View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16909_low_3 (Length: 378)

Name: NF16909_low_3
Description: NF16909
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16909_low_3
NF16909_low_3
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-375)||(41394236-41394609)
chr1 (1-325)||(20931359-20931682)
chr1 (1-325)||(20913051-20913367)
chr1 (1-239)||(5072388-5072626)
chr1 (1-239)||(18601118-18601356)
chr1 (1-325)||(20893551-20893875)
chr1 (1-325)||(37844374-37844700)
chr1 (1-325)||(20445693-20446019)
chr1 (1-325)||(20531458-20531783)
chr1 (1-324)||(22227823-22228146)
chr1 (1-324)||(22232520-22232843)
chr1 (1-239)||(2116268-2116506)
chr1 (53-326)||(45051489-45051759)
chr1 (104-251)||(51452608-51452755)
chr1 (293-373)||(21860334-21860414)
chr1 (293-367)||(44034829-44034903)
chr1 (259-366)||(27675086-27675191)
chr1 (293-373)||(41218728-41218808)
chr1 (309-366)||(13376711-13376768)
chr1 (309-366)||(20177513-20177570)
chr1 (293-324)||(15861327-15861358)
chr1 (194-234)||(16646118-16646158)
chr1 (293-325)||(51452809-51452841)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (1-239)||(25175577-25175815)
chr6 (1-239)||(27653983-27654221)
chr6 (1-239)||(16825752-16825992)
chr6 (1-325)||(23153461-23153786)
chr6 (1-324)||(14626045-14626367)
chr6 (1-326)||(1650020-1650342)
chr6 (1-251)||(1657748-1657996)
chr6 (1-251)||(35009439-35009688)
chr6 (1-251)||(15862487-15862734)
chr6 (256-325)||(23148266-23148335)
chr6 (293-373)||(19983144-19983224)
chr6 (293-373)||(35015009-35015089)
chr6 (293-373)||(18583640-18583720)
chr6 (55-251)||(29665941-29666137)
chr6 (166-251)||(27751603-27751688)
chr6 (309-366)||(21623506-21623563)
chr6 (151-235)||(29605612-29605696)
chr6 (309-366)||(22361619-22361676)
chr6 (294-366)||(14152632-14152704)
chr6 (293-325)||(18002395-18002427)
chr6 (293-325)||(23995247-23995279)
chr6 (293-325)||(26090059-26090091)
chr6 (293-324)||(4991396-4991427)
chr6 (153-235)||(18629608-18629691)
chr6 (295-325)||(15742120-15742150)
chr6 (151-233)||(17083200-17083282)
chr6 (293-325)||(1657661-1657693)
chr6 (293-325)||(15862789-15862821)
chr6 (194-234)||(18399144-18399184)
chr6 (293-325)||(18823283-18823315)
chr6 (293-325)||(18839138-18839170)
chr6 (293-325)||(27751742-27751774)
chr6 (293-325)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (1-239)||(25426642-25426880)
chr5 (1-239)||(12388-12626)
chr5 (1-239)||(19499913-19500151)
chr5 (1-239)||(22366481-22366719)
chr5 (1-236)||(18777995-18778230)
chr5 (1-239)||(21073595-21073833)
chr5 (1-325)||(23506979-23507302)
chr5 (1-236)||(43443398-43443633)
chr5 (1-325)||(27182471-27182796)
chr5 (1-239)||(4199985-4200223)
chr5 (1-235)||(27009855-27010089)
chr5 (1-325)||(22053753-22054082)
chr5 (1-325)||(18530988-18531316)
chr5 (39-239)||(29188284-29188483)
chr5 (1-251)||(34939292-34939540)
chr5 (104-251)||(20623085-20623232)
chr5 (104-251)||(21233528-21233675)
chr5 (105-249)||(25900408-25900552)
chr5 (104-251)||(16536313-16536460)
chr5 (104-251)||(37052860-37053007)
chr5 (294-368)||(11584374-11584448)
chr5 (293-366)||(5450695-5450768)
chr5 (309-366)||(21222462-21222519)
chr5 (151-235)||(29918127-29918212)
chr5 (155-244)||(32950862-32950951)
chr5 (293-325)||(16105967-16105999)
chr5 (293-325)||(20623286-20623318)
chr5 (293-325)||(21233442-21233474)
chr5 (293-325)||(25900320-25900352)
chr5 (293-325)||(37053061-37053093)
chr5 (153-235)||(21310709-21310792)
chr5 (153-234)||(5450844-5450926)
chr5 (293-325)||(108728-108760)
chr5 (293-325)||(9730278-9730310)
chr5 (293-325)||(16536514-16536546)
chr5 (194-234)||(16595713-16595753)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-239)||(19886661-19886899)
chr2 (1-373)||(20627190-20627562)
chr2 (1-325)||(462752-463075)
chr2 (1-373)||(19794581-19794953)
chr2 (1-373)||(43642833-43643206)
chr2 (1-325)||(8891256-8891581)
chr2 (1-325)||(36982364-36982690)
chr2 (1-251)||(17396653-17396902)
chr2 (1-325)||(24341309-24341638)
chr2 (104-251)||(25265390-25265537)
chr2 (104-251)||(19689401-19689548)
chr2 (104-251)||(23820187-23820334)
chr2 (104-251)||(14906440-14906587)
chr2 (229-325)||(22863169-22863267)
chr2 (1-201)||(7507894-7508093)
chr2 (293-373)||(22275045-22275125)
chr2 (293-373)||(22284278-22284358)
chr2 (104-251)||(20015127-20015274)
chr2 (294-373)||(15633538-15633617)
chr2 (309-366)||(43646232-43646289)
chr2 (153-234)||(68156-68238)
chr2 (293-326)||(19689314-19689347)
chr2 (293-325)||(9652796-9652828)
chr2 (293-325)||(14906354-14906386)
chr2 (314-366)||(19660221-19660273)
chr2 (293-325)||(23820388-23820420)
chr2 (293-324)||(25213372-25213403)
chr2 (153-234)||(22775206-22775288)
chr2 (153-234)||(22780584-22780666)
chr2 (293-366)||(19666848-19666921)
chr2 (309-366)||(25305769-25305826)
chr2 (259-366)||(31146032-31146138)
chr2 (293-325)||(7507757-7507789)
chr2 (293-325)||(17396567-17396599)
chr2 (293-325)||(20015328-20015360)
chr2 (293-325)||(28031134-28031166)
chr2 (293-325)||(33128372-33128404)
chr2 (155-234)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (2-325)||(3508-3830)
scaffold0266 (1-325)||(1138-1462)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-366)||(3059980-3060344)
chr7 (1-239)||(10989424-10989661)
chr7 (1-325)||(16211780-16212103)
chr7 (1-240)||(2437471-2437710)
chr7 (1-325)||(13036938-13037263)
chr7 (1-325)||(11580661-11580988)
chr7 (1-239)||(13911024-13911263)
chr7 (1-325)||(36052681-36053003)
chr7 (1-235)||(13572690-13572924)
chr7 (1-251)||(25292338-25292587)
chr7 (1-244)||(18253842-18254084)
chr7 (1-251)||(47481031-47481280)
chr7 (1-214)||(16478987-16479199)
chr7 (1-251)||(7293031-7293279)
chr7 (104-251)||(11516343-11516490)
chr7 (104-251)||(15441564-15441711)
chr7 (104-251)||(30262129-30262276)
chr7 (53-250)||(13321080-13321278)
chr7 (293-373)||(32493898-32493978)
chr7 (293-373)||(126738-126818)
chr7 (293-373)||(1936869-1936949)
chr7 (293-373)||(111121-111201)
chr7 (130-323)||(295893-296087)
chr7 (259-366)||(13377819-13377924)
chr7 (294-373)||(7283908-7283987)
chr7 (309-366)||(13389693-13389750)
chr7 (219-325)||(36024372-36024485)
chr7 (153-234)||(13377693-13377775)
chr7 (293-325)||(2029244-2029276)
chr7 (293-325)||(7293333-7293365)
chr7 (293-325)||(11516544-11516576)
chr7 (293-325)||(14113903-14113935)
chr7 (293-325)||(15441478-15441510)
chr7 (256-325)||(15709428-15709501)
chr7 (310-366)||(16919870-16919926)
chr7 (293-325)||(30262043-30262075)
chr7 (293-325)||(42056188-42056220)
chr7 (153-235)||(16914928-16915011)
chr7 (293-325)||(371417-371449)
chr7 (293-325)||(3049905-3049937)
chr7 (293-325)||(13321334-13321366)
chr7 (219-251)||(14113989-14114021)
chr7 (219-251)||(14423639-14423671)
chr7 (293-321)||(15516765-15516793)
chr7 (293-325)||(25124450-25124482)
chr7 (293-325)||(47480944-47480976)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (1-239)||(47357668-47357906)
chr4 (1-373)||(54118120-54118493)
chr4 (1-325)||(13246444-13246769)
chr4 (87-325)||(121989-122226)
chr4 (1-235)||(10644233-10644467)
chr4 (1-251)||(13048221-13048471)
chr4 (1-325)||(15675009-15675338)
chr4 (55-325)||(10104170-10104445)
chr4 (1-251)||(26680215-26680463)
chr4 (1-224)||(31115643-31115865)
chr4 (104-251)||(10488678-10488825)
chr4 (104-251)||(16327926-16328073)
chr4 (188-325)||(33240900-33241043)
chr4 (293-373)||(25119059-25119139)
chr4 (293-373)||(5682380-5682460)
chr4 (219-325)||(31132545-31132657)
chr4 (1-84)||(111409-111492)
chr4 (55-235)||(40885570-40885749)
chr4 (293-366)||(41165808-41165881)
chr4 (153-234)||(15044992-15045074)
chr4 (309-366)||(47534933-47534990)
chr4 (293-325)||(14952085-14952117)
chr4 (293-325)||(15135907-15135939)
chr4 (293-325)||(15272211-15272243)
chr4 (293-325)||(16327840-16327872)
chr4 (293-325)||(16609013-16609045)
chr4 (293-325)||(26680517-26680549)
chr4 (153-234)||(15109350-15109432)
chr4 (293-325)||(8045272-8045304)
chr4 (293-325)||(16523146-16523178)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-325)||(14842487-14842810)
chr3 (1-239)||(55316233-55316471)
chr3 (1-325)||(13838908-13839232)
chr3 (1-325)||(2049824-2050147)
chr3 (1-325)||(12030073-12030396)
chr3 (104-375)||(16743991-16744262)
chr3 (1-239)||(41270089-41270327)
chr3 (1-214)||(16821153-16821366)
chr3 (1-261)||(51158008-51158267)
chr3 (1-251)||(13975722-13975971)
chr3 (1-288)||(15858986-15859273)
chr3 (1-251)||(45860819-45861068)
chr3 (1-251)||(13954890-13955139)
chr3 (1-244)||(15936634-15936876)
chr3 (188-373)||(19231981-19232169)
chr3 (1-244)||(15938476-15938718)
chr3 (1-326)||(15614848-15615170)
chr3 (205-325)||(19260749-19260869)
chr3 (1-251)||(17912483-17912730)
chr3 (104-251)||(2449238-2449385)
chr3 (290-368)||(15857120-15857198)
chr3 (293-373)||(3992873-3992953)
chr3 (293-373)||(55513193-55513273)
chr3 (293-373)||(2844514-2844594)
chr3 (293-373)||(54037976-54038056)
chr3 (293-373)||(17955832-17955916)
chr3 (293-373)||(7854305-7854385)
chr3 (293-354)||(45581954-45582016)
chr3 (309-366)||(17205019-17205076)
chr3 (293-366)||(38810868-38810941)
chr3 (311-366)||(12031849-12031904)
chr3 (155-244)||(11986173-11986262)
chr3 (293-366)||(13301323-13301396)
chr3 (293-366)||(13311979-13312052)
chr3 (194-235)||(14080715-14080756)
chr3 (309-366)||(17191879-17191936)
chr3 (293-325)||(2449152-2449184)
chr3 (151-235)||(4145814-4145898)
chr3 (293-325)||(16261777-16261809)
chr3 (293-325)||(16933869-16933901)
chr3 (293-325)||(17912398-17912430)
chr3 (293-325)||(23492696-23492728)
chr3 (293-325)||(38168237-38168269)
chr3 (293-325)||(53771365-53771397)
chr3 (153-234)||(30207380-30207462)
chr3 (309-366)||(3576290-3576347)
chr3 (151-235)||(6228625-6228710)
chr3 (294-359)||(15550922-15550987)
chr3 (293-325)||(11986080-11986112)
chr3 (293-325)||(13954804-13954836)
chr3 (194-234)||(14059214-14059254)
chr3 (293-325)||(14285289-14285321)
chr3 (293-325)||(19947026-19947058)
chr3 (293-325)||(30153265-30153297)
chr3 (293-325)||(33342204-33342236)
chr3 (293-325)||(45861122-45861154)
chr3 (293-325)||(51961031-51961063)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-325)||(48612-48935)
scaffold0023 (1-214)||(36107-36320)
scaffold0023 (293-325)||(61122-61154)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (1-325)||(16193643-16193965)
chr8 (1-239)||(30120736-30120974)
chr8 (1-325)||(43373392-43373717)
chr8 (1-325)||(24928716-24929040)
chr8 (1-177)||(222753-222929)
chr8 (1-177)||(736376-736552)
chr8 (1-177)||(860271-860447)
chr8 (1-373)||(16404852-16405221)
chr8 (1-239)||(16674392-16674630)
chr8 (1-235)||(21844576-21844810)
chr8 (1-235)||(21851969-21852203)
chr8 (1-239)||(6774258-6774495)
chr8 (1-239)||(24548996-24549233)
chr8 (1-251)||(17345584-17345832)
chr8 (1-251)||(22907214-22907462)
chr8 (104-251)||(5238203-5238350)
chr8 (104-251)||(24661248-24661395)
chr8 (104-251)||(43685662-43685809)
chr8 (293-373)||(274766-274846)
chr8 (293-373)||(641003-641083)
chr8 (293-373)||(826809-826889)
chr8 (293-373)||(24716714-24716794)
chr8 (115-177)||(691908-691970)
chr8 (293-373)||(39115598-39115678)
chr8 (309-366)||(17285543-17285600)
chr8 (309-366)||(21198005-21198062)
chr8 (293-325)||(5238404-5238436)
chr8 (293-325)||(22907128-22907160)
chr8 (293-325)||(24385652-24385684)
chr8 (293-325)||(24661162-24661194)
chr8 (293-325)||(43685863-43685895)
chr8 (153-235)||(26011658-26011741)
chr8 (293-325)||(2545265-2545297)
chr8 (293-325)||(3431176-3431208)
chr8 (293-325)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-325)||(5990-6312)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-325)||(882-1204)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-325)||(8892-9215)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-325)||(171919-172242)
scaffold0001 (1-325)||(177622-177945)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-325)||(247366-247691)
scaffold0012 (293-325)||(34075-34107)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-325)||(12129-12450)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (2-325)||(26340-26663)
scaffold0162 (104-251)||(8180-8327)
scaffold0162 (309-366)||(6877-6934)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-325)||(41743-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (1-326)||(36836-37162)
scaffold0077 (294-373)||(15319-15398)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (11-244)||(5552-5785)
scaffold0772 (293-325)||(5846-5878)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-322)||(19220-19543)
scaffold0195 (1-251)||(21304-21553)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-214)||(43011-43224)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-325)||(128095-128417)
scaffold0008 (1-214)||(31700-31914)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-315)||(4996-5310)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-325)||(123087-123413)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-325)||(272039-272362)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-235)||(49-283)
scaffold0116 (293-373)||(30417-30497)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (105-323)||(51110-51328)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-235)||(64527-64766)
scaffold0026 (1-244)||(107761-108003)
scaffold0026 (194-236)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (1-244)||(48201-48443)
scaffold0049 (294-373)||(20493-20572)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-240)||(21115-21353)
scaffold0139 (1-214)||(14086-14298)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-277)||(148735-149012)
scaffold0025 (1-325)||(8863-9192)
scaffold0025 (225-325)||(146838-146938)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (105-325)||(89378-89600)
scaffold0028 (200-325)||(107708-107835)
scaffold0028 (293-324)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-214)||(9374-9586)
scaffold0215 (1-214)||(16272-16484)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-201)||(5254-5452)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (93-239)||(1304-1450)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-201)||(3736-3936)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-251)||(534-783)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-251)||(34460-34710)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (118-251)||(13636-13769)
scaffold0132 (293-373)||(42677-42754)
scaffold0132 (293-325)||(13824-13856)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-240)||(2976-3215)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (1-251)||(41662-41911)
scaffold0125 (285-325)||(41957-41997)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (83-239)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (104-251)||(26911-27058)
scaffold0141 (104-244)||(22656-22796)
scaffold0141 (293-325)||(22857-22889)
scaffold0141 (293-325)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (104-251)||(1582-1729)
scaffold0124 (293-325)||(1496-1528)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (104-251)||(37066-37213)
scaffold0078 (293-373)||(41632-41712)
