View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16912_low_85 (Length: 221)

Name: NF16912_low_85
Description: NF16912
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16912_low_85
NF16912_low_85
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (12-221)||(28492280-28492489)
chr1 (12-221)||(33256227-33256436)
chr1 (12-221)||(33276399-33276608)
chr1 (12-221)||(22600058-22600267)
chr1 (12-221)||(22153852-22154061)
chr1 (12-221)||(10757416-10757626)
chr1 (12-217)||(1577862-1578067)
chr1 (12-219)||(22201614-22201821)
chr1 (12-213)||(19717519-19717720)
chr1 (12-221)||(20954349-20954558)
chr1 (12-221)||(48704199-48704408)
chr1 (12-221)||(1900340-1900549)
chr1 (16-221)||(32785814-32786018)
chr1 (12-221)||(38282562-38282770)
chr1 (12-221)||(12284418-12284627)
chr1 (15-221)||(2267087-2267291)
chr1 (12-219)||(36134185-36134391)
chr1 (12-221)||(22427235-22427442)
chr1 (12-221)||(2268526-2268732)
chr1 (29-219)||(35401821-35402011)
chr1 (12-220)||(29215792-29215998)
chr1 (12-221)||(39200870-39201077)
chr1 (12-211)||(16235182-16235381)
chr1 (15-221)||(30893090-30893297)
chr1 (12-221)||(22464686-22464894)
chr1 (12-221)||(25448444-25448651)
chr1 (12-204)||(21028788-21028980)
chr1 (29-219)||(23036405-23036595)
chr1 (15-200)||(21191763-21191947)
chr1 (12-221)||(2834684-2834892)
chr1 (12-202)||(35040161-35040351)
chr1 (12-200)||(12613713-12613899)
chr1 (12-221)||(2327317-2327525)
chr1 (28-219)||(7309830-7310020)
chr1 (12-221)||(26702005-26702214)
chr1 (12-221)||(30572192-30572398)
chr1 (12-221)||(44821423-44821630)
chr1 (12-220)||(48570111-48570316)
chr1 (12-221)||(21702809-21703015)
chr1 (23-177)||(14263371-14263525)
chr1 (32-141)||(17024920-17025029)
chr1 (12-221)||(46088984-46089182)
chr1 (15-221)||(10250984-10251178)
chr1 (29-157)||(18896537-18896665)
chr1 (28-221)||(7744968-7745159)
chr1 (12-80)||(19215607-19215675)
chr1 (12-104)||(21121057-21121149)
chr1 (12-104)||(21135153-21135245)
chr1 (12-80)||(23024783-23024851)
chr1 (23-104)||(21204916-21204997)
chr1 (31-104)||(42284642-42284715)
chr1 (28-104)||(21984607-21984683)
chr1 (12-80)||(37642243-37642311)
chr1 (17-60)||(17371042-17371085)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (12-221)||(49642717-49642926)
chr3 (12-221)||(37467328-37467537)
chr3 (12-216)||(31303381-31303585)
chr3 (12-221)||(2561183-2561392)
chr3 (12-221)||(14392959-14393168)
chr3 (12-221)||(12963040-12963249)
chr3 (12-197)||(41494994-41495179)
chr3 (15-219)||(13948334-13948538)
chr3 (15-214)||(17238884-17239083)
chr3 (12-221)||(6090727-6090936)
chr3 (15-217)||(15903196-15903399)
chr3 (14-220)||(28582103-28582309)
chr3 (28-214)||(38177605-38177791)
chr3 (31-221)||(14969341-14969531)
chr3 (12-185)||(13780575-13780748)
chr3 (12-221)||(18121577-18121786)
chr3 (12-221)||(29951393-29951602)
chr3 (12-221)||(30000547-30000756)
chr3 (40-211)||(13824092-13824263)
chr3 (12-221)||(20646149-20646359)
chr3 (12-221)||(47405378-47405585)
chr3 (12-221)||(18142707-18142916)
chr3 (12-221)||(49553444-49553653)
chr3 (12-221)||(47207701-47207909)
chr3 (12-221)||(12726185-12726394)
chr3 (12-221)||(16658573-16658782)
chr3 (12-221)||(19888899-19889107)
chr3 (12-199)||(40799869-40800056)
chr3 (14-221)||(52920403-52920609)
chr3 (12-219)||(16032520-16032726)
chr3 (12-221)||(11223559-11223765)
chr3 (12-221)||(20627388-20627595)
chr3 (12-221)||(24775491-24775698)
chr3 (28-221)||(2785075-2785267)
chr3 (12-151)||(22804048-22804187)
chr3 (12-202)||(53056701-53056891)
chr3 (29-221)||(46349801-46349991)
chr3 (23-221)||(14955433-14955629)
chr3 (13-204)||(12388845-12389035)
chr3 (30-204)||(19249385-19249558)
chr3 (12-136)||(25398295-25398419)
chr3 (12-221)||(22140759-22140966)
chr3 (23-200)||(20725093-20725269)
chr3 (28-202)||(33583240-33583416)
chr3 (23-221)||(5213583-5213778)
chr3 (12-194)||(29855404-29855587)
chr3 (86-221)||(11869137-11869270)
chr3 (30-157)||(23538185-23538312)
chr3 (23-157)||(12968312-12968446)
chr3 (40-164)||(50300246-50300370)
chr3 (15-221)||(21640865-21641068)
chr3 (12-80)||(11868264-11868332)
chr3 (12-221)||(46796334-46796531)
chr3 (12-221)||(49666372-49666569)
chr3 (12-104)||(21605726-21605818)
chr3 (23-157)||(26417698-26417832)
chr3 (29-121)||(11909079-11909171)
chr3 (12-104)||(21636742-21636834)
chr3 (159-211)||(25398238-25398290)
chr3 (12-80)||(30054313-30054381)
chr3 (12-62)||(1728129-1728179)
chr3 (12-80)||(9700132-9700200)
chr3 (50-121)||(45858804-45858875)
chr3 (17-62)||(37412605-37412650)
chr3 (17-121)||(51341011-51341107)
chr3 (23-55)||(13557777-13557809)
chr3 (40-104)||(40850991-40851055)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (12-221)||(25829124-25829333)
chr2 (12-221)||(30666979-30667188)
chr2 (12-221)||(9015271-9015478)
chr2 (12-221)||(13963879-13964088)
chr2 (12-221)||(20568651-20568860)
chr2 (12-221)||(25037160-25037369)
chr2 (12-221)||(25041267-25041476)
chr2 (12-221)||(23234997-23235206)
chr2 (16-218)||(30621210-30621412)
chr2 (16-218)||(30623831-30624033)
chr2 (12-221)||(22188003-22188212)
chr2 (12-221)||(19540406-19540615)
chr2 (12-221)||(21537149-21537358)
chr2 (12-221)||(24576025-24576235)
chr2 (12-204)||(18376824-18377016)
chr2 (12-221)||(10009650-10009860)
chr2 (12-221)||(24377091-24377300)
chr2 (12-218)||(24850569-24850776)
chr2 (12-219)||(38781388-38781596)
chr2 (12-221)||(28140520-28140729)
chr2 (12-220)||(40782467-40782669)
chr2 (40-219)||(20151939-20152117)
chr2 (23-221)||(6574025-6574223)
chr2 (12-220)||(22317583-22317792)
chr2 (12-204)||(24779333-24779525)
chr2 (48-219)||(22260432-22260603)
chr2 (12-156)||(31800853-31800997)
chr2 (12-217)||(39037547-39037752)
chr2 (12-219)||(23595473-23595677)
chr2 (12-202)||(28711618-28711808)
chr2 (12-200)||(41121642-41121829)
chr2 (12-221)||(22454891-22455100)
chr2 (23-197)||(26619027-26619200)
chr2 (15-204)||(25189391-25189579)
chr2 (12-201)||(6392624-6392814)
chr2 (12-221)||(33074216-33074423)
chr2 (40-202)||(45087102-45087266)
chr2 (12-221)||(22802451-22802657)
chr2 (12-202)||(28701149-28701339)
chr2 (12-221)||(31327868-31328075)
chr2 (12-221)||(31334589-31334796)
chr2 (28-220)||(34321840-34322030)
chr2 (12-221)||(35743905-35744110)
chr2 (100-221)||(7609039-7609161)
chr2 (28-157)||(44881173-44881302)
chr2 (28-202)||(30557239-30557415)
chr2 (28-219)||(19115089-19115279)
chr2 (12-154)||(23184276-23184414)
chr2 (29-193)||(22272139-22272303)
chr2 (12-156)||(28550893-28551028)
chr2 (12-107)||(44840424-44840519)
chr2 (12-156)||(31968018-31968153)
chr2 (12-107)||(22776303-22776398)
chr2 (12-107)||(22781681-22781776)
chr2 (12-107)||(1587048-1587142)
chr2 (12-107)||(14581505-14581600)
chr2 (28-219)||(18430844-18431034)
chr2 (12-107)||(40332077-40332172)
chr2 (29-108)||(3277037-3277116)
chr2 (12-52)||(22258191-22258231)
chr2 (28-219)||(18702744-18702934)
chr2 (28-107)||(22785670-22785749)
chr2 (17-55)||(19498010-19498048)
chr2 (40-80)||(23392710-23392750)
chr2 (28-60)||(24814645-24814677)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (12-219)||(39693523-39693730)
chr8 (15-221)||(12757717-12757923)
chr8 (12-221)||(16207294-16207503)
chr8 (12-221)||(602674-602883)
chr8 (12-221)||(19156184-19156393)
chr8 (12-219)||(17914447-17914654)
chr8 (12-221)||(16681257-16681466)
chr8 (15-221)||(17525682-17525889)
chr8 (12-221)||(16188972-16189181)
chr8 (15-221)||(18321113-18321319)
chr8 (12-221)||(24646326-24646535)
chr8 (40-221)||(33082873-33083054)
chr8 (15-221)||(17441762-17441967)
chr8 (12-221)||(29693303-29693512)
chr8 (23-221)||(19943234-19943434)
chr8 (12-221)||(23185182-23185389)
chr8 (12-220)||(21932871-21933079)
chr8 (12-221)||(17701733-17701942)
chr8 (12-220)||(18679803-18680011)
chr8 (13-221)||(20382348-20382556)
chr8 (13-221)||(17267463-17267670)
chr8 (12-221)||(18718989-18719198)
chr8 (12-221)||(18121063-18121269)
chr8 (12-219)||(17797410-17797615)
chr8 (30-221)||(23263565-23263757)
chr8 (13-221)||(30421384-30421591)
chr8 (12-202)||(45538412-45538602)
chr8 (12-221)||(15336044-15336251)
chr8 (12-221)||(15425109-15425316)
chr8 (12-221)||(15516413-15516620)
chr8 (12-202)||(1237625-1237815)
chr8 (12-221)||(40845344-40845550)
chr8 (82-211)||(20255529-20255658)
chr8 (15-202)||(24551265-24551452)
chr8 (15-219)||(19707497-19707700)
chr8 (12-198)||(43644884-43645069)
chr8 (23-219)||(18685353-18685549)
chr8 (23-219)||(18722602-18722798)
chr8 (23-219)||(18730947-18731143)
chr8 (12-202)||(9320557-9320748)
chr8 (12-221)||(22673766-22673973)
chr8 (12-221)||(36105183-36105390)
chr8 (131-221)||(22745594-22745684)
chr8 (15-221)||(22663107-22663311)
chr8 (30-197)||(22461617-22461783)
chr8 (12-88)||(25164058-25164134)
chr8 (12-221)||(6407714-6407911)
chr8 (13-142)||(19956374-19956502)
chr8 (12-108)||(14989518-14989614)
chr8 (12-108)||(18151713-18151809)
chr8 (28-202)||(24833029-24833204)
chr8 (17-121)||(45567955-45568059)
chr8 (12-104)||(13430699-13430791)
chr8 (23-58)||(43639782-43639817)
chr8 (17-55)||(7018416-7018454)
chr8 (17-55)||(20259652-20259690)
chr8 (17-55)||(21046282-21046320)
chr8 (146-221)||(3598302-3598375)
chr8 (28-112)||(18772624-18772707)
chr8 (28-80)||(21301026-21301078)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (12-219)||(14644-14851)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (12-221)||(32481-32690)
scaffold0084 (12-221)||(49328-49537)
scaffold0084 (17-121)||(351-455)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (12-221)||(377465-377674)
scaffold0004 (12-221)||(220234-220442)
scaffold0004 (21-155)||(244256-244390)
scaffold0004 (12-219)||(211394-211599)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (12-216)||(2500030-2500234)
chr7 (13-220)||(15088513-15088720)
chr7 (12-221)||(13137852-13138061)
chr7 (12-221)||(10883130-10883339)
chr7 (12-221)||(13302802-13303011)
chr7 (12-221)||(44467056-44467266)
chr7 (12-221)||(16316514-16316723)
chr7 (12-221)||(2913565-2913774)
chr7 (12-221)||(21695393-21695602)
chr7 (12-221)||(22577978-22578187)
chr7 (15-219)||(11319400-11319604)
chr7 (15-221)||(28409034-28409240)
chr7 (14-215)||(13730638-13730839)
chr7 (12-221)||(13880096-13880305)
chr7 (12-221)||(21692279-21692488)
chr7 (12-219)||(13648721-13648928)
chr7 (15-221)||(21283330-21283536)
chr7 (12-221)||(12366705-12366914)
chr7 (12-220)||(9069554-9069762)
chr7 (12-221)||(11792899-11793108)
chr7 (12-221)||(30944282-30944489)
chr7 (12-221)||(33691669-33691878)
chr7 (23-221)||(23279916-23280113)
chr7 (12-221)||(30025897-30026106)
chr7 (15-221)||(24788136-24788342)
chr7 (16-221)||(30945315-30945518)
chr7 (28-221)||(15467924-15468117)
chr7 (12-221)||(29935316-29935524)
chr7 (12-221)||(28622315-28622522)
chr7 (15-211)||(5000788-5000985)
chr7 (12-221)||(9709761-9709968)
chr7 (12-221)||(48236861-48237068)
chr7 (15-221)||(14426542-14426746)
chr7 (17-200)||(19237022-19237204)
chr7 (15-219)||(39284524-39284727)
chr7 (12-218)||(331637-331842)
chr7 (12-221)||(33605677-33605885)
chr7 (41-219)||(13692372-13692541)
chr7 (12-202)||(16111860-16112050)
chr7 (12-204)||(13018479-13018671)
chr7 (12-124)||(16309961-16310073)
chr7 (15-202)||(35952663-35952851)
chr7 (12-221)||(13260580-13260781)
chr7 (13-219)||(13893958-13894162)
chr7 (14-149)||(14193108-14193243)
chr7 (40-200)||(13880608-13880768)
chr7 (12-221)||(41842231-41842439)
chr7 (12-202)||(4821466-4821655)
chr7 (40-164)||(12174354-12174479)
chr7 (37-204)||(13032046-13032213)
chr7 (46-221)||(16542979-16543152)
chr7 (46-221)||(16622510-16622683)
chr7 (12-221)||(8182922-8183128)
chr7 (148-221)||(4494634-4494707)
chr7 (40-141)||(9098283-9098384)
chr7 (15-132)||(19711059-19711176)
chr7 (95-202)||(13472555-13472663)
chr7 (23-221)||(2265478-2265674)
chr7 (65-202)||(15704475-15704612)
chr7 (15-156)||(1293025-1293157)
chr7 (12-107)||(48062891-48062986)
chr7 (17-221)||(14425444-14425636)
chr7 (12-80)||(27871710-27871778)
chr7 (65-152)||(16556664-16556751)
chr7 (65-152)||(16608911-16608998)
chr7 (28-104)||(19339324-19339400)
chr7 (12-80)||(24794813-24794881)
chr7 (12-71)||(4494569-4494628)
chr7 (159-221)||(7339833-7339893)
chr7 (28-107)||(16412000-16412078)
chr7 (188-221)||(14193242-14193275)
chr7 (18-55)||(14745750-14745787)
chr7 (12-104)||(32264791-32264884)
chr7 (12-80)||(48805977-48806045)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (12-220)||(37985525-37985733)
chr4 (12-215)||(29680462-29680665)
chr4 (12-221)||(16632430-16632639)
chr4 (12-217)||(19666362-19666567)
chr4 (12-221)||(12811090-12811296)
chr4 (12-221)||(3395580-3395789)
chr4 (12-221)||(45833384-45833593)
chr4 (12-221)||(55380280-55380489)
chr4 (12-221)||(19884692-19884900)
chr4 (12-221)||(37435447-37435656)
chr4 (20-212)||(12601099-12601291)
chr4 (12-207)||(9140902-9141097)
chr4 (12-221)||(19620973-19621182)
chr4 (12-220)||(14604819-14605028)
chr4 (15-221)||(56034567-56034773)
chr4 (12-221)||(10072925-10073133)
chr4 (12-221)||(14904268-14904477)
chr4 (23-221)||(22675434-22675630)
chr4 (28-221)||(413008-413199)
chr4 (12-221)||(10692841-10693048)
chr4 (12-221)||(10906607-10906814)
chr4 (12-221)||(19911792-19912002)
chr4 (40-221)||(3483739-3483920)
chr4 (12-221)||(13576028-13576235)
chr4 (23-221)||(17247245-17247440)
chr4 (75-220)||(14833449-14833594)
chr4 (23-221)||(54679931-54680125)
chr4 (14-202)||(29121362-29121550)
chr4 (12-220)||(6641674-6641881)
chr4 (12-221)||(40846089-40846298)
chr4 (12-221)||(6517475-6517682)
chr4 (12-221)||(23750512-23750719)
chr4 (12-202)||(8105628-8105819)
chr4 (12-221)||(3105334-3105540)
chr4 (12-164)||(56533030-56533182)
chr4 (12-191)||(25651046-25651224)
chr4 (23-157)||(11915701-11915835)
chr4 (119-221)||(23123528-23123630)
chr4 (32-179)||(16940026-16940172)
chr4 (12-221)||(17398598-17398795)
chr4 (82-221)||(15139287-15139426)
chr4 (12-121)||(16853493-16853602)
chr4 (86-221)||(55731844-55731976)
chr4 (23-157)||(17540396-17540530)
chr4 (28-197)||(41114707-41114875)
chr4 (12-104)||(38513868-38513960)
chr4 (12-80)||(20977447-20977515)
chr4 (12-80)||(22190836-22190904)
chr4 (28-67)||(8685509-8685548)
chr4 (31-157)||(11901196-11901322)
chr4 (28-112)||(17788067-17788152)
chr4 (12-80)||(39419787-39419855)
chr4 (12-104)||(40860657-40860749)
chr4 (28-78)||(1672395-1672445)
chr4 (28-78)||(1674870-1674920)
chr4 (12-62)||(14154065-14154115)
chr4 (40-80)||(3499705-3499745)
chr4 (12-80)||(9751593-9751661)
chr4 (23-80)||(27188691-27188748)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (12-219)||(1686-1893)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (12-221)||(13602168-13602377)
chr6 (12-220)||(26972173-26972379)
chr6 (12-221)||(32544261-32544470)
chr6 (16-221)||(23284564-23284769)
chr6 (14-221)||(9717841-9718048)
chr6 (13-221)||(20112643-20112852)
chr6 (12-219)||(15302196-15302403)
chr6 (12-221)||(12715363-12715573)
chr6 (28-221)||(13435544-13435737)
chr6 (12-221)||(14100384-14100592)
chr6 (12-198)||(18378310-18378496)
chr6 (15-219)||(15987232-15987437)
chr6 (12-221)||(29918013-29918221)
chr6 (12-221)||(15531568-15531777)
chr6 (12-221)||(19623975-19624184)
chr6 (29-219)||(21625114-21625303)
chr6 (12-221)||(24116824-24117034)
chr6 (40-221)||(19688790-19688969)
chr6 (12-221)||(18435552-18435761)
chr6 (12-221)||(19086154-19086353)
chr6 (12-221)||(22802137-22802344)
chr6 (16-198)||(20730671-20730853)
chr6 (12-199)||(16265116-16265303)
chr6 (46-221)||(34451612-34451787)
chr6 (12-219)||(16336123-16336328)
chr6 (15-221)||(15954702-15954906)
chr6 (94-221)||(25597557-25597684)
chr6 (12-221)||(16877209-16877416)
chr6 (12-221)||(22076353-22076560)
chr6 (12-182)||(26943572-26943741)
chr6 (29-200)||(10640384-10640555)
chr6 (12-202)||(20487880-20488071)
chr6 (23-221)||(21618251-21618447)
chr6 (18-221)||(12348995-12349195)
chr6 (23-221)||(19832978-19833175)
chr6 (16-184)||(12423261-12423428)
chr6 (29-197)||(19470683-19470850)
chr6 (12-103)||(25594064-25594155)
chr6 (28-221)||(21235137-21235316)
chr6 (12-154)||(33351939-33352079)
chr6 (12-94)||(17381517-17381599)
chr6 (12-104)||(19066079-19066171)
chr6 (15-80)||(19482751-19482816)
chr6 (12-80)||(17316610-17316678)
chr6 (28-112)||(25930485-25930568)
chr6 (17-122)||(14051425-14051529)
chr6 (12-80)||(26589595-26589664)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (12-220)||(17814960-17815168)
chr5 (12-221)||(6512367-6512573)
chr5 (12-221)||(41566370-41566579)
chr5 (12-221)||(21910548-21910757)
chr5 (12-221)||(23412910-23413119)
chr5 (12-221)||(89358-89567)
chr5 (12-218)||(7745632-7745838)
chr5 (12-221)||(21072177-21072385)
chr5 (12-221)||(20550887-20551096)
chr5 (12-221)||(33022656-33022863)
chr5 (12-221)||(19536236-19536446)
chr5 (12-221)||(13545456-13545657)
chr5 (12-221)||(26784346-26784555)
chr5 (12-221)||(31117869-31118077)
chr5 (12-202)||(4887014-4887204)
chr5 (12-221)||(30742973-30743179)
chr5 (12-221)||(42243673-42243880)
chr5 (12-221)||(11993880-11994087)
chr5 (12-204)||(6499231-6499423)
chr5 (12-221)||(23881059-23881267)
chr5 (12-221)||(15516962-15517168)
chr5 (12-221)||(29138346-29138551)
chr5 (12-221)||(21198941-21199148)
chr5 (12-184)||(12352768-12352940)
chr5 (12-221)||(642644-642849)
chr5 (12-221)||(21099641-21099849)
chr5 (13-204)||(25096777-25096969)
chr5 (13-204)||(25154747-25154939)
chr5 (12-202)||(33933259-33933453)
chr5 (12-202)||(14086492-14086684)
chr5 (12-110)||(9398781-9398879)
chr5 (28-221)||(26759157-26759348)
chr5 (15-221)||(3245380-3245583)
chr5 (23-156)||(26765501-26765634)
chr5 (12-151)||(28139599-28139738)
chr5 (12-131)||(30115863-30115982)
chr5 (12-108)||(9088961-9089057)
chr5 (17-133)||(32160763-32160879)
chr5 (15-107)||(28464389-28464481)
chr5 (12-220)||(25930104-25930301)
chr5 (12-107)||(10848765-10848860)
chr5 (12-104)||(35932059-35932151)
chr5 (17-132)||(11208011-11208125)
chr5 (28-112)||(16607520-16607603)
chr5 (122-221)||(5429985-5430083)
chr5 (23-80)||(23391680-23391737)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (14-221)||(18527-18734)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (12-221)||(12205-12414)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (15-219)||(25883-26087)
scaffold0083 (49-179)||(44652-44782)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (12-221)||(5596-5805)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (12-221)||(60012-60221)
scaffold0026 (12-221)||(7922-8131)
scaffold0026 (167-204)||(151794-151831)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (15-219)||(474-678)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (15-214)||(15116-15315)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (12-221)||(22672-22881)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (12-184)||(13567-13739)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (15-221)||(10013-10220)
scaffold0161 (15-80)||(14819-14884)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (15-221)||(19378-19584)
scaffold0035 (12-202)||(99133-99320)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (12-221)||(27335-27544)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (21-220)||(7708-7907)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (12-221)||(1656-1865)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (12-221)||(20877-21086)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (12-220)||(212350-212559)
scaffold0005 (75-220)||(6105-6250)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (34-221)||(4853-5040)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (12-221)||(9965-10174)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (12-221)||(36681-36890)
scaffold0120 (12-221)||(42115-42324)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (12-221)||(15789-16000)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (12-220)||(19027-19235)
scaffold0217 (15-221)||(9559-9762)
scaffold0217 (12-202)||(22056-22246)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (29-221)||(103585-103777)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (12-221)||(89963-90170)
scaffold0003 (28-107)||(712-790)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (75-220)||(30283-30428)
scaffold0047 (12-221)||(9899-10107)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (15-221)||(563-767)
scaffold1359 (17-221)||(1673-1865)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (12-221)||(6648-6855)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (12-217)||(215409-215612)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (12-221)||(6003-6211)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (12-221)||(9952-10161)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (12-221)||(5510-5717)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (82-221)||(692-831)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (15-221)||(60802-61006)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (12-221)||(1607-1814)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (12-221)||(78274-78481)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (12-220)||(143093-143292)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (46-221)||(9825-10000)
scaffold0334 (15-50)||(7823-7858)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (85-221)||(39494-39630)
scaffold0022 (85-221)||(137554-137690)
scaffold0022 (12-204)||(159051-159242)
scaffold0022 (12-77)||(37398-37463)
scaffold0022 (12-77)||(135458-135523)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (30-197)||(36115-36281)
scaffold0056 (15-104)||(25688-25777)
scaffold0056 (12-104)||(34827-34919)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (12-221)||(3300-3507)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (12-221)||(9151-9357)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (29-157)||(1491-1619)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (132-220)||(4900-4988)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (13-219)||(43828-44032)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (23-221)||(7064-7260)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (23-219)||(5634-5828)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (17-159)||(40638-40780)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (17-133)||(164940-165056)
scaffold0011 (70-221)||(65337-65485)
scaffold0011 (70-221)||(144382-144530)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (32-93)||(2029-2090)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (12-133)||(25393-25514)
scaffold0247 (12-55)||(15811-15854)
scaffold0247 (140-221)||(23471-23549)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (12-117)||(74577-74682)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (12-156)||(2702-2845)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (23-109)||(1324-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (23-109)||(1-87)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (17-121)||(15628-15732)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (47-202)||(7963-8117)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (12-107)||(17785-17880)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (23-126)||(38086-38189)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (132-221)||(5845-5935)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (29-121)||(1803-1895)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (12-81)||(2737-2806)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (12-80)||(7377-7445)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (12-80)||(87647-87715)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (12-102)||(846-935)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (23-80)||(3942-3999)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (12-53)||(6002-6043)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (23-77)||(7292-7346)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (23-104)||(31808-31888)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-80)||(731-788)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (28-60)||(6589-6621)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28492489 - 28492280
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28492489 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28492390  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28492389 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 28492290  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  28492289 cctgatgaac 28492280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256227
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33256336 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33256237  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    |||| |||||    
T  33256236 cctgttgaac 33256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276399
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33276508 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33276409  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    |||| |||||    
T  33276408 cctggtgaac 33276399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22600058
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22600167 tcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22600068  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22600067 cctgatgaac 22600058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154061
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22153952 tcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22154051  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22154052 cctgatgaac 22154061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757626
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10757516 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 10757615  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  10757616 tcctgatgaac 10757626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578067
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1577962 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 1578061  T
Q  212 cctgat 217  Q
    ||||||    
T  1578062 cctgat 1578067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201614
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||  ||||||||||||||||||    
T  22201721 tcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatct 22201622  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||||||||    
T  22201621 cctgatga 22201614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717720
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19717619 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 19717718  T
Q  212 cc 213  Q
    ||    
T  19717719 cc 19717720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20954558 - 20954349
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  20954558 agcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaa 20954459  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20954458 tcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20954359  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  20954358 cctgatgaac 20954349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704408
