View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16893_high_14 (Length: 343)

Name: NF16893_high_14
Description: NF16893
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16893_high_14
NF16893_high_14
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (11-341)||(33682076-33682407)
chr6 (11-341)||(14033115-14033445)
chr6 (76-341)||(23835030-23835295)
chr6 (12-343)||(28359728-28360061)
chr6 (11-341)||(27562412-27562741)
chr6 (114-314)||(12941800-12942000)
chr6 (63-314)||(28290133-28290384)
chr6 (103-341)||(1592730-1592971)
chr6 (103-341)||(22906936-22907178)
chr6 (114-341)||(19726577-19726807)
chr6 (103-341)||(21724725-21724966)
chr6 (114-295)||(21566163-21566346)
chr6 (138-314)||(34647652-34647829)
chr6 (114-314)||(12167237-12167439)
chr6 (114-314)||(19286146-19286348)
chr6 (138-314)||(29615199-29615376)
chr6 (138-314)||(34640978-34641155)
chr6 (114-314)||(19877330-19877532)
chr6 (114-314)||(19883106-19883308)
chr6 (138-314)||(25470691-25470868)
chr6 (138-314)||(24562282-24562459)
chr6 (138-314)||(23837580-23837758)
chr6 (114-314)||(19786847-19787050)
chr6 (114-341)||(937658-937888)
chr6 (141-275)||(29416468-29416605)
chr6 (114-226)||(18788448-18788560)
chr6 (114-226)||(18799428-18799540)
chr6 (114-226)||(19439792-19439904)
chr6 (138-240)||(11289602-11289705)
chr6 (114-340)||(19588556-19588781)
chr6 (114-341)||(14581831-14582056)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (11-341)||(36799349-36799678)
chr8 (11-341)||(1804364-1804695)
chr8 (11-341)||(18681400-18681730)
chr8 (11-341)||(31567709-31568039)
chr8 (11-341)||(31572930-31573260)
chr8 (11-341)||(9273054-9273387)
chr8 (103-341)||(22055690-22055930)
chr8 (103-339)||(22050174-22050412)
chr8 (114-341)||(22177557-22177787)
chr8 (138-314)||(44476236-44476414)
chr8 (138-314)||(44479498-44479676)
chr8 (138-314)||(19902928-19903105)
chr8 (138-314)||(23865434-23865611)
chr8 (114-341)||(22025559-22025791)
chr8 (138-314)||(23825124-23825301)
chr8 (114-314)||(17053597-17053799)
chr8 (138-314)||(25409554-25409731)
chr8 (114-314)||(30766925-30767126)
chr8 (114-341)||(22063562-22063794)
chr8 (114-314)||(14057583-14057784)
chr8 (114-244)||(25110911-25111043)
chr8 (114-340)||(41009433-41009658)
chr8 (139-314)||(18609793-18609969)
chr8 (114-339)||(21326822-21327047)
chr8 (114-269)||(21668901-21669059)
chr8 (114-179)||(21282196-21282261)
chr8 (114-314)||(21322234-21322439)
chr8 (232-340)||(20974118-20974228)
chr8 (114-340)||(10606904-10607136)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (11-341)||(806872-807201)
chr7 (25-341)||(23201388-23201706)
chr7 (25-341)||(23507515-23507833)
chr7 (11-341)||(18055583-18055913)
chr7 (11-341)||(11631814-11632144)
chr7 (11-341)||(18049104-18049434)
chr7 (11-341)||(20579816-20580145)
chr7 (63-314)||(23665753-23666004)
chr7 (63-314)||(29795730-29795981)
chr7 (63-314)||(29799549-29799800)
chr7 (95-341)||(15338797-15339046)
chr7 (114-314)||(11302852-11303052)
chr7 (103-341)||(15723180-15723421)
chr7 (103-341)||(15710956-15711197)
chr7 (103-341)||(35962701-35962943)
chr7 (103-341)||(14431960-14432201)
chr7 (103-314)||(14281609-14281822)
chr7 (76-341)||(19599813-19600080)
chr7 (114-341)||(1612594-1612825)
chr7 (138-314)||(12591635-12591812)
chr7 (138-314)||(14421354-14421532)
chr7 (114-314)||(13006306-13006508)
chr7 (138-314)||(13123971-13124148)
chr7 (114-314)||(16676192-16676393)
chr7 (138-314)||(4279963-4280140)
chr7 (138-314)||(19616295-19616472)
chr7 (138-314)||(12710900-12711077)
chr7 (138-314)||(13742505-13742682)
chr7 (114-314)||(17650429-17650629)
chr7 (139-315)||(16109067-16109244)
chr7 (103-241)||(14128244-14128383)
chr7 (114-341)||(6411792-6412023)
chr7 (114-283)||(11390302-11390473)
chr7 (114-283)||(20328224-20328395)
chr7 (114-283)||(11383814-11383985)
chr7 (114-283)||(18606896-18607067)
chr7 (114-269)||(21232009-21232167)
chr7 (114-340)||(11220086-11220311)
chr7 (114-201)||(36306034-36306121)
chr7 (230-314)||(37244401-37244484)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (14-341)||(12578766-12579092)
chr2 (14-341)||(12572284-12572610)
chr2 (11-341)||(27785668-27785998)
chr2 (11-341)||(27790889-27791219)
chr2 (11-341)||(27295877-27296208)
chr2 (11-314)||(10685498-10685801)
chr2 (114-314)||(20260824-20261024)
chr2 (103-341)||(2105548-2105790)
chr2 (138-314)||(5707014-5707191)
chr2 (114-314)||(23090006-23090207)
chr2 (138-314)||(6482321-6482499)
chr2 (138-314)||(6485788-6485966)
chr2 (114-314)||(23102434-23102635)
chr2 (114-314)||(9241333-9241534)
chr2 (138-314)||(26582675-26582852)
chr2 (138-314)||(23169298-23169475)
chr2 (138-314)||(23580555-23580732)
chr2 (138-314)||(200641-200818)
chr2 (114-314)||(23877838-23878040)
chr2 (156-314)||(27367600-27367760)
chr2 (138-314)||(43693401-43693578)
chr2 (138-314)||(6744324-6744501)
chr2 (114-294)||(22809901-22810084)
chr2 (140-312)||(23263985-23264158)
chr2 (114-271)||(21073954-21074114)
chr2 (114-269)||(19703456-19703615)
chr2 (114-340)||(20724011-20724236)
chr2 (114-340)||(23290904-23291129)
chr2 (230-271)||(24943419-24943460)
chr2 (236-312)||(23269201-23269276)
chr2 (236-312)||(23276070-23276145)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (11-341)||(635635-635967)
chr4 (11-341)||(42701199-42701529)
chr4 (11-341)||(51601946-51602276)
chr4 (11-341)||(51607827-51608157)
chr4 (11-341)||(41799825-41800155)
chr4 (11-341)||(53748625-53748954)
chr4 (114-314)||(15533786-15533986)
chr4 (103-341)||(23121570-23121812)
chr4 (95-341)||(20940231-20940480)
chr4 (114-314)||(18212138-18212339)
chr4 (103-341)||(14484400-14484642)
chr4 (138-314)||(11847053-11847230)
chr4 (103-341)||(17000131-17000373)
chr4 (138-314)||(8046897-8047074)
chr4 (141-341)||(4831090-4831293)
chr4 (141-341)||(4834385-4834588)
chr4 (103-341)||(11171222-11171464)
chr4 (114-341)||(43284871-43285101)
chr4 (114-269)||(15406955-15407113)
chr4 (114-271)||(14485552-14485713)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (30-341)||(13909502-13909813)
chr3 (30-341)||(13946447-13946758)
chr3 (11-341)||(44775174-44775504)
chr3 (11-341)||(44780358-44780688)
chr3 (30-341)||(13939961-13940268)
chr3 (11-341)||(4677137-4677466)
chr3 (11-341)||(41175450-41175779)
chr3 (11-341)||(41180588-41180917)
chr3 (76-341)||(8742848-8743113)
chr3 (76-341)||(8761018-8761283)
chr3 (63-341)||(12200176-12200454)
chr3 (103-340)||(16838466-16838705)
chr3 (103-341)||(14652680-14652921)
chr3 (103-341)||(16382844-16383085)
chr3 (114-299)||(12304763-12304949)
chr3 (114-340)||(13203514-13203743)
chr3 (114-314)||(17157061-17157262)
chr3 (138-314)||(9532849-9533027)
chr3 (114-314)||(24191762-24191963)
chr3 (114-314)||(41456123-41456325)
chr3 (114-314)||(16802425-16802626)
chr3 (103-337)||(14544155-14544394)
chr3 (138-314)||(8583294-8583471)
chr3 (138-314)||(14084531-14084708)
chr3 (138-314)||(14089932-14090109)
chr3 (138-314)||(49399473-49399650)
chr3 (138-314)||(24123203-24123380)
chr3 (156-314)||(13968850-13969010)
chr3 (156-314)||(13974325-13974485)
chr3 (159-314)||(17190836-17190992)
chr3 (141-341)||(34852211-34852414)
chr3 (103-225)||(16829943-16830065)
chr3 (114-341)||(14292674-14292906)
chr3 (191-340)||(16830055-16830206)
chr3 (114-283)||(23174189-23174358)
chr3 (114-271)||(17199015-17199175)
chr3 (114-203)||(31690570-31690659)
chr3 (115-314)||(12961378-12961580)
chr3 (114-201)||(23173876-23173963)
chr3 (139-272)||(17243680-17243815)
chr3 (252-340)||(18719250-18719339)
chr3 (253-314)||(11850780-11850840)
chr3 (114-203)||(12255238-12255326)
chr3 (227-271)||(18889009-18889053)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (11-341)||(21678141-21678469)
chr5 (11-341)||(17264667-17264998)
chr5 (11-341)||(17271149-17271480)
chr5 (11-341)||(22174987-22175320)
chr5 (63-314)||(9775467-9775718)
chr5 (114-314)||(37805292-37805492)
chr5 (103-341)||(758216-758456)
chr5 (95-341)||(22509126-22509374)
chr5 (103-340)||(22312793-22313033)
chr5 (138-314)||(19510999-19511177)
chr5 (65-338)||(20937568-20937845)
chr5 (114-314)||(23527448-23527651)
chr5 (114-314)||(22439701-22439902)
chr5 (138-314)||(21675471-21675648)
chr5 (156-314)||(1857520-1857680)
chr5 (141-341)||(10816746-10816949)
chr5 (141-341)||(23538773-23538976)
chr5 (226-314)||(23112827-23112914)
chr5 (114-203)||(22007896-22007986)
chr5 (253-314)||(24751647-24751707)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (11-341)||(27280165-27280496)
chr1 (103-340)||(3706727-3706967)
chr1 (138-314)||(20438531-20438709)
chr1 (103-341)||(23066665-23066907)
chr1 (138-314)||(21542056-21542233)
chr1 (138-314)||(42095903-42096080)
chr1 (114-341)||(22448244-22448469)
chr1 (114-341)||(20242503-20242735)
chr1 (138-314)||(20045879-20046056)
chr1 (114-314)||(19664105-19664306)
chr1 (114-341)||(32650074-32650304)
chr1 (114-314)||(41110814-41111016)
chr1 (215-341)||(955118-955248)
chr1 (114-314)||(19778434-19778639)
chr1 (114-340)||(29554419-29554645)
chr1 (105-201)||(955032-955128)
chr1 (230-314)||(36614935-36615015)
chr1 (230-314)||(24079551-24079634)
chr1 (230-314)||(24109120-24109203)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (11-265)||(40549-40804)
scaffold0124 (114-314)||(36793-36994)
scaffold0124 (269-341)||(8493-8565)
scaffold0124 (112-203)||(43965-44057)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (63-341)||(14421-14702)
scaffold0239 (103-279)||(7178-7356)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (63-341)||(141297-141577)
scaffold0021 (141-269)||(146611-146742)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (103-341)||(265071-265311)
scaffold0005 (103-341)||(258645-258885)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (114-341)||(41902-42132)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (114-341)||(63169-63399)
scaffold0026 (137-314)||(12876-13054)
scaffold0026 (114-341)||(124446-124677)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (114-339)||(6006-6235)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (114-295)||(4275-4458)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (114-295)||(15432-15615)
scaffold0025 (114-248)||(71155-71291)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (114-341)||(152332-152562)
scaffold0011 (138-314)||(174561-174738)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (114-314)||(4594-4795)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (115-341)||(50948-51177)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (95-341)||(13979-14228)
scaffold0063 (95-341)||(24180-24429)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (114-314)||(10234-10435)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (138-314)||(110758-110935)
scaffold0029 (246-314)||(116793-116861)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (114-341)||(10312-10543)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (103-337)||(47376-47615)
scaffold0067 (103-337)||(62796-63035)
scaffold0067 (103-337)||(56410-56649)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (103-343)||(14536-14778)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (138-314)||(174561-174739)
scaffold0001 (138-314)||(489127-489304)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (156-314)||(9649-9809)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (138-314)||(38401-38578)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (138-314)||(35546-35723)
scaffold0076 (156-314)||(30162-30322)
scaffold0076 (114-293)||(51676-51858)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (138-314)||(46979-47156)
scaffold0028 (138-314)||(52384-52561)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (138-314)||(2566-2743)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (114-314)||(29748-29948)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (114-341)||(5119-5350)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (114-283)||(143-314)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (114-295)||(10217-10400)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (185-341)||(15511-15670)
scaffold0348 (114-179)||(3058-3123)
scaffold0348 (114-170)||(15454-15510)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (114-248)||(20493-20629)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (156-295)||(1-132)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (105-341)||(17447-17688)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (114-343)||(4981-5216)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (190-314)||(5-131)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (137-223)||(1-87)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (114-269)||(41592-41750)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (253-341)||(3629-3718)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (114-314)||(8410-8615)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (114-269)||(326816-326975)
scaffold0004 (114-340)||(321040-321266)
scaffold0004 (140-271)||(115778-115911)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (114-269)||(7293-7451)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (140-271)||(102930-103063)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (114-269)||(392-550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (114-269)||(16914-17072)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (152-314)||(27781-27945)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (114-340)||(27840-28065)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (226-340)||(13504-13620)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (114-337)||(16021-16250)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (301-341)||(78539-78581)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (114-203)||(55975-56065)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (301-341)||(16913-16954)
scaffold0074 (114-203)||(17006-17095)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (112-203)||(1027-1119)
scaffold0461 (112-203)||(7963-8055)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 33682076 - 33682407
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33682076 gatgaatggatgctgactgaatgtacgttgtacttaattaaaattcccttaaagttgtaaattggatggtgaatcatatattatgtatatgtataggttg 33682175  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33682176 gttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagctttggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 33682275  T
Q  210 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33682276 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 33682375  T
Q  310 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33682376 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 33682407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14033445 - 14033115
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  14033445 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 14033348  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14033347 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 14033248  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14033247 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 14033148  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033147 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 14033115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 76 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23835295 - 23835030
Alignment:
Q  76 tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 174  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835295 tggtgaatcatatat-atgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 23835197  T
Q  175 tggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835196 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 23835097  T
Q  275 cggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23835096 cggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 23835030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 28359728 - 28360061
Alignment:
Q  12 atgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatat-tatgtatatgtttaggttgg 110  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||   ||||||| ||| ||||||| | || ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| ||    
T  28359728 atgaatggatgctgactgattgaatgttgtatttaaataaaattccttaacgttgtaagttggttggtgaaacatatatatatatatatgtctaggtggg 28359827  T
Q  111 ttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28359828 ttggtatgtagatatacaacaaggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 28359927  T
Q  210 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28359928 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 28360027  T
Q  310 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360028 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtag 28360061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 27562412 - 27562741
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttgg 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||| ||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27562412 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtgtttaattaaaattccttaacgttgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttgg 27562510  T
Q  111 ttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27562511 gtagtatgtagatatactcaatggggattagttgcattaacataacagcgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 27562610  T
Q  210 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27562611 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattcttggtaccaca 27562710  T
Q  310 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27562711 tgcatgggtg-ttagaggagttttagtggagt 27562741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12942000 - 12941800
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  12942000 gtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 12941901  T
Q  214 ctcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12941900 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccacatgc 12941802  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  12941801 at 12941800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Original strand, 28290133 - 28290384
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |  |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||    
T  28290133 gttgtaaattggagtggtgagtcatatat-acatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtggg 28290231  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctt 260  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28290232 agagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtgatgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctt 28290331  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28290332 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 28290384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1592971 - 1592730
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  1592971 taggttgggttgtatgtaggtatacacaagtgggtcagttgcaaaagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttctcgttcaaagtggtgg 1592872  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||     
T  1592871 agtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcgacagcggtgagggctacggtcctgatttt- 1592773  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  1592772 ggtaccacatgcataggtgttgttagaggagtcttagtggagt 1592730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22907178 - 22906936
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  22907178 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagctgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 22907079  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |    
T  22907078 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat 22906979  T
Q  300 cggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
     |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22906978 -ggtaccacatacatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 22906936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19726807 - 19726577
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  19726807 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 19726708  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | |||||||||||    
T  19726707 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatg 19726609  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  19726608 catgggtgttgttagaggagtcttggtggagt 19726577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 21724725 - 21724966
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || |   ||||||||||||    
T  21724725 taggttgggttgtatgtaggtatacacaagtgggtcagttgcaaaagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgcctaatagatcaaagtggtgg 21724824  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggt-gtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| |||||||||     
T  21724825 agtactagttgctcaaagtggtattagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtgagggctacggtcctgatttt- 21724923  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21724924 ggtaccacatgtatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 21724966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 21566163 - 21566346
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  21566163 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 21566262  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 295  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21566263 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcatgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga 21566346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 34647652 - 34647829
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  34647652 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 34647750  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34647751 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 34647829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12167439 - 12167237