scaffold0078 (293-325)||(36980-37012)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (1-93)||(9-101)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (293-373)||(80187-80267)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (292-373)||(166116-166197)
scaffold0016 (292-367)||(162036-162111)
scaffold0016 (293-366)||(116410-116483)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (293-373)||(31132-31212)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-93)||(48528-48620)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (293-367)||(5735-5809)
scaffold0686 (293-367)||(5941-6015)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (292-373)||(304-385)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (158-251)||(3360-3453)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (294-373)||(1701-1780)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (1-84)||(9396-9479)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (294-373)||(19802-19881)
scaffold0122 (294-373)||(24106-24185)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (294-364)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (294-368)||(6261-6335)
scaffold0310 (294-331)||(4-41)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (293-366)||(1363-1436)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (155-244)||(56106-56195)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (309-366)||(35816-35873)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (153-235)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (153-234)||(2317-2399)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (309-366)||(442-499)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (309-366)||(76699-76756)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (293-326)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (293-325)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (293-325)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (293-325)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (293-325)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (293-325)||(57392-57424)
scaffold0058 (194-235)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (293-325)||(55904-55936)
scaffold0032 (293-325)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (282-325)||(18015-18058)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (155-201)||(45198-45244)
scaffold0066 (293-325)||(45338-45370)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (309-366)||(632-689)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (309-366)||(6999-7056)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (194-235)||(1546-1587)
scaffold0456 (194-235)||(8691-8732)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (309-366)||(43651-43708)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (309-366)||(31357-31414)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (194-234)||(8011-8051)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (293-325)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (293-325)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (293-325)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (293-325)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (293-325)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (293-325)||(34308-34340)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (194-234)||(3525-3565)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (293-325)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 41394236 - 41394609
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||||    
T  41394236 gaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttag 41394335  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  41394336 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgc 41394434  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394435 atacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 41394534  T
Q  301 gataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41394535 gataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctcc 41394609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20931359 - 20931682
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  20931359 gaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttag 20931458  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  20931459 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 20931557  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20931558 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattat 20931657  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  20931658 gataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20913051 - 20913367
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  20913051 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aattaacaacaactttg 20913143  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  20913144 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 20913242  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||     
T  20913243 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattac 20913342  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20913343 gataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5072626 - 5072388
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5072626 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttag 5072527  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072526 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 5072427  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    ||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  5072426 atataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18601356 - 18601118
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18601356 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttag 18601257  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601256 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 18601157  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||| ||||||||||    
T  18601156 atacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20893875 - 20893551
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  20893875 gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttag 20893776  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  20893775 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 20893677  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20893676 atacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttacaaaatgatgatgatt 20893578  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20893577 atgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37844700 - 37844374
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  37844700 gaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 37844601  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
     | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  37844600 ca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 37844502  T
Q  200 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 297  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37844501 catacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgat 37844402  T
Q  298 tatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844401 tatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20445693 - 20446019
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  20445693 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttag 20445792  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  20445793 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 20445891  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgat 297  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20445892 atacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgat 20445991  T
Q  298 tatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20445992 tatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20531458 - 20531783
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  20531458 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttag 20531557  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  20531558 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 20531656  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    |||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20531657 atacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgatt 20531756  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||    
T  20531757 atgataaagactaatttccttacctta 20531783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 22227823 - 22228146
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22227823 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 22227922  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22227923 ca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 22228021  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatta 299  Q
    | |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |||||||    
T  22228022 acaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgatta 22228121  T
Q  300 tgataaagactaacccccttacctt 324  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  22228122 tgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 22232520 - 22232843
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22232520 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 22232619  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22232620 ca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 22232718  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatta 299  Q
    | |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |||||||    
T  22232719 acaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgatta 22232818  T
Q  300 tgataaagactaacccccttacctt 324  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  22232819 tgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 2116268 - 2116506
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaacaacaactta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  2116268 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataactta 2116367  T
Q  100 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
    | | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  2116368 gca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 2116466  T
Q  200 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||    
T  2116467 catacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 326
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051759
Alignment:
Q  53 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 152  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat- 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  252 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 326  Q
    || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860414
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 21860414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 293 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 366
Target Start/End: Original strand, 27675086 - 27675191
Alignment:
Q  259 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  27675086 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--acgattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcacttt 27675183  T
Q  359 agctccta 366  Q
    ||||||||    
T  27675184 agctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 41218728 - 41218808
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41218728 atgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 41218808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13376768 - 13376711
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  13376768 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 20177513 - 20177570
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20177513 ctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 20177570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Original strand, 16646118 - 16646158
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16646118 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16646158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452841
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttacctta 51452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 25175577 - 25175815
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175577 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 25175676  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175677 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 25175776  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25175777 atacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27654221 - 27653983
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654221 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 27654122  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654121 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 27654022  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||| ||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  27654021 atacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16825992 - 16825752
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16825992 gaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattag 16825893  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaactaacatcaattcat 198  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16825892 gagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcat 16825793  T
Q  199 gcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16825792 gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23153461 - 23153786
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  23153461 gaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 23153560  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  23153561 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 23153659  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153660 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 23153759  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23153760 atgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14626367 - 14626045
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14626367 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttag 14626268  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  14626267 cataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 14626169  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |    
T  14626168 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattgt 14626069  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctt 324  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  14626068 gataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1650342 - 1650020
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  1650342 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttag 1650243  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  1650242 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 1650144  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatta 299  Q