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48704299 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 48704398  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  48704399 tctgatgaac 48704408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900549
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1900440 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatct 1900539  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  1900540 cctgatgaac 1900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32786018 - 32785814
Alignment:
Q  16 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 115  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32786018 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 32785919  T
Q  116 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 215  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32785918 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 32785820  T
Q  216 atgaac 221  Q
    ||||||    
T  32785819 atgaac 32785814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282770
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38282661 tcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38282760  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  38282761 cctgatgaac 38282770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284627
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12284518 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 12284617  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  12284618 tctgatgaac 12284627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 2267087 - 2267291
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2267087 agagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 2267186  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  2267187 tttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcct 2267284  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  2267285 gatgaac 2267291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134391
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc-ttcaaa 36134283  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36134284 tcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 36134383  T
Q  212 cctgatga 219  Q
     |||||||    
T  36134384 tctgatga 36134391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22427442 - 22427235
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22427442 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22427343  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  22427342 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatct 22427245  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22427244 cctgatgaac 22427235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268732
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaa 2268625  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2268626 tcatttcaaaata---gttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatct 2268722  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  2268723 cctaatgaac 2268732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402011
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 35401920  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35401921 ttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga 35402011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29215998
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  29215892 tcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 29215989  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    |||||||||    
T  29215990 cctgatgaa 29215998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39201077 - 39200870
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  39201077 agcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 39200978  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  39200977 tcctttcaaactagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatct 39200880  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  39200879 cctaatgaac 39200870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16235381 - 16235182
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16235381 agcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaa 16235282  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16235281 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatct 16235182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 30893090 - 30893297
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||    
T  30893090 agagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcc 30893189  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||   |||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  30893190 tttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcc 30893289  T
Q  214 tgatgaac 221  Q
    ||||||||    
T  30893290 tgatgaac 30893297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22464894 - 22464686
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22464894 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22464795  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | || ||||    
T  22464794 tcatttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatc 22464697  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  22464696 tcctgatgaac 22464686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448444
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 25448552  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  25448551 tcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 25448454  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  25448453 tctgatgaac 25448444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21028980
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21028888 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtct 21028980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23036595 - 23036405
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23036595 agtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttg 23036496  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23036495 ttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga 23036405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21191947 - 21191763
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21191947 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 21191848  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 200  Q
    |||  || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  21191847 ttttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctttaa 21191763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 2834684 - 2834892
Alignment:
Q  12 agcagagacaca-aactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  2834684 agcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa 2834783  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  2834784 atcctttcaaattagccgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatc 2834881  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    ||| |||||||    
T  2834882 tcccgatgaac 2834892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040351
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaa 35040260  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  35040261 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaagt 35040351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613713
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 200  Q
    | ||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  12613799 t-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2327525 - 2327317
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||  | |||||| |||||||||| ||| |    
T  2327525 agcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcga 2327426  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||  |||||| || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2327425 atcctttcaaaatagtttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 2327328  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  2327327 tcctgatgaac 2327317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 7309830 - 7310020
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || || |||| | |||||||||||||||||||| | ||||||        
T  7309830 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttttgaa-gaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgacc 7309928  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7309929 gttgcttcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 7310020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26702214 - 26702005
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | |||  |||||||||||||||     
T  26702214 agcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaac 26702115  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  26702114 ttcatttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatct 26702015  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  26702014 tctgatgaac 26702005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 30572192 - 30572398
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||  ||    
T  30572192 agcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaa 30572291  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| || |||| || || ||||| |  |||| |  |||||||||||||  ||| ||||    
T  30572292 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaag--ttgtatct 30572388  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  30572389 cctgatgaac 30572398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821423
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||| ||| |||||||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaa 44821531  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||  ||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44821530 tccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 44821433  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  44821432 cctgatgaac 44821423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570111
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  ||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaa 48570217  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  48570216 tccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 48570120  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    |||||||||    
T  48570119 cctgatgaa 48570111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21703015
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| ||||||| |  ||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaa 21702908  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  21702909 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatct 21703005  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  21703006 cctgatgaac 21703015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14263525 - 14263371
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263525 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 14263426  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcca 177  Q
    |||| |||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  14263425 tagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatcca 14263371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024920
Alignment:
Q  32 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttg 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  132 cttcactctt 141  Q
    ||||||||||    
T  17024929 cttcactctt 17024920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 46088984 - 46089182
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  46088984 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 46089075  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
     |||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||| | || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  46089076 -cctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 46089172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 10250984 - 10251178
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  || ||  ||||| || ||||||||||||||          
T  10250984 agagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgccttc------ 10251077  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
       |||| |||  |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10251078 ---caaattagccgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcct 10251171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896537
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| | | ||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || |||  |    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccg 18896566  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    |||||||   |||| ||||||||||||||    
T  18896565 ttgcttcttgcttctagtcttctgcaatg 18896537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7745159 - 7744968
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||  ||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  7745159 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaact 7745060  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||| | ||  | ||||||| |||| |  |||||  || || |||||||| |||||| |||||| || || |  |||||||| |||||||||    
T  7745059 gttgctactcttcttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtagg--ttgcatcttctgatgaac 7744968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 19215607 - 19215675
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  19215607 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgct 19215675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21121149 - 21121057
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21121149 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21135245 - 21135153
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  21135245 agcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 23024783 - 23024851
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  23024783 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 23024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21204997 - 21204916
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  21204997 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 21204916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  31 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Original strand, 21984607 - 21984683
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21984607 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 37642243 - 37642311
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  37642243 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgct 37642311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 17371042 - 17371085
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtac 60  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17371042 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 17371085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642717
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49642826 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 49642727  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  49642726 cctgatgaac 49642717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467537
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  37467428 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatct 37467527  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  37467528 cctgatgaac 37467537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303585
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  31303481 tcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatct 31303580  T
Q  212 cctga 216  Q
    |||||    
T  31303581 cctga 31303585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561392
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||  |||||||    
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2561283 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 2561382  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  2561383 cctgatgaac 2561392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392959
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14393068 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 14392969  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  14392968 cctaatgaac 14392959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12963249 - 12963040
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12963249 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12963150  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12963149 accttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatct 12963050  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  12963049 cctgatgaac 12963040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Original strand, 41494994 - 41495179
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41494994 agcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 41495093  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41495094 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 13948334 - 13948538
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13948334 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 13948433  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13948434 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 13948533  T
Q  215 gatga 219  Q
    |||||    
T  13948534 gatga 13948538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17239083 - 17238884
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17239083 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 17238984  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17238983 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 17238884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6090936
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6090827 tcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatct 6090926  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  6090927 cctgatgaac 6090936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 15903196 - 15903399
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa-catccaatgccttcaaatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15903196 agagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatc 15903295  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15903296 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcc 15903395  T
Q  214 tgat 217  Q
    ||||    
T  15903396 tgat 15903399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 28582103 - 28582309
Alignment:
Q  14 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  28582103 cagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatc 28582202  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28582203 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 28582302  T
Q  214 tgatgaa 220  Q
    |||||||    
T  28582303 tgatgaa 28582309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38177791 - 38177605
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38177791 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38177692  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38177691 gttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 38177605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969531
Alignment:
Q  31 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  131 gcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaac 14969531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780575
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13780648 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18121786 - 18121577
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18121786 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18121687  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18121686 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 18121587  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  18121586 cctgatgaac 18121577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29951602 - 29951393
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29951602 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29951503  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  29951502 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 29951403  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  29951402 tctgatgaac 29951393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30000756 - 30000547
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30000756 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 30000657  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  30000656 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 30000557  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  30000556 tctgatgaac 30000547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824263
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcactc 13824191  T
Q  140 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13824192 ttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646359
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  20646249 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatc 20646348  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  20646349 tcctgatgaac 20646359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47405585 - 47405378
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  47405585 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaa 47405486  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  47405485 tcctttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 47405388  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  47405387 cgtgatgaac 47405378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18142916 - 18142707
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18142916 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18142817  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18142816 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatct 18142717  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  18142716 cctgatgaac 18142707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49553653 - 49553444
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49553653 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 49553554  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  49553553 tcctttcaaaatagtcactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 49553454  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  49553453 cctgatgaac 49553444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 47207701 - 47207909
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  47207701 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 47207800  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    || ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||    
T  47207801 tcatttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatc 47207898  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  47207899 tcctgatgaac 47207909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726185
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||  || |||||||||| ||||||    
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12726294 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatct 12726195  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  12726194 cctgatgaac 12726185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658573
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| || ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16658682 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatct 16658583  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  16658582 cctgatgaac 16658573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19889107 - 19888899
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19889107 agcagagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19889010  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  19889009 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatc 19888910  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    || ||||||||    
T  19888909 tcttgatgaac 19888899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800056
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttta 199  Q
    | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40799969 tactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta 40800056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 52920403 - 52920609
Alignment:
Q  14 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 113  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  52920403 cagagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaata 52920502  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  52920503 cttt-aaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcc 52920601  T
Q  214 tgatgaac 221  Q
    ||||||||    
T  52920602 tgatgaac 52920609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032726
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||| ||  ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  16032620 tcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 16032718  T
Q  212 cctgatga 219  Q
     |||||||    
T  16032719 tctgatga 16032726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 11223559 - 11223765
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  11223559 agcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 11223657  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||  |||  ||| ||||    
T  11223658 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatct 11223755  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  11223756 cctgatgaac 11223765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20627595 - 20627388
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  20627595 agcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaa 20627496  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  20627495 tccattcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatct 20627398  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  20627397 cctgatgaac 20627388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24775698 - 24775491
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||| || ||| |||||||||||||    
T  24775698 agcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 24775599  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  24775598 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 24775501  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  24775500 cctgatgaac 24775491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 2785075 - 2785267
