-104)||(9590515-9590608)
chr7 (11-104)||(10872837-10872930)
chr7 (291-399)||(41251-41359)
chr7 (233-313)||(11772288-11772368)
chr7 (16-104)||(44789386-44789474)
[»] chr6 (104 HSPs)
chr6 (122-534)||(10468921-10469333)
chr6 (122-534)||(24364209-24364621)
chr6 (122-534)||(27560689-27561101)
chr6 (122-534)||(15459133-15459545)
chr6 (122-534)||(28282885-28283297)
chr6 (123-534)||(22796705-22797116)
chr6 (122-523)||(8766220-8766621)
chr6 (126-534)||(21471398-21471806)
chr6 (122-443)||(14381539-14381860)
chr6 (122-452)||(17415365-17415695)
chr6 (119-501)||(25768021-25768403)
chr6 (243-534)||(25750606-25750897)
chr6 (122-415)||(18800858-18801151)
chr6 (137-534)||(34645673-34646070)
chr6 (232-534)||(14131361-14131663)
chr6 (123-534)||(21564205-21564616)
chr6 (232-534)||(19879095-19879397)
chr6 (138-534)||(18794487-18794883)
chr6 (150-534)||(5839319-5839703)
chr6 (138-534)||(11287686-11288082)
chr6 (231-520)||(27331614-27331903)
chr6 (231-520)||(27392354-27392643)
chr6 (138-534)||(11280593-11280989)
chr6 (228-534)||(19864484-19864790)
chr6 (228-520)||(25610039-25610331)
chr6 (11-110)||(24366428-24366527)
chr6 (13-123)||(10467017-10467127)
chr6 (13-123)||(14378084-14378194)
chr6 (13-123)||(14379634-14379744)
chr6 (13-123)||(21568159-21568269)
chr6 (13-123)||(28280981-28281091)
chr6 (138-517)||(1543172-1543551)
chr6 (138-373)||(1640730-1640965)
chr6 (138-520)||(12497837-12498219)
chr6 (138-520)||(12510682-12511064)
chr6 (13-123)||(19455027-19455137)
chr6 (13-113)||(24516576-24516676)
chr6 (13-123)||(19437005-19437115)
chr6 (150-520)||(23078280-23078650)
chr6 (231-520)||(22078869-22079158)
chr6 (150-534)||(25765390-25765773)
chr6 (122-522)||(27187245-27187645)
chr6 (122-522)||(27261595-27261995)
chr6 (231-534)||(16963548-16963851)
chr6 (138-520)||(12505166-12505548)
chr6 (13-123)||(15461339-15461449)
chr6 (13-123)||(18796693-18796803)
chr6 (122-240)||(19453511-19453629)
chr6 (228-520)||(18408121-18408413)
chr6 (228-520)||(22762633-22762925)
chr6 (228-463)||(29592098-29592333)
chr6 (420-534)||(1640596-1640710)
chr6 (144-517)||(25112366-25112739)
chr6 (13-122)||(25769848-25769957)
chr6 (228-463)||(16626895-16627130)
chr6 (255-358)||(25750919-25751022)
chr6 (13-123)||(19881301-19881411)
chr6 (13-119)||(34643754-34643860)
chr6 (410-523)||(18787696-18787809)
chr6 (324-520)||(17032373-17032569)
chr6 (231-499)||(18197728-18197996)
chr6 (150-522)||(28263297-28263669)
chr6 (150-522)||(28342046-28342418)
chr6 (13-115)||(21473611-21473713)
chr6 (147-463)||(2874900-2875216)
chr6 (231-534)||(16927821-16928124)
chr6 (228-463)||(24313346-24313581)
chr6 (247-520)||(21833178-21833451)
chr6 (11-123)||(18183533-18183645)
chr6 (150-522)||(28292472-28292844)
chr6 (11-110)||(18963254-18963353)
chr6 (408-534)||(22433794-22433920)
chr6 (13-123)||(23085939-23086049)
chr6 (11-104)||(27189458-27189551)
chr6 (11-104)||(27259689-27259782)
chr6 (122-377)||(16382445-16382700)
chr6 (122-377)||(23996202-23996457)
chr6 (49-123)||(19487486-19487560)
chr6 (11-107)||(5837385-5837481)
chr6 (228-377)||(16098004-16098153)
chr6 (228-377)||(25743265-25743414)
chr6 (31-107)||(20634126-20634202)
chr6 (11-58)||(30679173-30679220)
chr6 (231-377)||(1648965-1649111)
chr6 (228-298)||(11291845-11291915)
chr6 (255-373)||(16233167-16233285)
chr6 (227-313)||(18571669-18571755)
chr6 (256-377)||(18838114-18838235)
chr6 (150-271)||(22433929-22434050)
chr6 (11-107)||(2872969-2873065)
chr6 (11-107)||(16573909-16574005)
chr6 (11-107)||(16621375-16621471)
chr6 (11-107)||(22760621-22760717)
chr6 (37-107)||(23080488-23080558)
chr6 (10-107)||(18406109-18406206)
chr6 (228-313)||(25655501-25655586)
chr6 (11-100)||(28261363-28261452)
chr6 (11-100)||(28284464-28284553)
chr6 (11-100)||(28340112-28340201)
chr6 (231-311)||(21413119-21413199)
chr6 (11-107)||(24293948-24294044)
chr6 (11-107)||(25114571-25114667)
chr6 (31-107)||(25763414-25763490)
chr6 (467-499)||(26276762-26276794)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (122-538)||(37677023-37677440)
chr1 (122-534)||(20294360-20294772)
chr1 (122-534)||(31550180-31550592)
chr1 (192-538)||(20075128-20075474)
chr1 (122-534)||(22433115-22433527)
chr1 (124-534)||(19854262-19854672)
chr1 (142-532)||(19664895-19665285)
chr1 (122-534)||(20940062-20940474)
chr1 (122-473)||(20835887-20836241)
chr1 (122-534)||(20856760-20857172)
chr1 (303-538)||(20395173-20395408)
chr1 (173-410)||(11382666-11382903)
chr1 (245-534)||(20244148-20244437)
chr1 (122-416)||(41307891-41308185)
chr1 (13-123)||(20296566-20296676)
chr1 (13-123)||(21953063-21953173)
chr1 (11-122)||(48425059-48425170)
chr1 (11-122)||(52987927-52988038)
chr1 (150-520)||(17045042-17045412)
chr1 (231-520)||(20249812-20250101)
chr1 (231-520)||(50620352-50620641)
chr1 (122-534)||(19760865-19761277)
chr1 (11-122)||(31538090-31538201)
chr1 (11-122)||(37679235-37679346)
chr1 (13-123)||(20854855-20854965)
chr1 (13-123)||(20938158-20938268)
chr1 (228-499)||(20136761-20137032)
chr1 (11-122)||(38910919-38911030)
chr1 (138-520)||(19106329-19106711)
chr1 (13-123)||(24097698-24097808)
chr1 (13-123)||(19661231-19661341)
chr1 (13-123)||(21743647-21743757)
chr1 (231-517)||(21747500-21747785)
chr1 (324-520)||(50612617-50612813)
chr1 (13-123)||(20833995-20834105)
chr1 (13-123)||(41310711-41310821)
chr1 (231-508)||(16369271-16369548)
chr1 (228-522)||(16350704-16350998)
chr1 (13-123)||(19856459-19856569)
chr1 (122-463)||(21830322-21830663)
chr1 (228-463)||(33391134-33391369)
chr1 (17-123)||(16378249-16378355)
chr1 (228-522)||(41354574-41354868)
chr1 (324-520)||(16078834-16079030)
chr1 (438-534)||(24476928-24477024)
chr1 (228-463)||(51333598-51333833)
chr1 (228-517)||(21836915-21837204)
chr1 (227-377)||(20831496-20831646)
chr1 (11-104)||(41351755-41351848)
chr1 (138-286)||(16078667-16078815)
chr1 (11-107)||(22360337-22360433)
chr1 (11-107)||(50618491-50618587)
chr1 (227-377)||(20914315-20914465)
chr1 (10-110)||(21751107-21751207)
chr1 (11-107)||(21862466-21862562)
chr1 (246-377)||(46518826-46518957)
chr1 (11-104)||(33389122-33389215)
chr1 (11-74)||(16348688-16348751)
chr1 (384-534)||(21163228-21163378)
chr1 (11-104)||(17043108-17043201)
chr1 (11-104)||(21233824-21233917)
chr1 (11-104)||(21832475-21832568)
chr1 (11-104)||(51331586-51331679)
chr1 (31-107)||(430229-430305)
chr1 (11-107)||(21839120-21839216)
[»] chr2 (74 HSPs)
chr2 (122-534)||(11358341-11358753)
chr2 (122-538)||(20832545-20832961)
chr2 (122-538)||(31830218-31830634)
chr2 (122-538)||(1063311-1063727)
chr2 (122-534)||(23276340-23276752)
chr2 (122-522)||(23293534-23293934)
chr2 (122-534)||(27787305-27787717)
chr2 (122-534)||(12573917-12574329)
chr2 (256-534)||(24653909-24654187)
chr2 (138-534)||(23087014-23087410)
chr2 (300-534)||(24944931-24945165)
chr2 (138-532)||(27365562-27365956)
chr2 (11-122)||(1065522-1065633)
chr2 (11-122)||(31832429-31832540)
chr2 (228-500)||(23063675-23063947)
chr2 (150-534)||(24675053-24675437)
chr2 (228-534)||(22757036-22757342)
chr2 (231-534)||(21325842-21326145)
chr2 (13-123)||(19650613-19650723)
chr2 (13-123)||(24950360-24950470)
chr2 (231-520)||(23138615-23138904)
chr2 (231-520)||(23550405-23550694)
chr2 (150-520)||(24707977-24708347)
chr2 (13-123)||(25255689-25255799)
chr2 (13-122)||(23098581-23098690)
chr2 (13-123)||(19717580-19717690)
chr2 (13-123)||(27789510-27789620)
chr2 (19-122)||(12576124-12576227)
chr2 (199-534)||(30211461-30211796)
chr2 (122-463)||(24878462-24878803)
chr2 (13-123)||(23278546-23278656)
chr2 (122-439)||(24825749-24826066)
chr2 (228-463)||(9609771-9610006)
chr2 (138-463)||(24262005-24262330)
chr2 (228-520)||(23188586-23188878)
chr2 (228-463)||(16924895-16925130)
chr2 (228-463)||(16998635-16998870)
chr2 (228-463)||(27217651-27217886)
chr2 (122-499)||(45529116-45529487)
chr2 (228-517)||(21145603-21145892)
chr2 (228-463)||(16981787-16982022)
chr2 (228-463)||(17063352-17063587)
chr2 (282-520)||(27377098-27377336)
chr2 (228-457)||(24709674-24709903)
chr2 (11-123)||(24818791-24818903)
chr2 (13-123)||(23112506-23112616)
chr2 (228-457)||(17067016-17067245)
chr2 (228-424)||(27370943-27371139)
chr2 (228-463)||(22325429-22325664)
chr2 (122-184)||(19652516-19652578)
chr2 (243-463)||(10868485-10868705)
chr2 (243-463)||(44386157-44386377)
chr2 (11-116)||(30010745-30010850)
chr2 (441-522)||(24833359-24833440)
chr2 (11-107)||(23106289-23106385)
chr2 (11-107)||(24875311-24875407)
chr2 (11-115)||(30209478-30209582)
chr2 (122-377)||(12640386-12640641)
chr2 (227-377)||(22276000-22276150)
chr2 (11-104)||(10870639-10870732)
chr2 (11-104)||(24711823-24711916)
chr2 (11-107)||(21323827-21323923)
chr2 (122-313)||(25128432-25128623)
chr2 (227-377)||(24831759-24831909)
chr2 (11-107)||(23073649-23073745)
chr2 (11-107)||(24264156-24264252)
chr2 (11-107)||(24677275-24677371)
chr2 (11-107)||(27373055-27373151)
chr2 (11-107)||(41606946-41607042)
chr2 (31-106)||(22734355-22734430)
chr2 (11-104)||(16927149-16927242)
chr2 (11-104)||(17000789-17000882)
chr2 (228-313)||(23817626-23817711)
chr2 (11-107)||(44384131-44384227)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (122-538)||(47123502-47123918)
chr3 (122-532)||(16329814-16330224)
chr3 (122-535)||(10383530-10383943)
chr3 (122-534)||(11961189-11961601)
chr3 (122-532)||(12360697-12361107)
chr3 (122-534)||(18134501-18134913)
chr3 (122-534)||(8759237-8759649)
chr3 (122-534)||(11303928-11304340)
chr3 (122-534)||(41177084-41177496)
chr3 (122-534)||(16836665-16837071)
chr3 (122-534)||(10420200-10420612)
chr3 (122-534)||(13941586-13941998)
chr3 (122-534)||(44776809-44777221)
chr3 (122-531)||(15953123-15953532)
chr3 (137-534)||(14571410-14571807)
chr3 (122-531)||(16381083-16381491)
chr3 (138-534)||(15227211-15227607)
chr3 (123-534)||(13322808-13323219)
chr3 (122-473)||(12850434-12850785)
chr3 (138-532)||(13972291-13972685)
chr3 (138-532)||(14086237-14086631)
chr3 (150-534)||(12497800-12498184)
chr3 (228-520)||(17489416-17489708)
chr3 (11-122)||(47125713-47125824)
chr3 (11-122)||(10407737-10407848)
chr3 (391-534)||(31945034-31945177)
chr3 (150-520)||(9522285-9522655)
chr3 (17-123)||(12510738-12510844)
chr3 (228-534)||(14876771-14877077)
chr3 (393-534)||(31689049-31689190)
chr3 (11-122)||(28756087-28756198)
chr3 (13-123)||(41179290-41179400)
chr3 (13-122)||(44779016-44779125)
chr3 (228-520)||(16492453-16492745)
chr3 (13-123)||(10418296-10418406)
chr3 (13-123)||(11950159-11950269)
chr3 (13-123)||(12358778-12358888)
chr3 (150-520)||(15208457-15208827)
chr3 (150-520)||(16691726-16692096)
chr3 (13-123)||(18132597-18132707)
chr3 (13-116)||(8745641-8745744)
chr3 (13-123)||(13943792-13943902)
chr3 (13-123)||(16327911-16328021)
chr3 (13-123)||(16379179-16379289)
chr3 (13-123)||(16834761-16834871)
chr3 (13-123)||(17188142-17188252)
chr3 (124-499)||(15247734-15248109)
chr3 (13-123)||(11959420-11959530)
chr3 (13-122)||(24189073-24189182)
chr3 (138-534)||(16807108-16807504)
chr3 (122-237)||(28754177-28754292)
chr3 (13-123)||(13318753-13318863)
chr3 (13-123)||(13970371-13970481)
chr3 (13-123)||(14088441-14088551)
chr3 (13-123)||(14291783-14291893)
chr3 (138-520)||(15725116-15725497)
chr3 (13-123)||(16826532-16826642)
chr3 (13-123)||(31693436-31693546)
chr3 (150-499)||(16371000-16371349)
chr3 (228-463)||(10905833-10906068)
chr3 (228-463)||(16635396-16635631)
chr3 (228-463)||(43162720-43162955)
chr3 (13-110)||(12269991-12270088)
chr3 (138-399)||(26792581-26792842)
chr3 (150-522)||(53385212-53385584)
chr3 (228-463)||(15348517-15348752)
chr3 (122-237)||(17492489-17492604)
chr3 (13-123)||(31940671-31940781)
chr3 (228-463)||(10005223-10005458)
chr3 (228-463)||(48425070-48425305)
chr3 (13-74)||(12180161-12180222)
chr3 (150-522)||(16756779-16757151)
chr3 (228-463)||(13252313-13252548)
chr3 (138-517)||(15338838-15339217)
chr3 (228-463)||(15589664-15589899)
chr3 (138-457)||(16412464-16412783)
chr3 (138-463)||(15402692-15403017)
chr3 (150-522)||(6600311-6600683)
chr3 (228-463)||(20062326-20062561)
chr3 (25-119)||(15014030-15014124)
chr3 (13-123)||(15229371-15229481)
chr3 (13-123)||(15235239-15235349)
chr3 (228-463)||(5425202-5425436)
chr3 (122-377)||(8274565-8274820)
chr3 (122-377)||(16742869-16743124)
chr3 (220-347)||(15016008-15016135)
chr3 (11-77)||(11888614-11888680)
chr3 (17-123)||(15261388-15261494)
chr3 (122-377)||(15576469-15576724)
chr3 (227-377)||(13975316-13975466)
chr3 (469-534)||(12854360-12854425)
chr3 (122-235)||(13001770-13001883)
chr3 (11-104)||(16754961-16755054)
chr3 (228-313)||(17192877-17192962)
chr3 (11-104)||(53383278-53383371)
chr3 (11-107)||(15723194-15723290)
chr3 (11-107)||(17491624-17491720)
chr3 (122-205)||(4678329-4678412)
chr3 (11-104)||(6602513-6602606)
chr3 (11-104)||(16805207-16805300)
chr3 (11-107)||(3687717-3687813)
chr3 (11-107)||(5423190-5423286)
chr3 (11-107)||(10007374-10007470)
chr3 (11-107)||(10907984-10908080)
chr3 (11-107)||(12888483-12888579)
chr3 (11-104)||(5108871-5108964)
chr3 (11-104)||(15346505-15346598)
chr3 (11-104)||(15587652-15587745)
chr3 (11-104)||(48427224-48427317)
chr3 (11-107)||(14579668-14579764)
chr3 (19-107)||(15400785-15400873)
chr3 (11-107)||(20060314-20060410)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (122-534)||(16643-17055)
scaffold0089 (60-122)||(14786-14848)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (122-538)||(38817-39233)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (122-534)||(26225-26637)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (122-534)||(42747-43159)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (122-532)||(49137-49547)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (122-534)||(248577-248989)
scaffold0009 (13-119)||(250794-250900)
[»] scaffold0114 (5 HSPs)
scaffold0114 (124-532)||(20088-20496)
scaffold0114 (122-532)||(43471-43881)
scaffold0114 (122-532)||(44483-44893)
scaffold0114 (334-532)||(36021-36219)
scaffold0114 (13-123)||(22044-22154)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (122-534)||(13831-14243)
scaffold0034 (122-463)||(4883-5224)
scaffold0034 (13-123)||(2979-3089)
scaffold0034 (13-123)||(69540-69650)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (122-534)||(21601-22013)
scaffold0235 (13-123)||(9487-9597)
scaffold0235 (13-123)||(19701-19811)
scaffold0235 (227-313)||(25991-26077)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (122-534)||(42263-42675)
scaffold0010 (122-534)||(47329-47741)
scaffold0010 (11-122)||(40357-40468)
scaffold0010 (13-123)||(45453-45563)
scaffold0010 (11-107)||(4100-4196)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (122-534)||(195633-196044)
scaffold0011 (122-534)||(148534-148946)
scaffold0011 (327-534)||(68575-68782)
scaffold0011 (231-520)||(26572-26861)
scaffold0011 (13-123)||(150739-150849)
scaffold0011 (11-123)||(24557-24669)
scaffold0011 (227-377)||(121985-122135)
[»] scaffold0004 (7 HSPs)
scaffold0004 (122-534)||(117532-117944)
scaffold0004 (125-534)||(322668-323077)
scaffold0004 (122-534)||(385783-386195)
scaffold0004 (122-534)||(203398-203810)
scaffold0004 (122-534)||(111985-112397)
scaffold0004 (13-123)||(324874-324984)
scaffold0004 (13-123)||(201494-201604)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (231-534)||(16640-16943)
scaffold0113 (122-534)||(25795-26207)
[»] scaffold0298 (4 HSPs)
scaffold0298 (122-534)||(13291-13703)
scaffold0298 (122-534)||(17061-17473)
scaffold0298 (122-534)||(19947-20359)
scaffold0298 (13-123)||(10083-10193)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (122-534)||(10852-11264)
scaffold0124 (122-534)||(329-741)
scaffold0124 (13-74)||(14425-14486)
scaffold0124 (227-377)||(7845-7995)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (122-534)||(19084-19496)
scaffold0058 (13-122)||(21291-21400)
scaffold0058 (231-454)||(58445-58668)
scaffold0058 (450-534)||(59030-59114)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (123-534)||(62-473)
[»] scaffold0067 (7 HSPs)
scaffold0067 (122-534)||(52109-52521)
scaffold0067 (122-534)||(61143-61555)
scaffold0067 (122-502)||(67531-67911)
scaffold0067 (13-123)||(28792-28902)
scaffold0067 (13-123)||(59240-59350)
scaffold0067 (13-123)||(50206-50316)
scaffold0067 (13-123)||(65628-65738)
[»] scaffold0053 (4 HSPs)
scaffold0053 (122-534)||(57747-58158)
scaffold0053 (122-534)||(48963-49375)
scaffold0053 (13-123)||(47060-47170)
scaffold0053 (13-122)||(55873-55982)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (122-534)||(260272-260684)
scaffold0005 (150-522)||(164667-165039)
scaffold0005 (13-123)||(262394-262504)
scaffold0005 (234-533)||(278872-279171)
scaffold0005 (199-463)||(308694-308958)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (122-534)||(10013-10425)
[»] scaffold0203 (3 HSPs)
scaffold0203 (122-534)||(14181-14593)
scaffold0203 (354-534)||(9039-9219)
scaffold0203 (37-123)||(12349-12435)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (122-534)||(2715-3127)
scaffold0035 (13-123)||(4919-5029)
scaffold0035 (11-115)||(42131-42235)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (122-534)||(27483-27895)
scaffold0139 (122-534)||(1079-1490)
scaffold0139 (13-123)||(37818-37928)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (122-534)||(12711-13123)
scaffold0239 (13-123)||(10812-10922)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (122-511)||(1454-1843)
scaffold0120 (228-520)||(6001-6293)
scaffold0120 (150-313)||(22879-23042)
scaffold0120 (11-107)||(8206-8302)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (122-531)||(47091-47500)
scaffold0108 (13-123)||(49274-49384)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (122-532)||(27192-27601)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (122-534)||(7168-7576)
scaffold0367 (52-123)||(16214-16285)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (122-534)||(95932-96344)
scaffold0029 (232-534)||(112523-112825)
scaffold0029 (138-522)||(109757-110141)
scaffold0029 (13-123)||(94920-95030)
scaffold0029 (13-123)||(114729-114839)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (127-534)||(1104-1511)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (122-534)||(18467-18879)
scaffold0326 (466-534)||(3629-3697)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (138-478)||(4770-5110)
scaffold0404 (13-123)||(6920-7030)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (122-534)||(31374-31786)
scaffold0106 (13-123)||(33504-33614)
scaffold0106 (228-500)||(14037-14309)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (122-534)||(39703-40114)
scaffold0102 (13-123)||(41866-41976)
scaffold0102 (11-107)||(51369-51465)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (122-523)||(6158-6560)
scaffold0348 (13-123)||(9900-10010)
scaffold0348 (13-123)||(18509-18619)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (122-534)||(90862-91274)
scaffold0001 (13-122)||(515379-515488)
scaffold0001 (235-520)||(162091-162376)
scaffold0001 (13-123)||(453239-453349)
scaffold0001 (150-520)||(448037-448407)
scaffold0001 (18-123)||(495188-495293)
scaffold0001 (229-313)||(78666-78750)
[»] scaffold0309 (3 HSPs)
scaffold0309 (122-534)||(9762-10169)
scaffold0309 (13-123)||(11963-12073)
scaffold0309 (11-107)||(16827-16923)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (124-534)||(51795-52205)
scaffold0049 (17-123)||(49905-50011)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (122-534)||(3839-4251)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (122-534)||(26106-26518)
scaffold0192 (13-122)||(28696-28805)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (176-534)||(14050-14407)
scaffold0266 (13-123)||(16282-16392)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (122-523)||(3866-4267)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (270-534)||(4217-4481)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (122-534)||(5844-6255)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (168-534)||(7012-7378)
scaffold0585 (13-123)||(5115-5225)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (122-430)||(10837-11145)
scaffold0518 (491-534)||(10788-10831)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (122-534)||(4932-5344)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (122-534)||(37166-37578)
scaffold0026 (122-418)||(38103-38400)
scaffold0026 (13-123)||(50980-51090)
scaffold0026 (231-418)||(27376-27563)
scaffold0026 (11-107)||(31131-31227)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (122-534)||(25001-25413)
scaffold0234 (232-377)||(16211-16356)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (119-534)||(10667-11081)
scaffold0130 (52-123)||(8873-8944)
scaffold0130 (13-57)||(4915-4959)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (228-534)||(155-461)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (122-399)||(5312-5589)
[»] scaffold0104 (3 HSPs)
scaffold0104 (122-534)||(492-904)
scaffold0104 (13-123)||(44443-44553)
scaffold0104 (16-119)||(24388-24491)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (339-534)||(136083-136278)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (122-361)||(7-246)
scaffold0523 (13-123)||(2039-2149)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (234-534)||(27931-28231)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (290-534)||(1141-1385)
scaffold0165 (13-63)||(11188-11238)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (227-534)||(28804-29111)
scaffold0064 (227-534)||(40795-41102)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (122-309)||(78-265)
scaffold1710 (227-377)||(945-1095)
[»] scaffold0090 (3 HSPs)
scaffold0090 (232-534)||(18813-19115)
scaffold0090 (17-123)||(21019-21125)
scaffold0090 (232-415)||(23094-23277)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (138-532)||(33623-34017)
scaffold0076 (13-110)||(54437-54534)
scaffold0076 (13-123)||(31703-31813)
scaffold0076 (227-377)||(40379-40529)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (150-520)||(180195-180565)
scaffold0020 (13-123)||(99588-99698)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (13-123)||(860-970)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (122-384)||(1908-2170)
scaffold0751 (13-123)||(4346-4459)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (150-520)||(65383-65753)
scaffold0042 (327-534)||(39924-40131)
scaffold0042 (16-80)||(22918-22982)
scaffold0042 (228-277)||(39855-39904)
scaffold0042 (11-107)||(37844-37940)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (122-343)||(1164-1385)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (150-534)||(15037-15421)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (150-534)||(25677-26061)
scaffold0100 (11-78)||(22210-22277)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (122-285)||(5382-5545)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (13-123)||(1122-1232)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (228-534)||(5978-6284)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (228-499)||(1-272)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (150-520)||(654-1024)
[»] scaffold0730 (2 HSPs)
scaffold0730 (228-534)||(5627-5932)
scaffold0730 (13-123)||(27-137)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (13-123)||(29102-29212)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (138-532)||(50460-50854)
scaffold0028 (138-517)||(43135-43514)
scaffold0028 (13-123)||(48540-48650)
scaffold0028 (228-508)||(8475-8755)
scaffold0028 (11-107)||(45337-45433)
scaffold0028 (227-377)||(106608-106758)
scaffold0028 (11-107)||(17122-17218)
scaffold0028 (11-107)||(10660-10756)
scaffold0028 (228-296)||(13868-13936)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (150-520)||(127157-127527)
scaffold0022 (11-107)||(55941-56037)
scaffold0022 (11-107)||(40818-40914)
scaffold0022 (11-107)||(74538-74634)
[»] scaffold0222 (4 HSPs)
scaffold0222 (122-313)||(3285-3476)
scaffold0222 (13-123)||(1515-1625)
scaffold0222 (13-123)||(9231-9341)
scaffold0222 (411-534)||(3487-3610)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (157-520)||(219382-219745)
scaffold0012 (150-520)||(229021-229391)
scaffold0012 (11-107)||(217444-217540)
scaffold0012 (231-377)||(33034-33180)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (426-532)||(871-977)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (13-123)||(396-506)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (122-520)||(14338-14736)
scaffold0044 (138-463)||(655-980)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (13-123)||(268778-268888)
scaffold0007 (150-522)||(86462-86834)
scaffold0007 (25-115)||(84557-84647)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (150-520)||(4010-4380)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (13-123)||(19522-19632)
scaffold0244 (231-313)||(26196-26278)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (13-123)||(79857-79967)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (349-534)||(2023-2207)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (231-520)||(1117-1406)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (231-508)||(3130-3407)
scaffold0074 (13-123)||(11291-11401)
scaffold0074 (11-123)||(5281-5393)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (236-520)||(26-310)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (138-534)||(33519-33915)
scaffold0109 (138-520)||(8574-8956)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (150-534)||(14841-15225)
scaffold0040 (11-123)||(17047-17158)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (122-497)||(12907-13282)
scaffold0379 (11-123)||(5913-6025)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (13-123)||(815-925)
scaffold0420 (13-98)||(7809-7894)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (150-520)||(16423-16793)
scaffold0138 (11-123)||(7111-7223)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (13-123)||(43086-43196)
scaffold0126 (402-511)||(45832-45941)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (228-534)||(64067-64373)
scaffold0031 (13-123)||(109800-109910)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (122-499)||(16986-17363)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (231-520)||(15471-15759)
scaffold0333 (11-107)||(17835-17931)
scaffold0333 (231-301)||(15852-15922)
[»] scaffold0647 (3 HSPs)
scaffold0647 (150-534)||(872-1256)
scaffold0647 (11-110)||(3082-3181)
scaffold0647 (11-107)||(7683-7779)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (232-520)||(6350-6638)
scaffold0403 (11-107)||(8558-8654)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (13-119)||(880-986)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (13-123)||(6171-6281)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (13-123)||(670-780)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (122-520)||(624-1021)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (231-520)||(32791-33080)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (327-500)||(13388-13561)
scaffold0149 (13-110)||(5377-5474)
scaffold0149 (13-110)||(9808-9905)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (122-534)||(116835-117247)
scaffold0037 (122-377)||(98136-98391)
scaffold0037 (11-107)||(115062-115158)
scaffold0037 (279-376)||(23553-23650)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (13-123)||(2298-2408)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (13-123)||(13362-13472)
scaffold0261 (13-123)||(21541-21651)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (13-119)||(25287-25393)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (13-123)||(29311-29421)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (13-123)||(2886-2996)
scaffold0079 (11-107)||(28285-28381)
scaffold0079 (11-107)||(35682-35778)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (231-520)||(299-588)
[»] scaffold0431 (2 HSPs)
scaffold0431 (228-517)||(7358-7647)
scaffold0431 (11-107)||(9552-9648)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (13-110)||(19660-19757)
scaffold0077 (228-377)||(28302-28451)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (13-120)||(53218-53325)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (138-520)||(4351-4733)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (13-123)||(1571-1681)
scaffold0476 (228-520)||(9321-9613)
scaffold0476 (11-107)||(10352-10448)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (228-534)||(859-1164)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (19-123)||(619-723)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (231-418)||(9050-9237)
scaffold0507 (228-376)||(369-517)
scaffold0507 (430-520)||(6955-7045)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (243-478)||(1025-1260)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (420-534)||(9183-9297)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (122-216)||(6267-6361)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (13-119)||(31345-31451)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (231-520)||(16455-16744)
scaffold0282 (11-123)||(14503-14615)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (13-101)||(64545-64633)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (150-433)||(21932-22215)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (150-433)||(7855-8138)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (231-478)||(5241-5488)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (231-478)||(49513-49760)
scaffold0081 (11-107)||(20788-20884)
scaffold0081 (11-107)||(36212-36308)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (324-534)||(16921-17131)
scaffold0324 (16-107)||(13240-13331)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (13-123)||(1511-1621)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (445-534)||(18991-19080)
scaffold0023 (19-123)||(2537-2641)
scaffold0023 (11-119)||(86942-87050)
scaffold0023 (334-476)||(4567-4709)
scaffold0023 (11-106)||(151297-151392)
scaffold0023 (138-298)||(4400-4560)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (11-123)||(10765-10877)
scaffold0018 (16-123)||(16962-17069)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (122-424)||(7012-7315)
scaffold0454 (11-107)||(9124-9220)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (227-377)||(10476-10626)
scaffold0447 (227-377)||(5862-6012)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (138-397)||(726-985)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (38-123)||(1900-1985)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (243-463)||(449-669)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (11-123)||(9058-9170)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (13-123)||(10998-11108)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (227-377)||(8471-8621)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (18-123)||(14638-14743)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (412-460)||(8768-8816)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (122-377)||(316-571)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (122-377)||(46275-46530)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (227-377)||(3910-4060)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (122-300)||(23592-23770)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (227-377)||(14778-14928)
scaffold0132 (227-313)||(43723-43809)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (228-377)||(13029-13178)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (11-123)||(91-203)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (11-123)||(16002-16114)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (11-123)||(6041-6153)
scaffold0270 (11-123)||(13171-13283)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (11-107)||(23098-23194)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (11-107)||(85254-85350)
scaffold0008 (227-377)||(24001-24151)
scaffold0008 (11-107)||(85820-85916)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (11-123)||(103403-103515)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (441-520)||(6251-6330)
scaffold0358 (11-107)||(8235-8331)
scaffold0358 (11-107)||(17431-17527)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (138-361)||(7534-7757)
scaffold0080 (11-107)||(53821-53917)
scaffold0080 (11-104)||(11263-11356)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (17-107)||(839-929)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (10-116)||(1174-1280)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (17-123)||(176374-176480)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (228-377)||(8216-8365)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-116)||(15245-15350)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (17-89)||(84-156)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (11-107)||(803-899)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (19-107)||(3767-3855)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (11-107)||(24969-25065)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (11-110)||(3615-3714)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (228-377)||(3280-3429)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (228-377)||(14773-14922)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (11-107)||(6355-6451)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (11-119)||(940-1048)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (11-107)||(195511-195607)
scaffold0017 (11-104)||(58204-58297)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (228-283)||(3755-3810)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (228-297)||(1090-1159)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (31-107)||(1426-1502)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (31-107)||(245-321)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (11-107)||(20424-20520)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (228-300)||(1460-1532)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22502938 - 22502526
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22502938 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 22502839  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  22502838 ataagggaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 22502739  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22502738 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagt 22502639  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22502638 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgatt 22502539  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  22502538 ccaagggatgatg 22502526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20342541 - 20342125
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20342541 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctagtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 20342442  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  20342441 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagcgtgatcatgtttttctga 20342342  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  20342341 gagtcacccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 20342242  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20342241 ggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgatt 20342142  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  20342141 ccgagggatgatgatgt 20342125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 25848334 - 25847918
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25848334 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcagattg 25848235  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  25848234 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttga 25848135  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25848134 gagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgt 25848035  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25848034 ggcatacagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgttgcggatccttcacatgtgatt 25847935  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  25847934 ccgagggatgatgatgt 25847918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 126 - 538
Target Start/End: Original strand, 14887104 - 14887516
Alignment:
Q  126 cggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataa 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14887104 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataa 14887203  T
Q  226 gggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggt 325  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  14887204 gagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 14887303  T
Q  326 cactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||    
T  14887304 cactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggca 14887403  T
Q  426 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14887404 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccga 14887503  T
Q  526 gggatgatgatgt 538  Q
    | |||||||||||    
T  14887504 gagatgatgatgt 14887516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 37545605 - 37546022
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37545605 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttg 37545704  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttc-cta 320  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||     
T  37545705 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttctg 37545804  T
Q  321 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37545805 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttctgagagagttggtactg 37545904  T
Q  421 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37545905 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 37546004  T
Q  521 tccgagggatgatgatgt 538  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37546005 tccgagggatgatgatgt 37546022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 24798506 - 24798922
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  24798506 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggactggatttggttcacgagactactgagaaagtcagaatg 24798605  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  24798606 ataagggaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctga 24798705  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24798706 gagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgt 24798805  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24798806 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 24798905  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
     ||||||||||||||||    
T  24798906 acgagggatgatgatgt 24798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22381458 - 22381046
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  22381458 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaggtcaaaatg 22381359  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  22381358 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 22381259  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  22381258 gggtcactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacggt 22381159  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22381158 ggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcagatccgtcacatgtgatt 22381059  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  22381058 ccaagagatgatg 22381046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 22236029 - 22236441
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  22236029 tggtcggaggtgcaagactcctttattctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggagttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 22236128  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
     | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  22236129 gtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 22236228  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  22236229 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagt 22236328  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22236329 gtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 22236428  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||    
T  22236429 ccgagggatgatg 22236441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 23080198 - 23080610
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  23080198 tggtcggaggtgcaggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggtgcatgagactactgagaaagtcaagatg 23080297  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  23080298 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 23080397  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  23080398 gggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 23080497  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23080498 ggcttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgatt 23080597  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  23080598 ccaagggatgatg 23080610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 17269442 - 17269854
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  17269442 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 17269541  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17269542 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 17269641  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  | || || ||    
T  17269642 gagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggatcgggacggt 17269741  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || | |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  17269742 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtatttcacgtgtcacaactccggaagtatgtagcagatccttcgcatgttatt 17269841  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  17269842 ccgagagatgatg 17269854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20821712 - 20821300
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  20821712 tggtcggaagtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacagagaaagttaggatg 20821613  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcg-aagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttccta 320  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||     
T  20821612 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaag-accttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctg 20821514  T
Q  321 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactg 420  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  20821513 agggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagggttggaactg 20821414  T
Q  421 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  20821413 tggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttat 20821314  T
Q  521 tccgagggatgatg 534  Q
    ||| || |||||||    
T  20821313 tccaagagatgatg 20821300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 22462211 - 22461810
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  22462211 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggaattggttcatgaaactacagagaaagtcaagatg 22462112  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  22462111 attagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctga 22462012  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22462011 gggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgt 22461912  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||  | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  22461911 ggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgtcatt 22461812  T
Q  522 cc 523  Q
    ||    
T  22461811 cc 22461810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 137 - 534
Target Start/End: Original strand, 23442417 - 23442814
Alignment:
Q  137 gactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatg 236  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||    
T  23442417 gactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatg 23442516  T
Q  237 aaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttga 336  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||| |||    
T  23442517 aaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatga 23442616  T
Q  337 cgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttgg 436  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||   || ||||| |||||||| |||||||| | ||| |     
T  23442617 cgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtccgtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggt 23442716  T
Q  437 tttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  23442717 tttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgtatgttattccgagagatgatg 23442814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 122 - 517
Target Start/End: Original strand, 21890868 - 21891263
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  21890868 tggtcggaggtacaagactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaacagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 21890967  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  21890968 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 21891067  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || || ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  21891068 gagttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 21891167  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21891168 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 21891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 28923877 - 28924289
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  28923877 tggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatg 28923976  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  28923977 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctga 28924076  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28924077 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgt 28924176  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  28924177 ggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttatt 28924276  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  28924277 ccgagagatgatg 28924289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 28895051 - 28895463
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  28895051 tggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatg 28895150  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  28895151 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctga 28895250  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  28895251 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactct 28895350  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  28895351 ggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttatt 28895450  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  28895451 ccgagagatgatg 28895463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20774019 - 20773607
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  20774019 tggtcggaagtgtaagactcctttatgttggttcgagtcgggagaaaatgttgttttgggaccggaattggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 20773920  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||  | || || ||| ||||||| || || |  |||||||| || |    
T  20773919 attagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttcaggaagggggccatgtttttctga 20773820  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20773819 gggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgt 20773720  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  20773719 ggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgttatt 20773620  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  20773619 ccgagagatgatg 20773607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 24749663 - 24750075
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||| || || || | | ||    
T  24749663 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttg 24749762  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  24749763 ataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 24749862  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  24749863 gagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagt 24749962  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | | |||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  24749963 ggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttatt 24750062  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  24750063 cctagagatgatg 24750075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 24735720 - 24736132
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||| || || || | | ||    
T  24735720 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcggaagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttg 24735819  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  24735820 ataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 24735919  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  24735920 gagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagt 24736019  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | | |||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  24736020 ggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttatt 24736119  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  24736120 cctagagatgatg 24736132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 168 - 534
Target Start/End: Original strand, 21564121 - 21564487
Alignment:
Q  168 agtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttacc 267  Q
    ||||| |||||||||| |||  | |||||| ||||||| || || ||||   ||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21564121 agtgtagtgttgggactagatatagttcatcagactacagaaaaggtcaaattgataagagagaagacgaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatc 21564220  T
Q  268 atgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaa 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || || ||||||| | ||||  ||||| | ||||| |||||||| | |||    
T  21564221 atgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaa 21564320  T
Q  368 attgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgat 467  Q
     ||||||||   ||| ||||| || |||||||  || || |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21564321 tttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgat 21564420  T
Q  468 gtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||| || |||||||    
T  21564421 gtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgctattccaagagatgatg 21564487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 534
Target Start/End: Original strand, 24737015 - 24737306
Alignment:
Q  243 tcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtg 342  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||    
T  24737015 tcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtg 24737114  T
Q  343 ttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcc 442  Q
    | || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24737115 taggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgcc 24737214  T
Q  443 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24737215 acctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattcctagagatgatg 24737306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25850240 - 25850129
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25850240 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 25850141  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||||    
T  25850140 cgcgcctggtgt 25850129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Original strand, 26738842 - 26739212
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||  | || ||  | |||||||||||||| | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  26738842 tggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcaga 26738941  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  | |||||| | ||  | |||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  26738942 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaagagatcatatatttttgagggtcactcctgtgactggtgttggatg 26739041  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| | |||    
T  26739042 tgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcat 26739141  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  26739142 ctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 26739212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20344447 - 20344335
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20344447 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 20344348  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
    || ||||||||||    
T  20344347 cgtgcctggtgtg 20344335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 37541584 - 37541695
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37541584 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 37541683  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  37541684 tgcgcctggtgt 37541695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 21984520 - 21984812
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||  | || ||||    
T  21984520 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtca 21984619  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || |||| |||||| ||||| ||    
T  21984620 ctcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgta 21984719  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21984720 tcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaggtatgtaccggatccatcccatgtgat 21984812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 14885194 - 14885305
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14885194 atcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 14885293  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  14885294 tgcgcctggtgt 14885305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 24796600 - 24796711
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796600 atcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 24796699  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  24796700 tgcgcctggtgt 24796711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22504844 - 22504732
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22504844 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 22504745  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
    || ||||||||||    
T  22504744 cgagcctggtgtg 22504732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 25423360 - 25423068
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  25423360 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 25423261  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  25423260 ctcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 25423161  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |   || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  25423160 tcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaactatgtaccggatccatcccatgtgat 25423068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23516709 - 23516406
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  23516709 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 23516610  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  23516609 atgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcg 23516510  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggat 530  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||| |  ||||||| || |||||||| | ||| |||    
T  23516509 agttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatttcccggatccatctcatgtgatccagagtgat 23516410  T
Q  531 gatg 534  Q
    ||||    
T  23516409 gatg 23516406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23573991 - 23573621
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  23573991 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 23573892  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  23573891 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 23573792  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  23573791 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 23573692  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  23573691 ctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23573621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 20468205 - 20468617
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |  | |||||  | ||||||||||| || | | ||    
T  20468205 tggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaatgttaagttg 20468304  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||  | |    
T  20468305 atccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggagaccatgtatttttga 20468404  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||  | ||| ||||| |||| |||||  | ||| ||| | | ||| ||    
T  20468405 gagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtgtcagatattagaaagaatagaaacagt 20468504  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||     
T  20468505 ggcgtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccgtctcatgtgatc 20468604  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  20468605 ccaagagatgatg 20468617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 517
Target Start/End: Original strand, 22333012 - 22333391
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||||||||||||| || ||||    ||||| ||||    
T  22333012 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatga 22333111  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  22333112 aggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 22333211  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  22333212 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 22333311  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    || || || ||||||||||| |||||  | || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  22333312 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 22333391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22464114 - 22464007
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22464114 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 22464015  T
Q  113 cgcctggt 120  Q
    ||||||||    
T  22464014 cgcctggt 22464007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 17267539 - 17267649
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17267539 catcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 17267638  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  17267639 cgcccggtgtg 17267649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 28893147 - 28893257
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28893147 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28893246  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  28893247 cgccgggtgtg 28893257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 28921973 - 28922083
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28921973 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28922072  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  28922073 cgccgggtgtg 28922083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20778076 - 20777967
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20778076 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20777977  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  20777976 cgcctggtgt 20777967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22134929 - 22134604
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||||||||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  22134929 actccgttgtgctagtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatga 22134830  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  22134829 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgac 22134730  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  22134729 tggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggt 22134630  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||    
T  22134629 ttaccaccgcatctttcgaatttgca 22134604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18776038 - 18775642
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||  ||||    
T  18776038 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatga 18775939  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  18775938 aagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgac 18775839  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| |||   ||| |||| ||     
T  18775838 tggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgatgtatcgagtggga 18775739  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  | ||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  18775738 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 18775642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20823616 - 20823506
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20823616 catcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20823517  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  20823516 cgcctggtgtg 20823506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 324 - 520
Target Start/End: Original strand, 21343669 - 21343865
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  21343669 gtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtgg 21343768  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  21343769 cgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 21343865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 270 - 534
Target Start/End: Original strand, 21662297 - 21662560
Alignment:
Q  270 gacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaat 369  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  21662297 gacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagt 21662396  T
Q  370 tgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 469  Q
    ||||| | | ||| |||||   ||||||||  || || |||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  21662397 tgacttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21662495  T
Q  470 gtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
     ||||| || || || |||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21662496 atttcaagtgtcgcaacttcggaaatatgtatcggatccatcgcatgtgattccgagggatgatg 21662560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20798931 - 20798660
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  20798931 gagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 20798832  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  20798831 ctcctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcata 20798732  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    | || | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| ||| |||||    
T  20798731 tcgattgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaaatatgt 20798660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 22234125 - 22234235
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  22234125 catcagattaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 22234224  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  22234225 cgcctggtgtg 22234235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23440396 - 23440090
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  23440396 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 23440297  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  23440296 ctcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 23440197  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | |||  || || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  23440196 tcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 23440097  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  23440096 gatgatg 23440090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Original strand, 14999864 - 15000189
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  14999864 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 14999963  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  14999964 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 15000063  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  15000064 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 15000163  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || || ||||||||||| |||||    
T  15000164 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 15000189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23471397 - 23471108
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||    
T  23471397 aagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactc 23471298  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
       |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||   | ||| ||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |    
T  23471297 aagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattggtccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcgtatcg 23471198  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  23471197 agtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcacatgtgat 23471108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16356673 - 16356438
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16356673 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16356574  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16356573 ctcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 16356474  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16356473 ccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 16356438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34566665 - 34566430
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  34566665 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 34566566  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  34566565 ctcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 34566466  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  34566465 ccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 34566430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573400
Alignment:
Q  294 tttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgt 393  Q
    |||||||| || |||||||| ||  | || ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | | ||| ||||| ||||    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  394 atcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaa 493  Q
    ||||||  || || ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20573427  T
Q  494 gtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||||  | ||||| || ||||||||    
T  20573426 gtatgttccagatccatctcatgtgat 20573400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 324 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21404911 - 21404701
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||| |||||||   ||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||| || || |    
T  21404911 gtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggtttattggctcgtatcagatttcggaaagagttgggacagttg 21404812  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||| || |||||||||||    
T  21404811 cgtatagagtgggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgattcc 21404712  T
Q  524 gagggatgatg 534  Q
     || |||||||    
T  21404711 aagagatgatg 21404701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Original strand, 28914642 - 28914728
Alignment:
Q  37 gatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28914642 gatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtg 28914728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Original strand, 28929910 - 28929996
Alignment:
Q  37 gatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28929910 gatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtg 28929996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Original strand, 27685525 - 27685850
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||  ||||    
T  27685525 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatga 27685624  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  27685625 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 27685724  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  27685725 cggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 27685824  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || || ||||||||||| |||||    
T  27685825 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 27685850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Original strand, 37291621 - 37291946
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||||||||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  37291621 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 37291720  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| | || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  37291721 aagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 37291820  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  37291821 tggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 37291920  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || || ||||||||||| |||||    
T  37291921 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 37291946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 27668705 - 27668940
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  27668705 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 27668804  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  27668805 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggctta 27668904  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  27668905 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 27668940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40708951 - 40708716
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |  || ||  | || ||||    
T  40708951 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccgcgtgtttttgagagtca 40708852  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  40708851 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 40708752  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  40708751 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 40708716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 456
Target Start/End: Original strand, 21498145 - 21498479
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||| || | | ||    
T  21498145 tggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggacccgagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatg 21498244  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||  | |||||||||||||| ||||||||  |  | |    
T  21498245 attcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatagacatcgagtttcaagagggagatcatgtagttttga 21498344  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  21498345 gagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggt 21498444  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcga 456  Q
    ||  ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21498445 ggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22348700 - 22348361
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||    
T  22348700 tggtcggaggtgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 22348601  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    ||||| || ||||| ||||||| ||| || |||||||| || || ||||| |||||  ||||||||||||  || || || || || ||  | |    
T  22348600 attcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaa--atcttgagtttcgggaaggagaccacgtatttttga 22348503  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||    
T  22348502 gagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggt 22348403  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22348402 ggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22348361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19770131 - 19769960
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  19770131 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 19770032  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcaga 399  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  19770031 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcaga 19769960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 21562232 - 21562339
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgc 115  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||| | |||||||||||||||| |||     
T  21562232 cagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgt 21562331  T
Q  116 ctggtgtg 123  Q
    ||||||||    
