View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16886_high_2 (Length: 384)

Name: NF16886_high_2
Description: NF16886
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16886_high_2
NF16886_high_2
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (16-291)||(15338772-15339046)
chr7 (16-283)||(15723180-15723446)
chr7 (16-283)||(35962701-35962968)
chr7 (16-283)||(14431935-14432201)
chr7 (16-283)||(15710956-15711222)
chr7 (19-310)||(19599791-19600080)
chr7 (20-272)||(1612573-1612825)
chr7 (29-372)||(806875-807213)
chr7 (26-361)||(23201388-23201721)
chr7 (26-361)||(23507515-23507848)
chr7 (29-372)||(18055586-18055925)
chr7 (70-283)||(14281609-14281822)
chr7 (29-372)||(11631817-11632156)
chr7 (29-372)||(18049107-18049446)
chr7 (20-272)||(6411771-6412023)
chr7 (20-243)||(16109071-16109293)
chr7 (26-327)||(20579863-20580160)
chr7 (21-323)||(23665753-23666055)
chr7 (21-323)||(29795679-29795981)
chr7 (21-323)||(29799498-29799800)
chr7 (70-272)||(11390302-11390503)
chr7 (70-272)||(20328224-20328425)
chr7 (41-272)||(11302821-11303052)
chr7 (70-272)||(21232009-21232210)
chr7 (143-283)||(14128244-14128383)
chr7 (70-272)||(11383814-11384015)
chr7 (70-272)||(11220086-11220290)
chr7 (70-272)||(18606866-18607067)
chr7 (70-272)||(16676192-16676393)
chr7 (70-272)||(17650429-17650629)
chr7 (70-230)||(4279963-4280123)
chr7 (70-230)||(19616295-19616455)
chr7 (136-272)||(13006372-13006508)
chr7 (70-248)||(13123971-13124148)
chr7 (70-248)||(14421354-14421532)
chr7 (41-272)||(3289754-3289984)
chr7 (70-230)||(12591652-12591812)
chr7 (70-230)||(12710917-12711077)
chr7 (70-248)||(13742505-13742682)
chr7 (185-272)||(36306034-36306121)
chr7 (70-171)||(14945918-14946020)
chr7 (70-171)||(15373511-15373613)
chr7 (21-212)||(147016-147210)
chr7 (41-212)||(14320600-14320773)
chr7 (94-144)||(17182674-17182724)
chr7 (70-171)||(36306111-36306213)
chr7 (70-212)||(14565708-14565851)
chr7 (190-272)||(18958399-18958481)
chr7 (70-154)||(37244401-37244484)
chr7 (20-154)||(16187852-16187984)
chr7 (11-154)||(833040-833182)
chr7 (11-154)||(1198220-1198362)
chr7 (41-212)||(16008053-16008226)
chr7 (70-212)||(31154367-31154509)
chr7 (190-272)||(37244278-37244360)
chr7 (70-154)||(18958522-18958605)
chr7 (70-132)||(642550-642610)
chr7 (190-272)||(836998-837081)
chr7 (190-272)||(1202178-1202261)
chr7 (70-132)||(2438884-2438944)
chr7 (70-132)||(8197311-8197371)
chr7 (70-132)||(8213382-8213442)
chr7 (70-132)||(11299765-11299825)
chr7 (70-132)||(11308129-11308189)
chr7 (70-132)||(11339771-11339831)
chr7 (70-132)||(11879067-11879127)
chr7 (70-132)||(11899421-11899481)
chr7 (70-132)||(13964114-13964174)
chr7 (70-154)||(15086016-15086098)
chr7 (70-132)||(16843982-16844042)
chr7 (70-132)||(17726444-17726504)
chr7 (70-132)||(26113867-26113927)
chr7 (70-132)||(26120480-26120540)
chr7 (70-132)||(37285209-37285269)
chr7 (70-132)||(40923034-40923094)
chr7 (70-132)||(42058549-42058609)
chr7 (70-132)||(46649770-46649830)
chr7 (190-272)||(15085893-15085975)
chr7 (190-272)||(26289738-26289820)
chr7 (101-157)||(16187804-16187858)
chr7 (70-130)||(18437280-18437338)
chr7 (185-272)||(14945840-14945928)
chr7 (185-272)||(15373433-15373521)
chr7 (70-133)||(17468363-17468424)
chr7 (70-133)||(17584790-17584851)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (16-283)||(3706727-3706993)
chr1 (16-283)||(23066665-23066932)
chr1 (26-372)||(27280150-27280493)
chr1 (22-272)||(20242484-20242735)
chr1 (16-243)||(22448277-22448494)
chr1 (16-171)||(955118-955273)
chr1 (20-272)||(32650052-32650304)
chr1 (70-272)||(19664105-19664306)
chr1 (42-272)||(29554419-29554645)
chr1 (70-272)||(19778434-19778639)
chr1 (70-230)||(21542056-21542216)
chr1 (70-230)||(42095920-42096080)
chr1 (41-212)||(20941891-20942062)
chr1 (70-248)||(20438531-20438709)
chr1 (70-272)||(20838142-20838349)
chr1 (20-272)||(16883514-16883768)
chr1 (70-227)||(20045899-20046056)
chr1 (143-272)||(41110887-41111016)
chr1 (70-272)||(19961135-19961338)
chr1 (185-281)||(955032-955128)
chr1 (70-272)||(20824333-20824530)
chr1 (70-154)||(43088391-43088471)
chr1 (70-154)||(24079551-24079634)
chr1 (70-154)||(24109120-24109203)
chr1 (43-154)||(29534913-29535022)
chr1 (41-213)||(16371506-16371680)
chr1 (70-154)||(23195571-23195653)
chr1 (190-272)||(24108997-24109079)
chr1 (70-154)||(36614935-36615015)
chr1 (70-132)||(3652755-3652815)
chr1 (70-132)||(6740517-6740577)
chr1 (70-132)||(18026808-18026868)
chr1 (70-132)||(18418123-18418183)
chr1 (70-132)||(20292679-20292739)
chr1 (190-272)||(21664283-21664366)
chr1 (70-132)||(24850099-24850159)
chr1 (70-132)||(28556558-28556618)
chr1 (70-132)||(29596912-29596972)
chr1 (70-132)||(37675392-37675452)
chr1 (70-132)||(37682085-37682145)
chr1 (70-132)||(38908110-38908170)
chr1 (70-132)||(39094320-39094380)
chr1 (70-154)||(47484107-47484186)
chr1 (70-132)||(49328033-49328093)
chr1 (190-243)||(20086484-20086537)
chr1 (70-132)||(17146257-17146316)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (16-323)||(14421-14727)
scaffold0239 (104-283)||(7178-7356)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (16-283)||(14652680-14652946)
chr3 (16-283)||(16382844-16383110)
chr3 (18-272)||(13203514-13203767)
chr3 (16-283)||(16838466-16838731)
chr3 (26-356)||(13946432-13946758)
chr3 (35-356)||(13909496-13909813)
chr3 (16-283)||(14544155-14544423)
chr3 (16-323)||(12200151-12200454)
chr3 (26-356)||(13939946-13940268)
chr3 (29-372)||(44775162-44775501)
chr3 (29-372)||(44780346-44780685)
chr3 (17-243)||(34852213-34852439)
chr3 (26-310)||(8742848-8743128)
chr3 (26-310)||(8761018-8761298)
chr3 (26-372)||(4677122-4677463)
chr3 (26-372)||(41175435-41175776)
chr3 (26-372)||(41180573-41180914)
chr3 (24-272)||(14292657-14292906)
chr3 (16-195)||(16830055-16830232)
chr3 (21-272)||(12304698-12304949)
chr3 (70-272)||(16802425-16802626)
chr3 (70-272)||(17157061-17157262)
chr3 (70-272)||(23174159-23174358)
chr3 (161-283)||(16829943-16830065)
chr3 (70-272)||(24191762-24191963)
chr3 (70-271)||(12961378-12961580)
chr3 (70-272)||(31690570-31690774)
chr3 (17-272)||(17199015-17199264)
chr3 (20-272)||(18719109-18719361)
chr3 (70-230)||(8583311-8583471)
chr3 (70-230)||(14084531-14084691)
chr3 (70-230)||(14089932-14090092)
chr3 (20-272)||(18129776-18130029)
chr3 (70-248)||(9532849-9533027)
chr3 (70-230)||(13968850-13969010)
chr3 (70-230)||(13974325-13974485)
chr3 (14-272)||(19443421-19443674)
chr3 (70-230)||(24123220-24123380)
chr3 (70-230)||(49399473-49399633)
chr3 (70-272)||(41456123-41456325)
chr3 (70-243)||(17243684-17243857)
chr3 (70-268)||(11964880-11965080)
chr3 (70-227)||(17190836-17190992)
chr3 (70-272)||(31943441-31943645)
chr3 (42-272)||(12255106-12255326)
chr3 (70-236)||(18888966-18889133)
chr3 (70-272)||(18900005-18900209)
chr3 (20-212)||(18136351-18136543)
chr3 (102-272)||(13313911-13314084)
chr3 (21-212)||(38312183-38312378)
chr3 (99-272)||(13303235-13303411)
chr3 (99-272)||(13324823-13324999)
chr3 (185-272)||(23173876-23173963)
chr3 (41-171)||(23173758-23173886)
chr3 (70-212)||(18914006-18914148)
chr3 (69-202)||(12363444-12363578)
chr3 (190-272)||(10597706-10597788)
chr3 (70-132)||(11850778-11850840)
chr3 (20-154)||(2270356-2270489)
chr3 (20-157)||(17496069-17496204)
chr3 (20-154)||(12356098-12356230)
chr3 (20-154)||(12362647-12362779)
chr3 (20-154)||(12479833-12479965)
chr3 (70-132)||(9772023-9772083)
chr3 (21-132)||(29545269-29545380)
chr3 (161-272)||(12479679-12479791)
chr3 (70-132)||(2499151-2499211)
chr3 (70-132)||(8374031-8374091)
chr3 (70-132)||(9691514-9691574)
chr3 (70-154)||(10597829-10597911)
chr3 (70-132)||(10767738-10767798)
chr3 (70-154)||(12419391-12419473)
chr3 (70-132)||(19344259-19344319)
chr3 (70-132)||(21151564-21151624)
chr3 (70-132)||(29493535-29493595)
chr3 (70-132)||(29550919-29550979)
chr3 (70-132)||(30596965-30597025)
chr3 (70-132)||(45611648-45611708)
chr3 (70-132)||(50656095-50656155)
chr3 (70-132)||(53571341-53571401)
chr3 (190-272)||(18756935-18757017)
chr3 (70-112)||(18757099-18757141)
chr3 (71-132)||(38742917-38742976)
chr3 (70-132)||(54520256-54520317)
chr3 (70-212)||(14864788-14864930)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (16-283)||(2105523-2105790)
chr2 (26-372)||(27295880-27296223)
chr2 (29-372)||(12578754-12579092)
chr2 (29-372)||(12572272-12572610)
chr2 (29-372)||(27785656-27785995)
chr2 (29-372)||(27790877-27791216)
chr2 (21-372)||(10685501-10685852)
chr2 (21-272)||(20260773-20261024)
chr2 (70-272)||(22809882-22810084)
chr2 (21-272)||(9241282-9241534)
chr2 (70-272)||(20724032-20724236)
chr2 (70-272)||(23090006-23090207)
chr2 (70-272)||(23102434-23102635)
chr2 (70-272)||(19703456-19703659)
chr2 (70-248)||(26582675-26582852)
chr2 (70-272)||(21907248-21907452)
chr2 (104-272)||(23877873-23878040)
chr2 (72-243)||(23263985-23264155)
chr2 (70-248)||(23169298-23169475)
chr2 (70-248)||(23580555-23580732)
chr2 (70-230)||(200641-200801)
chr2 (70-230)||(6744341-6744501)
chr2 (70-230)||(27367600-27367760)
chr2 (70-230)||(43693401-43693561)
chr2 (70-272)||(21073954-21074157)
chr2 (70-248)||(6482321-6482499)
chr2 (70-248)||(6485788-6485966)
chr2 (70-272)||(23290925-23291129)
chr2 (70-272)||(19649517-19649721)
chr2 (41-272)||(23752763-23752994)
chr2 (41-272)||(24658745-24658977)
chr2 (70-230)||(5707031-5707191)
chr2 (70-272)||(24943376-24943580)
chr2 (41-209)||(27211017-27211187)
chr2 (17-124)||(22703436-22703543)
chr2 (41-212)||(26884122-26884295)
chr2 (41-212)||(24652301-24652472)
chr2 (41-154)||(22796770-22796881)
chr2 (70-212)||(6261581-6261723)
chr2 (70-153)||(28971375-28971456)
chr2 (100-209)||(27208682-27208792)
chr2 (72-148)||(23269201-23269276)
chr2 (72-148)||(23276070-23276145)
chr2 (70-154)||(23062501-23062584)
chr2 (190-272)||(28971251-28971333)
chr2 (70-132)||(45028509-45028570)
chr2 (185-272)||(22796600-22796688)
chr2 (70-132)||(4071616-4071676)
chr2 (70-132)||(4077421-4077481)
chr2 (70-132)||(11360311-11360371)
chr2 (70-132)||(14563833-14563893)
chr2 (70-132)||(20850190-20850250)
chr2 (70-132)||(21604765-21604825)
chr2 (70-132)||(22013184-22013244)
chr2 (70-132)||(24481671-24481731)
chr2 (70-132)||(25590278-25590338)
chr2 (70-132)||(27037245-27037305)
chr2 (70-132)||(27272252-27272312)
chr2 (70-132)||(27729509-27729569)
chr2 (70-132)||(30196586-30196646)
chr2 (70-132)||(35244106-35244166)
chr2 (70-132)||(35585358-35585418)
chr2 (190-272)||(21133225-21133307)
chr2 (70-132)||(32911559-32911620)
chr2 (70-154)||(21133348-21133431)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (16-283)||(22906911-22907178)
chr6 (26-372)||(33682079-33682422)
chr6 (19-272)||(19726555-19726807)
chr6 (16-283)||(1592705-1592971)
chr6 (16-283)||(21724725-21724991)
chr6 (19-272)||(937658-937910)
chr6 (29-372)||(14033103-14033442)
chr6 (26-372)||(27562415-27562756)
chr6 (26-310)||(23835015-23835295)
chr6 (26-372)||(28359730-28360074)
chr6 (21-323)||(28290133-28290435)
chr6 (69-243)||(29416470-29416644)
chr6 (21-272)||(12941749-12942000)
chr6 (20-264)||(8760410-8760654)
chr6 (70-272)||(21566163-21566364)
chr6 (70-272)||(19588556-19588760)
chr6 (70-248)||(29615199-29615376)
chr6 (70-272)||(14375284-14375489)
chr6 (70-230)||(24562282-24562442)
chr6 (136-272)||(12167303-12167439)
chr6 (136-272)||(19286212-19286348)
chr6 (161-272)||(18788449-18788560)
chr6 (161-272)||(18799429-18799540)
chr6 (20-272)||(8768149-8768391)
chr6 (136-272)||(19877396-19877532)
chr6 (136-272)||(19883172-19883308)
chr6 (70-211)||(19300705-19300846)
chr6 (150-272)||(19439782-19439904)
chr6 (70-272)||(2708368-2708573)
chr6 (136-272)||(19786847-19786984)
chr6 (70-272)||(24513801-24514005)
chr6 (70-230)||(25470708-25470868)
chr6 (70-272)||(14724364-14724568)
chr6 (70-272)||(19818899-19819102)
chr6 (70-242)||(23837580-23837752)
chr6 (136-248)||(34647652-34647763)
chr6 (70-272)||(14616245-14616449)
chr6 (144-248)||(11289602-11289705)
chr6 (136-248)||(34640978-34641089)
chr6 (112-272)||(14995923-14996086)
chr6 (70-212)||(15457465-15457607)
chr6 (70-212)||(15464060-15464202)
chr6 (70-154)||(23021423-23021503)
chr6 (70-272)||(14581831-14582034)
chr6 (70-132)||(5290257-5290319)
chr6 (87-212)||(31251385-31251511)
chr6 (70-132)||(12447289-12447350)
chr6 (70-132)||(13940433-13940494)
chr6 (190-272)||(23234901-23234983)
chr6 (70-154)||(26418761-26418844)
chr6 (70-132)||(94584-94644)
chr6 (70-132)||(10464303-10464363)
chr6 (70-132)||(10470825-10470885)
chr6 (70-132)||(14582804-14582864)
chr6 (70-132)||(15332212-15332272)
chr6 (70-132)||(17309673-17309733)
chr6 (190-272)||(17414117-17414200)
chr6 (21-132)||(25347031-25347145)
chr6 (70-132)||(27767359-27767419)
chr6 (70-132)||(17207831-17207892)
chr6 (17-85)||(19449237-19449304)
chr6 (70-132)||(24369187-24369246)
chr6 (70-132)||(30799527-30799586)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (16-283)||(23121545-23121812)
chr4 (16-283)||(14484375-14484642)
chr4 (21-291)||(20940211-20940480)
chr4 (26-372)||(635638-635982)
chr4 (16-283)||(17000131-17000398)
chr4 (16-272)||(43284871-43285126)
chr4 (17-283)||(11171222-11171488)
chr4 (17-243)||(4831092-4831318)
chr4 (17-243)||(4834387-4834613)
chr4 (29-372)||(42701187-42701526)
chr4 (29-372)||(51601949-51602288)
chr4 (29-372)||(51607830-51608169)
chr4 (29-372)||(41799828-41800167)
chr4 (26-372)||(53748628-53748969)
chr4 (21-272)||(15533735-15533986)
chr4 (70-272)||(15406912-15407113)
chr4 (70-272)||(18212138-18212339)
chr4 (20-230)||(16152435-16152647)
chr4 (20-272)||(16156581-16156836)
chr4 (70-272)||(14062908-14063113)
chr4 (70-272)||(26077686-26077890)
chr4 (70-248)||(11847053-11847230)
chr4 (20-272)||(14556054-14556309)
chr4 (70-272)||(15324875-15325077)
chr4 (20-272)||(2585143-2585396)
chr4 (98-272)||(14485537-14485713)
chr4 (70-271)||(41529059-41529263)
chr4 (70-248)||(8046897-8047074)
chr4 (100-272)||(14048229-14048404)
chr4 (21-272)||(14910534-14910788)
chr4 (70-212)||(40908583-40908726)
chr4 (70-209)||(27905211-27905350)
chr4 (69-268)||(1651035-1651237)
chr4 (114-219)||(14048121-14048227)
chr4 (20-154)||(30146727-30146860)
chr4 (70-197)||(16221226-16221355)
chr4 (70-132)||(20894944-20895004)
chr4 (70-132)||(49548656-49548716)
chr4 (70-153)||(13452226-13452307)
chr4 (70-132)||(46044942-46045003)
chr4 (16-53)||(16750817-16750854)
chr4 (191-272)||(37881521-37881602)
chr4 (70-132)||(391074-391134)
chr4 (70-132)||(3260065-3260125)
chr4 (70-132)||(5938873-5938933)
chr4 (70-132)||(7359196-7359256)
chr4 (70-132)||(11202504-11202564)
chr4 (70-132)||(11937106-11937166)
chr4 (70-132)||(20889325-20889385)
chr4 (70-132)||(21881542-21881602)
chr4 (70-132)||(23436056-23436116)
chr4 (70-132)||(26395633-26395693)
chr4 (70-132)||(29382838-29382898)
chr4 (70-132)||(29448750-29448810)
chr4 (70-132)||(29455434-29455494)
chr4 (70-132)||(35462684-35462744)
chr4 (70-132)||(50082208-50082268)
chr4 (70-132)||(52500499-52500559)
chr4 (20-159)||(14047980-14048118)
chr4 (17-85)||(15360988-15361055)
chr4 (70-129)||(33221320-33221377)
chr4 (70-132)||(39266311-39266370)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (16-272)||(41877-42132)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (16-283)||(22055665-22055930)
chr8 (16-283)||(22050147-22050412)
chr8 (16-272)||(22177532-22177787)
chr8 (34-372)||(9273057-9273394)
chr8 (29-372)||(36799337-36799675)
chr8 (26-372)||(1804367-1804710)
chr8 (29-372)||(18681403-18681742)
chr8 (17-272)||(22025559-22025815)
chr8 (29-372)||(31567712-31568051)
chr8 (29-372)||(31572933-31573272)
chr8 (17-272)||(22063562-22063818)
chr8 (70-272)||(14057583-14057784)
chr8 (70-272)||(41009433-41009637)
chr8 (70-242)||(21668857-21669029)
chr8 (70-272)||(21326822-21327027)
chr8 (20-272)||(10606882-10607136)
chr8 (70-272)||(21282058-21282261)
chr8 (70-272)||(21322234-21322439)
chr8 (70-243)||(18609793-18609965)
chr8 (70-230)||(23825124-23825284)
chr8 (140-272)||(25110911-25111043)
chr8 (20-197)||(20974073-20974250)
chr8 (70-230)||(30766966-30767126)
chr8 (70-248)||(44476236-44476414)
chr8 (70-248)||(44479498-44479676)
chr8 (70-248)||(25409554-25409731)
chr8 (136-248)||(23865500-23865611)
chr8 (70-230)||(19902945-19903105)
chr8 (136-272)||(17053663-17053799)
chr8 (20-212)||(19988224-19988416)
chr8 (41-211)||(20839959-20840129)
chr8 (70-153)||(31412606-31412688)
chr8 (70-153)||(31418788-31418870)
chr8 (70-154)||(23653839-23653921)
chr8 (21-199)||(27942221-27942401)
chr8 (161-272)||(21300117-21300229)
chr8 (20-154)||(21300271-21300403)
chr8 (197-272)||(22176034-22176107)
chr8 (69-132)||(39363479-39363543)
chr8 (70-132)||(4520804-4520864)
chr8 (70-132)||(10956755-10956815)
chr8 (70-132)||(14563542-14563602)
chr8 (70-132)||(14746590-14746650)
chr8 (70-132)||(14765588-14765648)
chr8 (70-132)||(16887368-16887428)
chr8 (70-132)||(23117210-23117270)
chr8 (70-132)||(26486090-26486150)
chr8 (70-132)||(27909654-27909714)
chr8 (70-132)||(27956073-27956133)
chr8 (70-132)||(36800512-36800572)
chr8 (70-132)||(23224817-23224876)
chr8 (17-85)||(36445917-36445984)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (16-283)||(758216-758481)
chr5 (16-321)||(20937540-20937845)
chr5 (16-283)||(22312793-22313059)
chr5 (16-291)||(22509126-22509399)
chr5 (26-372)||(17264670-17265013)
chr5 (26-372)||(17271152-17271495)
chr5 (26-372)||(21678144-21678484)
chr5 (26-372)||(22174972-22175317)
chr5 (17-243)||(10816721-10816947)
chr5 (17-243)||(23538748-23538974)
chr5 (21-323)||(9775416-9775718)
chr5 (21-272)||(37805292-37805543)
chr5 (70-272)||(22439701-22439902)
chr5 (70-272)||(22007896-22008102)
chr5 (70-230)||(1857520-1857680)
chr5 (70-230)||(21675488-21675648)
chr5 (21-212)||(23112773-23112965)
chr5 (20-272)||(6404469-6404722)
chr5 (70-248)||(19510999-19511177)
chr5 (70-272)||(6728233-6728438)
chr5 (70-272)||(23527448-23527651)
chr5 (20-272)||(22232609-22232863)
chr5 (21-272)||(34828977-34829232)
chr5 (21-212)||(38145787-38145980)
chr5 (21-272)||(28371398-28371653)
chr5 (21-212)||(42960031-42960224)
chr5 (69-154)||(19362597-19362678)
chr5 (70-154)||(19801964-19802044)
chr5 (70-132)||(24751645-24751707)
chr5 (70-132)||(24669107-24669169)
chr5 (70-132)||(24738876-24738938)
chr5 (70-154)||(27635972-27636054)
chr5 (70-132)||(23081837-23081898)
chr5 (70-132)||(25419820-25419881)
chr5 (69-132)||(15461420-15461481)
chr5 (70-151)||(18941296-18941372)
chr5 (70-132)||(597223-597283)
chr5 (70-132)||(1111778-1111838)
chr5 (70-132)||(5341817-5341877)
chr5 (70-132)||(5454438-5454498)
chr5 (70-132)||(5582377-5582437)
chr5 (70-132)||(10686094-10686154)
chr5 (70-132)||(11995086-11995146)
chr5 (70-132)||(17938984-17939044)
chr5 (70-132)||(19800440-19800500)
chr5 (70-132)||(20990301-20990361)
chr5 (70-132)||(25846293-25846353)
chr5 (70-132)||(25852925-25852985)
chr5 (70-132)||(30781014-30781074)
chr5 (70-132)||(38013683-38013743)
chr5 (70-132)||(40011072-40011132)
chr5 (70-132)||(41878103-41878163)
chr5 (70-132)||(23076389-23076450)
chr5 (70-132)||(23544959-23545020)
chr5 (70-132)||(7773747-7773806)
chr5 (185-272)||(18408973-18409061)
chr5 (73-132)||(19508115-19508172)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (16-272)||(63169-63424)
scaffold0026 (20-272)||(124446-124698)
scaffold0026 (70-249)||(12876-13054)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (16-323)||(141272-141577)
scaffold0021 (69-243)||(146565-146740)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (16-272)||(152307-152562)
scaffold0011 (20-272)||(197413-197667)
scaffold0011 (70-230)||(174578-174738)
scaffold0011 (70-272)||(258491-258696)
scaffold0011 (190-272)||(252007-252090)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (16-283)||(265046-265311)
scaffold0005 (16-283)||(258620-258885)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (28-272)||(6006-6250)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (16-291)||(13954-14228)
scaffold0063 (16-291)||(24155-24429)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (19-271)||(50948-51199)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (17-272)||(10288-10543)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (16-200)||(15512-15695)
scaffold0348 (70-272)||(2919-3123)
scaffold0348 (69-212)||(1761-1905)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (16-283)||(47376-47644)
scaffold0067 (16-283)||(62796-63064)
scaffold0067 (16-283)||(56410-56678)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (17-272)||(5095-5350)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (38-283)||(14536-14779)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (20-281)||(17426-17688)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (20-272)||(4981-5235)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (70-272)||(143-344)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (16-137)||(3604-3725)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (70-272)||(41592-41793)
[»] scaffold0124 (5 HSPs)
scaffold0124 (136-310)||(40566-40739)
scaffold0124 (21-272)||(36793-37045)
scaffold0124 (178-274)||(43965-44062)
scaffold0124 (26-112)||(8495-8580)
scaffold0124 (73-211)||(44054-44192)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (70-272)||(321062-321266)
scaffold0004 (70-272)||(326771-326975)
scaffold0004 (70-243)||(115736-115908)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (104-272)||(20493-20662)
scaffold0023 (70-218)||(156797-156944)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (70-272)||(4594-4795)
scaffold0077 (20-212)||(18201-18393)
scaffold0077 (70-212)||(23832-23975)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (70-272)||(27861-28065)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (76-272)||(51676-51872)
scaffold0076 (70-230)||(30162-30322)
scaffold0076 (70-230)||(35563-35723)
scaffold0076 (70-132)||(61-122)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (70-272)||(392-593)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (20-272)||(5877-6129)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (70-272)||(4275-4476)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (70-272)||(16914-17115)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (70-272)||(10234-10435)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (126-272)||(71145-71291)
scaffold0025 (70-272)||(15432-15633)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (70-236)||(29748-29913)
scaffold0154 (70-132)||(18519-18579)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (70-272)||(8410-8615)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (70-272)||(7249-7451)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (20-197)||(13465-13642)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (70-272)||(10199-10400)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (70-230)||(38401-38561)
scaffold0106 (20-272)||(46732-46985)
scaffold0106 (20-272)||(51005-51258)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (70-234)||(27781-27945)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (70-230)||(46996-47156)
scaffold0028 (70-230)||(52401-52561)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (70-243)||(102933-103105)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (70-209)||(2376-2516)
scaffold0203 (70-212)||(17139-17272)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (70-248)||(2566-2743)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (20-272)||(16866-17114)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (70-272)||(320-524)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (70-272)||(17376-17580)
scaffold0034 (70-272)||(10080-10284)
scaffold0034 (70-272)||(72229-72432)
scaffold0034 (20-154)||(614-746)
scaffold0034 (20-154)||(6773-6905)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (163-249)||(1-87)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (45-272)||(16021-16250)
scaffold0243 (42-272)||(8001-8233)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (20-272)||(95798-96051)
scaffold0001 (136-248)||(174561-174673)
scaffold0001 (136-248)||(489193-489304)
scaffold0001 (41-212)||(493992-494165)
scaffold0001 (69-154)||(179002-179083)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (70-272)||(171785-171990)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (70-248)||(110758-110935)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (70-230)||(9649-9809)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (41-211)||(44152-44322)
scaffold0010 (41-211)||(49218-49388)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (70-270)||(34776-34979)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (41-212)||(6911-7081)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (161-230)||(63-132)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (21-90)||(78532-78601)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (70-212)||(52670-52814)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (70-212)||(7843-7986)
scaffold0249 (70-212)||(14832-14974)
[»] scaffold0461 (4 HSPs)
scaffold0461 (70-211)||(1116-1258)
scaffold0461 (70-211)||(8052-8194)
scaffold0461 (178-274)||(1027-1124)
scaffold0461 (178-274)||(7963-8060)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (148-272)||(55939-56065)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (98-272)||(865-1041)
scaffold1427 (70-132)||(624-684)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (70-211)||(2038-2181)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (20-171)||(20754-20906)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (20-154)||(5464-5596)
scaffold0610 (161-272)||(5638-5750)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (135-272)||(11916-12054)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (70-272)||(24476-24680)
[»] scaffold0377 (2 HSPs)
scaffold0377 (70-159)||(7253-7343)
scaffold0377 (185-272)||(7344-7432)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (70-272)||(44200-44395)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (20-110)||(16892-16981)
scaffold0074 (166-272)||(16989-17095)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (60-157)||(370386-370483)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (20-158)||(57323-57460)
scaffold0061 (185-272)||(57157-57245)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (20-158)||(141173-141310)
scaffold0017 (185-272)||(141388-141476)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (70-154)||(16140-16223)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (43-154)||(6567-6676)
scaffold0192 (190-272)||(6761-6844)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (20-154)||(38794-38926)
scaffold0022 (20-154)||(136854-136986)
scaffold0022 (70-132)||(104287-104347)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (70-159)||(1895-1983)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (70-154)||(41231-41310)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (70-159)||(10002-10092)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (70-132)||(507-569)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (70-154)||(224-307)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (70-200)||(1-131)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (70-132)||(13406-13466)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (70-132)||(7713-7773)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (70-132)||(15102-15162)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (70-132)||(50001-50061)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (70-132)||(143962-144022)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (183-272)||(3302-3392)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (41-107)||(4501-4566)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (70-154)||(247019-247099)
scaffold0009 (70-154)||(253533-253613)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (70-154)||(31669-31752)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (70-133)||(26091-26155)
scaffold0104 (70-133)||(27473-27537)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 291
Target Start/End: Original strand, 15338772 - 15339046
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15338772 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 15338871  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15338872 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 15338970  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15338971 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatata 15339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15723446 - 15723180
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723446 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 15723347  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723346 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 15723248  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15723247 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 15723180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35962968 - 35962701
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35962968 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 35962869  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35962868 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 35962769  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  35962768 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 35962701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 14431935 - 14432201
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14431935 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagacccctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 14432034  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14432035 atggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagt 14432133  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14432134 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14432201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15711222 - 15710956
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15711222 tcaacgactcatgcaactcttcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 15711123  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15711122 atggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatc 15711024  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15711023 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 15710956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 19599791 - 19600080
Alignment:
Q  19 acgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19599791 acgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccacgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatg 19599890  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19599891 gttaaagcatttattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgatccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 19599989  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||| | || |||| |||||||||||||| | | ||||||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  19599990 agctctcccactattatgcttatacaactgacccacttgtgtatatctacatacaaccaaacctatgcatatatat-atatatgactcacca 19600080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 1612573 - 1612825
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcg 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1612573 cgactcatgccactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatgg 1612672  T
Q  120 ttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1612673 ttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaaatagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaa 1612771  T
Q  220 gctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  1612772 gctctcccacttttatgcttatccaactgactccacttgtgtatatctacatac 1612825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 807213 - 806875
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  807213 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 807116  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  807115 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 807019  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||    
T  807018 actgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgtt 806920  T
Q  327 agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    | |||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  806919 aaggaattt-aattaagtacaacattcattcagtcagcatccattc 806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23201721 - 23201388
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  23201721 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 23201624  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  23201623 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 23201527  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  23201526 ctcacttttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttacaac 23201427  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtc 361  Q
     || |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  23201426 attaagggaattttaattaaataagacatacattcagtc 23201388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23507848 - 23507515
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  23507848 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 23507751  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  23507750 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 23507654  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  23507653 ctcacttttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttacaac 23507554  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtc 361  Q
     || |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  23507553 attaagggaattttaattaaataagacatacattcagtc 23507515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18055925 - 18055586
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  18055925 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 18055828  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  18055827 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 18055731  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  18055730 actgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 18055632  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  18055631 aagggaattttaattatatacaacacaca-tcagtcaacatccattc 18055586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281609
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccacttt 14281723  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  14281722 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 14281623  T
Q  270 taccaaccaaccta 283  Q
    ||| | ||||||||    
T  14281622 tacaacccaaccta 14281609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11632156 - 11631817
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  11632156 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 11632059  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  11632058 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 11631962  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  11631961 actgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 11631863  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||   |||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  11631862 aagggaattttatttatatacaacacaca-tcagtcagcatccattc 11631817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18049446 - 18049107
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  18049446 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 18049349  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  18049348 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacctctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 18049252  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  18049251 actgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 18049153  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  18049152 aagggaattttaattatatacaacacaca-tcagtcaacatccattc 18049107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 6411771 - 6412023
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcg 119  Q
    ||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  6411771 cgactcatgcaacactccatcactccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaattg 6411870  T
Q  120 ttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaa 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6411871 ttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacactgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaatgcgttccagagccgaa 6411970  T
Q  220 gctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  6411971 gctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 6412023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16109293 - 16109071
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16109293 cgactcatgcaactactcaacgactccattaagactcctc-aataatgcgcatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatg 16109195  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16109194 gttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 16109096  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||    
T  16109095 aactctcccacttttatgcttatgc 16109071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20580160 - 20579863
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacca-aaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  20580160 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 20580063  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  20580062 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 20579966  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |    
T  20579965 cccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacc 20579867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23666055 - 23665753
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||    
