View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1687_low_68 (Length: 242)

Name: NF1687_low_68
Description: NF1687
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1687_low_68
NF1687_low_68
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (11-187)||(1150117-1150293)
chr8 (11-176)||(10555214-10555379)
chr8 (11-187)||(43643607-43643783)
chr8 (11-176)||(1204940-1205105)
chr8 (22-187)||(34894969-34895134)
chr8 (11-176)||(37970531-37970696)
chr8 (43-176)||(23854475-23854608)
chr8 (11-176)||(31933898-31934063)
chr8 (50-187)||(36695017-36695154)
chr8 (22-187)||(5299969-5300134)
chr8 (50-187)||(9864150-9864287)
chr8 (22-187)||(13307625-13307790)
chr8 (22-187)||(27082861-27083026)
chr8 (11-187)||(16446887-16447063)
chr8 (11-187)||(38643980-38644156)
chr8 (11-126)||(1149644-1149759)
chr8 (41-192)||(6098560-6098711)
chr8 (48-187)||(12876111-12876250)
chr8 (77-163)||(8803888-8803974)
chr8 (22-176)||(16222876-16223030)
chr8 (41-176)||(30654625-30654760)
chr8 (75-187)||(40862421-40862534)
chr8 (75-187)||(34952107-34952219)
chr8 (22-176)||(465855-466009)
chr8 (41-187)||(7890999-7891136)
chr8 (12-176)||(11727037-11727201)
chr8 (128-187)||(15009244-15009303)
chr8 (22-107)||(35459734-35459819)
chr8 (142-190)||(5018010-5018058)
chr8 (134-202)||(35459833-35459901)
chr8 (11-82)||(33906319-33906390)
chr8 (128-174)||(24823401-24823447)
chr8 (135-193)||(33906220-33906278)
chr8 (142-187)||(28220955-28221000)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (22-194)||(33551021-33551193)
chr2 (11-151)||(43648269-43648409)
chr2 (11-176)||(26357591-26357756)
chr2 (12-187)||(17054121-17054296)
chr2 (11-151)||(37905747-37905887)
chr2 (12-187)||(17071762-17071937)
chr2 (41-187)||(11366435-11366581)
chr2 (22-187)||(36641989-36642154)
chr2 (11-187)||(3176942-3177118)
chr2 (11-187)||(4264101-4264277)
chr2 (11-187)||(33660392-33660568)
chr2 (41-192)||(33902066-33902215)
chr2 (22-192)||(4478366-4478537)
chr2 (22-164)||(19289358-19289500)
chr2 (11-176)||(19424652-19424817)
chr2 (11-196)||(29242162-29242347)
chr2 (59-187)||(2325442-2325570)
chr2 (77-193)||(35958906-35959022)
chr2 (41-187)||(13711467-13711613)
chr2 (11-187)||(4166925-4167101)
chr2 (22-187)||(4763631-4763799)
chr2 (41-192)||(19313850-19314000)
chr2 (128-187)||(41465512-41465571)
chr2 (41-187)||(41463904-41464050)
chr2 (41-187)||(43770893-43771038)
chr2 (22-151)||(27349974-27350102)
chr2 (22-187)||(31570769-31570934)
chr2 (11-151)||(33709256-33709396)
chr2 (111-176)||(18494392-18494457)
chr2 (11-89)||(45327821-45327899)
chr2 (11-176)||(39167387-39167552)
chr2 (142-175)||(6177790-6177823)
chr2 (128-176)||(44285963-44286011)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (11-187)||(25184116-25184292)
chr4 (22-187)||(55477934-55478103)
chr4 (9-187)||(19089483-19089661)
chr4 (11-192)||(28003018-28003199)
chr4 (22-174)||(19440691-19440843)
chr4 (9-187)||(37663771-37663947)
chr4 (11-176)||(879580-879745)
chr4 (41-187)||(27396619-27396765)
chr4 (48-187)||(29584269-29584406)
chr4 (11-187)||(34361524-34361699)
chr4 (41-176)||(4598007-4598141)
chr4 (22-176)||(34948140-34948294)
chr4 (11-176)||(25701089-25701254)
chr4 (11-187)||(32912612-32912788)
chr4 (95-187)||(35021151-35021243)
chr4 (22-173)||(23761089-23761240)
chr4 (11-189)||(6864036-6864214)
chr4 (98-187)||(4396329-4396418)
chr4 (11-176)||(42199743-42199908)
chr4 (40-176)||(49375980-49376117)
chr4 (11-192)||(55241137-55241317)
chr4 (11-187)||(5047997-5048173)
chr4 (75-187)||(7703520-7703632)
chr4 (15-187)||(36493724-36493896)
chr4 (75-192)||(39397916-39398033)
chr4 (11-187)||(38011857-38012033)
chr4 (68-187)||(47253752-47253870)
chr4 (85-187)||(4205119-4205221)
chr4 (78-187)||(17167716-17167825)
chr4 (78-187)||(17173293-17173402)
chr4 (11-187)||(9139250-9139424)
chr4 (11-176)||(50697256-50697420)
chr4 (41-177)||(50764745-50764879)
chr4 (41-165)||(54499300-54499425)
chr4 (75-187)||(35025684-35025796)
chr4 (111-187)||(53124290-53124366)
chr4 (128-187)||(17272014-17272073)
chr4 (128-187)||(33341398-33341457)
chr4 (69-187)||(37287736-37287855)
chr4 (73-187)||(3042614-3042728)
chr4 (75-176)||(30002720-30002821)
chr4 (132-176)||(52516611-52516655)
chr4 (136-187)||(20097485-20097536)
chr4 (41-176)||(32592107-32592242)
chr4 (142-200)||(38811803-38811861)
chr4 (142-187)||(38812260-38812305)
chr4 (111-187)||(7152238-7152314)
chr4 (142-176)||(2266856-2266890)
chr4 (95-176)||(37775683-37775764)
chr4 (95-176)||(46888273-46888354)
chr4 (142-187)||(51959867-51959912)
chr4 (128-168)||(32579466-32579506)
chr4 (120-192)||(46884175-46884247)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (11-187)||(2959747-2959923)
chr1 (11-176)||(32267044-32267209)
chr1 (11-176)||(10922737-10922902)
chr1 (11-187)||(15382932-15383108)
chr1 (11-187)||(15752028-15752204)
chr1 (11-187)||(18422650-18422826)
chr1 (11-161)||(51128884-51129034)
chr1 (22-187)||(34012389-34012554)
chr1 (11-176)||(28564782-28564947)
chr1 (11-187)||(28769652-28769827)
chr1 (43-187)||(30326985-30327129)
chr1 (22-192)||(3309142-3309311)
chr1 (11-187)||(10182009-10182185)
chr1 (11-187)||(30254423-30254598)
chr1 (76-187)||(1547286-1547397)
chr1 (11-176)||(16415655-16415821)
chr1 (11-176)||(14758051-14758216)
chr1 (22-187)||(48620636-48620801)
chr1 (11-187)||(37618893-37619073)
chr1 (11-176)||(31621554-31621719)
chr1 (22-187)||(38823213-38823378)
chr1 (11-176)||(47279199-47279364)
chr1 (15-187)||(19899774-19899946)
chr1 (22-176)||(37451296-37451449)
chr1 (11-193)||(42721032-42721214)
chr1 (22-187)||(238525-238689)
chr1 (11-176)||(11742352-11742516)
chr1 (11-176)||(23999357-23999522)
chr1 (22-187)||(41926162-41926327)
chr1 (75-187)||(3534931-3535043)
chr1 (43-151)||(32216090-32216198)
chr1 (11-176)||(4330289-4330456)
chr1 (11-176)||(8222141-8222303)
chr1 (13-151)||(27763314-27763451)
chr1 (22-171)||(9903066-9903215)
chr1 (11-174)||(7079064-7079238)
chr1 (41-185)||(27533011-27533155)
chr1 (91-187)||(30254857-30254952)
chr1 (11-151)||(46931446-46931586)
chr1 (42-176)||(21289675-21289816)
chr1 (27-176)||(27267216-27267363)
chr1 (11-107)||(27227486-27227582)
chr1 (128-187)||(22170753-22170812)
chr1 (11-158)||(27563906-27564053)
chr1 (41-176)||(39393393-39393528)
chr1 (22-187)||(33725612-33725777)
chr1 (142-187)||(43579245-43579290)
chr1 (41-176)||(47682525-47682659)
chr1 (22-158)||(40884841-40884977)
chr1 (96-187)||(15168088-15168179)
chr1 (142-190)||(42663785-42663833)
chr1 (137-192)||(27227604-27227659)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (11-187)||(18797307-18797481)
chr7 (9-187)||(30055504-30055683)
chr7 (43-192)||(5657520-5657669)
chr7 (11-176)||(7334783-7334948)
chr7 (11-177)||(22687227-22687393)
chr7 (41-187)||(37109850-37109996)
chr7 (11-187)||(24211719-24211895)
chr7 (11-187)||(27283722-27283898)
chr7 (41-187)||(17842623-17842769)
chr7 (11-187)||(31579071-31579252)
chr7 (11-176)||(38258534-38258699)
chr7 (41-187)||(32821090-32821236)
chr7 (11-187)||(31520731-31520906)
chr7 (11-165)||(29173540-29173694)
chr7 (22-187)||(12390648-12390813)
chr7 (11-176)||(21991625-21991790)
chr7 (15-176)||(33688273-33688433)
chr7 (75-187)||(27421450-27421562)
chr7 (40-187)||(26524363-26524510)
chr7 (22-176)||(23111179-23111333)
chr7 (22-176)||(48928582-48928735)
chr7 (43-192)||(8861258-8861407)
chr7 (11-187)||(44413386-44413563)
chr7 (22-174)||(48928315-48928466)
chr7 (41-187)||(4582897-4583043)
chr7 (11-167)||(10481601-10481759)
chr7 (59-176)||(37347011-37347128)
chr7 (11-187)||(15612766-15612941)
chr7 (22-176)||(41765096-41765250)
chr7 (11-196)||(6546488-6546673)
chr7 (128-176)||(25691669-25691717)
chr7 (75-187)||(43686019-43686130)
chr7 (41-187)||(32432435-32432576)
chr7 (43-187)||(11071183-11071328)
chr7 (95-192)||(34362239-34362336)
chr7 (59-151)||(38053500-38053592)
chr7 (11-192)||(10359221-10359402)
chr7 (142-187)||(3953734-3953779)
chr7 (22-164)||(12165753-12165895)
chr7 (27-176)||(9355849-9355998)
chr7 (22-163)||(26980325-26980466)
chr7 (135-187)||(8299193-8299245)
chr7 (142-193)||(23402371-23402422)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (43-187)||(40552297-40552441)
chr3 (11-187)||(51212987-51213163)
chr3 (11-187)||(48354935-48355111)
chr3 (11-187)||(4761655-4761833)
chr3 (11-176)||(3655208-3655373)
chr3 (11-192)||(20373302-20373483)
chr3 (11-176)||(52040928-52041094)
chr3 (22-187)||(35844320-35844485)
chr3 (11-187)||(26941266-26941442)
chr3 (9-144)||(42506079-42506214)
chr3 (41-193)||(4015448-4015600)
chr3 (12-175)||(11357371-11357535)
chr3 (75-187)||(46297832-46297944)
chr3 (12-187)||(37203061-37203236)
chr3 (50-187)||(34132929-34133066)
chr3 (12-187)||(7327489-7327665)
chr3 (41-176)||(29099360-29099495)
chr3 (12-187)||(37157702-37157876)
chr3 (11-187)||(11466818-11466994)
chr3 (52-176)||(47481527-47481651)
chr3 (22-192)||(27480396-27480566)
chr3 (95-190)||(32373463-32373556)
chr3 (11-187)||(44186507-44186683)
chr3 (22-162)||(53176074-53176213)
chr3 (41-176)||(40935996-40936131)
chr3 (22-176)||(24488979-24489133)
chr3 (22-187)||(22450962-22451127)
chr3 (11-151)||(21009808-21009948)
chr3 (11-187)||(21193600-21193776)
chr3 (22-176)||(43975905-43976056)
chr3 (111-187)||(54505802-54505878)
chr3 (102-176)||(44891512-44891585)
chr3 (41-168)||(45174516-45174645)
chr3 (11-176)||(46994667-46994821)
chr3 (12-176)||(53229159-53229324)
chr3 (11-187)||(39282647-39282822)
chr3 (111-187)||(33698186-33698258)
chr3 (142-187)||(40640634-40640679)
chr3 (12-148)||(54828708-54828843)
chr3 (52-151)||(3362283-3362382)
chr3 (136-187)||(11835737-11835788)
chr3 (128-187)||(55343407-55343466)
chr3 (142-176)||(32180747-32180781)
chr3 (41-150)||(2007964-2008073)
chr3 (143-188)||(4556542-4556587)
chr3 (78-190)||(22446138-22446250)
chr3 (11-174)||(33378791-33378951)
chr3 (141-194)||(42204338-42204391)
chr3 (142-187)||(45879498-45879543)
chr3 (142-190)||(23165838-23165886)
chr3 (142-190)||(38392628-38392676)
chr3 (111-147)||(41585413-41585449)
chr3 (142-194)||(53811976-53812028)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (9-187)||(7890-8068)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (12-176)||(24886116-24886282)
chr5 (22-187)||(30969331-30969496)
chr5 (12-176)||(699164-699328)
chr5 (22-187)||(22974089-22974254)
chr5 (11-187)||(39572822-39572998)
chr5 (22-176)||(35511484-35511638)
chr5 (12-176)||(27318484-27318648)
chr5 (11-187)||(31705608-31705783)
chr5 (11-187)||(38528233-38528408)
chr5 (11-187)||(8741882-8742059)
chr5 (11-187)||(22980796-22980972)
chr5 (11-187)||(26268077-26268253)
chr5 (68-187)||(35826536-35826655)
chr5 (41-187)||(19119862-19120008)
chr5 (51-176)||(43308688-43308813)
chr5 (12-176)||(14919525-14919690)
chr5 (11-192)||(23116218-23116399)
chr5 (11-176)||(33908247-33908412)
chr5 (11-187)||(7693233-7693409)
chr5 (48-187)||(27330309-27330446)
chr5 (11-187)||(32563152-32563328)
chr5 (22-192)||(14409334-14409503)
chr5 (41-151)||(17158057-17158166)
chr5 (27-176)||(5837569-5837718)
chr5 (22-194)||(31786653-31786825)
chr5 (22-176)||(22255195-22255350)
chr5 (14-176)||(5112312-5112474)
chr5 (75-193)||(15724487-15724604)
chr5 (11-176)||(1429141-1429306)
chr5 (11-176)||(9200247-9200412)
chr5 (11-187)||(12910353-12910534)
chr5 (111-187)||(26317780-26317856)
chr5 (75-187)||(36860426-36860538)
chr5 (75-187)||(36866765-36866877)
chr5 (41-187)||(25500952-25501098)
chr5 (95-176)||(13956425-13956506)
chr5 (128-187)||(8466748-8466807)
chr5 (70-176)||(8436980-8437086)
chr5 (113-194)||(16004474-16004556)
chr5 (75-192)||(40133383-40133500)
chr5 (11-119)||(6824475-6824585)
chr5 (22-153)||(28416534-28416665)
chr5 (11-176)||(7208860-7209025)
chr5 (136-176)||(13380509-13380549)
chr5 (41-108)||(15992566-15992633)
chr5 (111-150)||(22255615-22255654)
chr5 (142-187)||(10237417-10237462)
chr5 (12-176)||(22019646-22019810)
chr5 (59-136)||(5829955-5830032)
chr5 (142-187)||(22616497-22616542)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (22-187)||(4318839-4319004)
chr6 (11-176)||(1945847-1946013)
chr6 (41-187)||(8513236-8513382)
chr6 (11-176)||(5627405-5627570)
chr6 (11-194)||(7235040-7235222)
chr6 (41-187)||(6088911-6089057)
chr6 (12-174)||(15491631-15491793)
chr6 (11-176)||(7055220-7055385)
chr6 (11-187)||(33893008-33893183)
chr6 (41-187)||(3879974-3880120)
chr6 (11-187)||(30353363-30353539)
chr6 (40-187)||(20768089-20768234)
chr6 (11-192)||(6091188-6091368)
chr6 (22-176)||(29182177-29182331)
chr6 (59-183)||(18498440-18498565)
chr6 (22-176)||(33618848-33619002)
chr6 (41-176)||(21017147-21017282)
chr6 (141-192)||(24662189-24662240)
chr6 (142-187)||(19631752-19631797)
chr6 (142-187)||(30338479-30338524)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (41-187)||(137-283)
scaffold0002 (11-136)||(408435-408559)
scaffold0002 (95-169)||(94473-94547)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-176)||(146022-146187)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (48-187)||(43960-44099)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (48-187)||(154688-154827)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (111-176)||(42362-42427)
scaffold0009 (128-187)||(100824-100883)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (22-187)||(11909-12077)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (141-192)||(12137-12188)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 1150117 - 1150293
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  1150117 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgttgtacaaacagtggga 1150216  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  1150217 tgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 1150293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 10555214 - 10555379
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  10555214 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggag 10555313  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10555314 tgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttca 10555379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 43643607 - 43643783
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||| ||     
T  43643607 caaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagag 43643706  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43643707 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattt 43643783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1205105 - 1204940
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||  ||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||       
T  1205105 caaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatg 1205006  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1205005 tgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 1204940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34895134 - 34894969
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  34895134 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcact 34895035  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34895034 acagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 34894969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 37970531 - 37970696
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||  |||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||      
T  37970531 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtgggg 37970630  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37970631 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttca 37970696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Original strand, 23854475 - 23854608
Alignment:
Q  43 ttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgt 142  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23854475 ttgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgt 23854574  T
Q  143 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23854575 taacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttca 23854608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 31933898 - 31934063
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| |||| ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||      
T  31933898 caaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtgggg 31933997  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  31933998 tgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttca 31934063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Original strand, 36695017 - 36695154
Alignment:
Q  50 tctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttc 149  Q
    |||||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36695017 tctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttc 36695116  T
Q  150 actagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |  |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  36695117 atcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattt 36695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 5299969 - 5300134
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||||||| ||||||  || |||||||||||| || || |||| |      
T  5299969 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttaca 5300068  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5300069 acacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 5300134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9864287 - 9864150
Alignment:
Q  50 tctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttc 149  Q
    |||||||| |||||||   ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||| |||    
T  9864287 tctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttc 9864188  T
Q  150 actagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    || | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9864187 accaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattt 9864150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13307790 - 13307625
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||  |||||||||| ||||| |  |||||  |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||      
T  13307790 aaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcaca 13307691  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  13307690 acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 13307625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 27082861 - 27083026
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||| ||| ||  || || |||||||||||  ||||||||| |    
T  27082861 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcact 27082960  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  27082961 acacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattt 27083026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 16446887 - 16447063