T  21562332 ctggtgtg 21562339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27610525 - 27610290
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  27610525 gagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 27610426  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  27610425 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 27610326  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  27610325 ccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgca 27610290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 41771013 - 41770778
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  41771013 gagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 41770914  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  41770913 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggctta 41770814  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  41770813 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 41770778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Original strand, 29476198 - 29476523
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||| |||||  || ||||    ||||| ||||    
T  29476198 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatga 29476297  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || || |||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  29476298 aggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 29476397  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
    || ||| |||||||| |||||||| | ||| |||||  | ||||||||||| || ||||||   |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  29476398 ggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacgaagttcattggtccatatcaggtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 29476497  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || || ||||||||||| |||||    
T  29476498 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 29476523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 20466302 - 20466414
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||| |||||||||||    
T  20466302 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttttggtgttactaa 20466401  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     || || ||||||    
T  20466402 tgcaccgggtgtg 20466414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 123
Target Start/End: Original strand, 21679005 - 21679093
Alignment:
Q  35 aggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21679005 aggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacggatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtg 21679093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23473410 - 23473298
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23473410 atcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 23473311  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  23473310 tgcgccaggtgtg 23473298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 377
Target Start/End: Original strand, 11210831 - 11211058
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||  | || || |||||||| || ||||| | | ||||   ||||||||||||||| || ||||    
T  11210831 tggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcaga 11210930  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||| | || || ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| | |||| |||| |||||||| ||    
T  11210931 gtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcg 11211030  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    ||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  11211031 tgctttgaagtgtaggaagttgactcct 11211058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27518578 - 27518343
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |  || ||  | || ||||    
T  27518578 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagacctcgtgtttttgagagtca 27518479  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  27518478 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 27518379  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  27518378 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 27518343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 500
Target Start/End: Original strand, 21665758 - 21665987
Alignment:
Q  270 gacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaat 369  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  21665758 gacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagt 21665857  T
Q  370 tgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 469  Q
    ||||| | | ||| |||||   ||||||||  || || |||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  21665858 tgacttcgaggtttattgg-ttgtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21665956  T
Q  470 gtttcatgtttctcagcttcagaagtatgta 500  Q
     ||||| || || || |||| ||| ||||||    
T  21665957 atttcaagtgtcgcaacttcggaaatatgta 21665987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 21937402 - 21937552
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||     
T  21937402 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagggtg 21937501  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  21937502 aatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 21937552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 446 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21625471 - 21625383
Alignment:
Q  446 acatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21625471 acatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactttgaaagtatgtagtggatccttcgcatgtgattccgagagatgatg 21625383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 21337497 - 21337609
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||  |||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21337497 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacgaa 21337596  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  21337597 tgcgccaggtgtg 21337609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22136851 - 22136743
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  22136851 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttactaa 22136752  T
Q  111 cgcgcctgg 119  Q
     || |||||    
T  22136751 tgcacctgg 22136743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 26736930 - 26737042
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26736930 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 26737029  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     || |||||||||    
T  26737030 tgcacctggtgtg 26737042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 265
Target Start/End: Original strand, 21831852 - 21831995
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||  | |||||  |||||||  | || || | |||     
T  21831852 tggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgagggtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacataaaaggttaagcta 21831951  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagtta 265  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21831952 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagtta 21831995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23503702 - 23503511
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||| || ||| || || || ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||  |||| || |||||||| || || || | | ||    
T  23503702 tggtcggaggtctaggacaccgttgtgttggtttgagtctggtgaaagtgctttgttaggaccggaagtggtgcaagagactacggaaaaggttaagatg 23503603  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    ||   ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  23503602 attcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaaattggtgatcatgt 23503511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24581365 - 24581215
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  |||||||     
T  24581365 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttgtaagggtg 24581266  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  24581265 aatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24581215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27520589 - 27520496
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  27520589 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 27520496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 301
Target Start/End: Original strand, 21339423 - 21339574
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| | |||||    
T  21339423 tggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcaga 21339522  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaaga 301  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  21339523 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaaga 21339574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18781297 - 18781189
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||||||||| || ||    
T  18781297 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 18781198  T
Q  111 cgcgcctgg 119  Q
    ||| |||||    
T  18781197 cgcacctgg 18781189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22350102 - 22350006
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  22350102 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 22350006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 37289699 - 37289795
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  37289699 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttttggtgttac 37289795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21409303 - 21409212
Alignment:
Q  25 gtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||    |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  21409303 gtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacataacgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgcc 21409212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27011238 - 27011088
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | || |||||||| ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  27011238 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 27011139  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | || | |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  27011138 aatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 27011088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 14997942 - 14998038
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  14997942 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 14998038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 22331090 - 22331186
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  22331090 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 22331186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27612537 - 27612441
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  27612537 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 27612441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 27683603 - 27683699
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  27683603 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 27683699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19772143 - 19772050
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  19772143 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 19772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 27666693 - 27666786
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||   ||||||||||||    
T  27666693 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttttgcctttcggtgt 27666786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 40710963 - 40710870
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  40710963 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 40710870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 29474276 - 29474372
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  29474276 atcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 29474372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 41773025 - 41772929
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  41773025 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 41772929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 3264721 - 3265137
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3264721 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 3264820  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  3264821 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 3264920  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  3264921 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 3265020  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3265021 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 3265120  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  3265121 ccgagggatgatgatgt 3265137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 11207158 - 11207574
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11207158 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 11207257  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  11207258 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 11207357  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  11207358 gagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 11207457  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  11207458 ggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgata 11207557  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  11207558 ccgagggatgatgatgt 11207574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 29453464 - 29453880
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29453464 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggacgggatttggttcatgagactactgagaaagtaaggttg 29453563  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  29453564 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 29453663  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  29453664 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 29453763  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29453764 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 29453863  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  29453864 ccgagggatgatgatgt 29453880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 44661793 - 44662205
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44661793 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 44661892  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  44661893 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 44661992  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44661993 gggttactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagt 44662092  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44662093 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 44662192  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  44662193 ccaagggatgatg 44662205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 33223263 - 33222851
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  33223263 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggttcatgaaactactgagaaagtcaagttg 33223164  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  33223163 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 33223064  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  33223063 gggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagagttggaacagt 33222964  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33222963 ggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgatt 33222864  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || | ||||||||    
T  33222863 ccaaaggatgatg 33222851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 126 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 20891323 - 20890918
Alignment:
Q  126 cggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataa 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20891323 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccgaatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataa 20891224  T
Q  226 gggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggt 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  20891223 gggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 20891124  T
Q  326 cactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20891123 cactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacagtggca 20891024  T
Q  426 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccga 525  Q
    ||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20891023 tatag-gatgggtttccaacacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaa 20890925  T
Q  526 gggatga 532  Q
    |||||||    
T  20890924 gggatga 20890918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 16146257 - 16145847
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  16146257 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggacagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaaggtg 16146158  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| || || |    
T  16146157 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctga 16146058  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16146057 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgt 16145958  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16145957 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 16145858  T
Q  522 ccgagggatga 532  Q
    ||||| |||||    
T  16145857 ccgagagatga 16145847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 1649204 - 1649616
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| | |     
T  1649204 tggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaagaaagtcaagata 1649303  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  1649304 atcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaa 1649403  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  1649404 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgt 1649503  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1649504 ggcatatagagttgggttgccacctcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctacggaagtatgtagcggatccttcacatgtaatt 1649603  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  1649604 ccaagggatgatg 1649616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 51606108 - 51606520
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  51606108 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 51606207  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  51606208 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataa 51606307  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||    
T  51606308 gagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggt 51606407  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  51606408 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttatt 51606507  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  51606508 ccgagagatgatg 51606520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 523
Target Start/End: Original strand, 15003291 - 15003692
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  15003291 tggtcggaagtggaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatg 15003390  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||| |||||||| ||  | |    
T  15003391 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttga 15003490  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||||||||||| ||    
T  15003491 gagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatccatatcagatatctgagagagttggaacagt 15003590  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15003591 ggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 15003690  T
Q  522 cc 523  Q
    ||    
T  15003691 cc 15003692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15246269 - 15245857
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||| || | | ||    
T  15246269 tggtcggaggtgcagaactcctttattctagtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacgaagaaggtaaagatg 15246170  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||   |||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  15246169 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttgagtttcaggagggagatcatgtatttctga 15246070  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || || ||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||| ||    
T  15246069 gagttacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagataacagagagggttggaacagt 15245970  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15245969 ggcatacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 15245870  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  15245869 ccgagagatgatg 15245857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15070730 - 15070346
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  15070730 tggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaga 15070631  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  15070630 gtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcg 15070531  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||  |||||||  | ||| |||||| | ||||| ||||| || || ||||  |  |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  15070530 tgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtccataccagatatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacat 15070431  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15070430 ctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgtgattccaagagatgatg 15070346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 418
Target Start/End: Original strand, 15359017 - 15359313
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| || | | ||    
T  15359017 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatg 15359116  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  15359117 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttccga 15359216  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaac 418  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15359217 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatcagagagggttggaac 15359313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 265 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 42703105 - 42702836
Alignment:
Q  265 accatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgag 364  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  42703105 accatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgag 42703006  T
Q  365 gaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcat 464  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42703005 aaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcat 42702906  T
Q  465 gatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  42702905 gatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 42702836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27900731 - 27900459
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  27900731 tggtcggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 27900632  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  27900631 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 27900532  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgta 394  Q
    |||| |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27900531 gggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgta 27900459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 11205253 - 11205365
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11205253 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 11205352  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||||    
T  11205353 cgcgcctggtgtg 11205365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 3262815 - 3262926
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3262815 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 3262914  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  3262915 tgcgcctggtgt 3262926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 29451558 - 29451669
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29451558 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 29451657  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  29451658 tgcgcctggtgt 29451669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 44659887 - 44659998
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44659887 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 44659986  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||||    
T  44659987 cgcgcctggtgt 44659998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14159809 - 14159425
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||  | |||||  |||||||||| || || | | ||||    |||||||||||||| |||||||    
T  14159809 tggtttgagtcaggtgagaatgtggttttgggaccggagattgttcaacagactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcaga 14159710  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| ||||| || || |||||  |||| |||||||||||    
T  14159709 gtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaaggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacg 14159610  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||    
T  14159609 tgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcat 14159510  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||  | |||| |||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  14159509 ctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcggaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgatg 14159425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Original strand, 16252128 - 16252510
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  |  ||||  ||||||||||||| || | | ||||    ||||| || |    
T  16252128 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattcttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaataa 16252227  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||| | ||||    
T  16252228 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgac 16252327  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  16252328 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 16252427  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16252428 ttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgat 16252510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7090671 - 7090380
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  7090671 gagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 7090572  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||| | || |||||||| | ||| |||||||| |  || |||| | |||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  7090571 ctcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg-ctcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 7090473  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
      |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7090472 ccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 7090380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14652625 - 14652253
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  14652625 tggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcaga 14652526  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||  | || ||||||| | |||| |||||||||||    
T  14652525 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacg 14652426  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||| |||    
T  14652425 tgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcat 14652326  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| | || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  14652325 ctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattc 14652253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12524005 - 12523623
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  12524005 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggttttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 12523906  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  12523905 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 12523806  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  12523805 tggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttgga 12523706  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12523705 ttaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12523623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16752877 - 16752665
Alignment:
Q  183 ccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaa 282  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16752877 ccagatttggttcatcaaacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaa 16752778  T
Q  283 aggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagtt 382  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  16752777 aggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagtt 16752678  T
Q  383 cattggcccgtat 395  Q
    |||||| ||||||    
T  16752677 cattggtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 518
Target Start/End: Original strand, 14851067 - 14851429
Alignment:
Q  156 gagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtc 255  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | |||| |||||| || | | |||||   |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14851067 gagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgac 14851166  T
Q  256 agaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcctt 355  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||||| | |||| |||||||||||||| ||    
T  14851167 aaaagagttatcatgataagcgtaggaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgaccggtgttggacgtgcatt 14851266  T
Q  356 gaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcg 455  Q
    |||||| | ||| || ||||| | ||| ||||| ||||||||||  |  || ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14851267 gaagtcaaagaagttaactccgaggtttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcg 14851366  T
Q  456 aacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtg 518  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||  ||| |||||||||  ||||||| || ||||||    
T  14851367 aatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaaattcggaagtatgttccggatccatctcatgtg 14851429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 15357143 - 15357253
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  15357143 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15357242  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  15357243 cgcctggtgtg 15357253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 499
Target Start/End: Original strand, 15149779 - 15150050
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  15149779 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 15149878  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||  |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||| | ||    
T  15149879 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgta 15149978  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    | |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||    
T  15149979 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 15150050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16149957 - 16149850
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || |    
T  16149957 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcac 16149858  T
Q  116 ctggtgtg 123  Q
    ||||||||    
T  16149857 ctggtgtg 16149850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16154103 - 16153996
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || |    
T  16154103 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcac 16154004  T
Q  116 ctggtgtg 123  Q
    ||||||||    
T  16154003 ctggtgtg 16153996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 1647300 - 1647410
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  1647300 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 1647399  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  1647400 cgcctggtgtg 1647410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15258177 - 15258067
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  15258177 catcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15258078  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  15258077 cgcctggtgtg 15258067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27902635 - 27902529
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  27902635 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaag 27902536  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  27902535 cgcctgg 27902529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 16355140 - 16355524
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  16355140 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 16355239  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || || | ||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||  | || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16355240 gtcgacaaaataattatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 16355339  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  16355340 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 16355439  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  16355440 ctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 16355524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 339 - 478
Target Start/End: Original strand, 18164333 - 18164472
Alignment:
Q  339 ggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 438  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| | |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  18164333 ggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtt 18164432  T
Q  439 tgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18164433 tgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 18164472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14680884 - 14680514
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  |||||||    
T  14680884 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcaga 14680785  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  | || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  14680784 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 14680685  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| |  || ||||| || |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  14680684 tgcattgaagtcaaataagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 14680585  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  14680584 ctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14680514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Original strand, 18227129 - 18227511
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  |||||||| ||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  18227129 actccgttgtgctggttttagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagaagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 18227228  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  18227229 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagaatcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgac 18227328  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  18227329 tggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtggga 18227428  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  18227429 ttaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 18227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 51604815 - 51604925
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51604815 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 51604914  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  51604915 cgcccggtgtg 51604925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Original strand, 14303661 - 14303985
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||||||||||||  || ||||    ||||| ||||    
T  14303661 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatga 14303760  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  14303761 aggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 14303860  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  14303861 cggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 14303959  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || || ||||||||||| |||||    
T  14303960 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 14303985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15319645 - 15319516
Alignment:
Q  405 gagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcgg 504  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  15319645 gagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccagcacatctttcaaatctgcatgatgtgtttcctgtgtcacaacttcagaagtatgtagcgg 15319546  T
Q  505 atccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15319545 atccttcgcatgttattccgagagatgatg 15319516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 15001388 - 15001498
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || || |||| ||||||||||| |||||| |    
T  15001388 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgatactaatg 15001487  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||| ||||    
T  15001488 cgcctgttgtg 15001498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15077952 - 15077824
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  15077952 tggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaga 15077853  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcga 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15077852 gtcgacagaagagttaccatgacaagcga 15077824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 19778566 - 19778801
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  19778566 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 19778665  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  19778666 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 19778765  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19778766 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 19778801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 29039177 - 29039412
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  29039177 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 29039276  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  29039277 ctcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 29039376  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29039377 ccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 29039412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 363
Target Start/End: Original strand, 15414953 - 15415194
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||  | |||||  ||||||| || || ||||   ||    
T  15414953 tggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacggaaaaggtcaaattg 15415052  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||  | |    
T  15415053 ataagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttga 15415152  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcga 363  Q
    | ||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  15415153 gagtcactcttgtgataggtgttggtcgtgccttgaaatcga 15415194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 426 - 523
Target Start/End: Original strand, 15415210 - 15415307
Alignment:
Q  426 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15415210 tatagagtgggtttgccaccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcc 15415307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 23955986 - 23955697
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  23955986 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 23955887  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  23955886 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 23955787  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  23955786 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 23955697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 522
Target Start/End: Original strand, 14266582 - 14266966
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| ||   | ||||  | ||||| ||||    
T  14266582 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctgagagaaaatga 14266681  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||  | || ||||| ||| ||||    
T  14266682 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgac 14266781  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||  ||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  14266782 tggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 14266881  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    || || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  14266882 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtaattc 14266966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12476839 - 12476604
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  12476839 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 12476740  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  12476739 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 12476640  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  12476639 ccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 12476604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18297444 - 18297209
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  18297444 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 18297345  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  18297344 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 18297245  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  18297244 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 18297209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 27711575 - 27711281
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  27711575 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 27711476  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  27711475 ctcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 27711376  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||  | || || ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  27711375 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 27711281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8386651 - 8386416
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  8386651 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 8386552  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  8386551 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 8386452  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  8386451 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 8386416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15072608 - 15072498
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  15072608 catcaaattaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15072509  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  15072508 cgcctggtgtg 15072498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 520
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927324
Alignment:
Q  347 acgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacca 446  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||     
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  447 catctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14927324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 40473279 - 40472990
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  40473279 gagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtca 40473180  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||  |  || |||||||||||  |||| ||    
T  40473179 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggctta 40473080  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  40473079 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 40472990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16218481 - 16218385
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||||||||    
T  16218481 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttac 16218385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16221801 - 16221705
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||||||||||    
T  16221801 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttac 16221705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 399
Target Start/End: Original strand, 8053396 - 8053567
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||  |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  8053396 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaagagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 8053495  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcaga 399  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  8053496 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcaga 8053567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 15364529 - 15364390
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||    
T  15364529 gtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtgg 15364430  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    | ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  15364429 cttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15364390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8708160 - 8708058
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8708160 catcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacg 8708061  T
Q  113 cgc 115  Q
    |||    
T  8708060 cgc 8708058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Original strand, 14849147 - 14849239
Alignment:
Q  31 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  14849147 gatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtg 14849239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23443356 - 23443245
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||    
T  23443356 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggt-ttacgaa 23443258  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  23443257 tgcgccaggtgtg 23443245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Original strand, 55375392 - 55375476
Alignment:
Q  229 agaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  55375392 agaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 55375476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8706263 - 8706108
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||  ||||||  || ||||| | |||     
T  8706263 tggtcggaggtgcagaacttcgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactatagaaaaagttaagcta 8706164  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcg 277  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| || ||||||||    
T  8706163 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcg 8706108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 534
Target Start/End: Original strand, 15359326 - 15359396
Alignment:
Q  464 tgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  15359326 tgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 15359396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 16445244 - 16445394
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  16445244 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtg 16445343  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || || || ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  16445344 aatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16445394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 8051384 - 8051477
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  8051384 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 8051477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14696356 - 14696252
Alignment:
Q  19 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctg 118  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||   ||||| |||||| |||||||| || ||||| |    
T  14696356 attaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccag 14696257  T
Q  119 gtgtg 123  Q
    |||||    
T  14696256 gtgtg 14696252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Original strand, 16676447 - 16676546
Alignment:
Q  199 agactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 298  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  16676447 agactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 16676546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9291075 - 9290925
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  |||||||| || ||  | |||||     
T  9291075 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcaggtatttttgagggtg 9290976  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| | |||||| | ||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  9290975 aatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcct 9290925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14997552 - 14997406
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| | ||    
T  14997552 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 14997453  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
     | |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  14997452 ttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13247884 - 13247799
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  13247884 gagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgt 13247799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 18225207 - 18225300
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  18225207 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 18225300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27713587 - 27713494
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  27713587 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 27713494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12478851 - 12478755
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  12478851 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 12478755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 16234753 - 16234849
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  16234753 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 16234849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 16353268 - 16353364
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | |||||| ||||||||    
T  16353268 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttttggtgttac 16353364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 19776554 - 19776650
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  19776554 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 19776650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23957998 - 23957902
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  23957998 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 23957902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 15145652 - 15145742
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||||||||||||    
T  15145652 agattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttac 15145742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Original strand, 15293189 - 15293275
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||  | || |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  15293189 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 15293275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8388663 - 8388570
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  8388663 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 8388570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 17092910 - 17093003
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  17092910 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 17093003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 360
Target Start/End: Original strand, 12132442 - 12132574
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||||||||| || || || ||| | ||||||||||  ||||| ||| | || |||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| |    
T  12132442 gagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 12132541  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagt 360  Q
     || | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  12132542 atcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 14301740 - 14301836
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  14301740 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 14301836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40475291 - 40475195
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  40475291 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 40475195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6679522 - 6679106
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6679522 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 6679423  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  6679422 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 6679323  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  6679322 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 6679223  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6679222 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 6679123  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  6679122 ccgagggatgatgatgt 6679106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12305169 - 12304757
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12305169 tggtcggaggtgtaggacccctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgctgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 12305070  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  12305069 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctta 12304970  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  12304969 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacagt 12304870  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12304869 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgatt 12304770  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  12304769 ccaagggatgatg 12304757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 804043 - 804459
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  804043 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactactaagaaagtcaggttg 804142  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  804143 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 804242  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||    
T  804243 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagt 804342  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  804343 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 804442  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  804443 ccgagggatgatgatgt 804459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14565553 - 14565137
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14565553 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttggttcacgagactactgagaaagtcaggttg 14565454  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  14565453 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 14565354  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  14565353 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagt 14565254  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14565253 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatttgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 14565154  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  14565153 ccgagggatgatgatgt 14565137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6604069 - 6603653
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6604069 tggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 6603970  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  6603969 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 6603870  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| || ||    
T  6603869 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaaatttcagagagaattggtacagt 6603770  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6603769 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 6603670  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  6603669 ccgagggatgatgatgt 6603653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 29303796 - 29304208
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29303796 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcagaatg 29303895  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  29303896 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 29303995  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  29303996 gggtcactccaatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaacagt 29304095  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29304096 ggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttaggaagtatgtagaggatccttcacatgtgatt 29304195  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  29304196 cctagggatgatg 29304208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 22061803 - 22062215
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  22061803 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 22061902  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || ||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  22061903 atcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctga 22062002  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  22062003 gggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaaatatcagagagggttggaactgt 22062102  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22062103 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 22062202  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  22062203 ccgagagatgatg 22062215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 31416844 - 31417256
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||| |||||||||||||||||| | ||    
T  31416844 tggtcggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttagtgcatcagactactgagaaagtcaagatg 31416943  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  31416944 ataagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 31417043  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||| ||    
T  31417044 gagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtattagatttcagaaagggttggaacagt 31417143  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31417144 ggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactacggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 31417243  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  31417244 ccaagagatgatg 31417256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 255 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28982635 - 28982352
Alignment:
Q  255 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28982635 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgcct 28982536  T
Q  355 tgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28982535 tgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 28982436  T
Q  455 gaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatgatgt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28982435 gaacttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 28982352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 255 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28987855 - 28987572
Alignment:
Q  255 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28987855 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgcct 28987756  T
Q  355 tgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 454  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28987755 tgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 28987656  T
Q  455 gaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatgatgt 538  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28987655 gaacttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 28987572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 146 - 534
Target Start/End: Original strand, 21324803 - 21325192
Alignment:
Q  146 atgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcg 245  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| | |||    
T  21324803 atgctggtttgagtcaggagatagtgtggtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcg 21324902  T
Q  246 cagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttg 345  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||| |    
T  21324903 cagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtag 21325002  T
Q  346 gacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacc 445  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21325003 gacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccacc 21325102  T
Q  446 acatc-tttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21325103 acatcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 21325192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1266649 - 1266238
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| || ||  ||    
T  1266649 tggtcagaggtgcaggactcctttgtgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtaaga-tg 1266551  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  1266550 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 1266451  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  1266450 gagttactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 1266351  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  1266350 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaacggatccttcgcatgttatt 1266251  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  1266250 ccaagagatgatg 1266238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Original strand, 21681856 - 21682252
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  21681856 actcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatga 21681955  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||| ||||    
T  21681956 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgac 21682055  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21682056 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggt 21682155  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21682156 ttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgaaacggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 21682252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23655338 - 23654926
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  23655338 tggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatg 23655239  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||| | || || |    
T  23655238 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagacggagatcatttgtttctga 23655139  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| ||    
T  23655138 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggtttgaacagt 23655039  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    || ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23655038 ggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 23654939  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  23654938 ccgagagatgatg 23654926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 261 - 534
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265400
Alignment:
Q  261 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  361 cgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 460  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  461 gcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16265327 gcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcaaagggatgatg 16265400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 31571212 - 31571624
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  31571212 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 31571311  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  31571312 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctga 31571411  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||    
T  31571412 gagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacggt 31571511  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  31571512 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttatt 31571611  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  31571612 ccgagagatgatg 31571624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 20008261 - 20007857
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || | | ||    
T  20008261 tggtcggaggtgcatgactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatg 20008162  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| |||||||| || || |    
T  20008161 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttccaagagggagatcatgtgtttctga 20008062  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |  ||  ||||||| ||||||||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  20008061 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagt 20007962  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  20007961 ggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttata 20007862  T
Q  522 ccgag 526  Q
    |||||    
T  20007861 ccgag 20007857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 526
Target Start/End: Original strand, 20010270 - 20010674
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||| |||  | ||    
T  20010270 tggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgttgttgggaccagatttagttcatcagactatagagaaggtccagatg 20010369  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  20010370 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 20010469  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  20010470 gagtcactccgatgacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagt 20010569  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20010570 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 20010669  T
Q  522 ccgag 526  Q
    |||||    
T  20010670 ccgag 20010674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19851822 - 19851410
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||  |||| |||| | ||    
T  19851822 tggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatg 19851723  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  19851722 ataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 19851623  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  19851622 gagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagt 19851523  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  19851522 ggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgttatt 19851423  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  19851422 ccaagagatgatg 19851410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19857858 - 19857446
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||  |||| |||| | ||    
T  19857858 tggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatg 19857759  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  19857758 ataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 19857659  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  19857658 gagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagt 19857559  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  19857558 ggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgttatt 19857459  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  19857458 ccaagagatgatg 19857446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 324 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27347435 - 27347221
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  27347435 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtgg 27347336  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27347335 catataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcc 27347236  T
Q  524 gagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||    
T  27347235 gagggatgatgatgt 27347221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21840828 - 21840416
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  21840828 tggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatg 21840729  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  21840728 ataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctaa 21840629  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| | || ||||| ||| ||||  ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  21840628 gagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagt 21840529  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21840528 ggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtattccacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 21840429  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  21840428 ccgagagatgatg 21840416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 122 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22051274 - 22051008
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| | ||    
T  22051274 tggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcaacagacgacagagaaggtcaagatg 22051175  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  22051174 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttga 22051075  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattgg 388  Q
      || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22051074 aagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccgaagttcattgg 22051008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 266
Target Start/End: Original strand, 16271594 - 16271738
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16271594 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgcgtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaggttg 16271693  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttac 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16271694 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaggagttac 16271738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15533763 - 15533393
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |   |||||   |||||||||||||| |||||||    
T  15533763 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcaga 15533664  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||  | || ||||||||| || | |||||||||||    
T  15533663 gtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacg 15533564  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  15533563 tgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 15533464  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  15533463 ctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgat 15533393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19978350 - 19977980
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    |||||||||||||| |||||||    
T  19978350 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcaga 19978251  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  19978250 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 19978151  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || | ||||||||| ||||| ||  |||| || || ||||| |||    
T  19978150 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcat 19978051  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19978050 cttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 19977980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20388482 - 20388109
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| |||  | |||||| |||||||  | || ||||   ||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  20388482 tggtttgagtcgggttaaaatgtagtgttgggacgagatatagttcatcagactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcgtaga 20388383  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || || |||||||   |||| |||||||| ||    
T  20388382 gtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactctagtgacaggtgttggtcg 20388283  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| ||   ||| ||||| || ||| |||  || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20388282 tgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacatatagagtgggtttgccaccacat 20388183  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||| || ||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20388182 ctttcgaatgtgcatgatgtgtttaatgtgtcgcaatttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattcc 20388109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Original strand, 21167013 - 21167319