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2785075 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagt 2785174  T
Q  127 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2785175 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 2785267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804048
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaag 22804088  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 151  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  22804087 tcctttcaaaatagccgttgcttcactcttctggtcttct 22804048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056701
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 53056792  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  || |||||||| |||| | |||||| | ||||||    
T  53056791 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaagt 53056701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46349991 - 46349801
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  46349991 agtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcg 46349892  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||||||    
T  46349891 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaac 46349801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 14955433 - 14955629
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14955433 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaa 14955532  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  14955533 tagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaac 14955629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12389035 - 12388845
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  12389035 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaat 12388936  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
     ||||  || |||| || |||||||| |||   ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12388935 tcttttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19249558 - 19249385
Alignment:
Q  30 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 129  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||    
T  19249558 gtagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgt 19249459  T
Q  130 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19249458 tgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398295
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaa 25398320  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttca 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  25398319 tcctttcaaaatagtcgttgcttca 25398295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140966
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||  ||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaa 22140858  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||| ||||| | || || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22140859 acccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 22140956  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22140957 cctgatgaac 22140966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Original strand, 20725093 - 20725269
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||     
T  20725093 aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaat 20725192  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||| | |||||||||||||    
T  20725193 tagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaa 20725269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 33583240 - 33583416
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 126  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33583240 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagc 33583339  T
Q  127 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  33583340 cgttgcttcacttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaagt 33583416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 5213583 - 5213778
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| || ||  || || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5213583 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgcttttgaat-aataagcatctaatgccttcaaatccttccaaaa 5213681  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| || || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5213682 tagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 5213778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 29855404 - 29855587
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29855404 agcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29855503  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaag 194  Q
    | |||||||| |||  |||||||||| | ||  |||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||    
T  29855504 ttctttcaaactagccgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaag 29855587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 221
Target Start/End: Original strand, 11869137 - 11869270
Alignment:
Q  86 aagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  11869137 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcattaaacaa 11869236  T
Q  186 catttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
      |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  11869237 attttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaac 11869270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538185
Alignment:
Q  30 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||  |||||   ||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  130 tgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 12968312 - 12968446
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||  ||     
T  12968312 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaat 12968411  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  12968412 tagtcgttacttcatgcttctagtcttctgcaatg 12968446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 164
Target Start/End: Original strand, 50300246 - 50300370
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 138  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  50300246 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttc-aaatagcagttgcttcact 50300344  T
Q  139 cttccagtcttctgcaatgcttagac 164  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  50300345 tttccagtcttctgcaatccttagac 50300370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 21640865 - 21641068
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||  || || || |||||||||| ||  |||||    
T  21640865 agagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatcc 21640964  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    || ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| | || || ||||| |  |||| | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  21640965 ttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcct 21641061  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  21641062 gatgaac 21641068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868332
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgct 11868332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46796531 - 46796334
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||  ||| ||||            
T  46796531 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatg-------- 46796440  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
     ||||||||| |||  ||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  46796439 -cctttcaaattagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 46796344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49666569 - 49666372
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||  ||||| |         || |||  ||    
T  49666569 agcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaagaata---------tgtctttcaa 49666479  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  49666478 tcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 49666382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605726
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26417832 - 26417698
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| | | |||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||     
T  26417832 aaacagagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttttgaat 26417733  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    |||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26417732 tagccgttgcttcattcttctagtcttctggaatg 26417698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11909171 - 11909079
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11909171 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21636834 - 21636742
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21636834 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25398290 - 25398238
Alignment:
Q  159 ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25398290 ttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054313
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 30054313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1728179 - 1728129
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 62  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1728179 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9700200 - 9700132
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  9700200 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 9700132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45858875 - 45858804
Alignment:
Q  50 acacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 121  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45858875 acacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 37412605 - 37412650
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 62  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37412605 agacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Original strand, 51341011 - 51341107
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        |||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||| |||||    
T  51341011 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac--------tttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaattcctt 51341102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 55
Target Start/End: Original strand, 13557777 - 13557809
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557777 aaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 13557809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Original strand, 40850991 - 40851055
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  40850991 tagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40851055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829333
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25829224 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatct 25829323  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  25829324 cctgatgaac 25829333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667188
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30667079 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatct 30667178  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  30667179 cctgatgaac 30667188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9015478 - 9015271
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  9015478 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 9015381  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9015380 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 9015281  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  9015280 cctgatgaac 9015271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963879
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13963988 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 13963889  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  13963888 actgatgaac 13963879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20568860 - 20568651
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20568860 agcagatacacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20568761  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  20568760 tcctttcaaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatct 20568661  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  20568660 cctgatgaac 20568651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037160
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25037269 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25037170  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  25037169 cctgatgaac 25037160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041267
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25041376 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25041277  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  25041276 cctgatgaac 25041267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235206
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23235097 ttctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 23235196  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  23235197 catgatgaac 23235206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 30621210 - 30621412
Alignment:
Q  16 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30621210 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30621309  T
Q  116 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30621310 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30621409  T
Q  216 atg 218  Q
    |||    
T  30621410 atg 30621412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 30623831 - 30624033
Alignment:
Q  16 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30623831 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30623930  T
Q  116 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 215  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30623931 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30624030  T
Q  216 atg 218  Q
    |||    
T  30624031 atg 30624033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22188003
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  22188112 tctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgt 22188013  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22188012 cctgatgaac 22188003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540615
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
     |||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540506 acctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 19540605  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  19540606 catgatgaac 19540615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21537358 - 21537149
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  21537358 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaa 21537259  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21537258 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21537159  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  21537158 cctgatgaac 21537149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576235
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaaga-ttaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24576125 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatc 24576224  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||| ||||||    
T  24576225 tcctaatgaac 24576235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376824
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18376916 tcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtct 18376824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009650
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttc-cagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10009760 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 10009661  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  10009660 tcctgatgaac 10009650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377300
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24377191 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24377289  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    || ||||||||    
T  24377290 tcttgatgaac 24377300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24850776 - 24850569
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||    
T  24850776 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaa 24850677  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24850676 tcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24850577  T
Q  211 tcctgatg 218  Q
    ||||||||    
T  24850576 tcctgatg 24850569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 38781388 - 38781596
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaact-gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  38781388 agcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaa 38781487  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38781488 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 38781587  T
Q  211 tcctgatga 219  Q
      |||||||    
T  38781588 ctctgatga 38781596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140520
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28140629 tcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatct 28140530  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    || |||||||    
T  28140529 cccgatgaac 28140520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782669
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    ||||  |||| ||||||||||||||    
T  40782567 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatct 40782660  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    |||||||||    
T  40782661 cctgatgaa 40782669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151939
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||     
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcactt 20152018  T
Q  140 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20152017 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatga 20151939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6574223 - 6574025
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574223 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 6574124  T
Q  122 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  6574123 ctagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaa 6574026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 22317583 - 22317792
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22317583 agcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22317682  T
Q  112 tcctttc-aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  22317683 tcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22317782  T
Q  211 tcctgatgaa 220  Q
    || |||||||    
T  22317783 tcttgatgaa 22317792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779525
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24779433 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 219
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260603
Alignment:
Q  48 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtc 147  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  148 ttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatga 22260603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800853
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaa 31800898  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31800897 tcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaat 31800853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037547
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||     
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  39037652 ttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatct 39037553  T
Q  212 cctgat 217  Q
     |||||    
T  39037552 tctgat 39037547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595473
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc--ttcagagaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  23595579 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatct 23595481  T
Q  212 cctgatga 219  Q
     |||||||    
T  23595480 tctgatga 23595473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711618
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    | | ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  28711708 ttcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 28711618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121642
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 200  Q
    ||||||  || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  41121729 tccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 41121642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454891
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    | | ||  || ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||    
T  22455000 ttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatc 22454902  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    | |||| ||||    
T  22454901 ttctgaagaac 22454891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26619200 - 26619027
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||  |||    
T  26619200 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaa 26619101  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26619100 tagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctt 26619027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Original strand, 25189391 - 25189579
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||| | |    
T  25189391 agagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttc 25189490  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
     ||  || ||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25189491 atttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 25189579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 6392624 - 6392814
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||    
T  6392624 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 6392722  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatc-cattgaacaacatttgaagctttaag 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||| |||| | |||||||| |||||    
T  6392723 atcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag 6392814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074423
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||  ||||| || |||| ||||||||| ||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaa 33074315  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||  | ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  33074316 tctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 33074413  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  33074414 cctgatgaac 33074423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45087266 - 45087102
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||   |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45087266 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 45087167  T
Q  140 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaac-atttgaagctttaagt 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  45087166 ttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaagt 45087102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 22802451 - 22802657
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||  ||||| || ||||  |||||||||||    
T  22802451 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaa 22802549  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||  ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||| || | | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22802550 tcctttcaaaatagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatct 22802647  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22802648 cctgatgaac 22802657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28701339 - 28701149
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28701339 agcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28701240  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||| || || |||| ||| |||| | |||||||| ||||||    
T  28701239 tcctttcaaaatatctgttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaagt 28701149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31328075 - 31327868
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  31328075 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 31327977  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
     || | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  |||| | || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31327976 accctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatc 31327879  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  31327878 tcctgatgaac 31327868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31334796 - 31334589
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  31334796 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 31334698  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
     || | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  |||| | || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31334697 accctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatc 31334600  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  31334599 tcctgatgaac 31334589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34322030 - 34321840
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  34322030 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtc 34321931  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    ||||||  ||| |||||| ||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  34321930 gttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaa 34321840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35743905
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||| |||||||||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaa 35744011  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||||  ||||||  | || | ||  || |||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  35744010 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatattctgcaatctttagac--gtttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaag--ttgcatct 35743915  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  35743914 cctgatgaac 35743905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609161
Alignment:
Q  100 aatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag-tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagcttt 7609138  T
Q  199 aagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7609139 aagtcttgcatctcctgatgaac 7609161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 44881173 - 44881302