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  12167439 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 12167340  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  12167339 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatg 12167240  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  12167239 cat 12167237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19286348 - 19286146
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  19286348 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 19286249  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  19286248 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatg 19286149  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  19286148 cat 19286146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 29615199 - 29615376
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  29615199 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 29615298  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  29615299 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggttat-ggtaccacatgcat 29615376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 34640978 - 34641155
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | | | ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  34640978 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgccgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 34641076  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34641077 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 34641155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19877532 - 19877330
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||  |||||  |||||||     
T  19877532 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttg 19877433  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  19877432 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatg 19877333  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  19877332 cat 19877330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19883308 - 19883106
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||  |||||  |||||||     
T  19883308 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttg 19883209  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  19883208 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatg 19883109  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  19883108 cat 19883106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 25470691 - 25470868
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  25470691 tagttgcataatcatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagaggtgag 25470789  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  25470790 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 25470868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24562459 - 24562282
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  24562459 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 24562361  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24562360 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 24562282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23837758 - 23837580
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||  ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23837758 tagttccataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaaacggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 23837659  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  23837658 aacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 23837580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 19786847 - 19787050
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcat-aaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  19786847 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 19786946  T
Q  213 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||    
T  19786947 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtaatggccctgaattatggtaccacat 19787046  T
Q  311 gcat 314  Q
    ||||    
T  19787047 gcat 19787050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 937658 - 937888
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| | || || | | |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  937658 gtatgtagatatacacgagtgggtcaattgcataagcatagaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcgttg 937757  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||  | || | ||||| | |||||||||||    
T  937758 ctcaaagtggtgttagaggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagaggtgagggctaaggtcatgattat-ggtaccacatg 937856  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  937857 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 937888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 275
Target Start/End: Original strand, 29416468 - 29416605
Alignment:
Q  141 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 238  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  29416468 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggagcaccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 29416567  T
Q  239 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagc 275  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  29416568 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagc 29416605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18788560 - 18788448
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  18788560 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 18788461  T
Q  214 ctcaaagtggtgt 226  Q
     |||||| |||||    
T  18788460 ttcaaagcggtgt 18788448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18799540 - 18799428
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  18799540 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 18799441  T
Q  214 ctcaaagtggtgt 226  Q
     |||||| |||||    
T  18799440 ttcaaagcggtgt 18799428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19439904 - 19439792
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  19439904 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttacataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 19439805  T
Q  214 ctcaaagtggtgt 226  Q
     |||||| |||||    
T  19439804 ttcaaagcggtgt 19439792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 240
Target Start/End: Original strand, 11289602 - 11289705
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  11289602 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 11289700  T
Q  236 gactt 240  Q
    |||||    
T  11289701 gactt 11289705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 19588556 - 19588781
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || |  || ||||||| ||||||  |||||||    
T  19588556 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttatcgttcaaagcggtggaacactagtt 19588655  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||    
T  19588656 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcatgaaaatgaatactttaaccattcaattagcggtgagggattcggccctgattat-ggtaccac 19588754  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  19588755 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 19588781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 14581831 - 14582056
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgg-gagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta-gt 211  Q
    ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| || || |||  ||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||  || | ||    
T  14581831 gtatgtatatatacataagggg-ttagttgcataagcataatagcggtgaggacttcggtcctggaatgccttgtcattcaaagtggaggaacacaatgt 14581929  T
Q  212 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
    |  |||||| |||||  |  |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||  ||  |||||||    
T  14581930 tgttcaaagcggtgtttaacggtgaggactcatgtcctgatgaaagaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccctg--ttatggtacca 14582027  T
Q  308 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||     | ||||||||||||||||||||    
T  14582028 catgcat-----tatagaggagtcttagtggagt 14582056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36799678 - 36799349
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttgg 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36799678 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaatt-aaattccttaacgttgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttgg 36799581  T
Q  111 ttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36799580 ttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 36799481  T
Q  210 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36799480 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 36799381  T
Q  310 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799380 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 36799349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 1804364 - 1804695
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa-gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||  ||||| ||| || |||| || | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1804364 gatgaatagatgctgattgaatgaatgttgtatttaattaaaatttccttaatgttgcaagttgaatggtgaatcatatat-atgtatatgtttaggttg 1804462  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1804463 gttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 1804562  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1804563 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 1804662  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804663 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 1804695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 18681400 - 18681730
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  18681400 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 18681497  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18681498 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 18681597  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18681598 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 18681697  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681698 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 18681730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 31567709 - 31568039
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  31567709 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 31567806  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31567807 gttggtatatagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 31567906  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31567907 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 31568006  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31568007 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 31568039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 31572930 - 31573260
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  31572930 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 31573027  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaagg-ggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31573028 gttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 31573127  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31573128 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 31573227  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573228 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 31573260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 9273054 - 9273387
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaa--ttccctaaa-gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggt 107  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||  || | |||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9273054 gatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaaatttacttaaatgttgtaagttggatggtgaatcatatat-atgtatatgtttaggt 9273152  T
Q  108 tggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9273153 tggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtac 9273252  T
Q  208 tagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9273253 tagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgttctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacc 9273352  T
Q  307 acatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273353 acatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 9273387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22055930 - 22055690
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  22055930 taggttggttg-tatgtagatatactcaagtgggtcatttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 22055832  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |     
T  22055831 agcactagttgcttaaagtggtgttagtggtgaggatttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat- 22055733  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22055732 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 22055690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22050412 - 22050174
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||    
T  22050412 taggttggttg-tatgtagatatactcaagtgggtcatttgcataagcataacagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 22050314  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |     
T  22050313 agcactagttgcttaaagtggtgttagtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat- 22050215  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtgga 339  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22050214 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtgga 22050174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22177787 - 22177557
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| || ||||     
T  22177787 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcaaaaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcacaagttg 22177688  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | |||||||||||    
T  22177687 ctcaaagtggtgttagtggtgaagacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatg 22177589  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22177588 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 22177557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44476414 - 44476236
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||  |||||  || ||||||    
T  44476414 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaacggtgtggagcggtgag 44476315  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44476314 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 44476236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44479676 - 44479498
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||  |||||  || ||||||    
T  44479676 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaacggtgtggagcggtgag 44479577  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44479576 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 44479498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 19902928 - 19903105
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19902928 tagttgcataaatatca-agtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19903026  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19903027 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 19903105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23865611 - 23865434
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23865611 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 23865513  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  23865512 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccatttgacagcggtgtgggtcatggccctggattatggtaccacatgcat 23865434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 22025559 - 22025791
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  22025559 gtatgtagatatagacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 22025658  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||    
T  22025659 ctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccaca 22025757  T
Q  310 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22025758 tgcatgggtgttgttagaggagtcttagaggagt 22025791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23825301 - 23825124
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  23825301 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 23825203  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23825202 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 23825124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17053799 - 17053597
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  17053799 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcagctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaaactagttg 17053700  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  17053699 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcggcagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatg 17053600  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  17053599 cat 17053597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25409731 - 25409554
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||     
T  25409731 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggatcgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgat 25409632  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25409631 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggttat-ggtaccacatgcat 25409554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 30766925 - 30767126
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || |  || ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||     
T  30766925 gtatgtagatatacacaggttgagtagttgcatag-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttg 30767023  T
Q  214 ctcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
     ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30767024 ttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtccttatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacat 30767122  T
Q  311 gcat 314  Q
    ||||    
T  30767123 gcat 30767126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 22063562 - 22063794
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||| ||||||| |||||||     
T  22063562 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctccggaacgccttgtcgttcaaagcggtggagcactagttg 22063661  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||||| | ||||| | |    
T  22063662 ctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcgaccctgattat-ggtactaaa 22063760  T
Q  310 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22063761 tgcatgggtgttgttagaggagtcttagaggagt 22063794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 14057583 - 14057784
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||  |||||  |||||||     
T  14057583 gtatgtaaatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttg 14057682  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||| | | |||||||||||    
T  14057683 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctgaatat-ggtaccacatg 14057781  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  14057782 cat 14057784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25111043 - 25110911
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  25111043 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaatgtcttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 25110944  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgt 244  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  25110943 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgt 25110911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 41009433 - 41009658
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  41009433 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 41009532  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  41009533 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggtttcggccctgattat-ggtaccac 41009631  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  41009632 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 41009658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18609969 - 18609793
Alignment:
Q  139 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 236  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||| || |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  18609969 agttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttgaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 18609870  T
Q  237 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||| |||   ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18609869 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctgaatat-ggtaccacatgcat 18609793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 339
Target Start/End: Original strand, 21326822 - 21327047
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggatt-agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  21326822 gtatgtagatatacacaagtggatttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 21326921  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||| | |||||||    
T  21326922 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtacca 21327020  T
Q  308 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtgga 339  Q
    |||||||     | ||||||||||||||||||    
T  21327021 catgcat-----tgtagaggagtcttagtgga 21327047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21669059 - 21668901
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||| |||||| |||| |  | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  21669059 gtatgtatatatacacaagtgagtcagttacataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 21668960  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  21668959 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 21668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21282261 - 21282196