T  23666055 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaat 23665957  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665956 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 23665859  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| ||    
T  23665858 aagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaat 23665760  T
Q  317 ttacaac 323  Q
    |||||||    
T  23665759 ttacaac 23665753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 323
Target Start/End: Original strand, 29795679 - 29795981
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | |||||||||||||||||| |||| ||||  |||  ||| |||| ||||    
T  29795679 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaaccagggccgtgacccataccactgtcgaat 29795777  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29795778 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 29795875  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| ||    
T  29795876 aagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaat 29795974  T
Q  317 ttacaac 323  Q
    |||||||    
T  29795975 ttacaac 29795981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 323
Target Start/End: Original strand, 29799498 - 29799800
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | |||||||||||||||||| |||| ||||  |||  ||| |||| ||||    
T  29799498 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaaccagggccgtgacccataccactgtcgaat 29799596  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29799597 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 29799694  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| ||    
T  29799695 aagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaat 29799793  T
Q  317 ttacaac 323  Q
    |||||||    
T  29799794 ttacaac 29799800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11390503 - 11390302
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11390503 atgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcttt 11390405  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  11390404 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 11390305  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  11390304 tac 11390302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20328425 - 20328224
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20328425 atgcatgtggtaccatatacaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 20328327  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  20328326 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 20328227  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  20328226 tac 20328224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 11302821 - 11303052
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttca 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||  ||| |||| |||||| ||||| |  |||    
T  11302821 actccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 11302918  T
Q  138 ggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgt 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11302919 ggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgc 11303017  T
Q  238 ttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||| ||| | || | || ||||||||||||||    
T  11303018 ttatgcaactgacccacctgtgtatatctacatac 11303052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21232210 - 21232009
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21232210 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 21232112  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || ||||  ||||||||||    
T  21232111 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctaca 21232012  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  21232011 tac 21232009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 283
Target Start/End: Original strand, 14128244 - 14128383
Alignment:
Q  143 taagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14128244 taagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatg 14128342  T
Q  243 cgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    | ||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14128343 caactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14128383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11384015 - 11383814
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  11384015 atgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacttaagtcctcaccgctaaacaccgcttt 11383917  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  11383916 gaaccactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 11383817  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  11383816 tac 11383814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220086
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgcttaacaccgctt 11220191  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  11220190 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttctgcaactaactccactggtgtatatcta 11220091  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  11220090 catac 11220086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 18606866 - 18607067
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  18606866 atgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-ttttcagaacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 18606964  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  18606965 gaaccactagtgttccaccgctttgaaccacaaggcgttccagagtcgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 18607064  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  18607065 tac 18607067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 16676192 - 16676393
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  16676192 atgcatgtggtaccatattaaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 16676290  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || || |||  |||||||||||    
T  16676291 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 16676390  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  16676391 tac 16676393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 17650429 - 17650629
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  17650429 atgcatgtggtaccatatttaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 17650527  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || || |||  |||||||||||    
T  17650528 gaacaactagtgttccaccgctt-gaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 17650626  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  17650627 tac 17650629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 4279963 - 4280123
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  4279963 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4280061  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4280062 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 4280123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 19616295 - 19616455
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  19616295 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 19616393  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19616394 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 19616455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Original strand, 13006372 - 13006508
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13006372 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgat 13006471  T
Q  236 gtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  13006472 gtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatac 13006508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13124148 - 13123971
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatc-aggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  13124148 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 13124050  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  13124049 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 13123971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 14421354 - 14421532
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  14421354 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 14421452  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  14421453 tgaacaactagcgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 14421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3289984 - 3289754
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||| |||||  | |||| |||||| ||||||||  ||||    
T  3289984 actccactaagactcctc-aacaatgtgcatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcgccgctaattgaatggttaaagcattcatt--cagg 3289888  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttt 239  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| || ||||| ||    
T  3289887 acataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagggccctcccgcttttatgatt 3289788  T
Q  240 atgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  3289787 atgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 3289754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12591812 - 12591652
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  12591812 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 12591714  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12591713 tgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact 12591652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12711077 - 12710917
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatc-aggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  12711077 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 12710979  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12710978 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccact 12710917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 13742505 - 13742682
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatc-aggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  13742505 atgcatgtggtaccataatttagggccgttacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 13742603  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  13742604 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccact-tgatgtttatgcaacta 13742682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36306121 - 36306034
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  36306121 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 36306034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14946020 - 14945918
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  14946020 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctt 14945921  T
Q  169 tga 171  Q
    |||    
T  14945920 tga 14945918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15373613 - 15373511
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  15373613 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctt 15373514  T
Q  169 tga 171  Q
    |||    
T  15373513 tga 15373511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 147016 - 147210
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  147016 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcaccgttatagaat 147113  T
Q  118 cgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
     |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  147114 ggttaaagcattctttttatcaggacatgagtcctcaccgttaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 147210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14320773 - 14320600
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt--t 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||  |    
T  14320773 actccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttcat 14320676  T
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14320675 caggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgacaaggcgttccag 14320600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17182724 - 17182674
Alignment:
Q  94 ccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacata 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17182724 ccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacata 17182674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36306213 - 36306111
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| || || |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  36306213 atgcatgtggtaccatattcaagaccgaagccctcaccactagtcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 36306114  T
Q  169 tga 171  Q
    |||    
T  36306113 tga 36306111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 14565708 - 14565851
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt---caggacataagtcctcaccactaagcaccac 166  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||   |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |    
T  14565708 atgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttttatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgc 14565804  T
Q  167 tttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14565805 tttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14565851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18958481 - 18958399
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  18958481 ctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagctctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatac 18958399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37244484 - 37244401
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  37244484 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 37244401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16187984 - 16187852
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  16187984 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaata 16187886  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||    
T  16187885 gttaaagcattc--gttcaggacataggtcctcacc 16187852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 833182 - 833040
Alignment:
Q  11 catcatcaacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgc 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||| | ||||   || ||||||||||||    
T  833182 catcaacatcgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgtatgcatgtggtaccatattcagagtcggagccctcaccgc 833084  T
Q  110 tg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |  | |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  833083 taattgaatggttaaagcattcatt--caggacataagtcctcacc 833040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1198362 - 1198220
Alignment:
Q  11 catcatcaacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgc 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||| | ||||   || ||||||||||||    
T  1198362 catcaacatcgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgtatgcatgtggtaccatattcagagtcggagccctcaccgc 1198264  T
Q  110 tg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |  | |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1198263 taattgaatggttaaagcattcatt--caggacataagtcctcacc 1198220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Original strand, 16008053 - 16008226
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tc 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||| || | |||||| |||||| ||||| ||| ||    
T  16008053 actccactaagactcctc-aacaaatgcaaccatgcatgtggtacc-atatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatc 16008150  T
Q  137 aggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||||||| |||||||| |  ||| || |  ||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  16008151 aggacatgagtcctcatcgttaa-catcgttttgaacaacatagtgctccatcgttttgaacgacaaggcgttccag 16008226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 31154367 - 31154509
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |  |||||||| ||||||| ||| ||  |||| ||    
T  31154367 atgcatgtggtaccata-tcagggccgaggccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttatatcaggacatgagtcctc-ccattat-caccgct 31154463  T
Q  168 ttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31154464 ttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 31154509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37244360 - 37244278
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  37244360 ctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatac 37244278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18958605 - 18958522
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  18958605 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcatgacataagtcctcacc 18958522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 642550 - 642610
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  642550 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 642610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 837081 - 836998
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  837081 ctttgaacgacaaggcgttccagagccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 836998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1202261 - 1202178
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  1202261 ctttgaacgacaaggcgttccagagccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 1202178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 2438884 - 2438944
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  2438884 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 2438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8197371 - 8197311
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  8197371 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 8197311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8213442 - 8213382
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  8213442 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 8213382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11299825 - 11299765
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11299825 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11299765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11308189 - 11308129
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11308189 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11308129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 11339771 - 11339831
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11339771 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11339831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 11879067 - 11879127
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11879067 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11879127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11899481 - 11899421
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11899481 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11899421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13964174 - 13964114
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  13964174 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 13964114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15086098 - 15086016
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15086098 atgcatgtggtaccatattcagggctgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 15086016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16844042 - 16843982
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  16844042 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 16843982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17726504 - 17726444
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  17726504 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 17726444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26113927 - 26113867
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  26113927 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 26113867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26120540 - 26120480
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  26120540 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 26120480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 37285209 - 37285269
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  37285209 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 37285269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40923094 - 40923034
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  40923094 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 40923034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 42058549 - 42058609
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  42058549 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 42058609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 46649770 - 46649830
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  46649770 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 46649830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15085975 - 15085893
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||| |||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  15085975 ctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgggactgactcacttgtgtatatctacatac 15085893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26289820 - 26289738
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  26289820 ctttgaatgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatac 26289738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16187858 - 16187804
Alignment:
Q  101 cctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccact 157  Q
    |||||||||| | |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16187858 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcatt--caggacataagtcctcaccact 16187804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18437338 - 18437280
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattc 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  18437338 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 18437280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14945928 - 14945840
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt-tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||| || | ||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  14945928 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggaaaaagccctcccgctttatatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 14945840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15373521 - 15373433
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt-tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||| || | ||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  15373521 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggaaaaagccctcccgctttatatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 15373433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17468424 - 17468363
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatt 133  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  17468424 atgcatgtggtaccaac--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatt 17468363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 17584790 - 17584851
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatt 133  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  17584790 atgcatgtggtaccaac--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatt 17584851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3706993 - 3706727
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3706993 tcaacgactcatgcaactcatcaccgctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 3706894  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3706893 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaattagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 3706795  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3706794 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 3706727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23066932 - 23066665
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23066932 tcaacaactcatgcaactcatcaccactccactaagacaactctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggatcgtagccctctccgctgtaga 23066833  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23066832 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 23066733  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23066732 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 23066665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 27280150 - 27280493
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  27280150 atgcaacccatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 27280247  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  27280248 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctct 27280345  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac- 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  27280346 cccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaaca 27280443  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27280444 tttaagtgaattttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattc 27280493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 20242484 - 20242735
Alignment:
Q  22 actcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgtt 121  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  20242484 actcatgcaactcaccaccactccactaagacttctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaaggccgaagccctaaccgctgtagaatgatt 20242583  T
Q  122 aaaacattcattttc-aggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaag 220  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242584 aaggcattcattttccaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaag 20242683  T
Q  221 ctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | | | || |||| ||||||||||||||    
T  20242684 ctctcccacttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatac 20242735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22448494 - 22448277
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22448494 tcaacgactcatgcaacttatcatcactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgttga 22448395  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22448394 atggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcac----------cactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 22448305  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  22448304 cgaagctcttctacttttatgcttatgc 22448277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 955273 - 955118
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  955273 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccactgtaga 955174  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttga 171  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  955173 atggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccactaaacaccactttga 955118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 32650052 - 32650304
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  32650052 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcaggaccgtagcccacaccgttgtcgaatg 32650150  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650151 gttaaagcattc-ttttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccga 32650249  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  32650250 agctctcccacttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 32650304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19664306 - 19664105
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19664306 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattc-ttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 19664208  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  19664207 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 19664108  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  19664107 tac 19664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29554645 - 29554419
Alignment:
Q  42 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagga 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||    
T  29554645 ctccactaagactcctctaccaa------tgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcattttcagga 29554552  T
Q  141 cataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttta 240  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || || |||    
T  29554551 cataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgctta 29554452  T
Q  241 tgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  29554451 tgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 29554419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19778639 - 19778434
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttc-aggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||    
T  19778639 atgcatgtggtaccataatcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagct 19778540  T
Q  168 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || | |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  19778539 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatct 19778440  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  19778439 acatac 19778434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 21542056 - 21542216
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  21542056 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21542154  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21542155 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 21542216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42096080 - 42095920
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  42096080 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 42095982  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42095981 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 42095920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20942062 - 20941891
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  20942062 actccactaagactcctcta-caatactcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattt-cagg 20941965  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20941964 acataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 20941891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20438709 - 20438531
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  20438709 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 20438611  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  20438610 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 20438531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20838349 - 20838142
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgt-agaatcgttaaaacattcatttt---caggacataagtcctcaccactaagcacca 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||   |||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  20838349 atgcatgtggtaccaaattcagggccggagccctcaccgctattagaatggttaaagtattcatttttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccg 20838250  T
Q  166 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac-tgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatat 264  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||    
T  20838249 ctttgaacaacaaatgttccaccactttgaacgacaaggcattccagggcagaatccctcccgcttattatgcttatgcaactaacccacttgtgtatat 20838150  T
Q  265 ctacatac 272  Q
    | ||||||    
T  20838149 ccacatac 20838142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16883768 - 16883514
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  16883768 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatatggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 16883670  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccac-tttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  16883669 gttaaagcattcattt-caggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgcttttgaacgacaaggcgttccagggcc 16883571  T
Q  217 gaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
      ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16883570 agagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 16883514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20046056 - 20045899
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  20046056 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtagaatggttaaagcattc-tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 20045958  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20045957 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 20045899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 272
Target Start/End: Original strand, 41110887 - 41111016
Alignment:
Q  143 taagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 242  Q
    |||||||||||| ||   |||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41110887 taagtcctcaccgctccacaccgctttgaacgactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatg 41110986  T
Q  243 cgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    | ||||  || | || ||||||||||||||    
T  41110987 caactaccccacctgtgtatatctacatac 41111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 19961135 - 19961338
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| || |||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  19961135 atgcatgtggtaccata-tcagagccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatccggacatgagtcctcaccgctaa-caccgctt 19961232  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatct 266  Q
     || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||    
T  19961233 cgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatct 19961332  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  19961333 acatac 19961338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 955128 - 955032
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  955128 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttccacttttatgctcatgctactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 955032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20824530 - 20824333
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgt-agaatcgttaaaacattcatttt---caggacataagtcctcaccactaagcacca 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||| ||            
T  20824530 atgcatgtggtaccaaattcaggaccagagccctcaccgctattagaatggttaaagcattcatttttttcaggacatgagtcctcaccgct-------- 20824439  T
Q  166 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac-tgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatat 264  Q
      |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | | ||||| |||||| ||||| |  |||| ||||||    
T  20824438 --ttgaacaacaagtgttccacctctttgaacgacaaggcgttctagagcagaagccctcccgcttattatgcttatgcaactaacctacttgtgtatat 20824341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 43088391 - 43088471
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||   ||||||||||||||||||    
T  43088391 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcatt---aggacataagtcctcacc 43088471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 24079551 - 24079634
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24079551 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 24079634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24109203 - 24109120
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24109203 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 24109120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 154
Target Start/End: Original strand, 29534913 - 29535022
Alignment:
Q  43 tccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggac 141  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  29534913 tccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca--ttcaggac 29535009  T
Q  142 ataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||    
T  29535010 ataagtcctcacc 29535022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 16371506 - 16371680
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tc 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||| || | |||||| |||||| ||||| ||| ||    
T  16371506 actccactaagactcctc-aacaaatgcaaccatgcatgtggtacc-atatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattcttttatc 16371603  T
Q  137 aggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaga 213  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || |  ||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  16371604 aggacataagtcctcatcgttaa-catcgttttgaacaacatagtgctccatcgttttgaacgacaaggctttccaga 16371680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23195653 - 23195571
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23195653 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 23195571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24109079 - 24108997
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  24109079 ctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatac 24108997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 36614935 - 36615015
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| | |||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  36614935 atgcatgtggtaccaaaa-cagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat---caggacataagtcctcacc 36615015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3652815 - 3652755
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  3652815 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 3652755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 6740517 - 6740577
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  6740517 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 6740577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18026868 - 18026808
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  18026868 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 18026808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 18418123 - 18418183
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  18418123 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 18418183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 20292679 - 20292739
