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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16904_low_59 (Length: 315)

Name: NF16904_low_59
Description: NF16904
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16904_low_59
NF16904_low_59
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (44-299)||(41900053-41900308)
chr2 (44-294)||(41900250-41900500)
chr2 (98-294)||(41900442-41900638)
chr2 (96-261)||(41899851-41900016)
chr2 (44-263)||(41899897-41900116)
chr2 (98-186)||(41899830-41899918)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (44-263)||(24470440-24470659)
chr4 (49-263)||(24421256-24421470)
chr4 (56-225)||(24420526-24420695)
chr4 (49-262)||(24470253-24470466)
chr4 (53-225)||(24470928-24471100)
chr4 (107-263)||(24477393-24477549)
chr4 (96-263)||(24421112-24421279)
chr4 (113-263)||(24420536-24420686)
chr4 (44-263)||(24470871-24471090)
chr4 (98-263)||(24420680-24420845)
chr4 (44-161)||(24421166-24421283)
chr4 (96-221)||(24477579-24477704)
chr4 (164-272)||(24420335-24420443)
chr4 (96-263)||(24420824-24420991)
chr4 (44-263)||(24420968-24421187)
chr4 (107-249)||(24477599-24477741)
chr4 (44-240)||(24470632-24470828)
chr4 (164-252)||(24471183-24471271)
chr4 (96-263)||(24470636-24470803)
chr4 (101-263)||(24420632-24420794)
chr4 (44-86)||(24481508-24481550)
chr4 (98-263)||(24420920-24421085)
chr4 (48-237)||(24470971-24471160)
chr4 (97-166)||(24482187-24482256)
chr4 (167-237)||(24420466-24420536)
chr4 (96-246)||(24470732-24470881)
chr4 (209-263)||(24477075-24477129)
chr4 (98-198)||(24406496-24406596)
chr4 (44-72)||(24477392-24477420)
chr4 (122-166)||(24481851-24481895)
[»] scaffold0879 (6 HSPs)
scaffold0879 (96-263)||(4495-4662)
scaffold0879 (107-263)||(4458-4614)
scaffold0879 (44-263)||(4587-4806)
scaffold0879 (44-161)||(4491-4608)
scaffold0879 (173-263)||(4428-4518)
scaffold0879 (98-263)||(4689-4854)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (98-237)||(11879442-11879581)
chr1 (98-237)||(11902134-11902273)
chr1 (98-159)||(11901921-11901982)
chr1 (98-222)||(11902086-11902210)
chr1 (138-246)||(11879434-11879542)
chr1 (98-234)||(11902038-11902174)
chr1 (164-234)||(52821110-52821180)
chr1 (97-266)||(52821222-52821391)
chr1 (98-159)||(52821572-52821633)
chr1 (97-225)||(52821311-52821439)
[»] scaffold1918 (2 HSPs)
scaffold1918 (98-213)||(286-401)
scaffold1918 (98-191)||(425-518)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41900308 - 41900053
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41900308 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 41900209  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 243  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41900208 tgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 41900109  T
Q  244 caaatctcccccgccaccatatgcatcactacccctttcttatgtctacaactctc 299  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41900108 caaatctcctccaccaccatatgcatcgctacccctttcttatgtctacaactctc 41900053  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41900500 - 41900250
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41900500 tatgtctataagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttata 41900401  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 243  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41900400 tttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtcta 41900301  T
Q  244 caaatctcccccgccaccatatgcatcactacccctttcttatgtctacaa 294  Q
    ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41900300 caagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaa 41900250  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900442
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccatatgcatcactacccctttcttatgtctacaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41900538 aatctcctccacctccctctccatcaccacaacctaagtatgtctataagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaa 41900442  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41900016 - 41899851
Alignment:
Q  96 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| || ||||  ||    
T  41900016 tctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgta 41899917  T
Q  196 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccacc 261  Q
    ||| |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  41899916 caagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccacc 41899851  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41900116 - 41899897
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || || || || ||||| || || || ||||    
T  41900116 tatgtttacaaatctcctccaccaccatatgcatcgctacccctttcttatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatg 41900017  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 243  Q
    | |||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||| || ||||||||||  ||    
T  41900016 tctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgta 41899917  T
Q  244 caaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||| ||||| || |||||||    
T  41899916 caagtctcctcccccaccat 41899897  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41899918 - 41899830
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccacc 186  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  41899918 tacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccacc 41899830  T