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||  || |||||||||||||||||||| || ||  || ||| |    
T  44881173 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagct 44881272  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44881273 gctgcttcattcttccagtcttctgcaatg 44881302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30557415 - 30557239
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  30557415 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatagt 30557316  T
Q  127 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
     | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  30557315 cgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaagt 30557239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 19115089 - 19115279
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| ||| |  |||||| || ||||| |||| |   || |||||    
T  19115089 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagtt 19115188  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||| || || |||||||    
T  19115189 gttgcttcattcttccagtcttctgcaat-agtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatga 19115279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184276
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc--ttcagagaacaga-atccaatgccttcaaa 23184318  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgca 154  Q
    | | ||  || |||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  23184317 ttcatttgaattagtcg-tgcttcactcttctggtcttctgca 23184276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272303
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa-catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||     
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtc 22272238  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaa 193  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22272239 attgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaa 22272303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550893
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 28550937  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 156  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  28550936 -cctttcaaaatagttgtttctatacttttccagtcttctgcaat 28550893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840519
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 44840519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31968018
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 31968062  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 156  Q
     | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31968061 -catttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat 31968018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776303
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781681
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1587142 - 1587048
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | |||||||||||||    
T  1587142 agcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgcctt 1587048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 14581505 - 14581600
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  14581505 agcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14581600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18431034 - 18430844
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||| | | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||  || |||      
T  18431034 gagtagtggaggtcgtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18430935  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| |  ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  18430934 gttgcttcatgcttctagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctttcagcttctgatga 18430844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332172
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277116
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 3277116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 52
Target Start/End: Original strand, 22258191 - 22258231
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258191 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 18702744 - 18702934
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||||||  || |||| ||||||||||||| ||||  || |||      
T  18702744 gagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18702843  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |  ||||||||| |||||||||| || |||| || || |||||||    
T  18702844 gttacttcatgcttctagtcttctgtaatg-atagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatga 18702934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22785749 - 22785670
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22785749 gagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 19498048 - 19498010
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19498048 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19498010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23392750 - 23392710
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  23392750 tagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgct 23392710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24814677 - 24814645
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtac 60  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24814677 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 24814645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693730
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39693623 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 39693722  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||||||||    
T  39693723 cctgatga 39693730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12757923 - 12757717
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12757923 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 12757824  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12757823 tttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcct 12757724  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  12757723 gatgaac 12757717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207503
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16207394 tcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 16207493  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  16207494 cctgatgaac 16207503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602674
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  602783 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcattt 602684  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  602683 cctgatgaac 602674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156393
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19156284 tcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatct 19156383  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  19156384 cttgatgaac 19156393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914654
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  17914547 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaact 17914646  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||| ||||    
T  17914647 cctaatga 17914654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681257
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16681366 tcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 16681267  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  16681266 cctgatgaac 16681257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17525889 - 17525682
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17525889 agagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcc 17525790  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17525789 tttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcc 17525690  T
Q  214 tgatgaac 221  Q
    ||||||||    
T  17525689 tgatgaac 17525682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 16188972 - 16189181
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  16188972 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaa 16189071  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16189072 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16189171  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  16189172 cctaatgaac 16189181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18321319 - 18321113
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18321319 agagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcc 18321220  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18321219 tttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 18321120  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  18321119 gatgaac 18321113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646535
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24646426 tcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 24646525  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  24646526 cttgatgaac 24646535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083054
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 33082972  T
Q  140 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082973 ttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 33083054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17441967 - 17441762
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  17441967 agagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgc-ttcaaatcc 17441869  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17441868 tttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcct 17441769  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  17441768 gatgaac 17441762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693512
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  29693403 tcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatct 29693502  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  29693503 cctaatgaac 29693512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 19943234 - 19943434
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19943234 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 19943333  T
Q  122 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943334 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 19943433  T
Q  221 c 221  Q
    |    
T  19943434 c 19943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23185389 - 23185182
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  23185389 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 23185290  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  23185289 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 23185192  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  23185191 cctgatgaac 23185182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933079
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21932971 tcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21933070  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    |||||||||    
T  21933071 cctgatgaa 21933079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701942
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||  | |||||||||||||||||    
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  17701833 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 17701932  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  17701933 tctgatgaac 17701942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 18679803 - 18680011
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18679803 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18679902  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18679903 tcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatct 18680002  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
     ||||||||    
T  18680003 tctgatgaa 18680011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20382556 - 20382348
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  20382556 gcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaat 20382457  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 212  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20382456 cctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctc 20382357  T
Q  213 ctgatgaac 221  Q
    |||||||||    
T  20382356 ctgatgaac 20382348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 17267463 - 17267670
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  17267463 gcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaat 17267562  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17267563 cctttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 17267661  T
Q  213 ctgatgaac 221  Q
     ||||||||    
T  17267662 ttgatgaac 17267670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719198
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  || ||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18719089 tcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 18719188  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||| ||||    
T  18719189 tctgaagaac 18719198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18121269 - 18121063
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  18121269 agcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 18121173  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  18121172 tcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 18121073  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  18121072 cctgatgaac 18121063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797615
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 17797509  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  17797510 tcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 17797607  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||||||||    
T  17797608 cctgatga 17797615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263565
Alignment:
Q  30 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  130 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagct-ttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    || |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaac 23263565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30421591 - 30421384
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattc--aaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30421591 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaa 30421493  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||    
T  30421492 atccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 30421395  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    | |||||||||    
T  30421394 ttctgatgaac 30421384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538412
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  45538502 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaagt 45538412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15336251 - 15336044
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  15336251 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15336152  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15336151 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15336054  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  15336053 cctgatgaac 15336044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15425316 - 15425109
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  15425316 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15425217  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15425216 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15425119  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  15425118 cctgatgaac 15425109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15516620 - 15516413
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  15516620 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15516521  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15516520 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15516423  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  15516422 cctgatgaac 15516413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 1237625 - 1237815
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1237625 agcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaa 1237724  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  1237725 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 1237815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845344
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaa 40845451  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  40845450 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 40845354  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  40845353 cctgatgaac 40845344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20255658 - 20255529
Alignment:
Q  82 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20255658 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattga 20255559  T
Q  182 acaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20255558 acagcctttgacgctttaagtcttgcatct 20255529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Original strand, 24551265 - 24551452
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||     
T  24551265 agagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatct 24551364  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24551365 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaagt 24551452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 19707497 - 19707700
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  19707497 agagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattc 19707596  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
     ||  || |||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  | |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  19707597 atttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttct 19707695  T
Q  215 gatga 219  Q
    |||||    
T  19707696 gatga 19707700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43645069
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 198  Q
    | | ||  || |||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  43644984 ttcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttt 43645069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18685549 - 18685353
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18685549 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18685450  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||| |||| ||||  |||| |||||||    
T  18685449 tagttgttgcttcactcttctggtcttcttgcaatgc-tagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatga 18685353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722602
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18731143 - 18730947
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18731143 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18731044  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18731043 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18730947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 9320557 - 9320748
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattca-aagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||| || |||||||||| |||||    
T  9320557 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaa 9320655  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcc-attgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||| |||| | |||||||| ||||||    
T  9320656 atcctttcaaaataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaagt 9320748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 22673766 - 22673973
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||| ||    
T  22673766 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaa 22673865  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||    |||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  22673866 tccttccaaaatagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 22673963  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    || |||||||    
T  22673964 ccggatgaac 22673973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 36105183 - 36105390
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36105183 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 36105282  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  36105283 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 36105380  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  36105381 cctgatgaac 36105390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745684
Alignment:
Q  131 gcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 22745684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 22663107 - 22663311
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||| ||||     
T  22663107 agagacaaaaatagagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatct 22663206  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    || ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||  | |||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22663207 ttccaaaatagttgttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcct 22663304  T
Q  215 gatgaac 221  Q
     ||||||    
T  22663305 aatgaac 22663311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461617
Alignment:
Q  30 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || | ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgt 22461684  T
Q  130 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 197  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22461683 tgcttcattcttctagtcttctgcaatg-atatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagctt 22461617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164134
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag 88  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactcttcaaag 25164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407911
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||||||||||||||       
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 6407810  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
          ||||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6407811 ------caaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 6407901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19956502 - 19956374
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  19956502 gcagagaca-aaacagggtattggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaat 19956404  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttc 142  Q
    |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  19956403 cctttagaattagtcgttgcttcactcttc 19956374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989518
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 14989518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151713
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 18151713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24833204 - 24833029
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 126  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||     
T  24833204 gagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagc 24833105  T
Q  127 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
      |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  24833104 cattgcttcact-tttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagt 24833029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 45568059 - 45567955
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  45568059 agacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctt 45567960  T
Q  117 tcaaa 121  Q
    |||||    
T  45567959 tcaaa 45567955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13430791 - 13430699
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  13430791 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 58
Target Start/End: Original strand, 43639782 - 43639817
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgt 58  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43639782 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgt 43639817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 7018454 - 7018416
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7018454 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7018416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20259690 - 20259652
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20259690 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20259652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 21046320 - 21046282
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21046320 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21046282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3598375 - 3598302
Alignment:
Q  146 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||  |||||| || || ||||  || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3598375 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 3598302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 18772624 - 18772707
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||| ||||  ||||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18772624 gagtagtggaggtaatggttgtacattt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaat 18772707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 21301026 - 21301078
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  21301026 gagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgct 21301078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14851
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14744 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 14843  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||| ||||    
T  14844 cctaatga 14851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32690
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  32581 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatct 32680  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  32681 cctgatgaac 32690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49537
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  49428 tcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatct 49527  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  49528 cctgatgaac 49537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 351
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  455 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 356  T
Q  117 tcaaa 121  Q
    |||||    
