View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16891_low_3 (Length: 358)

Name: NF16891_low_3
Description: NF16891
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16891_low_3
NF16891_low_3
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (10-358)||(12497799-12498147)
chr3 (10-358)||(14876730-14877078)
chr3 (10-358)||(16370964-16371312)
chr3 (10-358)||(17489401-17489749)
chr3 (10-358)||(9522270-9522618)
chr3 (10-358)||(16492412-16492760)
chr3 (10-358)||(16807157-16807505)
chr3 (10-358)||(16691711-16692059)
chr3 (22-358)||(10905773-10906109)
chr3 (10-358)||(15348476-15348824)
chr3 (22-358)||(10005163-10005499)
chr3 (22-358)||(48425010-48425346)
chr3 (22-358)||(13252253-13252589)
chr3 (22-358)||(15589623-15589959)
chr3 (10-358)||(15725165-15725512)
chr3 (22-358)||(16635336-16635672)
chr3 (22-358)||(43162660-43162996)
chr3 (10-358)||(15402741-15403089)
chr3 (22-358)||(20062285-20062621)
chr3 (10-358)||(53385249-53385597)
chr3 (10-344)||(15208442-15208776)
chr3 (17-358)||(26792630-26792971)
chr3 (10-358)||(5425161-5425508)
chr3 (10-358)||(15338820-15339168)
chr3 (10-358)||(16412513-16412861)
chr3 (10-358)||(6600298-6600646)
chr3 (10-358)||(16756816-16757164)
chr3 (37-344)||(15247725-15248032)
chr3 (28-318)||(15227228-15227518)
chr3 (37-312)||(13972386-13972661)
chr3 (11-314)||(47123506-47123809)
chr3 (46-346)||(15953200-15953500)
chr3 (11-314)||(10383531-10383834)
chr3 (28-346)||(13322884-13323202)
chr3 (28-318)||(18134606-18134896)
chr3 (10-314)||(14571409-14571713)
chr3 (25-314)||(16329923-16330212)
chr3 (149-317)||(15016016-15016184)
chr3 (10-327)||(10420296-10420613)
chr3 (46-353)||(8759307-8759614)
chr3 (46-353)||(13941621-13941928)
chr3 (46-353)||(41177119-41177426)
chr3 (76-314)||(12850543-12850781)
chr3 (37-312)||(14086261-14086536)
chr3 (10-314)||(11304037-11304341)
chr3 (28-314)||(12360806-12361092)
chr3 (25-299)||(11961313-11961587)
chr3 (169-331)||(8274657-8274819)
chr3 (147-314)||(16836774-16836941)
chr3 (10-353)||(44776808-44777151)
chr3 (169-331)||(13975303-13975465)
chr3 (46-318)||(16381190-16381459)
chr3 (169-331)||(16742961-16743123)
chr3 (10-152)||(31689049-31689191)
chr3 (247-331)||(17192892-17192976)
chr3 (10-154)||(31945033-31945177)
chr3 (169-331)||(15576470-15576632)
chr3 (185-346)||(18748401-18748562)
chr3 (270-331)||(6712667-6712728)
chr3 (169-287)||(6153141-6153259)
chr3 (7-63)||(320781-320836)
chr3 (185-287)||(21686681-21686783)
chr3 (10-71)||(12854365-12854426)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (10-358)||(24675052-24675400)
chr2 (10-358)||(22756995-22757343)
chr2 (10-358)||(21325798-21326146)
chr2 (10-356)||(24708016-24708362)
chr2 (10-358)||(23188571-23188919)
chr2 (10-321)||(23138600-23138911)
chr2 (10-321)||(23550390-23550701)
chr2 (34-344)||(23063664-23063974)
chr2 (22-358)||(16924835-16925171)
chr2 (22-358)||(16998575-16998911)
chr2 (16-358)||(21145562-21145904)
chr2 (22-358)||(16981727-16982063)
chr2 (22-358)||(17063292-17063628)
chr2 (10-358)||(24709596-24709944)
chr2 (10-358)||(44386101-44386449)
chr2 (22-358)||(9609711-9610047)
chr2 (10-358)||(22325388-22325736)
chr2 (10-358)||(24261933-24262281)
chr2 (10-358)||(24878527-24878875)
chr2 (10-358)||(27370832-27371180)
chr2 (22-358)||(27217591-27217927)
chr2 (10-260)||(27377101-27377351)
chr2 (22-358)||(10868425-10868761)
chr2 (22-358)||(17066953-17067286)
chr2 (10-318)||(23087013-23087321)
chr2 (112-356)||(24825816-24826060)
chr2 (25-346)||(30211461-30211782)
chr2 (37-313)||(27365656-27365932)
chr2 (11-314)||(31830222-31830525)
chr2 (30-356)||(45529100-45529420)
chr2 (25-314)||(11358450-11358739)
chr2 (11-314)||(20832549-20832852)
chr2 (28-314)||(23293539-23293825)
chr2 (10-187)||(41609047-41609224)
chr2 (10-318)||(23276339-23276647)
chr2 (46-318)||(27787340-27787612)
chr2 (11-314)||(1063315-1063618)
chr2 (48-287)||(24653946-24654185)
chr2 (187-346)||(25128387-25128546)
chr2 (46-353)||(12573952-12574259)
chr2 (169-331)||(22276001-22276163)
chr2 (25-103)||(24833360-24833438)
chr2 (46-211)||(24944966-24945131)
chr2 (270-331)||(27368391-27368452)
chr2 (169-331)||(12640478-12640640)
chr2 (185-331)||(24570227-24570373)
chr2 (10-54)||(45676685-45676729)
chr2 (247-346)||(23817597-23817696)
chr2 (185-331)||(22762128-22762274)
chr2 (169-331)||(24831746-24831908)
chr2 (10-53)||(23599834-23599877)
chr2 (268-331)||(14708908-14708971)
chr2 (31-71)||(17967577-17967617)
chr2 (185-233)||(23817750-23817798)
chr2 (185-233)||(28144701-28144749)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (10-358)||(23573606-23573954)
chr5 (10-358)||(23516405-23516753)
chr5 (10-358)||(23440089-23440437)
chr5 (10-358)||(18775641-18775989)
chr5 (45-358)||(20798659-20798972)
chr5 (10-358)||(21984479-21984827)
chr5 (10-358)||(25423053-25423401)
chr5 (24-344)||(26738893-26739213)
chr5 (10-358)||(14999913-15000261)
chr5 (10-358)||(22333061-22333409)
chr5 (10-358)||(22134532-22134880)
chr5 (10-358)||(19769824-19770172)
chr5 (10-358)||(27610218-27610566)
chr5 (22-358)||(40708656-40708992)
chr5 (10-358)||(41770706-41771054)
chr5 (10-358)||(27668664-27669012)
chr5 (10-358)||(27685574-27685922)
chr5 (22-358)||(34566370-34566706)
chr5 (10-344)||(23471093-23471427)
chr5 (22-358)||(16356378-16356714)
chr5 (10-358)||(27518271-27518619)
chr5 (10-358)||(37291670-37292018)
chr5 (10-358)||(29476247-29476595)
chr5 (35-358)||(22348314-22348635)
chr5 (10-353)||(20468275-20468618)
chr5 (22-224)||(21343666-21343868)
chr5 (89-358)||(21498210-21498479)
chr5 (10-251)||(20573385-20573626)
chr5 (37-346)||(23442479-23442788)
chr5 (47-318)||(21564180-21564451)
chr5 (28-346)||(21890945-21891263)
chr5 (28-344)||(22461816-22462132)
chr5 (10-318)||(28923982-28924290)
chr5 (11-314)||(25847922-25848225)
chr5 (10-318)||(28895156-28895464)
chr5 (11-314)||(14887209-14887512)
chr5 (28-313)||(24735830-24736115)
chr5 (28-313)||(24749773-24750058)
chr5 (10-346)||(20773606-20773942)
chr5 (11-314)||(37545714-37546018)
chr5 (7-318)||(22236134-22236445)
chr5 (11-314)||(20342129-20342432)
chr5 (28-299)||(24737018-24737289)
chr5 (25-314)||(22381060-22381349)
chr5 (25-314)||(24798615-24798904)
chr5 (10-272)||(21662300-21662561)
chr5 (25-314)||(22502540-22502829)
chr5 (25-346)||(23080275-23080596)
chr5 (28-346)||(20821317-20821635)
chr5 (25-233)||(21404715-21404923)
chr5 (222-344)||(21339474-21339596)
chr5 (46-272)||(21665761-21665986)
chr5 (169-346)||(11210880-11211057)
chr5 (46-353)||(17269512-17269819)
chr5 (169-331)||(27011089-27011251)
chr5 (169-331)||(21937389-21937551)
chr5 (185-331)||(23503464-23503610)
chr5 (169-331)||(24581216-24581378)
chr5 (10-98)||(21625382-21625470)
chr5 (265-356)||(21404939-21405030)
chr5 (189-331)||(25244553-25244695)
chr5 (189-331)||(25308705-25308847)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (10-358)||(65369-65716)
scaffold0042 (10-218)||(39924-40132)
scaffold0042 (266-358)||(39814-39906)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (10-358)||(21166972-21167320)
chr8 (10-358)||(19977965-19978313)
chr8 (10-358)||(30313579-30313927)
chr8 (10-358)||(15533378-15533726)
chr8 (10-358)||(16408480-16408828)
chr8 (10-358)||(32600142-32600490)
chr8 (10-358)||(22164626-22164974)
chr8 (10-358)||(21250940-21251287)
chr8 (10-358)||(22133476-22133824)
chr8 (10-358)||(22046372-22046719)
chr8 (10-358)||(23650039-23650387)
chr8 (10-358)||(21394300-21394648)
chr8 (10-358)||(21788793-21789141)
chr8 (10-358)||(21922170-21922518)
chr8 (10-358)||(17674458-17674806)
chr8 (10-319)||(22032030-22032339)
chr8 (22-358)||(19112700-19113036)
chr8 (10-356)||(20018187-20018533)
chr8 (10-344)||(22987199-22987533)
chr8 (10-358)||(19485305-19485653)
chr8 (10-358)||(22120609-22120957)
chr8 (10-251)||(15441179-15441420)
chr8 (10-285)||(23948887-23949162)
chr8 (25-344)||(20396574-20396893)
chr8 (157-344)||(22377902-22378089)
chr8 (157-344)||(22384077-22384264)
chr8 (46-318)||(20388133-20388405)
chr8 (10-346)||(21681917-21682253)
chr8 (28-314)||(20010379-20010665)
chr8 (11-314)||(6679110-6679413)
chr8 (28-314)||(1266255-1266541)
chr8 (11-314)||(804152-804455)
chr8 (10-314)||(22061912-22062216)
chr8 (10-314)||(23654925-23655229)
chr8 (28-311)||(19851427-19851710)
chr8 (28-311)||(19857463-19857746)
chr8 (28-346)||(21324856-21325175)
chr8 (11-314)||(14565141-14565444)
chr8 (46-353)||(31571282-31571589)
chr8 (28-314)||(20007866-20008152)
chr8 (11-314)||(6603657-6603960)
chr8 (28-346)||(31416921-31417239)
chr8 (25-314)||(29303905-29304194)
chr8 (10-314)||(21840415-21840719)
chr8 (10-284)||(16265127-16265401)
chr8 (25-314)||(12304771-12305060)
chr8 (11-287)||(28982356-28982632)
chr8 (11-287)||(28987576-28987852)
chr8 (169-346)||(20652780-20652957)
chr8 (11-222)||(27347225-27347436)
chr8 (169-331)||(22982593-22982755)
chr8 (250-344)||(23949158-23949252)
chr8 (169-331)||(21196964-21197126)
chr8 (167-314)||(22051018-22051165)
chr8 (169-331)||(16877557-16877719)
chr8 (169-331)||(21850799-21850961)
chr8 (185-331)||(22315364-22315510)
chr8 (315-358)||(22040162-22040205)
chr8 (288-358)||(18856853-18856923)
chr8 (270-331)||(23157473-23157534)
chr8 (172-331)||(24818078-24818237)
chr8 (10-42)||(22179309-22179341)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (10-356)||(64028-64374)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (12-358)||(278825-279171)
scaffold0005 (10-344)||(164718-165052)
scaffold0005 (10-358)||(308622-308970)
scaffold0005 (10-314)||(260271-260575)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (10-358)||(16355177-16355525)
chr4 (10-358)||(16252177-16252525)
chr4 (10-358)||(12523608-12523956)
chr4 (43-356)||(15149740-15150053)
chr4 (10-358)||(7090365-7090712)
chr4 (10-358)||(14680499-14680847)
chr4 (10-358)||(18227178-18227526)
chr4 (10-344)||(14652240-14652574)
chr4 (10-358)||(14159424-14159772)
chr4 (22-358)||(23955691-23956027)
chr4 (22-358)||(18297149-18297485)
chr4 (10-358)||(19778525-19778873)
chr4 (22-358)||(8386356-8386692)
chr4 (10-358)||(14303710-14304057)
chr4 (10-358)||(27711268-27711616)
chr4 (10-344)||(14851112-14851446)
chr4 (22-358)||(12476544-12476880)
chr4 (22-358)||(29039136-29039472)
chr4 (10-358)||(40472972-40473320)
chr4 (10-358)||(14266631-14266979)
chr4 (10-356)||(8053357-8053703)
chr4 (22-275)||(15364330-15364583)
chr4 (10-198)||(14927151-14927339)
chr4 (28-346)||(15003368-15003686)
chr4 (11-314)||(3264830-3265133)
chr4 (11-314)||(11207267-11207570)
chr4 (28-314)||(16145862-16146148)
chr4 (215-358)||(16676435-16676578)
chr4 (11-314)||(29453573-29453876)
chr4 (25-314)||(15070360-15070649)
chr4 (25-314)||(33222865-33223154)
chr4 (10-314)||(15245856-15246160)
chr4 (178-317)||(15415059-15415198)
chr4 (28-314)||(1649313-1649599)
chr4 (25-314)||(20890930-20891218)
chr4 (25-314)||(44661902-44662191)
chr4 (46-353)||(51606178-51606485)
chr4 (10-97)||(18607823-18607910)
chr4 (222-358)||(1640157-1640293)
chr4 (169-331)||(13247736-13247898)
chr4 (139-314)||(15359126-15359301)
chr4 (171-331)||(55375377-55375537)
chr4 (185-331)||(12132428-12132574)
chr4 (169-331)||(14997407-14997569)
chr4 (46-211)||(42702871-42703036)
chr4 (147-355)||(9849473-9849681)
chr4 (151-346)||(27900459-27900654)
chr4 (169-331)||(16445231-16445393)
chr4 (65-207)||(18164332-18164474)
chr4 (150-314)||(16752665-16752829)
chr4 (169-331)||(9290926-9291088)
chr4 (169-331)||(15293176-15293338)
chr4 (28-103)||(15415226-15415301)
chr4 (10-42)||(15351934-15351966)
chr4 (178-358)||(18550052-18550234)
chr4 (253-314)||(8706093-8706154)
chr4 (28-81)||(15359326-15359379)
chr4 (185-346)||(16685361-16685522)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (10-358)||(19864483-19864831)
chr6 (12-358)||(12497824-12498170)
chr6 (12-358)||(12510731-12511077)
chr6 (10-358)||(25765427-25765774)
chr6 (10-358)||(16963504-16963852)
chr6 (12-358)||(12505153-12505499)
chr6 (10-358)||(25609998-25610346)
chr6 (10-358)||(16927777-16928125)
chr6 (10-344)||(27331584-27331918)
chr6 (10-344)||(27392324-27392658)
chr6 (10-298)||(21833178-21833466)
chr6 (16-358)||(1543221-1543563)
chr6 (10-344)||(23078265-23078599)
chr6 (10-358)||(5839356-5839704)
chr6 (10-358)||(18408080-18408428)
chr6 (10-358)||(22078825-22079173)
chr6 (10-358)||(16626854-16627202)
chr6 (10-358)||(24313305-24313653)
chr6 (10-358)||(28263334-28263682)
chr6 (10-358)||(28342083-28342431)
chr6 (22-358)||(29592057-29592393)
chr6 (10-353)||(25112348-25112691)
chr6 (10-358)||(2874940-2875288)
chr6 (10-358)||(27187232-27187580)
chr6 (10-358)||(27261660-27262008)
chr6 (10-331)||(22762619-22762940)
chr6 (10-358)||(28292509-28292857)
chr6 (10-234)||(17032358-17032582)
chr6 (36-346)||(18197696-18198006)
chr6 (25-314)||(21471412-21471701)
chr6 (10-299)||(25750605-25750894)
chr6 (46-314)||(25768023-25768291)
chr6 (10-145)||(22433793-22433928)
chr6 (28-346)||(15459150-15459468)
chr6 (37-313)||(14131361-14131637)
chr6 (25-314)||(10469030-10469319)
chr6 (10-314)||(22796813-22797117)
chr6 (25-314)||(24364223-24364512)
chr6 (64-311)||(34645770-34646017)
chr6 (28-313)||(18794504-18794789)
chr6 (28-313)||(19879112-19879397)
chr6 (37-313)||(21564314-21564590)
chr6 (220-320)||(11291818-11291918)
chr6 (28-346)||(8766297-8766615)
chr6 (157-318)||(1640715-1640876)
chr6 (46-317)||(27560795-27561066)
chr6 (272-358)||(22433927-22434013)
chr6 (39-311)||(11287782-11288054)
chr6 (93-314)||(17415365-17415586)
chr6 (39-311)||(11280689-11280961)
chr6 (168-292)||(25750900-25751024)
chr6 (169-331)||(25743251-25743413)
chr6 (169-331)||(16098005-16098167)
chr6 (139-346)||(18800867-18801074)
chr6 (46-353)||(28282955-28283262)
chr6 (169-331)||(16382537-16382699)
chr6 (185-331)||(18571622-18571768)
chr6 (169-331)||(23996203-23996365)
chr6 (121-346)||(14381616-14381841)
chr6 (187-331)||(25655456-25655600)
chr6 (185-331)||(1648948-1649094)
chr6 (169-331)||(18838072-18838234)
chr6 (28-103)||(1640613-1640688)
chr6 (169-331)||(15078528-15078690)
chr6 (28-94)||(18787702-18787768)
chr6 (185-331)||(21413102-21413248)
chr6 (172-331)||(16233167-16233326)
chr6 (271-331)||(26276987-26277048)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (10-358)||(14323-14671)
scaffold0044 (10-358)||(583-931)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (10-358)||(5977-6325)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (10-356)||(17319-17665)
chr7 (10-358)||(15154653-15155001)
chr7 (10-358)||(11553103-11553451)
chr7 (10-346)||(12687422-12687758)
chr7 (10-358)||(14954541-14954889)
chr7 (10-344)||(14037728-14038062)
chr7 (10-344)||(14347758-14348092)
chr7 (10-356)||(14332318-14332664)
chr7 (22-358)||(8198561-8198897)
chr7 (10-358)||(8707526-8707874)
chr7 (10-358)||(10870916-10871264)
chr7 (10-358)||(15161058-15161406)
chr7 (10-358)||(11237214-11237562)
chr7 (10-358)||(18551759-18552107)
chr7 (10-358)||(23516770-23517118)
chr7 (10-358)||(18177663-18178011)
chr7 (10-358)||(13685984-13686333)
chr7 (22-358)||(44791352-44791688)
chr7 (10-355)||(15203800-15204145)
chr7 (76-344)||(15624539-15624807)
chr7 (28-319)||(12206818-12207109)
chr7 (28-314)||(19147151-19147437)
chr7 (28-314)||(20746550-20746836)
chr7 (10-346)||(15102592-15102928)
chr7 (28-314)||(8212151-8212437)
chr7 (10-314)||(14264267-14264571)
chr7 (11-314)||(11306286-11306589)
chr7 (11-314)||(49152224-49152527)
chr7 (28-314)||(16072317-16072603)
chr7 (28-313)||(11388452-11388736)
chr7 (25-356)||(21661900-21662228)
chr7 (28-344)||(13665493-13665804)
chr7 (46-346)||(16950462-16950762)
chr7 (46-353)||(18053937-18054244)
chr7 (46-317)||(23199763-23200034)
chr7 (46-317)||(23505890-23506161)
chr7 (193-344)||(35964865-35965016)
chr7 (7-346)||(6413430-6413769)
chr7 (25-314)||(13021294-13021583)
chr7 (46-314)||(14286399-14286667)
chr7 (268-358)||(9596236-9596326)
chr7 (185-331)||(14936443-14936589)
chr7 (25-314)||(12455640-12455928)
chr7 (10-314)||(14129795-14130099)
chr7 (10-314)||(14433613-14433917)
chr7 (242-344)||(11772256-11772358)
chr7 (10-71)||(12254326-12254387)
chr7 (46-314)||(1430-1698)
chr7 (46-314)||(26288060-26288327)
chr7 (169-331)||(4440008-4440170)
chr7 (169-331)||(7823980-7824142)
chr7 (185-331)||(15364036-15364182)
chr7 (169-331)||(27107802-27107964)
chr7 (169-330)||(21674562-21674723)
chr7 (169-331)||(12368604-12368766)
chr7 (132-312)||(26118630-26118810)
chr7 (185-331)||(45146652-45146797)
chr7 (46-161)||(15340454-15340569)
chr7 (184-327)||(20466877-20467020)
chr7 (178-311)||(41194-41327)
chr7 (25-103)||(26118818-26118896)
chr7 (270-331)||(13378879-13378940)
chr7 (189-329)||(17145288-17145428)
chr7 (247-314)||(15340590-15340657)
chr7 (270-344)||(12193737-12193811)
chr7 (185-331)||(13353247-13353393)
chr7 (249-314)||(12456940-12457005)
chr7 (28-137)||(15479338-15479447)
chr7 (270-346)||(17923862-17923938)
chr7 (268-346)||(5764672-5764750)
chr7 (10-42)||(13634038-13634070)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (10-358)||(639-987)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (10-358)||(17045079-17045427)
chr1 (10-344)||(20249797-20250131)
chr1 (10-358)||(19106314-19106662)
chr1 (10-358)||(50620308-50620656)
chr1 (10-358)||(20136725-20137073)
chr1 (10-358)||(21747482-21747829)
chr1 (10-356)||(16350665-16351011)
chr1 (10-358)||(33391093-33391441)
chr1 (10-358)||(16078716-16079045)
chr1 (10-358)||(51333557-51333905)
chr1 (10-358)||(21830250-21830598)
chr1 (10-353)||(19760935-19761278)
chr1 (33-329)||(16369267-16369563)
chr1 (10-358)||(21836897-21837245)
chr1 (10-358)||(41354533-41354881)
chr1 (10-236)||(50612602-50612828)
chr1 (28-346)||(19664952-19665270)
chr1 (46-314)||(20940171-20940439)
chr1 (10-164)||(21163227-21163381)
chr1 (11-314)||(37677027-37677331)
chr1 (28-346)||(19854279-19854597)
chr1 (25-314)||(31550289-31550578)
chr1 (28-344)||(20856839-20857155)
chr1 (25-314)||(20294374-20294663)
chr1 (10-346)||(22433192-22433528)
chr1 (25-314)||(20075167-20075456)
chr1 (147-314)||(11382678-11382845)
chr1 (142-314)||(41307904-41308076)
chr1 (46-299)||(20244183-20244436)
chr1 (76-346)||(20835964-20836237)
chr1 (11-221)||(20395194-20395404)
chr1 (169-331)||(20831483-20831645)
chr1 (169-331)||(20914316-20914478)
chr1 (185-331)||(21202378-21202524)
chr1 (169-331)||(46518827-46518989)
chr1 (10-103)||(24476927-24477020)
chr1 (169-231)||(22142232-22142294)
chr1 (270-331)||(22135649-22135710)
chr1 (245-329)||(20184364-20184448)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (10-358)||(33568-33916)
scaffold0109 (10-358)||(8559-8907)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (10-356)||(180180-180526)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-344)||(127208-127542)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (10-344)||(219426-219760)
scaffold0012 (10-358)||(229006-229354)
scaffold0012 (169-331)||(33017-33179)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (10-358)||(4400-4748)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (10-358)||(818-1165)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (10-358)||(5986-6334)
scaffold0120 (46-314)||(1563-1831)
scaffold0120 (169-331)||(22816-22978)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (10-344)||(32761-33095)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (10-358)||(6335-6683)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (10-358)||(689-1036)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (10-358)||(5184-5532)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (10-311)||(27930-28231)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (10-358)||(1102-1450)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (10-344)||(16950-17284)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (10-344)||(14840-15174)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (16-358)||(109806-110148)
scaffold0029 (28-313)||(112540-112825)
scaffold0029 (10-317)||(96038-96345)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (16-358)||(43123-43465)
scaffold0028 (10-358)||(8448-8796)
scaffold0028 (215-346)||(13834-13965)
scaffold0028 (37-312)||(50555-50830)
scaffold0028 (169-327)||(106599-106757)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (10-331)||(9306-9627)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (10-346)||(7340-7676)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (10-358)||(15456-15803)
scaffold0333 (224-358)||(15832-15966)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (10-358)||(14002-14350)
scaffold0106 (10-314)||(31373-31677)
scaffold0106 (265-358)||(17660-17753)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (10-309)||(26-325)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (10-344)||(15088-15422)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (10-344)||(111984-112318)
scaffold0004 (10-311)||(203510-203811)
scaffold0004 (11-344)||(117532-117865)
scaffold0004 (46-346)||(322703-323003)
scaffold0004 (25-353)||(385797-386125)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (10-330)||(162076-162396)
scaffold0001 (10-344)||(448022-448356)
scaffold0001 (46-346)||(90939-91239)
scaffold0001 (169-327)||(78655-78813)
scaffold0001 (136-211)||(175352-175427)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (10-358)||(377-725)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (10-353)||(3995-4338)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (22-344)||(26542-26864)
scaffold0011 (10-346)||(195710-196045)
scaffold0011 (28-314)||(148551-148837)
scaffold0011 (10-211)||(68582-68783)
scaffold0011 (169-331)||(121972-122134)
scaffold0011 (270-331)||(180147-180208)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (46-356)||(1-311)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (10-344)||(16474-16808)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (22-344)||(3115-3437)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-358)||(6900-7250)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (23-344)||(269-590)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-344)||(968-1301)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (112-358)||(21932-22178)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (25-353)||(116905-117233)
scaffold0037 (169-331)||(98137-98299)
scaffold0037 (169-233)||(23586-23650)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (112-358)||(7855-8101)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (60-358)||(49506-49804)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (10-344)||(12986-13320)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (10-232)||(16920-17142)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (10-344)||(16425-16759)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (25-353)||(886-1214)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (25-353)||(25719-26047)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (25-331)||(5613-5918)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (172-358)||(7522-7708)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (25-318)||(25106-25399)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (124-340)||(9047-9263)
scaffold0507 (169-331)||(355-517)
scaffold0507 (10-103)||(6940-7033)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (28-318)||(10774-11064)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (148-358)||(775-985)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (25-346)||(86511-86832)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (46-317)||(28805-29076)
scaffold0064 (46-317)||(40796-41067)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (37-314)||(26132-26409)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (10-346)||(18544-18880)
scaffold0326 (10-71)||(3637-3698)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (10-346)||(13908-14244)
scaffold0034 (82-353)||(4953-5224)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (28-346)||(10090-10408)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (46-346)||(47123-47423)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (28-314)||(79-365)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (28-346)||(27500-27818)
scaffold0139 (10-314)||(1188-1491)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (37-314)||(19973-20250)
scaffold0298 (10-346)||(13368-13704)
scaffold0298 (10-346)||(17138-17474)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (46-314)||(3874-4142)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (91-314)||(58445-58668)
scaffold0058 (47-314)||(19120-19387)
scaffold0058 (185-331)||(74038-74184)
scaffold0058 (25-83)||(59042-59100)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (37-311)||(7078-7352)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (46-314)||(51902-52170)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (37-314)||(1208-1485)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (10-314)||(9761-10060)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (10-314)||(14049-14352)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (46-314)||(2750-3018)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (28-346)||(3872-4190)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (28-318)||(172-462)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (61-211)||(4567-4717)
scaffold0023 (10-125)||(36974-37089)
scaffold0023 (247-344)||(4463-4560)
scaffold0023 (46-98)||(18993-19045)
scaffold0023 (265-317)||(58972-59024)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (37-346)||(21678-21987)
scaffold0235 (245-331)||(26004-26090)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (46-314)||(5953-6220)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (46-346)||(37201-37501)
scaffold0026 (142-346)||(38181-38385)
scaffold0026 (142-314)||(27376-27548)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (28-346)||(6164-6483)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (28-314)||(25904-26190)