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaa 179  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21282261 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaa 21282196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 21322234 - 21322439
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| || ||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  21322234 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggtctcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 21322333  T
Q  213 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||| | |||||||    
T  21322334 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtacca 21322432  T
Q  308 catgcat 314  Q
    |||||||    
T  21322433 catgcat 21322439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 340
Target Start/End: Original strand, 20974118 - 20974228
Alignment:
Q  232 tgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-tagagga 328  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  20974118 tgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacatgcatgagtgttgtagaaga 20974216  T
Q  329 gtcttagtggag 340  Q
    ||||||||||||    
T  20974217 gtcttagtggag 20974228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10607136 - 10606904
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggatt-agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtac-tagt 211  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||| || ||||| |||  ||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  || | ||    
T  10607136 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacaccttgt 10607037  T
Q  212 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
    |  |||| | |||||  || |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | |||||||    
T  10607036 tgttcaacgcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctgattat-ggtacca 10606938  T
Q  308 catgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggag 340  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  10606937 catgcatgagtgttgtagaagggtcttagtggag 10606904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 806872 - 807201
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttgg 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  806872 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaatt-aaattccttaacgttgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttgg 806969  T
Q  111 ttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  806970 ttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 807069  T
Q  210 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  807070 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 807169  T
Q  310 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807170 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 807201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 23201388 - 23201706
Alignment:
Q  25 gactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa-gttgtaaatcggatggtgactcatatat-tatgtatatgtttaggttggttggtatgtaga 122  Q
    ||||||||||||||  || |||||  ||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23201388 gactgaatgtatgtcttatttaattaaaattcccttaatgttgtaagttggatggtgaatcatatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtgga 23201487  T
Q  123 tatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201488 tatactcaaggggattagttgcataaacataaaagtgagagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtg 23201587  T
Q  223 gtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgttt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23201588 gtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgttt 23201687  T
Q  323 agaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23201688 agaggagtcttagtggagt 23201706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 23507515 - 23507833
Alignment:
Q  25 gactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa-gttgtaaatcggatggtgactcatatat-tatgtatatgtttaggttggttggtatgtaga 122  Q
    ||||||||||||||  || |||||  ||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23507515 gactgaatgtatgtcttatttaattaaaattcccttaatgttgtaagttggatggtgaatcatatatatatgtatatgtttaggttggttggtatgtgga 23507614  T
Q  123 tatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507615 tatactcaaggggattagttgcataaacataaaagtgagagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtg 23507714  T
Q  223 gtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgttt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23507715 gtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgttt 23507814  T
Q  323 agaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23507815 agaggagtcttagtggagt 23507833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 18055583 - 18055913
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  18055583 gatgaatggatgttgactga-tgtgtgttgtatataattaaaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 18055680  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18055681 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 18055780  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18055781 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 18055880  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055881 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 18055913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 11631814 - 11632144
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||   ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  11631814 gatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataaataaaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 11631911  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11631912 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 11632011  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11632012 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 11632111  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632112 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 11632144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 18049104 - 18049434
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  18049104 gatgaatggatgttgactga-tgtgtgttgtatataattaaaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 18049201  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18049202 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagaggtggagtact 18049301  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18049302 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 18049401  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049402 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 18049434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 20579816 - 20580145
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||| | |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  20579816 gatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataatt-aaattcctttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 20579912  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20579913 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 20580012  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20580013 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccac 20580112  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20580113 atgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 20580145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Original strand, 23665753 - 23666004
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |  |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||    
T  23665753 gttgtaaattggagtggtgagtcatatat-acatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtggg 23665851  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctt 260  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23665852 agagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctt 23665951  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23665952 taaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccacatgcat 23666004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29795981 - 29795730
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |  |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||    
T  29795981 gttgtaaattggagtggtgagtcatatat-acatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtggg 29795883  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctt 260  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29795882 agagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctt 29795783  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29795782 taaccattcgacagtggtatgggtcacggccctggtttt-ggtaccacatgcat 29795730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29799800 - 29799549
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |  |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||    
T  29799800 gttgtaaattggagtggtgagtcatatat-acatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtggg 29799702  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctt 260  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29799701 agagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctt 29799602  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29799601 taaccattcgacagtggtatgggtcacggccctggtttt-ggtaccacatgcat 29799549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15339046 - 15338797
Alignment:
Q  95 tatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaa 194  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||    
T  15339046 tatatgtataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaa 15338947  T
Q  195 agtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 292  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||    
T  15338946 agtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcc 15338847  T
Q  293 tgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15338846 tgatttt-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 15338797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11303052 - 11302852
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||     
T  11303052 gtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactagttg 11302953  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11302952 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccacatgc 11302854  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  11302853 at 11302852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 15723180 - 15723421
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  15723180 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 15723279  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||     
T  15723280 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt- 15723378  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15723379 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 15723421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 15710956 - 15711197
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  15710956 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggatctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 15711055  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||     
T  15711056 agtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt- 15711154  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15711155 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 15711197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 35962701 - 35962943
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  35962701 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 35962800  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  35962801 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt 35962900  T
Q  300 cggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35962901 -ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 35962943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14432201 - 14431960
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  14432201 taggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 14432102  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||     
T  14432101 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt- 14432003  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14432002 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggggtcttagtggagt 14431960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 314
Target Start/End: Original strand, 14281609 - 14281822
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  14281609 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaatgccttgtcgttcaaagtggtgg 14281708  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |    
T  14281709 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctgattat 14281808  T
Q  300 cggtaccacatgcat 314  Q
     ||||||||||||||    
T  14281809 -ggtaccacatgcat 14281822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19600080 - 19599813
Alignment:
Q  76 tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctct 175  Q
    |||||| |||||||| || ||||||  |||||| | | |||||||||||||| |||| || | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19600080 tggtgagtcatatat-atatatatgcataggtttggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgtataagcataatagtgggagagcttcggctct 19599982  T
Q  176 ggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgaca 273  Q
    |||| || | ||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| |||    
T  19599981 ggaacgccttgtcgttcaaagtggtggatcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaataaatgctttaaccattctaca 19599882  T
Q  274 gcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||| |||  |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19599881 gcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatgcgtgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 19599813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1612825 - 1612594
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggatt-agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||| ||    
T  1612825 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttggataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactattt 1612726  T
Q  213 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||    
T  1612725 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgggggctacggtcctgattat-ggtaccacat 1612627  T
Q  311 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1612626 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 1612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 12591635 - 12591812
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  12591635 tagttgcataatcatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcttcgtcgttcaaagcggtggagcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 12591733  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  12591734 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 12591812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14421532 - 14421354
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  14421532 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacgctagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 14421433  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  14421432 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 14421354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13006508 - 13006306
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  13006508 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 13006409  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  13006408 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatg 13006309  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  13006308 cat 13006306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 13123971 - 13124148
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  13123971 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 13124069  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  13124070 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatggtaccacatgcat 13124148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16676393 - 16676192
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||  ||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  16676393 gtatgtagatatacataagtgggttggttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 16676294  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  16676293 ttcaaagcggtgtcgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtccttaatat-ggtaccacatg 16676195  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  16676194 cat 16676192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4280140 - 4279963
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  4280140 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 4280042  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4280041 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 4279963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19616472 - 19616295
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  19616472 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 19616374  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19616373 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 19616295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 12710900 - 12711077
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  12710900 tagttgcataaatatca-agtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 12710998  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  12710999 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatggtaccacatgcat 12711077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13742682 - 13742505
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  13742682 tagttgcataaacatca-agtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 13742584  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  13742583 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtaacggccctaaattatggtaccacatgcat 13742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17650629 - 17650429
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||  ||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| | ||||||  |||||||     
T  17650629 gtatgtagatatacataagtgggttggttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaa-gcggtggaacactagttg 17650531  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  17650530 ttcaaagcggtgtcgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcctaaatat-ggtaccacatg 17650432  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  17650431 cat 17650429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 315
Target Start/End: Original strand, 16109067 - 16109244
Alignment:
Q  139 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 237  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16109067 agttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 16109166  T
Q  238 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatg 315  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  16109167 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatgcatg 16109244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14128383 - 14128244
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  14128383 taggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 14128284  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggactta 241  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14128283 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggactta 14128244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6412023 - 6411792
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  6412023 gtatgtagatatacacaagagggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgcattgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 6411924  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
     ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||    
T  6411923 ttcaaagcagtgtatagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacaattctacagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacat 6411825  T
Q  311 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  6411824 gcatgagtgttgttagaggagtcttagtggagt 6411792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 11390302 - 11390473
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  11390302 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 11390401  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 283  Q
     |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11390402 ttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggagtggg 11390473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 20328224 - 20328395
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  20328224 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 20328323  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 283  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20328324 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 20328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 11383814 - 11383985
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||| ||||||  ||||||      
T  11383814 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtgg 11383913  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 283  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11383914 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttaagtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggagtggg 11383985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18607067 - 18606896