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  21167013 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 21167112  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  21167113 ctcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgta 21167212  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  || |||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  21167213 tcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcgaaaatatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 21167312  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  21167313 gatgatg 21167319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 16269688 - 16269800
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16269688 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 16269787  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
    || ||||||||||    
T  16269788 cgggcctggtgtg 16269800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4984359 - 4984248
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4984359 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgtaactaa 4984260  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  4984259 agcgcctggtgt 4984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23650424 - 23650054
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    |||||||| ||||| |||||||    
T  23650424 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcaga 23650325  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||  | ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  23650324 gtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacg 23650225  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||    
T  23650224 tgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcat 23650125  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  23650124 ctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgttgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgat 23650054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6605975 - 6605864
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6605975 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 6605876  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  6605875 tgcgcctggtgt 6605864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28983228 - 28983117
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28983228 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28983129  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  28983128 tgcgcctggtgt 28983117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28988447 - 28988336
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28988447 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28988348  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  28988347 tgcgcctggtgt 28988336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 21323745 - 21323855
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  21323745 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctttcggtgttactaatg 21323844  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  21323845 cgcctggtgtg 21323855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 31569308 - 31569418
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31569308 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 31569407  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  31569408 cgcccggtgtg 31569418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27356850 - 27356741
Alignment:
Q  14 atcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgc 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  27356850 atcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgc 27356751  T
Q  114 gcctggtgtg 123  Q
    ||||||||||    
T  27356750 gcctggtgtg 27356741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 232 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21251243 - 21250955
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | || || || || ||  | || ||||||||    
T  21251243 agatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcc 21251144  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatataga 431  Q
    | |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  21251143 tgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcga 21251044  T
Q  432 gttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  21251043 gtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccagatccatcccatgtgat 21250955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32600449 - 32600157
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  32600449 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 32600350  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  32600349 ctcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 32600250  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| || || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  32600249 tcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatctatctcatgtgat 32600157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Original strand, 20396495 - 20396905
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||    
T  20396495 tggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggcgagagtgtagttttgggactagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttg 20396594  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||  | || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||  | |    
T  20396595 atgcgagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttta 20396694  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaag-ttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactg 420  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||  ||||| ||| ||| ||  |    
T  20396695 gagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgact-ctaagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattgaaatag 20396793  T
Q  421 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |  || |||| ||||| |||  ||||||| || ||||||||    
T  20396794 tggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaacttcggaagtgtgtttcggatccatctcatgtgat 20396893  T
Q  521 tccgagggatga 532  Q
    ||| || |||||    
T  20396894 tccaagagatga 20396905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14567446 - 14567348
Alignment:
Q  24 ggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgt 122  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14567446 ggtgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgt 14567348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22053178 - 22053068
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |    
T  22053178 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctttcggtgttactaatg 22053079  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  22053078 cgcctggtgtg 22053068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 31414935 - 31415041
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  31414935 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31415034  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  31415035 cgcctgg 31415041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23657242 - 23657136
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  23657242 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 23657143  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  23657142 cgcctgg 23657136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19984495 - 19984386
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||||||      
T  19984495 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatt 19984396  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  19984395 cgcctggtgt 19984386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 20008387 - 20008497
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  20008387 catcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 20008486  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  20008487 cgcctggtgtg 20008497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22046768 - 22046386
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  22046768 actccgttgtgctggtttgaatcaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 22046669  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||  ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||| | || || || || || ||  | || ||||||||  ||||    
T  22046668 aagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgcaggaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgac 22046569  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||  |||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  22046568 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgaggtttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtagga 22046469  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22046468 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 22046386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 21922214 - 21922503
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||  ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  21922214 aagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 21922313  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | |||| ||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||| |  |  ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  |    
T  21922314 atgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccgagatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 21922413  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  21922414 agtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgat 21922503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 520
Target Start/End: Original strand, 30313591 - 30313912
Alignment:
Q  199 agactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 298  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  30313591 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 30313690  T
Q  299 agagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcag 398  Q
     || || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| |||||||||    
T  30313691 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 30313790  T
Q  399 acttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatg 498  Q
    |  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||| ||||||||    
T  30313791 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 30313890  T
Q  499 tagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  30313891 ttccggatccatctcatgtgat 30313912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 21394341 - 21394633
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  21394341 gagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 21394440  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||    
T  21394441 ctcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgta 21394540  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
      |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21394541 ccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 21394633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 21788834 - 21789126
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  21788834 gagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 21788933  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||    
T  21788934 ctcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgta 21789033  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
      |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21789034 ccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 21789126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19861750 - 19861640
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||| |||||||||||||| |    
T  19861750 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatg 19861651  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19861650 cgcctggtgtg 19861640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21927743 - 21927633
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || || |||| ||||||| |||||||||| |    
T  21927743 catcagattaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 21927644  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  21927643 cgcctggtgtg 21927633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 22061145 - 22061247
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  22061145 catcagattaaggtgaaggatgaggaaatgcagaagaaggcctttaggacacgatatggtcattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 22061244  T
Q  113 cgc 115  Q
    |||    
T  22061245 cgc 22061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22987506 - 22987214
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || ||||    
T  22987506 gagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagtca 22987407  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||  |||| | |||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||| ||||||| ||||| ||    
T  22987406 ctccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctgaagtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcgta 22987307  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22987306 tcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaatacatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 22987214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 16408443 - 16408827
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  |||||||    
T  16408443 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcaga 16408542  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||| ||||| || || || || ||  | || ||||||| | |||| |||||||||||    
T  16408543 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagttccaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgactggtgttggacg 16408642  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  16408643 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 16408742  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| ||||| |||  ||||||  || |||||||| | ||| |||||||    
T  16408743 ctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtgtgtcccggatctatctcatgtgatccagagtgatgatg 16408827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22032337 - 22032045
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||| | || || || || || ||  | || ||||    
T  22032337 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagtca 22032238  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||   ||||||||  || || ||||||| |||  |||| ||    
T  22032237 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcgta 22032138  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22032137 tcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgtttcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 22032045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 22164667 - 22164959
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||   ||| ||  | |  ||||    
T  22164667 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgaaagtca 22164766  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| |||||  |    
T  22164767 ctcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgca 22164866  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22164867 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtcccggatccatcacatgtgat 22164959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 17674499 - 17674734
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  17674499 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 17674598  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  17674599 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 17674698  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17674699 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 17674734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19112995 - 19112760
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  19112995 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 19112896  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  19112895 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggctta 19112796  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19112795 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 19112760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23887345 - 23887240
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  23887345 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaa 23887246  T
Q  111 cgcgcc 116  Q
     |||||    
T  23887245 tgcgcc 23887240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 454
Target Start/End: Original strand, 22120560 - 22120876
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| || || || || ||| ||||  | |||||  ||||||||||||||||  || ||||    ||||| ||||    
T  22120560 actccgttgtgctggtttgagtgaggtgaaagagtggtcttaggatcagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatga 22120659  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  22120660 aggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgac 22120759  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  22120760 tggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 22120859  T
Q  438 ttgccaccacatctttc 454  Q
    || ||||| ||||||||    
T  22120860 ttaccaccgcatctttc 22120876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 22133517 - 22133809
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| || || ||   ||| ||  | || | ||    
T  22133517 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgagagaca 22133616  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  22133617 ctcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 22133716  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||| |||||||||  || |||| || ||||||||    
T  22133717 tcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtcccgaatccatcacatgtgat 22133809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 522
Target Start/End: Original strand, 19485346 - 19485640
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | || ||||    
T  19485346 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 19485445  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||| || ||||| ||    
T  19485446 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggctta 19485545  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  19485546 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 19485640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 20018226 - 20018518
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | || ||||    
T  20018226 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 20018325  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||     || ||||||||||| ||||| ||    
T  20018326 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggctta 20018425  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||  | || || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20018426 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 20018518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20390401 - 20390293
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  20390401 catcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatg 20390302  T
Q  113 cgcctggtg 121  Q
     ||||||||    
T  20390301 tgcctggtg 20390293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 376
Target Start/End: Original strand, 22377932 - 22378077
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||| |||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||||||    
T  22377932 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactc 22378031  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcc 376  Q
    |  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  22378032 cagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcc 22378077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 376
Target Start/End: Original strand, 22384107 - 22384252
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||| |||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||||||    
T  22384107 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactc 22384206  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcc 376  Q
    |  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  22384207 cagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcc 22384252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23949330 - 23949158
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |  | |||||||||||||| | | ||    
T  23949330 tggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaatcgtt-agcaaactactgagaaagttaagatg 23949232  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtt 295  Q
    ||    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  23949231 atccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15441390 - 15441194
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||    
T  15441390 gtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 15441291  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | ||| | ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||  ||||||||   |||||| || ||||||||    
T  15441290 cgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaagtatgttttggatccatctcatgtgat 15441194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 182
Target Start/End: Original strand, 20976021 - 20976081
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttggga 182  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20976021 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttggga 20976081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 22246897 - 22247009
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22246897 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22246996  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  22246997 tgcgccaggtgtg 22247009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23949154 - 23948888
Alignment:
Q  268 atgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaa 367  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||| || | |||    
T  23949154 atgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaatcaaagaa 23949055  T
Q  368 attgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgat 467  Q
     |||||||| | |||  |||| ||||||||||  ||||| ||| || | || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||    
T  23949054 gttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaattttcacgat 23948955  T
Q  468 gtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||| || || |||  |||||||||  ||||||  || |||||||| || || |||||||    
T  23948954 gtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatcagtctcatgtgatcccaagagatgatg 23948888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 29301896 - 29301986
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  29301896 agattaaggtgaaagatgagaatatgcagaagacggcattcagaacacgttatgggcattatgagtataaggtgatgccttttggtgttac 29301986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22522863 - 22522758
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22522863 atcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22522764  T
Q  111 cgcgcc 116  Q
     |||||    
T  22522763 tgcgcc 22522758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 19482528 - 19482621
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  19482528 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgt 19482621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 20016727 - 20016820
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  20016727 atcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 20016820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 20394597 - 20394666
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 80  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  20394597 atcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacga 20394666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18858894 - 18858798
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  18858894 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 18858798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 22375917 - 22376005
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttc 99  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||    
T  22375917 atcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttc 22376005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 22422356 - 22422468
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || |||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22422356 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 22422455  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  22422456 tgcgccaggtgtg 22422468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Original strand, 20652809 - 20652958
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| | ||| | ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||  | || || |    
T  20652809 gagaagatgaaagcgtctcagagtggacagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagagtga 20652908  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
     || | |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  20652909 atcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 20652958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21253261 - 21253165
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21253261 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 21253165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 21920212 - 21920308
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||| | | |||||||||||    
T  21920212 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgtcgttcggtgttac 21920308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23652358 - 23652246
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  23652358 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaa 23652259  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     || |||||||||    
T  23652258 tgcacctggtgtg 23652246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 16877465 - 16877720
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  16877465 tggtcggaggtgcaggacaccgttatgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 16877564  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| |||||||||| |  || |||||||| ||| | |    
T  16877565 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttga 16877664  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||  |||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  16877665 gggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16877720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 30311608 - 30311701
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  30311608 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 30311701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 32602462 - 32602369
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  32602462 atcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 32602369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 377
Target Start/End: Original strand, 21850816 - 21850962
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||| | |  |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| | ||    
T  21850816 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 21850915  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    || |||| |||||||| ||||  |||||||  ||||| |||||||||    
T  21850916 ctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcct 21850962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 17672487 - 17672580
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  17672487 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 17672580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Original strand, 21196978 - 21197063
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  21196978 gagaaaatgaaagcgtctcagagttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatcatgt 21197063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 19864557 - 19864653
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || ||  |||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  19864557 atcaccagattaaagtaaaatatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtagaaagttatgcctttcggtgttac 19864653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 21165002 - 21165098
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| | |||||||||||||||    
T  21165002 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttac 21165098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 11306177 - 11306593
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11306177 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttg 11306276  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  11306277 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 11306376  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  11306377 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 11306476  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11306477 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 11306576  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  11306577 ccgagggatgatgatgt 11306593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 8212042 - 8212458
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8212042 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 8212141  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  8212142 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 8212241  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  8212242 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 8212341  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8212342 ggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcaacttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtaatt 8212441  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8212442 ccgagggacgatgatgt 8212458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 49152636 - 49152220
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  49152636 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttg 49152537  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  49152536 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 49152437  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  49152436 gggtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 49152337  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49152336 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 49152237  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    ||||| |||||||||||    
T  49152236 ccgagagatgatgatgt 49152220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12456037 - 12455626
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  12456037 tggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggtacatgagactactgagaaagtcaaggtg 12455938  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  12455937 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 12455838  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  12455837 gggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatcagatttcagagagagttagaacagt 12455738  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12455737 ggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgatt 12455639  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  12455638 ccaagggatgatg 12455626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 122 - 507
Target Start/End: Original strand, 16950385 - 16950770
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  16950385 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggacaggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatg 16950484  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  16950485 ataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 16950584  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  16950585 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagggttggaacagt 16950684  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatc 507  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  16950685 ggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatc 16950770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 6413846 - 6413434
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  6413846 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtctggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatg 6413747  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  6413746 ataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctga 6413647  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  6413646 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttcgaatcagatttcagagagggttggaacagt 6413547  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  6413546 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagtggatccttcgcatgttatt 6413447  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  6413446 ccgagagatgatg 6413434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13021692 - 13021280
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  13021692 tggtcggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaggaaagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaagatg 13021593  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  13021592 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttcaagacggtgatcatgtttttctga 13021493  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  13021492 gggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 13021393  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13021392 ggcttatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatctttcacatgtgatt 13021293  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  13021292 ccaagagatgatg 13021280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 26118519 - 26118910
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26118519 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 26118618  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  26118619 ataagagaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 26118718  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||             
T  26118719 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagatagagt--------- 26118809  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
                |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26118810 ------------tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 26118897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 1321 - 1733
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  1321 tggtcagaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaggtcaagatg 1420  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  1421 ataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttgtga 1520  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
      || ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| || ||| || ||||||||  |    
T  1521 aagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttaagaaagggttggaacact 1620  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  1621 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagcttcggaaggatgtagcagatcattcgcatgttatt 1720  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||| ||||||    
T  1721 ccaaggaatgatg 1733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14130208 - 14129796
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||| | ||    
T  14130208 tggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatg 14130109  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |    
T  14130108 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttta 14130009  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||  |    
T  14130008 gagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgat 14129909  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14129908 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 14129809  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  14129808 ccgagagatgatg 14129796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14434026 - 14433614
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||| | ||    
T  14434026 tggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatg 14433927  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |    
T  14433926 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttta 14433827  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||  |    
T  14433826 gagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgat 14433727  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14433726 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 14433627  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  14433626 ccgagagatgatg 14433614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 137 - 534
Target Start/End: Original strand, 18053882 - 18054279
Alignment:
Q  137 gactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatg 236  Q
    |||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | |||| || |||||||||    
T  18053882 gactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagagttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatg 18053981  T
Q  237 aaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttga 336  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||  |||    
T  18053982 aaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatga 18054081  T
Q  337 cgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttgg 436  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  18054082 cgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttgg 18054181  T
Q  437 tttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  18054182 cttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 18054279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 14264158 - 14264570
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||  |||| |||| | ||    
T  14264158 tggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccgtatttggttcatcagactacgaagaatgtcaagatg 14264257  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  14264258 ataagcgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 14264357  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || || || |||||||| ||    
T  14264358 gagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagt 14264457  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14264458 ggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcctgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 14264557  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  14264558 ccgagagatgatg 14264570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 14286290 - 14286702
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||| | ||    
T  14286290 tggtcggaggtgcaggactcctttgtgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatg 14286389  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |    
T  14286390 ataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttga 14286489  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||| | ||  ||||||| ||    
T  14286490 gagttactccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcatataggattggaacagt 14286589  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  14286590 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttatt 14286689  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  14286690 ccaagagatgatg 14286702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 23199685 - 23200069
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  23199685 tggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcacaga 23199784  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||| |||||    
T  23199785 gtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacg 23199884  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||  | |||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23199885 tgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacat 23199984  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23199985 ctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 23200069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 23505812 - 23506196
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  23505812 tggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcacaga 23505911  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||| |||||    
T  23505912 gtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacg 23506011  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||  | |||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23506012 tgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacat 23506111  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23506112 ctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 23506196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 15102517 - 15102927
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  15102517 tggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcaggagagagtgttgt--tgggaccggatttgattcatcagactacagagaaagtcaagatg 15102614  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || || |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  | |    
T  15102615 ataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttga 15102714  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  15102715 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 15102814  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15102815 ggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 15102914  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  15102915 ccgagagatgatg 15102927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 19147546 - 19147146
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  19147546 tggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatg 19147447  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  19147446 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 19147347  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  19147346 gagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagt 19147247  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19147246 ggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgttatt 19147147  T
Q  522 c 522  Q
    |    
T  19147146 c 19147146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20746945 - 20746545
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  20746945 tggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatg 20746846  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  20746845 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 20746746  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  20746745 gagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagt 20746646  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20746645 ggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgttatt 20746546  T
Q  522 c 522  Q
    |    
T  20746545 c 20746545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 138 - 517
Target Start/End: Original strand, 16072224 - 16072603
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||| |||| | ||||||| || |||||||    
T  16072224 actcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcgtcagactatggagaaggtcaagatgataagagaaaagatga 16072323  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||| ||||    
T  16072324 aagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgac 16072423  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |||||||  | ||| |||    
T  16072424 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagtgggt 16072523  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16072524 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 16072603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13665872 - 13665476
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||           ||||| | ||||| |||||||||| | ||    
T  13665872 tggtcggaggggcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagttttgtgttggg-----------ttcatcaaactacagagaaagtcaagatg 13665784  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||  |||||||| || || |    
T  13665783 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtatttctga 13665684  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| || || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||     |||||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  13665683 gagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----ccgtatcagatttcagaaagggttggaacagt 13665589  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13665588 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 13665489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 220 - 534
Target Start/End: Original strand, 26288049 - 26288362
Alignment:
Q  220 tgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcct 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26288049 tgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttct 26288147  T
Q  320 aagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaact 419  Q
     ||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||| || ||| ||||     
T  26288148 gagggttactcctatgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaaca 26288247  T
Q  420 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  26288248 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgaaaatatgtagtggatccttcgcatgtta 26288347  T
Q  520 ttccgagggatgatg 534  Q
    |||| || |||||||    
T  26288348 ttccaagagatgatg 26288362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 125 - 534
Target Start/End: Original strand, 12206717 - 12207126
Alignment:
Q  125 tcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgata 224  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||  | |||||  ||||||| || || ||||   |||||    
T  12206717 tcggaggtgcaatactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccggatatagttcagcagactacagaaaaggtcaaattgata 12206816  T
Q  225 agggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaaggg 324  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||  | || |    
T  12206817 aaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttaagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagag 12206916  T
Q  325 tcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggc 424  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| || ||||| |||||  |||| ||||  || |||||||||| ||| |||||    
T  12206917 tcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttcgtaccagatatctgagagagttgcaacagtggc 12207016  T
Q  425 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccg 524  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  12207017 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcca 12207116  T
Q  525 agggatgatg 534  Q
    || |||||||    
T  12207117 agagatgatg 12207126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12457114 - 12456940
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  12457114 tggtcggaggtataggactcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttc 12457015  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagttt 296  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12457014 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 138 - 522
Target Start/End: Original strand, 11388358 - 11388741
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||| || || || | | ||||||| ||  ||||||    
T  11388358 actcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatga 11388457  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  11388458 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatgagtttcaagagga-gatcatgtgttcttgagagtcactcctatgac 11388556  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  11388557 aggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggt 11388656  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  11388657 ttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattc 11388741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 379 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15340574 - 15340419
Alignment:
Q  379 agttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 478  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340574 agttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 15340475  T
Q  479 ttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  15340474 gtcacagcttcggaagtatgtagcggatctttcgcatgttattcggagagatgatg 15340419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15340766 - 15340575
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  15340766 tggtcggaggtgcaggactccgttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagctg 15340667  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15340666 ataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgt 15340575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 13966678 - 13966788
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13966678 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 13966777  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  13966778 cgcctggtgtg 13966788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 26092806 - 26092917
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26092806 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 26092905  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  26092906 tgcgcctggtgt 26092917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 49154542 - 49154431
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49154542 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 49154443  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  49154442 tgcgcctggtgt 49154431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 11301223 - 11301332
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11301223 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 11301322  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  11301323 cgcctggtgt 11301332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 26116598 - 26116709
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26116598 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 26116697  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||||    
T  26116698 cgcgcctggtgt 26116709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Original strand, 17268 - 17650
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  17268 actccgttgtgctggtttcagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 17367  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  17368 aagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgac 17467  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |  || ||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  17468 tggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 17567  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  17568 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 17650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Original strand, 11553066 - 11553436
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  11553066 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 11553165  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  11553166 gttgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 11553265  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  11553266 tgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacat 11553365  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  11553366 ctttcgaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 11553436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 122 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15624886 - 15624539
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||| | |||||| |||| || | | ||    
T  15624886 tggtcggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtaattttgggaccagaaatcgttcatcaaactacttagaaggttaagttg 15624787  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||  || || || ||||||||||| || || || ||||| ||  | |    
T  15624786 atccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttga 15624687  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||  | |||||||  ||||| ||| ||||||| ||    
T  15624686 gagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttcatatcagatatcagaaagaattggaacggt 15624587  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 469  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15624586 ggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 15624539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14954926 - 14954556
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | || ||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  14954926 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtccagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 14954827  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  14954826 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 14954727  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||| |||    
T  14954726 tgcattgaagtcaaagaagttgaccccaaagtttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcat 14954627  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  14954626 ctttcgaatttgcacgacgttttccatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14954556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 243
Target Start/End: Original strand, 13968582 - 13968703
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13968582 tggtcggaggtgtatgactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcagattg 13968681  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagctt 243  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  13968682 ataagggaaaagatgaaagctt 13968703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12458879 - 12458769
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12458879 catcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 12458780  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  12458779 cgcctggtgtg 12458769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14139918 - 14139808
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14139918 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 14139819  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  14139818 cgcctggtgtg 14139808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15342670 - 15342560
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  15342670 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15342571  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  15342570 cgcctggtgtg 15342560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 18051963 - 18052072
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18051963 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 18052062  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    |||| |||||    
T  18052063 cgcccggtgt 18052072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12687807 - 12687437
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| ||  | || || ||||||||  | || ||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  12687807 tggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggaccagagattgtccaacagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 12687708  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||  |  | ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  12687707 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacg 12687608  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||    
T  12687607 tgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcat 12687508  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||| || ||||| || || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12687507 ctttcaaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12687437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13675691 - 13675581
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  13675691 catcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13675592  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  13675591 cgcctggtgtg 13675581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15204213 - 15203815
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||  | ||||| ||||| || | | ||    
T  15204213 tggtcagaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtaaggtgatagtgtagttttgggaccagattttgttcagcaaactacagagaaggttaagttg 15204114  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||  | |    
T  15204113 atccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttta 15204014  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||  | |||| |||||||| || || |||||||| |  || |||||||| | ||| ||||| | |||||||| | |||| ||| ||||||| ||    
T  15204013 gagtcacttttgtgactggtgttggccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtctgtatcagattacagaaagaattggaacggt 15203914  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
     |  ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  15203913 agagtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15203815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13023596 - 13023487
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  13023596 catcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13023497  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  13023496 cgcctggtgt 13023487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 15100613 - 15100723
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  15100613 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 15100712  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  15100713 cgcctggtgtg 15100723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 23503880 - 23503990
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23503880 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 23503979  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  23503980 cgcccggtgtg 23503990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 14284386 - 14284492
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  14284386 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14284485  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  14284486 cgcctgg 14284492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 16948482 - 16948588
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  16948482 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16948581  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  16948582 cgcctgg 16948588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 11386439 - 11386548
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  11386439 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11386538  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    |||| |||||    
T  11386539 cgccaggtgt 11386548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 16070307 - 16070416
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  16070307 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16070406  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||| ||||    
T  16070407 cgcctagtgt 16070416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 14262255 - 14262365
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  14262255 catcatattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14262354  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  14262355 cgcctggtgtg 14262365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19614914 - 19614804
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  19614914 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19614815  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19614814 cgcctggtgtg 19614804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 15154697 - 15154986
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||  || | |||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  15154697 aagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 15154796  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  |    
T  15154797 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttaccg 15154896  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  15154897 agtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15154986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18178060 - 18177699
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | ||||| ||||    
T  18178060 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtttagatgattcgagagaaaatga 18177961  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||||| | ||    
T  18177960 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataac 18177861  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| | |||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  18177860 tggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 18177761  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    || || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||    
T  18177760 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 18177699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 463
Target Start/End: Original strand, 11237174 - 11237490
Alignment:
Q  147 tgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgc 246  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||  || ||||    ||||  ||||| || ||||    
T  11237174 tgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgc 11237273  T
Q  247 agagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttgg 346  Q
    ||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| ||    
T  11237274 agaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtagg 11237373  T
Q  347 acgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacca 446  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || ||     
T  11237374 acgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccg 11237473  T
Q  447 catctttcgaacttgca 463  Q
    ||||||||||| |||||    
T  11237474 catctttcgaatttgca 11237490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19149445 - 19149340
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19149445 agattaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 19149347  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
    |||||||    
T  19149346 tggtgtg 19149340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20748844 - 20748739
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20748844 agattaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 20748746  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
    |||||||    
T  20748745 tggtgtg 20748739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14038032 - 14037743
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | || |||||||    
T  14038032 aagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactc 14037933  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |  || |||||  | |||||||  || || |||||| |||  ||||| ||| |    
T  14037932 ctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcg 14037833  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  14037832 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgat 14037743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14348062 - 14347773
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | || |||||||    
T  14348062 aagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactc 14347963  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |  || |||||  | |||||||  || || |||||| |||  ||||| ||| |    
T  14347962 ctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcg 14347863  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  14347862 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgat 14347773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Original strand, 15161009 - 15161334
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||  ||||    
T  15161009 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatga 15161108  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  15161109 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 15161208  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  15161209 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 15161308  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || || ||||||||||| |||||    
T  15161309 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 15161334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 522
Target Start/End: Original strand, 23516721 - 23517105
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| || || || || |||| |||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | ||||| ||||    
T  23516721 actccgttgtgccggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacaagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatga 23516820  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  23516821 aggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 23516920  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  23516921 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 23517020  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    || || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| ||||||| |  ||||||| || ||||| ||||    
T  23517021 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatattccggatccatctcatgtaattc 23517105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8707833 - 8707598
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  8707833 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 8707734  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  8707733 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 8707634  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  8707633 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 8707598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 12204810 - 12204920
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  12204810 catcagattaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 12204909  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  12204910 cgcctggtgtg 12204920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 8198856 - 8198567
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  8198856 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 8198757  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  8198756 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 8198657  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  8198656 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 8198567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 44791393 - 44791628
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  44791393 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 44791492  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  44791493 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 44791592  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  44791593 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 44791628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21662262 - 21661886
Alignment:
Q  155 tgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgt 254  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  |||||| ||| || || | | |||| || || ||||||||||| || |||||| |     
T  21662262 tgagtccggtgagagtgtggtactgggaccagacattgttcaacagactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtaga 21662163  T
Q  255 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcct 354  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||   || || ||||| ||  | || ||||| ||| | || ||||||||||| ||      
T  21662162 caaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaa---ggagaccatgtgtttttgagagtcacccctcttaccggtgttggacgggcac 21662066  T
Q  355 tgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 454  Q
    | || || | |||| | ||||| | ||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||  | || || ||||  || ||||| ||||| ||||||||    
T  21662065 taaaatcaaagaaactaactccgaggtttattggcccgtatcagatttcgcaaagagttggggcggttgcgtataacgtgggtttaccaccgcatctttc 21661966  T
Q  455 gaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  |  |||| || ||||||||||| || |||||||    
T  21661965 gaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaactacaaaagtatgtttcatatccatctcatgtgattccaagagatgatg 21661886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14332625 - 14332333
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  14332625 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 14332526  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||     || ||||||||||| ||||| ||    
T  14332525 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggctta 14332426  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
      |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||  | || || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  14332425 ccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14332333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 18551800 - 18552035
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  18551800 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 18551899  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||  |||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  18551900 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 18551999  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  18552000 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 18552035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13686286 - 13686057
Alignment:
Q  234 atgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctt 333  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || |||||||||     
T  13686286 atgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccta 13686187  T
Q  334 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 433  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  |  || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  13686186 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagt 13686087  T
Q  434 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
     ||||| ||  | ||||||||||| |||||    
T  13686086 gggtttaccgtcgcatctttcgaatttgca 13686057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 534
Target Start/End: Original strand, 15479335 - 15479464
Alignment:
Q  405 gagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcgg 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| || ||| | | |||||||||| | |    
T  15479335 gagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacatgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctg 15479434  T
Q  505 atccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  15479435 atccttcgcatgttattccaagagatgatg 15479464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10871223 - 10870988
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  10871223 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 10871124  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  10871123 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaggttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 10871024  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  10871023 ccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 10870988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 116
Target Start/End: Original strand, 48813290 - 48813387
Alignment:
Q  19 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48813290 attaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 48813387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14041935 - 14041839
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14041935 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttac 14041839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14351965 - 14351869
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14351965 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttac 14351869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 15146914 - 15147026
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||    
T  15146914 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgccttttggtgttacaaa 15147013  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     || |||||||||    
T  15147014 tgcacctggtgtg 15147026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7824129 - 7823979