scaffold0113 (25-314)||(16654-16943)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (57-346)||(4760-5049)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (28-329)||(14275-14576)
scaffold0203 (28-191)||(9039-9202)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (46-314)||(5041-5309)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (10-346)||(10851-11187)
scaffold0124 (37-346)||(406-715)
scaffold0124 (169-331)||(7832-7994)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (10-314)||(39702-40006)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (10-314)||(49072-49376)
scaffold0053 (10-314)||(57856-58159)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (10-346)||(42340-42676)
scaffold0010 (10-346)||(47406-47742)
scaffold0010 (149-227)||(2252-2330)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (37-255)||(1167-1385)
scaffold0165 (10-71)||(26203-26264)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (28-346)||(27207-27524)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (28-346)||(18830-19148)
scaffold0090 (132-346)||(23096-23310)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (28-314)||(49246-49532)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (28-313)||(509-794)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (10-346)||(61220-61556)
scaffold0067 (10-346)||(52186-52522)
scaffold0067 (46-346)||(67608-67908)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (11-314)||(38926-39229)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (28-329)||(20103-20404)
scaffold0114 (13-346)||(43471-43804)
scaffold0114 (13-346)||(44483-44816)
scaffold0114 (28-211)||(36036-36219)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (25-314)||(16752-17041)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (25-314)||(26239-26528)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (37-312)||(33718-33993)
scaffold0076 (169-331)||(40380-40542)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (46-314)||(12820-13088)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (10-257)||(4235-4482)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (152-331)||(28288-28467)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (10-206)||(136082-136278)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (46-314)||(248612-248880)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (46-196)||(2023-2173)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (46-343)||(7248-7543)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (185-346)||(14661-14822)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (262-338)||(3734-3810)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (171-331)||(23518-23678)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (12-103)||(6238-6329)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (169-331)||(3897-4059)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (169-331)||(46276-46438)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (46-226)||(13380-13560)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (169-299)||(1916-2046)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (169-331)||(3281-3443)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (169-331)||(8217-8379)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (169-331)||(14759-14921)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (48-314)||(42784-43050)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (169-331)||(24002-24164)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (10-71)||(7498-7559)
scaffold0101 (262-314)||(5491-5543)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (169-323)||(940-1094)
scaffold1710 (265-346)||(107-188)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (185-331)||(1076-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (169-331)||(408-570)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (169-331)||(13030-13192)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (178-314)||(1-137)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (147-314)||(5313-5480)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (185-331)||(8913-9059)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (185-331)||(9125-9271)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (169-331)||(14779-14941)
scaffold0132 (246-331)||(43737-43822)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (242-346)||(1241-1345)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (185-317)||(10493-10625)
scaffold0447 (185-317)||(5879-6011)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (185-331)||(3966-4112)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (185-317)||(8488-8620)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (37-145)||(45835-45943)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (304-358)||(12744-12798)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (245-331)||(26179-26265)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (245-331)||(1446-1532)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (265-346)||(3362-3443)
scaffold0222 (10-103)||(3518-3611)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (270-331)||(71442-71503)
scaffold0021 (193-331)||(13397-13535)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (28-103)||(887-962)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (10-97)||(9182-9269)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (172-331)||(10781-10940)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (270-331)||(18332-18393)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (280-331)||(14370-14421)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (245-331)||(824-910)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498147
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12498098  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12498099 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 12498147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876730
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14876779  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  14876778 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatct 14876730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371312
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16371263  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16371264 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 16371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489749
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17489700  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  17489701 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatct 17489749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522618
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 9522569  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  9522570 atcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatct 9522618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492412
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16492461  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  16492460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatct 16492412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807157
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || | |||  |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttc 16807206  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16807205 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 16807157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692059
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || || |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 16692010  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  16692011 attttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatct 16692059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906109
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10906072  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  10906073 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 10906109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348476
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15348525  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  15348524 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 15348476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005499
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10005462  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  10005463 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 10005499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425346
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 48425309  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  48425310 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 48425346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252589
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||     
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttgg 13252552  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  13252553 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 13252589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589623
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 15589660  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  15589659 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 15589623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725165
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 15725213  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  15725212 attttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtctgctgaacaatct 15725165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635672
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16635635  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  16635636 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 16635672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43162996
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 43162959  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  43162960 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 43162996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402741
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15402790  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  15402789 attttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatct 15402741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062285
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 20062322  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  20062321 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 20062285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385249
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 53385298  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  53385297 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 53385249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208776
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 15208741  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15208742 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 15208776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792630
Alignment:
Q  17 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcg 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | |||  | |||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  117 gtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatga 216  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  217 gtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttct 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 26792672  T
Q  317 cttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  26792671 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 26792630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425161
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  5425308 cataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 5425210  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  5425209 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 5425161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339168
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| || ||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15339119  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || | |||||| ||||||| ||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  15339120 atttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatct 15339168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412513
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| | ||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttc 16412562  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||    
T  16412561 attttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatct 16412513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600646
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||| ||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 6600597  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  6600598 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 6600646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756816
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | |  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttc 16756865  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  16756864 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 16756816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248032
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| || ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttc 336  Q
     ||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttc 15248024  T
Q  337 tcagtagt 344  Q
    ||||||||    
T  15248025 tcagtagt 15248032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227518
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctct 15227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972386
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatc 312  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 13972386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123809
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 47123805  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  47123806 tctt 47123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953200
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| | ||||| ||| || || ||| | ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||| | |||||| ||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 15953201  T
Q  346 t 346  Q
    |    
T  15953200 t 15953200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383834
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  || ||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 10383830  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  10383831 tctt 10383834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322884
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |  || ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||  || ||  ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||| |||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||   ||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatc 13322903  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  13322902 ttgactttctctgtagtct 13322884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134606
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    ||| ||  | ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 18134606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571713
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttc 14571708  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  14571709 atctt 14571713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329923
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatctt 16329923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15016016
Alignment:
Q  149 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttg 248  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  249 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatcttctc 15016016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420296
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 10420314  T
Q  310 atcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||||||  |||||||    
T  10420313 atcttctctctaatcatc 10420296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759307
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 8759315  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  8759314 tcctgaac 8759307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941928
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 13941920  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  13941921 tcctgaac 13941928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177426
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 41177418  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  41177419 tcctgaac 41177426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850543
Alignment:
Q  76 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  176 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 275  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  276 atgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatctt 12850543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086536
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatc 312  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 14086536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11304037
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||||  ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |    ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttc 11304042  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  11304041 atctt 11304037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360806
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| |  ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatctt 12360806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961313
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||  ||||||  || ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |  ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| | ||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11961313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274657
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 8274657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16836941 - 16836774
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  16836941 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 16836842  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  16836841 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 16836774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777151
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||||||||  |  || ||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||   |||||||||| | ||| || || ||  | ||||| ||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 44777107  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    |||||||||   |||||||| | ||| || ||||||| ||||||    
T  44777108 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaac 44777151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975303
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 13975303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381190
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| ||||| || || ||  | ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
      ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 16381190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742961
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 16742961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgata 152  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 331
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192976
Alignment:
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 17192976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacg 154  Q
    |||||   || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576632
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 15576632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 346
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748562
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| |||||||| || ||  |  ||||||||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||| |||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 18748562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6712728 - 6712667
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6712728 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaa 6712667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6153259 - 6153141
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||  |  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  6153259 ggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatatcctttctcc 6153160  T
Q  269 gcttatcatgataactctt 287  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6153159 tcttatcatgataactctt 6153141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320836
Alignment:
Q  7 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 63  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686783
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||||| || || ||  |  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  285 ctt 287  Q
    |||    
T  21686781 ctt 21686783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854365
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 12854365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675400
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 24675351  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24675352 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 24675400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22756995
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22757044  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  22757043 atcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatct 22756995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325798
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21325847  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||    
T  21325846 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatct 21325798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708016
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttc 24708063  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24708062 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 24708016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188919
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23188870  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||   ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23188871 attttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatct 23188919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138911
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23138899  T
Q  310 atcttctcttga 321  Q
    ||||| ||||||    
T  23138900 atcttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550701
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23550689  T
Q  310 atcttctcttga 321  Q
    ||||| ||||||    
T  23550690 atcttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 34 - 344
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063974
Alignment:
Q  34 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaa 133  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  134 ctctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  234 gtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaatt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||      
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 23063963  T
Q  334 ttctcagtagt 344  Q
    ||||| |||||    
T  23063964 ttctcggtagt 23063974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925171
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16925134  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  16925135 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 16925171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998911
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16998874  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  16998875 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 16998911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145562
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
    | || |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 21145605  T
Q  316 tcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||||||    
T  21145604 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatct 21145562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982063
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16982026  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  16982027 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 16982063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063628
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17063591  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  17063592 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 17063628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709944