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| || | ||  ||||||| ||||||  ||||||      
T  18607067 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcgactctggaacgccttgtggttcaaagcggtggaacactagtgg 18606968  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 283  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606967 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgttctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 18606896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 21232009 - 21232167
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  21232009 gtatgtagatatatacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 21232108  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  21232109 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 21232167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 11220086 - 11220311
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  11220086 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcagaagcataaaagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 11220185  T
Q  213 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||  | ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||    
T  11220186 gttcaaagcggtgttaagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaaatagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccac 11220284  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  11220285 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 11220311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Original strand, 36306034 - 36306121
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtg 201  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||    
T  36306034 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 36306121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Original strand, 37244401 - 37244484
Alignment:
Q  230 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37244401 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacatgcat 37244484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12579092 - 12578766
Alignment:
Q  14 gaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttg 113  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12579092 gaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaatt-aaattccttaacgttgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttggttg 12578995  T
Q  114 gtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12578994 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 12578895  T
Q  213 actcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12578894 actcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 12578795  T
Q  313 atgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578794 atgggtgtttagaggagtcttagtggagt 12578766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12572610 - 12572284
Alignment:
Q  14 gaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttg 113  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12572610 gaatggatgctgactgaatgaatgttgtacttaatt-aaattccttaacgttgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttggttg 12572513  T
Q  114 gtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12572512 gtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 12572413  T
Q  213 actcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12572412 actcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 12572313  T
Q  313 atgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12572312 atgggtgtttagaggagtcttagcggagt 12572284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27785998 - 27785668
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  27785998 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 27785901  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27785900 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 27785801  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27785800 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 27785701  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785700 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 27785668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27791219 - 27790889
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  27791219 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 27791122  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27791121 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 27791022  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27791021 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 27790922  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27790921 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 27790889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 27295877 - 27296208
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa--gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggtt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  27295877 gatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattggatggtgaatcatatat-atgtatatgtt-agatt 27295974  T
Q  109 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  27295975 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtact 27296074  T
Q  209 agttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296075 agttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 27296174  T
Q  308 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296175 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 27296208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 10685498 - 10685801
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttgg 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  || | || ||||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10685498 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaattaaactcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttgg 10685596  T
Q  111 ttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10685597 ttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 10685696  T
Q  210 gttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10685697 gttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccac 10685795  T
Q  309 atgcat 314  Q
    ||||||    
T  10685796 atgcat 10685801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20261024 - 20260824
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  20261024 gtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 20260925  T
Q  214 ctcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20260924 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccacatgc 20260826  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  20260825 at 20260824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2105790 - 2105548
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  2105790 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 2105691  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||      
T  2105690 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgaattat 2105591  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2105590 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 2105548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 5707014 - 5707191
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  5707014 tagttgcataatcatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcttcgtcgttcaaagcggtggagcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 5707112  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5707113 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 5707191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 23090006 - 23090207
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||| ||||||  ||||||||    
T  23090006 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttaaaagcggtggaacactagtta 23090105  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  23090106 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctgaatat-ggtaccacatg 23090204  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  23090205 cat 23090207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6482499 - 6482321
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  6482499 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 6482400  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  6482399 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 6482321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6485966 - 6485788
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  6485966 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 6485867  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  6485866 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 6485788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 23102434 - 23102635
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  23102434 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcctaaaagtgggagagcttcggctctggaactccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttt 23102533  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  23102534 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatg 23102632  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  23102633 cat 23102635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9241534 - 9241333
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  | |||||     
T  9241534 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtggaagaacttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacattagttg 9241435  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  9241434 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctgattat-ggtaccacatg 9241336  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  9241335 cat 9241333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26582852 - 26582675
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  26582852 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 26582753  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  26582752 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggttat-ggtaccacatgcat 26582675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 23169298 - 23169475
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23169298 tagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 23169397  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23169398 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 23169475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 23580555 - 23580732
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23580555 tagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 23580654  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23580655 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 23580732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 200818 - 200641
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  200818 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 200720  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  200719 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 200641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23878040 - 23877838
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||  ||||||| ||||||  |||||||     
T  23878040 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtagttcaaagcggtggaacactagttg 23877941  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||    
T  23877940 ttcaaagcggtgttgagcggtgaagacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctgaaatatggtaccacatg 23877841  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  23877840 cat 23877838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 27367600 - 27367760
Alignment:
Q  156 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  27367600 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 27367699  T
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27367700 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 27367760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43693578 - 43693401
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  43693578 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 43693480  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43693479 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 43693401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 6744324 - 6744501
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  ||| |||  ||||| | |||||  || |||||    
T  6744324 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactggttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 6744422  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6744423 ggacttaggtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 6744501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22810084 - 22809901
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  22810084 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcaggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 22809985  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg 294  Q
     |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||    
T  22809984 ttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccctg 22809901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23264158 - 23263985
Alignment:
Q  140 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 237  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  23264158 gttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 23264059  T
Q  238 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||| || |||| |||   ||||||||| | | ||||||||||||    
T  23264058 cttatgtcctgaaaagaatgctttaatcattcgatagtggtgagggctccggccctgaatat-ggtaccacatgc 23263985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 271
Target Start/End: Original strand, 21073954 - 21074114
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggatt-agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  | ||| ||||||| ||||||  ||| |||    
T  21073954 gtatgtagatatacacaagtggattcaattgcataaccataaaagcgggagggcttcggccctggaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacacttgtt 21074053  T
Q  213 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 271  Q
      |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21074054 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacccatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 21074114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 19703456 - 19703615
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||  ||||||| ||||||  |||||||    
T  19703456 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 19703555  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
      |||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  19703556 gttcaaagcggtgtttatcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 19703615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20724236 - 20724011
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  20724236 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcaaaaaagcgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 20724137  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||    
T  20724136 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccac 20724038  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  20724037 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 20724011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23291129 - 23290904
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtac-tagt 211  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||| || | ||| ||||||| |||| |  || | ||    
T  23291129 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgaaacactttgt 23291030  T
Q  212 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| | | ||||||||    
T  23291029 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaacgaatgctttaaccattcgattagcggtgagggctccggccctgaatat-ggtaccac 23290931  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  23290930 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 23290904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24943460 - 24943419
Alignment:
Q  230 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 271  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24943460 ggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 24943419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23269276 - 23269201
Alignment:
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||| | | ||||||||||||    
T  23269276 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctgaatat-ggtaccacatgc 23269201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23276145 - 23276070
Alignment:
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||| | | ||||||||||||    
T  23276145 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctgaatat-ggtaccacatgc 23276070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 635635 - 635967
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa--gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggtt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  635635 gatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattggatggtgaatcatatat-atgtatatgtttaggtt 635733  T
Q  109 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  635734 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagtact 635833  T
Q  209 agttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  635834 agttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 635933  T
Q  308 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635934 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 635967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42701529 - 42701199
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  42701529 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-acgtatatgtctaggttg 42701432  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42701431 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 42701332  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42701331 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 42701232  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701231 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 42701199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 51601946 - 51602276
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  51601946 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-acgtatatgtctaggttg 51602043  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51602044 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 51602143  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51602144 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 51602243  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602244 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 51602276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 51607827 - 51608157
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  51607827 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-acgtatatgtctaggttg 51607924  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51607925 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 51608024  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51608025 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 51608124  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608125 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 51608157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 41799825 - 41800155
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| | ||| | || |||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  41799825 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtataagttggttggtgaatcatatat-acgtatatgtctaggttg 41799922  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41799923 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 41800022  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41800023 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 41800122  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800123 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 41800155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 53748625 - 53748954
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  53748625 gatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 53748721  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53748722 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 53748821  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53748822 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccac 53748921  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53748922 atgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 53748954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15533986 - 15533786
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  15533986 gtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 15533887  T
Q  214 ctcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15533886 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccacatgc 15533788  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  15533787 at 15533786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23121812 - 23121570
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  23121812 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaatgcctcgtcgttcaaagtggtgg 23121713  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  23121712 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt 23121613  T
Q  300 cggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
     ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23121612 -ggtaccacatgcatgagtgttgttagaggagtcttagtggagt 23121570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20940480 - 20940231
Alignment:
Q  95 tatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaa 194  Q