T  355 tcaaa 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377465
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 377575  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  377574 tcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatct 377475  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  377474 cctgatgaac 377465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 220234 - 220442
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  220234 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatg-cttcaaa 220332  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  220333 ttcatttgaattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 220432  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  220433 cctgatgaac 220442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 244390 - 244256
Alignment:
Q  21 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaa 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  244390 acaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 244291  T
Q  121 aatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaa 155  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  244290 attagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211599
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||| || |||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaa 211493  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  211494 tccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 211591  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||||||||    
T  211592 cctgatga 211599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500234
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2500130 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 2500229  T
Q  212 cctga 216  Q
    |||||    
T  2500230 cctga 2500234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15088513 - 15088720
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15088513 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaat 15088612  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  15088613 cctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctc 15088712  T
Q  213 ctgatgaa 220  Q
    ||||||||    
T  15088713 ctgatgaa 15088720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137852
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13137961 tcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13137862  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  13137861 ccttatgaac 13137852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10883339 - 10883130
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10883339 agcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaa 10883240  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10883239 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 10883140  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  10883139 cctgatgaac 10883130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303011
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13302902 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13303001  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  13303002 cctaatgaac 13303011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467266
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44467156 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 44467255  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  44467256 tcctgatgaac 44467266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316514
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16316623 tcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcc 16316524  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  16316523 cctgatgaac 16316514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913565
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2913674 tcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatct 2913575  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  2913574 cctgatgaac 2913565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695602
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || |||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21695493 tcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatct 21695592  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  21695593 cttgatgaac 21695602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577978
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22578087 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 22577988  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22577987 cctgatgaac 22577978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 11319400 - 11319604
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  11319400 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcc 11319499  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |    
T  11319500 tttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctctt 11319599  T
Q  215 gatga 219  Q
    |||||    
T  11319600 gatga 11319604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 28409034 - 28409240
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409034 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 28409133  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |    
T  28409134 tttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctctt 28409233  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  28409234 gatgaac 28409240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13730839 - 13730638
Alignment:
Q  14 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13730839 cagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatc 13730740  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13730739 ttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcc 13730640  T
Q  214 tg 215  Q
    ||    
T  13730639 tg 13730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880305
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |    
T  13880196 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaatt 13880295  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  13880296 cctgatgaac 13880305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692488
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21692379 tcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatct 21692478  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  21692479 cctaatgaac 21692488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648928
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  13648821 tcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatct 13648920  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||||||||    
T  13648921 cctgatga 13648928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21283536 - 21283330
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21283536 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcc 21283437  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21283436 tttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcct 21283337  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  21283336 gatgaac 21283330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12366914 - 12366705
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12366914 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaa 12366815  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  12366814 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 12366715  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  12366714 cctgatgaac 12366705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069762
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9069654 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 9069753  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    |||||||||    
T  9069754 cctgatgaa 9069762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793108
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11792999 tgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatct 11793098  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  11793099 cctgatgaac 11793108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944282
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  30944389 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 30944292  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  30944291 cctgatgaac 30944282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691669
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| |||    
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  33691778 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatct 33691679  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  33691678 cctgatgaac 33691669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23280113 - 23279916
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23280113 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 23280014  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||  |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280013 tagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 23279916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026106
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaat 30025996  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  30025997 tcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 30026096  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  30026097 cttgatgaac 30026106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 24788136 - 24788342
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  24788136 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcc 24788235  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24788236 tttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 24788335  T
Q  215 gatgaac 221  Q
     ||||||    
T  24788336 aatgaac 24788342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30945518 - 30945315
Alignment:
Q  16 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 115  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30945518 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30945419  T
Q  116 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30945418 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30945321  T
Q  216 atgaac 221  Q
    ||||||    
T  30945320 atgaac 30945315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 15467924 - 15468117
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15467924 gagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 15468023  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468024 gttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 15468117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935316
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||     ||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29935424 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatct 29935326  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  29935325 cctgatgaac 29935316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28622522 - 28622315
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  28622522 agcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaa 28622423  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28622422 tcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 28622325  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  28622324 cctgatgaac 28622315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5000985 - 5000788
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5000985 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcc 5000886  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||    ||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5000885 tttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9709968 - 9709761
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  9709968 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9709869  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  9709868 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 9709771  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  9709770 cctgatgaac 9709761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48237068 - 48236861
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||  |||||||||||    
T  48237068 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaa 48236969  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  48236968 tcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 48236871  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  48236870 cctgatgaac 48236861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 14426542 - 14426746
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14426542 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 14426641  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || || |||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  14426642 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 14426739  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  14426740 gatgaac 14426746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19237022
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  117 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 200  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39284727 - 39284524
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39284727 agagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 39284628  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
     ||  || |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||  ||||| ||    
T  39284627 atttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttct 39284529  T
Q  215 gatga 219  Q
    |||||    
T  39284528 gatga 39284524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331842
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |   || || ||||||||||||||| |    
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagc-aataagcatccaatgccttcaga 331735  T
Q  112 tcctttcaaaa-tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatc 331834  T
Q  211 tcctgatg 218  Q
    ||||||||    
T  331835 tcctgatg 331842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 33605677 - 33605885
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33605677 agcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33605776  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||  | |||||||    
T  33605777 tcctttcaaaatagtcattgcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatc 33605874  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  33605875 tcctgatgaac 33605885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692541
Alignment:
Q  41 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactct 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||| ||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  141 tccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatga 13692541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111860
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 16111951  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||| |  |||||| || || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16111950 ttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaagt 16111860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13018671 - 13018479
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||     
T  13018671 agcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtct 204  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | | | |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  13018571 ttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtct 13018479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309961
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16309974  T
Q  112 tcctttcaaaata 124  Q
    |||||||||||||    
T  16309973 tcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35952851 - 35952663
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35952851 agagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcc 35952752  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  35952751 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagt 35952663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260580
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||      
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttca-- 13260684  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
         | | |||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  13260683 -----taagaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatct 13260590  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  13260589 cctgatgaac 13260580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13894162 - 13893958
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13894162 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaat 13894064  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 212  Q
    |||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||     
T  13894063 ccttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatctt 13893965  T
Q  213 ctgatga 219  Q
    |||||||    
T  13893964 ctgatga 13893958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 14193108 - 14193243
Alignment:
Q  14 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 113  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14193108 cagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatc 14193207  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtctt 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14193208 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Original strand, 13880608 - 13880768
Alignment:
Q  40 tagtggttgtac-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  13880608 tagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 13880707  T
Q  139 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  13880708 cttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842231
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||  |||||||| ||||||     
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||| |   |||| |||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  41842339 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatct 41842241  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  41842240 tctgatgaac 41842231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821655
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4821565  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||| |||  |||||| || || |||   || |||| | |||||||||||||||    
T  4821566 t-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaagt 4821655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12174479 - 12174354
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 138  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12174479 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 12174380  T
Q  139 cttccagtcttctgcaatgcttagac 164  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  12174379 tttccagtcttctgcaatccttagac 12174354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032046
Alignment:
Q  37 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | | | |||| |||| |||||| | | ||  |||||||||||||||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  137 ctcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtct 204  Q
    |||| |  |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatac-taggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct 13032046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542979
Alignment:
Q  46 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 145  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16543053  T
Q  146 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||  ||| || || || |||||||| |||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  16543052 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaac 16542979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622683
Alignment:
Q  46 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 145  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16622609  T
Q  146 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||  ||| || || || |||||||| |||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  16622610 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaac 16622683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8183128
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||| | || |||  ||    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaa 8183021  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || || |  ||  ||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  8183022 tcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgag--ttgcatct 8183118  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  8183119 cctgatgaac 8183128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494707
Alignment:
Q  148 ttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 4494707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098283
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  ||||||||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcactc 9098285  T
Q  140 tt 141  Q
    ||    
T  9098284 tt 9098283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19711176 - 19711059
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19711176 agagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcc 19711077  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgc 132  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  19711076 tttcaaattagtcgttgc 19711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13472663 - 13472555
Alignment:
Q  95 catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaa 193  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  13472663 catcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttaaa 13472564  T
Q  194 gctttaagt 202  Q
    |||||||||    
T  13472563 gctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2265674 - 2265478
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  2265674 aaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaa 2265575  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||  ||||||  ||| || ||||||||||||||  |||||| || || ||||  || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2265574 tagccgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 2265478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704475
Alignment:
Q  65 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 164  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  165 aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
     || || ||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 15704475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 1293025 - 1293157
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||         ||    
T  1293025 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cc 1293115  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 156  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  1293116 tttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttttgcaat 1293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 48062986 - 48062891
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  48062986 agcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 48062891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 14425444 - 14425636
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||||||||         | ||    
T  14425444 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catt 14425534  T
Q  117 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctga 216  Q
    |||||||||  |||||   |||  ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14425535 tcaaaatagccgttgccatacttntccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 14425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871778
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 27871778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556664
Alignment:
Q  65 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 152  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 152
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608998
Alignment:
Q  65 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 152  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19339400 - 19339324
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  19339400 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24794881 - 24794813
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24794881 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 4494569 - 4494628
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 71  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494569 agcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7339893 - 7339833
Alignment:
Q  159 ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7339893 ttagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 7339833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Original strand, 16412000 - 16412078
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  16412000 gagtagtggagataatggttgtacaatt-gtactattgtccttttcgaacgctcttcaaagaataagcatccaatgcctt 16412078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 221
Target Start/End: Original strand, 14193242 - 14193275
Alignment:
Q  188 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14193242 tttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaac 14193275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 14745787 - 14745750
Alignment:
Q  18 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745787 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 14745750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 32264884 - 32264791
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||    
T  32264884 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacactctgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataaacatccaatgc 32264791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 48806045 - 48805977
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  48806045 agcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgct 48805977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985525
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37985633 tcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37985534  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    | |||||||    
T  37985533 catgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29680665 - 29680462
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29680665 agcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29680566  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29680565 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatct 29680466  T