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Target: chr4 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 24470440 - 24470659
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||  ||||   | ||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24470440 tatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatg 24470539  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 243  Q
    | |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  24470540 tctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtcta 24470639  T
Q  244 caaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||| ||||| || |||||||    
T  24470640 caagtctcctcctccaccat 24470659  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24421470 - 24421256
Alignment:
Q  49 ctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtac 148  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| | | | ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  24421470 ctacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctac 24421371  T
Q  149 aagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaat 248  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24421370 aagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 24421271  T
Q  249 ctcccccgccaccat 263  Q
    |||| || |||||||    
T  24421270 ctcctcctccaccat 24421256  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24420695 - 24420526
Alignment:
Q  56 tctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcac 155  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| | | | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| |    
T  24420695 tctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtccc 24420596  T
Q  156 caccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcacc 225  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24420595 ctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacc 24420526  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 24470253 - 24470466
Alignment:
Q  49 ctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtac 148  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| | | | ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  24470253 ctacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctac 24470352  T
Q  149 aagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaat 248  Q
    ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24470353 aagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagt 24470452  T
Q  249 ctcccccgccacca 262  Q
    |||| || ||||||    
T  24470453 ctcctcctccacca 24470466  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 225
Target Start/End: Original strand, 24470928 - 24471100
Alignment:
Q  53 aagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagt 152  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| | | | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  24470928 aagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagt 24471027  T
Q  153 caccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcacc 225  Q
    | || || | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24471028 cccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacc 24471100  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24477549 - 24477393
Alignment:
Q  107 ccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctc 206  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||    
T  24477549 ccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctc 24477450  T
Q  207 cacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    | |  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24477449 ctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 24477393  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24421279 - 24421112
Alignment:
Q  96 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 195  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  24421279 tctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtcta 24421180  T
Q  196 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||    
T  24421179 caagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccat 24421112  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24420686 - 24420536
Alignment:
Q  113 ccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctc 212  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||| | ||||||||||||||||  || || || ||||| || || || |||||||| || || ||||| ||||    
T  24420686 ccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctc 24420587  T
Q  213 cctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24420586 cttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccat 24420536  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 24470871 - 24471090
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| | ||| | | | ||| | || ||||| || || ||| |||| || ||||||||||| || |||     
T  24470871 tatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatata 24470970  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 243  Q
    | ||||||||||||||||  || || || ||||| || || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24470971 tctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 24471070  T
Q  244 caaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  24471071 caaatctcctcccccaccat 24471090  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24420845 - 24420680
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||| | || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  24420845 tacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttaca 24420746  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    | || || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  24420745 agtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccat 24420680  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24421283 - 24421166
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||   ||||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24421283 tatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatg 24421184  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccac 161  Q
    | ||||||||||||||||    
T  24421183 tctacaagtcaccaccac 24421166  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24477704 - 24477579
Alignment:
Q  96 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 195  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| || ||  |||||||    
T  24477704 tctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtcta 24477605  T
Q  196 caaatctcctccacctccctctcctt 221  Q
    |||||| || || ||||| |||||||    
T  24477604 caaatcaccacctcctccgtctcctt 24477579  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24420443 - 24420335
Alignment:
Q  164 ccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  24420443 ccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttacaagtctccacctccaccat 24420344  T
Q  264 atgcatcac 272  Q
     | ||||||    
T  24420343 ctccatcac 24420335  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24420991 - 24420824
Alignment:
Q  96 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 195  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24420991 tctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtata 24420892  T
Q  196 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
     || || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  24420891 taagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccat 24420824  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24421187 - 24420968
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||  |||| | ||| | | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  24421187 tatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatata 24421088  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 243  Q
    | |||||||| || || |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||    
T  24421087 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtcta 24420988  T
Q  244 caaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||| || || || |||||||    
T  24420987 caagtcaccacctccaccat 24420968  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477599
Alignment:
Q  107 ccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctc 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  207 cacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatc 249  Q
    ||||||| ||||  || || ||||||||| |||| ||||||||    
T  24477641 cacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatc 24477599  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Original strand, 24470632 - 24470828
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |  ||||   | || || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  24470632 tatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatg 24470731  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgt 240  Q
    | |||||||||||||| |  || || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||    
T  24470732 tctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgt 24470828  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 252
Target Start/End: Original strand, 24471183 - 24471271
Alignment:
Q  164 ccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcc 252  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  24471183 ccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctccttatatttacaagtctcc 24471271  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 24470636 - 24470803
Alignment:
Q  96 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 195  Q
    |||||||||| || || |||||||| || || || || || || ||| | || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24470636 tctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtcta 24470735  T
Q  196 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||| || || || || || || || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24470736 caagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccat 24470803  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24420794 - 24420632
Alignment:
Q  101 aagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaat 200  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||| |  || ||||| || || || || || || || || ||||    
T  24420794 aagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaat 24420695  T
Q  201 ctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||| || || || |||||||    
T  24420694 ctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccat 24420632  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24481550 - 24481508
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccc 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24481550 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacccc 24481508  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24421085 - 24420920
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || || || || ||||| || || ||||||||||  || ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  24421085 tacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctaca 24420986  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    | || || || || || || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24420985 agtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccat 24420920  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 24470971 - 24471160
Alignment:
Q  48 tctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgta 147  Q
    |||||||||| || || ||||||||  | |||| ||||| | | ||| |||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  24470971 tctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 24471070  T
Q  148 caagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 237  Q
    ||| || || || |  || ||||| |||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  24471071 caaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24471160  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24482256 - 24482187
Alignment:
Q  97 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatcct 166  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||| ||||    
T  24482256 ctacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacctcct 24482187  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24420536 - 24420466
Alignment:
Q  167 tctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 237  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  24420536 tctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 24470732 - 24470881
Alignment:
Q  96 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 195  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24470732 tctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtata 24470831  T
Q  196 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaa 246  Q
     || || || || ||||| ||||| || || || || ||||||||||||||    
T  24470832 taagtcaccacctcctccatctccctctcctcc-ccaccatatgtttacaa 24470881  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24477129 - 24477075
Alignment:
Q  209 cctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24477129 cctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccat 24477075  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24406596 - 24406496
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || ||||| || || || ||| ||||||    
T  24406596 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctaca 24406497  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  24406496 a 24406496  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24477420 - 24477392
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatc 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24477420 tatgtctacaagtctcctcctccaccatc 24477392  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24481895 - 24481851
Alignment:
Q  122 ccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatcct 166  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24481895 ccatcaccacctcctccatatgtgtacaagtcacccccacctcct 24481851  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 6)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 4495 - 4662
Alignment:
Q  96 tctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtcta 195  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  4495 tctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtcta 4594  T
Q  196 caaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||| || || ||||| || || || || ||||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||    
T  4595 caagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccat 4662  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Original strand, 4458 - 4614
Alignment:
Q  107 ccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctc 206  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || || |  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  4458 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccac 4557  T
Q  207 cacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccat 4614  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 4587 - 4806
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||  |||| | ||| | | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  4587 tatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatata 4686  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgttta 243  Q
    | |||||||| || || |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||    
T  4687 tatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtcta 4786  T
Q  244 caaatctcccccgccaccat 263  Q
    ||| || || || |||||||    
T  4787 caagtcaccacctccaccat 4806  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Original strand, 4491 - 4608
Alignment:
Q  44 tatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||   | ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  4491 tatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatg 4590  T
Q  144 tgtacaagtcaccaccac 161  Q
    | ||||||||||||||||    
T  4591 tctacaagtcaccaccac 4608  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Original strand, 4428 - 4518
Alignment:
Q  173 tcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4428 tcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccat 4518  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 4689 - 4854
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || || || || ||||| || || ||||||||||  || ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  4689 tacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctaca 4788  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccat 263  Q
    | || || || || || || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  4789 agtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccat 4854  T