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   ||||  |||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||      
T  16446887 caaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtgggg 16446986  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  16446987 tgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 16447063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38644156 - 38643980
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  || |  |||||||||||      
T  38644156 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtgggg 38644057  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  38644056 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattt 38643980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 1149644 - 1149759
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  1149644 caaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggt 1149743  T
Q  111 tgttactcattacatt 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  1149744 tgttactcattacatt 1149759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Original strand, 6098560 - 6098711
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||  |||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  6098560 tcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagt 6098659  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
     |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  6098660 attaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttccat 6098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12876250 - 12876111
Alignment:
Q  48 aatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaact 147  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||    
T  12876250 aatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaact 12876151  T
Q  148 tcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||  |||||||||||| || |||||| |  |||||||||    
T  12876150 tcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattt 12876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 163
Target Start/End: Original strand, 8803888 - 8803974
Alignment:
Q  77 ctgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcat 163  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8803888 ctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16223030 - 16222876
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||     |||||| |    
T  16223030 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcact 16222931  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    | ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16222930 atattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttca 16222876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 30654625 - 30654760
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| || |||||||  ||||||  |||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30654625 tcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagt 30654724  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||    
T  30654725 gttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttca 30654760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40862534 - 40862421
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgtt-gatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgact 173  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  40862534 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgact 40862435  T
Q  174 tcattatagaattt 187  Q
    ||| ||||||||||    
T  40862434 tcactatagaattt 40862421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Original strand, 34952107 - 34952219
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  34952107 gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactt 34952206  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
     | ||||||||||    
T  34952207 tactatagaattt 34952219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 466009 - 465855
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| |  |||||||  ||||||  || ||||||||||||||  |||||||||      
T  466009 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcaca 465910  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  465909 acacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttca 465855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 7890999 - 7891136
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||         || |||||||||||||    
T  7890999 tcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtta---------tttttgatgttatagt 7891089  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7891090 gttaacttcacaaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 7891136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11727201 - 11727037
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||   |||||| ||| |||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||  || | |||||| |||||  |    
T  11727201 aaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggt 11727102  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  11727101 gttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttca 11727037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15009303 - 15009244
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15009303 ttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 15009244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 35459734 - 35459819
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtg 107  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||| || ||||||||||| |||||    
T  35459734 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5018058 - 5018010
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 190  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  5018058 ttaacttcactaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatttccc 5018010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Original strand, 35459833 - 35459901
Alignment:
Q  134 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataacataatca 202  Q
    ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||    
T  35459833 ttatagtattaactttacgaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcaataacattatca 35459901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33906390 - 33906319
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaac 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  33906390 caaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaac 33906319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 174
Target Start/End: Original strand, 24823401 - 24823447
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24823401 ttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactt 24823447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33906278 - 33906220
Alignment:
Q  135 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 193  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||    
T  33906278 tatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttccata 33906220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 28220955 - 28221000
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  28220955 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgactttatcatagaattt 28221000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 33551021 - 33551193
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  33551021 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcact 33551120  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  33551121 acatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataa 33551193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Original strand, 43648269 - 43648409
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       
T  43648269 caaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgagg 43648368  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43648369 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 43648409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26357756 - 26357591
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| | ||||| |  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |    
T  26357756 caaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggga 26357657  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26357656 tgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttca 26357591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 17054121 - 17054296
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||   |||||  || | || |||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  17054121 aaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaacaatgagat 17054220  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  17054221 gttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattt 17054296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37905887 - 37905747
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||      
T  37905887 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgggg 37905788  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37905787 tgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcac 37905747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 17071762 - 17071937
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||||||  || |||| |||||| |||||||||||| | ||  ||    
T  17071762 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaataatgagat 17071861  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  17071862 gttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattt 17071937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 11366435 - 11366581
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| || ||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11366435 tcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagt 11366534  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  11366535 gttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattt 11366581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36642154 - 36641989
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||   ||||||||       
T  36642154 aaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgca 36642055  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36642054 acacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 36641989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3177118 - 3176942
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||| | | |||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |      
T  3177118 caaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcg 3177019  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| || | ||||||  |||||||||    
T  3177018 tgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaattt 3176942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 4264101 - 4264277
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||| | ||| |||||| ||||| |  |||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |    
T  4264101 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggga 4264200  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  4264201 tgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattt 4264277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 33660392 - 33660568
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   || ||| ||||| |||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||  || |||||||||||| |      
T  33660392 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttggg 33660491  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  33660492 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattt 33660568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33902215 - 33902066
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| || ||||||  ||    
T  33902215 tcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgtta--gt 33902118  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  33902117 gttaacttcaccagaaaagtcattctaacgacttcatcatagaattttccat 33902066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4478537 - 4478366
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||| ||| ||||||  || |||||||||| |||| |||||||||      
T  4478537 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcaca 4478438  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctc-atgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4478437 acacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttccat 4478366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Original strand, 19289358 - 19289500
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||  || |||  ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  19289358 aaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcatt 19289457  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcatt 164  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  19289458 atatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 19424652 - 19424817
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||| ||| ||||||  || | || ||||| |||      
T  19424652 caaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatgggg 19424751  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19424752 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttca 19424817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 29242162 - 29242347
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   | |||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||      
T  29242162 caaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtgggg 29242261  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataaca 196  Q
    |||||| || || ||| || |||||||||| |||||||||| | ||||  |||| |||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  29242262 tgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttccttaaca 29242347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 187
Target Start/End: Original strand, 2325442 - 2325570
Alignment:
Q  59 ttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaa 158  Q
    |||||||  |||||| |||||||| ||||||  || |||||||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2325442 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaa 2325541  T
Q  159 gtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  2325542 gtcattcacataacttcaccatagaattt 2325570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35959022 - 35958906
Alignment:
Q  77 ctgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  35959022 ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttca 35958923  T
Q  177 ttatagaatttcccata 193  Q
    | ||||||||| |||||    
T  35958922 tcatagaattttccata 35958906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13711613 - 13711467
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  | |||  |||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||| | |||||| |||| |    
T  13711613 tcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataat 13711514  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  13711513 gttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattt 13711467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4167101 - 4166925
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||   |||||| | |||||||| ||| |||  |||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||      
T  4167101 caaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgggg 4167002  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  | ||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  4167001 tgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 4166925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4763799 - 4763631
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   | |||| |||||||||| ||||| |  |||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  4763799 aaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcact 4763700  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgtt---aacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | ||| || |||||||||   |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4763699 acagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattt 4763631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19314000 - 19313850
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||| |||    |||||||||  ||| | |||||| |||| |    
T  19314000 tcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataat 19313902  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  19313901 gttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttccat 19313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41465571 - 41465512
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41465571 ttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 41465512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 41463904 - 41464050
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||  |||||| || ||||| ||||||  || |||||||||||||   |||||||||  ||| | ||||| |||||||    
T  41463904 tcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagt 41464003  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
     |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||  |||||||||    
T  41464004 attaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaattt 41464050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 43770893 - 43771038
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||   || |  |||||||| ||||||  || |||| |||||||||  |||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  43770893 tcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagt 43770992  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  43770993 gttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaattt 43771038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 27349974 - 27350102
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| |  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||   |||||||||      
T  27349974 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagg-gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcaca 27350072  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27350073 acatttttgatgctatagtgttaacttcac 27350102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 31570769 - 31570934
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||  |||||  |||||||| |||||| ||| | || ||| |||||  ||||||| |      
T  31570769 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttaca 31570868  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  31570869 acacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattt 31570934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Original strand, 33709256 - 33709396