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||||||| | ||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24709895  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  24709896 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 24709944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386101
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 44386150  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
     | |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  44386149 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 44386101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9610047
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 9610010  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  9610011 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 9610047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325388
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22325437  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  22325436 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 22325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262281
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24262232  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  24262233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 24262281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878527
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24878576  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  24878575 attttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 24878527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371180
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | |||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 27371131  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27371132 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27371180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217927
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgt 27217890  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||    
T  27217891 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatct 27217927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377101
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatc 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868761
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||     
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttgg 10868724  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  10868725 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 10868761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067286
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17067249  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  17067250 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 17067286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087321
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 23087312  T
Q  310 atcttctct 318  Q
    |||||||||    
T  23087313 atcttctct 23087321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24826060 - 24825816
Alignment:
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24826060 actcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtca 24825961  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || |||||||||| ||||| || |  ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  24825960 caggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgctttcat 24825861  T
Q  312 cttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  24825860 cttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaat 24825816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211461
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||   ||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    ||   | |||| |||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||  ||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatc 30211483  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtct 346  Q
    | |||||  |||||||||||||    
T  30211482 aacttaaccttctcagtagtct 30211461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365656
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 27365656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830525
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 31830521  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  31830522 tctt 31830525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529420
Alignment:
Q  30 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgtt 129  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||| ||| || ||||  ||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  130 cgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 229  Q
    | ||||||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  230 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatctt 329  Q
    |||| ||||||||      |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||    
T  45529300 acacatggtcttc------aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaactt 45529393  T
Q  330 aattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    ||  |||| ||||||||  ||||||||    
T  45529394 aaccttcttagtagtctgttgaacaat 45529420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358450
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||| | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11358450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832852
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttca 20832848  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  20832849 tctt 20832852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293825
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatctt 23293825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||   ||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 187  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276647
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| | ||||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 23276638  T
Q  310 atcttctct 318  Q
    |||||||||    
T  23276639 atcttctct 23276647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787612
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 27787612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063618
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||  |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctca 1063614  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  1063615 tctt 1063618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 287
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  48 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  |  |||| | |    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  148 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 247  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  248 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 287  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128546
Alignment:
Q  187 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  287 tttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  25128487 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 25128546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574259
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   | || || || | ||| || || ||  | ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 12574251  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  12574252 tcctgaac 12574259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276163
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 22276163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833360
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 24833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945131
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 24945131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640478
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 12640478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24570227
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| | || |||||| || | |||||||||||||||| |||||||||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaa 24570227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23817696 - 23817597
Alignment:
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  23817696 tgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaactttttccgtagtct 23817597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22762274 - 22762128
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||||||  | | ||| |||||||||||    
T  22762274 acttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataact 22762175  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |  | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22762174 cttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaa 22762128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831746
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaa 24831746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 53  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 331
Target Start/End: Original strand, 14708908 - 14708971
Alignment:
Q  268 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14708908 cgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatcttaa 14708971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  31 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23817798 - 23817750
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  23817798 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacac 23817750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 28144701 - 28144749
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
T  28144701 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacac 28144749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573954
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23573905  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23573906 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 23573954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516753
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23516704  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||  ||||| | |||||||||||    
T  23516705 atcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatct 23516753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440437
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23440388  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  23440389 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 23440437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775989
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 18775940  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18775941 attctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 18775989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 45 - 358
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798972
Alignment:
Q  45 aacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgat 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  145 aactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttctt 244  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20798958  T
Q  345 ctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||    
T  20798959 ctgctgaacaatct 20798972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984479
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 21984528  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  21984527 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 21984479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423401
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 25423352  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  25423353 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 25423401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738893
Alignment:
Q  24 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  124 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 223  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  224 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaat 323  Q
    ||||||| |  || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 26738914  T
Q  324 catcttaattttctcagtagt 344  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  26738913 catcttaactttctcagtagt 26738893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999913
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14999962  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  14999961 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 14999913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333061
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22333110  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||   | |||||||||||||| |||||||||||    
T  22333109 attttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatct 22333061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134880
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22134831  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  22134832 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatct 22134880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770172
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19770123  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19770124 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 19770172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610566
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttc 27610517  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27610518 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27610566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40708992
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 40708955  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  40708956 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 40708992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41771054
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttc 41771005  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  41771006 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 41771054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668664
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27668713  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27668712 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27668664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685574
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 27685623  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||  ||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27685622 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27685574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566706
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 34566669  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  34566670 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 34566706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471427
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttc 23471392  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  23471393 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagt 23471427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356714
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16356677  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  16356678 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 16356714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518619
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27518570  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27518571 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27518619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291670
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 37291719  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  37291718 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatct 37291670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476247
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttc 29476296  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||  || ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  29476295 attttctcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatct 29476247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348635
Alignment:
Q  35 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaac 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  135 tctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacg 234  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  235 tggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattt 334  Q
    |||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||| || ||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactt 22348611  T
Q  335 tctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  22348612 tctcagtagtttgctgaacaatct 22348635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468275
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  |||||||| |||   | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttc 20468319  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    ||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||| | ||||||    
T  20468318 atcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaac 20468275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  222 tct 224  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498210
Alignment:
Q  89 tcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 188  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  189 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 288  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||| | ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  289 tgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 21498210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 251  Q
    ||   |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442479
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | |||  ||| ||||| |||| ||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttc 336  Q
     ||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||| | ||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  337 tcagtagtct 346  Q
    || |||||||    
T  23442488 tctgtagtct 23442479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564180
Alignment:
Q  47 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| || | |||||| || ||||     
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||| ||||||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctct 21564180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890945
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| | | || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtct 21890945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 344
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462132
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  328 ttaattttctcagtagt 344  Q
    || | |||||| |||||    
T  22462116 ttgactttctctgtagt 22462132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28923982
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28923991  T
Q  310 atcttctct 318  Q
    |||||||||    
T  28923990 atcttctct 28923982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848225
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | |||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 25848221  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  25848222 tctt 25848225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895156
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  |||||||  |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28895165  T
Q  310 atcttctct 318  Q
    |||||||||    
T  28895164 atcttctct 28895156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887209
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 14887213  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  14887212 tctt 14887209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735830
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 24735830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749773
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 24749773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773942
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| ||| || ||| |  |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 20773905  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||    
T  20773906 atcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtct 20773942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545714
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| || || | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  211 acatgagtgactctca-aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    | | ||||||| |||| |||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttc 37545719  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  37545718 atctt 37545714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236134
Alignment:
Q  7 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 106  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  107 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 206  Q
    | |||||||  || | ||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  207 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgct 22236146  T
Q  307 ttcatcttctct 318  Q
    ||||||||||||    
T  22236145 ttcatcttctct 22236134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342432
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | | |||||||||| ||| || || ||    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 20342428  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  20342429 tctt 20342432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737018
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24737018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381349
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 22381349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798615
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatctt 24798615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662300
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  |||| ||  |||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 272  Q
    || | |||||||||| | |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502829
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatctt 22502829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080275
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  || ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||    |||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatc 23080297  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  23080296 atcttgactttctcagtagtct 23080275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821635
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||  |||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || ||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 20821616  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
     ||| |||||| |||||||    
T  20821617 ctaactttctctgtagtct 20821635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21404923
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||||  ||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | ||||||||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  225 caaaaacac 233  Q
     ||||||||    
T  21404915 aaaaaacac 21404923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339474
Alignment:
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagt 21339474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||  |||| ||  |||| ||||||||| ||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgataca-accaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 272  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210880
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| |||||| || |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtct 11210880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269512
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| |  |  || ||||| |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 17269520  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  17269519 tcctgaac 17269512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011251
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 27011251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937389
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 21937389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503610
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23503564 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaa 23503610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581378
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || | ||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 24581378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 98  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 356
Target Start/End: Original strand, 21404939 - 21405030
Alignment:
Q  265 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| || |||  ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  21404939 ctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaacaat 21405030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244553
Alignment:
Q  189 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 288  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| ||||||||||| |    
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25244596  T