    |||||||| ||||| || |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  |||||||    
T  1650143 atacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgatta 1650047  T
Q  300 tgataaagactaacccccttaccttaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1650046 tgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1657996 - 1657748
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  1657996 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataacttag 1657898  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  1657897 ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 1657799  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657798 atccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35009688 - 35009439
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | ||||||||| |||    
T  35009688 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatag 35009589  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  35009588 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 35009490  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35009489 atacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 15862487 - 15862734
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  15862487 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataacttag 15862584  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15862585 ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 15862683  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15862684 atacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 325
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  256 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983144
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 19983144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015009
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 35015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583720
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 18583720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 251
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  55 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  154 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  166 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 21623506 - 21623563
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21623506 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  151 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22361676 - 22361619
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||||||||||    
T  22361676 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctccta 22361619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 366
Target Start/End: Original strand, 14152632 - 14152704
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14152632 tgattatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 14152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995279
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 324
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18629691 - 18629608
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  18629691 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742120
Alignment:
Q  295 gattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17083282 - 17083200
Alignment:
Q  151 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaat 233  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||    
T  17083282 tatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 17083200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657661
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 1657661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862821
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Original strand, 18399144 - 18399184
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18399144 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 18399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823283
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18823283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839138
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18839138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751774
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 27751774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276659
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 32276659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 25426642 - 25426880
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426642 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 25426741  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426742 gagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 25426841  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  25426842 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 12388 - 12626
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12388 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 12487  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12488 gagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 12587  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  12588 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 19499913 - 19500151
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499913 gaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 19500012  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500013 gagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 19500112  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19500113 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22366719 - 22366481
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366719 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttag 22366620  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366619 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 22366520  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  22366519 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18778230 - 18777995
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778230 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 18778131  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778130 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 18778031  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 236  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  18778030 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21073833 - 21073595
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073833 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 21073734  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21073733 aagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgc 21073634  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  21073633 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 23506979 - 23507302
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23506979 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 23507078  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  23507079 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 23507177  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  23507178 atacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattat 23507277  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23507278 gataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43443633 - 43443398
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43443633 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttag 43443534  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443533 aagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 43443434  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 236  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  43443433 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27182796 - 27182471
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  27182796 gaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 27182697  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  27182696 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgc 27182598  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182597 atacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 27182498  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27182497 atgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4200223 - 4199985
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  4200223 gaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacataa 4200124  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4200123 gagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 4200024  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  4200023 atacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27009855 - 27010089
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27009855 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttag 27009954  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||    
T  27009955 gagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgc 27010054  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  27010055 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22054082 - 22053753
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  22054082 gaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag 22053983  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  22053982 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatac 22053884  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgat 294  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||    
T  22053883 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgat 22053784  T
Q  295 gattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053783 gattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18531316 - 18530988
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  18531316 gaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag 18531217  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  18531216 ca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 18531118  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat---g 295  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  18531117 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacg 18531018  T
Q  296 attatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531017 attatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  39 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 138  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  139 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagc 238  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 34939292 - 34939540
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||    
T  34939292 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgacttag 34939390  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  34939391 ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 34939489  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34939490 atacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  105 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 204  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  205 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 249  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584448
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 368  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5450768 - 5450695
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5450768 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattattatcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 5450695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21222519 - 21222462
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21222519 ctaacccccataccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  151 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  155 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105999
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21310792 - 21310709
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  21310792 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5450926 - 5450844
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  5450926 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 5450844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108728
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 108728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730278
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 9730278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536546
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatctta 16536546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Original strand, 16595713 - 16595753
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16595713 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16595753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19886899 - 19886661
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886899 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 19886800  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886799 gagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 19886700  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19886699 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20627562 - 20627190
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||     
T  20627562 gaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaa 20627463  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||    
T  20627462 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgc 20627364  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaaaatgatgatgatta 299  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20627363 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgatta 20627264  T
Q  300 tgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20627263 tgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 20627190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 462752 - 463075
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  462752 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 462851  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  462852 ca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 462950  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462951 atacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 463050  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  463051 gataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19794953 - 19794581
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19794953 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttag 19794854  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  19794853 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgc 19794755  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19794754 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa-tttacaaaataatgatgatt 19794656  T