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |   |||||| |||||||  | |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||     
T  33709256 caaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggag 33709355  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    ||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33709356 tgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 33709396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 18494392 - 18494457
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18494392 tgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttca 18494457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 45327899 - 45327821
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgat 89  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  45327899 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgat 45327821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 39167387 - 39167552
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||||   |||||| | ||| |||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||       
T  39167387 caaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgagg 39167486  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||  | | | |||||  |||  |||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||    
T  39167487 tgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttca 39167552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6177823 - 6177790
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttc 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6177823 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 6177790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44286011 - 44285963
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  44286011 ttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaatcattcgcatgacttca 44285963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25184292 - 25184116
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||| ||     
T  25184292 caaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagag 25184193  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25184192 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattt 25184116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 55477934 - 55478103
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaa----acagtggaatgttact 117  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||    |||||||| |||||||    
T  55477934 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttact 55478033  T
Q  118 cattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  55478034 cgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 55478103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 19089483 - 19089661
Alignment:
Q  9 agcaaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  19089483 agcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgg 19089582  T
Q  109 aatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
      |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  19089583 ggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattt 19089661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 28003018 - 28003199
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  28003018 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggag 28003117  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    |  |||| | |||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  28003118 tactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 28003199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Original strand, 19440691 - 19440843
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19440691 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcatt 19440790  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19440791 acatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactt 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 37663771 - 37663947
Alignment:
Q  9 agcaaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37663771 agcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 37663870  T
Q  109 aatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
      |||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37663871 ggtgttactcattacagttttaatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 37663947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 879580 - 879745
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||||| |||||||||||||| ||       
T  879580 caaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgagg 879679  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||    
T  879680 tgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgacttca 879745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27396765 - 27396619
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||  ||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||| | || ||| |||| |    
T  27396765 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataat 27396666  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27396665 gttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 27396619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Original strand, 29584269 - 29584406
Alignment:
Q  48 aatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaact 147  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||   |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29584269 aatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaact 29584366  T
Q  148 tcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  29584367 tcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 29584406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 34361524 - 34361699
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||  || |||| || | ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||| || ||||| ||||||||||||      
T  34361524 caaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtgggg 34361622  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  34361623 tgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 34361699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4598141 - 4598007
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||  || ||||||||||||||  |||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  4598141 tcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacact-ttgatgttatagt 4598043  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4598042 gttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttca 4598007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 34948140 - 34948294
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||||||  |||||||||      
T  34948140 aaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcaca 34948239  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34948240 acacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgacttca 34948294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 25701089 - 25701254
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |      
T  25701089 caaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtaggg 25701188  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  25701189 tgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttca 25701254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 32912612 - 32912788
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||| | |||||||   |||||   |||||| |||||| ||||| |||||| | | |      
T  32912612 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactaggg 32912711  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32912712 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 32912788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 187
Target Start/End: Original strand, 35021151 - 35021243
Alignment:
Q  95 tgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  35021151 tgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 35021243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23761240 - 23761089
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| | |||||||||||   |||||||||      
T  23761240 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcaca 23761141  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgact 173  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23761140 acacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6864214 - 6864036
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||| ||   |||||| |||||||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||||   |||||||||| ||| | |    
T  6864214 caaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttgga 6864115  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcc 189  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  6864114 tgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgacatcaccatacaatttcc 6864036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4396418 - 4396329
Alignment:
Q  98 acaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4396418 acaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattt 4396329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42199908 - 42199743
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||| || ||||| |||||| | |||      
T  42199908 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatgggg 42199809  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||    
T  42199808 tattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttca 42199743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49376117 - 49375980
Alignment:
Q  40 atcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatag 139  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  || ||||||| ||||||  |||||||||  ||| | |||||| ||||     
T  49376117 atcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataa 49376018  T
Q  140 tgttaacttcactag-aaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49376017 tgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgacttca 49375980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 55241137 - 55241317
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||| | | |||||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||||  || ||||||||||||||      
T  55241137 caaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 55241235  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||   ||| | |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  55241236 tgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 55241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 5047997 - 5048173
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||   |||||| ||||| |||| |||||||  |||||   ||||||| |||||| |||| ||||||||||||       
T  5047997 caaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtgg 5048096  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |  |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5048097 tcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataacttcattatagaattt 5048173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7703632 - 7703520
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7703632 gactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 7703533  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
     |  |||||||||    
T  7703532 taacatagaattt 7703520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 36493724 - 36493896
Alignment:
Q  15 gtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgtt 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||   |||||| ||| | |||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  ||||    
T  36493724 gtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgtt 36493823  T
Q  115 actcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||  |||||||||    
T  36493824 actcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattt 36493896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39398033 - 39397916
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||  ||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  39398033 gactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgactt 39397934  T
Q  175 cattatagaatttcccat 192  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  39397933 caccatagaattttccat 39397916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38012033 - 38011857
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||| | |||| || ||||||||   |||||| |||||||||| ||||| |   ||||  |||||||| ||||||  ||  |||||||||||||      
T  38012033 caaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtgggg 38011934  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    || || ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  38011933 tgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattt 38011857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47253870 - 47253752
Alignment:
Q  68 ctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||  |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47253870 ctatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggg-tgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 47253772  T
Q  168 atgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  47253771 atgacttcaccatagaattt 47253752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205119
Alignment:
Q  85 ttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaa 4205122  T
Q  185 ttt 187  Q
    |||    
T  4205121 ttt 4205119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17167825 - 17167716
Alignment:
Q  78 tgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcat 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| || | ||||||     
T  17167825 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcac 17167726  T
Q  178 tatagaattt 187  Q
     |||||||||    
T  17167725 catagaattt 17167716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17173402 - 17173293
Alignment:
Q  78 tgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcat 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| || | ||||||     
T  17173402 tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcac 17173303  T
Q  178 tatagaattt 187  Q
     |||||||||    
T  17173302 catagaattt 17173293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9139424 - 9139250
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||  || ||||| ||| || ||| ||||||||| ||||      
T  9139424 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtgggg 9139325  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||| |  ||| || ||| ||||  ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  9139324 tgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattt 9139250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50697420 - 50697256
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| ||  | ||||| |||||| ||||||||||||| || |      
T  50697420 caaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtaggg 50697322  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  50697321 tgttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttcactaaaaaaatcatttttatgacttca 50697256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50764879 - 50764745
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||  |||||||||  ||| | |||||||  ||||    
T  50764879 tcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt--tagt 50764782  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcat 177  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  50764781 gttaacttcatcaaaaaagttattctcatgacttcat 50764745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 165
Target Start/End: Original strand, 54499300 - 54499425
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcatt-gtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatag 139  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||  ||||   |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||  ||| | |||||| |||||    
T  54499300 tcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatag 54499399  T
Q  140 tgttaacttcactagaaaagtcattc 165  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  54499400 tgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Original strand, 35025684 - 35025796
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| |||  ||| |||||||||  || |||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  35025684 gactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgactt 35025783  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
    ||  |||||||||    
T  35025784 cagcatagaattt 35025796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 53124366 - 53124290
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  53124366 tgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcatcatataattt 53124290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17272073 - 17272014
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  17272073 ttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 17272014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33341457 - 33341398
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33341457 ttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaattt 33341398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37287855 - 37287736
Alignment:
Q  69 tatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctc 167  Q
    ||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||    
T  37287855 tatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctc 37287756  T
Q  168 atgacttcattatagaattt 187  Q
    || ||||||  |||||||||    
T  37287755 attacttcaccatagaattt 37287736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3042728 - 3042614
Alignment:
Q  73 atgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgac 172  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||     
T  3042728 atgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgat 3042629  T
Q  173 ttcattatagaattt 187  Q
    ||||  |||||||||    
T  3042628 ttcaccatagaattt 3042614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 176
Target Start/End: Original strand, 30002720 - 30002821
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||   |||||||||  ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  30002720 gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgactt 30002819  T
Q  175 ca 176  Q
    ||    
T  30002820 ca 30002821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52516655 - 52516611
Alignment:
Q  132 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52516655 tgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctcatgacttca 52516611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 20097485 - 20097536
Alignment:
Q  136 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20097485 atagggttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 20097536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32592242 - 32592107