Q  289 tgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    || | ||| |     |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25244595 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaa 25244553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308705
Alignment:
Q  189 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 288  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| ||||||||||| |    
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25308748  T
Q  289 tgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    || | ||| |     |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25308747 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaa 25308705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65716
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  65369 acatcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 65667  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  65668 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 65716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  210 cacatgagt 218  Q
    |||| ||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39814
Alignment:
Q  266 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatct 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21166972
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21167021  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  21167020 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatct 21166972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978313
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19978264  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19978265 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 19978313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313579
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 30313628  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30313627 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 30313579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533726
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 15533677  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15533678 atcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 15533726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408480
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 16408529  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16408528 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 16408480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600490
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 32600441  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32600442 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatct 32600490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164626
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22164675  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22164674 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 22164626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251287
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 21251239  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  21251240 atc-tctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatct 21251287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133476
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22133525  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22133524 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 22133476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046719
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttc 22046670  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22046671 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 22046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650387
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttt 23650338  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  23650339 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatct 23650387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394300
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21394349  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | || ||||||||    
T  21394348 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatct 21394300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788793
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21788842  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | || ||||||||    
T  21788841 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatct 21788793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922170
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttc 21922219  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||    
T  21922218 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatct 21922170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674458
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17674507  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  17674506 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 17674458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032339
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22032329  T
Q  310 atcttctctt 319  Q
    || |||||||    
T  22032330 attttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19113036
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 19112999  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||    
T  19113000 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatct 19113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018187
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 20018234  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  20018233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 20018187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987533
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||  |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 22987498  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  22987499 atcttctcttgaatcatattatctttctcaatagt 22987533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485305
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19485354  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || ||||||||| || | |||||||||||    
T  19485353 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatct 19485305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120609
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22120658  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  22120657 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatct 22120609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
     ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 251  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396574
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |  ||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatc 20396594  T
Q  325 atcttaattttctcagtagt 344  Q
    | |||||  |||||||||||    
T  20396593 aacttaaccttctcagtagt 20396574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377902
Alignment:
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 22377902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384077
Alignment:
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 22384077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388405
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||  || | ||| || | |||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     || ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctct 20388405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681917
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || |    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 21681954  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  21681953 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 21681917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010379
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||   ||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 20010379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679413
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6679409  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  6679410 tctt 6679413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266541
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||   |||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 1266541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804152
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 804156  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  804155 tctt 804152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061912
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22061917  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  22061916 atctt 22061912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655229
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | | |   ||  |||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| |||||  || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttc 23655224  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  23655225 atctt 23655229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851710
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19851710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857746
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324856
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa-gatgcggtgataatccaactcggtacgccacc 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||  || |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  127 gttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 226  Q
    |||| ||| || | ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  227 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcat 326  Q
     ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||   |||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcat 21324876  T
Q  327 cttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||| | |||||| |||||||    
T  21324875 cttgactttctctgtagtct 21324856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565444
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 14565440  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  14565441 tctt 14565444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571282
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 31571290  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  31571289 tcctgaac 31571282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008152
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   || || ||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||| || ||| | ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatctt 20008152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603960
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6603956  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  6603957 tctt 6603960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416921
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  ||||||  || ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||    ||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatcatc 31416940  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | ||||||||||||||    
T  31416939 ttgactttctcagtagtct 31416921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303905
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| || ||| ||||| | |||||||||||| || |   | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatctt 29303905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840719
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
     | | |||| ||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||     
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttt 21840714  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  21840715 atctt 21840719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    || | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305060
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||  ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 12305060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 287  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 287  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652780
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||  |  |||||||||| | ||| ||||| |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtct 20652780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    ||||   || ||||| || | ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  211 acatgagtgact 222  Q
    | | ||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982755
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||| | || ||  |  | |||||||||| ||||||||  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaa 22982755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 344
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949252
Alignment:
Q  250 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagt 23949252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21196964
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| || | |||||||||||||| || ||  || | |||||||||| ||| ||||| |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||| | || | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 21196964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 314
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051165
Alignment:
Q  167 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttct 266  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||| ||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | || ||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  267 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 22051165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877557
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 16877557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850799
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 21850799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315510
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 22315510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 358
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040205
Alignment:
Q  315 ctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 22040205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 358
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856923
Alignment:
Q  288 ttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatct 18856923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23157534 - 23157473
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||| | | || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23157534 cttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaa 23157473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24818237 - 24818078
Alignment:
Q  172 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 271  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| | ||||| |||||  |  | ||||| |||||||| || |||||  |||||||||||  |||||| || | ||    
T  24818237 gtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctct 24818138  T
Q  272 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||| |||||||| |  | |||||| || | ||||||||| || |||||||||||||    
T  24818137 catcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaa 24818078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 42  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64028
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 64075  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  64074 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaat 64028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278825
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 278872  T
Q  312 cttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  278871 tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 278825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164718
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 164753  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  164752 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 164718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308970
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 308921  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  308922 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatct 308970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260575
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||  || |    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
     |||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 260570  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  260571 atctt 260575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355177
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttc 16355226  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16355225 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 16355177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252177
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttt 16252226  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  16252225 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatct 16252177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523956
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12523907  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  12523908 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 12523956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 43 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149740
Alignment:
Q  43 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  143 ataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttc 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  243 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagta 342  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaata 15149754  T
Q  343 gtctactgaacaat 356  Q
    |||| |||||||||    
T  15149753 gtctgctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090712
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttc 7090663  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  7090664 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatct 7090712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680847
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 14680798  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14680799 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 14680847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227178
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18227227  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18227226 attttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatct 18227178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652574
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14652539  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14652540 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 14652574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159772
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||   |||| |||||||  ||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 14159723  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||    
T  14159724 atcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatct 14159772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23956027
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgg 23955990  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  23955991 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 23956027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297485
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 18297448  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  18297449 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 18297485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778525
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19778574  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19778573 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 19778525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386692
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8386655  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  8386656 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 8386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303710
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 14303759  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14303758 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatct 14303710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711616
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27711567  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27711568 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27711616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851112
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14851147  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  14851146 atcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagt 14851112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476880
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 12476843  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || || ||||||||| | |||||||||||    
T  12476844 atcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatct 12476880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039136
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29039173  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  29039172 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 29039136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473320
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 40473271  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||    
T  40473272 attttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 40473320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266631
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14266680  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||   ||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  14266679 attttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatct 14266631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053357
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || ||||| |||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8053404  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  8053403 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 8053357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927151
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 198  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003368
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15003387  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  15003386 ttgactttctccgtagtct 15003368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264830
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 3264834  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  3264833 tctt 3264830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207267
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11207271  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  11207270 tctt 11207267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146148
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 16146148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16676578 - 16676435
Alignment:
Q  215 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  16676578 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatttt 16676479  T
Q  315 ctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16676478 ctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 16676435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453573
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 29453577  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  29453576 tctt 29453573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070649
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || || | ||| ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| | ||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 15070649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223154
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 33223154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246160
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | | || ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||   | || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15246155  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  15246156 atctt 15246160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415059
Alignment:
Q  178 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 277  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  278 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649313
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||  || ||||||| ||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 1649313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891218
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | |  || ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgcca 20891028  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | |||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 20891218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661902