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  7824129 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 7824030  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  7824029 aatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 7823979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 27107815 - 27107965
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  27107815 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 27107914  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  27107915 aatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 27107965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 301
Target Start/End: Original strand, 35964842 - 35964965
Alignment:
Q  178 tgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcg 277  Q
    ||||||||||| | |||||  | ||||||||||| || | | |||| || || |||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  35964842 tgggaccagacattgttcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcg 35964941  T
Q  278 aagaaaggatcttgagtttcaaga 301  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  35964942 taggaaggatcttgagtttcaaga 35964965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14334636 - 14334543
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  14334636 atcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 14334543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18179985 - 18179892
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  18179985 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgcctttcggtgt 18179892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8709845 - 8709749
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  8709845 atcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 8709749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 15380 - 15473
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  15380 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 15473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14936575 - 14936490
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  14936575 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgt 14936490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 11235243 - 11235339
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  11235243 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 11235339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 11551132 - 11551228
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  11551132 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 11551228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 15159087 - 15159183
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  15159087 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 15159183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9596363 - 9596236
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||| |||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  9596363 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 9596264  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcg 277  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  9596263 gtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15364169 - 15364083
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  15364169 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgt 15364083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9590608 - 9590515
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| |||||    
T  9590608 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgt 9590515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10872930 - 10872837
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  10872930 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 10872837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 399
Target Start/End: Original strand, 41251 - 41359
Alignment:
Q  291 gagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcc 390  Q
    |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| | |||||    ||||||||||    
T  41251 gagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgctttgaagtctaagaaacttactccacgtttcattggcc 41350  T
Q  391 cgtatcaga 399  Q
    | |||||||    
T  41351 cttatcaga 41359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 313
Target Start/End: Original strand, 11772288 - 11772368
Alignment:
Q  233 gatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    ||||||| | ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  11772288 gatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgt 11772368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Original strand, 44789386 - 44789474
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  44789386 cagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 44789474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 104)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 10468921 - 10469333
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10468921 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 10469020  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  10469021 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 10469120  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10469121 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgt 10469220  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10469221 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgatt 10469320  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  10469321 ccaagggatgatg 10469333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24364621 - 24364209
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24364621 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgagtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 24364522  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  24364521 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 24364422  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  24364421 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 24364322  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24364321 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 24364222  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  24364221 ccaagggatgatg 24364209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 27560689 - 27561101
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  27560689 tggtcgaaggtgcaggactccattgtgttggtttgaatcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 27560788  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27560789 atcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 27560888  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  27560889 gagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggt 27560988  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||| | | |||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  27560989 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagttgcggaagtatgtagcagacccttcgcatgtcatt 27561088  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  27561089 ccgagagatgatg 27561101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15459545 - 15459133
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  15459545 tggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactacggagaaagtcaggatg 15459446  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  15459445 attagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctga 15459346  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15459345 gggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgt 15459246  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||| | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  15459245 ggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtatcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttatt 15459146  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  15459145 ccaagagatgatg 15459133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 28282885 - 28283297
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  28282885 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 28282984  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28282985 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 28283084  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | || || ||    
T  28283085 gagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagaggatcgggacggt 28283184  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||| | | |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  28283185 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcacgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttatt 28283284  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  28283285 ccgagagatgatg 28283297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 123 - 534
Target Start/End: Original strand, 22796705 - 22797116
Alignment:
Q  123 ggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctga 222  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||| || | | |||    
T  22796705 ggtcggaggtgcaggactcctttatgttgatttgagtcaggagagagtgtagtgttgcgaccggatttggttcatcagactacagagaaggttaagatga 22796804  T
Q  223 taagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaag 322  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  22796805 taagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgag 22796904  T
Q  323 ggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtg 422  Q
     || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |  || ||||| |||||||| |||    
T  22796905 agttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtctgtatcatatatctgagagggttggaacagtg 22797004  T
Q  423 gcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  22797005 gcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgttattc 22797104  T
Q  523 cgagggatgatg 534  Q
    |||| |||||||    
T  22797105 cgagagatgatg 22797116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 523
Target Start/End: Original strand, 8766220 - 8766621
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  8766220 tggttggaggtgcaggactcatttatgctggtttgagtcaggagagagtgtcgtgtggggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 8766319  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  8766320 atcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctga 8766419  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| ||| || ||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  8766420 gggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 8766519  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  8766520 ggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 8766619  T
Q  522 cc 523  Q
    ||    
T  8766620 cc 8766621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 126 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21471806 - 21471398
Alignment:
Q  126 cggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataa 225  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||    
T  21471806 cggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgcagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagttaataa 21471707  T
Q  226 gggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggt 325  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||    
T  21471706 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagt 21471607  T
Q  326 cactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggca 425  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  21471606 cactcctatgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggca 21471507  T
Q  426 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccga 525  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21471506 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccaa 21471407  T
Q  526 gggatgatg 534  Q
    | |||||||    
T  21471406 gagatgatg 21471398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 443
Target Start/End: Original strand, 14381539 - 14381860
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  14381539 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtcgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 14381638  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  14381639 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 14381738  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  14381739 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagt 14381838  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgcca 443  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14381839 ggcatatagagttggtttgcca 14381860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17415695 - 17415365
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  17415695 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagaagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 17415596  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  | |    
T  17415595 ataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttatga 17415496  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  17415495 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 17415396  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctt 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17415395 ggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 119 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25768403 - 25768021
Alignment:
Q  119 gtgtggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcagg 218  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || |||||| | ||||| ||||| |||| |    
T  25768403 gtgtggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtctttggaccggatttagttcatcaaactacggagaaggtcaag 25768304  T
Q  219 ctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcc 318  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  25768303 ttgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttc 25768204  T
Q  319 taagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaac 418  Q
    | || ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  25768203 tgagagtcactcttatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaac 25768104  T
Q  419 tgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtag 501  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||    
T  25768103 agtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttccaatttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcagcttcggaagtatgtag 25768021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 243 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25750897 - 25750606
Alignment:
Q  243 tcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtg 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||| | |||||||||    
T  25750897 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgggtg 25750798  T
Q  343 ttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcc 442  Q
    |  ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  25750797 taagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgcc 25750698  T
Q  443 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  25750697 accacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcatcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 25750606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18801151 - 18800858
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  18801151 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagttaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatg 18801052  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  18801051 attagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctga 18800952  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttgg 415  Q
    | || |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| | | |||||| | ||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  18800951 gagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgacttcaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttgg 18800858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 534
Target Start/End: Original strand, 34645673 - 34646070
Alignment:
Q  137 gactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatg 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | ||||||| ||  | |||    
T  34645673 gactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttgataagagaacatatg 34645772  T
Q  237 aaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttga 336  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||    
T  34645773 aaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatga 34645872  T
Q  337 cgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttgg 436  Q
    | ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34645873 caggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaattgg 34645972  T
Q  437 tttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  34645973 attaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtacgtacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatg 34646070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 232 - 534
Target Start/End: Original strand, 14131361 - 14131663
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  14131361 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactcc 14131460  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatataga 431  Q
    | |||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14131461 tatgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatataga 14131560  T
Q  432 gttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatg 531  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | | |||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||    
T  14131561 gtgggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcagttacggaagtatgtaacggatccttcgcctgttattcctagagatg 14131660  T
Q  532 atg 534  Q
    |||    
T  14131661 atg 14131663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 123 - 534
Target Start/End: Original strand, 21564205 - 21564616
Alignment:
Q  123 ggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctga 222  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||   | || || | | |||    
T  21564205 ggtcggaggtgccggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactaaaaaaaaggttaagttga 21564304  T
Q  223 taagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaag 322  Q
    |||| ||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  21564305 taagagaacagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgag 21564404  T
Q  323 ggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtg 422  Q
     |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  21564405 agtcactcctttgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtg 21564504  T
Q  423 gcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||  | | |||||||||| |||||||||| ||| | ||||    
T  21564505 gcgtatagagtgggtttgccgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatattattc 21564604  T
Q  523 cgagggatgatg 534  Q
    | || |||||||    
T  21564605 ctagagatgatg 21564616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 232 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19879397 - 19879095
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||    
T  19879397 agatgaaagggtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcc 19879298  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatataga 431  Q
    | || | ||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  19879297 tatggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagg 19879198  T
Q  432 gttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatg 531  Q
    || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| | | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  19879197 gtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattccaagagatg 19879098  T
Q  532 atg 534  Q
    |||    
T  19879097 atg 19879095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18794883 - 18794487
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||| | || ||  ||||||| || || || | | ||||||| ||  ||||||    
T  18794883 actcctttgtgttggtttgagttaggagaaagtgtgatgttggggccagacatagtgcaacagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatga 18794784  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || || || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  18794783 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgac 18794684  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || |||||||| || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||  |||| |||||||| ||||||||| |||| |||    
T  18794683 aggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagtgggt 18794584  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | |  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  18794583 ttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacgaaagtatgtaccggatccgtcgcatgttattcctagagatgatg 18794487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 5839319 - 5839703
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||  | |||||  ||||||| |||||||||| | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  5839319 tggtttgaatcaggagatagggtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtcaagatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 5839418  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || ||    ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  5839419 gtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtttttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacg 5839518  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||    
T  5839519 tgcgttgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcat 5839618  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  5839619 ctttcgaatttacatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatg 5839703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Original strand, 11287686 - 11288082
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | | ||||| ||  | ||||    
T  11287686 actcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaacatatga 11287785  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| ||| ||||    
T  11287786 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcacccctatgac 11287885  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
    |||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  11287886 gggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggt 11287985  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| | | ||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| || |||||||    
T  11287986 ttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggattcttcgcatgttattccaagagatgatg 11288082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 27331614 - 27331903
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||  | || |||||||    
T  27331614 aagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactc 27331713  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |  || ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  |    
T  27331714 ctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccg 27331813  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||||   |||||| |||||||||||    
T  27331814 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgat 27331903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 27392354 - 27392643
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||  | || |||||||    
T  27392354 aagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactc 27392453  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |  || ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  |    
T  27392454 ctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccg 27392553  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||||   |||||| |||||||||||    
T  27392554 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgat 27392643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Original strand, 11280593 - 11280989
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | | ||||| ||  | ||||    
T  11280593 actcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaacatatga 11280692  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||  |||| ||| ||||    
T  11280693 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagaatcacacctatgac 11280792  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||| ||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  11280793 aggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggt 11280892  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| | | ||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| || |||||||    
T  11280893 ttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggattcttcgcatgttattccaagagatgatg 11280989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19864790 - 19864484
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  19864790 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagagtca 19864691  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||| ||||||| ||||| ||    
T  19864690 ctcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggcgta 19864591  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | |||| || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  19864590 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 19864491  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  19864490 gatgatg 19864484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 25610039 - 25610331
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || ||  | ||  | || ||||    
T  25610039 gagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtca 25610138  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    | ||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| |  || ||||| |||||| |||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  25610139 cacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccgagatttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 25610238  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25610239 tcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcccatgtgat 25610331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24366527 - 24366428
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24366527 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 24366428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 10467017 - 10467127
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10467017 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10467116  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  10467117 cgcctggtgtg 10467127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 14378084 - 14378194
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  14378084 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14378183  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  14378184 cgcctggtgtg 14378194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 14379634 - 14379744
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  14379634 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14379733  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  14379734 cgcctggtgtg 14379744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 21568159 - 21568269
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21568159 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttcggtgttactaacg 21568258  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  21568259 cgcctggtgtg 21568269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 28280981 - 28281091
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28280981 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 28281080  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  28281081 cgccgggtgtg 28281091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 517
Target Start/End: Original strand, 1543172 - 1543551
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  1543172 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 1543271  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  1543272 aagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgac 1543371  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  1543372 tggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 1543471  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  1543472 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 1543551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1640965 - 1640730
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||  | |||||| ||||||| || || ||||   ||||||| ||||||||||    
T  1640965 actccgttatgttggtttaagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcatcagactacagaaaaggtcaaattgataagagagaagatga 1640866  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || || |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||    
T  1640865 aagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaagagtcacccctgtgac 1640766  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgac 373  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  1640765 aggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgac 1640730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12498219 - 12497837
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||  | || || ||||| ||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  12498219 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 12498120  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||| | ||||    
T  12498119 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgac 12498020  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  12498019 cggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 12497920  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12497919 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Original strand, 12510682 - 12511064
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||  | || || ||||| ||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  12510682 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 12510781  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||| | ||||    
T  12510782 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgac 12510881  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  12510882 cggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 12510981  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12510982 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12511064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19455137 - 19455027
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |    
T  19455137 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaatg 19455038  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19455037 cgcctggtgtg 19455027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 24516576 - 24516676
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24516576 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 24516675  T
Q  113 c 113  Q
    |    
T  24516676 c 24516676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19437115 - 19437005
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  19437115 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19437016  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  19437015 cgcctagtgtg 19437005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23078650 - 23078280
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  23078650 tggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcaga 23078551  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
     ||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || ||  | || ||||||||| |||| |||||||| ||    
T  23078550 ctcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcg 23078451  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| |  || ||| |  |||||||||  || || ||||||  ||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||    
T  23078450 cgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcat 23078351  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  23078350 ctttcgaatttgcaagaagtattacatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23078280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 22078869 - 22079158
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  22078869 aagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 22078968  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||  ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||  || ||| | ||||||||||  || || |||||||| || ||||| ||| |    
T  22078969 ctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgtatcg 22079068  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  22079069 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtagcaacttcggaagtatgttcctgatccatcccatgtgat 22079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 25765390 - 25765773
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| |  || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| ||| |||    
T  25765390 tggtttgagtcaggtgaaaaagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtaga 25765489  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||  |  | || ||||| | | |||| |||||||||||    
T  25765490 gtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgcttttgagagtcacgc-tgtgactggtgttggacg 25765588  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| | ||||||||  || || ||||||||||| ||||  ||| |||| || || ||||| |||    
T  25765589 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcat 25765688  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||  |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  25765689 ctttcgaacttgcacgatgtgttccatgtgtcgtaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 25765773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 27187645 - 27187245
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| || | |||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||    
T  27187645 tggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 27187546  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | |    
T  27187545 atccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttga 27187446  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||| ||    
T  27187445 gagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggt 27187346  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||  |||| ||||| || |  ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| |||    
T  27187345 ggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatt 27187246  T
Q  522 c 522  Q
    |    
T  27187245 c 27187245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 522
Target Start/End: Original strand, 27261595 - 27261995
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| || | |||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||    
T  27261595 tggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 27261694  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | |    
T  27261695 atccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttga 27261794  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||| ||    
T  27261795 gagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggt 27261894  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||  |||| ||||| || |  ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| |||    
T  27261895 ggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatt 27261994  T
Q  522 c 522  Q
    |    
T  27261995 c 27261995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 534
Target Start/End: Original strand, 16963548 - 16963851
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  16963548 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagagtcactc 16963647  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||| |  || ||||| || |||||||  || || | |||||||||  |||| ||| |    
T  16963648 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggcgtatcg 16963747  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggat 530  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| |||    
T  16963748 tgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatccagagtgat 16963847  T
Q  531 gatg 534  Q
    ||||    
T  16963848 gatg 16963851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12505548 - 12505166
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||  | || || ||||| ||  | |||||| | ||||||||||| || | | ||||    ||||| ||||    
T  12505548 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagattggtcttaggacccgagattgttcatcatactactgagaatgttaagatgattcaagagaatatga 12505449  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||| | ||||    
T  12505448 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgac 12505349  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  12505348 cggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 12505249  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12505248 ttaccaccgcatctttcgatttttcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12505166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15461449 - 15461339
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15461449 catcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 15461350  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  15461349 cgcctggtgtg 15461339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18796803 - 18796693
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||| |    
T  18796803 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatg 18796704  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
     ||||||||||    
T  18796703 tgcctggtgtg 18796693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19453629 - 19453511
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | | ||    
T  19453629 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagttaagatg 19453530  T
Q  222 ataagggagaagatgaaag 240  Q
    || || |||||||||||||    
T  19453529 atcagagagaagatgaaag 19453511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 18408121 - 18408413
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || || || ||  | || || |    
T  18408121 gagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagagtaa 18408220  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  18408221 ctcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 18408320  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | | || || || ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||| || || ||||  ||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  18408321 tcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgcaccggattcatcccatgtgat 18408413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 22762633 - 22762925
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||| |||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  22762633 gagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgtaggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagtca 22762732  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |  || ||||| ||| ||||||  || || |||||||||||  |||| ||    
T  22762733 ctcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgta 22762832  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |  ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22762833 tcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccctcccatgtgat 22762925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 29592098 - 29592333
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  29592098 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 29592197  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  29592198 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 29592297  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29592298 ccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 29592333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 420 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1640710 - 1640596
Alignment:
Q  420 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtga 519  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  1640710 gtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtacgtagcggatccttcacatgtta 1640611  T
Q  520 ttccgagggatgatg 534  Q
    |||| || |||||||    
T  1640610 ttccaagagatgatg 1640596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 25112739 - 25112366
Alignment:
Q  144 ttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagctt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||   | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||| || ||||| |    
T  25112739 ttatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgt 25112640  T
Q  244 cgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgt 343  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||    
T  25112639 cgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgt 25112540  T
Q  344 tggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcca 443  Q
     |||||||| |||||||| | |||  |||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||| ||     
T  25112539 aggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccg 25112440  T
Q  444 ccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  25112439 ccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgt 25112366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25769957 - 25769848
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||| |    
T  25769957 catcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcggtgttactaatg 25769858  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  25769857 cgcctggtgt 25769848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 16626895 - 16627130
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16626895 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16626994  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16626995 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 16627094  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  16627095 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 16627130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 255 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25751022 - 25750919
Alignment:
Q  255 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcct 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  25751022 cagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgcgt 25750923  T
Q  355 tgaa 358  Q
    ||||    
T  25750922 tgaa 25750919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19881411 - 19881301
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  19881411 catcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19881312  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19881311 cgcctggtgtg 19881301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 34643754 - 34643860
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  34643754 catcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaacg 34643853  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  34643854 cgcctgg 34643860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 18787809 - 18787696
Alignment:
Q  410 agttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatcct 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||||    
T  18787809 agttggaacagtggcatatagagtgggtttgccatcacatatttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatcct 18787710  T
Q  510 tcccatgtgattcc 523  Q
    || ||||| |||||    
T  18787709 tcgcatgttattcc 18787696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17032569 - 17032373
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||    
T  17032569 gtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 17032470  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  17032469 cttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 17032373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 499
Target Start/End: Original strand, 18197728 - 18197996
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||  | || || ||| |||||||||||||  ||||||| || || |  |||||||    
T  18197728 aagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtcggaaagaccttaagtttcaagagggatatcatgtatttctgaaagtcactc 18197827  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | ||||  |||| ||||| |  |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| | |||| |||  || || ||| ||  ||| ||||| ||| |    
T  18197828 ttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtctgtataagatatcggaaagaatttaaacagtggcgtatcg 18197927  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  18197928 agtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtttcgcaacttcggaagtatgt 18197996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Original strand, 28263297 - 28263669
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  28263297 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcaga 28263396  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  28263397 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 28263496  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||    
T  28263497 tgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcat 28263596  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  28263597 ctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 28263669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Original strand, 28342046 - 28342418
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  28342046 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcaga 28342145  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  28342146 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 28342245  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||    
T  28342246 tgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcat 28342345  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  28342346 ctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 28342418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21473713 - 21473611
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| | |||||| ||||||||| |    
T  21473713 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcgatgttactaatg 21473614  T
Q  113 cgc 115  Q
    |||    
T  21473613 cgc 21473611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 463
Target Start/End: Original strand, 2874900 - 2875216
Alignment:
Q  147 tgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgc 246  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||  || ||||    ||||| ||||| || ||||    
T  2874900 tgctggtttgagtcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgc 2874999  T
Q  247 agagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttgg 346  Q
    ||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || || |  ||  | || ||||||||| |||| ||||| ||    
T  2875000 agaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagattttgagtttcaagaaggagaccacgagtttttgagagtcactcctatgactggtgtagg 2875099  T
Q  347 acgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacca 446  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || ||     
T  2875100 acgtgctttgaagtcaaataagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccg 2875199  T
Q  447 catctttcgaacttgca 463  Q
    ||||||||||| |||||    
T  2875200 catctttcgaatttgca 2875216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 534
Target Start/End: Original strand, 16927821 - 16928124
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||||||||  ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  16927821 aagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 16927920  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | ||||  ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||| |    
T  16927921 ttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcg 16928020  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggat 530  Q
      |||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||| | || ||||| || || ||||  ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| |||    
T  16928021 tcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatacagagtgat 16928120  T
Q  531 gatg 534  Q
    ||||    
T  16928121 gatg 16928124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 24313346 - 24313581
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  24313346 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 24313445  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  24313446 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 24313545  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  24313546 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 24313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 520
Target Start/End: Original strand, 21833178 - 21833451
Alignment:
Q  247 agagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttgg 346  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||  | ||  | ||  | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  21833178 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttgg 21833277  T
Q  347 acgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacca 446  Q
    | |||| |||||||| | ||| |||||||| |  || || || ||||||||||  || || ||||||||||  ||||| ||| |||| || || |||||     
T  21833278 aggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 21833377  T
Q  447 catctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  21833378 catctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 21833451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 18183533 - 18183645
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18183533 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 18183632  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||||||||||    
T  18183633 tgcgcctggtgtg 18183645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Original strand, 28292472 - 28292844
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  28292472 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcaga 28292571  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  28292572 gtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 28292671  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||    
T  28292672 tgctttgaagttaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcat 28292771  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  28292772 ctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 28292844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 18963254 - 18963353
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  18963254 atcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaa 18963353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 408 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22433920 - 22433794
Alignment:
Q  408 agagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatc 507  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||    
T  22433920 agagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 22433821  T
Q  508 cttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    | || |||||||| | ||| |||||||    
T  22433820 catctcatgtgatccagagtgatgatg 22433794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 23085939 - 23086049
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||||||||||||||| || |    
T  23085939 catcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatg 23086038  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  23086039 cgccgggtgtg 23086049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27189551 - 27189458
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  27189551 atcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgt 27189458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 27259689 - 27259782
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  27259689 atcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgt 27259782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 16382445 - 16382700
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  16382445 tggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 16382544  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |    
T  16382545 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttga 16382644  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| |||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  16382645 gggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 16382700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23996457 - 23996202
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  23996457 tggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 23996358  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  |||    
T  23996357 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaa 23996258  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  23996257 gggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 23996202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 123
Target Start/End: Original strand, 19487486 - 19487560
Alignment:
Q  49 acggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19487486 acggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtg 19487560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 5837385 - 5837481
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  5837385 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttac 5837481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16098153 - 16098004
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||  | || || |    
T  16098153 gagaagatgaaagcgtcttagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtga 16098054  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
      ||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  16098053 aacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16098004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Original strand, 25743265 - 25743414
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  | ||||  |    
T  25743265 gagaagatgagagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcaagtgtttttgagggaga 25743364  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
     || | |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  25743365 atcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 25743414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 20634126 - 20634202
Alignment:
Q  31 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20634126 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 20634202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 30679173 - 30679220
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggccttta 58  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30679173 atcatcagattaaagtgacggatgaggatatgcagaagacagccttta 30679220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 377
Target Start/End: Original strand, 1648965 - 1649111
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| | ||    
T  1648965 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 1649064  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    || |||| || ||||| ||||| |||||||   |||| |||||||||    
T  1649065 ctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtgggaagttgactcct 1649111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11291915 - 11291845
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 298  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11291915 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttca 11291845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16233285 - 16233167
Alignment:
Q  255 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcct 354  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| | |||| |||| || ||||| ||||| |    
T  16233285 cagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgt 16233186  T
Q  355 tgaagtcgaggaaattgac 373  Q
    ||||||  ||||| |||||    
T  16233185 tgaagtgtaggaagttgac 16233167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18571755 - 18571669
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||| | |||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  18571755 ggagaaaaggaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 18571669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 377
Target Start/End: Original strand, 18838114 - 18838235
Alignment:
Q  256 agaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcctt 355  Q
    |||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |  |||| | |||| |||| |||||||| | ||| ||    
T  18838114 agaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgcttt 18838213  T
Q  356 gaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||||  ||||| |||||||||    
T  18838214 gaagtgtaggaagttgactcct 18838235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22434050 - 22433929
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    |||||||||||||| |||||||    
T  22434050 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcaga 22433951  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatga 271  Q
    |||| || |||||||| |||||    
T  22433950 gtcgacaaaagagttatcatga 22433929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 2872969 - 2873065
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  2872969 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 2873065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16574005 - 16573909
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  16574005 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 16573909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 16621375 - 16621471
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  16621375 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 16621471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 22760621 - 22760717
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  22760621 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttac 22760717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23080558 - 23080488
Alignment:
Q  37 gatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| | |||||||||||||    
T  23080558 gatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttac 23080488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 18406109 - 18406206
Alignment:
Q  10 catcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  18406109 catcaccagattaaagtgaaagattaagatatgcagaagacagccttcagaacgtattatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttac 18406206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25655586 - 25655501
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| | ||| | ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  25655586 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgt 25655501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 28261363 - 28261452
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcg 100  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || || |||||||| | ||||||||    
T  28261363 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcg 28261452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28284553 - 28284464
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcg 100  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || || |||||||| | ||||||||    
T  28284553 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcg 28284464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 28340112 - 28340201
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcg 100  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || || |||||||| | ||||||||    
T  28340112 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcg 28340201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 21413119 - 21413199
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcat 311  Q
    ||||||||||| || |||||| | | ||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  21413119 aagatgaaagcgtctcagagtagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcat 21413199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 24293948 - 24294044
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||  |||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  24293948 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 24294044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25114667 - 25114571
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  25114667 atcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataaagttatgccttttggtgttac 25114571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 25763414 - 25763490
Alignment:
Q  31 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  25763414 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactatgagtataaagttatgcctttcggtgttac 25763490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 467 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 26276794 - 26276762
Alignment:
Q  467 tgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26276794 tgtgtttcatgtgtctcagcttcagaagtatgt 26276762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37677440 - 37677023
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37677440 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 37677341  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttccta- 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  37677340 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttg 37677241  T
Q  321 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  37677240 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 37677141  T
Q  421 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37677140 tggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 37677041  T
Q  521 tccgagggatgatgatgt 538  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37677040 tccgagggatgatgatgt 37677023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20294772 - 20294360
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  20294772 tggttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcagaatg 20294673  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20294672 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctga 20294573  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  20294572 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagt 20294473  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20294472 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgatt 20294373  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  20294372 ccaagggatgatg 20294360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 31550180 - 31550592
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31550180 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcatgagactacggagaaagtcaggttg 31550279  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  31550280 ataagagaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 31550379  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  31550380 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 31550479  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31550480 ggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 31550579  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  31550580 ccaagggatgatg 31550592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 192 - 538
Target Start/End: Original strand, 20075128 - 20075474
Alignment:
Q  192 gttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20075128 gttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttg 20075227  T
Q  292 agtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggccc 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  20075228 agtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtcc 20075327  T
Q  392 gtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcag 491  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20075328 gtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcgg 20075427  T
Q  492 aagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatgatgt 538  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20075428 aagtatgtagcagatccttcgcatgtgattccgagggatgacgatgt 20075474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 22433115 - 22433527
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  22433115 tggttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagcgagtgtggtgttgggaccgaatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatg 22433214  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  22433215 atcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttcaggagggtgatcatgtgttcctga 22433314  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  22433315 gggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcagatttcagagagggttgcaactgt 22433414  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22433415 ggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgttatt 22433514  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  22433515 ccgagagatgatg 22433527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19854672 - 19854262
Alignment:
Q  124 gtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgat 223  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  19854672 gtcggaggtgcaggactcctttacgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgat 19854573  T
Q  224 aagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagg 323  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||     
T  19854572 cagagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgaga 19854473  T
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    || |||||| |||||||||| || || || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  19854472 gttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcagagagggttggaacagtgg 19854373  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19854372 catatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcc 19854273  T
Q  524 gagggatgatg 534  Q
     || |||||||    
T  19854272 aagagatgatg 19854262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 142 - 532
Target Start/End: Original strand, 19664895 - 19665285
Alignment:
Q  142 ctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagc 241  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  19664895 ctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagc 19664994  T
Q  242 ttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggt 341  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||| |||||||     
T  19664995 gtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggg 19665094  T
Q  342 gttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgc 441  Q
    || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19665095 gtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgc 19665194  T
Q  442 caccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatga 532  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19665195 caccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatga 19665285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 20940062 - 20940474
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||| | ||    
T  20940062 tggtcggaggtataggactcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcaaactatagagaaagtcaagatg 20940161  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  20940162 atcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 20940261  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  20940262 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagt 20940361  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||| ||| || || |||    
T  20940362 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcgtatctttcgcacgttatt 20940461  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  20940462 ccaagagatgatg 20940474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 473
Target Start/End: Original strand, 20835887 - 20836241
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  20835887 tggtcggaggtgtagaactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgttttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 20835986  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||| || |    
T  20835987 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggcccttaagttttaggagggtgatcatgtttttctga 20836086  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtc---gaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaac 418  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||| | || |||||   || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20836087 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaac 20836186  T
Q  419 tgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20836187 tgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttt 20836241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 20856760 - 20857172
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  20856760 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggctggaattggttcatgaaactacggagaaagtcaagatg 20856859  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| || |    
T  20856860 attagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcaggaaggtgaccatgtttttctga 20856959  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20856960 gggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgt 20857059  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||  | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  20857060 ggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgttatt 20857159  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  20857160 ccaagagatgatg 20857172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 303 - 538
Target Start/End: Original strand, 20395173 - 20395408
Alignment:
Q  303 ggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagactt 402  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  20395173 ggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagattt 20395272  T
Q  403 cagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagc 502  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20395273 cagagagagttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatgtagc 20395372  T
Q  503 ggatccttcccatgtgattccgagggatgatgatgt 538  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20395373 ggatccttcacatgtgattccgagggatgatgatgt 20395408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 173 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11382903 - 11382666
Alignment:
Q  173 tgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgac 272  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11382903 tgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgac 11382804  T
Q  273 aagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattga 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11382803 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttga 11382704  T
Q  373 ctcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagaga 410  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11382703 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagaga 11382666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 245 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244148
Alignment:
Q  245 gcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgtt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  345 ggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccac 444  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  445 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatctttcgcatgttattccgagagatgatg 20244148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 122 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 41308185 - 41307891
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  || || ||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||   |     
T  41308185 tggtcgaaggtgcatgactcctttatgttggtttgagttgggagaaagtgtggtgttgggactggatttggttcatcagactacggagaaagtcaaaata 41308086  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  41308085 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttgagtttcaagagggagaccatgtgtttctga 41307986  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttgga 416  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| ||||||    
T  41307985 gggttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttgga 41307891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20296676 - 20296566
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20296676 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20296577  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  20296576 cgcctggtgtg 20296566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21953173 - 21953063