Q  299 atgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19794655 atgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattct 19794581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43643206 - 43642833
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||    
T  43643206 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaag 43643107  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  43643106 aa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 43643008  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43643007 atacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgatt 43642908  T
Q  299 atgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43642907 atgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 43642833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8891256 - 8891581
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8891256 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 8891355  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  8891356 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 8891454  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891455 atacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 8891554  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8891555 atgataaagactaacccctttacctta 8891581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36982690 - 36982364
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |    
T  36982690 gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttgg 36982591  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||     
T  36982590 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatga 36982492  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgat 297  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36982491 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgat 36982392  T
Q  298 tatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982391 tatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17396902 - 17396653
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  17396902 gaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttag 17396803  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||    
T  17396802 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgc 17396703  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17396702 atac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24341638 - 24341309
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  24341638 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag 24341539  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  24341538 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 24341440  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgat 294  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||    
T  24341439 atacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgat 24341340  T
Q  295 gattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341339 gattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25265537 - 25265390
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  25265537 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcata 25265438  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265437 caaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 229 - 325
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863267
Alignment:
Q  229 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7508093 - 7507894
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaacaacaactta 99  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  7508093 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa-ttaacaacaactta 7507995  T
Q  100 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
    |   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  7507994 gcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 7507896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275125
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 22275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284358
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 22284358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633617
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct 15633617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 43646232 - 43646289
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43646232 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652796
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 366
Target Start/End: Original strand, 19660221 - 19660273
Alignment:
Q  314 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19660221 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 324
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22775288 - 22775206
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22775288 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22780666 - 22780584
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22780666 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Original strand, 19666848 - 19666921
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  19666848 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta 19666921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 25305769 - 25305826
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | |||||||||||| ||||||    
T  25305769 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcatagcccaagcttcactttaactccta 25305826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146032
Alignment:
Q  259 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactt 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||  || |    ||||| | ||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctctagcccaagcttcactt 31146041  T
Q  358 tagctccta 366  Q
    |||||||||    
T  31146040 tagctccta 31146032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507757
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 7507757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396567
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 17396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015360
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttacctta 20015360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031134
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 28031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128404
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 33128404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
Alignment:
Q  155 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  43646059 aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt 43646139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3830 - 3508
Alignment:
Q  2 aatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  3830 aatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagc 3731  T
Q  102 agaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 201  Q
    | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  3730 a-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3632  T
Q  202 tacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatg 301  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3631 tacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatg 3532  T
Q  302 ataaagactaacccccttacctta 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  3531 acaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 1138 - 1462
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1138 gaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 1237  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  1238 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgc 1336  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgatta 299  Q
    |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1337 atactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgatta 1436  T
Q  300 tgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1437 tgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 3059980 - 3060344
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  3059980 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaa 3060079  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||    
T  3060080 ca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgc 3060178  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060179 atacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 3060278  T
Q  301 gataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3060279 gataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 10989424 - 10989661
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10989424 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta-caacaacttag 10989522  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989523 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 10989622  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  10989623 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16211780 - 16212103
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16211780 gaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 16211879  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  16211880 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 16211978  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16211979 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattat 16212078  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16212079 gataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 2437471 - 2437710
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  2437471 gaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttag 2437570  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    || |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2437571 gaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 2437670  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 240  Q
    |||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  2437671 atacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13037263 - 13036938
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13037263 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 13037164  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  13037163 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 13037065  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037064 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 13036965  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||    
T  13036964 atggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11580988 - 11580661
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  11580988 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 11580889  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  11580888 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 11580790  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatga 296  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11580789 atacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatga 11580690  T
Q  297 ttatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580689 ttatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13911263 - 13911024
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactt-a 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  13911263 gaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttta 13911164  T
Q  100 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
    |||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13911163 ggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatg 13911064  T
Q  200 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    ||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  13911063 catacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 36052681 - 36053003
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||    
T  36052681 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac---ttag 36052777  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  36052778 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgc 36052876  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    |||||||| || || || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36052877 atacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgatt 36052976  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36052977 atgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13572690 - 13572924
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13572690 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttag 13572789  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||    
T  13572790 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgc 13572889  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  13572890 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25292587 - 25292338
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  25292587 gaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctag 25292488  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||| |    
T  25292487 gag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatac 25292389  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25292388 atacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18254084 - 18253842
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18254084 gaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 18253985  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  18253984 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 18253886  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18253885 atacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47481280 - 47481031
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  47481280 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttag 47481181  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  47481180 ca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 47481082  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47481081 atacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16479199 - 16478987
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||     
T  16479199 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaa 16479100  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  16479099 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 16479001  T
Q  201 atacaaacataaca 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16479000 atacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 7293031 - 7293279
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||||||||| |      
T  7293031 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacat-- 7293128  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || |||||||||    