Q  212 cctg 215  Q
    ||||    
T  29680465 cctg 29680462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632639
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16632530 tcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16632629  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  16632630 cctgatgaac 16632639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19666462 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatct 19666561  T
Q  212 cctgat 217  Q
    ||||||    
T  19666562 cctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811090
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12811199 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 12811100  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||| ||||||    
T  12811099 cctaatgaac 12811090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395789
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3395680 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatct 3395779  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  3395780 cctgatgaac 3395789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 45833384 - 45833593
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||    
T  45833384 agcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaa 45833483  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45833484 tactttcaaaatagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 45833583  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  45833584 cctgatgaac 45833593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380489
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  55380380 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 55380478  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||| ||||||    
T  55380479 tcctaatgaac 55380489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 19884692 - 19884900
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  19884692 agcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19884791  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19884792 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 19884890  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  19884891 cctgatgaac 19884900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37435656 - 37435447
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  37435656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37435557  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37435556 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37435457  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  37435456 cctgatgaac 37435447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601291
Alignment:
Q  20 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  120 aaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 212  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctc 12601291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 207
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141097
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgc 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9141002 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620973
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19621082 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 19620983  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  19620982 cctgatgaac 19620973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14605028 - 14604819
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14605028 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14604929  T
Q  112 tcc-tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  14604928 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 14604829  T
Q  211 tcctgatgaa 220  Q
    ||||||||||    
T  14604828 tcctgatgaa 14604819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 56034567 - 56034773
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||      
T  56034567 agagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatta 56034666  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  56034667 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttct 56034766  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  56034767 gatgaac 56034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 10072925 - 10073133
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10072925 agcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaa 10073024  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10073025 tcctttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 10073123  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  10073124 cctgatgaac 10073133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904268
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  14904377 tcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatct 14904278  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  14904277 cctgatgaac 14904268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22675630 - 22675434
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  22675630 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaac 22675531  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  22675530 tagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaac 22675434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 413008 - 413199
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      
T  413008 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 413107  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  413108 gttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaac 413199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693048
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10692941 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10693038  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  10693039 cctgatgaac 10693048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906814
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10906707 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10906804  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  10906805 cctgatgaac 10906814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19912002 - 19911792
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctatt-caaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||    
T  19912002 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaa 19911903  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19911902 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatc 19911803  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  19911802 tcctgatgaac 19911792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483920
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 139  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 3483838  T
Q  140 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3483839 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaac 3483920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13576235 - 13576028
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13576235 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13576136  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  13576135 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 13576038  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  13576037 cctgatgaac 13576028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 17247245 - 17247440
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17247245 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaat 17247344  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  17247345 tagtcgttgcttcact-ttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaac 17247440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833594
Alignment:
Q  75 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  175 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 14833594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 54679931 - 54680125
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679931 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 54680030  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |  ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  54680031 tagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 54680125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 29121362 - 29121550
Alignment:
Q  14 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 113  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29121362 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatc 29121461  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  29121462 ctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 29121550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641881
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||  || |||  |||| ||||||||||   |||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  6641774 tccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatct 6641872  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
     ||||||||    
T  6641873 tctgatgaa 6641881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 40846089 - 40846298
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||     
T  40846089 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaac 40846188  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||| | |  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||    
T  40846189 ttcatttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatc 40846287  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    | |||||||||    
T  40846288 ttctgatgaac 40846298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517682
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||  |||| ||| ||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaa 6517574  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  6517575 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatct 6517672  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  6517673 cctgatgaac 6517682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750719
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattca-aagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcat 209  Q
     | | ||  ||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23750609 cttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 23750707  T
Q  210 ctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||    
T  23750708 ctcctgatgaac 23750719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 8105628 - 8105819
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||    
T  8105628 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 8105726  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac-aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8105727 atcctttcaaaatagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagt 8105819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105334
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||| | ||  ||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaa 3105441  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3105440 tcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3105344  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  3105343 cctgatgaac 3105334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 56533182 - 56533030
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||    
T  56533182 agcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaa 56533084  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 164  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  56533083 atcctttcaaaatagccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagac 56533030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25651224 - 25651046
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||||||    
T  25651224 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 25651126  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttg 191  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  25651125 tccttccaaaatagccgttgcttcacttttcaagtcttctgcgatctttagacaagtttgaatccgttaaacaacttttg 25651046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 11915701 - 11915835
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||    
T  11915701 aaacagagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaa 11915800  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11915801 tagtcgttgcttcactcttttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123630
Alignment:
Q  119 aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  219 aac 221  Q
    |||    
T  23123628 aac 23123630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 179
Target Start/End: Original strand, 16940026 - 16940172
Alignment:
Q  32 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |  ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  16940026 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttg 16940125  T
Q  132 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccatt 179  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  16940126 ctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccatt 16940172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398598
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 17398704  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
     |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| | || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17398703 -cctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 17398608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 15139287 - 15139426
Alignment:
Q  82 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 181  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15139287 ttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattga 15139386  T
Q  182 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  15139387 acaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaac 15139426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853602
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaa 16853592  T
Q  112 tcctttcaaa 121  Q
    ||| ||||||    
T  16853593 tcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 221
Target Start/End: Original strand, 55731844 - 55731976
Alignment:
Q  86 aagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 185  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||   ||||||||| ||||||  |||||| || || |||||||| |||||    
T  55731844 aagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaa 55731942  T
Q  186 catttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  55731943 cttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaac 55731976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 17540396 - 17540530
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| ||| |  |||||| || ||||| |||| |   ||     
T  17540396 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaat 17540495  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  17540496 tagttgttgcttcattctttcagtcttttgcaatg 17540530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41114875 - 41114707
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| || | |||  || || |||||||||||||||||| | ||  ||||||      
T  41114875 gagtggtggaaatagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagcc 41114776  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||   || |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41114775 gttgcttcattcttctagtcttttgcaatg-acaggcttgattaaatcaattgaacaacctttgaagctt 41114707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Original strand, 38513868 - 38513960
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  38513868 agcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 38513960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 20977447 - 20977515
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  20977447 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 20977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 22190836 - 22190904
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  22190836 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 22190904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8685548 - 8685509
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685548 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Original strand, 11901196 - 11901322
Alignment:
Q  31 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||| | | || |||| || |||||||||||||||||  ||||  || |||| |||    
T  11901196 tagtgtagatagtgattgtacacttcgtacaattgtccttttctaacgttctccagagaataagcatccaatgccttcaaaatcttttgaattagtcgtt 11901295  T
Q  131 gcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    ||||||   ||| ||||||||||||||    
T  11901296 gcttcatgtttctagtcttctgcaatg 11901322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17788152 - 17788067
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  17788152 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaat 17788067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Original strand, 40860657 - 40860749
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  40860657 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 1672395 - 1672445
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacg 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1672395 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacg 1672445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 1674870 - 1674920
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacg 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1674870 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacg 1674920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14154115 - 14154065
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 62  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14154115 agcagagacaaaaacagagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaa 14154065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3499745 - 3499705
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3499745 tagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgct 3499705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9751661 - 9751593
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||    
T  9751661 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgct 9751593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27188748 - 27188691
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  27188748 aaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 27188691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1893
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1786 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 1885  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||| ||||    
T  1886 cctaatga 1893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602377
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaat 13602267  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13602268 tcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13602367  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  13602368 cctgatgaac 13602377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972173
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972281 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 26972182  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    |||||||||    
T  26972181 cctgatgaa 26972173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544470
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||    
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32544361 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 32544460  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  32544461 cctgatgaac 32544470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284769
Alignment:
Q  16 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  116 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23284664 ttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23284763  T
Q  216 atgaac 221  Q
    ||||||    
T  23284764 atgaac 23284769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 9717841 - 9718048
Alignment:
Q  14 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 113  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9717841 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatc 9717940  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9717941 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcc 9718040  T
Q  214 tgatgaac 221  Q
    ||||||||    
T  9718041 tgatgaac 9718048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20112852 - 20112643
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20112852 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaat 20112753  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  20112752 cctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatct 20112653  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  20112652 cttgatgaac 20112643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 15302196 - 15302403
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15302196 agcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaa 15302295  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15302296 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatct 15302395  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||| ||||    
T  15302396 cctaatga 15302403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715363
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||||||    
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaa 12715474  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12715473 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 12715374  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  12715373 tcctgatgaac 12715363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 13435544 - 13435737
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  13435544 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 13435643  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435644 gttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 13435737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14100592 - 14100384
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  14100592 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaa 14100494  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  14100493 tcctttcaaaatagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatct 14100394  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  14100393 cctgatgaac 14100384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378496
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18378410 tcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 15987232 - 15987437
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat-c 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15987232 agagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 15987331  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| |    
T  15987332 cttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttc 15987431  T
Q  214 tgatga 219  Q
    ||||||    
T  15987432 tgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 29918013 - 29918221
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  29918013 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaa 29918112  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29918113 tcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 29918211  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  29918212 cctgatgaac 29918221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15531777 - 15531568
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  15531777 agcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 15531678  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||   |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15531677 tcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatct 15531578  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  15531577 tctgatgaac 15531568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 19623975 - 19624184
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactt-tgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||    
T  19623975 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaa 19624073  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19624074 atcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatc 19624173  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  19624174 tcctgatgaac 19624184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625303
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaaa-tagccg 21625212  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21625213 ttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga 21625303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117034
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||   | | |||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24116924 tcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 24117023  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    | |||||||||    
T  24117024 ttctgatgaac 24117034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19688969
Alignment:
Q  40 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactc 19688889  T
Q  140 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19688890 ttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaac 19688969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 18435552 - 18435761
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18435552 agcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18435651  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18435652 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatct 18435751  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  18435752 cctgatgaac 18435761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086353
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||            
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg-------- 19086245  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaa-caacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||    
T  19086246 --ctttcaaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatc 19086342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 22802137 - 22802344