    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||  |||||    
T  20940480 tatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtgggagagcttcagctctggaacgccttgttgttcaa 20940381  T
Q  195 agtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 292  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| ||    
T  20940380 agtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacaacggtgagggctacggtcc 20940281  T
Q  293 tgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20940280 tgatttt-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 20940231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18212339 - 18212138
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  18212339 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 18212240  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  18212239 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatg 18212141  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  18212140 cat 18212138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14484642 - 14484400
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  14484642 taggttgggttgtatgtagatacacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 14484543  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |    
T  14484542 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat 14484443  T
Q  300 cggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  14484442 -ggtaccacatgtatgggtgttgttagtggagtcttagtggagt 14484400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11847230 - 11847053
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  11847230 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 11847131  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  11847130 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-tttatggtaccacatgcat 11847053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 17000131 - 17000373
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||    
T  17000131 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaagtggtgg 17000230  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||||||||| ||   |||| |||||||||    
T  17000231 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgagaacttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccattttacagcggtgaggactacggtcctgatttt 17000330  T
Q  300 cggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17000331 -ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 17000373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 8046897 - 8047074
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtg--gtgag 235  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||| | |  |||||    
T  8046897 tagtggcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcagtgag 8046995  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  8046996 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 8047074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 341
Target Start/End: Original strand, 4831090 - 4831293
Alignment:
Q  141 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 238  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4831090 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 4831189  T
Q  239 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 336  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | | ||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  4831190 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctgaatat-ggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 4831288  T
Q  337 ggagt 341  Q
    |||||    
T  4831289 ggagt 4831293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 341
Target Start/End: Original strand, 4834385 - 4834588
Alignment:
Q  141 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 238  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4834385 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 4834484  T
Q  239 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 336  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | | ||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  4834485 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctgaatat-ggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 4834583  T
Q  337 ggagt 341  Q
    |||||    
T  4834584 ggagt 4834588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 11171222 - 11171464
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |  || || ||||||||||    
T  11171222 taggttgagtggtatgtatatatacacaagtgggtcagttgcataaacataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttatcgtttaaagtggtgg 11171321  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| || |||||| |||  ||| |||||||| |    
T  11171322 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacggcggtgagggctacgaccctgattat 11171421  T
Q  300 cggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
     ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11171422 -ggtactacatgcatggttgttattagaggagtcttagtggagt 11171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 43284871 - 43285101
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||   || || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||  ||||||||||||||| |||||||     
T  43284871 gtatgtagatatacaagagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgttgttcaaagtggtggagcactagttg 43284970  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||| || | |||  |||| ||||||| | |||||||||||    
T  43284971 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctacagaggagagggctacggtcctgattat-ggtaccacatg 43285069  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43285070 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 43285101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15407113 - 15406955
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  15407113 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataaacatgaaagcgagagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 15407014  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15407013 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 15406955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14485713 - 14485552
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtac-tagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||  | | ||| ||||||| ||||||  || | |||    
T  14485713 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacaccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgtt 14485614  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga 271  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  14485613 gttcaaagcggtgattagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcga 14485552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13909813 - 13909502
Alignment:
Q  30 aatgtatgttgtacttaatggaaattcccta-aagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatact 128  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13909813 aatgtatgttgtatttaattaaaatttccttgaagttttaaattggatggtgaatcatatattatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatact 13909714  T
Q  129 caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtag 228  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909713 caagggg-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtag 13909615  T
Q  229 tggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagagga 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909614 tggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagagga 13909515  T
Q  329 gtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||    
T  13909514 gtcttagtggagt 13909502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13946758 - 13946447
Alignment:
Q  30 aatgtatgttgtacttaatggaaattcccta-aagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatact 128  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13946758 aatgtatgttgtatttaattaaaatttccttgaagttgtaaattggatggtgaatcatatattatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatact 13946659  T
Q  129 caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtag 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946658 caagggg-ttagttgcattaacataacagtgggagagtttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtag 13946560  T
Q  229 tggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagagga 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946559 tggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagagga 13946460  T
Q  329 gtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||    
T  13946459 gtcttagtggagt 13946447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44775504 - 44775174
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  44775504 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 44775407  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaagg-ggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44775406 gttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 44775307  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44775306 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 44775207  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775206 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 44775174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44780688 - 44780358
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  44780688 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 44780591  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaagg-ggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44780590 gttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 44780491  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44780490 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 44780391  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780390 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 44780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13940268 - 13939961
Alignment:
Q  30 aatgtatgttgtacttaatggaaattcccta-aagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatact 128  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  13940268 aatgtatgttgtatttaattaaaatttccttgaagttgtaaattggatggtgaatcatatattatgtatat----aggttggttggtatgtagatatact 13940173  T
Q  129 caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtag 228  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940172 caagggg-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtag 13940074  T
Q  229 tggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagagga 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940073 tggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagagga 13939974  T
Q  329 gtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||    
T  13939973 gtcttagtggagt 13939961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4677466 - 4677137
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  4677466 gatgaatggatgctgactgg-tgtatgttgtatataatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 4677370  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4677369 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 4677270  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4677269 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccac 4677170  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4677169 atgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 4677137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41175779 - 41175450
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  41175779 gatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 41175683  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41175682 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 41175583  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41175582 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccac 41175483  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41175482 atgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 41175450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41180917 - 41180588
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  41180917 gatgaatggatgctgactga-tgtgtgttgtatataatt-aaattcccttaaaggtgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttg 41180821  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41180820 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtact 41180721  T
Q  209 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41180720 agttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttatggtaccac 41180621  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41180620 atgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 41180588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 76 - 341
Target Start/End: Original strand, 8742848 - 8743113
Alignment:
Q  76 tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 174  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8742848 tggtgaatcatatat-atgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 8742946  T
Q  175 tggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8742947 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 8743046  T
Q  275 cggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8743047 cggtgtgggtcacggccctgaattttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 8743113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 76 - 341
Target Start/End: Original strand, 8761018 - 8761283
Alignment:
Q  76 tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 174  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761018 tggtgaatcatatat-atgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctc 8761116  T
Q  175 tggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761117 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacag 8761216  T
Q  275 cggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8761217 cggtgtgggtcacggccctgaattttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagt 8761283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12200454 - 12200176
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||    
T  12200454 gttgtaaattggagtggtgagtcatatat-acgtatatgcttaggttggttggtatgtagatatactcaagtgggtaagttgcataagcataacagtggg 12200356  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctt 260  Q
    |||||||| |||||||||    | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12200355 agagcttcagctctggaacaacttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctt 12200256  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12200255 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccacatgcatgggtgtttacaggagtcttagtggagt 12200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 16838466 - 16838705
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  16838466 taggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 16838565  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||||| |     
T  16838566 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaggct-acggtcctgattat- 16838663  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16838664 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggag 16838705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 14652680 - 14652921
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  14652680 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataatagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 14652779  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |     
T  14652780 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat- 14652878  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14652879 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 14652921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 16382844 - 16383085
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  16382844 taggttgggttgtgtgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcattacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 16382943  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||     
T  16382944 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt- 16383042  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16383043 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 16383085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12304949 - 12304763
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | |  | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  12304949 gtatgtagatatacacaggtgagtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 12304850  T
Q  214 ctcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12304849 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgatttt 12304763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 13203514 - 13203743
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  13203514 gtatgtagatatactcaagtgggttagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 13203613  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||| |||| |||  |||||||||||    
T  13203614 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttaggtcctgaaaatgaatgctttaactattctacagcggtgagggctacggtcctg-tttatggtaccacatg 13203712  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggag 340  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13203713 catgggtgttgttagaggagtcttagtggag 13203743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17157262 - 17157061
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  17157262 gtatgtagatatacacaagggggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 17157163  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17157162 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atacggtaccacatg 17157064  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  17157063 cat 17157061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9533027 - 9532849
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||  || ||||||    
T  9533027 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagtggtgtggagcggtgag 9532928  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  9532927 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 9532849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24191963 - 24191762
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  24191963 gtatgtagatatacacaagggggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 24191864  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  24191863 ttcaaagcggtgttgagcggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccccga-atacggtaccacatg 24191765  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  24191764 cat 24191762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 41456123 - 41456325
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  41456123 gtatgtagatatacacaggtgggatagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 41456222  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  41456223 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatg 41456322  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  41456323 cat 41456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 16802425 - 16802626
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||| ||  |||||||     
T  16802425 gtatgtagatatacacaagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagttg 16802524  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  16802525 ttcaaagcggtgttgagcggtgatgacttatgtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatg 16802623  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  16802624 cat 16802626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 337
Target Start/End: Original strand, 14544155 - 14544394
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||    
T  14544155 taggttgggttgtatgtagatatacacaagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 14544254  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    |  ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |    
T  14544255 aacactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctgattat 14544354  T
Q  300 cggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 337  Q
     ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14544355 -ggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 14544394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 8583294 - 8583471
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  8583294 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 8583392  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8583393 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 8583471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14084708 - 14084531
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  14084708 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 14084610  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14084609 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 14084531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14090109 - 14089932
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  14090109 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 14090011  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14090010 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 14089932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49399650 - 49399473
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  49399650 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 49399552  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  49399551 ggacttaggtcctggtgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 49399473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 24123203 - 24123380
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  24123203 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 24123301  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  24123302 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacgtgcat 24123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 13968850 - 13969010