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  20292679 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 20292739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Original strand, 21664283 - 21664366
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  21664283 ctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 21664366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 24850099 - 24850159
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  24850099 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 24850159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28556618 - 28556558
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  28556618 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 28556558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29596972 - 29596912
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  29596972 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 29596912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 37675392 - 37675452
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  37675392 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 37675452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 37682085 - 37682145
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  37682085 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 37682145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38908170 - 38908110
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  38908170 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 38908110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 39094320 - 39094380
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  39094320 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 39094380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 47484107 - 47484186
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  47484107 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagccctcacc 47484186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 49328033 - 49328093
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  49328033 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 49328093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20086537 - 20086484
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||||    
T  20086537 ctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccctcccgcttttatgtttatgc 20086484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 17146257 - 17146316
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  17146257 atgcatgtggtaccaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 17146316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14727 - 14421
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14727 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 14628  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 14529  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccg 314  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| |||     
T  14528 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactcca 14430  T
Q  315 atttacaac 323  Q
    |||||||||    
T  14429 atttacaac 14421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7178
Alignment:
Q  104 caccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaag 203  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7356 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaat-accactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaag 7258  T
Q  204 gcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||   || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  7257 gcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatccaactgtcccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14652946 - 14652680
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652946 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 14652847  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652846 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 14652748  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  14652747 cgaagctctcccactattatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 14652680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16383110 - 16382844
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383110 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 16383011  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383010 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 16382912  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  16382911 cgaagctctcccactgtaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacacacaacccaaccta 16382844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13203767 - 13203514
Alignment:
Q  18 aacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13203767 aacgactcatgcaacttatcaccgctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataaacaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 13203668  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13203667 agttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 13203569  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  13203568 aagctctcccactgttatgcttatgcaactaacccacttgagtatatctacatac 13203514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16838731 - 16838466
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16838731 tcaacaactcatgcaactcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagcc-tcaccgctgtaga 16838633  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838632 atggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 16838534  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16838533 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 16838466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 13946432 - 13946758
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13946432 atgcaacctatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 13946529  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  13946530 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaaactct 13946626  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaact 324  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13946627 cccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaact 13946725  T
Q  325 t-tagggaatttccattaagtacaacatacatt 356  Q
    |  ||| |||||  ||||| |||||||||||||    
T  13946726 tcaaggaaattttaattaaatacaacatacatt 13946758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 356
Target Start/End: Original strand, 13909496 - 13909813
Alignment:
Q  35 atcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatt 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |     
T  13909496 atcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tc 13909592  T
Q  134 ttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtt 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13909593 atcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtt 13909690  T
Q  234 atgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactt-tagggaa 332  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||    
T  13909691 atgttaatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttaaaacttcaaggaaa 13909789  T
Q  333 tttccattaagtacaacatacatt 356  Q
    |||  ||||| |||||||||||||    
T  13909790 ttttaattaaatacaacatacatt 13909813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14544423 - 14544155
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacaccca-tgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtag 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14544423 tcaacgactcatgccactcaacaccacctcactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcg 14544324  T
Q  115 aatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagag 214  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14544323 aatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagag 14544224  T
Q  215 ccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  14544223 ccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 14544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 323
Target Start/End: Original strand, 12200151 - 12200454
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||    
T  12200151 tcaacaacttatgcaacccatcaccactccactaagactcctgtaa--acacccatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcga 12200248  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12200249 atggttaaagcattc-tcatcaggacataagttctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagttgttccagagc 12200346  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccg 314  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||     
T  12200347 tgaagctctcccactgttatgcttatgcaacttacccacttgagtatatctacataccaaccaacctaagcatatacgt-atatatgactcaccactcca 12200445  T
Q  315 atttacaac 323  Q
    |||||||||    
T  12200446 atttacaac 12200454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 13939946 - 13940268
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13939946 atgcaacctatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 13940043  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  13940044 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 13940140  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaact 324  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13940141 cccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacct----atatacataatatatgattcaccatccaatttacaact 13940235  T
Q  325 t-tagggaatttccattaagtacaacatacatt 356  Q
    |  ||| |||||  ||||| |||||||||||||    
T  13940236 tcaaggaaattttaattaaatacaacatacatt 13940268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 44775162 - 44775501
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  44775162 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 44775259  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  44775260 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 44775356  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  44775357 actgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 44775455  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44775456 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 44775501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 44780346 - 44780685
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  44780346 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 44780443  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  44780444 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 44780540  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  44780541 actgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 44780639  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44780640 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 44780685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34852439 - 34852213
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34852439 caacgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgttgtaga 34852341  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34852340 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 34852241  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  34852240 cgaagctctctcacttttatgattatgc 34852213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8743128 - 8742848
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  8743128 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 8743031  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  8743030 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 8742934  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8742933 cccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcacca 8742848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8761298 - 8761018
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  8761298 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 8761201  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  8761200 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 8761104  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8761103 cccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcacca 8761018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 4677122 - 4677463
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacca-aaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  4677122 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 4677219  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  4677220 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 4677316  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |    
T  4677317 cccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacc 4677415  T
Q  324 ttt-agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    ||| |||||||||  ||||  |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  4677416 tttaagggaattt-aattatatacaacataca-ccagtcagcatccattc 4677463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 41175435 - 41175776
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacca-aaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  41175435 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 41175532  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  41175533 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 41175629  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |    
T  41175630 cccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacc 41175728  T
Q  324 ttt-agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    ||| |||||||||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  41175729 tttaagggaattt-aattatatacaacacaca-tcagtcagcatccattc 41175776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 41180573 - 41180914
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacca-aaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  41180573 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 41180670  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  41180671 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 41180767  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |    
T  41180768 cccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacc 41180866  T
Q  324 ttt-agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    ||| |||||||||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  41180867 tttaagggaattt-aattatatacaacacaca-tcagtcagcatccattc 41180914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Original strand, 14292657 - 14292906
Alignment:
Q  24 tcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaa 123  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14292657 tcatgcgacacatcaccactccactaagactcctctaacaacatccatacatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaa 14292756  T
Q  124 aacattcattttc-aggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagct 222  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14292757 agcattcattttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaacgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagct 14292856  T
Q  223 ctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| | || ||||  ||| |||||||||    
T  14292857 ctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatttctacatac 14292906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16830232 - 16830055
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16830232 tcaacaactcatgcaactcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtag-cctcaccgctgtaga 16830134  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttga 195  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16830133 atggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttga 16830055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 12304698 - 12304949
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||| |||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||    
T  12304698 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgtatgtggtatcaaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaat 12304796  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304797 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 12304894  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |  | | || ||||||||||||||    
T  12304895 aagctctcccacttttatgcttatgcaactgactcacctgtgtatatctacatac 12304949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16802626 - 16802425
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || | |||| ||||    
T  16802626 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattc-tcatcaggacataagtcatcaccgctcaacaccgcttt 16802528  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  16802527 gaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctaca 16802428  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  16802427 tac 16802425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 17157061 - 17157262
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  17157061 atgcatgtggtaccgtattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 17157159  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  17157160 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctaca 17157259  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  17157260 tac 17157262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 23174159 - 23174358
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  23174159 atgcatgtggtaccatgttcaagaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt--ttttcaggacataagtcctcaccgctaa-caccgcttt 23174255  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  23174256 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcaagagccgaagctctcccacttttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatatctaca 23174355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16830065 - 16829943
Alignment:
Q  161 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||    
T  16830065 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagt 16829966  T
Q  261 atatctacataccaaccaaccta 283  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  16829965 atatctacatacaatccaaccta 16829943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 24191762 - 24191963
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||  | || || ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| || | |||| ||||    
T  24191762 atgcatgtggtaccgtattcggggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagttctcaccgctcaacaccgcttt 24191860  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  24191861 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctaca 24191960  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  24191961 tac 24191963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961378
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctt 12961481  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctac 268  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||  |||||| ||| | || |||| ||||||||||    
T  12961480 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagcccttccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 12961381  T
Q  269 ata 271  Q
    |||    
T  12961380 ata 12961378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31690774 - 31690570
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  31690774 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 31690675  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    | | |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| | || |||| |||||||||    
T  31690674 taaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 31690575  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  31690574 catac 31690570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17199264 - 17199015
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-ga 115  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||       | ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |  ||    
T  17199264 caacgactcatgcaacaccccacaactccgctaagactcctcta-------caatgcatgtggtaccataatcagggctggagccctcaccgctattcga 17199172  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17199171 atggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgctaa-caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagc 17199073  T
Q  216 cgaagctctcccactgt-tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||| ||  | || |||| ||||||||||||||    
T  17199072 cgaagctctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatac 17199015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18719361 - 18719109
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgc-tgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | | ||||     
T  18719361 cgactcatgcaacccacaaccgctccactaagactcttcta-caacactcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatg 18719263  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18719262 gttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgagaaggcgttccagggccg 18719163  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    || | ||| | || ||||  |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  18719162 aaaccctcacgct-ttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 18719109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8583471 - 8583311
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  8583471 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 8583373  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583372 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 8583311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 14084531 - 14084691
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  14084531 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14084629  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084630 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 14084691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 14089932 - 14090092
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  14089932 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14090030  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14090031 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 14090092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18130029 - 18129776
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |  | ||||    
T  18130029 cgactcatgcaactattcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcacatgcatgtggtaccaaattcagggccggaggcctcaccgttaattgaat 18129931  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18129930 ggttaaaacattcatt--caggacataagtcctcaccactaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcc 18129833  T
Q  217 gaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatctacatac 272  Q
       || ||||| || | ||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  18129832 agggccctcccgctttcatgcttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 18129776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 9532849 - 9533027
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   ||||||||    
T  9532849 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccactt 9532947  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  9532948 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 9533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13969010 - 13968850
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  13969010 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13968912  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13968911 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13968850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13974485 - 13974325
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  13974485 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13974387  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13974386 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13974325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 19443421 - 19443674
Alignment:
Q  14 catcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  19443421 catcatcgactcatgcaacactccacaactccactaagactcctcta--------catgcatgtggtaccataa-cagggccggagccctcaccgctata 19443511  T
Q  114 gaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19443512 gaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 19443611  T
Q  212 gagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    | || ||||| ||| || || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  19443612 gggcagaagccctcaccgcttttatgcttatgcaactgactccgcttgtgtatatctacatac 19443674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24123380 - 24123220
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  24123380 atgcacgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24123282  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24123281 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 24123220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 49399473 - 49399633
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  49399473 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaccaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 49399571  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49399572 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 49399633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41456325 - 41456123
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  41456325 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 41456227  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctac 268  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  || | || ||||||||||    
T  41456226 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactatcccacctgtgtatatctac 41456127  T
Q  269 atac 272  Q
    ||||    
T  41456126 atac 41456123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17243857 - 17243684
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  17243857 atgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctagtcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 17243759  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  17243758 tgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgc 17243684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11965080 - 11964880
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| |||    
T  11965080 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcattt-caggacctaagtcctcaccgctaaacaccgctt 11964982  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| || || || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  11964981 tgaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacatggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 11964882  T
Q  267 ac 268  Q
    ||    
T  11964881 ac 11964880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 227
Target Start/End: Original strand, 17190836 - 17190992
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||  | | |||| ||||    
T  17190836 atgcatgtggtaccaaattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgatcaacaccgcttt 17190934  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17190935 gaacaactagtgttccaccgctttgaaagacaaggcgttccagagccgaagctctccc 17190992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 31943441 - 31943645
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||   | |||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||    
T  31943441 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgcaaatcgaatggttaaaacattctttttcaggaaatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 31943540  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || | ||| |||||| ||| | || |||| |||||||||    
T  31943541 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagagccgaagccctctcgctttcatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 31943640  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  31943641 catac 31943645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 272
Target Start/End: Original strand, 12255106 - 12255326
Alignment:
Q  42 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcagga 140  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  12255106 ctccactaagactcttcta-caacactcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagacctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcagga 12255204  T
Q  141 cataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttt 239  Q
    ||| ||||||          |||| |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||    
T  12255205 catgagtcct----------caccgctttgatcaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgct-ttatactt 12255293  T
Q  240 atgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  12255294 atgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 12255326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 18888966 - 18889133
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||    
T  18888966 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcatcactgaacaccgctt 18889064  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 236  Q
    ||| |||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  18889065 tgaacaataaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatg 18889133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 18900005 - 18900209
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||  | |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||    
T  18900005 atgcatgtggtaccatattcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattt-ttttcaggacataagtcctcacctctaaacatcgctt 18900103  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcga-ctaatccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| | | | ||| |||| ||||||||    
T  18900104 tgaacaacaaagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatct 18900203  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  18900204 acatac 18900209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18136543 - 18136351
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||| |||  | ||||    
T  18136543 cgactcatgcaactactcaacgactacactaagactcctc-aacaatgcacatgcatgtggtaccatattaagggccggagccctcactgctaattgaat 18136445  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
     |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18136444 ggttaaagcattcatt--caggacataagtcctcaccactaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccag 18136351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13314084 - 13313911
Alignment:
Q  102 ctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacga 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  13314084 ctcaccgctatagaatggttaaagtattcttttatcaggacatgagtcctcaccactaatcaccgttttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacga 13313985  T
Q  200 caaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| || || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  13313984 caaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 13313911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38312378 - 38312183
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  38312378 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggagccctcaccgttatagaat 38312281  T
Q  118 cgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgag-caac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
     |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||  |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38312280 ggttaaaacattctttttatcaggacatgagtcctcaccgctaa-caccgctttgaaacaacatggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 38312183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13303411 - 13303235
Alignment:
Q  99 gccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaa 196  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| |||| | ||| |||||| |||||||    
T  13303411 gccctcaccgctatagaatggttaaagtattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgttttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaa 13303312  T
Q  197 cgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| || || |||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||    
T  13303311 cgacaaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgtttatgcaactgacccacttgtatatatctacatac 13303235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13324999 - 13324823
Alignment:
Q  99 gccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaa 196  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||| | ||| |||||| |||||||    
T  13324999 gccctcaccgctatagaatgattaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccattttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaa 13324900  T
Q  197 cgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| || || ||||  |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  13324899 cgacaaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 13324823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Original strand, 23173876 - 23173963
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23173876 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 23173963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 171
Target Start/End: Original strand, 23173758 - 23173886
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcagga 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  23173758 actccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggt-gtaaccctcacctctgtcgaatggttaaagcattctttttcagga 23173855  T
Q  141 cataagtcctcaccactaagcaccactttga 171  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  23173856 cataagtcctcaccgctaaacaccgctttga 23173886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 18914006 - 18914148
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||| |||| |||    
T  18914006 atgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattt-caggacataagtcatctcc-ctaaacaccgctt 18914103  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18914104 tgaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacaaggtgttccag 18914148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 202
Target Start/End: Original strand, 12363444 - 12363578
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  12363444 catgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca-tttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 12363542  T
Q  168 ttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaa 202  Q
    | || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||    
T  12363543 tcgaacaacaaagtgttccaccgctttgaaagacaa 12363578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10597788 - 10597706
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  10597788 ctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatgcgactaactcacttgtgtatatctacatac 10597706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11850840 - 11850778
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11850840 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 11850778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2270489 - 2270356
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||  | ||||    
T  2270489 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctaattgaat 2270391  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
      ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2270390 gattaaagcattca--ttcaggacataagtcctcacc 2270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 17496069 - 17496204
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||    
T  17496069 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaat 17496167  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccact 157  Q
     |||||| ||||||   |||| | ||||||||||||||||    
T  17496168 ggttaaagcattca---tcagaatataagtcctcaccact 17496204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12356230 - 12356098
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  12356230 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 12356132  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||    
T  12356131 gttaaagcattc--gttcaggacataggtcctcacc 12356098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12362779 - 12362647
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  12362779 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 12362681  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||    
T  12362680 gttaaagcattc--gttcaggacataggtcctcacc 12362647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12479965 - 12479833
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  12479965 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 12479867  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  12479866 gttaaaacatt--tgttcagaacataggtcctcacc 12479833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9772083 - 9772023
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  9772083 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat 9772023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29545380 - 29545269
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa--cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| || ||  ||   |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  29545380 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaaaaaatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 29545283  T
Q  119 gttaaaacattcat 132  Q
    |||||| |||||||    
T  29545282 gttaaagcattcat 29545269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12479791 - 12479679
Alignment:
Q  161 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgag 259  Q
    |||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| |    
T  12479791 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtg 12479692  T
Q  260 tatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||    
T  12479691 tatatctacatac 12479679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2499211 - 2499151