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22802137 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22802236  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | |||||||| | || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  22802237 ttctttcaaacttgtcgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 22802334  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22802335 cctgatgaac 22802344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20730853 - 20730671
Alignment:
Q  16 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 115  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20730853 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 20730754  T
Q  116 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 198  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  20730753 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt 20730671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265116
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaa 16265204  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttta 199  Q
     ||||||||  || | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16265203 acctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta 16265116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451612
Alignment:
Q  46 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  146 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaac 34451612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336328
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| ||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaa 16336222  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  16336223 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatct 16336320  T
Q  212 cctgatga 219  Q
    ||||||||    
T  16336321 cctgatga 16336328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 15954702 - 15954906
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15954702 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcc 15954801  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||  || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  15954802 tttcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctctt 15954899  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  15954900 gatgaac 15954906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Original strand, 25597557 - 25597684
Alignment:
Q  94 acatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25597557 acatccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaa 25597656  T
Q  194 gctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25597657 gctttaagtcttgcatgtcctgatgaac 25597684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 16877209 - 16877416
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | |||  | |||||||| ||||||||    
T  16877209 agcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaa 16877308  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  16877309 tccttttaagatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 16877406  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  16877407 cctgatgaac 16877416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076353
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||| ||| ||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaa 22076461  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||    
T  22076460 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatct 22076363  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22076362 cctgatgaac 22076353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 26943572 - 26943741
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26943572 agcaaagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaa 26943671  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaa 182  Q
    |||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  26943672 tcctattgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgc-tagacatgattaaatcctttgaa 26943741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640384
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||     
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20488071 - 20487880
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  20488071 agcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20487972  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagatt-aaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| || || ||  ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  20487971 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaagt 20487880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 21618251 - 21618447
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21618251 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 21618350  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||  || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  21618351 tagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaac 21618447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 12348995 - 12349195
Alignment:
Q  18 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttt 117  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  12348995 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatccttt 12349094  T
Q  118 caaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgat 217  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12349095 caaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgat 12349191  T
Q  218 gaac 221  Q
    ||||    
T  12349192 gaac 12349195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19833175 - 19832978
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19833175 aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaa 19833076  T
Q  122 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || || ||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19833075 atagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 19832978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 12423261 - 12423428
Alignment:
Q  16 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 115  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  12423261 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcct 12423360  T
Q  116 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 184  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || || |||||||| ||||    
T  12423361 ttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgc-attcttagacgagtttgaatccattaaaca 12423428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470850
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 197  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagctt 19470850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 21235137 - 21235316
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||           
T  21235137 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa------- 21235229  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||   || |      ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  21235230 gtccattgaa-----cagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaac 21235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33351939
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||  ||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt-gaagaataaacatccaatgtttttcaa 33351981  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgca 154  Q
    ||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||    
T  33351980 tcctttcaaaatag-ccttgctatacttttccagtcttctgca 33351939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Original strand, 17381517 - 17381599
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa 94  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  17381517 agcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaa 17381599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19066171 - 19066079
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  19066171 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 19482751 - 19482816
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  19482751 agagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 19482816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17316678 - 17316610
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  17316678 agcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 17316610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 25930485 - 25930568
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||  ||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  25930485 gagtagtggagatagtggttgtacaatt-gtactattatccttttccaacgctcttcaaggaataagcatccaatgacttcaaat 25930568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14051529 - 14051425
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||  ||| | || ||||||||| |||||||| | |    
T  14051529 agacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaa-tgtactttgtcgactctctttgaaggataagcatccaatgacttcaaattcct 14051431  T
Q  117 tcaaaa 122  Q
    ||||||    
T  14051430 tcaaaa 14051425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 26589595 - 26589664
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac-ttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  26589595 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgct 26589664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815168
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17815060 tcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 17815159  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    | |||||||    
T  17815160 cttgatgaa 17815168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512367
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc---caatgccttcaaa 6512477  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6512476 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 6512377  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  6512376 cctgatgaac 6512367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566370
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  41566479 tcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatct 41566380  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  41566379 cctgatgaac 41566370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910757
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  21910648 tcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatct 21910747  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  21910748 cctgatgaac 21910757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412910
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23413019 tcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 23412920  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  23412919 cctgatgaac 23412910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89358
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  89467 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatct 89368  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  89367 cctgatgaac 89358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745632
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7745738 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatct 7745639  T
Q  212 cctgatg 218  Q
    |||||||    
T  7745638 cctgatg 7745632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072177
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21072285 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatct 21072187  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  21072186 cctgatgaac 21072177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551096
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20550986 tcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 20551085  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  20551086 tcctgatgaac 20551096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 33022656 - 33022863
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33022656 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 33022755  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  33022756 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 33022853  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  33022854 cctgatgaac 33022863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536236
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcact-cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19536346 tccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 19536247  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  19536246 tcctgatgaac 19536236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13545657 - 13545456
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  13545657 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13545558  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13545557 tcctttcaaagtagttgttgcttcact--------cttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13545466  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  13545465 cctgatgaac 13545456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 26784346 - 26784555
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| | | | ||||    
T  26784346 agcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaa 26784445  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  26784446 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatct 26784545  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    |||| |||||    
T  26784546 cctgctgaac 26784555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 31117869 - 31118077
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31117869 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 31117968  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||  | |||||||    
T  31117969 ttctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatc 31118066  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  31118067 tcctgatgaac 31118077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887204
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    || |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4887114 tcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaagt 4887204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 30742973 - 30743179
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30742973 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 30743071  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |  |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  30743072 tcctttcaaaataatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 30743169  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  30743170 cctgatgaac 30743179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 42243673 - 42243880
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  42243673 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaa 42243771  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  42243772 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 42243869  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    |||||||||||    
T  42243870 tcctgatgaac 42243880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 11993880 - 11994087
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  11993880 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 11993979  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  11993980 tcccttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatct 11994077  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  11994078 cctgatgaac 11994087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499423
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||     
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaac 6499330  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtct 204  Q
    | | ||  |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | | |    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6499331 ttcatttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatac-tgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtct 6499423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881267
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||    
T  23881159 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatc 23881256  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    | |||||||||    
T  23881257 ttctgatgaac 23881267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 15516962 - 15517168
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| || ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  15516962 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 15517060  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15517061 tccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15517158  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  15517159 tctgatgaac 15517168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138346
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 29138452  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||  || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  29138451 tccttccaaaatagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 29138356  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  29138355 cctgatgaac 29138346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198941
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || |||  ||||| ||| | |||  |||||||||| | | ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  21199048 ttcatttgaattagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 21198951  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  21198950 tctgatgaac 21198941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352768
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||     
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaac 12352841  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 184  Q
    | | ||  || |||   ||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12352840 ttcatttgaattagccattgcttcaccctcctgatcttctgcaatgcttagacaagatcaaatccaatgaaca 12352768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 642849 - 642644
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  642849 agcagagacacaa---gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaac 642753  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |   ||  || |||  |||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  642752 tttatttgaattagccgttgtttcactctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 642654  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  642653 tctgatgaac 642644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099641
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   ||| |||||||||||||||      
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || ||||||||||||||||||    ||||| || ||||| ||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||||    
T  21099749 ttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgc-taggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatct 21099651  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  21099650 tctgatgaac 21099641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25096969 - 25096777
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 109  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25096969 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25096871  T
Q  110 aatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    ||||||||  || || | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25096870 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25154939 - 25154747
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 109  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25154939 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25154841  T
Q  110 aatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    ||||||||  || || | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25154840 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933453
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||  ||  | |||||| |||||||||| || ||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaa 33933358  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaac--atttgaagctttaagt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  33933359 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaagt 33933453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086492
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaa 14086585  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  14086584 atcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaagt 14086492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398781
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaa 9398781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 26759157 - 26759348
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| | ||| |||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26759157 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtc 26759256  T
Q  128 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||| | |  || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26759257 gttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 26759348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3245583 - 3245380
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||  ||| |    
T  3245583 agagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattc 3245484  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  ||||   || |||||||||||  |||||||||||    
T  3245483 tttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcct 3245387  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  3245386 gatgaac 3245380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 26765501 - 26765634
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26765501 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 26765600  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 156  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26765601 tagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139738
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |   ||||| || ||||||||| |||  ||    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaa 28139698  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  28139699 tcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttct 28139738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115863
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| |||||| |  ||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaa 30115883  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttg 131  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  30115882 tcctttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089057
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||||||||||||||    
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc 9089057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 32160763 - 32160879
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  32160763 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 32160862  T
Q  117 tcaaaatagttgttgct 133  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  32160863 tcaaattagctgttgct 32160879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28464481 - 28464389
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  28464481 agagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 28464389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25930301 - 25930104
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||||||       
T  25930301 agcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc--- 25930205  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
           ||| |||  |||| |  ||| |||||||||| ||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  25930204 ------taaattagccgttgttatacttttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 25930113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 10848765 - 10848860
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||    
T  10848765 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgcctt 10848860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35932151 - 35932059
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  35932151 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11208125 - 11208011
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||    | |||||||||| ||||||||  |    
T  11208125 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctct 11208027  T
Q  117 tcaaaatagttgttgc 132  Q
    |||||||||| |||||    
T  11208026 tcaaaatagtcgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 16607520 - 16607603
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| | | ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  16607520 gagtagtggagatagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcttccaatgccttcaaat 16607603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 5429985 - 5430083
Alignment:
Q  122 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| || || || ||| ||||  |||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  5429985 atagctgttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatctcctgatgaa 5430082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23391737 - 23391680
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  23391737 aaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgct 23391680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18734 - 18527
Alignment:
Q  14 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18734 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatc 18635  T
Q  114 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||    
T  18634 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcc 18535  T
Q  214 tgatgaac 221  Q
    ||||||||    
T  18534 tgatgaac 18527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 12205 - 12414
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12205 agcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 12304  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||    
T  12305 ttctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtct 12404  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  12405 cctgatgaac 12414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26087 - 25883
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26087 agagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 25988  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25987 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcct 25888  T
Q  215 gatga 219  Q
    |||||    
T  25887 gatga 25883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44652
Alignment:
Q  49 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtct 148  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  149 tctgcaatgcttagacaagattaaatccatt 179  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatccatt 44652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5596