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | |||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 44661902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606178
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 51606186  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  51606185 tcctgaac 51606178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607823
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 97  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640157
Alignment:
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 1640157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13247898
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  |||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||||||||| |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaa 13247898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15359301 - 15359126
Alignment:
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |    
T  15359301 tctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgat 15359202  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15359201 ctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 15359126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375377
Alignment:
Q  171 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 270  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  271 ttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaa 55375377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132428
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| || | ||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaa 12132428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997569
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     ||||||||||| |||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaa 14997569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703036
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 42703036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9849681 - 9849473
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |    |||||||||||||  || ||| |  ||    
T  9849681 ctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccgact 9849582  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||| ||| || ||  | ||||||||| ||||||| |  | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||    
T  9849581 tgaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagtct 9849482  T
Q  347 actgaacaa 355  Q
     ||||||||    
T  9849481 gctgaacaa 9849473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900654
Alignment:
Q  151 tacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaa 250  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||  |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  251 actcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 27900654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445231
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 16445231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  65 acacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 164  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  165 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacca 207  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752829
Alignment:
Q  150 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttga 249  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  250 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 16752829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291088
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| | |||||| || | || |||||||| || || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 9291088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293176
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 15293176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415226
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtg 15415226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18550234 - 18550052
Alignment:
Q  178 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 277  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| |||||||  || |    ||| |||||||| |    ||| || ||||||||||    
T  18550234 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaacaaatgatacctttcctgaaactccaatgatttccttcgcttatcat 18550135  T
Q  278 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttca-tct-tctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || | ||| || || |||| |||||||||||    
T  18550134 gatagctcttttgtctattttgtgatgctttcattctctctctcgaatcattttgactttttctgtcgtctgctgaacaatct 18550052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 314
Target Start/End: Original strand, 8706093 - 8706154
Alignment:
Q  253 tcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  8706093 tcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatctt 8706154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359326
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatca 81  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 346
Target Start/End: Original strand, 16685361 - 16685522
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||| | |||||||||||| | || ||  |  ||||||| | || ||| ||  | | ||||||||||||| |    
T  16685361 acttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaacttgaaattaaatatccttcatcctcttatcatgataaat 16685460  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
     || || | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  16685461 tttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttcttcgtagtct 16685522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864831
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19864782  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  19864783 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatct 19864831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498170
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12498123  T
Q  312 cttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  12498124 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 12498170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510731
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12510778  T
Q  312 cttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  12510777 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 12510731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765427
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 25765476  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  25765475 attttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatct 25765427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963504
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16963553  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16963552 atcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatct 16963504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505499
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||     
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12505452  T
Q  312 cttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  12505453 attctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatct 12505499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25609998
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 25610047  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  25610046 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatct 25609998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927777
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttc 16927826  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||    
T  16927825 atcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatct 16927777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331584
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27331619  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27331618 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagt 27331584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392324
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27392359  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27392358 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagt 27392324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833178
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 21833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543221
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttc 1543264  T
Q  316 tcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  1543263 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 1543221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078599
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttc 23078564  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23078565 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 23078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839356
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 5839405  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  5839404 attttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatct 5839356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408080
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttc 18408129  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  18408128 atcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 18408080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078825
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 22078874  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||    
T  22078873 atcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatct 22078825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626854
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16626903  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||    
T  16626902 attttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatct 16626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313305
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 24313354  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  24313353 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 24313305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263334
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28263383  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  28263382 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 28263334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342083
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28342132  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  28342131 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 28342083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592057
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29592094  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  29592093 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 29592057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112691
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||     
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgcttta 25112647  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||    
T  25112648 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 25112691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2874940
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 2874989  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  2874988 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 2874940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187580
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27187531  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27187532 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27187580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261660
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27261709  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27261708 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 27261660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762619
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||  |||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttc 22762641  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22762640 atcttctcttgaatcatcttaa 22762619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292509
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28292558  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  28292557 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 28292509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032582
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacg 234  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197696
Alignment:
Q  36 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaact 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  136 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgt 235  Q
    ||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  236 ggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaatttt 335  Q
    | | | | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| |  ||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttacctt 18197707  T
Q  336 ctcagtagtct 346  Q
    |||||||||||    
T  18197706 ctcagtagtct 18197696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471701
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 21471701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750894
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25750894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768291
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 25768291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433928
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22433928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459468
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 15459449  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
     | | |||||| |||||||    
T  15459450 ctgactttctccgtagtct 15459468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131361
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  || || ||||  || ||||| |||| |||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||| |||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 14131361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10469030
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 10469030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796813
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || ||||  |||||| ||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || ||||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttc 22796818  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  22796817 atctt 22796813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364512
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 24364512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645770
Alignment:
Q  64 gacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataa 163  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  164 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttt 263  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  264 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 34645770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794789
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || |  |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||||| || ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 18794789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879397
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || | |||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatct 19879397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564314
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || |  || || ||||  |||||||| |||| ||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatct 21564314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 320
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  220 actctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctctt 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  320 g 320  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766297
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||| |  ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||||| |||   ||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatc 8766316  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  8766315 ttgactttctctgtagtct 8766297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 318
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640876
Alignment:
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |||||| || ||| |||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 1640876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560795
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 27560795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434013
Alignment:
Q  272 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 22434013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287782
Alignment:
Q  39 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 138  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | | ||||||||||| ||||| || |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 314
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415586
Alignment:
Q  93 aagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 192  Q
    |||||||||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  193 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  293 gactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||  || |||||||||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatctt 17415586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280689
Alignment:
Q  39 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 138  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| | | |||| |||||| ||||| || |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 292
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  168 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttcta 267  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  268 cgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743251
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaa 25743251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098167
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaa 16098167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 346
Target Start/End: Original strand, 18800867 - 18801074
Alignment:
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |    
T  18800867 tctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgat 18800966  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctc 338  Q
    |  | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||    
T  18800967 ccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctc 18801066  T
Q  339 agtagtct 346  Q
     |||||||    
T  18801067 cgtagtct 18801074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28282955
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| |  |  || ||||| |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 28282963  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  28282962 tcctgaac 28282955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382537
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 16382537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571768
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  18571722 cttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaa 18571768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996365
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 23996365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14381841 - 14381616
Alignment:
Q  121 gccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtga 220  Q
    ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |    
T  14381841 gccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 14381742  T
Q  221 ctctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttg 320  Q
    | |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||      
T  14381741 ccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctct 14381642  T
Q  321 aatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
     |||||||| | |||||| |||||||    
T  14381641 tatcatcttgactttctctgtagtct 14381616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655600
Alignment:
Q  187 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |   || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  287 tttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 25655600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648948
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 1648948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838072
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| |||||| || | || | ||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| | |  |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaa 18838072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640688
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 1640688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078528
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | | ||||||||| || || ||  |  | |||||||| | ||| |||||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaa 15078528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787768
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa 94  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaa 18787768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21413102
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||| ||| ||||  || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||  ||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaa 21413102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233326
Alignment:
Q  172 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 271  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  272 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||| |||||||| |||||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaa 16233326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Original strand, 26276987 - 26277048
Alignment:
Q  271 ttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatg-ctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  26276987 ttatcatgataactcttctgcctactcagtgatgcctttcatcttctcctaaatcatcttaa 26277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14671
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14622  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14623 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 14671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 583 - 931
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 882  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  883 attttctcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatct 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6325
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6276  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  6277 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatct 6325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17319
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 17366  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17365 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 17319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154653
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttc 15154702  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  15154701 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 15154653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553103
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 11553152  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  11553151 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 11553103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687758
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12687721  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12687722 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12687758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954889
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14954840  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  14954841 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatct 14954889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038062
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14038027  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14038028 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagt 14038062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348092
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14348057  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14348058 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagt 14348092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332664
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14332617  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  14332618 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 14332664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198897
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8198860  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  8198861 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 8198897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707874