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  2499211 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 2499151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8374091 - 8374031
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  8374091 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 8374031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9691574 - 9691514
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  9691574 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 9691514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10597911 - 10597829
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||| | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10597911 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccgtcaccactgtttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 10597829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 10767738 - 10767798
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  10767738 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 10767798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 12419391 - 12419473
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  12419391 atgcatatggtaccataatcagggccgaagccctcactgctgtttgaatggttaaagcattcat---caggacataagtcctcacc 12419473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19344319 - 19344259
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  19344319 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcat 19344259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21151624 - 21151564
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  21151624 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 21151564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 29493535 - 29493595
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  29493535 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 29493595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 29550919 - 29550979
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  29550919 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 29550979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30597025 - 30596965
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  30597025 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 30596965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 45611648 - 45611708
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  45611648 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 45611708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 50656155 - 50656095
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  50656155 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 50656095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 53571401 - 53571341
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  53571401 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 53571341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18757017 - 18756935
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  18757017 ctttgaacgacgaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatac 18756935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18757141 - 18757099
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18757141 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgt 18757099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 132
Target Start/End: Original strand, 38742917 - 38742976
Alignment:
Q  71 tgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  38742917 tgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 38742976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 54520256 - 54520317
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  54520256 atgcatgtggtaccata-tcagggccggagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat 54520317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 14864788 - 14864930
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| || |||  ||| |||||||| |  | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||| || |  ||    
T  14864788 atgcatgtggtaccataa-cagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaaacattcttttatcaggacatgagtcctcatcattaa-catcgttt 14864885  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||| |||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  14864886 tgaacaacatagtgttccatcattttgaacgacaaagcgttccag 14864930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 2105523 - 2105790
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2105523 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtag 2105622  T
Q  115 aatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagag 214  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2105623 aatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagag 2105721  T
Q  215 ccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  2105722 ccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 2105790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27296223 - 27295880
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  27296223 atgcaacccatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 27296126  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  27296125 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctct 27296028  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac- 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  27296027 cccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaaca 27295930  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27295929 tttaagtgaattttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattc 27295880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 12578754 - 12579092
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  12578754 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 12578851  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  12578852 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 12578948  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||    
T  12578949 actgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgtt 12579047  T
Q  327 agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    | |||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12579048 aaggaattt-aattaagtacaacattcattcagtcagcatccattc 12579092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 12572272 - 12572610
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  12572272 caacttatcaccactccgctaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 12572369  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  12572370 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 12572466  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||    
T  12572467 actgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgtt 12572565  T
Q  327 agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    | |||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12572566 aaggaattt-aattaagtacaacattcattcagtcagcatccattc 12572610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 27785656 - 27785995
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  27785656 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 27785753  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  27785754 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 27785850  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  27785851 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 27785949  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27785950 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 27785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 27790877 - 27791216
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  27790877 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 27790974  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  27790975 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 27791071  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  27791072 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 27791170  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27791171 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 27791216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10685852 - 10685501
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||    
T  10685852 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaat 10685754  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  10685753 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccg 10685656  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |     
T  10685655 aagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaac 10685557  T
Q  317 ttacaactttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    ||||| ||||| || | ||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10685556 ttacacctttaagggagtttaattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 10685501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 20260773 - 20261024
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||    
T  20260773 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaat 20260871  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260872 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 20260969  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || | || ||||||||||||||    
T  20260970 aagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacatac 20261024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 22809882 - 22810084
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22809882 atgcatgtggtaccatatccagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcttt 22809981  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  22809982 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcctgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 22810081  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  22810082 tac 22810084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 9241282 - 9241534
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||||||| ||||    
T  9241282 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaat 9241380  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241381 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccg 9241479  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| ||| ||||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  9241480 aagttcttccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 9241534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724236
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 20724131  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  20724132 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttttgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 20724231  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  20724232 catac 20724236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23090207 - 23090006
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  23090207 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23090109  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    ||  |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  23090108 gaataactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23090009  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  23090008 tac 23090006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23102635 - 23102434
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  23102635 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23102537  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  23102536 gaaaaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagagccgaagctctcccacttttaggcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23102437  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  23102436 tac 23102434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19703659 - 19703456
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  19703659 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc-ccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgataaacaccgctt 19703561  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  19703560 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 19703461  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  19703460 catac 19703456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 26582675 - 26582852
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  26582675 atgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 26582773  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  26582774 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 26582852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 21907248 - 21907452
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  21907248 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaaacattc-ttttcaggacataagtcctcaccgcaaaacaccgctt 21907346  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  21907347 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatct 21907446  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  21907447 acatac 21907452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Original strand, 23877873 - 23878040
Alignment:
Q  104 caccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaag 203  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| || | |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  23877873 caccgctgtcgaatggttaaagcatt-atcatcaggacataagtcttcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaactacaag 23877971  T
Q  204 gcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  23877972 gcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctacatac 23878040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Original strand, 23263985 - 23264155
Alignment:
Q  72 gcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttga 171  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| || | ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  23263985 gcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccactatcgaatgattaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttga 23264083  T
Q  172 gcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  23264084 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgc 23264155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23169475 - 23169298
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  23169475 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23169377  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  23169376 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23169298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23580732 - 23580555
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  23580732 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23580634  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  23580633 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23580555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 200641 - 200801
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  200641 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 200739  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200740 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 200801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6744501 - 6744341
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  6744501 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 6744403  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744402 tgaacaaccagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 6744341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27367760 - 27367600
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  27367760 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 27367662  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27367661 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 27367600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 43693401 - 43693561
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  43693401 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 43693499  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43693500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 43693561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21074157 - 21073954
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||    
T  21074157 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacatgggtcctcaccgctaaacaccgctt 21074059  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| | | ||||| |||| |||||||||    
T  21074058 tgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccagggccgaagccctcccgcttttatggttatgcaattgaatccacttgtgtatatcta 21073959  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  21073958 catac 21073954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 6482321 - 6482499
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  6482321 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 6482419  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  6482420 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6482499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 6485788 - 6485966
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  6485788 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 6485886  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  6485887 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6485966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 23290925 - 23291129
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  23290925 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcgttt-caggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 23291023  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  23291024 tgaacaacaaagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 23291123  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  23291124 acatac 23291129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19649721 - 19649517
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  19649721 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 19649622  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||  |||||| ||| |  | |||| |||||||||    
T  19649621 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatacttatgcaactgactcacttgtgtatatcta 19649522  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  19649521 catac 19649517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 23752763 - 23752994
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||  | |||| |||||| ||||||||  ||||    
T  23752763 actccactaagattcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagctctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatt--cagg 23752859  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtt 238  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||| || || |    
T  23752860 acataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccacttttgtgct 23752959  T
Q  239 tatgcgactaa-tccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23752960 tatgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 23752994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 24658745 - 24658977
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24658745 actccactaagactcctcta-cgatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattt-cagg 24658842  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtt 238  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||  |    
T  24658843 acataagttctcactgctaaacaccactttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatact 24658942  T
Q  239 tatgcgac-taatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||||||||||||    
T  24658943 tatacaacttactccacttgtgtatatctacatac 24658977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5707191 - 5707031
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  5707191 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 5707093  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5707092 tgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact 5707031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 24943376 - 24943580
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  24943376 atgcatgtggtaccatattcagggccgcagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgcgaaacaccgctt 24943474  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||  ||| |||||||| || ||  ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  24943475 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttctagggccagagccctcccacttttgtgcgtatgcaactgactccacttgtgtatatct 24943574  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  24943575 acatac 24943580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27211187 - 27211017
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt--t 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||  |    
T  27211187 actccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaaacattcttttcat 27211090  T
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttc 209  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27211089 caggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttc 27211017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Original strand, 22703436 - 22703543
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22703436 caacgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcatc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctttaga 22703534  T
Q  116 atcgttaaa 124  Q
    || ||||||    
T  22703535 atggttaaa 22703543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Original strand, 26884122 - 26884295
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt-- 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||      
T  26884122 actccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttat 26884219  T
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26884220 caggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 26884295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Original strand, 24652301 - 24652472
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | |  ||  || ||||||||||||   | |||| |||||| ||||||||| || |    
T  24652301 actccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattatgggtcggagccctcaccgcgaattgaatggttaaagcattcattt-caag 24652398  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24652399 acataagtcctcaccgctaaacactgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 24652472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22796881 - 22796770
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||  ||||||    
T  22796881 actccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccagagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca--ttcagg 22796785  T
Q  140 acataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||||    
T  22796784 acataagtcctcacc 22796770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6261723 - 6261581
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt--tcaggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||| | ||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||    
T  6261723 atgcatgtggtaccata-tcagagccgaaaccctcaccgttatagaatggttaaagcattcttttcatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgct 6261627  T
Q  168 ttgagcaact-agtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6261626 ttgaacaacttagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 6261581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28971456 - 28971375
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcac 153  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  28971456 atgcatgtggtaccatattcaggaccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcac 28971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27208792 - 27208682
Alignment:
Q  100 ccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt--tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaa 196  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  27208792 ccctcaccgttatagaatggttaaaacattcttttcatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaa 27208695  T
Q  197 cgacaaggcgttc 209  Q
    |||||||||||||    
T  27208694 cgacaaggcgttc 27208682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 148
Target Start/End: Original strand, 23269201 - 23269276
Alignment:
Q  72 gcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtc 148  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23269201 gcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtc 23269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 148
Target Start/End: Original strand, 23276070 - 23276145
Alignment:
Q  72 gcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtc 148  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23276070 gcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtc 23276145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 23062501 - 23062584
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23062501 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca--ttcaggacataagtcctcacc 23062584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28971333 - 28971251
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  28971333 ctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatac 28971251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 45028509 - 45028570
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  45028509 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 45028570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22796688 - 22796600
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  22796688 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 22796600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4071676 - 4071616
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4071676 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 4071616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 4077421 - 4077481
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4077421 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 4077481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11360371 - 11360311
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11360371 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11360311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 14563833 - 14563893
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  14563833 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 14563893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 20850190 - 20850250
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  20850190 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 20850250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 21604765 - 21604825
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  21604765 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 21604825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22013244 - 22013184
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  22013244 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 22013184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24481731 - 24481671
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  24481731 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 24481671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25590338 - 25590278
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  25590338 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 25590278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 27037245 - 27037305
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  27037245 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 27037305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 27272252 - 27272312
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  27272252 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 27272312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 27729509 - 27729569
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  27729509 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 27729569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30196646 - 30196586
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  30196646 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 30196586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35244166 - 35244106
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  35244166 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 35244106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 35585358 - 35585418
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  35585358 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 35585418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21133307 - 21133225
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  21133307 ctttgaacgacaaggcgttctagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatac 21133225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32911620 - 32911559
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||    
T  32911620 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcat 32911559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21133431 - 21133348
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21133431 atgcatgtagtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 21133348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 22906911 - 22907178
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22906911 tcaacgaatcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgtatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 22907010  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907011 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 22907110  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  || | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22907111 cgaagctctcccactgttatgcttatgcagctgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 22907178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33682422 - 33682079
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  33682422 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 33682325  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||    
T  33682324 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccaaagctct 33682228  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaact 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33682227 cccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaact 33682128  T
Q  325 tt-agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33682127 ttaagggaattttaattaagtacaacgtacattcagtcagcatccattc 33682079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 19726555 - 19726807
Alignment:
Q  19 acgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19726555 acgactcatgcaactcatcaccactccaccaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatg 19726654  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19726655 gttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccga 19726753  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  19726754 agctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 19726807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 1592705 - 1592971
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1592705 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacctatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcga 1592804  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1592805 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgagaaggcgttccagagc 1592903  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  1592904 cgaagctctcccactgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaaccta 1592971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21724991 - 21724725
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21724991 tcaactactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatacatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctataga 21724892  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  21724891 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-taccactttgagcaactagtactccaccactttgatctattaggcgttccagagc 21724793  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  21724792 cgaagctctcccactgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaaccta 21724725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 937910 - 937658
Alignment:
Q  19 acgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  937910 acgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcatgaccttagccctcacctctgtagaatg 937811  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  937810 gttaaagcattcattttcaggacataagtcctcacctctaa-caccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccga 937712  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| | | | || || | ||||||||||||||    
T  937711 agctctcccacttctatgcttatgcaattgacccactcgtgtatatctacatac 937658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 14033103 - 14033442
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  14033103 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 14033200  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  14033201 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 14033297  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  14033298 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 14033396  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14033397 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 14033442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27562756 - 27562415
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaa-aatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  27562756 atgcaacttatcaccactccactaaaactcctctaaca---cccatgcatgtggtaccaagaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 27562660  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  27562659 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 27562563  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||    
T  27562562 cccgctgttatgttaatgcaactaatccccattgagtatatctacatactacccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaac 27562464  T
Q  324 tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     ||| |||||||  |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27562463 gttaaggaattttaattaaacacaacattcattcagtcagcatccattc 27562415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 310
Target Start/End: Original strand, 23835015 - 23835295
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  23835015 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 23835112  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  23835113 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 23835209  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23835210 cccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcacca 23835295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28360074 - 28359730
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||  ||| |||| ||||||    
T  28360074 atgcaacttattactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaa 28359977  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  28359976 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 28359880  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttg-agtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaa 322  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| || | ||||||    
T  28359879 cccactgttatgttaatgcaactaatccccttgttgtatatctacataccaacccacctagacatatatatatatatatgtttcaccaaccaacttacaa 28359780  T
Q  323 ctttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    | ||| |||||||   |||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  28359779 cgttaaggaattttatttaaatacaacattcaatcagtcagcatccattc 28359730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28290435 - 28290133
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||    
T  28290435 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaat 28290337  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28290336 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-catcactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 28290239  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgat 316  Q
    || |||||||||||||||| | |||| ||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| ||    
T  28290238 aaactctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaat 28290140  T
Q  317 ttacaac 323  Q
    |||||||    
T  28290139 ttacaac 28290133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29416644 - 29416470
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29416644 catgcatgtggtaccatattcaaggtcgtagccctcacagctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactt 29416545  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29416544 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgctccagagccgaagctctcccacttttatgattatgc 29416470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 12941749 - 12942000
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaac---acccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||    | | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||    
T  12941749 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgaaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaat 12941847  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941848 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 12941945  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || | || ||||||||||||||    
T  12941946 aagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacatac 12942000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8760654 - 8760410
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  | ||||     