T  7293129 gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgc 7293228  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7293229 atacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Original strand, 13321080 - 13321278
Alignment:
Q  53 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata- 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||     
T  13321080 ataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatac 13321177  T
Q  151 tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 249  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13321178 tttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcc 13321277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493898
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 32493898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126818
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct 126818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936869
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatgattct 1936869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111121
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 111121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295893
Alignment:
Q  130 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcac 229  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || || |||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  230 gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 323  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 366
Target Start/End: Original strand, 13377819 - 13377924
Alignment:
Q  259 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||    
T  13377819 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 13377916  T
Q  359 agctccta 366  Q
    ||||||||    
T  13377917 agctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283908
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 7283908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 325
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024485
Alignment:
Q  219 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  313 -cccccttacctta 325  Q
     |||||||||||||    
T  36024472 ccccccttacctta 36024485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029276
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 325
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709501
Alignment:
Q  256 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctta 15709501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 366
Target Start/End: Original strand, 16919870 - 16919926
Alignment:
Q  310 taacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16919870 taacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 16919926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056188
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16915011 - 16914928
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  16915011 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371449
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 371449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049937
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321366
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13321366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14114021 - 14113989
Alignment:
Q  219 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14114021 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14423671 - 14423639
Alignment:
Q  219 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14423671 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttac 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124482
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480944
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 47480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 47357668 - 47357906
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357668 gaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 47357767  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47357768 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgc 47357867  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  47357868 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54118493 - 54118120
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  54118493 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttag 54118394  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  54118393 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 54118295  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54118294 atacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgatt 54118195  T
Q  299 atgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54118194 atgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattct 54118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 13246444 - 13246769
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13246444 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 13246543  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  13246544 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgc 13246642  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246643 atacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 13246742  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13246743 atgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 87 - 325
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122226
Alignment:
Q  87 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 186  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  187 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 286  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  287 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10644233 - 10644467
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10644233 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 10644332  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  10644333 gagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 10644432  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  10644433 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13048471 - 13048221
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13048471 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttag 13048372  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||    
T  13048371 gagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgc 13048272  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13048271 atacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15675338 - 15675009
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  15675338 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag 15675239  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15675238 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 15675140  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgat 294  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||    
T  15675139 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgat 15675040  T
Q  295 gattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675039 gattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104170
Alignment:
Q  55 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 154  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  155 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--ta 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  253 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 26680215 - 26680463
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |      
T  26680215 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-- 26680312  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  26680313 gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgc 26680412  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26680413 atacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31115643 - 31115865
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  31115643 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttag 31115742  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    || |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  31115743 ga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 31115841  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttgg 224  Q
    ||||||||||| || || ||||||    
T  31115842 atacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 325
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241043
Alignment:
Q  188 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  286 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119059
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 25119059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682380
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatgattct 5682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 325
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  219 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  313 cccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 111409 - 111492
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 84  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111409 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
Q  55 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  154 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41165881 - 41165808
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  41165881 atgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47534990 - 47534933
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  47534990 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctccta 47534933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952117
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135907
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272211
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15109432 - 15109350
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  15109432 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 15109350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045304
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 8045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523178
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16523178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14842810 - 14842487
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14842810 gaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 14842711  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  14842710 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgc 14842612  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  14842611 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattat 14842512  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14842511 gataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 55316233 - 55316471
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55316233 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttag 55316332  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316333 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 55316432  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  55316433 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 13838908 - 13839232
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||    
T  13838908 gaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag 13839007  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  13839008 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgc 13839106  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgatta 299  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13839107 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgatta 13839206  T
Q  300 tgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  13839207 tgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 2049824 - 2050147
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2049824 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 2049923  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||    
T  2049924 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggc 2050022  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2050023 atacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattat 2050122  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2050123 gataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12030396 - 12030073
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||    
T  12030396 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttag 12030297  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  12030296 ca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 12030198  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12030197 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattat 12030098  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  12030097 gataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 104 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16744262 - 16743991
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||| |||    
T  16744262 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggata 16744163  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgat 303  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16744162 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggt 16744063  T
Q  304 aaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttctcc 375  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16744062 aaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctcc 16743991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 41270089 - 41270327
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41270089 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttag 41270188  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270189 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgc 41270288  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  41270289 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16821153 - 16821366
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16821153 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttag 16821252  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  16821253 gagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgc 16821352  T
Q  201 atacaaacataaca 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16821353 atacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51158267 - 51158008
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  51158267 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 51158168  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  51158167 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 51158069  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 261  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158068 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13975971 - 13975722