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8707825  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  8707826 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatct 8707874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871264
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10871215  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  10871216 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 10871264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161058
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15161107  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||  ||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  15161106 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 15161058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237214
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 11237263  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||  ||||||| ||||||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  11237262 attctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 11237214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551759
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18551808  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  18551807 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 18551759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516770
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttc 23516819  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  23516818 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 23516770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18178011
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 18177962  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  18177963 attttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgctgaacaatct 18178011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686333
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaga-catcatgcaaattcgaaagatgcggtgataat 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||  | |||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  109 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 208  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  209 tcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgcttt 308  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgcttt 13686283  T
Q  309 catcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||  ||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  13686284 cattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 13686333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791352
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 44791389  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  44791388 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 44791352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 355
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204145
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||| | ||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15204099  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaa 355  Q
    ||||| || || |||| |||||  ||||| ||||| | ||||||||    
T  15204100 atcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagtttgctgaacaa 15204145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 344
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624807
Alignment:
Q  76 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  176 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 275  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  276 atgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagt 15624807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206818
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||  |||||| || |||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctctt 319  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 12206818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147437
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 19147437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746836
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 20746836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102592
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 15102629  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    || || |||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  15102628 attttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 15102592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212151
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    | | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 8212151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264267
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || |    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14264272  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  14264271 atctt 14264267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306286
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11306290  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  11306289 tctt 11306286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152527
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 49152523  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  49152524 tctt 49152527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072317
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 16072317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388452
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  11388536 gaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 11388452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 356
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662228
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||    ||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||  | ||||||||  || | ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | | | ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
    ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatc 21662196  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    | |||||  || ||| ||||||  ||||||||    
T  21662197 aacttaacattttcattagtctgttgaacaat 21662228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 344
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665804
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 13665787  T
Q  328 ttaattttctcagtagt 344  Q
    || | |||||| |||||    
T  13665788 ttgactttctctgtagt 13665804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950462
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||    |||||||| | |||||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 16950463  T
Q  346 t 346  Q
    |    
T  16950462 t 16950462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053937
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| || ||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 18053945  T
Q  346 tactgaac 353  Q
    | ||||||    
T  18053944 tcctgaac 18053937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199763
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505890
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23505890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964865
Alignment:
Q  193 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  293 gactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
     |||||| || || |||||||| |||  ||||| |||||  |||||||||||    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagt 35964865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 346
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413769
Alignment:
Q  7 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 106  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  107 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 206  Q
    | |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | ||||| || |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  207 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||| | |||| || |||| |||||| || ||  | || ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 6413729  T
Q  307 ttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| || ||    |||||||| | ||||||||||||||    
T  6413730 ttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 6413769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021583
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| ||||||   || || |||| | ||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 13021583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286399
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  || | ||| |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatctt 14286399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596326
Alignment:
Q  268 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatct 9596326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936589
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 14936589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455928
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| ||  || ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 12455928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130099
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||   |||| ||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14130094  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  14130095 atctt 14130099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433917
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||   |||| ||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14433912  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  14433913 atctt 14433917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11772358 - 11772256
Alignment:
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagt 341  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  11772358 cttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttctcagt 11772259  T
Q  342 agt 344  Q
    |||    
T  11772258 agt 11772256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1430
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| |||||| | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |  ||| ||| ||| ||| || || ||  | ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatctt 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288060
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctc 26288128  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     ||||| || ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  26288127 ctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 26288060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440170
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | |  | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaa 4440170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824142
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 7824142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364182
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 15364182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107802
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 27107802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674562
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||  || || || |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatctta 330  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatctta 21674562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368604
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaa 12368604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26118810 - 26118630
Alignment:
Q  132 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 231  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||| |||| |||     
T  26118810 aactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaa 26118711  T
Q  232 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatc 312  Q
    || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26118710 acatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatc 26118630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146797
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||  |  |||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| | |  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaa 45146797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 161
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  146 actgatacggaccaat 161  Q
     |||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20467020
Alignment:
Q  184 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |  | ||||| |||||||| |  |||||  || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  284 tcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    | || || | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20466977 tattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatc 20467020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41194
Alignment:
Q  178 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  278 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcat 41194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118818
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtg 26118818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Original strand, 13378879 - 13378940
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13378879 cttatcataataacgcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaa 13378940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17145428 - 17145288
Alignment:
Q  189 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 288  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| | | ||||| |||||||| ||  || |  |||||||||||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||     
T  17145428 caaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttc 17145329  T
Q  289 tgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatctt 329  Q
    || | |||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  17145328 tgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatctt 17145288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 15340590 - 15340657
Alignment:
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  15340590 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 15340657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Original strand, 12193737 - 12193811
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  12193737 cttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 12193811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353393
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||  | ||  |   ||| |||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 13353346  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| ||   |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  13353347 cttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaa 13353393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457005
Alignment:
Q  249 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 12457005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479338
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  128 ttcgaactct 137  Q
    ||| ||||||    
T  15479347 ttccaactct 15479338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 346
Target Start/End: Original strand, 17923862 - 17923938
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||| ||||||| || | | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  17923862 cttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 17923938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 346
Target Start/End: Original strand, 5764672 - 5764750
Alignment:
Q  268 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||| ||||||||||||| || |   | || ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5764672 cgcttaccatgataactcttctgcctgatttgcgatgccttcatcctctcttgaatcattttaactttctcagtagtct 5764750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 42  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 639 - 987
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 938  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  939 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045079
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17045128  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17045127 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 17045079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250131
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 20250096  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20250097 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 20250131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106662
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19106613  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  19106614 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 19106662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620308
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 50620357  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  50620356 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatct 50620308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137073
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 20137024  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  20137025 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatct 20137073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747829
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21747780  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  21747781 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatct 21747829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16351011 - 16350665
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16351011 acatcgtcattctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16350912  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350911 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16350812  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  16350811 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16350712  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  16350711 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 16350665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391093
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 33391142  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  33391141 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 33391093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078716
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||                   || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc-------------------ctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16078765  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16078764 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 16078716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333557
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 51333606  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  51333605 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 51333557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830598
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21830549  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||  ||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  21830550 attttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatct 21830598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760935
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 19760979  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    ||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||| | ||||||    
T  19760978 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 19760935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369563
Alignment:
Q  33 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  133 actctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 232  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  233 cgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatctt 329  Q
    | || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctt 16369563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837245
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttc 21837196  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||| ||||||| || | |||||||||| |  ||||||||||    
T  21837197 attttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatct 21837245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354533
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 41354582  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||| | ||||||| || ||||||||| || | |||||||||||    
T  41354581 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatct 41354533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612602
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664952
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19664971  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  19664970 ttgactttctctgtagtct 19664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940171
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatctt 20940171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 164  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677331
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    ||||| ||| ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  211 acatgagtgactctcaa-aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    | | ||||||| ||||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 37677326  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  37677327 atctt 37677331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854597
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||   ||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19854578  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  19854579 ttgactttctctgtagtct 19854597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550289
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatctt 31550289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856839
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || |||||  |||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||   |||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatc 20856856  T
Q  328 ttaattttctcagtagt 344  Q
    || | |||||| |||||    
T  20856855 ttgactttctccgtagt 20856839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294663
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 20294663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433192
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  || |    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||  ||| || ||||| | |||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || ||||  ||||| || ||  | || |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22433229  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||   |||||||||| ||| || |||||||    
T  22433228 atcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 22433192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075167
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatctt 20075167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Original strand, 11382678 - 11382845
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || || ||  | ||     
T  11382678 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11382777  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  11382778 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11382845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 314
Target Start/End: Original strand, 41307904 - 41308076
Alignment:
Q  142 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||||||     
T  41307904 gatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctc 41308003  T
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  41308004 cctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 41308076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244436
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20244436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20835964
Alignment:
Q  76 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  176 acttcttt---gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 272  Q
    |||||||    ||||| || | |||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | || | ||||| |||  | || | ||||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  273 atcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 20835964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395194
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || |||||  ||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  211 acatgagtgac 221  Q
    | | |||||||    
T  20395204 aaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831483
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 20831483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914478
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
      |||| |||||||||||| | || |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20914416 atttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 20914478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202378
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | | || | |||||||||||||  || ||  |  | |||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 21202378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518989