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  ||| |  |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||   ||| | |||||  | ||||    
T  32592242 tcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagt 32592143  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  32592142 gttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttca 32592107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38811861 - 38811803
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataacataat 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  38811861 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccatatcataat 38811803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 38812260 - 38812305
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38812260 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 38812305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Original strand, 7152238 - 7152314
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  7152238 tgttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattt 7152314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 176
Target Start/End: Original strand, 2266856 - 2266890
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2266856 ttaacttcactagaaaagtcattatcatgacttca 2266890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37775764 - 37775683
Alignment:
Q  95 tgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||| || || |||||||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||||    
T  37775764 tgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttca 37775683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 46888273 - 46888354
Alignment:
Q  95 tgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||| |||||  | ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  46888273 tgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgacttca 46888354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51959912 - 51959867
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  51959912 ttaacttcaccagaaaagtcattatcgtgacttcattgtagaattt 51959867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32579506 - 32579466
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctca 168  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32579506 ttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctca 32579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Original strand, 46884175 - 46884247
Alignment:
Q  120 ttacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||| || ||||||  ||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  46884175 ttacattttttatgttacggtgttaacttcgccaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttccat 46884247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2959923 - 2959747
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |    
T  2959923 caaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggga 2959824  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  2959823 tgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 2959747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32267209 - 32267044
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  32267209 caaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 32267110  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  32267109 tgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttca 32267044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10922902 - 10922737
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  10922902 caaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 10922803  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  10922802 tcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgatttca 10922737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15383108 - 15382932
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |    
T  15383108 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtggga 15383009  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  15383008 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattt 15382932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15752204 - 15752028
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||       
T  15752204 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgagg 15752105  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15752104 tgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 15752028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18422826 - 18422650
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||      
T  18422826 caaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgggg 18422727  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  18422726 tgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattt 18422650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51129034 - 51128884
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||     
T  51129034 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggag 51128935  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtc 161  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51128934 tgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 34012389 - 34012554
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  34012389 aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcact 34012488  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34012489 acagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattt 34012554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 28564782 - 28564947
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||        
T  28564782 caaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaagg 28564881  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||| ||||||    
T  28564882 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttca 28564947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28769827 - 28769652
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||      
T  28769827 caaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggtggg- 28769729  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||  |||||||||    
T  28769728 tgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaattt 28769652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Original strand, 30326985 - 30327129
Alignment:
Q  43 ttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgt 142  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30326985 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgt 30327084  T
Q  143 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  30327085 taaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattt 30327129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3309311 - 3309142
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||||  |||||||||      
T  3309311 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagtggg-tgttactcaca 3309213  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  3309212 acacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttccat 3309142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 10182009 - 10182185
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||  |||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||      
T  10182009 caaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcg 10182108  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||| || || ||| || |||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  10182109 tgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 10182185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30254598 - 30254423
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||    |||||| |||||||||| |||||||  || ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||       
T  30254598 caaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgtg- 30254500  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  30254499 tattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 30254423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1547397 - 1547286
Alignment:
Q  76 actgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttc 175  Q
    ||||||| ||||||  || || |||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1547397 actgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 1547298  T
Q  176 attatagaattt 187  Q
    |  |||||||||    
T  1547297 accatagaattt 1547286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16415821 - 16415655
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtg-ga 109  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||  || |||||||||| |  |     
T  16415821 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagg 16415722  T
Q  110 atgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
     ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16415721 gtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 16415655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14758216 - 14758051
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  ||  ||||||||||| |      
T  14758216 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtg 14758117  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    || |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14758116 tgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 14758051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48620801 - 48620636
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| |  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||      
T  48620801 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcaca 48620702  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  48620701 acacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattt 48620636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 37618893 - 37619073
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagt--ctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   | |||| |||||||||| |||||||    ||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  37618893 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtgg 37618992  T
Q  109 aatgtt--actcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
      ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  37618993 ggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 37619073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 31621554 - 31621719
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||  ||||||  ||  ||||||| || ||      
T  31621554 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcgggg 31621653  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    || |||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31621654 tgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 31621719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38823378 - 38823213
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  || ||||| ||||||  || |||||||| |||||  ||||||||       
T  38823378 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgca 38823279  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38823278 acaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 38823213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47279364 - 47279199
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| || |||  || ||||||||||||||      
T  47279364 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtgggg 47279265  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||  ||| | |||||  |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  47279264 tgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca 47279199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 19899774 - 19899946
Alignment:
Q  15 gtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgtt 114  Q
    |||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| |||||||  |||||| |  ||||| ||||||  |||| |||||||||||   ||||    
T  19899774 gtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgtt 19899873  T
Q  115 actcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  19899874 actcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattt 19899946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37451449 - 37451296
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||| | |||||||  ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || |  ||||||| |||    
T  37451449 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttatt 37451351  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||    
T  37451350 acatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgacttca 37451296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42721214 - 42721032
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  || ||||| |||||| | | ||||||||||||||      
T  42721214 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtgggg 42721115  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 193  Q
    ||||||||| || ||| || ||| ||||| | ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  42721114 tgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttccata 42721032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 238525 - 238689
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| | |||||| | ||| |||  |||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||      
T  238525 aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgga-tgttactcaca 238623  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||| || ||  ||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  238624 acatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaattt 238689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 11742352 - 11742516
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||| ||||| |||||||   ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||      
T  11742352 caaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggg 11742450  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||| |  ||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11742451 tgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttca 11742516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23999522 - 23999357
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| ||||| |  |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||      
T  23999522 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgggg 23999423  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  23999422 tgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttca 23999357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41926327 - 41926162
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||  ||||   |||||||| | ||||  || |||||||||||||| || ||||||| |    
T  41926327 aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcact 41926228  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  41926227 atatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaattt 41926162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3535043 - 3534931
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| ||| || |||||||||    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  3535043 gactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgactt 3534944  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
    ||| |||||||||    
T  3534943 cataatagaattt 3534931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32216198 - 32216090
Alignment:
Q  43 ttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgt 142  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  ||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32216198 ttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgt 32216099  T
Q  143 taacttcac 151  Q
    |||||||||    
T  32216098 taacttcac 32216090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4330456 - 4330289
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagt-gga 109  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||| | ||     
T  4330456 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggg 4330357  T
Q  110 atgttactcattacattgttgatgttatagtg-ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
     ||||||||| |||| | |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  4330356 gtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataacttca 4330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8222303 - 8222141
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||||||  |||||||   || |||       
T  8222303 caaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgta---acggtgtgg 8222207  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  8222206 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttca 8222141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Original strand, 27763314 - 27763451
Alignment:
Q  13 aggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||||||   |||||| || ||||| | |||||||  |||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||  |||  ||    
T  27763314 aggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactatggg-tg 27763412  T
Q  113 ttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27763413 ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 27763451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Original strand, 9903066 - 9903215
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||   ||||  || ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||| |    
T  9903066 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcact 9903165  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatga 171  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  9903166 acagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 7079064 - 7079238
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtg--- 107  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||       
T  7079064 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgagg 7079163  T
Q  108 --------gaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
            |  |||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  7079164 tgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 185
Target Start/End: Original strand, 27533011 - 27533155
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||  || ||||| ||||||  || |||||||| |||||  |||||| ||  | | | |||||| ||||||    
T  27533011 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagt 27533110  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaat 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27533111 gttaacttcaccagaaaagtcattctcataactttatcatagaat 27533155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30254952 - 30254857
Alignment:
Q  91 tcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  30254952 tcattgtacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttcaccatagaattt 30254857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 46931586 - 46931446
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| |||||||   ||||| | |||||  ||||||  | || ||||||||||||      
T  46931586 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtgggg 46931487  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46931486 tattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289675
Alignment:
Q  42 cttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgat-------gt 134  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||  || ||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||       |     
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  135 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 21289675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 27267216 - 27267363
Alignment:
Q  27 tagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacatt 126  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| ||| ||  || ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  27267216 tagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacatt 27267315  T
Q  127 gttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
     || |||   ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  27267316 ttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca 27267363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 27227486 - 27227582
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtg 107  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  27227486 caaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtg 27227582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22170812 - 22170753
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  22170812 ttgatgttatagtgttaacttcattagaaaagtcattttcatgatttcaccatagaattt 22170753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 27563906 - 27564053
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| |   |||    ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||     
T  27563906 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggag 27564005  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaa 158  Q
    ||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27564006 tgttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttcactaaaaaa 27564053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39393528 - 39393393
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| || ||||  |||||  || | ||| ||||||  || |||||||||| || | | |||||||  ||| | |||||| ||||||    
T  39393528 tcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagt 39393429  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39393428 gttaacttcattagaaaagtcattctcataacttca 39393393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 33725612 - 33725777
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||    | ||| |||||  || |||||| |    
T  33725612 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaat 33725711  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  33725712 acacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccatagaattt 33725777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43579290 - 43579245
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43579290 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 43579245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 47682525 - 47682659
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa-tgttactcattacattgttgatgttatag 139  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||| || ||||| ||||||  || ||||||| |||||| | |||||||||  ||||| || ||| ||  |    
T  47682525 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatgcta--g 47682622  T
Q  140 tgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  47682623 tgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgacttca 47682659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40884977 - 40884841
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||  ||||   |||||||| ||||||  ||  |||||||||||||  || |||||| |    
T  40884977 aaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcact 40884878  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaa 158  Q
    ||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  40884877 acacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15168179 - 15168088
Alignment:
Q  96 gtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15168179 gtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaattt 15168088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 42663785 - 42663833
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 190  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  42663785 ttaacttcactaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatttccc 42663833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 192
Target Start/End: Original strand, 27227604 - 27227659
Alignment:
Q  137 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27227604 tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 27227659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18797481 - 18797307
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  18797481 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 18797382  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18797381 tgttactcattacattttttatgt--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 18797307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30055683 - 30055504
Alignment:
Q  9 agcaaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30055683 agcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 30055584  T
Q  109 aatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
      |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30055583 ggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 30055504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 192
Target Start/End: Original strand, 5657520 - 5657669
Alignment:
Q  43 ttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgt 142  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||  |||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  5657520 ttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 5657619  T
Q  143 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  5657620 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 5657669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7334948 - 7334783
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| || |||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  7334948 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 7334849  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  7334848 tgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgacttca 7334783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22687393 - 22687227
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   | |||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  || || ||||||||||||     
T  22687393 caaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggag 22687294  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcat 177  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22687293 tgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcat 22687227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37109996 - 37109850
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37109996 tcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagt 37109897  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  37109896 gttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattt 37109850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24211895 - 24211719
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||  |||| || ||||||| |      
T  24211895 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtaggg 24211796  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  24211795 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 24211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27283898 - 27283722
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||    |||||| |||||||| | ||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  27283898 caaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtgggg 27283799  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || ||||||  |||||||||    
T  27283798 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattt 27283722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 17842623 - 17842769
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||   ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17842623 tcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagt 17842722  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  17842723 gttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattt 17842769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 31579071 - 31579252
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgta-----caaacag 105  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||      ||||||    
T  31579071 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacag 31579170  T
Q  106 tggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||  |||||||||    
T  31579171 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattt 31579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38258699 - 38258534
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||       
T  38258699 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtgg 38258600  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||    
T  38258599 tgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttca 38258534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 32821090 - 32821236
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  32821090 tcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatatt 32821189  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  32821190 gttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattt 32821236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 31520731 - 31520906
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||| | |||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||     
T  31520731 caaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgg-gactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggag 31520829  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  31520830 tgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcataaaattt 31520906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29173694 - 29173540
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| | | |||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  29173694 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggag 29173595  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattc 165  Q
    |||||||||  ||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29173594 tgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 12390648 - 12390813
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| |  |||||  |||  ||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  12390648 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcatt 12390747  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||  |||||||||    
T  12390748 acacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattt 12390813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21991790 - 21991625
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  || ||||||||||||||      
T  21991790 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtgggg 21991691  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||   ||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21991690 tgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttca 21991625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Original strand, 33688273 - 33688433
Alignment:
Q  15 gtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgtt 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||  || || ||||||||| | |||||    
T  33688273 gtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgtt 33688372  T
Q  115 actcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  33688373 actcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaagtcattctcataacttca 33688433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Original strand, 27421450 - 27421562
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| |||||    
T  27421450 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgactt 27421549  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
    ||  |||||||||    
T  27421550 caccatagaattt 27421562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Original strand, 26524363 - 26524510
Alignment:
Q  40 atcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatag 139  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||||  || || ||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  26524363 atcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatag 26524462  T
Q  140 tgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26524463 tgttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 26524510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23111333 - 23111179
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||  ||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||      
T  23111333 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcaca 23111234  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23111233 atatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttca 23111179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 48928582 - 48928735
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |  |||||  |||||||| ||||||  ||  ||||||| |||||  || |||||| |    
T  48928582 aaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgg-gactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcact 48928680  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48928681 acacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 48928735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8861407 - 8861258
Alignment:
Q  43 ttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgt 142  Q
    |||| |||||||| | |||||||  |||||  |||| ||| ||||||  || ||||||||||||||  ||||| |||| ||| | |||||| ||||||||    
T  8861407 ttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgt 8861308  T
Q  143 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  8861307 taacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 8861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 44413386 - 44413563
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||    ||||| ||| |||||| |||| ||  |||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||      
T  44413386 caaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagtgtacaaacattgggg 44413485  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcact-agaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  44413486 tgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactttaccatagaattt 44413563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Original strand, 48928315 - 48928466
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |  |||||  |||||||| ||||||  ||  ||||||| |||||  || |||||| |    
T  48928315 aaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgg-gactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcact 48928413  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48928414 acacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4583043 - 4582897
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||  ||||| |||||  ||||||    
T  4583043 tcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagt 4582944  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
     |||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  4582943 attaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 4582897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10481759 - 10481601
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagt-gga 109  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||     
T  10481759 caaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 10481660  T
Q  110 atgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcact-agaaaagtcattctc 167  Q
     |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  10481659 gtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattctc 10481601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37347128 - 37347011
Alignment:
Q  59 ttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaa 158  Q
    |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  37347128 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaa 37347029  T
Q  159 gtcattctcatgacttca 176  Q
     ||||| |||||||||||    
T  37347028 atcattttcatgacttca 37347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 15612766 - 15612941
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   |||   |||||||| ||||||  || | |||||||| |||      
T  15612766 caaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactgggg 15612865  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  15612866 tgttactcataacact-ttgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattt 15612941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 41765096 - 41765250
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||| || ||||||  ||  |||||||||||||  || |||||| |    
T  41765096 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcact 41765195  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| | |||||| |||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  41765196 acacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttca 41765250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6546673 - 6546488
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||   | | ||| |||||| | | |||||||| |||||      
T  6546673 caaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtgggg 6546574  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataaca 196  Q
    ||||||||   ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  6546573 tgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttccaaaaca 6546488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Original strand, 25691669 - 25691717
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25691669 ttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgacttca 25691717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43686130 - 43686019
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggg-tgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgactt 43686032  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