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21953173 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 21953074  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  21953073 cgcctggtgtg 21953063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48425170 - 48425059
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48425170 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 48425071  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  48425070 tgcgcctggtgt 48425059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 52988038 - 52987927
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52988038 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 52987939  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  52987938 tgcgcctggtgt 52987927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Original strand, 17045042 - 17045412
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  17045042 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 17045141  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  17045142 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacg 17045241  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| || |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  17045242 tgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 17045341  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  17045342 ctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 17045412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20250101 - 20249812
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  20250101 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 20250002  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || || ||||  |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  |    
T  20250001 ctgtgactggtgttggacgagcgttgaagtcaaagaagttgactccgaaatttattgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccg 20249902  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20249901 agtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 20249812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 50620352 - 50620641
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||| || ||  | || |||||||    
T  50620352 aagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactc 50620451  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||| |    
T  50620452 ctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcatatcg 50620551  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  50620552 agtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 50620641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 19760865 - 19761277
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||    
T  19760865 tggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttg 19760964  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||  | |    
T  19760965 atccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttga 19761064  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||| ||||||| ||    
T  19761065 gagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggaccgtatcagatatccgaaagaattggaacggt 19761164  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||| | |||||||  ||||||| || ||||||||     
T  19761165 ggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtatcgcaacttcggtagtatgtttcggatccgtctcatgtgatc 19761264  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  19761265 ccaagagatgatg 19761277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 31538090 - 31538201
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31538090 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 31538189  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  31538190 tgcgcctggtgt 31538201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37679346 - 37679235
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37679346 atcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 37679247  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  37679246 tgcgcctggtgt 37679235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 20854855 - 20854965
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20854855 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 20854954  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  20854955 cgcctggtgtg 20854965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 20938158 - 20938268
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20938158 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 20938257  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  20938258 cgcctggtgtg 20938268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20137032 - 20136761
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |  || ||  | || ||||    
T  20137032 gagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtca 20136933  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| | ||||||||  || || |||||||| || ||||| ||    
T  20136932 ctcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgta 20136833  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    | | |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  20136832 tcgtgttggtttaccacggcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 20136761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 38910919 - 38911030
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38910919 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaa 38911018  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  38911019 tgcgcctggtgt 38911030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19106711 - 19106329
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  19106711 actccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 19106612  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  19106611 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcggagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 19106512  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  19106511 tggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccatatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttgga 19106412  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || | ||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  19106411 ttactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 19106329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 24097698 - 24097808
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  24097698 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 24097797  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  24097798 cgcctggtgtg 24097808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 19661231 - 19661341
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  19661231 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19661330  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19661331 cgcctggtgtg 19661341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 21743647 - 21743757
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  21743647 catcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 21743746  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  21743747 cgcctggtgtg 21743757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21747785 - 21747500
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||| || || ||  | |   | || |||||||    
T  21747785 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgtagaaag-atcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtcactc 21747687  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| |  || |||||  |||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  |    
T  21747686 ctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccgagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 21747587  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  21747586 agtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 21747500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 324 - 520
Target Start/End: Original strand, 50612617 - 50612813
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||    
T  50612617 gtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtgg 50612716  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||| |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  50612717 catatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 50612813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 20833995 - 20834105
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  20833995 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatg 20834094  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||| |||||||    
T  20834095 cgcgtggtgtg 20834105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41310821 - 41310711
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| | |||||||||||||||| |    
T  41310821 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataacgtgatgtctttcggtgttactaatg 41310722  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  41310721 cgcctagtgtg 41310711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 16369548 - 16369271
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || |||||||| ||  | || |||||||    
T  16369548 aagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactc 16369449  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || ||||  ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| | | ||| ||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  |    
T  16369448 ctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccg 16369349  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatcc 508  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  |||||||    
T  16369348 tgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 16369271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 522
Target Start/End: Original strand, 16350704 - 16350998
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16350704 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16350803  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16350804 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 16350903  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  16350904 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 16350998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19856569 - 19856459
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || || |||| |||||||| ||||||| | |    
T  19856569 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcgttgttactcatg 19856470  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19856469 cgcctggtgtg 19856459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21830663 - 21830322
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| ||   | ||    
T  21830663 tggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatg 21830564  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | |    
T  21830563 atctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttga 21830464  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||||| ||    
T  21830463 gagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggt 21830364  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    ||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  21830363 ggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 21830322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 33391134 - 33391369
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  33391134 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 33391233  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  33391234 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 33391333  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  33391334 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 33391369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16378355 - 16378249
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16378355 agattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcc 16378256  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
    |||||||    
T  16378255 tggtgtg 16378249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 522
Target Start/End: Original strand, 41354574 - 41354868
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || || || || || ||  | || ||||    
T  41354574 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 41354673  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||| || ||||| ||    
T  41354674 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggctta 41354773  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  41354774 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 41354868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 520
Target Start/End: Original strand, 16078834 - 16079030
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||  ||||    
T  16078834 gtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtgg 16078933  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16078934 cgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactacggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 16079030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 438 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24477024 - 24476928
Alignment:
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  24477024 ttgccaccacatctctcgaattttcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccctcgcatgtgattccgagagatgatg 24476928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 51333598 - 51333833
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || || || ||  | || ||||    
T  51333598 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaataaggagaccacgtgtttttgagagtca 51333697  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  51333698 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcatatattggaaagagttggaacggtggctta 51333797  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  51333798 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 51333833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21837204 - 21836915
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  21837204 gagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 21837105  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  21837104 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 21837005  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||  | || || ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || |||||    
T  21837004 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgt 21836915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 20831496 - 20831646
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  20831496 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 20831595  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  20831596 aatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 20831646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 41351755 - 41351848
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  41351755 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgt 41351848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 286
Target Start/End: Original strand, 16078667 - 16078815
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  16078667 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 16078766  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaagga 286  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16078767 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagga 16078815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 22360337 - 22360433
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22360337 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 22360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 50618491 - 50618587
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50618491 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttac 50618587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20914465 - 20914315
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| |  |||||||||| ||| | ||  | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  20914465 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtg 20914366  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  20914365 aatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 20914315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21751207 - 21751107
Alignment:
Q  10 catcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttacta 109  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  21751207 catcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttttggtgttacta 21751108  T
Q  110 a 110  Q
    |    
T  21751107 a 21751107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 21862466 - 21862562
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21862466 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttac 21862562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 46518957 - 46518826
Alignment:
Q  246 cagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttg 345  Q
    |||||| | |||||||| || ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| | |||| |||| |||||||    
T  46518957 cagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttg 46518858  T
Q  346 gacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  46518857 gtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 46518826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 33389122 - 33389215
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  33389122 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 33389215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 16348688 - 16348751
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtca 74  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  16348688 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtca 16348751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21163378 - 21163228
Alignment:
Q  384 attggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctc 483  Q
    ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  | || ||||| || |    
T  21163378 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgtcgc 21163279  T
Q  484 agcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    | |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  21163278 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 21163228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 17043108 - 17043201
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  17043108 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 17043201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 21233824 - 21233917
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  21233824 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 21233917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21832568 - 21832475
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |  || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  21832568 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 21832475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 51331586 - 51331679
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  51331586 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 51331679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 430229 - 430305
Alignment:
Q  31 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| || |||||||| || | |||||||||||||||    
T  430229 gatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgcctttcggtgttac 430305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21839216 - 21839120
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  21839216 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 21839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 74)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 11358341 - 11358753
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11358341 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 11358440  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  11358441 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 11358540  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||    
T  11358541 gagtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggtacagt 11358640  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11358641 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 11358740  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  11358741 ccaagggatgatg 11358753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20832961 - 20832545
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20832961 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcagattg 20832862  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  20832861 ataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 20832762  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  20832761 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 20832662  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20832661 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 20832562  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  20832561 ccgagggatgatgatgt 20832545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31830634 - 31830218
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31830634 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttg 31830535  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  31830534 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctga 31830435  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31830434 gagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgt 31830335  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31830334 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 31830235  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  31830234 ccgagggatgatgatgt 31830218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1063727 - 1063311
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1063727 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgtgtgagagtgttgtgttgggaccagatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttg 1063628  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  1063627 ataagagaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 1063528  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1063527 gggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaattggtactgt 1063428  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1063427 ggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 1063328  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  1063327 ccgagggatgatgatgt 1063311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23276752 - 23276340
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  23276752 tggtcggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagtcatgatg 23276653  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  23276652 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 23276553  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |  | |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  23276552 gatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagt 23276453  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23276452 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 23276353  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  23276352 ccgagagatgatg 23276340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 122 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23293934 - 23293534
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||| | ||    
T  23293934 tggtcggaggttgaggactcctttatgtcggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaagatg 23293835  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  23293834 atcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 23293735  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  23293734 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 23293635  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23293634 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 23293535  T
Q  522 c 522  Q
    |    
T  23293534 c 23293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27787717 - 27787305
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  27787717 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaaggtg 27787618  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27787617 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 27787518  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||    
T  27787517 gagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggt 27787418  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  27787417 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttatt 27787318  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  27787317 ccgagagatgatg 27787305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12574329 - 12573917
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  12574329 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaagagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 12574230  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12574229 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 12574130  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| || ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||    
T  12574129 gggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggt 12574030  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| | | |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  12574029 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttatt 12573930  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  12573929 ccgagagatgatg 12573917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 256 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24654187 - 24653909
Alignment:
Q  256 agaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcctt 355  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  24654187 agaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcatt 24654088  T
Q  356 gaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcg 455  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24654087 gaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcg 24653988  T
Q  456 aacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24653987 aacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatttagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 24653909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23087410 - 23087014
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||  | |||| | |||||| ||| || || |   ||||||| ||||||||||    
T  23087410 actccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatattgttcgtcagactattgaaaaggttaaattgataagagagaagatga 23087311  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||||||| | ||||    
T  23087310 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgac 23087211  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  23087210 aggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgtatagagtgtgt 23087111  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  23087110 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatcccaagagatgatg 23087014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 300 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24945165 - 24944931
Alignment:
Q  300 gagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcaga 399  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24945165 gagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaga 24945066  T
Q  400 cttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
     |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  24945065 tttcaaagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 24944966  T
Q  500 agcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24944965 agcggagccttcgcatgttattccaagagatgatg 24944931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 532
Target Start/End: Original strand, 27365562 - 27365956
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | | ||||| ||  ||||||    
T  27365562 actcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacagatga 27365661  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  27365662 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgac 27365761  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27365762 aggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttgga 27365861  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatga 532  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| | | |||||||||| || ||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  27365862 ttaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccgaatccttcgcatattattcctagggatga 27365956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1065633 - 1065522
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1065633 atcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 1065534  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  1065533 tgcgcctggtgt 1065522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31832540 - 31832429
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31832540 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaa 31832441  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  31832440 tgcgcctggtgt 31832429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23063947 - 23063675
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || |||||  | || ||||    
T  23063947 gagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtca 23063848  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| |||| |||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  23063847 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgta 23063748  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgta 500  Q
    | |||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  23063747 tcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgta 23063675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24675437 - 24675053
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| ||| |||    
T  24675437 tggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtaga 24675338  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  24675337 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacg 24675238  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||    
T  24675237 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcat 24675138  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  | ||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  24675137 cttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 24675053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Original strand, 22757036 - 22757342
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || || || ||  | || ||||    
T  22757036 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagagtca 22757135  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  22757136 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 22757235  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  22757236 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 22757335  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  22757336 gatgatg 22757342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 231 - 534
Target Start/End: Original strand, 21325842 - 21326145
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  21325842 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 21325941  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| |  || ||| | ||||||||||  || || |||||||| || ||||| ||| |    
T  21325942 ctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcg 21326041  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggat 530  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||    
T  21326042 agtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgat 21326141  T
Q  531 gatg 534  Q
    ||||    
T  21326142 gatg 21326145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 19650613 - 19650723
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  19650613 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgtcactaacg 19650712  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19650713 cgcctggtgtg 19650723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24950470 - 24950360
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24950470 catcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 24950371  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  24950370 cgcctggtgtg 24950360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23138904 - 23138615
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  || || || ||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  23138904 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagagtcactc 23138805  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  23138804 ttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcg 23138705  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  23138704 agtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23138615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23550694 - 23550405
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  || || || ||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  23550694 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagagtcactc 23550595  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  23550594 ttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcg 23550495  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  23550494 agtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23550405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Original strand, 24707977 - 24708347
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  24707977 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 24708076  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || ||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  24708077 gtcgacaaaagaaatatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 24708176  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||||||||  ||  |||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  24708177 tgctttgaagtcaaagaagttgactcctagattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 24708276  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  24708277 ctttcgaatttgcatgacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 24708347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25255799 - 25255689
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  25255799 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 25255700  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||| |||||||    
T  25255699 cgcttggtgtg 25255689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 23098581 - 23098690
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  23098581 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 23098680  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  23098681 cgcctggtgt 23098690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 19717580 - 19717690
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  19717580 catcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaag 19717679  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19717680 cgcctggtgtg 19717690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27789620 - 27789510
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27789620 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 27789521  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  27789520 cgcccggtgtg 27789510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12576227 - 12576124
Alignment:
Q  19 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctg 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  12576227 attaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccg 12576128  T
Q  119 gtgt 122  Q
    ||||    
T  12576127 gtgt 12576124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 534
Target Start/End: Original strand, 30211461 - 30211796
Alignment:
Q  199 agactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 298  Q
    ||||||||||||| || | | |||| || || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  30211461 agactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 30211560  T
Q  299 agagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcag 398  Q
    ||| || || ||||| ||  | || ||||| | | |||| ||||||||||| ||  | || || | |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  30211561 agaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcag 30211660  T
Q  399 acttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatg 498  Q
    | ||| || | ||||||    || || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||    
T  30211661 atttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 30211760  T
Q  499 tagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |   |||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  30211761 ttttggatcaatctcatgtgattccaagagatgatg 30211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 463
Target Start/End: Original strand, 24878462 - 24878803
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||  || ||    
T  24878462 tggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatg 24878561  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | |    
T  24878562 attcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttga 24878661  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||||| ||    
T  24878662 gagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggt 24878761  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    ||| ||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24878762 ggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 24878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23278656 - 23278546
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  23278656 catcaaattaaggtgaaggacaaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 23278557  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  23278556 cgcctggtgtg 23278546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 439
Target Start/End: Original strand, 24825749 - 24826066
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||    
T  24825749 tggtcggaggtgtaggactccgttgtgttgggttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaggttaagatg 24825848  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || || ||||||||| | || || ||| |||| ||  |||    
T  24825849 atccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaggaaggagataatgtatttttaa 24825948  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| | ||| |||||  |||||||||  ||||| ||| |||| || ||    
T  24825949 gagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggttcgtatcagatatcagaaagaattgggacggt 24826048  T
Q  422 ggcatatagagttggttt 439  Q
    ||| ||| |||| |||||    
T  24826049 ggcgtatcgagtgggttt 24826066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9610006 - 9609771
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  9610006 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 9609907  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  9609906 ctcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 9609807  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  9609806 ccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 9609771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 24262330 - 24262005
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  24262330 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 24262231  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  24262230 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 24262131  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| |  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  24262130 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 24262031  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || |||||||||||||| |||||    
T  24262030 ttaccgccacatctttcgaatttgca 24262005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23188878 - 23188586
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||  | ||  | || ||||    
T  23188878 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttgagagtca 23188779  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||  |||| ||    
T  23188778 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgta 23188679  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | ||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  23188678 tcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23188586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16925130 - 16924895
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16925130 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16925031  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16925030 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 16924931  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16924930 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16924895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16998870 - 16998635
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16998870 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16998771  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16998770 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 16998671  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16998670 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16998635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27217886 - 27217651
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  27217886 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 27217787  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  27217786 ctcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 27217687  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  27217686 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 27217651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 45529487 - 45529116
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| || || ||||| || || |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||  |||||||| |||| || | | ||    
T  45529487 tggtcggagatgcaaaactccattgtgttggtatgagtccggtgagagtgtggtattgggaccggacattgttcaacagactactaagaaggttaagttg 45529388  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||| ||      || ||||| ||  | |    
T  45529387 attagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatcttgagtttgaa------gaccatgtgtttatga 45529294  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||| ||||||| | ||| |||| ||| ||||||| ||| || |||||||| || ||    
T  45529293 gagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattgacccatatcagatttcggaaagagttgggacggt 45529194  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
     || |||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || || |||| |||| ||||    
T  45529193 tgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagcatgt 45529116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 517
Target Start/End: Original strand, 21145603 - 21145892
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  21145603 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 21145702  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||  | ||||||||  |  || |||||||||||  |||| ||    
T  21145703 ctcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttattgatctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggctta 21145802  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  21145803 tcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 21145892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16982022 - 16981787
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16982022 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16981923  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16981922 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 16981823  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16981822 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16981787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 17063587 - 17063352
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  17063587 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 17063488  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  17063487 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 17063388  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17063387 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 17063352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 282 - 520
Target Start/End: Original strand, 27377098 - 27377336
Alignment:
Q  282 aaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagt 381  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  |    
T  27377098 aaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagat 27377197  T
Q  382 tcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttc 481  Q
    | ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  27377198 ttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtc 27377297  T
Q  482 tcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
     || ||||  ||||||||   |||||| || ||||||||    
T  27377298 gcaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgat 27377336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24709903 - 24709674
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  24709903 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 24709804  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  24709803 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtattagatattggaaagagttggaacggtggctta 24709704  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaa 457  Q
      |||| ||||| || || |||||| ||||    
T  24709703 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaa 24709674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 24818791 - 24818903
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||| ||    
T  24818791 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 24818890  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  24818891 tgcgccaggtgtg 24818903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23112616 - 23112506
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  23112616 catcagattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatg 23112517  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  23112516 cgcctagtgtg 23112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17067245 - 17067016
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  17067245 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 17067146  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| |     
T  17067145 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttt 17067046  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaa 457  Q
      |||| ||||| || || |||||||||||    
T  17067045 acgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 17067016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27371139 - 27370943
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  27371139 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 27371040  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggc 424  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| |||||    
T  27371039 ctcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggc 27370943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 22325429 - 22325664
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  22325429 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 22325528  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  22325529 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 22325628  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  22325629 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 22325664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 184
Target Start/End: Original strand, 19652516 - 19652578
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggacc 184  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19652516 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggacc 19652578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10868705 - 10868485
Alignment:
Q  243 tcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtg 342  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||    
T  10868705 tcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtg 10868606  T
Q  343 ttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcc 442  Q
    | |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||    
T  10868605 taggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttacc 10868506  T
Q  443 accacatctttcgaacttgca 463  Q
     || ||||||||||| |||||    
T  10868505 gccgcatctttcgaatttgca 10868485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 463
Target Start/End: Original strand, 44386157 - 44386377
Alignment:
Q  243 tcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtg 342  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||    
T  44386157 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtg 44386256  T
Q  343 ttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcc 442  Q
    | |||||||| |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||    
T  44386257 taggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacc 44386356  T
Q  443 accacatctttcgaacttgca 463  Q
    ||| |||||| |||| |||||    
T  44386357 accgcatcttgcgaatttgca 44386377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Original strand, 30010745 - 30010850
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||    |||| ||||||| ||||||||||    
T  30010745 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaa 30010844  T
Q  111 cgcgcc 116  Q
     |||||    
T  30010845 tgcgcc 30010850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 522
Target Start/End: Original strand, 24833359 - 24833440
Alignment:
Q  441 ccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  24833359 ccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgattc 24833440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 23106289 - 23106385
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23106289 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 23106385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 24875311 - 24875407
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  24875311 atcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 24875407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Original strand, 30209478 - 30209582
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||    |||| ||||||||||||||||||    
T  30209478 atcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaa 30209577  T
Q  111 cgcgc 115  Q
     ||||    
T  30209578 tgcgc 30209582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 12640386 - 12640641
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  12640386 tggtcggaggtgtaggacaccgttatgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 12640485  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| |||||||||| |  || |||||||| ||| | |    
T  12640486 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttga 12640585  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||  |||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  12640586 gggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 12640641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22276150 - 22276000
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||  | || ||     
T  22276150 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtg 22276051  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| ||||||   ||||| |||||||||    
T  22276050 aatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcct 22276000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10870732 - 10870639
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  10870732 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 10870639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24711916 - 24711823
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  24711916 atcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 24711823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 21323827 - 21323923
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  21323827 atcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttttggtgttac 21323923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25128623 - 25128432
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||  | || || |||||||| || ||||| | | ||    
T  25128623 tggtcggaggtgtaggacgccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgttttgttaggatcggaggttgtccaagagactacggaaaaagttaagatg 25128524  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||  |  | || |||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  25128523 attcaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgatgaaaggaggaaggacattgagtttcaagttggtgatcatgt 25128432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 24831759 - 24831909
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| |  || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  24831759 ggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 24831858  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || || || ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  24831859 aatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24831909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23073745 - 23073649
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||    
T  23073745 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgcctttcggtgttac 23073649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24264252 - 24264156
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  24264252 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 24264156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24677371 - 24677275
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  || || || || ||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||    
T  24677371 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttac 24677275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27373151 - 27373055
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  27373151 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 27373055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 41606946 - 41607042
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  41606946 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 41607042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 106
Target Start/End: Original strand, 22734355 - 22734430
Alignment:
Q  31 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgtta 106  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || || || |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22734355 gatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgtta 22734430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16927242 - 16927149
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  16927242 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 16927149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17000882 - 17000789
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  17000882 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 17000789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Original strand, 23817626 - 23817711
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  23817626 gagaagatcaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgt 23817711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 44384131 - 44384227
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  44384131 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 44384227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 47123918 - 47123502
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47123918 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttg 47123819  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  47123818 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctga 47123719  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47123718 gagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgt 47123619  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47123618 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaggtatgttgcggatccttctcatgtgatt 47123519  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    |||||||||||||||||    
T  47123518 ccgagggatgatgatgt 47123502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Original strand, 16329814 - 16330224
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16329814 tggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 16329913  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  16329914 ataagggaaaagatgaaagcttcacagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 16330013  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16330014 gggtcactcctttgacaggtgttggacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagt 16330113  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16330114 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgatt 16330213  T
Q  522 ccgagggatga 532  Q
    || ||||||||    
T  16330214 ccaagggatga 16330224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 122 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 10383943 - 10383530
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10383943 tggtcggaggtgtaggactcctttgtgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttg 10383844  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  10383843 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 10383744  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  10383743 gggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 10383644  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  10383643 ggcatatagagttggtttgccaccacacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatc 10383544  T
Q  522 ccgagggatgatga 535  Q
    ||||||||||||||    
T  10383543 ccgagggatgatga 10383530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 11961189 - 11961601
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || ||||   ||    
T  11961189 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatgtggttcatgagacgactgaaaaggtcaaaatg 11961288  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  11961289 ataagggaaaagatgaaggctttgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 11961388  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  11961389 gggtcactcctttgacgagtgtacgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagt 11961488  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11961489 ggcttatagagttgatttgcccccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgatt 11961588  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  11961589 ccaagagatgatg 11961601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Original strand, 12360697 - 12361107
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||    
T  12360697 tggtcggaggtgcaggactccattatgctggtttgagtcaggagagagtgctgtattgggaccagacttggttcatcggactacagagaaagtcaagatg 12360796  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  12360797 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 12360896  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || ||| || ||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  12360897 gagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagt 12360996  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12360997 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 12361096  T
Q  522 ccgagggatga 532  Q
    || || |||||    
T  12361097 ccaagagatga 12361107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 18134501 - 18134913
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||   ||    
T  18134501 tggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagataaagtcaaaatg 18134600  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||| ||| || || |    
T  18134601 atcggagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcttgtatttctga 18134700  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  18134701 gagttactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 18134800  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18134801 ggcttatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 18134900  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  18134901 ccaagagatgatg 18134913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 8759237 - 8759649
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  8759237 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 8759336  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8759337 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 8759436  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||    
T  8759437 gagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggt 8759536  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || | |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  8759537 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaactgcggaagtatgtagcagatccttcacatgttatt 8759636  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  8759637 ccgagagatgatg 8759649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 11303928 - 11304340
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||| || |||| ||||| || | | ||    
T  11303928 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgaatttgattcatcaggctacggagaaggtaaagatg 11304027  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  11304028 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctga 11304127  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||    ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  ||    
T  11304128 gagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaatagt 11304227  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11304228 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 11304327  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  11304328 cctagtgatgatg 11304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 41177496 - 41177084
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  41177496 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 41177397  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41177396 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 41177297  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||    
T  41177296 gagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggt 41177197  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  41177196 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttatt 41177097  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  41177096 ccgagagatgatg 41177084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 16836665 - 16837071
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | ||    
T  16836665 tggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatgagacgactgagaaggtcaagatg 16836764  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |    
T  16836765 ataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttga 16836864  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  16836865 gagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggt 16836964  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  16836965 gacatatagagttggtttgccaccacacc------acttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatcttatt 16837058  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  16837059 ccgagagatgatg 16837071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 10420200 - 10420612
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  10420200 tggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagaccacggagaaagtcaggatg 10420299  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |    
T  10420300 attagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctga 10420399  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  10420400 gggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagtcggaactgt 10420499  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  10420500 ggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcacatgttatt 10420599  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  10420600 ccgagagatgatg 10420612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13941998 - 13941586
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||| | ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  13941998 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 13941899  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13941898 atcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaa 13941799  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||    
T  13941798 gagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggt 13941699  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  13941698 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttatt 13941599  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  13941598 ccgagagatgatg 13941586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 44777221 - 44776809
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| | ||    
T  44777221 tggtcgaaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagacaggagaaagtgttgtgttgggaccagatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 44777122  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  44777121 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttccaagagggtgatcatgtatttctaa 44777022  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||    
T  44777021 gagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagaggatcggaacggt 44776922  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44776921 ggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 44776822  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  44776821 ccgagagatgatg 44776809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 531
Target Start/End: Original strand, 15953123 - 15953532
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  15953123 tggtcggaggtgcagaactcctttatgtttgtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 15953222  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  15953223 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctga 15953322  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |  | |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  15953323 gatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttcgtatcagatatctgagagggttggaacagt 15953422  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  15953423 ggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcattcgcatgttatt 15953522  T
Q  522 ccgagggatg 531  Q
    ||||| ||||    
T  15953523 ccgagagatg 15953532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 137 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14571807 - 14571410
Alignment:
Q  137 gactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatg 236  Q
    ||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||| || ||||||    
T  14571807 gactcctttgtgttggtttgaatcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagaccacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatg 14571708  T
Q  237 aaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttga 336  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  | || || |||||| |||    
T  14571707 aaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatga 14571608  T
Q  337 cgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttgg 436  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  14571607 cgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtggg 14571508  T
Q  437 tttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  14571507 cttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtacgtagcggatccttcgcatgttatcccgagagatgatg 14571410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 531
Target Start/End: Original strand, 16381083 - 16381491
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgtt--gggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggc 219  Q
    |||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |  |||||| || ||||||||||||||||| || || |||| |     
T  16381083 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgctggtttgagtccggagagagtgttatggttggggaccggatttggttcatgagactacagaaaaggtcaaga 16381182  T
Q  220 tgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcct 319  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  || ||||||||||| ||  |    
T  16381183 tgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaga---gttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtattttt 16381279  T
Q  320 aagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaact 419  Q
    ||| || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||     
T  16381280 aagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacg 16381379  T
Q  420 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtga 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  16381380 gtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagcttcggaaatatgtagcagatccttcgcatgtta 16381479  T
Q  520 ttccgagggatg 531  Q
    ||||||| ||||    
T  16381480 ttccgagagatg 16381491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15227607 - 15227211
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||||| || |||||  |||||||  | || ||||   ||||||| ||||||||||    
T  15227607 actccgttatgttggtttgagtcgagtgaaggtgtaatgttgggaccagatttagttcagcagactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatga 15227508  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||||||||| ||||    
T  15227507 aagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgac 15227408  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15227407 aggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggt 15227308  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  15227307 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatttcgagagatgatg 15227211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 123 - 534
Target Start/End: Original strand, 13322808 - 13323219
Alignment:
Q  123 ggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctga 222  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  13322808 ggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcaggtcagagtgctgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatga 13322907  T
Q  223 taagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaag 322  Q
    | |  || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  13322908 tcatagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttgggtttcaggagggagaccatgtgtttctgag 13323007  T
Q  323 ggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtg 422  Q
     || |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||  ||||||| |||    
T  13323008 agttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatattggagaggattggaacagtg 13323107  T
Q  423 gcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  13323108 gcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtattccatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccgtcgcatgttattc 13323207  T
Q  523 cgagggatgatg 534  Q
    | || |||||||    
T  13323208 caagagatgatg 13323219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 122 - 473
Target Start/End: Original strand, 12850434 - 12850785
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| | |||||  | |||||||   ||    
T  12850434 tggtcggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactacataaaaagtcaaattg 12850533  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||| || || |    
T  12850534 ataagagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctga 12850633  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||  || |||||||||||||| ||    
T  12850634 gagtcactcctgtgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaacagt 12850733  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttt 473  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12850734 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttggaatttgcatgatgtgttt 12850785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 532