T  8760654 cgactcatgcaacacacaaccactccactaagactcctcta-caatactcatgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccacttatcgaatg 8760556  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  8760555 gttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacgactagtgttccaccactttgaacaacaaggcgttccagggcaga 8760456  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatat 264  Q
    ||| ||||  || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||    
T  8760455 agccctccagcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatat 8760410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21566364 - 21566163
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  21566364 atgcacgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc-tcatcatgacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21566266  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  21566265 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 21566166  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  21566165 tac 21566163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19588760 - 19588556
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||  | |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  19588760 atgcatgtggtaccataatcagggccgaatccctcaccgctaattgaatggttaaagtattcattttcatgacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 19588661  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  19588660 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 19588561  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  19588560 catac 19588556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29615376 - 29615199
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||   |||| ||||    
T  29615376 atgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 29615278  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  29615277 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 29615199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14375489 - 14375284
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  14375489 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaggattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 14375390  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | |||||| | ||| ||| || | ||||||||    
T  14375389 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttaagcttatgcaaataactccactagtgtatatct 14375290  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  14375289 acatac 14375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 24562282 - 24562442
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  24562282 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24562380  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24562381 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 24562442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Original strand, 12167303 - 12167439
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12167303 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgat 12167402  T
Q  236 gtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  12167403 gtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatac 12167439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Original strand, 19286212 - 19286348
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19286212 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgat 19286311  T
Q  236 gtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  19286312 gtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatac 19286348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Original strand, 18788449 - 18788560
Alignment:
Q  161 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagt 260  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||    
T  18788449 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgt 18788548  T
Q  261 atatctacatac 272  Q
    ||||||||||||    
T  18788549 atatctacatac 18788560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Original strand, 18799429 - 18799540
Alignment:
Q  161 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagt 260  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||    
T  18799429 caccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgt 18799528  T
Q  261 atatctacatac 272  Q
    ||||||||||||    
T  18799529 atatctacatac 18799540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8768391 - 8768149
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  |  | ||||     
T  8768391 cgactcatgcaacacacaaccactccactaagactcctcta-caatactcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccaattatcgaatg 8768293  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||          |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  8768292 gttaaagcattctttttcaggacatgaatcctcaccgct----------ttgaacaactagtgttccaccattttgaacgacaaggcgttccagggcaga 8768203  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| ||||  || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  8768202 agccctccagcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 8768149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Original strand, 19877396 - 19877532
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19877396 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgat 19877495  T
Q  236 gtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  19877496 gtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatac 19877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Original strand, 19883172 - 19883308
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19883172 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgat 19883271  T
Q  236 gtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  19883272 gtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatac 19883308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19300846 - 19300705
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  19300846 atgcatgtggtaccata-tcaggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaa-caccgctt 19300749  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19300748 tgaacaacatagtgttccaccactttgaacgacaaagcgttcca 19300705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 272
Target Start/End: Original strand, 19439782 - 19439904
Alignment:
Q  150 tcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa 249  Q
    ||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||| |    
T  19439782 tcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactga 19439881  T
Q  250 tccccttgagtatatctacatac 272  Q
     || |||| ||||||||||||||    
T  19439882 cccacttgtgtatatctacatac 19439904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 2708368 - 2708573
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||    
T  2708368 atgcatgtggtaccatatttagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagttctcaccgctaaacaccgctt 2708467  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||  ||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  2708468 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcctatgcaactaactccacttgtgtatatct 2708567  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  2708568 acatac 2708573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19786984 - 19786847
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19786984 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgat 19786885  T
Q  236 gttt-atgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  19786884 gtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctacatac 19786847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24514005 - 24513801
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  24514005 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctt 24513907  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcga-ctaatccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||| |||||| | | | ||| |||| ||||||||    
T  24513906 tgaacaacaaagtgttccaccgctttaaacgacaaggcgttccagggccgaaaccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatct 24513807  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  24513806 acatac 24513801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25470868 - 25470708
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  25470868 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggacctaagtcctcacctctccacaccgctt 25470770  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25470769 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 25470708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 14724364 - 14724568
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||   |  ||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |||    
T  14724364 atgcatgtggtaccataatcagggttggggccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggatataagttctcaccgctaatcaccgctt 14724463  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| |||||||||    
T  14724464 tgaacaacaagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcta 14724563  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  14724564 catac 14724568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 19818899 - 19819102
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  19818899 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccttcaccgctaattgaatggttaaagcattcattt-caggacataagtcatcaccgctaaacaccgctt 19818997  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| || || || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  19818998 tgaacaacaaagtgttccacctctttgaacgacaaggcattccagggccggagc-ctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 19819096  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  19819097 acatac 19819102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 242
Target Start/End: Original strand, 23837580 - 23837752
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||| ||   |||| |||    
T  23837580 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagttctcaccgctccacaccgctt 23837678  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 242  Q
    ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23837679 tgaacaactagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatg 23837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34647763 - 34647652
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  34647763 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgat 34647665  T
Q  236 gtttatgcgacta 248  Q
    |||||||| ||||    
T  34647664 gtttatgcaacta 34647652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14616449 - 14616245
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  14616449 atgcatgtggtaccgtattcagggccggagccgtcaccgctaatagaatgtttaaagcattcatttt-aggacataagtcatcaccgctaaacaccgctt 14616351  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  14616350 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatct 14616251  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  14616250 acatac 14616245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11289705 - 11289602
Alignment:
Q  144 aagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11289705 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgc 11289607  T
Q  244 gacta 248  Q
     ||||    
T  11289606 aacta 11289602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34641089 - 34640978
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  34641089 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacggcgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgat 34640991  T
Q  236 gtttatgcgacta 248  Q
    |||||||| ||||    
T  34640990 gtttatgcaacta 34640978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14996086 - 14995923
Alignment:
Q  112 tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcc 210  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14996086 tagaatggttaaagcattccttttcaggacatgagtcctcaccattaaacaccgctttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcc 14995987  T
Q  211 agagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    || ||  |||| ||| || || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  14995986 agggcataagccctcaccgcttttatgattatgcaactgactccgcttgtgtatatctacatac 14995923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 15457465 - 15457607
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |  |||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||    
T  15457465 atgcatgtggtaccata-tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttatatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgct 15457561  T
Q  168 ttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15457562 ttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 15457607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 15464060 - 15464202
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |  |||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||    
T  15464060 atgcatgtggtaccata-tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttatatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgct 15464156  T
Q  168 ttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15464157 ttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 15464202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23021503 - 23021423
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||   ||||||||||||||||||||    
T  23021503 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgctttagaatggttaaagaattca---tcaggacataagtcctcacc 23021423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581831
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatt-ttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataa-cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattctttcatcaggacatgagtcctcaccgttaaacaccgctt 14581936  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||  ||| || || ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||| |    
T  14581935 tgaacaacattgtgttcctccactttgaatgacaaggcattccaggaccgaagtcctcaccgctattatgcttatgcaactaa-ccccttatgtatatat 14581837  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  14581836 acatac 14581831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5290319 - 5290257
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5290319 atgcatgtggtaccatattcagggacgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5290257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 212
Target Start/End: Original strand, 31251385 - 31251511
Alignment:
Q  87 atcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgct 183  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |    
T  31251385 atcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgtt 31251482  T
Q  184 ccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31251483 ccaccgctttgaatgacaaggcgttccag 31251511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12447350 - 12447289
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  12447350 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 12447289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 13940433 - 13940494
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  13940433 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat 13940494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23234983 - 23234901
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||| ||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  23234983 ctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactcacttgtgtatatctacatac 23234901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26418844 - 26418761
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26418844 atgcatgtggtatcataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 26418761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 94644 - 94584
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  94644 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 94584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10464363 - 10464303
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  10464363 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 10464303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10470885 - 10470825
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  10470885 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 10470825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 14582804 - 14582864
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  14582804 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 14582864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15332272 - 15332212
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  15332272 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 15332212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 17309673 - 17309733
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  17309673 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 17309733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Original strand, 17414117 - 17414200
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  17414117 ctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 17414200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Original strand, 25347031 - 25347145
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa--cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||| || ||  || | ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| | ||||    
T  25347031 gactcatgcaagacatgacaactccactaagacacctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtttgaat 25347130  T
Q  118 cgttaaaacattcat 132  Q
     |||||| |||||||    
T  25347131 ggttaaagcattcat 25347145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 27767359 - 27767419
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  27767359 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 27767419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17207892 - 17207831
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  17207892 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 17207831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Original strand, 19449237 - 19449304
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaa 85  Q
    |||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  19449237 caacgactcatgcaacactcgacaactccactaagactcctct-acaatgctcatgcatgtggtaccaa 19449304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 24369187 - 24369246
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  24369187 atgcatgtggtaccaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 24369246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30799586 - 30799527
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  30799586 atgcatgtggtaccaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 30799527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 23121545 - 23121812
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23121545 tcaacgactcatgtaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 23121644  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23121645 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacgaggcattccagagc 23121744  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23121745 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 23121812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 14484375 - 14484642
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14484375 tcaacgactcatgccactcatcaccactccactaagactccactaacaacacccatacatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 14484474  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14484475 atggttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 14484574  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  14484575 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtgtatctacatacaacccaaccta 14484642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 20940211 - 20940480
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgt 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20940211 gactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggt 20940310  T
Q  121 taaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaag 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20940311 taaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgttccagagctgaag 20940409  T
Q  221 ctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 291  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||    
T  20940410 ctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatata 20940480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 635982 - 635638
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  635982 atgcaacccatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 635885  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  635884 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctct 635787  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac- 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  635786 cccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaaca 635688  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  635687 tttaagtgaattttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattc 635638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17000398 - 17000131
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17000398 tcaacgactcatgcaattcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagtcctcaccgctgtaaa 17000299  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17000298 atggttaaaacattcattttcaggacataagttctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgttccagagc 17000199  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17000198 cgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 17000131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43285126 - 43284871
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43285126 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctctcctctgtaga 43285027  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  43285026 atggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgtcccagagc 43284928  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || ||   ||||||||||||||    
T  43284927 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccactcttgtatatctacatac 43284871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11171488 - 11171222
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaa 116  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  11171488 caacgactcatgcaacacaccaccactccactaagactcctctaataacaaccatgcatgtagtaccataatcagggtcgtagccctcaccgccgtagaa 11171389  T
Q  117 tcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  11171388 tggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttaaacgataaggcgttccaaagcc 11171289  T
Q  217 gaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  11171288 gaagctctcccacttttatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatatacataccactcaaccta 11171222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4831318 - 4831092
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4831318 caacgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtaga 4831220  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4831219 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 4831120  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4831119 cgaagctctcccacttttatgattatgc 4831092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4834613 - 4834387
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4834613 caacgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtaga 4834515  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4834514 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 4834415  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4834414 cgaagctctcccacttttatgattatgc 4834387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 42701187 - 42701526
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  42701187 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 42701284  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  42701285 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 42701381  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  42701382 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 42701480  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42701481 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 42701526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 51602288 - 51601949
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  51602288 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 51602191  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  51602190 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 51602094  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  51602093 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 51601995  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51601994 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 51601949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 51608169 - 51607830
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  51608169 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 51608072  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  51608071 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 51607975  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  51607974 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 51607876  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51607875 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 51607830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41800167 - 41799828
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  41800167 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 41800070  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  41800069 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 41799973  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||| | ||||    
T  41799972 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttataccttt 41799874  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41799873 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 41799828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 53748969 - 53748628
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacca-aaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  53748969 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--actcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 53748872  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  53748871 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 53748775  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |    
T  53748774 cccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacc 53748676  T
Q  324 ttt-agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    ||| |||||||||  ||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  53748675 tttaagggaattt-aattatatacaacacaca-tcagtcagcatccattc 53748628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 15533735 - 15533986
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||    
T  15533735 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaat 15533833  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533834 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 15533931  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || | || ||||||||||||||    
T  15533932 aagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacatac 15533986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 15406912 - 15407113
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15406912 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 15407010  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  15407011 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctctcgctttcatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 15407110  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  15407111 tac 15407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 18212138 - 18212339
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  18212138 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 18212236  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  18212237 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 18212336  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  18212337 tac 18212339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 16152435 - 16152647
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  ||||||     
T  16152435 cgactcatgcaacactcgacaactccactaagaatcctctaa-accgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatg 16152533  T
Q  119 gttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16152534 gttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcc 16152633  T
Q  217 gaagctctcccact 230  Q
    ||||| ||||||||    
T  16152634 gaagccctcccact 16152647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 16156581 - 16156836
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  ||||||     
T  16156581 cgactcatgcaacactcgacaactccactaagaatcctcta-caccgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatg 16156679  T
Q  119 gttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  16156680 gttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaggcc 16156779  T
Q  217 gaagctctcccac-tgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| | || || | ||||||||||||||    
T  16156780 gaagccctcccacttattatgattatgcaactgacccactcgtgtatatctacatac 16156836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 14062908 - 14063113
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  14062908 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 14063007  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || || || |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  14063008 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatacct 14063107  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  14063108 acatac 14063113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26077890 - 26077686
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  26077890 atgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 26077791  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||  | | | || |||| |||||||||    
T  26077790 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtttcagagccgaagccctcccgcttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatcta 26077691  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  26077690 catac 26077686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 11847053 - 11847230
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| ||||    
T  11847053 atgcatgtggtaccataaacagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 11847151  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  11847152 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 11847230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14556309 - 14556054
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  14556309 cgactcatgcaacacttaacaactccactaagactcctcta-cagtgcacatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatg 14556211  T
Q  119 gttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  14556210 gttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggca 14556111  T
Q  217 gaagctctcccactgt-tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
      ||| ||||| || | |||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  14556110 agagccctcccgctttatatgcttatgctactgacccacttgtgtatatctacatac 14556054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 15324875 - 15325077
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||    
T  15324875 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc-ccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaa-aaccgctt 15324972  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| || | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||  ||||| ||| || | |||||||||    
T  15324973 tgaacatcaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcttatgtaactaactccactggtgtatatcta 15325072  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  15325073 catac 15325077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2585396 - 2585143
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaact-catcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaat 117  Q
    |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||    
T  2585396 cgactcatgcaactacttaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaat 2585298  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
      ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2585297 gattaaagcattcatt--caggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcc 2585200  T
Q  217 gaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
       || ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| | ||||||||||||    
T  2585199 agggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgcatatctacatac 2585143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 272
Target Start/End: Original strand, 14485537 - 14485713
Alignment:
Q  98 agccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttga 195  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||    
T  14485537 agccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttga 14485636  T
Q  196 acgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  14485637 acgacaaggtgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 14485713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41529263 - 41529059
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  41529263 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 41529164  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||  ||| ||||| || || || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  41529163 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgtttcagggccagagccctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 41529064  T
Q  267 acata 271  Q
    |||||    
T  41529063 acata 41529059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8047074 - 8046897
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||  ||   |||| |||    
T  8047074 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcactgctccacaccgctt 8046976  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  8046975 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgccacta 8046897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 14048229 - 14048404
Alignment:
Q  100 ccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaac 197  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||    
T  14048229 ccctcaccgctgatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaac 14048328  T
Q  198 gacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  14048329 gacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 14048404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 14910534 - 14910788
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||   || | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14910534 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactactc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatagaat 14910632  T
Q  118 cgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
     |||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||| |||| || | |||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |    
T  14910633 ggttaaagcattcttttataaggacatgagtcctcacc-ctaa-catcgctttgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgacaaggcgttccaggac 14910730  T
Q  216 cgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| || ||| || || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  14910731 cgaggccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 14910788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 40908583 - 40908726
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||    
T  40908583 atgcatgtggtaccataa-cagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgttaaacaccgctt 40908681  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40908682 tgaacaacattgtgttccaccactttgaatgacaaggcattccag 40908726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 209
Target Start/End: Original strand, 27905211 - 27905350
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||| |||| |||    
T  27905211 atgcatgtggtaccata-tcaggactgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctctccgctaa-caccgctt 27905308  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttc 209  Q
    ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  27905309 tgaacaacatagtgttccatcgctttgaacgacaaggcgttc 27905350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1651237 - 1651035
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    |||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||   || | || ||    
T  1651237 catgcatgtggtaccataa-cagggtcggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgtcaaactccgct 1651139  T
Q  168 ttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatat 264  Q
    |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  1651138 ttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgcttatgcaactgactccgcttgtgtatat 1651039  T
Q  265 ctac 268  Q
    ||||    
T  1651038 ctac 1651035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Original strand, 14048121 - 14048227
Alignment:
Q  114 gaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14048121 gaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgttttgaacgacaaggcgttccag 14048220  T
Q  213 agccgaa 219  Q
     ||||||    
T  14048221 ggccgaa 14048227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 30146727 - 30146860
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  ||||||    
T  30146727 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaatagaat 30146825  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