    ||  |||||||||    
T  43686031 caccatagaattt 43686019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32432576 - 32432435
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||  ||||| |||     |||||    
T  32432576 tcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttg-----atagt 32432482  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||  |||||||||    
T  32432481 gttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattt 32432435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11071328 - 11071183
Alignment:
Q  43 ttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgt 142  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||| ||||||      
T  11071328 ttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagtac 11071229  T
Q  143 taacttcactagaaaagt-cattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||| || | |||| | |||| |||||||||||  |||||||||    
T  11071228 taactttaccaaaaaaatacattttcatgacttcaccatagaattt 11071183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Original strand, 34362239 - 34362336
Alignment:
Q  95 tgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||    
T  34362239 tgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttccat 34362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38053592 - 38053500
Alignment:
Q  59 ttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  38053592 ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcac 38053500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 10359221 - 10359402
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagatt-aagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgga 109  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||   ||||||  ||||||||| |||||||  |||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||| ||| |     
T  10359221 caaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagg 10359319  T
Q  110 atgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||||   |||| || || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  10359320 atgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttccat 10359402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3953779 - 3953734
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3953779 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcatcatagaattt 3953734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12165895 - 12165753
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||     |||| ||| ||||||  || ||||||||||||||  |||||||||      
T  12165895 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcaca 12165796  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcatt 164  Q
    ||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12165795 acactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 9355849 - 9355998
Alignment:
Q  27 tagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacatt 126  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||| || | ||   |||||  ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||  | || |||| ||||||    
T  9355849 tagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacatt 9355948  T
Q  127 gttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
     || ||| ||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  9355949 ttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttca 9355998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26980466 - 26980325
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||   ||||  |||||||| ||||||  || ||||||||| ||||  |||||||||      
T  26980466 aaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcaca 26980367  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcat 163  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  26980366 acacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8299245 - 8299193
Alignment:
Q  135 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  8299245 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 8299193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Original strand, 23402371 - 23402422
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  23402371 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcgccatagaattttccata 23402422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Original strand, 40552297 - 40552441
Alignment:
Q  43 ttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgt 142  Q
    |||| |||||||||| |||||||   ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40552297 ttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 40552396  T
Q  143 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40552397 taacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 40552441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 51212987 - 51213163
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||      
T  51212987 caaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccattgtacaaacagtgggg 51213086  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51213087 tgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 51213163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48355111 - 48354935
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||      
T  48355111 caaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggg 48355012  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  48355011 tgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 48354935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 4761655 - 4761833
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |     
T  4761655 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaag 4761754  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac--tagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||   | |||||||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  4761755 tgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattt 4761833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 3655208 - 3655373
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||      
T  3655208 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgggg 3655307  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |  | |||||||||| | |||||||||    
T  3655308 tgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttca 3655373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 20373302 - 20373483
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  | ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  20373302 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 20373401  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  20373402 tgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcactataaaattttccat 20373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 52040928 - 52041094
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagt-gga 109  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||  || | |||||||| | ||     
T  52040928 caaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggg 52041027  T
Q  110 atgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
      |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52041028 gagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 52041094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35844485 - 35844320
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||   |||||||||      
T  35844485 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcaca 35844386  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  35844385 acatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattt 35844320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 26941266 - 26941442
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||  | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  26941266 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgggg 26941365  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26941366 tgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattt 26941442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Original strand, 42506079 - 42506214
Alignment:
Q  9 agcaaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42506079 agcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 42506178  T
Q  109 aatgttactcattacattgttgatgttatagtgtta 144  Q
      | |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42506179 ggtattactcattacaattttgatgttatagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4015600 - 4015448
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| |  |||||||||  ||| | |||||| ||||||    
T  4015600 tcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagt 4015501  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 193  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  4015500 gttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccata 4015448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 11357371 - 11357535
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa- 110  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||       
T  11357371 aaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtggggg 11357470  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttc 175  Q
    ||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11357471 tgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Original strand, 46297832 - 46297944
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  46297832 gactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgactt 46297931  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
    ||  |||||||||    
T  46297932 caccatagaattt 46297944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37203236 - 37203061
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||  |    
T  37203236 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggt 37203137  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  37203136 gttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattt 37203061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34133066 - 34132929
Alignment:
Q  50 tctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttc 149  Q
    |||||||| |||||||   ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||  ||||||||||| |||    
T  34133066 tctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttc 34132967  T
Q  150 actagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    || | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34132966 accaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattt 34132929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 7327489 - 7327665
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| || ||||||||   |||||| |||| ||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| |||||||| | |||| |    
T  7327489 aaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagt 7327588  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtg-ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  7327589 gttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattt 7327665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29099495 - 29099360
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||  ||| |  |||||||| || ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  29099495 tcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagt 29099396  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29099395 gttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttca 29099360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37157876 - 37157702
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||  |    
T  37157876 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtacaa-cagtggggt 37157778  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  37157777 gttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattt 37157702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11466994 - 11466818
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||| ||| ||||||  || ||||||||||||||      
T  11466994 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 11466895  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| |   ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  11466894 tgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattt 11466818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47481651 - 47481527
Alignment:
Q  52 tgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||| |||||||  |||||| | || ||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481651 tgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 47481552  T
Q  152 tagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
     | |||  ||||||  |||||||||    
T  47481551 caaaaacatcattcctatgacttca 47481527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 27480396 - 27480566
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| |||  ||||||||| | | ||| ||||||||    
T  27480396 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgctactcatt 27480495  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    | | | |||||||||||||||| |||| || | |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27480496 atacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaattttccat 27480566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32373556 - 32373463
Alignment:
Q  95 tgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 190  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32373556 tgtacaaacagtgga--gttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgacttcatcatagaatttccc 32373463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 44186507 - 44186683
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   | |||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||      
T  44186507 caaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcgggg 44186606  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  44186607 tgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaattt 44186683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 53176213 - 53176074
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| |      
T  53176213 aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtggaca-ttacttaca 53176115  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtca 162  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  53176114 acatttttgatgttatgatgttaacttcatcagaaaagtca 53176074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40936131 - 40935996
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| | |||||  |||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||   ||||||||   ||| | |||||| ||||||    
T  40936131 tcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagt 40936032  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40936031 gttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttca 40935996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 24488979 - 24489133
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| | |||||||| |||||||   ||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24488979 aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcaca 24489078  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||| || ||  |||||| |||||||||| | |||| ||||| || ||||||||    
T  24489079 acatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgacttca 24489133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22451127 - 22450962
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  ||   |||||||||||   || |||||| |    
T  22451127 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcact 22451028  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  22451027 acacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 22450962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Original strand, 21009808 - 21009948
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| |||||||   ||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||      
T  21009808 caagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgggg 21009907  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  21009908 tgttactcattacatttttgatgttatagtgtcaaattcac 21009948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21193776 - 21193600
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||   |||||| |||||||||| || ||||  | |||  |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||      
T  21193776 caaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtgggg 21193677  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | |||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21193676 tgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattt 21193600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 43975905 - 43976056
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||   ||||| || | ||| |||||| |||| ||||||| |||||| || |||||| |    
T  43975905 aaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcact 43976004  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| | |||||| ||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  43976005 acacttttgatgctatagtgttgacttc---aaaaaagtcattctcatgacttca 43976056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54505878 - 54505802
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   |||||||| ||| |||||    
T  54505878 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattcttgcgacttcatcataaaattt 54505802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44891585 - 44891512
Alignment:
Q  102 acagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  44891585 acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgacttca 44891512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45174645 - 45174516
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt--acattgttgatgttata 138  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||   | ||||||||||||| | |||||||||    ||| | |||||||||||    
T  45174645 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttata 45174546  T
Q  139 gtgttaacttcactagaaaagtcattctca 168  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  45174545 gtgttaacttcaccaaaaaagttattctca 45174516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 46994667 - 46994821
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||       ||       
T  46994667 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta-------tg--- 46994756  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| | |||||||    
T  46994757 tgttactcattacatt-ttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttacgacttca 46994821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 53229159 - 53229324
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtg-gaa 110  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||   | |||||||||| || |      