Target Start/End: Original strand, 13972291 - 13972685
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | | ||||| ||   |||||    
T  13972291 actcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatga 13972390  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  13972391 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgac 13972490  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13972491 aggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttgga 13972590  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatga 532  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  13972591 ttaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 13972685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14086631 - 14086237
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | | ||||| ||   |||||    
T  14086631 actcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatga 14086532  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  14086531 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgac 14086432  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| || || ||||| ||||| || |||    
T  14086431 aggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggt 14086332  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatga 532  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | | |||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  14086331 ttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 14086237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12498184 - 12497800
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  12498184 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 12498085  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  12498084 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 12497985  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  12497984 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcat 12497885  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  12497884 ctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 12497800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17489708 - 17489416
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  17489708 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 17489609  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  17489608 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 17489509  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17489508 tcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 17489416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 47125824 - 47125713
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47125824 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 47125725  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  47125724 tgcgcctggtgt 47125713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10407848 - 10407737
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  10407848 atcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctttctgtgttactaa 10407749  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  10407748 tgcgcctggtgt 10407737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 391 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945034
Alignment:
Q  391 cgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttca 490  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||     
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 31945078  T
Q  491 gaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31945077 gaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 31945034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9522655 - 9522285
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || |   ||||    || ||||||||||| || ||||    
T  9522655 tggtttgagtcaggtgagagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacaga 9522556  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  9522555 gtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 9522456  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||    
T  9522455 agctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcat 9522356  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  9522355 cttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 9522285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 12510738 - 12510844
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12510738 agataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacgagtacaaaatgatgcctttcggtgttactaacgcgcc 12510837  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
    |||||||    
T  12510838 tggtgtg 12510844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Original strand, 14876771 - 14877077
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||  | || || |    
T  14876771 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtta 14876870  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  14876871 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 14876970  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  14876971 tcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 14877070  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  14877071 gatgatg 14877077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 393 - 534
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689190
Alignment:
Q  393 tatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcaga 492  Q
    |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 31689148  T
Q  493 agtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31689149 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 31689190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28756198 - 28756087
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28756198 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 28756099  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     ||||| |||||    
T  28756098 tgcgccgggtgt 28756087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41179400 - 41179290
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41179400 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 41179301  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    | || ||||||    
T  41179300 cacccggtgtg 41179290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44779125 - 44779016
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44779125 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 44779026  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    |||| |||||    
T  44779025 cgcccggtgt 44779016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Original strand, 16492453 - 16492745
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16492453 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16492552  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||| |  || ||||| | ||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16492553 ctcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgta 16492652  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16492653 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 16492745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 10418296 - 10418406
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10418296 catcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10418395  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  10418396 cgcctggtgtg 10418406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 11950159 - 11950269
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |    
T  11950159 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctttcggtgttactaatg 11950258  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  11950259 cgcctggtgtg 11950269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 12358778 - 12358888
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  12358778 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaag 12358877  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  12358878 cgcctggtgtg 12358888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15208827 - 15208457
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| ||| |||    
T  15208827 tggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtaga 15208728  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||  |  ||||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  15208727 gtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 15208628  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
     || |||||||  | ||| |||||||| | ||| ||||| ||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||  ||| |||| ||||| | ||| |||    
T  15208627 cgcattgaagtaaaagaagttgactccgaggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggagtatcgagtgggtttacaaccgcat 15208528  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  15208527 ctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15208457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16692096 - 16691726
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  |||||||||| ||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  16692096 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 16691997  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16691996 gtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 16691897  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |  || |||||  ||||||| |  || || || |||||||| ||||||||| | || || || ||||| |||    
T  16691896 tgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgggtcgtatcaaatatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcat 16691797  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16691796 ctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 16691726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 18132597 - 18132707
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  18132597 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 18132696  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  18132697 cgcctggtgtg 18132707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 8745641 - 8745744
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8745641 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 8745740  T
Q  113 cgcc 116  Q
    ||||    
T  8745741 cgcc 8745744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13943902 - 13943792
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13943902 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 13943803  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  13943802 cgcccggtgtg 13943792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 16327911 - 16328021
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  16327911 catcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaaca 16328010  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  16328011 cgcctggtgtg 16328021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 16379179 - 16379289
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16379179 catcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 16379278  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  16379279 cgcccggtgtg 16379289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 16834761 - 16834871
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  16834761 catcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16834860  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  16834861 cgcctggtgtg 16834871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17188252 - 17188142
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17188252 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 17188153  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  17188152 cgcctggtgtg 17188142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 15248109 - 15247734
Alignment:
Q  124 gtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgat 223  Q
    ||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    
T  15248109 gtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgat 15248010  T
Q  224 aagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagg 323  Q
        || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||  |   |||||||||||| || |||||||| ||  | ||     
T  15248009 tcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacaatgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgaga 15247910  T
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| | ||  ||||| |||||| |||  || || ||| ||||||| ||||    
T  15247909 gtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtgtattggtccgtattagatatcggaaagaattggaacggtgg 15247810  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    | ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| |||||    
T  15247809 cgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatgt 15247734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 11959420 - 11959530
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  11959420 catcagatgaaggtcaaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11959519  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  11959520 cgcctggtgtg 11959530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24189182 - 24189073
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  24189182 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatg 24189083  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  24189082 cgcctggtgt 24189073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Original strand, 16807108 - 16807504
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |   ||||    ||||| ||||    
T  16807108 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatga 16807207  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  16807208 aagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgac 16807307  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||  |  ||  | || ||||||||||  ||  | | | ||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  16807308 tggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttggaacggtggcgtatcgagtggga 16807407  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||| ||| |||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  16807408 ttaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaattatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 16807504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28754292 - 28754177
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  28754292 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgcgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattg 28754193  T
Q  222 ataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||    
T  28754192 ataagagaaaagatga 28754177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 13318753 - 13318863
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |    
T  13318753 catcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgccattcggtgttactaatg 13318852  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  13318853 cgcctggtgtg 13318863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 13970371 - 13970481
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  13970371 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 13970470  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  13970471 cgcctggtgtg 13970481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14088551 - 14088441
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  14088551 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 14088452  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  14088451 cgcctggtgtg 14088441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 14291783 - 14291893
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||  ||| || ||||||||||||||| |    
T  14291783 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttttggtcactatgaatataagatgatgcatttcggtgttactaatg 14291882  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  14291883 cgcctggtgtg 14291893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Original strand, 15725116 - 15725497
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||| || || ||||    ||||| ||||    
T  15725116 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaattc-ggatgatccaagagaaaatga 15725214  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  15725215 aggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgac 15725314  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  15725315 gggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 15725414  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || || || ||||||||||| |||||  | || || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  15725415 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15725497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 16826532 - 16826642
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  16826532 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttttggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16826631  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    || ||||||||    
T  16826632 cgtctggtgtg 16826642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 31693436 - 31693546
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  31693436 catcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31693535  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  31693536 cgcctggtgtg 31693546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16371349 - 16371000
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    |||||||||||||| |||||||    
T  16371349 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcaga 16371250  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||  | || ||  | || ||||||||| |||| ||||||||| |    
T  16371249 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaagaagactacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatg 16371150  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  16371149 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggacggtggcgtattgagtgggattaccaccgcat 16371050  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    |||||||| |||||||  || || ||||| || || |||| |||||||||    
T  16371049 ctttcgaatttgcatgtcgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 16371000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10906068 - 10905833
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  10906068 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 10905969  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  10905968 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 10905869  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  10905868 ccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 10905833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16635631 - 16635396
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  16635631 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 16635532  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  16635531 ctcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 16635432  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16635431 ccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 16635396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43162955 - 43162720
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  43162955 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 43162856  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  43162855 ctcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 43162756  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  43162755 ccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 43162720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12270088 - 12269991
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||| ||||||||||||||||||    
T  12270088 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaa 12269991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 399
Target Start/End: Original strand, 26792581 - 26792842
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  26792581 actccattatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 26792680  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||| ||||||||| ||||    
T  26792681 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgac 26792780  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcaga 399  Q
      |||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26792781 tagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcaga 26792842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Original strand, 53385212 - 53385584
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  53385212 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 53385311  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  53385312 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacg 53385411  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||    
T  53385412 tgctttgaagtcgaaaaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcat 53385511  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  53385512 ctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 53385584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 15348517 - 15348752
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  15348517 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 15348616  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  15348617 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 15348716  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  15348717 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 15348752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17492604 - 17492489
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| || | | ||    
T  17492604 tggtcggaggtgcaggactcctttaagctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatg 17492505  T
Q  222 ataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| |||||||    
T  17492504 ataagggaaaagatga 17492489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31940781 - 31940671
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  31940781 catcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31940682  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  31940681 cgcctggtgtg 31940671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10005458 - 10005223
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  10005458 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 10005359  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  10005358 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 10005259  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  10005258 ccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 10005223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 48425305 - 48425070
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  48425305 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 48425206  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  48425205 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 48425106  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  48425105 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 48425070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12180222 - 12180161
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtca 74  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12180222 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtca 12180161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Original strand, 16756779 - 16757151
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  16756779 tggtttgagtcagatgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcaga 16756878  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || || || ||  | ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  16756879 gtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 16756978  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||    
T  16756979 tgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcatattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcat 16757078  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  16757079 ctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtcattc 16757151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13252548 - 13252313
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  13252548 gagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 13252449  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  13252448 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 13252349  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  13252348 ccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 13252313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 15339217 - 15338838
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||| | ||||||||||| ||   | ||||    ||| | ||||    
T  15339217 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagcaaatga 15339118  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| | || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  15339117 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 15339018  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     || || |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||| ||||||| || || ||  |||| |||    
T  15339017 tggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggt 15338918  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    || || |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  15338917 ttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 15338838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 15589664 - 15589899
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  15589664 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 15589763  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  15589764 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 15589863  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  15589864 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 15589899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 457
Target Start/End: Original strand, 16412464 - 16412783
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | |||||| |||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  16412464 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 16412563  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  16412564 aagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgtaggaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgac 16412663  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  16412664 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 16412763  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaa 457  Q
    || || || |||||||||||    
T  16412764 ttaccgccgcatctttcgaa 16412783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Original strand, 15402692 - 15403017
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| ||   | ||||    ||||| ||||    
T  15402692 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagaaaatga 15402791  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  15402792 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagattttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 15402891  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     || || |||||||| |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||  |  || ||| ||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  15402892 tggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgatgttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggt 15402991  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || |||||||||||||| |||||    
T  15402992 ttaccgccacatctttcgaatttgca 15403017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 6600683 - 6600311
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  6600683 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcaga 6600584  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  | || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  6600583 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacg 6600484  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||  || | |||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||    
T  6600483 tgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcat 6600384  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  6600383 ctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 6600311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 20062326 - 20062561
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  20062326 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 20062425  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| || || |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  20062426 ctcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 20062525  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  20062526 ccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 20062561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Original strand, 15014030 - 15014124
Alignment:
Q  25 gtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctgg 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15014030 gtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctgg 15014124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15229481 - 15229371
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |    
T  15229481 catcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 15229382  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  15229381 cgcctagtgtg 15229371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15235349 - 15235239
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |    
T  15235349 catcagattaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 15235250  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  15235249 cgcctagtgtg 15235239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 463
Target Start/End: Original strand, 5425202 - 5425436
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || ||  |  | || ||||    
T  5425202 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgctt-tgagagtca 5425300  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||    
T  5425301 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctta 5425400  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  5425401 ccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 5425436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 8274565 - 8274820
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  8274565 tggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 8274664  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |    
T  8274665 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttga 8274764  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  8274765 gggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 8274820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 16742869 - 16743124
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || |||||||| || || || | | ||    
T  16742869 tggtcggaggtgtaggacaccgttttgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatg 16742968  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||  | |    
T  16742969 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtcaagttggtgatcatgtgtttttga 16743068  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  16743069 gggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16743124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Original strand, 15016008 - 15016135
Alignment:
Q  220 tgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcct 319  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||  |    
T  15016008 tgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttt 15016107  T
Q  320 aagggtcactcctttgacgggtgttgga 347  Q
     || ||||||||| |||| |||||||||    
T  15016108 gagagtcactcctgtgaccggtgttgga 15016135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Original strand, 11888614 - 11888680
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcatta 77  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11888614 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacatta 11888680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15261494 - 15261388
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||  || |||||    
T  15261494 agattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttagaaatgcgcc 15261395  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
     ||||||    
T  15261394 aggtgtg 15261388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15576724 - 15576469
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || |  |||||||| || || || | | ||    
T  15576724 tggtcggaggtgtagaacaccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgtttggaccggaagttgtgcgagagactacggaaaaggttaagatg 15576625  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||  | |    
T  15576624 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttga 15576525  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  15576524 gggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 15576469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 13975316 - 13975466
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  13975316 ggagaagatgaaggcatctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 13975415  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||  |||||||  ||||| |||||||||    
T  13975416 aatcctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcct 13975466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 534
Target Start/End: Original strand, 12854360 - 12854425
Alignment:
Q  469 tgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12854360 tgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 12854425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13001883 - 13001770
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||| || || |||| | ||    
T  13001883 tggtcggaggtgcaaaactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaatgtcaagttg 13001784  T
Q  222 ataagggagaagat 235  Q
    ||||| || |||||    
T  13001783 ataagagaaaagat 13001770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 16754961 - 16755054
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  16754961 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgt 16755054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17192962 - 17192877
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  17192962 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgt 17192877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 53383278 - 53383371
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  53383278 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgt 53383371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 15723194 - 15723290
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  15723194 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 15723290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17491720 - 17491624
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17491720 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcagtgttac 17491624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4678412 - 4678329
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactac 205  Q
    |||||| ||||| | |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4678412 tggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactac 4678329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6602606 - 6602513
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  6602606 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcaaaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgt 6602513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 16805207 - 16805300
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  16805207 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 16805300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3687813 - 3687717
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  3687813 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 3687717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 5423190 - 5423286
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  5423190 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 5423286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10007470 - 10007374
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  10007470 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 10007374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10908080 - 10907984
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  10908080 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 10907984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12888579 - 12888483
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  12888579 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 12888483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 5108871 - 5108964
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  5108871 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 5108964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 15346505 - 15346598
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  15346505 atcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 15346598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 15587652 - 15587745
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  15587652 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 15587745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 48427317 - 48427224
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  48427317 atcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 48427224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 14579668 - 14579764
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||| ||||| || |||| | | |||||||||||    
T  14579668 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaatgcggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgttcggtgttac 14579764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 15400785 - 15400873
Alignment:
Q  19 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  15400785 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 15400873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 20060314 - 20060410
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || |||||    
T  20060314 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttac 20060410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 16643 - 17055
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16643 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttaagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcagattg 16742  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  16743 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 16842  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16843 gggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagt 16942  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16943 ggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgatt 17042  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  17043 ccaagggatgatg 17055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 122
Target Start/End: Original strand, 14786 - 14848
Alignment:
Q  60 gacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14786 gacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgt 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 122 - 538
Target Start/End: Original strand, 38817 - 39233
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38817 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagcgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttg 38916  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  38917 ataaggaaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctga 39016  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  39017 gagtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagt 39116  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39117 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcacgaagtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatt 39216  T
Q  522 ccgagggatgatgatgt 538  Q
    | |||||||||||||||    
T  39217 cagagggatgatgatgt 39233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26637 - 26225
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26637 tggtcggaggtgtaggactcctttatgttggtttgagtcaggtgaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatgagactactgagaaagttaggttg 26538  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  26537 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 26438  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  26437 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggtgggaacagt 26338  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26337 ggcttatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatctttcgcatgtgatt 26238  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  26237 ccaagggatgatg 26225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43159 - 42747
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  43159 tggtcggaggtgtaggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatg 43060  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  43059 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctta 42960  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  42959 gggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagt 42860  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  42859 ggcttatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatctagcggatccttcacatgttatt 42760  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  42759 ccaagggatgatg 42747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Original strand, 49137 - 49547
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | ||    
T  49137 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatgagactacagaaaaagtcaagatg 49236  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  49237 atcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttctga 49336  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  49337 gggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgt 49436  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  49437 ggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 49536  T
Q  522 ccgagggatga 532  Q
    ||||| |||||    
T  49537 ccgagagatga 49547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 248989 - 248577
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  248989 tggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccgaacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatg 248890  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  248889 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 248790  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||    
T  248789 gggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggaaaagt 248690  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  248689 ggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttatt 248590  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  248589 ccaagggatgatg 248577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 250900 - 250794
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  250900 catcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 250801  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  250800 cgcctgg 250794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 5)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 124 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 20496 - 20088
Alignment:
Q  124 gtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgat 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||| | ||||    
T  20496 gtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaaaaaagtcaagatgat 20397  T
Q  224 aagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagg 323  Q
     || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |||    
T  20396 tagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagg 20297  T
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    || |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20296 gttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtgg 20197  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20196 cctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcc 20097  T
Q  524 gagggatga 532  Q
    ||| |||||    
T  20096 gagagatga 20088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 43881 - 43471
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  43881 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatg 43782  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  43781 atcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctga 43682  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43681 gggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgt 43582  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  43581 ggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 43482  T
Q  522 ccgagggatga 532  Q
    | ||| |||||    
T  43481 cagagagatga 43471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 44893 - 44483
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  44893 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatg 44794  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  44793 atcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctga 44694  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44693 gggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgt 44594  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44593 ggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 44494  T
Q  522 ccgagggatga 532  Q
    | ||| |||||    
T  44493 cagagagatga 44483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 334 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36021
Alignment:
Q  334 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 433  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  434 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatga 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtttttccgagagatga 36021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22154 - 22044
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22154 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 22055  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    | |||||||||    
T  22054 cacctggtgtg 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 13831 - 14243
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  13831 tggtcggagatgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatg 13930  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||    
T  13931 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaa 14030  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||    
T  14031 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaacagt 14130  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14131 ggcatatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 14230  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  14231 ccgagagatgatg 14243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 463
Target Start/End: Original strand, 4883 - 5224
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  4883 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaagagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcattagactacagagaaagtcaagatg 4982  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| || || |    
T  4983 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctga 5082  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  5083 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagt 5182  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5183 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 2979 - 3089
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  2979 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 3078  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  3079 cgcctggtgtg 3089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 69650 - 69540
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  69650 catcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 69551  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  69550 cgcctggtgtg 69540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 21601 - 22013
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  21601 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagtgggtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatg 21700  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || || |    
T  21701 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtaaccatgtatttctga 21800  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||||||| ||    
T  21801 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtccgtataagatatcggagagggttggaacagt 21900  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  21901 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcggatgttatt 22000  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  22001 ccgagagatgatg 22013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 9487 - 9597
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9487 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 9586  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  9587 cgcctggtgtg 9597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 19701 - 19811
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19701 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacg 19800  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19801 cgcctggtgtg 19811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26077 - 25991
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||||||| || || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  26077 ggagaagatgaaggcgtctcatagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 25991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 42263 - 42675
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  42263 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 42362  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  42363 atcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 42462  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42463 gggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgt 42562  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42563 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 42662  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  42663 ccgagagatgatg 42675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 47329 - 47741
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  47329 tggtcggaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 47428  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  47429 atcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 47528  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47529 gggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgt 47628  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  47629 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 47728  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  47729 ccgagagatgatg 47741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 40357 - 40468
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40357 atcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaa 40456  T
Q  111 cgcgcctggtgt 122  Q
     |||||||||||    
T  40457 tgcgcctggtgt 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 45453 - 45563
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  45453 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 45552  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  45553 cgcctggtgtg 45563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4196 - 4100
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || || ||||||| | |||||||||||||    
T  4196 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttac 4100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 195633 - 196044
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  195633 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 195732  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || |  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  195733 atcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgttttc-tga 195831  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  195832 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagt 195931  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  195932 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 196031  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  196032 ccgagagatgatg 196044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 148946 - 148534
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||    
T  148946 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaggatg 148847  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| || || |    
T  148846 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctga 148747  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||| ||    
T  148746 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagagggttggaacagt 148647  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  148646 ggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 148547  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  148546 ccaagagatgatg 148534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 327 - 534
Target Start/End: Original strand, 68575 - 68782
Alignment:
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcat 426  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||    
T  68575 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcat 68674  T
Q  427 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgag 526  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  68675 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgag 68774  T
Q  527 ggatgatg 534  Q
     |||||||    
T  68775 agatgatg 68782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 26572 - 26861
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || || || ||||| || ||  | || || ||||    
T  26572 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagttactc 26671  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| ||||||||||| || |||||||  | ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||| ||||| ||| |    
T  26672 ctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattggcccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcgtatcg 26771  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  26772 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 26861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 150849 - 150739
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || || || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  150849 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 150750  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  150749 cgcctagtgtg 150739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 24557 - 24669
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24557 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 24656  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  24657 tgcgccaggtgtg 24669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 121985 - 122135
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  121985 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtg 122084  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  122085 aatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 122135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 7)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 117944 - 117532
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||| | ||    
T  117944 tggtcggaggtgtaagactcctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcatactacggagaaagtcaagatg 117845  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  117844 atcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 117745  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  117744 gggttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagt 117645  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  117644 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 117545  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  117544 ccgagagatgatg 117532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 125 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 323077 - 322668
Alignment:
Q  125 tcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgata 224  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||     
T  323077 tcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtccggatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgatc 322978  T
Q  225 agggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaaggg 324  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || || |    
T  322977 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagag 322878  T
Q  325 tcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggc 424  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||  ||||    
T  322877 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttggaacaatggc 322778  T
Q  425 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccg 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||     
T  322777 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagtggatccttcgcatgttattcca 322678  T
Q  525 agggatgatg 534  Q
    || |||||||    
T  322677 agagatgatg 322668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 386195 - 385783
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| || | | ||    
T  386195 tggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcattagactacggagaaggttaagatg 386096  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| | || || |    
T  386095 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttcaagagggagatcatctatttctga 385996  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | |||||||||  ||||||||| ||  |||| |||||||  | ||| |||||||| ||||| || ||  | || ||||  || |||||||||||||| ||    
T  385995 gagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccagatatctgagagagttggaacagt 385896  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  385895 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgatt 385796  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||| | |||||||    
T  385795 ccgtgagatgatg 385783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 203398 - 203810
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |  | |||||  |||||||  | || || | |||     
T  203398 tggtcggaggtgcagaactctgttatgttggtttgagtcgggtgagagtgtagtgttgggaccgaatattgttcaccagactacataaaaggttaagcta 203497  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||    
T  203498 ataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaa 203597  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||| | |||| |||| ||| ||||| |||||| | | ||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||| ||    
T  203598 gagtcactcttgtgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagt 203697  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  203698 ggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtattggatccatcgcatgtgatt 203797  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||    
T  203798 ccgagggatgatg 203810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 112397 - 111985
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||  | |||| |||||| || | | ||    
T  112397 tggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggagagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactattgagaaggttaagttg 112298  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||| ||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||  | |    
T  112297 atccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttga 112198  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||    
T  112197 gagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggt 112098  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||     
T  112097 ggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtttcggatccatctcatgtgatc 111998  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  111997 ccaagagatgatg 111985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 324984 - 324874
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  324984 catcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 324885  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  324884 cgcctggtgtg 324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 201494 - 201604
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||     
T  201494 catcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaaca 201593  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  201594 cgccgggtgtg 201604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 231 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16943 - 16640
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16943 aagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 16844  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16843 ctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatag 16744  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggat 530  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16743 tgttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggat 16644  T
Q  531 gatg 534  Q
    ||||    
T  16643 gatg 16640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 25795 - 26207
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || | | ||    
T  25795 tggtcggaggtgcaagaatcctttatgctggtttgagttaggagagagtgttgtgctgggaccggatttggtccatcagactacggagaaggtaaagatg 25894  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  25895 ataagggaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctga 25994  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| | || |||||||| ||    
T  25995 gagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagt 26094  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  26095 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaacttcggaaatatgtagcggatccttcgcatgttatt 26194  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  26195 ccaagagatgatg 26207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 13291 - 13703
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  13291 tggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatg 13390  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  13391 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctaa 13490  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  13491 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagt 13590  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13591 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 13690  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  13691 ccgagagatgatg 13703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 17061 - 17473
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  17061 tggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatg 17160  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  17161 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctta 17260  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  17261 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagt 17360  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17361 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 17460  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  17461 ccgagagatgatg 17473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 20359 - 19947
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||| ||| | ||    
T  20359 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtcttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaactcaagatg 20260  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  20259 ataagggaaaagatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctga 20160  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  20159 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagt 20060  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  20059 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcctttgcatgttatt 19960  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  19959 ccaagagatgatg 19947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 10083 - 10193
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  10083 catcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 10182  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  10183 cgcctagtgtg 10193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 11264 - 10852
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  11264 tggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatg 11165  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  11164 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctta 11065  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  11064 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagt 10965  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10964 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 10865  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  10864 ccgagagatgatg 10852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 329 - 741
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  329 tggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcatcagactacagagaaagtcaagatg 428  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  429 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctta 528  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  529 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 628  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  629 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcctttgcatgttatt 728  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  729 ccaagagatgatg 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 14486 - 14425
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtca 74  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14486 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtca 14425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 7845 - 7995
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | || ||     
T  7845 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtg 7944  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  7945 aatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19496 - 19084
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  19496 tggtcggaggtgcaggactcctttattctggtttgagtcaggatagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 19397  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |    
T  19396 atcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttcaggatggtgatcatgtatttctga 19297  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  19296 gggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcagatatcggagagggttggaacagt 19197  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  19196 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgttatt 19097  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||| | |||||||    
T  19096 ccgggagatgatg 19084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21400 - 21291
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || || || ||||  ||||||||||||||||| |    
T  21400 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctttcggtgttactaatg 21301  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  21300 cgcctggtgt 21291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 454
Target Start/End: Original strand, 58445 - 58668
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || | |||||    
T  58445 aagatgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactc 58544  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | |||| |||||||||| |||  |||| || | |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| || || || |||||    
T  58545 atgtgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatag 58644  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttc 454  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  58645 agtgggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 534
Target Start/End: Original strand, 59030 - 59114
Alignment:
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||| || ||||||  ||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  59030 ctttcaaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggatgtatgtttcggatccatctcatgtgattccaagagatgatg 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 123 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 62
Alignment:
Q  123 ggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctga 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  473 ggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatga 374  T
Q  223 taagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaag 322  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  373 taagggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgag 274  T
Q  323 ggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtg 422  Q
     || |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  273 agttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtg 174  T
Q  423 gcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  173 gcatacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatgtagcggatccttcgcatgttattc 74  T
Q  523 cgagggatgatg 534  Q
    | || |||||||    
T  73 caagagatgatg 62  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 7)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 52109 - 52521
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  52109 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 52208  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  52209 atcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctga 52308  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||  | || |||||||| ||    
T  52309 gggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagt 52408  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  52409 ggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 52508  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  52509 ccgagagatgatg 52521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 61143 - 61555
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  61143 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 61242  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  61243 atcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctga 61342  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||  | || |||||||| ||    
T  61343 gggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagt 61442  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  61443 ggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 61542  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  61543 ccgagagatgatg 61555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 502
Target Start/End: Original strand, 67531 - 67911
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  67531 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 67630  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  67631 atcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctga 67730  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||  | || |||||||| ||    
T  67731 gggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagt 67830  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagc 502  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  67831 ggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagc 67911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 28902 - 28792
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  28902 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 28803  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  28802 cgcctggtgtg 28792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 59240 - 59350