Alignment:
Q  156 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  13968850 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 13968949  T
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13968950 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 13969010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 13974325 - 13974485
Alignment:
Q  156 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  13974325 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 13974424  T
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13974425 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 13974485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17190992 - 17190836
Alignment:
Q  159 gggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagt--ggtgaggacttatgtcctgttgagaat 256  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17190992 gggagagcttcggctctggaacgccttgtctttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgatcggtgaggacttatgtcctgatgagaat 17190893  T
Q  257 gctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17190892 gctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgaattt-ggtaccacatgcat 17190836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 341
Target Start/End: Original strand, 34852211 - 34852414
Alignment:
Q  141 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 238  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  34852211 ttgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 34852310  T
Q  239 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 336  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||| | | ||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  34852311 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacaacggtgagggctacggccctgaatat-ggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 34852409  T
Q  337 ggagt 341  Q
    |||||    
T  34852410 ggagt 34852414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Original strand, 16829943 - 16830065
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  16829943 taggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 16830042  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg 225  Q
    || ||||||| ||||||||||||    
T  16830043 agcactagttgctcaaagtggtg 16830065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14292906 - 14292674
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||| |||  |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| | ||||| |||||||     
T  14292906 gtatgtagaaatatacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcgttggagcactagttg 14292807  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||    
T  14292806 ctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctaaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccaca 14292708  T
Q  310 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    || |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  14292707 tgtatggatgttgttagaggagtcttagtggagt 14292674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 16830055 - 16830206
Alignment:
Q  191 tcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacg 288  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||    
T  16830055 tcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaggct-acg 16830153  T
Q  289 gccctgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggag 340  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16830154 gtcctgattat-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggag 16830206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23174358 - 23174189
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  23174358 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcaaaagcataaaagtgggagagcttcggctcttgaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 23174259  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 283  Q
     |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23174258 ttcaaagcggtgttagcggtgaggacttatgtcctg-aaaaaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 23174189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 271
Target Start/End: Original strand, 17199015 - 17199175
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacata-acagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| || |  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  17199015 gtatgtagatatacacaagtgggtcggttgcatagtcatatacagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 17199114  T
Q  213 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgt-tgagaatgctttaaccattcga 271  Q
      |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17199115 gttcaaagcggtgttagcggtgaggacttaggtcctgtaaaagaatgctttaaccattcga 17199175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Original strand, 31690570 - 31690659
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  31690570 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataaacataaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 31690659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 314
Target Start/End: Original strand, 12961378 - 12961580
Alignment:
Q  115 tatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttac 214  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||||||||  |||| || || || |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||      
T  12961378 tatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagtataaaagcggaagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgt 12961477  T
Q  215 tcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
    |||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  12961478 tcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggtttcggccctgattat-ggtaccacat 12961576  T
Q  311 gcat 314  Q
    ||||    
T  12961577 gcat 12961580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23173963 - 23173876
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtg 201  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||    
T  23173963 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 23173876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 17243680 - 17243815
Alignment:
Q  139 agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 236  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |  | ||| ||||||| ||||||  ||| |||  |||||| |||||  || |||||||    
T  17243680 agttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 17243779  T
Q  237 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 272  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  17243780 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgac 17243815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Original strand, 18719250 - 18719339
Alignment:
Q  252 agaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  18719250 agaatgctttaaccattcgataagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacatgcatgagtgttgtagaagagtcttagtggag 18719339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 314
Target Start/End: Original strand, 11850780 - 11850840
Alignment:
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  11850780 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctgaatat-ggtaccacatgcat 11850840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12255326 - 12255238
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  12255326 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagtataa-agcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 12255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18889053 - 18889009
Alignment:
Q  227 agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 271  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18889053 agtgatgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 18889009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 21678141 - 21678469
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttgg 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21678141 gatgaatggatgctgactgaatgaatgttgtatttaatt-aaattccttaacgttgtaagttggttggtgaatcatatat-atgtatatgtctaggttgg 21678238  T
Q  111 ttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21678239 ttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta 21678338  T
Q  210 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21678339 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 21678438  T
Q  310 tgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21678439 tgcatgggt-attagaggagtcttagtggagt 21678469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 17264667 - 17264998
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa--gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggtt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||    
T  17264667 gatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattggatggtgaatcatatataa-gtatatgtt-agatt 17264764  T
Q  109 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17264765 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtact 17264864  T
Q  209 agttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17264865 agttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 17264964  T
Q  308 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17264965 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 17264998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 17271149 - 17271480
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa--gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggtt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||    
T  17271149 gatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattggatggtgaatcatatataa-gtatatgtt-agatt 17271246  T
Q  109 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17271247 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtact 17271346  T
Q  209 agttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17271347 agttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcaacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 17271446  T
Q  308 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17271447 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 17271480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22175320 - 22174987
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaa--ttccctaaa-gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggt 107  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||  || | |||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  22175320 gatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaaatttacttaaacgttgtaagttggatggtgaatcatatat-atgtatatgtt-agat 22175223  T
Q  108 tggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaa-cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22175222 tggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttggtcgttcaaagtggtggagta 22175123  T
Q  207 ctagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtac 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22175122 ctagttactcaaagtggtgttagtggttaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtac 22175023  T
Q  306 cacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175022 cacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 22174987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9775718 - 9775467
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |  |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||    
T  9775718 gttgtaaattggagtggtgagtcatatat-acatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcatgagcataacagtggg 9775620  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctt 260  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9775619 agagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctt 9775520  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9775519 taaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctgatttt-ggtaccacatgcat 9775467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 37805292 - 37805492
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  37805292 gtatgtagatatacacaggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgtaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 37805391  T
Q  214 ctcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37805392 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctgatttt-ggtaccacatgc 37805490  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  37805491 at 37805492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 758216 - 758456
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  758216 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 758315  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcg 301  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | |    
T  758316 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-g 758414  T
Q  302 gtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  758415 gtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 758456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 22509126 - 22509374
Alignment:
Q  95 tatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaa 194  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| |||||    
T  22509126 tatatgtataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggatctggaacgccttgtcgttcaa 22509225  T
Q  195 agtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |     
T  22509226 agtggtggagtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtct 22509325  T
Q  293 tgattttcggtaccacatgcatgg-gtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  22509326 tgatttt-ggtaccacatgcatggtgttgttagaggagtcttagttgagt 22509374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 22312793 - 22313033
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  22312793 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 22312892  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |     
T  22312893 agcactagttgctcaaagtggtgtcagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat- 22312991  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22312992 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggag 22313033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19511177 - 19510999
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19511177 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19511078  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19511077 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 19510999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20937845 - 20937568
Alignment:
Q  65 tgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggag 163  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20937845 tgtaaatcggagtggtgagtcatatac-atatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggag 20937747  T
Q  164 agcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctt 260  Q
    |||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   | ||||||||    
T  20937746 agcttcggctgtggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcttgaaaatgaatgctt 20937647  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtgg 338  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20937646 taaccattctacatcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtgg 20937568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23527651 - 23527448
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcat-aaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  23527651 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 23527552  T
Q  213 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  23527551 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 23527452  T
Q  311 gcat 314  Q
    ||||    
T  23527451 gcat 23527448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 22439701 - 22439902
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || | ||| ||||||| |||| |  |||||||     
T  22439701 gtatgtagatatacataagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagctccggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgaaacactagttg 22439800  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  22439801 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatg 22439899  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  22439900 cat 22439902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 21675471 - 21675648
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  21675471 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 21675569  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  21675570 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatgcat 21675648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 1857520 - 1857680
Alignment:
Q  156 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  1857520 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 1857619  T
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1857620 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatgcat 1857680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10816949 - 10816746
Alignment:
Q  141 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 238  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10816949 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaattggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 10816850  T
Q  239 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 336  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| | |||| | | ||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  10816849 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacgacactgaatat-ggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 10816751  T
Q  337 ggagt 341  Q
    |||||    
T  10816750 ggagt 10816746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23538976 - 23538773
Alignment:
Q  141 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 238  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23538976 ttgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgacttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 23538877  T
Q  239 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 336  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||| | | ||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  23538876 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccatactacagcggtgagggctacggccctgaatat-ggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 23538778  T
Q  337 ggagt 341  Q
    |||||    
T  23538777 ggagt 23538773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 314
Target Start/End: Original strand, 23112827 - 23112914
Alignment:
Q  226 tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23112827 tagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgagggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 23112914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Original strand, 22007896 - 22007986
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataa-cagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  22007896 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataatcataataagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 22007986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 314
Target Start/End: Original strand, 24751647 - 24751707
Alignment:
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  24751647 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctgaatat-ggtaccacatgcat 24751707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27280496 - 27280165
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccctaaa--gttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggtt 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  27280496 gatgaatagatgctgactgaatgtatgttgtatttaattaaaattcacttaaatgttgtaaattggatggtgaatcatatat-atgtatatgtt-agatt 27280399  T
Q  109 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  27280398 ggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgctcggtcgttcaaagtggtggagtact 27280299  T
Q  209 agttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27280298 agttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 27280199  T
Q  308 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280198 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 27280165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 103 - 340
Target Start/End: Original strand, 3706727 - 3706967
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  3706727 taggttggattgtatgtagatatactcaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 3706826  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttc 300  Q
    || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||     
T  3706827 agcactaattgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt- 3706925  T
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3706926 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggag 3706967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 20438531 - 20438709
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  20438531 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 20438630  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  20438631 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 20438709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Original strand, 23066665 - 23066907
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  23066665 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 23066764  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||  |||||||||    
T  23066765 agcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggagagggctacgatcctgatttt 23066864  T
Q  300 cggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  23066865 -ggtaccacatgcatgggtgttgttagagttgtcttagtggagt 23066907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21542233 - 21542056