T  53229159 aaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgaggg 53229258  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||| |||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  53229259 tgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgacttca 53229324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39282822 - 39282647
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||   |||||  ||||||| ||||||  || |||| |||||||||      
T  39282822 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtgggg 39282723  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    | |||||||  ||| | |||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  39282722 tattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattt 39282647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33698258 - 33698186
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||  |||||||||    
T  33698258 tgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcactagaga----attctcatgacttcaccatagaattt 33698186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 40640634 - 40640679
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40640634 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 40640679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Original strand, 54828708 - 54828843
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   ||||||  || |||||| |||||||  |||||| || ||||  |||||| || ||||  |||| ||||  |    
T  54828708 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggt 54828807  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaactt 148  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  54828808 gttactcattacatt-tttatgttatagtgttaactt 54828843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3362382 - 3362283
Alignment:
Q  52 tgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac 151  Q
    |||||| |||||||  | |||| || ||||| ||||||  || |||||||| ||||| |||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  3362382 tgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcac 3362283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 11835737 - 11835788
Alignment:
Q  136 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  11835737 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 11835788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Original strand, 55343407 - 55343466
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  55343407 ttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 55343466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 176
Target Start/End: Original strand, 32180747 - 32180781
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32180747 ttaacttcactagaaaagtcattctcataacttca 32180781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2008073 - 2007964
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||  || ||||| ||||||  || ||||||||||||||  |||||||||  ||| | || | | ||||||    
T  2008073 tcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagt 2007974  T
Q  141 gttaacttca 150  Q
    ||||||||||    
T  2007973 gttaacttca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4556587 - 4556542
Alignment:
Q  143 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttc 188  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4556587 taacttcacgagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttc 4556542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 190
Target Start/End: Original strand, 22446138 - 22446250
Alignment:
Q  78 tgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||| ||||||  || |||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  22446138 tgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttca 22446236  T
Q  177 ttatagaatttccc 190  Q
       |||||||||||    
T  22446237 ccgtagaatttccc 22446250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 33378791 - 33378951
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| |  |||||  |||||||| |||||| |||  ||||||| | |||      
T  33378791 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattgggg 33378890  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |  |||||| |||| | |||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  33378891 tactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac---aaaagtcattctcataactt 33378951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42204391 - 42204338
Alignment:
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 194  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  42204391 gttaacttcatcagaaaagtcattctcacgacttcacgatagaattttccataa 42204338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 45879498 - 45879543
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45879498 ttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcagcatagaattt 45879543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 23165838 - 23165886
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 190  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  23165838 ttaacttcactaaaaaaatcattatcatgacttcaccatagaatttccc 23165886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 38392628 - 38392676
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 190  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  38392628 ttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatataatttccc 38392676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 147
Target Start/End: Original strand, 41585413 - 41585449
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaact 147  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41585413 tgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 53811976 - 53812028
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 194  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  53811976 ttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataa 53812028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8068 - 7890
Alignment:
Q  9 agcaaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    |||||| || || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8068 agcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 7969  T
Q  109 aatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
      |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  7968 ggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24886282 - 24886116
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |    
T  24886282 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 24886183  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcac--tagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  24886182 gttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttca 24886116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 30969331 - 30969496
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||      
T  30969331 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcaca 30969430  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30969431 acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgacttcattgtagaattt 30969496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 699328 - 699164
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |    
T  699328 aaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 699229  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  699228 gttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttca 699164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 22974089 - 22974254
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22974089 aaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcatt 22974188  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22974189 acttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattt 22974254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39572998 - 39572822
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||  ||||||  ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||     
T  39572998 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggag 39572899  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39572898 tgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 39572822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 35511484 - 35511638
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  35511484 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcact 35511583  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  35511584 acagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttca 35511638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 27318484 - 27318648
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  || |||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  |    
T  27318484 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgt 27318583  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27318584 gttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttca 27318648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 31705608 - 31705783
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| || |      
T  31705608 caaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtaggg 31705706  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  31705707 tgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattt 31705783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 38528233 - 38528408
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||      
T  38528233 caaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgggg 38528331  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||  |||||||||    
T  38528332 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattt 38528408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 8741882 - 8742059
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||      
T  8741882 caaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggg 8741981  T
Q  111 -tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
     |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8741982 gtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 8742059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22980972 - 22980796
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||      
T  22980972 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtgggg 22980873  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    | ||||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  22980872 tattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcataaaattt 22980796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26268253 - 26268077
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||| ||| |||||| |||  |||||||||||||      
T  26268253 caaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtgggg 26268154  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26268153 tgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactgtagaattt 26268077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 35826536 - 35826655
Alignment:
Q  68 ctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  35826536 ctatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatc 35826635  T
Q  168 atgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  35826636 atgacttcaccatagaattt 35826655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19120008 - 19119862
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    ||| | |||||| ||||||    
T  19120008 tcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagt 19119909  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19119908 gttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 19119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 176
Target Start/End: Original strand, 43308688 - 43308813
Alignment:
Q  51 ctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca 150  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  43308688 ctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagtgg-gtgttattcattacatttttgatgttataatgttaacttta 43308786  T
Q  151 ct-agaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  43308787 ctaaaaaaagtcattctcatgacttca 43308813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 14919525 - 14919690
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   | |||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||||   |    
T  14919525 aaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggt 14919624  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  14919625 gttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttca 14919690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 23116218 - 23116399
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||||| ||||||| || ||||||||||||||      
T  23116218 caaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtgggg 23116317  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    || |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  23116318 tgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttccat 23116399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33908412 - 33908247
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||  | |||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||     
T  33908412 caaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggag 33908313  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    || |||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33908312 tgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgacttca 33908247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7693409 - 7693233
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |   || ||| ||||| |||| |||||||  ||| || || ||||| ||||||  || |||||||||||||| |    
T  7693409 caaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggga 7693310  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  7693309 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattt 7693233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27330446 - 27330309
Alignment:
Q  48 aatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaact 147  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  27330446 aatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaact 27330349  T
Q  148 tcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  27330348 tcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 27330309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32563328 - 32563152
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   || |  |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||     
T  32563328 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggag 32563229  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  32563228 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattt 32563152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 14409334 - 14409503
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||  |||  || |||||  || |||||| |    
T  14409334 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcact 14409432  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  14409433 acatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 14409503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 151
Target Start/End: Original strand, 17158057 - 17158166
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| || ||||  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17158057 tcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagt 17158155  T
Q  141 gttaacttcac 151  Q
    |||||||||||    
T  17158156 gttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5837718 - 5837569
Alignment:
Q  27 tagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacatt 126  Q
    |||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||| |    
T  5837718 tagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacact 5837619  T
Q  127 gttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
     |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5837618 tttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatgaattca 5837569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 31786653 - 31786825
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||||     | |||| |    
T  31786653 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcact 31786752  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 194  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  31786753 acatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttccataa 31786825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22255350 - 22255195
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   |||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22255350 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcatt 22255251  T
Q  122 aca-ttgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  22255250 acattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgacttca 22255195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 5112312 - 5112474
Alignment:
Q  14 ggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgt 113  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    |||||| ||| | |||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  || ||||||||||||||  |||    
T  5112312 ggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgt 5112411  T
Q  114 tactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||| || ||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  5112412 tactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttca 5112474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15724604 - 15724487
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15724604 gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactt 15724506  T
Q  175 cattatagaatttcccata 193  Q
    ||  ||||||||| |||||    
T  15724505 caccatagaattttccata 15724487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 1429141 - 1429306
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||   |||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||  ||||||  || ||||||||||||||      
T  1429141 caaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtgggg 1429240  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||    
T  1429241 tgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttca 1429306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9200412 - 9200247
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||| ||   |||||| ||| |||||| |||||||  ||| || |||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||      
T  9200412 caaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtgggg 9200313  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  9200312 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttca 9200247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12910534 - 12910353