     |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30146826 ggttaaagcattca--ttcaggacataagtcctcacc 30146860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Original strand, 16221226 - 16221355
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  16221226 atgcatgtggtaccatattcagggacgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaacgctaaacaccgctt 16221325  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaac 197  Q
    ||| ||||  |||| |||||| ||||||||    
T  16221326 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaac 16221355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 20894944 - 20895004
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  20894944 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat 20895004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 49548716 - 49548656
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  49548716 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat 49548656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Original strand, 13452226 - 13452307
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcac 153  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  13452226 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcac 13452307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 46045003 - 46044942
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  46045003 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 46044942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 16750817 - 16750854
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagac 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16750817 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagac 16750854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Original strand, 37881521 - 37881602
Alignment:
Q  191 tttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  37881521 tttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcccgcttttatgcatatgcgacttactcacttgtgtatatctacatac 37881602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 391074 - 391134
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  391074 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 391134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3260125 - 3260065
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  3260125 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 3260065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 5938873 - 5938933
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  5938873 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 5938933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 7359196 - 7359256
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  7359196 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 7359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11202564 - 11202504
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11202564 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11202504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 11937106 - 11937166
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11937106 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11937166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 20889325 - 20889385
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  20889325 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 20889385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 21881542 - 21881602
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  21881542 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 21881602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23436116 - 23436056
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  23436116 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 23436056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 26395633 - 26395693
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  26395633 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 26395693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29382898 - 29382838
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  29382898 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 29382838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29448810 - 29448750
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  29448810 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 29448750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29455494 - 29455434
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  29455494 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 29455434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35462744 - 35462684
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  35462744 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 35462684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 50082208 - 50082268
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  50082208 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 50082268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 52500499 - 52500559
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  52500499 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 52500559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Original strand, 14047980 - 14048118
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||| | ||||| ||  || ||||||||||  | ||||    
T  14047980 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aataatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggccagagtcctcaccgctaattgaat 14048078  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaa 159  Q
     |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14048079 ggttaaagcattca--ttcaggatataagtcctcaccgctaa 14048118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15361055 - 15360988
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaa 85  Q
    |||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  15361055 caacgactcatgcaacactcgaccactccactaagactcctct-acaatgcacatgcatgtggtaccaa 15360988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 129
Target Start/End: Original strand, 33221320 - 33221377
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacatt 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  33221320 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 33221377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39266370 - 39266311
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  39266370 atgcatgtggtaccaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 39266311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 41877 - 42132
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41877 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 41976  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 42075  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  42076 cgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 42132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 22055665 - 22055930
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22055665 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 22055764  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22055765 atggttaaagcattcattttcaggacctaaatcctcaccactaa-caccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 22055863  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22055864 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctacata-caaccaaccta 22055930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 22050147 - 22050412
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050147 tcaacgactcatgcaactcatcaccattccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 22050246  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22050247 atggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccactaa-caccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagc 22050345  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22050346 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctacata-caaccaaccta 22050412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 22177532 - 22177787
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22177532 tcaacgacacatgccactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 22177631  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22177632 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcttcaccactaa-caccactttgagcaacttgtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 22177730  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22177731 cgaagctctcccacttttttgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22177787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9273394 - 9273057
Alignment:
Q  34 catcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  9273394 catcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-t 9273298  T
Q  133 tttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 232  Q
      |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273297 catcagaacataagtcctcaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgt 9273199  T
Q  233 tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac-tttaggga 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | |    
T  9273198 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccatccaacttacaacatttaagta 9273100  T
Q  332 a--tttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    |  |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9273099 aatttttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattc 9273057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Original strand, 36799337 - 36799675
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  36799337 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 36799434  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  36799435 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 36799531  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||    
T  36799532 actgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgtt 36799630  T
Q  327 agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
    | |||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36799631 aaggaattt-aattaagtacaacattcattcagtcagcatccattc 36799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1804710 - 1804367
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  1804710 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 1804613  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  1804612 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 1804516  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | || ||||    
T  1804515 cccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccattcaacttgcaac 1804417  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     || ||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  1804416 attaaggaaattttaattaaatacaacattcattcaatcagcatctattc 1804367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18681742 - 18681403
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  18681742 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 18681645  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  18681644 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 18681548  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  18681547 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 18681449  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18681448 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 18681403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22025815 - 22025559
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaa 116  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22025815 caacgactcatgcatcacaccaccactcctctaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaa 22025716  T
Q  117 tcgttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22025715 tggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagc 22025616  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || ||||  |||||||||||||    
T  22025615 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtctatatctacatac 22025559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31568051 - 31567712
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  31568051 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 31567954  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  31567953 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 31567857  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  31567856 actgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctatataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 31567758  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31567757 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 31567712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31573272 - 31572933
Alignment:
Q  29 caactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  31573272 caacttatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 31573175  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  31573174 ttc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 31573078  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt 326  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||    
T  31573077 actgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaccttt 31572979  T
Q  327 -agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31572978 aagggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 31572933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22063818 - 22063562
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaa 116  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  22063818 caacgactcatgcatcacaccaccactcctctaagactcctctaacaacacccatgcatttagtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtagaa 22063719  T
Q  117 tcgttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22063718 tggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccggagc 22063619  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22063618 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22063562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14057784 - 14057583
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14057784 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattc-ttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 14057686  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| ||||    
T  14057685 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatttaca 14057586  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  14057585 tac 14057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009433
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 41009538  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  41009537 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 41009438  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  41009437 catac 41009433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 242
Target Start/End: Original strand, 21668857 - 21669029
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  21668857 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc-ccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 21668955  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 242  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21668956 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatg 21669029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21327027 - 21326822
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttc-aggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  21327027 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 21326928  T
Q  168 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatct 266  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  21326927 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaaatccacttgtgtatatct 21326828  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  21326827 acatac 21326822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 10606882 - 10607136
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  10606882 cgactcatgcaacccacaaccgctccactaagacccttcta-caacactcatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 10606980  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  10606981 gttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcgttgaacaacaaggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcca 10607080  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  10607081 gagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 10607136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 21282058 - 21282261
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||  |||| |||    
T  21282058 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcgtcaccgctatacaccgctt 21282157  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctac 268  Q
    ||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  21282158 tgaacaacaagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctac 21282257  T
Q  269 atac 272  Q
    ||||    
T  21282258 atac 21282261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21322439 - 21322234
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  21322439 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 21322340  T
Q  168 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  | ||||| || | |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  21322339 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgagaccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatct 21322240  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  21322239 acatac 21322234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Original strand, 18609793 - 18609965
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  18609793 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 18609891  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    || ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  18609892 gaacaactagtgttccaccgctttcaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgc 18609965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 23825124 - 23825284
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  23825124 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23825222  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23825223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 23825284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Original strand, 25110911 - 25111043
Alignment:
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttt 239  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25110911 acataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagacattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 25111010  T
Q  240 atgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25111011 atgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 25111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20974250 - 20974073
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||     
T  20974250 cgactcatgcaacccacaaccgctccactaagactcttcta-caacactcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatg 20974152  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaac 197  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  20974151 gttaaagcattctttttcaggacataagtcctcatcgctaaacaccgctttgaacaacttgtgttccaccgctttgaac 20974073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30767126 - 30766966
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  30767126 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcataaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30767028  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30767027 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 30766966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 44476236 - 44476414
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   ||||  ||    
T  44476236 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgttt 44476334  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  44476335 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44476414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 44479498 - 44479676
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   ||||  ||    
T  44479498 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgttt 44479596  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  44479597 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44479676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 25409554 - 25409731
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||   |||| ||||    
T  25409554 atgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcatcaccgctccacaccgcttt 25409652  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  25409653 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgatccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 25409731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 248
Target Start/End: Original strand, 23865500 - 23865611
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23865500 caggacataagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgat 23865598  T
Q  236 gtttatgcgacta 248  Q
    |||||||| ||||    
T  23865599 gtttatgcaacta 23865611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19903105 - 19902945
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  19903105 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 19903007  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19903006 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccact 19902945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Original strand, 17053663 - 17053799
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  17053663 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagttttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccactttgat 17053762  T
Q  236 gtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| ||||  || | || ||||||||||||||    
T  17053763 gtttatgcaactaccccacctgtgtatatctacatac 17053799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19988416 - 19988224
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  19988416 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagattcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatatttagggccggagccctcaccgctaattgaatg 19988318  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactag-tgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||| |  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19988317 gttaaagcattcattt-caggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttcaacaacaaaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 19988224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20840129 - 20839959
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||||| || |    
T  20840129 actccactaagactcctcta-caatgcacatgcatttggtaccatattcagggccggagccctcactgctaattgaattgttaaagcattcattt-catg 20840032  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    ||||||||| |||   |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20840031 acataagtcttcattgctaaacacctctttgaacaacaaagtgttccacttctttgaacgacaaggcgttcca 20839959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31412688 - 31412606
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  31412688 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcac 31412606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31418870 - 31418788
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcac 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  31418870 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcac 31418788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 23653839 - 23653921
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  23653839 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatt---aggacataagtcctcacc 23653921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27942401 - 27942221
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  27942401 gactcatgcaagacatgacaactcaactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcaccgttatagaat 27942304  T
Q  118 cgttaaaacattcattt--tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacga 199  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  27942303 ggttaaaacattcttttcatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacga 27942221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21300229 - 21300117
Alignment:
Q  161 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgag 259  Q
    |||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| |    
T  21300229 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaaggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 21300130  T
Q  260 tatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||    
T  21300129 tatatctacatac 21300117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21300403 - 21300271
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | ||||     
T  21300403 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatg 21300305  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  21300304 gttaaagcattca--ttcatgacataggtcctcacc 21300271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22176107 - 22176034
Alignment:
Q  197 cgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22176107 cgacaaggcgttccagagccgaatctctcc--cttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22176034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 132
Target Start/End: Original strand, 39363479 - 39363543
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  39363479 catgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaaacattcat 39363543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4520864 - 4520804
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4520864 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 4520804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10956815 - 10956755
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  10956815 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 10956755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 14563542 - 14563602
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  14563542 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 14563602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14746650 - 14746590
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  14746650 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 14746590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 14765588 - 14765648
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  14765588 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 14765648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16887428 - 16887368
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  16887428 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 16887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 23117210 - 23117270
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  23117210 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 23117270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26486150 - 26486090
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  26486150 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 26486090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27909714 - 27909654
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  27909714 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 27909654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27956133 - 27956073
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  27956133 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 27956073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36800572 - 36800512
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  36800572 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 36800512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23224876 - 23224817
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  23224876 atgcatgtggtaccaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 23224817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36445984 - 36445917
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaa 85  Q
    |||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  36445984 caacgactcatgcaacacccgacaactccactaagactcctct-acaatgcacatgcatgtggtaccaa 36445917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 758481 - 758216
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  758481 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 758382  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  758381 atggttaaagcattca-tttcaggacgtaagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 758284  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  758283 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 321
Target Start/End: Original strand, 20937540 - 20937845
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20937540 tcaacgactcatgcaactcatcaccaccccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgatgtaga 20937639  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20937640 atggttaaagcattcattttcaagacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccacagc 20937739  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccg 314  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||||    
T  20937740 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactccg 20937838  T
Q  315 atttaca 321  Q
    |||||||    
T  20937839 atttaca 20937845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22313059 - 22312793
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22313059 tcaacgactcatgcaactcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 22312960  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22312959 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactga-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagt 22312861  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22312860 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 22312793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22509399 - 22509126
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22509399 tcaacgactcatgcaactcatcaccactcaactaagactcctctaacaacacc-atgcatgtggtaccaaaatcaagaccgtagccctcaccgctgtaga 22509301  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22509300 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatc 22509202  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22509201 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatata 22509126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17265013 - 17264670
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  17265013 atgcaacccatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 17264916  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  17264915 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctct 17264818  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac- 323  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  17264817 cccactgtgatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatac-ttatatatgattcaccatccaatttacaaca 17264720  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17264719 tttaagtgaattttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattc 17264670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17271495 - 17271152
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  17271495 atgcaacccatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgttgaatggttaaa 17271398  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  17271397 gcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctct 17271300  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac- 323  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  17271299 cccactgtgatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatac-ttatatatgattcaccatccaatttacaaca 17271202  T
Q  324 -tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17271201 tttaagtgaattttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattc 17271152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21678484 - 21678144
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  21678484 atgcaacttatcaccactccactaagactcctctaata---cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 21678388  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  21678387 gcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctct 21678291  T
Q  225 cccactgttatgtttatgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||    
T  21678290 cccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaac 21678192  T
Q  324 tttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21678191 gttaaggaattt-aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattc 21678144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 22174972 - 22175317
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaa 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  22174972 atgcaacccatcaccactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaa 22175069  T
Q  125 acattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctct 224  Q
     ||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22175070 gcattc-tcatcaggacataagtcctaaccactaa-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctct 22175167  T
Q  225 cccactgttatg-tttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac 323  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  22175168 cccactgttatgttttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaacttacaac 22175265  T
Q  324 -tttagggaa--tttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattc 372  Q
     |||| | ||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22175266 gtttaagtaaatttttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattc 22175317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 10816721 - 10816947
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||    
T  10816721 caacgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagtgtcgtagccctcaccgctgtaga 10816819  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10816820 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccaatttgaacgacaaggcgttccagagc 10816919  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10816920 cgaagctctcccacttttatgattatgc 10816947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 23538748 - 23538974
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||     
T  23538748 caacgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcgcatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagt 23538846  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23538847 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagtcgttccagagc 23538946  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  23538947 cgaagctctctcacttttatgattatgc 23538974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 323
Target Start/End: Original strand, 9775416 - 9775718
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||    
T  9775416 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaat 9775514  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775515 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 9775612  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgat 316  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| ||    
T  9775613 aagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaat 9775711  T
Q  317 ttacaac 323  Q
    |||||||    
T  9775712 ttacaac 9775718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37805543 - 37805292
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | |||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||    
T  37805543 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaat 37805445  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37805444 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttacagagccg 37805347  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || | || ||||||||||||||    
T  37805346 aagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacatac 37805292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22439902 - 22439701
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  22439902 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 22439804  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||  |||||||||||    
T  22439803 gaacaactagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccggagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 22439704  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  22439703 tac 22439701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22008102 - 22007896
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || | ||    
T  22008102 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacctaagtcctcaccgctaaacatcgct 22008003  T
Q  168 ttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac-tgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatc 265  Q
    |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||    
T  22008002 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttattatgattatgcaactgacccacttgtgtatatc 22007903  T
Q  266 tacatac 272  Q
    |||||||    
T  22007902 tacatac 22007896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1857680 - 1857520
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  1857680 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 1857582  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857581 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 1857520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21675648 - 21675488