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  21542233 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 21542135  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21542134 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 21542056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 42095903 - 42096080
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  42095903 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 42096001  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42096002 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 42096080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 22448244 - 22448469
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggg----attagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta 209  Q
    |||||||||||||| |||| ||    |||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22448244 gtatgtagatatacacaagtgggtcaattaattgcataagcataaaagtagaagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcacta 22448343  T
Q  210 gttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22448344 gttgctcaaagtggtg--------aggacttatgtcctgtaaatgaatgctttaaccattcaacagcggtgagggctacggccctgattat-ggtaccac 22448434  T
Q  309 atgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22448435 atgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 22448469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20242735 - 20242503
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  20242735 gtatgtagatatacacaagtgggtcatttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 20242636  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  |||||| |||| ||||| ||||||||  |||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  20242635 ctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaatgaatgccttaatcattctacagcggttagggcttcggccttgatttt-ggtaccaca 20242537  T
Q  310 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20242536 tgcatgggtgttgttagagaagtcttagtggagt 20242503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 20045879 - 20046056
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  20045879 tagtttcataaacatca-agcgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 20045977  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  20045978 gacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattctacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 20046056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 19664105 - 19664306
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  19664105 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 19664204  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||   ||||||||| | | |||||||||||    
T  19664205 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctgaatat-ggtaccacatg 19664303  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  19664304 cat 19664306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32650304 - 32650074
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggatt-agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  | |||||    
T  32650304 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacattagtt 32650205  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
      |||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| | | ||||||||||    
T  32650204 gttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggctacggtcctgaatat-ggtaccacat 32650106  T
Q  311 gcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||| |  || | ||||||||||||||||||    
T  32650105 gcatgcgcattgttgaggagtcttagtggagt 32650074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41111016 - 41110814
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  ||||||      
T  41111016 gtatgtagatatacacaggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtcg 41110917  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||    
T  41110916 ttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcatgctgagaatgctttaaccattcgacaatggtgtgggtcatgaccctgaattatggtatcacatg 41110817  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  41110816 cat 41110814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 341
Target Start/End: Original strand, 955118 - 955248
Alignment:
Q  215 tcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  955118 tcaaagtggtgtttagtggtgagggcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagtggtgagggctacggtcctgatttt-ggtaccacatg 955216  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  955217 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 955248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 19778434 - 19778639
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  19778434 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 19778533  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
      ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||||| | |||||||    
T  19778534 gttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctgattat-ggtacca 19778632  T
Q  308 catgcat 314  Q
    |||||||    
T  19778633 catgcat 19778639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 29554419 - 29554645
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggatt-agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || || || ||||| ||| |||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  29554419 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 29554518  T
Q  213 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||| ||| |||   ||||||||||| | ||||||||    
T  29554519 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcagtgagggcttcggccctgattat-ggtaccac 29554617  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    |||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  29554618 atgcattgg----tagaggagtcttagtggag 29554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Original strand, 955032 - 955128
Alignment:
Q  105 ggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtg 201  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| || | ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  955032 ggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagtagcatgagcataaaagtggaagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtg 955128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36615015 - 36614935
Alignment:
Q  230 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  36615015 ggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggtttcggccctg--ttttggtaccacatgcat 36614935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24079634 - 24079551
Alignment:
Q  230 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24079634 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacatgcat 24079551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Original strand, 24109120 - 24109203
Alignment:
Q  230 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24109120 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacatgcat 24109203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40804 - 40549
Alignment:
Q  11 gatgaatggatgatgactgaatgtatgttgtacttaatggaaattccct-aaagttgtaaatcggatggtgactcatatattatgtatatgtttaggttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||  ||||| ||| |||| ||||| | |  |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  40804 gatgaatggatgttgactga-tgtgtgttgtatataattaaaatttccttaaagatgtaagttgattggtgaatcatatat-atgtatatgtataggttg 40707  T
Q  110 gttggtatgtagatatactcaa-ggggattagttgcat-aaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtac 207  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40706 gttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaaacataacagtggaagagcttcggctctggaatgcttggtcgttcaaagtggtggagtac 40607  T
Q  208 tagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaacc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40606 tagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaacc 40549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 36793 - 36994
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  36793 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 36892  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  36893 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgattat-ggtaccacatg 36991  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  36992 cat 36994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 341
Target Start/End: Original strand, 8493 - 8565
Alignment:
Q  269 cgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8493 cgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggggtttagaggagtcttagtggagt 8565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Original strand, 43965 - 44057
Alignment:
Q  112 tggtatgtagatatactcaaggggattag-ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  43965 tggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcattaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 44057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Original strand, 14421 - 14702
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||  || ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| ||||||    
T  14421 gttgtaaattggagtggtgagtcatatac-atatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtggg 14519  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgct 259  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  14520 agagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgct 14619  T
Q  260 ttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14620 ttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 14702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 279
Target Start/End: Original strand, 7178 - 7356
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  7178 taggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggacagttggataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 7277  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggt-gtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtg 279  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7278 agcactagttgctcaaagtggtattagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 141577 - 141297
Alignment:
Q  63 gttgtaaatcgga-tggtgactcatatattatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtggg 161  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |  ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||||||    
T  141577 gttgtaaattggagtggtgagtcatatat-acatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtggg 141479  T
Q  162 agagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctt 260  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||||||    
T  141478 agagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctt 141379  T
Q  261 taaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  141378 taaccattctacagcggtgagggcttcggtcctgattat-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 141297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 146742 - 146611
Alignment:
Q  141 ttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtgg--tgtagtggtgaggac 238  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  146742 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcgtctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtttttagtggtgaggac 146643  T
Q  239 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  146642 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 265311 - 265071
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  265311 taggttgggtggtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 265212  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcg 301  Q
     | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| | |    
T  265211 ggcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaaggctacggtcctgattat-g 265113  T
Q  302 gtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  265112 gtaccacatgcatgggtgttgttagaagagtcttagtggagt 265071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 258885 - 258645
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  258885 taggttgggtggtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 258786  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcg 301  Q
     | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| | |    
T  258785 ggcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacatatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaaggctacggtcctgattat-g 258687  T
Q  302 gtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  258686 gtaccacatgcatgggtgttgttagaagagtcttagtggagt 258645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42132 - 41902
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  42132 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 42033  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | |||||||||||    
T  42032 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatg 41934  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41933 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 41902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 63169 - 63399
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||| |||||||     
T  63169 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagttg 63268  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | |||||||||||    
T  63269 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatg 63367  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  63368 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 63399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 314
Target Start/End: Original strand, 12876 - 13054
Alignment:
Q  137 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtg--gtga 234  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||  || ||||  |||||| ||||||| |  ||||    
T  12876 ttagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacaagttgttcaaagcggtgtagagcggtga 12975  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  12976 ggacttaggtcctgataagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggacctgattat-ggtaccacatgcat 13054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Original strand, 124446 - 124677
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  |||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||     
T  124446 gtatgtagatataaacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttctgacctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttg 124545  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||    
T  124546 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgataagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccaca 124644  T
Q  310 tgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  124645 tgcatgagtattgtagaggagtcttagtggagt 124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 339
Target Start/End: Original strand, 6006 - 6235
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  6006 gtatgtagatatacataagtgggttagttacataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 6105  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||    
T  6106 ctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacat 6204  T
Q  311 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtgga 339  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6205 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtgga 6235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 4275 - 4458
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||| ||     
T  4275 gtatgtagatatacacaagtggattagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactaattg 4374  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 295  Q
     ||| || |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4375 ttcacagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 4458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 15432 - 15615
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||     
T  15432 gtatgtagatatacacaagggggttagttgcacaagcataaaagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcattcaaagcggtggaacactagttg 15531  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 295  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15532 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga 15615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 71291 - 71155
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| |  | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  71291 gtatgtagatatacacaagtgtgtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 71192  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg 248  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  71191 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctg 71155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 152562 - 152332
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||     
T  152562 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttg 152463  T
Q  214 ctcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||| |||| | || |||  |||| ||||||| | |||||||||||    
T  152462 ctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgattgctttaaccattctacagtgttgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatg 152364  T
Q  312 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  152363 catggttgttgttagaggagtcttagtggagt 152332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 174561 - 174738
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  174561 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 174659  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  174660 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 174738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 4594 - 4795
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  4594 gtatgtagatatacataagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 4693  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  4694 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaacaattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatg 4792  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  4793 cat 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 341
Target Start/End: Original strand, 50948 - 51177
Alignment:
Q  115 tatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttac 214  Q
    ||||||||||||| ||||  | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||||||||| ||||||| |    
T  50948 tatgtagatatacacaagtaggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagttgc 51047  T
Q  215 tcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  51048 tcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaacgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgattat-ggtaccacatgc 51146  T
Q  313 atgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51147 atgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 51177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14228 - 13979
Alignment:
Q  95 tatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaa 194  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||    
T  14228 tatatgtataggttaggttgtatgtagatatacacaagggggttagttgcataaacatagaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaa 14129  T
Q  195 agtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| || | |||| |||  |||| ||    
T  14128 agtggtggagcactcgttgctcaaagtggtgttagtggcgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctaccgaggtgagggctacggtcc 14029  T
Q  293 tgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  14028 tga-tttcgataccacatgcatgggtgttgttagcggagtcttagtggagt 13979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24429 - 24180
Alignment:
Q  95 tatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaa 194  Q
    ||||||| |||||| | | |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| || | ||| |||||    
T  24429 tatatgtataggttaggttgtatgtggatatacacaaggcggttagttgcataagcatagaagtggaagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaa 24330  T
Q  195 agtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 292  Q
    |||||||||| |||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||    
T  24329 agtggtggagcactcattcctcaaagtggtgttagtggcgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagaggtgagggctacggtcc 24230  T
Q  293 tgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  24229 tgattat-ggtaccagatgcatgggtgttgttagcggagtcttagtggagt 24180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 10234 - 10435
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    ||||||||||||||  ||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  10234 gtatgtagatatacataagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcagctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 10333  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  10334 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaatat-ggtaccacatg 10432  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  10433 cat 10435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 110935 - 110758
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||| | |||||  || ||||||    
T  110935 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaatgcggtgtggagcggtgag 110837  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  110836 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 110758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 116861 - 116793
Alignment:
Q  246 ctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  116861 ctgttaagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 116793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10543 - 10312
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| | ||  | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  10543 gtatgtagatatacacgagtcggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactggttg 10444  T
Q  214 ctcaaagtg--gtgtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  10443 ctcaaagtgatgtttagtgatgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctgattat-ggtaccacat 10345  T