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || |  || |||||||| |||||||||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaa 46518989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477020
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtg 24477020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 231  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22135710 - 22135649
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||    
T  22135710 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaatcatcttaa 22135649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 329
Target Start/End: Original strand, 20184364 - 20184448
Alignment:
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatctt 329  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||| || | |||||| ||  ||  |||||||||||| ||||||||    
T  20184364 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatctt 20184448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33568
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 33617  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  33616 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatct 33568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8907
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 8858  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  8859 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatct 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180526
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 180479  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  180480 atcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaat 180526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127208
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttc 127243  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  127242 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 127208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219426
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 219461  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  219460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 219426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229354
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
     | | |||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 229305  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  229306 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatct 229354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33017
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 33017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4400
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 4449  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  4448 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatct 4400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 818
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||  ||||| ||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttcc 867  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  866 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatct 818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6334
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttc 6285  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  6286 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 6334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1563
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |||||  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22978
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaa 22978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32761
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttc 32796  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  32795 atcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagt 32761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6683
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||  ||||| | | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6634  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  6635 atctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatct 6683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 689
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  836 cacacgagggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 738  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  737 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatct 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5532
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 5483  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||    
T  5484 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatct 5532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28231
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 28229  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  28230 at 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1450
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttc 1401  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  1402 atcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17284
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttc 17249  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  17250 atcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagt 17284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15174
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttc 15139  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15140 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 15174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109806
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttc 109849  T
Q  316 tcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  109848 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 109806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112825
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96038
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 96046  T
Q  310 atcttctc 317  Q
    ||||||||    
T  96045 atcttctc 96038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43465
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
     ||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttc 43422  T
Q  316 tcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  43423 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 43465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8796
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  8448 acatcgtcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 8547  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8548 ccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 8647  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8648 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8747  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  8748 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatct 8796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 346
Target Start/End: Original strand, 13834 - 13965
Alignment:
Q  215 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  13834 gagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttt 13933  T
Q  315 ctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  13934 ctcttgaatcatctgaactttcttagtagtct 13965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50555
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatc 312  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| | |||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 50555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106599
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatc 106599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9627
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttc 9605  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9606 atcttctcttgaatcatcttaa 9627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7676
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 7639  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7640 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 7676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15803
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15754  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  15755 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 15803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 358
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15966
Alignment:
Q  224 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaat 323  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  324 catcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 15966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14350
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14301  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||    
T  14302 atcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatct 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31677
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || |  ||| ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttc 31672  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  31673 atctt 31677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 358
Target Start/End: Original strand, 17660 - 17753
Alignment:
Q  265 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatct 17753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 26
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15088
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttc 15123  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  15122 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagt 15088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112318
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatc 112283  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  112284 atcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagt 112318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203510
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttc 203512  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  203511 at 203510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117865
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttca 117831  T
Q  311 tcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||   |||||||| | |||||| |||||    
T  117832 tcttctctctgatcatcttgactttctccgtagt 117865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 346
Target Start/End: Original strand, 322703 - 323003
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| || |||||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
     |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| | |||||| ||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtc 323002  T
Q  346 t 346  Q
    |    
T  323003 t 323003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386125
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| || | ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  | ||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
    || ||| |  || ||| | ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 386096  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  386097 atcttaaccttctccgtagtctaatgaac 386125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162396
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 162375  T
Q  310 a-tcttctcttgaatcatctta 330  Q
    | |||| |||| ||||||||||    
T  162376 actctt-tcttaaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448356
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
     ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttc 448321  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  448322 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 448356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90939
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     || ||| |||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||| | |||||| ||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 90940  T
Q  346 t 346  Q
    |    
T  90939 t 90939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78655
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatc 78655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  136 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 377 - 725
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 676  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
     | |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  677 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4338
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 4294  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  4295 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttattgaac 4338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26542
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 26565  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  26564 atcatcttaaccttctcagtagt 26542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195710
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttc 195747  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  195746 atcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtct 195710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148837
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||  | ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatctt 148837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68582
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  210 ca 211  Q
    ||    
T  68583 ca 68582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121972
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaa 121972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Original strand, 180147 - 180208
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  180147 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaa 180208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 46 - 356
Target Start/End: Original strand, 1 - 311
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||| ||||||||| ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |   | ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtc 300  T
Q  346 tactgaacaat 356  Q
    | |||||||||    
T  301 tgctgaacaat 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16474
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 16509  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16508 atcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagt 16474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3437
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| || ||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttga 321  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||     
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgg 3414  T
Q  322 atcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  3415 atcatcttaaccttctcagtagt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7250
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaaga-tgcggtgataat 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||| | |||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  109 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 208  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  209 tcacatgagtgactctcaaaa-acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctt 307  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 7199  T
Q  308 tcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  7200 tcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatct 7250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 269
Alignment:
Q  23 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 122  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  123 caccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 222  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  223 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaa 322  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 291  T
Q  323 tcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  290 tcatcttaaccttctcagtagt 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 968 - 1301
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || || || ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttc 1267  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    |  || |||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  1268 actttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagt 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 112 - 358
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22178
Alignment:
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  312 cttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatct 22178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116905
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
    |||||| || || |||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatc 116934  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    | |||||  ||||||||||| | ||||||    
T  116933 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 116905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98299
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 98299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23586
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacac 23586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 112 - 358
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8101
Alignment:
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 8054  T
Q  312 cttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  8055 tttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatct 8101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 60 - 358
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49804
Alignment:
Q  60 ttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggacca 159  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  160 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagat 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  260 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatct 49804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 12986
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||| ||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  ||||| ||| |||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13021  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  13020 atcttttcttggatcatctaaactttctcagtagt 12986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16425
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||  | ||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    |||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttc 16460  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16459 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 16425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Original strand, 886 - 1214
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatc 1185  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
      |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  1186 cacttaatcttctcagtagtttgctgaac 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25719
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
     ||||| || |||| | |||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||     
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatt 25748  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    | |||||  ||||||||||| | ||||||    
T  25747 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 25719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5613
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  ||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||||| ||| |  ||||||| |||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 5620  T
Q  325 atcttaa 331  Q
    | |||||    
T  5619 aacttaa 5613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 172 - 358
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7708
Alignment:
Q  172 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  272 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25106
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
     | |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 25106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 340
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9263
Alignment:
Q  124 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 223  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  224 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaat 323  Q
    ||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  324 catcttaattttctcag 340  Q
     |||||||  |||||||    
T  9247 tatcttaaccttctcag 9263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 355
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7033
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtg 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10774
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||  || ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||| | || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 10774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 148 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 775
Alignment:
Q  148 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 247  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  248 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtcta 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |     
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  348 ctgaacaatct 358  Q
    |||||||||||    
T  785 ctgaacaatct 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86511
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||  | ||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatc 324  Q
     |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||   |||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatc 86533  T
Q  325 atcttaattttctcagtagtct 346  Q
    | |||||  |||||||||||||    
T  86532 aacttaaccttctcagtagtct 86511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28805
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 28805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40796
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26409
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatctt 26409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18544
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 18581  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  18580 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 18544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3637
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13908
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13945  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| ||    |||||||| | ||||||||||||||    
T  13944 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 13908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4953
Alignment:
Q  82 tgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 181  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  182 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 281  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  282 actcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaac 353  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaac 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10090
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||||||||||||   |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatc 10109  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  10108 ttgactttctctgtagtct 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 346
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47423
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | | |||| || |||| |||||| || ||| | ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||| | |||||| ||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 47422  T
Q  346 t 346  Q
    |    
T  47423 t 47423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 79 - 365
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatctt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27818
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||| || ||| | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 27799  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  27800 ttgactttctctgtagtct 27818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1188
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||   || |    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||   || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | || ||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 1193  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  1192 atctt 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20250
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatctt 20250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13368
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||| | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 13405  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  13404 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 13368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17138
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || || | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 17175  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  17174 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 17138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4142