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  13975971 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttag 13975872  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||||||||    
T  13975871 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgc 13975772  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13975771 atac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15859273 - 15858986
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  15859273 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttag 15859174  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15859173 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 15859075  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 288  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15859074 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttacaaaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 45860819 - 45861068
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  45860819 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttag 45860918  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||||||||    
T  45860919 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgc 45861018  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45861019 atac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13955139 - 13954890
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  13955139 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttag 13955040  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||||||||    
T  13955039 gagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgc 13954940  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13954939 atac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15936876 - 15936634
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  15936876 gaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttat 15936777  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  15936776 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 15936678  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15936677 atacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 373
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232169
Alignment:
Q  188 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 284  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  285 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 19232169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15938718 - 15938476
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  15938718 gaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttat 15938619  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||     
T  15938618 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatga 15938520  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
     |||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15938519 ttacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 15614848 - 15615170
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  15614848 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttag 15614947  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  15614948 ca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgc 15615046  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatta 299  Q
    ||||||| |||||| || |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  |||||||    
T  15615047 atacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgatta 15615143  T
Q  300 tgataaagactaacccccttaccttaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15615144 tgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  205 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 304  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  305 aagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17912730 - 17912483
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| | ||| ||||| ||     
T  17912730 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatat 17912631  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  17912630 ca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 17912533  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17912532 atacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 290 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
Q  290 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 368  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992953
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 3992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513273
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 55513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844594
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 2844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037976
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 54037976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955832
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagct----ctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatgattct 17955832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854385
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 7854385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 354
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 17205019 - 17205076
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  17205019 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38810941 - 38810868
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  38810941 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 366
Target Start/End: Original strand, 12031849 - 12031904
Alignment:
Q  311 aacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  12031849 aacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 12031904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  155 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13301396 - 13301323
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13301396 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13312052 - 13311979
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13312052 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13311979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 17191879 - 17191936
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  17191879 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  151 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261809
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492728
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168269
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771397
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 30207380 - 30207462
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30207380 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 30207462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3576347 - 3576290
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3576347 ctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagcccaagcttcactttacctccta 3576290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6228710 - 6228625
Alignment:
Q  151 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||||| || |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  6228710 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 359
Target Start/End: Original strand, 15550922 - 15550987
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 359  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  15550922 tgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 15550987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986080
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 11986080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954804
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 13954804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14059254 - 14059214
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14059254 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 14059214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285321
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 14285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947058
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153297
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342236
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861154
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 45861154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961031
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 48612 - 48935
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||    
T  48612 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttag 48711  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  48712 ca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 48810  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48811 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 48910  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48911 gataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36107 - 36320
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36107 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttag 36206  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36207 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatac 36306  T
Q  201 atacaaacataaca 214  Q
    ||||||||||||||    
T  36307 atacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61122
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 61122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16193965 - 16193643
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || |    
T  16193965 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttgg 16193866  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  16193865 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 16193767  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16193766 atacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattat 16193667  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  16193666 gataaagactaa-ccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 30120736 - 30120974
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30120736 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttag 30120835  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30120836 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgc 30120935  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  30120936 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43373717 - 43373392
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43373717 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 43373618  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  43373617 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgc 43373519  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  43373518 atacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgatt 43373419  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43373418 atgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24929040 - 24928716
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| |||||||||    
T  24929040 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttag 24928941  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
      ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  24928940 c-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 24928842  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgatta 299  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24928841 atacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgatta 24928742  T
Q  300 tgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24928741 tgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 222929 - 222753
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222929 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 222830  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 177  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222829 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 736552 - 736376
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736552 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 736453  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 177  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736452 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 860447 - 860271
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860447 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 860348  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 177  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860347 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16405221 - 16404852
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||   ||||    
T  16405221 gaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaacaac---ttag 16405125  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  16405124 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 16405026  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16405025 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgatt 16404927  T
Q  299 atgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16404926 atgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 16404852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16674630 - 16674392
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16674630 gaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttag 16674531  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16674530 gagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgc 16674431  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    ||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16674430 ataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21844810 - 21844576
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21844810 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttag 21844711  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  21844710 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc 21844611  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21844610 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21852203 - 21851969
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21852203 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttag 21852104  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  21852103 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc 21852004  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21852003 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6774495 - 6774258
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  6774495 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttag 6774396  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  6774395 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 6774297  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  6774296 atacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 24548996 - 24549233