Q  311 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10344 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 337
Target Start/End: Original strand, 47376 - 47615
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||    
T  47376 taggttgggttgtatgtagatatacacaagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 47475  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |    
T  47476 agcactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctgattat 47575  T
Q  300 cggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 337  Q
     ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  47576 -ggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 47615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 337
Target Start/End: Original strand, 62796 - 63035
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||    
T  62796 taggttgggttgtatgtagatatacacaagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 62895  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    || ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |    
T  62896 agcactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctgattat 62995  T
Q  300 cggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 337  Q
     ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  62996 -ggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 63035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 337
Target Start/End: Original strand, 56410 - 56649
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||    
T  56410 taggttgggttgtatgtagatatacacaagagggtcagttgcataagcataaaagtgggagagattcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 56509  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 299  Q
    |  ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |    
T  56510 aacactagttgctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctgattat 56609  T
Q  300 cggtaccacatgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 337  Q
     ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  56610 -ggtaccacatgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 56649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 343
Target Start/End: Original strand, 14536 - 14778
Alignment:
Q  103 taggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||| |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||    
T  14536 taggttgggttgtatgtagatatacataagtgagtcagttgaataagcataacagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtgg 14635  T
Q  203 agtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcg 301  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||| ||  ||  |||| ||||| | | |    
T  14636 agcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaatgaatgttttaaccattctacagcgatgatggctacggtcctgaatat-g 14734  T
Q  302 gtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtag 343  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14735 ataccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtag 14778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 174561 - 174739
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  | |||| |||||  || ||||||    
T  174561 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttaaaagcggtgtggagcggtgag 174660  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||    
T  174661 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccaagaattatggtaccacatgcat 174739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 489304 - 489127
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  489304 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 489206  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  489205 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagtgttgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 489127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 9649 - 9809
Alignment:
Q  156 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| ||||| |||||    
T  9649 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctattgag 9748  T
Q  254 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  9749 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 9809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38578 - 38401
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  38578 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 38480  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38479 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 38401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 35546 - 35723
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  35546 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 35644  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35645 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 35723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 30162 - 30322
Alignment:
Q  156 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  30162 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 30261  T
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30262 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 30322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 293
Target Start/End: Original strand, 51676 - 51858
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||  | |||||     
T  51676 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctttggaacgccttgtcattcaaagcggtggaacagtagttg 51775  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccct 293  Q
     |||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||    
T  51776 ttcaaagcggtgtttagcggtgagggcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccct 51858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 46979 - 47156
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  46979 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 47077  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47078 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 47156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 52384 - 52561
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 234  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  52384 tagttgcataa-catcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 52482  T
Q  235 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52483 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 52561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2743 - 2566
Alignment:
Q  138 tagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 235  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||| ||||||  || ||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  2743 tagttgcataagcatcaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacaccagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 2644  T
Q  236 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2643 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattat-ggtaccacatgcat 2566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29948 - 29748
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  ||| |||     
T  29948 gtatgtagatatacacaagtgggt-agttgtctaagcataaaagtgggagagctttggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttg 29850  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatg 311  Q
     ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  29849 ttcaaagtggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggttacggccctgattat-ggtaccacatg 29751  T
Q  312 cat 314  Q
    |||    
T  29750 cat 29748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5350 - 5119
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  5350 gtatgtagatatacacaagagggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 5251  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacat 310  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||    |||||| ||| | ||||||||||    
T  5250 ttcaaagcggtgtatagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctttggccctaattat-ggtaccacat 5152  T
Q  311 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5151 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 5119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 143 - 314
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  143 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttg 242  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 283  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  243 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10400 - 10217
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||| ||||||| |||  || ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||| ||  |||||||     
T  10400 gtatgtggatatacacaaatgggttagtcgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagttg 10301  T
Q  214 ctcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 295  Q
     |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10300 ttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctga 10217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 341
Target Start/End: Original strand, 15511 - 15670
Alignment:
Q  185 agtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 282  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  15511 agtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacgattctacagcggtgagg 15610  T
Q  283 gtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15611 gctacggtcctgattat-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 15670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3123 - 3058
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaa 179  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  3123 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggctctggaa 3058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 15454 - 15510
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcg 170  Q
    |||||||||||||| | || || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15454 gtatgtagatatacacgagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcg 15510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20629
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||||     
T  20493 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggagtactagttg 20592  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg 248  Q
    ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20593 ctcaacgcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctg 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 1
Alignment:
Q  156 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||        |||||||| |||||||||||||    
T  132 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaagcggtg--------aggacttaggtcctgttgagaa 41  T
Q  256 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcctga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17688 - 17447
Alignment:
Q  105 ggttggttggtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggag 204  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  17688 ggttgggttgtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggaaagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggag 17589  T
Q  205 tactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcg 301  Q
     |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||| || |||   |||||| |||| | |    
T  17588 cactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcgatgagggcttcggccccgattat-g 17490  T
Q  302 gtaccacatgcat---gggtgtttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    |||||||||||||   || || ||||| |||||||||||||||    
T  17489 gtaccacatgcatgagggttgattagaagagtcttagtggagt 17447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 343
Target Start/End: Original strand, 4981 - 5216
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtac-tagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| || | |||    
T  4981 gtatgtagatatacacaagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggagcactttgtt 5080  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccaca 309  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||    
T  5081 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccaca 5179  T
Q  310 tgcat---gggtgtttagaggagtcttagtggagtag 343  Q
    |||||   || || |||||||| ||||||||||||||    
T  5180 tgcatgagggttgattagaggaatcttagtggagtag 5216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 314
Target Start/End: Original strand, 5 - 131
Alignment:
Q  190 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcac 287  Q
    ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5 ttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgataatgctttaaccattcgacagcggtgtggatcac 104  T
Q  288 ggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  105 ggccctggattatggtaccacatgcat 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
Q  137 ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtgg 223  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  87 ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgctttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 41592 - 41750
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||| ||||||  |||||||     
T  41592 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttaaaagcggtggaacactagttg 41691  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
     |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  41692 ttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 41750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3718 - 3629
Alignment:
Q  253 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3718 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgatttt-ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 3629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8615 - 8410
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  8615 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 8516  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtacca 307  Q
      ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||||| | |||||||    
T  8515 gttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctgattat-ggtacca 8417  T
Q  308 catgcat 314  Q
    |||||||    
T  8416 catgcat 8410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 326975 - 326816
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  326975 gtatgtagatatacacaaggggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 326876  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  326875 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 326816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 321266 - 321040
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || || | |||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  321266 gtatgtagatatacacaaggggagtttgttgcataagcacaaaaatgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 321167  T
Q  213 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||    
T  321166 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctgattat-ggtaccac 321068  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    |||||    | | |||||||||||||||||||    
T  321067 atgca----tttgtagaggagtcttagtggag 321040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 115911 - 115778
Alignment:
Q  140 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 237  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||| | |||||| || | ||| ||||||| ||||||  ||  |||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  115911 gttgcataagcataaaagcgggagggcttcgaccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacccgttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 115812  T
Q  238 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 271  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  115811 cttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 115778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7451 - 7293
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| || ||||||  ||||| ||    
T  7451 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcatagcggtggaacactagata 7352  T
Q  214 ctcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
     |||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||    
T  7351 ttcaaagcggtgtttagtggtaaggacttatatcctgaaaatgaatgctttaaccattc 7293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 271
Target Start/End: Original strand, 102930 - 103063
Alignment:
Q  140 gttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 237  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  102930 gttgcataagcataaaagcgggagagcttcggccctggaacgagttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 103029  T
Q  238 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 271  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  103030 cttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 103063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 392 - 550
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||||  |||||||     
T  392 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaatcggtggaacactagttg 491  T
Q  214 ctcaaagtg--gtgtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
     |||||| |  || ||| | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  492 ttcaaagcggagtttagcgatgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 269
Target Start/End: Original strand, 16914 - 17072
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtta 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||  |||||  |||||||     
T  16914 gtatgtagatatacacaagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttg 17013  T
Q  214 ctcaaa--gtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 269  Q
     |||||  |  || ||| ||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  17014 ttcaaaacggagtttagcggtgaggccttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 17072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27945
Alignment:
Q  152 taacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgt- 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||  || ||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |     
T  27781 taacagcgggagagcttcggctctggaacggcttgtcgttcaaagtggtggaacacgagttgttcaaagcggtgttagcgatgaggacttatgtcctata 27880  T
Q  250 tgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcat 314  Q
      ||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27881 aaagaatgctttaaccattcgaatagcggtgagggctccggccctgattat-ggtaccacatgcat 27945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28065 - 27840
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtactagtt 212  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  28065 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 27966  T
Q  213 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||    
T  27965 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccac 27867  T
Q  309 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 340  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  27866 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 27840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 340
Target Start/End: Original strand, 13504 - 13620
Alignment:
Q  226 tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccacatgcatgggtgtt-t 322  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  13504 tagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctgattat-ggtaccacatgcatgagtgttgt 13602  T
Q  323 agaggagtcttagtggag 340  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13603 agaagagtcttagtggag 13620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 337
Target Start/End: Original strand, 16021 - 16250
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggatt-agttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtggagtacta-gt 211  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || || ||  |||| ||| |||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||  ||    
T  16021 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcaggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgt 16120  T
Q  212 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgattttcggtaccac 308  Q
    |  |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||| |||  |||||||||| | | ||||||||    
T  16121 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaagcattcgaatagcggtgagggctacggccctgaatat-ggtaccac 16219  T
Q  309 atgcatggg--tgtttagaggagtcttagtg 337  Q
    ||||||| |  | | ||||||||||||||||    
T  16220 atgcatgagcatttgtagaggagtcttagtg 16250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 341
Target Start/End: Original strand, 78539 - 78581
Alignment:
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  78539 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 78581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 56065 - 55975
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  56065 gtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacacaaaagcgggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 55975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16954 - 16913
Alignment:
Q  301 ggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16954 ggtaccacatgcatgagtgttgtagaggagtcttagtggagt 16913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17095 - 17006
Alignment:
Q  114 gtatgtagatatactcaaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  17095 gtatgtagatatatacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggcgctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 17006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Original strand, 1027 - 1119
Alignment:
Q  112 tggtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  1027 tggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8055
Alignment:
Q  112 tggtatgtagatatactcaagggga-ttagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcattcaaagtggtgga 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  7963 tggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University