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttc-----attgtacaaacag 105  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   || ||| |||||||||| |||| ||  |||||| |||||||| |||||| ||     | |||||||||||    
T  12910534 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacag 12910435  T
Q  106 tggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||  |||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  12910434 tggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 12910353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Original strand, 26317780 - 26317856
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26317780 tgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattt 26317856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36860538 - 36860426
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  36860538 gactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgactt 36860439  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
    ||  |||||||||    
T  36860438 caccatagaattt 36860426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36866877 - 36866765
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  36866877 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgactt 36866778  T
Q  175 cattatagaattt 187  Q
    ||  |||||||||    
T  36866777 caccatagaattt 36866765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 25500952 - 25501098
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||  || |||||||||||||   ||||| |||  ||| | |||||| ||||||    
T  25500952 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagt 25501051  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25501052 gttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 25501098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956506
Alignment:
Q  95 tgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttca 13956506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8466807 - 8466748
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8466807 ttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattt 8466748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8437086 - 8436980
Alignment:
Q  70 atgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcat 169  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| | | || | ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  8437086 atgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcat 8436987  T
Q  170 gacttca 176  Q
    |||||||    
T  8436986 gacttca 8436980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 194
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004556
Alignment:
Q  113 ttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtc-attctcatgacttcattatagaatttcccataa 194  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttccataa 16004556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40133500 - 40133383
Alignment:
Q  75 gactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  40133500 gactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgactt 40133401  T
Q  175 cattatagaatttcccat 192  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  40133400 caccatagaattttccat 40133383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Original strand, 6824475 - 6824585
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactga--acgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||| | |||||||  |||||| ||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  6824475 caaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 6824574  T
Q  109 aatgttactca 119  Q
    | |||||||||    
T  6824575 agtgttactca 6824585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Original strand, 28416534 - 28416665
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   || |  || ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||      
T  28416534 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcaca 28416633  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcacta 153  Q
    | | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28416634 atacttttgatattatagtgttaacttcacta 28416665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 7208860 - 7209025
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||| || |      
T  7208860 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtaggg 7208958  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||| || |||| || |||||| | ||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  7208959 tgttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcaccaaaaaaagtcatttttatgacttca 7209025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13380549 - 13380509
Alignment:
Q  136 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13380549 atagggttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 13380509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Original strand, 15992566 - 15992633
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtgg 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15992566 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgg 15992633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22255654 - 22255615
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22255654 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 22255615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10237462 - 10237417
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  10237462 ttaacttcactagaaaagtcattttcatgacttcacaatagaattt 10237417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22019810 - 22019646
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   |||||| ||| ||||||  ||||||  ||| |  |||| ||| |||||| ||| | |||||||| |||  |    
T  22019810 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggt 22019711  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||  ||| | |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22019710 gttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattctaataacttca 22019646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5830032 - 5829955
Alignment:
Q  59 ttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgtta 136  Q
    |||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||| || ||||||    
T  5830032 ttgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgtta 5829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22616542 - 22616497
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  22616542 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 22616497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 4318839 - 4319004
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||  |||||  |  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||     
T  4318839 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcata 4318938  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4318939 acacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 4319004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1946013 - 1945847
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| ||  |||||| || ||||  |||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  1946013 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtgggg 1945914  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  1945913 tgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttca 1945847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8513382 - 8513236
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||   ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||| |||||||    
T  8513382 tcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagt 8513283  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8513282 gttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 8513236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5627570 - 5627405
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| ||||| |  |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||      
T  5627570 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgggg 5627471  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  5627470 tgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttca 5627405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 7235040 - 7235222
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| |  |||||| |||||||| ||||||  ||  |||||||||||||      
T  7235040 caaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatga-gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtgggg 7235138  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 194  Q
    || |||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  7235139 tgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataa 7235222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6089057 - 6088911
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||   ||||||||  ||| | |||||  ||||||    
T  6089057 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagt 6088958  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  6088957 gttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 6088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15491793 - 15491631
Alignment:
Q  12 aaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaat 111  Q
    |||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||  || |||||||| |||||  |    
T  15491793 aaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggt 15491694  T
Q  112 gttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 174  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15491693 gttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 7055220 - 7055385
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||       
T  7055220 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgagg 7055319  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  7055320 tgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttca 7055385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 33893008 - 33893183
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| |  |||||||| ||| || |||||||||||| |||||      
T  33893008 caaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagg-gactgaacttttaatatcattgtacaaatagtgggg 33893106  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |  |||||||||    
T  33893107 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattt 33893183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 3879974 - 3880120
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||| | |||||  |||| |    
T  3879974 tcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataat 3880073  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  3880074 gttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattt 3880120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 30353363 - 30353539
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||  || |||||| |||||||  |||||  ||||||||  | |||  || |||||||||||||  |    
T  30353363 caaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaacagtgaga 30353462  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    | ||||||   ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30353463 tattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 30353539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20768234 - 20768089
Alignment:
Q  40 atcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatag 139  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||  |||||| |||||||| ||||||  || |  ||||||| |||| || |||||| |||| | |||||| |||||    
T  20768234 atcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccacta-acaaacaatgga-tgctactcactacacttttgatgctatag 20768137  T
Q  140 tgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20768136 tgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 20768089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 6091188 - 6091368
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   | |||| ||||| |||| |||||||  ||| ||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||      
T  6091188 caaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtg 6091287  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| | ||||||||| || | |||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  6091288 tgttactcactacattttttatgttaca-tgttaactttaccaaaaaaattattttcatgacttcacaatagaatttcccat 6091368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29182331 - 29182177
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||| | |||||||||| |||||||   ||||  |||||||| ||||||  || |||| |||||||||  |||||||||      
T  29182331 aaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcaca 29182232  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||    
T  29182231 acacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttca 29182177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498440
Alignment:
Q  59 ttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa-tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaa 157  Q
    |||||||  |||||| |||||||| ||||||  || ||||||||| ||||   |||| |||| |||| | |||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  158 agtcattctcatgacttcattataga 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactataga 18498440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33619002 - 33618848
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcatt 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||||||  ||  ||||||| | |||  || |||||| |    
T  33619002 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctactcact 33618903  T
Q  122 acattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||| | ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  33618902 acacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgacttca 33618848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 21017147 - 21017282
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  ||||| || ||  || | |    
T  21017147 tcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaat 21017246  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  21017247 gttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttca 21017282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 24662189 - 24662240
Alignment:
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  24662189 gttaacttcactagaaaagtcattatcatgactttaccatagaattttccat 24662240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19631797 - 19631752
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  19631797 ttaacttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 19631752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30338524 - 30338479
Alignment:
Q  142 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  30338524 ttaacttcactaaaaaagtcattctcacaacttcatcatagaattt 30338479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 137
Alignment:
Q  41 tcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagt 140  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||  || |||    
T  283 tcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagt 184  T
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  183 gttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 408435 - 408559
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||  ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||        
T  408435 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaagg 408533  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgtta 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  408534 tgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 94473 - 94547
Alignment:
Q  95 tgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcat 169  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  94473 tgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 146022 - 146187
Alignment:
Q  11 caaggtatgagaaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaa 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||   |||||| || ||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| | |||      
T  146022 caaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatgggg 146121  T
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||    
T  146122 tgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgacttca 146187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44099 - 43960
Alignment:
Q  48 aatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaact 147  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  44099 aatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaact 44000  T
Q  148 tcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| | ||||||| |||| | |||||||  |||||||||    
T  43999 tcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaattt 43960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Original strand, 154688 - 154827
Alignment:
Q  48 aatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattgtacaaacagtggaatgttactcattacattgttgatgttatagtgttaact 147  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  154688 aatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaact 154787  T
Q  148 tcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||| | ||||||| |||| | |||||||  |||||||||    
T  154788 tcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaattt 154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42427 - 42362
Alignment:
Q  111 tgttactcattacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 176  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  42427 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttca 42362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 100883 - 100824
Alignment:
Q  128 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  100883 ttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 100824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12077 - 11909
Alignment:
Q  22 aaaagtagattaagtgggatcttgtgaatctgatgagttgatgagtctatgatgactgaacgtttgatttcattg-tacaaacagtggaa-tgttactca 119  Q
    |||| |||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||   ||||| |||||||| ||||||  || || |||||||| |||   |||||||||    
T  12077 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactca 11978  T
Q  120 ttacattgttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtca-ttctcatgacttcattatagaattt 187  Q
      ||| | || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  11977 caacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaattt 11909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 12137 - 12188
Alignment:
Q  141 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  12137 gttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcatagaattttccat 12188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University