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5705 tcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5606  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  5605 cctgatgaac 5596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60221
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  60112 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 60211  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  60212 tctgatgaac 60221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 7922 - 8131
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  7922 agcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaa 8021  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8022 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 8121  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  8122 cctgatgaac 8131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 151831 - 151794
Alignment:
Q  167 gattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  151831 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 474 - 678
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  474 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 573  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  574 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 673  T
Q  215 gatga 219  Q
    |||||    
T  674 gatga 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 15116 - 15315
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15116 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 15215  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15216 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 15315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22881
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22772 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 22871  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  22872 cctgatgaac 22881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13739
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13667 tcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 10013
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10220 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcc 10121  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10120 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 10021  T
Q  214 tgatgaac 221  Q
    ||||||||    
T  10020 tgatgaac 10013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14819
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 14819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19584 - 19378
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  19584 agagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcc 19485  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19484 tttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcct 19385  T
Q  215 gatgaac 221  Q
     ||||||    
T  19384 catgaac 19378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99133
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||  ||  ||||| || |||||||||||||  ||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcagcgc--tttgaagaataagcatccaatgccttgtaa 99223  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||| ||| |||||||   |||||| || || ||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  99222 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagt 99133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27335
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27444 tcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 27345  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  27344 cctgatgaac 27335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7907
Alignment:
Q  21 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaa 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  7708 acaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaa 7807  T
Q  121 aatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7808 aatagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 7907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1865
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  1656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 1755  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1756 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 1855  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  1856 cctgatgaac 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20877
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20986 tcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20887  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  20886 cttgatgaac 20877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 212350 - 212559
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  212350 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 212449  T
Q  112 tcc-tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  212450 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 212549  T
Q  211 tcctgatgaa 220  Q
    ||||||||||    
T  212550 tcctgatgaa 212559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6105
Alignment:
Q  75 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  175 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 6105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5040 - 4853
Alignment:
Q  34 tggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5040 tggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgct 4941  T
Q  134 tcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4940 tcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaac 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10174
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  10065 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatct 10164  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  10165 cctgatgaac 10174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36681
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  36790 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 36691  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  36690 cttgatgaac 36681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42324
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  42215 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 42314  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  42315 cttgatgaac 42324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 15789 - 16000
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15789 agcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa 15888  T
Q  111 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcat 209  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15889 gtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcat 15988  T
Q  210 ctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||    
T  15989 ctcctgatgaac 16000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19235
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| |||    
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||     
T  19127 tccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatca 19226  T
Q  212 cctgatgaa 220  Q
    |||||||||    
T  19227 cctgatgaa 19235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 9559 - 9762
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   |||| || ||||||||||| |  |||||    
T  9559 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcc 9658  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  9659 tttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcct 9755  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  9756 gatgaac 9762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22056
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  |  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaa 22147  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||||  || ||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  22146 tccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaagt 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103777
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||  |    
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccg 103684  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103685 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 103777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89963
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  90070 tcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatct 89973  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  89972 cctgatgaac 89963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Original strand, 712 - 790
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  712 gagtagtggagataatggttgtacaatt-gtactattgtccttttcgaacgctcttcaaagaataagcatccaatgcctt 790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30428
Alignment:
Q  75 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 174  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  175 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 30428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10107
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    | | ||  || |||| |||| | ||||||||   ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |  |||||    
T  9999 ttcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatct 10097  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  10098 tctgatgaac 10107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 563
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  767 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 668  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||  |||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  667 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 570  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  569 gatgaac 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1673
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||||||||         | ||    
T  1865 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catt 1775  T
Q  117 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctga 216  Q
    |||||||||  |||||   ||| |||||||||||||||||| |||| | || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1774 tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6648
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  6855 agcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6756  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6755 tcttttcaaaatagtcggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 6658  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  6657 cctgatgaac 6648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 215612 - 215409
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  215612 agcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 215513  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  215512 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 215415  T
Q  212 cctgat 217  Q
    ||||||    
T  215414 cctgat 215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6211
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||  || |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||  |||||    
T  6103 tccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatct 6201  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  6202 tctgatgaac 6211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 9952 - 10161
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9952 agcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaa 10051  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 210  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||    
T  10052 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatc 10150  T
Q  211 tcctgatgaac 221  Q
    | |||||||||    
T  10151 ttctgatgaac 10161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5510
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||||||    
T  5717 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaa 5618  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||| ||||||   ||||||||    
T  5617 tcctttcaaaatagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatct 5520  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
     |||||||||    
T  5519 tctgatgaac 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 692
Alignment:
Q  82 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  831 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattga 732  T
Q  182 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  731 acagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaac 692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 60802 - 61006
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  60802 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatcc 60901  T
Q  115 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 214  Q
    || ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  60902 ttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcct 60999  T
Q  215 gatgaac 221  Q
    |||||||    
T  61000 gatgaac 61006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1607
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  1814 agcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaa 1715  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| || || || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||||    
T  1714 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatct 1617  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  1616 cctgatgaac 1607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 78481 - 78274
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  78481 agcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaa 78382  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||  | || | | ||||||||||||||   |||||||    
T  78381 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatct 78284  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    | ||||||||    
T  78283 catgatgaac 78274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 143093 - 143292
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||         |||||||  ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  143093 agcatagacaaaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt---------gtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 143183  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  143184 tccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatct 143283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10000
Alignment:
Q  46 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||   |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  146 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaac 10000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 50
Target Start/End: Original strand, 7823 - 7858
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7823 agagacacaaactgagtagaggagatagtggttgta 7858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 39494 - 39630
Alignment:
Q  85 aaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 184  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39494 aaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaaca 39593  T
Q  185 acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39594 gcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaac 39630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 137554 - 137690
Alignment:
Q  85 aaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 184  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  137554 aaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaaca 137653  T
Q  185 acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  137654 gcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaac 137690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159242
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 204  Q
    | | ||  || |||  |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  159151 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtct 159242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 37398 - 37463
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 77  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37398 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 135458 - 135523
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 77  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  135458 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36115
Alignment:
Q  30 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || | ||| ||| || ||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgt 36182  T
Q  130 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36181 tgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagctt 36115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 25777 - 25688
Alignment:
Q  15 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  25777 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgc 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 3300 - 3507
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3300 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 3399  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3400 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3497  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  3498 cctgatgaac 3507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 9151 - 9357
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  9151 agcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 9250  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| ||  || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  9251 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 9347  T
Q  212 cctgatgaac 221  Q
    ||||||||||    
T  9348 cctgatgaac 9357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1491
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcg 1520  T
Q  129 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 157  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1519 ttgcttcactcctatagtcttctgcaatg 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4900
Alignment:
Q  132 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaa 4900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44032 - 43828
Alignment:
Q  13 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 112  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44032 gcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaat 43934  T
Q  113 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 212  Q
    | |||  || |||   ||||||||||||||   |||||||||||| |||| |  |||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||  |||||     
T  43933 ctttttgaattagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatctt 43835  T
Q  213 ctgatga 219  Q
    |||||||    
T  43834 ctgatga 43828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7064
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||  ||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  7260 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaa 7161  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  | ||||  | || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7160 tagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 7064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5828
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||| | ||  |||    
T  5634 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-ttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaa 5732  T
Q  123 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 219  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| || ||||||| |  ||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||    
T  5733 tagtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatg-ataggcatgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatga 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Original strand, 40638 - 40780
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||| |||    
T  40638 agacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattctt 40737  T
Q  117 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgct 159  Q
    |  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40738 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct 40780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 165056 - 164940
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  165056 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 164957  T
Q  117 tcaaaatagttgttgct 133  Q
    ||||| |||||||||||    
T  164956 tcaaattagttgttgct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65337
Alignment:
Q  70 ttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagat 169  Q
    ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  170 taaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 65337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144382
Alignment:
Q  70 ttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagat 169  Q
    ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  170 taaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaac 144382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2029
Alignment:
Q  32 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25393
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| ||  |||||||||| |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgct 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  25414 tcctttcaaaatagtcgttgct 25393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 15854 - 15811
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 55  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15854 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23549 - 23471
Alignment:
Q  140 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23549 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaac 23471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Original strand, 74577 - 74682
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  74577 agcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaa 74676  T
Q  112 tccttt 117  Q
    ||||||    
T  74677 tccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2702
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| |  |||||||||| ||| ||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa 2746  T
Q  112 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 156  Q
     |||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||    
T  2745 -ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1410
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||    
T  1324 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||    
T  87 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15732 - 15628
Alignment:
Q  17 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||  ||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  15732 agacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctt 15633  T
Q  117 tcaaa 121  Q
    |||||    
T  15632 tcaaa 15628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8117
Alignment:
Q  47 tgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagt 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  147 cttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 202  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | |||||||||||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17880 - 17785
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||    
T  17880 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgcctt 17785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38189 - 38086
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||     
T  38189 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaat 38090  T
Q  123 tagt 126  Q
    ||||    
T  38089 tagt 38086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5845
Alignment:
Q  132 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacattt-gaagctttaagtcttgcatctcctgatgaac 221  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5935 cttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaac 5845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1803
Alignment:
Q  29 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1895 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2737
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcta 81  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  2806 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgcta 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 7377 - 7445
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7377 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgct 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 87715 - 87647
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  87715 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgct 87647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 846
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaat 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || ||||||||    
T  935 agcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaat 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3942
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3999 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgct 3942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6043
Alignment:
Q  12 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 53  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6002 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 7292 - 7346
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 77  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7292 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaac 7346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 31888 - 31808
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 104  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| | | ||||||| || ||||||||||    
T  31888 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgc 31808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 80
Target Start/End: Original strand, 731 - 788
Alignment:
Q  23 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 80  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  731 aaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgct 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6621 - 6589
Alignment:
Q  28 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtac 60  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6621 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 6589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University