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  21675648 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21675550  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21675549 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 21675488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23112965 - 23112773
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  23112965 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaat 23112867  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
     |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23112866 ggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccag 23112773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6404722 - 6404469
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | ||||     
T  6404722 cgactcatgcaacactcaacaactccattaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaatg 6404624  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaact-agtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  6404623 gttaaagcattcattta-aggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacagagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcca 6404525  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     ||||||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  6404524 gagctctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 6404469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 19510999 - 19511177
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  19510999 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 19511097  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  19511098 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 19511177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6728438 - 6728233
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  6728438 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaacattctttttcaagacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 6728339  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||  || || || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  6728338 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtttcagggccggagccctcctgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 6728239  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  6728238 acatac 6728233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 23527448 - 23527651
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  23527448 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 23527546  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttt-atgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||  || | || |||||||||    
T  23527547 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatcta 23527646  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  23527647 catac 23527651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22232863 - 22232609
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||    
T  22232863 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctcta-caatactcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaat 22232765  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
     |||| | |||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||     
T  22232764 ggttatagcattca-tttcaggacataagtctttaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggca 22232666  T
Q  217 gaagctctcccactgt-tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
      ||| ||||| || | |||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22232665 agagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22232609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 34828977 - 34829232
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  34828977 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccggagccctcaccgttatagaat 34829074  T
Q  118 cgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagag 214  Q
     |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  34829075 ggttaaagcattctttttatcaggacatgagtcctcaccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagga 34829173  T
Q  215 ccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |  ||| || || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  34829174 ccgaggtcctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 34829232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38145980 - 38145787
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  38145980 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcaccgttatagaat 38145883  T
Q  118 cgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
     |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38145882 ggttaaagcattctttttatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 38145787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28371653 - 28371398
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  28371653 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcaccgttatagaat 28371556  T
Q  118 cgttaaaacattcatttt---caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaga 213  Q
     |||||| ||||| ||||   |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28371555 ggttaaagcattcttttttatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagg 28371458  T
Q  214 gccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     |||| |  ||| ||| | ||||| |||||| || | ||| |||| ||||||||||||||    
T  28371457 accgaggtcctcaccatttttatgcttatgcaacgactccacttgtgtatatctacatac 28371398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 42960031 - 42960224
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  42960031 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagagccgaagccctcaccgttatagaat 42960128  T
Q  118 cgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
     |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42960129 ggttaaagcattctttttatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccag 42960224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 154
Target Start/End: Original strand, 19362597 - 19362678
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19362597 catgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 19362678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19802044 - 19801964
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19802044 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 19801964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24751707 - 24751645
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24751707 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 24751645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24669169 - 24669107
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24669169 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 24669107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24738938 - 24738876
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24738938 atgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 24738876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27636054 - 27635972
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27636054 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 27635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23081898 - 23081837
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  23081898 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 23081837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 25419820 - 25419881
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  25419820 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 25419881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 132
Target Start/End: Original strand, 15461420 - 15461481
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  15461420 catgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 15461481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18941372 - 18941296
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctc 151  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   |||||||||||| ||||    
T  18941372 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagccctc 18941296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 597223 - 597283
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  597223 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 597283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1111838 - 1111778
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  1111838 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 1111778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5341877 - 5341817
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  5341877 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 5341817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 5454438 - 5454498
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  5454438 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 5454498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5582437 - 5582377
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  5582437 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 5582377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 10686094 - 10686154
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  10686094 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 10686154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 11995086 - 11995146
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  11995086 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 11995146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17939044 - 17938984
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  17939044 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 17938984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19800500 - 19800440
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  19800500 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 19800440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 20990301 - 20990361
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  20990301 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 20990361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 25846293 - 25846353
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  25846293 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 25846353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 25852925 - 25852985
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  25852925 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 25852985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 30781014 - 30781074
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  30781014 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 30781074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 38013683 - 38013743
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  38013683 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 38013743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40011132 - 40011072
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  40011132 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 40011072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41878163 - 41878103
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  41878163 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 41878103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23076450 - 23076389
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||    
T  23076450 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcat 23076389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23545020 - 23544959
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  23545020 atgcatgcggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 23544959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7773806 - 7773747
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  7773806 atgcatgtggtaccaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 7773747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18409061 - 18408973
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| || || || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  18409061 caccgctttgaacgacaaggcgttctagggccaaagcccttccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 18408973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 132
Target Start/End: Original strand, 19508115 - 19508172
Alignment:
Q  73 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  19508115 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 19508172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 63424 - 63169
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63424 tcaacgacacatgccactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 63325  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  63324 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttccagagc 63226  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  63225 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 63169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 124698 - 124446
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  124698 cgactcatgcaacacacaaccactccactaagactcctcta-caatactcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatg 124600  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  124599 gttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaggtcaga 124500  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | || ||||  |||||||||||||    
T  124499 agccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtttatatctacatac 124446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12876
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||   |||| ||||    
T  13054 atgcatgtggtaccataatcaggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-ttatcaggacctaagtcctcaccgctctacaccgcttt 12956  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa 249  Q
    || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  12955 gaacaacttgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaactaa 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 323
Target Start/End: Original strand, 141272 - 141577
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  141272 tcaacgactcatgcaactcatctccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccgctgtaga 141371  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141372 atggttaaagcattca-tttcaggacgtaagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 141469  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  | |||||||| |||||| |||     
T  141470 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgt-atatatgactcaccactcca 141568  T
Q  315 atttacaac 323  Q
    |||||||||    
T  141569 atttacaac 141577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Original strand, 146565 - 146740
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  146565 catgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaaaaccact 146664  T
Q  168 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  146665 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagacgaagctctcccacttttatgattatgc 146740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 152307 - 152562
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  152307 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacaaccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaacactgtaga 152406  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152407 atggttaaagcaatcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 152505  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  152506 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 152562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 197667 - 197413
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  197667 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 197569  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||     
T  197568 gttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggcca 197469  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     ||| |||||||| || || |||||| ||| | ||| |||| |||||||| |||||    
T  197468 gagccctcccacttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcttcatac 197413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 174738 - 174578
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  174738 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 174640  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174639 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 174578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 258491 - 258696
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  258491 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 258590  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  258591 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaggagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 258690  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  258691 acatac 258696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Original strand, 252007 - 252090
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  252007 ctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 252090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 265046 - 265311
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  265046 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtaga 265145  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  265146 atggttaaagcattca-tttcatgacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 265243  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  265244 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaaccta 265311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 258620 - 258885
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  258620 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtaga 258719  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  258720 atggttaaagcattca-tttcatgacatatgtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 258817  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  258818 cgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaaccta 258885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6006
Alignment:
Q  28 gcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaaca 127  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6250 gcaactcatcaccattccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 6151  T
Q  128 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 6051  T
Q  228 actgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| ||||| |||||  ||||| || |||  ||||||||||||||    
T  6050 acttttatgcttatgtaactaacccacttatgtatatctacatac 6006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 291
Target Start/End: Original strand, 13954 - 14228
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13954 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactccgctaacaacacccatgcatgtggtatcgaaatcaggaccgtagccctcacctcggtaga 14053  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14054 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcgccactaa-caccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagc 14152  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 291  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  14153 cgaagctctcccacttctatgtttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaacctaacctatacatata 14228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 291
Target Start/End: Original strand, 24155 - 24429
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24155 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactccgctaacaacacccatgcatctggtaccataatcaggaccgtagccctcacctctgtaga 24254  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagc 215  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24255 atggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcgccactaa-caccactttgaggaatgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagc 24353  T
Q  216 cgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 291  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||| | | |||||| |||||||    
T  24354 cgaagctcttccacttctatgcttatgcaactaaccgccttgtgtatatccacatacaacctaacctatacatata 24429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51199 - 50948
Alignment:
Q  19 acgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51199 acgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatg 51100  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51099 gttaaagcattcgttttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttctagagccga 51001  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacata 271  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| | |  |||| |||||||||||||    
T  51000 agctctcccacttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 10288 - 10543
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaa 116  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10288 caacgactcatgcaaaacatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaa 10387  T
Q  117 tcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10388 tggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcactaaacatcactttgagcaaccagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtcccagagcc 10487  T
Q  217 gaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |  || | ||||||||||||||    
T  10488 gaagctctcccacttttatgattatgcaactgaccgactcgtgtatatctacatac 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15695 - 15512
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15695 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 15596  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgac 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15595 atcgttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgac 15512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 2919 - 3123
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||    
T  2919 atgcatgtggtaccatgttcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcatcaccgctaaacacctctt 3018  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  3019 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatcta 3118  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  3119 catac 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1905 - 1761
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  | | ||    
T  1905 catgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca-tttcaagacataagtcctcaccgctaaaaagcgct 1807  T
Q  168 ttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1806 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttccag 1761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47644 - 47376
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacaccca-tgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtag 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  47644 tcaacgactcatgccactcaacaccacctcactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcg 47545  T
Q  115 aatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagag 214  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47544 aatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagag 47445  T
Q  215 ccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47444 ccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 47376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 63064 - 62796
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacaccca-tgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtag 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  63064 tcaacgactcatgccactcaacaccacctcactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcg 62965  T
Q  115 aatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagag 214  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62964 aatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagag 62865  T
Q  215 ccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  62864 ccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 62796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 56678 - 56410
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacaccca-tgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtag 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  56678 tcaacgactcatgccactcaacaccacctcactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcg 56579  T
Q  115 aatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagag 214  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56578 aatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagag 56479  T
Q  215 ccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  56478 ccgaatctctcccacttttatgcttatgcaactgaccctcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 56410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 5095 - 5350
Alignment:
Q  17 caacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaa 116  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  5095 caacgactcatgcgacacatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataattagggccaaagccctcaccgctgtagaa 5194  T
Q  117 tcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5195 tggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagcc 5294  T
Q  217 gaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5295 gaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14779 - 14536
Alignment:
Q  38 actactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14779 actactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtatcatattcaggaccgtagccatcatcgctgtagaatggttaaaacattcattt-ca 14681  T
Q  138 ggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgt 237  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  14680 ggacataagtcctcaccactaa-caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactgttatgc 14582  T
Q  238 ttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 283  Q
    |||| | ||| |  | |||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  14581 ttattcaactgactcacttatgtatatctacatacaacccaaccta 14536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 281
Target Start/End: Original strand, 17426 - 17688
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaa-caacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||     
T  17426 cgactcatgcaacacaccaccactccactaagactcttctaatcaaccctcatgcatgtggtaccataatcggggccgaagccctcatcgctgtagaatg 17525  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526 gttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccga 17625  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 281  Q
    |||| |||| || ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  17626 agctttcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 17688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5235 - 4981
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaa-caacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatc 118  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  5235 cgactcatacaacacaccactactccactaagattcctctaatcaaccctcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatg 5136  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5135 gttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgctccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccg 5036  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5035 aagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 4981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 143
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  344 atgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 246  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  245 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 146  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  145 tac 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 3604 - 3725
Alignment:
Q  16 tcaacgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3604 tcaacgactcatgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtaga 3703  T
Q  116 atcgttaaaacattcattttca 137  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  3704 atggttaaagcattcattttca 3725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41793 - 41592
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  41793 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 41695  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  41694 gaacaactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 41595  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  41594 tac 41592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 310
Target Start/End: Original strand, 40566 - 40739
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40566 caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcattccagagccgaagctcttccactgttat 40663  T
Q  236 gttt-atgcgactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 310  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40664 gtttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcacca 40739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37045 - 36793
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaat 117  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| ||||||| || |  ||| ||||||||| ||||    
T  37045 gactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccatgacccacaccgctgtcgaat 36947  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
     |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36946 ggttaaagcattc-ttatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccg 36848  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  36847 aagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 36793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44062 - 43965
Alignment:
Q  178 agtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcga-ctaatccccttgagtatatctacatacca 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||| | | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  44062 agtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgctttaatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 43965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8580 - 8495
Alignment:
Q  26 atgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgt 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  8580 atgcaacttatcaccactccactaagactcctcta--aacccccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44192 - 44054
Alignment:
Q  73 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttga 171  Q
    |||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  44192 catgtggtaccatattcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttt-aggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttga 44094  T
Q  172 gcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
     ||||  |||| |||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  44093 -caacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaagtgttcca 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321266
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  321062 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 321161  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || || |||||| || || |||||||| |||||||||    
T  321162 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccatttttgtgcttatgcaacaaactccccttgtgtatatcta 321261  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  321262 catac 321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 326771 - 326975
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||| ||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  326771 atgcatgtggtaccataatcagggtcggagcgctcaccactaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 326870  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  326871 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccccttgtgtatatcta 326970  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  326971 catac 326975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Original strand, 115736 - 115908
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||| || | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  115736 atgcatgtggtaccatatttagggccggagccctcaccactatcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 115834  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    || ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  115835 gaacaacgggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggtcgaagccctcccgcttttatgcttatgc 115908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20662 - 20493
Alignment:
Q  104 caccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaa 202  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20662 caccactgtagaatgattaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcgttgagcaactagtactccaccgctttgaacgacaa 20563  T
Q  203 ggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  20562 ggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 156944 - 156797
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  156944 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacacctctt 156845  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    ||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  156844 tgaacaac--gtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccga 156797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4594
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  4795 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaattgttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4697  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||  |||||||||||    
T  4696 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 4597  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  4596 tac 4594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18393 - 18201
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  ||||||     
T  18393 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatactcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatg 18295  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18294 gctaaagcattcattt-caggacataggtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 18201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23975 - 23832
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  23975 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcattt-caggacataggtcctcaccgctaatcaccgctt 23877  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23876 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 23832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 27861 - 28065
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  27861 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 27960  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  27961 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatcta 28060  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  28061 catac 28065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51872 - 51676
Alignment:
Q  76 gtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaa 175  Q
    ||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||    
T  51872 gtggtaccataattagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgctaaacaccgctttgaacaa 51773  T
Q  176 ctagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  51772 ctactgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 51676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30322 - 30162
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  30322 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30224  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 30162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35723 - 35563
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  35723 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 35625  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35624 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 35563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 61 - 122
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  61 atgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat 122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 593 - 392
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||    
T  593 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcgctaaactccgcttt 495  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  494 gaacaactagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 395  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  394 tac 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6129 - 5877
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||     
T  6129 cgactcatgcaacacacaaccactccactaagactcctcta-caacactcatacatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatg 6031  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccga 218  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  6030 gttaaagaattcattttcaggacataagtcctcatcgctaa-caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacggcaaggcgttccagggccgg 5932  T
Q  219 agctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| |||||||| |||||    
T  5931 agccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatcttcatac 5877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4275
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| || |    
T  4476 atgcatgcggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctgt 4378  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  4377 gaacaattagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaatccacttgtgtatatctaca 4278  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  4277 tac 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17115 - 16914
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||  |||    
T  17115 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcattttcaggacataaggcctcaccgctaaactccgtttt 17017  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  17016 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 16917  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  16916 tac 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10435 - 10234