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  24548996 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttag 24549095  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  24549096 ca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 24549194  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  24549195 atacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 17345584 - 17345832
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  17345584 gaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataacttag 17345682  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  17345683 ca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 17345781  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17345782 atataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22907462 - 22907214
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |      
T  22907462 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-- 22907365  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  22907364 gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgc 22907265  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22907264 atacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274846
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 274846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641003
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 641003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826809
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 826809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716714
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 24716714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  115 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115678
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 39115678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 17285543 - 17285600
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  17285543 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17285600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21198062 - 21198005
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21198062 ctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21198005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385652
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 235
Target Start/End: Original strand, 26011658 - 26011741
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  26011658 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 26011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545297
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 2545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431176
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 3431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886686
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttacctta 22886686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6312 - 5990
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  6312 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-ttaacaacaacttag 6214  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  6213 ca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 6115  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||    
T  6114 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattat 6015  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6014 gataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 882
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  1204 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-ttaacaacaacttag 1106  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  1105 ca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 1007  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||    
T  1006 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattat 907  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  906 gataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8892 - 9215
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  8892 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaa 8991  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||    
T  8992 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgc 9090  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9091 atacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattat 9190  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9191 gataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 171919 - 172242
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  171919 gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag 172018  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |    
T  172019 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc 172117  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172118 atacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 172217  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  172218 gataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 177622 - 177945
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  177622 gaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttag 177721  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |    
T  177722 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatcc 177820  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177821 atacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 177920  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  177921 gataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 247691 - 247366
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  247691 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 247592  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  247591 ca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgc 247493  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247492 atacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 247393  T
Q  299 atgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  247392 atgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34075
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 12129 - 12450
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||     
T  12129 gaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaa 12226  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12227 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 12325  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatta 299  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  12326 atacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaaaattaagatgatta 12424  T
Q  300 tgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12425 tgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26663 - 26340
Alignment:
Q  2 aatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||     
T  26663 aatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagc 26564  T
Q  102 agaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 201  Q
    | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| || |||||||||| |||    
T  26563 a-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgca 26465  T
Q  202 tacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26464 tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattat 26365  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26364 gataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6934 - 6877
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6934 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactccta 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 41743 - 42066
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  41743 gaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttag 41842  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||    
T  41843 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgc 41941  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41942 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 42041  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  42042 gataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37162 - 36836
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||   ||| |||||||||    
T  37162 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttag 37063  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||    
T  37062 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgc 36964  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatt 298  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36963 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgatt 36864  T
Q  299 atgataaagactaacccccttaccttaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36863 atgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15319
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattct 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  11 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  111 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 210  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  211 aacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5878
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 19220 - 19543
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19220 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttag 19319  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  19320 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 19418  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgat 297  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19419 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgat 19518  T
Q  298 tatgataaagactaacccccttacc 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  19519 tatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 21304 - 21553
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21304 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttag 21403  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  21404 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 21502  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21503 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43011 - 43224
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43011 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttag 43110  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  43111 gagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 43210  T
Q  201 atacaaacataaca 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  43211 atagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 128417 - 128095
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||     
T  128417 gaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-ttaacaacaacctaa 128319  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  128318 ca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 128220  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  128219 atacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattat 128120  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  128119 gataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31914 - 31700
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaactt-a 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  31914 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttta 31815  T
Q  100 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
    |||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31814 ggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatg 31715  T
Q  200 catacaaacataaca 214  Q
    ||| |||||||||||    
T  31714 cattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5310 - 4996
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |    
T  5310 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttg 5211  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||    
T  5210 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgc 5112  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatta 299  Q
    ||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5111 atacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgatta 5012  T
Q  300 tgataaagactaaccc 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  5011 tgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 123413 - 123087
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  123413 gaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttag 123314  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  123313 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 123215  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgat 297  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  123214 atacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgat 123115  T
Q  298 tatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  123114 tatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 272039 - 272362
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||    
T  272039 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttag 272138  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||| |    
T  272139 ca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattc 272237  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 300  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272238 atacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattat 272337  T
Q  301 gataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  272338 gataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 49 - 283
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  49 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttag 148  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    ||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  149 gagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgc 248  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  249 atacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 30417 - 30497
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  30417 atgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatgattct 30497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 105 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51110
Alignment:
Q  105 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 204  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  205 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 304  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  305 aagactaacccccttacct 323  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  51128 aagactaatctccttacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 64766 - 64527
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  64766 gaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttag 64667  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc-----aatt 195  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||     ||||    