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Target: chr1 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||| |||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 237  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Original strand, 11902134 - 11902273
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  || || || || || || ||||| ||    ||||    
T  11902134 tacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccatactattaca 11902233  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 237  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11902234 agtctcctccaccaccctcgccttccccaccgccaccata 11902273  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Original strand, 11901921 - 11901982
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccacc 159  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11901921 tacaagtccccaccaccgccgtctccctcaccacctcctccttatgtgtataagtcaccacc 11901982  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Original strand, 11902086 - 11902210
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || || || || || ||||    
T  11902086 tacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtaca 11902185  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttc 222  Q
    | || || ||||| ||||| |||||    
T  11902186 agtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 246
Target Start/End: Original strand, 11879434 - 11879542
Alignment:
Q  138 cttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||  |||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  11879434 cttatgagtacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctcctta 11879533  T
Q  238 tgtttacaa 246  Q
    ||| |||||    
T  11879534 tgtgtacaa 11879542  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 234
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||| |||||||||||| |  | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||  | || || ||||| ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  198 aatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctcc 234  Q
    | || || |||||||| || || ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52821180 - 52821110
Alignment:
Q  164 ccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctcc 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  52821180 ccttctccctcacctccaccaccttactactacaagtctcctccaccaccctctccctcacctccacctcc 52821110  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52821391 - 52821222
Alignment:
Q  97 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctac 196  Q
    ||||||||| || |||||||| || || ||||| || || |||||    ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||   |||     
T  52821391 ctacaagtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccttcaccttcacctcctccaccttactactat 52821292  T
Q  197 aaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccatatgtttacaaatctcccccgccaccatatg 266  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || || || ||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  52821291 aaatctcctcctccaccctctccctcccctcctccaccttactattacaagtctcccccaccaccatatg 52821222  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52821633 - 52821572
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccacc 159  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  52821633 tacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacc 52821572  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52821439 - 52821311
Alignment:
Q  97 ctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctac 196  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||    ||||||||||| ||||  || |||||||||||||| || || ||   ||||    
T  52821439 ctacaagtccccaccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccctctccctcacctccacctccttactactac 52821340  T
Q  197 aaatctcctccacctccctctccttcacc 225  Q
    || || |||||||| || || ||||||||    
T  52821339 aagtcacctccaccaccttcaccttcacc 52821311  T

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Target: scaffold1918 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1918
Description:

Target: scaffold1918; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 286
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctaca 197  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| | ||  | ||||    
T  401 tacaagtcacccccaccaccatcaccatcaccaccaccaccttacatttacaagtcaccaccgcctccctcaccgtcacctccaccatcttacatttaca 302  T
Q  198 aatctcctccacctcc 213  Q
    ||||||| ||||||||    
T  301 aatctccaccacctcc 286  T

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Target: scaffold1918; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 518 - 425
Alignment:
Q  98 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgtacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatg 191  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||  | |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||    
T  518 tacaagtcacccccacctccatcaccatcacctccaccaccttacatttacaagtcaccaccacctccatcaccgtcacctccaccaccatatg 425  T

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