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  10435 atgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 10337  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| | || |||  |||||||||||    
T  10336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttatgtatatctaca 10237  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  10236 tac 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 71145 - 71291
Alignment:
Q  126 cattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71145 cattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc 71244  T
Q  226 ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    || || ||||| |||||| ||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  71245 ccgcttttatgcttatgcaactgacacacttgtgtatatctacatac 71291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15633 - 15432
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  15633 atgcatgtggtaccttattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 15535  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15534 gaacaactagtgttccaccgctttgaatgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttgtgcaactaacccccttgtgtatatctaca 15435  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  15434 tac 15432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29913
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  29748 atgcatgtggtaccataatcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccacttt 29846  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 236  Q
    || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29847 gaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccaaagctctcccacttttatg 29913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18579 - 18519
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  18579 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 18519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8615
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttc-aggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||    
T  8410 atgcatgtggtaccataatcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagct 8509  T
Q  168 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || | |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  8510 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatct 8609  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  8610 acatac 8615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 7249 - 7451
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||| || ||  | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||    
T  7249 atgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctc-ccactaattgaatggttaaagcattcattttcaggatataagtccttaccactaaacaccgctt 7347  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctac 268  Q
    |||  | |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||    
T  7348 tgaatatctagtgttccaccgctatgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 7447  T
Q  269 atac 272  Q
    ||||    
T  7448 atac 7451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13642 - 13465
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||     
T  13642 cgactcatgcaacccacaaccgctccactaagactcttcta-caacactcatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatg 13544  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaac 197  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||| |||||| ||||||||    
T  13543 gttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaacatgtgttccaccgctttgaac 13465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 10199 - 10400
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||  ||| | ||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  10199 atgcttgtggtaccatattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 10297  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctaca 269  Q
    || ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| |||    
T  10298 gaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcgactaacccatttgtgtatatccaca 10397  T
Q  270 tac 272  Q
    |||    
T  10398 tac 10400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Original strand, 38401 - 38561
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  38401 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 38499  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 38561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46985 - 46732
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||  | ||||     
T  46985 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaacgctaattgaatg 46887  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  46886 gttaaaacattcattt-cagaaaataagtcctcaccgctaatcaccgatttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagcca 46788  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  46787 tagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 46732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51258 - 51005
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||  | ||||     
T  51258 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaacgctaattgaatg 51160  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  51159 gttaaaacattcattt-cagaaaataagtcctcaccgctaatcaccgatttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagcca 51061  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  51060 tagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 51005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27781
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| |||  |||||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  27945 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttataggacataagtcctcatcgctaa-caccgctt 27847  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtta 234  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27846 tgaacaactcgtgttccaccactttgaacgacaagccgttccagagccgaagctctcccgctgtta 27781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47156 - 46996
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  47156 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 47058  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47057 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 46996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52561 - 52401
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  52561 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 52463  T
Q  170 -gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52462 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 52401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 103105 - 102933
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  || | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  103105 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcacttctttcgaatggttaaagcattc-ttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 103007  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 243  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  103006 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaactcgttccagggccgaagctctcccgcttttatgcttatgc 102933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 2376
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  2516 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatagttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctt 2417  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttc 209  Q
    ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2416 tgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttc 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17272 - 17139
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||          |    
T  17272 atgcatgttgtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcattttcaagagataagtcctcaccgct----------t 17183  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17182 tgaacaacaagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccag 17139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 2566 - 2743
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccacttt 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||    
T  2566 atgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 2664  T
Q  170 gagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  2665 gaacaactggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactttgatgcttatgcaacta 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17114 - 16866
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  17114 cgactcatgcaacactccacaactccactaagactcctcta-------caatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatg 17022  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  17021 gttaaaacattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcca 16922  T
Q  218 aagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16921 gagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 16866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 320 - 524
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  320 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 419  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||  |||||| ||| | || |||| |||||||||    
T  420 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 519  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  520 catac 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17580 - 17376
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  17580 atgcatgtggtaccatattcagggccgaaaccctcaccgctgatcgaatggttaaaacattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctt 17481  T
Q  169 tgagcaactag-tgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    ||| |||| |  || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||  ||| | || |||| |||||||||    
T  17480 tgaacaacaaaatgttccacagctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgtaactgacccacttgtgtatatcta 17381  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  17380 catac 17376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10284 - 10080
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||    
T  10284 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcttcaccgctaaacaccgctt 10185  T
Q  169 tgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatcta 267  Q
    | | |||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||    
T  10184 ttaacaacaaagtgttccacatctttgaacgacaaggcgttccagggctgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 10085  T
Q  268 catac 272  Q
    |||||    
T  10084 catac 10080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 72229 - 72432
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  72229 atgcatgtggtaccata-tcaaggccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaat-accgctt 72326  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatct 266  Q
    ||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| || ||| || || ||||| |||||  ||||| || |||| ||||||||    
T  72327 tgaacaacatagtgttccaccgctttaaacgacaaggcgttccaggaccgaggccctcaccgcttttatgcttatgaaactaacccacttgtgtatatct 72426  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  72427 acatac 72432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 746 - 614
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  746 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgcacatgcatatggtaccgtaatcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 648  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  647 gttaaagcattca--ttcaggacataagtcctcacc 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6905 - 6773
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  6905 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgcacatgcatatggtaccgtaatcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 6807  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6806 gttaaagcattca--ttcaggacataagtcctcacc 6773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Original strand, 1 - 87
Alignment:
Q  163 ccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  1 ccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaagcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16250 - 16021
Alignment:
Q  45 cactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacat 143  Q
    ||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16250 cactaagactcctctacaaatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctattcgaatgcttaaagcattc-ttttcaggacat 16152  T
Q  144 aagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 242  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  || || || |||||    
T  16151 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcctgcttttgtgcttatg 16052  T
Q  243 cgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    | ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16051 caactgactccacttgtgtatatctacatac 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8233 - 8001
Alignment:
Q  42 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagga 140  Q
    |||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||| | ||||| | | ||| |||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  8233 ctccactaagactcctctacaaatgctcatgcatgtggtaccatattcagggcaggagctctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttt-agga 8135  T
Q  141 cataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttt 239  Q
    ||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| || || |  ||    
T  8134 catgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagggccggagccctcccgcttttgtcctt 8035  T
Q  240 atgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  8034 atgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 8001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 95798 - 96051
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | ||||| | | | |||||||||||  |  |||    
T  95798 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcacatgcatgtggtaccatattcagggcagaaaccctcaccgctaattaaat 95896  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 216  Q
     |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  95897 ggttaaagcattcatt--caggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcaagggcc 95994  T
Q  217 gaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
     |||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  95995 aaagccctcccacttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 96051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 174673 - 174561
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  174673 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttttaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgat 174574  T
Q  236 gtttatgcgacta 248  Q
    |||||||| ||||    
T  174573 gtttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 248
Target Start/End: Original strand, 489193 - 489304
Alignment:
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttat 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  489193 caggacctaagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgat 489291  T
Q  236 gtttatgcgacta 248  Q
    |||||||| ||||    
T  489292 gtttatgcaacta 489304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 494165 - 493992
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaa---cacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt-- 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||      
T  494165 actccactaagactcctc-aacaaatgcaactatgcatgtggtaccata-tcagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttttat 494068  T
Q  136 caggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  494067 caggacatgagtcctc-ccattaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 493992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 154
Target Start/End: Original strand, 179002 - 179083
Alignment:
Q  69 catgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  179002 catgcatgtggtaccaaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 179083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 171990 - 171785
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccac-t 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |    
T  171990 atgcatgtggtaccataatcagggctggagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 171891  T
Q  168 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatct 266  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| ||||  |||||||    
T  171890 ttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtttatatct 171791  T
Q  267 acatac 272  Q
    ||||||    
T  171790 acatac 171785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 110758 - 110935
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| ||   |||| | |    
T  110758 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcat 110856  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgacta 248  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  110857 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 110935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9809 - 9649
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaat-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||| |||||    | ||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  9809 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaat-aggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 9711  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9710 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 9649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44322 - 44152
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||| || |    
T  44322 actccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattt-caag 44225  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    ||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44224 acataagtcgtcattgctaaacaccactttgaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttcca 44152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49388 - 49218
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||| || |    
T  49388 actccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattt-caag 49291  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    ||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49290 acataagtcgtcattgctaaacaccactttgaacaacaaagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttcca 49218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Original strand, 34776 - 34979
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcatttt-caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  34776 atgcatgtggtaccatattcagggcgg-agccctcaccactaatagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 34874  T
Q  168 ttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatc 265  Q
    |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| |||||||    
T  34875 ttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatc 34974  T
Q  266 tacat 270  Q
    |||||    
T  34975 tacat 34979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Original strand, 6911 - 7081
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||  ||||    
T  6911 actccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatgttcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatt--cagg 7007  T
Q  140 acataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7008 acataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 7081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Original strand, 63 - 132
Alignment:
Q  161 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 230  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63 caccgctttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 78601 - 78532
Alignment:
Q  21 gactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatca 90  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  78601 gactcacgcaactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatca 78532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52814 - 52670
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||    
T  52814 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgggtcctcaccgctaaacaccgctt 52715  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52714 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 52670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7986 - 7843
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    |||||| |||||||| | || || ||| ||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  7986 atgcatatggtaccatattctgggccggagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcattt-caggacataagtcctcaccgctaaacaccgctt 7888  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7887 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 7843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14974 - 14832
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |  |||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||    
T  14974 atgcatgtggtaccata-tcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattctttatatcaggacatgagtcctc-ccattaa-caccgct 14878  T
Q  168 ttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccag 212  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14877 ttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 14832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1258 - 1116
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1258 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttt-aggacataagtcctcaccgctaaacaccactt 1160  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  1159 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaagtgttcca 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8194 - 8052
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8194 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttt-aggacataagtcctcaccgctaaacaccactt 8096  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  8095 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacaacaaagtgttcca 8052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1124 - 1027
Alignment:
Q  178 agtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcga-ctaatccccttgagtatatctacatacca 274  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| | | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  1124 agtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8060 - 7963
Alignment:
Q  178 agtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcga-ctaatccccttgagtatatctacatacca 274  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| | | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  8060 agtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 272
Target Start/End: Original strand, 55939 - 56065
Alignment:
Q  148 cctcaccactaagcaccactttgagcaacta-gtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgac 246  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||| ||    
T  55939 cctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgtttatgcaac 56038  T
Q  247 taa-tccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  56039 taactccacttgtgtatatctacatac 56065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 272
Target Start/End: Original strand, 865 - 1041
Alignment:
Q  98 agccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattt-tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttga 195  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  865 agccctccctgctatagaatggttaaagcattcttttatcaagacatgcgtcctcaccactaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttga 963  T
Q  196 acgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||| || || ||||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  964 acgacaaggcgttccaggaccgaggcactcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 624 - 684
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  624 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Original strand, 2038 - 2181
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2038 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttt-aggacataagtcctcaccgctaaacaccactt 2136  T
Q  169 tgagcaac--tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttcca 211  Q
    ||| ||||  ||||| |||||| || ||||| |||| | ||||||    
T  2137 tgaacaacaatagtgttccaccgctgtgaacaacaaagtgttcca 2181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Original strand, 20754 - 20906
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgc-tgtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||   ||||||     
T  20754 cgactcatgcaacactcgacaactccactaagaatcctctaa-accgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgcaaatagaatg 20852  T
Q  119 gttaaaacattca-ttttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttga 171  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  20853 gttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcatcgctaaacaccgctttga 20906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 5464 - 5596
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  5464 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatactcatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatt 5562  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  5563 gttaaagcattca--ttcaggacataggtcctcacc 5596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Original strand, 5638 - 5750
Alignment:
Q  161 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgag 259  Q
    |||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| |    
T  5638 caccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtg 5737  T
Q  260 tatatctacatac 272  Q
    |||||||||||||    
T  5738 tatatctacatac 5750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12054 - 11916
Alignment:
Q  135 tcaggacataagtcctcaccactaagcaccactttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgt 232  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || || |    
T  12054 tcaggacatgagtcctcaccgctaa-caccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaggccctcaccgcttt 11956  T
Q  233 tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |||||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11955 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 11916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24680 - 24476
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcatttt--caggacataagtcctcaccactaagcaccact 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||| | | |||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||| ||    
T  24680 atgcatgtggtaccata-tcagggccggagcccgcactgttatagaatggttaaagcattctttttatcaggacatgagtcctcaccgttaa-caccgct 24583  T
Q  168 ttgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatc 265  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| || ||| || || ||||| |||||| ||| | || |||| |||||||    
T  24582 ttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaagtcgttccaggaccgaggccctcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatc 24483  T
Q  266 tacatac 272  Q
    |||||||    
T  24482 tacatac 24476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0377
Description:

Target: scaffold0377; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Original strand, 7253 - 7343
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgta-gaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaa 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  7253 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatacgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgctaa 7343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Original strand, 7344 - 7432
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt-tatgtttatgcgactaatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||  | || |||| ||||||||||||||    
T  7344 caccgctttgaacgacagggcgttccagagccgaagctctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatac 7432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Original strand, 44200 - 44395
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||          |||| |||    
T  44200 atgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcct----------caccgctt 44289  T
Q  169 tgagcaac-tagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaa-tccccttgagtatatct 266  Q
    ||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || || || |||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  44290 tgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaggaccgaagccatcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatct 44389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Original strand, 16892 - 16981
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct 110  Q
    ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||    
T  16892 cgactcatgcaacacacaatcactccactaagactcctcta-caacactcatgcatgtggtaccataatcagagccgaagccctcaccgct 16981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 272
Target Start/End: Original strand, 16989 - 17095
Alignment:
Q  166 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgactaatccccttgagtatatc 265  Q
    |||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||| | || ||||  ||||||    
T  16989 ctttgaacaacatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagcgccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatc 17088  T
Q  266 tacatac 272  Q
    |||||||    
T  17089 tacatac 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 370386 - 370483
Alignment:
Q  60 aacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccact 157  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  370386 aacaactcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca-tttcaggacataagtcctcaccact 370483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 57460 - 57323
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | ||||    
T  57460 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcacatggatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaat 57362  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccacta 158  Q
     |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  57361 ggttaaagcattcatt--caggacataagtcctcaccacta 57323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 57245 - 57157
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  57245 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 57157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 141173 - 141310
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatca-ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaat 117  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||| | |||||  || |||||||||||||  | ||||    
T  141173 cgactcatgcaactactcaacgactccactaagactcctc-aacaatgcacatggatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaat 141271  T
Q  118 cgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccacta 158  Q
     |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  141272 ggttaaagcattcatt--caggacataagtcctcaccacta 141310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Original strand, 141388 - 141476
Alignment:
Q  185 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  141388 caccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 141476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16223 - 16140
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16223 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaacattca--ttcaggacataagtcctcacc 16140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 154
Target Start/End: Original strand, 6567 - 6676
Alignment:
Q  43 tccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggac 141  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  6567 tccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca--ttcaggac 6663  T
Q  142 ataagtcctcacc 154  Q
    ||||||| |||||    
T  6664 ataagtcttcacc 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Original strand, 6761 - 6844
Alignment:
Q  190 ctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  6761 ctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 6844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38794
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  38926 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 38828  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||    
T  38827 gttaaagcattc--gttcaggacataggtcctcacc 38794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 136986 - 136854
Alignment:
Q  20 cgactcatgcaactcatcactactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatc 118  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | ||||     
T  136986 cgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctcta-caatgctcatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatg 136888  T
Q  119 gttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||    
T  136887 gttaaagcattc--gttcaggacataggtcctcacc 136854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 104287 - 104347
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  104287 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 104347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Original strand, 1895 - 1983
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgct-gtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaa 159  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1895 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattca--ttcaggacataagtcctcaccgctaa 1983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 41231 - 41310
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  41231 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagccctcacc 41310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Original strand, 10002 - 10092
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaa 159  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10002 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaa 10092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 569 - 507
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  569 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccactgtagaatgattaaagcattcat 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 224 - 307
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  224 atgcatgtggtaccataatcaaggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 1
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatc-aggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaagcaccactt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||   || ||||||||| |||| |||||| |||| ||   |||||| |||||||||||| ||   |||| |||    
T  131 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgatccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt-atcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgctt 33  T
Q  169 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgac 200  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 13406 - 13466
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  13406 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 13466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 7713 - 7773
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  7713 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 7773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 15102 - 15162
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  15102 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 15162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 50001 - 50061
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  50001 atgcatgtggtaccaa--tcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 50061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 143962 - 144022
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcat 132  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  143962 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 144022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3392 - 3302
Alignment:
Q  183 tccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcgact-aatccccttgagtatatctacatac 272  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| || || || |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  3392 tccaccgctttgaacgacaaggtgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 3302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4566 - 4501
Alignment:
Q  41 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcacc 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  4566 actccactaagactcctcta-caatgcacatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcacc 4501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 247019 - 247099
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  247019 atgcatgtggtacgaaaa-caggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagccctcacc 247099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 253533 - 253613
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  253533 atgcatgtggtacgaaaa-caggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagccctcacc 253613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31752 - 31669
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg--tagaatcgttaaaacattcattttcaggacataagtcctcacc 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||  | |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31752 atgcatgtggtaccataatcagggccaaagcactcaccgctgttttgaatggttaaagcattca---tcaggacataagtcctcacc 31669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 26091 - 26155
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcatt 133  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  26091 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatt 26155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 27473 - 27537
Alignment:
Q  70 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctg-tagaatcgttaaaacattcatt 133  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  27473 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatt 27537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University