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||| ||| |||||| || ||| | ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||  || |||||||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatctt 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58445
Alignment:
Q  91 gaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 190  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||| | || ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  191 aagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 290  Q
      ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  291 tcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || |||||||||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcatctt 58445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 314
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19387
Alignment:
Q  47 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || || ||||     
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatctt 19387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74184
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||| |||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| || | |||||| |||||| || ||||||   ||||||||||||    
T  74138 cttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaa 74184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatg 83  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7078
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcat 311  Q
     ||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 7078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51902
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatctt 51902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1208
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || || | |   || ||||| |||| ||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatctt 1208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10060
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | |||||||||||| |     | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 10055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14352
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||  ||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14347  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  14348 atctt 14352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3018
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || | | | ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatctt 3018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4190
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |  ||  |||||  ||| ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||   ||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatc 4171  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  4172 ttgactttctccgtagtct 4190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Original strand, 172 - 462
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||  || ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| | |||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctct 318  Q
    ||| || |||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  61 tgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaa 160  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  161 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  110 caactcggtacgccac 125  Q
    ||||| | ||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4463
Alignment:
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagt 344  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagt 4463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 317
Target Start/End: Original strand, 58972 - 59024
Alignment:
Q  265 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  58972 ctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctc 59024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21678
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| || |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttc 336  Q
    ||   | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    |||||||| | ||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  337 tcagtagtct 346  Q
    ||||||||||    
T  21687 tcagtagtct 21678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26090
Alignment:
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| || || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 26090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5953
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| |||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||  || | ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatctt 5953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 346
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37501
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | | |||||||| | |||||| || |||    |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||| |||||| ||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtc 37500  T
Q  346 t 346  Q
    |    
T  37501 t 37501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38385 - 38181
Alignment:
Q  142 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  38385 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 38286  T
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagt 341  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||  ||||||||| | |||||| ||    
T  38285 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 38186  T
Q  342 agtct 346  Q
    |||||    
T  38185 agtct 38181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27548 - 27376
Alignment:
Q  142 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  27548 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 27449  T
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  27448 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatctt 27376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6483
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||  || |||| ||  || ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| || ||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  228 -aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcat 326  Q
     ||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcat 6463  T
Q  327 cttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  6464 cttgactttctcagtagtct 6483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25904
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatctt 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16943
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| |  || ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |  ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 16943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 346
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5049
Alignment:
Q  57 aagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacgga 156  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| || |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||| | |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||| | ||||||||||||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtct 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14275
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || ||  | || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  328 tt 329  Q
    ||    
T  14276 tt 14275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 191  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5041
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||  |||| ||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| || ||| | ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11187
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || || | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 11150  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  11151 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 11187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 406
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttc 336  Q
     ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| | ||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttc 416  T
Q  337 tcagtagtct 346  Q
    || |||||||    
T  415 tctgtagtct 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7832
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 7832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Original strand, 39702 - 40006
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 40001  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  40002 atctt 40006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49072
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||  || |    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||  ||| ||| | |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | | || ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttc 49077  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  49076 atctt 49072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57856
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttc 57861  T
Q  310 atctt 314  Q
    |||||    
T  57860 atctt 57856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42340
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 42377  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  42376 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 42340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47406
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 47443  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  47442 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 47406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  149 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | |  |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactca 255  Q
     ||| | ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26203
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27524
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || | |||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    ||| || || | | | |||||||| |||||  | || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  |  ||||||||||| |||   ||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatc 27505  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    || | |||||| |||||||    
T  27506 ttgactttctccgtagtct 27524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 346
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19148
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  |||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    | | |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||  |||| |    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaac 19129  T
Q  328 ttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| || || |||||||    
T  19130 ttaatcttttctgtagtct 19148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 346
Target Start/End: Original strand, 23096 - 23310
Alignment:
Q  132 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 231  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| |||    
T  23096 aactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaac 23195  T
Q  232 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    || |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||  |||| |||||    
T  23196 acatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaa 23295  T
Q  332 ttttctcagtagtct 346  Q
    | || || |||||||    
T  23296 tcttttctgtagtct 23310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49246
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 49246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 313
Target Start/End: Original strand, 509 - 794
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatct 313  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatct 794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61220
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 61257  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  61256 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 61220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52186
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttc 309  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 52223  T
Q  310 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  52222 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 52186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67608
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtc 345  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| | |||||| ||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtc 67609  T
Q  346 t 346  Q
    |    
T  67608 t 67608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38926
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||  || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttca 310  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttca 38930  T
Q  311 tctt 314  Q
    ||||    
T  38929 tctt 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20404
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatc 327  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatc 20402  T
Q  328 tt 329  Q
    ||    
T  20403 tt 20404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43804
Alignment:
Q  13 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  113 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 212  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  213 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatc 312  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||  || |||||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 43770  T
Q  313 ttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    || |||   |||||||||| ||| || |||||||    
T  43771 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 43804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44816
Alignment:
Q  13 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  113 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 212  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  213 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatc 312  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||  || |||||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 44782  T
Q  313 ttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    || |||   |||||||||| ||| || |||||||    
T  44783 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 44816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16752
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatctt 16752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26528
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||  || ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | ||||  || || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 26528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33718
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatc 312  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 33718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40542
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 40542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12820
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||| ||  || ||||| |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     || |||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||  || |||||||||||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatctt 12820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4235
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaag 257  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28288
Alignment:
Q  152 acggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 251  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||  || |||| ||    
T  28467 acggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaa 28368  T
Q  252 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28367 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaa 28288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 206  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248880
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||  ||| |||| | ||||| |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| |||| ||| || || ||  | ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 248880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 196  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7248
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  | |||||| |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa--ccttctgaaa 7446  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| |  ||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtag 343  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| | |||||| ||||    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtag 7248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 346
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14822
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtct 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3734
Alignment:
Q  262 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctc 3734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23678
Alignment:
Q  171 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 270  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||     |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  271 ttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaa 23678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6329
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtg 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3897
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaa 3897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46438
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 46438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| | ||| |||| ||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 226  Q
     |||||||  |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2046
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3443
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||| |  || ||||| |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8379
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaa 8379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14759
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaa 14759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 314
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43050
Alignment:
Q  48 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  | ||||| | |    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  148 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 247  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| || | ||| || || ||  | || |    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  248 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatctt 43050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24164
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaa 24164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5491
Alignment:
Q  262 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 940
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaat 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 107 - 188
Alignment:
Q  265 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||| | |||||| |||||||    
T  107 ctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1076
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||| || || ||  |  |  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaa 1076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 408
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| ||  |  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13192
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaa 13192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 314
Target Start/End: Original strand, 1 - 137
Alignment:
Q  178 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 277  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  278 gataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    | |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatctt 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Original strand, 5313 - 5480
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  5313 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 5412  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatctt 314  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  5413 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9059 - 8913
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||  || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  9059 acttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 8960  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8959 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 8913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9271
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || || || ||  |  | |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 9271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14941
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||  | ||||||||||| | |||||||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaa 14941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 331
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43822
Alignment:
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaa 43822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1345 - 1241
Alignment:
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagt 341  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||   ||||||||| | |||||| ||    
T  1345 cttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgt 1246  T
Q  342 agtct 346  Q
    |||||    
T  1245 agtct 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3966
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||| |||| ||| || || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  4012 cttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 3966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctc 317  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45943
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 45934  T
Q  137 tttctgata 145  Q
    | |||||||    
T  45935 tctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 358
Target Start/End: Original strand, 12744 - 12798
Alignment:
Q  304 gctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctactgaacaatct 358  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12744 gctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 12798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26179
Alignment:
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1446
Alignment:
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaa 1446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 3362
Alignment:
Q  265 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 346  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtct 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3518
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtg 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71503
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaa 71503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13535
Alignment:
Q  193 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || ||||| ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||| | ||    
T  13397 gcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatc 13496  T
Q  293 gactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
     |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13497 tactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaa 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 887
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtg 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9269
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 97  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagat 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Original strand, 10781 - 10940
Alignment:
Q  172 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 271  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| || |||  | | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | ||    
T  10781 gtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 10880  T
Q  272 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10881 tatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaa 10940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Original strand, 18332 - 18393
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  18332 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 18393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 331
Target Start/End: Original strand, 14370 - 14421
Alignment:
Q  280 taactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14370 taactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaa 14421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 824
Alignment:
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 331  Q
    |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| |||| || | |||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  910 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatcttctgcctactctgagatgcattcatcttttcctaaatcatcttaa 824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University