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  59240 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 59339  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  59340 cgcccggtgtg 59350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 50206 - 50316
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  50206 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 50305  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  50306 cgcccggtgtg 50316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 65628 - 65738
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  65628 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaca 65727  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  65728 cgcccggtgtg 65738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 57747 - 58158
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||  |||| | ||    
T  57747 tggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagagggtcaagatg 57846  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||  | |    
T  57847 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttga 57945  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  57946 gagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatcagatttcagagaggattggaacggt 58045  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  58046 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 58145  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  58146 ccgagagatgatg 58158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 48963 - 49375
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  48963 tggtcggaggtgcagaactcctttatgttggttcgagtcacgtgaaagtgtggtattgggactggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatg 49062  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||  ||||||| || || |    
T  49063 ataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggaaatcatgtgtttctga 49162  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || || ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |     
T  49163 gagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagc 49262  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  49263 ggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 49362  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  49363 ccgagagatgatg 49375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 47060 - 47170
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  47060 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 47159  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  47160 cgcctggtgtg 47170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 55873 - 55982
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  55873 catcaaattcaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatg 55972  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  55973 cgcctggtgt 55982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 260684 - 260272
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||| | ||    
T  260684 tggtcggaggtgcaggactctgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatg 260585  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |    
T  260584 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttga 260485  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||| ||    
T  260484 gagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattagaacggt 260385  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  260384 ggcatatagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 260285  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  260284 ccgagagatgatg 260272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Original strand, 164667 - 165039
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  164667 tggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcaga 164766  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||  | || ||||||| | |||| |||||||||||    
T  164767 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacg 164866  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||| |||    
T  164867 tgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcat 164966  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| | || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  164967 ctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattc 165039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 262504 - 262394
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  262504 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 262405  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  262404 cgcctggtgtg 262394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 533
Target Start/End: Original strand, 278872 - 279171
Alignment:
Q  234 atgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctt 333  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||||     
T  278872 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctg 278971  T
Q  334 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 433  Q
    |||| ||||| ||||  || |||||||| | ||| |||||||| |  || || || ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  278972 tgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 279071  T
Q  434 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgat 533  Q
     || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  279072 gggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgat 279171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 308958 - 308694
Alignment:
Q  199 agactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 298  Q
    ||||||||||||||||  || ||||    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  308958 agactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 308859  T
Q  299 agagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcag 398  Q
    ||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || || || ||||| ||||| |||||||||    
T  308858 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaaagtttattggtccgtatcag 308759  T
Q  399 acttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    |  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  308758 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 308694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 10013 - 10425
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  10013 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgggtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 10112  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  10113 atcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 10212  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10213 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatcagagttcagaaagagttggaactgt 10312  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | | |||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  10313 ggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttatt 10412  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  10413 ccaagagatgatg 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 14181 - 14593
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||  |||| ||||| | ||    
T  14181 tggtcggaggtgcaggactcctttatcctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggtttatcagactatagagatagtcaagatg 14280  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || |  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  14281 atcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagttttaggagggtgatcatgtatttctga 14380  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  14381 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 14480  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  14481 ggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttatt 14580  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
     |||| |||||||    
T  14581 tcgagagatgatg 14593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 354 - 534
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9219
Alignment:
Q  354 ttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 453  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  454 cgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttatttcgagagatgatg 9219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12435
Alignment:
Q  37 gatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtg 12435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3127 - 2715
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||| | ||    
T  3127 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacaacagagaaagtcaagatg 3028  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||  | |    
T  3027 ataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtatttatga 2928  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  2927 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagt 2828  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  2827 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagaagatccttcgcatgttatt 2728  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  2727 ccaagagatgatg 2715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5029 - 4919
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  5029 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 4930  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  4929 cgcctggtgtg 4919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Original strand, 42131 - 42235
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||    |||| ||||||||||||||||||    
T  42131 atcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaa 42230  T
Q  111 cgcgc 115  Q
    |||||    
T  42231 cgcgc 42235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27895 - 27483
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  27895 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccagattcggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 27796  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || |  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  27795 atcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggagatcatgtgtttctga 27696  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| ||    
T  27695 gagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtataagatatcagagagggttggaacagt 27596  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27595 ggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 27496  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  27495 ccaagagatgatg 27483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 1079 - 1490
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| | || | ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||| | ||    
T  1079 tggtcggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaagagaaaatgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacgaagaaagtcaagatg 1178  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  1179 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 1278  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |  ||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  1279 gaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtt-attggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 1377  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1378 ggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 1477  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  1478 ccgagagatgatg 1490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37928 - 37818
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |    
T  37928 catcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgccttacggtgttactaatg 37829  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  37828 cgcctggtgtg 37818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 12711 - 13123
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| | ||    
T  12711 tggtcggaggtgcaggactcttttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattaggaccagatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatg 12810  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |    
T  12811 ataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttga 12910  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||  |||||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||    
T  12911 gagttactccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtccgtattagatttcagagaggattggaacggt 13010  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  13011 ggcatacagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagtggatccttcgcatgttatt 13110  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  13111 ccgagagatgatg 13123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 10812 - 10922
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10812 catcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 10911  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  10912 cgcctggtgtg 10922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 122 - 511
Target Start/End: Original strand, 1454 - 1843
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||| | ||    
T  1454 tggtcggaggtgcaagactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagactagagagaaagtcaagatg 1553  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||  ||||||||||| | ||  |||||||| || |  |    
T  1554 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttgagtttcaggtggaagatcatgtatttcgga 1653  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||||||| ||    
T  1654 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtccgtatcagatatcagaaagggttggaacagt 1753  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttc 511  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  1754 ggcatatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggattcttc 1843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6293 - 6001
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  6293 gagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 6194  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    | ||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||  || || |||||||| || ||||| ||    
T  6193 cacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgta 6094  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  6093 tcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 6001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23042 - 22879
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||  | || || |||||||| || || || | | ||||   |||||||||||| |  || ||||    
T  23042 tggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcaga 22943  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  22942 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 22879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8302 - 8206
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  8302 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttac 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 122 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 47500 - 47091
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  47500 tggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatg 47401  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  47400 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 47301  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  47300 gggttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 47201  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  47200 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaacagatccttcgcatgttatt 47101  T
Q  522 ccgagggatg 531  Q
    ||||| ||||    
T  47100 ccgagagatg 47091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 49384 - 49274
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| ||||||||| |||||||| |    
T  49384 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatg 49285  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  49284 cgcctggtgtg 49274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 27601 - 27192
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  27601 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcaggagaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatg 27502  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||  ||||||| || || |    
T  27501 ataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtaggaaggc-cttgaatttcaagagggatatcatgtatttctga 27403  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  27402 gagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaaccgt 27303  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27302 ggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatgtagcggatccttcgcatgttatt 27203  T
Q  522 ccgagggatga 532  Q
    ||||| |||||    
T  27202 ccgagagatga 27192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 7168 - 7576
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||||| | ||    
T  7168 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgtgtcaggagagggtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagtctacagagaaagtcaagatg 7267  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || || |    
T  7268 atcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttaagtttcaggagggtgatcatgtatttctga 7367  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| ||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  7368 gggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaga-ag-gttggaacagt 7465  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||    
T  7466 ggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtagcgga--cttcgcatgttatt 7563  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  7564 ccaagagatgatg 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 16214 - 16285
Alignment:
Q  52 gcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214 gcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 16285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 95932 - 96344
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  95932 tggtcggaggtgtagaactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggacttggttcatgagactacggagaaagttagggtg 96031  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |    
T  96032 atcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttttga 96131  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  96132 gggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgt 96231  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  96232 ggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcacatgttatt 96331  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  96332 ccgagagatgatg 96344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 232 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 112825 - 112523
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||    
T  112825 agatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcc 112726  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatataga 431  Q
    | |||| ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  112725 tatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagg 112626  T
Q  432 gttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatg 531  Q
    || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| | | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  112625 gtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattccaagagatg 112526  T
Q  532 atg 534  Q
    |||    
T  112525 atg 112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 522
Target Start/End: Original strand, 109757 - 110141
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  109757 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 109856  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  109857 aagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgac 109956  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    
T  109957 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 110056  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    || || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  110057 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccctctcatgtaattc 110141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 94920 - 95030
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  94920 catcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 95019  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  95020 cgccgggtgtg 95030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 114839 - 114729
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  114839 catcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 114740  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  114739 cgcctggtgtg 114729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 127 - 534
Target Start/End: Original strand, 1104 - 1511
Alignment:
Q  127 ggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataag 226  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| | | |||||    
T  1104 ggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttatgttgggaccggatttggttcattagactacggagaaggtcaagataataag 1203  T
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
     || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||     
T  1204 agaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtt 1303  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcat 426  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  1304 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcat 1403  T
Q  427 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgag 526  Q
    | | | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  1404 aaaaaataggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgaatgttattccgag 1503  T
Q  527 ggatgatg 534  Q
     |||||||    
T  1504 agatgatg 1511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 18467 - 18879
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  18467 tggtcggaggtgcaaaactcctttatgttgatttgagtcaggagaaagtgtagagttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatg 18566  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  18567 ataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 18666  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||   ||||||||  |||||||| ||| |||| ||    
T  18667 gagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtttgtatcagatatcagagagggttagaacagt 18766  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18767 ggcatacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 18866  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    | ||| |||||||    
T  18867 cggagagatgatg 18879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 534
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3697
Alignment:
Q  466 atgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  3629 atgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatg 3697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 138 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5110 - 4770
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  5110 actcctttataatggtttgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatga 5011  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||| ||||    
T  5010 aagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgac 4911  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  4910 gggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtccgtataagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 4811  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 478  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4810 ttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgt 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7030 - 6920
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  7030 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 6931  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||| ||||    
T  6930 cgcctgatgtg 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 31786 - 31374
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| | || ||||||||| | |||||  ||||||||| | ||    
T  31786 tggtcggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagttaggagaaagcgttgtgttgggatcggatttggttcatcaaactacatagaaagtcaagatg 31687  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||  ||||||| || || |    
T  31686 atcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtgtttctga 31587  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || ||| || |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || || ||  ||||||| ||    
T  31586 gagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgataggtttggaacagt 31487  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31486 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttttttgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 31387  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  31386 ccgagagatgatg 31374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33614 - 33504
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  33614 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 33515  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  33514 cgcctggtgtg 33504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14309 - 14037
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || ||  | ||  | |  ||||    
T  14309 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatagtca 14210  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | | | |||||||| |  || ||||| | |||| |||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  14209 ctcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttattggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 14110  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgta 500  Q
    | ||||  | || ||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  14109 tcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaacttccgaagtatgta 14037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 40114 - 39703
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||| | |     
T  40114 tggtcggaggtgca-gactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtattgggaccggatttggttcatcagactaacgagaaagtcaagatt 40016  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  40015 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatttctga 39916  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| ||||| ||  | ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || ||||| |||||||| ||    
T  39915 gagttactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatccgatatctgagagggttggaacagt 39816  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  39815 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtagcggatccttctcatgttatt 39716  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  39715 ccgagagatgatg 39703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41976 - 41866
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| ||||||||| |||||||| |    
T  41976 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatg 41877  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  41876 cgcctggtgtg 41866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 51369 - 51465
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | |||||| ||||||||    
T  51369 atcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgccttttggtgttac 51465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 122 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 6560 - 6158
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6560 tggtcggaggtgcaggactcctttatgcttgtttgagttgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaagatg 6461  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatg-ttttccta 320  Q
    || |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||     
T  6460 atcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttcctg 6361  T
Q  321 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactg 420  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  6360 agggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagatttggaactg 6261  T
Q  421 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||  | | |||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  6260 tggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgttat 6161  T
Q  521 tcc 523  Q
    |||    
T  6160 tcc 6158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 9900 - 10010
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9900 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 9999  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  10000 cgccaggtgtg 10010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 18509 - 18619
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18509 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 18608  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  18609 cgccaggtgtg 18619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 90862 - 91274
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  90862 tggtcggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagcgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatg 90961  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  90962 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 91061  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||| ||| | || ||| |||  || ||||| |||||||| ||    
T  91062 gagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtccatattagatatctgagagggttggaacagt 91161  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  91162 ggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactgcggaagtatgtagcaaatccttcgcatgttatt 91261  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  91262 ccgagagatgatg 91274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 515379 - 515488
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  515379 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 515478  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  515479 cgcctggtgt 515488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 235 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 162376 - 162091
Alignment:
Q  235 tgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactccttt 334  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||| |  || || || ||  | || ||||||||| |    
T  162376 tgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgtatttttgagagtcactcctat 162277  T
Q  335 gacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagtt 434  Q
    ||| ||||||||||| || | |||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||     
T  162276 gactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtg 162177  T
Q  435 ggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  162176 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatgttccggatccatcccatgtgat 162091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 453239 - 453349
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || || || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  453239 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 453338  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  453339 cgcctggtgtg 453349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 448407 - 448037
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||  |||||||    
T  448407 tggttcgagtcaggtgagagtgtggttttttgaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcaga 448308  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| || ||  | || ||||||||| | ||   |||||||||    
T  448307 gtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactattgttggacg 448208  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |  || || ||| ||||||| |||||  ||  ||| ||||| ||||| |||    
T  448207 agcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttaccaccgcat 448108  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||| |  ||||||| || ||||||||    
T  448107 ctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtattttccggatccatctcatgtgat 448037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 495293 - 495188
Alignment:
Q  18 gattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcct 117  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| || |||||     
T  495293 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 495194  T
Q  118 ggtgtg 123  Q
    ||||||    
T  495193 ggtgtg 495188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Original strand, 78666 - 78750
Alignment:
Q  229 agaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||||| || || |||| | | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  78666 agaagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 78750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10169 - 9762
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  10169 tggtcggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatg 10070  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |     ||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  10069 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggacg-----tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 9975  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| || ||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  9974 gagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagt 9875  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9874 ggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 9775  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  9774 ccgagagatgatg 9762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12073 - 11963
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  12073 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11974  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  11973 cgcctggtgtg 11963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16923 - 16827
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16923 atcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 16827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 124 - 534
Target Start/End: Original strand, 51795 - 52205
Alignment:
Q  124 gtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgat 223  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||    
T  51795 gtcggaggtgcatgactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcaaactacggagaaggtcaagatgat 51894  T
Q  224 aagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagg 323  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||     
T  51895 aagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgaga 51994  T
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| | ||| || |||||||  || || || |||||||| ||||    
T  51995 gtcactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtgg 52094  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  52095 catacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtagctgatcattcgcatgttattcc 52194  T
Q  524 gagggatgatg 534  Q
     || |||||||    
T  52195 aagagatgatg 52205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 49905 - 50011
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  49905 agattaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcc 50004  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
    |||||||    
T  50005 tggtgtg 50011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4251 - 3839
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  4251 tggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatg 4152  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  4151 ataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 4052  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
      ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  4051 tagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagtgttggaacagt 3952  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3951 ggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggttccttcgcatgttatt 3852  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || || |||||||    
T  3851 ccaagagatgatg 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26518 - 26106
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || || | ||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  26518 tggtcggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtcgggagaaaatgtagtgttgggagcggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatg 26419  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  | |    
T  26418 ataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttga 26319  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||    
T  26318 gagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagt 26219  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| || || |||    
T  26218 ggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcaagttatt 26119  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    | ||| |||||||    
T  26118 ctgagagatgatg 26106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28805 - 28696
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |    
T  28805 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 28706  T
Q  113 cgcctggtgt 122  Q
    ||||||||||    
T  28705 cgcctggtgt 28696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 176 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14407 - 14050
Alignment:
Q  176 gttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaag 275  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14407 gttgggaccggatttggttcatcagactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaag 14308  T
Q  276 cgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactc 375  Q
    |  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  14307 catagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactc 14208  T
Q  376 ctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttca 475  Q
    | ||||| || ||  ||||  |||  || || || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14207 cgaagtttatcggttcgtactagatatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttca 14109  T
Q  476 tgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14108 tgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagggatgatg 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16392 - 16282
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  16392 catcagattaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 16293  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  16292 cgcctggtgtg 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 4267 - 3866
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||| ||||| | ||||||| |||  |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || || ||| || ||||||| |||||||||| | ||    
T  4267 tggtcgaaggtgcaggactcctatatattggtttgagtcaagagaaagtgtagtgttgggaccggatttagtttatcagactacggagaaagtcaagatg 4168  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||| || || |    
T  4167 ataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagatggagatcatgtgtttctga 4068  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||| |||||||| ||    
T  4067 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatcagatatctgagagggttggaacagt 3968  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3967 ggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatt 3868  T
Q  522 cc 523  Q
    ||    
T  3867 cc 3866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 270 - 534
Target Start/End: Original strand, 4217 - 4481
Alignment:
Q  270 gacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaat 369  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  4217 gacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagt 4316  T
Q  370 tgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 469  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4317 tgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 4416  T
Q  470 gtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4417 gtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatg 4481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 5844 - 6255
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||| | | ||||| || || |||| | ||    
T  5844 tggtcggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcgtcaaactacagaaaaggtcaagttg 5943  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||| || || |    
T  5944 ataagagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctga 6043  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||  || |||||||||||||||||    
T  6044 gggttactcctatgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgt 6143  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  6144 ggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgt-tttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagaggatccttcgcatgttatt 6242  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  6243 ccgagagatgatg 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 168 - 534
Target Start/End: Original strand, 7012 - 7378
Alignment:
Q  168 agtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttacc 267  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||| || || |||| | ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  7012 agtgtggtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaaggtcaagttgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatc 7111  T
Q  268 atgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaa 367  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||    
T  7112 atgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaa 7211  T
Q  368 attgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgat 467  Q
     |||||||| ||||||||||| || || ||||  || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7212 gttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgat 7311  T
Q  468 gtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  7312 gtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcaagttattccaagagatgatg 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 5115 - 5225
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||| |    
T  5115 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataagatgatgtctttcggtgttactaatg 5214  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  5215 cgcctggtgtg 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 11145 - 10837
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  11145 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagttaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatg 11046  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || || || |||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  11045 atcagagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctta 10946  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |||| ||| || ||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  10945 gggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagaggattggaacagt 10846  T
Q  422 ggcatatag 430  Q
    ||| |||||    
T  10845 ggcctatag 10837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 10831 - 10788
Alignment:
Q  491 gaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10831 gaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 10788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 4932 - 5344
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||  || || ||||| ||||||| |||| | || |||||| |||| || ||||| |||| | ||    
T  4932 tggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtggggagaaagtgtggtgttggaaccatatttagttcatcagaccacggagaaggtcaagatg 5031  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  5032 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 5131  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    |  |||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||  ||  |||| ||||||||  |    
T  5132 gaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttcgtatcagatatctaagagggttggaacact 5231  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  5232 ggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcagatcattcgcatgttatt 5331  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    ||||| |||||||    
T  5332 ccgagagatgatg 5344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 37578 - 37166
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| | | ||    
T  37578 tggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcaggagaaactgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagttaagatg 37479  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||| | | |||||||| || || |    
T  37478 ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattgagtttcaagggagagatcatgtgtttctta 37379  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||  || || || |||||||| ||    
T  37378 gagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtctatatcagatatctgaaagggttggaacagt 37279  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  37278 ggcatacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgttacatgtctcgcaacttcggaagtatgtagtggatccttcacatgttatt 37179  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    | ||| |||||||    
T  37178 ctgagagatgatg 37166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 122 - 418
Target Start/End: Original strand, 38103 - 38400
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggttt-gagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggct 220  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||| |||||||||| | |    
T  38103 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttgaatcatcagactacggagaaagtcaagat 38202  T
Q  221 gataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttccta 320  Q
    ||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  38203 gattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 38302  T
Q  321 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaac 418  Q
    || || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||  || || ||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  38303 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaac 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 51090 - 50980
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  51090 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 50991  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  50990 cgcctggtgtg 50980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 418
Target Start/End: Original strand, 27376 - 27563
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  27376 aagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactc 27475  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaac 418  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||  || || ||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  27476 ctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaac 27563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31227 - 31131
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || || || ||||| | |||||||||||||||    
T  31227 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttac 31131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 25001 - 25413
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| |  ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || || || | |||     
T  25001 tggtcggaggtgcagaactccgttctgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacagaaaaggttaagcta 25100  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| || || || |||||||| |||||||  || || ||||| || ||||    
T  25101 ataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatcttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaa 25200  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |  | ||| |||||| |||||||||  || || ||||||||||| ||    
T  25201 gagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattggctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagt 25300  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  25301 ggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcacatgtgatt 25400  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  25401 ccaagggatgatg 25413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 377
Target Start/End: Original strand, 16211 - 16356
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| | || |||||||  || |||||||| ||  ||||||| | |||    
T  16211 agatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatatagactttcaagttggggatcatgtgtttttaagggtgaatcc 16310  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||||| | ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  16311 tgtgaccggtgtttgtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 119 - 534
Target Start/End: Original strand, 10667 - 11081
Alignment:
Q  119 gtgtggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcagg 218  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||  | |||||  ||||||| ||||| | ||      
T  10667 gtgtggtcggaggtgcagaactccgttacgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacagagaaggccaat 10766  T
Q  219 ctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcc 318  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||      
T  10767 -tgataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttt 10865  T
Q  319 taagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaac 418  Q
    | || ||||||||| |||| ||| | || ||||||||||| |||| ||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||  || |||| |||||||||    
T  10866 tgagagtcactcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaac 10965  T
Q  419 tgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtg 518  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  10966 agtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtt 11065  T
Q  519 attccgagggatgatg 534  Q
    ||||| || |||||||    
T  11066 attccaagagatgatg 11081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 8873 - 8944
Alignment:
Q  52 gcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8873 gcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtg 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 4915 - 4959
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggccttt 57  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4915 catctgattaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacagccttt 4959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 155
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  461 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttttctgagggtta 362  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  361 ctcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaactgtggcata 262  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||  | | |||||||||| | |||||||| ||||| ||| | ||     
T  261 tagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgttatttcaaga 162  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  161 gatgatg 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 122 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5589 - 5312
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||| | ||    
T  5589 tggtcggaagtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatg 5490  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |    
T  5489 ataaggaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttga 5390  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcaga 399  Q
    | || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5389 gagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcaga 5312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 904 - 492
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||| || || || | | ||    
T  904 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttg 805  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    |||||  |  |||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  804 ataagaaaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 705  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | || |||||| |||| ||||| ||  |||| || || || | ||| |||||||| ||||| || || |||||||| | ||||||||| |||||||| ||    
T  704 gagttactcctatgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagt 605  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  604 ggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcggaacttccaaagtatgtagcggatccttcacatgttatt 505  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
     | || |||||||    
T  504 tctagagatgatg 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 44443 - 44553
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  44443 catcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 44542  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  44543 cgcctggtgtg 44553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24491 - 24388
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgc 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24491 cagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgc 24392  T
Q  116 ctgg 119  Q
    ||||    
T  24391 ctgg 24388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 339 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136083
Alignment:
Q  339 ggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 438  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  439 tgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcggatgttatcccgagagatgatg 136083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 122 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 7
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||    
T  246 tggtcggaggtgcaggactccattatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatg 147  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  146 ataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 47  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtc 361  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46 gagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtc 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2149 - 2039
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| ||||||||||| |||||| |    
T  2149 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgctactaatg 2050  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||||| |||||    
T  2049 cgcctagtgtg 2039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 27931
Alignment:
Q  234 atgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctt 333  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | || || |||||      
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  334 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 433  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  434 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgat 533  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 27932  T
Q  534 g 534  Q
    |    
T  27931 g 27931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 290 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1141
Alignment:
Q  290 tgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggc 389  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||     
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  390 ccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttc 489  Q
    | ||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  490 agaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
     |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  1185 ggaagtatgtagcggatccttcgtatgttattccgagagatgatg 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11238 - 11188
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11238 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggaca 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 534
Target Start/End: Original strand, 28804 - 29111
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  | || |||    
T  28804 ggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 28903  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcat 426  Q
    |||| | |||| |||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||   ||| ||||| || |||||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  28904 actcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcat 29003  T
Q  427 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgag 526  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  29004 atagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccaag 29103  T
Q  527 ggatgatg 534  Q
     |||||||    
T  29104 agatgatg 29111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 534
Target Start/End: Original strand, 40795 - 41102
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  | || |||    
T  40795 ggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 40894  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcat 426  Q
    |||| | |||| |||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||   ||| ||||| || |||||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  40895 actcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcat 40994  T
Q  427 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgag 526  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  40995 atagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccaag 41094  T
Q  527 ggatgatg 534  Q
     |||||||    
T  41095 agatgatg 41102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 78
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  265 tggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 166  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatc 309  Q
    || || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| | ||| ||||||    
T  165 atcagagagaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttttaggagtgtgatc 78  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 945 - 1095
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | || |||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  945 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 1044  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  1045 aatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 232 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19115 - 18813
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  19115 agatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcc 19016  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatataga 431  Q
    | |||| ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  19015 tatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtataga 18916  T
Q  432 gttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatg 531  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  |   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  18915 gtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattgtggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattcctagagatg 18816  T
Q  532 atg 534  Q
    |||    
T  18815 atg 18813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21125 - 21019
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  21125 agattaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcactacgaatataaggtgatgcttttcggtgttactaatgcgcc 21026  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
    |||||||    
T  21025 tggtgtg 21019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23277 - 23094
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||    
T  23277 agatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcc 23178  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttgg 415  Q
    | |||| ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||    
T  23177 tatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgg 23094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 532
Target Start/End: Original strand, 33623 - 34017
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | | ||||| ||   |||||    
T  33623 actcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatga 33722  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  33723 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgac 33822  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| || || ||||| ||||| || |||    
T  33823 aggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggt 33922  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatga 532  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | | |||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  33923 ttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 34017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 54437 - 54534
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  54437 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaa 54534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 31703 - 31813
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  31703 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 31802  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  31803 cgcctggtgtg 31813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40529 - 40379
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  40529 ggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 40430  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  40429 aatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 40379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 180565 - 180195
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  |||||| ||||||||| | | ||||    |||||||||||||| |||||||    
T  180565 tggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcaga 180466  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || || |||||  |||| ||||||||||     
T  180465 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacc 180366  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||| | ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||    
T  180365 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaacagtggcgtatcgagttggcttaccaccgcat 180266  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  180265 ctttcgaattttcatgatgtctttcaagtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 180195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 99588 - 99698
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  99588 catcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 99687  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  99688 cgcctggtgtg 99698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 860 - 970
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  860 catcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 959  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  960 cgcctggtgtg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 122 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2170 - 1908
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||  |||| | ||    
T  2170 tggtcggaggtgcaggactcctttatgttggttcgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttgattcttcagactacggagagggtcaagatg 2071  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||||| || ||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  2070 ataagagaaaaggtgaaagcgacgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctga 1971  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttca 384  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  1970 gagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttca 1908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4346
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagt---acaaagtgaggcctttcggtgttacta 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   | || |||| |||||||||||||||||    
T  4459 catcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttacta 4360  T
Q  110 acgcgcctggtgtg 123  Q
    | ||||||||||||    
T  4359 atgcgcctggtgtg 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 65753 - 65383
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  65753 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 65654  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| || ||||||||    
T  65653 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacg 65554  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||    
T  65553 tgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcat 65454  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  65453 ctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 65383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 534
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40131
Alignment:
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcat 426  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||| ||  |  || ||||||||||| ||||| |    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  427 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgag 526  Q
    || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccagag 40123  T
Q  527 ggatgatg 534  Q
     |||||||    
T  40124 tgatgatg 40131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22982 - 22918
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 80  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22982 cagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacga 22918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Original strand, 39855 - 39904
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcg 277  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  39855 gagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcg 39904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 37844 - 37940
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| | |||||||||||||||    
T  37844 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttac 37940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 1164 - 1385
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  1164 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagacgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaagatg 1263  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  1264 attagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctga 1363  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgt 343  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  1364 gggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 15037 - 15421
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  15037 tggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcaga 15136  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || |||||||| |   | || ||||||| | |||| |||||||||||    
T  15137 gtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacg 15236  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||  | ||| ||||| | ||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||    
T  15237 tgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcat 15336  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||| || || || |||||||    
T  15337 ctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtcatcccaagagatgatg 15421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Original strand, 25677 - 26061
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | | ||    || ||||||||||| |||||||    
T  25677 tggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcaga 25776  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||| ||| ||||| ||||| || |||||  |||||||||| || ||  | ||||| ||  | || ||||||||| |||| || ||||||||    
T  25777 gtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttgagtttcaggaaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacg 25876  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| |||||| | ||||  | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||    
T  25877 tgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcat 25976  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  25977 ctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgattccaagggatgatg 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 22210 - 22277
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattac 78  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22210 atcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattac 22277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 285
Target Start/End: Original strand, 5382 - 5545
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  5382 tggtcggaggtgtaggactcctttctgatggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactatagagaaagtcaagatg 5481  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaagg 285  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5482 atcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 5545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1232 - 1122
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1232 catcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtaatgcctttcggtgttactaacg 1133  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  1132 cgcctggtgtg 1122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 6284 - 5978
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| ||||    
T  6284 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgcaggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgtttttaagagtca 6185  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||| ||    
T  6184 ctcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatggtggcgta 6085  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  6084 tcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 5985  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  5984 gatgatg 5978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 1
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | || ||||    
T  272 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatcttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagagtca 173  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
     |||  |||| |||||||||||||| |||||||  |  || |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||  ||||||||    
T  172 atccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggcata 73  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || || |||| |||||||||    
T  72 tcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1024 - 654
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  1024 tggtttgagtcaggtgatagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcaga 925  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  924 gtcaacaaaagagttatcatgataagcatagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 825  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || || |||||||  ||||| ||| | ||||| || ||||| |||    
T  824 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcat 725  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  724 ctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Original strand, 5627 - 5932
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||||    
T  5627 gagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagtca 5725  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| | ||| | |||  ||||||| | |||| | |||||||| || || || ||    
T  5726 ctcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatggttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcgta 5825  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | || |||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  5826 tagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacatcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattccaagg 5925  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  5926 gatgatg 5932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 27 - 137
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  27 catcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 126  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  127 cgcctggtgtg 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29212 - 29102
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29212 catcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 29113  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  29112 cgcctggtgtg 29102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 532
Target Start/End: Original strand, 50460 - 50854
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||  | ||||| || || || | | | ||||| ||   |||||    
T  50460 actcctttgtgttggtttgagtcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatga 50559  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| ||||    
T  50560 aagcgtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgac 50659  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| || || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  || |||||||| || || ||||| ||||| || |||    