T  64666 gagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataatt 64567  T
Q  196 catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  64566 catgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 107761 - 108003
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  107761 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttat 107860  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  107861 ca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 107959  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  107960 atacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 236  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 48201 - 48443
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  48201 gaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaa 48300  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  48301 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 48399  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48400 atacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20572
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 20572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21353 - 21115
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  21353 gaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttag 21254  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    || |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||| |||     
T  21253 ga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatgg 21155  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 240  Q
    |||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  21154 atacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14298 - 14086
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  14298 gaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttag 14199  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  14198 ga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgc 14100  T
Q  201 atacaaacataaca 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  14099 atacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 148735 - 149012
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  148735 gaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 148834  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  148835 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgc 148933  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 277  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148934 atacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8863 - 9192
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  8863 gaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttag 8962  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  8963 ca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 9061  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgat 294  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||    
T  9062 atacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgat 9161  T
Q  295 gattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9162 gattatgatgaagactaacacacttacctta 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146938
Alignment:
Q  225 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 324  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  146938 a 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89378
Alignment:
Q  105 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 204  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  205 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 302  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  303 taaagactaacccccttacctta 325  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  89400 tgaagactaacccccttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  200 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 297  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  298 tatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 324
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9586 - 9374
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  9586 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttag 9487  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  9486 ca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 9388  T
Q  201 atacaaacataaca 214  Q
    ||||||||||||||    
T  9387 atacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16484 - 16272
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  16484 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttag 16385  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  16384 ca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 16286  T
Q  201 atacaaacataaca 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16285 atacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5452 - 5254
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  5452 gaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcag 5354  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  5353 ca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 5255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  93 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 192  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  193 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3736 - 3936
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3736 gaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttag 3835  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
     | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  3836 ca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 3934  T
Q  200 ca 201  Q
    ||    
T  3935 ca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 534
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||  |||||  |||||||    
T  783 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttag 684  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  683 ca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 585  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  584 atacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34710 - 34460
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaacaacaactta 99  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  34710 gaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaactta 34611  T
Q  100 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
    | | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  34610 gca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 34512  T
Q  200 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34511 catacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Original strand, 13636 - 13769
Alignment:
Q  118 agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaaca 217  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13636 agcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13735  T
Q  218 tagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13736 aagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42754
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 42754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13856
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 2976 - 3215
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaacaacaactta 99  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  2976 gaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaactta 3075  T
Q  100 ggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatg 199  Q
    | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  3076 gca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg 3174  T
Q  200 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 240  Q
     |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  3175 gatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 41662 - 41911
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || | ||||||||| |||    
T  41662 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatag 41761  T
Q  101 gagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgc 200  Q
     | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  41762 ca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgc 41860  T
Q  201 atacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41861 atacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41997
Alignment:
Q  285 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctta 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13325
Alignment:
Q  83 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 182  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  183 actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 239  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 244
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37213 - 37066
Alignment:
Q  104 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 203  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37213 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37114  T
Q  204 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37113 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41712
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 41712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 101 - 9
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaac 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  101 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaattaacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80267
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 80267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166116
Alignment:
Q  292 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
Q  292 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 367  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 116483 - 116410
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  116483 atgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31132
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 48528 - 48620
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaac 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48528 gaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 293 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 367  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 293 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 367  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 304
Alignment:
Q  292 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 251
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  158 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1780
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 9396 - 9479
Alignment:
Q  1 gaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 84  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9396 gaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19802
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 19802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24106
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 373  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 24106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 94 - 164
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcc 364  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6261
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 368  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  294 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 331  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1363
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1436 atgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcactttagttccta 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56106
Alignment:
Q  155 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 244  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  56195 aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35873
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  35816 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 235
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  153 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 442 - 499
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  442 ctaacccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 76756 - 76699
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  76756 ctaacccccttaccttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 76699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193396
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6443
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 878
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9882
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13285
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57392
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55936
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108075
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 325
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18058
Alignment:
Q  282 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 201
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  155 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45370
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 45370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 632 - 689
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  632 ctaacccccttaccataattatcactaattcctagcccaagcttcactttagctccta 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7056
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  6999 ctaacccccttaccataattatcaccaattcctagcccaaccttcactttagctccta 7056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 235  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43708 - 43651
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43708 ctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Original strand, 31357 - 31414
Alignment:
Q  309 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 366  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31357 ctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 31414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8051
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8011 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17209
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5476
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4346
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17304
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5581
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34308
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3565
Alignment:
Q  194 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3525 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  293 atgattatgataaagactaacccccttacctta 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University