T  50660 aggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggt 50759  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatga 532  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||  || | | |||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  50760 ttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgtagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 50854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 43514 - 43135
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  43514 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 43415  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  43414 aagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgac 43315  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  43314 tggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggt 43215  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  43214 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 43135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 48540 - 48650
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  48540 catcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 48639  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  48640 cgcctggtgtg 48650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 8755 - 8475
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || ||||| |||||||||||| | || || || || || ||  | || ||||    
T  8755 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtca 8656  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||  ||||| ||    
T  8655 ctcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaagggtggctta 8556  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatcc 508  Q
      |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || ||||| || || |||| |||||||||  |||||||    
T  8555 ccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 8475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 45433 - 45337
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  45433 atcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 106608 - 106758
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | || |||| ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  106608 ggagaagatgaaagcatctcagagtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 106707  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| | ||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  106708 aatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcct 106758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17218 - 17122
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  17218 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 17122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10756 - 10660
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  10756 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 10660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13936 - 13868
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagttt 296  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || ||||| ||||||||||||    
T  13936 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttt 13868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Original strand, 127157 - 127527
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    |||||||||||||| |  ||||    
T  127157 tggtttaagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccaga 127256  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | || ||||||| | |||| |||||||||||    
T  127257 gtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacg 127356  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||    
T  127357 tgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgatccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcat 127456  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  127457 ctttcgaatttacatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 127527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 56037 - 55941
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  56037 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttac 55941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40914 - 40818
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40914 atcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttac 40818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 74634 - 74538
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  74634 atcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttac 74538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 313
Target Start/End: Original strand, 3285 - 3476
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||| | | ||    
T  3285 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaacggatttggttcatcagactacagagaaagttaagatg 3384  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||  |||  |||||| ||||||||||||||    
T  3385 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtaggaaggcccttttgtttcaggagggtgatcatgt 3476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 1515 - 1625
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1515 catcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 1614  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  1615 cgcctggtgtg 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9341 - 9231
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  9341 catcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaacg 9242  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  9241 cgcctggtgtg 9231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 411 - 534
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3610
Alignment:
Q  411 gttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatcctt 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatgtagcggatcctt 3586  T
Q  511 cccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    | ||||| |||||||| |||||||    
T  3587 cacatgttattccgagagatgatg 3610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 520
Target Start/End: Original strand, 219382 - 219745
Alignment:
Q  157 agtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtca 256  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  219382 agtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca 219481  T
Q  257 gaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttg 356  Q
     |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  219482 aaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcgttg 219581  T
Q  357 aagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcga 456  Q
    ||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||    
T  219582 aagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggattaacaccgcatctttcga 219681  T
Q  457 acttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    | ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  219682 atttgcacgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgat 219745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 229391 - 229021
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  229391 tggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcaga 229292  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||  | || ||||||||| | || ||||| |||||    
T  229291 gtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctattactggtgtgggacg 229192  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  ||  |||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  || | || || ||||| |||    
T  229191 tgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcat 229092  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  229091 ctttcgaatatgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 229021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 217444 - 217540
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||    
T  217444 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttac 217540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 377
Target Start/End: Original strand, 33034 - 33180
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| |  |    
T  33034 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaaac 33133  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    || |||| |||||||| ||||| |||||||  | ||| |||||||||    
T  33134 ctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcct 33180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 426 - 532
Target Start/End: Original strand, 871 - 977
Alignment:
Q  426 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  871 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatccttcacatgttattccga 970  T
Q  526 gggatga 532  Q
    | |||||    
T  971 gagatga 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 506 - 396
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  506 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 407  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  406 cgcctggtgtg 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14736 - 14338
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || || |||||||||||| |||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||||||||||||| | | ||    
T  14736 tggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatg 14637  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||  | || || ||  | |    
T  14636 attcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggataccacgtgtttttga 14537  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||    
T  14536 gagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggt 14437  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||  | |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  14436 ggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtcttccatgtgtcgaaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 980 - 655
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||| | |||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  980 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactagtaagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 881  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  880 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 781  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |  |  || ||||||||||| ||||| ||   ||| |||    
T  780 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggt 681  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgca 463  Q
    || || || ||||||||||| |||||    
T  680 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 268888 - 268778
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  268888 catcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 268789  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  268788 cgcctggtgtg 268778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 522
Target Start/End: Original strand, 86462 - 86834
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| || | | ||||||| || |||||| |||| || ||||    
T  86462 tggtatgagtccggtgagactgtggtactgggaccagacatttttcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacaga 86561  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    || | || |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||  | || ||||||| | |||| |||||||||||    
T  86562 gtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacg 86661  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    |||  | || || | |||| ||||| | | ||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||     
T  86662 tgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggtttattggcccgtatcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaa 86761  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattc 522  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||| || ||||||||||    
T  86762 ctttcgaacctacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgattc 86834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Original strand, 84557 - 84647
Alignment:
Q  25 gtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgc 115  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  84557 gtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgc 84647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4380 - 4010
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| |||||||    
T  4380 tggttcgaatcaggtgagagtgtagttttaggaccagaaatcgttcaataaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcaga 4281  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || ||||||||| |||| ||||| || || || ||||||||| |||| || |||||||| ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  4280 gtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 4181  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||  ||| ||||| | ||| |||    
T  4180 cgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaaggattggaacggtggcgtatcaagtgggtttactaccgcat 4081  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  4080 ctttcgaatttgcatgatttgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 4010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19632 - 19522
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  19632 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 19533  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  19532 cgcctggtgtg 19522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Original strand, 26196 - 26278
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  26196 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 26278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 79857 - 79967
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  79857 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatg 79956  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||| |||||||    
T  79957 cgcttggtgtg 79967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 349 - 534
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2207
Alignment:
Q  349 gtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccaca 448  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  449 tctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcgga-ccttcgcatgttattccaagagatgatg 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1117
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||    
T  1406 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactc 1307  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||  ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  |    
T  1306 ctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 1207  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |  || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1206 agtggatttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttttatgtgttgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3130
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||| |||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||    
T  3407 aagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactc 3308  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||| | | ||| |||||  |||||||||  |  || ||| ||||||| ||||| ||| |    
T  3307 ctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgtatcagatatttgaaagaattggaacggtggcgtatcg 3208  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatcc 508  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  |||||||    
T  3207 agtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11401 - 11291
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  11401 catctgattaaggtgaaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 11302  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    | |||||||||    
T  11301 cacctggtgtg 11291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5393 - 5281
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||   ||||| ||||||||||||||| ||    
T  5393 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaa 5294  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  5293 tgcgccaggtgtg 5281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 520
Target Start/End: Original strand, 26 - 310
Alignment:
Q  236 gaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttg 335  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| ||  | || ||||||| | ||    
T  26 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtg 125  T
Q  336 acgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttg 435  Q
    || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||  |  || ||||| ||||||||||  || || || |||||||| ||||| ||| ||||      
T  126 actggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtga 225  T
Q  436 gtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  226 gtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 534
Target Start/End: Original strand, 33519 - 33915
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||| |||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  33519 actccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 33618  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||  | |  ||||||| | ||||    
T  33619 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgac 33718  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  33719 tggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtggga 33818  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  33819 ttactaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatg 33915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8956 - 8574
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||| |||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  8956 actccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 8857  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | |  ||||||| | ||||    
T  8856 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgac 8757  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  8756 tggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtggga 8657  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || |||  |||||||||   |||||| || ||||||||    
T  8656 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgat 8574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15225 - 14841
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||    || ||||||||||| || ||||    
T  15225 tggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtctcaga 15126  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || | |||||| ||||| ||||  || || || ||||||||||| || || |||||||| ||  | |  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  15125 gtcgacatatgagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacg 15026  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
     || |||||||| |  || |||||||| | ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||| || || ||||| |||    
T  15025 cgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggcttaccaccgcat 14926  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  14925 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagagatgatg 14841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17158 - 17047
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||  |||||||||||||| ||    
T  17158 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtga-tcctttcggtgttaccaa 17060  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  17059 tgcgccaggtgtg 17047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 497
Target Start/End: Original strand, 12907 - 13282
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||  |  ||||  | ||||||||||||||   | ||    
T  12907 tggtcggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtcaggttagagtgcagttttgggaccagaaattcttcagcaaactactgagaaagtttagatg 13006  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |    
T  13007 atccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaaggagaccatgtgttattga 13106  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | |  || ||| |  |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||    
T  13107 gagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagatttattagttcgtatcagatatcagaaagaatgggaatggt 13206  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtat 497  Q
     || ||| |||| ||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  13207 agcgtatggagtgggtttaccaccacaacttttgaatttacatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtat 13282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 5913 - 6025
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||    |||| ||||||||||||||| ||    
T  5913 atcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcggtgttacaaa 6012  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
    |||||| ||||||    
T  6013 cgcgccaggtgtg 6025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 815
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  925 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 826  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||| ||||||    
T  825 cgccgggtgtg 815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7894 - 7809
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggccttt 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  7894 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgccttt 7809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 520
Target Start/End: Original strand, 16423 - 16793
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |  | |||||  | ||||||||||| || | | ||||     | ||||||||||| |||||||    
T  16423 tggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccaaaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcaga 16522  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    || | || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16523 gttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacg 16622  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
      | |||||||| | ||| |||||||  | ||| | ||| ||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||    
T  16623 cacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcat 16722  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| |   | ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16723 ctttcgaatttgcatgatatgttccatgtattaaaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgat 16793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 7111 - 7223
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||| ||    
T  7111 atcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgttcggtgttacaaa 7210  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     || |||||||||    
T  7211 tgcacctggtgtg 7223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43196 - 43086
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  43196 catcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatg 43097  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  43096 cgcctggtgtg 43086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 402 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 45941 - 45832
Alignment:
Q  402 tcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtag 501  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||    
T  45941 tcagagagggttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtag 45842  T
Q  502 cggatccttc 511  Q
    ||||||||||    
T  45841 cggatccttc 45832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Original strand, 64067 - 64373
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || ||  | || ||||    
T  64067 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 64166  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| || | || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||   |  |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  64167 ctcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtgagattcattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgta 64266  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  64267 tcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 64366  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  64367 gatgatg 64373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 109910 - 109800
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  109910 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 109811  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
     |||| |||||    
T  109810 tgcctagtgtg 109800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17363 - 16986
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||  |  ||||  | ||||||| ||| || | | ||    
T  17363 tggtcggaggtgtagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagattgtagttttgggaccagaaatcattcaacaaactactgtgaaggttaagatg 17264  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||  | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| || ||  | |    
T  17263 attcaagaaaagatgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttga 17164  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||    
T  17163 gagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggt 17064  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgt 499  Q
    ||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  17063 ggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 16986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15471
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||  | || ||||||||||| || || || || ||  | |  |||| ||    
T  15759 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgacagtcattc 15660  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||  || |||||  |||||||||  || || ||||||||||| ||||||||| |    
T  15659 ttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcg 15560  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  || || |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15559 agtaggtttaccaccacat-tttcgaatttgcacgatgtgtttcatgggtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 15471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17931 - 17835
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  17931 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttac 17835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15922 - 15852
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaaga 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||  | || |||||||||||    
T  15922 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaaga 15852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 872
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||  | |||||||||||  | | |  |||    || ||||| ||||| |||||||    
T  1256 tggtttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaagattaagtggatccaagaaaagattaaagcgtcgcaga 1157  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
     | | || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  1156 tttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacg 1057  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacat 449  Q
    ||| ||||| |  | |||||||| ||| | ||| ||||| || |||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||| || | ||||| ||||| |||    
T  1056 tgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcat 957  T
Q  450 ctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || || || |||  |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  956 ctttcgaatatgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatccatctcatgtgattccaagggacgatg 872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3181 - 3082
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  3181 atcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcggtgttactaa 3082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 7683 - 7779
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7683 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 232 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6638 - 6350
Alignment:
Q  232 agatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcc 331  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||     
T  6638 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactca 6539  T
Q  332 tttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatataga 431  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  |  || |||||||| |  |||| |||| ||    
T  6538 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggtatatcga 6439  T
Q  432 gttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || || ||  |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  6438 gtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgat 6350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8654 - 8558
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |  || ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8654 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacatctttcataacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 8558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 880 - 986
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |    
T  880 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatg 979  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  980 cgcctgg 986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 6171 - 6281
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6171 catcagataaaggggaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacg 6270  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    ||| |||||||    
T  6271 cgcatggtgtg 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 780 - 670
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||||| |    
T  780 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccattcggtgttactaatg 681  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  680 cgcctggtgtg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 520
Target Start/End: Original strand, 624 - 1021
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||| |||||||| | | ||    
T  624 tggtcggagatgcaaaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatg 723  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || || || || ||  | |    
T  724 attcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgttt-tga 822  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||| ||    
T  823 gagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggt 922  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  923 ggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtttcatgtggagcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 32791 - 33080
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||| || |||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||| || ||  | || |||||||    
T  32791 aagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactc 32890  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
     | |||| |||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||| | |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  |    
T  32891 ttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 32990  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  32991 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttacggatccatctcatgtgat 33080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 327 - 500
Target Start/End: Original strand, 13388 - 13561
Alignment:
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcat 426  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||   ||||||||  || ||||| |||||||| ||| |||    
T  13388 actcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaacagtgacat 13487  T
Q  427 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgta 500  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  13488 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgta 13561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 5377 - 5474
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||| || |||||||||||||||    
T  5377 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaa 5474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 9808 - 9905
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||| || |||||||||||||||    
T  9808 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatttcggtgttactaa 9905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 534
Target Start/End: Original strand, 116835 - 117247
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| |||||  || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |  | |||||  | ||||||||||| || | | ||    
T  116835 tggtcggaggtgtaggactctgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttg 116934  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||    || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||  | || || || ||  | |    
T  116935 atccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgagtttcaagaaagagaacaagtatttttga 117034  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgt 421  Q
    | ||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||| ||| ||| ||    
T  117035 gagtcactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattgtaacggt 117134  T
Q  422 ggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgatt 521  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||  | ||||  || |||||||||    
T  117135 ggcgtatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgtttcagatctatctcatgtgatt 117234  T
Q  522 ccgagggatgatg 534  Q
    || ||||||||||    
T  117235 ccaagggatgatg 117247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 98391 - 98136
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  98391 tggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 98292  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  |||    
T  98291 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaa 98192  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  98191 gggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 98136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 115062 - 115158
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||||||    
T  115062 atcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgcctttcggtgttac 115158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 376
Target Start/End: Original strand, 23553 - 23650
Alignment:
Q  279 agaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcc 376  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||  | ||||| | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  23553 agaaaggatattgagtttcatgttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 2298 - 2408
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  2298 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatg 2397  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  2398 cgcctggtgtg 2408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 13362 - 13472
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |    
T  13362 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatg 13461  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  13462 cgcctggtgtg 13472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 21541 - 21651
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |    
T  21541 catcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatg 21640  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  21641 cgcctggtgtg 21651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25393 - 25287
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25393 catcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttattaacg 25294  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  25293 cgcctgg 25287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 29311 - 29421
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  29311 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatg 29410  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  29411 cgcctggtgtg 29421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2996 - 2886
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2996 catcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatg 2897  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  2896 cgcctggtgtg 2886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28381 - 28285
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||| | |||||| ||||||||    
T  28381 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttttggtgttac 28285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 35778 - 35682
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  35778 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 35682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 299 - 588
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |  |||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||| || || ||||| ||  | || |||| ||    
T  299 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaaagacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcaatc 398  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || | || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||  ||||| ||| |    
T  399 ctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgtatcg 498  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||   |||||| || ||||||||    
T  499 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttatggatccatctcatgtgat 588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7647 - 7358
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||    
T  7647 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtca 7548  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  7547 ctcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggagagagttggaacggtggctta 7448  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgt 517  Q
      |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  7447 gcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 7358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9648 - 9552
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  9648 atcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 9552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 19660 - 19757
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||    
T  19660 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaa 19757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Original strand, 28302 - 28451
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||||||||| || || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||  | ||||| |    
T  28302 gagaagatgaaggcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatgtgtttttgagggtga 28401  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
     || | |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  28402 atcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 28451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 53325 - 53218
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  53325 catcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctttcgatgttactaatg 53226  T
Q  113 cgcctggt 120  Q
     |||||||    
T  53225 tgcctggt 53218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 520
Target Start/End: Original strand, 4351 - 4733
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||| |||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  4351 actccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 4450  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||  | |  ||||||| | ||||    
T  4451 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgac 4550  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggt 437  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  4551 tggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtggga 4650  T
Q  438 ttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || |||  |||||||||   |||||| || ||||||||    
T  4651 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgat 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 1571 - 1681
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| | |||||| ||||||||| |    
T  1571 catcagatcaaggtgaaggataaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgtctttcgttgttactaatg 1670  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  1671 cgcctggtgtg 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9613 - 9321
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || || || ||  | || ||||    
T  9613 gagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagtca 9514  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||  |||||||||  || ||||| | ||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||    
T  9513 ctcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactcctagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 9414  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
      |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || ||||  ||||||||    ||||| |||||||||||    
T  9413 ccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttctagatccatcccatgtgat 9321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10448 - 10352
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  10448 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttac 10352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 534
Target Start/End: Original strand, 859 - 1164
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||  | || ||||    
T  859 gagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtttt-ttgagagtca 957  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcata 427  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  | ||| | || |||||  |||| |||    
T  958 ctcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatataagaaaaagatggaaaggtggaata 1057  T
Q  428 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagg 527  Q
    | ||||||| || ||||  || |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||     
T  1058 tcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 1157  T
Q  528 gatgatg 534  Q
    |||||||    
T  1158 gatgatg 1164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Original strand, 619 - 723
Alignment:
Q  19 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctg 118  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  619 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctg 718  T
Q  119 gtgtg 123  Q
    |||||    
T  719 gtgtg 723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9237 - 9050
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||    
T  9237 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtcactc 9138  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaac 418  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| | ||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  9137 ctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaac 9050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 376
Target Start/End: Original strand, 369 - 517
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | || |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| | || || |    
T  369 gagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttcttgagagtga 468  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcc 376  Q
     |||| | ||  ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  469 atcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 430 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7045 - 6955
Alignment:
Q  430 gagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || || || |||   ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  7045 gagtgggtttgccaccgcatgtttcgaatttgcatgatgtgtttcaagtgtcacaacttagaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 6955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1025
Alignment:
Q  243 tcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtg 342  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| ||| | || ||||| ||| |||| ||||    
T  1260 tcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaagaaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgtgactggtg 1161  T
Q  343 ttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcc 442  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||| ||  || || |||||||||||  |||| ||  |||| ||||| ||    
T  1160 ttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggatatcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggtttacc 1061  T
Q  443 accacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 478  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1060 accgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgt 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 420 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9297 - 9183
Alignment:
Q  420 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtga 519  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9297 gtggcatacagagtgggattgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtggttcatatgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcacatgtta 9198  T
Q  520 ttccgagggatgatg 534  Q
    ||||||| |||||||    
T  9197 ttccgagagatgatg 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Original strand, 6267 - 6361
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtca 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6267 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcagaagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacagaaaaagtca 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 31345 - 31451
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| |    
T  31345 catcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatg 31444  T
Q  113 cgcctgg 119  Q
    |||||||    
T  31445 cgcctgg 31451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 520
Target Start/End: Original strand, 16455 - 16744
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||   |||||||| || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  16455 aagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtagggaggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggtcactc 16554  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    |  |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |  || ||||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||  ||||| |||      
T  16555 cagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggcgtatca 16654  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||| |||||||||   |||||| || ||||||||    
T  16655 tgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttcgggatccatctcatgtgat 16744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 14503 - 14615
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14503 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaa 14602  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  14603 tgcgccaggtgtg 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 64545 - 64633
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| |||||    
T  64545 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccgttcgg 64633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22215 - 21932
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  |||||| ||||||||| |   ||||    |||||||||||||| ||| |||    
T  22215 tggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactattgagaaagttaaaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtaga 22116  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||| || || || || ||  | || |||||||||  ||| |||||||||||    
T  22115 gtcgacaaaagagttatcatgataagtgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgcgactggtgttggacg 22016  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 433  Q
    ||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  22015 tgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8138 - 7855
Alignment:
Q  150 tggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatgaaagcttcgcaga 249  Q
    |||||||||||| |||| || || || || ||||||||  | |||||  ||||||||||||| || | | ||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  8138 tggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaga 8039  T
Q  250 gtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtgttggacg 349  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||  | || |||||| |  |||| |||||||||||    
T  8038 gtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacg 7939  T
Q  350 tgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 433  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  7938 tgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 7855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5488 - 5241
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||  || || || || |||||||||||| |||| || || ||  | ||  | || |||||||    
T  5488 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgcaggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagagtcactc 5389  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||| |  || ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| |    
T  5388 ctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcg 5289  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 478  Q
    ||| || || ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5288 agtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 5241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 49760 - 49513
Alignment:
Q  231 aagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactc 330  Q
    |||| |||||| ||||||||| | || |||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||  | ||  | || |||||||    
T  49760 aagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacatattttttagagtcactc 49661  T
Q  331 ctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatag 430  Q
    || |||  | ||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||  |    
T  49660 ctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 49561  T
Q  431 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 478  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49560 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 49513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20884 - 20788
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  20884 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagatatgcctttcggtgttac 20788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 36308 - 36212
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  36308 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtataaagttatgcctttcggtgttac 36212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 324 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17131 - 16921
Alignment:
Q  324 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtgg 423  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||| |  |||||||||  || || ||||||  ||| ||||    
T  17131 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagttttaacggtgg 17032  T
Q  424 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattcc 523  Q
    | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||  ||||||| |  |||||||| |     
T  17031 cgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatttcatgtgatcca 16932  T
Q  524 gagggatgatg 534  Q
    ||| |||||||    
T  16931 gagtgatgatg 16921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13331
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13240 cagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttac 13331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 1511 - 1621
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || || || || || ||||   |||||||||||||||| |    
T  1511 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatg 1610  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  1611 cgcctggtgtg 1621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 534
Target Start/End: Original strand, 18991 - 19080
Alignment:
Q  445 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgattccgagggatgatg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  18991 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcagatccctcgcatgttattccgagagatgatg 19080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Original strand, 2537 - 2641
Alignment:
Q  19 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctg 118  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||    
T  2537 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttctggtgttacaaacgcgcttg 2636  T
Q  119 gtgtg 123  Q
    |||||    
T  2637 gtgtg 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 87050 - 86942
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  87050 atcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcgatgatgcctttcggtgttactaa 86951  T
Q  111 cgcgcctgg 119  Q
    ||| |||||    
T  86950 cgcccctgg 86942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 476
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4709
Alignment:
Q  334 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagt 433  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |  || ||||| |||||||||   || || ||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  434 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcat 476  Q
     ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcat 4709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 151392 - 151297
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgtta 106  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  151392 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgtta 151297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 298
Target Start/End: Original strand, 4400 - 4560
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||||  | |||||||| ||  | | | ||||    || |||||||    
T  4400 actcctttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatgattcaagaaaagatga 4499  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 298  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  4500 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatctcgagtttca 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10877
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||| ||    
T  10765 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 10864  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  10865 tgcgccaggtgtg 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 16962 - 17069
Alignment:
Q  16 cagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgc 115  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  16962 cagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgc 17061  T
Q  116 ctggtgtg 123  Q
    | ||||||    
T  17062 caggtgtg 17069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7315 - 7012
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||| ||   | ||    
T  7315 tggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatg 7216  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt-tttccta 320  Q
    ||    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| || || || || |||  |     
T  7215 atctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttg 7116  T
Q  321 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactg 420  Q
    || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||  |  || ||||||||||| |    
T  7115 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacgg 7016  T
Q  421 tggc 424  Q
    ||||    
T  7015 tggc 7012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 9124
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  9220 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 9124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10626 - 10476
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  10626 ggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 10527  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | |||||||    
T  10526 aatcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 10476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6012 - 5862
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  6012 ggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 5913  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | |||||||    
T  5912 aatcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 5862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 397
Target Start/End: Original strand, 726 - 985
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    ||||| ||||    
T  726 actccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatga 825  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  826 aagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgac 925  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatca 397  Q
     ||||| ||||||||  ||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  926 tggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 123
Target Start/End: Original strand, 1900 - 1985
Alignment:
Q  38 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtg 1985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 449
Alignment:
Q  243 tcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgacgggtg 342  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||||||| |||| ||||    
T  669 tcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtg 570  T
Q  343 ttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcctaagttcattggcccgtatcagacttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcc 442  Q
    | |||||||| |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||    
T  569 taggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttacc 470  T
Q  443 accacatctttcgaacttgca 463  Q
    ||| |||||| |||| |||||    
T  469 accgcatcttgcgaatttgca 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 9058 - 9170
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||| ||||||||||||||| ||    
T  9058 atcaccagattaaggtgaaagacggggatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 9157  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  9158 tgcgccaggtgtg 9170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11108 - 10998
Alignment:
Q  13 catcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacg 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| || |    
T  11108 catcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttaccaatg 11009  T
Q  113 cgcctggtgtg 123  Q
    |||||||||||    
T  11008 cgcctggtgtg 10998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8621 - 8471
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  8621 ggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtg 8522  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | |||||||    
T  8521 aatcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14743 - 14638
Alignment:
Q  18 gattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcct 117  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||| |||||| || || |||    
T  14743 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacct 14644  T
Q  118 ggtgtg 123  Q
    ||||||    
T  14643 ggtgtg 14638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 8816 - 8768
Alignment:
Q  412 ttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8816 ttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 8768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 316 - 571
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||  | ||  | |||||||| || || || | | ||    
T  316 tggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgaaagagactacggaaaaggttaagatg 415  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||  | |    
T  416 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgctcatgtgtttttga 515  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||||||    
T  516 gggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcct 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 46530 - 46275
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  46530 tggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 46431  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaa 321  Q
    ||   |||||||||||| || || |||||| | || |||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |    
T  46430 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttga 46331  T
Q  322 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    |||| | |||| | || |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  46330 gggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 46275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Original strand, 3910 - 4060
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  | ||||||||| ||  |||| ||     
T  3910 ggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttttaagagtg 4009  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  4010 aatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23770 - 23592
Alignment:
Q  122 tggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctg 221  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || | | ||    
T  23770 tggtcggaggtgtaggacaccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatg 23671  T
Q  222 ataagggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaag 300  Q
    ||   ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  23670 attcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 23592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14928 - 14778
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    |||||||||||| |  || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||||     
T  14928 ggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtg 14829  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  14828 aatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43809 - 43723
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgt 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  43809 ggagaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaacttggtgatcatgt 43723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13178 - 13029
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||  | || || |    
T  13178 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttgttgagagtga 13079  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
      ||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  13078 accctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 13029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 91 - 203
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| ||    
T  91 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaa 190  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     || |||||||||    
T  191 tgcacctggtgtg 203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 16002 - 16114
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| || || || |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||   ||||| |||||| |||||||| ||    
T  16002 atcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgcctttgggtgttacaaa 16101  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
    |||||| ||||||    
T  16102 cgcgccaggtgtg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6153 - 6041
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  6153 atcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 6054  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  6053 tgcgccaggtgtg 6041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13283 - 13171
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  13283 atcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 13184  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  13183 tgcgccaggtgtg 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 23098 - 23194
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23098 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 23194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 85254 - 85350
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  85254 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 85350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24151 - 24001
Alignment:
Q  227 ggagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtc 326  Q
    ||||||||| ||||| || || ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||  | || ||     
T  24151 ggagaagattaaagcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagtt 24052  T
Q  327 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
    | |||  |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  24051 aatccggtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 85820 - 85916
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  85820 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 85916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 103515 - 103403
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||    
T  103515 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaa 103416  T
Q  111 cgcgcctggtgtg 123  Q
     ||||| ||||||    
T  103415 tgcgccaggtgtg 103403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6330 - 6251
Alignment:
Q  441 ccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgtagcggatccttcccatgtgat 520  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6330 ccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 8235
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8331 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 8235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17527 - 17431
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17527 atcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 17431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7757 - 7534
Alignment:
Q  138 actcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggctgataagggagaagatga 237  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| || || || || |||||| |  | |||||  | |||||||||||||| | | ||||    ||||| ||||    
T  7757 actccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 7658  T
Q  238 aagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtcactcctttgac 337  Q
    |||| ||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  | || ||||||||| ||||    
T  7657 aagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgac 7558  T
Q  338 gggtgttggacgtgccttgaagtc 361  Q
     ||||| |||||||| ||||||||    
T  7557 tggtgtaggacgtgctttgaagtc 7534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 53917 - 53821
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||  | ||||| |||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53917 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttctgaacacggtatggtccctatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 53821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 11263 - 11356
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  11263 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 11356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 839 - 929
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||    
T  839 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttac 929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1280 - 1174
Alignment:
Q  10 catcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttacta 109  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||    |||| |||||||||||||||||    
T  1280 catcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttacta 1181  T
Q  110 acgcgcc 116  Q
    |||||||    
T  1180 acgcgcc 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 176374 - 176480
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaacgcgcc 116  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||   |||||   |||||||||||||||| |||||    
T  176374 agattaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcc 176473  T
Q  117 tggtgtg 123  Q
    |||||||    
T  176474 tggtgtg 176480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8365 - 8216
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||| |    
T  8365 gagaatatgaaagcgtctcagagtagacagaagacttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtga 8266  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
     || | |||| |||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||||||||    
T  8265 atcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Original strand, 15245 - 15350
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| || || |||||||  |||||||||||||| ||    
T  15245 atcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcggtgttacaaa 15344  T
Q  111 cgcgcc 116  Q
     |||||    
T  15345 tgcgcc 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 84
Alignment:
Q  17 agattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagt 89  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  156 agattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 803 - 899
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  803 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttac 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3855 - 3767
Alignment:
Q  19 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || ||||||| |||||||||||||||    
T  3855 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttac 3767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 24969 - 25065
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||| |||||||||||||||    
T  24969 atcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttac 25065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3714 - 3615
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  3714 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttactaa 3615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3429 - 3280
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  | |||||||| |  ||||||||||| ||  | || || |    
T  3429 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtga 3330  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
     |||| |||| ||| |||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  3329 atcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Original strand, 14773 - 14922
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgttttcctaagggtca 327  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||  | ||||| |    
T  14773 gagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtga 14872  T
Q  328 ctcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaaattgactcct 377  Q
     || | ||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  14873 atcatgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 6355 - 6451
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||    
T  6355 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttttgcctttcggtgttac 6451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 940
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttactaa 110  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| ||    
T  1048 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaa 949  T
Q  111 cgcgcctgg 119  Q
     ||||||||    
T  948 tgcgcctgg 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 195511 - 195607
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||||||    
T  195511 atcaccagattaagataaatgatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttac 195607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 58297 - 58204
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgt 104  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| | ||||||||||||    
T  58297 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 58204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 3755 - 3810
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  3755 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 297
Target Start/End: Original strand, 1090 - 1159
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 297  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| |||||||||    
T  1090 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttc 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 1426 - 1502
Alignment:
Q  31 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || |  ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1426 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggccattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttac 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 321 - 245
Alignment:
Q  31 gatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| || |||||||| || | |||||||||||||||    
T  321 gatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgcctttcggtgttac 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20520 - 20424
Alignment:
Q  11 atcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgaggcctttcggtgttac 107  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  20520 atcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttac 20424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 1460 - 1532
Alignment:
Q  228 gagaagatgaaagcttcgcagagtcgtcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaag 300  Q
    |||||||||||||| || |||||| |  |||||||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||    
T  1460 gagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttcaag 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University